diff --git a/src/main/java/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/gnarlyGenotyper/GnarlyGenotyperEngine.java b/src/main/java/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/gnarlyGenotyper/GnarlyGenotyperEngine.java index 3464bb8596f..f8553ab74b0 100644 --- a/src/main/java/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/gnarlyGenotyper/GnarlyGenotyperEngine.java +++ b/src/main/java/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/gnarlyGenotyper/GnarlyGenotyperEngine.java @@ -331,16 +331,11 @@ protected GenotypesContext iterateOnGenotypes(final VariantContext vc, final Lis final GenotypeBuilder genotypeBuilder = new GenotypeBuilder(g); genotypeBuilder.name(name); if (isGDBnoCall(g) || g.getAlleles().contains(Allele.NON_REF_ALLELE)) { - genotypeBuilder.alleles(GATKVariantContextUtils.noCallAlleles(g.getPloidy())); + genotypeBuilder.alleles(GATKVariantContextUtils.noCallAlleles(g.getPloidy())).noGQ(); } - else if (nonRefReturned) { - if (g.hasAD()) { - final int[] AD = trimADs(g, targetAlleles.size()); - genotypeBuilder.AD(AD); - } - else if (g.countAllele(Allele.NON_REF_ALLELE) > 0) { - genotypeBuilder.alleles(GATKVariantContextUtils.noCallAlleles(g.getPloidy())).noGQ(); - } + if (nonRefReturned && g.hasAD()) { + final int[] AD = trimADs(g, targetAlleles.size()); + genotypeBuilder.AD(AD); } if (g.hasPL()) { //lookup PL size from cache if ploidy matches and cache has our number of alts diff --git a/src/test/java/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/GnarlyGenotyperIntegrationTest.java b/src/test/java/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/GnarlyGenotyperIntegrationTest.java index 716c30f300c..480d495af0b 100644 --- a/src/test/java/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/GnarlyGenotyperIntegrationTest.java +++ b/src/test/java/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/GnarlyGenotyperIntegrationTest.java @@ -56,9 +56,9 @@ public void assertThatExpectedOutputUpdateToggleIsDisabled() { @DataProvider(name="VCFdata") public Object[][] getVCFdata() { return new Object[][]{ - //chrX haploid sample plus diploid sample + //chrX haploid sample plus diploid sample -- expected results validated with vcf-validator (samtools?) {new File[]{getTestFile("NA12891.chrX.haploid.rb.g.vcf"), getTestFile("NA12892.chrX.diploid.rb.g.vcf")}, - getTestFile("lotsOfAltsNoPLs.vcf"), null, Arrays.asList(new SimpleInterval("chrX", 1000000, 5000000)), Arrays.asList("--merge-input-intervals", "--only-output-calls-starting-in-intervals"), b38_reference_20_21}, + getTestFile("haploidPlusDiploid.expected.vcf"), null, Arrays.asList(new SimpleInterval("chrX", 1000000, 5000000)), Arrays.asList("--merge-input-intervals", "--only-output-calls-starting-in-intervals"), b38_reference_20_21}, //8 ALT alleles -- no PLs {new File[]{getTestFile("sample6.vcf"), getTestFile("sample7.vcf"), getTestFile("sample8.vcf"), getTestFile("sample9.vcf")}, diff --git a/src/test/resources/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/GnarlyGenotyper/haploidPlusDiploid.expected.vcf b/src/test/resources/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/GnarlyGenotyper/haploidPlusDiploid.expected.vcf new file mode 100644 index 00000000000..1e731ab0791 --- /dev/null +++ b/src/test/resources/org/broadinstitute/hellbender/tools/walkers/GnarlyGenotyper/haploidPlusDiploid.expected.vcf @@ -0,0 +1,14758 @@ +##fileformat=VCFv4.2 +##ALT= +##FILTER= +##FILTER= +##FORMAT= +##FORMAT= +##FORMAT= +##FORMAT= +##FORMAT= +##FORMAT= +##FORMAT= +##FORMAT= +##FORMAT= +##FORMAT= +##GATKCommandLine= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##INFO= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##contig= +##source=HaplotypeCaller +#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT NA12891 NA12892 +chrX 1000523 . AT A 231.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=6.95;BaseQRankSum=-0.353;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=4.978;MQ=58.65;MQRankSum=0.787;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.200;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,450 0|1:23,16:39:99:.:0|1:1000523_AT_A:271,0,363:1000523:7,16,8,8 +chrX 1000524 . T A,* 3280 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=49,16;AS_QD=25.36,0.00;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.98;QD=50.92;SOR=1.342;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26,0:26:99:.:.:1086,0,948:.:0,0,6,12 1|2:0,23,16:39:99:1|0:1000523_AT_A:2224,426,271,519,0,363:1000523:0,0,15,24 +chrX 1000527 . T A 3804 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=30.97;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.01;QD=44.58;SOR=0.947;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,34:34:99:.:.:1495,0:.:0,0,14,20 1|1:0,52:52:99:0|1:1000523_AT_A:2339,157,0:1000523:0,0,24,28 +chrX 1001211 . C CA 42.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=2.48;BaseQRankSum=-0.534;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=14.829;MQ=59.12;MQRankSum=-1.189;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.41;SOR=1.012;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,19:33:82:.:82,0:11,3,7,12 0/0:.:54:28:49:0,28,1314 +chrX 1002155 . C T 3508 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=33.38;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.38;SOR=1.189;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1450,0:0,0,23,19 1/1:0,64:64:99:2088,192,0:0,0,41,23 +chrX 1002419 . A G 724 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=7.39;BaseQRankSum=-0.026;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=6.303;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.549;SOR=0.808;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,28:51:99:108,0:8,15,14,14 0/1:26,25:51:99:646,0,731:13,13,16,9 +chrX 1003019 . T C 3761 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.68;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.68;SOR=1.047;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1782,0:0,0,25,28 1/1:0,63:63:99:2009,188,0:0,0,24,39 +chrX 1003441 . A G 3045 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=32.03;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=32.03;SOR=0.870;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1641,0:0,0,22,29 1/1:0,45:45:99:1434,135,0:0,0,22,23 +chrX 1003976 . G A 455 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.33;BaseQRankSum=0.223;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;MQRankSum=0.799;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=0.582;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,373 0/1:33,19:52:99:.:485,0,935:20,13,11,8 +chrX 1004323 . CTCTT C 692.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=17.85;BaseQRankSum=1.72;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=10.428;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.080;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,373 0/1:22,19:41:99:.:732,0,856:4,18,9,10 +chrX 1004381 . C CTCTT 3701.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=30.62;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;QD=44.01;SOR=0.922;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1908,0:0,0,20,23 1/1:0,42:42:99:1833,126,0:0,0,18,24 +chrX 1004402 . C CTT,A 1401 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,26;AS_QD=32.13,26.80;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;QD=34.07;SOR=1.127;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,540,540 1/2:0,16,26:42:99:.:1431,971,917,458,0,765:0,0,25,17 +chrX 1004407 . T TA 944.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=19.68;BaseQRankSum=-1.565;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.34;MQRankSum=1.641;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.28;SOR=0.660;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:99:51:.:.:0,540 0|1:22,28:50:99:.:0|1:1004407_T_TA:984,0,801:1004407:12,10,15,13 +chrX 1004412 . T TA 797.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.20;BaseQRankSum=-0.827;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.162;MQ=59.30;MQRankSum=1.525;QD=18.20;ReadPosRankSum=1.023;SOR=1.041;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:99:51:.:.:0,540 0|1:22,24:46:99:.:0|1:1004407_T_TA:837,0,813:1004407:12,10,15,9 +chrX 1004528 . A G 347 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=6.73;BaseQRankSum=-0.46;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.053;MQ=59.83;MQRankSum=-1.122;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.906;SOR=0.493;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,34:56:99:.:377,0:13,9,18,16 0/0:.:56:55:56:0,55,1166 +chrX 1004768 . AATAT A 719.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=9.61;BaseQRankSum=-0.282;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=6.018;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.843;SOR=1.266;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,48:79:99:.:759,0:15,16,30,18 0/0:.:56:55:56:0,55,1166 +chrX 1004902 . T TAAG 1744.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=12.65;BaseQRankSum=0.971;DP=155;ExcessHet=0.0000;FS=8.799;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.794;SOR=0.462;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,40:73:99:334,0:20,13,19,21 0/1:31,37:68:99:1450,0,1191:19,12,18,19 +chrX 1005166 . T C 672 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.33;BaseQRankSum=0.933;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.33;ReadPosRankSum=1.381;SOR=0.476;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:76:99:76:0,1619 0/1:24,25:49:99:.:702,0,646:9,15,11,14 +chrX 1005288 . G C 807 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=8.05;BaseQRankSum=2.717;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=4.750;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.252;SOR=0.605;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,26:47:99:154,0:13,8,12,14 0/1:30,27:57:99:683,0,652:16,14,13,14 +chrX 1005396 . G T 761 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.41;BaseQRankSum=-2.005;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.662;MQ=59.63;MQRankSum=-0.916;QD=13.41;ReadPosRankSum=1.23;SOR=0.321;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,1270 0/1:28,31:59:99:.:791,0,742:18,10,16,15 +chrX 1005591 . C T 184 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=4.76;BaseQRankSum=-0.948;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=4.364;MQ=59.25;MQRankSum=0.257;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.537;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,26:45:99:.:214,0:12,7,12,14 0/0:.:32:38:31:0,38,875 +chrX 1005628 . CAAAAAAAAAA C,CAAAAAA,CAAAA 1002.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=23,10,6;AS_QD=17.65,18.17,18.36;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=43.880;MQ=57.94;MQRankSum=2.499;QD=22.17;SOR=2.538;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:4,9,10,0:23:99:327,420,0,610:0,4,17,2 1/3:4,14,0,6:24:99:715,168,598,743,461,995,458,0,560,500:0,4,14,6 +chrX 1005719 . T C 3439 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=31.83;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.83;SOR=1.483;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2127,0:0,0,46,20 1/1:0,43:43:99:1342,127,0:0,0,25,18 +chrX 1006053 . T TGC 482.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.60;BaseQRankSum=1.076;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=8.834;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.60;ReadPosRankSum=2.231;SOR=1.518;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,99 0/1:26,19:45:99:.:522,0,933:11,15,13,6 +chrX 1006057 . C T,CGTGT 834 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=19,0;AS_QD=23.35,12.94;BaseQRankSum=1.157;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=12.992;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.35;ReadPosRankSum=1.794;SOR=1.456;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,99,99 0/1:18,19,0:37:99:.:864,0,918,631,741,1392:6,12,13,6 +chrX 1006320 . T C 897 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.26;BaseQRankSum=1.192;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=8.565;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=1.103;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,99 0/1:31,34:65:99:.:927,0,762:13,18,21,13 +chrX 1006332 . C A 856 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.66;BaseQRankSum=0.435;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=6.366;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.3;SOR=0.687;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,99 0/1:36,34:70:99:.:886,0,935:22,14,15,19 +chrX 1006461 . T A 919 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.38;BaseQRankSum=-0.615;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.26;SOR=0.761;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,99 0/1:31,35:66:99:.:949,0,807:19,12,22,13 +chrX 1006608 . T G 1739 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=13.71;BaseQRankSum=-0.388;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.966;SOR=0.676;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,34:61:99:.:.:365,0:.:13,14,13,21 0|1:32,36:68:99:0|1:1006608_T_G:1404,0,1162:1006608:12,20,17,19 +chrX 1006624 . T C 1873 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=14.31;BaseQRankSum=0.203;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=4.228;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.407;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,38:65:99:.:.:499,0:.:11,16,16,22 0|1:32,36:68:99:0|1:1006608_T_G:1404,0,1163:1006608:11,21,18,18 +chrX 1006956 . TTTTTTATTATTATTA T 313.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=6.19;BaseQRankSum=-1.07;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;MQRankSum=1.618;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.264;SOR=0.646;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,32:57:99:.:353,0:8,5,19,13 0/0:.:48:0:48:0,0,694 +chrX 1006958 . T *,TA 1159.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,34;AS_QD=31.98,27.51;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.629;MQ=59.10;QD=35.26;SOR=0.451;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,32,0:57:99:353,0,1152:8,5,19,13 2/2:0,0,34:34:99:1199,1200,1200,101,102,0:0,0,13,21 +chrX 1006959 . T *,TTA,TTATTA,TTTATTA,TTTATTATTA 1435.97 . AC=1,1,1,0,0;AF=0.333,0.333,0.333,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,10,19,0,0;AS_QD=28.08,23.23,29.03,30.67,26.61;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.655;MQ=59.10;QD=50.86;SOR=0.503;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,32,0,0,0,0:57:99:353,0,1152,1152,1152,1152:8,5,19,13 2/3:0,0,10,19,0,0:29:99:1475,1411,1557,789,803,704,410,443,0,316,1248,1451,705,416,1584,1400,1581,782,442,1605,1784:0,0,10,19 +chrX 1006980 . A T 413 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=8.20;BaseQRankSum=-1.684;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=3.899;MQ=59.70;MQRankSum=1.244;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.009;SOR=1.014;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,32:54:99:.:443,0:10,12,19,13 0/0:.:46:93:46:0,93,1395 +chrX 1007009 . T C 1192 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=11.42;BaseQRankSum=-1.458;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.549;MQ=59.52;MQRankSum=1.735;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.980;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,36:61:99:521,0:16,9,23,13 0/1:19,27:46:99:701,0,523:7,12,14,13 +chrX 1007018 . A G 3996 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=28.55;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=37.98;SOR=0.853;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2269,0:0,0,37,23 1/1:0,46:46:99:1757,137,0:0,0,20,26 +chrX 1007081 . A G 877 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=8.25;BaseQRankSum=-2.137;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.540;MQ=59.96;MQRankSum=1.218;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.522;SOR=0.833;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,38:65:99:323,0:14,13,18,20 0/1:22,23:45:99:584,0,618:11,11,10,13 +chrX 1007312 . A G 591 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.18;BaseQRankSum=-1.419;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.069;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.499;SOR=0.648;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:61:63:0,61 0/1:26,25:51:99:.:621,0,707:12,14,13,12 +chrX 1007424 . C T 4033 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=31.74;BaseQRankSum=2.267;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=31.74;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.415;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1895,0:0,0,35,24 1/1:1,68:69:99:2168,197,0:1,0,40,28 +chrX 1007489 . G T 1039 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=8.76;BaseQRankSum=0.766;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.678;MQ=59.95;MQRankSum=1.187;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.465;SOR=0.600;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,36:63:99:288,0:13,14,16,20 0/1:30,29:59:99:781,0,812:20,10,20,9 +chrX 1007505 . G C 808 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.14;BaseQRankSum=2.696;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.470;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.193;SOR=1.179;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1706 0/1:37,32:69:99:.:838,0,845:23,14,23,9 +chrX 1007655 . C T 5011 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=28.53;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=38.19;SOR=1.205;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2616,0:0,0,25,35 1/1:0,72:72:99:2425,216,0:0,0,27,45 +chrX 1007668 . G A 4842 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=29.52;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.06;SOR=1.092;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:2527,0:0,0,26,32 1/1:0,70:70:99:2345,210,0:0,0,27,43 +chrX 1007715 . G A 996 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=7.66;BaseQRankSum=0.09;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.662;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.66;ReadPosRankSum=2.387;SOR=0.626;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,34:66:91:91,0:14,18,11,23 0/1:31,37:68:99:935,0,800:8,23,15,22 +chrX 1007787 . T C 1334 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=10.91;BaseQRankSum=2.222;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.809;SOR=0.658;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,40:65:99:562,0:13,12,19,21 0/1:31,29:60:99:802,0,856:10,21,10,19 +chrX 1007801 . A G 4627 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=32.91;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.86;SOR=0.848;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2477,0:0,0,36,29 1/1:0,58:58:99:2180,174,0:0,0,21,37 +chrX 1007874 . CT C 1988.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=31.45;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.15;SOR=1.251;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,198 1|1:0,47:47:99:.:0|1:1007874_CT_C:2028,141,0:1007874:0,0,29,18 +chrX 1007876 . T C 135 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=3.44;BaseQRankSum=0.336;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.497;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.952;SOR=0.914;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,26:48:99:.:165,0:10,12,15,11 0/0:.:47:99:47:0,120,1800 +chrX 1007877 . CTT C 125.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=3.44;BaseQRankSum=-0.762;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.497;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=3.44;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.914;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,26:48:99:.:165,0:10,12,15,11 0/0:.:47:99:47:0,120,1800 +chrX 1007878 . T *,C 2123 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,50;AS_QD=31.26,27.76;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.811;MQ=60.00;QD=43.06;SOR=1.023;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,26,0:48:99:.:.:165,0,1139:.:10,12,15,11 2|2:0,0,50:50:99:0|1:1007874_CT_C:2153,2153,2153,150,150,0:1007874:0,0,30,20 +chrX 1007893 . T G 526 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.49;BaseQRankSum=-1.289;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.809;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.496;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:4:58:0,4 0/1:30,23:53:99:.:556,0,1097:18,12,11,12 +chrX 1007916 . C A 643 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.46;BaseQRankSum=-1.034;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.33;SOR=0.682;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:44:68:44:0,68 0/1:24,26:50:99:.:673,0,814:13,11,14,12 +chrX 1007946 . G A 64 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=2.54;BaseQRankSum=-0.419;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.43;MQRankSum=-0.868;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.536;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,20:37:94:.:94,0:6,11,8,12 0/0:.:51:99:51:0,108,1538 +chrX 1008002 . C G 635 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.55;BaseQRankSum=-0.498;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.507;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:99:48:0,110 0/1:27,26:53:99:.:665,0,690:15,12,13,13 +chrX 1008067 . G A 1082 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=10.80;BaseQRankSum=1.177;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.579;MQ=59.77;MQRankSum=1.001;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.884;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,31:55:99:.:.:254,0:.:13,11,15,16 0|1:25,23:48:99:0|1:1008067_G_A:858,0,929:1008067:12,13,15,8 +chrX 1008075 . C T 970 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=9.62;BaseQRankSum=-0.418;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.583;MQ=59.77;MQRankSum=0.963;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.941;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,29:54:99:.:.:160,0:.:13,12,15,14 0|1:27,23:50:99:0|1:1008067_G_A:840,0,991:1008067:13,14,14,9 +chrX 1008120 . A G 3314 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=31.85;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=31.85;SOR=0.833;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1652,0:0,0,29,23 1/1:0,53:53:99:1692,159,0:0,0,27,26 +chrX 1008157 . G A 4260 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=33.85;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=38.65;SOR=0.786;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:1832,0:.:0,0,31,24 1|1:0,56:56:99:0|1:1008157_G_A:2458,169,0:1008157:0,0,27,29 +chrX 1008169 . G T 4100 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=25.42;BaseQRankSum=3.526;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=-0.212;QD=37.21;ReadPosRankSum=1.541;SOR=0.869;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,51:53:99:.:.:1648,0:.:1,1,29,22 1|1:0,58:58:99:0|1:1008157_G_A:2482,174,0:1008157:0,0,30,28 +chrX 1008653 . C T 1091 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=9.50;BaseQRankSum=1.747;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.375;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.808;SOR=1.044;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,32:58:99:209,0:14,12,18,14 0/1:28,32:60:99:912,0,717:13,15,19,13 +chrX 1009311 . C T 4497 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=137;AS_QD=33.04;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.04;SOR=0.708;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2457,0:0,0,35,39 1/1:0,63:63:99:2070,189,0:0,0,34,29 +chrX 1010108 . A G 3570 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=31.86;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.86;SOR=1.179;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1691,0:0,0,19,33 1/1:0,61:61:99:1909,182,0:0,0,26,35 +chrX 1010342 . G T 958 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=14.53;BaseQRankSum=1.77;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.363;MQ=59.82;MQRankSum=-0.913;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=1.201;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:41:34:0,41 0/1:32,36:68:99:.:988,0,768:15,17,13,23 +chrX 1010432 . G A 351 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=8.11;BaseQRankSum=1.011;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.982;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=1.228;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:41:34:0,41 0/1:32,15:47:99:.:381,0,921:10,22,3,12 +chrX 1010495 . G A 108 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=4.76;BaseQRankSum=0.227;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=6.680;MQ=59.48;MQRankSum=0.645;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=1.506;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:41:34:0,41 0/1:22,7:29:99:.:138,0,558:9,13,5,2 +chrX 1010652 . A T 320 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=8.33;BaseQRankSum=-0.192;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=7.134;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.33;ReadPosRankSum=-2.298;SOR=0.169;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:41:34:0,41 0/1:27,15:42:99:.:350,0,763:7,20,7,8 +chrX 1010887 . C G 713 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=9.41;BaseQRankSum=1.606;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=22.511;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.05;SOR=1.785;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,21:42:50:50,0:9,12,12,9 0/1:13,24:37:99:693,0,299:4,9,20,4 +chrX 1011067 . A G 802 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.87;BaseQRankSum=-0.155;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.990;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.63;SOR=0.709;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:21:52:0,21 0/1:28,32:60:99:.:832,0,734:15,13,15,17 +chrX 1011341 . C T 1641 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=14.66;BaseQRankSum=0.067;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=7.311;MQ=58.30;MQRankSum=1.393;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=0.358;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:20,32:52:99:.:.:525,0:.:13,7,16,16 0|1:31,31:62:99:0|1:1011341_C_T:1146,0,1162:1011341:19,12,15,16 +chrX 1011345 . C T 1579 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=14.37;BaseQRankSum=0.435;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.374;MQ=58.29;MQRankSum=1.341;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.360;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:20,31:51:99:.:.:494,0:.:13,7,15,16 0|1:31,30:61:99:0|1:1011341_C_T:1115,0,1165:1011341:19,12,15,15 +chrX 1011486 . G GA 314.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=8.23;BaseQRankSum=0.077;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=6.587;MQ=58.85;MQRankSum=-0.22;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.099;SOR=1.739;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:26:38:0,26 0/1:25,18:43:99:.:354,0,567:13,12,13,5 +chrX 1011523 . A G 1420 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=30.85;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.83;QD=30.85;SOR=0.919;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:26:38:0,26 1/1:0,47:47:99:.:1450,140,0:0,0,26,21 +chrX 1011586 . G A 653 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=1.642;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=5.389;MQ=59.51;MQRankSum=-0.075;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.178;SOR=1.126;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:26:38:0,26 0/1:31,26:57:99:.:683,0,771:17,14,10,16 +chrX 1011618 . T C 724 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=5.94;BaseQRankSum=0.162;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=1.419;MQ=59.57;MQRankSum=-0.184;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.872;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,39:72:99:239,0:13,20,16,23 0/1:32,23:55:99:515,0,838:17,15,10,13 +chrX 1011658 . GA G,AA 766 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=59,1;AS_QD=7.11,0.00;BaseQRankSum=-2.224;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=4.735;MQ=59.53;MQRankSum=-1.067;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=1.193;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,37,1:64:99:282,0,2006:9,17,13,25 0/1:27,22,0:49:99:514,0,638,595,704,1299:15,12,8,14 +chrX 1011734 . A G 910 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=13.06;BaseQRankSum=1.536;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.895;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.06;ReadPosRankSum=2.029;SOR=0.615;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:65:71:0,65 0/1:37,35:72:99:.:940,0,935:17,20,18,17 +chrX 1012152 . G A 1065 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=7.93;BaseQRankSum=3.103;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=1.353;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.33;SOR=0.859;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,39:74:99:149,0:18,17,23,16 0/1:31,33:64:99:946,0,741:17,14,18,15 +chrX 1012190 . A G,T 1178 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=30,2;AS_QD=18.30,10.13;BaseQRankSum=-1.155;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.318;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.585;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:24:64:0,24,24 0/1:36,30,2:68:99:.:1208,0,1371,823,1431,2204:15,21,17,15 +chrX 1012195 . AAATG A 1237.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=18.51;BaseQRankSum=0.854;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=4.697;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.762;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:24:64:0,24 0/1:35,34:69:99:.:1277,0,1347:15,20,19,15 +chrX 1012548 . A AGTATTAATATTAAATATTACTGGATATTTAAG,ATTATTAATATTAAATATTACTGGATATTTAATTATTAATATTAAATATTACTGGATATTTAATTATTAATATTAAATATTACTGGATATTTAAGTATTAATATTAAATATTACTGGATATTTAAG 623.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,0;AS_QD=33.63,30.55;DP=163;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.42;QD=21.39;SOR=0.527;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,0,0:31:7:.:663,0,7:14,17,0,0 0/0:.:86:99:86:0,108,1620,108,1620,1620 +chrX 1012573 . G A 55 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=35;AS_QD=1.27;BaseQRankSum=0.076;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.395;SOR=0.612;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,35:67:85:.:85,0:13,19,15,20 ./.:.:73:.:73:0,0,0 +chrX 1012629 . A G 959 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=14.76;BaseQRankSum=-1.135;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=16.747;MQ=59.97;MQRankSum=1.141;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.083;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1678 0|1:30,37:67:99:.:0|1:1012629_A_G:989,0,1053:1012629:24,6,19,18 +chrX 1012647 . AT A 716.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=5.82;BaseQRankSum=1.073;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=6.730;MQ=59.99;MQRankSum=0;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.199;SOR=1.255;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,30:60:3:.:.:3,0:.:16,14,15,15 0|1:43,27:70:99:1|0:1012629_A_G:753,0,1619:1012629:23,20,22,5 +chrX 1012842 . G A 870 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.43;BaseQRankSum=0.105;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.988;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.836;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:79:69:.:.:0,79 0|1:42,25:67:99:.:0|1:1012842_G_A:900,0,1654:1012842:15,27,8,17 +chrX 1012848 . T C 872 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.46;BaseQRankSum=-1.613;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.988;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.817;SOR=0.836;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:79:69:.:.:0,79 0|1:42,25:67:99:.:0|1:1012842_G_A:902,0,1654:1012842:15,27,8,17 +chrX 1012877 . C A 1021 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=9.30;BaseQRankSum=-0.9;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.421;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.446;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,27:51:99:.:.:145,0:.:12,12,16,11 0|1:37,25:62:99:0|1:1012877_C_A:906,0,1417:1012877:14,23,10,15 +chrX 1012889 . A T 1049 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=9.30;BaseQRankSum=-0.502;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.631;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,28:55:75:.:.:75,0:.:16,11,17,11 0|1:33,28:61:99:0|1:1012877_C_A:1004,0,1281:1012877:13,20,11,17 +chrX 1012978 . C CT 1874.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=17.24;BaseQRankSum=1.307;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.669;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.502;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,36:58:99:.:.:625,0:.:17,5,21,15 0|1:20,33:53:99:0|1:1012978_C_CT:1289,0,740:1012978:12,8,23,10 +chrX 1012980 . T C 1884 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=17.24;BaseQRankSum=0.447;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.669;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.502;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,36:58:99:.:.:625,0:.:17,5,21,15 0|1:20,33:53:99:0|1:1012978_C_CT:1289,0,740:1012978:12,8,23,10 +chrX 1013043 . G T 1108 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=9.03;BaseQRankSum=0.52;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=5.470;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.175;SOR=0.590;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,41:71:99:278,0:16,14,17,24 0/1:24,31:55:99:860,0,604:15,9,17,14 +chrX 1013130 . C T 1021 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=7.40;BaseQRankSum=2.439;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.631;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.37;SOR=0.778;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,36:70:24:24,0:14,20,15,21 0/1:34,38:72:99:1027,0,712:14,20,14,24 +chrX 1013287 . C T 52 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=1.05;BaseQRankSum=2.519;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=11.225;MQ=59.46;MQRankSum=0.942;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.065;SOR=1.206;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:40,38:78:82:.:82,0:17,23,24,14 0/0:.:67:72:67:0,72,1427 +chrX 1013432 . G A 246 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=5.02;BaseQRankSum=-0.109;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=14.936;MQ=58.79;MQRankSum=-0.408;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.516;SOR=1.670;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,30:55:99:.:276,0:15,10,9,21 0/0:.:67:72:67:0,72,1427 +chrX 1013442 . A G 375 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=7.36;BaseQRankSum=1.387;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=15.864;MQ=59.09;MQRankSum=-1.474;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=1.825;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,32:55:99:.:405,0:14,9,9,23 0/0:.:67:72:67:0,72,1427 +chrX 1013452 . G A 375 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=7.36;BaseQRankSum=-1.046;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=12.916;MQ=59.09;MQRankSum=-1.474;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.572;SOR=1.853;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,32:55:99:.:405,0:13,10,9,23 0/0:.:67:72:67:0,72,1427 +chrX 1013464 . C T 510 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=10.00;BaseQRankSum=0.978;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=24.110;MQ=59.07;MQRankSum=-1.386;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.793;SOR=2.468;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,33:54:99:.:540,0:13,8,7,26 0/0:.:67:72:67:0,72,1427 +chrX 1013465 . T C 510 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=10.00;BaseQRankSum=-1.32;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=24.110;MQ=59.07;MQRankSum=-1.386;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.821;SOR=2.468;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,33:54:99:.:540,0:13,8,7,26 0/0:.:67:72:67:0,72,1427 +chrX 1013495 . T C 330 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=6.92;BaseQRankSum=-1.394;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=19.436;MQ=59.69;MQRankSum=-1.195;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.305;SOR=2.252;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,30:52:99:.:360,0:13,9,7,23 0/0:.:67:72:67:0,72,1427 +chrX 1013511 . T C 514 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=5.61;BaseQRankSum=0.573;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=6.476;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.059;SOR=1.304;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,28:53:99:115,0:13,12,8,20 0/1:27,17:44:99:429,0,731:12,15,8,9 +chrX 1013626 . C A 710 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.98;BaseQRankSum=2.523;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=12.127;MQ=58.54;MQRankSum=-0.537;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.447;SOR=1.713;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:64:59:0,64 0/1:30,27:57:99:.:740,0,737:13,17,19,8 +chrX 1013732 . G A 874 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=7.60;BaseQRankSum=-1.794;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=7.350;MQ=59.23;MQRankSum=0.774;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.422;SOR=1.379;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,37:66:99:176,0:17,12,25,12 0/1:23,30:53:99:728,0,642:11,12,20,10 +chrX 1013919 . C CA 420.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=7.80;BaseQRankSum=2.565;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.747;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=1.220;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:27:60:0,27 0/1:37,22:59:99:.:460,0,926:16,21,7,15 +chrX 1014037 . T TA 390.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.24;BaseQRankSum=0.327;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.581;MQ=59.70;MQRankSum=-0.818;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=1.519;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:27:60:0,27 0/1:18,24:42:99:.:430,0,316:9,9,16,8 +chrX 1014207 . C T 561 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.43;BaseQRankSum=-0.483;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.836;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:27:60:0,27 0/1:21,23:44:99:.:591,0,543:8,13,8,15 +chrX 1014401 . A C 518 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.18;BaseQRankSum=1.305;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=2.490;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.182;SOR=1.117;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:27:60:0,27 0/1:28,21:49:99:.:548,0,740:16,12,14,7 +chrX 1014504 . C G 479 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=4.59;BaseQRankSum=1.636;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.705;MQ=59.79;MQRankSum=0.772;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.019;SOR=0.611;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:99:127,0:17,13,14,18 0/1:32,17:49:99:382,0,867:16,16,11,6 +chrX 1014689 . T C 779 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.45;BaseQRankSum=-2.61;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=7.278;MQ=59.60;MQRankSum=-1.256;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.580;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,178 0/1:25,31:56:99:.:809,0,690:9,16,17,14 +chrX 1014740 . CAA C 421.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.81;BaseQRankSum=-0.07;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=1.341;MQ=59.09;MQRankSum=1.323;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.018;SOR=0.412;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,178 0/1:20,16:36:99:.:461,0,569:7,13,7,9 +chrX 1014800 . C A 786 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=18.55;BaseQRankSum=-0.035;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.716;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.55;ReadPosRankSum=2.589;SOR=0.487;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,178 0/1:15,29:44:99:.:816,0,358:9,6,14,15 +chrX 1014853 . C T 825 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.83;BaseQRankSum=0.475;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.869;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=0.337;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:4:55:0,4 0/1:22,32:54:99:.:855,0,533:15,7,18,14 +chrX 1015097 . G A 855 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=10.06;BaseQRankSum=1.832;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=4.146;MQ=59.83;MQRankSum=1.176;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.229;SOR=0.354;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,21:40:99:171,0:12,7,11,10 0/1:21,27:48:99:714,0,536:14,7,15,12 +chrX 1015169 . T C 593 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=0.468;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=5.860;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.194;SOR=0.223;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:37:99:37:0,109 0/1:28,24:52:99:.:623,0,728:19,9,12,12 +chrX 1015202 . A G 511 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=6.22;BaseQRankSum=1.204;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.783;MQ=59.88;MQRankSum=1.584;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.467;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,21:39:99:129,0:12,6,12,9 0/1:30,18:48:99:412,0,754:17,13,9,9 +chrX 1015236 . T C 380 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=5.32;BaseQRankSum=0.446;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=5.862;MQ=59.94;MQRankSum=1.164;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.073;SOR=0.527;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,21:38:99:111,0:11,6,11,10 0/1:26,13:39:99:299,0,727:15,11,5,8 +chrX 1015320 . G A 469 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.88;BaseQRankSum=2.285;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.221;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.513;SOR=0.460;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,99 0/1:24,18:42:99:.:499,0,648:9,15,8,10 +chrX 1015436 . C A,T 456 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,18;AS_QD=0.00,11.30;BaseQRankSum=-0.309;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.420;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.498;SOR=0.811;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:4:63:0,4,4 0/2:25,1,18:44:99:.:486,602,1861,0,828,720:15,10,8,11 +chrX 1015482 . C G 464 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.50;BaseQRankSum=-1.825;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.478;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:58:44:0,58 0/1:31,21:52:99:.:494,0,902:19,12,10,11 +chrX 1015725 . G A 129 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=3.31;BaseQRankSum=1.042;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.512;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=1.220;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,26:48:99:.:159,0:11,11,16,10 0/0:.:58:91:58:0,91,1448 +chrX 1015850 . G A 4152 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=32.93;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.93;SOR=0.843;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1925,0:0,0,27,32 1/1:0,68:68:99:2257,204,0:0,0,32,36 +chrX 1016071 . C T 286 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=4.79;BaseQRankSum=-0.169;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.071;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.286;SOR=1.002;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,38:66:99:.:316,0:15,13,23,15 0/0:.:63:99:63:0,105,1800 +chrX 1016187 . C T 965 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=21.63;BaseQRankSum=-2.155;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.512;MQ=59.51;MQRankSum=0.188;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.641;SOR=0.392;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:39:50:.:.:0,39 0|1:20,26:46:99:.:0|1:1016187_C_T:995,0,751:1016187:12,8,13,13 +chrX 1016188 . A G 965 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=21.63;BaseQRankSum=-1.42;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.512;MQ=59.51;MQRankSum=0.188;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.517;SOR=0.392;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:39:50:.:.:0,39 0|1:20,26:46:99:.:0|1:1016187_C_T:995,0,751:1016187:12,8,13,13 +chrX 1016558 . C G 621 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.63;BaseQRankSum=1.082;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=7.508;MQ=59.77;MQRankSum=0.934;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.636;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:39:50:0,39 0/1:31,25:56:99:.:651,0,794:20,11,11,14 +chrX 1016706 . AT A 375.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.92;BaseQRankSum=-0.307;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=4.815;MQ=59.40;MQRankSum=-0.947;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.927;SOR=1.164;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:39:50:0,39 0/1:19,19:38:99:.:415,0,394:8,11,12,7 +chrX 1016934 . G T 571 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.52;BaseQRankSum=1.358;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=5.874;MQ=59.58;MQRankSum=0;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.17;SOR=1.261;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:39:50:0,39 0/1:26,22:48:99:.:601,0,667:14,12,8,14 +chrX 1017024 . A AT 699.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.96;BaseQRankSum=-0.768;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.037;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.481;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:39:50:0,39 0/1:27,30:57:99:.:739,0,652:17,10,17,13 +chrX 1017767 . A G 617 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.11;BaseQRankSum=-0.141;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.031;MQ=59.94;MQRankSum=0.859;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.389;SOR=1.165;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:39:50:0,39 0/1:38,26:64:99:.:647,0,1058:18,20,16,10 +chrX 1017813 . G A 639 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=6.97;BaseQRankSum=0.822;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.813;MQ=59.38;MQRankSum=0;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=1.103;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,21:41:35:35,0:9,11,4,17 0/1:31,24:55:99:634,0,848:16,15,14,10 +chrX 1017849 . A G 713 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=7.51;BaseQRankSum=2.14;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=8.130;MQ=59.31;MQRankSum=0;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=1.514;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,21:41:85:85,0:11,9,7,14 0/1:32,26:58:99:658,0,927:15,17,9,17 +chrX 1017903 . AAAC A 876.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.96;BaseQRankSum=-1.013;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=5.379;MQ=59.86;MQRankSum=-1.04;QD=16.96;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=1.027;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:16:46:0,16 0/1:29,25:54:99:.:916,0,1119:16,13,10,15 +chrX 1018392 . C A 1047 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=9.88;BaseQRankSum=1.192;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.482;MQ=59.60;MQRankSum=0;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.462;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,31:51:99:363,0:8,12,18,13 0/1:31,27:58:99:714,0,803:14,17,11,16 +chrX 1018753 . G C 694 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.93;BaseQRankSum=-1.275;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;MQRankSum=1.072;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.82;SOR=0.689;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,125 0/1:27,29:56:99:.:724,0,705:14,13,15,14 +chrX 1019304 . C T 611 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.65;BaseQRankSum=-1.785;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.209;SOR=0.662;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,125 0/1:30,25:55:99:.:641,0,858:16,14,12,13 +chrX 1019431 . A G 448 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.26;BaseQRankSum=-0.1;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=9.548;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.97;SOR=0.849;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,125 0/1:19,20:39:99:.:478,0,474:6,13,12,8 +chrX 1019476 . C CA 772.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=23.20;BaseQRankSum=-2.594;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=5.073;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.220;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,125 0|1:14,21:35:99:.:0|1:1019476_C_CA:812,0,513:1019476:4,10,10,11 +chrX 1019482 . T A 782 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=23.20;BaseQRankSum=-1.526;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=5.073;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.220;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,125 0|1:14,21:35:99:.:0|1:1019476_C_CA:812,0,513:1019476:4,10,10,11 +chrX 1019717 . T C 943 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=9.93;BaseQRankSum=0.642;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.669;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.123;SOR=0.854;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,34:57:99:362,0:9,14,18,16 0/1:19,22:41:99:611,0,497:11,8,13,9 +chrX 1020259 . G A 1009 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.43;BaseQRankSum=-0.876;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.958;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=0.830;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,332 0/1:34,38:72:99:.:1039,0,934:16,18,21,17 +chrX 1020922 . CGTCTGACCCTCATTCCTTTTCCTGACTGTACAGTATTCCATTGTGTGTCTCTTCTCCCACTGGGCCTGATGTCTTCAAGGTTCATCCACTCTGCAGCCTGT C 45.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=0.99;BaseQRankSum=-0.279;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=5.719;MQ=58.17;MQRankSum=-2.131;QD=0.988;ReadPosRankSum=-0.04;SOR=1.134;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,332 0/1:70,16:86:85:.:85,0,2724:31,39,10,6 +chrX 1021230 . G A 536 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.51;BaseQRankSum=-0.693;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.43;MQRankSum=0.408;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.157;SOR=0.892;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,332 0/1:16,23:39:99:.:566,0,396:9,7,14,9 +chrX 1022137 . C T 3705 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=31.92;BaseQRankSum=2.395;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.278;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=31.92;ReadPosRankSum=1.562;SOR=0.446;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,70:71:99:2246,0:0,1,33,37 1/1:0,46:46:99:1489,138,0:0,0,29,17 +chrX 1022192 . C T 3254 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=32.20;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=32.20;SOR=0.732;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2074,0:0,0,31,33 1/1:0,38:38:99:1210,113,0:0,0,21,17 +chrX 1022370 . A AT 446.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.85;BaseQRankSum=-1.908;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;MQRankSum=1.125;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.602;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,134 0/1:19,22:41:99:.:486,0,421:9,10,11,11 +chrX 1022408 . G A 474 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=1.393;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=9.199;MQ=59.85;MQRankSum=0.957;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.961;SOR=1.960;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,134 0/1:23,19:42:99:.:504,0,593:12,11,5,14 +chrX 1022417 . GGA G 838.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=18.29;BaseQRankSum=1.02;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=4.047;MQ=59.87;MQRankSum=1.001;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.124;SOR=1.315;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,134 0/1:25,23:48:99:.:878,0,963:12,13,8,15 +chrX 1022436 . T C 2404 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=23.18;BaseQRankSum=0.37;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.365;MQ=59.94;MQRankSum=-0.941;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.454;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1739,0:0,0,29,25 0/1:25,26:51:99:695,0,666:10,15,12,14 +chrX 1022475 . A G 3468 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=32.39;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.39;SOR=0.693;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1716,0:0,0,30,25 1/1:0,53:53:99:1782,159,0:0,0,24,29 +chrX 1022576 . A G 3643 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=32.50;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=32.50;SOR=0.822;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2007,0:0,0,29,33 1/1:0,51:51:99:1666,153,0:0,0,31,20 +chrX 1022599 . T G 3698 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=31.33;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;QD=31.33;SOR=0.744;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2146,0:0,0,33,36 1/1:0,50:50:99:1582,149,0:0,0,28,22 +chrX 1022620 . T C 3963 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=31.20;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=31.20;SOR=0.693;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2361,0:0,0,35,40 1/1:0,53:53:99:1632,158,0:0,0,29,24 +chrX 1023083 . C T 2147 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=18.45;BaseQRankSum=2.854;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=7.385;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.103;SOR=1.452;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,28:55:99:111,0:12,15,11,17 1/1:1,62:63:99:2066,179,0:1,0,18,44 +chrX 1023426 . TTTTATTTATTTA TTTTA,T 1482.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=19,30;AS_QD=5.38,29.76;BaseQRankSum=1.417;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=2.494;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.675;SOR=0.417;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,19,0:34:99:183,0,858:10,5,11,8 2/2:0,0,30:30:93:1339,1339,1339,93,93,0:0,0,17,13 +chrX 1023584 . G A 1691 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.10;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.10;SOR=0.941;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,160 1/1:0,52:52:99:.:1721,156,0:0,0,23,29 +chrX 1023718 . A G 2039 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=14.99;BaseQRankSum=2.778;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=5.990;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.341;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,43:79:99:143,0:14,22,15,28 1/1:1,58:59:99:1926,167,0:0,1,35,23 +chrX 1024094 . A T 741 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.07;BaseQRankSum=-1.615;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.990;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=0.897;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1697 0/1:29,30:59:99:.:771,0,801:14,15,13,17 +chrX 1024113 . T C 802 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.60;BaseQRankSum=-0.983;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.654;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.60;ReadPosRankSum=-2.004;SOR=0.953;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1697 0/1:26,31:57:99:.:832,0,688:14,12,13,18 +chrX 1024365 . T C 1766 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=32.65;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.65;SOR=1.061;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:1796,0:0,0,32,23 0/0:.:54:99:54:0,105,1395 +chrX 1024396 . A C 703 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.45;BaseQRankSum=-1.363;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=7.267;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=1.981;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1484 0/1:16,26:42:99:.:733,0,430:8,8,19,7 +chrX 1024627 . T A 1172 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.78;BaseQRankSum=-1.987;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.36;MQRankSum=-3.879;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.729;SOR=0.704;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,1484 0|1:33,31:64:99:.:0|1:1024627_T_A:1202,0,1272:1024627:17,16,15,16 +chrX 1024631 . C G 834 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.29;BaseQRankSum=0.834;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.938;MQ=54.62;MQRankSum=2.973;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=0.648;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1484 0/1:32,33:65:99:.:864,0,1225:15,17,17,16 +chrX 1024632 . G T 1166 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.12;BaseQRankSum=-0.338;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.34;MQRankSum=-2.955;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.700;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,1484 0|1:35,31:66:99:.:0|1:1024627_T_A:1196,0,1366:1024627:17,18,15,16 +chrX 1024641 . A G 1043 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.31;BaseQRankSum=-0.583;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.948;MQ=53.86;MQRankSum=-3.235;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.836;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,1484 0|1:34,28:62:99:.:0|1:1024627_T_A:1073,0,1313:1024627:17,17,13,15 +chrX 1024696 . G A 712 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.14;BaseQRankSum=0.804;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.114;MQ=49.52;MQRankSum=3.092;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.461;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1484 0/1:22,27:49:99:.:742,0,543:9,13,13,14 +chrX 1024728 . G A 1473 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=29.47;BaseQRankSum=1.36;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.85;MQRankSum=1.116;QD=29.47;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.614;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,48:51:99:.:1503,0:2,1,28,20 0/0:.:39:87:39:0,87,1211 +chrX 1024762 . G C 352 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=9.55;BaseQRankSum=-0.049;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.267;MQ=40.51;MQRankSum=1.002;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.713;SOR=1.015;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1623 0/1:25,15:40:99:.:382,0,694:12,13,6,9 +chrX 1024785 . C T 2951 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.76;BaseQRankSum=-0.253;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=44.99;MQRankSum=-1.469;QD=32.76;ReadPosRankSum=0.536;SOR=0.352;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,54:55:99:1781,0:1,0,32,22 1/1:0,36:36:99:1200,108,0:0,0,19,17 +chrX 1024812 . G A 730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.54;BaseQRankSum=0.017;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.925;MQ=46.04;MQRankSum=-1.765;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.411;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1490 0/1:14,27:41:99:.:760,0,309:9,5,13,14 +chrX 1024956 . C T 708 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.10;BaseQRankSum=-0.99;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=5.076;MQ=57.57;MQRankSum=1.092;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.549;SOR=0.299;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1490 0/1:33,28:61:99:.:738,0,934:12,21,14,14 +chrX 1025071 . G C 705 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.31;BaseQRankSum=1.019;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=4.181;MQ=58.08;MQRankSum=1.666;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.283;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1490 0/1:21,27:48:99:.:735,0,506:7,14,13,14 +chrX 1025127 . A C 1554 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=28.76;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.52;QD=36.84;SOR=1.055;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:18:49:0,18 1/1:0,43:43:99:.:1584,129,0:0,0,25,18 +chrX 1025151 . C T 751 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=20.03;BaseQRankSum=1.66;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=1.252;MQ=59.03;MQRankSum=-0.883;QD=20.03;ReadPosRankSum=2.536;SOR=0.941;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,609 0|1:18,21:39:99:.:0|1:1025151_C_T:781,0,625:1025151:11,7,14,7 +chrX 1025167 . A C 785 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=20.90;BaseQRankSum=1.181;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.03;MQRankSum=-0.78;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.571;SOR=0.859;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,609 0|1:17,22:39:99:.:0|1:1025151_C_T:815,0,601:1025151:11,6,15,7 +chrX 1025224 . T A 356 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=15.44;BaseQRankSum=0.81;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=3.979;MQ=57.73;MQRankSum=-1.12;QD=15.44;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=2.419;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,609 0/1:10,15:25:99:.:386,0,233:9,1,15,0 +chrX 1025382 . T A 2211 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=22.64;BaseQRankSum=0.113;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.893;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=22.64;ReadPosRankSum=0.33;SOR=0.548;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1478,0:0,0,19,27 0/1:25,28:53:99:763,0,670:9,16,11,17 +chrX 1025461 . G A 601 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.88;BaseQRankSum=2.644;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=4.022;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.780;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,158 0/1:26,23:49:99:.:631,0,592:11,15,13,10 +chrX 1025641 . G C 905 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.61;BaseQRankSum=0.027;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.964;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.04;SOR=0.900;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,158 0/1:29,35:64:99:.:935,0,716:16,13,21,14 +chrX 1025683 . G C 3671 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=31.91;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=31.91;SOR=0.918;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1741,0:0,0,29,25 1/1:0,62:62:99:1960,186,0:0,0,35,27 +chrX 1025917 . T C 656 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.70;BaseQRankSum=-1.318;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.062;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.527;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1457 0/1:26,28:54:99:.:686,0,682:17,9,17,11 +chrX 1025922 . G T 2188 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=28.86;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.47;QD=44.36;SOR=0.693;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2218,0:0,0,25,25 0/0:.:60:99:60:0,110,1534 +chrX 1025924 . C T 2188 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=31.11;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.52;QD=44.36;SOR=0.693;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2218,0:0,0,25,25 0/0:.:60:99:60:0,110,1534 +chrX 1025967 . A G 248 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=4.88;BaseQRankSum=-0.184;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.907;MQ=57.66;MQRankSum=-2.523;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.679;SOR=0.301;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,33:57:99:.:278,0:7,17,14,19 0/0:.:60:99:60:0,110,1534 +chrX 1026022 . G A 110 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=2.50;BaseQRankSum=1.687;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.458;MQ=57.44;MQRankSum=-2.944;QD=2.50;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=0.392;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,29:56:99:.:140,0:7,20,10,19 0/0:.:60:99:60:0,110,1534 +chrX 1026294 . A G 859 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.88;BaseQRankSum=-0.026;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;MQRankSum=0.51;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.006;SOR=0.752;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,223 0/1:36,33:69:99:.:889,0,964:18,18,17,16 +chrX 1026350 . A G 4166 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=31.55;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=31.55;SOR=0.708;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1964,0:0,0,29,33 1/1:0,71:71:99:2232,213,0:0,0,38,33 +chrX 1026439 . TC T 881.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.75;BaseQRankSum=0.489;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.462;SOR=0.781;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1722 0/1:35,32:67:99:.:921,0,1058:15,20,13,19 +chrX 1026709 . G C 2483 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=24.16;BaseQRankSum=0.547;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.884;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.16;ReadPosRankSum=0.689;SOR=0.908;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1802,0:0,0,29,24 0/1:24,27:51:99:711,0,597:12,12,15,12 +chrX 1026918 . T TCC 320.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=18.95;BaseQRankSum=0.088;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.308;SOR=0.818;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,920 0|1:9,10:19:99:.:0|1:1026918_T_TCC:360,0,351:1026918:2,7,2,8 +chrX 1026927 . T TCCTCCTCCACCTCCCCC 470.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=23.18;BaseQRankSum=1.346;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.643;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.18;ReadPosRankSum=-1.387;SOR=1.938;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,920 0|1:9,13:22:99:.:0|1:1026918_T_TCC:510,0,339:1026918:2,7,1,12 +chrX 1027040 . C T 2848 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=33.86;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=33.86;SOR=1.039;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1707,0:0,0,29,22 1/1:0,34:34:99:1171,102,0:0,0,20,14 +chrX 1027089 . C T 449 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.09;BaseQRankSum=0.042;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=9.298;MQ=59.76;MQRankSum=-0.941;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.516;SOR=0.064;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1697 0/1:17,17:34:99:.:479,0,479:15,2,10,7 +chrX 1027238 . A G 3975 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=32.30;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.30;SOR=1.107;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2030,0:0,0,35,27 1/1:0,62:62:99:1975,185,0:0,0,38,24 +chrX 1027289 . ATCAC A 1256.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=20.57;BaseQRankSum=0.995;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.495;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.494;SOR=1.170;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:44:64:.:.:0,44 0|1:30,33:63:99:.:0|1:1027289_ATCAC_A:1296,0,1160:1027289:17,13,22,11 +chrX 1027295 . CGGTATTTGT C 1240.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=18.82;BaseQRankSum=0.465;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.349;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.922;SOR=1.142;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:44:64:.:.:0,44 0|1:35,33:68:99:.:0|1:1027289_ATCAC_A:1280,0,1370:1027289:20,15,22,11 +chrX 1027306 . C T 1257 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=1.998;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=2.130;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.50;ReadPosRankSum=1.293;SOR=1.121;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:44:64:.:.:0,44 0|1:33,33:66:99:.:0|1:1027289_ATCAC_A:1287,0,1286:1027289:19,14,22,11 +chrX 1027532 . TTTTCTTTC T 672.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=14.83;BaseQRankSum=-0.195;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.948;SOR=0.791;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:44:64:0,44 0/1:29,19:48:99:.:712,0,1154:13,16,8,11 +chrX 1027660 . C CTT 1577.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=24.50;BaseQRankSum=-0.285;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.38;MQRankSum=-0.941;QD=24.50;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.874;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,15:15:99:.:.:618,0:.:0,0,0,7 0|1:25,26:51:99:0|1:1027660_C_CTT:999,0,962:1027660:6,19,7,19 +chrX 1027662 . C CTCT 1620.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=24.78;BaseQRankSum=-1.638;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.182;MQ=59.34;MQRankSum=-0.924;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.437;SOR=0.917;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,15:15:99:.:.:618,0:.:0,0,0,7 0|1:25,27:52:99:0|1:1027660_C_CTT:1042,0,958:1027660:6,19,7,20 +chrX 1027672 . C T 1880 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=27.29;BaseQRankSum=-0.778;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;MQRankSum=-0.917;QD=27.29;ReadPosRankSum=-0.149;SOR=0.555;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,22:22:99:.:.:930,0:.:0,0,2,12 0|1:23,25:48:99:0|1:1027660_C_CTT:980,0,891:1027660:5,18,8,17 +chrX 1027679 . T TTCTC 1919.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=27.59;BaseQRankSum=-0.905;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;MQRankSum=-0.936;QD=27.59;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.789;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1020,0:.:0,0,2,14 0|1:23,24:47:99:0|1:1027660_C_CTT:939,0,894:1027660:6,17,8,16 +chrX 1027701 . T TTTCC 2305.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=27.92;BaseQRankSum=-0.043;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.822;MQ=58.92;MQRankSum=-1.428;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=1.368;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1335,0:.:0,0,4,19 0|1:27,26:53:99:0|1:1027660_C_CTT:1010,0,1055:1027660:9,18,7,19 +chrX 1027721 . C T 2459 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=29.63;BaseQRankSum=0.86;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.366;MQ=58.83;MQRankSum=-1.675;QD=29.63;ReadPosRankSum=-0.96;SOR=1.087;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,34:34:99:.:.:1470,0:.:0,0,4,22 0|1:24,26:50:99:0|1:1027660_C_CTT:1019,0,929:1027660:7,17,8,18 +chrX 1027741 . T TTC 2678.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=30.54;BaseQRankSum=-0.466;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=7.335;MQ=58.64;MQRankSum=-2.001;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.413;SOR=1.617;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,40:40:99:.:.:1740,0:.:0,0,6,26 0|1:24,25:49:99:0|1:1027660_C_CTT:978,0,933:1027660:9,15,7,18 +chrX 1027745 . C CTTTTCTTCTTTCTCTT,CTTTTTTTCTTTCTCTT 2582.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=57,2;AS_QD=31.98,15.11;BaseQRankSum=0.141;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=7.414;MQ=58.70;MQRankSum=-2.085;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.68;SOR=1.735;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33,2:35:99:.:.:1690,0,1282:.:0,0,6,26 0|1:25,24,0:49:99:0|1:1027660_C_CTT:932,0,966,1008,1039,2046:1027660:10,15,7,17 +chrX 1027779 . T TTCTC 3881.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=21.53;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.23;QD=42.62;SOR=1.346;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1961,0:0,0,17,29 1/1:0,46:46:99:1960,138,0:0,0,17,29 +chrX 1027800 . C CT 604.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=15.71;BaseQRankSum=-0.58;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.498;MQ=59.79;MQRankSum=0.978;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.203;SOR=0.451;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:48:99:48:.:.:0,950 0|1:22,19:41:99:.:0|1:1027800_C_CT:644,0,793:1027800:8,14,10,9 +chrX 1027828 . T C 682 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=16.18;BaseQRankSum=-0.758;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=2.498;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.933;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:48:99:48:.:.:0,950 0|1:23,21:44:99:.:0|1:1027800_C_CT:712,0,833:1027800:11,12,12,9 +chrX 1027982 . G C 2781 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=31.58;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.58;SOR=0.761;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1423,0:0,0,25,19 1/1:0,45:45:99:1388,134,0:0,0,18,27 +chrX 1028049 . C CTTCCTTCCTTCT 424.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=18.56;BaseQRankSum=-0.282;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=6.239;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.56;ReadPosRankSum=-2.153;SOR=0.707;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:99:50:0,1324 0/1:13,12:25:99:.:464,0,472:4,9,7,5 +chrX 1028201 . A G 4144 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=27.86;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=44.88;SOR=0.852;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,42:42:99:.:.:1890,0:.:0,0,21,21 1|1:0,51:51:99:0|1:1028201_A_G:2284,154,0:1028201:0,0,29,22 +chrX 1028203 . G C 4179 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=28.60;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=44.78;SOR=0.874;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,42:42:99:.:.:1890,0:.:0,0,21,21 1|1:0,52:52:99:0|1:1028201_A_G:2319,157,0:1028201:0,0,30,22 +chrX 1028205 . G A 4179 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.11;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=44.78;SOR=0.924;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,42:42:99:.:.:1890,0:.:0,0,21,21 1|1:0,52:52:99:0|1:1028201_A_G:2319,157,0:1028201:0,0,31,21 +chrX 1028213 . G A 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.08;BaseQRankSum=1.275;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.576;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1459 0|1:26,24:50:99:.:0|1:1028201_A_G:654,0,683:1028201:16,10,14,10 +chrX 1028567 . T C 523 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.29;BaseQRankSum=-0.317;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.424;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.552;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1459 0/1:26,23:49:99:.:553,0,672:11,15,12,11 +chrX 1028649 . G C 3221 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=25.20;BaseQRankSum=1.947;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.473;SOR=0.763;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2345,0:0,0,31,41 0/1:26,31:57:99:906,0,702:12,14,15,16 +chrX 1029274 . G A 503 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.84;BaseQRankSum=0.058;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.364;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.84;ReadPosRankSum=-2.231;SOR=1.508;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1667 0/1:24,21:45:99:.:533,0,629:12,12,7,14 +chrX 1029445 . C G 3129 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=26.33;BaseQRankSum=2.931;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.905;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.33;ReadPosRankSum=2.384;SOR=0.818;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2256,0:0,0,35,34 0/1:20,31:51:99:903,0,462:10,10,18,13 +chrX 1029617 . A G 4360 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=33.51;BaseQRankSum=0.32;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=8.883;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.51;ReadPosRankSum=1.225;SOR=0.365;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:3158,0:.:0,0,38,34 0|1:27,32:59:99:0|1:1029617_A_G:1232,0,1006:1029617:18,9,12,20 +chrX 1029625 . A G 4373 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=33.36;BaseQRankSum=-0.461;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=6.961;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.36;ReadPosRankSum=0.959;SOR=0.346;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3143,0:.:0,0,38,33 0|1:28,33:61:99:0|1:1029617_A_G:1260,0,1035:1029617:18,10,13,20 +chrX 1029650 . G A 3429 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=24.88;BaseQRankSum=2.037;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=5.457;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=0.317;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2456,0:0,0,39,37 0/1:27,36:63:99:1003,0,590:17,10,17,19 +chrX 1029806 . T C 2315 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=21.51;BaseQRankSum=-0.804;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=5.856;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=21.51;ReadPosRankSum=-2.054;SOR=0.280;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1596,0:0,0,24,29 0/1:26,30:56:99:749,0,687:9,17,17,13 +chrX 1029919 . T TAAAAAAA 569.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.23;BaseQRankSum=0.998;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.15;MQRankSum=-1.63;QD=15.23;ReadPosRankSum=-2.371;SOR=0.657;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,1754 0|1:23,17:40:99:.:0|1:1029919_T_TAAAAAAA:609,0,838:1029919:15,8,11,6 +chrX 1029934 . A AAC 3295.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.70;BaseQRankSum=-0.15;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.945;MQ=59.69;MQRankSum=1.662;QD=32.70;ReadPosRankSum=-0.024;SOR=0.527;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2421,0:.:0,0,24,32 0|1:20,26:46:99:1|0:1029919_T_TAAAAAAA:914,0,672:1029919:11,9,17,9 +chrX 1030044 . C T 2810 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=23.47;BaseQRankSum=4.026;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=6.613;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.47;ReadPosRankSum=1.423;SOR=0.876;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2025,0:0,0,36,24 0/1:32,29:61:99:815,0,769:14,18,15,14 +chrX 1030110 . A T 2662 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=24.25;BaseQRankSum=-0.245;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=0.702;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1817,0:0,0,25,29 0/1:26,31:57:99:875,0,712:10,16,8,23 +chrX 1030169 . G A 2537 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=23.13;BaseQRankSum=-0.113;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=23.13;ReadPosRankSum=1.297;SOR=0.785;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1859,0:0,0,26,30 0/1:28,27:55:99:708,0,758:12,16,8,19 +chrX 1030259 . A G 2216 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=22.02;BaseQRankSum=-1.394;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.128;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=22.02;ReadPosRankSum=0.211;SOR=1.183;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1623,0:0,0,16,34 0/1:27,25:52:99:623,0,731:12,15,10,15 +chrX 1030893 . T C 2468 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=25.23;BaseQRankSum=-2.465;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.985;MQ=59.89;MQRankSum=1.248;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.532;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1836,0:0,0,27,28 0/1:18,26:44:99:662,0,469:10,8,14,12 +chrX 1030969 . CAA C 2097.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=30.10;BaseQRankSum=2.101;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=2.298;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=30.10;ReadPosRankSum=-0.833;SOR=0.445;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,43:44:99:.:.:1768,0:.:0,1,18,25 0|1:17,10:27:99:0|1:1030969_CAA_C:369,0,673:1030969:6,11,4,6 +chrX 1030981 . A T 1646 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=19.72;BaseQRankSum=3.831;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=6.123;MQ=58.95;MQRankSum=-0.794;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=0.285;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:6,48:54:99:.:.:1286,0:.:0,6,24,24 0|1:20,11:31:99:0|1:1030969_CAA_C:390,0,761:1030969:9,11,5,6 +chrX 1031033 . C A 2678 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.24;BaseQRankSum=2.288;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.50;MQRankSum=-1.166;QD=32.24;ReadPosRankSum=-0.91;SOR=0.710;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2183,0:.:0,0,29,20 0|1:21,14:35:99:0|1:1031033_C_A:525,0,840:1031033:12,9,7,7 +chrX 1031038 . G GGAGAAAGAGA 2638.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.88;BaseQRankSum=0.647;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.95;MQRankSum=-1.697;QD=31.88;ReadPosRankSum=-1.846;SOR=0.807;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47:47:99:.:.:2114,0:.:0,0,30,17 0|1:22,15:37:99:0|1:1031033_C_A:564,0,879:1031033:13,9,8,7 +chrX 1031048 . A AAAT 2246.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=30.48;BaseQRankSum=-0.849;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.185;MQ=57.00;MQRankSum=-2.488;QD=30.48;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=1.041;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,42:42:99:.:.:1890,0:.:0,0,28,14 0|1:22,11:33:99:0|1:1031033_C_A:396,0,891:1031033:13,9,7,4 +chrX 1031053 . G GAAAGA 2189.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.12;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.917;MQ=56.74;QD=30.12;SOR=1.721;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1835,0:.:0,0,2,0 0|1:22,11:33:99:0|1:1031053_G_GAAAGA:394,0,891:1031053:13,9,0,0 +chrX 1031058 . AG A 41.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=30.49;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.39;QD=40.50;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,2:2:81:.:81,0:0,0,2,0 0/0:.:31:24:31:0,24,919 +chrX 1031059 . GGAGA *,G 266.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,9;AS_QD=0.00,9.27;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.764;MQ=58.38;QD=9.27;SOR=1.508;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,2,0:2:81:.:.:81,0,90:.:0,0,2,0 0|2:24,0,9:33:99:0|1:1031059_GGAGA_G:306,203,1184,0,1008,981:1031059:15,9,0,0 +chrX 1031067 . AC A 131.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=29.53;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.44;QD=42.75;SOR=3.258;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,4:4:99:.:171,0:0,0,4,0 0/0:.:32:58:32:0,58,968 +chrX 1031068 . C *,A 276 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,9;AS_QD=0.00,9.27;BaseQRankSum=0.666;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=8.158;MQ=57.69;MQRankSum=-4.695;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.589;SOR=2.712;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,4,0:4:99:.:.:171,0,180:.:0,0,4,0 0|2:24,0,9:33:99:0|1:1031059_GGAGA_G:306,221,1204,0,1008,981:1031059:15,9,1,0 +chrX 1031070 . G GGAA 131.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=30.36;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.31;QD=42.75;SOR=3.258;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,4:4:99:.:171,0:0,0,4,0 0/0:.:31:58:31:0,58,978 +chrX 1031079 . G A 142 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=27.97;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.30;QD=43.00;SOR=3.258;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,4:4:99:.:172,0:0,0,4,0 0/0:.:31:0:31:0,0,640 +chrX 1031084 . A G,* 144 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=4,0;AS_QD=35.21,35.18;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=5.374;MQ=53.13;QD=43.50;SOR=2.368;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,4,0:4:99:.:.:174,0,284:.:0,0,4,0 0|2:24,0,2:26:7:0|1:1031059_GGAGA_G:7,79,1087,0,1008,1001:1031059:17,7,2,0 +chrX 1031085 . ATG *,A 134.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,4;AS_QD=32.25,34.86;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=5.374;MQ=53.13;QD=43.50;SOR=2.368;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,4:4:99:.:.:174,386,0:.:0,0,4,0 0|1:24,2,0:26:7:0|1:1031059_GGAGA_G:7,0,1001,79,1008,1087:1031059:17,7,2,0 +chrX 1031095 . G GA 54.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=3.48;BaseQRankSum=1.033;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=2.634;MQ=56.78;MQRankSum=-3.588;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.912;SOR=1.565;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,630 0|1:23,4:27:94:.:0|1:1031059_GGAGA_G:94,0,953:1031059:17,6,4,0 +chrX 1031101 . AG A 102.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=5.46;BaseQRankSum=0.266;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.91;MQRankSum=-3.782;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=0.394;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,630 0|1:21,5:26:99:.:0|1:1031059_GGAGA_G:142,0,866:1031059:17,4,4,1 +chrX 1031102 . G GA,GAA,* 1577.97 . AC=0,1,1;AF=0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,7,0;AS_QD=29.05,31.88,0.00;BaseQRankSum=1.383;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=4.152;MQ=53.36;MQRankSum=-1.611;QD=179.67;ReadPosRankSum=1.383;SOR=1.718;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:2,0,7,0:9:99:.:.:1617,358,0,622:.:0,2,6,0 0|3:21,0,0,5:26:99:0|1:1031059_GGAGA_G:142,205,1087,205,1087,1087,0,882,882,866:1031059:17,4,4,1 +chrX 1031108 . GA G 180.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=7.33;BaseQRankSum=0.88;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.64;MQRankSum=-2.481;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.092;SOR=1.048;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,360 0|1:23,7:30:99:.:0|1:1031059_GGAGA_G:220,0,944:1031059:17,6,6,1 +chrX 1031126 . A T 310 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=10.97;BaseQRankSum=-1.816;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.920;MQ=55.46;MQRankSum=-1.181;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.200;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:65:65:.:.:0,65 0|1:20,11:31:99:.:0|1:1031059_GGAGA_G:340,0,807:1031059:16,4,7,4 +chrX 1031144 . G GA 619.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=21.26;BaseQRankSum=0.443;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.94;MQRankSum=1.482;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=0.963;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:65:65:.:.:0,65 0|1:14,17:31:99:.:1|0:1031033_C_A:659,0,538:1031033:10,4,13,4 +chrX 1031152 . GA G 589.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=20.97;BaseQRankSum=-0.805;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.94;MQRankSum=1.387;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.874;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:65:65:.:.:0,65 0|1:14,16:30:99:.:1|0:1031033_C_A:629,0,541:1031033:10,4,12,4 +chrX 1031156 . A G 315 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=11.90;BaseQRankSum=-0.307;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=3.638;MQ=56.04;MQRankSum=-1.027;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.777;SOR=0.250;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:65:65:.:.:0,65 0|1:18,11:29:99:.:0|1:1031059_GGAGA_G:345,0,724:1031059:14,4,7,4 +chrX 1031157 . G A 315 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=11;AS_QD=11.90;BaseQRankSum=1.025;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.638;MQ=56.04;MQRankSum=-1.027;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.688;SOR=0.250;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:55:.:55:.:.:0,0 0|1:18,11:29:99:.:0|1:1031059_GGAGA_G:345,0,724:1031059:14,4,7,4 +chrX 1031171 . AG A 299.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=10.94;BaseQRankSum=0.497;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.70;MQRankSum=-1.181;QD=10.94;ReadPosRankSum=2.376;SOR=0.443;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1245 0|1:20,11:31:99:.:0|1:1031059_GGAGA_G:339,0,808:1031059:14,6,7,4 +chrX 1031172 . GAGAAAGAAAGAAAGAAAGA G,GAGAAAGAAAGAAAGA,*,GAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA 2231.97 . AC=1,0,1,1;AF=0.333,0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=28,0,11,10;AS_QD=30.31,29.84,0.00,28.80;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.99;QD=46.35;SOR=1.007;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28,0,0,0:28:99:1208,0,1208,1208,1208:0,0,15,13 3/4:0,0,0,11,10:21:99:1063,1004,1386,905,1076,1499,550,940,665,906,515,454,835,0,834:0,0,13,8 +chrX 1031174 . GA *,G,AA 815 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,11,0;AS_QD=0.00,30.22,31.80;BaseQRankSum=-0.464;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.70;MQRankSum=-0.161;QD=40.24;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.606;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28,0,0:28:99:1208,0,1208,1208:0,0,15,13 0/2:10,0,11,0:21:99:845,395,1022,0,635,771,527,800,559,1086:6,4,7,4 +chrX 1031176 . A *,AGAAAGAAAGAAAG 469.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,10;AS_QD=0.00,24.24;BaseQRankSum=0;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.326;MQ=56.70;MQRankSum=0.242;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.460;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28,0:28:99:1208,0,1208:0,0,15,13 0/2:11,0,10:21:99:509,402,1041,0,414,865:7,4,6,4 +chrX 1031190 . GA *,G 764.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,11;AS_QD=0.00,27.72;BaseQRankSum=0.351;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.097;MQ=56.78;MQRankSum=-1.027;QD=27.72;ReadPosRankSum=2.788;SOR=0.968;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28,0:28:99:1208,0,1208:0,0,15,13 0/2:18,0,11:29:99:804,420,1275,0,703,660:9,9,7,4 +chrX 1031438 . A G 2887 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=23.15;BaseQRankSum=-1.077;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=1.729;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=23.15;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=0.914;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2181,0:0,0,27,42 0/1:28,29:57:99:736,0,742:14,14,17,12 +chrX 1031528 . G GA,A 2015 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=78,1;AS_QD=19.11,0.00;BaseQRankSum=-1.913;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.761;MQ=59.89;MQRankSum=0.948;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.547;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55,0:55:99:1539,0,1539:0,0,29,26 0/1:29,23,1:53:99:506,0,675,638,766,1901:16,13,10,14 +chrX 1031918 . G C 623 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.87;BaseQRankSum=-0.594;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.772;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=0.338;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1494 0/1:29,26:55:99:.:653,0,783:10,19,12,14 +chrX 1032007 . C T 773 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.99;BaseQRankSum=1.91;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=3.397;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.378;SOR=1.255;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1494 0/1:37,30:67:99:.:803,0,920:18,19,11,19 +chrX 1032087 . C G 856 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.29;BaseQRankSum=0.578;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=8.994;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.974;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1494 0/1:29,33:62:99:.:886,0,737:18,11,13,20 +chrX 1032612 . G A 4040 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=32.82;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.82;SOR=0.981;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,78:78:99:2561,0:0,0,48,30 1/1:0,46:46:99:1509,138,0:0,0,22,24 +chrX 1032900 . A G 4976 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=31.18;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=43.16;SOR=0.877;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,64:64:99:.:.:2798,0:.:0,0,24,40 1|1:0,52:52:99:0|1:1032900_A_G:2208,156,0:1032900:0,0,29,23 +chrX 1032915 . T G 5195 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=28.44;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;QD=42.83;SOR=0.831;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,68:68:99:.:.:2901,0:.:0,0,27,41 1|1:0,54:54:99:0|1:1032900_A_G:2324,163,0:1032900:0,0,30,24 +chrX 1032979 . G C 3982 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=34.00;BaseQRankSum=-0.179;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.863;MQ=59.76;MQRankSum=-0.782;QD=34.00;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.560;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2583,0:.:0,0,23,35 0|1:24,36:60:99:0|1:1032979_G_C:1429,0,888:1032979:10,14,20,16 +chrX 1032984 . A G 4068 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=33.87;BaseQRankSum=-0.542;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.857;MQ=59.77;MQRankSum=-0.762;QD=33.87;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.573;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59:59:99:.:.:2617,0:.:0,0,24,35 0|1:24,38:62:99:0|1:1032979_G_C:1481,0,882:1032979:10,14,20,18 +chrX 1033025 . A T 2520 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=22.37;BaseQRankSum=1.749;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=-0.163;QD=22.37;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.728;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,52:53:99:1647,0:0,1,16,36 0/1:26,35:61:99:903,0,966:9,17,13,22 +chrX 1033029 . C T 647 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.92;BaseQRankSum=1.41;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=0.809;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1583 0/1:35,27:62:99:.:677,0,1358:14,21,10,17 +chrX 1033183 . G A 3573 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=33.36;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.36;SOR=0.936;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1673,0:0,0,29,22 1/1:0,57:57:99:1930,171,0:0,0,31,26 +chrX 1033301 . C T 2660 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=23.60;BaseQRankSum=0.958;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.177;MQ=59.38;MQRankSum=0;QD=23.60;ReadPosRankSum=-2.139;SOR=1.116;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1920,0:0,0,39,21 0/1:26,28:54:99:770,0,676:16,10,22,6 +chrX 1033364 . C T 1079 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=19.12;BaseQRankSum=-1.107;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;MQRankSum=-0.966;QD=19.12;ReadPosRankSum=-1.389;SOR=0.693;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1205 0|1:29,29:58:99:.:0|1:1033364_C_T:1109,0,1109:1033364:16,13,16,13 +chrX 1033365 . A G 1079 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=19.12;BaseQRankSum=-1.039;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;MQRankSum=-0.966;QD=19.12;ReadPosRankSum=-1.12;SOR=0.693;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1205 0|1:29,29:58:99:.:0|1:1033364_C_T:1109,0,1109:1033364:16,13,16,13 +chrX 1033493 . A G 1947 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=24.41;BaseQRankSum=0.222;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.375;MQ=57.03;MQRankSum=-3.267;QD=24.41;ReadPosRankSum=0.999;SOR=1.034;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1376,0:0,0,13,22 0/1:23,23:46:99:601,0,822:12,11,11,12 +chrX 1033518 . T C 1910 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=24.56;BaseQRankSum=-0.641;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.923;MQ=56.01;MQRankSum=-3.964;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.2;SOR=0.612;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1168,0:0,0,13,15 0/1:29,22:51:99:772,0,715:13,16,13,9 +chrX 1033564 . T C 725 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.06;BaseQRankSum=-2.864;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=19.319;MQ=52.17;MQRankSum=5.901;QD=16.06;ReadPosRankSum=2.948;SOR=0.035;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,720 0/1:18,29:47:99:.:755,0,609:16,2,15,14 +chrX 1033594 . A G 1692 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=23.27;BaseQRankSum=1.028;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=25.456;MQ=48.14;MQRankSum=-5.571;QD=23.27;ReadPosRankSum=1.629;SOR=3.258;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1204,0:.:0,0,22,5 0|1:32,15:47:99:0|1:1033594_A_G:518,0,1248:1033594:18,14,15,0 +chrX 1033602 . C T 1836 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=23.33;BaseQRankSum=1.678;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=23.416;MQ=48.30;MQRankSum=-5.065;QD=23.33;ReadPosRankSum=1.782;SOR=2.977;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30:30:99:.:.:1288,0:.:0,0,24,6 0|1:33,17:50:99:0|1:1033594_A_G:578,0,1253:1033594:18,15,16,1 +chrX 1033761 . A G 7292 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=259;AS_QD=26.63;BaseQRankSum=-2.567;DP=283;ExcessHet=0.0000;FS=5.039;MQ=57.86;MQRankSum=0.543;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.116;SOR=0.418;VarDP=275 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,166:166:99:4929,0:0,0,92,74 0/1:16,93:109:99:2393,0,195:6,10,41,52 +chrX 1033904 . G A 55 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=1.08;BaseQRankSum=0.937;DP=214;ExcessHet=0.0000;FS=33.075;MQ=57.00;MQRankSum=-6.726;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=3.418;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:131:99:131:.:.:0,362 0|1:68,11:79:85:.:0|1:1033904_G_A:85,0,2284:1033904:45,23,1,10 +chrX 1033910 . T C 1068 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=14.26;BaseQRankSum=-0.329;DP=210;ExcessHet=0.0000;FS=14.464;MQ=56.96;MQRankSum=-4.086;QD=14.26;ReadPosRankSum=-1.393;SOR=0.311;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:131:99:131:.:.:0,362 0|1:37,40:77:99:.:0|1:1033904_G_A:1098,0,961:1033904:27,10,19,21 +chrX 1034005 . A G 4054 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=29.17;BaseQRankSum=4.439;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=3.555;MQ=59.61;MQRankSum=8.833;QD=29.17;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=0.295;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,57:63:99:1785,0:5,1,24,33 1/1:1,76:77:99:2299,204,0:0,1,41,35 +chrX 1034239 . T C 4039 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=31.79;BaseQRankSum=-0.733;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=7.070;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.79;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.568;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,66:68:99:2074,0:0,2,38,28 1/1:0,60:60:99:1995,180,0:0,0,33,27 +chrX 1034344 . T A 5081 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=36.33;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=40.89;SOR=0.709;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2729,0:0,0,30,34 1/1:0,61:61:99:2382,183,0:0,0,32,29 +chrX 1034359 . T C 3226 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=28.81;BaseQRankSum=-3.592;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=28.81;ReadPosRankSum=-0.668;SOR=0.622;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:2555,0:0,0,29,30 0/1:25,29:54:99:701,0,717:13,12,15,14 +chrX 1034415 . CTTTTTTT CTTTTT,C 1849.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=55,0;AS_QD=32.02,0.00;BaseQRankSum=-0.432;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=9.059;MQ=59.38;MQRankSum=-0.218;QD=32.02;ReadPosRankSum=-0.5;SOR=1.447;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27,0:28:99:824,0,826:1,0,8,19 1/1:3,28,0:31:40:1065,40,0,1094,138,1929:2,1,10,18 +chrX 1034422 . T *,C 378 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,15;AS_QD=0.00,10.20;BaseQRankSum=0.04;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.784;MQ=59.69;MQRankSum=-1.239;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.691;SOR=0.363;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,1018,1018 0/2:25,0,15:40:99:.:408,477,1851,0,833,832:9,16,7,8 +chrX 1034587 . G GTTT 470.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=14.17;BaseQRankSum=-2.084;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=14.764;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.162;SOR=2.970;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:99:51:.:.:0,1291 0|1:22,14:36:99:.:0|1:1034587_G_GTTT:510,0,860:1034587:12,10,2,12 +chrX 1034592 . G T 507 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=14.13;BaseQRankSum=-1.197;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=17.088;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=3.119;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:99:51:.:.:0,1291 0|1:23,15:38:99:.:0|1:1034587_G_GTTT:537,0,887:1034587:12,11,2,13 +chrX 1034597 . G GTT,T 3510 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=75,14;AS_QD=34.29,30.05;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.78;SOR=0.761;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56,0:56:99:2219,0,2219:0,0,31,25 1/2:0,19,14:33:99:1321,573,512,746,0,828:0,0,12,21 +chrX 1034872 . TG T 464.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=-0.699;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.250;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.2;SOR=0.976;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:34:60:.:.:0,34 0|1:28,14:42:99:.:0|1:1034872_TG_T:504,0,1128:1034872:14,14,8,6 +chrX 1034876 . T C 474 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=-0.715;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.250;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.976;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:34:60:.:.:0,34 0|1:28,14:42:99:.:0|1:1034872_TG_T:504,0,1128:1034872:14,14,8,6 +chrX 1035084 . G A 1766 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.07;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.07;SOR=0.765;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:34:60:0,34 1/1:0,56:56:99:.:1796,168,0:0,0,29,27 +chrX 1035276 . G C 1186 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=10.39;BaseQRankSum=-1.316;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.710;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.831;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,36:59:99:402,0:8,15,15,21 0/1:26,32:58:99:814,0,660:13,13,12,20 +chrX 1035311 . TCC T 4652.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=28.66;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=0.976;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2674,0:0,0,27,36 1/1:0,47:47:99:2018,142,0:0,0,21,26 +chrX 1035318 . G A 505 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.70;BaseQRankSum=2.158;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=10.731;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.859;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,1340 0/1:30,20:50:99:.:535,0,802:10,20,12,8 +chrX 1035364 . G A 556 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.74;BaseQRankSum=-0.751;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=6.369;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.132;SOR=0.333;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,1340 0/1:23,23:46:99:.:586,0,622:7,16,12,11 +chrX 1035399 . G A 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.62;BaseQRankSum=-1.717;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=0.546;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,1340 0/1:20,27:47:99:.:687,0,748:8,12,12,15 +chrX 1035407 . C T 1850 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=21.12;BaseQRankSum=2.389;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.861;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.605;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1329,0:0,0,22,18 0/1:28,21:49:99:551,0,1071:13,15,9,12 +chrX 1035570 . A G 583 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.57;BaseQRankSum=-1.21;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.57;ReadPosRankSum=-2.15;SOR=0.569;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,1171 0/1:13,24:37:99:.:613,0,322:7,6,12,12 +chrX 1035580 . G C 3330 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=28.50;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.74;SOR=0.780;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1827,0:0,0,26,29 1/1:0,39:39:99:1533,117,0:0,0,19,20 +chrX 1035624 . G A 1599 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=21.16;BaseQRankSum=2.047;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.974;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.91;SOR=0.518;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,39:40:99:1200,0:1,0,20,19 0/1:20,17:37:99:429,0,501:11,9,9,8 +chrX 1035637 . G GA 1706.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=22.97;BaseQRankSum=-0.393;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=0.804;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,40:41:99:956,0:0,1,24,16 1/1:1,34:35:77:790,77,0:1,0,15,19 +chrX 1036076 . G A 3192 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=33.56;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.56;SOR=0.823;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1628,0:0,0,24,25 1/1:0,47:47:99:1594,141,0:0,0,21,26 +chrX 1036406 . AAAAC A 644.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=-0.395;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.760;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,223 0/1:34,19:53:99:.:684,0,1362:19,15,11,8 +chrX 1036731 . G A 142 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=4.53;BaseQRankSum=2.475;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=5.750;MQ=58.85;MQRankSum=0.961;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.555;SOR=1.897;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,20:38:99:.:172,0:9,6,16,4 0/0:.:42:27:37:0,27,936 +chrX 1036734 . A G 2955 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=33.17;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.92;QD=33.17;SOR=1.192;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1367,0:0,0,23,10 1/1:0,53:53:99:1618,158,0:0,0,29,24 +chrX 1036854 . G A 678 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.75;BaseQRankSum=1.642;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=4.156;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.404;SOR=1.133;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:51:41:0,51 0/1:22,26:48:99:.:708,0,530:10,12,16,10 +chrX 1036990 . CT C 35.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=2.59;BaseQRankSum=-1.524;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.70;MQRankSum=-2.159;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.714;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:51:41:0,51 0/1:21,8:29:75:.:75,0,776:6,15,2,6 +chrX 1036995 . T TC 546.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=16.74;BaseQRankSum=1.09;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=5.490;MQ=57.64;MQRankSum=1.783;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=1.890;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:51:41:0,51 0/1:15,20:35:99:.:586,0,419:7,8,5,15 +chrX 1037028 . G C 981 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=31.59;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.70;QD=31.59;SOR=1.911;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:51:41:0,51 1/1:0,32:32:94:.:1011,94,0:0,0,9,23 +chrX 1037077 . T TC 389.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=11.59;BaseQRankSum=-1.577;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.07;MQRankSum=-2.311;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.752;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:51:41:0,51 0/1:25,12:37:99:.:429,0,1002:9,16,4,8 +chrX 1037083 . A C,T 3180 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=57,25;AS_QD=25.31,31.63;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.77;QD=39.15;SOR=0.961;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43,0:43:99:1651,0,1651:0,0,23,20 1/2:0,14,25:39:99:1559,1023,996,536,0,465:0,0,13,26 +chrX 1037099 . T C 877 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=23.26;BaseQRankSum=2.639;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=4.987;MQ=53.67;MQRankSum=2.731;QD=23.26;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.215;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:99:48:0,1285 0/1:16,23:39:99:.:907,0,484:4,12,10,13 +chrX 1037149 . C A 4085 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=35.32;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.59;QD=43.32;SOR=0.714;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2298,0:.:0,0,27,25 1|1:0,43:43:99:0|1:1037149_C_A:1817,129,0:1037149:0,0,21,22 +chrX 1037154 . G A 2407 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.70;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.77;QD=43.52;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:2437,0:0,0,30,26 0/0:.:41:99:41:0,111,1300 +chrX 1037159 . T A 1762 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=29.96;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.36;QD=42.67;SOR=0.693;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,1673 1|1:0,42:42:99:.:0|1:1037149_C_A:1792,126,0:1037149:0,0,21,21 +chrX 1037236 . G A 1871 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.78;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=32.78;SOR=1.493;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1901,0:0,0,38,20 0/0:.:45:99:45:0,106,1245 +chrX 1037245 . G A 544 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.71;BaseQRankSum=1.679;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=4.322;MQ=59.67;MQRankSum=0.907;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.961;SOR=0.270;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1224 0/1:28,21:49:99:.:574,0,735:20,8,12,9 +chrX 1037855 . TTATATATATATATATA TTA,TTATA,TTATATA,T 1155.97 . AC=1,0,0,1;AF=0.333,0.00,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=20,4,2,13;AS_QD=27.15,35.74,4.78,23.10;BaseQRankSum=-0.381;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=10.069;MQ=59.18;MQRankSum=2.764;QD=25.98;ReadPosRankSum=2.17;SOR=0.352;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,20,4,2,0:27:99:733,0,345,690,753:1,0,13,13 0/4:6,0,0,0,13:19:99:462,480,691,480,691,691,480,691,691,691,0,211,211,211,170:5,1,5,8 +chrX 1038068 . T C 3239 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=31.43;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=31.43;SOR=1.146;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1815,0:0,0,35,24 1/1:0,45:45:99:1454,135,0:0,0,27,18 +chrX 1038217 . C T 525 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.33;BaseQRankSum=0.794;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=8.562;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.239;SOR=1.033;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1800 0/1:24,21:45:99:.:555,0,627:9,15,13,8 +chrX 1038396 . G A 2009 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.89;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=1.329;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:2039,0:0,0,23,39 0/0:.:57:71:57:0,71,1142 +chrX 1038468 . C A 2140 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=31.45;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.45;SOR=0.781;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,69:69:99:.:2170,0:0,0,33,36 0/0:.:57:71:57:0,71,1142 +chrX 1039957 . C A 1836 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=18.12;BaseQRankSum=3.029;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.685;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.651;SOR=0.612;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,40:42:99:1248,0:1,1,19,21 0/1:33,28:61:99:618,0,842:18,15,14,14 +chrX 1040003 . A G 3463 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=29.35;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=29.35;SOR=1.104;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1796,0:0,0,23,37 1/1:0,59:59:99:1697,174,0:0,0,26,33 +chrX 1040202 . C A 867 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.81;BaseQRankSum=-0.027;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=6.897;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.635;SOR=0.223;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1800 0/1:36,34:70:99:.:897,0,952:27,9,20,14 +chrX 1040715 . C T 3354 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=24.88;BaseQRankSum=2.022;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=0.769;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2258,0:0,0,31,37 0/1:28,40:68:99:1126,0,654:14,14,21,19 +chrX 1040742 . C T 3014 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=24.75;BaseQRankSum=4.223;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.792;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.742;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1964,0:0,0,31,27 0/1:28,37:65:99:1080,0,647:13,15,20,17 +chrX 1040758 . T C 2906 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=23.87;BaseQRankSum=1.722;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.729;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.87;ReadPosRankSum=1.247;SOR=0.822;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1871,0:0,0,31,25 0/1:29,38:67:99:1065,0,725:14,15,20,18 +chrX 1041497 . G A 56 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=1.37;BaseQRankSum=2.929;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.64;SOR=0.646;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,31:63:86:.:86,0:12,20,12,19 0/0:.:64:99:64:0,108,1484 +chrX 1041636 . TTATC T 803.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=17.20;BaseQRankSum=0;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.434;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.721;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,1707 0|1:27,22:49:99:.:0|1:1041636_TTATC_T:843,0,1067:1041636:12,15,12,10 +chrX 1041652 . TTGTC T 800.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=16.80;BaseQRankSum=0;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.447;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.473;SOR=0.684;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,1707 0|1:28,22:50:99:.:0|1:1041636_TTATC_T:840,0,1109:1041636:12,16,12,10 +chrX 1041708 . C CT 672.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=-0.349;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=4.324;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.822;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,1707 0|1:27,19:46:99:.:0|1:1041708_C_CT:712,0,1077:1041708:11,16,11,8 +chrX 1041709 . ATCTG A 2280.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=26.13;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=0.770;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:2320,0:0,0,27,25 0/0:.:46:99:46:0,114,1710 +chrX 1041711 . C *,CATA 798.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,22;AS_QD=0.00,17.10;BaseQRankSum=-0.913;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=5.732;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.48;SOR=0.626;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52,0:52:99:.:.:2320,0,2320:.:0,0,27,25 0|2:27,0,22:49:99:0|1:1041708_C_CT:838,919,2053,0,1134,1068:1041708:11,16,13,9 +chrX 1041713 . G *,A 771 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,21;AS_QD=0.00,16.69;BaseQRankSum=-2.381;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=4.344;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=0.590;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52,0:52:99:.:.:2320,0,2320:.:0,0,27,25 0|2:27,0,21:48:99:0|1:1041708_C_CT:801,882,2016,0,1134,1071:1041708:11,16,12,9 +chrX 1041735 . GTATC GTATCTATC,G 1753.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=24,19;AS_QD=29.87,31.95;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.70;SOR=0.739;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,1152,1152 1/2:0,24,19:43:99:.:1793,786,714,1007,0,1118:0,0,22,21 +chrX 1041753 . G GTCTA 680.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=-2.333;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=2.597;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.928;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,1152 0|1:26,19:45:99:.:0|1:1041708_C_CT:720,0,1024:1041708:12,14,11,8 +chrX 1041761 . G GTCTA 2013.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=29.89;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.63;SOR=0.780;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,1152 1/1:0,46:46:99:.:2053,138,0:0,0,22,24 +chrX 1041826 . C G 592 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.14;BaseQRankSum=-0.549;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=2.614;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.386;SOR=1.016;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,1152 0|1:27,17:44:99:.:0|1:1041826_C_G:622,0,1052:1041826:13,14,10,7 +chrX 1041838 . GTATC G 611.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.15;BaseQRankSum=0.855;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.588;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.542;SOR=1.179;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,1152 0|1:28,18:46:99:.:0|1:1041826_C_G:651,0,1091:1041826:14,14,11,7 +chrX 1041871 . T TATCA 2669.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.14;BaseQRankSum=0.194;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.057;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.14;ReadPosRankSum=0.88;SOR=0.433;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1726,0:0,0,19,20 0/1:22,26:48:99:983,0,815:13,9,14,12 +chrX 1041921 . A G 388 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=13.48;BaseQRankSum=-1.094;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=0.569;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1171 0/1:13,18:31:99:.:418,0,472:7,6,9,9 +chrX 1041922 . TATCA T 362.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=12.97;BaseQRankSum=-1.128;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.451;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.97;ReadPosRankSum=2.106;SOR=0.721;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1171 0/1:20,11:31:99:.:402,0,777:9,11,6,5 +chrX 1042231 . ATCTG A 587.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=13.63;BaseQRankSum=-1.776;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.165;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.609;SOR=0.497;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1171 0|1:29,17:46:99:.:0|1:1042231_ATCTG_A:627,0,1156:1042231:12,17,8,9 +chrX 1042251 . ATCTC A 669.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=15.76;BaseQRankSum=-1.43;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.154;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.966;SOR=0.674;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1171 0|1:26,19:45:99:.:0|1:1042231_ATCTG_A:709,0,1034:1042231:12,14,10,9 +chrX 1042255 . C G,* 3763 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=97,19;AS_QD=31.75,0.00;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.70;SOR=0.877;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72,0:72:99:2322,0,2322:0,0,41,31 1/2:0,25,19:44:99:1471,787,713,752,0,992:0,0,22,22 +chrX 1042308 . C CATCT 650.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=17.25;BaseQRankSum=-0.078;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.817;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.307;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,402 0/1:22,18:40:99:.:690,0,818:14,8,9,9 +chrX 1042373 . A ATCTC 1169.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=20.84;BaseQRankSum=-0.646;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.84;ReadPosRankSum=0.05;SOR=1.426;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,40:58:99:.:1209,0:1,1,8,15 0/0:.:49:99:49:0,99,1373 +chrX 1042389 . G A 788 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=20.45;BaseQRankSum=-0.904;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.45;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.804;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,1157 0|1:18,22:40:99:.:0|1:1042389_G_A:818,0,690:1042389:11,7,14,8 +chrX 1042407 . C CTGTT 734.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=18.43;BaseQRankSum=0.684;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.172;SOR=0.551;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,1157 0|1:22,20:42:99:.:0|1:1042389_G_A:774,0,864:1042389:13,9,11,9 +chrX 1042416 . C CATCT 834.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=19.42;BaseQRankSum=0.896;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.84;SOR=0.602;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,1157 0|1:22,23:45:99:.:0|1:1042389_G_A:874,0,855:1042389:13,9,13,10 +chrX 1042440 . GTCCA G,GTCCATCCA 1653.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=23,19;AS_QD=31.43,29.47;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=1.259;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1157,1157 1/2:0,23,19:42:99:.:1693,780,802,917,0,860:0,0,26,16 +chrX 1042496 . A G 660 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.78;BaseQRankSum=0.825;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.225;SOR=1.267;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1157 0/1:27,27:54:99:.:690,0,678:13,14,17,10 +chrX 1042580 . G A 808 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.45;BaseQRankSum=0.51;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.976;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1157 0/1:28,30:58:99:.:838,0,759:14,14,13,17 +chrX 1042970 . C CTTTAT 627.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=17.10;BaseQRankSum=0.963;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.507;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1157 0/1:21,18:39:99:.:667,0,818:6,15,6,12 +chrX 1043057 . C T 278 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=8.32;BaseQRankSum=1.082;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=5.845;MQ=59.54;MQRankSum=0;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.156;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,23:37:99:.:308,0:2,12,8,15 0/0:.:46:60:46:0,60,1251 +chrX 1043155 . T C 1517 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=32.23;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.23;SOR=1.179;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,918 1/1:0,48:48:99:.:1547,144,0:0,0,19,29 +chrX 1043587 . A G 4463 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=29.61;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.07;QD=43.20;SOR=1.374;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2190,0:.:0,0,35,16 1|1:0,53:53:99:0|1:1043587_A_G:2303,159,0:1043587:0,0,31,22 +chrX 1043608 . GATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAA G 4423.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=32.87;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.05;QD=44.19;SOR=1.368;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:2201,0:.:0,0,33,17 1|1:0,51:51:99:0|1:1043587_A_G:2262,154,0:1043587:0,0,31,20 +chrX 1043760 . A C 484 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.24;BaseQRankSum=-0.957;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.43;MQRankSum=-0.592;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.209;SOR=0.709;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,578 0/1:22,20:42:99:.:514,0,813:10,12,9,11 +chrX 1043771 . C T 976 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=10.59;BaseQRankSum=2.06;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.910;MQ=59.71;MQRankSum=1.491;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.265;SOR=1.100;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,38:56:99:473,0:9,9,14,24 0/1:20,19:39:99:533,0,755:9,11,8,11 +chrX 1043814 . CAAA C,AAAA,CA 1639 . AC=1,0,1;AF=0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=33,2,25;AS_QD=16.89,0.00,15.74;BaseQRankSum=-0.577;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=5.221;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=1.425;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:7,33,2,0:42:99:929,0,1208,1338:4,3,7,28 0/3:15,0,0,25:40:99:740,785,1219,785,1219,1219,0,434,434,358:6,9,12,13 +chrX 1043852 . G C 1962 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=20.75;BaseQRankSum=0.318;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=5.845;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=1.104;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1492,0:0,0,17,30 0/1:28,21:49:99:500,0,698:15,13,10,11 +chrX 1044097 . T C 3541 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.46;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;QD=32.46;SOR=0.888;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1665,0:0,0,29,22 1/1:0,59:59:99:1906,177,0:0,0,31,28 +chrX 1044246 . T C 107 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=1.90;BaseQRankSum=-1.899;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.214;MQ=59.44;MQRankSum=1.313;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.737;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,40:72:99:.:137,0:18,14,18,22 0/0:.:57:99:57:0,108,1525 +chrX 1044258 . A G 3572 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=28.36;BaseQRankSum=-0.474;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.933;MQ=59.02;MQRankSum=3.927;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.659;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,73:74:99:.:.:2764,0:.:1,0,36,37 0|1:29,24:53:99:0|1:1044258_A_G:838,0,1124:1044258:16,13,9,15 +chrX 1044277 . T C 855 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.53;BaseQRankSum=-2.905;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=9.545;MQ=58.22;MQRankSum=-0.135;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=1.331;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:99:72:.:.:0,1800 0|1:31,26:57:99:.:0|1:1044258_A_G:885,0,1182:1044258:18,13,9,17 +chrX 1044368 . CT C 1044.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=13.22;BaseQRankSum=1.912;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=6.655;MQ=59.70;MQRankSum=1.651;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=0.250;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,27:48:99:215,0:14,7,15,12 1/1:1,33:34:95:869,95,0:1,0,16,17 +chrX 1044397 . G A,C 872 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=30,3;AS_QD=30.07,10.00;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.33;SOR=0.752;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:50:62:0,50,50 1/1:0,30,3:33:68:.:902,89,0,880,68,872:0,0,17,16 +chrX 1044452 . G A 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.26;BaseQRankSum=0.511;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=19.240;MQ=59.62;MQRankSum=-0.861;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.619;SOR=1.926;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:50:62:0,50 0/1:19,23:42:99:.:599,0,445:13,6,6,17 +chrX 1044511 . A G 717 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.58;BaseQRankSum=-2.27;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=18.431;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=1.084;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:50:62:0,50 0/1:25,30:55:99:.:747,0,684:7,18,19,11 +chrX 1045394 . AAC A 882.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.44;BaseQRankSum=-1.429;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.931;SOR=0.716;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:50:62:.:.:0,50 0|1:26,24:50:99:.:0|1:1045394_AAC_A:922,0,1019:1045394:11,15,10,14 +chrX 1045398 . G T 892 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.44;BaseQRankSum=0.336;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=0.716;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:99:69:.:.:0,278 0|1:26,24:50:99:.:0|1:1045394_AAC_A:922,0,1019:1045394:11,15,10,14 +chrX 1046212 . C T 674 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=6.12;BaseQRankSum=1.624;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=10.334;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.02;SOR=1.166;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,34:65:99:145,0:13,18,21,13 0/1:29,21:50:99:559,0,746:14,15,13,8 +chrX 1046456 . T C 799 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=6.28;BaseQRankSum=-0.574;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=3.094;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.911;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,31:60:49:49,0:12,17,14,17 0/1:40,32:72:99:780,0,1060:23,17,14,18 +chrX 1046850 . A G 589 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=14.07;BaseQRankSum=-1.98;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.635;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.07;ReadPosRankSum=-2.444;SOR=1.609;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:36:52:.:.:0,36 0|1:25,19:44:99:.:0|1:1046850_A_G:619,0,962:1046850:11,14,5,14 +chrX 1046871 . T A,TA 480 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,14;AS_QD=0.00,14.17;BaseQRankSum=-1.168;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=2.909;MQ=59.61;MQRankSum=-1.119;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.873;SOR=0.729;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:36:52:0,36,36 0/2:22,2,14:38:99:.:510,546,1167,0,651,995:13,9,7,9 +chrX 1046872 . C A 480 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=12.75;BaseQRankSum=0.491;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;MQRankSum=-1.31;QD=12.75;ReadPosRankSum=-1.154;SOR=0.560;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:36:52:.:.:0,36 0|1:26,14:40:99:.:0|1:1046850_A_G:510,0,1029:1046850:14,12,7,7 +chrX 1046913 . AGAAG A 255.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=8.94;BaseQRankSum=0.466;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=4.159;MQ=59.24;MQRankSum=-2.296;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.734;SOR=1.898;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:36:52:.:.:0,36 0|1:24,9:33:99:.:0|1:1046913_AGAAG_A:295,0,968:1046913:16,8,8,1 +chrX 1046922 . GAAAGAA G 395.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=12.43;BaseQRankSum=-0.59;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=4.301;MQ=59.17;MQRankSum=-2.092;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.825;SOR=2.030;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,180 0|1:23,12:35:99:.:0|1:1046913_AGAAG_A:435,0,929:1046913:13,7,8,1 +chrX 1046932 . A G 405 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=12.43;BaseQRankSum=0.646;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=4.301;MQ=59.19;MQRankSum=-2.092;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.613;SOR=2.030;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,180 0|1:23,12:35:99:.:0|1:1046913_AGAAG_A:435,0,929:1046913:13,7,8,1 +chrX 1046982 . G A 348 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=10.80;BaseQRankSum=0.164;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.43;MQRankSum=-3.02;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.65;SOR=0.434;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:99:45:0,180 0/1:20,15:35:99:.:378,0,546:18,2,13,2 +chrX 1047073 . GAAGGAAGGAAGAAAGAAAGA GAAGA,G 543.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=4,9;AS_QD=30.18,31.99;DP=31;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.85;SOR=3.767;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,4,0:4:99:179,0,179:0,0,4,0 2/2:0,0,9:9:28:404,404,404,28,28,0:0,0,8,1 +chrX 1047316 . T C 642 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.71;BaseQRankSum=-0.608;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=10.731;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.05;SOR=1.852;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:90:64:0,90 0/1:24,25:49:99:.:672,0,661:11,13,18,7 +chrX 1047558 . T A 850 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.92;BaseQRankSum=-0.92;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.616;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:90:64:0,90 0/1:19,33:52:99:.:880,0,464:7,12,13,20 +chrX 1047696 . T TTCTC,TTCTCTCTCTCTCTCTCTC,TTCTCTC 1231.97 . AC=1,0,2;AF=0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=11,6,16;AS_QD=34.14,25.40,28.06;BaseQRankSum=-0.253;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.73;MQRankSum=-0.307;QD=37.38;ReadPosRankSum=-0.952;SOR=0.368;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,6,0:17:99:794,0,226,631:0,0,9,8 3/3:1,0,0,16:17:24:477,481,504,481,504,504,24,47,47,0:1,0,10,6 +chrX 1047872 . GA G 979.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=8.56;BaseQRankSum=1.604;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=2.376;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.704;SOR=0.490;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,40:66:99:406,0:14,12,22,18 0/1:26,27:53:99:613,0,572:17,9,14,13 +chrX 1048300 . A T 1014 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=10.55;BaseQRankSum=-1.842;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=2.702;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.631;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,32:52:99:272,0:10,10,13,19 0/1:18,29:47:99:772,0,475:7,11,19,10 +chrX 1048390 . C G 837 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=10.97;BaseQRankSum=0.017;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.871;MQ=59.54;MQRankSum=0;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.843;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,24:42:99:218,0:9,9,8,16 0/1:13,24:37:99:649,0,296:5,8,12,12 +chrX 1048503 . AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGG A 233.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=27.30;BaseQRankSum=-1.054;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.70;MQRankSum=1.834;QD=27.30;ReadPosRankSum=1.687;SOR=0.569;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:45:26:0,45 0/1:3,7:10:54:.:273,0,54:3,0,6,1 +chrX 1048565 . AGG A 248.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=24.00;DP=37;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.19;QD=24.00;SOR=1.445;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,12:12:99:.:288,0:0,0,8,4 0/0:.:22:0:22:0,0,416 +chrX 1048568 . AAGGGGAAGGGAAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGACGGACGGAAGGAAGGGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG *,A 195.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,12;AS_QD=0.00,16.79;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.68;MQRankSum=1.153;QD=16.79;SOR=1.445;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:2,0,12:14:99:.:235,462,0:1,1,8,4 0/0:.:23:20:23:0,20,600,20,600,600 +chrX 1048838 . C A 572 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=19.42;BaseQRankSum=2.878;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=5.884;MQ=59.61;MQRankSum=0;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.493;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,471 0/1:11,20:31:99:.:602,0,249:8,3,9,11 +chrX 1048967 . T C 668 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=14.24;BaseQRankSum=1.665;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=8.955;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.79;SOR=2.194;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:19:74:.:.:0,19 0|1:30,19:49:99:.:0|1:1048967_T_C:698,0,1203:1048967:14,16,4,15 +chrX 1048968 . C T 668 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=14.24;BaseQRankSum=1.665;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=8.955;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.77;SOR=2.194;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:75:99:75:.:.:0,114 0|1:30,19:49:99:.:0|1:1048967_T_C:698,0,1203:1048967:14,16,4,15 +chrX 1049241 . C T 843 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.34;BaseQRankSum=1.562;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.469;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.562;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,36:72:96:96,0:16,20,15,21 0/1:20,27:47:99:777,0,524:6,14,12,15 +chrX 1049385 . A C 680 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.20;BaseQRankSum=1.235;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.69;SOR=0.846;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:33:33:0,33 0/1:24,26:50:99:.:710,0,594:12,12,12,14 +chrX 1050443 . GGAGGTTGCAGTGAGCT G 986.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=21.38;BaseQRankSum=0.156;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;MQRankSum=1.129;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.61;SOR=0.669;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:33:33:0,33 0/1:22,26:48:99:.:1026,0,822:12,10,14,12 +chrX 1050510 . C CA 316.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=11.48;BaseQRankSum=0.311;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.079;SOR=0.722;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:37:69:0,37 0/1:14,17:31:99:.:356,0,277:9,5,11,6 +chrX 1050900 . G GT 978.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=25.45;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=25.45;SOR=1.292;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:37:69:0,37 1/1:0,40:40:99:.:1018,120,0:0,0,15,25 +chrX 1051047 . C A 493 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.45;BaseQRankSum=0.214;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.109;SOR=0.709;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:37:69:0,37 0/1:22,20:42:99:.:523,0,599:12,10,11,9 +chrX 1051324 . G A 3462 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=24.77;BaseQRankSum=-0.514;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=1.690;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.77;ReadPosRankSum=1.295;SOR=0.560;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,81:81:99:2690,0:0,0,40,41 0/1:29,31:60:99:802,0,767:16,13,15,16 +chrX 1051665 . A AAAG 1240.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=22.86;BaseQRankSum=-1.027;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.353;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.008;SOR=0.369;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:11:62:0,11 0/1:23,33:56:99:.:1280,0,844:8,15,15,18 +chrX 1052561 . C T 2127 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=22.24;BaseQRankSum=-0.357;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.925;MQ=56.07;MQRankSum=-3.252;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.396;SOR=0.963;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1471,0:0,0,23,23 0/1:24,27:51:99:686,0,602:12,12,18,9 +chrX 1052617 . C CAAAGGCTGCAATGTGAATGAATTTTTGGAAATAGCCCTAATGCTCATCTATGAAGGAGTGATAAACACAGCATCCTTTATCCATGCAATGGAATATTATGCAGTCTAGAAAAGGAATAAGGCTCTGACAAAAGACTGCAATATGTATGAATTTTGGAAACAGCCCTACTGCCCATCTATAAAGGAATGGATAAACACAGCATAGTTCATCTATACAATGCAATATTATAATGGAATATTATGCAGCCTGGAACAGGAACAAGGCTCTGAG 1141.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=12.70;BaseQRankSum=-0.435;DP=160;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.43;MQRankSum=0.816;QD=12.70;ReadPosRankSum=-4.294;SOR=0.666;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,500 0|1:48,45:93:99:.:0|1:1052617_C_CAAAGGCTGCAATGTGAATGAATTTTTGGAAATAGCCCTAATGCTCATCTATGAAGGAGTGATAAACACAGCATCCTTTATCCATGCAATGGAATATTATGCAGTCTAGAAAAGGAATAAGGCTCTGACAAAAGACTGCAATATGTATGAATTTTGGAAACAGCCCTACTGCCCATCTATAAAGGAATGGATAAACACAGCATAGTTCATCTATACAATGCAATATTATAATGGAATATTATGCAGCCTGGAACAGGAACAAGGCTCTGAG:1181,0,676:1052617:21,27,20,25 +chrX 1052675 . G T 580 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.84;BaseQRankSum=-0.938;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=11.299;MQ=59.49;MQRankSum=-2.477;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.795;SOR=0.595;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,500 0|1:37,25:62:99:.:0|1:1052617_C_CAAAGGCTGCAATGTGAATGAATTTTTGGAAATAGCCCTAATGCTCATCTATGAAGGAGTGATAAACACAGCATCCTTTATCCATGCAATGGAATATTATGCAGTCTAGAAAAGGAATAAGGCTCTGACAAAAGACTGCAATATGTATGAATTTTGGAAACAGCCCTACTGCCCATCTATAAAGGAATGGATAAACACAGCATAGTTCATCTATACAATGCAATATTATAATGGAATATTATGCAGCCTGGAACAGGAACAAGGCTCTGAG:610,0,1111:1052617:12,25,14,11 +chrX 1052757 . C A 642 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=5.33;BaseQRankSum=-2.874;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.670;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.49;SOR=0.619;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,40:67:99:297,0:18,9,20,20 0/1:23,36:59:99:375,0,636:8,15,18,18 +chrX 1052840 . C T 137 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=3.27;BaseQRankSum=0.023;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.546;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.397;SOR=1.024;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1668 0|1:43,8:51:99:.:0|1:1052840_C_T:167,0,1743:1052840:25,18,3,5 +chrX 1052845 . C T 131 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=3.04;BaseQRankSum=-0.145;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.526;MQ=59.60;MQRankSum=0;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.55;SOR=1.029;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1668 0|1:45,8:53:99:.:0|1:1052840_C_T:161,0,1827:1052840:26,19,3,5 +chrX 1053706 . C T 515 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=4.87;BaseQRankSum=1.662;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.502;MQ=59.75;MQRankSum=0.027;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.649;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,27:53:15:15,0:11,15,14,13 0/1:37,22:59:99:530,0,865:17,20,12,10 +chrX 1054168 . T G 771 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.13;BaseQRankSum=2.912;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=0.922;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,173 0/1:32,29:61:99:.:801,0,790:17,15,17,12 +chrX 1054720 . T A 844 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.87;BaseQRankSum=-0.699;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.719;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,173 0/1:30,33:63:99:.:874,0,784:12,18,13,20 +chrX 1054829 . G A 990 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=17.29;BaseQRankSum=1.537;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.279;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.919;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,173 0/1:23,36:59:99:.:1020,0,533:13,10,15,21 +chrX 1055093 . G A 521 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.34;BaseQRankSum=-1.223;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.026;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.906;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,173 0/1:36,23:59:99:.:551,0,1013:16,20,9,14 +chrX 1055164 . TTTTA T 759.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=-1.552;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=5.610;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=1.524;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,173 0/1:35,22:57:99:.:799,0,1403:17,18,7,15 +chrX 1056171 . CA C 647.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=18.08;BaseQRankSum=1.5;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.27;MQRankSum=-1.099;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.059;SOR=0.782;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,173 0/1:15,23:38:99:.:687,0,395:8,6,6,4 +chrX 1056304 . C T 483 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.25;BaseQRankSum=0.26;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.009;MQ=58.43;MQRankSum=0;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.607;SOR=0.479;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,173 0/1:16,20:36:99:.:513,0,387:10,6,9,10 +chrX 1056557 . A AT 386.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=21;AS_QD=11.51;BaseQRankSum=-0.846;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=4.743;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.69;SOR=1.508;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:27:.:27:0,1 0/1:16,21:37:99:.:426,0,310:8,8,14,7 +chrX 1056700 . C T 711 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=16.11;BaseQRankSum=1.244;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=4.112;MQ=59.04;MQRankSum=0.336;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=1.043;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,997 0|1:26,20:46:99:.:0|1:1056700_C_T:741,0,1032:1056700:12,14,12,8 +chrX 1056704 . T C 676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=15.35;BaseQRankSum=0.468;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=6.115;MQ=58.31;MQRankSum=0.261;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.753;SOR=1.194;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,997 0|1:27,19:46:99:.:0|1:1056700_C_T:706,0,1056:1056700:12,15,12,7 +chrX 1056802 . C T 2841 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=22.97;BaseQRankSum=2.567;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=4.918;MQ=59.02;MQRankSum=2.018;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.375;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,37:56:99:697,0:12,7,16,21 1/1:0,69:69:99:2174,207,0:0,0,36,33 +chrX 1057102 . G A 415 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=6.85;BaseQRankSum=1.228;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.624;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:94:57:0,94 0/1:46,19:65:99:.:445,0,1291:25,21,10,9 +chrX 1057295 . C G 347 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=7.11;BaseQRankSum=-0.159;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.346;MQ=59.95;MQRankSum=-1.48;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.273;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:94:57:0,94 0/1:37,16:53:99:.:377,0,1083:13,24,8,8 +chrX 1057420 . AACAC A,AACACAC 414.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,17;AS_QD=0.00,14.19;BaseQRankSum=-1.528;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.376;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.399;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:94:57:0,94,94 0/2:15,1,17:33:99:.:454,526,1153,0,481,693:9,6,9,9 +chrX 1057442 . C T 360 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=10.83;BaseQRankSum=0.278;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.357;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.095;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:94:57:.:.:0,94 0|1:22,14:36:99:.:0|1:1057442_C_T:390,0,756:1057442:12,10,9,5 +chrX 1057444 . CAT C 350.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=10.83;BaseQRankSum=0.655;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.357;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.974;SOR=1.095;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:94:57:.:.:0,94 0|1:22,14:36:99:.:0|1:1057442_C_T:390,0,756:1057442:12,10,9,5 +chrX 1057446 . T *,C,TAC 1287 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=14,21,0;AS_QD=0.00,33.59,33.00;BaseQRankSum=2.053;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=3.802;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.58;ReadPosRankSum=-1.486;SOR=0.876;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:94:57:0,94,94,94 1/2:1,14,21,0:36:99:.:1317,740,712,578,0,775,1124,643,747,1380:0,1,21,14 +chrX 1057501 . G T 1261 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=31.49;BaseQRankSum=2.512;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=3.340;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.49;ReadPosRankSum=-1.311;SOR=0.540;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:94:57:0,94 1/1:1,40:41:99:.:1291,113,0:0,1,22,18 +chrX 1057562 . T TCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCCAATTCAAATGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCAC 5976.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=147;AS_QD=30.03;BaseQRankSum=0.853;DP=180;ExcessHet=0.0000;FS=3.507;MQ=55.73;MQRankSum=-0.611;QD=40.65;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=0.605;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,69:70:99:2753,0:0,1,36,33 1/1:0,78:78:99:3263,221,0:0,0,46,32 +chrX 1058087 . A G 1988 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=29.37;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.87;SOR=0.976;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,100 1|1:0,46:46:99:.:0|1:1058087_A_G:2018,138,0:1058087:0,0,26,20 +chrX 1058088 . A G 1988 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=28.93;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.87;SOR=0.976;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,100 1|1:0,46:46:99:.:0|1:1058087_A_G:2018,138,0:1058087:0,0,26,20 +chrX 1058136 . C T 1321 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=10.23;BaseQRankSum=2.621;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=6.913;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.629;SOR=0.316;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,35:66:99:.:.:200,0:.:22,9,23,12 0|1:36,30:66:99:0|1:1058136_C_T:1151,0,1401:1058136:25,11,15,15 +chrX 1058137 . G A 1321 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=10.23;BaseQRankSum=2.239;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=6.913;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.615;SOR=0.316;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,35:66:99:.:.:200,0:.:22,9,23,12 0|1:36,30:66:99:0|1:1058136_C_T:1151,0,1401:1058136:25,11,15,15 +chrX 1058141 . T C 1279 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=9.99;BaseQRankSum=1.844;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=6.778;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.801;SOR=0.339;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,35:66:99:.:.:200,0:.:21,10,23,12 0|1:36,29:65:99:0|1:1058136_C_T:1109,0,1404:1058136:25,11,14,15 +chrX 1058255 . C T 982 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=16.87;BaseQRankSum=1.274;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.87;ReadPosRankSum=-1.298;SOR=0.693;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,104 0/1:24,36:60:99:.:1012,0,554:12,12,18,18 +chrX 1058303 . C G 771 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=6.85;BaseQRankSum=-0.253;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.471;MQ=59.96;MQRankSum=1.102;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.801;SOR=0.542;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,32:60:99:109,0:12,16,15,17 0/1:31,26:57:99:692,0,866:15,16,14,12 +chrX 1058749 . C T 978 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.38;BaseQRankSum=2.785;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.796;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.302;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1565 0/1:23,35:58:99:.:1008,0,531:15,8,18,17 +chrX 1058970 . C T 3226 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=24.12;BaseQRankSum=-0.682;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.769;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.592;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2317,0:0,0,38,31 0/1:30,36:66:99:939,0,766:16,14,15,21 +chrX 1059047 . T C 2692 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=21.43;BaseQRankSum=2.778;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.636;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,59:61:99:1865,0:1,1,27,32 0/1:33,33:66:99:857,0,909:14,19,14,19 +chrX 1059130 . AT A 1977.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=20.58;BaseQRankSum=0.114;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.58;ReadPosRankSum=1.584;SOR=0.734;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1678,0:0,0,30,25 0/1:27,16:43:99:339,0,689:15,12,10,6 +chrX 1059245 . C G 2626 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=23.93;BaseQRankSum=1.057;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=6.164;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.93;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.260;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2112,0:0,0,39,28 0/1:24,20:44:99:544,0,622:17,7,9,11 +chrX 1059510 . C T 3061 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=24.53;BaseQRankSum=1.686;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.53;ReadPosRankSum=0.445;SOR=0.704;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2357,0:0,0,31,42 0/1:27,26:53:99:734,0,729:12,15,13,13 +chrX 1059715 . A G 2741 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=24.52;BaseQRankSum=3.83;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=7.583;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.781;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1737,0:0,0,29,24 0/1:25,35:60:99:1034,0,598:10,15,21,14 +chrX 1059917 . T G 2935 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=25.13;BaseQRankSum=1.392;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.005;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=0.430;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2009,0:0,0,28,32 0/1:24,34:58:99:956,0,575:14,10,19,15 +chrX 1060070 . C T 733 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.45;BaseQRankSum=-0.14;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=3.248;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.368;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1443 0/1:43,30:73:99:.:763,0,1204:17,26,15,15 +chrX 1060234 . C T 602 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.74;BaseQRankSum=0.075;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.597;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.316;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1443 0/1:23,23:46:99:.:632,0,616:15,8,12,11 +chrX 1060278 . T C 787 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.33;BaseQRankSum=0.945;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.245;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=0.409;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1443 0/1:28,29:57:99:.:817,0,747:17,11,15,14 +chrX 1060379 . G A 3635 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=29.56;BaseQRankSum=1.85;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.618;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.56;ReadPosRankSum=-1.413;SOR=0.543;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59:59:99:.:.:2583,0:.:0,0,34,25 0|1:35,30:65:99:0|1:1060379_G_A:1082,0,1359:1060379:22,13,18,12 +chrX 1060396 . C T 3702 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=28.27;BaseQRankSum=1.446;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.730;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.588;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,61:61:99:.:.:2643,0:.:0,0,38,23 0|1:40,31:71:99:0|1:1060379_G_A:1089,0,1586:1060379:26,14,19,12 +chrX 1060420 . T G 1502 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=21.89;BaseQRankSum=-0.132;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.611;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1800 0|1:31,39:70:99:.:0|1:1060420_T_G:1532,0,1184:1060420:19,12,23,16 +chrX 1060422 . T C 1508 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=22.62;BaseQRankSum=-1.17;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.62;ReadPosRankSum=-0.31;SOR=0.713;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1800 0|1:29,39:68:99:.:0|1:1060420_T_G:1538,0,1100:1060420:17,12,23,16 +chrX 1060467 . G A 835 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=0.264;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=3.312;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.483;SOR=1.048;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1800 0/1:33,34:67:99:.:865,0,836:16,17,20,14 +chrX 1060573 . G A 743 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.59;BaseQRankSum=1.154;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=1.953;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.925;SOR=0.718;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1800 0/1:43,30:73:99:.:773,0,1140:20,23,16,14 +chrX 1060624 . A G 701 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=9.49;BaseQRankSum=-1.524;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.893;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.805;SOR=0.883;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1800 0/1:47,30:77:99:.:731,0,1342:26,21,18,12 +chrX 1060773 . A G 4429 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=139;AS_QD=32.08;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.08;SOR=0.965;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2360,0:0,0,34,40 1/1:0,65:65:99:2099,195,0:0,0,27,38 +chrX 1061125 . T C 4302 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=32.57;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.57;SOR=1.016;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,82:82:99:2639,0:0,0,47,35 1/1:0,51:51:99:1693,153,0:0,0,29,22 +chrX 1061237 . CT C 2750.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=31.00;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=31.00;SOR=0.832;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1524,0:0,0,23,26 1/1:0,41:41:99:1266,123,0:0,0,19,22 +chrX 1061359 . T C 3929 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=32.45;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;QD=32.45;SOR=0.945;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2193,0:0,0,28,39 1/1:0,55:55:99:1766,165,0:0,0,26,29 +chrX 1061591 . G A 839 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=17.04;BaseQRankSum=-0.859;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.152;MQ=59.67;MQRankSum=-0.73;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.502;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,258 0/1:19,32:51:99:.:869,0,462:13,6,20,12 +chrX 1061774 . A T 734 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.42;BaseQRankSum=0.62;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.844;MQ=59.69;MQRankSum=-0.907;QD=14.42;ReadPosRankSum=-1.346;SOR=1.273;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,258 0/1:25,28:53:99:.:764,0,635:12,13,10,18 +chrX 1062215 . T C 4254 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=28.82;BaseQRankSum=2.231;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=35.70;ReadPosRankSum=-0.508;SOR=0.250;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2444,0:0,0,31,31 1/1:1,57:58:99:1840,164,0:0,1,29,28 +chrX 1062222 . C A 442 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=8.14;BaseQRankSum=0.898;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.040;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.668;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,36:58:99:.:472,0:12,10,17,19 0/0:.:50:90:50:0,90,1306 +chrX 1062489 . C CCT 289.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.97;BaseQRankSum=1.043;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.423;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.73;SOR=0.962;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1300 0/1:21,12:33:99:.:329,0,643:10,11,7,5 +chrX 1062552 . C G 3336 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=31.46;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.46;SOR=0.750;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1814,0:0,0,31,25 1/1:0,51:51:99:1552,152,0:0,0,24,27 +chrX 1063156 . G C 644 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.04;BaseQRankSum=-1.144;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.587;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.714;SOR=1.186;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:70:59:0,70 0/1:22,26:48:99:.:674,0,591:9,13,8,18 +chrX 1063183 . A G 1667 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=32.02;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.02;SOR=1.287;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:70:59:0,70 1/1:0,53:53:99:.:1697,159,0:0,0,20,33 +chrX 1063240 . A G 1717 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=32.96;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.96;SOR=1.287;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:70:59:0,70 1/1:0,53:53:99:.:1747,159,0:0,0,20,33 +chrX 1063363 . C T 2076 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=20.85;BaseQRankSum=1.543;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=9.547;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.679;SOR=1.104;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,26:52:10:.:.:10,0:.:11,15,15,11 1|1:0,49:49:99:0|1:1063363_C_T:2096,147,0:1063363:0,0,31,18 +chrX 1063368 . CA C 2056.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=27.15;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=1.345;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,1260 1|1:0,49:49:99:.:0|1:1063363_C_T:2096,147,0:1063363:0,0,31,18 +chrX 1063446 . C T 2014 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=15.72;BaseQRankSum=2.904;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=1.582;MQ=59.45;MQRankSum=1.945;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.922;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:37,33:70:58:58,0:20,17,20,13 1/1:0,60:60:99:1986,180,0:0,0,35,25 +chrX 1063484 . G C 2680 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=1.857;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=4.678;MQ=59.34;MQRankSum=0.45;QD=19.50;ReadPosRankSum=1.783;SOR=0.393;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:37,40:77:99:.:.:125,0:.:24,13,24,16 1|1:1,61:62:99:0|1:1063484_G_C:2585,152,0:1063484:1,0,33,28 +chrX 1063496 . G A 2672 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=19.03;BaseQRankSum=1.691;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=5.920;MQ=59.35;MQRankSum=0.378;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.741;SOR=0.335;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:39,40:79:55:.:.:55,0:.:26,13,24,16 1|1:1,62:63:99:0|1:1063484_G_C:2647,155,0:1063484:1,0,33,29 +chrX 1063796 . G A 3837 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=33.05;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.05;SOR=1.112;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1807,0:0,0,33,21 1/1:0,63:63:99:2060,189,0:0,0,36,27 +chrX 1063931 . G A 3847 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=33.14;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.14;SOR=0.856;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1991,0:0,0,24,35 1/1:0,58:58:99:1886,173,0:0,0,30,28 +chrX 1064330 . A G 2164 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=21.30;BaseQRankSum=-2.129;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.802;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=21.30;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.815;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1703,0:0,0,24,25 0/1:32,22:54:99:491,0,911:17,15,8,14 +chrX 1064477 . G A 446 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.52;BaseQRankSum=0.784;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.209;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.83;SOR=0.941;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:59:61:0,59 0/1:31,19:50:99:.:476,0,853:10,21,5,14 +chrX 1064604 . C T 3226 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=28.81;BaseQRankSum=0.92;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.81;ReadPosRankSum=-1.671;SOR=0.711;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2419,0:.:0,0,30,24 0|1:36,23:59:99:0|1:1064604_C_T:837,0,1370:1064604:20,16,13,10 +chrX 1064614 . C T 3274 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=29.77;BaseQRankSum=0.651;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.77;ReadPosRankSum=-1.528;SOR=0.761;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2522,0:.:0,0,33,24 0|1:33,21:54:99:0|1:1064604_C_T:782,0,1291:1064604:19,14,13,8 +chrX 1064650 . G C 3718 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.31;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.31;SOR=0.918;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2020,0:0,0,32,29 1/1:0,55:55:99:1728,165,0:0,0,32,23 +chrX 1064750 . C T 1992 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=20.85;BaseQRankSum=0.293;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.750;MQ=57.40;MQRankSum=-0.887;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.349;SOR=0.523;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1573,0:0,0,24,24 0/1:31,18:49:99:449,0,852:18,13,11,7 +chrX 1064783 . A G 2005 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=20.98;BaseQRankSum=2.184;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.851;MQ=53.68;MQRankSum=-0.754;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.083;SOR=0.584;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,47:48:99:1473,0:0,1,23,24 0/1:25,24:49:99:562,0,689:14,11,13,11 +chrX 1064842 . C G 2853 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.68;BaseQRankSum=2.299;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.52;MQRankSum=-1.125;QD=31.68;ReadPosRankSum=1.291;SOR=0.703;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,46:47:99:.:.:1922,0:.:1,0,25,21 0|1:19,25:44:99:0|1:1064842_C_G:961,0,691:1064842:10,9,14,11 +chrX 1064858 . T C 2949 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.74;BaseQRankSum=-0.196;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=6.551;MQ=48.45;MQRankSum=-1.345;QD=32.74;ReadPosRankSum=2.697;SOR=0.593;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,45:45:99:.:.:2024,0:.:0,0,23,22 0|1:21,25:46:99:0|1:1064842_C_G:955,0,735:1064842:8,13,15,10 +chrX 1064880 . T C 3800 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=28.93;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.93;QD=38.69;SOR=0.713;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1972,0:0,0,25,21 1/1:0,53:53:99:1858,157,0:0,0,25,28 +chrX 1064909 . T C 893 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=17.75;BaseQRankSum=-0.013;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=15.407;MQ=54.61;MQRankSum=0.306;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.671;SOR=1.706;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:44:99:44:.:.:0,1380 0|1:28,24:52:99:.:0|1:1064909_T_C:923,0,1103:1064909:17,11,7,17 +chrX 1064911 . G T 2198 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=22.28;BaseQRankSum=-2.283;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=7.685;MQ=53.98;MQRankSum=-0.498;QD=22.28;ReadPosRankSum=-1.836;SOR=0.434;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1499,0:0,0,22,24 0/1:26,28:54:99:729,0,1008:9,17,17,11 +chrX 1064920 . T C 1096 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.11;BaseQRankSum=2.343;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=9.708;MQ=55.86;MQRankSum=0.21;QD=20.11;ReadPosRankSum=1.575;SOR=1.336;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:99:58:.:.:0,1365 0|1:27,29:56:99:.:0|1:1064909_T_C:1126,0,1046:1064909:16,11,10,19 +chrX 1064937 . T C 1159 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=21.62;BaseQRankSum=0.727;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=9.624;MQ=57.06;MQRankSum=-0.82;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.671;SOR=1.281;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:99:58:.:.:0,1365 0|1:24,31:55:99:.:0|1:1064909_T_C:1189,0,894:1064909:14,10,11,20 +chrX 1065160 . G A 4720 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=28.43;BaseQRankSum=0.989;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.93;MQRankSum=7.617;QD=42.04;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.907;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:2398,0:0,0,29,26 1/1:2,56:58:99:2352,120,0:1,1,32,24 +chrX 1065161 . A C 4829 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=30.83;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.93;QD=43.00;SOR=0.903;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:2398,0:0,0,29,26 1/1:0,58:58:99:2461,174,0:0,0,33,25 +chrX 1065231 . G A 769 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.67;BaseQRankSum=0.494;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.95;MQRankSum=0.019;QD=15.67;ReadPosRankSum=-1.14;SOR=0.756;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,259 0/1:20,31:51:99:.:799,0,737:10,10,15,16 +chrX 1065235 . G C 695 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.50;BaseQRankSum=0.256;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.98;MQRankSum=-0.218;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.328;SOR=0.693;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,259 0|1:38,20:58:99:.:0|1:1065235_G_C:725,0,1505:1065235:19,19,10,10 +chrX 1065239 . AAT A 730.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=13.28;BaseQRankSum=0.623;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.78;MQRankSum=0.23;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.494;SOR=0.738;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,259 0|1:37,21:58:99:.:0|1:1065235_G_C:770,0,1480:1065235:18,19,11,10 +chrX 1065250 . T TATA 771.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.48;BaseQRankSum=-0.157;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.053;MQ=59.05;MQRankSum=0.017;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.787;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,259 0|1:34,22:56:99:.:0|1:1065235_G_C:811,0,1351:1065235:16,18,12,10 +chrX 1065420 . G A 947 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.51;BaseQRankSum=-0.923;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.159;SOR=0.814;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,259 0/1:26,37:63:99:.:977,0,675:12,14,16,21 +chrX 1065491 . A T 3625 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=32.63;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.63;SOR=0.693;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2024,0:0,0,35,27 1/1:0,50:50:99:1631,149,0:0,0,21,29 +chrX 1065538 . C A 2772 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=34.17;BaseQRankSum=-0.603;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.064;MQ=59.81;MQRankSum=-0.139;QD=34.17;ReadPosRankSum=1.473;SOR=0.150;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,27:29:99:717,0:2,0,14,12 1/1:0,53:53:99:2085,159,0:0,0,25,28 +chrX 1065539 . A AAAAAAC 1037.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=20.32;BaseQRankSum=-1.008;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.315;MQ=59.69;MQRankSum=-0.907;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=0.945;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,615 0/1:25,28:53:99:.:1077,0,955:13,12,12,16 +chrX 1065744 . CGTTA C 6070.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=31.92;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.93;SOR=1.146;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,80:80:99:3600,0:0,0,30,50 1/1:0,56:56:99:2510,169,0:0,0,25,31 +chrX 1065991 . A G 1584 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=31.04;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=31.04;SOR=0.941;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:1614,0:0,0,23,29 0/0:.:59:38:59:0,38,1300 +chrX 1066674 . T TA 1695.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=27.98;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.98;SOR=0.758;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1387 1/1:0,62:62:99:.:1735,186,0:0,0,30,32 +chrX 1066960 . C G 2641 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=33.42;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.73;SOR=0.756;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2671,0:0,0,33,31 0/0:.:79:71:79:0,71,1800 +chrX 1066977 . G A 2559 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=26.59;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=42.44;SOR=0.865;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,61:61:99:.:2589,0:0,0,33,28 0/0:.:79:71:79:0,71,1800 +chrX 1067316 . G A 917 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=10.41;BaseQRankSum=0.118;DP=181;ExcessHet=0.0000;FS=1.801;MQ=57.92;MQRankSum=-3.954;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.709;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:75:99:75:.:.:0,1065 0|1:58,33:91:99:.:0|1:1067316_G_A:947,0,2139:1067316:31,27,15,17 +chrX 1067323 . C T 816 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=9.95;BaseQRankSum=0.91;DP=174;ExcessHet=0.0000;FS=3.142;MQ=58.23;MQRankSum=-3.977;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.801;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:75:99:75:.:.:0,1065 0|1:57,28:85:99:.:0|1:1067316_G_A:846,0,2146:1067316:31,26,12,15 +chrX 1067327 . T C 816 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=9.95;BaseQRankSum=0.337;DP=175;ExcessHet=0.0000;FS=3.142;MQ=58.25;MQRankSum=-3.977;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.801;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:75:99:75:.:.:0,1065 0|1:57,28:85:99:.:0|1:1067316_G_A:846,0,2146:1067316:31,26,12,15 +chrX 1067372 . C T 39 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=1.17;BaseQRankSum=1.348;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=16.673;MQ=58.16;MQRankSum=-2.744;QD=1.17;ReadPosRankSum=-2.143;SOR=2.804;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1065 0/1:51,8:59:69:.:69,0,1698:30,21,1,7 +chrX 1067407 . T A 3488 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.88;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.15;QD=32.88;SOR=0.925;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1935,0:0,0,30,30 1/1:0,47:47:99:1583,142,0:0,0,16,27 +chrX 1067504 . C CT,CTT 632.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=47,2;AS_QD=7.30,0.00;BaseQRankSum=0.875;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=10.084;MQ=59.32;MQRankSum=0;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.57;SOR=0.917;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,26,2:44:99:301,0,771:6,10,15,13 0/1:29,21,0:50:99:371,0,599,458,661,1119:12,17,14,7 +chrX 1067669 . G C 893 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=10.86;BaseQRankSum=2.745;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=11.915;MQ=57.45;MQRankSum=0;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.158;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,35:55:99:571,0:5,15,19,16 0/1:17,13:30:99:352,0,456:3,14,1,12 +chrX 1067707 . A T 943 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=17.38;BaseQRankSum=1.764;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=11.980;MQ=56.46;MQRankSum=-0.725;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.271;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,42:56:99:.:973,0:3,11,22,20 0/0:.:32:84:32:0,84,1260 +chrX 1067784 . T C 211 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=11.48;BaseQRankSum=1.348;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=24.123;MQ=53.76;MQRankSum=-3.162;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.524;SOR=4.162;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:14,7:21:99:.:0|1:1067784_T_C:241,0,567:1067784:10,4,0,7 +chrX 1067787 . GAACCACCAC G 158.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=8.25;BaseQRankSum=1.486;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=24.644;MQ=55.85;MQRankSum=-3.99;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.496;SOR=3.896;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:18,6:24:99:.:0|1:1067784_T_C:198,0,738:1067784:13,5,0,6 +chrX 1067798 . C G 159 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=7.00;BaseQRankSum=1.102;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=28.067;MQ=56.20;MQRankSum=-4.314;QD=7.00;ReadPosRankSum=-1.203;SOR=3.894;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:21,6:27:99:.:0|1:1067784_T_C:189,0,864:1067784:16,5,0,6 +chrX 1067806 . C A 156 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=6.64;BaseQRankSum=1.151;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=26.104;MQ=56.30;MQRankSum=-4.417;QD=6.64;ReadPosRankSum=-2.383;SOR=3.895;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:22,6:28:99:.:0|1:1067784_T_C:186,0,906:1067784:16,6,0,6 +chrX 1067809 . T C 454 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=16.13;BaseQRankSum=-0.796;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.325;MQ=56.49;MQRankSum=1.592;QD=16.13;ReadPosRankSum=2.086;SOR=1.445;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:17,13:30:99:.:1|0:1067784_T_C:484,0,663:1067784:9,8,9,4 +chrX 1067811 . T C 150 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=6.00;BaseQRankSum=1.1;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=28.079;MQ=56.49;MQRankSum=-4.613;QD=6.00;ReadPosRankSum=-2.829;SOR=3.895;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:24,6:30:99:.:0|1:1067784_T_C:180,0,990:1067784:18,6,0,6 +chrX 1067812 . A C 454 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=16.13;BaseQRankSum=-0.774;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.325;MQ=56.58;MQRankSum=1.592;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.616;SOR=1.445;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:17,13:30:99:.:1|0:1067784_T_C:484,0,663:1067784:9,8,9,4 +chrX 1067817 . G T 105 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=4.50;BaseQRankSum=0.898;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=24.892;MQ=57.08;MQRankSum=-4.56;QD=4.50;ReadPosRankSum=-2.693;SOR=3.587;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:25,5:30:99:.:0|1:1067784_T_C:135,0,1035:1067784:19,6,0,5 +chrX 1067819 . G T 63 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=3.21;BaseQRankSum=0.793;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=20.535;MQ=57.50;MQRankSum=-4.383;QD=3.21;ReadPosRankSum=-2.605;SOR=3.224;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:25,4:29:93:.:0|1:1067784_T_C:93,0,1038:1067784:19,6,0,4 +chrX 1067820 . T G 63 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=3.21;BaseQRankSum=0.521;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=20.535;MQ=57.50;MQRankSum=-4.383;QD=3.21;ReadPosRankSum=-2.073;SOR=3.224;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,983 0|1:25,4:29:93:.:0|1:1067784_T_C:93,0,1038:1067784:19,6,0,4 +chrX 1067905 . T C 2785 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=26.06;BaseQRankSum=-0.561;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=15.216;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.085;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2159,0:0,0,31,36 0/1:16,25:41:99:656,0,378:13,3,16,9 +chrX 1067949 . CT C 2164.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=27.55;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;QD=27.55;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1364,0:0,0,24,25 1/1:0,31:31:93:840,93,0:0,0,18,13 +chrX 1068892 . G A 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=1.90;BaseQRankSum=-0.132;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.222;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.965;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,32:60:99:.:114,0:12,16,19,13 0/0:.:57:48:57:0,48,1165 +chrX 1068905 . G A 561 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.57;BaseQRankSum=1.245;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.121;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.152;SOR=0.815;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1800 0/1:25,22:47:99:.:591,0,642:13,12,10,12 +chrX 1069058 . G T 1861 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.18;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.18;SOR=1.047;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:1891,0:0,0,24,33 0/0:.:55:99:55:0,100,1255 +chrX 1069765 . C T 1885 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=33.02;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.02;SOR=0.914;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1915,0:0,0,32,26 0/0:.:55:99:55:0,100,1255 +chrX 1069898 . G A 612 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.46;BaseQRankSum=0.671;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=9.502;MQ=59.81;MQRankSum=1.251;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=1.271;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,1404 0/1:16,23:39:99:.:642,0,383:10,6,8,15 +chrX 1070069 . A G 2312 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=22.74;BaseQRankSum=-0.143;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.377;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.74;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.758;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1513,0:0,0,23,24 0/1:25,31:56:99:829,0,641:14,11,12,19 +chrX 1070332 . A C 3505 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=32.73;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=32.73;SOR=0.730;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1927,0:0,0,33,26 1/1:0,49:49:99:1608,147,0:0,0,22,27 +chrX 1070438 . G C 1851 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=33.00;BaseQRankSum=3.531;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=4.548;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=33.00;ReadPosRankSum=-0.73;SOR=1.351;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,56:57:99:.:1881,0:0,1,37,19 0/0:.:40:36:39:0,36,1111 +chrX 1070501 . G GAGGA 162.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=8.42;BaseQRankSum=-2.203;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.43;MQRankSum=0.993;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=0.358;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,1061 0/1:17,7:24:99:.:202,0,622:15,2,6,1 +chrX 1070544 . GAGAA G 1007.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=32.18;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=43.63;SOR=1.519;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,1061 1/1:0,24:24:73:.:1047,73,0:0,0,16,8 +chrX 1070612 . A G 1242 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=29.58;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=29.58;SOR=0.836;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1272,0:0,0,23,20 0/0:.:44:50:44:0,50,958 +chrX 1070709 . A AAAGG,AAGG 1857.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=10,43;AS_QD=28.36,31.73;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;QD=35.79;SOR=1.938;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,10,13:23:99:609,138,0:0,0,15,8 2/2:0,0,30:30:90:1288,1288,1288,90,90,0:0,0,23,7 +chrX 1070744 . GGAAA G 712.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=20.32;BaseQRankSum=2.416;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.12;MQRankSum=-0.877;QD=20.32;ReadPosRankSum=-2.218;SOR=0.566;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:25:32:0,25 0/1:17,20:37:99:.:752,0,654:10,7,11,9 +chrX 1070781 . G C 321 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=9.49;BaseQRankSum=-1.591;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.61;MQRankSum=0.453;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.402;SOR=0.655;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:25:32:0,25 0/1:21,16:37:99:.:351,0,759:12,9,9,7 +chrX 1070812 . G GA 940.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=24.50;BaseQRankSum=-0.871;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;MQRankSum=0;QD=24.50;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.569;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:8,15:23:99:.:.:322,0:.:0,0,12,3 1|1:1,16:17:7:0|1:1070812_G_GA:658,7,0:1070812:1,0,8,8 +chrX 1070844 . GAA G 1098.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=30.45;BaseQRankSum=-0.969;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.93;MQRankSum=-0.231;QD=40.64;ReadPosRankSum=1.222;SOR=0.335;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:36:99:36:.:.:0,541 1|1:1,27:28:39:.:0|1:1070812_G_GA:1138,39,0:1070812:1,0,13,14 +chrX 1070854 . AAG A 1127.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=29.30;BaseQRankSum=-0.587;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.17;MQRankSum=-0.226;QD=40.24;ReadPosRankSum=1.435;SOR=0.223;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:36:99:36:.:.:0,541 1|1:1,28:29:42:.:0|1:1070812_G_GA:1167,42,0:1070812:1,0,14,14 +chrX 1070856 . G GAGAAAGAA,GAAAGAGAAAGAA,* 106.97 . AC=0,1,2;AF=0.00,0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,15,0;AS_QD=0.00,4.56,0.00;BaseQRankSum=-1.164;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.106;MQ=59.88;MQRankSum=1.002;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.136;SOR=0.502;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:17,0,15,0:32:99:.:.:146,665,0,788:.:11,6,12,3 3|3:1,0,0,28:29:42:0|1:1070812_G_GA:1167,1170,1212,1170,1212,1212,42,84,84,0:1070812:1,0,14,14 +chrX 1070913 . A AAAG 4195.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=30.48;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=42.78;SOR=0.888;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:2043,0:0,0,24,24 1/1:0,51:51:99:2192,153,0:0,0,21,30 +chrX 1071132 . T C 830 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=32;AS_QD=14.10;BaseQRankSum=0.041;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.558;MQ=59.68;MQRankSum=-0.501;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.589;SOR=0.336;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:64:.:64:0,0 0/1:29,32:61:99:.:860,0,744:11,18,16,16 +chrX 1071249 . G A 3857 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=33.51;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.85;QD=33.51;SOR=1.003;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2051,0:0,0,31,31 1/1:0,54:54:99:1836,162,0:0,0,35,19 +chrX 1071926 . C T 908 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=15.90;BaseQRankSum=-0.655;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.05;MQRankSum=-0.263;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.656;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:84:62:0,84 0/1:24,35:59:99:.:938,0,607:14,10,20,15 +chrX 1072115 . C T 689 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.10;BaseQRankSum=1.479;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.929;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:84:62:0,84 0/1:25,26:51:99:.:719,0,645:10,15,9,17 +chrX 1072174 . T G 548 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.62;BaseQRankSum=0;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.289;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.62;ReadPosRankSum=-1.289;SOR=0.604;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:84:62:0,84 0/1:16,21:37:99:.:578,0,414:7,9,11,10 +chrX 1072429 . A G 3660 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=32.09;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;QD=32.09;SOR=0.899;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1651,0:0,0,23,29 1/1:0,63:63:99:2039,189,0:0,0,29,34 +chrX 1072455 . T G 579 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.37;BaseQRankSum=-1.159;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.210;MQ=59.65;MQRankSum=0;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.394;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,238 0/1:40,25:65:99:.:609,0,1156:14,26,11,14 +chrX 1072635 . C T 809 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.47;BaseQRankSum=1.239;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.048;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.963;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,238 0/1:28,30:58:99:.:839,0,724:17,11,20,10 +chrX 1072731 . G C 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.19;BaseQRankSum=1.291;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=4.231;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.294;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,238 0/1:27,21:48:99:.:585,0,774:19,8,12,9 +chrX 1073011 . CAAAA CAA,CAAA,CAAAAAAAAAAA,C,CAAAAA 842.97 . AC=0,2,0,1,0;AF=0.00,0.667,0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=15,18,14,14,2;AS_QD=15.12,24.05,0.38,28.75,2.00;BaseQRankSum=1.107;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=2.806;MQ=59.10;MQRankSum=-0.151;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.314;SOR=1.802;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,15,12,14,0,0:41:96:353,96,0,347,411,411:0,0,27,14 2/4:2,0,6,0,14,2:24:69:529,551,637,401,446,412,551,637,446,637,69,173,0,173,329,521,594,399,594,129,592:1,1,17,5 +chrX 1073338 . G GCATAA 1696.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=30.46;BaseQRankSum=0.354;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.788;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=30.46;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.248;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,32:34:99:.:.:974,0:.:0,2,15,17 1|1:0,23:23:68:0|1:1073338_G_GCATAA:762,68,0:1073338:0,0,6,17 +chrX 1073355 . G A,GTAACA 2362 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=57,0;AS_QD=29.87,31.30;BaseQRankSum=2.2;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=41.24;ReadPosRankSum=1.041;SOR=0.478;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,34,0:35:99:1374,0,1549:0,1,16,18 1/1:0,23,0:23:68:1018,68,0,871,118,1270:0,0,6,17 +chrX 1073457 . T A 2859 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.59;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=33.59;SOR=0.947;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1320,0:0,0,26,12 1/1:0,48:48:99:1569,144,0:0,0,22,26 +chrX 1073553 . AAAAT A 150.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=5.76;BaseQRankSum=-1.364;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.12;MQRankSum=1.319;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.782;SOR=0.722;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:84:99:84:0,1097 0/1:24,9:33:99:.:190,0,913:13,11,5,4 +chrX 1073668 . A AAAT 549.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=16.83;BaseQRankSum=-1.4;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=1.344;MQ=54.06;MQRankSum=-2.233;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.282;SOR=1.112;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:84:99:84:.:.:0,1097 0|1:19,16:35:99:.:0|1:1073668_A_AAAT:589,0,749:1073668:9,10,6,10 +chrX 1073673 . G A 559 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=16;AS_QD=16.83;BaseQRankSum=-0.452;DP=179;ExcessHet=0.0000;FS=1.344;MQ=54.10;MQRankSum=-2.233;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=1.112;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:138:.:138:.:.:0,0 0|1:19,16:35:99:.:0|1:1073668_A_AAAT:589,0,749:1073668:9,10,6,10 +chrX 1074199 . TAAAATAAAATAAAATATA T 173.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=8.19;BaseQRankSum=1.813;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=4.222;MQ=59.97;MQRankSum=0.656;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.09;SOR=1.206;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,237 0/1:19,7:26:99:.:213,0,710:11,8,2,4 +chrX 1074389 . A G 2777 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=21.27;BaseQRankSum=-0.034;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.731;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.27;ReadPosRankSum=1.002;SOR=0.572;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1816,0:0,0,29,28 0/1:36,39:75:99:991,0,897:20,16,21,18 +chrX 1074424 . C A 900 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=12.92;BaseQRankSum=-0.724;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.910;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.938;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,1479 0/1:37,35:72:99:.:930,0,1020:18,19,15,20 +chrX 1074475 . A G 3587 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=33.49;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.49;SOR=1.232;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1559,0:0,0,18,28 1/1:0,62:62:99:2058,186,0:0,0,24,38 +chrX 1074950 . G A 2076 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=33.98;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.12;SOR=1.270;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2106,0:0,0,19,31 0/0:.:50:39:46:0,39,993 +chrX 1074984 . G A 2021 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=33.74;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=41.86;SOR=1.007;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,49:49:99:.:2051,0:0,0,21,28 0/0:.:50:39:46:0,39,993 +chrX 1075133 . C A 1556 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=29.92;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=44.06;SOR=1.209;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1586,0:0,0,14,22 0/0:.:50:39:46:0,39,993 +chrX 1075135 . G A 1590 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=28.22;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=43.78;SOR=1.270;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,37:37:99:.:1620,0:0,0,14,23 0/0:.:50:39:46:0,39,993 +chrX 1075207 . C T 1407 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=34.21;BaseQRankSum=0.806;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.21;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.467;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,39:42:99:.:1437,0:2,1,21,18 0/0:.:50:39:46:0,39,993 +chrX 1075299 . A G 1023 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=21.49;BaseQRankSum=-0.745;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.390;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,48:49:99:.:1053,0:1,0,28,20 0/0:.:34:4:34:0,4,864 +chrX 1075436 . C T 1276 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=27.79;BaseQRankSum=1.681;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=13.041;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.668;SOR=0.472;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,43:47:99:.:1306,0:0,4,24,19 0/0:.:41:49:41:0,49,901 +chrX 1075526 . T C 1303 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=31.74;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.74;SOR=1.259;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,800 1/1:0,42:42:99:.:1333,126,0:0,0,26,16 +chrX 1075573 . G A 1502 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=31.27;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.27;SOR=1.345;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,800 1/1:0,49:49:99:.:1532,147,0:0,0,31,18 +chrX 1075639 . A C 670 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.50;BaseQRankSum=-1.998;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.182;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.493;SOR=0.587;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,800 0/1:27,29:56:99:.:700,0,728:12,15,15,14 +chrX 1075771 . G C,GATAC 667 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=23,0;AS_QD=12.67,0.00;BaseQRankSum=0.768;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.361;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.371;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,800,800 0/1:32,23,0:55:99:.:697,0,1015,767,1040,2328:20,12,12,11 +chrX 1076249 . GAA G,GA,GAAA 1744.97 . AC=1,0,2;AF=0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=17,15,49;AS_QD=32.28,36.29,23.82;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=22.02;SOR=1.124;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,15,0:32:61:617,0,61,536:0,0,17,15 3/3:0,0,0,49:49:99:1167,1167,1167,1167,1167,1167,145,145,145,0:0,0,31,18 +chrX 1076280 . C T 2842 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.22;BaseQRankSum=-0.548;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=31.22;ReadPosRankSum=0.128;SOR=0.258;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1220,0:0,0,17,21 1/1:1,53:54:99:1652,127,0:0,1,29,24 +chrX 1076678 . CA C 2130.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=25.53;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.53;SOR=0.243;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1138,0:0,0,22,20 1/1:1,40:41:97:1032,97,0:0,1,18,22 +chrX 1076933 . T C 2963 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=31.84;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.84;SOR=0.976;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1516,0:0,0,26,23 1/1:0,45:45:99:1477,135,0:0,0,27,18 +chrX 1077471 . A G 3587 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=32.29;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.29;SOR=1.061;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2297,0:0,0,42,30 1/1:0,40:40:99:1320,120,0:0,0,23,17 +chrX 1077668 . G A 213 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=4.86;BaseQRankSum=0.812;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.799;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,28:50:99:.:243,0:12,10,16,12 0/0:.:54:99:54:0,101,1377 +chrX 1077834 . A G 1776 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.25;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=32.25;SOR=1.302;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:55:49:0,55 1/1:0,56:56:99:.:1806,167,0:0,0,21,35 +chrX 1077865 . G A 1742 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=33.43;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=33.43;SOR=1.287;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:55:49:0,55 1/1:0,53:53:99:.:1772,159,0:0,0,20,33 +chrX 1078063 . C T 1155 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=32.03;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.40;QD=32.03;SOR=0.984;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:55:49:0,55 1/1:0,37:37:99:.:1185,110,0:0,0,21,16 +chrX 1078130 . G GTATATATATATATA,GTGTATATATATATATA,GTA,GTATATA,GTGTGTA,GTGTGTGTA,GTGTGTATATA,GTGTGTGTATATA 1627.97 . AC=0,1,0,0,0,1,1,0;AF=0.00,0.333,0.00,0.00,0.00,0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=1,6,0,0,0,13,9,0;AS_QD=0.00,29.03,20.67,20.33,29.23,28.85,30.59,27.90;BaseQRankSum=0;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=5.968;MQ=57.80;MQRankSum=1.019;QD=52.09;ReadPosRankSum=-0.984;SOR=0.088;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:SB 2:3,1,6,0,0,0,0,0,0:10:99:3,0,5,2 6/7:0,0,0,0,0,0,13,9,0:22:99:0,0,11,11 +chrX 1078257 . T TG 3235.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.67;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=37.22;SOR=0.836;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1456,0:0,0,18,21 1/1:0,49:49:99:1819,147,0:0,0,29,20 +chrX 1078314 . G A 1597 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.54;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=0.952;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:40:36:40:0,36 1/1:0,50:50:99:.:1627,150,0:0,0,28,22 +chrX 1079244 . C T 412 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=6.05;BaseQRankSum=2.398;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=8.215;MQ=59.92;MQRankSum=-1.204;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=1.531;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,42:73:99:.:442,0:16,15,14,28 0/0:.:54:52:54:0,52,837 +chrX 1079312 . T C 1586 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.32;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.32;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:20:58:0,20 1/1:0,50:50:99:.:1616,149,0:0,0,24,26 +chrX 1079367 . A C 1573 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.71;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.71;SOR=0.818;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:20:58:0,20 1/1:0,49:49:99:.:1603,146,0:0,0,26,23 +chrX 1079465 . G C 5888 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=31.95;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.84;SOR=1.011;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3113,0:.:0,0,29,42 1|1:0,64:64:99:0|1:1079465_G_C:2805,193,0:1079465:0,0,29,35 +chrX 1079474 . C G 5725 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=23.34;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.27;SOR=1.085;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,68:68:99:.:.:3019,0:.:0,0,27,41 1|1:0,62:62:99:0|1:1079465_G_C:2736,187,0:1079465:0,0,27,35 +chrX 1079571 . T C 3201 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=25.64;BaseQRankSum=-0.991;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;MQRankSum=0.33;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.645;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,32:54:84:.:.:84,0:.:16,6,24,8 1|1:0,72:72:99:0|1:1079571_T_C:3147,217,0:1079571:0,0,49,23 +chrX 1079589 . C T 3013 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=29.82;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=1.576;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,1593 1|1:0,69:69:99:.:0|1:1079571_T_C:3043,208,0:1079571:0,0,46,23 +chrX 1079609 . G A 1588 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=29.96;BaseQRankSum=2.431;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.421;MQ=59.05;MQRankSum=-0.353;QD=29.96;ReadPosRankSum=1.146;SOR=2.215;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,52:54:99:.:1618,0:1,1,39,13 0/0:.:63:72:63:0,72,1439 +chrX 1079851 . CT C,CTTTT,CTT 1011.97 . AC=0,1,2;AF=0.00,0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=16,20,33;AS_QD=12.65,20.00,18.56;BaseQRankSum=-0.561;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=3.827;MQ=59.37;MQRankSum=0;QD=15.01;ReadPosRankSum=-1.634;SOR=0.853;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,16,20,0:36:99:420,205,0,662:0,0,24,12 3/3:1,0,0,33:34:80:631,634,652,634,652,652,80,97,97,0:0,1,17,16 +chrX 1080345 . A T 3450 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=26.98;BaseQRankSum=-0.04;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;MQRankSum=1.794;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.415;SOR=0.666;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,37:61:99:.:.:533,0:.:10,14,12,25 1|1:0,68:68:99:0|1:1080345_A_T:2947,205,0:1080345:0,0,33,35 +chrX 1080361 . C T 3335 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=27.58;BaseQRankSum=-0.525;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;MQRankSum=1.825;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.714;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,35:57:99:.:.:523,0:.:9,13,10,25 1|1:0,65:65:99:0|1:1080345_A_T:2842,196,0:1080345:0,0,31,34 +chrX 1080677 . G A 1839 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.22;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=32.22;SOR=0.693;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:64:51:0,64 1/1:0,58:58:99:.:1869,174,0:0,0,29,29 +chrX 1080953 . C T 1881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.95;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.54;QD=32.95;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:64:51:0,64 1/1:0,58:58:99:.:1911,174,0:0,0,31,27 +chrX 1081259 . A ACCCTGTCTCT 3150.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=29.26;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.85;QD=41.97;SOR=1.349;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:64:51:.:.:0,64 1|1:0,76:76:99:.:0|1:1081259_A_ACCCTGTCTCT:3190,228,0:1081259:0,0,28,48 +chrX 1081260 . A ACTAAAAATACAAAAATTGGTCAGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGAATCATGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 3150.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=27.55;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.85;QD=41.97;SOR=1.349;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:64:51:.:.:0,64 1|1:0,76:76:99:.:0|1:1081259_A_ACCCTGTCTCT:3190,228,0:1081259:0,0,28,48 +chrX 1081343 . A G 1347 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=34.43;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.34;QD=34.43;SOR=0.793;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:64:51:0,64 1/1:0,40:40:99:.:1377,120,0:0,0,21,19 +chrX 1081393 . A G 1031 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=31.21;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.14;QD=31.21;SOR=2.584;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:64:51:0,64 1/1:0,34:34:99:.:1061,101,0:0,0,27,7 +chrX 1081436 . C CAAAA,CAAAAAA 2078.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=18,39;AS_QD=20.29,33.52;BaseQRankSum=0.601;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=4.126;MQ=57.92;MQRankSum=-1.181;QD=33.62;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.165;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,18,0:24:99:487,0,750:5,1,11,7 2/2:0,0,39:39:99:1631,1632,1633,116,117,0:0,0,21,18 +chrX 1081985 . C T 4069 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=31.78;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.78;SOR=0.988;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2128,0:0,0,38,29 1/1:0,62:62:99:1971,185,0:0,0,35,27 +chrX 1082081 . C T 2105 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=33.36;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=33.36;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:64:60:0,64 1/1:0,64:64:99:.:2135,192,0:0,0,30,34 +chrX 1082261 . T A 2371 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.45;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.45;SOR=0.804;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:99:73:0,269 1/1:0,74:74:99:.:2401,222,0:0,0,39,35 +chrX 1083442 . C CAA,CA 1514.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=32,38;AS_QD=27.41,17.82;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;QD=22.20;SOR=1.329;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32,0:32:99:877,0,877:0,0,12,20 2/2:0,0,38:38:99:677,677,677,108,108,0:0,0,14,24 +chrX 1083477 . G A 1832 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.67;BaseQRankSum=2.935;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;MQRankSum=-0.095;QD=32.67;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.252;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,56:57:99:.:1862,0:0,1,27,29 0/0:.:63:79:63:0,79,1201 +chrX 1083657 . C T 1487 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=32.79;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=41.00;SOR=0.859;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,37:37:99:.:1517,0:0,0,20,17 0/0:.:37:83:37:0,83,1141 +chrX 1083667 . CGACCCAGAGGGCTAGAATTGATAGGGTTGTGTCCCAGGGGGCTAAGATTCGTAGGGTTAT C 1379.97 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=35;AS_QD=34.51;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=3.259;MQ=59.43;MQRankSum=4.364;QD=39.42;SOR=0.491;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,35:36:99:.:1419,0:0,1,19,16 ./.:.:0:.:0:0,0,0 +chrX 1084241 . G C 233 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=9;AS_QD=26.30;BaseQRankSum=1.036;DP=10;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=42.73;MQRankSum=0.385;QD=26.30;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.307;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,9:10:99:.:263,0:1,0,5,4 ./.:.:0:.:0:0,0,0 +chrX 1084898 . T C 5414 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=29.49;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.26;SOR=0.709;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3149,0:.:0,0,38,33 1|1:0,52:52:99:0|1:1084898_T_C:2295,157,0:1084898:0,0,23,29 +chrX 1084899 . T A 5414 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=21.26;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.26;SOR=0.709;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3149,0:.:0,0,38,33 1|1:0,52:52:99:0|1:1084898_T_C:2295,157,0:1084898:0,0,23,29 +chrX 1085116 . CT C 3880.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.55;BaseQRankSum=3.429;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.30;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.263;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,48:49:99:.:.:1326,0:.:0,1,16,32 1|1:0,59:59:99:0|1:1085116_CT_C:2594,178,0:1085116:0,0,35,24 +chrX 1085130 . T C 2658 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=30.16;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.35;SOR=1.143;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1740 1|1:0,62:62:99:.:0|1:1085116_CT_C:2688,187,0:1085116:0,0,37,25 +chrX 1085238 . T C 3546 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=31.65;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.65;SOR=0.711;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1835,0:0,0,33,26 1/1:0,54:54:99:1741,162,0:0,0,23,31 +chrX 1085316 . A G 1776 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=31.68;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.68;SOR=0.728;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:1806,0:0,0,28,29 0/0:.:61:99:61:0,120,1800 +chrX 1085595 . G A 1542 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=31.44;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.44;SOR=1.051;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1707 1/1:0,50:50:99:.:1572,149,0:0,0,21,29 +chrX 1085652 . G A 2224 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=34.15;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.15;SOR=0.886;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2254,0:0,0,36,30 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 1085708 . G C 3152 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=29.35;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.00;SOR=1.061;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,74:74:99:.:3182,0:0,0,43,31 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 1085724 . C A 2943 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=28.74;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=1.179;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,68:68:99:.:2973,0:0,0,41,27 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 1085802 . C CACCCAAAGGGCTGAATTCATAGGGTCGTGACTCATTGTGCTGGATTTGCTGAATTTTGACTCAGAGGGCTAAGAGTTGTAGGGTTATGCCTTATAAAGCTAGATTGATTGTGTTGTGACCCATGGGGCTGAGATTTATAGGGTTGCG 4732.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=31.40;BaseQRankSum=0.146;DP=197;ExcessHet=0.0000;FS=2.425;MQ=57.77;MQRankSum=-1.85;QD=36.43;ReadPosRankSum=-1.218;SOR=0.355;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,117:131:99:.:4772,0:9,5,61,56 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 1085821 . G A 2098 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=49;AS_QD=35.35;BaseQRankSum=2.403;DP=156;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.86;MQRankSum=-0.266;QD=42.56;ReadPosRankSum=-1.179;SOR=0.239;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:104:.:104:.:.:0,0 1|1:1,49:50:99:.:0|1:1085821_G_A:2128,141,0:1085821:1,0,25,24 +chrX 1085829 . A G 2167 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=51;AS_QD=27.61;DP=161;ExcessHet=0.0000;FS=3.181;MQ=57.65;MQRankSum=-0.3;QD=42.25;SOR=0.408;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:107:.:107:.:.:0,0 1|1:1,51:52:99:.:0|1:1085821_G_A:2197,147,0:1085821:1,0,24,27 +chrX 1085881 . T C 1236 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.09;BaseQRankSum=2.81;DP=205;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.12;MQRankSum=1.024;QD=18.09;ReadPosRankSum=2.921;SOR=0.741;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:132:49:132:0,49 0/1:23,47:70:99:.:1266,0,378:10,13,20,27 +chrX 1086093 . G T 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=1.50;BaseQRankSum=2.826;DP=209;ExcessHet=0.0000;FS=5.224;MQ=45.49;MQRankSum=-2.715;QD=1.50;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.852;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:66,10:76:99:.:0|1:1086093_G_T:114,0,2148:1086093:41,25,4,6 +chrX 1086116 . G A 1067 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.28;BaseQRankSum=1.155;DP=199;ExcessHet=0.0000;FS=13.748;MQ=45.59;MQRankSum=-2.646;QD=18.28;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.727;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:29,31:60:99:.:0|1:1086116_G_A:1097,0,996:1086116:20,9,13,18 +chrX 1086121 . A G 985 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=18.13;BaseQRankSum=-0.136;DP=193;ExcessHet=0.0000;FS=12.236;MQ=45.38;MQRankSum=-2.889;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=0.916;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:28,28:56:99:.:0|1:1086116_G_A:1015,0,983:1086116:19,9,11,17 +chrX 1086232 . A T 379 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=19.48;BaseQRankSum=-0.616;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.69;MQRankSum=-1.077;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.551;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:4,17:21:99:.:0|1:1086232_A_T:409,0,129:1086232:1,3,6,11 +chrX 1086233 . T C 379 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=19.48;BaseQRankSum=-0.616;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.69;MQRankSum=-1.077;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.551;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:4,17:21:99:.:0|1:1086232_A_T:409,0,129:1086232:1,3,6,11 +chrX 1086444 . A G 46 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=0.70;BaseQRankSum=0.594;DP=244;ExcessHet=0.0000;FS=4.239;MQ=49.69;MQRankSum=-0.116;QD=0.704;ReadPosRankSum=1.007;SOR=1.322;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:96,12:108:76:.:0|1:1086444_A_G:76,0,3576:1086444:46,50,4,8 +chrX 1086527 . A T 379 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=3.90;BaseQRankSum=-2.014;DP=241;ExcessHet=0.0000;FS=2.180;MQ=42.87;MQRankSum=-2.455;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.336;SOR=1.087;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:87,18:105:99:.:0|1:1086527_A_T:409,0,3417:1086527:42,45,7,11 +chrX 1086528 . T C 379 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=3.90;BaseQRankSum=-1.758;DP=241;ExcessHet=0.0000;FS=2.180;MQ=42.87;MQRankSum=-2.455;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.611;SOR=1.087;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:87,18:105:99:.:0|1:1086527_A_T:409,0,3417:1086527:42,45,7,11 +chrX 1086657 . G A 419 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=5.91;BaseQRankSum=-0.192;DP=209;ExcessHet=0.0000;FS=15.459;MQ=48.34;MQRankSum=-3.628;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=2.584;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:58,18:76:99:.:0|1:1086657_G_A:449,0,2149:1086657:27,31,3,15 +chrX 1086683 . T G 202 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=3.52;BaseQRankSum=2.008;DP=199;ExcessHet=0.0000;FS=24.502;MQ=52.82;MQRankSum=-4.72;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.48;SOR=4.804;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:132:49:132:.:.:0,49 0|1:56,10:66:99:.:0|1:1086657_G_A:232,0,2081:1086657:28,28,0,10 +chrX 1086706 . G A 65 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=1.46;BaseQRankSum=0.451;DP=197;ExcessHet=0.0000;FS=8.196;MQ=54.27;MQRankSum=-3.938;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.197;SOR=2.147;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:132:49:132:0,49 0/1:56,9:65:95:.:95,0,1561:21,35,1,8 +chrX 1086780 . G A 3784 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.88;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.693;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1918,0:0,0,31,28 1/1:0,57:57:99:1896,171,0:0,0,27,30 +chrX 1087090 . C T 1742 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=33.43;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.43;SOR=1.077;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:1772,0:0,0,31,22 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1087227 . G C 212 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=4.25;BaseQRankSum=2.127;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.154;SOR=0.593;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,31:57:99:.:242,0:15,11,17,14 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1087919 . T C 1881 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.53;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.53;SOR=0.728;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:1911,0:0,0,29,28 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1088150 . G A 332 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=4.16;BaseQRankSum=0.84;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.814;MQ=57.57;MQRankSum=2.639;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.542;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:39,48:87:99:.:362,0:17,22,23,25 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1088173 . A AG 306.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=4.33;BaseQRankSum=0.871;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.840;MQ=57.63;MQRankSum=2.365;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.577;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,44:80:99:.:346,0:16,20,21,23 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1088175 . A T 3386 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=31.98;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.63;QD=43.24;SOR=0.881;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,79:79:99:.:3416,0:0,0,36,43 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1088222 . G A 582 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=11.55;BaseQRankSum=-1.578;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=8.351;MQ=54.74;MQRankSum=4.686;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.54;SOR=0.148;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,34:53:99:.:612,0:14,5,17,17 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1088238 . A T 2206 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=25.65;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.32;QD=43.00;SOR=0.941;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:2236,0:0,0,29,23 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1088321 . C T 402 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=5.47;BaseQRankSum=0.468;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.843;MQ=55.79;MQRankSum=-2.93;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.575;SOR=0.818;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,43:79:99:.:432,0:19,17,24,19 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1088334 . G A 565 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=6.54;BaseQRankSum=0.731;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.71;MQRankSum=-2.562;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.74;SOR=0.691;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:40,51:91:99:.:595,0:22,18,28,23 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1088342 . T A 1064 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=12.29;BaseQRankSum=0.683;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.74;MQRankSum=-2.152;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.747;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,57:89:99:.:1094,0:17,15,31,26 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1088495 . C CT 582.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=23.92;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.74;QD=23.92;SOR=1.220;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:622,0:0,0,10,16 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1089188 . G T 242 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=5.13;BaseQRankSum=0.179;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.347;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=0.768;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,31:53:99:.:272,0:10,12,17,14 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1091401 . A G 314 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=5.55;BaseQRankSum=-2.111;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=5.201;MQ=59.74;MQRankSum=1.291;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.207;SOR=1.093;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,38:62:99:.:344,0:11,13,23,15 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1092556 . T C 677 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=12.63;BaseQRankSum=0.022;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.859;MQ=59.06;MQRankSum=-1.644;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=1.062;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,37:56:99:.:707,0:10,9,15,22 0/0:.:32:22:27:0,22,808 +chrX 1093454 . A G 2394 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=22.04;BaseQRankSum=-0.149;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.04;ReadPosRankSum=1.46;SOR=0.791;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,27:52:46:.:.:46,0:.:12,13,13,14 1|1:1,57:58:99:0|1:1093454_A_G:2378,129,0:1093454:1,0,27,30 +chrX 1093476 . C T 2475 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=21.78;BaseQRankSum=0.077;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.561;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.986;SOR=0.529;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,28:55:36:.:.:36,0:.:16,11,13,15 1|1:1,59:60:99:0|1:1093454_A_G:2469,135,0:1093454:1,0,28,31 +chrX 1093541 . GA G 1642.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=15.57;BaseQRankSum=0.501;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=6.166;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.274;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,23:46:31:31,0:16,7,14,9 1/1:1,61:62:99:1651,159,0:1,0,33,28 +chrX 1094544 . T TCA 1773.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=17.43;BaseQRankSum=-0.684;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=9.632;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.196;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,28:54:37:37,0:7,19,13,15 1/1:0,50:50:99:1776,150,0:0,0,23,27 +chrX 1094592 . G A 1460 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=33.86;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.86;SOR=0.883;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:49:55:0,49 1/1:0,44:44:99:.:1490,132,0:0,0,20,24 +chrX 1094634 . T C 1845 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=34.72;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.72;SOR=1.118;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:49:55:0,49 1/1:0,54:54:99:.:1875,162,0:0,0,22,32 +chrX 1094714 . T C 1975 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=16.99;BaseQRankSum=-1.075;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=4.139;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=0.381;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,30:57:64:64,0:17,10,15,15 1/1:0,61:61:99:1941,182,0:0,0,33,28 +chrX 1095293 . C T 3735 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=33.92;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.92;SOR=0.786;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1905,0:0,0,27,29 1/1:0,55:55:99:1860,165,0:0,0,26,29 +chrX 1095437 . A G 751 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.24;BaseQRankSum=-0.728;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.177;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.555;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,521 0/1:30,29:59:99:.:781,0,821:17,13,14,15 +chrX 1095595 . A G 3998 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=31.22;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=31.22;SOR=0.840;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2099,0:0,0,36,30 1/1:0,63:63:99:1929,188,0:0,0,33,30 +chrX 1095743 . G A 3140 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=33.37;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.13;QD=33.37;SOR=0.802;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1518,0:0,0,23,23 1/1:0,49:49:99:1652,147,0:0,0,22,27 +chrX 1096088 . G A 2955 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.80;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.80;SOR=1.191;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1729,0:0,0,34,18 1/1:0,39:39:99:1256,117,0:0,0,21,18 +chrX 1096291 . G A 4843 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=31.69;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.67;SOR=0.862;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2788,0:0,0,33,36 1/1:0,57:57:99:2085,171,0:0,0,25,32 +chrX 1096298 . G A 1023 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=8.29;BaseQRankSum=2.14;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.191;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.877;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,42:71:99:443,0:15,14,20,22 0/1:33,23:56:99:610,0,869:17,16,9,14 +chrX 1096319 . C T 979 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=17.70;BaseQRankSum=-0.876;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.326;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.877;SOR=0.602;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,485 0/1:21,36:57:99:.:1009,0,523:9,12,19,17 +chrX 1096607 . C T 3488 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.57;BaseQRankSum=2.317;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=3.613;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=32.57;ReadPosRankSum=1.064;SOR=0.688;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1712,0:0,0,29,22 1/1:1,56:57:99:1806,161,0:0,1,32,24 +chrX 1096641 . G A 658 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.23;BaseQRankSum=0.193;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.090;MQ=59.83;MQRankSum=-0.924;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.458;SOR=0.998;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,1371 0/1:25,27:52:99:.:688,0,618:14,11,17,10 +chrX 1096900 . C T 4134 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=32.53;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.53;SOR=0.757;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2204,0:0,0,34,33 1/1:0,61:61:99:1960,182,0:0,0,28,33 +chrX 1096983 . A G 3788 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=30.79;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=30.79;SOR=1.788;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2069,0:0,0,45,20 1/1:0,59:59:99:1749,175,0:0,0,41,18 +chrX 1097313 . A G,T 3163 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=103,2;AS_QD=31.00,22.00;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=30.41;SOR=0.791;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46,2:48:99:1419,0,1375:0,0,24,24 1/1:0,57,0:57:99:1774,169,0,1774,169,1774:0,0,26,31 +chrX 1098079 . A ATT 650.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=7.67;BaseQRankSum=-0.657;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=5.229;MQ=59.66;MQRankSum=-0.85;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.671;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,25:45:95:95,0:8,12,13,12 0/1:22,23:45:99:595,0,630:10,12,13,10 +chrX 1098644 . C G 2968 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=32.24;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.08;QD=32.24;SOR=0.901;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1627,0:0,0,27,24 1/1:0,42:42:99:1371,126,0:0,0,24,18 +chrX 1098714 . C G 2921 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.43;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;QD=32.43;SOR=1.014;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1482,0:0,0,24,21 1/1:0,46:46:99:1469,138,0:0,0,28,18 +chrX 1098785 . G A 3519 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=32.86;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=32.86;SOR=1.179;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1731,0:0,0,33,19 1/1:0,56:56:99:1818,168,0:0,0,32,24 +chrX 1099064 . TA T 262.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=7.74;BaseQRankSum=0.696;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.237;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.926;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:47:53:0,47 0/1:23,16:39:99:.:302,0,481:10,13,6,10 +chrX 1099285 . G A 716 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.23;BaseQRankSum=1.629;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=11.275;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.795;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:47:53:0,47 0/1:32,29:61:99:.:746,0,713:21,11,12,17 +chrX 1099341 . T C 734 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.92;BaseQRankSum=0.345;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=10.982;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=1.086;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:47:53:0,47 0/1:21,27:48:99:.:764,0,556:7,14,17,10 +chrX 1099763 . G C 1053 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=17.47;BaseQRankSum=-0.525;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.332;MQ=59.23;MQRankSum=1.88;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.284;SOR=0.731;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:47:53:0,47 0/1:23,39:62:99:.:1083,0,568:9,14,22,17 +chrX 1100147 . A G 530 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=6.59;BaseQRankSum=0.112;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.814;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.487;SOR=0.563;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,27:48:99:130,0:8,13,15,12 0/1:20,17:37:99:430,0,602:14,6,7,10 +chrX 1100375 . T C 646 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=8.35;BaseQRankSum=-0.666;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.856;MQ=59.54;MQRankSum=1.163;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.885;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:14,22:36:99:161,0:10,4,12,10 0/1:20,25:45:99:515,0,483:8,12,15,10 +chrX 1100494 . A T 57 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=4.14;BaseQRankSum=0.221;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=5.566;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.074;SOR=2.303;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,189 0/1:16,5:21:87:.:87,0,423:11,5,5,0 +chrX 1100656 . C CA 334.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.35;BaseQRankSum=1.643;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.179;SOR=0.718;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,189 0/1:21,19:40:99:.:374,0,429:11,10,9,10 +chrX 1101357 . G T 640 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=17.18;BaseQRankSum=-1.059;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.83;MQRankSum=1.531;QD=17.18;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=0.885;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,189 0|1:21,18:39:99:.:0|1:1101357_G_T:670,0,814:1101357:3,18,2,16 +chrX 1101362 . A G 582 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=17.00;BaseQRankSum=-2.309;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.15;MQRankSum=1.387;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.804;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,189 0|1:20,16:36:99:.:0|1:1101357_G_T:612,0,792:1101357:3,17,2,14 +chrX 1101388 . G C 327 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=11.52;BaseQRankSum=-1.872;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.14;MQRankSum=0.387;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.752;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,189 0|1:21,10:31:99:.:0|1:1101357_G_T:357,0,801:1101357:5,16,2,8 +chrX 1101588 . G C 47 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=8.56;BaseQRankSum=0.431;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=3.332;MQ=47.45;MQRankSum=1.981;QD=8.56;ReadPosRankSum=-2.26;SOR=2.833;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,189 0/1:6,3:9:77:.:77,0,154:3,3,3,0 +chrX 1101893 . C T 888 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.13;BaseQRankSum=-2.438;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.57;MQRankSum=-1.137;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.873;SOR=0.640;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,189 0|1:21,27:48:99:.:0|1:1101893_C_T:918,0,759:1101893:12,9,15,12 +chrX 1101918 . G A 839 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=18.10;BaseQRankSum=-1.265;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.098;MQ=56.99;MQRankSum=-0.523;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.527;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,189 0|1:23,25:48:99:.:0|1:1101893_C_T:869,0,819:1101893:14,9,14,11 +chrX 1103446 . A G 1241 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=10.68;BaseQRankSum=-1.847;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.415;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.841;SOR=0.698;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,35:59:99:201,0:12,12,22,13 0/1:21,39:60:99:1070,0,528:9,12,17,22 +chrX 1103650 . C T 1068 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=28;AS_QD=24.40;BaseQRankSum=-0.258;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.199;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.40;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.425;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:78:.:78:.:.:0,0 0|1:17,28:45:99:.:0|1:1103650_C_T:1098,0,630:1103650:7,10,14,14 +chrX 1103656 . T C 1009 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=24.16;BaseQRankSum=-0.659;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.217;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.425;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:25:78:.:.:0,25 0|1:17,26:43:99:.:0|1:1103650_C_T:1039,0,636:1103650:7,10,13,13 +chrX 1103776 . A C 4630 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=147;AS_QD=31.70;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;QD=31.70;SOR=0.852;VarDP=147 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,81:81:99:2553,0:0,0,41,40 1/1:0,66:66:99:2107,198,0:0,0,38,28 +chrX 1104041 . C G 1899 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.69;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=32.69;SOR=1.773;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1929,0:0,0,18,41 0/0:.:59:65:59:0,65,1534 +chrX 1104392 . A G 250 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=4.12;BaseQRankSum=0.427;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.928;MQ=59.86;MQRankSum=0.147;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.24;SOR=0.910;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,37:68:99:.:280,0:16,15,21,16 0/0:.:59:65:59:0,65,1534 +chrX 1104697 . A G 2334 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=20.74;BaseQRankSum=2.436;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.619;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.74;ReadPosRankSum=1.4;SOR=0.876;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,56:57:99:1766,0:1,0,31,25 0/1:34,23:57:99:598,0,929:17,17,13,10 +chrX 1104816 . TATAA T 4136.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=29.83;BaseQRankSum=-0.434;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=4.530;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.511;SOR=0.550;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,77:78:99:3386,0:0,1,38,39 0/1:39,23:62:99:790,0,1516:17,22,14,9 +chrX 1105099 . A G 1050 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=7.71;BaseQRankSum=-1.217;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=4.021;MQ=59.97;MQRankSum=1.122;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.443;SOR=1.052;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,37:68:71:71,0:17,14,23,14 0/1:34,38:72:99:1009,0,909:16,18,21,17 +chrX 1105264 . A C 712 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.49;BaseQRankSum=0.013;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.749;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=1.138;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,490 0/1:27,28:55:99:.:742,0,724:14,13,11,17 +chrX 1105518 . G A 1073 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=9.59;BaseQRankSum=-0.356;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.477;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.36;SOR=1.015;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,38:65:99:304,0:11,16,25,13 0/1:22,28:50:99:799,0,604:16,6,16,12 +chrX 1105690 . C G 1950 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=33.00;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=0.986;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,213 1/1:0,60:60:99:.:1980,180,0:0,0,26,34 +chrX 1106001 . T C 695 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.68;BaseQRankSum=1.764;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=0.631;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,213 0|1:27,26:53:99:.:0|1:1106001_T_C:725,0,709:1106001:12,15,12,14 +chrX 1106050 . G C 3898 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=33.80;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.64;SOR=0.784;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1777,0:.:0,0,23,18 1|1:0,49:49:99:0|1:1106001_T_C:2151,147,0:1106001:0,0,20,29 +chrX 1106057 . AGAG A 3771.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=28.45;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.80;SOR=0.763;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1708,0:.:0,0,22,17 1|1:0,48:48:99:0|1:1106001_T_C:2103,144,0:1106001:0,0,20,28 +chrX 1106379 . A AAG 3053.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=27.01;BaseQRankSum=-0.86;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=3.066;MQ=59.14;MQRankSum=-0.129;QD=39.15;ReadPosRankSum=-0.65;SOR=0.304;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1895,0:0,0,22,25 1/1:1,31:32:55:1198,55,0:1,0,16,15 +chrX 1106507 . G A 469 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.68;BaseQRankSum=-1.123;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=0.560;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,189 0/1:13,21:34:99:.:499,0,316:8,5,12,9 +chrX 1106604 . A AAGAG 37.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=2.57;BaseQRankSum=0.804;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.415;MQ=59.75;MQRankSum=-0.869;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=0.446;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,16:30:77:.:77,0:9,5,9,7 0/0:.:39:32:32:0,32,834 +chrX 1106916 . A G,T 1245 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=6,40;AS_QD=11.14,31.10;BaseQRankSum=1.189;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=27.13;ReadPosRankSum=0.664;SOR=0.223;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:60:42:0,60,60 2/2:1,6,40:47:48:.:1275,1206,1197,113,48,0:1,0,23,23 +chrX 1106972 . G A 430 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.02;BaseQRankSum=0.157;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.38;SOR=0.671;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:60:42:0,60 0/1:32,19:51:99:.:460,0,850:17,15,10,9 +chrX 1107115 . C T 74 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=2.31;BaseQRankSum=0.193;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.561;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=0.669;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,24:45:99:.:104,0:12,9,11,13 0/0:.:57:63:57:0,63,1190 +chrX 1107197 . T G 163 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=3.78;BaseQRankSum=-2.012;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=10.488;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.78;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=0.773;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,29:51:99:.:193,0:15,7,12,17 0/0:.:57:63:57:0,63,1190 +chrX 1107893 . G C 2471 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.91;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=32.91;SOR=1.121;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,76:76:99:.:2501,0:0,0,45,31 0/0:.:57:63:57:0,63,1190 +chrX 1107922 . G C 2128 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=31.74;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.74;SOR=0.814;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,68:68:99:.:2158,0:0,0,36,32 0/0:.:57:63:57:0,63,1190 +chrX 1109012 . G A 2360 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=28.41;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.45;SOR=1.262;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2390,0:0,0,34,21 0/0:.:57:63:57:0,63,1190 +chrX 1109019 . G C 2360 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=33.52;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.45;SOR=1.159;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2390,0:0,0,33,22 0/0:.:57:63:57:0,63,1190 +chrX 1109095 . C T 2162 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=31.52;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=39.14;SOR=0.922;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:2192,0:0,0,31,25 0/0:.:57:63:57:0,63,1190 +chrX 1109463 . C CAAGA 694.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=20.97;BaseQRankSum=0.422;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.478;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.97;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.458;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:35:50:0,35 0/1:14,21:35:99:.:734,0,461:11,3,15,6 +chrX 1109608 . GGGAA G 389.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.46;BaseQRankSum=0.235;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=6.747;MQ=59.45;MQRankSum=1.367;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.432;SOR=1.057;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,26:41:99:.:429,0:9,6,10,16 0/0:.:64:37:56:0,37,874 +chrX 1109622 . T G,TGAAAGGAAAGGAAGGAAAG 1473 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=28,14;AS_QD=30.65,29.24;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.99;QD=35.79;SOR=0.788;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28,14:42:99:.:1503,0,655:0,0,20,22 0/0:.:64:37:56:0,37,874,37,874,874 +chrX 1110351 . GTC G 311.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=6.16;BaseQRankSum=2.052;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.245;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=0.763;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,33:57:99:.:351,0:11,13,18,15 0/0:.:64:37:56:0,37,874 +chrX 1110509 . A ATGCATGCTAGTGTGTGTGTATGTAGGCATCTGTGTGTACGCATGCTAGTATATGTGAACACACGTGTATGTGCATGAATACTAGTGTGTTTATGTATGTGTGTATGTAGGCGTCTGTGTGTATGCATCTGTATCTGTGCATGCATGCTAGTGTGTTTGTGTGCACATGGGTG,ATGCATGCTAGTGTGTGTGTATGTAGGCATCTGTGTGTATGCATGCTAGTATATGTGAACACACGTGTATGTGCATGAATACTAGTGTGTTTATGTATGTGTGTATGTAGGCGTCTGTGTGTATGCATCTGTATCTGTGCATGCATGCTAGTGTGTTTGTGTGCACATGGGTG,ATGCATGCTAGTGTGTGTGTATGTAGGCATCTGTGTGTATGCATGCTAGTATATGTGAACACACGTGTATGTGCATGAATACTAGGGTGTTTATGTATGTGTGTATGTAGGCGTCTGTGTGTATGCATCTGTATCTGTGCATGCATGCTAGTGTGTTTGTGTGCACATGGGTG 6092.97 . AC=0,1,2;AF=0.00,0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=14,17,81;AS_QD=29.76,32.91,28.12;BaseQRankSum=0.16;DP=184;ExcessHet=0.0000;FS=2.930;MQ=58.78;MQRankSum=-1.021;QD=50.26;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.286;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,14,17,0:31:99:2685,119,0,2756:0,0,10,21 3/3:10,0,0,81:91:99:3447,3460,3479,3460,3479,3479,223,243,243,0:3,7,42,39 +chrX 1110562 . T C 261 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=5.71;BaseQRankSum=-1.029;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.281;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.573;SOR=0.287;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,31:51:99:.:291,0:15,5,19,12 0/0:.:46:95:46:0,95,1240 +chrX 1110980 . G A 124 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=2.57;BaseQRankSum=-0.82;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=3.878;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.283;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,33:60:99:.:154,0:7,20,13,20 0/0:.:41:26:40:0,26,1091 +chrX 1111650 . G GGA 2143.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=30.34;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.98;SOR=1.101;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:2183,0:0,0,33,23 0/0:.:41:26:40:0,26,1091 +chrX 1112120 . G GC 420.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=14.38;BaseQRankSum=-0.186;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.393;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.548;SOR=1.022;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,769 0/1:17,15:32:99:.:460,0,477:10,7,10,5 +chrX 1112283 . A G 2656 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=23.16;BaseQRankSum=-0.951;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.009;SOR=0.690;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1994,0:0,0,32,30 0/1:27,27:54:99:692,0,722:13,14,11,16 +chrX 1112297 . T C 2761 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=22.51;BaseQRankSum=2.038;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=1.675;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.51;ReadPosRankSum=1.733;SOR=0.484;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,64:65:99:2075,0:1,0,32,29 0/1:31,28:59:99:716,0,845:17,14,12,15 +chrX 1112674 . G A 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.58;BaseQRankSum=0.159;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.765;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1355 0/1:26,27:53:99:.:720,0,670:13,13,14,13 +chrX 1112749 . G A 797 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=8.44;BaseQRankSum=0.622;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.681;SOR=0.690;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,23:43:99:114,0:10,10,13,10 0/1:27,28:55:99:713,0,712:14,13,13,15 +chrX 1113022 . G A 881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=8.21;BaseQRankSum=0.98;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.475;MQ=59.92;MQRankSum=1.137;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.554;SOR=0.629;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,29:53:99:143,0:8,16,13,16 0/1:30,28:58:99:768,0,808:16,14,17,11 +chrX 1113049 . C G 620 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=6.57;BaseQRankSum=0.016;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=6.386;MQ=59.80;MQRankSum=1.135;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.104;SOR=0.399;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,25:46:99:144,0:5,16,9,16 0/1:31,22:53:99:506,0,844:15,16,15,7 +chrX 1113116 . G A 822 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=8.35;BaseQRankSum=2.664;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=7.863;MQ=59.81;MQRankSum=1.171;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.196;SOR=1.426;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,24:43:99:224,0:8,11,9,15 0/1:35,24:59:99:628,0,898:19,16,8,16 +chrX 1113143 . A G 737 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.46;BaseQRankSum=0.602;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.657;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.987;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:16:49:0,16 0/1:28,29:57:99:.:767,0,678:15,13,12,17 +chrX 1113288 . A G 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=2.48;BaseQRankSum=-0.985;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.786;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,25:46:99:.:114,0:13,8,16,9 0/0:.:59:99:59:0,104,1216 +chrX 1113440 . G A 105 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=2.65;BaseQRankSum=1.3;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.078;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.472;SOR=0.892;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,27:51:99:.:135,0:10,14,10,17 0/0:.:59:99:59:0,104,1216 +chrX 1114047 . C T 2242 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=16.83;BaseQRankSum=1.693;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=1.597;MQ=59.22;MQRankSum=-1.741;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.608;SOR=0.536;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,33:66:10:10,0:15,18,13,20 1/1:0,69:69:99:2262,207,0:0,0,38,31 +chrX 1114061 . C G 3055 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=22.68;BaseQRankSum=-0.549;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.746;MQ=59.21;MQRankSum=-0.283;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.171;SOR=0.585;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:32,33:65:34:.:.:34,0:.:15,17,13,20 1|1:1,70:71:99:0|1:1114061_C_G:3051,169,0:1114061:0,1,37,33 +chrX 1114065 . A G 3055 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=22.68;BaseQRankSum=-0.558;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.746;MQ=59.20;MQRankSum=-0.283;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.189;SOR=0.585;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:32,33:65:34:.:.:34,0:.:15,17,13,20 1|1:1,70:71:99:0|1:1114061_C_G:3051,169,0:1114061:0,1,37,33 +chrX 1114244 . G A 111 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=3.92;BaseQRankSum=1.98;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.20;MQRankSum=0.16;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.141;SOR=0.683;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,19:36:99:.:141,0:9,8,10,9 0/0:.:65:41:65:0,41,849 +chrX 1114555 . A T 1765 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=17.10;BaseQRankSum=0.218;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.638;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,26:48:69:69,0:10,11,14,11 1/1:0,57:57:99:1726,171,0:0,0,25,27 +chrX 1114669 . A G 52 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=1.74;BaseQRankSum=0.389;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=8.452;MQ=54.20;MQRankSum=-4.054;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.44;SOR=0.595;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,25:47:82:.:82,0:7,15,14,11 0/0:.:67:29:60:0,29,1420 +chrX 1115159 . T C 755 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=10.47;BaseQRankSum=1.711;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.933;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.929;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,49:75:99:.:785,0:14,12,29,20 0/0:.:67:29:60:0,29,1420 +chrX 1115793 . T A 280 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=4.19;BaseQRankSum=-2.125;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=11.968;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.926;SOR=0.788;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,43:74:99:.:310,0:20,11,18,25 0/0:.:49:29:42:0,29,1067 +chrX 1115991 . T C 138 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=2.40;BaseQRankSum=-0.93;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.706;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,38:70:99:.:168,0:21,11,25,13 0/0:.:49:29:42:0,29,1067 +chrX 1116051 . G A 149 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=2.36;BaseQRankSum=0.675;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.872;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.495;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,40:76:99:.:179,0:21,15,21,19 0/0:.:49:29:42:0,29,1067 +chrX 1118282 . G C 576 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.63;BaseQRankSum=0.588;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.121;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.67;SOR=0.430;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1153 0/1:24,24:48:99:.:606,0,585:14,10,12,12 +chrX 1118471 . G T 658 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.51;BaseQRankSum=-0.911;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.743;MQ=59.58;MQRankSum=0.983;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.987;SOR=0.336;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1153 0/1:29,26:55:99:.:688,0,809:18,11,13,13 +chrX 1118571 . A G 807 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.74;BaseQRankSum=-0.312;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=16.649;MQ=59.69;MQRankSum=1.001;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.888;SOR=1.001;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1153 0|1:26,24:50:99:.:0|1:1118571_A_G:837,0,926:1118571:7,19,15,9 +chrX 1118600 . AG A 762.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=18.23;BaseQRankSum=-0.672;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=17.187;MQ=59.63;MQRankSum=1.001;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.587;SOR=1.712;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1153 0|1:23,21:44:99:.:0|1:1118571_A_G:802,0,903:1118571:8,15,15,6 +chrX 1118602 . AG A 762.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=18.23;BaseQRankSum=0.197;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=17.187;MQ=59.63;MQRankSum=1.001;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.133;SOR=1.712;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1153 0|1:23,21:44:99:.:0|1:1118571_A_G:802,0,903:1118571:8,15,15,6 +chrX 1118628 . A G 572 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.44;BaseQRankSum=-2.362;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=6.869;MQ=59.58;MQRankSum=0.931;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.396;SOR=0.811;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1153 0|1:22,17:39:99:.:0|1:1118571_A_G:602,0,840:1118571:8,14,10,7 +chrX 1118748 . AAAG A 353.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=13.10;BaseQRankSum=1.689;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.497;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.944;SOR=1.136;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1153 0/1:19,11:30:99:.:393,0,409:10,9,7,4 +chrX 1119093 . AT A 487.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.54;BaseQRankSum=-0.221;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.899;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.35;SOR=1.270;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1153 0/1:26,24:50:99:.:527,0,559:13,13,15,9 +chrX 1119370 . GT G 458.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.60;BaseQRankSum=-1.358;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=6.121;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.917;SOR=1.360;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1153 0/1:24,23:47:99:.:498,0,599:13,11,8,15 +chrX 1119648 . AG A 2949.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=27.68;BaseQRankSum=1.204;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.081;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.234;SOR=1.055;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:2102,0:0,0,36,23 0/1:20,29:49:99:887,0,564:10,10,15,14 +chrX 1119905 . A AT 1459.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=17.03;BaseQRankSum=-0.325;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.909;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.394;SOR=0.892;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,45:46:99:1154,0:1,0,29,16 0/1:24,18:42:99:345,0,510:13,11,9,9 +chrX 1119939 . A G 1675 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=19.60;BaseQRankSum=1.029;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.959;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.963;SOR=0.573;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1317,0:0,0,23,23 0/1:25,16:41:99:388,0,656:14,11,7,9 +chrX 1120163 . GTC G 2971.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=29.52;BaseQRankSum=-1.591;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.829;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=29.52;ReadPosRankSum=-2.451;SOR=0.539;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1982,0:0,0,21,26 0/1:27,28:55:99:1029,0,967:15,12,16,12 +chrX 1120279 . C T 2718 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=26.17;BaseQRankSum=1.099;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.971;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.863;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1792,0:0,0,24,29 0/1:18,34:52:99:956,0,395:9,9,23,11 +chrX 1120586 . C G 2935 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=26.71;BaseQRankSum=2.736;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.332;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.783;SOR=0.411;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,65:66:99:2099,0:0,1,26,39 0/1:15,30:45:99:866,0,386:5,10,13,17 +chrX 1121022 . G A 2719 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=25.45;BaseQRankSum=-2.018;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.36;SOR=0.532;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1767,0:0,0,32,20 0/1:18,38:56:99:982,0,427:12,6,23,15 +chrX 1121217 . G A 2408 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=22.16;BaseQRankSum=2.123;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.806;MQ=59.44;MQRankSum=0;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.665;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,45:46:99:1399,0:1,0,16,18 0/1:27,37:64:99:1039,0,657:14,13,18,19 +chrX 1121266 . A G 2449 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=28.83;BaseQRankSum=-1.245;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.53;MQRankSum=0;QD=28.83;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.625;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1722,0:0,0,18,21 0/1:17,30:47:99:757,0,421:8,9,17,13 +chrX 1121270 . G A 1726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=30.24;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.17;QD=43.90;SOR=0.793;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,40:40:99:.:1756,0:0,0,19,21 0/0:.:56:99:56:0,104,1513 +chrX 1121739 . A C 2804 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=24.02;BaseQRankSum=-1.792;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.859;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.02;ReadPosRankSum=0.657;SOR=1.023;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2011,0:0,0,40,20 0/1:26,32:58:99:823,0,699:14,12,16,16 +chrX 1121932 . C T 3063 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=24.94;BaseQRankSum=3.359;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=4.192;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.704;SOR=0.379;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2154,0:0,0,27,39 0/1:26,32:58:99:939,0,634:9,17,17,15 +chrX 1122546 . C A 3000 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=26.12;BaseQRankSum=-1.522;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.918;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.12;ReadPosRankSum=0.451;SOR=0.892;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2079,0:0,0,32,29 0/1:21,34:55:99:951,0,545:11,10,22,12 +chrX 1123776 . C G 2523 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=24.08;BaseQRankSum=1.234;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.609;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=24.08;ReadPosRankSum=1.347;SOR=0.330;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,54:56:99:1676,0:0,2,33,21 0/1:18,32:50:99:877,0,467:15,3,21,11 +chrX 1124514 . CACGT C 1973.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=22.62;BaseQRankSum=-0.424;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.856;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.986;SOR=0.507;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,47:48:99:.:.:1609,0:.:1,0,28,19 0|1:26,15:41:99:0|1:1124514_CACGT_C:404,0,990:1124514:14,12,3,12 +chrX 1125142 . TTAGA T 3293.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=33.67;BaseQRankSum=0.218;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.350;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=33.67;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=1.223;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2693,0:.:0,0,40,20 0|1:22,17:39:99:0|1:1125142_TTAGA_T:640,0,872:1125142:11,11,7,10 +chrX 1125214 . TAGAC T 3101.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=31.41;BaseQRankSum=-0.5;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=4.311;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=31.41;ReadPosRankSum=0.867;SOR=1.060;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2340,0:.:0,0,34,18 0|1:27,21:48:99:0|1:1125142_TTAGA_T:801,0,1064:1125142:13,14,9,12 +chrX 1125260 . C CATAG 1946.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=23.94;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=43.17;SOR=0.874;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,46:46:99:.:1986,0:0,0,25,21 0/0:.:38:48:38:0,48,933 +chrX 1125296 . TGATA T 3024.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=27.51;BaseQRankSum=-1.116;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.47;MQRankSum=-0.807;QD=36.05;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.668;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:2433,0:.:0,0,26,29 0|1:13,17:30:99:0|1:1125296_TGATA_T:631,0,486:1125296:6,7,8,9 +chrX 1125325 . T C 2763 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.10;BaseQRankSum=-2.547;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.26;MQRankSum=-0.86;QD=32.10;ReadPosRankSum=1.19;SOR=0.779;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2158,0:.:0,0,26,26 0|1:16,19:35:99:0|1:1125296_TGATA_T:635,0,552:1125296:8,8,8,11 +chrX 1125529 . G A 2132 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=23.76;BaseQRankSum=0.372;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.76;ReadPosRankSum=-1.474;SOR=0.789;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1617,0:0,0,19,29 0/1:23,20:43:99:545,0,625:11,12,12,8 +chrX 1126648 . G C 3087 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=23.09;BaseQRankSum=0.384;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.733;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.09;ReadPosRankSum=-2.23;SOR=0.606;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2407,0:0,0,38,36 0/1:34,27:61:99:710,0,934:18,16,13,14 +chrX 1126828 . T A 2962 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=23.56;BaseQRankSum=-2.006;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=9.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.973;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2383,0:0,0,25,46 0/1:31,25:56:99:609,0,868:18,13,14,11 +chrX 1127011 . G C 1696 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=31.38;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.38;SOR=0.729;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:1726,0:0,0,28,27 0/0:.:58:91:58:0,91,1191 +chrX 1127213 . A ATAGG 4380.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=25.11;BaseQRankSum=-0.772;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=37.14;ReadPosRankSum=0;SOR=0.628;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:3128,0:0,0,32,38 0/1:17,32:49:99:1292,0,618:8,9,18,14 +chrX 1127292 . CACAGGTACAGGT C 3059.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=26.49;BaseQRankSum=2.433;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=1.785;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.49;ReadPosRankSum=1.341;SOR=0.984;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,57:59:99:1878,0:2,0,21,36 0/1:27,31:58:99:1221,0,1029:11,16,13,18 +chrX 1127618 . T G 162 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=7;AS_QD=27.43;DP=20;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.43;QD=27.43;SOR=1.609;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:12:.:12:0,0 1/1:0,7:7:21:.:192,21,0:0,0,2,5 +chrX 1128110 . T G 407 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=25.71;DP=21;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=32.84;QD=25.71;SOR=1.061;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:437,0:0,0,7,10 0/0:.:2:0:2:0,0,20 +chrX 1128869 . G C 271 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=8.85;BaseQRankSum=-0.801;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=17.627;MQ=48.13;MQRankSum=1.016;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.105;SOR=2.233;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:40:20:40:0,20 0/1:20,14:34:99:.:301,0,494:7,13,11,3 +chrX 1133500 . C G 225 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=4.40;BaseQRankSum=-0.989;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.023;MQ=59.92;MQRankSum=1.225;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.685;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,34:58:99:.:255,0:13,11,16,18 0/0:.:65:43:65:0,43,1130 +chrX 1133521 . A G 488 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.57;BaseQRankSum=0.27;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.410;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.420;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1349 0/1:29,20:49:99:.:518,0,794:12,17,10,10 +chrX 1134660 . G C 3279 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=23.98;BaseQRankSum=1.098;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=2.778;MQ=59.64;MQRankSum=-0.38;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.506;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2384,0:0,0,38,38 0/1:28,34:62:99:925,0,678:16,12,16,18 +chrX 1135632 . C CAA 1001.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=23.66;BaseQRankSum=-1.051;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=11.601;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.66;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.797;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,1101 0/1:17,27:44:99:.:1041,0,622:12,5,11,16 +chrX 1135990 . C A 305 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=7.79;BaseQRankSum=2.118;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=1.226;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.575;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,25:43:99:.:335,0:8,10,12,13 0/0:.:51:40:51:0,40,943 +chrX 1136005 . G A 285 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=7.68;BaseQRankSum=1.238;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=1.238;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=0.743;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,24:41:99:.:315,0:8,9,11,13 0/0:.:51:40:51:0,40,943 +chrX 1136011 . C T 205 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=6.03;BaseQRankSum=1.667;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.593;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,22:39:99:.:235,0:9,8,11,11 0/0:.:51:40:51:0,40,943 +chrX 1136043 . C A 36 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=2.36;BaseQRankSum=0.155;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.02;MQRankSum=-1.289;QD=2.36;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.709;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:13,15:28:66:.:66,0:6,7,8,7 0/0:.:36:51:36:0,51,948 +chrX 1136052 . CAAA C 129.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=8.89;BaseQRankSum=-0.792;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=7.521;MQ=58.93;MQRankSum=0;QD=8.89;ReadPosRankSum=0;SOR=2.279;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,248 0/1:13,6:19:99:.:169,0,397:6,7,5,1 +chrX 1136618 . A G 562 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.45;BaseQRankSum=0.106;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.32;MQRankSum=1.063;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.775;SOR=0.836;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:61:57:0,61 0/1:21,23:44:99:.:592,0,532:8,13,8,15 +chrX 1136793 . T G 663 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=6.42;BaseQRankSum=-0.82;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.06;MQRankSum=2.668;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=0.674;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,30:55:38:38,0:13,12,20,10 0/1:24,29:53:99:655,0,582:18,6,17,12 +chrX 1136909 . G C 841 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.61;BaseQRankSum=-0.234;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.10;MQRankSum=-2.294;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=0.693;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,183 0/1:32,32:64:99:.:871,0,850:15,17,15,17 +chrX 1136954 . T C 733 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.74;BaseQRankSum=-1.887;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.09;MQRankSum=-2.478;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.462;SOR=0.767;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,183 0/1:35,30:65:99:.:763,0,972:17,18,14,16 +chrX 1137173 . C T 195 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=4.02;BaseQRankSum=0.598;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=59.25;MQRankSum=-0.338;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.61;SOR=0.544;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,31:56:99:.:225,0:11,14,15,16 0/0:.:63:99:63:0,120,1800 +chrX 1137177 . T C 2911 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=23.72;BaseQRankSum=-0.307;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=7.665;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=23.72;ReadPosRankSum=-1.385;SOR=0.293;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:2151,0:0,0,27,31 0/1:36,30:66:99:790,0,1013:13,23,17,13 +chrX 1137702 . C G,A 1056 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=29,30;AS_QD=3.17,11.16;BaseQRankSum=0.749;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=6.122;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.403;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,29,0:51:99:238,0,963:7,15,13,16 0/2:24,0,30:54:99:848,920,1663,0,742,652:11,13,17,13 +chrX 1137978 . C G 1876 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=16.02;BaseQRankSum=-1.311;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=5.362;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.02;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.862;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,40:69:99:302,0:13,16,26,14 1/1:0,50:50:99:1604,149,0:0,0,25,25 +chrX 1138501 . C T 1145 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=25.00;BaseQRankSum=2.099;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=13.041;MQ=59.71;MQRankSum=3.355;QD=25.00;ReadPosRankSum=-1.278;SOR=0.472;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,185 1/1:4,43:47:76:.:1175,76,0:0,4,24,19 +chrX 1138550 . C T 1770 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=24.00;BaseQRankSum=2.291;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.00;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.682;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,185 0|1:28,47:75:99:.:0|1:1138550_C_T:1800,0,953:1138550:15,13,25,22 +chrX 1138559 . G A 1821 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=23.14;BaseQRankSum=2.049;DP=156;ExcessHet=0.0000;FS=0.871;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.14;ReadPosRankSum=1.986;SOR=0.516;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,185 0|1:32,48:80:99:.:0|1:1138550_C_T:1851,0,1118:1138550:19,13,26,22 +chrX 1138563 . A G 1826 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=22.10;BaseQRankSum=1.12;DP=160;ExcessHet=0.0000;FS=2.934;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.10;ReadPosRankSum=2.784;SOR=0.438;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,185 0|1:35,49:84:99:.:0|1:1138550_C_T:1856,0,1242:1138550:22,13,27,22 +chrX 1138575 . C T 1929 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=22.01;BaseQRankSum=0.798;DP=167;ExcessHet=0.0000;FS=2.821;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=22.01;ReadPosRankSum=1.259;SOR=0.443;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,185 0|1:38,51:89:99:.:0|1:1138550_C_T:1959,0,1346:1138550:23,15,27,24 +chrX 1138605 . C T 740 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=8.46;BaseQRankSum=0.571;DP=169;ExcessHet=0.0000;FS=6.733;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.595;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,185 0/1:52,39:91:99:.:770,0,1734:31,21,18,21 +chrX 1138619 . G C 1746 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=19.73;BaseQRankSum=-0.752;DP=166;ExcessHet=0.0000;FS=14.503;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.635;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,185 0|1:42,48:90:99:.:0|1:1138550_C_T:1776,0,1551:1138550:28,14,21,27 +chrX 1138641 . G C 1616 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=16.97;BaseQRankSum=-0.291;DP=173;ExcessHet=0.0000;FS=8.044;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=0.747;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,185 0|1:49,48:97:99:.:0|1:1138550_C_T:1646,0,1670:1138550:29,20,21,27 +chrX 1138687 . G A 54 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=1.40;BaseQRankSum=0.193;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=11.419;MQ=59.85;MQRankSum=0.467;QD=1.40;ReadPosRankSum=1.232;SOR=2.699;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,185 0/1:51,9:60:84:.:84,0,1384:28,23,8,1 +chrX 1138700 . A G 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.22;BaseQRankSum=0.21;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=5.726;MQ=59.82;MQRankSum=-0.779;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.103;SOR=1.275;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,185 0/1:22,33:55:99:.:892,0,510:10,12,21,12 +chrX 1139306 . C T 889 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.92;BaseQRankSum=1.079;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.961;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.960;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,185 0/1:33,33:66:99:.:919,0,889:14,19,12,21 +chrX 1139855 . G T 1154 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=16.44;BaseQRankSum=-0.471;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=4.713;MQ=59.65;MQRankSum=1.246;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.936;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,185 0/1:29,43:72:99:.:1184,0,713:16,13,18,25 +chrX 1139856 . C T 2861 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=27.65;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=40.15;SOR=0.807;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,185 1/1:0,72:72:99:.:2891,217,0:0,0,34,38 +chrX 1139875 . G A 2296 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.43;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=31.43;SOR=0.864;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,185 1/1:0,74:74:99:.:2326,221,0:0,0,34,40 +chrX 1140501 . C G 1464 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=31.13;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.13;SOR=0.693;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,185 1/1:0,48:48:99:.:1494,144,0:0,0,24,24 +chrX 1140554 . C T 716 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=5.92;BaseQRankSum=0.461;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.32;SOR=0.697;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,40:76:99:161,0:22,14,22,18 0/1:28,22:50:99:585,0,757:12,16,11,11 +chrX 1140569 . A G 2105 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=16.68;BaseQRankSum=-2.018;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=4.881;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.411;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,38:73:99:111,0:21,14,21,17 1/1:0,55:55:99:2024,165,0:0,0,25,30 +chrX 1140993 . C G 2073 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=30.48;BaseQRankSum=2.041;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=3.475;MQ=59.47;MQRankSum=-0.142;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.276;SOR=0.606;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:66:70:0,66 1/1:1,68:69:99:.:2103,196,0:0,1,38,30 +chrX 1141145 . A G 1810 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=31.72;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.89;QD=31.72;SOR=0.693;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:66:70:0,66 1/1:0,58:58:99:.:1840,174,0:0,0,29,29 +chrX 1141203 . G A 1807 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=16.85;BaseQRankSum=2.07;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.835;MQ=59.34;MQRankSum=-2.037;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.892;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,28:56:85:85,0:13,15,13,15 1/1:0,53:53:99:1752,159,0:0,0,21,32 +chrX 1141234 . C T 2259 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=22.44;BaseQRankSum=2.182;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;MQRankSum=-1.59;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.33;SOR=0.752;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,30:55:99:.:.:185,0:.:11,14,14,16 1|1:0,47:47:99:0|1:1141234_C_T:2104,141,0:1141234:0,0,19,28 +chrX 1141239 . G C 2139 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=22.59;BaseQRankSum=2.503;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.878;MQ=59.54;MQRankSum=-1.676;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.12;SOR=0.818;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,26:50:99:.:.:100,0:.:11,13,13,13 1|1:0,46:46:99:0|1:1141234_C_T:2069,138,0:1141234:0,0,18,28 +chrX 1141265 . A G 2201 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=23.48;BaseQRankSum=0.367;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;MQRankSum=-1.478;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.719;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,25:43:99:243,0:9,9,15,10 1/1:0,52:52:99:1988,156,0:0,0,23,29 +chrX 1141270 . AAGT A 839.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.90;BaseQRankSum=-0.466;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=23.293;MQ=59.67;MQRankSum=-0.111;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.685;SOR=1.544;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1577 0/1:29,23:52:99:.:879,0,1132:21,8,7,16 +chrX 1141515 . C T 673 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.34;BaseQRankSum=1.332;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.540;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.340;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1577 0/1:34,28:62:99:.:703,0,826:13,21,14,14 +chrX 1141771 . A G 1373 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=13.62;BaseQRankSum=-0.838;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=8.811;MQ=59.53;MQRankSum=-0.434;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.239;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,35:65:99:132,0:9,21,16,19 1/1:0,38:38:99:1271,114,0:0,0,18,20 +chrX 1141892 . AAC A,AACACAC,AAAACACAC 776.97 . AC=0,0,1;AF=0.00,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,0,18;AS_QD=0.00,5.67,24.73;BaseQRankSum=-0.128;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=11.400;MQ=56.59;MQRankSum=-0.069;QD=24.73;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.463;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:99:39:0,412,412,412 0/3:15,0,0,18:33:99:.:816,917,2065,731,1862,1836,0,661,675,597:3,12,10,8 +chrX 1141894 . C *,A 311 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,15;AS_QD=0.00,9.47;BaseQRankSum=-0.047;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=10.793;MQ=56.59;MQRankSum=0.937;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=2.434;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:99:39:0,412,412 0/2:21,0,15:36:99:.:341,499,2066,0,927,866:11,10,3,12 +chrX 1142225 . AAC A 206.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=20.50;BaseQRankSum=-0.53;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=4.771;MQ=46.12;MQRankSum=-0.517;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.145;SOR=1.670;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,11:12:99:.:246,0:1,0,3,8 0/0:.:19:21:17:0,21,315 +chrX 1142274 . AC A 113.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=30.60;BaseQRankSum=0;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.44;MQRankSum=1.282;QD=30.60;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:23:99:23:.:.:0,496 0|1:1,4:5:11:.:0|1:1142274_AC_A:153,0,11:1142274:0,1,1,3 +chrX 1142280 . C G 123 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=30.60;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.10;MQRankSum=1.282;QD=30.60;SOR=0.693;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:23:99:23:.:.:0,496 0|1:1,4:5:11:.:0|1:1142274_AC_A:153,0,11:1142274:0,1,1,3 +chrX 1142511 . A G 65 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=31.67;DP=26;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.30;QD=31.67;SOR=2.833;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:99:23:0,496 1/1:0,3:3:9:.:95,9,0:0,0,3,0 +chrX 1142574 . AACACACAC A,AACAC,AACACACACACACACAC 1200.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,10,9;AS_QD=31.54,29.33,27.76;BaseQRankSum=-0.167;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.89;MQRankSum=2.142;QD=28.84;ReadPosRankSum=1.736;SOR=1.666;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,9,10,0:21:99:352,121,0,468:1,1,6,13 1/3:0,13,0,9:22:99:888,362,402,897,405,933,529,0,535,503:0,0,7,15 +chrX 1142834 . T C 1930 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=30.88;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.16;QD=41.70;SOR=0.735;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:44:99:44:.:.:0,168 1|1:0,47:47:99:.:0|1:1142834_T_C:1960,141,0:1142834:0,0,24,23 +chrX 1142846 . G A 1766 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=42;AS_QD=27.49;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.21;QD=42.76;SOR=0.788;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:39:.:39:.:.:0,0 1|1:0,42:42:99:.:0|1:1142834_T_C:1796,126,0:1142834:0,0,22,20 +chrX 1142916 . A AACACAC 166.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=34.33;BaseQRankSum=0;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=7.782;MQ=35.65;MQRankSum=0.967;QD=34.33;ReadPosRankSum=0.674;SOR=3.590;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:21:99:21:0,135 0/1:1,5:6:28:.:206,0,28:1,0,0,5 +chrX 1143812 . AACACACACAC A 125.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=-0.303;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.61;MQRankSum=0.26;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.905;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:45:23:0,45 0/1:9,5:14:99:.:165,0,242:4,5,3,2 +chrX 1144231 . A C 1703 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=14.44;BaseQRankSum=1.065;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=6.992;MQ=59.10;MQRankSum=1.724;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.809;SOR=1.209;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,37:63:99:.:.:610,0:.:14,12,15,22 0|1:27,30:57:99:0|1:1144231_A_C:1123,0,963:1144231:13,14,11,19 +chrX 1144249 . A C 1952 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=16.38;BaseQRankSum=1.251;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.45;MQRankSum=1.399;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.761;SOR=0.660;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,43:66:99:.:.:887,0:.:11,12,21,22 0|1:26,29:55:99:0|1:1144231_A_C:1095,0,921:1144231:11,15,12,17 +chrX 1144396 . G A 1050 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=16.62;BaseQRankSum=-0.928;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.970;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.483;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,173 0/1:26,39:65:99:.:1080,0,678:11,15,19,20 +chrX 1144477 . G A 1168 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=15.56;BaseQRankSum=-0.15;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.880;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.889;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,173 0/1:33,44:77:99:.:1198,0,846:18,15,26,18 +chrX 1144683 . C T 797 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=6.13;BaseQRankSum=-0.331;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=2.238;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.794;SOR=0.489;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:38,39:77:14:14,0:24,14,25,14 0/1:28,30:58:99:813,0,769:18,10,15,15 +chrX 1145083 . C CA,CAA 1980.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=68,23;AS_QD=27.85,32.30;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;QD=22.20;SOR=0.760;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,16,23:39:99:858,126,0:0,0,20,19 1/1:0,52,0:52:99:1162,154,0,1162,154,1162:0,0,24,28 +chrX 1145234 . G A 527 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.66;BaseQRankSum=0.235;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.635;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.66;ReadPosRankSum=1.352;SOR=0.491;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1606 0/1:23,21:44:99:.:557,0,617:14,9,10,11 +chrX 1145288 . T TCTC 1041.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=11.50;BaseQRankSum=-0.445;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.787;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.962;SOR=0.559;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,30:56:99:205,0:18,8,17,13 0/1:16,22:38:99:876,0,565:7,9,12,10 +chrX 1145457 . G A 1135 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=8.96;BaseQRankSum=1.37;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=4.207;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.986;SOR=1.059;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,40:72:99:308,0:12,20,23,17 0/1:26,32:58:99:857,0,639:18,8,20,12 +chrX 1145558 . C T 4233 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.05;BaseQRankSum=2.489;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=7.873;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=32.05;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.833;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:3083,0:.:0,0,28,41 0|1:33,31:64:99:0|1:1145558_C_T:1180,0,1260:1145558:19,14,15,16 +chrX 1145559 . G A 4233 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.05;BaseQRankSum=1.116;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=7.873;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=32.05;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.833;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:3083,0:.:0,0,28,41 0|1:33,31:64:99:0|1:1145558_C_T:1180,0,1260:1145558:19,14,15,16 +chrX 1145727 . C T 966 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=8.44;BaseQRankSum=2.708;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.689;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.678;SOR=0.813;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,40:67:99:417,0:13,14,19,21 0/1:29,22:51:99:579,0,665:13,16,8,14 +chrX 1146061 . C A 922 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=13.80;BaseQRankSum=1.25;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=3.248;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.24;SOR=0.705;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,232 0/1:34,35:69:99:.:952,0,894:19,15,16,19 +chrX 1146492 . A C 169 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=11.71;BaseQRankSum=0.882;DP=20;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=29.29;MQRankSum=-2.01;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.495;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:35:1:0,35 0/1:7,10:17:10:.:199,0,10:3,4,5,5 +chrX 1147338 . C A 405 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=12.43;BaseQRankSum=1.482;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=1.421;MQ=57.43;MQRankSum=0.174;QD=12.43;ReadPosRankSum=-2.795;SOR=1.099;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:15:35:1:.:.:0,35 0|1:23,12:35:99:.:0|1:1147338_C_A:435,0,930:1147338:13,10,8,4 +chrX 1147339 . C T 402 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=1.921;DP=37;ExcessHet=0.0000;FS=1.383;MQ=57.51;MQRankSum=0.121;QD=12.00;ReadPosRankSum=-2.347;SOR=1.009;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:15:35:1:.:.:0,35 0|1:24,12:36:99:.:0|1:1147338_C_A:432,0,972:1147338:14,10,8,4 +chrX 1147351 . C T 615 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.13;BaseQRankSum=3.105;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=4.786;MQ=57.76;MQRankSum=0.661;QD=16.13;ReadPosRankSum=-1.688;SOR=1.609;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:15:35:1:.:.:0,35 0|1:23,17:40:99:.:0|1:1147338_C_A:645,0,915:1147338:12,11,12,5 +chrX 1147353 . G C 615 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.13;BaseQRankSum=-0.723;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=4.786;MQ=57.76;MQRankSum=0.661;QD=16.13;ReadPosRankSum=-2.281;SOR=1.609;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:15:35:1:.:.:0,35 0|1:23,17:40:99:.:0|1:1147338_C_A:645,0,915:1147338:12,11,12,5 +chrX 1147373 . C A 847 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.54;BaseQRankSum=2.967;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.61;MQRankSum=0.129;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.752;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:41:5:41:.:.:0,5 0|1:27,23:50:99:.:0|1:1147338_C_A:877,0,943:1147338:16,11,14,9 +chrX 1147405 . C T 1118 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=29;AS_QD=22.08;BaseQRankSum=1.345;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.399;MQ=59.03;MQRankSum=-0.41;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.852;SOR=1.143;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:44:.:44:.:.:0,0 0|1:23,29:52:99:.:0|1:1147338_C_A:1148,0,878:1147338:12,11,18,11 +chrX 1147411 . C G 1150 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=30;AS_QD=22.26;BaseQRankSum=1.182;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.05;MQRankSum=-0.381;QD=22.26;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.841;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:49:.:49:.:.:0,0 0|1:23,30:53:99:.:0|1:1147338_C_A:1180,0,875:1147338:13,10,18,12 +chrX 1147439 . T C 1295 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=35;AS_QD=21.37;BaseQRankSum=0.778;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.979;MQ=59.33;MQRankSum=-1.229;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.284;SOR=0.917;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:62:.:62:.:.:0,0 0|1:27,35:62:99:.:0|1:1147338_C_A:1325,0,946:1147338:14,13,20,15 +chrX 1147523 . G C 4198 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=33.56;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.56;SOR=1.016;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2361,0:0,0,33,37 1/1:0,56:56:99:1867,168,0:0,0,21,35 +chrX 1147667 . C T 1063 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=14.77;BaseQRankSum=-0.268;DP=160;ExcessHet=0.0000;FS=0.888;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.862;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:85:99:85:0,155 0/1:32,42:74:99:.:1093,0,806:17,15,24,18 +chrX 1147735 . G A 3498 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=24.33;BaseQRankSum=1.329;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=4.825;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.33;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.804;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,80:80:99:2655,0:0,0,34,46 0/1:33,32:65:99:873,0,852:18,15,16,16 +chrX 1147883 . C G 6288 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=143;AS_QD=25.57;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=0.707;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3121,0:.:0,0,33,38 1|1:0,72:72:99:0|1:1147883_C_G:3197,217,0:1147883:0,0,38,34 +chrX 1147884 . A C 6288 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=143;AS_QD=32.59;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=0.707;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3121,0:.:0,0,33,38 1|1:0,72:72:99:0|1:1147883_C_G:3197,217,0:1147883:0,0,38,34 +chrX 1147908 . G A 945 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=6.96;BaseQRankSum=1.886;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=4.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.96;ReadPosRankSum=2.062;SOR=0.748;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,34:68:31:31,0:16,18,14,20 0/1:36,36:72:99:944,0,950:22,14,18,18 +chrX 1147942 . G A 828 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.00;BaseQRankSum=1.599;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=2.138;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.617;SOR=1.051;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,385 0/1:35,31:66:99:.:858,0,948:21,14,21,10 +chrX 1147978 . C T 1772 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=13.15;BaseQRankSum=1.489;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=2.205;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.62;SOR=0.918;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:29,38:67:99:.:.:404,0:.:14,15,23,15 0|1:34,36:70:99:0|1:1147978_C_T:1398,0,1308:1147978:22,12,23,13 +chrX 1147979 . C G 1772 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=13.15;BaseQRankSum=0.768;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=2.205;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.76;SOR=0.918;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:29,38:67:99:.:.:404,0:.:14,15,23,15 0|1:34,36:70:99:0|1:1147978_C_T:1398,0,1308:1147978:22,12,23,13 +chrX 1148339 . A T 1937 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.34;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.34;SOR=0.871;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1967,0:0,0,27,32 0/0:.:34:32:29:0,32,667 +chrX 1148479 . T TATATATATATATATATATA 358.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=32.19;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.57;QD=39.80;SOR=1.085;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,203 1|1:0,10:10:30:.:0|1:1148479_T_TATATATATATATATATATA:398,30,0:1148479:0,0,4,6 +chrX 1148481 . T A 368 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=28.99;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.57;QD=39.80;SOR=1.085;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,203 1|1:0,10:10:30:.:0|1:1148479_T_TATATATATATATATATATA:398,30,0:1148479:0,0,4,6 +chrX 1148483 . T A,TA 729 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=14,17;AS_QD=31.40,30.41;BaseQRankSum=-0.649;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.79;MQRankSum=-0.214;QD=23.72;ReadPosRankSum=-1.301;SOR=0.465;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:1,14,17:32:99:.:759,213,0:0,1,12,19 0/0:.:3:0:3:0,0,25,0,25,25 +chrX 1148495 . A AATTTTT 230.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=27.70;DP=35;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.32;QD=45.00;SOR=1.329;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,540 1|1:0,6:6:18:.:0|1:1148479_T_TATATATATATATATATATA:270,18,0:1148479:0,0,2,4 +chrX 1148497 . A ATATTTTTTTTTT,ATATTTTTTTTTTTT,ATATATATTTTTTTTTT,ATATATATTTTTTTTTTTT,T 1105 . AC=0,0,0,1,2;AF=0.00,0.00,0.00,0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=4,2,1,4,6;AS_QD=31.92,28.49,31.74,32.99,26.41;BaseQRankSum=-0.649;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.61;MQRankSum=-0.223;QD=63.06;ReadPosRankSum=0.29;SOR=0.551;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 4:1,4,2,1,4,0:12:36:.:.:865,138,278,36,0,618:.:0,1,4,7 5|5:0,0,0,0,0,6:6:18:0|1:1148479_T_TATATATATATATATATATA:270,270,270,270,270,270,270,270,270,270,270,270,270,270,270,18,18,18,18,18,0:1148479:0,0,2,4 +chrX 1148635 . G C 672 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.50;BaseQRankSum=-0.033;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;MQRankSum=0;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.806;SOR=0.546;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:46:99:46:.:.:0,400 0|1:26,26:52:99:.:0|1:1148635_G_C:702,0,1004:1148635:18,8,17,9 +chrX 1148642 . A C 692 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.88;BaseQRankSum=0.244;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.54;MQRankSum=0.11;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.804;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:46:99:46:.:.:0,400 0|1:25,27:52:99:.:1|0:1148635_G_C:722,0,948:1148635:17,8,19,8 +chrX 1148742 . G C 4743 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=27.59;BaseQRankSum=1.572;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.86;MQRankSum=-0.15;QD=42.62;ReadPosRankSum=1.509;SOR=0.479;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,61:62:99:.:.:2555,0:.:1,0,39,22 1|1:0,50:50:99:0|1:1148742_G_C:2218,150,0:1148742:0,0,29,21 +chrX 1148746 . C G 5000 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=30.55;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.85;QD=43.74;SOR=1.270;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2812,0:.:0,0,42,23 1|1:0,50:50:99:0|1:1148742_G_C:2218,150,0:1148742:0,0,29,21 +chrX 1148858 . G A 2153 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=22.28;BaseQRankSum=-0.556;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.981;MQ=59.47;MQRankSum=0;QD=22.28;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.446;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1583,0:0,0,19,31 0/1:25,23:48:99:600,0,695:8,17,10,13 +chrX 1148907 . G A 461 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=8.93;BaseQRankSum=2.235;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.036;MQ=59.50;MQRankSum=-1.365;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.553;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,34:55:99:.:491,0:9,12,16,18 0/0:.:57:85:57:0,85,1241 +chrX 1149700 . A G 497 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.46;BaseQRankSum=-1.225;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.560;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1093 0/1:26,20:46:99:.:527,0,741:12,14,10,10 +chrX 1149723 . G A 488 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.77;BaseQRankSum=1.946;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.192;MQ=59.49;MQRankSum=0;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.990;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1093 0/1:25,19:44:99:.:518,0,650:14,11,12,7 +chrX 1150001 . C CA 236.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=4.93;BaseQRankSum=0.582;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=2.294;MQ=58.89;MQRankSum=-1.502;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=1.158;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:13,17:30:71:71,0:10,3,4,13 0/1:14,12:26:99:205,0,269:3,11,7,5 +chrX 1150018 . A AAAAAGAAAAG 522.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=16.53;BaseQRankSum=-1.133;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=23.252;MQ=59.22;MQRankSum=-1.973;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=1.768;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,500 0|1:19,15:34:99:.:0|1:1150018_A_AAAAAGAAAAG:562,0,753:1150018:4,15,11,4 +chrX 1150034 . A G 573 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.08;BaseQRankSum=-0.106;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=16.245;MQ=59.26;MQRankSum=-2.037;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.326;SOR=1.128;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,500 0|1:23,17:40:99:.:0|1:1150018_A_AAAAAGAAAAG:603,0,854:1150018:6,17,11,6 +chrX 1150086 . ATAGC A 638.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=15.41;BaseQRankSum=-0.038;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.672;MQ=59.14;MQRankSum=-2.103;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.638;SOR=0.721;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,500 0/1:26,18:44:99:.:678,0,1006:11,15,10,8 +chrX 1150096 . AGATGATGGAGAT A 693.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=17.88;BaseQRankSum=0.195;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.795;MQ=59.24;MQRankSum=-1.934;QD=17.88;ReadPosRankSum=0.6;SOR=0.695;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,500 0/1:22,19:41:99:.:733,0,855:9,13,10,8 +chrX 1150108 . T *,TGATAGATAGATAGATAGATA 1577.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=18,16;AS_QD=0.00,28.92;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.21;QD=47.56;SOR=0.811;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,500,500 1/2:0,18,16:34:99:.:1617,667,778,763,0,781:0,0,18,16 +chrX 1150131 . T C,TAGATAGATAGATAGAC 895 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=18,0;AS_QD=20.56,6.22;BaseQRankSum=0.144;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.30;MQRankSum=-2.143;QD=20.56;ReadPosRankSum=2.179;SOR=0.686;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,500,500 0/1:27,18,0:45:99:.:925,0,1033,757,995,1785:15,12,10,8 +chrX 1150174 . G A 1164 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=22.53;BaseQRankSum=1.003;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=7.625;MQ=59.77;MQRankSum=-0.804;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.102;SOR=0.321;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,500 0|1:22,31:53:99:.:0|1:1150174_G_A:1194,0,804:1150174:15,7,15,16 +chrX 1150175 . G T 1164 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=22.53;BaseQRankSum=-1.18;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=7.625;MQ=59.77;MQRankSum=-0.804;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.038;SOR=0.321;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,500 0|1:22,31:53:99:.:0|1:1150174_G_A:1194,0,804:1150174:15,7,15,16 +chrX 1150190 . G GATAGATAC 1165.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=12.42;BaseQRankSum=-0.355;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=9.790;MQ=59.35;MQRankSum=-0.797;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.307;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,23:46:9:9,0:14,9,13,10 0/1:21,30:51:99:1196,0,771:15,6,13,17 +chrX 1150372 . A G 2753 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=26.99;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.51;QD=44.17;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1697 1|1:0,63:63:99:.:0|1:1150372_A_G:2783,190,0:1150372:0,0,29,34 +chrX 1150377 . C T 2774 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.53;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.48;QD=44.51;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1697 1|1:0,63:63:99:.:0|1:1150372_A_G:2804,190,0:1150372:0,0,29,34 +chrX 1150378 . A C 835 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.66;BaseQRankSum=1.286;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.988;MQ=58.48;MQRankSum=1.44;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.717;SOR=0.892;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1697 0/1:28,31:59:99:.:865,0,745:14,14,14,17 +chrX 1150386 . A C 2705 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=31.68;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.43;QD=44.84;SOR=0.725;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1697 1|1:0,61:61:99:.:0|1:1150372_A_G:2735,184,0:1150372:0,0,30,31 +chrX 1150406 . G C 719 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=-1.029;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.97;MQRankSum=-1.241;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.701;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1697 0/1:29,29:58:99:.:749,0,794:14,15,15,14 +chrX 1150420 . G A 101 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=2.02;BaseQRankSum=1.229;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.056;MQ=59.93;MQRankSum=1.078;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.197;SOR=0.895;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,34:65:99:.:131,0:15,16,19,15 0/0:.:56:99:56:0,120,1800 +chrX 1150463 . A G 1671 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=14.66;BaseQRankSum=1.95;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.926;MQ=58.83;MQRankSum=0;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.380;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,32:63:34:34,0:12,19,17,15 1/1:1,52:53:99:1667,134,0:0,1,23,29 +chrX 1150494 . C T 978 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=17.08;BaseQRankSum=-1.662;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.020;MQ=58.03;MQRankSum=-2.803;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.86;SOR=0.982;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,516 0|1:32,27:59:99:.:0|1:1150494_C_T:1008,0,1251:1150494:18,14,17,10 +chrX 1150502 . T A 953 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.66;BaseQRankSum=-0.361;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.159;MQ=58.03;MQRankSum=-2.697;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.11;SOR=0.991;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,516 0|1:33,26:59:99:.:0|1:1150494_C_T:983,0,1297:1150494:18,15,16,10 +chrX 1150514 . ATCCCAGCTACTCGGGCATGGTGGTGCACACCTACAG A 886.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.43;BaseQRankSum=-1.798;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.151;MQ=58.83;MQRankSum=-3.01;QD=15.43;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=0.900;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,516 0|1:35,25:60:99:.:0|1:1150494_C_T:926,0,1383:1150494:17,18,14,11 +chrX 1150538 . T *,A 1888 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=23,31;AS_QD=0.00,34.45;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.03;QD=35.52;SOR=0.846;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,516,516 1/2:0,23,31:54:99:.:1918,1056,1274,943,0,850:0,0,29,25 +chrX 1150846 . AAAG A 562.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=9.87;BaseQRankSum=0.05;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=7.354;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=9.87;ReadPosRankSum=2.143;SOR=0.199;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,16:32:50:50,0:11,5,9,7 0/1:14,15:29:99:552,0,543:11,3,8,7 +chrX 1150849 . G *,GA 1179.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=15,14;AS_QD=0.00,35.54;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.157;MQ=60.00;QD=42.03;SOR=0.500;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,16,0:32:50:50,0,790:11,5,9,7 1/2:0,15,14:29:99:1219,504,543,611,0,552:0,0,19,10 +chrX 1150910 . GAGAA G 1559.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=35.04;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;QD=43.22;SOR=0.984;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:64:45:0,64 1/1:0,37:37:99:.:1599,111,0:0,0,21,16 +chrX 1150986 . GAGAAAGAA G 558.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=16.16;BaseQRankSum=-0.39;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.987;SOR=0.532;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:64:59:0,64 0/1:21,16:37:99:.:598,0,810:14,7,10,6 +chrX 1151066 . T C 1373 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=31.89;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.89;SOR=0.784;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:64:59:0,64 1/1:0,44:44:99:.:1403,131,0:0,0,23,21 +chrX 1151121 . G A 775 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.78;BaseQRankSum=-0.707;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=19.144;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.78;ReadPosRankSum=-1.618;SOR=1.634;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:64:59:0,64 0/1:21,30:51:99:.:805,0,532:7,14,21,9 +chrX 1151186 . C G 433 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=10.07;BaseQRankSum=1.781;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=8.862;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.428;SOR=1.359;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1771 0/1:28,18:46:99:.:463,0,755:17,11,6,12 +chrX 1151278 . C T 565 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=9.02;BaseQRankSum=-0.247;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.138;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.1;SOR=1.051;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1771 0/1:42,24:66:99:.:595,0,1200:21,21,10,14 +chrX 1151291 . C G 151 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=3.18;BaseQRankSum=-1.898;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=5.393;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.731;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,32:57:99:.:181,0:15,10,14,18 0/0:.:70:99:70:0,115,1800 +chrX 1151403 . C CGAGAGA 787.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=17.23;BaseQRankSum=-0.46;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.580;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,1080 0/1:26,22:48:99:.:827,0,985:11,15,10,12 +chrX 1151444 . GA G 129.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=3.60;BaseQRankSum=-2.544;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=6.121;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.784;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,26:47:99:.:169,0:13,8,11,15 0/0:.:49:99:49:0,106,1402 +chrX 1151448 . G GA 162.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=4.21;BaseQRankSum=-2.679;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=6.121;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=0.884;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,27:48:99:.:202,0:13,8,11,16 0/0:.:49:99:49:0,106,1402 +chrX 1151461 . G A 599 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.10;BaseQRankSum=2.567;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.711;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:47:99:47:0,138 0/1:25,23:48:99:.:629,0,602:13,12,11,12 +chrX 1151521 . A AAGAGAGAGGAGAGAGAAAAAGAGAGGACAC 1031.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=25.50;BaseQRankSum=-0.476;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=7.200;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.50;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=0.414;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:47:99:47:0,138 0/1:14,28:42:99:.:1071,0,506:10,4,13,15 +chrX 1151552 . A C 241 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=6.02;BaseQRankSum=-2.222;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=9.264;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=1.878;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:47:99:47:0,138 0/1:30,15:45:99:.:271,0,1120:14,16,11,4 +chrX 1151714 . G T 364 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=9.61;BaseQRankSum=-2.034;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=6.618;MQ=59.78;MQRankSum=0.934;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.434;SOR=1.730;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:59:62:.:.:0,59 0|1:23,18:41:99:.:0|1:1151714_G_T:394,0,653:1151714:12,11,13,5 +chrX 1151737 . GAC G 2348.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=25.68;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=42.64;SOR=0.922;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:59:62:.:.:0,59 1|1:0,56:56:99:.:0|1:1151714_G_T:2388,168,0:1151714:0,0,31,25 +chrX 1151759 . C T 868 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.72;BaseQRankSum=1.039;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=0.895;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.293;SOR=0.641;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:59:62:.:.:0,59 0|1:35,26:61:99:.:0|1:1151714_G_T:898,0,1339:1151714:18,17,13,13 +chrX 1151769 . G A 905 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.08;BaseQRankSum=-1.077;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.976;MQ=59.85;MQRankSum=0.94;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.495;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:59:62:.:.:0,59 0|1:34,28:62:99:.:0|1:1151714_G_T:935,0,1291:1151714:19,15,14,14 +chrX 1151989 . T TTAAA,TAA 1498.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=28,39;AS_QD=8.44,20.68;BaseQRankSum=0.105;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.973;MQ=59.62;MQRankSum=-0.733;QD=18.31;ReadPosRankSum=-2.626;SOR=0.333;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,28,0:45:99:380,0,1094:4,13,10,18 2/2:0,0,39:39:99:1158,1159,1159,117,117,0:0,0,14,25 +chrX 1152400 . C T 714 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.29;BaseQRankSum=-0.529;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.736;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.705;SOR=0.831;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,1211 0/1:28,28:56:99:.:744,0,735:12,16,16,12 +chrX 1152487 . C G 1035 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=16.38;BaseQRankSum=-2.137;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=6.813;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.624;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,1211 0/1:27,38:65:99:.:1065,0,743:10,17,21,17 +chrX 1152607 . G GCTCT 4082.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=34.07;BaseQRankSum=0.542;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.861;MQ=59.85;MQRankSum=-0.794;QD=34.07;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.574;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2737,0:0,0,29,33 0/1:24,35:59:99:1385,0,903:13,11,19,16 +chrX 1152632 . G C 2705 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=22.60;BaseQRankSum=-0.438;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=22.60;ReadPosRankSum=1.195;SOR=0.665;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,57:58:99:1805,0:1,0,30,27 0/1:27,36:63:99:930,0,700:14,13,19,17 +chrX 1152757 . G A 566 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=22;AS_QD=11.92;BaseQRankSum=-0.863;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.447;MQ=57.49;MQRankSum=-0.364;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.684;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:61:.:61:.:.:0,0 0|1:28,22:50:99:.:0|1:1152757_G_A:596,0,973:1152757:16,12,10,12 +chrX 1152778 . A G 998 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=30;AS_QD=21.42;BaseQRankSum=0.239;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.578;MQ=57.78;MQRankSum=-0.219;QD=21.42;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.843;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:53:.:53:.:.:0,0 0|1:18,30:48:99:.:0|1:1152757_G_A:1028,0,413:1152757:8,10,17,13 +chrX 1152831 . C T 735 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=31.31;BaseQRankSum=0;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.19;MQRankSum=2.005;QD=40.26;ReadPosRankSum=1.37;SOR=0.622;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,18:19:99:.:765,0:0,1,6,12 0/0:.:40:34:36:0,34,962 +chrX 1152852 . G A 1276 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=21.77;BaseQRankSum=0.716;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=2.210;MQ=54.66;MQRankSum=2.005;QD=21.77;ReadPosRankSum=1.553;SOR=1.061;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,18:19:99:.:.:765,0:.:0,1,6,12 0|1:26,15:41:99:0|1:1152757_G_A:541,0,1047:1152757:12,14,6,9 +chrX 1152857 . G A 1203 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=22.02;BaseQRankSum=-1.82;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=2.305;MQ=55.04;MQRankSum=-3.445;QD=22.02;ReadPosRankSum=1.756;SOR=1.127;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,17:17:99:.:.:765,0:.:0,0,6,11 0|1:26,13:39:99:0|1:1152757_G_A:468,0,1053:1152757:12,14,5,8 +chrX 1152861 . A C 1164 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=22.53;BaseQRankSum=-0.365;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=2.305;MQ=55.28;MQRankSum=-3.8;QD=22.53;ReadPosRankSum=1.91;SOR=1.044;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:720,0:.:0,0,6,10 0|1:24,13:37:99:0|1:1152757_G_A:474,0,969:1152757:11,13,5,8 +chrX 1152862 . G A 1164 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=22.53;BaseQRankSum=0.07;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=2.305;MQ=55.28;MQRankSum=-3.8;QD=22.53;ReadPosRankSum=2.521;SOR=1.044;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:720,0:.:0,0,6,10 0|1:24,13:37:99:0|1:1152757_G_A:474,0,969:1152757:11,13,5,8 +chrX 1152870 . C T 1487 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=21.37;BaseQRankSum=-2.084;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=2.120;MQ=54.84;MQRankSum=-3.038;QD=21.37;ReadPosRankSum=2.6;SOR=1.041;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:720,0:.:0,0,7,9 0|1:24,31:55:99:0|1:1152757_G_A:797,0,929:1152757:11,13,11,20 +chrX 1152871 . A G 1445 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=21.07;BaseQRankSum=-0.089;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=2.161;MQ=54.78;MQRankSum=-2.945;QD=21.07;ReadPosRankSum=-1.123;SOR=1.112;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:720,0:.:0,0,7,9 0|1:24,30:54:99:0|1:1152757_G_A:755,0,932:1152757:11,13,10,20 +chrX 1152873 . T C 1398 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=20.40;BaseQRankSum=-0.586;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=2.067;MQ=54.78;MQRankSum=-3.018;QD=20.40;ReadPosRankSum=-1.35;SOR=0.979;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,15:15:99:.:.:675,0:.:0,0,7,8 0|1:25,30:55:99:0|1:1152757_G_A:753,0,939:1152757:11,14,10,20 +chrX 1152891 . G A 1421 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=20.44;BaseQRankSum=-0.057;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.972;MQ=55.21;MQRankSum=0.371;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.492;SOR=0.841;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,15:17:99:.:.:625,0:.:2,0,9,6 0|1:27,27:54:99:0|1:1152757_G_A:826,0,978:1152757:13,14,10,17 +chrX 1152898 . C G 451 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=22.90;BaseQRankSum=-1.347;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.808;MQ=54.48;MQRankSum=-1.115;QD=22.90;ReadPosRankSum=1.813;SOR=0.375;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:6,15:21:99:.:481,0:4,2,8,7 0/0:.:52:68:52:0,68,1300 +chrX 1153053 . C T 486 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.21;BaseQRankSum=2.05;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.325;MQ=58.80;MQRankSum=-0.138;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.137;SOR=0.425;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:68:55:0,68 0/1:36,20:56:99:.:516,0,983:15,21,10,10 +chrX 1153139 . T G 509 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.72;BaseQRankSum=0.19;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.678;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.071;SOR=0.327;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,29:46:99:.:539,0:6,11,14,15 0/0:.:62:84:62:0,84,1781 +chrX 1153148 . C T 479 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.18;BaseQRankSum=2.017;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.522;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.356;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,31:50:99:.:509,0:7,12,15,16 0/0:.:62:84:62:0,84,1781 +chrX 1153156 . A G 469 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=9.98;BaseQRankSum=-1.079;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.14;SOR=0.593;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,31:50:99:.:499,0:8,11,14,17 0/0:.:62:84:62:0,84,1781 +chrX 1153206 . T G 452 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=9.09;BaseQRankSum=0.176;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;MQRankSum=-0.74;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.576;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,33:53:99:.:482,0:9,11,16,17 0/0:.:62:84:62:0,84,1781 +chrX 1153217 . C A 749 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.98;BaseQRankSum=0.551;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=7.660;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=1.219;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,233 0|1:30,22:52:99:.:0|1:1153217_C_A:779,0,1140:1153217:17,13,8,14 +chrX 1153227 . C T 2934 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=28.78;BaseQRankSum=0.24;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.074;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.88;SOR=0.579;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:2186,0:.:0,0,25,25 0|1:31,22:53:99:0|1:1153217_C_A:778,0,1184:1153217:18,13,9,13 +chrX 1153404 . G A 231 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=5.33;BaseQRankSum=-0.838;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;MQRankSum=-0.91;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.542;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,29:49:99:.:261,0:6,14,10,19 0/0:.:54:70:54:0,70,1398 +chrX 1153478 . A AAATAAT,AAAT,AAATAATAATAATAAT 3754.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=41,23,22;AS_QD=29.24,33.00,34.68;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=44.12;SOR=1.127;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41,0,0:41:99:1816,0,1817,1817:0,0,18,23 2/3:0,0,23,22:45:99:1978,1941,1935,931,932,853,971,974,0,901:0,0,17,28 +chrX 1154025 . C T 616 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.67;BaseQRankSum=1.323;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.359;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.67;ReadPosRankSum=-2.169;SOR=0.420;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:30:59:0,30 0/1:28,23:51:99:.:646,0,800:17,11,12,11 +chrX 1154037 . G A 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=0.723;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=-2.977;SOR=0.816;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:30:59:0,30 0/1:29,24:53:99:.:635,0,764:16,13,14,10 +chrX 1154196 . T C 460 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.25;BaseQRankSum=-1.882;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.693;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:30:59:0,30 0/1:20,20:40:99:.:490,0,555:6,14,6,14 +chrX 1154357 . C T 330 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=8.78;BaseQRankSum=0.536;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=9.709;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.041;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:7,14:21:99:.:.:195,0:.:0,7,3,11 0|1:14,6:20:99:0|1:1154357_C_T:165,0,538:1154357:0,14,0,6 +chrX 1154368 . A C 1254 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=34.60;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;QD=36.69;SOR=7.168;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:638,0:.:0,0,0,16 1|1:0,19:19:57:0|1:1154357_C_T:646,57,0:1154357:0,0,0,19 +chrX 1154390 . T C 107 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=7.21;BaseQRankSum=0.195;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.95;MQRankSum=0.955;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.551;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:11:90:11:.:.:0,90 0|1:14,5:19:99:.:0|1:1154357_C_T:137,0,521:1154357:1,13,0,5 +chrX 1154436 . T TCCTCTCCTCTCCTCC 112.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=25.58;DP=20;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.17;QD=38.00;SOR=3.258;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:5:45:5:0,45 1/1:0,4:4:12:.:152,12,0:0,0,4,0 +chrX 1154470 . CT C 50.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=9.00;BaseQRankSum=0;DP=24;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.67;MQRankSum=2.128;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.411;SOR=1.085;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,6:10:90:.:90,0:4,0,6,0 0/0:.:7:21:7:0,21,213 +chrX 1154486 . T TCCTCC 154.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=14.92;BaseQRankSum=0.833;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=2.276;MQ=54.36;MQRankSum=0;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.7;SOR=1.034;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,3:3:99:99,0:0,0,2,1 0/1:5,5:10:95:95,0,144:3,2,1,4 +chrX 1154590 . T TTTTTCTTTTC 675.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=25.54;BaseQRankSum=-1.084;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.54;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=0.567;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:99:48:0,336 0/1:10,18:28:99:.:715,0,366:6,4,10,8 +chrX 1154683 . G T 583 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.60;BaseQRankSum=1.457;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.377;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.256;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:99:48:0,336 0/1:20,22:42:99:.:613,0,529:17,3,16,6 +chrX 1155077 . G C 89 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=2.90;BaseQRankSum=-1.435;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.25;SOR=0.580;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,23:41:99:.:119,0:10,8,12,11 0/0:.:53:57:53:0,57,1082 +chrX 1155120 . GAAAA G 436.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.33;BaseQRankSum=1.112;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.33;ReadPosRankSum=2.618;SOR=0.838;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,27:42:99:.:476,0:6,9,10,17 0/0:.:53:57:53:0,57,1082 +chrX 1155256 . A C 723 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.58;BaseQRankSum=0.093;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.673;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,99 0/1:35,30:65:99:.:753,0,920:20,15,17,13 +chrX 1155979 . A ATT 534.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.11;BaseQRankSum=-0.775;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=11.348;MQ=57.00;MQRankSum=0.416;QD=15.11;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=1.673;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:11,27:38:99:.:574,0:7,4,8,19 0/0:.:44:58:44:0,58,1156 +chrX 1156232 . A G 693 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=26.78;BaseQRankSum=1.42;DP=29;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.27;MQRankSum=0.179;QD=26.78;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.990;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,11:11:99:.:.:413,0:.:0,0,5,6 0|1:6,10:16:99:0|1:1156232_A_G:310,0,150:1156232:3,3,7,3 +chrX 1156255 . A ATT 338.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=30.77;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.46;QD=37.80;SOR=0.693;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,10:10:99:.:378,0:0,0,5,5 0/0:.:32:37:32:0,37,923 +chrX 1156322 . C G 723 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=27.89;BaseQRankSum=1.994;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.38;MQRankSum=0;QD=27.89;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=0.368;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,26:27:99:.:753,0:0,1,11,15 0/0:.:32:37:32:0,37,923 +chrX 1156476 . G A 2250 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=26.39;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.77;SOR=1.057;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:2280,0:0,0,26,36 0/0:.:32:37:32:0,37,923 +chrX 1157032 . C CA 1234.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=19.60;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;QD=19.60;SOR=1.249;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:702,0:0,0,15,21 1/1:0,29:29:85:572,85,0:0,0,10,19 +chrX 1157457 . T C 1941 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.29;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.35;QD=31.29;SOR=0.724;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,63:63:99:.:1971,0:0,0,32,31 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1157528 . C T 2654 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=31.27;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;QD=44.00;SOR=0.793;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,61:61:99:.:2684,0:0,0,32,29 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1157530 . T G 2654 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=33.74;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;QD=44.00;SOR=0.793;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,61:61:99:.:2684,0:0,0,32,29 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1157575 . A G 1865 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.67;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=32.67;SOR=0.997;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1895,0:0,0,25,33 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1157783 . A G 1731 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=32.61;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=32.61;SOR=0.767;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:1761,0:0,0,28,26 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1157893 . C T 1955 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=32.02;BaseQRankSum=2.482;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.610;MQ=59.11;MQRankSum=-0.336;QD=32.02;ReadPosRankSum=1.677;SOR=0.707;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,61:62:99:.:1985,0:1,0,26,35 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1157937 . C T 2087 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=32.57;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.15;QD=32.57;SOR=0.854;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,65:65:99:.:2117,0:0,0,30,35 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1158264 . AAAAACAAAAC A 1551.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=24.95;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=43.00;SOR=0.859;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,37:37:99:.:1591,0:0,0,17,20 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1158314 . A C 1522 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=31.04;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=31.04;SOR=1.051;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:1552,0:0,0,29,21 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1158810 . C T 1871 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.78;BaseQRankSum=2.897;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.47;MQRankSum=-0.094;QD=32.78;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.478;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,57:58:99:.:1901,0:0,1,22,35 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1159310 . A G 1591 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=28.95;BaseQRankSum=-0.64;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.168;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=28.95;ReadPosRankSum=0.186;SOR=0.395;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,55:56:99:.:1621,0:0,1,29,26 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1159456 . C T 2367 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=32.63;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=43.58;SOR=1.159;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2397,0:0,0,22,33 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1159461 . A G 2333 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=25.69;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;QD=43.76;SOR=1.118;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:2363,0:0,0,22,32 0/0:.:61:25:56:0,25,1305 +chrX 1159735 . AAGAG A 680.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=-1.749;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.189;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.00;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=0.410;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1120 0/1:26,19:45:99:.:720,0,1024:10,16,9,10 +chrX 1159739 . G GAGAC,* 1569.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,0;AS_QD=30.39,28.86;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=44.69;SOR=0.723;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36,0:36:99:1609,0,1609:0,0,12,24 0/2:26,0,19:45:99:720,798,1879,0,1081,1024:10,16,9,10 +chrX 1159791 . AAGAGAC A 74.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=3.08;BaseQRankSum=1.493;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=2.937;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.585;SOR=0.293;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,20:37:99:.:114,0:6,11,10,10 0/0:.:45:27:24:0,27,725 +chrX 1160065 . CAGAG C 1094.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=31.27;BaseQRankSum=-0.762;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=39.10;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.446;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,28:29:99:.:1134,0:0,1,11,17 0/0:.:45:0:45:0,0,928 +chrX 1160320 . G A,GGAGA 1984 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,51;AS_QD=0.00,30.52;BaseQRankSum=0.864;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.507;MQ=58.49;MQRankSum=4.424;QD=30.52;ReadPosRankSum=1.627;SOR=0.450;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,0,35:37:99:1382,1913,0:1,1,21,14 0/2:13,0,16:29:99:632,672,1218,0,547,498:5,8,5,11 +chrX 1160325 . GAC G 620.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=18.86;BaseQRankSum=-0.393;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=3.012;MQ=58.97;MQRankSum=1.029;QD=18.86;ReadPosRankSum=-2.088;SOR=0.306;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:99:56:.:.:0,809 0|1:18,17:35:99:.:0|1:1160325_GAC_G:660,0,702:1160325:6,12,8,9 +chrX 1160333 . CAG C 652.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=19.22;BaseQRankSum=-0.153;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.348;MQ=58.89;MQRankSum=1.056;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.76;SOR=0.360;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:99:56:.:.:0,809 0|1:18,18:36:99:.:0|1:1160325_GAC_G:692,0,699:1160325:6,12,8,10 +chrX 1160533 . C CAGAGAG 774.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=27.84;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.349;MQ=55.22;MQRankSum=-0.466;QD=35.39;SOR=2.200;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,21:23:99:.:814,0:1,1,5,16 0/0:.:50:42:50:0,42,1141 +chrX 1160555 . GAGAGAC G 371.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=18.68;BaseQRankSum=0.491;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=4.652;MQ=53.63;MQRankSum=1.348;QD=18.68;ReadPosRankSum=2.231;SOR=1.856;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:7,15:22:99:.:411,0:4,3,4,11 0/0:.:46:22:42:0,22,899 +chrX 1160796 . G GGAGA 1563.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=26.40;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.85;QD=44.53;SOR=0.693;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1603,0:0,0,18,18 0/0:.:41:0:41:0,0,986 +chrX 1160823 . C CAG 2394.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=37.92;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.79;QD=44.25;SOR=0.850;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2434,0:0,0,18,21 0/0:.:48:24:46:0,24,1090 +chrX 1160847 . CAGAG C 1625.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=30.30;BaseQRankSum=1.702;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.136;MQ=59.01;MQRankSum=4.06;QD=41.63;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.405;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,39:40:99:.:1665,0:1,0,16,18 0/0:.:48:24:46:0,24,1090 +chrX 1161439 . G A 1921 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.07;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=33.07;SOR=0.871;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1951,0:0,0,27,32 0/0:.:48:24:46:0,24,1090 +chrX 1161504 . C CATAT 2271.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=33.76;BaseQRankSum=2.419;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.48;MQRankSum=4.202;QD=42.80;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.282;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,53:54:99:.:2311,0:1,0,26,27 0/0:.:48:24:46:0,24,1090 +chrX 1161529 . G A 2491 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=28.08;BaseQRankSum=-0.239;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;MQRankSum=5.431;QD=41.33;ReadPosRankSum=-1.051;SOR=0.280;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,60:61:99:.:2521,0:1,0,32,28 0/0:.:48:24:46:0,24,1090 +chrX 1161599 . CACATAT C 2547.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=30.74;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;QD=44.60;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2587,0:0,0,27,31 0/0:.:48:24:46:0,24,1090 +chrX 1162360 . T G 2982 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=24.49;BaseQRankSum=0.261;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.836;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=24.49;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=0.543;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2289,0:0,0,35,33 0/1:27,28:55:99:723,0,695:17,10,21,7 +chrX 1162640 . A G 384 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=11.19;BaseQRankSum=-0.336;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=4.887;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=1.119;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1220 0/1:21,16:37:99:.:414,0,586:9,12,10,6 +chrX 1162823 . G C 848 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=18.68;BaseQRankSum=1.315;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=4.865;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.473;SOR=1.609;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1220 0|1:22,25:47:99:.:0|1:1162823_G_C:878,0,829:1162823:11,11,11,5 +chrX 1162834 . A G 2128 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=29.56;BaseQRankSum=1.403;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.991;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=29.56;ReadPosRankSum=1.611;SOR=0.979;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:1563,0:.:0,0,20,15 0|1:22,16:38:99:0|1:1162823_G_C:595,0,876:1162823:12,10,11,5 +chrX 1162839 . G GA 2119.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=29.58;BaseQRankSum=1.385;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.991;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=29.58;ReadPosRankSum=1.568;SOR=0.979;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:1564,0:.:0,0,20,15 0|1:22,16:38:99:0|1:1162823_G_C:595,0,876:1162823:12,10,11,5 +chrX 1162842 . G A,GGAAAA 2738 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=51,0;AS_QD=34.61,24.18;BaseQRankSum=1.672;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=40.71;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.582;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35,0:35:99:1879,0,1689:0,0,20,15 0/1:17,16,0:33:99:889,0,855,668,712,1620:11,6,11,5 +chrX 1162909 . C T 2532 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=23.50;BaseQRankSum=-0.219;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.926;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=23.50;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.951;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1739,0:0,0,36,18 0/1:24,31:55:99:823,0,594:14,10,18,13 +chrX 1163128 . A G 2859 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=23.68;BaseQRankSum=2.558;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.749;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.492;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1948,0:0,0,29,31 0/1:29,33:62:99:941,0,730:11,18,12,21 +chrX 1163520 . G T 1020 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=16.94;BaseQRankSum=-1.528;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.07;SOR=0.641;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,684 0/1:24,38:62:99:.:1050,0,624:11,13,18,20 +chrX 1163639 . A G 517 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=22.79;BaseQRankSum=-1.161;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=5.653;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.79;ReadPosRankSum=0;SOR=2.584;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,684 0|1:10,14:24:99:.:0|1:1163639_A_G:547,0,365:1163639:7,3,13,1 +chrX 1163643 . G A 520 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=23.91;BaseQRankSum=-0.74;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.696;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.91;ReadPosRankSum=0.167;SOR=2.066;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,684 0|1:9,14:23:99:.:0|1:1163639_A_G:550,0,336:1163639:7,2,13,1 +chrX 1163675 . GGGAGGGAC G 325.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=28.65;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.56;SOR=1.402;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,684 1/1:0,9:9:28:.:365,28,0:0,0,6,3 +chrX 1163761 . G GAGGGAGGA 1561.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=27.74;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=6.255;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=42.13;SOR=2.430;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,37:38:99:.:1601,0:0,1,29,8 0/0:.:14:22:8:0,22,268 +chrX 1163796 . G A 699 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=20.83;BaseQRankSum=1.98;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=1.147;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=0.727;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,919 0|1:16,19:35:99:.:0|1:1163796_G_A:729,0,615:1163796:10,6,12,7 +chrX 1163801 . GA G 655.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=19.86;BaseQRankSum=0.216;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=1.086;QD=19.86;ReadPosRankSum=-0.604;SOR=0.776;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,919 0|1:17,18:35:99:.:0|1:1163796_G_A:695,0,648:1163796:11,6,12,6 +chrX 1163803 . AAG A 355.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=12.34;BaseQRankSum=-2.068;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.841;SOR=0.693;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:99:50:0,919 0/1:19,13:32:99:.:395,0,741:13,6,9,4 +chrX 1163886 . T A 4284 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=31.65;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.15;QD=44.47;SOR=0.799;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,40:40:99:.:.:1789,0:.:0,0,19,21 1|1:0,57:57:99:0|1:1163886_T_A:2525,172,0:1163886:0,0,32,25 +chrX 1163895 . T G 4299 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=31.08;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.14;QD=44.63;SOR=0.947;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,43:43:99:.:.:1899,0:.:0,0,18,14 1|1:0,54:54:99:0|1:1163886_T_A:2430,163,0:1163886:0,0,30,24 +chrX 1163911 . G C,GAGAACAGAAC,GAACAGAACAGAACAGAAC,GAGAACAGAACAGAACAGAACAGAACAGAAC 276 . AC=0,0,1,0;AF=0.00,0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,9,10,0;AS_QD=31.75,24.22,30.60,35.87;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.16;QD=16.11;SOR=0.793;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 3:0,0,9,10,0:19:88:.:306,660,88,0,249:0,0,10,9 0/0:.:53:84:53:0,84,1260,84,1260,1260,84,1260,1260,1260,84,1260,1260,1260,1260 +chrX 1163915 . A G 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.21;BaseQRankSum=-0.957;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=4.103;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=1.345;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,943 0|1:33,19:52:99:.:0|1:1163886_T_A:687,0,1327:1163886:18,15,13,6 +chrX 1163916 . C G 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.21;BaseQRankSum=1.204;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=4.103;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=1.345;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,943 0|1:33,19:52:99:.:0|1:1163886_T_A:687,0,1327:1163886:18,15,13,6 +chrX 1163948 . GAACAGAACAGA G 453.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=9.30;BaseQRankSum=-0.317;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.641;MQ=59.52;MQRankSum=0;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.54;SOR=1.051;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,943 0|1:38,15:53:99:.:0|1:1163886_T_A:493,0,1477:1163886:18,20,9,6 +chrX 1164150 . AG A 2093.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.75;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=37.42;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2133,0:0,0,27,30 0/0:.:55:62:55:0,62,1172 +chrX 1164615 . A G 314 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=7.02;BaseQRankSum=-0.554;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=4.541;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.683;SOR=0.241;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1473 0/1:33,16:49:99:.:344,0,904:22,11,8,8 +chrX 1165116 . G A 2279 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=27.46;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.52;SOR=1.000;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1473 1|1:0,65:65:99:.:0|1:1165116_G_A:2309,195,0:1165116:0,0,28,37 +chrX 1165150 . AATTT A 1002.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.10;BaseQRankSum=1.785;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=2.033;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.994;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1473 0|1:41,28:69:99:.:0|1:1165116_G_A:1042,0,1637:1165116:19,22,11,17 +chrX 1165166 . T C 996 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.45;BaseQRankSum=0.344;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=1.962;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.942;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1473 0|1:43,28:71:99:.:0|1:1165116_G_A:1026,0,1690:1165116:21,22,12,16 +chrX 1165201 . T C 1685 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=31.18;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.18;SOR=0.884;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1473 1/1:0,55:55:99:.:1715,163,0:0,0,25,30 +chrX 1165244 . T TAATAAATTTATTAATTTATTAATTTATATTA 3188.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=35.69;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.72;QD=44.83;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1473 1|1:0,72:72:99:.:0|1:1165244_T_TAATAAATTTATTAATTTATTAATTTATATTA:3228,216,0:1165244:0,0,37,35 +chrX 1165257 . T A,TATTA,TATTAATTTATTAATTTATATTAAATTAATTAATTTATTA 5618 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=69,4,15;AS_QD=28.24,33.76,28.91;BaseQRankSum=1.863;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=3.261;MQ=59.34;MQRankSum=-0.279;QD=63.46;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=0.442;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69,0,0:69:99:2557,0,2557,2557:0,0,36,33 2/3:1,0,4,15:20:99:3091,2072,1915,723,731,554,299,308,0,102:0,1,11,8 +chrX 1165265 . T A 2878 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=28.20;BaseQRankSum=2.212;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=3.490;MQ=58.86;MQRankSum=-0.292;QD=43.40;ReadPosRankSum=-1.28;SOR=0.618;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,425 1|1:1,66:67:99:.:0|1:1165244_T_TAATAAATTTATTAATTTATTAATTTATATTA:2908,186,0:1165244:0,1,37,29 +chrX 1165345 . A ATATTTATATT 2343.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=27.28;BaseQRankSum=-0.33;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=3.979;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.33;ReadPosRankSum=1.607;SOR=0.970;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,425 1|1:1,54:55:99:.:0|1:1165345_A_ATATTTATATT:2383,120,0:1165345:0,1,33,21 +chrX 1165363 . C T 1860 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=24.86;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=1.005;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,425 1|1:0,42:42:99:.:0|1:1165345_A_ATATTTATATT:1890,126,0:1165345:0,0,24,18 +chrX 1165375 . T G 1635 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=32.37;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.859;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,425 1|1:0,37:37:99:.:0|1:1165345_A_ATATTTATATT:1665,111,0:1165345:0,0,20,17 +chrX 1165405 . T TA 1209.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=32.49;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.50;QD=44.61;SOR=0.997;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,425 1|1:0,28:28:84:.:0|1:1165345_A_ATATTTATATT:1249,84,0:1165345:0,0,16,12 +chrX 1165464 . ATT A 2605.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=34.02;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=0.796;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,425 1|1:0,59:59:99:.:0|1:1165464_ATT_A:2645,178,0:1165464:0,0,28,31 +chrX 1165471 . A T 2750 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=26.31;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.84;SOR=0.826;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,425 1|1:0,62:62:99:.:0|1:1165464_ATT_A:2780,187,0:1165464:0,0,29,33 +chrX 1165475 . T G 2867 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.30;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.57;SOR=0.854;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,425 1|1:0,65:65:99:.:0|1:1165464_ATT_A:2897,196,0:1165464:0,0,30,35 +chrX 1165476 . A AAT 2857.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=27.15;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.57;SOR=0.854;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,425 1|1:0,65:65:99:.:0|1:1165464_ATT_A:2897,196,0:1165464:0,0,30,35 +chrX 1165560 . A G 1980 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.90;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.90;SOR=1.010;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:81:99:81:0,425 1/1:0,63:63:99:.:2010,188,0:0,0,27,36 +chrX 1165632 . G T 4828 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=146;AS_QD=33.27;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.27;SOR=0.901;VarDP=146 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,82:82:99:2730,0:0,0,36,46 1/1:0,64:64:99:2128,192,0:0,0,30,34 +chrX 1165706 . A G 2371 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.89;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,73:73:99:.:2401,0:0,0,40,33 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 1165709 . TAATA T 2810.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=28.66;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.53;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,1658 1|1:0,64:64:99:.:0|1:1165709_TAATA_T:2850,193,0:1165709:0,0,34,30 +chrX 1165734 . A G 2733 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.83;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=0.892;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,1658 1|1:0,64:64:99:.:0|1:1165709_TAATA_T:2763,192,0:1165709:0,0,35,29 +chrX 1166067 . T G 558 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.32;BaseQRankSum=0.806;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=5.374;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=0.756;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1658 0/1:34,23:57:99:.:588,0,920:20,14,10,13 +chrX 1166213 . T C 2007 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.83;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.83;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2037,0:0,0,30,34 0/0:.:64:48:64:0,48,720 +chrX 1166298 . G GAT,GATT 1609.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,8;AS_QD=28.52,27.43;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.01;QD=117.79;SOR=0.976;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1531,1531 1/2:0,6,8:14:63:.:1649,205,82,187,0,63:0,0,8,6 +chrX 1166299 . G GT,T 2942 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=50,41;AS_QD=25.66,27.64;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.58;QD=32.66;SOR=0.715;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50,0:50:99:.:.:1283,0,1283:.:0,0,25,25 2|2:0,0,41:41:99:0|1:1166299_G_T:1689,1689,1689,123,123,0:1166299:0,0,21,20 +chrX 1166311 . G GT,T 2509 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=44,35;AS_QD=24.14,35.20;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.37;QD=32.14;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,44,0:44:99:.:.:1062,0,1062:.:0,0,23,21 2|2:0,0,35:35:99:0|1:1166299_G_T:1477,1477,1477,105,105,0:1166299:0,0,17,18 +chrX 1166346 . C T 1814 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=29.64;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.15;QD=44.98;SOR=1.075;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:44:70:44:.:.:0,70 1|1:0,41:41:99:.:0|1:1166346_C_T:1844,123,0:1166346:0,0,17,24 +chrX 1166354 . C T 1904 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=30.90;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.12;QD=44.98;SOR=1.055;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:44:70:44:.:.:0,70 1|1:0,43:43:99:.:0|1:1166346_C_T:1934,129,0:1166346:0,0,18,25 +chrX 1166364 . A G 1928 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=35.59;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.58;QD=44.50;SOR=0.883;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:44:70:44:.:.:0,70 1|1:0,44:44:99:.:0|1:1166346_C_T:1958,132,0:1166346:0,0,20,24 +chrX 1166392 . C T 3506 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=34.33;BaseQRankSum=3.289;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.04;MQRankSum=-0.423;QD=34.33;ReadPosRankSum=0.996;SOR=1.190;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1967,0:0,0,18,34 1/1:2,49:51:99:1569,132,0:1,1,22,27 +chrX 1166427 . C T 85 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=2.02;BaseQRankSum=-0.126;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.03;MQRankSum=-0.21;QD=2.02;ReadPosRankSum=-1.375;SOR=0.587;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,30:57:99:.:115,0:10,17,12,18 0/0:.:53:72:53:0,72,1529 +chrX 1166446 . G T 2886 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=26.51;BaseQRankSum=3.067;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.729;MQ=59.66;MQRankSum=-0.055;QD=26.51;ReadPosRankSum=1.554;SOR=0.766;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,57:58:99:2258,0:0,1,25,32 0/1:28,24:52:99:658,0,757:15,13,13,11 +chrX 1166469 . G C 85 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=1.89;BaseQRankSum=-0.197;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.548;MQ=59.89;MQRankSum=-1.334;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=1.188;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,32:61:99:.:115,0:13,16,11,21 0/0:.:49:96:49:0,96,1370 +chrX 1166606 . A C 3175 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=32.37;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.37;SOR=0.797;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1657,0:0,0,23,29 1/1:0,47:47:99:1548,141,0:0,0,24,23 +chrX 1166689 . C A 3216 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.14;BaseQRankSum=2.504;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=5.130;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.14;ReadPosRankSum=1.733;SOR=1.704;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,50:51:99:1638,0:0,1,33,17 1/1:0,50:50:99:1608,149,0:0,0,37,13 +chrX 1166730 . T A 4449 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=30.13;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=42.66;SOR=1.458;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2072,0:.:0,0,32,17 1|1:0,56:56:99:0|1:1166730_T_A:2407,169,0:1166730:0,0,36,20 +chrX 1166754 . C T 4553 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=29.14;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=44.50;SOR=1.413;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,44:44:99:.:.:1970,0:.:0,0,29,15 1|1:0,59:59:99:0|1:1166730_T_A:2613,178,0:1166730:0,0,37,22 +chrX 1166775 . G A 4634 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=31.27;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=42.40;SOR=1.069;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46:46:99:.:.:1927,0:.:0,0,26,20 1|1:0,64:64:99:0|1:1166730_T_A:2737,193,0:1166730:0,0,38,26 +chrX 1166962 . T A 3126 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.57;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=33.57;SOR=0.976;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1648,0:0,0,25,23 1/1:0,46:46:99:1508,137,0:0,0,16,30 +chrX 1167036 . ATATATAATATAT A 781.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=18.24;BaseQRankSum=0.415;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.145;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=0.810;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:99:48:0,282 0/1:23,22:45:99:.:821,0,889:12,11,10,12 +chrX 1167043 . ATATAT A,* 2953.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=48,22;AS_QD=31.40,0.00;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.76;SOR=0.750;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28,0:28:99:1251,0,1302:0,0,15,13 1/2:0,20,22:42:99:1742,890,832,828,0,889:0,0,19,23 +chrX 1167201 . ATATATTATATATAT A 3993.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=28.02;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=44.32;SOR=0.855;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:2319,0:0,0,22,30 1/1:0,39:39:99:1714,118,0:0,0,20,19 +chrX 1167229 . T C 48 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=1.53;BaseQRankSum=-2.137;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;MQRankSum=0;QD=1.53;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.721;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,28:51:78:.:78,0:10,13,12,16 0/0:.:47:54:47:0,54,1212 +chrX 1167297 . C T 3210 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.40;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.40;SOR=0.693;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1675,0:0,0,24,28 1/1:0,48:48:99:1565,144,0:0,0,26,22 +chrX 1167371 . C A 3512 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=32.80;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.80;SOR=0.808;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1707,0:0,0,25,27 1/1:0,56:56:99:1835,168,0:0,0,32,24 +chrX 1168003 . TTTTC T 708.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=15.91;BaseQRankSum=0.388;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=6.465;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.809;SOR=1.739;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,956 0/1:27,20:47:99:.:748,0,1040:12,15,5,15 +chrX 1168051 . CCCTT C 549.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=15.92;BaseQRankSum=0.475;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.569;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,956 0/1:21,16:37:99:.:589,0,833:6,15,5,11 +chrX 1168235 . C T 2827 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.47;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=32.47;SOR=1.116;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1718,0:0,0,18,35 1/1:0,35:35:99:1139,105,0:0,0,18,17 +chrX 1168366 . C CTCTT 863.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.72;BaseQRankSum=0.198;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.860;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.444;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1308 0/1:29,25:54:99:.:903,0,1035:18,11,12,13 +chrX 1168484 . G C 965 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.31;BaseQRankSum=1.099;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=7.310;MQ=58.55;MQRankSum=-2.192;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.445;SOR=1.744;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:99:56:.:.:0,1308 0|1:32,29:61:99:.:0|1:1168484_G_C:995,0,1206:1168484:17,15,21,8 +chrX 1168504 . AGC A 3328.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=31.48;BaseQRankSum=0.133;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.79;MQRankSum=-3.494;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.718;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2329,0:.:0,0,22,30 0|1:28,27:55:99:0|1:1168484_G_C:1039,0,1094:1168484:14,14,18,9 +chrX 1168521 . C A,T 2573 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=54,20;AS_QD=32.54,28.96;BaseQRankSum=-0.74;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.855;MQ=57.42;MQRankSum=-3.448;QD=26.03;ReadPosRankSum=-0.951;SOR=0.560;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28,20:48:99:.:.:1590,0,258:.:0,0,21,27 0|1:26,26,0:52:99:0|1:1168484_G_C:1013,0,1013,1092,1092,2183:1168484:12,14,16,10 +chrX 1168522 . A G 3181 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.79;BaseQRankSum=-2.094;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.859;MQ=57.40;MQRankSum=-3.522;QD=31.79;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.590;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:2240,0:.:0,0,23,27 0|1:26,25:51:99:0|1:1168484_G_C:971,0,1006:1168484:12,14,15,10 +chrX 1168543 . C A 2982 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=29.24;BaseQRankSum=-0.378;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.47;MQRankSum=-3.404;QD=29.24;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=0.735;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48:48:99:.:.:2048,0:.:0,0,21,27 0|1:29,26:55:99:0|1:1168484_G_C:964,0,1058:1168484:14,15,14,12 +chrX 1168654 . G A 1614 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=32.24;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.10;QD=32.24;SOR=1.094;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,51:51:99:.:1644,0:0,0,21,30 0/0:.:56:66:56:0,66,957 +chrX 1168888 . T C 1730 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=30.34;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=30.34;SOR=1.085;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:991,0:0,0,13,20 1/1:0,25:25:75:769,75,0:0,0,11,14 +chrX 1168934 . T G 184 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=9.73;BaseQRankSum=0.628;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=4.200;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.229;SOR=0.169;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:8,14:22:99:.:214,0:2,6,7,7 0/0:.:21:25:20:0,25,545 +chrX 1169135 . GGGA G 661.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=30.48;BaseQRankSum=0;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=16.250;MQ=58.92;MQRankSum=1.221;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.267;SOR=5.994;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,7:9:99:216,0:0,2,7,0 0/1:2,12:14:42:485,0,42:2,0,12,0 +chrX 1169211 . G A 329 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=18.89;BaseQRankSum=0;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.30;MQRankSum=0;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.55;SOR=0.741;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:99:23:0,99 0/1:7,12:19:99:.:359,0,186:6,1,10,2 +chrX 1169270 . GA G 871.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=30.58;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.81;QD=43.38;SOR=4.712;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:99:23:0,99 1/1:0,21:21:63:.:911,63,0:0,0,20,1 +chrX 1169278 . A AAGGAGGAGGGAGG,AAGGAGGAGGGAGGAGGAGGAGGGAGG 965.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,6;AS_QD=33.75,29.98;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.67;QD=77.31;SOR=5.283;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:99:23:0,99,99 1/2:0,7,6:13:99:.:1005,278,220,319,0,266:0,0,13,0 +chrX 1169426 . G T 1793 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=18.60;BaseQRankSum=0.653;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.944;MQ=59.52;MQRankSum=0;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.586;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,24:46:91:91,0:15,7,15,9 1/1:0,52:52:99:1732,156,0:0,0,34,18 +chrX 1169517 . G T,* 1436 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=28,2;AS_QD=26.70,0.00;BaseQRankSum=0.594;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=4.451;MQ=58.81;MQRankSum=0;QD=26.65;ReadPosRankSum=1.343;SOR=2.170;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,26,0:51:63:63,0,682:13,12,2,0 1/2:0,2,2:4:51:1403,176,51,178,0,55:0,0,3,1 +chrX 1169598 . C *,T 208 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,2;AS_QD=0.00,28.01;BaseQRankSum=0;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=3.979;MQ=53.90;MQRankSum=-1.036;QD=47.60;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.061;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:47:99:47:.:.:0,323,323 0|2:3,0,2:5:38:.:0|1:1169516_GGCTTTCAAATTTATTTCTTGCTTCCGTGATAATTGTCTTTCAAATGCATTTCTTGCTTTCTTGGAAATTA_G:238,95,508,0,85,38:1169516:3,0,1,1 +chrX 1169813 . CTT C,CT 2157.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=28,61;AS_QD=34.10,30.62;BaseQRankSum=1.349;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.14;ReadPosRankSum=1.419;SOR=0.859;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28,18:46:99:1023,0,268:0,0,26,20 2/2:2,0,43:45:90:1174,1180,1219,90,129,0:1,1,22,21 +chrX 1169845 . A AT 144.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=3.91;BaseQRankSum=1.637;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=0.873;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,27:47:99:.:184,0:11,9,16,11 0/0:.:47:74:47:0,74,1177 +chrX 1170083 . TTTTTTTC T 102.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=3.46;BaseQRankSum=-0.722;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=12.008;MQ=58.79;MQRankSum=-0.14;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=1.477;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,22:41:99:.:142,0:12,7,7,15 0/0:.:53:87:53:0,87,1305 +chrX 1170088 . TTC *,T 321.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,14;AS_QD=0.00,19.00;BaseQRankSum=0.781;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=17.733;MQ=59.42;MQRankSum=0;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=1.143;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:19,22,0:41:99:.:.:142,0,950:.:12,7,7,15 0|2:5,0,14:19:51:0|1:1170088_TTC_T:361,376,469,0,93,51:1170088:5,0,6,8 +chrX 1170090 . C *,T 1032 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=14,5;AS_QD=0.00,31.02;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=5.738;MQ=59.42;QD=55.89;SOR=0.680;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:19,22,0:41:99:.:.:142,0,950:.:12,7,7,15 1|2:0,14,5:19:51:1|0:1170088_TTC_T:1062,148,51,454,0,361:1170088:0,0,11,8 +chrX 1170108 . G A 327 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=8.50;BaseQRankSum=0.471;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.209;MQ=59.08;MQRankSum=-1.002;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=0.928;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,25:42:99:.:357,0:7,10,9,16 0/0:.:58:46:58:0,46,972 +chrX 1170147 . G A 280 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=6.33;BaseQRankSum=0.014;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.249;MQ=59.29;MQRankSum=-1.766;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.93;SOR=1.473;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,28:49:99:.:310,0:10,11,9,19 0/0:.:58:46:58:0,46,972 +chrX 1170152 . C G 290 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=6.53;BaseQRankSum=-0.731;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=6.304;MQ=59.29;MQRankSum=-1.766;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.647;SOR=1.718;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,28:49:99:.:320,0:10,11,8,20 0/0:.:58:46:58:0,46,972 +chrX 1170498 . G A 681 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.16;BaseQRankSum=-0.155;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.869;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:51:51:0,51 0/1:41,29:70:99:.:711,0,1094:21,20,13,16 +chrX 1171074 . G T 512 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.68;BaseQRankSum=1.037;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.970;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.299;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:51:51:0,51 0/1:35,21:56:99:.:542,0,978:12,23,10,11 +chrX 1172163 . C T 1615 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=15.37;BaseQRankSum=1.398;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;MQRankSum=0;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.874;SOR=0.753;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:99:141,0:12,18,14,18 1/1:0,45:45:99:1504,135,0:0,0,16,29 +chrX 1172371 . C A 681 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=8.89;BaseQRankSum=1.327;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=5.676;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.410;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,24:42:99:234,0:9,9,11,13 0/1:21,17:38:99:477,0,581:15,6,9,8 +chrX 1172435 . T G 383 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=16;AS_QD=11.80;BaseQRankSum=-1.523;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=5.023;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.133;SOR=1.109;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:54:.:54:0,0 0/1:19,16:35:99:.:413,0,532:8,11,10,6 +chrX 1172510 . C G 1009 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=10.19;BaseQRankSum=1.215;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.578;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.802;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,28:53:98:.:.:98,0:.:14,11,15,13 0|1:24,25:49:99:0|1:1172510_C_G:941,0,909:1172510:9,15,14,11 +chrX 1172513 . T G 976 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=9.96;BaseQRankSum=-0.734;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.576;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.759;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,27:52:65:.:.:65,0:.:14,11,14,13 0|1:24,25:49:99:0|1:1172510_C_G:941,0,909:1172510:9,15,14,11 +chrX 1173463 . C G 3879 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.27;BaseQRankSum=2.19;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.71;MQRankSum=2.874;QD=31.27;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=0.481;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,66:67:99:2089,0:1,0,41,25 1/1:0,58:58:99:1820,173,0:0,0,35,23 +chrX 1173475 . G A,T 4223 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=124,0;AS_QD=34.30,25.69;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.75;QD=34.30;SOR=0.981;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68,0:68:99:2202,0,2202:0,0,40,28 1/1:0,56,0:56:99:2051,168,0,2152,172,2565:0,0,30,26 +chrX 1173483 . G A 607 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.02;BaseQRankSum=1.594;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=3.854;MQ=58.02;MQRankSum=-0.944;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.364;SOR=1.058;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:79:99:79:0,1800 0/1:28,25:53:99:.:637,0,670:13,15,15,10 +chrX 1173764 . C T 1112 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=49;AS_QD=16.08;BaseQRankSum=3.613;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=8.124;MQ=50.20;MQRankSum=2.538;QD=16.08;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=1.855;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,49:71:99:.:1142,0:9,13,11,38 ./.:.:70:.:70:0,0,0 +chrX 1173766 . C G 1112 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=50;AS_QD=15.64;BaseQRankSum=2.53;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=7.927;MQ=49.89;MQRankSum=2.456;QD=15.64;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=1.781;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,50:73:99:.:1142,0:9,14,11,39 ./.:.:69:.:69:0,0,0 +chrX 1173773 . C T 1017 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=46;AS_QD=15.40;BaseQRankSum=2.52;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=8.292;MQ=48.39;MQRankSum=2.032;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=1.824;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,46:68:99:.:1047,0:8,14,9,37 ./.:.:74:.:74:0,0,0 +chrX 1173812 . G A 459 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=34;AS_QD=8.43;BaseQRankSum=2.199;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.029;MQ=43.22;MQRankSum=0.807;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.246;SOR=1.480;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,34:58:99:.:489,0:6,18,5,29 ./.:.:70:.:70:0,0,0 +chrX 1173832 . T C 449 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=31;AS_QD=9.39;BaseQRankSum=1.738;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.132;MQ=41.03;MQRankSum=-0.068;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=1.347;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,31:51:99:.:479,0:5,15,5,26 ./.:.:60:.:60:0,0,0 +chrX 1173852 . T C 674 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=34;AS_QD=13.54;BaseQRankSum=1.508;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.412;MQ=42.24;MQRankSum=0.174;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.602;SOR=1.067;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,34:52:99:.:704,0:4,14,6,28 ./.:.:55:.:55:0,0,0 +chrX 1173853 . G C 629 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=33;AS_QD=12.92;BaseQRankSum=0.823;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.384;MQ=42.31;MQRankSum=0.218;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.631;SOR=1.022;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,33:51:99:.:659,0:4,14,6,27 ./.:.:55:.:55:0,0,0 +chrX 1173858 . G C 584 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=32;AS_QD=12.28;BaseQRankSum=1.706;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=42.27;MQRankSum=0.152;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.316;SOR=0.976;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,32:50:99:.:614,0:4,14,6,26 ./.:.:58:.:58:0,0,0 +chrX 1174685 . G T 547 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.42;BaseQRankSum=0;DP=46;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=33.81;MQRankSum=1.065;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.889;SOR=1.609;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:9,12:21:72:72,0:9,0,12,0 0/1:5,17:22:99:505,0,103:5,0,17,0 +chrX 1174904 . G A 733 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.74;BaseQRankSum=2.383;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.35;MQRankSum=0.171;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.676;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,423 0/1:36,29:65:99:.:763,0,892:16,20,13,16 +chrX 1175513 . G A 3642 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=32.21;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.21;SOR=1.009;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1712,0:0,0,20,33 1/1:0,61:61:99:1960,182,0:0,0,29,32 +chrX 1175582 . CT C 3066.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=31.06;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.06;SOR=0.863;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1394,0:0,0,23,22 1/1:0,55:55:99:1712,165,0:0,0,23,32 +chrX 1176207 . ATATAT A 4077.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=29.83;BaseQRankSum=-0.229;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.087;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=42.01;ReadPosRankSum=1.66;SOR=0.240;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,48:49:99:.:.:2125,0:.:0,1,24,24 1|1:3,46:49:99:0|1:1176207_ATATAT_A:1992,106,0:1176207:3,0,24,22 +chrX 1176243 . T TTTA 4002.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=30.16;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=44.91;SOR=0.832;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,42:42:99:.:.:1882,0:.:0,0,23,19 1|1:0,48:48:99:0|1:1176207_ATATAT_A:2160,144,0:1176207:0,0,25,23 +chrX 1176267 . A T 1222 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=14.90;BaseQRankSum=-1.261;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.826;MQ=59.77;MQRankSum=1.18;QD=14.90;ReadPosRankSum=1.685;SOR=0.577;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:17,26:43:99:.:.:390,0:.:9,8,11,15 0|1:18,23:41:99:0|1:1176207_ATATAT_A:862,0,687:1176207:7,11,13,10 +chrX 1176272 . A G 1189 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=14.69;BaseQRankSum=-1.9;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.838;MQ=59.77;MQRankSum=1.18;QD=14.69;ReadPosRankSum=1.293;SOR=0.544;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:17,25:42:99:.:.:357,0:.:9,8,11,14 0|1:18,23:41:99:0|1:1176207_ATATAT_A:862,0,687:1176207:7,11,13,10 +chrX 1176274 . T A 1203 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=15.22;BaseQRankSum=1.58;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;MQRankSum=1.156;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.625;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:16,25:41:99:.:.:392,0:.:9,7,11,14 0|1:18,22:40:99:0|1:1176207_ATATAT_A:841,0,690:1176207:7,11,12,10 +chrX 1176288 . T TATA,TATAAGAAAATAATAAAATATTATA 2685.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=39,24;AS_QD=27.22,33.21;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;QD=43.25;SOR=0.790;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21,13:34:99:1159,0,215:0,0,16,18 1/2:0,18,11:29:99:1566,486,657,751,0,688:0,0,14,15 +chrX 1176329 . A ATATTATAAAATAATAATAATATATTAT,ATATTATAAAATAATAATAATATATTATTATTATAAAATAATAATAATATATTAT 2378.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=9,18;AS_QD=28.72,33.60;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;QD=89.56;SOR=0.765;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,3,12:15:99:1317,335,0:0,0,9,6 1/2:0,6,6:12:99:1101,213,148,299,0,243:0,0,5,7 +chrX 1176703 . G C 725 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=11.80;BaseQRankSum=-0.497;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.950;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.109;SOR=0.846;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,199 0/1:33,31:64:99:.:755,0,851:14,19,12,19 +chrX 1176929 . C T 571 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=5.51;BaseQRankSum=0.953;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.15;MQRankSum=-1.06;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.21;SOR=0.730;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,33:65:64:64,0:14,18,19,14 0/1:23,21:44:99:537,0,603:14,9,9,12 +chrX 1176950 . A G 530 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.91;BaseQRankSum=0.972;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=4.144;MQ=58.95;MQRankSum=-0.022;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.956;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,254 0/1:25,22:47:99:.:560,0,608:14,11,9,13 +chrX 1176965 . A G 3565 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.68;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.14;QD=32.68;SOR=0.693;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2236,0:0,0,36,31 1/1:0,43:43:99:1359,129,0:0,0,19,24 +chrX 1177509 . AT A 895.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=8.35;BaseQRankSum=-0.123;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.519;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.783;SOR=0.510;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,34:64:99:.:.:180,0:.:10,20,17,17 0|1:27,21:48:99:0|1:1177509_AT_A:755,0,1017:1177509:15,12,10,11 +chrX 1177537 . TATA T 1134.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=10.67;BaseQRankSum=1.013;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.686;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,34:61:99:.:.:323,0:.:12,15,18,16 0|1:26,23:49:99:0|1:1177509_AT_A:851,0,1000:1177509:16,10,12,11 +chrX 1177565 . A C 436 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.13;BaseQRankSum=-2.236;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.763;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,313 0/1:25,21:46:99:.:466,0,979:15,10,13,8 +chrX 1177597 . C T 868 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=9.55;BaseQRankSum=1.18;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.628;SOR=0.711;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,33:51:99:238,0:10,8,18,15 0/1:18,25:43:99:660,0,592:11,7,16,9 +chrX 1177712 . G A 2791 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=34.40;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.40;SOR=0.693;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:2011,0:0,0,29,30 1/1:0,23:23:68:810,68,0:0,0,12,11 +chrX 1177753 . A ATATTATATATCATAATTATATTATATTATTATAATATGTAT 881.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.88;BaseQRankSum=0.368;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.88;ReadPosRankSum=-1.631;SOR=0.576;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,342 0|1:22,36:58:99:.:0|1:1177753_A_ATATTATATATCATAATTATATTATATTATTATAATATGTAT:921,0,829:1177753:9,13,16,20 +chrX 1177793 . AATATG A 1000.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.26;BaseQRankSum=0.774;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=7.625;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.588;SOR=1.156;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,342 0|1:27,27:54:99:.:0|1:1177753_A_ATATTATATATCATAATTATATTATATTATTATAATATGTAT:1040,0,1040:1177753:11,16,17,10 +chrX 1177798 . G A,* 2865 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=59,27;AS_QD=31.44,0.00;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.66;SOR=0.693;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34,0:34:99:1076,0,1303:0,0,15,19 1/2:0,25,27:52:99:1819,1122,1040,706,0,1040:0,0,28,24 +chrX 1178011 . C T 354 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=9.85;BaseQRankSum=0.926;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;MQRankSum=-0.34;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.664;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:41:20:40:0,20 0/1:24,15:39:99:.:384,0,642:8,16,5,10 +chrX 1178158 . A T,* 2779 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=46,0;AS_QD=27.41,32.66;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.21;QD=61.07;SOR=0.892;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41,0:41:99:.:.:1600,0,1111:.:0,0,7,8 1|1:0,5,0:5:9:0|1:1178158_A_*:1209,87,0,255,9,188:1178158:0,0,2,3 +chrX 1178182 . TATAAA T 2771.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=29.81;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.38;QD=40.16;SOR=0.892;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1600,0:.:0,0,7,8 1|1:0,29:29:88:0|1:1178158_A_*:1211,88,0:1178158:0,0,2,3 +chrX 1178194 . TTATATTATATTATTGTATATGA T 1486.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=33.91;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.90;QD=33.91;SOR=0.892;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:866,0:.:0,0,7,8 1|1:0,20:20:61:0|1:1178158_A_*:660,61,0:1178158:0,0,2,3 +chrX 1178477 . A ATATATAATTATATATTATAATTATATTATATTATTT,ATATATAATTATATATTATAATTATATTATATTATTATATATAATTATATATTATAATTATATTATATTATTT 309.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,5;AS_QD=2.07,17.45;BaseQRankSum=1.687;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=2.199;MQ=55.43;MQRankSum=0.693;QD=17.45;ReadPosRankSum=-1.661;SOR=1.781;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:15,0,5:20:99:.:349,318,0:8,7,4,1 0/0:.:36:0:36:0,0,10,0,10,10 +chrX 1179123 . A AT 3210.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=28.02;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.02;SOR=1.140;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:1775,0:0,0,41,22 1/1:0,53:53:99:1475,159,0:0,0,28,25 +chrX 1179302 . T C 2137 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=22.81;BaseQRankSum=1.247;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.311;MQ=57.39;MQRankSum=1.682;QD=22.81;ReadPosRankSum=1.277;SOR=0.848;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:13,45:58:99:.:.:1430,0:.:6,7,19,26 0|1:9,28:37:99:0|1:1179302_T_C:737,0,254:1179302:6,3,13,15 +chrX 1179304 . C T 2537 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=27.02;BaseQRankSum=1.745;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.438;MQ=57.39;MQRankSum=2.205;QD=27.02;ReadPosRankSum=1.781;SOR=0.830;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:13,45:58:99:.:.:1430,0:.:6,7,19,26 0|1:7,30:37:89:0|1:1179302_T_C:1137,0,89:1179302:5,2,14,16 +chrX 1179323 . A AT 875.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=14.30;BaseQRankSum=0.577;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.008;MQ=55.94;MQRankSum=0.486;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.650;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,42:64:99:.:915,0:12,10,20,22 0/0:.:55:38:55:0,38,1530 +chrX 1179493 . A AT 947.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=10.18;BaseQRankSum=0.295;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.658;MQ=56.82;MQRankSum=1.576;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.448;SOR=0.471;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,30:47:99:386,0:7,10,15,15 0/1:23,27:50:99:601,0,471:10,13,13,14 +chrX 1179814 . A G 3722 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=32.63;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.42;QD=32.63;SOR=0.710;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2349,0:0,0,32,39 1/1:0,44:44:99:1403,132,0:0,0,25,19 +chrX 1179950 . G A 1534 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=30.67;BaseQRankSum=3.347;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=7.833;MQ=58.81;MQRankSum=-0.297;QD=30.67;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.922;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:90:68:0,90 1/1:2,49:51:99:.:1564,132,0:2,0,19,30 +chrX 1180083 . G A 1896 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.03;BaseQRankSum=2.734;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.40;MQRankSum=3.029;QD=36.34;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.693;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:90:68:.:.:0,90 1|1:1,52:53:99:.:0|1:1180083_G_A:1926,149,0:1180083:0,1,17,35 +chrX 1180104 . G C 539 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.16;BaseQRankSum=1.78;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=4.197;MQ=59.42;MQRankSum=-0.326;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=1.405;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:90:68:.:.:0,90 0|1:29,22:51:99:.:0|1:1180083_G_A:569,0,691:1180083:12,17,6,16 +chrX 1180735 . G A 723 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.15;BaseQRankSum=2.562;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=2.143;MQ=59.62;MQRankSum=1.669;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.531;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:90:68:0,90 0/1:33,29:62:99:.:753,0,735:19,14,14,15 +chrX 1180859 . C G 388 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=9.50;BaseQRankSum=-1.683;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.661;MQ=59.79;MQRankSum=-1.156;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.350;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:90:68:0,90 0/1:26,18:44:99:.:418,0,966:16,10,9,9 +chrX 1180873 . CA C 189.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=5.45;BaseQRankSum=-3.127;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.21;MQRankSum=-0.47;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.059;SOR=0.527;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:90:68:0,90 0/1:28,14:42:99:.:229,0,905:19,9,9,5 +chrX 1180877 . A C 740 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.10;BaseQRankSum=2.28;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.959;MQ=59.18;MQRankSum=2.206;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.37;SOR=1.295;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:90:68:0,90 0/1:24,27:51:99:.:770,0,774:13,11,18,9 +chrX 1181048 . G C 4169 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=32.30;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;QD=32.30;SOR=0.929;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2149,0:0,0,34,35 1/1:0,61:61:99:2050,183,0:0,0,38,23 +chrX 1181117 . G A 870 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=7.03;BaseQRankSum=1.367;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=5.475;MQ=59.24;MQRankSum=0;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.757;SOR=1.200;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:34,34:68:77:.:.:77,0:.:18,16,16,18 0|1:37,23:60:99:0|1:1181117_G_A:823,0,1382:1181117:18,19,19,4 +chrX 1181132 . C A 928 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=7.73;BaseQRankSum=0.255;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=15.145;MQ=59.36;MQRankSum=0;QD=7.73;ReadPosRankSum=2.092;SOR=1.318;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,34:64:99:.:.:169,0:.:14,16,19,15 0|1:38,22:60:99:0|1:1181117_G_A:789,0,1417:1181117:16,22,17,5 +chrX 1181345 . A G 4894 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=153;AS_QD=32.18;DP=160;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=32.18;SOR=0.788;VarDP=153 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2188,0:0,0,33,34 1/1:0,86:86:99:2736,258,0:0,0,40,46 +chrX 1181512 . T C 3685 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=31.75;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.75;SOR=0.818;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1756,0:0,0,23,32 1/1:0,62:62:99:1959,186,0:0,0,32,30 +chrX 1181546 . C T 94 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=2.48;BaseQRankSum=2.193;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.096;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.525;SOR=1.022;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,26:50:99:.:124,0:12,12,11,15 0/0:.:63:99:63:0,120,1800 +chrX 1181622 . G T 659 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.88;BaseQRankSum=1.158;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=9.522;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=0.730;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:99:50:0,1475 0/1:32,26:58:99:.:689,0,848:21,11,11,15 +chrX 1181764 . G A 842 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.06;BaseQRankSum=3.035;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.984;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.475;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:99:50:0,1475 0/1:31,31:62:99:.:872,0,756:12,19,14,17 +chrX 1181794 . G C 1124 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=9.16;BaseQRankSum=2.942;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.423;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=0.897;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,35:59:99:393,0:10,14,14,21 0/1:39,28:67:99:761,0,1024:20,19,13,15 +chrX 1181871 . G C 803 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.22;BaseQRankSum=1.646;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.789;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:74:58:0,74 0/1:33,30:63:99:.:833,0,887:19,14,18,12 +chrX 1181907 . G A 1925 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=32.05;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.05;SOR=1.727;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,61:61:99:.:1955,0:0,0,42,19 0/0:.:59:99:59:0,120,1800 +chrX 1181950 . A G 660 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.32;BaseQRankSum=-0.922;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.689;SOR=0.693;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1800 0/1:28,28:56:99:.:690,0,735:17,11,17,11 +chrX 1182131 . A G 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.59;BaseQRankSum=0.556;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=1.031;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.473;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:87:99:87:0,1785 0/1:30,26:56:99:.:705,0,824:13,17,13,13 +chrX 1182193 . AAAAATAAAATAAAATAAAAT AAAAAT,AAAAATAAAAT,A 1338.97 . AC=2,0,1;AF=0.667,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=28,12,6;AS_QD=24.32,31.18,33.91;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.19;QD=29.96;SOR=0.693;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,12,0:30:99:718,0,180,758:0,0,14,16 1/3:0,10,0,6:16:99:660,254,221,662,253,666,410,0,416,393:0,0,9,7 +chrX 1182273 . AATAAAAATAAAATAAAATAAAATAAG A 368.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=14.07;BaseQRankSum=1.583;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.645;MQ=59.20;MQRankSum=-1.208;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.586;SOR=0.223;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,1146 0|1:18,11:29:99:.:0|1:1182273_AATAAAAATAAAATAAAATAAAATAAG_A:408,0,723:1182273:13,5,6,5 +chrX 1182275 . TA T,* 1477.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,0;AS_QD=33.23,0.00;BaseQRankSum=0.872;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=5.603;MQ=58.76;MQRankSum=-0.429;QD=39.92;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.259;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,36,0:38:99:.:.:1517,0,1571:.:2,0,22,14 0|2:18,0,11:29:99:0|1:1182273_AATAAAAATAAAATAAAATAAAATAAG_A:408,462,1218,0,756,723:1182273:13,5,6,5 +chrX 1182284 . AATAAAATAAAATAAG A,* 194.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=18,0;AS_QD=7.55,0.00;BaseQRankSum=-1.345;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=7.343;MQ=58.79;MQRankSum=-0.195;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.422;SOR=0.195;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:13,18,0:31:99:.:.:234,0,765:.:9,4,9,9 0|2:18,0,11:29:99:0|1:1182273_AATAAAAATAAAATAAAATAAAATAAG_A:408,462,1218,0,756,723:1182273:13,5,6,5 +chrX 1182316 . TAAAATAAATAAAATA T 452.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=13.67;BaseQRankSum=1.664;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=5.630;MQ=59.35;MQRankSum=-1.197;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.371;SOR=0.169;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:39:99:39:.:.:0,982 0|1:22,14:36:99:.:0|1:1182273_AATAAAAATAAAATAAAATAAAATAAG_A:492,0,857:1182273:17,5,8,6 +chrX 1182321 . TAAATAAAATA T,* 1286.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=37,0;AS_QD=34.00,0.00;BaseQRankSum=0.734;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=9.235;MQ=58.99;MQRankSum=-0.344;QD=34.00;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.164;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,37,0:39:99:.:.:1326,0,1406:.:2,0,22,15 0|2:22,0,14:36:99:0|1:1182273_AATAAAAATAAAATAAAATAAAATAAG_A:492,558,1458,0,900,857:1182273:17,5,8,6 +chrX 1182569 . C G 1775 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=31.67;BaseQRankSum=-0.384;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.67;ReadPosRankSum=-0.03;SOR=0.362;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,56:57:99:.:1805,0:0,1,24,32 0/0:.:62:46:62:0,46,1047 +chrX 1182844 . T C 3276 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=31.79;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.79;SOR=0.813;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1665,0:0,0,26,26 1/1:0,52:52:99:1641,156,0:0,0,23,29 +chrX 1182919 . CAAA C,CAAAAA 1383.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=14,49;AS_QD=4.59,20.62;BaseQRankSum=-1.162;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=-1.301;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=0.724;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,14,26:40:99:812,656,0:0,0,19,21 0/2:20,0,23:43:99:611,671,1302,0,631,561:10,10,13,10 +chrX 1182991 . G C 3944 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=30.69;BaseQRankSum=-0.029;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.169;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.80;ReadPosRankSum=-1.089;SOR=1.046;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:2409,0:.:0,0,34,21 0|1:13,40:53:99:0|1:1182991_G_C:1565,0,416:1182991:7,6,24,16 +chrX 1183011 . C T 3102 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=34.42;BaseQRankSum=-1.085;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.090;MQ=59.98;MQRankSum=0;QD=34.42;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.471;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,36:36:99:.:.:1549,0:.:0,0,19,17 0|1:15,40:55:99:0|1:1182991_G_C:1583,0,479:1182991:9,6,21,19 +chrX 1183078 . A G 3736 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=31.65;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;QD=31.65;SOR=0.710;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1955,0:0,0,30,32 1/1:0,57:57:99:1811,171,0:0,0,30,27 +chrX 1183138 . C T 158 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=3.19;BaseQRankSum=-0.531;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=0.17;QD=3.19;ReadPosRankSum=1.199;SOR=0.601;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,33:59:99:.:188,0:8,18,11,22 0/0:.:42:21:39:0,21,1125 +chrX 1183238 . C T 108 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=2.30;BaseQRankSum=-2.512;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.582;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.55;SOR=0.350;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,33:60:99:.:138,0:10,17,16,17 0/0:.:42:21:39:0,21,1125 +chrX 1183574 . A G 657 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=32.71;DP=22;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=39.16;QD=32.71;SOR=6.184;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:464,0:0,0,0,14 1/1:0,7:7:21:223,21,0:0,0,0,7 +chrX 1184482 . G GT 480.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.00;BaseQRankSum=-0.57;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=5.014;MQ=59.36;MQRankSum=-0.681;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=0.188;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:5:30:4:0,30 0/1:14,26:40:99:.:520,0,242:10,4,13,13 +chrX 1184528 . G A 3923 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=34.68;BaseQRankSum=3.038;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;MQRankSum=3.915;QD=34.68;ReadPosRankSum=1.02;SOR=0.260;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2290,0:0,0,38,25 1/1:1,50:51:99:1663,143,0:1,0,21,29 +chrX 1184789 . C CT 1072.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=22.24;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.30;QD=22.24;SOR=1.051;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:678,0:0,0,15,15 1/1:0,20:20:59:434,59,0:0,0,14,6 +chrX 1185095 . C CT,CTTTT,CTT 1421.97 . AC=0,1,2;AF=0.00,0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=5,20,28;AS_QD=32.99,23.83,26.93;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.24;QD=27.57;SOR=1.402;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,5,20,0:25:99:707,298,0,570:0,0,16,9 3/3:0,0,0,28:28:84:754,754,755,754,755,755,84,84,84,0:0,0,18,10 +chrX 1185137 . C T 3356 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.05;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.70;QD=44.55;SOR=0.859;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,37:37:99:.:.:1643,0:.:0,0,15,22 1|1:0,39:39:99:0|1:1185137_C_T:1743,117,0:1185137:0,0,20,19 +chrX 1185138 . A G 3356 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=27.09;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.67;QD=44.55;SOR=0.859;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,37:37:99:.:.:1643,0:.:0,0,15,22 1|1:0,39:39:99:0|1:1185137_C_T:1743,117,0:1185137:0,0,20,19 +chrX 1185301 . G A 623 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.05;BaseQRankSum=2.092;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.115;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.115;SOR=1.011;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:89:61:0,89 0/1:40,25:65:99:.:653,0,1115:21,19,15,10 +chrX 1185634 . A G 3886 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=32.63;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.63;SOR=0.950;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1861,0:0,0,30,28 1/1:0,62:62:99:2055,186,0:0,0,23,39 +chrX 1185875 . G A 272 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=7.95;BaseQRankSum=0;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.616;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.943;SOR=1.148;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,535 0/1:26,12:38:99:.:302,0,787:19,7,10,2 +chrX 1186113 . A T 4883 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=31.80;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.95;QD=41.99;SOR=1.159;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2628,0:.:0,0,22,40 1|1:0,55:55:99:0|1:1186113_A_T:2285,165,0:1186113:0,0,25,30 +chrX 1186138 . T C 4804 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=30.86;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.09;QD=42.40;SOR=1.101;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2596,0:.:0,0,21,39 1|1:0,54:54:99:0|1:1186113_A_T:2238,162,0:1186113:0,0,26,28 +chrX 1186589 . G A 367 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=7.63;BaseQRankSum=2.848;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=13.167;MQ=59.91;MQRankSum=-0.784;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=1.485;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,31:52:99:.:397,0:13,8,10,21 0/0:.:53:49:53:0,49,1041 +chrX 1186909 . C T 129 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=2.74;BaseQRankSum=0.069;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=10.454;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=2.064;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,31:58:99:.:159,0:11,16,6,25 0/0:.:53:49:53:0,49,1041 +chrX 1187334 . T C 1762 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=32.58;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.58;SOR=0.970;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:89:56:0,89 1/1:0,55:55:99:.:1792,165,0:0,0,31,24 +chrX 1187391 . ATT A,AT 1310.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=49,20;AS_QD=20.00,16.80;BaseQRankSum=-0.755;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=12.631;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.726;SOR=0.192;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,11,20:33:99:420,270,0:2,0,15,16 1/1:3,38,0:41:43:930,43,0,939,112,1008:3,0,18,20 +chrX 1187538 . T C 3574 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=32.47;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=1.241;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1780,0:0,0,33,20 1/1:0,58:58:99:1824,173,0:0,0,35,23 +chrX 1187837 . C T 362 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=7.26;BaseQRankSum=0.451;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.657;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,33:54:99:.:392,0:8,13,13,20 0/0:.:57:71:57:0,71,1201 +chrX 1187949 . AAAG A 355.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=18;AS_QD=10.39;BaseQRankSum=1.11;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=12.329;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.41;SOR=1.779;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:47:.:47:.:.:0,1 0|1:20,18:38:99:.:0|1:1187949_AAAG_A:395,0,453:1187949:8,12,13,5 +chrX 1187950 . A G,* 3405 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=41,39;AS_QD=26.64,0.00;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=1.096;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,21,21:42:1:.:.:1466,0,1:.:0,0,26,16 1|2:0,20,18:38:99:1|0:1187949_AAAG_A:1969,535,395,592,0,453:1187949:0,0,21,17 +chrX 1187953 . AG A 413.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.92;BaseQRankSum=-1.142;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=12.329;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.820;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:46:30:44:.:.:0,30 0|1:18,20:38:99:.:1|0:1187949_AAAG_A:453,0,395:1187949:13,5,8,12 +chrX 1187956 . GA G 388.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.57;BaseQRankSum=-1.142;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=10.037;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.674;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:46:30:44:.:.:0,30 0|1:18,19:37:99:.:1|0:1187949_AAAG_A:428,0,398:1187949:13,5,8,11 +chrX 1187957 . A AAG,* 3461.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=64,19;AS_QD=32.84,0.00;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=0.997;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46,0:46:99:.:.:1525,0,1060:.:0,0,12,9 1|2:0,18,19:37:99:0|1:1187949_AAAG_A:1976,568,428,538,0,398:1187949:0,0,21,16 +chrX 1188057 . C T 473 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=12.27;BaseQRankSum=2.553;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.837;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=1.230;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,189 0/1:23,18:41:99:.:503,0,591:14,9,13,5 +chrX 1188300 . C T 4017 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=32.90;BaseQRankSum=1.973;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.340;MQ=59.92;MQRankSum=-0.098;QD=32.90;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.490;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2345,0:0,0,35,34 1/1:1,53:54:99:1702,137,0:1,0,21,32 +chrX 1188832 . T C 693 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.46;BaseQRankSum=-0.664;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.116;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.205;SOR=0.480;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1311 0/1:22,28:50:99:.:723,0,575:14,8,16,12 +chrX 1188868 . TATATGTATATGCATTTGTATATGTATTTGC T 165.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=5.13;BaseQRankSum=0.219;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.363;MQ=59.64;MQRankSum=0;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.473;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1311 0|1:30,10:40:99:.:0|1:1188868_TATATGTATATGCATTTGTATATGTATTTGC_T:205,0,1135:1188868:17,13,5,5 +chrX 1188880 . C *,T 1664 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;AS_AltDP=9,26;AS_QD=0.00,31.92;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;QD=48.40;SOR=1.148;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:48:.:48:0,0,0 1/2:0,9,26:35:99:.:1694,870,1055,344,0,272:0,0,21,14 +chrX 1188928 . T *,C 241 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,10;AS_QD=0.00,6.16;BaseQRankSum=0.416;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.163;SOR=0.495;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,680,680 0|2:34,0,10:44:99:.:0|1:1188868_TATATGTATATGCATTTGTATATGTATTTGC_T:271,321,1832,0,1324,1255:1188868:19,15,5,5 +chrX 1189097 . CTA C 530.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.83;BaseQRankSum=-1.179;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.345;MQ=59.02;MQRankSum=-1.851;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.889;SOR=0.252;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:11:49:0,11 0/1:19,17:36:99:.:570,0,630:4,15,6,11 +chrX 1189117 . CCATATATAGTGTG C 205.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=10.21;BaseQRankSum=1.405;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=11.020;MQ=56.83;MQRankSum=2.176;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=2.812;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:35:34:.:.:0,35 0|1:16,8:24:99:.:0|1:1189117_CCATATATAGTGTG_C:245,0,590:1189117:9,7,1,7 +chrX 1189118 . C *,T 1491 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=8,15;AS_QD=0.00,26.96;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.49;QD=66.13;SOR=1.179;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:35:34:.:.:0,35,35 1|2:0,8,15:23:99:.:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:1521,624,548,347,0,248:1189117:0,0,9,14 +chrX 1189130 . G *,A 1533 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;AS_AltDP=8,16;AS_QD=0.00,33.23;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.83;QD=65.13;SOR=1.051;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:33:.:33:.:.:0,0,0 1|2:0,8,16:24:99:.:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:1563,666,590,347,0,245:1189117:0,0,10,14 +chrX 1189138 . AGTGT AGTGTGT,A 1485.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=31,8;AS_QD=29.11,25.67;BaseQRankSum=1.976;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=10.057;MQ=56.63;MQRankSum=-2.214;QD=29.33;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.097;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:13,15,0:28:90:90,0,675:2,11,7,8 1/2:0,16,8:24:99:1435,334,244,655,0,591:0,0,10,14 +chrX 1189160 . G GTA 781.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=17.85;BaseQRankSum=-0.552;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=28.081;MQ=55.31;MQRankSum=-2.048;QD=17.85;ReadPosRankSum=2.103;SOR=0.141;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:9,15:24:99:.:.:270,0:.:0,9,7,8 0|1:8,14:22:99:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:551,0,248:1189117:1,7,8,6 +chrX 1189162 . G A 756 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.47;BaseQRankSum=0;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=25.403;MQ=55.35;MQRankSum=-1.895;QD=17.47;ReadPosRankSum=2.513;SOR=0.014;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:9,15:24:99:.:.:270,0:.:0,9,7,8 0|1:8,13:21:99:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:516,0,250:1189117:1,7,7,6 +chrX 1189179 . GTA G 854.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=23.53;BaseQRankSum=-0.32;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=27.173;MQ=53.79;MQRankSum=-1.099;QD=23.53;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.541;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:7,14:21:99:.:.:315,0:.:0,7,8,6 0|1:3,14:17:84:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:579,0,84:1189117:0,3,8,6 +chrX 1189206 . A AGTGTGTGTG 1085.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=29.18;DP=32;ExcessHet=0.0000;FS=3.900;MQ=52.35;MQRankSum=-0.657;QD=41.67;SOR=0.970;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,12:12:99:.:.:540,0:.:0,0,8,4 0|1:1,14:15:0:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:585,0,0:1189117:0,1,8,6 +chrX 1189207 . TA *,T 1130.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=4,26;AS_QD=0.00,31.92;DP=31;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.09;QD=39.00;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,4,12:16:99:.:.:540,360,0:.:0,0,8,8 2|2:0,0,14:14:42:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:630,630,630,42,42,0:1189117:0,0,8,6 +chrX 1189231 . AG A 1306.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=26.12;BaseQRankSum=-0.23;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=2.108;MQ=56.65;MQRankSum=-0.561;QD=35.42;ReadPosRankSum=1.937;SOR=1.508;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,18:21:99:.:.:701,0:.:1,2,13,5 1|1:2,15:17:38:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:645,38,0:1189117:2,0,11,4 +chrX 1189233 . T TATATATATATATA 1261.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=29.16;BaseQRankSum=0.425;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=2.057;MQ=57.00;MQRankSum=-0.414;QD=35.16;ReadPosRankSum=1.116;SOR=1.445;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,18:21:99:.:.:701,0:.:1,2,13,5 1|1:2,14:16:35:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:600,35,0:1189117:2,0,10,4 +chrX 1189258 . G A 1596 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=32.52;BaseQRankSum=2.281;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.93;MQRankSum=0;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.063;SOR=1.012;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,27:30:99:.:.:921,0:.:1,2,17,10 1|1:2,18:20:47:1|0:1189117_CCATATATAGTGTG_C:705,47,0:1189117:2,0,12,6 +chrX 1189464 . G A 876 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=10.30;BaseQRankSum=0.121;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=4.088;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.985;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,23:38:99:228,0:10,5,9,14 0/1:23,27:50:99:678,0,550:10,13,12,15 +chrX 1189532 . A G 2109 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=32.41;BaseQRankSum=2.299;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=3.282;MQ=59.57;MQRankSum=0;QD=32.41;ReadPosRankSum=-1.517;SOR=0.469;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,31:32:99:998,0:0,1,18,13 1/1:0,34:34:99:1141,102,0:0,0,17,17 +chrX 1189553 . G GA 340.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.18;BaseQRankSum=-1.459;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.317;MQ=59.77;MQRankSum=-0.884;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.916;SOR=0.473;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,855 0/1:16,18:34:99:.:380,0,353:10,6,10,8 +chrX 1189699 . C A,G 607 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=52,2;AS_QD=5.84,0.00;BaseQRankSum=1.474;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.520;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.542;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,30,0:58:80:80,0,922:17,11,15,15 0/1:29,22,2:53:99:557,0,705,658,804,2092:16,13,14,10 +chrX 1190058 . G A 1057 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=11.32;BaseQRankSum=1.415;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.667;MQ=59.10;MQRankSum=0.245;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.143;SOR=0.931;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,30:56:99:.:.:201,0:.:14,12,16,14 0|1:16,24:40:99:0|1:1190058_G_A:886,0,589:1190058:7,9,14,10 +chrX 1190060 . T C 3738 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=27.87;BaseQRankSum=-0.781;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=3.297;MQ=59.08;MQRankSum=-0.192;QD=40.09;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.466;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:2147,0:.:0,0,29,26 1|1:1,38:39:72:0|1:1190058_G_A:1621,72,0:1190058:0,1,21,17 +chrX 1190077 . G A 483 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=13.15;BaseQRankSum=-2.618;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.252;MQ=59.65;MQRankSum=-0.421;QD=13.15;ReadPosRankSum=2.489;SOR=0.495;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,319 0|1:25,14:39:99:.:1|0:1190058_G_A:513,0,997:1190058:14,11,7,7 +chrX 1190092 . C T 471 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=11.65;BaseQRankSum=-0.508;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;MQRankSum=-0.533;QD=11.65;ReadPosRankSum=2.697;SOR=0.518;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,319 0|1:29,14:43:99:.:1|0:1190058_G_A:501,0,1104:1190058:16,13,7,7 +chrX 1190358 . G A 1801 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=33.29;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=33.29;SOR=0.884;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,319 1/1:0,55:55:99:.:1831,165,0:0,0,30,25 +chrX 1190597 . C T 434 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=7.48;BaseQRankSum=3.012;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.485;SOR=0.686;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,35:62:99:.:464,0:14,13,17,18 0/0:.:63:83:63:0,83,1487 +chrX 1190738 . C T 1067 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=17.98;BaseQRankSum=2.301;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=5.332;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.757;SOR=0.662;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,164 0/1:23,38:61:99:.:1097,0,536:9,14,21,17 +chrX 1190829 . G A 631 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.40;BaseQRankSum=2.545;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=5.476;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.785;SOR=1.519;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,164 0/1:34,24:58:99:.:661,0,895:17,17,8,16 +chrX 1190963 . G A 342 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=6.76;BaseQRankSum=0.971;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.646;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,164 0/1:39,16:55:99:.:372,0,1056:19,20,8,8 +chrX 1191045 . G A 266 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=5.48;BaseQRankSum=1.219;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.48;ReadPosRankSum=-2.189;SOR=0.829;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,31:54:99:.:296,0:11,12,17,14 0/0:.:46:73:46:0,73,1330 +chrX 1191074 . T C 412 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.28;BaseQRankSum=0.352;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=4.566;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.205;SOR=1.306;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:31:49:0,31 0/1:26,17:43:99:.:442,0,733:12,14,11,6 +chrX 1191089 . G A 469 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=5.14;BaseQRankSum=1.041;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.773;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,27:53:15:15,0:16,10,14,13 0/1:26,18:44:99:484,0,711:13,13,12,6 +chrX 1191295 . C CTCTTTCTT,CTCTTTCTTTCCTTCTT,CTCTT,CTCTTTCTTTCCT 1084.97 . AC=0,1,1,1;AF=0.00,0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,24,7,24;AS_QD=0.00,6.73,9.30,19.84;BaseQRankSum=2.559;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.24;MQRankSum=2.73;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=0.693;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:10,0,24,0,0:34:99:249,613,0,802,802:2,8,7,17 3/4:3,0,0,7,24:34:99:875,933,1197,933,1197,1197,689,808,808,762,141,439,439,0,549:2,1,11,20 +chrX 1191656 . T C 3516 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=31.66;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.66;SOR=1.015;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1779,0:0,0,37,20 1/1:0,55:55:99:1767,165,0:0,0,27,28 +chrX 1191803 . C T 2919 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=30.40;BaseQRankSum=-0.989;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=3.319;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=30.40;ReadPosRankSum=2.203;SOR=0.351;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2028,0:.:0,0,24,27 0|1:22,24:46:99:0|1:1191803_C_T:921,0,830:1191803:8,14,12,12 +chrX 1191810 . T C 1265 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=13.92;BaseQRankSum=-0.539;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.706;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.686;SOR=0.512;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:18,30:48:99:.:.:371,0:.:9,9,13,17 0|1:21,24:45:99:0|1:1191803_C_T:924,0,799:1191803:7,14,12,12 +chrX 1191971 . C T 876 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=21.07;BaseQRankSum=0.756;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=14.774;MQ=57.59;MQRankSum=-2.406;QD=21.07;ReadPosRankSum=1.657;SOR=1.959;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,218 0|1:20,23:43:99:.:0|1:1191971_C_T:906,0,759:1191971:12,8,6,17 +chrX 1191972 . A G 3245 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=34.11;BaseQRankSum=-0.098;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=11.143;MQ=56.27;MQRankSum=-2.406;QD=34.11;ReadPosRankSum=1.315;SOR=1.204;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,53:53:99:.:.:2369,0:.:0,0,22,31 0|1:20,23:43:99:0|1:1191971_C_T:906,0,759:1191971:12,8,6,17 +chrX 1191974 . G A 3214 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=34.51;BaseQRankSum=-0.093;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=9.094;MQ=56.06;MQRankSum=-2.347;QD=34.51;ReadPosRankSum=1.197;SOR=1.195;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2335,0:.:0,0,22,30 0|1:19,23:42:99:0|1:1191971_C_T:909,0,729:1191971:11,8,6,17 +chrX 1191976 . T C 3265 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=28.79;BaseQRankSum=-0.306;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=9.543;MQ=55.96;MQRankSum=-2.342;QD=35.05;ReadPosRankSum=1.007;SOR=1.100;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2425,0:.:0,0,24,30 0|1:18,22:40:99:0|1:1191971_C_T:870,0,690:1191971:11,7,5,17 +chrX 1191980 . T C 3045 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=34.55;BaseQRankSum=-0.262;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=7.348;MQ=55.72;MQRankSum=-2.342;QD=34.55;ReadPosRankSum=0.68;SOR=0.916;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2205,0:.:0,0,24,25 0|1:18,22:40:99:0|1:1191971_C_T:870,0,690:1191971:11,7,5,17 +chrX 1191987 . T C 3000 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=34.83;BaseQRankSum=-0.085;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=5.466;MQ=55.38;MQRankSum=-2.438;QD=34.83;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.823;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47:47:99:.:.:2115,0:.:0,0,25,22 0|1:17,23:40:99:0|1:1191971_C_T:915,0,645:1191971:10,7,5,18 +chrX 1191988 . G A 2993 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=34.75;BaseQRankSum=0.807;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=5.466;MQ=55.20;MQRankSum=-2.498;QD=34.75;ReadPosRankSum=-0.34;SOR=0.823;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48:48:99:.:.:2150,0:.:0,0,26,22 0|1:17,22:39:99:0|1:1191971_C_T:873,0,648:1191971:10,7,4,18 +chrX 1191993 . G C 2948 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=34.63;BaseQRankSum=-0.195;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=5.542;MQ=55.20;MQRankSum=-2.498;QD=34.63;ReadPosRankSum=-0.794;SOR=0.874;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47:47:99:.:.:2105,0:.:0,0,25,22 0|1:17,22:39:99:0|1:1191971_C_T:873,0,648:1191971:10,7,4,18 +chrX 1192021 . T C 1849 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=23.20;BaseQRankSum=-0.38;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.001;MQ=54.54;MQRankSum=-3.679;QD=23.20;ReadPosRankSum=-1.931;SOR=0.747;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1404,0:0,0,25,19 0/1:19,18:37:99:475,0,504:10,9,4,14 +chrX 1192068 . G A 313 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=10.09;BaseQRankSum=2.319;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=3.176;MQ=52.52;MQRankSum=-4.96;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.691;SOR=1.044;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:45:36:0,45 0/1:21,13:34:99:.:343,0,543:12,9,5,8 +chrX 1192097 . T C 330 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=5.90;BaseQRankSum=1.473;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.67;MQRankSum=-2.031;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.662;SOR=0.772;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,19:35:97:97,0:9,7,10,9 0/1:16,10:26:99:263,0,433:8,8,6,4 +chrX 1192160 . C G 563 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=19.77;BaseQRankSum=-2.661;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.74;MQRankSum=-2.766;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=0.483;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:38:99:38:.:.:0,585 0|1:13,17:30:99:.:0|1:1192160_C_G:593,0,474:1192160:10,3,12,5 +chrX 1192184 . G A 518 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=17.13;BaseQRankSum=1.347;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=4.170;MQ=53.86;MQRankSum=-2.224;QD=17.13;ReadPosRankSum=1.039;SOR=0.184;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:38:99:38:.:.:0,585 0|1:17,15:32:99:.:0|1:1192160_C_G:548,0,607:1192160:15,2,11,4 +chrX 1192220 . A C 695 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=22;AS_QD=15.10;BaseQRankSum=-2.23;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.242;MQ=58.06;MQRankSum=-0.324;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.704;SOR=0.504;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:40:.:40:.:.:0,0 0|1:26,22:48:99:.:0|1:1192220_A_C:725,0,895:1192220:20,6,16,6 +chrX 1192221 . C A,CA 1780 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=37,18;AS_QD=25.40,24.66;BaseQRankSum=-0.383;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=6.769;MQ=57.67;MQRankSum=-0.324;QD=22.35;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.217;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,15,18:33:99:.:.:1085,210,0:.:0,0,17,16 0|1:26,22,0:48:99:0|1:1192220_A_C:725,0,895,803,961,1764:1192220:20,6,16,6 +chrX 1192564 . C A 802 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.80;BaseQRankSum=1.982;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.089;MQ=59.61;MQRankSum=-0.686;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.463;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,406 0/1:34,31:65:99:.:832,0,856:12,22,13,18 +chrX 1192708 . TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC T,TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC 1184.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,10;AS_QD=30.10,32.06;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.23;QD=39.48;SOR=1.402;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,406,406 1/2:0,21,10:31:99:.:1224,418,689,805,0,777:0,0,11,20 +chrX 1192765 . T TTTCCTTCCTTCC 275.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.26;BaseQRankSum=-0.48;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.44;MQRankSum=-1.368;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.532;SOR=0.730;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:13,21:34:99:.:315,0:5,8,8,13 0/0:.:60:45:60:0,45,1485 +chrX 1193297 . T C 2320 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=33.27;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.96;SOR=1.009;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1018 1|1:0,56:56:99:.:0|1:1193297_T_C:2350,168,0:1193297:0,0,32,24 +chrX 1193322 . C T 4179 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=27.88;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.58;SOR=1.109;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2090,0:.:0,0,39,24 1|1:0,49:49:99:0|1:1193297_T_C:2119,147,0:1193297:0,0,27,22 +chrX 1193650 . T C 1756 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=31.33;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.34;QD=31.33;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:1786,0:0,0,30,27 0/0:.:40:32:39:0,32,1092 +chrX 1193781 . CAA C,CAAA 986.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=21,23;AS_QD=25.57,17.52;BaseQRankSum=-0.354;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.14;MQRankSum=-0.335;QD=22.30;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.990;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,21,0:23:99:588,0,627:1,1,12,9 2/2:0,0,23:23:68:438,439,439,68,68,0:0,0,13,10 +chrX 1193853 . C G,T 1523 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=2,48;AS_QD=10.00,32.35;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=31.06;SOR=0.859;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,1046,1046 2/2:0,2,48:50:99:.:1553,1538,1533,143,129,0:0,0,27,23 +chrX 1193955 . C G 110 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=3.11;BaseQRankSum=-2.097;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=4.288;MQ=59.63;MQRankSum=0.225;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.771;SOR=0.850;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,26:45:99:.:140,0:8,11,15,11 0/0:.:54:90:54:0,90,1485 +chrX 1193956 . G A 1127 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=32.14;BaseQRankSum=2.677;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.802;MQ=58.63;MQRankSum=2.823;QD=32.14;ReadPosRankSum=-1.637;SOR=0.876;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1146 1/1:1,35:36:98:.:1157,98,0:1,0,14,21 +chrX 1194053 . G A 622 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=10.35;BaseQRankSum=1.283;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.988;MQ=59.24;MQRankSum=-1.537;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.464;SOR=0.724;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,40:63:99:.:652,0:12,11,19,21 0/0:.:58:69:58:0,69,1257 +chrX 1194153 . G C 1285 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=29.89;BaseQRankSum=2.855;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;MQRankSum=-0.322;QD=29.89;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.892;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,171 1/1:2,42:44:99:.:1315,112,0:1,1,23,19 +chrX 1194226 . A G 5109 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=31.84;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=43.92;SOR=0.710;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2710,0:.:0,0,28,34 1|1:0,55:55:99:0|1:1194226_A_G:2429,165,0:1194226:0,0,30,25 +chrX 1194239 . A G 5305 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=30.45;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=44.46;SOR=0.726;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2771,0:.:0,0,26,36 1|1:0,58:58:99:0|1:1194226_A_G:2564,174,0:1194226:0,0,33,25 +chrX 1194251 . G C 5302 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=25.43;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=43.00;SOR=0.759;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,61:61:99:.:.:2660,0:.:0,0,25,36 1|1:0,63:63:99:0|1:1194226_A_G:2672,189,0:1194226:0,0,35,28 +chrX 1194331 . A G 4563 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=28.37;BaseQRankSum=-0.283;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.050;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=42.14;ReadPosRankSum=-1.58;SOR=0.282;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,44:45:99:.:.:1849,0:.:0,1,19,25 1|1:0,64:64:99:0|1:1194331_A_G:2744,192,0:1194331:0,0,36,28 +chrX 1194351 . G A 4902 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=26.97;BaseQRankSum=-0.172;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;MQRankSum=0;QD=41.80;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.259;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,48:49:99:.:.:2013,0:.:0,1,17,31 1|1:0,69:69:99:0|1:1194331_A_G:2919,207,0:1194331:0,0,39,30 +chrX 1194440 . T C 5254 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=32.03;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=39.73;SOR=1.179;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,61:61:99:.:.:2216,0:.:0,0,25,36 1|1:0,72:72:99:0|1:1194440_T_C:3068,216,0:1194440:0,0,28,44 +chrX 1194448 . T C 2935 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=31.27;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.97;SOR=1.211;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,214 1|1:0,69:69:99:.:0|1:1194440_T_C:2965,207,0:1194440:0,0,27,42 +chrX 1194464 . A G 3912 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=32.85;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=32.85;SOR=1.368;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1846,0:0,0,26,31 1/1:0,63:63:99:2096,189,0:0,0,18,45 +chrX 1194501 . C T 1971 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.92;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.92;SOR=2.342;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:55:56:0,55 1/1:0,59:59:99:.:2001,177,0:0,0,14,45 +chrX 1194528 . A G 3757 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=32.37;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.37;SOR=1.159;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2007,0:0,0,32,31 1/1:0,54:54:99:1780,162,0:0,0,15,39 +chrX 1194628 . G A 1607 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=33.41;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.41;SOR=1.007;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,283 1/1:0,49:49:99:.:1637,147,0:0,0,28,21 +chrX 1194682 . A G 1801 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.12;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.12;SOR=1.342;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,283 1/1:0,57:57:99:.:1831,170,0:0,0,36,21 +chrX 1194744 . A G 4167 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=31.56;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=31.56;SOR=1.055;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2402,0:0,0,42,34 1/1:0,57:57:99:1795,170,0:0,0,35,22 +chrX 1195067 . C G 913 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=33.68;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=33.68;SOR=1.382;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:70:57:0,70 1/1:0,28:28:84:.:943,84,0:0,0,18,10 +chrX 1195409 . T C 2141 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=18.56;BaseQRankSum=0.347;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=0.748;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,33:57:99:306,0:12,12,17,16 1/1:1,59:60:99:1865,145,0:1,0,32,27 +chrX 1195454 . G C 4207 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=32.34;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.34;SOR=0.838;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2310,0:0,0,33,39 1/1:0,59:59:99:1927,177,0:0,0,28,31 +chrX 1195635 . T A 3863 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=32.17;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=32.17;SOR=0.710;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1993,0:0,0,35,27 1/1:0,59:59:99:1900,176,0:0,0,26,33 +chrX 1195721 . G C 1992 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=17.14;BaseQRankSum=1.363;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.781;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,30:58:99:129,0:13,15,18,12 1/1:0,60:60:99:1893,179,0:0,0,22,38 +chrX 1195817 . A ATATATAT 2424.97 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=55;AS_QD=36.46;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=0.970;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:67:.:67:0,1 1/1:0,55:55:99:.:2464,165,0:0,0,31,24 +chrX 1195903 . G A 58 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=1.33;BaseQRankSum=-0.13;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.021;MQ=59.75;MQRankSum=0;QD=1.33;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.473;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,35:66:88:.:88,0:18,13,18,17 0/0:.:56:99:56:0,100,1378 +chrX 1196036 . A G 3475 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=32.16;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;QD=32.16;SOR=0.956;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1993,0:0,0,38,23 1/1:0,48:48:99:1512,144,0:0,0,23,25 +chrX 1196078 . T G 2514 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=24.46;BaseQRankSum=-1.069;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.934;MQ=58.65;MQRankSum=-0.534;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.336;SOR=0.957;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,35:58:99:.:.:507,0:.:12,11,25,10 1|1:0,46:46:99:0|1:1196078_T_G:2037,138,0:1196078:0,0,22,24 +chrX 1196079 . T C 2514 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=24.46;BaseQRankSum=-1.178;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.934;MQ=58.65;MQRankSum=-0.534;QD=24.46;ReadPosRankSum=0.08;SOR=0.957;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,35:58:99:.:.:507,0:.:12,11,25,10 1|1:0,46:46:99:0|1:1196078_T_G:2037,138,0:1196078:0,0,22,24 +chrX 1196187 . AT A 1121.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=19.03;BaseQRankSum=-0.483;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=25.840;MQ=59.42;MQRankSum=1.649;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=1.934;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:5,34:39:99:653,0:5,0,6,28 1/1:0,22:22:66:508,66,0:0,0,9,13 +chrX 1196218 . C T 138 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=3.57;BaseQRankSum=-1.06;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=8.613;MQ=59.66;MQRankSum=1.155;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.153;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,26:47:99:.:168,0:5,16,12,14 0/0:.:46:47:46:0,47,893 +chrX 1196542 . C T 3122 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.53;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=33.53;SOR=0.924;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1618,0:0,0,27,22 1/1:0,45:45:99:1534,135,0:0,0,25,20 +chrX 1196580 . C G 3170 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.00;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=32.00;SOR=0.775;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1489,0:0,0,20,25 1/1:0,55:55:99:1711,164,0:0,0,28,27 +chrX 1196617 . A G 3330 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=30.83;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=30.83;SOR=0.912;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1784,0:0,0,26,31 1/1:0,52:52:99:1576,154,0:0,0,23,29 +chrX 1196650 . G T 104 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=2.23;BaseQRankSum=-1.562;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=5.246;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.999;SOR=1.068;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,33:60:99:.:134,0:15,12,13,20 0/0:.:53:77:53:0,77,1296 +chrX 1196921 . G A 414 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.06;BaseQRankSum=2.89;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.914;SOR=0.681;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1522 0/1:32,17:49:99:.:444,0,845:17,15,9,8 +chrX 1197217 . C T 240 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=6.28;BaseQRankSum=0.96;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=59.89;MQRankSum=1.226;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.16;SOR=0.803;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,25:43:99:.:270,0:10,8,11,14 0/0:.:53:35:48:0,35,1192 +chrX 1197611 . C T 2023 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=33.11;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=33.11;SOR=0.693;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,154 1/1:0,62:62:99:.:2053,186,0:0,0,31,31 +chrX 1197767 . C T 1706 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=29.93;BaseQRankSum=1.269;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=29.93;ReadPosRankSum=-1.106;SOR=0.478;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,154 1/1:1,57:58:99:.:1736,149,0:0,1,22,35 +chrX 1198182 . TCCCAGGAAGGCAGGACACCC T 358.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=8.12;BaseQRankSum=-0.429;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=17.374;MQ=49.04;MQRankSum=3.663;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.527;SOR=1.041;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,154 0|1:31,18:49:99:.:0|1:1198182_TCCCAGGAAGGCAGGACACCC_T:398,0,881:1198182:12,2,5,9 +chrX 1198203 . TCCCTCCCACCTCGAAGGCAGGACACCCTCCCTCCCACCTC T 157.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=2.81;BaseQRankSum=0.56;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=1.163;MQ=47.28;MQRankSum=2.903;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=0.953;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,154 0|1:56,14:70:99:.:0|1:1198182_TCCCAGGAAGGCAGGACACCC_T:197,0,1445:1198182:24,32,5,9 +chrX 1198352 . G GCCTCCCTCCCACCTCCCGGGAAGATAGGACAC 91.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=26.20;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.32;MQRankSum=0.524;QD=26.20;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.981;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,154 0|1:1,4:5:16:.:0|1:1198352_G_GCCTCCCTCCCACCTCCCGGGAAGATAGGACAC:131,0,16:1198352:1,0,4,0 +chrX 1198377 . TAGGACACCCTCCCTCCCACCTCGAAGGC T 83.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=3.84;BaseQRankSum=0.464;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.68;MQRankSum=1.678;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.451;SOR=0.315;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,154 0|1:25,7:32:99:.:1|0:1198352_G_GCCTCCCTCCCACCTCCCGGGAAGATAGGACAC:123,0,615:1198352:22,3,6,1 +chrX 1198430 . A G 122 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=3.71;BaseQRankSum=0.73;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=4.157;MQ=52.22;MQRankSum=1.845;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=0.187;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,154 0|1:32,9:41:99:.:1|0:1198352_G_GCCTCCCTCCCACCTCCCGGGAAGATAGGACAC:152,0,780:1198352:26,6,6,3 +chrX 1198436 . G A 149 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=4.26;BaseQRankSum=0.081;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.802;MQ=52.41;MQRankSum=1.971;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.41;SOR=0.238;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,154 0|1:32,10:42:99:.:1|0:1198352_G_GCCTCCCTCCCACCTCCCGGGAAGATAGGACAC:179,0,774:1198352:26,6,7,3 +chrX 1198437 . C T 150 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=4.29;BaseQRankSum=0.105;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.802;MQ=52.69;MQRankSum=1.971;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.668;SOR=0.238;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,154 0|1:32,10:42:99:.:1|0:1198352_G_GCCTCCCTCCCACCTCCCGGGAAGATAGGACAC:180,0,773:1198352:26,6,7,3 +chrX 1198547 . C T 2440 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.50;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.50;SOR=0.746;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,154 1/1:0,76:76:99:.:2470,228,0:0,0,37,39 +chrX 1198740 . C CAT 2081.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=30.10;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=36.57;SOR=0.693;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,154 1/1:0,58:58:99:.:2121,172,0:0,0,29,29 +chrX 1199928 . A ACGTGTGTTG 2209.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=30.53;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=1.051;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,154 1|1:0,50:50:99:.:0|1:1199928_A_ACGTGTGTTG:2249,150,0:1199928:0,0,21,29 +chrX 1199932 . A ATATATGT 2333.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=21.77;BaseQRankSum=0.356;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=13.266;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.881;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,29:57:44:.:.:44,0:.:18,10,11,18 1|1:0,52:52:99:0|1:1199928_A_ACGTGTGTTG:2329,157,0:1199928:0,0,22,30 +chrX 1199934 . G T 2340 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=21.74;BaseQRankSum=0.861;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=13.266;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.881;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,29:57:42:.:.:42,0:.:18,10,11,18 1|1:0,52:52:99:0|1:1199928_A_ACGTGTGTTG:2328,156,0:1199928:0,0,22,30 +chrX 1200072 . A ATG 2000.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=28.40;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.80;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,177 1/1:0,50:50:99:.:2040,150,0:0,0,26,24 +chrX 1200104 . G GTA 1813.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=26.29;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.09;SOR=0.836;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,43:43:99:.:0|1:1200104_G_GTA:1853,129,0:1200104:0,0,20,23 +chrX 1200127 . C A 1979 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=33.98;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.00;SOR=0.733;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,49:49:99:.:0|1:1200104_G_GTA:2009,147,0:1200104:0,0,25,24 +chrX 1200319 . G A 2071 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=28.09;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;QD=42.88;SOR=1.112;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,49:49:99:.:0|1:1200319_G_A:2101,147,0:1200319:0,0,20,29 +chrX 1200329 . ATG A 2247.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.08;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;QD=43.98;SOR=0.941;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,52:52:99:.:0|1:1200319_G_A:2287,157,0:1200319:0,0,23,29 +chrX 1200371 . T C 2310 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=29.60;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.23;QD=45.00;SOR=0.853;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,52:52:99:.:0|1:1200319_G_A:2340,157,0:1200319:0,0,28,24 +chrX 1200372 . G A 2265 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=28.83;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.22;QD=45.00;SOR=0.900;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,51:51:99:.:0|1:1200319_G_A:2295,154,0:1200319:0,0,28,23 +chrX 1200405 . G A 2400 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=26.26;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.26;QD=45.00;SOR=1.022;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,54:54:99:.:0|1:1200319_G_A:2430,163,0:1200319:0,0,31,23 +chrX 1200407 . G GT 2435.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=31.82;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;QD=45.00;SOR=1.061;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,55:55:99:.:0|1:1200319_G_A:2475,166,0:1200319:0,0,32,23 +chrX 1200430 . G GTA 2433.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=27.81;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;QD=43.39;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,57:57:99:.:0|1:1200319_G_A:2473,171,0:1200319:0,0,30,27 +chrX 1200583 . A G 1548 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=29.54;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.04;QD=42.65;SOR=0.957;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,37:37:99:.:0|1:1200583_A_G:1578,117,0:1200583:0,0,14,18 +chrX 1200592 . T TGC 1538.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=28.47;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.04;QD=42.65;SOR=0.957;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,37:37:99:.:0|1:1200583_A_G:1578,117,0:1200583:0,0,14,18 +chrX 1200614 . G A 1098 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=30.40;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.39;QD=41.78;SOR=0.874;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,27:27:87:.:0|1:1200583_A_G:1128,87,0:1200583:0,0,10,12 +chrX 1200651 . GTGTGGGTATATATA G 704.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=32.70;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.75;QD=43.76;SOR=0.804;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:0,17:17:40:.:0|1:1200583_A_G:744,40,0:1200583:0,0,9,8 +chrX 1200701 . T C 915 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=30.50;BaseQRankSum=-0.445;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;MQRankSum=0;QD=41.09;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.299;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:1,22:23:24:.:0|1:1200701_T_C:945,24,0:1200701:1,0,12,10 +chrX 1200723 . G A 1213 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=27.20;BaseQRankSum=1.491;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.452;MQ=59.17;MQRankSum=-0.131;QD=40.10;ReadPosRankSum=0;SOR=0.643;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:1,30:31:48:.:0|1:1200701_T_C:1243,48,0:1200701:1,0,13,17 +chrX 1200742 . G T 1614 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=30.14;BaseQRankSum=-0.41;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.212;MQ=57.87;MQRankSum=-0.447;QD=37.36;ReadPosRankSum=-1.143;SOR=0.442;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,177 1|1:1,43:44:86:.:0|1:1200701_T_C:1644,86,0:1200701:1,0,20,23 +chrX 1200799 . A ATGTGTATATATATGTGTATATAAGCTGTGTATCTATATGTGTGTATATGCG 4126.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=28.73;BaseQRankSum=0.646;DP=159;ExcessHet=0.0000;FS=4.098;MQ=58.24;MQRankSum=-0.507;QD=28.73;ReadPosRankSum=0.334;SOR=0.874;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,36:61:99:.:.:501,0:.:13,12,13,23 1|1:1,83:84:99:0|1:1200799_A_ATGTGTATATATATGTGTATATAAGCTGTGTATCTATATGTGTGTATATGCG:3665,206,0:1200799:1,0,39,44 +chrX 1200842 . CAT C 2593.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=28.06;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.92;QD=43.88;SOR=1.071;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:64:57:.:.:0,64 1|1:0,60:60:99:.:0|1:1200799_A_ATGTGTATATATATGTGTATATAAGCTGTGTATCTATATGTGTGTATATGCG:2633,181,0:1200799:0,0,35,25 +chrX 1200936 . G T 1935 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.75;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=0.906;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:64:57:0,64 1/1:0,60:60:99:.:1965,180,0:0,0,33,27 +chrX 1201007 . T C 2749 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=27.71;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.75;SOR=0.787;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:64:57:.:.:0,64 1|1:0,65:65:99:.:0|1:1201007_T_C:2779,195,0:1201007:0,0,31,34 +chrX 1201016 . T C 4833 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=30.03;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.53;SOR=0.833;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2230,0:.:0,0,26,34 1|1:0,60:60:99:0|1:1201007_T_C:2633,180,0:1201007:0,0,30,30 +chrX 1201052 . C G 2805 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=33.23;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=1.044;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,154 1|1:0,64:64:99:.:0|1:1201052_C_G:2835,193,0:1201052:0,0,27,37 +chrX 1201063 . T C 2736 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.92;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=1.010;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,154 1|1:0,63:63:99:.:0|1:1201052_C_G:2766,189,0:1201052:0,0,27,36 +chrX 1201096 . T C 1864 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=31.05;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.05;SOR=0.941;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,154 1/1:0,61:61:99:.:1894,181,0:0,0,27,34 +chrX 1201150 . G A 1981 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=34.08;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.08;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,154 1/1:0,59:59:99:.:2011,177,0:0,0,26,33 +chrX 1201217 . G A 2474 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=20.87;BaseQRankSum=-1.722;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.792;MQ=59.96;MQRankSum=-0.951;QD=20.87;ReadPosRankSum=1.361;SOR=0.443;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,31:61:33:.:.:33,0:.:19,11,19,12 1|1:0,59:59:99:0|1:1201217_G_A:2471,178,0:1201217:0,0,31,28 +chrX 1201242 . C A 2353 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=20.72;BaseQRankSum=0.343;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=-0.934;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.56;SOR=0.643;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:29,31:60:78:.:.:78,0:.:17,12,17,14 1|1:0,55:55:99:0|1:1201217_G_A:2305,165,0:1201217:0,0,32,23 +chrX 1201277 . C T,CCTGTGTGTGT 2488 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=2,76;AS_QD=0.00,25.96;BaseQRankSum=0.158;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=8.420;MQ=59.93;MQRankSum=-0.91;QD=25.43;ReadPosRankSum=-1.893;SOR=0.409;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:21,2,21:44:97:.:.:97,1113,0:.:14,7,10,13 2|2:0,0,55:55:99:0|1:1201277_C_CCTGTGTGTGT:2421,2422,2423,165,165,0:1201277:0,0,27,28 +chrX 1201317 . C T 2715 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=26.72;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.30;QD=45.00;SOR=0.865;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,104 1|1:0,61:61:99:.:0|1:1201277_C_CCTGTGTGTGT:2745,183,0:1201277:0,0,28,33 +chrX 1201340 . C CTGTG 2730.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.78;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.68;SOR=0.976;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,104 1|1:0,62:62:99:.:0|1:1201277_C_CCTGTGTGTGT:2770,187,0:1201277:0,0,27,35 +chrX 1201384 . G A 2079 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=35.32;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.35;SOR=1.094;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,104 1|1:0,51:51:99:.:0|1:1201277_C_CCTGTGTGTGT:2109,153,0:1201277:0,0,21,30 +chrX 1201481 . TAGAG T 2029.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=22.74;BaseQRankSum=-1.26;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.915;MQ=54.20;MQRankSum=0.19;QD=22.74;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.564;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,27:49:99:.:.:212,0:.:10,12,14,13 1|1:0,42:42:99:0|1:1201481_TAGAG_T:1857,126,0:1201481:0,0,20,22 +chrX 1201526 . G GAGACAGATGATACATAGATAGATGATAGAGAGAT,GAGATAGATGATACATAGATAGATGATAGAGAGAT 3468.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=67,18;AS_QD=30.47,34.22;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.45;QD=41.27;SOR=0.765;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,20,18:38:53:.:.:1425,53,0:.:0,0,19,19 1|1:0,47,0:47:99:0|1:1201481_TAGAG_T:2083,141,0,2083,141,2084:1201481:0,0,25,22 +chrX 1201649 . T TTAGA 2443.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=21.97;BaseQRankSum=-2.029;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.97;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.679;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,36:64:99:324,0:16,12,18,18 1/1:0,49:49:99:2159,147,0:0,0,30,19 +chrX 1201798 . GGGTA G 2337.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=23.53;BaseQRankSum=1.822;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.53;ReadPosRankSum=0.36;SOR=0.719;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,25:48:82:82,0:12,11,12,13 1/1:1,52:53:99:2295,115,0:0,1,26,26 +chrX 1202027 . G A 1825 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=17.34;BaseQRankSum=1.109;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.845;SOR=0.626;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,32:58:99:242,0:11,15,15,17 1/1:0,49:49:99:1613,147,0:0,0,21,28 +chrX 1202647 . GT G 4463.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=25.68;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.85;SOR=0.903;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2575,0:0,0,28,36 1/1:0,49:49:99:1928,147,0:0,0,23,26 +chrX 1202858 . A G 1359 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=34.73;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.73;SOR=0.902;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,139 1/1:0,40:40:99:.:1389,120,0:0,0,22,18 +chrX 1203095 . CAAA C,CAA 543.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=20,8;AS_QD=15.64,3.19;BaseQRankSum=0;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=41.136;MQ=59.05;MQRankSum=0;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.869;SOR=2.776;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:8,5,8:21:67:67,419,0:1,7,9,4 0/1:5,15,0:20:35:516,0,35,532,80,613:1,4,14,1 +chrX 1203246 . T C 3652 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=29.69;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=29.69;SOR=0.865;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2006,0:0,0,36,32 1/1:0,56:56:99:1676,167,0:0,0,31,25 +chrX 1203651 . C T 2964 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=29.94;BaseQRankSum=-0.038;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=3.867;MQ=54.54;MQRankSum=-0.327;QD=29.94;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.944;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:16,32:48:99:.:.:692,0:.:7,9,22,10 1|1:0,52:52:99:0|1:1203651_C_T:2302,156,0:1203651:0,0,27,25 +chrX 1203652 . A G 2964 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=29.94;BaseQRankSum=-0.488;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.867;MQ=54.59;MQRankSum=-0.327;QD=29.94;ReadPosRankSum=0.219;SOR=0.944;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:16,32:48:99:.:.:692,0:.:7,9,22,10 1|1:0,52:52:99:0|1:1203651_C_T:2302,156,0:1203651:0,0,27,25 +chrX 1203728 . A C 2465 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=21.89;BaseQRankSum=0.251;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=5.229;MQ=59.81;MQRankSum=-0.708;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.283;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,32:50:99:457,0:13,5,23,9 1/1:0,64:64:99:2038,191,0:0,0,32,32 +chrX 1203938 . C A 3550 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.55;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.55;SOR=0.730;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2017,0:0,0,34,28 1/1:0,48:48:99:1563,144,0:0,0,20,28 +chrX 1204074 . C G 3173 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=28.99;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=41.60;SOR=1.012;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1628,0:.:0,0,24,15 1|1:0,38:38:99:0|1:1204074_C_G:1575,114,0:1204074:0,0,20,18 +chrX 1204096 . A AAAAAAAAAAAG,AAAAAAAAAGAG 2993.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=54,22;AS_QD=29.04,33.75;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.79;QD=39.91;SOR=1.194;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,17,22:39:99:.:.:1401,188,0:.:0,0,22,17 1|1:0,37,0:37:99:0|1:1204074_C_G:1632,111,0,1632,111,1632:1204074:0,0,24,13 +chrX 1204150 . C CTGTGTGTGTGTGTGTG,CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG,CTGTGTG,CTGTGTGTGTGTGTGTGTG 3103.97 . AC=0,1,1,1;AF=0.00,0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=8,24,13,17;AS_QD=28.88,27.51,29.33,33.17;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.16;QD=50.69;SOR=0.758;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,8,24,0,0:32:99:1660,699,0,1362,1362:0,0,17,15 3/4:0,0,0,13,17:30:99:1483,1383,1367,1383,1367,1367,727,728,728,673,553,553,553,0,485:0,0,15,15 +chrX 1204794 . C T 3643 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=33.39;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;QD=33.39;SOR=0.806;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:1806,0:.:0,0,30,26 1|1:0,54:54:99:0|1:1204781_T_C:1867,162,0:1204781:0,0,28,26 +chrX 1207501 . ACCC A,AC,ACC,* 674.97 . AC=0,1,1,0;AF=0.00,0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=9,12,3,5;AS_QD=30.00,30.37,13.70,0.00;BaseQRankSum=1.55;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=7.890;MQ=56.03;MQRankSum=2.649;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=3.126;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,9,12,0,0:22:97:577,97,0,480,480:1,0,1,20 0/3:6,0,0,3,5:14:19:137,160,480,160,480,480,0,187,187,133,19,385,385,79,550:1,5,1,7 +chrX 1207978 . T A 2177 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.08;BaseQRankSum=-0.435;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.08;ReadPosRankSum=-0.659;SOR=0.223;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,70:71:99:.:2207,0:0,1,35,35 0/0:.:50:25:32:0,25,898 +chrX 1208053 . T C 2237 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.39;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.39;SOR=1.418;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,70:70:99:.:2267,0:0,0,45,25 0/0:.:50:25:32:0,25,898 +chrX 1208508 . G A 213 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=4.34;BaseQRankSum=-0.139;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.038;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.693;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,32:56:99:.:243,0:11,13,17,15 0/0:.:50:25:32:0,25,898 +chrX 1209203 . A G 381 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=6.97;BaseQRankSum=-0.584;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.121;MQ=59.02;MQRankSum=-0.917;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.444;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,36:59:99:.:411,0:6,17,12,24 0/0:.:50:25:32:0,25,898 +chrX 1209266 . G A 282 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=6.00;BaseQRankSum=0.076;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;MQRankSum=-0.277;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.121;SOR=0.737;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,31:52:99:.:312,0:9,12,13,18 0/0:.:50:25:32:0,25,898 +chrX 1209413 . G C 189 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=4.76;BaseQRankSum=0.14;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=8.562;MQ=59.27;MQRankSum=0;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=1.282;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,23:46:99:.:219,0:14,9,8,15 0/0:.:45:21:43:0,21,855 +chrX 1210111 . A AAAAAG 276.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=9.58;BaseQRankSum=1.814;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.377;MQ=59.11;MQRankSum=1.478;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.774;SOR=0.693;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,109 0/1:20,13:33:99:.:316,0,719:11,9,6,7 +chrX 1210115 . AGAAAAG A 565.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.40;BaseQRankSum=0.962;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.221;MQ=59.13;MQRankSum=-2.021;QD=14.40;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.460;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,109 0|1:24,18:42:99:.:0|1:1210115_AGAAAAG_A:605,0,942:1210115:15,9,10,8 +chrX 1210126 . G A 550 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=13.81;BaseQRankSum=0.169;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.727;MQ=59.17;MQRankSum=-2.124;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=0.356;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,109 0|1:25,17:42:99:.:0|1:1210115_AGAAAAG_A:580,0,976:1210115:16,9,9,8 +chrX 1210238 . T C 1194 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.77;BaseQRankSum=0.644;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.773;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,109 0|1:40,33:73:99:.:0|1:1210238_T_C:1224,0,1570:1210238:21,19,18,15 +chrX 1210249 . A G 1269 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.65;BaseQRankSum=-1.779;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.3;SOR=0.634;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,109 0|1:43,35:78:99:.:0|1:1210238_T_C:1299,0,1689:1210238:24,19,19,16 +chrX 1210271 . A G 1234 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.85;BaseQRankSum=1.624;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.801;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,109 0|1:41,34:75:99:.:0|1:1210238_T_C:1264,0,1533:1210238:23,18,20,14 +chrX 1210381 . C T 1106 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=10.23;BaseQRankSum=1.055;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.464;MQ=59.88;MQRankSum=0.173;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.487;SOR=1.034;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,28:50:99:291,0:11,11,17,11 0/1:30,31:61:99:845,0,765:15,15,17,14 +chrX 1210390 . T C 322 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=6.77;BaseQRankSum=-2.017;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=3.976;MQ=59.73;MQRankSum=0.222;QD=6.77;ReadPosRankSum=1.195;SOR=1.048;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,30:52:99:.:352,0:10,12,18,12 0/0:.:57:99:57:0,105,1510 +chrX 1210751 . G A 661 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.82;BaseQRankSum=-0.948;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.827;SOR=0.682;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:35:11:0,35 0/1:24,26:50:99:.:691,0,652:11,13,12,14 +chrX 1210802 . A G 536 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=0.235;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.809;SOR=0.905;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:35:11:0,35 0/1:27,21:48:99:.:566,0,749:13,14,9,12 +chrX 1211139 . A G 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=21.24;BaseQRankSum=0.845;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=6.548;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.082;SOR=0.501;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:35:11:.:.:0,35 0|1:18,24:42:99:.:0|1:1211139_A_G:892,0,632:1211139:12,6,11,13 +chrX 1211166 . TG T 973.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=22.02;BaseQRankSum=-0.091;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=6.133;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.02;ReadPosRankSum=0.917;SOR=0.506;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:35:11:.:.:0,35 0|1:20,26:46:99:.:0|1:1211139_A_G:1013,0,762:1211139:13,7,12,14 +chrX 1211169 . ATGG A 970.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=21.49;BaseQRankSum=-1.39;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=4.196;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.565;SOR=0.557;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:35:11:.:.:0,35 0|1:21,26:47:99:.:0|1:1211139_A_G:1010,0,793:1211139:13,8,12,14 +chrX 1211257 . G GTGGA 633.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=17.71;BaseQRankSum=0.259;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=4.846;MQ=56.39;MQRankSum=0;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.337;SOR=1.565;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:35:11:0,35 0/1:20,18:38:99:.:673,0,761:9,11,5,13 +chrX 1211995 . C A 1825 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=31.44;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=31.44;SOR=0.796;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1002,0:0,0,14,17 1/1:0,28:28:83:853,83,0:0,0,14,14 +chrX 1212252 . G A 827 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=8.08;BaseQRankSum=3.035;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.119;SOR=0.693;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,29:54:99:233,0:10,15,13,16 0/1:29,23:52:99:624,0,772:17,12,13,10 +chrX 1212289 . C T 1051 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=11.03;BaseQRankSum=2.828;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.749;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.606;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,27:43:99:352,0:5,11,12,15 0/1:29,26:55:99:729,0,728:16,13,14,12 +chrX 1212386 . A G 146 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=5.18;BaseQRankSum=-0.998;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.976;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,20:34:99:.:176,0:9,5,14,6 0/0:.:50:98:50:0,98,1298 +chrX 1212416 . C CAG 1097.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=24.19;BaseQRankSum=0.501;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=1.157;MQ=59.88;MQRankSum=-0.744;QD=24.19;ReadPosRankSum=1.391;SOR=0.592;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,943 0|1:18,29:47:99:.:0|1:1212416_C_CAG:1137,0,668:1212416:8,10,15,14 +chrX 1212418 . GAAAAA GAAAAAAA,G 1210.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=23,29;AS_QD=2.19,14.88;BaseQRankSum=0.15;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.634;MQ=59.51;MQRankSum=0;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.762;SOR=0.542;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:15,23,0:38:99:.:.:149,0,587:.:7,8,8,15 0|2:30,0,29:59:99:0|1:1212416_C_CAG:1101,1191,2412,0,1220,1133:1212416:11,19,15,14 +chrX 1212806 . A AACAC,AACACACAC 1476.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=9,35;AS_QD=22.30,30.94;BaseQRankSum=0.436;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.283;MQ=59.43;MQRankSum=-1.13;QD=26.14;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=1.058;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,9,14:23:99:718,205,0:0,0,4,19 0/2:14,0,21:35:99:798,841,1430,0,589,525:5,9,9,12 +chrX 1213715 . CT C 194.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=10.64;BaseQRankSum=-1.004;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=2.430;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.223;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:7:35:5:0,35 0/1:12,10:22:99:.:234,0,282:11,1,8,2 +chrX 1215976 . C A 196 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=3.90;BaseQRankSum=1.285;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.019;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.18;SOR=0.514;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,32:58:99:.:226,0:10,16,14,18 0/0:.:54:20:36:0,20,909 +chrX 1216077 . A G 87 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=2.05;BaseQRankSum=-0.81;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.235;MQ=59.71;MQRankSum=-0.881;QD=2.05;ReadPosRankSum=-1.09;SOR=0.450;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,31:57:99:.:117,0:9,17,13,18 0/0:.:54:20:36:0,20,909 +chrX 1216334 . T C 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=2.48;BaseQRankSum=-1.397;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=4.351;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.853;SOR=1.473;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,25:46:99:.:114,0:11,10,17,8 0/0:.:54:20:36:0,20,909 +chrX 1216699 . C CA 359.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.76;BaseQRankSum=0.541;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=9.717;MQ=57.97;MQRankSum=-0.658;QD=13.76;ReadPosRankSum=-1.51;SOR=0.182;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1181 1/1:4,25:29:15:.:399,15,0:4,0,12,13 +chrX 1216929 . C T 2420 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=21.30;BaseQRankSum=2.046;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.30;ReadPosRankSum=-1.661;SOR=0.692;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1589,0:0,0,26,20 0/1:37,32:69:99:861,0,939:19,18,14,18 +chrX 1217815 . A G 1691 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=32.47;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.22;QD=32.47;SOR=0.730;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:1721,0:0,0,26,27 0/0:.:55:23:49:0,23,1054 +chrX 1218626 . CATAG CATAGATAGATAG,C 1163.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=39,13;AS_QD=12.03,15.40;BaseQRankSum=-1.047;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.973;MQ=59.80;MQRankSum=1.067;QD=16.26;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.941;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,23,0:45:33:33,0,1004:11,11,11,12 1/2:0,16,13:29:99:1170,519,469,649,0,631:0,0,12,17 +chrX 1218744 . TA T 1108.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=15.73;BaseQRankSum=1.77;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.319;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.365;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,27:45:99:385,0:8,10,12,15 0/1:9,19:28:99:763,0,320:2,7,10,9 +chrX 1218748 . T TA,TAGATGATA,TGATA 3737.97 . AC=2,0,1;AF=0.667,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=46,18,7;AS_QD=29.75,23.71,28.46;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=53.20;SOR=0.971;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27,18,0:45:99:2138,0,393,1670:0,0,20,25 1/3:0,19,0,7:26:99:1639,333,320,1403,377,1404,823,0,829,763:0,0,11,15 +chrX 1218824 . C CGATA 691.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=21.50;BaseQRankSum=-2.148;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=11.024;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.50;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.266;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,774 0/1:15,19:34:99:.:731,0,565:12,3,9,10 +chrX 1219473 . G A 2179 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=24.01;BaseQRankSum=1.903;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.309;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=24.01;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.824;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1732,0:1,0,24,29 0/1:21,17:38:99:477,0,570:11,10,7,10 +chrX 1219511 . G GATACATAC 2305.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=30.86;BaseQRankSum=1.391;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.740;MQ=59.99;MQRankSum=0;QD=30.86;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.462;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,42:43:99:1725,0:1,0,22,20 0/1:17,16:33:99:620,0,655:6,11,8,8 +chrX 1220493 . G C 259 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=5.90;BaseQRankSum=1.147;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.450;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.908;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,30:49:99:.:289,0:9,10,17,13 0/0:.:58:43:58:0,43,1092 +chrX 1227535 . A AGGAT 379.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.64;BaseQRankSum=-0.902;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=3.012;MQ=59.22;MQRankSum=0.728;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.106;SOR=0.255;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:7,8:15:44:44,0:4,3,5,3 0/1:11,10:21:99:375,0,432:8,3,4,6 +chrX 1228286 . G T 2495 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=22.54;BaseQRankSum=2.139;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.739;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=22.54;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.908;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,56:57:99:1782,0:1,0,28,28 0/1:28,27:55:99:743,0,708:13,15,8,19 +chrX 1231354 . G GA 603.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=20.09;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.22;QD=20.09;SOR=0.818;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:643,0:0,0,17,15 0/0:.:45:26:40:0,26,1000 +chrX 1232322 . T C 3992 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=32.70;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.70;SOR=0.963;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2057,0:0,0,36,27 1/1:0,60:60:99:1965,180,0:0,0,33,27 +chrX 1232787 . G C 4270 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=137;AS_QD=31.39;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.39;SOR=0.933;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2191,0:0,0,35,37 1/1:0,65:65:99:2109,195,0:0,0,26,39 +chrX 1232823 . G A 4075 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=33.37;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.37;SOR=0.848;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2233,0:0,0,41,27 1/1:0,55:55:99:1872,165,0:0,0,25,30 +chrX 1232867 . G A 4017 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=31.37;BaseQRankSum=-0.597;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=3.112;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=31.37;ReadPosRankSum=0.198;SOR=0.323;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,69:70:99:2118,0:1,0,37,32 1/1:0,59:59:99:1929,177,0:0,0,25,34 +chrX 1233300 . G GA 984.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=23.81;BaseQRankSum=-1.706;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=15.826;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.468;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,129 0|1:16,27:43:99:.:0|1:1233300_G_GA:1024,0,534:1233300:13,3,12,15 +chrX 1233320 . G A 1009 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=24.16;BaseQRankSum=0.294;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=15.826;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.468;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,129 0|1:16,27:43:99:.:0|1:1233300_G_GA:1039,0,540:1233300:13,3,12,15 +chrX 1233402 . C T 704 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=15.29;BaseQRankSum=-0.271;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.190;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.420;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,129 0|1:28,20:48:99:.:0|1:1233402_C_T:734,0,1095:1233402:19,9,12,8 +chrX 1233421 . T C 818 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.42;BaseQRankSum=0.727;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;MQRankSum=-1.143;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.584;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,129 0|1:32,23:55:99:.:0|1:1233402_C_T:848,0,1274:1233402:19,13,13,10 +chrX 1233424 . A G 776 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.93;BaseQRankSum=0.462;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;MQRankSum=-1.168;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.673;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,129 0|1:32,22:54:99:.:0|1:1233402_C_T:806,0,1277:1233402:19,13,13,9 +chrX 1233519 . G A 783 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.90;BaseQRankSum=1.103;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=8.911;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=12.90;ReadPosRankSum=1.432;SOR=1.471;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,129 0/1:33,30:63:99:.:813,0,927:15,18,20,10 +chrX 1233671 . C T 473 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=12.58;BaseQRankSum=0.089;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.19;MQRankSum=-1.812;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.825;SOR=0.738;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,129 0|1:25,15:40:99:.:0|1:1233671_C_T:503,0,892:1233671:12,13,7,8 +chrX 1233693 . G C 492 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=13.05;BaseQRankSum=-0.25;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.264;MQ=59.76;MQRankSum=-1.174;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.097;SOR=0.832;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,129 0|1:24,16:40:99:.:0|1:1233671_C_T:522,0,916:1233671:11,13,9,7 +chrX 1233704 . CA C 123.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=7.09;BaseQRankSum=0.18;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=1.674;MQ=59.47;MQRankSum=0.965;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=1.003;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,129 0/1:13,10:23:99:.:163,0,246:7,6,4,6 +chrX 1233919 . AAC A 946.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=18.60;BaseQRankSum=1.207;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;MQRankSum=-0.838;QD=18.60;ReadPosRankSum=1.232;SOR=0.616;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,129 0/1:23,30:53:99:.:986,0,761:12,11,15,15 +chrX 1234713 . TTA T 818.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=0.461;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=12.092;MQ=59.90;MQRankSum=-0.955;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.411;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,129 0/1:22,22:44:99:.:858,0,840:17,5,10,12 +chrX 1235377 . C G 258 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=8.00;BaseQRankSum=0.391;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.17;MQRankSum=0.502;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.78;SOR=0.538;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,129 0/1:23,13:36:99:.:288,0,582:8,15,5,8 +chrX 1236674 . C T 588 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.22;BaseQRankSum=-0.06;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.969;MQ=51.78;MQRankSum=-5.311;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.904;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,129 0/1:42,25:67:99:.:618,0,1181:19,23,10,15 +chrX 1237555 . C T 803 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.88;BaseQRankSum=1.58;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.182;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.347;SOR=1.001;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,129 0/1:29,31:60:99:.:833,0,713:15,14,13,18 +chrX 1238797 . G A 433 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=9.08;BaseQRankSum=-0.783;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=59.13;MQRankSum=0.455;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.545;SOR=0.601;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,31:51:99:.:463,0:11,9,15,16 0/0:.:55:51:55:0,51,1218 +chrX 1238808 . C T 468 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=9.96;BaseQRankSum=-0.397;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.09;MQRankSum=0.51;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.452;SOR=0.671;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,31:50:99:.:498,0:10,9,15,16 0/0:.:55:51:55:0,51,1218 +chrX 1238906 . T TAATA 1764.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=33.81;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=44.00;SOR=1.206;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:55:54:0,55 1/1:0,41:41:99:.:1804,123,0:0,0,25,16 +chrX 1239188 . G GAGA 2483.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=20.18;BaseQRankSum=0.721;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.18;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.674;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,36:70:88:88,0:12,22,13,23 1/1:0,55:55:99:2435,165,0:0,0,20,35 +chrX 1239278 . C T 2829 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=30.17;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.67;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,100 1|1:0,64:64:99:.:0|1:1239278_C_T:2859,193,0:1239278:0,0,34,30 +chrX 1239282 . T A 2805 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.26;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,100 1|1:0,63:63:99:.:0|1:1239278_C_T:2835,190,0:1239278:0,0,34,29 +chrX 1239292 . TA T 2698.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=30.59;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.16;SOR=1.143;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,100 1|1:0,62:62:99:.:0|1:1239278_C_T:2738,187,0:1239278:0,0,37,25 +chrX 1239545 . A G 32 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=1.32;BaseQRankSum=-3.949;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.628;MQ=59.74;MQRankSum=-0.818;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.109;SOR=0.363;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,27:47:62:.:62,0:6,14,11,16 0/0:.:61:99:61:0,101,1414 +chrX 1240016 . C T 1787 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=33.04;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.04;SOR=1.061;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1035 1/1:0,55:55:99:.:1817,165,0:0,0,23,32 +chrX 1240099 . G C 4245 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=31.67;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=31.67;SOR=0.902;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,83:83:99:2639,0:0,0,46,37 1/1:0,52:52:99:1636,155,0:0,0,28,24 +chrX 1240387 . C A 3102 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=32.63;BaseQRankSum=2.569;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=3.912;MQ=59.12;MQRankSum=-0.294;QD=32.63;ReadPosRankSum=-1.445;SOR=0.901;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1742,0:0,1,33,20 1/1:0,42:42:99:1390,126,0:0,0,24,18 +chrX 1240628 . C G 4449 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=30.71;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=36.41;SOR=1.179;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,66:66:99:.:.:2134,0:.:0,0,23,43 1|1:0,57:57:99:0|1:1240628_C_G:2345,171,0:1240628:0,0,26,31 +chrX 1240641 . CA C 2300.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=27.16;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.21;QD=41.05;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:99:72:.:.:0,1800 1|1:0,57:57:99:.:0|1:1240628_C_G:2340,171,0:1240628:0,0,27,30 +chrX 1240771 . G C 1650 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=15.14;BaseQRankSum=1.07;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.056;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.697;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,29:59:13:13,0:17,13,13,16 1/1:0,52:52:99:1667,155,0:0,0,24,28 +chrX 1240858 . G GTCTCTCTCTGAGGGATGGAGATTTGGGGTGAGTGTGGA 673.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=32.41;BaseQRankSum=-0.682;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.16;MQRankSum=-1.247;QD=32.41;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=0.446;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:44:84:44:0,84 0/1:4,18:22:99:.:713,0,118:1,3,7,11 +chrX 1240862 . C CTCTCTGAGGGATGGAGATTTGGGGTGAGTGTGGA 112.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=6.61;BaseQRankSum=0.768;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.11;MQRankSum=0.595;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.582;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:44:84:44:0,84 0/1:18,5:23:99:.:152,0,718:7,11,2,3 +chrX 1241333 . G GTCTCTCTCTGAGGGATGGAGATTTGGGGTGAGTGGGGA 504.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.95;BaseQRankSum=-0.227;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=6.884;MQ=58.28;MQRankSum=-1.04;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.885;SOR=0.744;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:39:6:0,39 0/1:20,19:39:99:.:544,0,598:7,13,11,8 +chrX 1241733 . A G 612 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=16.46;BaseQRankSum=-1.029;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=1.235;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.465;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:36:39:6:.:.:0,39 0|1:21,18:39:99:.:0|1:1241733_A_G:642,0,776:1241733:9,12,9,9 +chrX 1241747 . T A 1465 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=29.97;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.34;SOR=0.798;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:36:39:6:.:.:0,39 1|1:0,38:38:99:.:0|1:1241733_A_G:1495,114,0:1241733:0,0,20,18 +chrX 1241755 . A G 681 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=18.23;BaseQRankSum=-0.896;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=1.236;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=0.818;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:36:39:6:.:.:0,39 0|1:19,20:39:99:.:0|1:1241733_A_G:711,0,707:1241733:9,10,11,9 +chrX 1242369 . A G 411 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=8.32;BaseQRankSum=-0.967;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.451;MQ=59.35;MQRankSum=2.158;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.387;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,34:53:99:.:441,0:12,7,18,16 0/0:.:59:56:59:0,56,1101 +chrX 1242442 . T G 587 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.82;BaseQRankSum=-0.75;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.875;MQ=59.62;MQRankSum=-0.782;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.457;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1349 0/1:16,23:39:99:.:617,0,419:6,10,12,11 +chrX 1242535 . C A 655 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.27;BaseQRankSum=0.519;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.079;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.540;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1349 0/1:23,25:48:99:.:685,0,605:13,10,13,12 +chrX 1242773 . C T 1632 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=13.30;BaseQRankSum=-2.035;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=15.044;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.239;SOR=0.928;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,49:77:99:.:.:927,0:.:18,10,19,30 0|1:28,20:48:99:0|1:1242773_C_T:735,0,1105:1242773:16,12,9,11 +chrX 1242781 . A C 1909 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=15.27;BaseQRankSum=-1.726;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=17.173;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=1.270;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,51:77:99:.:.:1145,0:.:16,10,18,33 0|1:29,21:50:99:0|1:1242773_C_T:794,0,1154:1242773:16,13,8,13 +chrX 1242782 . C T 2004 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=15.89;BaseQRankSum=-1.473;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=14.885;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.482;SOR=1.160;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,53:78:99:.:.:1240,0:.:15,10,20,33 0|1:29,21:50:99:0|1:1242773_C_T:794,0,1154:1242773:16,13,8,13 +chrX 1242796 . A G 1053 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=14.06;BaseQRankSum=1.951;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=15.549;MQ=59.56;MQRankSum=-1.237;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=1.435;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,51:77:99:.:1083,0:16,10,17,34 0/0:.:53:42:53:0,42,1052 +chrX 1243117 . A G 297 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=6.67;BaseQRankSum=-1.103;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.67;ReadPosRankSum=-1.909;SOR=0.551;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,31:49:99:.:327,0:5,13,10,21 0/0:.:53:42:53:0,42,1052 +chrX 1243320 . G A 692 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=7.08;BaseQRankSum=1.76;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=2.581;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.08;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=0.511;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,27:53:85:85,0:14,12,12,15 0/1:25,24:49:99:637,0,646:15,10,13,11 +chrX 1243666 . T TAA 838.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=14.39;BaseQRankSum=1.044;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=2.667;MQ=59.64;MQRankSum=-0.784;QD=14.39;ReadPosRankSum=-1.305;SOR=0.368;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:13,18:31:54:54,0:5,8,11,7 1/1:0,30:30:89:824,89,0:0,0,13,17 +chrX 1244479 . G GAGAA 1939.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=27.77;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.98;SOR=1.038;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:1979,0:0,0,26,19 0/0:.:23:33:19:0,33,495 +chrX 1244565 . A AGGCGAG 275.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=11.67;BaseQRankSum=0.456;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.78;MQRankSum=-1.816;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.276;SOR=1.302;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:10,17:27:99:.:315,0:10,0,17,0 0/0:.:23:33:19:0,33,495 +chrX 1244588 . G GAA 275.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=0.586;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.40;MQRankSum=-1.698;QD=15.00;ReadPosRankSum=-1.12;SOR=1.508;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:7,14:21:99:.:315,0:7,0,14,0 0/0:.:24:23:23:0,23,690 +chrX 1244589 . G GGGAAGGGA 275.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=1.265;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.40;MQRankSum=-1.698;QD=15.00;ReadPosRankSum=-0.93;SOR=1.508;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:7,14:21:99:.:315,0:7,0,14,0 0/0:.:24:23:23:0,23,690 +chrX 1244594 . G GGGAAGGGAAGGGA,A 780 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,10;AS_QD=33.65,27.12;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.05;QD=47.65;SOR=5.784;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,7,10:17:99:.:810,135,0:0,0,17,0 0/0:.:24:23:23:0,23,690,23,690,690 +chrX 1244599 . G A 1435 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=29.90;BaseQRankSum=-0.282;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=7.153;MQ=57.35;MQRankSum=0;QD=29.90;ReadPosRankSum=1.923;SOR=2.851;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1122,0:.:0,0,25,0 0|1:14,10:24:99:0|1:1244599_G_A:343,0,475:1244599:12,2,9,1 +chrX 1244609 . G A 1374 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=27.00;BaseQRankSum=2.386;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=18.176;MQ=57.73;MQRankSum=0;QD=27.00;ReadPosRankSum=1.608;SOR=3.990;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,24:25:99:.:.:1071,0:.:0,1,24,0 0|1:17,10:27:99:0|1:1244599_G_A:333,0,572:1244599:13,4,9,1 +chrX 1245112 . CAT C 1879.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=29.08;BaseQRankSum=1.987;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.69;MQRankSum=2.872;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.275;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,65:66:99:.:1919,0:0,1,15,17 0/0:.:45:41:30:0,41,720 +chrX 1245114 . T *,TGC 1788.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=30,31;AS_QD=0.00,27.87;BaseQRankSum=1.049;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.452;MQ=58.63;MQRankSum=2.686;QD=29.48;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.595;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:1,30,31:62:9:.:1828,9,0:0,1,34,27 0/0:.:45:41:30:0,41,720,41,720,720 +chrX 1245456 . A G 1496 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=29.92;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.05;QD=29.92;SOR=0.900;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,51:51:99:.:1526,0:0,0,28,23 0/0:.:45:41:30:0,41,720 +chrX 1245563 . G T 36 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=1.78;BaseQRankSum=0.614;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=20.230;MQ=57.00;MQRankSum=-3.069;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.394;SOR=2.219;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:99:36:0,616 0/1:27,10:37:66:.:66,0,660:8,19,8,2 +chrX 1245700 . G C 102 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=2.69;BaseQRankSum=-0.679;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.69;ReadPosRankSum=2.081;SOR=0.623;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,27:49:99:.:132,0:12,10,13,14 0/0:.:38:36:36:0,36,853 +chrX 1245746 . A T 89 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=2.59;BaseQRankSum=-0.624;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.156;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.59;ReadPosRankSum=-2.427;SOR=1.022;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,25:46:99:.:119,0:10,11,10,15 0/0:.:38:36:36:0,36,853 +chrX 1246225 . G A 517 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.03;BaseQRankSum=1.556;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.749;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:12,27:39:99:.:547,0:8,4,18,9 0/0:.:38:36:36:0,36,853 +chrX 1246240 . C T 1562 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=32.36;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.89;SOR=1.863;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,38:38:99:.:1592,0:0,0,27,11 0/0:.:38:36:36:0,36,853 +chrX 1246245 . CAAA C,CAAAAAA 522.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,18;AS_QD=13.00,31.22;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.08;QD=18.13;SOR=1.839;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,13,18:31:99:.:562,393,0:0,0,22,9 0/0:.:41:0:41:0,0,928,0,928,928 +chrX 1246344 . G A 2344 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=33.60;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;QD=44.79;SOR=0.808;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:2374,0:0,0,25,28 0/0:.:60:26:57:0,26,1150 +chrX 1246345 . T G 2378 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=32.13;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;QD=43.78;SOR=0.884;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2408,0:0,0,25,30 0/0:.:60:26:57:0,26,1150 +chrX 1246351 . G A 263 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=5.05;BaseQRankSum=1.343;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.708;MQ=59.49;MQRankSum=2.119;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.330;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,34:58:99:.:293,0:9,15,17,17 0/0:.:60:26:57:0,26,1150 +chrX 1246559 . C T 1907 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=34.59;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.83;QD=34.59;SOR=1.101;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:1937,0:0,0,33,23 0/0:.:60:26:57:0,26,1150 +chrX 1246655 . A G 1800 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=31.55;BaseQRankSum=-0.41;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.15;MQRankSum=-0.646;QD=31.55;ReadPosRankSum=1.285;SOR=0.301;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,57:58:99:.:1830,0:1,0,31,26 0/0:.:60:26:57:0,26,1150 +chrX 1246851 . A G 1448 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=30.79;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.79;SOR=0.963;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,48:48:99:.:1478,0:0,0,21,27 0/0:.:60:26:57:0,26,1150 +chrX 1247193 . T TAA 1390.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=32.50;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=32.50;SOR=1.105;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,44:44:99:.:1430,0:0,0,26,18 0/0:.:34:0:34:0,0,844 +chrX 1247347 . A G 2550 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=35.65;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;QD=39.09;SOR=0.957;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2580,0:0,0,29,37 0/0:.:43:31:23:0,31,650 +chrX 1247351 . G A 228 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=3.91;BaseQRankSum=0.681;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.075;MQ=59.33;MQRankSum=-1.668;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.202;SOR=1.035;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,37:66:99:.:258,0:14,15,15,22 0/0:.:43:31:23:0,31,650 +chrX 1247440 . CAA C 1399.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=33.47;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.42;QD=33.47;SOR=0.941;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1439,0:0,0,19,24 0/0:.:43:31:23:0,31,650 +chrX 1247882 . GGAGAGA G,GGAGAGAGA 725.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=11,19;AS_QD=30.64,32.79;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.19;QD=25.50;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,6:17:99:337,0,142:0,0,6,11 2/2:0,0,13:13:39:428,428,429,39,39,0:0,0,8,5 +chrX 1248455 . C CGAGAG 2937.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=29.95;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.42;QD=43.78;SOR=1.179;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1617,0:0,0,23,14 1/1:0,31:31:93:1360,93,0:0,0,18,13 +chrX 1249129 . C T 2267 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=30.07;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.54;SOR=1.220;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:2297,0:0,0,33,21 0/0:.:50:37:38:0,37,1132 +chrX 1249141 . A C,AC 292 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,13;AS_QD=4.25,12.38;BaseQRankSum=0.062;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=3.176;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.235;SOR=0.634;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,1499,1499 0/2:13,7,13:33:99:.:322,237,831,0,247,332:8,5,9,11 +chrX 1249144 . C G 2498 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=26.81;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.59;SOR=1.493;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2528,0:0,0,38,20 0/0:.:48:99:48:0,105,1575 +chrX 1249151 . CCA C 2390.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=36.76;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=1.835;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:2430,0:0,0,38,16 0/0:.:48:99:48:0,105,1575 +chrX 1249175 . C T 2169 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=28.37;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.98;SOR=1.390;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2199,0:0,0,32,18 0/0:.:53:53:53:0,53,972 +chrX 1249914 . T G 1989 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.55;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=31.55;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2019,0:0,0,30,34 0/0:.:53:53:53:0,53,972 +chrX 1250510 . CTAGATAGATAGATAGATAGA CTAGATAGATAGATAGA,C 3142.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=60,17;AS_QD=32.63,23.83;BaseQRankSum=2.202;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=4.007;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=40.79;ReadPosRankSum=1.371;SOR=0.974;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,42,0:43:99:1815,0,1830:0,1,30,12 1/2:0,18,17:35:99:1367,637,582,734,0,962:0,0,17,18 +chrX 1251071 . T TGATA 1928.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=31.28;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=0.829;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:1968,0:0,0,24,21 0/0:.:52:30:18:0,30,450 +chrX 1251132 . A ATATC 1729.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=36.40;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.23;SOR=1.022;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,40:40:99:.:1769,0:0,0,23,17 0/0:.:52:30:18:0,30,450 +chrX 1251392 . C T 2301 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=28.34;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=44.83;SOR=0.853;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:2331,0:0,0,24,28 0/0:.:52:30:18:0,30,450 +chrX 1251399 . G A 2301 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.50;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=44.83;SOR=0.941;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:2331,0:0,0,23,29 0/0:.:52:30:18:0,30,450 +chrX 1251429 . G A 2265 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=36.84;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=45.00;SOR=0.813;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,51:51:99:.:2295,0:0,0,24,27 0/0:.:52:30:18:0,30,450 +chrX 1251434 . T A 2085 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=32.47;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=45.00;SOR=0.823;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,47:47:99:.:2115,0:0,0,25,22 0/0:.:52:30:18:0,30,450 +chrX 1251480 . TATGGGTATATCCAC T 2156.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=31.70;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=44.82;SOR=1.007;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,49:49:99:.:2196,0:0,0,28,21 0/0:.:52:30:18:0,30,450 +chrX 1251499 . ATATACCCATATGGGTATATCCACATAGATATACCCATATGGGTATATCCACATAGATATACCCATATGGG A 2061.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=31.63;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=44.70;SOR=1.022;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,47:47:99:.:2101,0:0,0,27,20 0/0:.:16:30:14:0,30,442 +chrX 1251597 . A G 382 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=9.36;BaseQRankSum=-1.441;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.622;MQ=58.57;MQRankSum=-2.103;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=1.179;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1463 0/1:26,18:44:99:.:412,0,741:13,13,7,11 +chrX 1251839 . T TGATA 449.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=18.81;BaseQRankSum=-1.113;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.458;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1463 0/1:13,13:26:99:.:489,0,507:8,5,7,6 +chrX 1251870 . TAGATAGATAGAC T 95.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=3.00;BaseQRankSum=2.801;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.150;MQ=59.81;MQRankSum=-0.891;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.922;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,24:45:99:.:135,0:9,12,9,15 0/0:.:59:46:59:0,46,1274 +chrX 1252085 . A G 1657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=33.74;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=33.74;SOR=0.859;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:1687,0:0,0,23,27 0/0:.:59:46:59:0,46,1274 +chrX 1252255 . T C 1890 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.68;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.68;SOR=1.342;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:1920,0:0,0,36,21 0/0:.:59:46:59:0,46,1274 +chrX 1253260 . G A 1819 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=30.31;BaseQRankSum=-0.664;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.874;MQ=58.99;MQRankSum=3.166;QD=30.31;ReadPosRankSum=1.278;SOR=0.892;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,60:61:99:.:1849,0:1,0,24,36 0/0:.:59:46:59:0,46,1274 +chrX 1254129 . G A 1796 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.04;BaseQRankSum=-0.32;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.087;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.335;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,56:57:99:.:1826,0:1,0,27,29 0/0:.:59:46:59:0,46,1274 +chrX 1254462 . A G 1860 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=30.48;BaseQRankSum=-0.524;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=30.48;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=0.264;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,61:62:99:.:1890,0:0,1,29,32 0/0:.:59:46:59:0,46,1274 +chrX 1255606 . G T 1547 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=32.85;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.26;QD=32.85;SOR=0.776;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,48:48:99:.:1577,0:0,0,23,25 0/0:.:59:46:59:0,46,1274 +chrX 1256385 . T C 1715 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=31.73;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.02;QD=31.73;SOR=0.804;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:1745,0:0,0,29,26 0/0:.:59:46:59:0,46,1274 +chrX 1256887 . A G 1293 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=30.07;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.07;SOR=0.693;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,44:44:99:.:1323,0:0,0,22,22 0/0:.:53:54:53:0,54,1138 +chrX 1257004 . T C 1833 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=31.58;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.58;SOR=0.871;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1863,0:0,0,27,32 0/0:.:53:54:53:0,54,1138 +chrX 1258071 . A G 2568 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=23.41;BaseQRankSum=0.65;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.99;MQRankSum=-2.001;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.329;SOR=0.746;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1916,0:0,0,36,24 0/1:25,26:51:99:682,0,590:14,11,13,13 +chrX 1258132 . T G 880 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=17.84;BaseQRankSum=0.565;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.418;MQ=57.89;MQRankSum=-2.52;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.266;SOR=1.172;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:22:55:0,22 0/1:27,24:51:99:.:910,0,1023:13,14,9,15 +chrX 1258147 . CGGGG C 874.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.62;BaseQRankSum=1.926;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.049;MQ=57.09;MQRankSum=-2.346;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.973;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:22:55:.:.:0,22 0|1:31,24:55:99:.:0|1:1258147_CGGGG_C:914,0,1229:1258147:15,16,10,14 +chrX 1258151 . G GACAA 832.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.15;BaseQRankSum=-2.259;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.040;MQ=57.03;MQRankSum=-2.438;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.409;SOR=0.890;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:22:55:.:.:0,22 0|1:31,23:54:99:.:0|1:1258147_CGGGG_C:872,0,1232:1258147:15,16,10,13 +chrX 1258154 . C A 842 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.15;BaseQRankSum=2.365;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.040;MQ=57.03;MQRankSum=-2.438;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.328;SOR=0.890;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:22:55:.:.:0,22 0|1:31,23:54:99:.:0|1:1258147_CGGGG_C:872,0,1232:1258147:15,16,10,13 +chrX 1258190 . G A 757 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.12;BaseQRankSum=0.221;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.93;MQRankSum=-2.454;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.34;SOR=0.673;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:22:55:0,22 0/1:29,31:60:99:.:787,0,681:12,17,13,18 +chrX 1258197 . T G 2172 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=38.06;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.79;QD=36.70;SOR=1.071;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:22:55:0,22 1/1:0,60:60:99:.:2202,179,0:0,0,25,35 +chrX 1258264 . A G 698 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=16.93;BaseQRankSum=-1.523;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.171;MQ=57.58;MQRankSum=-2.771;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.481;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:22:55:.:.:0,22 0|1:23,20:43:99:.:0|1:1258264_A_G:728,0,883:1258264:10,13,10,10 +chrX 1258276 . G A 635 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=16.22;BaseQRankSum=-0.527;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.709;MQ=58.75;MQRankSum=-1.978;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.747;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:22:55:.:.:0,22 0|1:23,18:41:99:.:0|1:1258264_A_G:665,0,889:1258264:10,13,10,8 +chrX 1258329 . CAA C 149.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=7.56;BaseQRankSum=0.457;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=12.418;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=3.781;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:22:55:0,22 0/1:17,8:25:99:.:189,0,436:10,7,8,0 +chrX 1259030 . T C 1457 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=30.35;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.16;QD=30.35;SOR=1.112;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:22:55:0,22 1/1:0,49:49:99:.:1487,146,0:0,0,29,20 +chrX 1259365 . C CA 1315.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=26.57;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=26.57;SOR=0.813;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:22:55:0,22 1/1:0,51:51:99:.:1355,153,0:0,0,27,24 +chrX 1259468 . T C 1087 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.96;BaseQRankSum=0.7;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;MQRankSum=-1.061;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.693;SOR=0.770;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:22:55:.:.:0,22 0|1:38,32:70:99:.:0|1:1259468_T_C:1117,0,1386:1259468:15,23,12,20 +chrX 1259489 . C T 1241 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=18.16;BaseQRankSum=-1.691;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.012;MQ=59.70;MQRankSum=-0.916;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.460;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:22:55:.:.:0,22 0|1:33,37:70:99:.:0|1:1259468_T_C:1271,0,1233:1259468:12,21,16,21 +chrX 1259962 . G A 698 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.56;BaseQRankSum=0.12;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.961;MQ=59.42;MQRankSum=0.955;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=0.906;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:22:55:0,22 0/1:34,29:63:99:.:728,0,882:17,17,13,16 +chrX 1260394 . C T 706 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.14;BaseQRankSum=0.627;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.850;MQ=59.54;MQRankSum=-1.402;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.189;SOR=1.402;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:22:55:0,22 0/1:28,28:56:99:.:736,0,715:13,15,9,19 +chrX 1260665 . T C 1163 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=10.37;BaseQRankSum=0.565;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;MQRankSum=1.521;QD=10.37;ReadPosRankSum=2.108;SOR=0.717;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:29,32:61:99:.:.:147,0:.:14,15,15,17 0|1:26,28:54:99:0|1:1260665_T_C:1046,0,1007:1260665:12,14,13,15 +chrX 1260669 . G C 1192 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=10.63;BaseQRankSum=0.978;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;MQRankSum=1.571;QD=10.63;ReadPosRankSum=2.291;SOR=0.720;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,33:61:99:.:.:225,0:.:14,14,16,17 0|1:28,26:54:99:0|1:1260665_T_C:997,0,1097:1260665:12,16,11,15 +chrX 1260673 . C T 1109 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=9.65;BaseQRankSum=1.474;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;MQRankSum=1.518;QD=9.65;ReadPosRankSum=2.381;SOR=0.693;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,33:63:99:.:.:135,0:.:15,15,16,17 0|1:29,26:55:99:0|1:1260665_T_C:1004,0,1119:1260665:13,16,12,14 +chrX 1260698 . G C 937 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.91;BaseQRankSum=2.832;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=59.29;MQRankSum=-0.053;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.16;SOR=0.741;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:55:58:.:.:0,55 0|1:28,26:54:99:.:0|1:1260665_T_C:967,0,951:1260665:13,15,14,12 +chrX 1260946 . C T 617 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.20;BaseQRankSum=1.298;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.093;MQ=58.79;MQRankSum=-0.063;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.2;SOR=0.799;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:55:58:0,55 0/1:25,24:49:99:.:647,0,627:13,12,11,13 +chrX 1261186 . G A 745 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.20;BaseQRankSum=-1.174;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.070;MQ=59.02;MQRankSum=-1.216;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.906;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:55:58:0,55 0/1:22,29:51:99:.:775,0,581:11,11,13,16 +chrX 1261400 . G A 1680 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=14.37;BaseQRankSum=-0.099;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=9.262;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.38;SOR=1.262;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,40:61:99:613,0:10,11,26,14 0/1:20,38:58:99:1097,0,486:9,11,23,15 +chrX 1261599 . C G 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.74;BaseQRankSum=1.767;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.609;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:48:55:0,48 0/1:18,25:43:99:.:720,0,432:6,12,9,16 +chrX 1261641 . TTTTTC T 1181.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=14.36;BaseQRankSum=-0.023;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.57;MQRankSum=-0.611;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.112;SOR=0.616;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,25:43:99:320,0:5,13,8,17 0/1:18,24:42:99:901,0,651:6,12,8,16 +chrX 1261678 . TTTC T 1125.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=13.87;BaseQRankSum=-1.273;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.918;MQ=57.83;MQRankSum=-1.051;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.209;SOR=0.830;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:16,25:41:99:.:.:333,0:.:6,10,8,10 0|1:20,23:43:99:0|1:1261678_TTTC_T:832,0,737:1261678:11,8,6,7 +chrX 1261689 . C T 249 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=8.45;BaseQRankSum=-1.182;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.261;MQ=57.98;MQRankSum=-2.501;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.621;SOR=0.490;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:49:53:.:.:0,49 0|1:20,13:33:99:.:0|1:1261678_TTTC_T:279,0,762:1261678:13,7,6,7 +chrX 1261697 . TTTTTTTTC T 233.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=7.80;BaseQRankSum=-2.021;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=5.284;MQ=58.03;MQRankSum=-2.568;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.532;SOR=0.464;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:49:53:.:.:0,49 0|1:22,13:35:99:.:0|1:1261678_TTTC_T:273,0,816:1261678:14,7,6,7 +chrX 1262049 . T C 667 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.84;BaseQRankSum=-0.543;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.192;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.474;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:49:53:0,49 0/1:17,27:44:99:.:697,0,418:7,10,13,14 +chrX 1262130 . C G 529 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.89;BaseQRankSum=-0.259;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.500;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.417;SOR=1.091;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:49:53:0,49 0/1:26,21:47:99:.:559,0,732:15,11,14,7 +chrX 1262191 . C A 738 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.36;BaseQRankSum=1.487;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.290;MQ=55.83;MQRankSum=-0.637;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.265;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:49:53:0,49 0/1:23,27:50:99:.:768,0,584:17,6,16,11 +chrX 1262274 . A G 2168 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=20.54;BaseQRankSum=-0.93;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=5.977;MQ=51.66;MQRankSum=-4.166;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.956;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,29:54:99:211,0:11,14,19,10 1/1:0,53:53:99:1987,159,0:0,0,29,24 +chrX 1262296 . C G 1459 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=13.54;BaseQRankSum=0.402;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=7.462;MQ=52.13;MQRankSum=-3.019;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=1.109;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,35:59:99:.:.:475,0:.:12,12,19,16 0|1:23,28:51:99:0|1:1262296_C_G:1014,0,800:1262296:10,13,19,9 +chrX 1262303 . A G 4286 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=30.98;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.27;QD=39.24;SOR=0.846;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2373,0:0,0,30,30 1/1:0,50:50:99:1943,150,0:0,0,29,21 +chrX 1262315 . G A 1112 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=10.48;BaseQRankSum=1.499;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=5.976;MQ=53.80;MQRankSum=-2.59;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.475;SOR=0.953;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,32:60:99:.:.:226,0:.:12,16,15,17 0|1:24,25:49:99:0|1:1262296_C_G:916,0,829:1262296:12,12,18,7 +chrX 1262402 . A C 774 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=7.31;BaseQRankSum=0.417;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.547;MQ=59.40;MQRankSum=-1.235;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.11;SOR=0.907;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,36:64:99:252,0:12,16,14,22 0/1:25,21:46:99:552,0,671:12,13,9,12 +chrX 1262723 . G A 1307 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=17.14;BaseQRankSum=2.264;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=19.253;MQ=57.98;MQRankSum=3.608;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.420;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:14,33:47:99:696,0:3,11,19,14 0/1:9,22:31:99:641,0,190:2,7,11,11 +chrX 1262937 . C T 1198 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=11.58;BaseQRankSum=0.332;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.628;MQ=58.48;MQRankSum=0.611;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.992;SOR=0.498;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,31:49:99:362,0:14,4,16,15 0/1:24,33:57:99:866,0,572:12,12,20,13 +chrX 1262988 . TA T 467.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=-0.377;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.192;MQ=58.75;MQRankSum=0;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.428;SOR=0.446;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:79:99:79:0,343 0/1:19,24:43:99:.:507,0,376:11,8,12,12 +chrX 1263241 . A C 3840 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.21;BaseQRankSum=-1.719;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.006;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.283;SOR=0.841;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2889,0:.:0,0,30,35 0|1:33,26:59:99:0|1:1263241_A_C:981,0,1306:1263241:18,15,10,16 +chrX 1263242 . A C 3840 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.21;BaseQRankSum=-1.741;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=5.006;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.841;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2889,0:.:0,0,30,35 0|1:33,26:59:99:0|1:1263241_A_C:981,0,1306:1263241:18,15,10,16 +chrX 1263352 . G A 3866 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=33.59;BaseQRankSum=4.069;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.086;MQ=59.92;MQRankSum=-0.091;QD=33.59;ReadPosRankSum=0.615;SOR=0.306;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,61:62:99:2080,0:0,1,29,32 1/1:0,54:54:99:1816,162,0:0,0,30,24 +chrX 1263391 . T C 2892 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=23.01;BaseQRankSum=0.186;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.697;MQ=59.80;MQRankSum=0.934;QD=23.01;ReadPosRankSum=1.855;SOR=0.461;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2291,0:0,0,36,35 0/1:31,25:56:99:631,0,850:19,12,16,9 +chrX 1263485 . T C 1232 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=17.05;BaseQRankSum=0.257;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.888;MQ=59.18;MQRankSum=-0.208;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.549;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:99:72:.:.:0,1800 0|1:41,33:74:99:.:0|1:1263485_T_C:1262,0,1606:1263485:17,24,15,18 +chrX 1263494 . C G 1310 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.18;BaseQRankSum=0.245;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.21;MQRankSum=-0.197;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.634;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:99:72:.:.:0,1800 0|1:43,35:78:99:.:0|1:1263485_T_C:1340,0,1684:1263485:19,24,16,19 +chrX 1263497 . A G 2831 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=33.35;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.22;QD=37.16;SOR=0.948;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:99:72:.:.:0,1800 1|1:0,77:77:99:.:0|1:1263485_T_C:2861,231,0:1263485:0,0,34,43 +chrX 1263504 . C T 1397 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=17.84;BaseQRankSum=0.671;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=0.850;MQ=59.19;MQRankSum=-0.551;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.29;SOR=0.534;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:99:72:.:.:0,1800 0|1:42,38:80:99:.:0|1:1263485_T_C:1427,0,1610:1263485:18,24,18,20 +chrX 1263669 . C T 1026 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=16.25;BaseQRankSum=0.793;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.960;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.706;SOR=0.507;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1800 0/1:27,38:65:99:.:1056,0,658:15,12,19,19 +chrX 1263793 . T A 2881 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=29.05;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.78;SOR=1.341;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,65:65:99:.:2911,0:0,0,24,41 0/0:.:18:21:10:0,21,315 +chrX 1263800 . A G 2965 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=29.24;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=44.04;SOR=1.352;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,68:68:99:.:2995,0:0,0,25,43 0/0:.:18:21:10:0,21,315 +chrX 1265049 . A G 1236 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=10.82;BaseQRankSum=1.372;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.712;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.307;SOR=0.808;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,32:61:99:149,0:14,15,9,23 0/1:17,39:56:99:1117,0,403:6,11,20,19 +chrX 1265563 . G A 415 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.83;BaseQRankSum=-1.263;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.155;MQ=54.04;MQRankSum=-1.851;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.518;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,809 0/1:13,17:30:99:.:445,0,337:5,8,9,8 +chrX 1265626 . C T 76 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=3.03;BaseQRankSum=0;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.69;MQRankSum=-0.245;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.922;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,19:35:99:.:106,0:4,12,4,15 0/0:.:48:56:48:0,56,775 +chrX 1265774 . G T 783 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.52;BaseQRankSum=0.994;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=1.037;MQ=54.25;MQRankSum=-4.868;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.957;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:76:99:76:0,279 0/1:26,30:56:99:.:813,0,640:14,12,18,12 +chrX 1266742 . A G 670 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=10.45;BaseQRankSum=-0.423;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.781;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,190 0/1:39,28:67:99:.:700,0,1073:20,19,15,13 +chrX 1266775 . C T 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.34;BaseQRankSum=2.138;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.579;SOR=0.693;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,190 0/1:43,25:68:99:.:635,0,1080:19,24,11,14 +chrX 1266882 . GGT G 453.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.64;BaseQRankSum=0.814;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.329;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.436;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,190 0/1:23,16:39:99:.:493,0,750:7,16,6,10 +chrX 1267524 . C T 622 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=6.39;BaseQRankSum=2.071;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=6.303;MQ=54.85;MQRankSum=1.376;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.445;SOR=0.808;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,37:60:99:241,0:9,14,23,14 0/1:26,16:42:99:411,0,697:12,14,7,9 +chrX 1267868 . C T 874 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=8.22;BaseQRankSum=2.756;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.45;MQRankSum=-0.492;QD=8.22;ReadPosRankSum=2.181;SOR=0.765;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,28:55:99:165,0:16,11,13,15 0/1:27,28:55:99:739,0,693:11,16,14,14 +chrX 1267935 . C T 539 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.61;BaseQRankSum=0.219;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=58.03;MQRankSum=-0.843;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.65;SOR=0.957;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,115 0/1:25,24:49:99:.:569,0,608:13,12,14,10 +chrX 1268043 . C T 946 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.77;BaseQRankSum=1.097;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.111;MQ=53.22;MQRankSum=-0.654;QD=18.77;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.996;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,115 0|1:25,27:52:99:.:0|1:1268043_C_T:976,0,845:1268043:10,15,9,18 +chrX 1268066 . ATG A 751.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.20;BaseQRankSum=-0.739;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.512;MQ=50.24;MQRankSum=0.262;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.707;SOR=1.127;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,115 0|1:25,21:46:99:.:0|1:1268043_C_T:791,0,898:1268043:12,13,8,13 +chrX 1268129 . G A 559 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.70;BaseQRankSum=-0.315;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.623;MQ=49.57;MQRankSum=0.528;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.839;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,115 0/1:20,23:43:99:.:589,0,506:11,9,10,13 +chrX 1268463 . ATG A 2142.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=28.36;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=41.17;SOR=0.730;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:2182,0:0,0,27,26 0/0:.:41:99:41:0,105,1210 +chrX 1268792 . C G 219 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=3.77;BaseQRankSum=-0.848;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.460;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.84;SOR=0.345;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,37:66:99:.:249,0:10,19,17,20 0/0:.:46:25:46:0,25,1191 +chrX 1268954 . C G 2931 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=23.31;BaseQRankSum=0.755;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.787;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.31;ReadPosRankSum=-2.014;SOR=0.420;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2028,0:0,0,30,34 0/1:29,34:63:99:933,0,719:17,12,19,15 +chrX 1269339 . G A 726 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=6.69;BaseQRankSum=0.794;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=8.771;MQ=59.76;MQRankSum=0.936;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.59;SOR=0.989;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,28:55:87:87,0:12,15,13,15 0/1:32,26:58:99:669,0,903:21,11,9,17 +chrX 1269384 . A G 1019 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=9.12;BaseQRankSum=1.336;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=18.115;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.79;SOR=1.204;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,30:53:99:249,0:10,13,11,19 0/1:32,30:62:99:800,0,836:23,9,11,19 +chrX 1269413 . C G 661 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.34;BaseQRankSum=2.43;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=12.339;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.519;SOR=0.861;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:56:62:0,56 0/1:31,25:56:99:.:691,0,804:21,10,10,15 +chrX 1269509 . C G 2658 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=24.00;BaseQRankSum=-0.82;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.836;MQ=59.97;MQRankSum=0.904;QD=24.00;ReadPosRankSum=0.926;SOR=0.562;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2174,0:0,0,29,36 0/1:27,20:47:99:514,0,767:11,16,9,11 +chrX 1269591 . C T 551 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.39;BaseQRankSum=0.12;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=7.920;MQ=59.36;MQRankSum=1.375;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=0.184;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:34:44:0,34 0/1:27,24:51:99:.:581,0,623:8,19,12,12 +chrX 1269630 . AG A 815.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.10;BaseQRankSum=-0.592;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.50;MQRankSum=-0.115;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.06;SOR=0.592;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:34:44:.:.:0,34 0|1:27,23:50:99:.:0|1:1269630_AG_A:855,0,1022:1269630:11,16,10,13 +chrX 1269642 . A G 861 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=18.56;BaseQRankSum=-0.577;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=-1.001;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.711;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:49:45:.:.:0,49 0|1:25,23:48:99:.:0|1:1269630_AG_A:891,0,975:1269630:11,14,10,13 +chrX 1269646 . AGAGAT A 848.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=18.12;BaseQRankSum=-0.271;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.100;MQ=59.89;MQRankSum=-1.022;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.165;SOR=0.963;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:49:45:.:.:0,49 0|1:26,23:49:99:.:0|1:1269630_AG_A:888,0,1012:1269630:13,13,10,13 +chrX 1269649 . G A,* 903 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=25,0;AS_QD=34.56,0.00;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.75;QD=34.56;SOR=0.737;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,25,0:27:99:.:.:933,0,946:.:0,0,12,10 0|2:26,0,23:49:99:0|1:1269630_AG_A:888,966,2047,0,1081,1012:1269630:13,13,10,13 +chrX 1269651 . T A,* 948 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=25,0;AS_QD=32.45,0.00;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.75;QD=37.62;SOR=0.737;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,25,0:26:99:.:.:978,0,969:.:0,0,12,10 0|2:26,0,23:49:99:0|1:1269630_AG_A:888,966,2047,0,1081,1012:1269630:13,13,10,13 +chrX 1270168 . A C,T 2853 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=75,20;AS_QD=20.80,8.18;BaseQRankSum=1.275;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=2.462;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.36;ReadPosRankSum=1.812;SOR=0.973;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75,0:75:99:2392,0,2392:0,0,27,48 0/2:40,0,20:60:99:491,610,1781,0,1171,1111:18,22,10,10 +chrX 1270243 . T TA 440.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=8.89;BaseQRankSum=0.408;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=6.042;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.82;SOR=1.301;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1800 0/1:37,17:54:99:.:480,0,1269:17,20,11,6 +chrX 1270357 . G T 3327 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=25.82;BaseQRankSum=-0.791;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=6.499;MQ=59.93;MQRankSum=-1.018;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.625;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:2236,0:.:0,0,39,30 0|1:32,29:61:99:0|1:1270357_G_T:1121,0,1245:1270357:13,19,14,15 +chrX 1270360 . C T 1094 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=18.73;BaseQRankSum=-0.434;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.994;MQ=59.84;MQRankSum=-1.001;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.215;SOR=0.481;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1800 0|1:31,29:60:99:.:0|1:1270357_G_T:1124,0,1214:1270357:13,18,14,15 +chrX 1270364 . C T 1055 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=18.71;BaseQRankSum=-1.036;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.473;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1800 0|1:30,28:58:99:.:0|1:1270357_G_T:1085,0,1175:1270357:13,17,14,14 +chrX 1270447 . C T 757 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.12;BaseQRankSum=-0.253;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.960;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.569;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1800 0/1:29,31:60:99:.:787,0,723:16,13,16,15 +chrX 1270478 . A G 3351 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=28.65;BaseQRankSum=-0.381;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.722;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.65;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.473;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2401,0:.:0,0,32,30 0|1:30,26:56:99:0|1:1270478_A_G:980,0,1160:1270478:17,13,12,14 +chrX 1270485 . T G 74 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=1.63;BaseQRankSum=-0.267;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.100;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.63;ReadPosRankSum=-1.332;SOR=0.851;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,34:64:99:.:104,0:14,16,19,15 0/0:.:55:99:55:0,120,1800 +chrX 1270489 . C T 3279 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=27.81;BaseQRankSum=0.341;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.674;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.81;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.502;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2399,0:.:0,0,32,31 0|1:32,24:56:99:0|1:1270478_A_G:910,0,1218:1270478:18,14,12,12 +chrX 1270579 . T C 1825 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=19.53;BaseQRankSum=-2.117;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=15.788;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.53;ReadPosRankSum=-1.502;SOR=0.904;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1503,0:0,0,19,28 0/1:30,18:48:99:352,0,845:20,10,7,11 +chrX 1270639 . C T 38 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=1.26;BaseQRankSum=1.675;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=2.386;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.311;SOR=1.219;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,27:54:68:.:68,0:12,15,9,18 0/0:.:48:88:48:0,88,1375 +chrX 1270642 . T C 121 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=2.75;BaseQRankSum=-0.049;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=5.541;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.152;SOR=1.461;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,29:55:99:.:151,0:12,14,9,20 0/0:.:48:88:48:0,88,1375 +chrX 1270685 . A G 2155 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=23.49;BaseQRankSum=-0.853;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.138;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.49;ReadPosRankSum=0.081;SOR=1.103;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1650,0:0,0,24,29 0/1:20,20:40:99:535,0,555:10,10,6,14 +chrX 1270752 . T A 257 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=6.67;BaseQRankSum=1.318;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.154;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=1.480;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,115 0/1:31,12:43:99:.:287,0,908:13,18,3,9 +chrX 1270857 . G T 1443 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=16.93;BaseQRankSum=1.313;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.58;MQRankSum=0;QD=16.93;ReadPosRankSum=0;SOR=0.749;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1428,0:0,0,19,25 0/1:38,5:43:45:45,0,1058:16,22,1,4 +chrX 1270898 . G A 384 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.18;BaseQRankSum=3.127;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=1.445;MQ=56.72;MQRankSum=3.606;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.984;SOR=0.358;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:12,22:34:99:.:414,0:4,8,10,12 0/0:.:35:39:27:0,39,829 +chrX 1271158 . C G 573 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.31;BaseQRankSum=-0.814;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;MQRankSum=-1.429;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.37;SOR=0.641;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,296 0/1:25,24:49:99:.:603,0,682:18,7,17,7 +chrX 1271188 . C T 549 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.24;BaseQRankSum=1.792;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.342;MQ=59.01;MQRankSum=-1.555;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.446;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:99:58:.:.:0,296 0|1:21,17:38:99:.:0|1:1271188_C_T:579,0,810:1271188:15,6,11,6 +chrX 1271197 . G T 507 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=10.53;BaseQRankSum=-0.936;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.625;MQ=59.47;MQRankSum=0.784;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.399;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,37:51:99:.:537,0:9,5,20,17 0/0:.:33:84:33:0,84,948 +chrX 1271210 . G T 366 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=1.579;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.79;MQRankSum=-1.985;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.495;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:22,11:33:99:.:0|1:1271188_C_T:396,0,891:1271188:15,7,7,4 +chrX 1271213 . AG A 353.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=11.56;BaseQRankSum=1.377;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.83;MQRankSum=-2.031;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.449;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:23,11:34:99:.:0|1:1271188_C_T:393,0,933:1271188:16,7,7,4 +chrX 1271218 . C T 360 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=11.14;BaseQRankSum=2.049;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.37;MQRankSum=-1.317;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.055;SOR=0.541;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:24,11:35:99:.:0|1:1271188_C_T:390,0,975:1271188:16,8,7,4 +chrX 1271221 . G A 363 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=11.56;BaseQRankSum=1.119;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.33;MQRankSum=-1.272;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.593;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:23,11:34:99:.:0|1:1271188_C_T:393,0,933:1271188:15,8,7,4 +chrX 1271227 . T C 273 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=8.91;BaseQRankSum=1.493;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.33;MQRankSum=-1.586;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.202;SOR=0.895;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:25,9:34:99:.:0|1:1271188_C_T:303,0,1023:1271188:15,10,6,3 +chrX 1271228 . G A 273 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=8.91;BaseQRankSum=0;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.33;MQRankSum=-1.586;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.895;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:25,9:34:99:.:0|1:1271188_C_T:303,0,1023:1271188:15,10,6,3 +chrX 1271234 . C T 270 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=8.57;BaseQRankSum=1.442;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=1.478;MQ=58.10;MQRankSum=-0.868;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.996;SOR=1.002;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:26,9:35:99:.:0|1:1271188_C_T:300,0,1065:1271188:15,11,6,3 +chrX 1271244 . G A 267 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=8.25;BaseQRankSum=1.389;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.67;MQRankSum=-0.591;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.3;SOR=0.927;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:27,9:36:99:.:0|1:1271188_C_T:297,0,1107:1271188:16,11,6,3 +chrX 1271250 . T C 144 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=5.44;BaseQRankSum=0.896;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.38;MQRankSum=-1.099;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.256;SOR=0.446;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:26,6:32:99:.:0|1:1271188_C_T:174,0,1074:1271188:15,11,3,3 +chrX 1271272 . C A 111 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=5.04;BaseQRankSum=-0.052;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.10;MQRankSum=-1.212;QD=5.04;ReadPosRankSum=-2.37;SOR=0.741;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:40:99:40:.:.:0,712 0|1:23,5:28:99:.:0|1:1271188_C_T:141,0,951:1271188:13,10,3,2 +chrX 1271332 . AT A 152.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=19.20;DP=46;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.32;QD=19.20;SOR=1.609;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,10:10:99:.:192,0:0,0,3,7 0/0:.:20:0:20:0,0,337 +chrX 1271409 . C T 655 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=34.25;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.21;QD=34.25;SOR=1.127;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:685,0:0,0,8,12 0/0:.:47:99:47:0,120,1800 +chrX 1271526 . A AT 469.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=9.43;BaseQRankSum=-0.404;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=5.681;MQ=59.48;MQRankSum=-1.441;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.497;SOR=1.202;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,32:54:99:.:509,0:10,12,20,12 0/0:.:61:74:61:0,74,1563 +chrX 1271542 . T C 639 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=11.53;BaseQRankSum=1.409;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.056;MQ=59.48;MQRankSum=-1.357;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.281;SOR=0.916;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,36:58:99:.:669,0:13,9,23,13 0/0:.:61:74:61:0,74,1563 +chrX 1271547 . T C 692 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=12.45;BaseQRankSum=-0.953;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.062;MQ=59.44;MQRankSum=-1.307;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.704;SOR=0.547;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,37:58:99:.:722,0:14,7,23,14 0/0:.:61:74:61:0,74,1563 +chrX 1271577 . T C 1831 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=13.39;BaseQRankSum=0.52;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;MQRankSum=0.986;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=0.639;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,49:74:99:1069,0:17,8,28,21 0/1:34,31:65:99:792,0,897:20,14,21,10 +chrX 1271578 . G A 1039 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=14.45;BaseQRankSum=-0.201;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=3.433;MQ=59.56;MQRankSum=-1.444;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.361;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,49:74:99:.:1069,0:17,8,28,21 0/0:.:69:99:69:0,107,1800 +chrX 1271796 . C T 482 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=7.01;BaseQRankSum=-0.342;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.863;SOR=0.674;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,44:73:99:.:512,0:13,16,20,24 0/0:.:69:99:69:0,107,1800 +chrX 1271812 . C T 851 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.15;BaseQRankSum=2.833;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=4.916;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.603;SOR=1.390;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1482 0/1:35,32:67:99:.:881,0,875:17,18,11,21 +chrX 1272089 . G T 1225 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=20.57;BaseQRankSum=-0.573;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.133;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.57;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.910;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1482 0|1:29,32:61:99:.:0|1:1272089_G_T:1255,0,1109:1272089:14,15,18,14 +chrX 1272097 . G A 1219 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=19.83;BaseQRankSum=-0.098;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.433;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=0.832;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1482 0|1:31,32:63:99:.:0|1:1272089_G_T:1249,0,1163:1272089:14,17,18,14 +chrX 1272146 . G A 505 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.73;BaseQRankSum=1.099;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.075;MQ=59.71;MQRankSum=0.823;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.936;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1482 0/1:34,21:55:99:.:535,0,912:15,19,8,13 +chrX 1272185 . C T 1122 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=10.02;BaseQRankSum=2.669;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.140;MQ=59.82;MQRankSum=0.765;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.478;SOR=0.770;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,40:60:99:655,0:7,13,23,17 0/1:36,19:55:99:497,0,932:17,19,10,9 +chrX 1272355 . G GA 644.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=7.52;BaseQRankSum=0.978;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=6.875;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.243;SOR=1.400;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,27:50:99:135,0:11,12,9,18 0/1:22,19:41:99:549,0,655:11,11,7,12 +chrX 1272381 . C A,CA 359 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=3,37;AS_QD=0.00,4.80;BaseQRankSum=-0.098;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=18.519;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=2.173;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:20,3,22:45:99:107,854,0:12,8,5,20 0/2:24,0,15:39:99:282,354,948,0,594,549:11,13,5,10 +chrX 1272452 . C A 623 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=6.34;BaseQRankSum=3.082;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.736;MQ=59.93;MQRankSum=0.983;QD=6.34;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.818;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,26:55:17:17,0:17,12,12,14 0/1:25,23:48:99:636,0,630:10,15,11,12 +chrX 1272474 . CTTTAT C 3080.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.52;BaseQRankSum=0.95;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.134;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=31.52;ReadPosRankSum=1.072;SOR=1.091;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:2258,0:0,0,29,23 0/1:24,23:47:99:862,0,914:12,12,15,8 +chrX 1272801 . CT C 632.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.61;BaseQRankSum=0.676;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=6.348;MQ=59.62;MQRankSum=-1.751;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.324;SOR=1.439;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,126 0|1:28,18:46:99:.:0|1:1272801_CT_C:672,0,1121:1272801:15,13,6,12 +chrX 1272815 . T C 968 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=18.15;BaseQRankSum=-1.847;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.783;MQ=59.63;MQRankSum=-1.481;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.141;SOR=1.184;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,126 0|1:29,26:55:99:.:0|1:1272801_CT_C:998,0,1131:1272801:15,14,10,16 +chrX 1272825 . CTT C 970.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.56;BaseQRankSum=0.833;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.155;MQ=59.67;MQRankSum=-1.577;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.840;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,126 0|1:34,27:61:99:.:0|1:1272801_CT_C:1010,0,1244:1272801:18,16,12,15 +chrX 1272853 . T C 565 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.23;BaseQRankSum=-2.128;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=59.93;MQRankSum=-1.021;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.845;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,126 0/1:28,25:53:99:.:595,0,774:13,15,14,11 +chrX 1272905 . A G 449 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.39;BaseQRankSum=-0.537;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.388;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.869;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,126 0/1:28,23:51:99:.:479,0,643:13,15,13,10 +chrX 1273039 . C T 303 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=6.40;BaseQRankSum=-0.763;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.47;MQRankSum=-1.147;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.737;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,31:52:99:.:333,0:12,9,18,13 0/0:.:52:35:48:0,35,1270 +chrX 1273125 . CT C 602.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.46;BaseQRankSum=-1.618;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.209;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.242;SOR=1.022;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,158 0/1:30,26:56:99:.:642,0,761:15,15,11,15 +chrX 1273451 . G A 1578 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=11.24;BaseQRankSum=2.174;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.616;MQ=59.86;MQRankSum=1.115;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.187;SOR=0.774;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:33,39:72:99:.:.:244,0:.:13,20,20,19 0|1:35,36:71:99:0|1:1273451_G_A:1364,0,1310:1273451:21,14,19,17 +chrX 1273464 . G A 1580 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=12.11;BaseQRankSum=0.617;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=2.189;MQ=59.85;MQRankSum=1.16;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.65;SOR=0.788;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:29,37:66:99:.:.:293,0:.:10,19,20,17 0|1:33,34:67:99:0|1:1273451_G_A:1317,0,1262:1273451:20,13,18,16 +chrX 1273747 . AT A 179.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=5.62;BaseQRankSum=0.459;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=2.886;MQ=58.84;MQRankSum=0.276;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.083;SOR=1.021;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,391 0/1:24,15:39:99:.:219,0,897:11,13,9,6 +chrX 1273753 . T TG 1148.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=13.05;BaseQRankSum=-1.401;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.715;MQ=58.62;MQRankSum=0.948;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.487;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:18,25:43:99:.:.:308,0:.:7,11,12,13 0|1:25,23:48:99:0|1:1273753_T_TG:880,0,944:1273753:11,14,11,12 +chrX 1273759 . T G 1278 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=14.70;BaseQRankSum=-0.611;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.733;MQ=58.58;MQRankSum=1.102;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.151;SOR=0.568;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:16,26:42:99:.:.:414,0:.:7,9,13,13 0|1:24,23:47:99:0|1:1273753_T_TG:894,0,915:1273753:11,13,12,11 +chrX 1273767 . A T 1293 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=15.75;BaseQRankSum=3.721;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=4.109;MQ=58.76;MQRankSum=1.054;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.629;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:15,23:38:99:.:.:381,0:.:6,9,12,11 0|1:22,24:46:99:0|1:1273753_T_TG:942,0,852:1273753:10,12,13,11 +chrX 1273770 . T TG 1279.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=15.52;BaseQRankSum=-0.59;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=4.156;MQ=58.61;MQRankSum=1.054;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.601;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:15,23:38:99:.:.:381,0:.:6,9,12,11 0|1:23,24:47:99:0|1:1273753_T_TG:938,0,876:1273753:10,13,13,11 +chrX 1273829 . G A 2028 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=24.80;BaseQRankSum=-1.079;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=10.874;MQ=59.51;MQRankSum=-1.439;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.229;SOR=1.042;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1276,0:0,0,23,15 0/1:15,30:45:99:782,0,367:5,10,19,11 +chrX 1273858 . G A 861 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=10.48;BaseQRankSum=0.919;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=5.706;MQ=59.57;MQRankSum=0;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.342;SOR=1.241;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,23:43:99:109,0:12,8,15,8 0/1:15,27:42:99:782,0,395:5,10,16,11 +chrX 1273923 . T G 673 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.52;BaseQRankSum=-0.483;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.693;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:34:44:0,34 0/1:26,26:52:99:.:703,0,728:17,9,17,9 +chrX 1274563 . G A 627 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.73;BaseQRankSum=-1.015;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=18.458;MQ=55.72;MQRankSum=-2.31;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.213;SOR=3.258;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:618,0:0,0,2,14 0/1:34,6:40:39:39,0,992:14,20,0,6 +chrX 1274598 . T G 147 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=2.77;BaseQRankSum=1.115;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=41.975;MQ=56.80;MQRankSum=-1.573;QD=2.77;ReadPosRankSum=2.31;SOR=5.548;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:8,10:18:90:.:.:90,0:.:7,1,0,10 0|1:41,5:46:87:0|1:1274598_T_G:87,0,1706:1274598:20,21,0,5 +chrX 1274600 . T C 99 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=1.95;BaseQRankSum=-1.012;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=41.974;MQ=58.13;MQRankSum=-1.671;QD=1.95;ReadPosRankSum=2.044;SOR=5.548;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:9,10:19:45:.:.:45,0:.:7,2,0,10 0|1:42,5:47:84:0|1:1274598_T_G:84,0,1749:1274598:21,21,0,5 +chrX 1274601 . A G 96 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=1.88;BaseQRankSum=1.611;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=41.116;MQ=58.16;MQRankSum=-1.671;QD=1.88;ReadPosRankSum=2.166;SOR=5.548;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:9,10:19:45:.:.:45,0:.:7,2,0,10 0|1:43,5:48:81:0|1:1274598_T_G:81,0,1791:1274598:21,22,0,5 +chrX 1274605 . G T 96 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=1.88;BaseQRankSum=1.442;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=41.116;MQ=58.20;MQRankSum=-1.671;QD=1.88;ReadPosRankSum=1.022;SOR=5.548;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:9,10:19:45:.:.:45,0:.:7,2,0,10 0|1:43,5:48:81:0|1:1274598_T_G:81,0,1791:1274598:21,22,0,5 +chrX 1274611 . C T 38 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=5;AS_QD=1.31;BaseQRankSum=1.262;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=12.662;MQ=59.25;MQRankSum=-3.001;QD=1.31;ReadPosRankSum=-2.022;SOR=3.609;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:40:.:40:.:.:0,0 0|1:47,5:52:68:.:0|1:1274598_T_G:68,0,1958:1274598:24,23,0,5 +chrX 1274906 . A G 2355 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=22.29;BaseQRankSum=-0.894;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=0.765;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1602,0:0,0,24,28 0/1:25,30:55:99:783,0,649:12,13,14,16 +chrX 1275486 . G A 970 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.38;BaseQRankSum=-0.645;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=8.592;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.065;SOR=0.405;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,486 0/1:27,38:65:99:.:1000,0,683:9,18,20,18 +chrX 1275607 . G A 2952 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=27.87;BaseQRankSum=1.251;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=8.615;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.87;ReadPosRankSum=-1.141;SOR=0.203;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47:47:99:.:.:1794,0:.:0,0,36,11 0|1:28,32:60:99:0|1:1275607_G_A:1188,0,1027:1275607:24,4,20,12 +chrX 1275627 . C T 1210 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=20.33;BaseQRankSum=1.025;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.502;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.71;SOR=0.365;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:43:47:.:.:0,43 0|1:28,33:61:99:.:0|1:1275607_G_A:1240,0,1024:1275607:22,6,23,10 +chrX 1276169 . TTTTG T 2654.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.07;BaseQRankSum=-0.078;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=3.434;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=32.07;ReadPosRankSum=0.8;SOR=0.669;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1961,0:0,0,23,21 0/1:21,19:40:99:733,0,801:12,9,6,13 +chrX 1276360 . ATATTTATT A,ATATTTATTTATTTATT 1921.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=27,47;AS_QD=25.02,29.71;BaseQRankSum=1.187;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=21.09;ReadPosRankSum=-1.271;SOR=0.602;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,27,28:55:95:1246,95,0:0,0,28,27 0/2:19,0,19:38:99:715,773,1550,0,776,719:9,10,9,10 +chrX 1277118 . T TA 375.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=7.83;BaseQRankSum=0.645;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.083;MQ=59.90;MQRankSum=1.273;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.6;SOR=0.465;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,32:53:99:.:415,0:9,12,16,16 0/0:.:38:21:35:0,21,988 +chrX 1277593 . C CAA 408.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.45;BaseQRankSum=0.054;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=14.233;MQ=59.08;MQRankSum=0.255;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.581;SOR=2.233;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:56:45:0,56 0/1:9,22:31:99:.:448,0,164:6,3,5,17 +chrX 1277693 . G A 903 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.05;BaseQRankSum=-0.632;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.979;MQ=59.45;MQRankSum=0.233;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=0.527;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:56:45:0,56 0/1:26,36:62:99:.:933,0,632:15,11,19,17 +chrX 1277956 . A G 253 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=7.86;BaseQRankSum=0.162;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.30;MQRankSum=-0.741;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.874;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,22:36:99:.:283,0:7,7,12,10 0/0:.:51:46:51:0,46,1023 +chrX 1277976 . C CA 148.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=7.83;BaseQRankSum=-0.644;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=3.834;MQ=58.89;MQRankSum=0;QD=7.83;ReadPosRankSum=0;SOR=1.336;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:85:99:85:0,660 0/1:12,12:24:99:.:188,0,202:7,5,4,8 +chrX 1278179 . C T 554 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.43;BaseQRankSum=-0.5;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=6.054;MQ=58.39;MQRankSum=0.418;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.555;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:85:99:85:0,660 0/1:25,22:47:99:.:584,0,683:16,9,10,12 +chrX 1278355 . C T 1315 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=14.78;BaseQRankSum=1.013;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=11.930;MQ=58.99;MQRankSum=-1.674;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.756;SOR=1.126;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,66:91:99:.:1345,0:15,10,25,41 0/0:.:61:40:61:0,40,1310 +chrX 1278412 . T C 669 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=8.74;BaseQRankSum=-0.697;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=9.999;MQ=55.30;MQRankSum=-2.414;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.766;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,52:80:99:.:699,0:18,10,22,30 0/0:.:61:40:61:0,40,1310 +chrX 1278481 . T G 408 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=7.82;BaseQRankSum=-0.758;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.325;MQ=49.09;MQRankSum=-5.415;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=1.061;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,36:56:99:.:438,0:10,10,15,21 0/0:.:61:40:61:0,40,1310 +chrX 1278698 . A T 2258 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=30.11;BaseQRankSum=1.987;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.367;MQ=58.70;MQRankSum=-0.208;QD=30.11;ReadPosRankSum=-0.96;SOR=0.525;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:633,0:0,0,11,9 1/1:1,55:56:99:1655,157,0:1,0,23,32 +chrX 1278883 . C T 516 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.93;BaseQRankSum=2.344;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.053;MQ=58.95;MQRankSum=1.635;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.685;SOR=0.688;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:54:28:0,54 0/1:34,21:55:99:.:546,0,857:18,16,10,11 +chrX 1278985 . C T 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.52;BaseQRankSum=2.197;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.414;MQ=59.85;MQRankSum=-1.225;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.399;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:54:28:0,54 0/1:32,20:52:99:.:495,0,775:13,19,10,10 +chrX 1279130 . T C 2876 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=22.70;BaseQRankSum=3.644;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.763;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=22.70;ReadPosRankSum=1.493;SOR=0.843;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1954,0:0,0,37,24 0/1:33,34:67:99:952,0,750:18,15,18,16 +chrX 1279350 . AAAT A 1260.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=20.00;BaseQRankSum=1.317;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.00;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.735;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,506 0/1:31,34:65:99:.:1300,0,1172:14,17,15,19 +chrX 1279365 . T A,TTAA 73 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=24,0;AS_QD=2.15,0.00;BaseQRankSum=-1.033;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.693;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,24,0:48:99:.:103,0,1519:11,13,11,13 0/0:.:62:99:62:0,102,1254,102,1254,1254 +chrX 1279758 . C T 904 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=15.31;BaseQRankSum=0.988;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.213;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.426;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,357 0/1:26,35:61:99:.:934,0,591:9,17,15,20 +chrX 1279777 . GTT G 1209.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=22.71;BaseQRankSum=0.399;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.815;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,357 0|1:23,32:55:99:.:0|1:1279777_GTT_G:1249,0,835:1279777:10,13,13,19 +chrX 1279801 . T C 1243 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=21.95;BaseQRankSum=-0.988;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.698;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.949;SOR=0.883;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:71:59:.:.:0,71 0|1:25,33:58:99:.:0|1:1279777_GTT_G:1273,0,888:1279777:14,11,14,19 +chrX 1280488 . A G,AAAG 1963 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=42,3;AS_QD=34.96,17.39;BaseQRankSum=0.027;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.158;MQ=58.87;MQRankSum=0.283;QD=33.22;ReadPosRankSum=1.445;SOR=0.428;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23,1:24:99:1252,0,1123:0,0,11,13 0/1:15,19,2:36:99:741,0,464,557,394,1236:6,9,11,10 +chrX 1280546 . G A 2052 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=21.69;BaseQRankSum=0.206;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=4.375;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.22;SOR=1.198;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1434,0:0,0,29,15 0/1:27,25:52:99:648,0,706:14,13,14,11 +chrX 1280794 . A G 358 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.52;BaseQRankSum=-0.331;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=5.449;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.621;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:41:99:41:0,450 0/1:15,16:31:99:.:388,0,379:5,10,9,7 +chrX 1280853 . T TCTC 415.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=18.20;BaseQRankSum=0.03;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.580;MQ=59.58;MQRankSum=0;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.109;SOR=1.179;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:41:99:41:.:.:0,450 0|1:12,13:25:99:.:0|1:1280853_T_TCTC:455,0,445:1280853:6,6,8,5 +chrX 1280873 . T TCC 130.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=15.45;BaseQRankSum=-0.66;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=22.175;MQ=56.02;MQRankSum=0.301;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=4.395;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,8:11:99:.:170,0:3,0,0,8 0/0:.:31:37:29:0,37,758 +chrX 1281006 . C T 120 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=5.00;BaseQRankSum=1.135;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=5.792;MQ=54.01;MQRankSum=1.55;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=1.304;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,8:14:88:88,0:4,2,2,6 0/1:12,4:16:62:62,0,193:7,5,2,2 +chrX 1281112 . TCTC T,CCTC 270 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=8,4;AS_QD=23.08,6.78;BaseQRankSum=-1.121;DP=35;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.66;MQRankSum=-1.57;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.693;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:10:20:10:0,20,20 0/1:5,8,4:17:99:.:300,0,228,239,121,385:2,3,5,7 +chrX 1281540 . C T 2168 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=23.38;BaseQRankSum=2.998;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=10.026;MQ=59.69;MQRankSum=1.048;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.762;SOR=0.245;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,50:52:99:1634,0:1,1,23,27 0/1:21,21:42:99:564,0,529:6,15,13,8 +chrX 1282031 . T TA 800.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=12.73;BaseQRankSum=0.927;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.694;MQ=59.09;MQRankSum=0;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.35;SOR=1.242;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,37:39:99:667,0:1,1,28,9 0/1:14,13:27:99:173,0,194:9,5,8,5 +chrX 1283123 . GTTCC G 1802.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=27.09;BaseQRankSum=1.256;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.009;MQ=59.51;MQRankSum=1.104;QD=27.09;ReadPosRankSum=1.306;SOR=0.981;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1426,0:0,0,11,23 0/1:22,12:34:99:416,0,833:10,12,7,5 +chrX 1283167 . GTTCC G 2663.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.10;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.22;QD=42.90;SOR=1.270;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1328,0:0,0,11,20 1/1:0,32:32:96:1375,96,0:0,0,13,19 +chrX 1284119 . T C 2603 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=22.90;BaseQRankSum=-1.444;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.009;SOR=0.709;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1959,0:0,0,25,37 0/1:27,26:53:99:674,0,749:12,15,14,12 +chrX 1284189 . G C 2889 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=33.94;BaseQRankSum=-0.631;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.039;MQ=58.60;MQRankSum=0.612;QD=33.94;ReadPosRankSum=1.206;SOR=0.759;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2249,0:.:0,0,28,23 0|1:17,18:35:99:0|1:1284189_G_C:670,0,638:1284189:8,9,9,9 +chrX 1284195 . CTTTT C 2893.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.59;BaseQRankSum=-1.333;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.492;MQ=58.24;MQRankSum=1.18;QD=32.59;ReadPosRankSum=0.775;SOR=0.547;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,53:53:99:.:.:2304,0:.:0,0,28,25 0|1:20,17:37:99:0|1:1284189_G_C:629,0,782:1284189:8,12,9,8 +chrX 1284201 . T C 2833 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.53;BaseQRankSum=-0.633;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.040;MQ=58.33;MQRankSum=1.18;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.636;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2234,0:.:0,0,28,23 0|1:20,17:37:99:0|1:1284189_G_C:629,0,782:1284189:8,12,9,8 +chrX 1284273 . G A 1156 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=15.21;BaseQRankSum=1.956;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=8.084;MQ=56.32;MQRankSum=0.608;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.163;SOR=1.578;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,38:44:99:1054,0:2,4,11,27 0/1:27,7:34:99:132,0,778:12,15,1,6 +chrX 1284611 . TTTA T 280.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=7.44;BaseQRankSum=1.211;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=7.897;MQ=49.82;MQRankSum=-3.231;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=1.738;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:75:99:75:.:.:0,150 0|1:32,11:43:99:.:0|1:1284611_TTTA_T:320,0,1268:1284611:18,14,3,8 +chrX 1284626 . C G 250 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=9;AS_QD=7.37;BaseQRankSum=0.619;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.531;MQ=52.82;MQRankSum=-3.729;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.674;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:60:.:60:.:.:0,0 0|1:29,9:38:99:.:0|1:1284611_TTTA_T:280,0,1180:1284611:17,12,4,5 +chrX 1284660 . A ATT 132.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=9.05;BaseQRankSum=0.641;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=17.041;MQ=53.48;MQRankSum=-0.264;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.103;SOR=3.232;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,758 0/1:9,10:19:99:.:172,0,192:3,6,9,1 +chrX 1284910 . G A 188 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=2.83;BaseQRankSum=0.953;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.99;MQRankSum=-4.52;QD=2.83;ReadPosRankSum=-3.028;SOR=0.835;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,1373 0|1:67,10:77:99:.:0|1:1284910_G_A:218,0,2783:1284910:30,37,4,6 +chrX 1284914 . A G 188 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=2.83;BaseQRankSum=0.817;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.13;MQRankSum=-4.52;QD=2.83;ReadPosRankSum=-3.365;SOR=0.835;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,1373 0|1:67,10:77:99:.:0|1:1284910_G_A:218,0,2783:1284910:30,37,4,6 +chrX 1284919 . A G 137 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=2.11;BaseQRankSum=0.297;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=1.404;MQ=59.16;MQRankSum=-4.869;QD=2.11;ReadPosRankSum=-3.322;SOR=1.161;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,1373 0|1:70,9:79:99:.:0|1:1284910_G_A:167,0,2882:1284910:32,38,3,6 +chrX 1284924 . A C 59 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=1.19;BaseQRankSum=1.073;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.12;MQRankSum=-5.445;QD=1.19;ReadPosRankSum=-2.982;SOR=0.687;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,1373 0|1:68,7:75:89:.:0|1:1284910_G_A:89,0,2804:1284910:30,38,3,4 +chrX 1284962 . T C 2264 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=19.12;BaseQRankSum=0.303;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=6.139;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=19.12;ReadPosRankSum=-2.34;SOR=1.164;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1463,0:0,0,17,31 0/1:39,33:72:99:831,0,1029:20,19,15,18 +chrX 1285064 . A T 3194 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=28.79;BaseQRankSum=1.336;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=8.586;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.79;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=1.580;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2212,0:.:0,0,34,17 0|1:34,27:61:99:0|1:1285064_A_T:1012,0,1323:1285064:17,17,18,9 +chrX 1285065 . A T 3194 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=28.79;BaseQRankSum=0.854;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=8.586;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.79;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=1.580;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2212,0:.:0,0,34,17 0|1:34,27:61:99:0|1:1285064_A_T:1012,0,1323:1285064:17,17,18,9 +chrX 1285120 . G C 3151 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=22.40;BaseQRankSum=2.11;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=17.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.548;SOR=1.773;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2432,0:0,0,54,20 0/1:40,28:68:99:749,0,1061:19,21,17,11 +chrX 1285168 . T A 3332 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=21.41;BaseQRankSum=-0.284;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=1.444;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.41;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.863;VarDP=157 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,77:77:99:2396,0:0,0,44,33 0/1:41,39:80:99:966,0,1065:21,20,20,19 +chrX 1285387 . G A 2619 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=21.71;BaseQRankSum=1.117;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=6.780;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.71;ReadPosRankSum=1.252;SOR=1.394;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1703,0:1,0,17,36 0/1:32,36:68:99:946,0,777:15,17,14,22 +chrX 1285432 . G A 2325 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=21.61;BaseQRankSum=1.726;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.746;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=21.61;ReadPosRankSum=0.95;SOR=0.508;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,50:52:99:1618,0:0,2,22,28 0/1:28,29:57:99:737,0,752:12,16,14,15 +chrX 1285484 . G A 1914 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=22.09;BaseQRankSum=2.385;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.100;MQ=59.47;MQRankSum=0.355;QD=22.09;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.974;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,43:44:99:1450,0:0,1,20,23 0/1:26,18:44:99:494,0,672:14,12,6,12 +chrX 1285628 . GAGCTTGC G 2613.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.96;BaseQRankSum=0.457;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=5.069;MQ=59.36;MQRankSum=0;QD=31.96;ReadPosRankSum=-0.705;SOR=0.279;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1834,0:.:0,0,21,20 0|1:21,21:42:99:0|1:1285628_GAGCTTGC_G:819,0,818:1285628:14,7,11,10 +chrX 1285648 . C G 2856 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.80;BaseQRankSum=0.348;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.396;MQ=59.14;MQRankSum=0;QD=32.80;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.393;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,45:45:99:.:.:2025,0:.:0,0,26,19 0|1:21,22:43:99:0|1:1285628_GAGCTTGC_G:861,0,816:1285628:14,7,12,10 +chrX 1285660 . G C 2511 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.16;BaseQRankSum=0.424;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.669;MQ=58.79;MQRankSum=0;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.57;SOR=0.333;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1845,0:.:0,0,24,17 0|1:20,18:38:99:0|1:1285628_GAGCTTGC_G:696,0,786:1285628:14,6,10,8 +chrX 1285701 . C CA 129.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=4.97;BaseQRankSum=1.027;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.365;MQ=57.61;MQRankSum=-1.48;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.208;SOR=1.179;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:38:99:38:0,907 0/1:16,18:34:99:.:169,0,462:8,8,7,11 +chrX 1285719 . AAAAAAAAAAAAAG A 2012.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=21.60;BaseQRankSum=1.277;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.11;MQRankSum=1.117;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=0.699;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,43:46:99:1528,0:3,0,22,21 0/1:30,19:49:99:524,0,1107:14,16,10,9 +chrX 1285939 . T G 2561 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=21.96;BaseQRankSum=2.08;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=9.865;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.496;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1995,0:0,0,35,27 0/1:34,22:56:99:596,0,939:12,22,10,12 +chrX 1286017 . C A 5662 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=29.01;BaseQRankSum=2.621;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.84;MQRankSum=-0.352;QD=43.12;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=0.247;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,56:57:99:.:.:2429,0:.:1,0,26,30 1|1:0,75:75:99:0|1:1286017_C_A:3263,226,0:1286017:0,0,39,36 +chrX 1286038 . T C 5809 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=30.04;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.52;QD=44.92;SOR=0.822;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2520,0:.:0,0,27,29 1|1:0,74:74:99:0|1:1286017_C_A:3319,223,0:1286017:0,0,34,40 +chrX 1286043 . T C 5684 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=28.43;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.58;QD=44.99;SOR=0.843;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2430,0:.:0,0,26,28 1|1:0,73:73:99:0|1:1286017_C_A:3284,220,0:1286017:0,0,33,40 +chrX 1286048 . G A 2874 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=24.20;BaseQRankSum=1.176;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=8.758;MQ=58.40;MQRankSum=-0.18;QD=24.20;ReadPosRankSum=-1.082;SOR=0.897;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:2250,0:0,0,24,26 0/1:44,26:70:99:654,0,1193:25,19,8,18 +chrX 1286071 . A G 4643 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=31.05;BaseQRankSum=1.436;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.191;MQ=58.28;MQRankSum=-0.384;QD=37.99;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.381;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:2193,0:0,0,24,27 1/1:1,71:72:99:2480,190,0:1,0,34,37 +chrX 1286267 . T C 698 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=-1.942;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=2.544;MQ=59.59;MQRankSum=-0.676;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.291;SOR=0.951;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1505 0/1:17,33:50:99:.:728,0,393:9,8,14,19 +chrX 1286280 . G A 870 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=19.15;BaseQRankSum=1.251;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.735;MQ=59.57;MQRankSum=-0.639;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.32;SOR=1.041;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1505 0/1:15,32:47:99:.:900,0,310:8,7,13,19 +chrX 1286350 . C G 709 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.40;BaseQRankSum=0.194;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=6.089;MQ=59.27;MQRankSum=0.179;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=1.064;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1505 0/1:22,26:48:99:.:739,0,600:13,9,10,16 +chrX 1286388 . G T 917 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.87;BaseQRankSum=-0.433;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=59.31;MQRankSum=-0.027;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.127;SOR=0.404;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1505 0|1:27,26:53:99:.:0|1:1286388_G_T:947,0,1024:1286388:16,11,13,13 +chrX 1286395 . C G 914 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.48;BaseQRankSum=-2.06;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.363;MQ=59.30;MQRankSum=-0.053;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=0.369;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1505 0|1:28,26:54:99:.:0|1:1286388_G_T:944,0,1055:1286388:18,10,14,12 +chrX 1286422 . A G 2698 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=23.72;BaseQRankSum=-1.914;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;MQRankSum=-1.131;QD=23.72;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.625;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1825,0:0,0,31,26 0/1:23,35:58:99:903,0,591:13,10,19,16 +chrX 1286474 . CAGG C 1001.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.77;BaseQRankSum=0.476;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.946;MQ=59.64;MQRankSum=0.306;QD=15.77;ReadPosRankSum=2.261;SOR=0.539;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:99:69:.:.:0,1766 0|1:38,28:66:99:.:0|1:1286474_CAGG_C:1041,0,1501:1286474:22,16,15,13 +chrX 1286487 . G C 1014 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.06;BaseQRankSum=0.222;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.965;MQ=59.67;MQRankSum=-0.199;QD=16.06;ReadPosRankSum=1.969;SOR=0.490;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:99:69:.:.:0,1766 0|1:37,28:65:99:.:0|1:1286474_CAGG_C:1044,0,1459:1286474:22,15,15,13 +chrX 1286570 . CAAAAA CAAAA,C 3041.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=83,26;AS_QD=25.46,31.49;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=28.27;SOR=0.787;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54,0:54:99:1372,0,1372:0,0,28,26 1/2:0,29,26:55:99:1709,1055,968,736,0,1335:0,0,29,26 +chrX 1287078 . T C 2063 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=20.72;BaseQRankSum=0.841;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=2.874;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.72;ReadPosRankSum=-1.638;SOR=0.810;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1229,0:0,0,21,19 0/1:30,31:61:99:864,0,770:14,16,18,13 +chrX 1287207 . A G 972 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=14.52;BaseQRankSum=2.342;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.239;MQ=58.89;MQRankSum=0;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.517;SOR=1.054;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:11,18:29:99:273,0:6,5,5,13 0/1:15,25:40:99:729,0,376:3,12,7,18 +chrX 1287301 . G C 114 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=3.27;BaseQRankSum=0.283;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=2.622;MQ=58.83;MQRankSum=0.307;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.368;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,24:44:99:.:144,0:7,13,11,13 0/0:.:48:53:48:0,53,1261 +chrX 1287354 . A C 4186 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=30.33;BaseQRankSum=2.181;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;MQRankSum=4.358;QD=43.02;ReadPosRankSum=0.12;SOR=0.379;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,57:58:99:.:.:2457,0:.:0,1,24,33 1|1:0,40:40:99:0|1:1287354_A_C:1759,120,0:1287354:0,0,17,23 +chrX 1287361 . C T 4116 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=35.08;BaseQRankSum=2.219;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;MQRankSum=4.281;QD=43.19;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.357;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,55:56:99:.:.:2387,0:.:0,1,24,31 1|1:0,40:40:99:0|1:1287354_A_C:1759,120,0:1287354:0,0,17,23 +chrX 1287457 . T G 1477 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=31.40;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.40;SOR=0.693;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,976 1/1:0,48:48:99:.:1507,144,0:0,0,24,24 +chrX 1287653 . A G 1183 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=32.78;BaseQRankSum=2.431;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.30;MQRankSum=-0.27;QD=32.78;ReadPosRankSum=1.587;SOR=0.442;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,34:37:99:.:1213,0:1,2,16,18 0/0:.:53:36:52:0,36,1263 +chrX 1287659 . A G 1493 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=34.39;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.12;QD=42.31;SOR=0.804;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1523,0:0,0,17,19 0/0:.:53:36:52:0,36,1263 +chrX 1287663 . T C 88 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=3.58;BaseQRankSum=-0.893;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=1.356;MQ=53.10;MQRankSum=-1.106;QD=3.58;ReadPosRankSum=2.361;SOR=1.061;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,17:33:99:.:118,0:8,8,7,10 0/0:.:53:36:52:0,36,1263 +chrX 1287691 . G A 481 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=18.93;BaseQRankSum=0.529;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.690;MQ=52.89;MQRankSum=-0.31;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.834;SOR=0.503;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:8,19:27:99:.:511,0:5,3,9,10 0/0:.:53:36:52:0,36,1263 +chrX 1287696 . G C 481 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=18.93;BaseQRankSum=1.368;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.690;MQ=52.89;MQRankSum=-0.31;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.503;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:8,19:27:99:.:511,0:5,3,9,10 0/0:.:53:36:52:0,36,1263 +chrX 1287705 . G A 651 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=27.24;BaseQRankSum=1.011;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=12.128;MQ=52.77;MQRankSum=0.289;QD=27.24;ReadPosRankSum=1.007;SOR=0.027;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:5,20:25:99:.:681,0:5,0,10,10 0/0:.:53:36:52:0,36,1263 +chrX 1287885 . T C 726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=30.24;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.59;QD=30.24;SOR=1.136;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:756,0:0,0,10,15 0/0:.:53:36:52:0,36,1263 +chrX 1287988 . T C 3074 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=31.35;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.70;QD=31.35;SOR=1.384;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1617,0:0,0,19,32 1/1:0,48:48:99:1487,144,0:0,0,17,31 +chrX 1288102 . A G 1878 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=30.77;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.77;SOR=0.758;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,174 1/1:0,62:62:99:.:1908,185,0:0,0,30,32 +chrX 1288208 . A G 1422 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=30.89;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=30.89;SOR=1.659;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,47:47:99:.:1452,0:0,0,32,15 0/0:.:48:77:48:0,77,1042 +chrX 1288246 . C G 1168 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=30.72;BaseQRankSum=2.355;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.222;SOR=1.179;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,38:39:99:.:1198,0:1,0,29,9 0/0:.:24:0:24:0,0,397 +chrX 1288274 . G C 513 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=33.93;BaseQRankSum=0;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.83;MQRankSum=2.071;QD=38.79;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=0.442;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 0|1:1,13:14:3:.:0|1:1288274_G_C:543,0,3:1288274:0,1,7,6 +chrX 1288279 . T C 512 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=28.56;BaseQRankSum=-0.348;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.63;MQRankSum=2.071;QD=38.71;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=0.442;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 0|1:1,13:14:2:.:0|1:1288274_G_C:542,0,2:1288274:0,1,7,6 +chrX 1288297 . C T 386 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=26.54;BaseQRankSum=0;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.89;MQRankSum=1.81;QD=37.82;ReadPosRankSum=-0.16;SOR=0.399;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 0|1:1,10:11:11:.:0|1:1288297_C_T:416,0,11:1288297:0,1,4,6 +chrX 1288298 . A *,G 388 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,10;AS_QD=0.00,32.57;BaseQRankSum=0;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.89;MQRankSum=1.988;QD=32.15;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.223;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49,49 1|2:1,2,10:13:2:.:0|1:1288297_C_T:418,378,416,2,0,13:1288297:0,1,6,6 +chrX 1288375 . G A 130 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=32.00;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.72;QD=32.00;SOR=1.022;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:49:58:0,49 1/1:0,5:5:13:.:160,13,0:0,0,2,3 +chrX 1288388 . G A 375 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=31.08;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.88;QD=45.00;SOR=0.892;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 1|1:0,9:9:27:.:0|1:1288388_G_A:405,27,0:1288388:0,0,4,5 +chrX 1288396 . T C 555 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=30.84;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.20;QD=45.00;SOR=0.836;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 1|1:0,13:13:39:.:0|1:1288388_G_A:585,39,0:1288388:0,0,7,6 +chrX 1288398 . C G 555 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=28.10;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.20;QD=45.00;SOR=0.836;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 1|1:0,13:13:39:.:0|1:1288388_G_A:585,39,0:1288388:0,0,7,6 +chrX 1288406 . T C 690 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=34.59;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.54;QD=45.00;SOR=1.244;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 1|1:0,16:16:48:.:0|1:1288388_G_A:720,48,0:1288388:0,0,10,6 +chrX 1288407 . G A 690 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=27.99;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.54;QD=45.00;SOR=1.244;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 1|1:0,16:16:48:.:0|1:1288388_G_A:720,48,0:1288388:0,0,10,6 +chrX 1288409 . A G 735 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=31.71;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.87;QD=45.00;SOR=1.371;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 1|1:0,17:17:51:.:0|1:1288388_G_A:765,51,0:1288388:0,0,11,6 +chrX 1288413 . C T 959 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=29.75;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.08;QD=44.95;SOR=0.874;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 1|1:0,22:22:66:.:0|1:1288388_G_A:989,66,0:1288388:0,0,12,10 +chrX 1288422 . T C 1098 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=29.60;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.70;QD=43.38;SOR=0.846;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 1|1:0,26:26:78:.:0|1:1288388_G_A:1128,78,0:1288388:0,0,14,12 +chrX 1288424 . G A 1098 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=29.67;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.83;QD=43.38;SOR=0.846;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:49:58:.:.:0,49 1|1:0,26:26:78:.:0|1:1288388_G_A:1128,78,0:1288388:0,0,14,12 +chrX 1288437 . A G 2457 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=28.36;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=38.86;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2487,0:0,0,34,30 0/0:.:61:87:61:0,87,907 +chrX 1288439 . G A 30 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=0.94;BaseQRankSum=-0.146;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.000;MQ=59.93;MQRankSum=-0.938;QD=0.938;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=1.080;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,33:64:60:.:60,0:14,17,20,13 0/0:.:61:87:61:0,87,907 +chrX 1288903 . CAT C 2803.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=21.70;BaseQRankSum=-1.631;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.736;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.615;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,41:75:99:333,0:15,19,18,23 1/1:0,56:56:99:2510,169,0:0,0,27,29 +chrX 1291275 . CTTT C 1838.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=26.87;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=43.67;SOR=0.941;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1878,0:0,0,19,24 0/0:.:26:23:24:0,23,604 +chrX 1292338 . C T 224 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=3.58;BaseQRankSum=0.032;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=6.235;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=0.962;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,39:71:99:.:254,0:18,14,16,23 0/0:.:40:26:31:0,26,899 +chrX 1292638 . C T 397 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=6.10;BaseQRankSum=0.918;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.913;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.836;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,41:70:99:.:427,0:16,13,24,17 0/0:.:40:26:31:0,26,899 +chrX 1293221 . G GTTTC 1895.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=30.65;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=45.00;SOR=0.941;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1935,0:0,0,24,19 0/0:.:40:26:31:0,26,899 +chrX 1293271 . G T 299 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=5.48;BaseQRankSum=-1.014;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=9.328;MQ=55.97;MQRankSum=0.482;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.388;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,34:60:99:.:329,0:18,8,16,18 0/0:.:40:26:31:0,26,899 +chrX 1293281 . G C 2660 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=30.13;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.66;QD=44.10;SOR=1.022;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,61:61:99:.:2690,0:0,0,35,26 0/0:.:40:26:31:0,26,899 +chrX 1293364 . A G 2456 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=29.24;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.83;QD=37.10;SOR=0.784;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,67:67:99:.:2486,0:0,0,32,35 0/0:.:40:26:31:0,26,899 +chrX 1294013 . CACCTGGACCCAGTGTAGACAGGAGAAGACTGCACCACCTCCACCTGGACCGAGTGTAGACAGGAGGAGACCCTGCCCCACCTCT C 163.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=13.53;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=1.809;QD=13.53;SOR=0.495;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,11:15:99:.:203,0:1,3,4,7 0/0:.:42:44:42:0,44,1051 +chrX 1294564 . C G 1712 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.50;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.50;SOR=1.747;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:1742,0:0,0,16,36 0/0:.:54:31:50:0,31,1288 +chrX 1294784 . C G 1548 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=32.88;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=1.426;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,48:48:99:.:1578,0:0,0,31,17 0/0:.:54:31:50:0,31,1288 +chrX 1294922 . T C 2880 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.68;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.39;QD=35.93;SOR=0.995;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,81:81:99:.:2910,0:0,0,35,46 0/0:.:55:24:39:0,24,996 +chrX 1294960 . G A 1022 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=15.94;BaseQRankSum=-0.607;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.329;MQ=56.68;MQRankSum=-1.665;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.796;SOR=1.071;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,46:66:99:.:1052,0:8,12,15,31 0/0:.:55:24:39:0,24,996 +chrX 1294977 . G A 881 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=14.23;BaseQRankSum=1.497;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.364;MQ=59.56;MQRankSum=-1.465;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.671;SOR=1.207;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,42:64:99:.:911,0:9,13,13,29 0/0:.:55:24:39:0,24,996 +chrX 1295062 . T C 407 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=9.50;BaseQRankSum=0.643;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.689;MQ=59.01;MQRankSum=-1.486;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.340;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,30:46:99:.:437,0:10,6,15,15 0/0:.:55:24:39:0,24,996 +chrX 1295603 . A T 434 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=8.44;BaseQRankSum=-0.945;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=10.292;MQ=58.57;MQRankSum=-0.404;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.174;SOR=1.008;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,21:55:99:.:464,0:22,12,8,13 0/0:.:55:24:39:0,24,996 +chrX 1295832 . C T 1091 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=27.21;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;QD=40.04;SOR=1.061;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:1121,0:0,0,10,7 0/0:.:55:24:39:0,24,996 +chrX 1295837 . T C 185 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=7.96;BaseQRankSum=-0.175;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.40;MQRankSum=-1.14;QD=7.96;ReadPosRankSum=2.052;SOR=0.476;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:11,16:27:99:.:215,0:7,4,4,3 0/0:.:55:24:39:0,24,996 +chrX 1295861 . C T 49 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=3.29;BaseQRankSum=-2.185;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.57;MQRankSum=0.139;QD=3.29;ReadPosRankSum=1.949;SOR=0.476;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:11,13:24:79:.:79,0:7,4,4,3 0/0:.:55:24:39:0,24,996 +chrX 1295913 . T C 897 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=30.90;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.26;QD=30.90;SOR=0.693;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:927,0:0,0,15,15 0/0:.:55:24:39:0,24,996 +chrX 1296223 . G A 31 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=1.42;BaseQRankSum=3.038;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.28;SOR=0.784;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,21:43:61:.:61,0:11,11,11,10 0/0:.:41:37:37:0,37,967 +chrX 1297068 . T C 40 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=6;AS_QD=4.67;BaseQRankSum=-1.64;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=5.426;MQ=42.16;MQRankSum=1.731;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.573;SOR=2.272;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:21:.:21:0,0 0/1:9,6:15:70:.:70,0,199:4,5,5,1 +chrX 1297798 . C T 337 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=4.77;BaseQRankSum=0.451;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.122;MQ=37.78;MQRankSum=0.335;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.286;SOR=1.307;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:15:59:15:.:.:0,59 0|1:62,15:77:99:.:1|0:1297758_A_G:367,0,2302:1297758:37,25,11,4 +chrX 1297842 . G A 317 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=4.39;BaseQRankSum=-1.392;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.443;MQ=37.31;MQRankSum=0.813;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.764;SOR=1.191;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:15:59:15:.:.:0,59 0|1:63,16:79:99:.:1|0:1297758_A_G:347,0,2234:1297758:36,27,11,5 +chrX 1297909 . GTCTCCTACCCATGACCCCTGGCAGAACCCTACAGTCCCCTACTCACGACCCCTACAC G 129.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=18.78;BaseQRankSum=0.566;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=34.64;MQRankSum=0.334;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:15:59:15:0,59 0/1:3,6:9:87:.:169,0,87:0,3,1,5 +chrX 1298376 . A G 40 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=11.67;BaseQRankSum=0.623;DP=18;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=35.54;MQRankSum=0.524;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.329;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,4:6:70:.:70,0:2,0,4,0 0/0:.:15:20:12:0,20,371 +chrX 1298615 . CG C 764.97 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=20;AS_QD=22.39;DP=46;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.13;QD=40.20;SOR=0.693;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:804,0:0,0,8,8 ./.:.:26:.:26:0,0,0 +chrX 1298617 . ACCCCTACACTCTCCTACCCATGACCCCTGGTGGAACCCTACAGTCCCCTACTCACGACCCCTACACTCTCCTACCCATGACCTCTGGTGGAACCCTACAGTCCCCTACTCACG A,* 1072.97 . AC=1,0;AF=1.00,0.00;AN=1;AS_AltDP=16,12;AS_QD=33.22,0.00;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.52;QD=39.71;SOR=1.179;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,16,12:28:99:.:1112,0,180:0,0,11,17 ./.:.:26:.:26:0,0,0,0,0,0 +chrX 1298749 . CATGACCCCCA C 2523.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=29.46;BaseQRankSum=-1.048;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.25;MQRankSum=-1.232;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.760;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1664,0:0,0,13,24 0/1:26,24:50:99:899,0,1004:11,15,12,12 +chrX 1298829 . A G 148 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=3.36;BaseQRankSum=-1.223;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.375;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=0.368;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,30:53:99:.:178,0:9,14,15,15 0/0:.:58:98:58:0,98,1514 +chrX 1299044 . A G 2465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=29.21;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.24;SOR=1.318;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,67:67:99:.:2495,0:0,0,42,25 0/0:.:58:98:58:0,98,1514 +chrX 1299055 . A T 676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.97;BaseQRankSum=0.569;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.638;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1725 0/1:33,26:59:99:.:706,0,928:16,17,13,13 +chrX 1299729 . G C 2164 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=33.24;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.24;SOR=0.886;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2194,0:0,0,30,36 0/0:.:67:96:67:0,96,1418 +chrX 1300229 . TAAATA T 1843.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=29.47;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.80;SOR=0.784;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:76:65:0,76 1/1:0,44:44:99:.:1883,133,0:0,0,21,23 +chrX 1300356 . A G 1952 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=30.03;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.03;SOR=0.886;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:76:65:0,76 1/1:0,66:66:99:.:1982,196,0:0,0,30,36 +chrX 1300407 . C T 2026 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=30.69;BaseQRankSum=2.115;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.69;ReadPosRankSum=-1.423;SOR=0.223;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:76:65:0,76 1/1:1,66:67:99:.:2056,191,0:1,0,33,33 +chrX 1300678 . C G 1692 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.12;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.12;SOR=0.941;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:76:65:0,76 1/1:0,52:52:99:.:1722,156,0:0,0,23,29 +chrX 1301224 . A G 1303 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=29.62;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=29.62;SOR=1.154;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:76:65:0,76 1/1:0,45:45:99:.:1333,133,0:0,0,27,18 +chrX 1301331 . CAA C 364.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=20.20;BaseQRankSum=0.746;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=11.326;MQ=57.74;MQRankSum=1.422;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.482;SOR=1.099;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:14:46:0,14 1/1:3,17:20:9:.:404,9,0:0,3,11,6 +chrX 1301595 . CT C 293.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.81;BaseQRankSum=-0.334;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=4.682;MQ=58.63;MQRankSum=-0.39;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=1.406;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:5,21:26:99:.:333,0:3,2,7,14 0/0:.:46:20:37:0,20,952 +chrX 1301912 . CTTT C 141.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=5.84;BaseQRankSum=0.376;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.412;MQ=59.12;MQRankSum=0;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.609;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,17:31:99:.:181,0:6,8,9,8 0/0:.:46:20:37:0,20,952 +chrX 1302020 . A G 796 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=7.94;BaseQRankSum=1.214;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.737;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.329;SOR=0.846;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,34:58:99:332,0:13,11,21,13 0/1:27,19:46:99:494,0,676:14,13,9,10 +chrX 1302196 . G A 156 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=2.70;BaseQRankSum=1.957;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.001;MQ=59.45;MQRankSum=0.103;QD=2.70;ReadPosRankSum=-1.334;SOR=0.446;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,36:69:99:.:186,0:19,14,18,18 0/0:.:52:31:50:0,31,1298 +chrX 1302314 . G C 1014 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=8.09;BaseQRankSum=0.697;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=5.357;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.866;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,42:77:99:173,0:16,19,22,20 0/1:21,31:52:99:871,0,519:10,11,19,12 +chrX 1303111 . G T 177 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=5.91;BaseQRankSum=0.993;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=8.346;MQ=50.30;MQRankSum=-3.258;QD=5.91;ReadPosRankSum=1.973;SOR=1.498;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,551 0/1:25,10:35:99:.:207,0,627:10,15,7,3 +chrX 1303975 . G A 822 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.44;BaseQRankSum=-1.729;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=9.154;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.382;SOR=1.232;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,551 0/1:26,33:59:99:.:852,0,697:15,11,12,21 +chrX 1304050 . T C 494 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.15;BaseQRankSum=0.052;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=20.683;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.98;SOR=1.567;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,551 0/1:27,20:47:99:.:524,0,742:19,8,6,14 +chrX 1304146 . T C 317 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=6.55;BaseQRankSum=-0.962;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=14.534;MQ=58.12;MQRankSum=-3.845;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.415;SOR=1.980;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,551 0/1:37,16:53:99:.:347,0,1057:22,15,4,12 +chrX 1304331 . T C 48 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=2.29;BaseQRankSum=1.106;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=21.478;MQ=59.40;MQRankSum=0.456;QD=2.29;ReadPosRankSum=-2.514;SOR=3.223;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,551 0|1:30,4:34:78:.:0|1:1304331_T_C:78,0,1248:1304331:7,23,4,0 +chrX 1304340 . C A 132 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=4.50;BaseQRankSum=1.216;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=30.550;MQ=59.43;MQRankSum=0.522;QD=4.50;ReadPosRankSum=-2.57;SOR=3.894;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,551 0|1:30,6:36:99:.:0|1:1304331_T_C:162,0,1242:1304331:7,23,6,0 +chrX 1304341 . A G 132 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=4.50;BaseQRankSum=0.842;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=30.550;MQ=59.43;MQRankSum=0.522;QD=4.50;ReadPosRankSum=-2.421;SOR=3.894;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,551 0|1:30,6:36:99:.:0|1:1304331_T_C:162,0,1242:1304331:7,23,6,0 +chrX 1304353 . TTGCAC T 197.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=5.78;BaseQRankSum=-0.283;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=38.706;MQ=59.50;MQRankSum=0.554;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=4.396;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,551 0|1:33,8:41:99:.:0|1:1304353_TTGCAC_T:237,0,1362:1304353:8,25,8,0 +chrX 1304361 . C CGCCGT 278.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=7.23;BaseQRankSum=0.911;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=44.291;MQ=59.56;MQRankSum=0.597;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.122;SOR=4.797;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,551 0|1:34,10:44:99:.:0|1:1304353_TTGCAC_T:318,0,1387:1304353:9,25,10,0 +chrX 1304644 . GT G 801.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=16.17;BaseQRankSum=-1.927;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=4.357;MQ=59.91;MQRankSum=-0.625;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.387;SOR=1.387;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,36:52:99:.:841,0:7,9,11,25 0/0:.:55:88:55:0,88,1275 +chrX 1304652 . TTG T 1006.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=21.79;BaseQRankSum=0.738;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.79;ReadPosRankSum=-1.05;SOR=0.745;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,1579 0|1:21,27:48:99:.:0|1:1304652_TTG_T:1046,0,780:1304652:8,13,10,17 +chrX 1304666 . T G 1856 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=18.67;BaseQRankSum=-0.377;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.739;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=1.022;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:18,37:55:99:.:.:817,0:.:10,8,14,23 0|1:18,28:46:99:0|1:1304652_TTG_T:1069,0,672:1304652:7,11,12,16 +chrX 1304917 . C G 3094 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=34.71;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;QD=34.71;SOR=1.166;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1883,0:0,0,20,31 1/1:0,39:39:99:1241,116,0:0,0,16,23 +chrX 1305124 . G C 1929 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=16.19;BaseQRankSum=2.173;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.850;MQ=59.33;MQRankSum=1.939;QD=16.19;ReadPosRankSum=2.033;SOR=0.801;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,36:62:99:278,0:13,13,19,17 1/1:2,57:59:99:1681,141,0:0,2,32,25 +chrX 1305214 . A G 2093 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=30.77;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=30.77;SOR=0.910;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:46:51:0,46 1/1:0,69:69:99:.:2123,206,0:0,0,38,31 +chrX 1305282 . C T 940 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=12.13;BaseQRankSum=0.106;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.846;MQ=59.60;MQRankSum=0.018;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=0.902;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:46:51:0,46 0/1:40,40:80:99:.:970,0,955:20,20,22,18 +chrX 1305942 . T C 865 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=14.44;BaseQRankSum=-2.167;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=-0.817;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.656;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:46:51:0,46 0/1:26,36:62:99:.:895,0,659:12,14,17,19 +chrX 1306171 . G C 679 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.77;BaseQRankSum=0.215;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.687;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:46:51:0,46 0/1:21,27:48:99:.:709,0,510:11,10,13,14 +chrX 1306855 . A G 502 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=11.08;BaseQRankSum=-2.018;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.551;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.21;SOR=0.506;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,31:48:99:.:532,0:10,7,15,16 0/0:.:49:25:38:0,25,901 +chrX 1306862 . G GGA 459.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.18;BaseQRankSum=-0.519;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=2.568;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.453;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,31:49:99:.:499,0:11,7,15,16 0/0:.:49:25:38:0,25,901 +chrX 1306955 . T G 3286 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=30.70;BaseQRankSum=1.216;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.70;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.361;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,59:60:99:1744,0:0,1,27,32 1/1:0,48:48:99:1572,144,0:0,0,19,29 +chrX 1307018 . G A 90 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=2.31;BaseQRankSum=1.838;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.035;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.082;SOR=0.551;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,27:52:99:.:120,0:11,14,13,14 0/0:.:66:99:66:0,115,1541 +chrX 1307319 . T C 4615 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=29.76;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.01;SOR=1.241;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2401,0:0,0,37,25 1/1:0,67:67:99:2244,201,0:0,0,42,25 +chrX 1307344 . C T 304 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=5.22;BaseQRankSum=0.406;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.477;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.632;SOR=1.078;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,37:64:99:.:334,0:13,14,22,15 0/0:.:52:44:52:0,44,1231 +chrX 1307388 . T C,TC 526 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,30;AS_QD=0.00,12.09;BaseQRankSum=-0.181;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=8.445;MQ=59.91;MQRankSum=-0.653;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.213;SOR=0.507;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:16,3,30:49:99:.:556,671,0:5,11,18,15 0/0:.:52:44:52:0,44,1231,44,1231,1231 +chrX 1307397 . G T 526 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=11.35;BaseQRankSum=-0.042;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.600;MQ=59.90;MQRankSum=-0.72;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.349;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,31:49:99:.:556,0:6,12,14,17 0/0:.:52:44:52:0,44,1231 +chrX 1307522 . T TCGAC 500.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=7.61;BaseQRankSum=1.76;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=6.386;MQ=59.63;MQRankSum=-0.802;QD=7.61;ReadPosRankSum=-1.33;SOR=0.264;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,42:71:99:.:540,0:19,10,21,21 0/0:.:78:99:78:0,120,1800 +chrX 1307523 . T TGATTAGATGAAGCCCACCATTCTCCTTTATACCTTC 501.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=7.62;BaseQRankSum=1.22;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=6.386;MQ=59.63;MQRankSum=-0.802;QD=7.62;ReadPosRankSum=-2.578;SOR=0.264;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,42:71:99:.:541,0:19,10,21,21 0/0:.:77:0:77:0,0,1116 +chrX 1307792 . T C 3186 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=30.40;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.68;QD=44.67;SOR=0.986;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:712,0:.:0,0,1,3 1|1:0,56:56:99:0|1:1307792_T_C:2504,169,0:1307792:0,0,25,31 +chrX 1307793 . TTTTAGACCTTTGACTGATTAGATGAGGCCTACCCTTCTCCC *,T,CTTTAGACCTTTGACTGATTAGATGAGGCCTACCCTTCTCCC 3546 . AC=0,0,3;AF=0.00,0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,0,66;AS_QD=31.47,32.56,22.34;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.37;QD=54.18;SOR=0.957;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 3:0,0,0,10:10:99:.:.:1072,532,919,0:.:0,0,4,6 3|3:0,0,0,56:56:99:0|1:1307792_T_C:2504,2504,2504,2504,2504,2504,169,169,169,0:1307792:0,0,25,31 +chrX 1307797 . A *,G 3337 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,61;AS_QD=27.49,34.31;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.43;QD=55.20;SOR=0.941;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,6:6:99:.:.:892,262,0:.:0,0,2,4 2|2:0,0,55:55:99:0|1:1307792_T_C:2475,2475,2475,166,166,0:1307792:0,0,25,30 +chrX 1307804 . T *,C 2977 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,65;AS_QD=29.85,32.01;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.37;QD=46.26;SOR=1.000;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,7:7:99:.:.:397,826,0:.:0,0,2,5 2|2:0,0,58:58:99:0|1:1307792_T_C:2610,2610,2610,175,175,0:1307792:0,0,26,32 +chrX 1307819 . G *,A 3474 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,67;AS_QD=32.32,29.17;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.12;QD=52.30;SOR=0.723;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,10:10:99:.:.:939,381,0:.:0,0,4,6 2|2:0,0,57:57:99:0|1:1307792_T_C:2565,2565,2565,172,172,0:1307792:0,0,29,28 +chrX 1307823 . T *,C 3296 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,66;AS_QD=33.16,35.26;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.79;QD=50.39;SOR=0.693;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,10:10:99:.:.:806,382,0:.:0,0,4,6 2|2:0,0,56:56:99:0|1:1307792_T_C:2520,2520,2520,169,169,0:1307792:0,0,29,27 +chrX 1307824 . AC *,A 3286.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,66;AS_QD=29.20,35.04;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.79;QD=50.39;SOR=0.693;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,10:10:99:.:.:806,382,0:.:0,0,4,6 2|2:0,0,56:56:99:0|1:1307792_T_C:2520,2520,2520,169,169,0:1307792:0,0,29,27 +chrX 1307829 . TC *,T 3372.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,70;AS_QD=24.24,31.52;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.89;QD=48.74;SOR=0.750;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,10:10:99:.:.:717,383,0:.:0,0,4,6 2|2:0,0,60:60:99:0|1:1307792_T_C:2695,2695,2695,181,181,0:1307792:0,0,30,30 +chrX 1307834 . C *,CTT 3368.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,70;AS_QD=31.45,33.92;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.05;QD=48.69;SOR=0.811;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,10:10:99:.:.:717,383,0:.:0,0,4,6 2|2:0,0,60:60:99:0|1:1307792_T_C:2691,2691,2691,181,181,0:1307792:0,0,29,31 +chrX 1307995 . C T 1268 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=17.31;BaseQRankSum=2.412;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=10.104;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.147;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,23:38:99:157,0:12,3,14,9 1/1:1,36:37:99:1141,100,0:0,1,16,20 +chrX 1308189 . C T 243 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=4.33;BaseQRankSum=-1.072;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=0.664;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,36:63:99:.:273,0:11,16,15,21 0/0:.:49:34:47:0,34,1186 +chrX 1308288 . G A 1725 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=32.50;BaseQRankSum=2.916;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.50;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.271;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,129 1/1:1,53:54:99:.:1755,152,0:1,0,28,25 +chrX 1308713 . G A 105 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=1.96;BaseQRankSum=2.638;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=5.275;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.78;SOR=1.409;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,35:69:99:.:135,0:22,12,27,8 0/0:.:60:99:60:0,116,1578 +chrX 1308965 . T C 4011 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=30.38;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=30.38;SOR=0.708;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2106,0:0,0,31,41 1/1:0,61:61:99:1935,183,0:0,0,36,25 +chrX 1309183 . C T 2037 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=18.79;BaseQRankSum=2.417;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.008;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.853;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,25:51:86:86,0:12,14,15,10 1/1:0,59:59:99:1981,177,0:0,0,32,27 +chrX 1310574 . A G 111 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=2.66;BaseQRankSum=0.233;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=9.971;MQ=59.34;MQRankSum=1.288;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.502;SOR=1.064;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,29:53:99:.:141,0:15,9,11,18 0/0:.:61:60:61:0,60,1170 +chrX 1310641 . G C 304 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=8.35;BaseQRankSum=-0.73;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=4.837;MQ=59.80;MQRankSum=-0.723;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.91;SOR=0.958;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,25:40:99:.:334,0:9,6,10,15 0/0:.:61:60:61:0,60,1170 +chrX 1310858 . G C 203 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=3.19;BaseQRankSum=-1.699;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.966;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.19;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.430;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,41:73:99:.:233,0:13,19,20,21 0/0:.:61:60:61:0,60,1170 +chrX 1311121 . C T 101 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=2.34;BaseQRankSum=0.63;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.238;SOR=0.698;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,29:56:99:.:131,0:13,14,15,14 0/0:.:61:60:61:0,60,1170 +chrX 1311187 . G T 125 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=2.35;BaseQRankSum=0.853;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=10.444;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.35;ReadPosRankSum=-1.69;SOR=0.717;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,35:66:99:.:155,0:11,20,20,15 0/0:.:61:60:61:0,60,1170 +chrX 1311440 . TG T 115.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=3.16;BaseQRankSum=0.23;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=10.441;MQ=59.91;MQRankSum=1.149;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.392;SOR=1.732;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,27:49:99:.:155,0:10,12,19,8 0/0:.:61:60:61:0,60,1170 +chrX 1312229 . A G 2305 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=22.89;BaseQRankSum=-0.291;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.897;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.89;ReadPosRankSum=0.08;SOR=0.539;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1810,0:0,0,24,33 0/1:24,21:45:99:525,0,645:9,15,9,12 +chrX 1312428 . G C 949 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=8.98;BaseQRankSum=-0.122;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.711;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.784;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,34:57:99:307,0:12,11,12,22 0/1:27,25:52:99:672,0,736:12,15,15,10 +chrX 1312643 . A G 745 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=7.83;BaseQRankSum=0.502;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=9.745;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.466;SOR=1.565;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,31:52:99:242,0:12,9,22,9 0/1:27,20:47:99:533,0,757:12,15,12,8 +chrX 1312966 . T C 883 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.49;BaseQRankSum=-0.182;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=5.014;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.734;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:15:59:0,15 0/1:29,34:63:99:.:913,0,779:17,12,15,19 +chrX 1313274 . A T 3000 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=22.95;BaseQRankSum=-0.477;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.662;MQ=59.63;MQRankSum=0.644;QD=22.95;ReadPosRankSum=-1.091;SOR=0.532;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2260,0:0,0,39,31 0/1:31,31:62:99:770,0,829:19,12,18,13 +chrX 1313555 . CA C 2144.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=20.22;BaseQRankSum=0.113;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.846;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=0.599;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1543,0:0,0,25,29 0/1:26,28:54:99:641,0,577:10,16,9,19 +chrX 1313709 . C T 1984 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=21.43;BaseQRankSum=-1.108;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.893;MQ=59.06;MQRankSum=-0.684;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.560;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1548,0:0,0,25,24 0/1:24,21:45:99:466,0,622:10,14,7,14 +chrX 1313847 . G A 540 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.25;BaseQRankSum=0.562;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=12.051;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.615;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,189 0/1:19,21:40:99:.:570,0,488:5,14,12,9 +chrX 1314000 . G A 776 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.90;BaseQRankSum=0.827;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.35;SOR=0.826;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,189 0/1:28,30:58:99:.:806,0,704:14,14,16,14 +chrX 1314217 . CCCAACCCCA C 325.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=7.93;BaseQRankSum=3.304;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=8.742;MQ=57.47;MQRankSum=1.315;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=1.117;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,27:46:99:.:365,0:12,7,10,17 0/0:.:47:28:44:0,28,1261 +chrX 1314228 . TGCACCTGCCCAACCCCACTGCACCTGCCCAACCCCACTGCGCCTGCCCAACCCCACTGCATCTGCCCAACCACTCTGTGCCTGCCC T 185.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=4.59;BaseQRankSum=2.237;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=8.049;MQ=56.90;MQRankSum=1.453;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=1.159;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,27:49:99:.:225,0:13,9,10,17 0/0:.:45:99:45:0,108,1360 +chrX 1314259 . ACC *,A 695.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,20;AS_QD=0.00,20.42;BaseQRankSum=0.427;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.761;MQ=55.99;MQRankSum=-2.518;QD=20.42;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=0.919;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,27,0:49:99:.:.:225,0,1191:.:13,9,10,17 0|2:16,0,20:36:99:0|1:1314259_ACC_A:735,783,1415,0,632,572:1314259:6,10,11,9 +chrX 1314264 . ACTGCGCCTGCCCAACCC *,A 679.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,20;AS_QD=0.00,17.54;BaseQRankSum=0.209;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.720;MQ=56.29;MQRankSum=-2.993;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=0.884;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,27,0:49:99:.:.:225,0,1191:.:13,9,10,17 0|2:21,0,20:41:99:0|1:1314259_ACC_A:719,782,1624,0,842,782:1314259:9,12,11,9 +chrX 1314285 . T *,A 688 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,19;AS_QD=0.00,18.89;BaseQRankSum=-0.076;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.802;MQ=55.99;MQRankSum=-2.916;QD=18.89;ReadPosRankSum=2.206;SOR=0.811;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,27,0:49:99:.:.:225,0,1191:.:13,9,10,17 0|2:19,0,19:38:99:0|1:1314259_ACC_A:718,775,1546,0,772,714:1314259:6,13,10,9 +chrX 1314319 . A G 836 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=27.94;BaseQRankSum=1.315;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.04;MQRankSum=1.673;QD=27.94;ReadPosRankSum=1.906;SOR=0.566;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:6,25:31:99:.:866,0:2,4,10,15 0/0:.:36:48:36:0,48,720 +chrX 1314333 . C T 153 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=6.31;BaseQRankSum=0.14;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=1.862;MQ=57.73;MQRankSum=-2.648;QD=6.31;ReadPosRankSum=-2.364;SOR=1.289;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:90:28:.:.:0,90 0|1:23,6:29:99:.:0|1:1314259_ACC_A:183,0,929:1314259:11,12,4,2 +chrX 1314338 . C G 975 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.63;BaseQRankSum=2.385;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=2.277;MQ=57.72;MQRankSum=-0.764;QD=17.63;ReadPosRankSum=1.82;SOR=1.106;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:5,24:29:99:.:.:909,0:.:2,3,8,16 0|1:24,4:28:96:0|1:1314259_ACC_A:96,0,977:1314259:11,13,2,2 +chrX 1314482 . A G,ACCCAACCCCACTGTGCCTGCTCAACCGCACTGCACCTGCCCAATCCCACTGCACCTG 810 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,7;AS_QD=13.14,20.21;BaseQRankSum=2.499;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=29.074;MQ=56.94;MQRankSum=-0.321;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.578;SOR=1.405;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,21,0:36:99:274,0,725:11,4,4,17 0/2:6,0,7:13:99:566,288,780,0,203,150:6,0,5,2 +chrX 1314864 . CCAACCGCACTGCACCTGCCCAACCACACTGAACCTGCT C 447.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=31.31;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.76;QD=44.27;SOR=2.494;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:487,0:0,0,9,2 0/0:.:25:34:23:0,34,700 +chrX 1315022 . A G 1012 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=33;AS_QD=31.58;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.18;QD=31.58;SOR=0.880;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,33:33:99:.:1042,0:0,0,18,15 ./.:.:62:.:62:0,0,0 +chrX 1315210 . A C 2777 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=23.79;BaseQRankSum=2.242;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=13.658;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.79;ReadPosRankSum=0.329;SOR=1.539;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,57:58:99:1815,0:1,0,19,38 0/1:26,34:60:99:992,0,703:14,12,11,23 +chrX 1315546 . C G 902 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=7.58;BaseQRankSum=0.886;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=4.330;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.851;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,27:53:25:25,0:15,11,13,14 0/1:36,34:70:99:907,0,916:18,18,14,20 +chrX 1315585 . T G 2847 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=23.39;BaseQRankSum=0.179;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.797;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.39;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.723;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1968,0:0,0,31,30 0/1:29,33:62:99:909,0,773:15,14,14,19 +chrX 1315770 . AATAGATAGATAGATAG A 915.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=18.37;BaseQRankSum=-1.324;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=3.925;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.815;SOR=0.723;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,614 0|1:27,25:52:99:.:0|1:1315770_AATAGATAGATAGATAG_A:955,0,1044:1315770:11,16,14,11 +chrX 1315800 . TAGATAGATAGA T 1176.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=18.15;BaseQRankSum=-0.069;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=3.333;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.733;SOR=1.078;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,614 0|1:35,32:67:99:.:1|0:1315770_AATAGATAGATAGATAG_A:1216,0,1329:1315770:18,17,13,19 +chrX 1315821 . TAGATAGATG T 1140.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=17.10;BaseQRankSum=2.238;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.261;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.349;SOR=0.746;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1215 0|1:38,31:69:99:.:1|0:1315770_AATAGATAGATAGATAG_A:1180,0,1476:1315770:21,17,14,17 +chrX 1315856 . A G 961 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=7.80;BaseQRankSum=-0.433;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.403;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.042;SOR=0.558;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,34:64:45:.:.:45,0:.:18,12,17,17 0|1:37,26:63:99:1|0:1315770_AATAGATAGATAGATAG_A:946,0,1398:1315770:18,19,13,13 +chrX 1315953 . TGATA T 475.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=13.92;BaseQRankSum=0.474;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=1.289;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,107 0/1:23,14:37:99:.:515,0,821:12,11,5,9 +chrX 1316001 . CAGAT C 3072.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=34.97;BaseQRankSum=1.255;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.258;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.97;ReadPosRankSum=1.773;SOR=0.856;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2659,0:0,0,36,24 0/1:17,12:29:99:453,0,652:8,9,4,8 +chrX 1316031 . G GATAC 615.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=19.85;BaseQRankSum=0.027;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.377;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.018;SOR=0.405;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1530 0/1:16,17:33:99:.:655,0,610:6,10,8,9 +chrX 1316059 . A AATAGATAGATAGATAGATAG 933.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=9.63;BaseQRankSum=0.189;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.745;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.014;SOR=0.578;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,32:61:99:129,0:16,13,17,15 0/1:18,22:40:99:844,0,670:6,12,10,12 +chrX 1316199 . A G 1121 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=9.84;BaseQRankSum=-0.844;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=4.584;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=1.179;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:32,40:72:99:.:.:375,0:.:15,17,16,24 0|1:23,22:45:99:0|1:1316199_A_G:776,0,868:1316199:11,12,7,15 +chrX 1316222 . TAGATAGATGATAGATGAC T 953.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.76;BaseQRankSum=1.813;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.661;MQ=59.82;MQRankSum=-0.922;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.770;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:36,40:76:99:.:.:244,0:.:15,21,19,21 0|1:29,23:52:99:0|1:1316199_A_G:749,0,1153:1316199:12,17,6,17 +chrX 1316265 . GATA G 927.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=7.86;BaseQRankSum=1.85;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;MQRankSum=-0.28;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.674;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:32,39:71:99:.:.:270,0:.:14,18,19,20 0|1:31,21:52:99:0|1:1316199_A_G:697,0,1242:1316199:13,18,7,14 +chrX 1316269 . GATAGA G,GTAGA 880.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,35;AS_QD=1.84,9.48;BaseQRankSum=1.58;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.911;MQ=59.67;MQRankSum=0.697;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.199;SOR=0.728;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:31,0,22:53:99:269,1012,0:15,16,13,9 0/2:31,0,13:44:99:651,537,1851,0,1268,1227:13,18,6,7 +chrX 1316303 . T C,TAGAC,TAGATAGAC 597 . AC=1,0,0;AF=0.333,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=13,0,0;AS_QD=16.08,3.69,3.19;BaseQRankSum=1.612;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.17;MQRankSum=0.761;QD=16.08;ReadPosRankSum=2.25;SOR=0.684;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:6:59:0,6,6,6 0/1:26,13,0,0:39:99:.:627,0,1163,531,963,1601,544,1119,1592,1764:12,14,6,7 +chrX 1316609 . G A 2751 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=23.77;BaseQRankSum=0.107;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=7.060;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.77;ReadPosRankSum=0.531;SOR=1.131;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2302,0:0,0,42,28 0/1:28,19:47:99:479,0,757:13,15,12,7 +chrX 1316694 . T C 2949 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=23.46;BaseQRankSum=-0.249;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.46;ReadPosRankSum=1.496;SOR=0.636;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2272,0:0,0,39,29 0/1:31,28:59:99:707,0,826:18,13,15,13 +chrX 1316735 . C T 670 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.07;BaseQRankSum=-0.911;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=2.244;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.53;SOR=0.395;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:99:73:0,450 0/1:31,27:58:99:.:700,0,858:19,12,14,13 +chrX 1316970 . G A 3315 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=24.24;BaseQRankSum=1.191;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=6.475;MQ=58.97;MQRankSum=-0.214;QD=24.24;ReadPosRankSum=1.382;SOR=1.311;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,74:75:99:2506,0:0,1,49,25 0/1:32,31:63:99:839,0,818:17,15,18,13 +chrX 1317246 . C CTT,CTTT,CTTTT,CT 1448.97 . AC=0,2,0,1;AF=0.00,0.667,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,21,3,5;AS_QD=35.77,28.59,24.99,33.77;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.69;QD=43.76;SOR=1.609;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,5,5,3,0:13:89:866,179,0,89,331:0,0,3,10 2/4:0,0,16,0,5:21:88:622,569,552,104,124,88,569,552,124,552,392,380,0,380,332:0,0,8,13 +chrX 1317342 . C T 447 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=6.19;BaseQRankSum=2.067;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=7.597;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.09;SOR=0.847;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,22:44:20:20,0:14,8,9,13 0/1:17,16:33:99:457,0,437:9,8,7,9 +chrX 1317573 . A T,AT 1182 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=48,18;AS_QD=11.50,11.75;BaseQRankSum=0.555;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.536;MQ=59.42;MQRankSum=-1.374;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=1.027;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,21,18:39:99:517,361,0:0,0,19,20 0/1:26,27,0:53:99:695,0,623,772,704,1475:14,12,8,19 +chrX 1318095 . TC T 416.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=9.91;BaseQRankSum=-0.569;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=4.427;MQ=59.13;MQRankSum=0;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.628;SOR=0.894;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,29:46:99:.:456,0:10,7,12,17 0/0:.:36:21:35:0,21,968 +chrX 1318155 . A AT 431.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.47;BaseQRankSum=1.149;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.206;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.965;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:52:36:0,52 0/1:22,23:45:99:.:471,0,447:8,14,7,16 +chrX 1318463 . G A 774 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=7.96;BaseQRankSum=0.589;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.8;SOR=0.772;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,31:54:99:211,0:10,13,13,18 0/1:25,22:47:99:593,0,677:9,16,7,15 +chrX 1318847 . G A 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=3.45;BaseQRankSum=-2.262;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;MQRankSum=-0.797;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.51;SOR=0.602;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,19:33:99:.:114,0:4,10,6,13 0/0:.:46:72:46:0,72,1115 +chrX 1318916 . C CA 359.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=5.05;BaseQRankSum=-0.795;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.906;MQ=59.55;MQRankSum=0;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=0.889;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,21:39:41:41,0:4,14,6,15 0/1:22,18:40:99:358,0,465:10,12,6,12 +chrX 1318955 . G A 426 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.13;BaseQRankSum=2.416;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=6.529;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.13;ReadPosRankSum=2.412;SOR=1.739;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:35:50:0,35 0/1:28,17:45:99:.:456,0,763:14,14,5,12 +chrX 1319153 . G A 970 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=17.54;BaseQRankSum=0.409;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.871;MQ=59.50;MQRankSum=-0.09;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.482;SOR=1.383;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:35:50:.:.:0,35 0|1:30,27:57:99:.:0|1:1319153_G_A:1000,0,1157:1319153:17,13,19,8 +chrX 1319156 . T C 967 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=17.19;BaseQRankSum=-1.678;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.815;MQ=59.49;MQRankSum=-0.124;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.85;SOR=1.303;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:35:50:.:.:0,35 0|1:31,27:58:99:.:0|1:1319153_G_A:997,0,1199:1319153:18,13,19,8 +chrX 1319328 . C T 681 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=6.71;BaseQRankSum=1.69;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=4.727;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.749;SOR=1.136;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,24:49:6:6,0:10,15,14,10 0/1:29,28:57:99:705,0,724:17,12,17,11 +chrX 1319714 . GT G 661.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.31;BaseQRankSum=1.528;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=59.71;MQRankSum=0.907;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.073;SOR=0.671;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:49:49:.:.:0,49 0|1:28,21:49:99:.:0|1:1319714_GT_G:701,0,1019:1319714:15,13,10,11 +chrX 1319727 . T G 668 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=13.96;BaseQRankSum=-1.316;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.107;MQ=59.68;MQRankSum=0.891;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.625;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:49:49:.:.:0,49 0|1:29,21:50:99:.:0|1:1319714_GT_G:698,0,1049:1319714:16,13,10,11 +chrX 1319918 . T C 86 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=2.42;BaseQRankSum=-0.559;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=3.965;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.473;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,25:48:99:.:116,0:14,9,12,13 0/0:.:56:63:56:0,63,1281 +chrX 1320499 . C CT 1277.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=16.46;BaseQRankSum=0.308;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=3.558;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.685;SOR=1.244;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1126,0:0,0,30,16 0/1:22,12:34:99:191,0,449:12,10,8,4 +chrX 1320664 . ATT A 170.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=6.36;BaseQRankSum=0.252;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.691;MQ=59.72;MQRankSum=-1.148;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=0.477;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,855 0/1:22,11:33:99:.:210,0,496:7,15,6,5 +chrX 1321196 . A G 736 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.02;BaseQRankSum=0.106;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=-0.831;QD=15.02;ReadPosRankSum=-1.208;SOR=0.643;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,855 0/1:22,29:51:99:.:766,0,547:8,14,11,18 +chrX 1321256 . T C 665 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.63;BaseQRankSum=-0.976;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.407;MQ=59.93;MQRankSum=-0.904;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.934;SOR=1.079;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,855 0/1:24,27:51:99:.:695,0,631:10,14,9,18 +chrX 1321309 . A G 647 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.82;BaseQRankSum=-1.341;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=-0.9;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.600;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,855 0/1:23,26:49:99:.:677,0,607:10,13,12,14 +chrX 1321378 . T A 725 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.80;BaseQRankSum=-1.333;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=7.160;MQ=59.30;MQRankSum=-2.0;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.834;SOR=0.462;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,855 0/1:29,30:59:99:.:755,0,771:19,10,14,16 +chrX 1321455 . T G 627 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.60;BaseQRankSum=1.186;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.549;MQ=59.02;MQRankSum=-2.189;QD=14.60;ReadPosRankSum=-1.502;SOR=0.547;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,855 0|1:24,21:45:99:.:0|1:1321455_T_G:657,0,798:1321455:14,10,10,11 +chrX 1321470 . A AAAAT 578.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.73;BaseQRankSum=1.703;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.683;MQ=59.48;MQRankSum=-2.046;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=0.317;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,855 0|1:26,19:45:99:.:0|1:1321455_T_G:618,0,905:1321455:17,9,10,9 +chrX 1321537 . T G 542 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.43;BaseQRankSum=-1.304;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.891;SOR=0.826;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,855 0/1:22,24:46:99:.:572,0,588:14,8,16,8 +chrX 1321574 . C CA 442.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.48;BaseQRankSum=-0.673;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=6.349;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=0.335;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,855 0/1:19,27:46:99:.:482,0,314:13,6,13,14 +chrX 1321653 . G A 656 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.63;BaseQRankSum=2.079;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.582;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.359;SOR=0.639;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,855 0/1:33,26:59:99:.:686,0,810:19,14,12,14 +chrX 1321858 . G A 2842 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=22.44;BaseQRankSum=2.959;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.723;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.44;ReadPosRankSum=1.482;SOR=0.798;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,68:69:99:2259,0:0,1,33,35 0/1:36,23:59:99:613,0,919:18,18,9,14 +chrX 1321891 . G A 2685 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=22.44;BaseQRankSum=-0.354;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.670;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.44;ReadPosRankSum=1.16;SOR=0.701;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2241,0:0,0,35,34 0/1:33,19:52:99:474,0,949:18,15,6,13 +chrX 1322062 . G A 581 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=1.273;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=13.641;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.01;SOR=0.755;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1623 0/1:29,22:51:99:.:611,0,830:21,8,9,13 +chrX 1322095 . T C 2262 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=23.15;BaseQRankSum=-2.557;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.943;MQ=59.92;MQRankSum=-0.873;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.931;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1711,0:0,0,27,26 0/1:21,25:46:99:581,0,584:11,10,18,7 +chrX 1322099 . A ATTATTTAT,ATTATTTATTTAT 2142.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=17,40;AS_QD=28.04,28.06;BaseQRankSum=-0.815;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;MQRankSum=-1.072;QD=30.31;ReadPosRankSum=-1.93;SOR=0.677;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,15:32:52:1179,0,52:0,0,16,16 0/2:15,0,25:40:99:1003,1050,1681,0,631,556:8,7,14,11 +chrX 1322169 . A G 2410 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=24.16;BaseQRankSum=-2.33;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=11.693;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.16;ReadPosRankSum=2.083;SOR=0.420;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1795,0:0,0,23,25 0/1:26,27:53:99:645,0,726:18,8,12,15 +chrX 1322271 . AT A 562.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=7.92;BaseQRankSum=1.072;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.686;SOR=0.691;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,23:35:99:252,0:6,6,12,11 0/1:23,18:41:99:350,0,460:12,11,8,10 +chrX 1322439 . GTTTTTTT G,GTTTTTTTT 637.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=19,39;AS_QD=10.27,14.72;BaseQRankSum=-2.289;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.745;SOR=0.977;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,19,19:38:99:389,122,0:0,0,16,22 0/2:7,0,20:27:46:288,309,411,0,103,46:3,4,6,14 +chrX 1322599 . T C 913 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=8.50;BaseQRankSum=-0.988;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.551;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.897;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,37:62:99:346,0:15,10,23,14 0/1:25,24:49:99:597,0,654:13,12,14,10 +chrX 1322668 . T C 1051 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=9.74;BaseQRankSum=2.29;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.455;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.018;SOR=0.492;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,42:71:99:516,0:15,14,22,20 0/1:18,22:40:99:565,0,496:5,13,9,13 +chrX 1322905 . A G 2928 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=23.66;BaseQRankSum=-0.604;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;MQRankSum=0;QD=23.66;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.758;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,61:62:99:1903,0:0,1,36,25 0/1:23,40:63:99:1055,0,517:14,9,24,16 +chrX 1323158 . T TATAAAATAAAATAAAATAAA,TATAAAATAAAATAAAATAAAATAAA,TATAAAATAAAATAAAATAAAATACA 1156.97 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=26,19,0;AS_QD=7.21,10.42,0.63;BaseQRankSum=-0.471;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.659;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:14,26,0,0:40:99:519,0,1144,1144:9,5,15,11 0/2:32,0,19,0:51:99:677,725,2060,0,1342,1279,648,2009,1343,2007:19,13,12,7 +chrX 1323236 . G A 608 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=7.98;BaseQRankSum=0.572;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=6.109;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=1.379;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,342 0/1:52,28:80:99:.:638,0,1341:28,24,19,9 +chrX 1323290 . G C 514 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=8.00;BaseQRankSum=-0.381;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=2.165;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.324;SOR=1.121;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,342 0/1:45,23:68:99:.:544,0,1280:23,22,14,9 +chrX 1323317 . C T 676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=10.23;BaseQRankSum=0.516;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.936;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.939;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,342 0/1:41,28:69:99:.:706,0,1106:21,20,16,12 +chrX 1323752 . C T 856 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.54;BaseQRankSum=0.91;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=58.78;MQRankSum=-2.367;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.880;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,342 0/1:24,33:57:99:.:886,0,558:12,12,18,15 +chrX 1323780 . A C 4035 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=30.11;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.04;QD=30.11;SOR=0.769;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2349,0:0,0,38,38 1/1:0,59:59:99:1716,174,0:0,0,32,27 +chrX 1323982 . C G 1285 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=32.07;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.07;SOR=1.075;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:44:15:44:0,15 1/1:0,41:41:99:.:1315,122,0:0,0,17,24 +chrX 1324013 . CA C 836.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=25.03;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;MQRankSum=6.002;QD=25.03;SOR=0.330;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:47:38:43:0,38 1/1:1,34:35:80:.:876,80,0:0,1,15,19 +chrX 1324413 . G GGAAA 1585.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=30.09;BaseQRankSum=0.35;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=4.324;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=30.09;ReadPosRankSum=-0.46;SOR=1.061;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1337,0:0,0,18,12 0/1:16,8:24:99:288,0,636:7,9,5,3 +chrX 1324452 . AAAAG A 1557.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=31.94;BaseQRankSum=0.41;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=10.874;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.94;ReadPosRankSum=0.462;SOR=2.780;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1269,0:0,0,25,4 0/1:12,9:21:99:328,0,477:8,4,9,0 +chrX 1324516 . A G 1091 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=24.37;BaseQRankSum=2.327;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=4.075;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=2.636;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:802,0:0,0,24,1 0/1:10,11:21:99:319,0,242:9,1,11,0 +chrX 1324560 . A G 1677 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=25.10;BaseQRankSum=-0.849;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.602;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1323,0:0,0,27,15 0/1:12,14:26:99:384,0,339:8,4,8,6 +chrX 1326083 . G C 49 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=1.05;BaseQRankSum=-0.16;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=6.007;MQ=59.94;MQRankSum=1.068;QD=1.05;ReadPosRankSum=-1.697;SOR=1.179;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,39:75:79:.:79,0:17,19,24,15 0/0:.:19:32:17:0,32,520 +chrX 1326122 . C T 95 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=1.69;BaseQRankSum=1.682;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=14.781;MQ=59.72;MQRankSum=0.038;QD=1.69;ReadPosRankSum=1.444;SOR=1.808;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,38:74:99:.:125,0:16,20,27,11 0/0:.:19:32:17:0,32,520 +chrX 1326321 . A G 1034 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=7.82;BaseQRankSum=-0.644;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.640;MQ=59.73;MQRankSum=1.15;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.325;SOR=0.792;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,35:63:99:168,0:15,13,15,20 0/1:37,36:73:99:896,0,967:14,23,15,21 +chrX 1326404 . T A 362 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=7.26;BaseQRankSum=1.514;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.346;MQ=59.91;MQRankSum=1.198;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.951;SOR=0.991;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,31:54:99:.:392,0:12,11,13,18 0/0:.:67:50:67:0,50,1578 +chrX 1326599 . C T 913 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.79;BaseQRankSum=-0.688;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.124;MQ=59.52;MQRankSum=0.54;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.479;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:46:45:0,46 0/1:18,35:53:99:.:943,0,407:11,7,19,16 +chrX 1326725 . C CA 712.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.35;BaseQRankSum=0.566;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.528;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.473;SOR=1.115;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:46:45:0,46 0/1:18,31:49:99:.:752,0,392:8,10,11,20 +chrX 1326782 . T G 886 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=13.67;BaseQRankSum=0.071;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.465;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.67;ReadPosRankSum=2.625;SOR=0.384;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:46:45:0,46 0/1:32,35:67:99:.:916,0,841:23,9,22,13 +chrX 1327118 . T G 1091 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.01;BaseQRankSum=-0.404;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.263;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.01;ReadPosRankSum=-1.174;SOR=1.146;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:46:45:.:.:0,46 0|1:39,31:70:99:.:0|1:1327118_T_G:1121,0,1525:1327118:20,19,19,12 +chrX 1327120 . T C 1091 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.01;BaseQRankSum=-1.245;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.263;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.01;ReadPosRankSum=-0.976;SOR=1.146;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:46:45:.:.:0,46 0|1:39,31:70:99:.:0|1:1327118_T_G:1121,0,1525:1327118:20,19,19,12 +chrX 1327296 . A G 1037 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=9.70;BaseQRankSum=0.715;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.552;MQ=58.89;MQRankSum=1.854;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=0.544;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,33:58:99:503,0:10,15,16,17 0/1:29,23:52:99:564,0,773:10,19,7,16 +chrX 1327504 . T C 349 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=6.53;BaseQRankSum=-2.695;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=5.743;MQ=59.50;MQRankSum=1.138;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.232;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,37:58:99:.:379,0:15,6,20,17 0/0:.:50:20:46:0,20,1120 +chrX 1327541 . A G 296 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=5.09;BaseQRankSum=-1.655;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=11.284;MQ=59.09;MQRankSum=0.541;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.541;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,38:64:99:.:326,0:18,8,17,21 0/0:.:50:20:46:0,20,1120 +chrX 1327603 . A G 197 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=3.24;BaseQRankSum=-1.407;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=10.405;MQ=59.56;MQRankSum=-0.265;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.574;SOR=1.485;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,39:70:99:.:227,0:17,14,13,26 0/0:.:50:20:46:0,20,1120 +chrX 1327902 . G A 36 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=1.05;BaseQRankSum=3.133;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.442;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.454;SOR=0.482;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,31:63:66:.:66,0:13,19,16,15 0/0:.:50:20:46:0,20,1120 +chrX 1328389 . A AT 772.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=22.56;BaseQRankSum=0.79;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.69;MQRankSum=1.464;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.560;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,17:19:99:395,0:0,2,5,12 1/1:0,17:17:50:417,50,0:0,0,4,13 +chrX 1328494 . C G 564 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=23.76;BaseQRankSum=-1.559;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.15;MQRankSum=1.417;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.085;SOR=0.999;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:38:55:38:.:.:0,55 0|1:9,16:25:99:.:0|1:1328494_C_G:594,0,328:1328494:5,4,10,6 +chrX 1328533 . A AT 634.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=22.47;BaseQRankSum=-1.453;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.630;MQ=58.87;MQRankSum=-0.083;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=1.236;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:38:55:38:.:.:0,55 0|1:11,19:30:99:.:0|1:1328494_C_G:674,0,375:1328494:7,4,14,5 +chrX 1328606 . ATT A 69.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=5.19;BaseQRankSum=1.354;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=2.172;MQ=59.77;MQRankSum=0.671;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.475;SOR=1.609;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:36:19:0,36 0/1:16,5:21:99:.:109,0,436:9,7,4,1 +chrX 1328673 . C T 332 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=12.93;BaseQRankSum=-0.482;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=5.904;MQ=59.14;MQRankSum=-0.929;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.08;SOR=1.144;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:36:19:0,36 0/1:14,14:28:99:.:362,0,369:9,5,5,9 +chrX 1329260 . G C 243 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=4.96;BaseQRankSum=1.523;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.704;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.017;SOR=1.214;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,31:55:99:.:273,0:12,12,19,12 0/0:.:55:83:55:0,83,1241 +chrX 1329315 . C T 149 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=3.51;BaseQRankSum=0.964;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=5.732;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=1.053;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,28:51:99:.:179,0:10,13,17,11 0/0:.:55:83:55:0,83,1241 +chrX 1329394 . C T 877 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.49;BaseQRankSum=0.919;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.479;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.085;SOR=0.978;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1555 0/1:23,32:55:99:.:907,0,584:13,10,13,19 +chrX 1329480 . T C 273 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=5.41;BaseQRankSum=-0.561;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=5.291;MQ=59.80;MQRankSum=0.154;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.511;SOR=0.648;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,31:56:99:.:303,0:15,10,14,17 0/0:.:49:34:36:0,34,873 +chrX 1329481 . G T 273 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=5.41;BaseQRankSum=-0.058;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.291;MQ=59.81;MQRankSum=0.154;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.648;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,31:56:99:.:303,0:15,10,14,17 0/0:.:49:34:36:0,34,873 +chrX 1329511 . G A 410 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=8.15;BaseQRankSum=-0.057;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=10.113;MQ=59.79;MQRankSum=0.269;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.194;SOR=1.354;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,32:54:99:.:440,0:13,9,11,21 0/0:.:49:34:36:0,34,873 +chrX 1329519 . A G 549 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=10.34;BaseQRankSum=-2.373;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=10.366;MQ=59.80;MQRankSum=0.368;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=1.596;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,35:56:99:.:579,0:12,9,11,24 0/0:.:49:34:36:0,34,873 +chrX 1329598 . C T 106 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=2.39;BaseQRankSum=1.048;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=5.959;MQ=59.49;MQRankSum=0.015;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.136;SOR=1.702;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,30:57:99:.:136,0:11,16,7,23 0/0:.:49:34:36:0,34,873 +chrX 1331066 . T G 302 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=5.63;BaseQRankSum=-0.806;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=12.163;MQ=59.65;MQRankSum=1.747;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.208;SOR=1.844;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,35:59:99:.:332,0:13,11,10,25 0/0:.:49:34:36:0,34,873 +chrX 1332318 . G A 6431 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=183;AS_QD=31.67;DP=190;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.31;SOR=1.483;VarDP=183 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,115:115:99:4309,0:0,0,81,34 1/1:0,68:68:99:2152,203,0:0,0,38,30 +chrX 1332429 . G C 2060 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=17.86;BaseQRankSum=1.619;DP=178;ExcessHet=0.0000;FS=8.290;MQ=59.87;MQRankSum=0.197;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=1.473;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,83:117:99:.:2090,0:17,17,54,29 0/0:.:60:99:60:0,117,1800 +chrX 1332539 . GT G 1325.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=12.41;BaseQRankSum=-0.231;DP=176;ExcessHet=0.0000;FS=2.723;MQ=58.20;MQRankSum=-3.01;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.573;SOR=0.439;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,76:110:99:.:1365,0:13,21,35,41 0/0:.:60:99:60:0,117,1800 +chrX 1332806 . C CT 2489.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=23.42;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.45;QD=23.42;SOR=0.769;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:1209,0:.:0,0,23,32 1|1:0,53:53:99:0|1:1332806_C_CT:1320,158,0:1332806:0,0,33,20 +chrX 1333057 . GC G 4915.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=139;AS_QD=28.12;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=35.65;SOR=0.767;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,89:89:99:3185,0:0,0,48,41 1/1:0,50:50:99:1770,150,0:0,0,24,26 +chrX 1333260 . A AT,ATT 854.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=1,26;AS_QD=32.99,34.38;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=33.11;SOR=0.922;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:92:99:92:0,515,515 2/2:0,1,26:27:56:.:894,634,558,84,56,0:0,0,15,12 +chrX 1333674 . G A 595 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=0.513;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=59.69;MQRankSum=-0.981;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.721;SOR=0.790;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:92:99:92:0,515 0/1:27,26:53:99:.:625,0,605:14,13,12,14 +chrX 1333900 . C T 3294 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=26.17;BaseQRankSum=-0.162;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.964;MQ=59.70;MQRankSum=0.846;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.992;SOR=0.839;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,81:81:99:2881,0:0,0,43,38 0/1:28,18:46:99:443,0,766:13,15,12,6 +chrX 1334132 . C G,T 71 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=34,34;AS_QD=0.70,1.53;BaseQRankSum=1.59;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=0.808;MQ=59.69;MQRankSum=0.579;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.31;SOR=0.880;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:32,34,34:100:55:.:101,55,0:16,16,37,31 0/0:.:48:57:48:0,57,1149,57,1149,1149 +chrX 1334150 . A C,T 609 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,23;AS_QD=0.00,12.78;BaseQRankSum=0.628;DP=168;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.576;SOR=0.576;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:116:99:116:0,1078,1078 0/2:27,2,23:52:99:.:639,691,1478,0,764,723:16,11,14,11 +chrX 1334253 . G C 1494 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=15.24;BaseQRankSum=-0.609;DP=172;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=1.446;QD=15.24;ReadPosRankSum=2.729;SOR=0.801;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,67:100:99:.:1524,0:12,21,23,44 0/0:.:66:74:66:0,74,1800 +chrX 1334262 . C T 1587 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=17.02;BaseQRankSum=-2.276;DP=166;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=1.531;QD=17.02;ReadPosRankSum=1.898;SOR=0.779;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,66:95:99:.:1617,0:11,18,24,42 0/0:.:66:74:66:0,74,1800 +chrX 1334314 . G A 1245 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=14.66;BaseQRankSum=1.102;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=0.900;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.66;ReadPosRankSum=-1.44;SOR=0.886;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,62:87:99:.:1275,0:12,13,27,35 0/0:.:66:74:66:0,74,1800 +chrX 1334459 . T C 2652 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=16.35;BaseQRankSum=-2.192;DP=176;ExcessHet=0.0000;FS=33.316;MQ=58.88;MQRankSum=2.919;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.333;SOR=0.378;VarDP=164 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,89:107:99:2064,0:15,3,41,48 0/1:29,28:57:99:618,0,784:21,8,13,15 +chrX 1334797 . G C 1695 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=29.74;BaseQRankSum=1.871;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.163;MQ=59.54;MQRankSum=-0.094;QD=29.74;ReadPosRankSum=0.717;SOR=0.389;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:49:59:0,49 1/1:1,57:58:99:.:1725,162,0:0,1,30,27 +chrX 1334865 . GA AA,GAA,GAAA,G 1295 . AC=0,1,1,1;AF=0.00,0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,32,15,20;AS_QD=0.00,25.78,30.24,18.85;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=19.20;SOR=1.131;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 3:0,2,17,15,0:34:40:636,1013,40,0,600:0,0,15,19 2/4:0,0,15,0,20:35:99:689,751,863,460,540,551,751,863,540,863,312,383,0,383,377:0,0,13,22 +chrX 1335060 . C A 308 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=6.04;BaseQRankSum=0.236;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.039;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.65;SOR=0.922;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,33:56:99:.:338,0:11,12,14,19 0/0:.:62:58:62:0,58,1453 +chrX 1335191 . G A 714 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.63;BaseQRankSum=1.062;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=6.440;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.241;SOR=0.993;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,1106 0/1:40,30:70:99:.:744,0,1021:17,23,18,12 +chrX 1335418 . AT A,ATT,TT 658 . AC=2,1,0;AF=0.667,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=37,17,2;AS_QD=5.75,7.38,0.00;BaseQRankSum=1.032;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=7.072;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=0.498;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,20,0,0:40:29:29,0,486,486:13,7,11,9 1/2:0,17,17,2:36:99:659,360,472,386,0,539,706,460,605,1545:0,0,15,21 +chrX 1335504 . G A 632 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.98;BaseQRankSum=-0.077;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.917;MQ=59.93;MQRankSum=-0.904;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.256;SOR=1.009;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:87:67:0,87 0/1:24,27:51:99:.:662,0,542:11,13,16,11 +chrX 1336122 . G A 646 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.08;BaseQRankSum=0.481;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;MQRankSum=1.129;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.846;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:87:67:0,87 0/1:22,26:48:99:.:676,0,521:11,11,14,12 +chrX 1336379 . C T 639 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.38;BaseQRankSum=-0.904;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.842;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.38;ReadPosRankSum=-1.262;SOR=0.625;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:87:67:0,87 0/1:24,26:50:99:.:669,0,644:10,14,14,12 +chrX 1336450 . G A 674 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.54;BaseQRankSum=-1.341;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.971;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.656;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:87:67:0,87 0/1:32,29:61:99:.:704,0,849:15,17,15,14 +chrX 1336550 . G GA 1017.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=25.78;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=25.78;SOR=1.075;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:87:67:0,87 1/1:0,41:41:99:.:1057,123,0:0,0,17,24 +chrX 1336907 . T C 2379 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=16.73;BaseQRankSum=0.442;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=1.552;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.519;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:37,38:75:61:61,0:23,14,20,18 1/1:0,69:69:99:2348,208,0:0,0,41,28 +chrX 1336938 . C T 951 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=16.63;BaseQRankSum=-1.543;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.63;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.598;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,595 0/1:23,36:59:99:.:981,0,601:16,7,24,12 +chrX 1337864 . C T 481 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=7.10;BaseQRankSum=0.74;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=3.380;MQ=44.99;MQRankSum=1.534;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.633;SOR=0.800;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,595 0/1:47,25:72:99:.:511,0,1123:21,26,14,11 +chrX 1337999 . C T 469 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.34;BaseQRankSum=2.517;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=11.766;MQ=49.98;MQRankSum=1.395;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.095;SOR=1.469;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:38:8:38:0,8 0/1:25,19:44:99:.:499,0,572:9,16,13,6 +chrX 1338139 . G T 244 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=7.21;BaseQRankSum=0.437;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.342;MQ=56.65;MQRankSum=-0.255;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.354;SOR=1.078;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,943 0/1:25,13:38:99:.:274,0,600:12,13,5,8 +chrX 1338404 . C T 808 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.24;BaseQRankSum=-0.114;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.440;MQ=58.04;MQRankSum=1.951;QD=15.24;ReadPosRankSum=2.207;SOR=1.121;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,943 0/1:24,31:55:99:.:838,0,597:15,9,22,9 +chrX 1338681 . G A 892 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.37;BaseQRankSum=0.641;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.198;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.37;ReadPosRankSum=1.457;SOR=1.085;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,943 0/1:27,33:60:99:.:922,0,717:13,14,13,20 +chrX 1338809 . G GT 573.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=10.05;BaseQRankSum=0.826;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.975;MQ=59.75;MQRankSum=-0.094;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.788;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,943 0/1:33,28:61:99:.:613,0,805:17,16,13,15 +chrX 1338863 . G A 864 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.55;BaseQRankSum=0.961;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.48;MQRankSum=0.022;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.93;SOR=0.816;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,943 0/1:33,33:66:99:.:894,0,864:15,18,14,19 +chrX 1339115 . T C 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.05;BaseQRankSum=1.263;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.243;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.956;SOR=0.980;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,943 0/1:31,26:57:99:.:687,0,827:16,15,11,15 +chrX 1339373 . T C 940 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.47;BaseQRankSum=-0.765;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=4.729;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.377;SOR=1.385;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,943 0/1:36,36:72:99:.:970,0,1004:17,19,12,24 +chrX 1339433 . G A 810 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=10.63;BaseQRankSum=0.138;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=3.071;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.379;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,943 0/1:45,34:79:99:.:840,0,1222:18,27,17,17 +chrX 1339519 . C T 813 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.04;BaseQRankSum=0.569;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.918;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.4;SOR=0.520;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,943 0/1:37,33:70:99:.:843,0,936:15,22,15,18 +chrX 1340707 . C T 4269 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=33.07;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.07;SOR=0.856;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2517,0:0,0,43,32 1/1:0,55:55:99:1782,165,0:0,0,27,28 +chrX 1340842 . C T 4097 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=31.50;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.50;SOR=0.708;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2123,0:0,0,32,35 1/1:0,64:64:99:2004,191,0:0,0,34,30 +chrX 1341116 . A T 3433 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=33.30;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=33.30;SOR=0.772;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1673,0:0,0,19,30 1/1:0,55:55:99:1790,165,0:0,0,31,24 +chrX 1341215 . G A 4072 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=32.30;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=32.30;SOR=0.993;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2123,0:0,0,39,27 1/1:0,61:61:99:1979,182,0:0,0,33,28 +chrX 1341255 . A G 6006 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=143;AS_QD=35.89;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=42.21;SOR=0.956;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,75:75:99:.:.:3149,0:.:0,0,42,33 1|1:0,68:68:99:0|1:1341255_A_G:2887,205,0:1341255:0,0,38,30 +chrX 1341269 . C T 5639 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=28.49;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=43.61;SOR=0.892;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,66:66:99:.:.:2891,0:.:0,0,37,29 1|1:0,64:64:99:0|1:1341255_A_G:2778,193,0:1341255:0,0,34,30 +chrX 1341301 . GA G 2901.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=26.74;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=26.74;SOR=0.767;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1287,0:0,0,24,24 1/1:0,62:62:99:1654,186,0:0,0,29,33 +chrX 1341374 . C CAT 4501.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=30.68;BaseQRankSum=1.936;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=1.481;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=30.68;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.531;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2907,0:0,0,38,27 0/1:40,43:83:99:1634,0,1509:23,17,19,24 +chrX 1341381 . GCA G 6170.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=144;AS_QD=30.13;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=43.13;SOR=0.904;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2903,0:0,0,38,27 1/1:0,79:79:99:3307,238,0:0,0,41,38 +chrX 1341544 . A ACT 6288.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=141;AS_QD=27.00;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=0.892;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,74:74:99:.:.:3324,0:.:0,0,36,38 1|1:0,67:67:99:0|1:1341544_A_ACT:3004,202,0:1341544:0,0,28,39 +chrX 1341546 . G C 6343 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=142;AS_QD=32.78;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=0.874;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,75:75:99:.:.:3369,0:.:0,0,37,38 1|1:0,67:67:99:0|1:1341544_A_ACT:3004,202,0:1341544:0,0,28,39 +chrX 1341548 . G A 6329 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=143;AS_QD=28.25;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=0.889;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,77:77:99:.:.:3399,0:.:0,0,37,40 1|1:0,66:66:99:0|1:1341544_A_ACT:2960,199,0:1341544:0,0,28,38 +chrX 1341553 . CATGT C 6118.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=139;AS_QD=29.01;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=0.895;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,75:75:99:.:.:3299,0:.:0,0,35,40 1|1:0,64:64:99:0|1:1341544_A_ACT:2859,193,0:1341544:0,0,28,36 +chrX 1341602 . G A 2211 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.01;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.01;SOR=0.693;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:9:73:0,9 1/1:0,70:70:99:.:2241,209,0:0,0,35,35 +chrX 1341661 . A G 4499 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=141;AS_QD=32.12;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.12;SOR=0.796;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2134,0:0,0,38,27 1/1:0,76:76:99:2395,227,0:0,0,36,40 +chrX 1341724 . G C 4531 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=33.54;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.54;SOR=0.784;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2145,0:0,0,33,31 1/1:0,72:72:99:2416,216,0:0,0,32,40 +chrX 1341847 . A G 4142 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=32.59;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.59;SOR=1.051;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2265,0:0,0,29,40 1/1:0,59:59:99:1907,176,0:0,0,25,34 +chrX 1341935 . C T 3430 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=32.64;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.64;SOR=0.770;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1805,0:0,0,26,29 1/1:0,51:51:99:1655,153,0:0,0,29,22 +chrX 1342025 . C T 3606 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=30.81;BaseQRankSum=2.071;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.81;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.389;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1845,0:0,0,24,35 1/1:1,58:59:99:1791,167,0:0,1,25,33 +chrX 1342099 . C T 3956 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=33.50;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.50;SOR=1.015;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2234,0:0,0,29,37 1/1:0,53:53:99:1752,159,0:0,0,22,31 +chrX 1342166 . C G 3523 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=32.60;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=0.869;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1979,0:0,0,34,28 1/1:0,47:47:99:1574,141,0:0,0,25,22 +chrX 1342191 . G A 3565 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=33.29;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.29;SOR=1.179;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2108,0:0,0,41,23 1/1:0,44:44:99:1487,132,0:0,0,24,20 +chrX 1342323 . A G 3588 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.89;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.89;SOR=0.693;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1841,0:0,0,29,27 1/1:0,54:54:99:1777,161,0:0,0,26,28 +chrX 1342559 . C CT 86.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=6.00;BaseQRankSum=0.153;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=4.018;MQ=59.57;MQRankSum=-1.058;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.559;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,685 0/1:12,9:21:99:.:126,0,182:4,8,5,4 +chrX 1342578 . G T 48 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=2.89;BaseQRankSum=-2.088;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=30.497;MQ=59.56;MQRankSum=0.676;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.356;SOR=4.161;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,685 0/1:20,7:27:78:.:78,0,563:5,15,7,0 +chrX 1342726 . A G 633 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.11;BaseQRankSum=0.239;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.687;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,685 0/1:21,26:47:99:.:663,0,479:8,13,10,16 +chrX 1342893 . G A 3082 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.11;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=33.11;SOR=1.464;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1569,0:0,0,33,14 1/1:0,47:47:99:1543,141,0:0,0,28,19 +chrX 1342944 . G A 770 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=18.18;BaseQRankSum=-0.144;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=9.221;MQ=59.98;MQRankSum=-0.709;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.403;SOR=1.220;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,526 0/1:16,28:44:99:.:800,0,402:6,10,18,10 +chrX 1343510 . CA C 1671.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=31.11;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.11;SOR=0.884;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,526 1/1:0,55:55:99:.:1711,165,0:0,0,30,25 +chrX 1343666 . C CA 193.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=12.94;BaseQRankSum=0.25;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=9.672;MQ=59.12;MQRankSum=-0.298;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.594;SOR=3.101;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,526 0/1:3,15:18:8:.:233,0,8:2,1,2,13 +chrX 1343775 . CT C 276.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=9.03;BaseQRankSum=1.018;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.958;MQ=59.51;MQRankSum=-1.032;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.019;SOR=0.321;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,526 0/1:19,16:35:99:.:316,0,387:12,7,8,8 +chrX 1343857 . A G 384 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=11.19;BaseQRankSum=-0.375;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.273;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.657;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:16:39:0,16 0/1:20,17:37:99:.:414,0,534:11,9,8,9 +chrX 1344084 . A G 561 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.94;BaseQRankSum=-1.398;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.418;SOR=1.051;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,278 0/1:30,24:54:99:.:591,0,1126:15,15,14,10 +chrX 1344097 . TTA T 1015.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=21.53;BaseQRankSum=0.33;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.53;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.705;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,278 0/1:22,27:49:99:.:1055,0,832:13,9,16,11 +chrX 1344131 . G C 1671 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=15.19;BaseQRankSum=-0.314;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.797;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.533;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,31:61:9:9,0:13,17,17,14 1/1:0,51:51:99:1692,153,0:0,0,25,26 +chrX 1344657 . T C 608 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=6.79;BaseQRankSum=0.435;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.676;MQ=59.51;MQRankSum=0.553;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.887;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,24:47:45:45,0:13,10,11,13 0/1:24,23:47:99:593,0,632:11,13,10,13 +chrX 1344878 . G C 697 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.47;BaseQRankSum=-0.88;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.678;SOR=0.586;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,189 0/1:20,27:47:99:.:727,0,524:11,9,14,13 +chrX 1345006 . CA C 1228.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=26.42;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;QD=26.42;SOR=0.963;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,189 1/1:0,48:48:99:.:1268,144,0:0,0,21,27 +chrX 1345233 . C A,CAA 553 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=3,37;AS_QD=0.00,7.38;BaseQRankSum=-0.828;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.102;MQ=59.56;MQRankSum=0.37;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.326;SOR=0.386;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:15,3,22:40:99:170,832,0:12,3,13,12 0/2:27,0,15:42:99:413,495,1396,0,901,856:17,10,11,4 +chrX 1345291 . G T 358 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=7.19;BaseQRankSum=1.319;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.997;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=0.275;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,32:54:99:.:388,0:15,7,17,15 0/0:.:58:99:58:0,99,1697 +chrX 1345691 . T C 537 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.61;BaseQRankSum=1.652;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.747;MQ=59.69;MQRankSum=-2.264;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.416;SOR=0.991;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,243 0/1:37,22:59:99:.:567,0,1008:17,20,13,9 +chrX 1345771 . C T 623 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=8.71;BaseQRankSum=1.226;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=10.591;MQ=59.81;MQRankSum=-1.879;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.486;SOR=0.577;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,243 0/1:48,27:75:99:.:653,0,1257:16,32,15,12 +chrX 1345928 . G C 762 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.89;BaseQRankSum=-1.094;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.226;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.665;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,243 0/1:27,30:57:99:.:792,0,748:12,15,16,14 +chrX 1346295 . T C 491 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=4.34;BaseQRankSum=-2.47;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=6.988;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.647;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,35:62:60:60,0:16,11,15,20 0/1:36,22:58:99:461,0,1028:21,15,11,11 +chrX 1346364 . G A 804 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.90;BaseQRankSum=1.52;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=7.343;MQ=59.36;MQRankSum=-1.047;QD=13.90;ReadPosRankSum=1.179;SOR=1.006;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,175 0|1:37,23:60:99:.:0|1:1346364_G_A:834,0,1432:1346364:22,15,9,14 +chrX 1346371 . A G 803 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.61;BaseQRankSum=0.137;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=7.398;MQ=59.33;MQRankSum=-0.967;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.133;SOR=1.015;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,175 0|1:34,23:57:99:.:0|1:1346364_G_A:833,0,1348:1346364:20,14,9,14 +chrX 1346644 . A G 540 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.18;BaseQRankSum=-0.59;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.039;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.558;SOR=0.507;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,175 0/1:33,23:56:99:.:570,0,939:14,19,11,12 +chrX 1347174 . T C 39 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=0.73;BaseQRankSum=0.147;DP=159;ExcessHet=0.0000;FS=5.118;MQ=59.59;MQRankSum=-0.509;QD=0.734;ReadPosRankSum=-0.62;SOR=0.357;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:46,48:94:69:.:69,0:28,18,24,24 0/0:.:64:51:64:0,51,1235 +chrX 1347587 . C G 31 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=0.91;BaseQRankSum=1.389;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.939;MQ=59.94;MQRankSum=1.015;QD=0.910;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.542;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,33:67:61:.:61,0:13,21,14,19 0/0:.:64:51:64:0,51,1235 +chrX 1347813 . T C 120 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=2.78;BaseQRankSum=0.129;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.860;MQ=59.27;MQRankSum=-0.437;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.535;SOR=1.215;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,29:54:99:.:150,0:12,13,18,11 0/0:.:64:51:64:0,51,1235 +chrX 1347906 . G A 1878 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=29.83;BaseQRankSum=2.313;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.34;MQRankSum=-0.165;QD=36.69;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=0.273;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,51:52:99:.:1908,0:0,1,24,27 0/0:.:64:51:64:0,51,1235 +chrX 1348036 . C CA 108.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=6.17;BaseQRankSum=-0.211;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=18.842;MQ=57.92;MQRankSum=-0.249;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=3.023;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,189 0/1:15,9:24:99:.:148,0,307:10,5,1,8 +chrX 1348068 . C T 1037 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=31.38;BaseQRankSum=2.649;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.98;MQRankSum=0;QD=31.38;ReadPosRankSum=-1.53;SOR=0.302;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,189 1/1:1,33:34:91:.:1067,91,0:0,1,15,18 +chrX 1348212 . G T 356 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=7.15;BaseQRankSum=-0.178;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.322;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.985;SOR=0.538;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,33:54:99:.:386,0:9,12,17,16 0/0:.:53:25:48:0,25,1300 +chrX 1348326 . G C 3015 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=23.07;BaseQRankSum=-0.321;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=7.134;MQ=59.65;MQRankSum=0;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.254;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2315,0:0,0,30,46 0/1:28,28:56:99:730,0,750:8,20,16,12 +chrX 1348397 . G C 1994 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.63;BaseQRankSum=-0.466;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=3.438;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.63;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.583;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,233 1/1:1,63:64:99:.:2024,158,0:0,1,35,28 +chrX 1348511 . A C 105 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=2.60;BaseQRankSum=0.574;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=9.895;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.688;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,28:52:99:.:135,0:16,8,12,16 0/0:.:51:27:42:0,27,1081 +chrX 1348692 . T G,C,TTCTC 1925 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=24,15,8;AS_QD=6.17,33.02,26.18;BaseQRankSum=-0.412;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.076;MQ=59.05;MQRankSum=-0.818;QD=30.08;ReadPosRankSum=1.169;SOR=0.544;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,24,0,0:42:99:259,0,1069,1069:6,12,10,14 2/3:0,0,15,8:23:99:1696,1369,1339,376,391,307,655,671,0,602:0,0,8,15 +chrX 1348696 . CTTTCTTTCTG C 133.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=3.76;BaseQRankSum=0.991;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.142;MQ=59.03;MQRankSum=-0.873;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.743;SOR=0.498;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,25:46:99:.:173,0:8,13,11,14 0/0:.:41:86:41:0,86,1146 +chrX 1348706 . G *,GTTTC 2054.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,47;AS_QD=37.94,31.37;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.28;QD=44.55;SOR=0.691;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:21,25,0:46:99:.:.:173,0,1104:.:8,13,11,14 2|2:0,0,47:47:99:0|1:1348706_G_GTTTC:2094,2094,2094,141,141,0:1348706:0,0,17,30 +chrX 1348732 . T TTC 3495.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=25.72;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=43.11;SOR=1.022;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1793,0:.:0,0,20,21 1|1:0,41:41:99:0|1:1348706_G_GTTTC:1742,122,0:1348706:0,0,15,26 +chrX 1348885 . T TTTC 3508.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.21;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.91;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:2108,0:0,0,25,22 1/1:0,32:32:96:1440,96,0:0,0,12,20 +chrX 1349187 . C CT 1561.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=19.77;BaseQRankSum=2.678;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=9.982;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.572;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,46:47:99:1209,0:1,0,21,25 0/1:15,19:34:99:392,0,291:10,5,8,11 +chrX 1349244 . C T 2526 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=29.05;BaseQRankSum=1.085;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;MQRankSum=0;QD=29.05;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=0.608;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1995,0:0,0,26,24 0/1:18,20:38:99:561,0,456:8,10,7,13 +chrX 1349357 . T C 2815 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=22.40;BaseQRankSum=2.514;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=8.234;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.622;SOR=1.230;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,65:67:99:2013,0:1,1,38,27 0/1:30,30:60:99:832,0,771:14,16,21,9 +chrX 1349626 . T G 1183 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=8.73;BaseQRankSum=1.848;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=3.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.496;SOR=0.478;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,32:61:99:144,0:9,20,17,15 0/1:36,42:78:99:1069,0,1018:16,20,16,26 +chrX 1350200 . A G 1745 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=12.50;BaseQRankSum=0.993;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=1.393;MQ=58.75;MQRankSum=1.25;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.563;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,34:61:99:.:.:134,0:.:18,9,19,15 0|1:36,45:81:99:0|1:1350200_A_G:1641,0,1294:1350200:24,12,31,14 +chrX 1350225 . C T 3587 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=26.60;BaseQRankSum=2.916;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=3.672;MQ=58.32;MQRankSum=-0.327;QD=26.60;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=0.411;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,55:58:99:.:.:1967,0:.:3,0,30,25 0|1:33,45:78:99:0|1:1350200_A_G:1650,0,1210:1350200:21,12,28,17 +chrX 1350588 . TA T 2123.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=34.86;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.06;SOR=1.118;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:2163,0:0,0,32,22 0/0:.:63:84:63:0,84,1260 +chrX 1350649 . C G 3193 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=29.75;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;QD=44.76;SOR=1.226;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,72:72:99:.:3223,0:0,0,44,28 0/0:.:60:0:60:0,0,297 +chrX 1350672 . T C 3255 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=29.24;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;QD=45.00;SOR=1.032;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,73:73:99:.:3285,0:0,0,42,31 0/0:.:57:0:57:0,0,302 +chrX 1350682 . G A 3180 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.21;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;QD=44.58;SOR=1.148;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,72:72:99:.:3210,0:0,0,43,29 0/0:.:61:0:61:0,0,312 +chrX 1350777 . C T 2127 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=22.47;BaseQRankSum=-1.342;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=3.006;MQ=59.34;MQRankSum=-1.067;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.02;SOR=0.931;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47:47:99:.:.:1564,0:.:0,0,27,20 0|1:27,22:49:99:0|1:1350777_C_T:593,0,736:1350777:13,14,12,10 +chrX 1350890 . A AGACAAAC 3309.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=29.12;BaseQRankSum=1.22;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.640;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=29.12;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.510;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:2418,0:0,0,23,31 0/1:36,25:61:99:931,0,1427:14,22,12,13 +chrX 1351001 . A G 2664 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=23.63;BaseQRankSum=2.267;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;MQRankSum=0;QD=23.63;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.792;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2014,0:0,0,29,32 0/1:28,25:53:99:680,0,687:13,15,9,16 +chrX 1351079 . T C 2337 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=21.32;BaseQRankSum=-0.595;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.819;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=0.566;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1695,0:0,0,29,25 0/1:30,27:57:99:672,0,801:13,17,13,14 +chrX 1351138 . T C 2405 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=21.36;BaseQRankSum=-2.898;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.773;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.604;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1936,0:0,0,28,31 0/1:32,23:55:99:499,0,898:14,18,10,13 +chrX 1351182 . A G 3052 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=24.46;BaseQRankSum=0.398;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.667;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=24.46;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.538;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2264,0:0,0,30,36 0/1:30,30:60:99:818,0,807:13,17,16,14 +chrX 1351339 . T TA 3483.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=26.89;BaseQRankSum=-1.456;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=2.615;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.706;SOR=1.044;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2483,0:0,0,39,26 0/1:34,32:66:99:1040,0,1033:17,17,17,15 +chrX 1351667 . C T 591 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.42;BaseQRankSum=2.248;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.096;MQ=59.40;MQRankSum=-0.021;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.923;SOR=0.446;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:64:61:0,64 0/1:26,24:50:99:.:621,0,590:15,11,12,12 +chrX 1351909 . C T 270 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=6.12;BaseQRankSum=0.521;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.754;MQ=58.98;MQRankSum=-1.536;QD=6.12;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=1.251;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:64:61:0,64 0/1:35,14:49:99:.:300,0,969:17,18,5,9 +chrX 1352044 . C T 938 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=7.50;BaseQRankSum=0.369;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=5.327;MQ=59.67;MQRankSum=0.02;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.461;SOR=1.010;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,36:71:45:45,0:16,19,21,15 0/1:25,33:58:99:923,0,654:13,12,19,14 +chrX 1352245 . G T 2841 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=23.15;BaseQRankSum=0.953;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.961;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.15;ReadPosRankSum=1.494;SOR=0.896;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2068,0:0,0,28,34 0/1:30,30:60:99:803,0,757:16,14,12,18 +chrX 1352649 . C G 2881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=23.86;BaseQRankSum=-1.113;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=0.653;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1964,0:0,0,28,29 0/1:29,36:65:99:947,0,754:14,15,19,17 +chrX 1352724 . C T 4330 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=32.78;BaseQRankSum=-0.117;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.78;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.653;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2759,0:.:0,0,36,26 0|1:30,41:71:99:0|1:1352724_C_T:1601,0,1115:1352724:17,13,21,20 +chrX 1352731 . T G 4355 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=32.48;BaseQRankSum=-0.57;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.770;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.48;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.822;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,64:64:99:.:.:2819,0:.:0,0,39,25 0|1:31,40:71:99:0|1:1352724_C_T:1566,0,1149:1352724:17,14,21,19 +chrX 1352821 . C T 3498 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=28.22;BaseQRankSum=0.075;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.939;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.977;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,66:66:99:.:.:2592,0:.:0,0,39,27 0|1:29,30:59:99:0|1:1352821_C_T:936,0,846:1352821:14,15,16,14 +chrX 1352880 . AATCCCCCATGATGGGTTTCATCATGAGTCATAGAACCCCCTATCATGGATTCCATCATGGGTCATGGGAACCCCCATCATGGGTCCCATCATGGTTCATAGG A 2731.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=21.99;BaseQRankSum=1.362;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=4.440;MQ=58.50;MQRankSum=-1.259;QD=21.99;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.400;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2099,0:.:0,0,25,29 0|1:48,24:72:99:0|1:1352821_C_T:672,0,1845:1352821:19,29,13,11 +chrX 1353263 . T TCATCATGGGTTCCACCATGAGTCATGGGATCCCC 2855.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=28.66;BaseQRankSum=2.003;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.149;MQ=59.41;MQRankSum=-0.904;QD=28.66;ReadPosRankSum=-2.467;SOR=0.532;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:2003,0:0,0,24,26 0/1:24,27:51:99:892,0,802:10,14,16,11 +chrX 1353326 . AC A 1480.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=19.00;BaseQRankSum=0.021;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.692;MQ=59.45;MQRankSum=-1.657;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.717;SOR=0.843;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1046,0:0,0,15,27 0/1:18,20:38:99:474,0,449:10,8,12,8 +chrX 1353805 . A AC 540.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.08;BaseQRankSum=-2.587;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=4.156;MQ=59.23;MQRankSum=-1.878;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.238;SOR=1.133;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:22:36:0,22 0/1:22,26:48:99:.:580,0,507:12,10,10,16 +chrX 1353943 . A ACC 37.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=11.00;BaseQRankSum=0.566;DP=46;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.76;MQRankSum=0.792;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.368;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,4:7:77:.:77,0:2,1,2,2 0/0:.:15:25:13:0,25,373 +chrX 1353965 . G A 814 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=31.26;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=38.36;SOR=1.765;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:844,0:0,0,4,10 0/0:.:15:25:13:0,25,373 +chrX 1353970 . A AC 69.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=5.74;BaseQRankSum=-0.854;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;MQRankSum=-0.333;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.374;SOR=1.329;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:7,12:19:99:.:109,0:1,2,3,9 0/0:.:30:16:30:0,16,714 +chrX 1353976 . A C 859 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=31.18;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;QD=38.65;SOR=1.911;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:889,0:0,0,4,11 0/0:.:32:0:32:0,0,70 +chrX 1354354 . G A 2198 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=23.96;BaseQRankSum=-1.372;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=23.96;ReadPosRankSum=-1.523;SOR=0.784;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1426,0:0,0,23,22 0/1:18,30:48:99:802,0,472:10,8,20,10 +chrX 1354393 . A C 1984 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=22.63;BaseQRankSum=-1.669;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=22.63;ReadPosRankSum=2.692;SOR=0.602;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1300,0:0,0,22,19 0/1:21,27:48:99:714,0,566:13,8,18,9 +chrX 1354508 . A G 1511 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=21.70;BaseQRankSum=0.429;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.231;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.96;SOR=0.768;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:863,0:0,0,17,9 0/1:20,25:45:99:678,0,490:9,11,11,14 +chrX 1354641 . A G 301 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=13.24;BaseQRankSum=1.693;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=3.682;MQ=57.75;MQRankSum=-0.052;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=1.609;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,4:4:99:111,0:0,0,4,0 0/1:12,9:21:99:220,0,244:6,6,5,4 +chrX 1354978 . A AAGGTGG 50.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=30.07;DP=22;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=45.00;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,2:2:90:.:90,0:0,0,2,0 0/0:.:12:0:12:0,0,199 +chrX 1354995 . AGAG A 95.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=31.23;DP=16;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=2.833;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,3:3:99:.:135,0:0,0,3,0 0/0:.:10:0:10:0,0,29 +chrX 1355020 . AG A 180.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=33.74;DP=26;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.52;QD=36.67;SOR=0.693;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,6:6:99:.:220,0:0,0,3,3 0/0:.:13:0:13:0,0,49 +chrX 1355080 . A AAGG 230.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=27.96;DP=29;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.64;QD=45.00;SOR=2.303;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,6:6:99:.:270,0:0,0,5,1 0/0:.:14:0:14:0,0,213 +chrX 1355656 . G T 2005 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=22.12;BaseQRankSum=3.878;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.717;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,49:53:99:1505,0:1,3,32,17 0/1:19,20:39:99:530,0,414:13,6,10,10 +chrX 1356186 . CTCCTAAA C 180.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=3.14;BaseQRankSum=-0.36;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=1.933;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.14;ReadPosRankSum=1.206;SOR=0.597;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,37:70:99:.:220,0:15,18,19,18 0/0:.:65:93:65:0,93,1240 +chrX 1356428 . A G 712 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=8.24;BaseQRankSum=1.894;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.831;MQ=59.90;MQRankSum=1.53;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.576;SOR=0.526;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,23:44:99:125,0:6,15,11,12 0/1:24,22:46:99:617,0,641:9,15,6,16 +chrX 1356785 . A C 3251 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=22.94;BaseQRankSum=1.462;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=3.626;MQ=59.70;MQRankSum=0.957;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.403;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,78:78:99:2491,0:0,0,34,44 0/1:35,30:65:99:790,0,882:13,22,16,14 +chrX 1356997 . A G 2792 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=21.71;BaseQRankSum=0.058;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=3.677;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.276;SOR=0.389;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1781,0:0,0,35,20 0/1:36,39:75:99:1041,0,967:23,13,16,23 +chrX 1357011 . G A 2898 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=22.52;BaseQRankSum=2.774;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=3.677;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.389;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1871,0:0,0,36,21 0/1:36,37:73:99:1057,0,911:23,13,15,22 +chrX 1357573 . T C 2929 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=31.15;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;QD=31.15;SOR=1.053;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1531,0:0,0,22,28 1/1:0,45:45:99:1428,134,0:0,0,18,27 +chrX 1357679 . G A 2403 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=23.17;BaseQRankSum=2.129;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.569;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=23.17;ReadPosRankSum=-0.26;SOR=1.264;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1711,0:0,0,19,37 0/1:24,25:49:99:722,0,647:12,12,12,13 +chrX 1359575 . T C 1637 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=22.84;BaseQRankSum=-0.693;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.29;SOR=0.808;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1231,0:0,0,17,19 0/1:20,17:37:99:436,0,534:10,10,8,9 +chrX 1360031 . ATC A 1915.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=29.18;BaseQRankSum=-0.252;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.280;MQ=59.58;MQRankSum=-1.899;QD=29.18;ReadPosRankSum=1.036;SOR=1.132;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30:30:99:.:.:1330,0:.:0,0,22,8 0|1:20,17:37:99:0|1:1360031_ATC_A:625,0,751:1360031:10,10,6,11 +chrX 1360057 . A G 2126 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=27.64;BaseQRankSum=1.868;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=11.141;MQ=59.54;MQRankSum=-1.506;QD=27.64;ReadPosRankSum=-1.721;SOR=1.285;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,37:37:99:.:.:1494,0:.:0,0,27,10 0|1:22,19:41:99:0|1:1360031_ATC_A:662,0,722:1360031:9,13,9,10 +chrX 1360139 . G A 1456 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=19.05;BaseQRankSum=-1.534;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=6.974;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.593;SOR=1.189;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1210,0:0,0,28,16 0/1:20,14:34:99:276,0,499:9,11,8,6 +chrX 1360220 . TTCTCTGTGTCTGTCTCTGTATCTCTCTCCCTTTCTCCCTCCATCTTTCTCTCTCTCTCCTGGTCTCTATCTCCCCCTCTCCCTGTC T 2190.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=28.59;BaseQRankSum=1.506;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.899;MQ=58.57;MQRankSum=-0.345;QD=28.59;ReadPosRankSum=-1.165;SOR=0.586;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1727,0:0,0,19,20 0/1:25,14:39:99:503,0,970:14,11,9,5 +chrX 1361202 . C CCTCT 722.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=12.49;BaseQRankSum=-0.533;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.018;MQ=56.69;MQRankSum=-1.456;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=0.521;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,39:61:99:.:762,0:13,9,21,18 0/0:.:48:5:48:0,5,1270 +chrX 1361666 . T A 671 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.95;BaseQRankSum=1.768;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=5.041;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.114;SOR=0.835;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:47:49:0,47 0/1:13,24:37:99:.:701,0,301:8,5,10,14 +chrX 1361755 . GAA G,GA 487.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=14,24;AS_QD=7.07,13.87;BaseQRankSum=1.182;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=6.682;MQ=58.89;MQRankSum=0;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.784;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,12,14:27:99:379,181,0:0,1,15,11 0/2:13,2,10:25:99:148,157,630,0,234,183:5,8,7,5 +chrX 1362130 . GTC G 1243.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=22.91;BaseQRankSum=-0.423;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.327;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.91;ReadPosRankSum=-1.083;SOR=0.824;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,128 0/1:22,34:56:99:.:1283,0,772:10,12,19,15 +chrX 1362165 . C CCT 1183.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=23.08;BaseQRankSum=-1.106;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.08;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.557;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,128 0/1:18,35:53:99:.:1223,0,549:8,10,17,18 +chrX 1362634 . T C 1085 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=18.58;BaseQRankSum=0.372;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=3.894;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.323;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:80:99:80:0,363 0/1:21,39:60:99:.:1115,0,510:6,15,16,23 +chrX 1362690 . G A 1124 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=7.90;BaseQRankSum=0.18;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=4.020;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.90;ReadPosRankSum=-1.16;SOR=0.438;VarDP=146 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:41,42:83:15:15,0:18,23,19,23 0/1:20,43:63:99:1139,0,467:4,16,18,25 +chrX 1362769 . T TTTTA 931.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=26.97;BaseQRankSum=1.461;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.672;SOR=0.859;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,124 0/1:12,24:36:99:.:971,0,432:6,6,11,13 +chrX 1362807 . G A 708 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.40;BaseQRankSum=-0.192;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.307;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.287;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,124 0/1:18,27:45:99:.:738,0,461:12,6,14,13 +chrX 1363126 . T C 345 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=8.33;BaseQRankSum=1.162;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=0.723;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,124 0/1:29,16:45:99:.:375,0,762:13,16,7,9 +chrX 1363393 . C T 397 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=10.68;BaseQRankSum=2.248;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.66;MQRankSum=-1.718;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.58;SOR=0.845;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,124 0/1:24,16:40:99:.:427,0,594:10,14,6,10 +chrX 1363436 . G C 385 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=10.64;BaseQRankSum=0.651;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.309;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.402;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,124 0/1:23,16:39:99:.:415,0,638:8,15,7,9 +chrX 1363494 . G A 723 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=17.93;BaseQRankSum=-0.558;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.749;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.93;ReadPosRankSum=1.235;SOR=0.493;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,124 0/1:15,27:42:99:.:753,0,359:6,9,14,13 +chrX 1364200 . A T 864 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=8.94;BaseQRankSum=0.335;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.314;SOR=0.683;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,30:53:99:212,0:11,12,16,14 0/1:20,27:47:99:682,0,424:11,9,13,14 +chrX 1364797 . T A 5325 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=28.92;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;MQRankSum=-0.143;QD=42.84;SOR=0.530;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2498,0:.:0,0,23,34 1|1:3,65:68:99:0|1:1364797_T_A:2857,187,0:1364797:1,2,31,34 +chrX 1364798 . A T 5310 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=30.50;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=1.579;MQ=59.76;MQRankSum=-0.253;QD=41.72;SOR=0.449;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2498,0:.:0,0,23,34 1|1:6,65:71:99:0|1:1364797_T_A:2842,178,0:1364797:2,4,31,34 +chrX 1367572 . C A 286 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=6.08;BaseQRankSum=0.191;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.96;MQRankSum=1.015;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.741;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:9,10:19:59:59,0:3,6,7,3 0/1:21,12:33:99:257,0,442:17,4,8,4 +chrX 1368251 . G A 864 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=7.15;BaseQRankSum=0.069;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.284;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.490;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,33:65:32:32,0:13,19,15,18 0/1:28,32:60:99:862,0,743:13,15,17,15 +chrX 1368745 . G A 411 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=7.47;BaseQRankSum=0.555;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.08;MQRankSum=0.208;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.680;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:15,16:31:77:.:.:77,0:.:5,10,5,11 0|1:16,12:28:99:0|1:1368745_G_A:364,0,498:1368745:6,10,5,7 +chrX 1368776 . C G 247 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=12.59;BaseQRankSum=0.6;DP=31;ExcessHet=0.0000;FS=2.780;MQ=48.41;MQRankSum=0.694;QD=12.59;ReadPosRankSum=1.082;SOR=0.105;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:9:59:9:.:.:0,59 0|1:14,8:22:99:.:0|1:1368745_G_A:277,0,564:1368745:1,13,2,6 +chrX 1368778 . G T 215 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=11.67;BaseQRankSum=0;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=6.067;MQ=47.79;MQRankSum=0.378;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.078;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:9:59:9:.:.:0,59 0|1:14,7:21:99:.:0|1:1368745_G_A:245,0,567:1368745:1,13,2,5 +chrX 1368785 . A G 173 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=10.15;BaseQRankSum=0.246;DP=29;ExcessHet=0.0000;FS=6.952;MQ=47.09;MQRankSum=0;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.097;SOR=0.055;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:9:59:9:.:.:0,59 0|1:14,6:20:99:.:0|1:1368745_G_A:203,0,570:1368745:1,13,2,4 +chrX 1368803 . G A 150 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=0;DP=25;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=42.94;MQRankSum=0.875;QD=12.00;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=0.223;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:9:59:9:.:.:0,59 0|1:10,5:15:99:.:0|1:1368745_G_A:180,0,405:1368745:1,9,1,4 +chrX 1375953 . G C 37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=2;AS_QD=33.50;DP=3;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=28.54;QD=33.50;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:1:.:1:0,0 1/1:0,2:2:6:.:67,6,0:0,0,2,0 +chrX 1376130 . C T 85 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=28.75;DP=7;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=24.00;QD=28.75;SOR=3.258;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,4:4:99:.:115,0:0,0,4,0 0/0:.:3:0:3:0,0,45 +chrX 1376945 . A C 327 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=10.50;BaseQRankSum=0.338;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=3.176;MQ=39.21;MQRankSum=-1.887;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.56;SOR=1.044;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:43:38:25:.:.:0,38 0|1:21,13:34:99:.:0|1:1376945_A_C:357,0,548:1376945:12,9,5,8 +chrX 1376963 . G A 236 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=3.13;BaseQRankSum=1.229;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=5.599;MQ=41.37;MQRankSum=-0.349;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.554;SOR=1.135;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,25:47:99:131,0:13,9,15,10 0/1:30,8:38:99:135,0,1019:12,18,5,3 +chrX 1377062 . G C 475 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=4.81;BaseQRankSum=0.065;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.595;MQ=52.95;MQRankSum=-3.283;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.806;SOR=0.545;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,34:63:2:2,0:19,10,20,14 0/1:21,21:42:99:503,0,603:13,8,13,8 +chrX 1377105 . C CAG 1302.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=10.40;BaseQRankSum=1.137;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=6.590;MQ=57.22;MQRankSum=-2.968;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.941;SOR=0.812;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,35:65:99:175,0:19,11,15,20 0/1:33,31:64:99:1167,0,1252:16,17,14,17 +chrX 1377287 . C G 184 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=3.63;BaseQRankSum=1.783;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=-0.885;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.607;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,32:59:99:.:214,0:15,12,17,15 0/0:.:67:55:67:0,55,1229 +chrX 1377633 . G A 104 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=2.35;BaseQRankSum=1.204;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.35;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.712;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,30:57:99:.:134,0:10,17,11,19 0/0:.:67:55:67:0,55,1229 +chrX 1377728 . C G 66 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=2.82;BaseQRankSum=3.117;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.394;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.053;SOR=1.165;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,18:34:96:.:96,0:9,7,12,6 0/0:.:67:55:67:0,55,1229 +chrX 1377729 . G C 66 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=2.82;BaseQRankSum=2.23;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.394;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.424;SOR=1.165;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,18:34:96:.:96,0:9,7,12,6 0/0:.:67:55:67:0,55,1229 +chrX 1380100 . A G 625 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=-0.178;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=9.010;MQ=59.55;MQRankSum=0;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.299;SOR=1.613;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:49:40:0,49 0/1:19,26:45:99:.:655,0,462:11,8,8,18 +chrX 1380544 . G A 73 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=25.75;BaseQRankSum=0;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.75;ReadPosRankSum=1.15;SOR=1.609;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:49:40:.:.:0,49 0|1:1,3:4:33:.:0|1:1380544_G_A:103,0,33:1380544:1,0,3,0 +chrX 1380565 . C T 38 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=8.50;BaseQRankSum=-1.242;DP=18;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.69;MQRankSum=1.15;QD=8.50;ReadPosRankSum=0;SOR=1.863;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,6:8:68:.:68,0:2,0,6,0 0/0:.:6:12:6:0,12,139 +chrX 1380576 . G T 101 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=21.83;BaseQRankSum=-1.282;DP=23;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.329;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:12:99:12:.:.:0,199 0|1:2,4:6:62:.:0|1:1380544_G_A:131,0,62:1380544:2,0,4,0 +chrX 1380613 . T TGAG 395.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=19.77;BaseQRankSum=-0.301;DP=31;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.77;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=1.609;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,7:11:99:119,0:4,0,7,0 0/1:3,8:11:99:316,0,102:3,0,8,0 +chrX 1380656 . AG A 106.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=9.73;BaseQRankSum=-1.068;DP=27;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.73;ReadPosRankSum=2.374;SOR=1.112;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:6,9:15:99:.:146,0:6,0,9,0 0/0:.:14:21:12:0,21,338 +chrX 1380681 . A G 341 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.28;BaseQRankSum=1.251;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.28;ReadPosRankSum=2.351;SOR=0.793;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:10,12:22:99:112,0:10,0,12,0 0/1:9,9:18:99:259,0,247:9,0,9,0 +chrX 1380877 . A G 884 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=8.02;BaseQRankSum=0.528;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.760;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,34:58:99:313,0:12,12,17,17 0/1:32,24:56:99:601,0,854:17,15,14,10 +chrX 1380942 . T C 814 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=6.30;BaseQRankSum=-0.965;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.636;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,33:65:14:14,0:19,13,21,12 0/1:35,34:69:99:830,0,890:19,16,16,18 +chrX 1380985 . T G 1201 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=9.40;BaseQRankSum=-0.503;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.656;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,38:65:99:361,0:18,9,25,13 0/1:32,34:66:99:870,0,810:17,15,17,17 +chrX 1381116 . T C 250 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=4.91;BaseQRankSum=0.56;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.001;MQ=59.84;MQRankSum=1.64;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.564;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,32:57:99:.:280,0:10,15,14,18 0/0:.:59:99:59:0,120,1800 +chrX 1381244 . C T 256 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=4.93;BaseQRankSum=-0.114;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=0.25;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.811;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,34:58:99:.:286,0:12,12,16,18 0/0:.:59:99:59:0,120,1800 +chrX 1381505 . C T 619 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.80;BaseQRankSum=0.917;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.935;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:58:61:0,58 0/1:30,25:55:99:.:649,0,779:10,20,7,18 +chrX 1381948 . G T 2276 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=22.83;BaseQRankSum=0.312;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.822;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.482;SOR=0.804;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,38:41:99:1578,0:0,0,14,13 0/1:32,28:60:99:728,0,837:16,16,15,13 +chrX 1381968 . C T 289 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=5.15;BaseQRankSum=1.838;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.979;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.362;SOR=0.884;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,35:62:99:.:319,0:15,12,21,14 0/0:.:66:54:66:0,54,1676 +chrX 1382274 . G GCC 1926.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=14.35;BaseQRankSum=-1.791;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.649;MQ=59.26;MQRankSum=0;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.601;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:33,48:81:99:.:.:604,0:.:15,18,20,28 0|1:21,35:56:99:0|1:1382274_G_GCC:1362,0,749:1382274:9,12,19,16 +chrX 1382275 . A ACCGCGCCTGGTCCAAAGTGCCGGGATGACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGTCCAAAGTGCCGGGATGACAGGCGTGAGC,ACCGCGCCTGGTCCAAAGTGCCGGGATGACAGGCGTGAGC 1924.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=48,35;AS_QD=5.90,15.30;BaseQRankSum=-1.915;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.649;MQ=59.27;MQRankSum=0;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.601;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:33,48,0:81:99:.:.:602,0,2058:.:15,18,20,28 0|2:21,0,35:56:99:0|1:1382274_G_GCC:1362,1425,2279,0,854,749:1382274:9,12,19,16 +chrX 1382670 . A AT 305.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=4.42;BaseQRankSum=1.125;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.819;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.42;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.512;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,25:49:41:41,0:13,11,13,12 0/1:14,15:29:99:304,0,263:8,6,7,8 +chrX 1382756 . G GT 259.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=9.34;BaseQRankSum=1.347;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.428;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.358;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,179 0/1:17,15:32:99:.:299,0,350:11,6,8,7 +chrX 1382782 . G C 322 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=10.67;BaseQRankSum=-2.678;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=7.702;MQ=59.89;MQRankSum=0.974;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.176;SOR=0.846;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,179 0/1:18,15:33:99:.:352,0,517:12,6,6,9 +chrX 1383037 . AGTCTCG A 844.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=18.81;BaseQRankSum=-0.848;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=1.022;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.859;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,179 0/1:24,23:47:99:.:884,0,897:18,6,18,5 +chrX 1383292 . GGCCTGT G 880.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=9.48;BaseQRankSum=1.893;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=5.054;MQ=59.81;MQRankSum=-0.924;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.704;SOR=0.901;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,27:52:70:70,0:15,10,13,14 0/1:23,22:45:99:850,0,895:11,12,8,14 +chrX 1383328 . T C 400 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.94;BaseQRankSum=-1.598;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;MQRankSum=-1.394;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.855;SOR=0.693;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:35:42:0,35 0/1:18,18:36:99:.:430,0,498:8,10,8,10 +chrX 1383689 . C T 999 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.83;BaseQRankSum=0.879;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.656;SOR=0.446;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:35:42:0,35 0/1:28,37:65:99:.:1029,0,708:18,10,21,16 +chrX 1383947 . A AG 1211.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=16.46;BaseQRankSum=-0.426;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;MQRankSum=-1.332;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.577;SOR=0.663;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:35:42:0,35 0/1:36,40:76:99:.:1251,0,1114:15,21,17,23 +chrX 1384144 . A C 930 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=11.16;BaseQRankSum=-1.141;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.833;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=11.16;ReadPosRankSum=2.245;SOR=0.836;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,27:46:99:197,0:9,10,16,11 0/1:12,28:40:99:763,0,287:6,6,14,14 +chrX 1384474 . T C 854 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.68;BaseQRankSum=1.513;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.565;SOR=0.307;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,248 0/1:21,32:53:99:.:884,0,446:14,7,17,15 +chrX 1384500 . C T 793 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.53;BaseQRankSum=0.605;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.904;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.547;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,248 0/1:23,30:53:99:.:823,0,565:14,9,14,16 +chrX 1385385 . A G 249 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=5.47;BaseQRankSum=-2.552;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.657;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.448;SOR=0.585;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,248 0/1:36,15:51:99:.:279,0,997:15,21,8,7 +chrX 1387220 . T C 1191 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=9.47;BaseQRankSum=-0.049;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=9.465;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.884;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,35:62:99:236,0:11,16,19,16 0/1:31,36:67:99:985,0,826:14,17,22,14 +chrX 1387425 . C G 1344 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=10.49;BaseQRankSum=1.54;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=2.254;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.924;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,40:65:99:475,0:13,12,22,18 0/1:34,32:66:99:899,0,903:20,14,22,10 +chrX 1388051 . A G 789 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.43;BaseQRankSum=-0.759;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.992;MQ=58.37;MQRankSum=0.453;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.850;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:38:67:0,38 0/1:29,32:61:99:.:819,0,761:11,18,11,21 +chrX 1388153 . C T 47 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=1.07;BaseQRankSum=0.836;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.910;MQ=55.50;MQRankSum=-0.244;QD=1.07;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.497;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:35,37:72:77:.:77,0:15,20,18,19 0/0:.:62:78:62:0,78,1400 +chrX 1389083 . G A 766 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.96;BaseQRankSum=-0.886;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.226;MQ=59.72;MQRankSum=-0.881;QD=13.96;ReadPosRankSum=-1.018;SOR=0.784;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1198 0/1:26,31:57:99:.:796,0,658:12,14,17,14 +chrX 1389174 . A G 753 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=6.69;BaseQRankSum=-0.2;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=10.385;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.409;SOR=1.569;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,36:64:99:244,0:12,16,11,25 0/1:32,21:53:99:539,0,923:18,14,8,13 +chrX 1389431 . G A 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=-0.216;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=9.901;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=0.771;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1364 0/1:29,24:53:99:.:635,0,793:10,19,14,10 +chrX 1389690 . T C 647 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.82;BaseQRankSum=1.012;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=5.913;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.37;SOR=1.163;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1364 0/1:25,24:49:99:.:677,0,692:14,11,9,15 +chrX 1390577 . CA C 128.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=4.20;BaseQRankSum=-0.197;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=10.357;MQ=59.91;MQRankSum=-0.809;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.219;SOR=0.080;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,23:40:99:.:168,0:14,3,12,11 0/0:.:58:95:58:0,95,1221 +chrX 1390681 . G A 390 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=9.13;BaseQRankSum=0.396;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=1.174;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=0.815;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:78:99:78:0,1114 0/1:28,18:46:99:.:420,0,644:15,13,8,10 +chrX 1390818 . C A,CTTAGAGACGGGGTCTTGCTATGTTGCCCTGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAACGATCCTCCCTGGGCCTCTCCGAGTGCTGGGACACCCCGCCCTGCTAAGTTTAAAAA 740 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,5;AS_QD=23.70,22.65;BaseQRankSum=0.296;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.775;MQ=59.17;MQRankSum=0.857;QD=22.00;ReadPosRankSum=-1.095;SOR=0.336;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:4:63:0,4,4 0/2:29,1,5:35:59:.:770,59,798,0,743,868:18,11,3,3 +chrX 1391140 . A AT 414.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=8.73;BaseQRankSum=0.398;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=1.090;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.896;SOR=0.634;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:80:35:71:0,35 0/1:31,21:52:99:.:454,0,770:17,14,10,11 +chrX 1391295 . C G 611 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=5.34;BaseQRankSum=1.296;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=4.604;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.772;SOR=0.370;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,38:69:99:274,0:8,23,16,22 0/1:34,17:51:99:367,0,969:14,20,8,9 +chrX 1391744 . C T 1120 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=7.42;BaseQRankSum=1.683;DP=159;ExcessHet=0.0000;FS=2.826;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.894;VarDP=155 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:37,38:75:95:95,0:21,16,18,20 0/1:40,40:80:99:1055,0,1081:17,23,25,15 +chrX 1392191 . T C 884 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.85;BaseQRankSum=1.494;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=4.860;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.232;SOR=0.316;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:79:99:79:0,1800 0/1:32,34:66:99:.:914,0,824:21,11,18,16 +chrX 1392220 . A G 796 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=5.90;BaseQRankSum=-0.601;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=3.018;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.299;SOR=0.727;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:37,39:76:39:39,0:17,20,15,24 0/1:32,32:64:99:787,0,791:20,12,18,14 +chrX 1392435 . A G 1037 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.03;BaseQRankSum=0.646;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=-0.878;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.743;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1477 0/1:32,39:71:99:.:1067,0,829:16,16,20,19 +chrX 1392611 . C T 964 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=-1.184;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=8.393;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.684;SOR=1.586;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1477 0/1:31,40:71:99:.:994,0,806:15,16,27,13 +chrX 1392769 . TG T 838.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=9.15;BaseQRankSum=1.868;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=8.284;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.01;SOR=0.322;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,26:45:99:232,0:5,14,11,15 0/1:24,27:51:99:646,0,541:10,14,16,11 +chrX 1392895 . C T 618 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.46;BaseQRankSum=-2.67;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.181;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.832;SOR=1.002;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:99:46:0,282 0/1:25,27:52:99:.:648,0,704:8,17,7,20 +chrX 1392941 . C G 661 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=21.59;BaseQRankSum=-0.366;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=10.431;MQ=58.80;MQRankSum=-1.441;QD=21.59;ReadPosRankSum=-0.23;SOR=2.833;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:99:46:0,282 0/1:13,19:32:99:.:691,0,411:5,8,2,17 +chrX 1392950 . TCCTCCCTC T,*,CCCTCCCTC 758 . AC=1,0,1;AF=0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=4,0,8;AS_QD=33.00,0.00,31.47;BaseQRankSum=-0.614;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=11.139;MQ=58.38;MQRankSum=-0.361;QD=60.62;ReadPosRankSum=0.535;SOR=5.131;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:99:46:0,282,282,282 1/3:1,4,0,8:13:99:.:788,623,665,448,332,640,130,0,306,285:1,0,0,12 +chrX 1392962 . C CCCTCCCGCCTCCCT,CCCTCCCGCCTCCCTCCTCCCGCCTCCCGCCTCCCT 68.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,4;AS_QD=0.00,12.00;BaseQRankSum=0.497;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.54;MQRankSum=-1.981;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.18;SOR=1.609;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:99:46:0,282,282 0/2:5,0,4:9:99:.:108,148,595,0,234,372:1,4,0,4 +chrX 1392980 . T TCCCGCCTCCCGCCTCCCTCCCTCCC,TCCCTCCTCCCTCCCTCCCGCCTCCCGCCTCCCGCCTCCCTCCCTCCC,TCCCTCCTCCCGCCTCCCGCCTCCCTCCTCCCTCCCTCCCGCCTCCCGCCTCCCGCCTCCCTCCCTCCC 334.97 . AC=1,0,0;AF=0.333,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=4,0,0;AS_QD=34.00,16.57,28.86;BaseQRankSum=1.097;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.59;MQRankSum=-2.253;QD=34.00;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=0.330;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:99:46:0,282,282,282 0/1:7,4,0,0:11:99:.:374,0,248,258,293,914,172,288,819,811:0,7,0,4 +chrX 1393128 . G C 2072 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.84;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=32.84;SOR=0.693;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1087,0:0,0,16,17 1/1:0,31:31:93:1015,93,0:0,0,16,15 +chrX 1393208 . G C 1439 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=22.26;BaseQRankSum=1.035;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.26;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.559;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:873,0:0,0,18,10 0/1:16,22:38:99:596,0,391:12,4,17,5 +chrX 1393233 . T TCTC 2106.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.66;BaseQRankSum=0.028;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.185;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.66;ReadPosRankSum=0.892;SOR=0.487;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1373,0:0,0,22,10 0/1:18,20:38:99:773,0,696:14,4,15,5 +chrX 1393383 . C A 1723 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=29.22;BaseQRankSum=1.901;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.22;ReadPosRankSum=0.982;SOR=0.418;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:29:38:0,29 1/1:1,59:60:99:.:1753,166,0:1,0,35,24 +chrX 1393645 . G C 6110 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=151;AS_QD=29.03;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=40.66;SOR=1.186;VarDP=151 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:3258,0:0,0,29,44 1/1:0,78:78:99:2882,234,0:0,0,31,47 +chrX 1393647 . A G 4091 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=27.29;BaseQRankSum=-1.508;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=4.468;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=27.29;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=0.403;VarDP=151 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:3258,0:0,0,29,44 0/1:42,36:78:99:863,0,1142:14,28,17,19 +chrX 1393680 . A G 1018 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.16;BaseQRankSum=-0.258;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=4.799;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.027;SOR=1.356;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1467 0/1:36,38:74:99:.:1048,0,982:15,21,11,27 +chrX 1393850 . C CT,CTT 2193.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=52,24;AS_QD=32.38,32.72;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=29.38;SOR=0.693;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,9,24:33:99:1117,353,0:0,0,18,15 1/1:0,43,0:43:99:1116,128,0,1116,129,1116:0,0,20,23 +chrX 1394019 . T A 250 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=6.51;BaseQRankSum=-0.23;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.232;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.51;ReadPosRankSum=2.025;SOR=1.077;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,26:43:99:.:280,0:8,9,10,16 0/0:.:53:43:53:0,43,1036 +chrX 1395196 . A G 676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.07;BaseQRankSum=-0.992;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.054;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.07;ReadPosRankSum=-1.523;SOR=1.011;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,773 0/1:27,27:54:99:.:706,0,736:14,13,16,11 +chrX 1396113 . TTTGC T 586.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=0.88;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.815;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.56;ReadPosRankSum=-1.859;SOR=1.292;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,773 0/1:26,17:43:99:.:626,0,1040:11,15,5,12 +chrX 1397221 . A C 2384 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=24.38;BaseQRankSum=-1.136;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=5.115;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=24.38;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.541;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1599,0:0,0,21,31 0/1:18,29:47:99:815,0,474:11,7,17,12 +chrX 1398314 . C A 71 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=2.59;BaseQRankSum=1.153;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=35.495;MQ=59.25;MQRankSum=-1.681;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.614;SOR=5.669;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,569 0/1:23,16:39:99:.:101,0,504:13,10,0,16 +chrX 1398808 . C G 3077 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.05;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.05;SOR=0.736;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1980,0:0,0,33,28 1/1:0,33:33:99:1127,99,0:0,0,15,18 +chrX 1399285 . C T 679 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.38;BaseQRankSum=-0.058;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=5.783;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.65;SOR=1.586;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,498 0/1:27,26:53:99:.:709,0,760:14,13,18,8 +chrX 1400363 . CTGTG C,CTG 3720.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=63,50;AS_QD=29.36,31.33;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.27;SOR=0.990;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32,28:60:99:1531,0,188:0,0,33,27 1/2:0,31,22:53:99:2229,844,755,1275,0,1241:0,0,31,22 +chrX 1400386 . T C 702 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.81;BaseQRankSum=-1.854;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=5.153;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=1.352;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:99:73:0,150 0/1:39,23:62:99:.:732,0,1425:20,19,15,8 +chrX 1401053 . G A 3698 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=32.70;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.36;QD=32.70;SOR=0.802;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1763,0:0,0,30,25 1/1:0,59:59:99:1965,177,0:0,0,24,35 +chrX 1402102 . C T 4161 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=31.75;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.75;SOR=1.078;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2127,0:0,0,29,38 1/1:0,65:65:99:2064,194,0:0,0,26,39 +chrX 1402667 . TCCCCAATGCAGCTTCCTTCCCCCTCCCAAAATGCAGCCTCTGTCCCCACTC T 199.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=29.88;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.28;MQRankSum=-0.619;QD=29.88;SOR=0.693;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:44:70:44:0,70 0/1:2,6:8:60:.:239,0,60:0,2,1,5 +chrX 1404130 . ATGGT A 1040.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=24.55;BaseQRankSum=2.063;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=3.155;MQ=59.00;MQRankSum=-0.282;QD=24.55;ReadPosRankSum=1.128;SOR=1.426;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:25:5:0,25 0/1:15,29:44:99:.:1080,0,516:8,7,13,6 +chrX 1404531 . A G 497 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=5.43;BaseQRankSum=0.224;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.668;MQ=59.65;MQRankSum=0.679;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.476;SOR=1.038;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,25:47:99:103,0:10,12,13,12 0/1:30,20:50:99:424,0,803:16,14,13,7 +chrX 1404690 . G GTAGA 3082.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=25.07;BaseQRankSum=1.034;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=9.217;MQ=51.36;MQRankSum=-0.674;QD=41.08;ReadPosRankSum=1.93;SOR=0.044;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,39:42:99:1718,0:0,3,22,17 1/1:1,33:34:57:1404,57,0:0,1,13,20 +chrX 1406505 . G A 479 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.83;BaseQRankSum=0.535;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=8.463;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=1.270;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,853 0/1:27,20:47:99:.:509,0,738:16,11,7,13 +chrX 1406606 . A G 3486 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=32.26;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=32.26;SOR=0.711;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1745,0:0,0,25,29 1/1:0,55:55:99:1771,165,0:0,0,29,26 +chrX 1407042 . GTAGA G 3820.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=33.21;BaseQRankSum=2.041;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=2.209;QD=39.79;ReadPosRankSum=1.623;SOR=0.758;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:2047,0:0,0,29,20 1/1:4,44:48:99:1813,117,0:2,2,19,25 +chrX 1410509 . G A 3679 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=33.72;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.72;SOR=0.806;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2021,0:0,0,32,28 1/1:0,50:50:99:1688,150,0:0,0,26,24 +chrX 1410576 . A G 3969 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=32.25;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.25;SOR=0.725;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2409,0:0,0,41,33 1/1:0,50:50:99:1590,150,0:0,0,20,30 +chrX 1410658 . C T 4114 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=33.42;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.42;SOR=0.725;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2199,0:0,0,33,32 1/1:0,59:59:99:1945,177,0:0,0,28,31 +chrX 1410747 . GTGATGCA G 5022.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=30.79;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=44.40;SOR=0.802;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:2427,0:0,0,27,28 1/1:0,59:59:99:2635,178,0:0,0,33,26 +chrX 1410836 . C G 5870 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=20.22;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=44.70;SOR=0.962;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,73:73:99:.:.:3267,0:.:0,0,40,33 1|1:0,59:59:99:0|1:1410836_C_G:2633,178,0:1410836:0,0,34,25 +chrX 1410837 . C T 5895 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=27.58;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=44.55;SOR=0.941;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,74:74:99:.:.:3292,0:.:0,0,40,34 1|1:0,59:59:99:0|1:1410836_C_G:2633,178,0:1410836:0,0,34,25 +chrX 1410847 . T G 6033 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=139;AS_QD=32.12;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=43.62;SOR=0.965;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,75:75:99:.:.:3286,0:.:0,0,41,34 1|1:0,64:64:99:0|1:1410836_C_G:2777,193,0:1410836:0,0,37,27 +chrX 1410969 . C T 3786 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=33.18;BaseQRankSum=2.386;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=33.18;ReadPosRankSum=-1.398;SOR=0.268;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1796,0:0,0,21,32 1/1:1,61:62:99:2020,176,0:0,1,33,28 +chrX 1411061 . A C 3077 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=31.07;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=31.07;SOR=1.167;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1418,0:0,0,26,19 1/1:0,55:55:99:1689,164,0:0,0,34,21 +chrX 1411108 . C G 3733 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=31.89;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.23;QD=31.89;SOR=0.727;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1592,0:0,0,23,26 1/1:0,69:69:99:2171,206,0:0,0,37,32 +chrX 1411168 . A C 4989 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=25.70;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=44.81;SOR=0.804;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2274,0:.:0,0,27,24 1|1:0,61:61:99:0|1:1411168_A_C:2745,184,0:1411168:0,0,32,29 +chrX 1411171 . G A 4990 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=34.17;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=44.82;SOR=0.844;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2275,0:.:0,0,28,23 1|1:0,61:61:99:0|1:1411168_A_C:2745,184,0:1411168:0,0,32,29 +chrX 1411191 . A C 4805 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=33.79;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=42.79;SOR=0.822;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2109,0:.:0,0,27,22 1|1:0,64:64:99:0|1:1411168_A_C:2726,192,0:1411168:0,0,33,31 +chrX 1411240 . G GGA 4427.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=27.79;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.98;SOR=1.049;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:2271,0:0,0,34,22 1/1:0,53:53:99:2196,159,0:0,0,29,24 +chrX 1411335 . C G 1023 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=6.58;BaseQRankSum=0.201;DP=161;ExcessHet=0.0000;FS=1.970;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.826;SOR=0.712;VarDP=160 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:40,42:82:41:41,0:20,20,27,15 0/1:40,38:78:99:1012,0,1101:18,22,15,23 +chrX 1411420 . C T 870 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.85;BaseQRankSum=0.703;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.950;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.876;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:81:99:81:0,153 0/1:32,33:65:99:.:900,0,847:14,18,13,20 +chrX 1411565 . T C 1083 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.55;BaseQRankSum=-2.312;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.818;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,153 0|1:29,31:60:99:.:0|1:1411565_T_C:1113,0,1093:1411565:14,15,14,17 +chrX 1411590 . G A 995 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.80;BaseQRankSum=0.203;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=0.638;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:81:99:81:.:.:0,153 0|1:33,28:61:99:.:0|1:1411565_T_C:1025,0,1219:1411565:16,17,14,14 +chrX 1411624 . G GCTGACACTTCAGCAACACGGCTGTAAA 4816.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=33.72;BaseQRankSum=1.329;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=3.695;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.72;ReadPosRankSum=-1.209;SOR=0.840;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,84:84:99:3777,0:0,0,39,45 0/1:32,28:60:99:1079,0,1260:17,15,11,17 +chrX 1411685 . C A 242 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=3.24;BaseQRankSum=0.694;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=7.314;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=1.453;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:38,46:84:99:.:272,0:18,20,15,31 0/0:.:60:30:59:0,30,1633 +chrX 1411735 . AAG A 973.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.48;BaseQRankSum=-1.401;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.037;SOR=0.865;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:45:63:.:.:0,45 0|1:26,26:52:99:.:0|1:1411735_AAG_A:1013,0,1013:1411735:9,17,8,18 +chrX 1411738 . A C 980 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.06;BaseQRankSum=1.07;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.116;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.980;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:45:63:.:.:0,45 0|1:27,26:53:99:.:0|1:1411735_AAG_A:1010,0,1045:1411735:10,17,8,18 +chrX 1411747 . T C 1012 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.30;BaseQRankSum=-1.386;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.087;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.837;SOR=1.029;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:45:63:.:.:0,45 0|1:27,27:54:99:.:0|1:1411735_AAG_A:1042,0,1032:1411735:11,16,9,18 +chrX 1411806 . CT C,CTT,CTTT,CTTTTTTTTT 1145.97 . AC=0,1,1,1;AF=0.00,0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,19,8,8;AS_QD=0.00,33.25,29.34,33.57;BaseQRankSum=2.03;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=3.606;MQ=57.59;MQRankSum=0;QD=30.38;ReadPosRankSum=1.429;SOR=0.733;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,3,14,0,0:18:99:178,395,0,333,333:0,1,11,6 3/4:0,0,5,8,8:21:99:1007,769,697,628,556,520,212,193,113,102,296,278,106,0,393:0,0,11,10 +chrX 1411988 . T G 749 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.56;BaseQRankSum=-0.566;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.178;MQ=59.05;MQRankSum=-1.498;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.296;SOR=1.051;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,233 0/1:33,29:62:99:.:779,0,928:14,19,10,19 +chrX 1412107 . A G 834 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=6.35;BaseQRankSum=-0.545;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=9.270;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.074;SOR=0.269;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,35:67:59:59,0:12,20,15,20 0/1:36,33:69:99:805,0,954:12,24,19,14 +chrX 1412291 . G A 885 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=34;AS_QD=12.71;BaseQRankSum=1.059;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=9.865;MQ=59.21;MQRankSum=1.678;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.892;SOR=1.335;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:60:.:60:0,0 0/1:38,34:72:99:.:915,0,1441:17,21,22,12 +chrX 1412311 . T C 1437 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=20.10;BaseQRankSum=-0.133;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=6.184;MQ=59.21;MQRankSum=-1.669;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.465;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,219 0|1:35,38:73:99:.:0|1:1412311_T_C:1467,0,1355:1412311:22,13,18,20 +chrX 1412315 . G C 1440 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=20.42;BaseQRankSum=-0.145;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=6.105;MQ=59.21;MQRankSum=-1.645;QD=20.42;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.486;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,219 0|1:34,38:72:99:.:0|1:1412311_T_C:1470,0,1313:1412311:21,13,18,20 +chrX 1412320 . C T 913 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=35;AS_QD=12.74;BaseQRankSum=1.213;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=4.444;MQ=59.23;MQRankSum=1.679;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.514;SOR=1.118;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:63:.:63:0,0 0/1:39,35:74:99:.:943,0,1522:19,20,21,14 +chrX 1412372 . T C 632 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=5.43;BaseQRankSum=-1.353;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.298;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.54;SOR=0.919;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,33:64:14:14,0:12,19,13,20 0/1:32,26:58:99:648,0,887:18,14,12,14 +chrX 1412523 . T C 709 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.55;BaseQRankSum=-0.611;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.08;MQRankSum=1.315;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.588;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,452 0/1:34,30:64:99:.:739,0,1190:18,16,15,15 +chrX 1412549 . G T 766 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=30;AS_QD=13.49;BaseQRankSum=0.617;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=7.069;MQ=59.69;MQRankSum=1.475;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.977;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:63:.:63:0,0 0/1:29,30:59:99:.:796,0,1128:12,17,18,12 +chrX 1412564 . C T 740 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.22;BaseQRankSum=1.816;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=9.031;MQ=59.71;MQRankSum=-1.623;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.382;SOR=1.451;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,237 0/1:36,27:63:99:.:770,0,1307:20,16,9,18 +chrX 1412627 . C G 713 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.43;BaseQRankSum=1.023;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=16.869;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=2.522;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,237 0/1:35,30:65:99:.:743,0,857:17,18,6,24 +chrX 1412665 . C T 1355 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=10.49;BaseQRankSum=0.714;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=0.304;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.32;SOR=0.690;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,40:67:99:474,0:16,11,19,21 0/1:30,35:65:99:911,0,761:9,21,14,21 +chrX 1412755 . C T 1010 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=8.52;BaseQRankSum=2.24;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=3.304;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.445;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,39:70:99:280,0:19,12,20,19 0/1:25,27:52:99:760,0,633:14,11,14,13 +chrX 1412872 . C G 1260 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=11.52;BaseQRankSum=2.127;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=7.355;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.086;SOR=1.182;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,33:60:99:.:.:377,0:.:12,15,18,15 0|1:28,24:52:99:0|1:1412872_C_G:913,0,1048:1412872:14,14,17,7 +chrX 1412877 . T C 1307 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=12.50;BaseQRankSum=-0.065;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=7.486;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.66;SOR=1.196;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,33:59:99:.:.:412,0:.:11,15,18,15 0|1:24,24:48:99:0|1:1412872_C_G:925,0,925:1412872:13,11,17,7 +chrX 1412945 . A G 842 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=8.30;BaseQRankSum=-0.37;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.742;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.675;SOR=0.839;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,31:57:99:134,0:15,11,16,15 0/1:22,26:48:99:738,0,595:12,10,18,8 +chrX 1412958 . AAG A 720.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=16.89;BaseQRankSum=-0.857;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.597;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.366;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:64:72:0,64 0/1:23,22:45:99:.:760,0,851:15,8,12,10 +chrX 1413069 . G C 1088 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=17.47;BaseQRankSum=-1.781;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.573;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:64:72:0,64 0/1:21,43:64:99:.:1118,0,496:9,12,20,23 +chrX 1413244 . C G 1635 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=12.24;BaseQRankSum=2.048;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=6.292;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.589;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,45:73:99:.:.:761,0:.:17,11,19,26 0|1:38,25:63:99:0|1:1413244_C_G:904,0,1509:1413244:21,17,14,11 +chrX 1413253 . G T 6012 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=24.85;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=44.76;SOR=0.769;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:3239,0:.:0,0,35,37 1|1:0,63:63:99:0|1:1413244_C_G:2803,190,0:1413244:0,0,35,28 +chrX 1413254 . C T 1476 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=23.53;BaseQRankSum=-0.891;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.53;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.610;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:99:72:.:.:0,437 0|1:26,38:64:99:.:1|0:1413244_C_G:1506,0,935:1413244:15,11,21,17 +chrX 1413348 . A AGGC 1062.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=17.22;BaseQRankSum=-0.726;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.283;SOR=0.711;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,437 0/1:35,29:64:99:.:1102,0,1382:17,18,15,14 +chrX 1414720 . T C 3581 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=33.13;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.13;SOR=0.711;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1899,0:0,0,29,28 1/1:0,52:52:99:1712,156,0:0,0,26,26 +chrX 1414803 . G A 5098 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=34.24;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.59;SOR=1.169;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:2204,0:.:0,0,18,32 1|1:0,65:65:99:0|1:1414803_G_A:2924,196,0:1414803:0,0,28,37 +chrX 1414804 . C T 5233 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=29.28;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=1.131;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2249,0:.:0,0,19,32 1|1:0,67:67:99:0|1:1414803_G_A:3014,202,0:1414803:0,0,29,38 +chrX 1414824 . G C,T 5461 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=3,119;AS_QD=30.91,28.83;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.01;SOR=0.906;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,3,56:59:99:.:.:2656,1832,0:.:0,0,26,33 2|2:0,0,63:63:99:0|1:1414803_G_A:2835,2835,2835,190,190,0:1414803:0,0,29,34 +chrX 1414846 . T C 5550 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=29.20;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.865;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2835,0:.:0,0,29,34 1|1:0,61:61:99:0|1:1414803_G_A:2745,184,0:1414803:0,0,28,33 +chrX 1414856 . T G 5405 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=37.08;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.92;SOR=0.850;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2835,0:.:0,0,31,32 1|1:0,58:58:99:0|1:1414803_G_A:2600,175,0:1414803:0,0,25,33 +chrX 1414878 . T C 5172 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=24.99;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.71;SOR=0.973;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,61:61:99:.:.:2684,0:.:0,0,28,33 1|1:0,58:58:99:0|1:1414803_G_A:2518,175,0:1414803:0,0,24,34 +chrX 1414942 . ATT A 4156.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=29.60;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.14;SOR=0.859;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:2056,0:0,0,30,20 1/1:0,52:52:99:2140,157,0:0,0,25,27 +chrX 1415053 . G C 776 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.66;BaseQRankSum=0.141;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;MQRankSum=-1.378;QD=13.66;ReadPosRankSum=-1.16;SOR=0.627;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:58:50:0,58 0/1:29,30:59:99:.:806,0,756:16,13,16,14 +chrX 1415064 . CT C 4919.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=30.48;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=44.28;SOR=0.970;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:2215,0:.:0,0,27,23 1|1:0,62:62:99:0|1:1415064_CT_C:2744,187,0:1415064:0,0,36,26 +chrX 1415071 . G A 4807 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=28.65;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;QD=43.97;SOR=0.846;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:2205,0:.:0,0,24,26 1|1:0,60:60:99:0|1:1415064_CT_C:2632,181,0:1415064:0,0,35,25 +chrX 1415101 . T C 3826 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=32.96;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;QD=32.96;SOR=1.159;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1757,0:0,0,27,27 1/1:0,63:63:99:2099,189,0:0,0,43,20 +chrX 1415150 . T C 3810 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=30.97;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.23;QD=30.97;SOR=1.151;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1863,0:0,0,33,27 1/1:0,64:64:99:1977,191,0:0,0,41,23 +chrX 1415204 . G C 5420 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=28.72;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.17;QD=43.60;SOR=1.082;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,64:64:99:.:.:2814,0:.:0,0,36,28 1|1:0,61:61:99:0|1:1415204_G_C:2636,183,0:1415204:0,0,37,24 +chrX 1415214 . T TCCAGGCGTGAGCCTGGGCACGTGGC 6049.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=138;AS_QD=27.29;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.24;QD=44.12;SOR=1.059;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,70:70:99:.:.:3082,0:.:0,0,40,30 1|1:0,68:68:99:0|1:1415204_G_C:3007,204,0:1415204:0,0,40,28 +chrX 1415292 . A G 5260 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=28.06;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=44.45;SOR=0.710;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2419,0:.:0,0,29,25 1|1:0,65:65:99:0|1:1415292_A_G:2871,196,0:1415292:0,0,30,35 +chrX 1415294 . A C 5260 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=23.76;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=44.45;SOR=0.710;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2419,0:.:0,0,29,25 1|1:0,65:65:99:0|1:1415292_A_G:2871,196,0:1415292:0,0,30,35 +chrX 1415323 . C T 3328 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=32.60;BaseQRankSum=2.384;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.316;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.60;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.477;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1581,0:0,0,24,23 1/1:1,55:56:99:1777,158,0:1,0,23,32 +chrX 1415389 . A C 5278 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=31.85;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=1.160;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2488,0:.:0,0,26,31 1|1:0,65:65:99:0|1:1415389_A_C:2820,196,0:1415389:0,0,23,42 +chrX 1415401 . C T 4991 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=31.17;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.28;SOR=1.003;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2372,0:.:0,0,25,31 1|1:0,60:60:99:0|1:1415389_A_C:2649,181,0:1415389:0,0,25,35 +chrX 1415427 . T C 4461 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=33.17;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=0.930;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2193,0:.:0,0,20,29 1|1:0,52:52:99:0|1:1415427_T_C:2298,157,0:1415427:0,0,25,27 +chrX 1415429 . G A 4461 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=28.38;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=0.930;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2193,0:.:0,0,20,29 1|1:0,52:52:99:0|1:1415427_T_C:2298,157,0:1415427:0,0,25,27 +chrX 1415461 . T C 4080 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=26.16;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=41.52;SOR=0.888;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2105,0:.:0,0,26,25 1|1:0,48:48:99:0|1:1415461_T_C:2005,144,0:1415461:0,0,28,20 +chrX 1415471 . C CTTT 4593.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=24.10;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=42.12;SOR=0.806;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2184,0:.:0,0,25,27 1|1:0,58:58:99:0|1:1415461_T_C:2449,175,0:1415461:0,0,33,25 +chrX 1415492 . T C 3856 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=27.45;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;QD=40.48;SOR=1.022;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2047,0:.:0,0,28,23 1|1:0,45:45:99:0|1:1415461_T_C:1839,135,0:1415461:0,0,27,18 +chrX 1415611 . G A 4865 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=30.79;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.14;QD=42.94;SOR=0.728;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,66:66:99:.:.:2858,0:.:0,0,35,31 1|1:0,48:48:99:0|1:1415611_G_A:2037,144,0:1415611:0,0,23,25 +chrX 1415626 . C T 4862 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=31.00;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.17;QD=42.91;SOR=0.841;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3028,0:.:0,0,39,32 1|1:0,43:43:99:0|1:1415611_G_A:1864,129,0:1415611:0,0,22,21 +chrX 1415698 . A T 4998 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=24.57;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.58;QD=43.34;SOR=0.960;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,67:67:99:.:.:2938,0:.:0,0,44,23 1|1:0,49:49:99:0|1:1415698_A_T:2090,147,0:1415698:0,0,21,28 +chrX 1415709 . G A 5127 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=30.75;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=42.98;SOR=0.991;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,70:70:99:.:.:3032,0:.:0,0,44,26 1|1:0,50:50:99:0|1:1415698_A_T:2125,150,0:1415698:0,0,24,26 +chrX 1416000 . G C 3819 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=32.62;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.62;SOR=0.914;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2013,0:0,0,28,33 1/1:0,57:57:99:1836,171,0:0,0,25,32 +chrX 1416045 . GCA G 5030.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=31.21;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;QD=42.97;SOR=1.040;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2779,0:0,0,25,41 1/1:0,52:52:99:2291,157,0:0,0,25,27 +chrX 1416332 . C T 3209 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=27.05;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=43.77;SOR=0.747;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46:46:99:.:.:2010,0:.:0,0,26,20 1|1:0,28:28:84:0|1:1416332_C_T:1229,84,0:1416332:0,0,10,18 +chrX 1416340 . CAG C 3299.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=29.78;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=43.93;SOR=0.801;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,44:44:99:.:.:1951,0:.:0,0,24,20 1|1:0,32:32:96:0|1:1416332_C_T:1388,96,0:1416332:0,0,12,20 +chrX 1416385 . GCACA G 3380.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.05;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=45.00;SOR=1.051;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,43:43:99:.:.:1935,0:.:0,0,19,24 1|1:0,33:33:99:0|1:1416385_GCACA_G:1485,99,0:1416385:0,0,13,20 +chrX 1416416 . AACAG A 3740.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=31.95;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=45.00;SOR=0.897;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,45:45:99:.:.:2025,0:.:0,0,19,26 1|1:0,39:39:99:0|1:1416385_GCACA_G:1755,117,0:1416385:0,0,19,20 +chrX 1416458 . G GAC 2700.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.14;BaseQRankSum=-1.064;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.166;MQ=59.96;MQRankSum=1.469;QD=31.14;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.791;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:13,26:39:99:.:.:545,0:.:6,7,14,12 1|1:0,49:49:99:0|1:1416385_GCACA_G:2195,147,0:1416385:0,0,27,22 +chrX 1416463 . G A 4125 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=36.76;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=44.68;SOR=0.804;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,44:44:99:.:.:1960,0:.:0,0,22,22 1|1:0,49:49:99:0|1:1416385_GCACA_G:2195,148,0:1416385:0,0,27,22 +chrX 1416540 . C T 2935 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=29.95;BaseQRankSum=2.097;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=29.95;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.223;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1632,0:0,1,26,27 1/1:0,45:45:99:1333,133,0:0,0,23,22 +chrX 1416709 . C T 3489 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=33.20;BaseQRankSum=2.806;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.20;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.231;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1732,0:1,0,28,25 1/1:0,52:52:99:1787,156,0:0,0,25,27 +chrX 1416737 . ACAGT A 4361.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=32.74;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=44.91;SOR=0.820;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:2116,0:0,0,23,24 1/1:0,51:51:99:2285,154,0:0,0,23,28 +chrX 1416778 . TACAC T 4402.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=26.66;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=44.87;SOR=0.936;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:2282,0:0,0,22,29 1/1:0,48:48:99:2160,145,0:0,0,22,26 +chrX 1416824 . T C 3477 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.78;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=32.78;SOR=1.158;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2005,0:0,0,22,38 1/1:0,47:47:99:1502,140,0:0,0,21,26 +chrX 1416854 . G C 3426 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=32.91;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=32.91;SOR=1.015;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1844,0:0,0,24,32 1/1:0,49:49:99:1612,147,0:0,0,21,28 +chrX 1417034 . G GAC 4667.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=29.33;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.41;SOR=1.036;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2668,0:.:0,0,35,25 1|1:0,46:46:99:0|1:1417034_G_GAC:2039,138,0:1417034:0,0,26,20 +chrX 1417051 . T C 4495 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=27.92;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=1.043;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2458,0:.:0,0,32,24 1|1:0,48:48:99:0|1:1417034_G_GAC:2067,144,0:1417034:0,0,28,20 +chrX 1417143 . A G 3515 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=30.56;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.56;SOR=0.728;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1764,0:0,0,32,28 1/1:0,56:56:99:1781,167,0:0,0,25,31 +chrX 1417304 . C CAG 5410.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.26;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=1.342;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:3082,0:0,0,26,44 1/1:0,54:54:99:2368,162,0:0,0,20,34 +chrX 1417342 . C T 5219 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=28.77;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.48;SOR=1.131;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2730,0:.:0,0,24,38 1|1:0,56:56:99:0|1:1417342_C_T:2519,169,0:1417342:0,0,24,32 +chrX 1417343 . G A 5254 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=30.57;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=1.150;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2730,0:.:0,0,24,38 1|1:0,57:57:99:0|1:1417342_C_T:2554,172,0:1417342:0,0,24,33 +chrX 1417358 . A C 5067 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=33.17;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=43.56;SOR=1.112;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2538,0:.:0,0,23,35 1|1:0,59:59:99:0|1:1417342_C_T:2559,178,0:1417342:0,0,25,34 +chrX 1417405 . C T 4837 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.60;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.25;SOR=1.168;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2638,0:.:0,0,24,36 1|1:0,50:50:99:0|1:1417405_C_T:2229,150,0:1417405:0,0,20,30 +chrX 1417411 . C CACAG 4052.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=34.87;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.73;SOR=1.125;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:1763,0:.:0,0,20,31 1|1:0,52:52:99:0|1:1417405_C_T:2329,157,0:1417405:0,0,22,30 +chrX 1417516 . C CAT 4562.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=30.43;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=44.68;SOR=0.712;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:2453,0:.:0,0,25,30 1|1:0,48:48:99:0|1:1417516_C_CAT:2149,144,0:1417516:0,0,26,22 +chrX 1417523 . G GCA 4427.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=31.13;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=44.67;SOR=0.733;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2404,0:.:0,0,26,28 1|1:0,46:46:99:0|1:1417516_C_CAT:2063,138,0:1417516:0,0,25,21 +chrX 1417570 . GCACA G 3844.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=29.70;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=0.763;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:2105,0:0,0,23,24 1/1:0,40:40:99:1779,120,0:0,0,19,21 +chrX 1417721 . GAC G 4654.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=27.51;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=43.87;SOR=0.714;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,66:66:99:.:.:2871,0:.:0,0,27,29 1|1:0,41:41:99:0|1:1417721_GAC_G:1823,124,0:1417721:0,0,22,19 +chrX 1417748 . G A 4973 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=31.42;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=44.27;SOR=0.836;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,67:67:99:.:.:2933,0:.:0,0,28,29 1|1:0,46:46:99:0|1:1417721_GAC_G:2070,138,0:1417721:0,0,27,19 +chrX 1417752 . AGACATGCTCCATGT A 4847.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=29.32;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=44.43;SOR=0.818;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2727,0:.:0,0,26,26 1|1:0,48:48:99:0|1:1417721_GAC_G:2160,144,0:1417721:0,0,27,21 +chrX 1417769 . CAGGTAT C 4792.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=29.52;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=44.33;SOR=0.842;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2727,0:.:0,0,26,26 1|1:0,47:47:99:0|1:1417721_GAC_G:2105,142,0:1417721:0,0,27,20 +chrX 1417804 . CAGAG C 4980.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=29.78;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;QD=44.82;SOR=0.804;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:2635,0:0,0,24,35 1/1:0,53:53:99:2385,160,0:0,0,29,24 +chrX 1418109 . C G 3616 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=30.90;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.90;SOR=0.997;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1840,0:0,0,27,30 1/1:0,61:61:99:1806,181,0:0,0,24,37 +chrX 1418522 . G T 3777 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.82;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.82;SOR=0.693;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1614,0:0,0,25,22 1/1:0,69:69:99:2193,206,0:0,0,33,36 +chrX 1418741 . T C 3407 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.12;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.12;SOR=0.750;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1868,0:0,0,31,27 1/1:0,49:49:99:1569,146,0:0,0,24,25 +chrX 1418988 . C T 381 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=8.22;BaseQRankSum=0.97;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.120;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.527;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:39:68:0,39 0/1:33,17:50:99:.:411,0,897:14,19,8,9 +chrX 1419421 . C T 4203 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=32.07;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.07;SOR=0.854;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2016,0:0,0,32,32 1/1:0,68:68:99:2217,204,0:0,0,39,29 +chrX 1420047 . G C 4863 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=36.11;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.89;SOR=0.787;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2283,0:.:0,0,27,24 1|1:0,58:58:99:0|1:1420047_G_C:2610,175,0:1420047:0,0,30,28 +chrX 1420049 . C CTA 3924.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=36.86;BaseQRankSum=3.668;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.04;ReadPosRankSum=1.766;SOR=0.811;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2318,0:.:0,0,28,24 1|1:4,54:58:84:0|1:1420047_G_C:1646,84,0:1420047:2,2,28,26 +chrX 1420165 . A G 3287 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=31.00;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.00;SOR=1.158;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1496,0:0,0,32,19 1/1:0,56:56:99:1821,168,0:0,0,32,24 +chrX 1420810 . T C 1810 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.86;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.86;SOR=0.922;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,159 1/1:0,56:56:99:.:1840,168,0:0,0,31,25 +chrX 1420837 . G A 3993 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=32.44;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.44;SOR=1.151;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1955,0:0,0,37,24 1/1:0,63:63:99:2068,189,0:0,0,37,26 +chrX 1420939 . A G 2962 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=33.24;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=33.24;SOR=0.832;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1499,0:0,0,23,21 1/1:0,46:46:99:1493,137,0:0,0,25,21 +chrX 1420960 . ATT A 1741.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=30.19;BaseQRankSum=-0.136;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=6.247;MQ=59.76;MQRankSum=3.944;QD=30.19;ReadPosRankSum=1.495;SOR=0.191;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:929,0:1,0,15,13 1/1:2,28:30:31:852,31,0:2,0,12,16 +chrX 1421166 . C T 4465 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=33.05;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=33.05;SOR=0.849;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2402,0:0,0,33,40 1/1:0,63:63:99:2093,189,0:0,0,30,33 +chrX 1421227 . A G 4561 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=34.78;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=34.78;SOR=0.693;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2378,0:0,0,35,29 1/1:0,68:68:99:2213,204,0:0,0,31,37 +chrX 1422183 . A G 3989 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=32.15;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.15;SOR=0.810;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1980,0:0,0,30,31 1/1:0,64:64:99:2039,192,0:0,0,29,35 +chrX 1422206 . T C 6018 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=31.21;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=0.738;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59:59:99:.:.:2655,0:.:0,0,30,29 1|1:0,76:76:99:0|1:1422206_T_C:3393,229,0:1422206:0,0,36,40 +chrX 1422207 . G A 6018 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=30.21;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=0.738;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59:59:99:.:.:2655,0:.:0,0,30,29 1|1:0,76:76:99:0|1:1422206_T_C:3393,229,0:1422206:0,0,36,40 +chrX 1422234 . C T 5590 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=31.22;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.25;SOR=0.954;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2578,0:.:0,0,33,25 1|1:0,69:69:99:0|1:1422234_C_T:3042,208,0:1422234:0,0,38,31 +chrX 1422235 . A G 5590 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=26.64;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.25;SOR=0.954;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2578,0:.:0,0,33,25 1|1:0,69:69:99:0|1:1422234_C_T:3042,208,0:1422234:0,0,38,31 +chrX 1422272 . A G 5739 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=27.36;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=1.127;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,70:70:99:.:.:3128,0:.:0,0,41,29 1|1:0,60:60:99:0|1:1422272_A_G:2641,181,0:1422272:0,0,36,24 +chrX 1422273 . T C 5739 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=31.30;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=1.127;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,70:70:99:.:.:3128,0:.:0,0,41,29 1|1:0,60:60:99:0|1:1422272_A_G:2641,181,0:1422272:0,0,36,24 +chrX 1422382 . C G 4316 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=31.96;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.96;SOR=0.990;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,81:81:99:2560,0:0,0,41,40 1/1:0,55:55:99:1786,165,0:0,0,18,37 +chrX 1422417 . T C 5510 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=28.79;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.32;SOR=1.170;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:3062,0:.:0,0,35,34 1|1:0,56:56:99:0|1:1422417_T_C:2478,169,0:1422417:0,0,15,41 +chrX 1422420 . A G 5649 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=33.68;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=1.110;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:3062,0:.:0,0,35,34 1|1:0,60:60:99:0|1:1422417_T_C:2617,181,0:1422417:0,0,18,42 +chrX 1422435 . C T 5689 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=28.36;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.68;SOR=1.092;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,74:74:99:.:.:3299,0:.:0,0,36,38 1|1:0,54:54:99:0|1:1422435_C_T:2420,163,0:1422435:0,0,17,37 +chrX 1422437 . C T 5758 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=27.80;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.52;SOR=1.085;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,75:75:99:.:.:3334,0:.:0,0,37,38 1|1:0,55:55:99:0|1:1422435_C_T:2454,166,0:1422435:0,0,17,38 +chrX 1422447 . C A 5358 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=27.00;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.16;SOR=1.115;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:3054,0:.:0,0,33,36 1|1:0,53:53:99:0|1:1422435_C_T:2334,160,0:1422435:0,0,17,36 +chrX 1422512 . T C 4075 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=32.84;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.84;SOR=0.742;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2460,0:0,0,39,36 1/1:0,50:50:99:1645,149,0:0,0,22,28 +chrX 1422550 . C T 3629 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=31.82;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.82;SOR=0.782;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2335,0:0,0,40,35 1/1:0,40:40:99:1324,120,0:0,0,20,20 +chrX 1422631 . C T 3923 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=33.22;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.22;SOR=1.247;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,77:77:99:2516,0:0,0,26,51 1/1:0,42:42:99:1437,126,0:0,0,20,22 +chrX 1422663 . C T 3785 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.89;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=1.003;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2305,0:0,0,24,48 1/1:0,44:44:99:1510,132,0:0,0,26,18 +chrX 1423209 . C T 4019 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=33.19;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=33.19;SOR=0.986;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2052,0:0,0,27,34 1/1:0,61:61:99:1997,183,0:0,0,26,35 +chrX 1423259 . C T 3528 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=32.94;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=32.94;SOR=0.892;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1777,0:0,0,23,31 1/1:0,54:54:99:1781,162,0:0,0,26,28 +chrX 1423484 . A G 3509 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=33.07;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.07;SOR=0.789;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1712,0:0,0,24,28 1/1:0,55:55:99:1827,165,0:0,0,27,28 +chrX 1423555 . C T 3220 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=31.55;BaseQRankSum=2.438;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=2.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.55;ReadPosRankSum=1.366;SOR=0.158;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,51:52:99:1657,0:1,0,28,23 1/1:1,50:51:99:1593,143,0:1,0,28,22 +chrX 1423595 . G A 3106 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=30.75;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.75;SOR=0.732;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1663,0:0,0,28,28 1/1:0,46:46:99:1473,137,0:0,0,24,22 +chrX 1423743 . TCCATCCATCCTC T 2894.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=26.74;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.16;QD=44.45;SOR=0.754;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1502,0:0,0,19,15 1/1:0,32:32:97:1432,97,0:0,0,13,19 +chrX 1423775 . CCCAT C 2466.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=34.60;BaseQRankSum=1.793;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.23;MQRankSum=6.085;QD=35.30;ReadPosRankSum=-0.32;SOR=0.533;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,35:36:99:1485,0:0,1,16,19 1/1:2,33:35:55:1021,55,0:1,1,14,19 +chrX 1424325 . C T 1817 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.40;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;QD=32.40;SOR=0.728;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1164,0:0,0,16,20 1/1:0,21:21:63:683,63,0:0,0,12,9 +chrX 1424365 . C CATCCACCCTCCCATCCATCT 2330.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=26.67;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.91;QD=43.89;SOR=2.303;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1246,0:.:0,0,20,9 1|1:0,25:25:75:0|1:1424365_C_CATCCACCCTCCCATCCATCT:1124,75,0:1424365:0,0,21,4 +chrX 1424386 . G C 2606 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=35.86;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.48;QD=43.93;SOR=2.226;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1353,0:.:0,0,21,10 1|1:0,29:29:87:0|1:1424365_C_CATCCACCCTCCCATCCATCT:1283,87,0:1424365:0,0,24,5 +chrX 1424402 . G A 2552 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=30.49;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.18;QD=43.03;SOR=2.226;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1355,0:.:0,0,22,10 1|1:0,28:28:84:0|1:1424365_C_CATCCACCCTCCCATCCATCT:1227,84,0:1424365:0,0,23,5 +chrX 1424438 . G A 2464 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.82;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.71;QD=32.82;SOR=2.124;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1251,0:0,0,24,14 1/1:0,38:38:99:1243,114,0:0,0,32,6 +chrX 1424471 . C T 2711 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=30.80;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.60;QD=30.80;SOR=1.636;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1361,0:0,0,28,15 1/1:0,46:46:99:1380,137,0:0,0,32,14 +chrX 1424536 . C T 4429 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=30.91;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=42.47;SOR=0.772;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46:46:99:.:.:1911,0:.:0,0,25,20 1|1:0,59:59:99:0|1:1424536_C_T:2548,177,0:1424536:0,0,29,30 +chrX 1424557 . CATCT C 4076.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=31.98;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=42.88;SOR=0.693;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,36:36:99:.:.:1543,0:.:0,0,19,17 1|1:0,60:60:99:0|1:1424536_C_T:2573,180,0:1424536:0,0,29,31 +chrX 1424678 . A G 174 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=6.00;BaseQRankSum=0.247;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.627;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,20:34:99:.:204,0:6,8,9,11 0/0:.:56:94:56:0,94,1145 +chrX 1424853 . T TCCAC,C 1057 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=26,0;AS_QD=29.08,32.49;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.54;QD=41.81;SOR=4.255;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13,0:13:99:574,0,575:0,0,0,13 1/1:0,13,0:13:39:513,39,0,456,57,621:0,0,2,11 +chrX 1424939 . A C 2896 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=30.78;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.54;QD=44.33;SOR=0.957;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1261,0:.:0,0,11,18 1|1:0,37:37:99:0|1:1424939_A_C:1665,111,0:1424939:0,0,18,19 +chrX 1424964 . A G 3036 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=28.69;BaseQRankSum=0.278;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=5.806;MQ=56.86;MQRankSum=0.167;QD=38.33;ReadPosRankSum=2.666;SOR=0.313;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1376,0:.:0,0,13,15 1|1:8,41:49:29:0|1:1424939_A_C:1690,29,0:1424939:6,2,20,21 +chrX 1424967 . CA C 2559.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.90;BaseQRankSum=0.868;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=5.073;MQ=56.86;MQRankSum=0.427;QD=32.90;ReadPosRankSum=2.382;SOR=0.361;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,28:30:99:.:.:909,0:.:1,1,13,15 1|1:8,41:49:29:0|1:1424939_A_C:1690,29,0:1424939:6,2,20,21 +chrX 1424969 . TCCC T 2553.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.01;BaseQRankSum=0.696;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=9.254;MQ=56.97;MQRankSum=0.427;QD=32.01;ReadPosRankSum=2.192;SOR=0.296;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,28:30:99:.:.:909,0:.:1,1,13,15 1|1:10,41:51:25:0|1:1424939_A_C:1684,25,0:1424939:8,2,20,21 +chrX 1424981 . TCCATCTATCCACCTACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCTTCCTC T 3213.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=28.04;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.20;QD=43.96;SOR=0.992;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1312,0:0,0,17,13 1/1:0,44:44:99:1941,135,0:0,0,25,19 +chrX 1425068 . C G 3064 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=31.25;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.60;QD=31.25;SOR=0.713;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1309,0:0,0,22,20 1/1:0,57:57:99:1785,170,0:0,0,28,29 +chrX 1425142 . A G 3253 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=31.87;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.87;SOR=0.712;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1711,0:0,0,26,28 1/1:0,49:49:99:1572,146,0:0,0,26,23 +chrX 1425191 . G A 3928 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.92;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.92;SOR=0.793;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1869,0:0,0,32,28 1/1:0,64:64:99:2089,192,0:0,0,33,31 +chrX 1425379 . A C 4135 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=33.06;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=33.06;SOR=0.976;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2236,0:0,0,39,29 1/1:0,58:58:99:1929,174,0:0,0,32,26 +chrX 1425429 . G C 4402 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=32.83;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=1.129;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2191,0:0,0,40,26 1/1:0,69:69:99:2241,206,0:0,0,40,29 +chrX 1425440 . C T 4266 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=33.05;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.05;SOR=1.127;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2149,0:0,0,39,26 1/1:0,65:65:99:2147,195,0:0,0,38,27 +chrX 1425778 . G A 4452 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=33.20;BaseQRankSum=2.505;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=4.582;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.20;ReadPosRankSum=0.178;SOR=1.344;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,77:78:99:2552,0:1,0,27,50 1/1:0,57:57:99:1930,171,0:0,0,19,38 +chrX 1425853 . T C 3643 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=31.94;BaseQRankSum=3.458;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.409;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.94;ReadPosRankSum=-1.22;SOR=0.848;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,62:65:99:1975,0:2,1,28,34 1/1:0,50:50:99:1698,150,0:0,0,19,31 +chrX 1425946 . A G 4105 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=32.56;BaseQRankSum=-0.312;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.185;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.56;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.376;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,70:71:99:2300,0:0,1,36,34 1/1:0,56:56:99:1835,168,0:0,0,30,26 +chrX 1425991 . C T 4396 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=32.79;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=0.867;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2204,0:0,0,33,33 1/1:0,69:69:99:2222,207,0:0,0,40,29 +chrX 1426159 . A G 3759 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=30.31;BaseQRankSum=-0.619;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.188;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=30.31;ReadPosRankSum=-0.33;SOR=0.378;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,62:63:99:1900,0:0,1,30,32 1/1:0,62:62:99:1889,185,0:0,0,35,27 +chrX 1426220 . T C 4058 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=30.74;BaseQRankSum=-0.594;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=-0.088;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.534;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,66:67:99:2094,0:0,1,23,43 1/1:0,66:66:99:1994,197,0:0,0,26,40 +chrX 1426271 . A G 4467 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=137;AS_QD=32.82;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.82;SOR=1.082;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2197,0:0,0,28,37 1/1:0,72:72:99:2300,216,0:0,0,29,43 +chrX 1426316 . C T 923 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=12.54;BaseQRankSum=2.149;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=0.749;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1800 0/1:41,35:76:99:.:953,0,1603:17,24,14,21 +chrX 1426322 . C T 2806 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=21.65;BaseQRankSum=0;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=1.553;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.65;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.534;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1797,0:1,0,28,25 0/1:36,41:77:99:1039,0,1379:15,21,17,24 +chrX 1426398 . A G 2522 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=21.09;BaseQRankSum=-0.504;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.09;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.659;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,55:56:99:.:.:1701,0:.:1,0,36,19 0|1:30,35:65:99:0|1:1426398_A_G:851,0,1134:1426398:18,12,18,17 +chrX 1426406 . G A 834 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.09;BaseQRankSum=0.28;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=6.522;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.09;ReadPosRankSum=-1.538;SOR=1.473;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,1742 0|1:34,32:66:99:.:1|0:1426398_A_G:864,0,1290:1426398:17,17,21,11 +chrX 1426722 . G A 2627 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=25.30;BaseQRankSum=2.418;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.943;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=25.30;ReadPosRankSum=1.329;SOR=0.835;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,59:60:99:1904,0:0,1,25,34 0/1:18,27:45:99:753,0,653:9,9,13,14 +chrX 1426735 . C T 398 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.30;BaseQRankSum=1.68;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.748;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1786 0/1:29,17:46:99:.:428,0,1135:15,14,8,9 +chrX 1426794 . T C 2566 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=25.20;BaseQRankSum=2.854;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.839;SOR=0.655;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1865,0:0,0,27,30 0/1:21,25:46:99:731,0,532:10,11,13,12 +chrX 1426891 . G T 3219 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.24;BaseQRankSum=1.906;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;MQRankSum=-0.162;QD=31.24;ReadPosRankSum=1.633;SOR=0.714;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,53:54:99:.:.:2365,0:.:1,0,26,27 0|1:27,23:50:99:0|1:1426891_G_T:884,0,1064:1426891:12,15,9,14 +chrX 1426896 . T C 3239 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.74;BaseQRankSum=-0.663;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;MQRankSum=-1.043;QD=31.74;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=0.641;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,53:53:99:.:.:2385,0:.:0,0,26,27 0|1:27,23:50:99:0|1:1426891_G_T:884,0,1064:1426891:12,15,9,14 +chrX 1426915 . A G 3291 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=31.33;BaseQRankSum=-1.749;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;MQRankSum=-1.193;QD=31.33;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.728;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2610,0:.:0,0,28,30 0|1:29,19:48:99:0|1:1426891_G_T:711,0,1161:1426891:13,16,6,13 +chrX 1426938 . A G 3473 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.68;BaseQRankSum=-0.975;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.935;MQ=59.51;MQRankSum=-1.001;QD=33.68;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.813;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2690,0:.:0,0,30,30 0|1:23,21:44:99:0|1:1426891_G_T:813,0,903:1426891:12,11,7,14 +chrX 1426939 . T C 3473 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.68;BaseQRankSum=0.447;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.935;MQ=59.51;MQRankSum=-1.001;QD=33.68;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.813;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2690,0:.:0,0,30,30 0|1:23,21:44:99:0|1:1426891_G_T:813,0,903:1426891:12,11,7,14 +chrX 1427002 . A AAAAC 2663.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=30.72;BaseQRankSum=0.573;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=-1.272;QD=30.72;ReadPosRankSum=2.044;SOR=0.662;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2255,0:.:0,0,30,22 0|1:23,13:36:99:0|1:1427002_A_AAAAC:448,0,886:1427002:13,10,6,7 +chrX 1427009 . G A 3601 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.42;BaseQRankSum=-1.207;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.014;MQ=59.79;MQRankSum=-1.272;QD=32.42;ReadPosRankSum=1.714;SOR=0.864;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2797,0:.:0,0,30,22 0|1:24,23:47:99:0|1:1427002_A_AAAAC:834,0,881:1427002:11,12,6,7 +chrX 1427037 . C T 3206 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=23.28;BaseQRankSum=-0.762;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=-1.092;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.901;SOR=0.663;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,80:80:99:2595,0:0,0,51,29 0/1:33,26:59:99:641,0,895:20,13,12,14 +chrX 1427158 . T G 3020 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=22.76;BaseQRankSum=2.117;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.635;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,78:79:99:2526,0:1,0,44,34 0/1:33,22:55:99:524,0,896:19,14,13,9 +chrX 1427224 . C G 2281 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=23.58;BaseQRankSum=1.147;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.962;MQ=59.73;MQRankSum=0.818;QD=23.58;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=1.061;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1949,0:0,0,24,36 0/1:24,14:38:99:362,0,654:12,12,7,7 +chrX 1427305 . C T 2614 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=24.04;BaseQRankSum=1.89;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=5.765;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.04;ReadPosRankSum=1.676;SOR=1.323;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1998,0:0,0,18,41 0/1:28,23:51:99:646,0,778:13,15,10,13 +chrX 1427402 . A G 3008 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=22.01;BaseQRankSum=-2.184;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=1.516;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.01;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.541;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2456,0:0,0,41,33 0/1:39,25:64:99:582,0,1121:23,16,13,12 +chrX 1427477 . A G 3059 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=22.71;BaseQRankSum=-1.526;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.773;MQ=59.88;MQRankSum=1.001;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.215;SOR=0.589;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2386,0:0,0,49,27 0/1:31,29:60:99:703,0,878:19,12,12,17 +chrX 1427524 . C G 3145 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=23.01;BaseQRankSum=2.511;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=11.528;MQ=59.62;MQRankSum=1.693;QD=23.01;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.726;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,79:81:99:2448,0:1,1,48,31 0/1:30,27:57:99:727,0,752:11,19,12,15 +chrX 1427708 . T C 907 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=12.49;BaseQRankSum=1.062;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.769;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:76:99:76:0,1800 0/1:39,36:75:99:.:937,0,1006:22,17,21,15 +chrX 1427899 . G A 2877 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=22.36;BaseQRankSum=1.126;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.774;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2198,0:0,0,32,38 0/1:32,28:60:99:709,0,768:17,15,13,15 +chrX 1427983 . A G 2939 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=23.20;BaseQRankSum=-0.801;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.824;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.399;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2199,0:0,0,33,33 0/1:32,30:62:99:770,0,876:12,20,12,18 +chrX 1428177 . G C 3906 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=30.28;BaseQRankSum=-0.77;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.769;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=30.28;ReadPosRankSum=1.625;SOR=0.871;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,61:61:99:.:.:2645,0:.:0,0,24,37 0|1:32,37:69:99:0|1:1428177_G_C:1291,0,1129:1428177:15,17,18,19 +chrX 1428198 . C A 3930 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=31.43;BaseQRankSum=0.587;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=31.43;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.707;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2784,0:.:0,0,26,39 0|1:28,33:61:99:0|1:1428177_G_C:1176,0,1024:1428177:12,16,16,17 +chrX 1428309 . G A 216 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=7.94;BaseQRankSum=2.074;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=16.320;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.486;SOR=2.228;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,109 0/1:21,10:31:99:.:246,0,492:7,14,8,2 +chrX 1428322 . CAAA CAA,C 1760.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=45,20;AS_QD=26.78,34.90;BaseQRankSum=-0.391;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.894;SOR=0.534;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32,0:33:99:755,0,779:1,0,23,9 1/2:0,13,20:33:99:1045,645,568,312,0,498:0,0,18,15 +chrX 1428596 . G A 4325 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=32.50;BaseQRankSum=-0.396;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.59;MQRankSum=-0.257;QD=32.50;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.518;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2145,0:0,0,21,44 1/1:1,68:69:99:2210,173,0:0,1,29,39 +chrX 1428646 . C CAAATAAATAAATAAATAAAT,CAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT,CAAAT,CAAATAAATAAATAAATAAATAAAT 4164.97 . AC=2,0,0,1;AF=0.667,0.00,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=39,14,1,15;AS_QD=33.61,31.26,26.93,34.55;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.45;QD=60.93;SOR=1.054;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27,14,0,0:41:99:1741,0,599,1474,1474:0,0,18,23 1/4:0,12,0,1,15:28:99:2463,712,588,2353,707,2348,2307,661,2302,2296,549,0,544,498,411:0,0,11,17 +chrX 1428743 . T C 3346 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=30.69;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.69;SOR=0.846;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1586,0:0,0,30,23 1/1:0,57:57:99:1790,170,0:0,0,29,28 +chrX 1428887 . C CTTAA 607.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.59;BaseQRankSum=0.895;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.287;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=1.133;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,1410 0/1:22,17:39:99:.:647,0,847:10,12,6,11 +chrX 1428959 . C T 707 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.04;BaseQRankSum=-0.025;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.236;MQ=59.87;MQRankSum=-0.825;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=0.283;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,1410 0/1:21,28:49:99:.:737,0,492:15,6,16,12 +chrX 1429138 . G A 2282 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=25.98;BaseQRankSum=-0.62;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=1.184;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.465;SOR=0.781;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1651,0:0,0,22,21 0/1:20,26:46:99:661,0,493:10,10,11,15 +chrX 1429558 . G A 2363 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=21.18;BaseQRankSum=-2.474;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.666;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=0.503;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1616,0:0,0,28,20 0/1:34,31:65:99:777,0,967:20,14,14,17 +chrX 1430077 . C T 744 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.13;BaseQRankSum=-0.213;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.13;ReadPosRankSum=-2.099;SOR=0.797;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1517 0/1:19,29:48:99:.:774,0,451:10,9,16,13 +chrX 1430277 . A G 673 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=14.96;BaseQRankSum=-0.336;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.166;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.430;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:70:99:70:.:.:0,1517 0|1:28,19:47:99:.:0|1:1430277_A_G:703,0,1117:1430277:17,11,10,9 +chrX 1430284 . T A 638 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.21;BaseQRankSum=0.832;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.172;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.420;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:70:99:70:.:.:0,1517 0|1:29,18:47:99:.:0|1:1430277_A_G:668,0,1152:1430277:17,12,9,9 +chrX 1430418 . T C 740 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.62;BaseQRankSum=0.659;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.181;SOR=0.772;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1517 0/1:33,28:61:99:.:770,0,943:17,16,15,13 +chrX 1430703 . C T 4243 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=32.62;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.62;SOR=0.739;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2113,0:0,0,31,36 1/1:0,64:64:99:2160,192,0:0,0,33,31 +chrX 1430885 . AT A 864.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.70;BaseQRankSum=-0.742;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.910;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.473;SOR=0.818;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:99:73:0,1800 0/1:34,32:66:99:.:904,0,942:17,17,15,17 +chrX 1430965 . T C 420 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=8.18;BaseQRankSum=-0.78;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.085;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.461;SOR=0.458;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:99:73:0,1800 0/1:35,20:55:99:.:450,0,1011:20,15,10,10 +chrX 1430991 . CTT C 332.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=6.00;BaseQRankSum=-1.711;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.19;SOR=0.678;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,35:62:99:.:372,0:13,14,17,18 0/0:.:46:80:46:0,80,1155 +chrX 1431098 . T C 331 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=7.68;BaseQRankSum=-0.432;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.531;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.388;SOR=0.609;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1800 0/1:30,17:47:99:.:361,0,783:13,17,9,8 +chrX 1431355 . T A 2911 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=23.53;BaseQRankSum=0.909;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.641;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.53;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.912;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:2350,0:.:0,0,37,32 0|1:33,23:56:99:0|1:1431355_T_A:591,0,1258:1431355:17,16,15,8 +chrX 1431357 . T C 701 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.05;BaseQRankSum=-1.048;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.754;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.330;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:75:99:75:.:.:0,1716 0|1:25,31:56:99:.:1|0:1431355_T_A:731,0,877:1431355:16,9,16,15 +chrX 1431451 . A G 894 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.44;BaseQRankSum=1.108;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=5.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.834;SOR=0.942;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1716 0/1:30,34:64:99:.:924,0,771:17,13,14,20 +chrX 1431491 . CTACT C 1097.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=16.97;BaseQRankSum=2.042;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.924;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.031;SOR=0.551;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1716 0/1:37,30:67:99:.:1137,0,1447:20,17,15,15 +chrX 1431640 . T A 5107 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=156;AS_QD=32.93;DP=162;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.93;SOR=1.261;VarDP=156 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,84:84:99:2747,0:0,0,31,53 1/1:0,72:72:99:2390,216,0:0,0,29,43 +chrX 1431804 . G A 3791 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=29.39;BaseQRankSum=1.268;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=10.941;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.39;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.685;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3070,0:.:0,0,40,31 0|1:37,22:59:99:0|1:1431804_G_A:751,0,1456:1431804:14,23,12,10 +chrX 1431821 . A T 3599 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=28.80;BaseQRankSum=0.078;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=6.123;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.494;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,68:68:99:.:.:2955,0:.:0,0,38,30 0|1:38,20:58:99:0|1:1431804_G_A:674,0,1495:1431804:15,23,8,12 +chrX 1431867 . G C 1567 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=25.76;BaseQRankSum=1.534;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.761;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,1622 0|1:21,41:62:99:.:0|1:1431867_G_C:1597,0,685:1431867:9,12,17,24 +chrX 1431886 . G C 1666 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=26.50;BaseQRankSum=2.042;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=7.377;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.50;ReadPosRankSum=-1.246;SOR=0.556;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,1622 0|1:20,44:64:99:.:0|1:1431867_G_C:1696,0,605:1431867:7,13,24,20 +chrX 1432077 . C G 2192 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=21.37;BaseQRankSum=0.023;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.674;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1544,0:0,0,17,29 0/1:32,26:58:99:678,0,862:14,18,15,11 +chrX 1432656 . C T 514 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.95;BaseQRankSum=0.112;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=12.104;MQ=58.84;MQRankSum=-0.507;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.960;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1483 0/1:21,21:42:99:.:544,0,529:6,15,13,8 +chrX 1432748 . G C 687 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=9.96;BaseQRankSum=-0.182;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=8.240;MQ=57.60;MQRankSum=-0.405;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.208;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1483 0/1:38,34:72:99:.:717,0,1144:12,26,17,17 +chrX 1432760 . T C 5770 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=26.29;BaseQRankSum=2.046;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.68;MQRankSum=0.38;QD=38.93;ReadPosRankSum=-0.939;SOR=0.785;VarDP=149 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,76:76:99:.:.:3420,0:.:0,0,31,45 0|1:14,59:73:99:0|1:1432760_T_C:2380,0,322:1432760:6,8,25,34 +chrX 1432762 . C G 5941 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=139;AS_QD=27.44;BaseQRankSum=2.045;DP=162;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.74;MQRankSum=0.285;QD=39.03;ReadPosRankSum=-1.205;SOR=0.839;VarDP=153 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,77:77:99:.:.:3465,0:.:0,0,31,46 0|1:14,62:76:99:0|1:1432760_T_C:2506,0,313:1432760:6,8,25,37 +chrX 1432786 . G A 6139 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=144;AS_QD=32.56;BaseQRankSum=2.708;DP=175;ExcessHet=0.0000;FS=3.126;MQ=58.13;MQRankSum=-1.614;QD=37.39;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=1.076;VarDP=165 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,84:84:99:3780,0:0,0,36,48 0/1:21,60:81:99:2389,0,587:10,11,21,39 +chrX 1432789 . C A 6272 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=147;AS_QD=31.66;BaseQRankSum=2.606;DP=182;ExcessHet=0.0000;FS=1.967;MQ=58.20;MQRankSum=-1.548;QD=37.74;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.962;VarDP=167 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,85:85:99:.:.:3815,0:.:0,0,36,49 0|1:20,62:82:99:0|1:1432760_T_C:2487,0,504:1432760:9,11,22,40 +chrX 1432816 . G A 257 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=2.87;BaseQRankSum=-1.461;DP=228;ExcessHet=0.0000;FS=0.888;MQ=58.56;MQRankSum=0.464;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.838;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:116:99:116:0,1075 0/1:75,25:100:99:.:287,0,2764:30,45,9,16 +chrX 1432824 . G A 117 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=1.29;BaseQRankSum=0.532;DP=241;ExcessHet=0.0000;FS=6.259;MQ=58.44;MQRankSum=-0.101;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.858;SOR=1.017;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:116:99:116:.:.:0,1075 0|1:101,13:114:99:.:0|1:1432824_G_A:147,0,3908:1432824:42,59,8,5 +chrX 1432859 . C A 366 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=3.19;BaseQRankSum=1.322;DP=253;ExcessHet=0.0000;FS=12.305;MQ=59.02;MQRankSum=-1.047;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=1.532;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:116:99:116:.:.:0,1075 0|1:102,22:124:99:.:0|1:1432824_G_A:396,0,3371:1432824:45,57,15,7 +chrX 1432955 . G A 5331 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=144;AS_QD=29.46;BaseQRankSum=1.415;DP=201;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.35;MQRankSum=0.203;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.753;VarDP=182 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,98:98:99:4224,0:0,0,58,40 0/1:38,46:84:99:1137,0,835:22,16,27,19 +chrX 1432967 . A G 6344 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=151;AS_QD=30.50;BaseQRankSum=-0.645;DP=197;ExcessHet=0.0000;FS=2.683;MQ=57.33;MQRankSum=-2.506;QD=35.41;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.461;VarDP=180 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,94:94:99:4179,0:0,0,56,38 0/1:29,57:86:99:2195,0,984:19,10,32,25 +chrX 1432968 . T G 5815 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=141;AS_QD=33.02;BaseQRankSum=0.964;DP=196;ExcessHet=0.0000;FS=0.702;MQ=57.32;MQRankSum=-1.198;QD=33.02;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.790;VarDP=177 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,92:92:99:4109,0:0,0,55,37 0/1:36,49:85:99:1736,0,1271:21,15,30,19 +chrX 1433501 . TA T,TAA 291.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=18,20;AS_QD=8.53,9.38;BaseQRankSum=-0.503;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.94;MQRankSum=0;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.267;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,11,11:23:13:81,13,0:1,0,12,10 1/2:0,7,9:16:99:250,156,223,134,0,158:0,0,8,8 +chrX 1433935 . G A 854 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=6.80;BaseQRankSum=1.074;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.201;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.898;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:43:43,0:16,14,20,12 0/1:37,31:68:99:841,0,1010:18,19,15,16 +chrX 1434489 . C CAA,CAAAAAA 530.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=11,0;AS_QD=21.92,10.87;BaseQRankSum=-1.203;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=8.852;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.278;SOR=1.714;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23,23 0/1:15,11,0:26:99:.:570,0,582,407,616,1014:9,6,3,8 +chrX 1434504 . G A 515 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.34;BaseQRankSum=0.532;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=4.847;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.585;SOR=0.599;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23 0/1:20,18:38:99:.:545,0,728:13,7,8,10 +chrX 1434782 . G A 365 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=12.74;BaseQRankSum=2.24;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=1.400;MQ=59.19;MQRankSum=-0.968;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.645;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23 0/1:16,15:31:99:.:395,0,382:9,7,7,8 +chrX 1434794 . CAA C,AAA 330 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=13,3;AS_QD=13.85,0.00;BaseQRankSum=-1.873;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=5.781;MQ=59.05;MQRankSum=-0.832;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.338;SOR=0.595;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23,23 0/1:13,13,3:29:99:.:360,0,596,399,363,1053:9,4,7,9 +chrX 1434979 . G C 674 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.35;BaseQRankSum=2.321;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.026;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.886;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23 0/1:41,27:68:99:.:704,0,1070:21,20,12,15 +chrX 1435249 . C T 1172 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=14.84;BaseQRankSum=0.716;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.836;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.738;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23 0/1:37,44:81:99:.:1202,0,933:18,19,23,21 +chrX 1435259 . GA G 1245.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=17.36;BaseQRankSum=0.318;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.36;ReadPosRankSum=0.26;SOR=0.677;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23 0/1:35,39:74:99:.:1285,0,1164:19,16,21,18 +chrX 1435756 . T C 724 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=16.76;BaseQRankSum=1.914;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.143;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.203;SOR=0.495;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:23:56:.:.:0,23 0|1:25,20:45:99:.:0|1:1435756_T_C:754,0,957:1435756:11,14,10,10 +chrX 1435762 . T C 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.09;BaseQRankSum=-0.575;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.807;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:23:56:.:.:0,23 0|1:24,21:45:99:.:0|1:1435756_T_C:769,0,923:1435756:11,13,9,12 +chrX 1436104 . C A 851 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.31;BaseQRankSum=2.277;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=16.583;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.52;SOR=2.107;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23 0/1:22,32:54:99:.:881,0,462:9,13,24,8 +chrX 1436192 . G C 1122 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=17.45;BaseQRankSum=-0.277;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.147;MQ=59.51;MQRankSum=2.345;QD=17.45;ReadPosRankSum=-1.667;SOR=0.777;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23 0/1:24,42:66:99:.:1152,0,556:11,13,23,19 +chrX 1436260 . G A 1535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=20.06;BaseQRankSum=1.011;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.899;MQ=59.52;MQRankSum=-0.968;QD=20.06;ReadPosRankSum=1.332;SOR=1.018;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:23:56:.:.:0,23 0|1:38,40:78:99:.:0|1:1436260_G_A:1565,0,1475:1436260:17,21,15,25 +chrX 1436264 . C G 1567 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=20.22;BaseQRankSum=0.149;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.851;MQ=59.49;MQRankSum=-0.943;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.995;SOR=0.942;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:23:56:.:.:0,23 0|1:38,41:79:99:.:0|1:1436260_G_A:1597,0,1472:1436260:17,21,16,25 +chrX 1436266 . G A 1567 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=20.22;BaseQRankSum=1.628;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.851;MQ=59.50;MQRankSum=-0.943;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.163;SOR=0.942;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:23:56:.:.:0,23 0|1:38,41:79:99:.:0|1:1436260_G_A:1597,0,1472:1436260:17,21,16,25 +chrX 1436303 . T A 1011 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=13.70;BaseQRankSum=0.375;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=3.132;MQ=59.28;MQRankSum=-0.57;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=1.186;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:23:56:0,23 0/1:38,38:76:99:.:1041,0,1016:18,20,14,24 +chrX 1436439 . G A 328 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.94;BaseQRankSum=1.169;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=1.409;MQ=54.00;MQRankSum=0.405;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.791;SOR=1.230;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:13,23:36:99:.:358,0:7,6,15,8 0/0:.:61:99:61:0,100,1728 +chrX 1436497 . C T 971 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=10.43;BaseQRankSum=2.424;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=2.676;MQ=51.43;MQRankSum=1.971;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.456;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,28:46:99:282,0:14,4,15,13 0/1:24,26:50:99:719,0,590:10,14,12,14 +chrX 1436927 . T C 1023 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=8.16;BaseQRankSum=1.694;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=5.332;MQ=59.90;MQRankSum=1.155;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=0.944;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,36:68:99:119,0:16,16,18,18 0/1:27,34:61:99:934,0,636:12,15,22,12 +chrX 1437035 . C G 936 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=11.64;BaseQRankSum=0.193;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=7.550;MQ=59.99;MQRankSum=0;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.82;SOR=0.241;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,22:38:99:208,0:4,12,11,11 0/1:17,28:45:99:758,0,391:7,10,14,14 +chrX 1437227 . A G 993 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=17.05;BaseQRankSum=0.174;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.09;MQRankSum=-4.486;QD=17.05;ReadPosRankSum=2.293;SOR=0.606;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,728 0|1:31,29:60:99:.:0|1:1437227_A_G:1023,0,772:1437227:9,22,9,20 +chrX 1437242 . G A 601 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.69;BaseQRankSum=-0.203;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.80;MQRankSum=-3.319;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.663;SOR=0.619;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,728 0|1:32,27:59:99:.:0|1:1437227_A_G:631,0,1202:1437227:9,23,8,19 +chrX 1438059 . T C 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.06;BaseQRankSum=-0.302;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=17.532;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.06;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=2.252;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:39:73:0,39 0/1:22,26:48:99:.:675,0,556:13,9,6,20 +chrX 1438207 . C A 605 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=5.83;BaseQRankSum=2.92;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=6.182;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=5.83;ReadPosRankSum=0;SOR=0.318;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:38,38:76:99:172,0:13,25,17,21 0/1:16,17:33:99:463,0,347:5,11,8,9 +chrX 1438282 . CA C 1856.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=19.35;BaseQRankSum=-0.324;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.866;SOR=0.817;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,55:56:99:1508,0:1,0,34,21 0/1:23,19:42:99:388,0,495:13,10,11,8 +chrX 1438381 . C G 923 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=7.62;BaseQRankSum=1.204;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=21.480;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.63;SOR=0.707;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,41:72:99:.:.:223,0:.:19,12,18,23 0|1:33,20:53:99:0|1:1438381_C_G:730,0,1284:1438381:24,9,8,12 +chrX 1438387 . A T 3867 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.43;BaseQRankSum=-1.115;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=13.888;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.43;ReadPosRankSum=0.29;SOR=0.372;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:3199,0:.:0,0,36,36 0|1:33,19:52:99:0|1:1438381_C_G:698,0,1318:1438381:23,10,7,12 +chrX 1438411 . T C 3842 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=31.74;BaseQRankSum=0.452;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=8.199;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.74;ReadPosRankSum=-0.8;SOR=0.520;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,70:70:99:.:.:3140,0:.:0,0,34,36 0|1:32,20:52:99:0|1:1438381_C_G:732,0,1283:1438381:20,12,8,12 +chrX 1438414 . G C 3842 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=31.74;BaseQRankSum=0.04;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=8.199;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.74;ReadPosRankSum=-0.828;SOR=0.520;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,70:70:99:.:.:3140,0:.:0,0,34,36 0|1:32,20:52:99:0|1:1438381_C_G:732,0,1283:1438381:20,12,8,12 +chrX 1439179 . G A 1079 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=10.17;BaseQRankSum=1.573;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=9.529;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.742;SOR=0.228;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,30:53:99:289,0:17,6,17,13 0/1:26,30:56:99:820,0,696:18,8,16,14 +chrX 1439313 . G C 3276 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=23.28;BaseQRankSum=2.171;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=2.494;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.28;ReadPosRankSum=1.677;SOR=0.596;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1940,0:0,0,27,30 0/1:36,49:85:99:1366,0,834:20,16,24,25 +chrX 1439836 . CA C 43.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=2.31;BaseQRankSum=-1.193;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;MQRankSum=1.113;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.781;SOR=0.683;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,19:36:83:.:83,0:8,9,9,10 0/0:.:47:0:47:0,0,1046 +chrX 1442105 . G A 4397 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=32.79;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=0.973;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2050,0:0,0,34,28 1/1:0,73:73:99:2377,219,0:0,0,42,31 +chrX 1442798 . T C 2053 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=18.27;BaseQRankSum=-0.084;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.66;SOR=0.697;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,35:60:99:377,0:15,10,22,13 1/1:0,54:54:99:1706,161,0:0,0,31,23 +chrX 1442906 . A T 3704 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=31.38;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.38;SOR=1.150;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1423,0:0,0,23,22 1/1:0,74:74:99:2311,221,0:0,0,48,26 +chrX 1443049 . A G 5676 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=30.74;BaseQRankSum=2.731;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=6.378;MQ=59.47;MQRankSum=-0.204;QD=41.65;ReadPosRankSum=-0.09;SOR=0.291;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,55:57:99:.:.:2308,0:.:2,0,27,28 1|1:0,80:80:99:0|1:1443049_A_G:3398,240,0:1443049:0,0,37,43 +chrX 1443058 . G GAC 6046.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=144;AS_QD=28.54;BaseQRankSum=0.818;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=3.040;MQ=59.29;MQRankSum=-0.257;QD=41.68;ReadPosRankSum=0.147;SOR=0.155;VarDP=146 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,65:67:99:.:.:2707,0:.:2,0,33,32 1|1:0,79:79:99:0|1:1443049_A_G:3379,237,0:1443049:0,0,38,41 +chrX 1443140 . C T,CACCGCCGTCGTGGACACAT 2419 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=32,27;AS_QD=32.83,20.82;BaseQRankSum=1.017;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=9.362;MQ=58.55;MQRankSum=2.493;QD=37.11;ReadPosRankSum=-1.392;SOR=0.084;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,20,0:24:99:430,0,558:4,0,12,8 1/2:3,12,27:42:99:2019,1019,1083,357,0,404:2,1,18,21 +chrX 1443163 . G A 2227 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=30.50;BaseQRankSum=1.959;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.922;MQ=57.99;MQRankSum=2.263;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.289;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,23:27:99:491,0:4,0,14,9 1/1:1,46:47:99:1766,116,0:0,1,27,19 +chrX 1443253 . ACGCCGCCGTCTTGGACACACACCGCCATCATGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACAGACACCGCCATCTTGGACACACACCACCATCATGGACACACGC A,ACGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACAGACACCGCCATCTTGGACACACACCACCATCATGGACACACGC,ACGCCGTCTTGGACACACACCGCCATCATGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACAGACACCGCCATCTTGGACACACACCACCATCATGGACACACGC 3362.97 . AC=2,1,0;AF=0.667,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=60,11,0;AS_QD=26.64,32.46,27.49;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.30;QD=47.92;SOR=0.779;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,8,11,0:19:99:.:.:1365,680,0,494:.:0,0,10,9 1|1:0,52,0,0:52:99:0|1:1443253_ACGCCGCCGTCTTGGACACACACCGCCATCATGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACAGACACCGCCATCTTGGACACACACCACCATCATGGACACACGC_A:2037,144,0,2037,144,2037,2037,144,2037,2037:1443253:0,0,24,28 +chrX 1443302 . TTGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACAGACACCGCCATCTTGGACACACACCACCATCA *,T 1185.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=8,9;AS_QD=0.00,29.03;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.00;QD=72.06;SOR=0.722;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,8,9:17:19:.:.:1225,19,0:.:0,0,10,7 1|1:0,52,0:52:99:0|1:1443253_ACGCCGCCGTCTTGGACACACACCGCCATCATGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACAGACACCGCCATCTTGGACACACACCACCATCATGGACACACGC_A:2037,144,0,2037,144,2037:1443253:0,0,24,28 +chrX 1443397 . T A,* 39 . AC=1,0;AF=1.00,0.00;AN=1;AS_AltDP=12,0;AS_QD=3.14,0.00;BaseQRankSum=-1.187;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=6.373;MQ=53.90;MQRankSum=-0.462;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=0.707;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:10,12,0:22:69:.:69,0,1430:7,3,5,7 ./.:.:47:.:47:0,0,0,0,0,0 +chrX 1443416 . T A 1889 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=30.72;BaseQRankSum=-0.353;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.67;MQRankSum=-0.385;QD=39.16;ReadPosRankSum=-1.228;SOR=0.257;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:46:10:46:.:.:0,10 1|1:1,48:49:99:.:0|1:1443253_ACGCCGCCGTCTTGGACACACACCGCCATCATGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACACACACCGCCATCTTGGACAGACACCGCCATCTTGGACACACACCACCATCATGGACACACGC_A:1919,126,0:1443253:0,1,23,25 +chrX 1443587 . C T 4379 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=29.48;BaseQRankSum=1.04;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.96;MQRankSum=-0.358;QD=40.08;ReadPosRankSum=0.56;SOR=0.808;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,67:69:99:.:.:2753,0:.:1,1,31,36 1|1:0,41:41:99:0|1:1443587_C_T:1656,123,0:1443587:0,0,20,21 +chrX 1443625 . C T 4807 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=33.13;BaseQRankSum=1.728;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.086;MQ=58.61;MQRankSum=-0.285;QD=41.70;ReadPosRankSum=-1.458;SOR=0.306;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,69:70:99:.:.:2861,0:.:1,0,30,39 1|1:0,46:46:99:0|1:1443587_C_T:1976,138,0:1443587:0,0,26,20 +chrX 1443632 . GTGGACAGACACCGCCATCA G 4352.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=30.72;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.39;MQRankSum=-0.305;QD=41.83;SOR=0.239;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,61:62:99:.:.:2524,0:.:1,0,28,33 1|1:0,43:43:99:0|1:1443587_C_T:1868,130,0:1443587:0,0,25,18 +chrX 1444109 . A G 1944 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=30.84;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.84;SOR=1.044;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:19:65:0,19 1/1:0,64:64:99:.:1974,191,0:0,0,27,37 +chrX 1444192 . C T 1889 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=20.41;BaseQRankSum=0.438;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=0.728;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,25:44:99:222,0:9,10,12,13 1/1:0,50:50:99:1697,150,0:0,0,23,27 +chrX 1444208 . AT A 433.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=27;AS_QD=14.33;BaseQRankSum=-1.343;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=25.668;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.33;ReadPosRankSum=-1.261;SOR=1.601;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:47:.:47:0,0 0/1:6,27:33:6:.:473,0,6:6,0,8,19 +chrX 1444507 . G C 1750 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=30.17;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=30.17;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,303 1/1:0,59:59:99:.:1780,176,0:0,0,33,26 +chrX 1444765 . T C 1724 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=14.62;BaseQRankSum=-2.638;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=5.305;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.317;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,37:68:88:88,0:20,11,21,16 1/1:0,52:52:99:1666,155,0:0,0,25,27 +chrX 1445633 . T C 2005 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=17.70;BaseQRankSum=-3.915;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.879;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.007;SOR=0.549;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,40:63:99:429,0:10,13,19,21 1/1:0,52:52:99:1606,154,0:0,0,25,27 +chrX 1446139 . G C 3258 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=23.32;BaseQRankSum=0.43;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=1.622;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.912;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:32,36:68:99:.:.:209,0:.:16,16,22,14 1|1:0,73:73:99:0|1:1446139_G_C:3079,219,0:1446139:0,0,38,35 +chrX 1446162 . G A 3519 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=25.53;BaseQRankSum=1.629;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=1.745;MQ=59.97;MQRankSum=-0.812;QD=25.53;ReadPosRankSum=-1.938;SOR=0.929;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,38:65:99:.:.:423,0:.:14,13,29,9 1|1:0,74:74:99:0|1:1446139_G_C:3126,223,0:1446139:0,0,35,39 +chrX 1446500 . A AT 696.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=9.09;BaseQRankSum=2.094;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=6.171;MQ=59.49;MQRankSum=0.535;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.922;SOR=1.327;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:13,27:40:99:.:.:281,0:.:8,5,16,11 0|1:16,25:41:99:0|1:1446500_A_AT:455,0,249:1446500:6,10,17,8 +chrX 1448747 . C G 446 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.33;BaseQRankSum=-0.54;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=8.302;MQ=59.19;MQRankSum=-1.75;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.39;SOR=0.525;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,418 0/1:31,20:51:99:.:476,0,865:10,21,11,9 +chrX 1449219 . G A 1026 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.76;BaseQRankSum=2.029;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=6.622;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.75;SOR=0.731;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,418 0/1:28,39:67:99:.:1056,0,658:17,11,17,22 +chrX 1449699 . C A 356 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.70;BaseQRankSum=0.573;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.363;MQ=58.78;MQRankSum=1.617;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.428;SOR=0.990;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,418 0/1:15,18:33:99:.:386,0,294:6,9,6,12 +chrX 1450540 . A C 97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=3.97;BaseQRankSum=-2.698;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=3.552;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.3;SOR=1.426;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,418 0/1:23,9:32:99:.:127,0,649:14,9,7,2 +chrX 1450799 . A G 1186 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=29.87;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.59;QD=39.23;SOR=0.756;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:6:34:.:.:0,6 1|1:0,31:31:93:.:0|1:1450799_A_G:1216,93,0:1450799:0,0,15,16 +chrX 1450818 . C G 643 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=29.26;BaseQRankSum=-0.921;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=9.881;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.26;ReadPosRankSum=2.071;SOR=1.872;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,19:23:99:.:673,0:1,3,14,5 0/0:.:47:0:47:0,0,138 +chrX 1450828 . C G 1934 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=26.99;BaseQRankSum=2.711;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.603;MQ=59.35;MQRankSum=0;QD=37.06;ReadPosRankSum=-0.076;SOR=1.242;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,22:25:99:.:.:817,0:.:1,2,17,5 1|1:0,28:28:84:0|1:1450799_A_G:1147,84,0:1450799:0,0,15,13 +chrX 1451067 . A C 122 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=9.50;BaseQRankSum=-1.382;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=9.249;MQ=56.45;MQRankSum=-2.782;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.579;SOR=2.225;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,140 0/1:10,6:16:99:.:152,0,293:3,7,5,1 +chrX 1451175 . TAGGGGGTCCTGGGACACTCCTCCCTCCCCATCCCTA T 851.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=29.86;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;QD=17.13;SOR=1.426;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:876,0:0,0,8,15 1/1:0,0:0:7:15,7,0:0,0,0,0 +chrX 1451620 . C T 394 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=11.46;BaseQRankSum=-0.879;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=0.976;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.205;SOR=0.879;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,790 0/1:20,17:37:99:.:424,0,535:12,8,11,6 +chrX 1451683 . C T 1837 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=23.34;BaseQRankSum=2.258;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=5.620;MQ=59.98;MQRankSum=0;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.531;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,45:46:99:1414,0:1,0,20,25 0/1:16,18:34:99:453,0,382:10,6,9,9 +chrX 1451751 . G A 1744 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=23.65;BaseQRankSum=2.09;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=11.011;MQ=58.30;MQRankSum=2.894;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.158;SOR=1.031;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,48:49:99:1489,0:1,0,20,28 0/1:14,12:26:99:285,0,315:9,5,3,9 +chrX 1452221 . C T 590 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.92;BaseQRankSum=-0.663;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.143;MQ=59.46;MQRankSum=1.084;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=1.024;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:45:58:0,45 0/1:23,25:48:99:.:620,0,581:13,10,16,9 +chrX 1453145 . CT C 685.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.80;BaseQRankSum=-0.55;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=6.542;MQ=59.55;MQRankSum=-0.088;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=0.165;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:45:58:0,45 0/1:26,23:49:99:.:725,0,903:6,20,10,13 +chrX 1453409 . G A 495 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.67;BaseQRankSum=-1.098;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=8.763;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.072;SOR=0.150;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:45:58:0,45 0/1:24,21:45:99:.:525,0,678:6,18,10,11 +chrX 1454039 . G T 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=4.22;BaseQRankSum=0.797;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=1.576;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=0.430;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:12,15:27:99:.:114,0:9,3,10,5 0/0:.:25:31:20:0,31,567 +chrX 1454922 . A G 4081 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=31.62;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=31.62;SOR=0.929;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1932,0:0,0,39,21 1/1:0,70:70:99:2179,208,0:0,0,33,37 +chrX 1454969 . C T 896 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=13.62;BaseQRankSum=-0.903;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=1.973;MQ=59.72;MQRankSum=0.084;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.487;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1699 0/1:33,35:68:99:.:926,0,903:14,19,17,18 +chrX 1455591 . T C 869 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.24;BaseQRankSum=0.338;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=5.188;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.71;SOR=1.099;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1699 0/1:26,33:59:99:.:899,0,656:14,12,13,20 +chrX 1456048 . A G 4136 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=31.32;BaseQRankSum=-0.561;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.32;ReadPosRankSum=-1.163;SOR=0.306;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,72:73:99:2262,0:1,0,43,29 1/1:0,60:60:99:1904,179,0:0,0,29,31 +chrX 1456286 . C CTT,CTTT 2231.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=33,30;AS_QD=34.77,28.94;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=36.05;SOR=0.724;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,12,15:27:17:977,17,0:0,0,16,11 1/2:0,21,15:36:99:1294,316,190,427,0,315:0,0,16,20 +chrX 1456392 . T C 2798 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=32.88;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=32.88;SOR=1.005;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1582,0:0,0,21,27 1/1:0,38:38:99:1246,114,0:0,0,16,22 +chrX 1456520 . G A 717 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.37;BaseQRankSum=0.059;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.338;SOR=0.678;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:54:66:0,54 0/1:25,27:52:99:.:747,0,693:14,11,15,12 +chrX 1456689 . C G 3128 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=23.39;BaseQRankSum=-0.114;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.739;MQ=59.29;MQRankSum=0.905;QD=23.39;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.936;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2108,0:0,0,39,29 0/1:28,39:67:99:1050,0,697:15,13,24,15 +chrX 1456769 . G A 3643 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=32.79;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.23;QD=32.79;SOR=0.729;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1881,0:0,0,22,36 1/1:0,54:54:99:1792,162,0:0,0,33,21 +chrX 1457426 . A G 737 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.34;BaseQRankSum=-1.018;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.790;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=0.379;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1359 0/1:21,29:50:99:.:767,0,546:17,4,21,8 +chrX 1458084 . A G 2370 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=21.43;BaseQRankSum=-1.061;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=13.046;MQ=59.04;MQRankSum=1.317;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=0.300;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1858,0:0,0,27,34 0/1:27,24:51:99:542,0,731:19,8,14,10 +chrX 1458110 . C CTATG 748.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=17.13;BaseQRankSum=-0.441;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.687;MQ=59.36;MQRankSum=0;QD=17.13;ReadPosRankSum=-2.167;SOR=1.195;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1647 0/1:24,22:46:99:.:788,0,932:15,9,16,6 +chrX 1458189 . A AATCT 4068.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=32.53;BaseQRankSum=1.93;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.148;MQ=59.99;MQRankSum=-0.16;QD=41.49;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=0.484;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1947,0:0,0,21,23 1/1:3,52:55:49:2161,49,0:2,1,25,27 +chrX 1458526 . T C 2356 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=20.05;BaseQRankSum=-1.252;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=13.809;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.05;ReadPosRankSum=-1.198;SOR=0.763;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1750,0:0,0,27,31 0/1:34,27:61:99:636,0,960:22,12,9,18 +chrX 1458580 . CATCTATCT C,CATCT 1410.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=17,37;AS_QD=13.70,24.17;BaseQRankSum=1.263;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=10.967;MQ=59.98;MQRankSum=0.754;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.865;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,17,26:43:99:1056,508,0:0,0,17,26 0/2:23,0,11:34:99:394,463,1429,0,966,932:15,8,5,6 +chrX 1459184 . CATCTATCCATTTATCCATCATCTATATATTAATTT C 621.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.17;BaseQRankSum=0.576;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=1.028;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.721;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1507 0/1:46,19:65:99:.:661,0,1873:22,24,10,9 +chrX 1459326 . CATCT C,CATCTATCT 1336.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=11,35;AS_QD=12.81,24.57;BaseQRankSum=0.314;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.036;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.993;SOR=0.972;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,11,22:33:99:920,510,0:0,0,11,22 0/2:21,0,13:34:99:456,520,1375,0,855,816:9,12,6,7 +chrX 1459615 . C CATCT 3317.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.91;BaseQRankSum=0.562;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=4.656;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.91;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=0.313;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:2603,0:0,0,29,30 0/1:23,20:43:99:754,0,881:15,8,12,8 +chrX 1460609 . T A 2499 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=24.32;BaseQRankSum=-1.807;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.865;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=24.32;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.446;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1910,0:0,0,29,23 0/1:26,26:52:99:619,0,713:11,15,10,16 +chrX 1460971 . C T 387 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=6.04;BaseQRankSum=1.284;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.981;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.04;ReadPosRankSum=1.435;SOR=0.489;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,40:69:99:.:417,0:17,12,21,19 0/0:.:58:41:58:0,41,1325 +chrX 1461160 . A AC 550.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=22.69;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=22.69;SOR=1.220;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:590,0:0,0,16,10 0/0:.:45:0:45:0,0,1027 +chrX 1461244 . G A 2642 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=30.02;BaseQRankSum=-0.219;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.202;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=30.02;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.814;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46:46:99:.:.:1998,0:.:0,0,24,22 0|1:24,19:43:99:0|1:1461244_G_A:674,0,929:1461244:13,11,5,14 +chrX 1461251 . C T 2537 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=29.85;BaseQRankSum=-0.399;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.986;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=29.85;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.703;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,43:43:99:.:.:1893,0:.:0,0,23,20 0|1:24,19:43:99:0|1:1461244_G_A:674,0,929:1461244:13,11,6,13 +chrX 1461666 . A G 2726 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=23.56;BaseQRankSum=0.136;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=8.974;MQ=59.21;MQRankSum=-0.589;QD=23.56;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=1.071;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2080,0:0,0,24,39 0/1:28,26:54:99:676,0,751:16,12,11,15 +chrX 1461849 . C A 3018 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.43;BaseQRankSum=-1.541;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=8.307;MQ=57.22;MQRankSum=-1.924;QD=32.43;ReadPosRankSum=2.086;SOR=0.546;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2205,0:.:0,0,26,23 0|1:23,22:45:99:0|1:1461849_C_A:843,0,878:1461849:8,15,11,8 +chrX 1461851 . C CTAATATA 3275.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.82;BaseQRankSum=0.521;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=6.200;MQ=57.17;MQRankSum=-1.966;QD=32.82;ReadPosRankSum=1.792;SOR=0.567;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:2475,0:.:0,0,29,26 0|1:24,22:46:99:0|1:1461849_C_A:840,0,920:1461849:9,15,11,8 +chrX 1461854 . T TA 3230.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.70;BaseQRankSum=-0.105;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=7.859;MQ=57.15;MQRankSum=-1.966;QD=32.70;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.612;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2430,0:.:0,0,29,25 0|1:24,22:46:99:0|1:1461849_C_A:840,0,932:1461849:9,15,11,8 +chrX 1461865 . A G 3224 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.22;BaseQRankSum=-0.476;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=7.652;MQ=57.06;MQRankSum=-1.378;QD=32.22;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.764;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2565,0:.:0,0,32,25 0|1:25,19:44:99:0|1:1461849_C_A:689,0,993:1461849:10,15,11,8 +chrX 1461866 . A ATC 649.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=15.66;BaseQRankSum=-0.903;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=4.420;MQ=58.29;MQRankSum=-1.378;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.811;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,1485 0|1:25,19:44:99:.:0|1:1461849_C_A:689,0,993:1461849:10,15,11,8 +chrX 1461868 . A C,ATCATCTGTC 2560 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,37;AS_QD=32.58,28.14;BaseQRankSum=-1.742;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=10.390;MQ=57.06;MQRankSum=-1.378;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=1.164;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,22,18:40:99:.:.:1900,0,178:.:0,0,26,14 0|2:25,0,19:44:99:0|1:1461849_C_A:690,765,1816,0,1050,993:1461849:10,15,11,8 +chrX 1461872 . CT C 217.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=5.98;BaseQRankSum=1.62;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=4.714;MQ=55.95;MQRankSum=1.519;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.558;SOR=1.564;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,25:43:99:.:257,0:10,8,18,7 0/0:.:47:99:47:0,120,1800 +chrX 1461874 . A ATCTGT,AT,ACTAT 4100.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=25,35,24;AS_QD=30.37,29.88,32.54;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.90;QD=49.29;SOR=0.954;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25,18,0:43:99:1900,0,257,1478:0,0,28,15 2/3:0,0,17,24:41:99:2240,2015,2039,1035,1107,1082,733,741,0,622:0,0,19,22 +chrX 1461880 . TG T 3071.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.42;BaseQRankSum=-2.619;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=13.633;MQ=56.61;MQRankSum=-1.67;QD=31.42;ReadPosRankSum=-1.477;SOR=1.261;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2520,0:.:0,0,35,21 0|1:27,16:43:99:0|1:1461849_C_A:591,0,1085:1461849:11,16,11,5 +chrX 1461888 . C CT,CATCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCT 2987.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=70,0;AS_QD=32.90,0.00;BaseQRankSum=-2.389;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=13.262;MQ=56.61;MQRankSum=-1.521;QD=32.90;ReadPosRankSum=-2.273;SOR=1.144;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55,0:55:99:2469,0,2469:0,0,34,21 0/1:22,15,0:37:99:558,0,962,670,962,2212:8,14,10,5 +chrX 1461931 . GATCT G 2559.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.09;BaseQRankSum=-3.386;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=11.472;MQ=55.04;MQRankSum=-4.574;QD=32.09;ReadPosRankSum=-1.256;SOR=1.482;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:2594,0:0,0,38,20 0/1:21,2:23:5:5,0,865:9,12,2,0 +chrX 1462012 . ACTATCTACCTATCTATCTAATCTATCTACTATCTATCTATCTAATCTATCTACTATCTATCTAATCTATCTACTATCTATCTACTATCTAATCTATCCACTCTCTATCTACCTATCTAATCTATCTACTATCTATCTATCTAATCTATCTACTAT A 596.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=31.62;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.75;QD=37.41;SOR=0.804;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:636,0:0,0,8,9 0/0:.:36:37:36:0,37,900 +chrX 1462040 . ACTAT *,A,ACTATCTAT 365.97 . AC=1,0,2;AF=0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,0,9;AS_QD=29.55,29.62,32.70;DP=31;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.693;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0,0:17:99:636,0,636,636:0,0,8,9 3/3:0,0,0,9:9:27:405,411,442,411,447,478,27,33,33,0:0,0,5,4 +chrX 1462215 . A ACTAT,ACTATCTATCTATCTAATCTATCTACTATCTATCTATCTACTATCTAATCTATCTACTCTCTATCTACCTATCTAATCTATCTACTATCTATCTATCTAATCTATCTACTATCTATCTACCTATCTAATCTATCTACTATCTATCTAATCTATCTACTAT 2745.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=60,0;AS_QD=23.68,28.18;BaseQRankSum=1.772;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.28;MQRankSum=1.37;QD=45.66;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.351;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,42,0:43:99:1832,0,1890:1,0,24,18 0/1:0,18,0:18:10:953,0,763,728,10,1034:0,0,10,8 +chrX 1462258 . A ACTAT,AATCTATCTACTATCTATCTACCTATCTAATCTATCTACTAT 3048.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=46,8;AS_QD=25.35,30.11;BaseQRankSum=-0.973;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.994;MQ=55.03;MQRankSum=-4.251;QD=38.12;ReadPosRankSum=-2.92;SOR=0.487;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,46,0:47:99:2034,0,1625:0,0,15,12 0/2:26,0,8:34:99:1054,298,1377,0,1017,1049:15,11,3,5 +chrX 1462274 . ACTAT A 1679.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=28.96;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.62;QD=42.98;SOR=1.127;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,39:40:99:.:1719,0:0,0,12,8 0/0:.:57:93:57:0,93,1395 +chrX 1462293 . A AATCTATCTACTATCCATCT 191.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=8;AS_QD=7.00;BaseQRankSum=0.379;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=6.237;MQ=57.21;MQRankSum=-4.175;QD=7.00;ReadPosRankSum=2.96;SOR=0.954;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:39:.:39:.:.:0,0 0|1:25,8:33:99:.:0|1:1462244_C_CTAT:231,0,1052:1462244:16,9,3,5 +chrX 1462302 . A ACTAT 1632.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=30.20;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.44;QD=42.87;SOR=1.179;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,38:39:99:.:1672,0:0,0,11,7 0/0:.:65:78:65:0,78,1170 +chrX 1462321 . T TACTATCTATCTATCTAATCTATCTACTATCTATCTATCTAA 173.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=8.52;BaseQRankSum=0.052;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.721;MQ=57.22;MQRankSum=-3.855;QD=8.52;ReadPosRankSum=-3.372;SOR=0.803;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:41:99:41:.:.:0,1147 0|1:18,7:25:99:.:0|1:1462244_C_CTAT:213,0,767:1462244:10,8,3,4 +chrX 1462341 . G A 2220 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.47;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.17;QD=45.00;SOR=1.390;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2250,0:0,0,18,32 0/0:.:54:32:52:0,32,887 +chrX 1462345 . GTCTA G 2210.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=35.16;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.52;QD=45.00;SOR=1.390;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2250,0:0,0,18,32 0/0:.:54:32:52:0,32,887 +chrX 1462357 . GTCTA ATCTA,G 3035 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=50,21;AS_QD=26.39,33.64;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.08;QD=43.17;SOR=1.195;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50,0:50:99:2231,0,2231:0,0,16,34 1/2:0,0,21:21:51:834,807,824,51,0,1319:0,0,12,9 +chrX 1462371 . C G,CTATG 3427 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=51,0;AS_QD=31.23,31.44;BaseQRankSum=2.67;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=11.187;MQ=59.51;MQRankSum=-0.165;QD=46.72;ReadPosRankSum=1.529;SOR=1.481;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,51,0:52:99:2242,0,2250:0,1,17,34 0/1:22,0,0:22:51:1215,0,830,51,854,881:13,9,0,0 +chrX 1462598 . GT G 1930.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=21.89;BaseQRankSum=-1.414;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.970;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.941;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1492,0:0,0,26,24 0/1:20,20:40:99:478,0,456:10,10,5,15 +chrX 1462977 . CA C,CAAA 1222.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=57,17;AS_QD=15.58,1.05;BaseQRankSum=1.67;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.186;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.97;SOR=1.134;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33,17:50:99:740,0,697:0,0,25,25 0/1:24,24,0:48:99:522,0,497,594,569,1164:12,12,19,5 +chrX 1464550 . C G 583 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.15;BaseQRankSum=-0.01;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=7.639;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=1.564;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,432 0/1:30,25:55:99:.:613,0,746:14,16,17,8 +chrX 1464647 . G C 3001 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=22.96;BaseQRankSum=-1.269;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.96;ReadPosRankSum=-1.741;SOR=0.703;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2073,0:0,0,27,38 0/1:30,37:67:99:958,0,792:12,18,14,23 +chrX 1465033 . G A 206 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=4.29;BaseQRankSum=1.972;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.746;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,30:55:99:.:236,0:12,13,14,16 0/0:.:58:84:58:0,84,1514 +chrX 1465276 . T C 863 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=17.17;BaseQRankSum=-2.025;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=4.058;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.32;SOR=0.734;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1002 0/1:20,32:52:99:.:893,0,528:12,8,14,18 +chrX 1466607 . T C 4384 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=140;AS_QD=31.53;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.53;SOR=0.722;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1974,0:0,0,32,30 1/1:0,78:78:99:2440,233,0:0,0,39,39 +chrX 1466710 . T TCCTC 896.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=22.29;BaseQRankSum=-1.044;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=0.657;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1240 0/1:18,24:42:99:.:936,0,673:5,13,7,17 +chrX 1466864 . CTCCT C 2336.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=34.43;BaseQRankSum=1.374;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=23.051;MQ=59.61;MQRankSum=0;QD=34.43;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.948;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,32:36:99:1196,0:4,0,10,22 1/1:2,31:33:70:1180,70,0:2,0,14,17 +chrX 1466951 . C T 1385 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=34.51;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.51;SOR=2.476;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:40:34:39:0,34 1/1:0,41:41:99:.:1415,123,0:0,0,9,32 +chrX 1466968 . C G 92 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=2.71;BaseQRankSum=0.197;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=4.824;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.243;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,24:45:99:.:122,0:4,17,8,16 0/0:.:45:99:45:0,117,1589 +chrX 1466984 . T TG 1389.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=32.48;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=32.48;SOR=1.230;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:34:50:0,34 1/1:0,44:44:99:.:1429,132,0:0,0,17,27 +chrX 1467036 . G GACTC 2255.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=23.66;BaseQRankSum=-0.253;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.906;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.66;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.522;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,28:51:99:.:.:225,0:.:10,13,13,15 1|1:0,46:46:99:0|1:1467036_G_GACTC:2070,138,0:1467036:0,0,23,23 +chrX 1467051 . G T 2549 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=23.45;BaseQRankSum=1.589;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.827;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.45;ReadPosRankSum=-1.163;SOR=0.601;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,31:57:99:.:.:225,0:.:12,14,16,15 1|1:0,53:53:99:0|1:1467036_G_GACTC:2354,160,0:1467036:0,0,25,28 +chrX 1467056 . C T 2458 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=22.21;BaseQRankSum=1.821;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.786;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.689;SOR=0.460;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,30:58:99:.:.:110,0:.:12,16,15,15 1|1:0,54:54:99:0|1:1467036_G_GACTC:2378,163,0:1467036:0,0,27,27 +chrX 1467408 . G A 2983 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=22.83;BaseQRankSum=1.326;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.83;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.742;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2233,0:0,0,38,28 0/1:35,31:66:99:780,0,813:21,14,21,10 +chrX 1467533 . G C 1985 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=15.74;BaseQRankSum=2.109;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.744;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.905;SOR=0.588;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,36:70:99:119,0:18,16,16,20 1/1:0,58:58:99:1896,174,0:0,0,31,27 +chrX 1467971 . G A 516 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.38;BaseQRankSum=0.898;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.163;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.301;SOR=1.012;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:71:72:0,71 0/1:27,21:48:99:.:546,0,699:11,16,7,14 +chrX 1468319 . G A 3157 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=25.50;BaseQRankSum=1.569;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=4.314;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.50;ReadPosRankSum=-1.265;SOR=1.066;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1960,0:0,0,32,26 0/1:25,42:67:99:1227,0,617:12,13,27,15 +chrX 1468759 . C T 289 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=8;AS_QD=27.53;DP=27;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.88;SOR=1.863;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,8:8:99:.:319,0:0,0,2,6 ./.:.:17:.:17:0,0,0 +chrX 1468778 . T TC 140.97 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=4;AS_QD=28.06;DP=10;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=3.258;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,4:4:99:.:180,0:0,0,0,4 ./.:.:5:.:5:0,0,0 +chrX 1468786 . C T 105 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=3;AS_QD=26.78;DP=8;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=2.833;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,3:3:99:.:135,0:0,0,0,3 ./.:.:5:.:5:0,0,0 +chrX 1469781 . C A 623 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=6.40;BaseQRankSum=-0.279;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=5.024;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.785;SOR=0.331;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,26:52:5:5,0:18,8,10,16 0/1:25,25:50:99:648,0,664:15,10,17,8 +chrX 1470053 . A C 703 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.63;BaseQRankSum=0.2;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.094;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.575;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1030 0/1:34,29:63:99:.:733,0,888:19,15,14,15 +chrX 1470202 . T TAAAC 670.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=22.19;BaseQRankSum=-1.297;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.340;MQ=58.67;MQRankSum=-2.324;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=0.473;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1030 0/1:14,18:32:99:.:710,0,534:6,8,9,9 +chrX 1470310 . A G 688 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.40;BaseQRankSum=-1.975;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.442;MQ=55.95;MQRankSum=-4.58;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.872;SOR=0.860;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1030 0/1:33,30:63:99:.:718,0,908:15,18,17,13 +chrX 1471162 . C T 667 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=1.244;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.573;SOR=1.051;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1030 0/1:29,25:54:99:.:697,0,805:15,14,15,10 +chrX 1471309 . A ATT,ATTT,T 1247 . AC=0,1,1;AF=0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=8,13,22;AS_QD=21.93,20.22,15.37;BaseQRankSum=-1.932;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=5.851;MQ=58.32;MQRankSum=-1.904;QD=20.60;ReadPosRankSum=2.329;SOR=0.223;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,8,13,0:21:55:.:.:647,55,0,434:.:0,0,7,14 0|3:19,0,0,22:41:99:0|1:1471309_A_T:630,685,1253,685,1253,1253,0,568,568,503:1471309:5,14,12,10 +chrX 1471331 . TGTAA T 370.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=10.79;BaseQRankSum=-0.181;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.984;MQ=58.00;MQRankSum=-2.06;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.784;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,403 0|1:24,14:38:99:.:0|1:1471309_A_T:410,0,771:1471309:10,14,8,6 +chrX 1471413 . C T 373 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=8.76;BaseQRankSum=0.724;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=6.329;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=1.286;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:99:45:0,403 0/1:29,17:46:99:.:403,0,730:16,13,6,11 +chrX 1471465 . AT A 469.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.05;BaseQRankSum=-1.014;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.776;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:99:45:0,403 0/1:16,23:39:99:.:509,0,307:8,8,12,11 +chrX 1471554 . G A 877 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=9.16;BaseQRankSum=1.238;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.990;MQ=59.53;MQRankSum=0;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.584;SOR=0.800;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,31:52:99:358,0:9,12,15,16 0/1:26,21:47:99:549,0,658:12,14,14,7 +chrX 1471764 . A G 713 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.29;BaseQRankSum=-0.455;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.359;SOR=0.781;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:45:52:0,45 0/1:23,29:52:99:.:743,0,600:10,13,12,17 +chrX 1471940 . C T 725 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.25;BaseQRankSum=1.591;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=5.608;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.33;SOR=0.781;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:45:52:0,45 0/1:25,28:53:99:.:755,0,580:15,10,12,16 +chrX 1472111 . C T 743 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.05;BaseQRankSum=-0.08;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.276;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.18;SOR=1.059;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:45:52:0,45 0/1:26,29:55:99:.:773,0,678:14,12,18,11 +chrX 1472263 . C T 1046 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=21.10;BaseQRankSum=0.205;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=5.731;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.10;ReadPosRankSum=2.366;SOR=0.254;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:45:52:.:.:0,45 0|1:23,28:51:99:.:0|1:1472263_C_T:1076,0,829:1472263:7,16,13,15 +chrX 1472276 . AAG A 1121.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=22.76;BaseQRankSum=-0.619;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=4.016;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.448;SOR=0.311;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:45:52:.:.:0,45 0|1:21,30:51:99:.:0|1:1472263_C_T:1161,0,773:1472263:7,14,14,16 +chrX 1472314 . A G 823 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=17.41;BaseQRankSum=-0.88;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.142;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.41;ReadPosRankSum=-2.135;SOR=0.486;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:45:52:0,45 0/1:19,30:49:99:.:853,0,500:7,12,13,17 +chrX 1472356 . A G 637 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.16;BaseQRankSum=-1.268;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;MQRankSum=-0.826;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.784;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:45:52:0,45 0/1:19,25:44:99:.:667,0,493:8,11,10,15 +chrX 1472454 . G A 267 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=14.85;BaseQRankSum=0.146;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=1.848;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.85;ReadPosRankSum=-2.74;SOR=1.180;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:45:52:0,45 0/1:9,11:20:99:.:297,0,243:5,4,4,7 +chrX 1472602 . TTTAGA T 215.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=12.75;BaseQRankSum=0.2;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;MQRankSum=-1.258;QD=12.75;ReadPosRankSum=2.072;SOR=0.527;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:45:52:0,45 0/1:13,7:20:99:.:255,0,525:5,8,3,4 +chrX 1472694 . GGGAGGGTGGATGTGTGGATGAAT G 126.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=6.64;BaseQRankSum=0.961;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=1.958;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.627;SOR=1.179;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:45:52:.:.:0,45 0|1:19,6:25:99:.:0|1:1472694_GGGAGGGTGGATGTGTGGATGAAT_G:166,0,678:1472694:13,6,5,1 +chrX 1472728 . T A 130 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=10.67;BaseQRankSum=1.035;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.245;SOR=0.941;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:45:52:.:.:0,45 0|1:10,5:15:99:.:0|1:1472694_GGGAGGGTGGATGTGTGGATGAAT_G:160,0,384:1472694:7,3,4,1 +chrX 1472858 . A G 328 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=9.94;BaseQRankSum=-1.281;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.748;MQ=59.34;MQRankSum=-0.16;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.685;SOR=1.152;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:45:52:0,45 0/1:20,16:36:99:.:358,0,547:11,9,6,10 +chrX 1472933 . C T 357 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=13.82;BaseQRankSum=-0.165;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.750;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.352;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:45:52:0,45 0/1:11,17:28:99:.:387,0,268:9,2,12,5 +chrX 1472981 . T C 65 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=5.00;BaseQRankSum=0.31;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.94;MQRankSum=-0.746;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.405;SOR=0.527;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:8,11:19:95:.:95,0:7,1,9,2 0/0:.:38:0:38:0,0,709 +chrX 1473133 . G GTGGA 624.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=18.44;BaseQRankSum=0.456;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.89;MQRankSum=1.056;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=0.914;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:40:99:40:0,352 0/1:18,18:36:99:.:664,0,652:9,9,10,8 +chrX 1473377 . GTGGGTGGGTGGA G 438.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=23.90;BaseQRankSum=0.396;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=4.285;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.90;ReadPosRankSum=1.268;SOR=0.169;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:40:99:40:0,352 0/1:8,12:20:99:.:478,0,248:6,2,6,6 +chrX 1473389 . A *,G 727 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,7;AS_QD=0.00,34.75;BaseQRankSum=-0.157;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=3.979;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=37.85;ReadPosRankSum=1.562;SOR=1.061;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:40:99:40:0,352,352 1/2:1,12,7:20:99:.:757,232,247,505,0,479:0,1,12,7 +chrX 1473438 . T C 302 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=13.28;BaseQRankSum=0;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=3.831;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=0.180;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:40:99:40:0,352 0/1:11,14:25:99:.:332,0,239:8,3,7,7 +chrX 1473525 . GTGGA G 520.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=20.00;BaseQRankSum=-0.027;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=5.969;MQ=58.99;MQRankSum=0.312;QD=20.00;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.148;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:40:99:40:0,352 0/1:12,16:28:99:.:560,0,445:3,9,8,8 +chrX 1473596 . G GTGGATTGATGGATCAGTGTTTAGATAGGTGGATGTGTGGGTGGATGAATGGA 236.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=7.46;BaseQRankSum=-1.058;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.400;MQ=56.09;MQRankSum=-3.036;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=0.382;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,23:37:99:.:276,0:10,4,14,9 0/0:.:52:99:52:0,105,1429 +chrX 1473713 . T A 454 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.13;BaseQRankSum=0.111;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=5.366;MQ=59.80;MQRankSum=-0.877;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=0.194;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:15,17:32:99:.:484,0,361:11,4,9,8 +chrX 1473815 . AGTGGGTGG A 631.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=15.60;BaseQRankSum=-0.558;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.600;MQ=58.52;MQRankSum=-0.92;QD=15.60;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.387;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:25,18:43:99:.:0|1:1473815_AGTGGGTGG_A:671,0,995:1473815:15,10,9,9 +chrX 1473843 . G C 754 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.68;BaseQRankSum=-1.032;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.99;MQRankSum=-0.907;QD=15.68;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=0.632;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:29,21:50:99:.:0|1:1473815_AGTGGGTGG_A:784,0,1154:1473815:17,12,12,9 +chrX 1473870 . A G 653 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.94;BaseQRankSum=-0.714;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.01;MQRankSum=-0.954;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.19;SOR=0.560;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:29,20:49:99:.:683,0,800:17,12,11,9 +chrX 1473875 . G A 668 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.42;BaseQRankSum=-1.276;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.02;MQRankSum=-1.129;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=0.582;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:33,19:52:99:.:0|1:1473815_AGTGGGTGG_A:698,0,1328:1473815:20,13,11,8 +chrX 1473909 . T G 581 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.02;BaseQRankSum=0.683;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.519;MQ=58.03;MQRankSum=0.31;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.381;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:42,19:61:99:.:0|1:1473815_AGTGGGTGG_A:611,0,1546:1473815:30,12,12,7 +chrX 1473984 . C T 839 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=20.69;BaseQRankSum=-0.163;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=10.157;MQ=58.63;MQRankSum=-0.03;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.44;SOR=1.472;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:14,28:42:99:.:869,0,305:9,5,9,19 +chrX 1473998 . A G 311 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=7.58;BaseQRankSum=-1.221;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=4.546;MQ=58.21;MQRankSum=-1.705;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=1.508;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:29,16:45:99:.:341,0,964:14,15,5,11 +chrX 1474035 . G A 378 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.27;BaseQRankSum=1.198;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.413;MQ=57.85;MQRankSum=-1.413;QD=9.27;ReadPosRankSum=2.307;SOR=1.051;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:32,12:44:99:.:408,0,1168:11,21,3,9 +chrX 1474044 . T C 414 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=9.45;BaseQRankSum=1.042;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.061;MQ=57.86;MQRankSum=-1.997;QD=9.45;ReadPosRankSum=2.234;SOR=1.402;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:34,13:47:99:.:0|1:1474044_T_C:444,0,1388:1474044:13,21,3,10 +chrX 1474045 . G T 414 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=9.45;BaseQRankSum=1.092;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.061;MQ=57.86;MQRankSum=-1.997;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.796;SOR=1.402;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:34,13:47:99:.:0|1:1474044_T_C:444,0,1388:1474044:13,21,3,10 +chrX 1474051 . C T 475 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=10.74;BaseQRankSum=1.802;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=7.153;MQ=57.91;MQRankSum=-2.487;QD=10.74;ReadPosRankSum=2.009;SOR=2.026;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:32,15:47:99:.:505,0,863:14,18,3,12 +chrX 1474053 . G A 408 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=8.94;BaseQRankSum=0.519;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.924;MQ=57.95;MQRankSum=-2.084;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.989;SOR=1.609;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:36,13:49:99:.:0|1:1474044_T_C:438,0,1451:1474044:15,21,3,10 +chrX 1474093 . T G 241 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=6.61;BaseQRankSum=1.539;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=5.573;MQ=56.94;MQRankSum=-1.691;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=1.304;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:32,9:41:99:.:0|1:1474093_T_G:271,0,1317:1474093:18,14,3,6 +chrX 1474097 . G A 238 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=6.38;BaseQRankSum=-0.256;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=5.707;MQ=57.02;MQRankSum=-1.738;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=1.288;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:33,9:42:99:.:0|1:1474093_T_G:268,0,1359:1474093:19,14,3,6 +chrX 1474101 . A C 204 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=5.57;BaseQRankSum=-1.275;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=9.102;MQ=57.02;MQRankSum=-1.974;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.938;SOR=1.784;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:34,8:42:99:.:0|1:1474093_T_G:234,0,1404:1474093:20,14,2,6 +chrX 1474109 . G A 243 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=6.20;BaseQRankSum=-1.886;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=11.925;MQ=56.76;MQRankSum=-2.491;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.016;SOR=2.025;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:35,9:44:99:.:0|1:1474093_T_G:273,0,1443:1474093:21,14,2,7 +chrX 1474119 . T C 228 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=5.27;BaseQRankSum=0.23;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=11.911;MQ=56.74;MQRankSum=-2.448;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.863;SOR=2.025;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:40,9:49:99:.:0|1:1474093_T_G:258,0,1653:1474093:24,16,2,7 +chrX 1474136 . G T 128 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=3.04;BaseQRankSum=-0.66;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=13.375;MQ=57.38;MQRankSum=-2.373;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.404;SOR=2.549;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:45,7:52:99:.:0|1:1474093_T_G:158,0,1868:1474093:26,19,1,6 +chrX 1474140 . G C 125 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=2.92;BaseQRankSum=-0.441;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=13.668;MQ=56.93;MQRankSum=-3.333;QD=2.92;ReadPosRankSum=-1.143;SOR=2.546;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:46,7:53:99:.:0|1:1474093_T_G:155,0,1910:1474093:27,19,1,6 +chrX 1474166 . G A 861 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=20.25;BaseQRankSum=0.443;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.675;MQ=58.68;MQRankSum=-1.518;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.482;SOR=1.179;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:19,25:44:99:.:0|1:1474166_G_A:891,0,702:1474166:11,8,17,8 +chrX 1474178 . G T 930 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=21.82;BaseQRankSum=-0.597;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=4.762;MQ=58.71;MQRankSum=-1.379;QD=21.82;ReadPosRankSum=1.574;SOR=1.536;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:17,27:44:99:.:0|1:1474166_G_A:960,0,633:1474166:10,7,20,7 +chrX 1474371 . ATAAGTGGGTGGG A 35.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=3.75;BaseQRankSum=1.128;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.95;MQRankSum=-1.242;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.066;SOR=0.784;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:17,3:20:75:.:75,0,705:7,10,1,2 +chrX 1474510 . A G 123 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=6.95;BaseQRankSum=0.767;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=7.829;MQ=55.72;MQRankSum=0.118;QD=6.95;ReadPosRankSum=-2.045;SOR=2.568;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:15,7:22:99:.:153,0,388:8,7,1,6 +chrX 1474556 . GTGGATGGA G,GTGGA 580.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=9,13;AS_QD=20.64,24.87;BaseQRankSum=-0.454;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.171;MQ=57.92;MQRankSum=-0.151;QD=25.83;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=0.105;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516,516 1/2:2,9,13:24:99:.:620,393,638,247,0,360:2,0,11,11 +chrX 1475157 . T G 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=17.68;BaseQRankSum=2.019;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.17;MQRankSum=-0.773;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.335;SOR=0.619;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:20,17:37:99:.:0|1:1475157_T_G:654,0,751:1475157:11,9,9,8 +chrX 1475159 . A G 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=17.68;BaseQRankSum=0.998;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.12;MQRankSum=-0.773;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.619;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,516 0|1:20,17:37:99:.:0|1:1475157_T_G:654,0,751:1475157:11,9,9,8 +chrX 1475359 . G A 795 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.73;BaseQRankSum=0.321;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.826;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:26,30:56:99:.:825,0,671:13,13,14,16 +chrX 1475713 . T A 995 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.30;BaseQRankSum=-0.08;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=4.778;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.618;SOR=1.046;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:30,37:67:99:.:1025,0,767:16,14,15,22 +chrX 1475809 . A C 749 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.77;BaseQRankSum=-1.7;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.529;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,516 0/1:31,30:61:99:.:779,0,863:18,13,16,14 +chrX 1476512 . C G 3180 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=31.17;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=31.17;SOR=0.880;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1561,0:0,0,28,24 1/1:0,51:51:99:1649,153,0:0,0,28,23 +chrX 1476592 . GA G,AA 407 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=20,3;AS_QD=10.66,0.00;BaseQRankSum=1.521;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=0.641;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436,436 0/1:21,20,3:44:99:.:437,0,461,485,408,1394:7,14,8,15 +chrX 1476631 . T A 592 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.54;BaseQRankSum=-1.243;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.1;SOR=0.657;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436 0/1:34,25:59:99:.:622,0,971:16,18,12,13 +chrX 1477198 . A AG 761.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.30;BaseQRankSum=0.67;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=9.998;MQ=59.76;MQRankSum=0.841;QD=14.30;ReadPosRankSum=2.786;SOR=1.158;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436 0/1:34,22:56:99:.:801,0,1196:21,13,8,14 +chrX 1477199 . A AAG,AAAGAAG 1117.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=22,0;AS_QD=25.15,10.83;BaseQRankSum=-0.985;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=8.105;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=25.15;ReadPosRankSum=2.146;SOR=1.199;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436,436 0/1:24,22,0:46:99:.:1157,0,1172,897,982,2009:14,10,8,14 +chrX 1477298 . T TCAATCATCTATCAATCAGA 1078.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.33;BaseQRankSum=-1.374;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.618;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436 0/1:26,29:55:99:.:1118,0,995:14,12,15,14 +chrX 1477448 . T A 642 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.39;BaseQRankSum=1.569;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.008;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.545;SOR=0.941;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436 0/1:34,25:59:99:.:672,0,924:17,17,14,11 +chrX 1477539 . C T 991 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.80;BaseQRankSum=-0.678;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.214;SOR=0.648;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,436 0|1:41,28:69:99:.:0|1:1477539_C_T:1021,0,1597:1477539:20,21,14,14 +chrX 1477550 . A ATCG 1050.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.03;BaseQRankSum=-2.68;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.737;SOR=0.614;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,436 0|1:39,29:68:99:.:0|1:1477539_C_T:1090,0,1550:1477539:18,21,14,15 +chrX 1477972 . C T 1302 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.00;BaseQRankSum=0.306;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.913;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.545;SOR=0.560;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436 0/1:27,47:74:99:.:1332,0,636:16,11,26,21 +chrX 1478050 . G A 821 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.73;BaseQRankSum=-2.532;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.146;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.845;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436 0/1:28,34:62:99:.:851,0,760:13,15,19,15 +chrX 1478249 . A G 679 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.77;BaseQRankSum=-0.888;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=4.047;MQ=59.14;MQRankSum=-2.068;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.241;SOR=1.048;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436 0/1:28,20:48:99:.:709,0,1056:15,13,8,12 +chrX 1478273 . G GCA,GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA 492.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,11;AS_QD=2.57,13.64;BaseQRankSum=1.339;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=7.663;MQ=59.10;MQRankSum=-2.803;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=1.763;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436,436 0/2:28,0,11:39:99:.:532,460,1731,0,1138,1177:15,13,3,8 +chrX 1478375 . G A 688 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.40;BaseQRankSum=-1.125;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.102;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.324;SOR=0.452;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436 0/1:33,30:63:99:.:718,0,867:13,20,14,16 +chrX 1478473 . T TTTTA 638.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=16.95;BaseQRankSum=-0.688;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.260;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.430;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,436 0/1:22,18:40:99:.:678,0,843:8,14,8,10 +chrX 1478548 . G A 631 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=5.65;BaseQRankSum=1.786;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=10.133;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.34;SOR=0.529;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,32:64:25:25,0:20,12,16,16 0/1:29,24:53:99:636,0,709:18,11,10,14 +chrX 1478606 . A G 867 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.31;BaseQRankSum=0.186;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.905;SOR=0.688;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1629 0/1:23,32:55:99:.:897,0,594:13,10,18,14 +chrX 1478675 . C T 846 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.85;BaseQRankSum=1.266;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=7.248;MQ=59.89;MQRankSum=-0.885;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.202;SOR=0.433;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1629 0/1:27,32:59:99:.:876,0,686:18,9,15,17 +chrX 1478770 . T G 668 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.74;BaseQRankSum=-1.146;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=6.789;MQ=59.90;MQRankSum=-1.083;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=1.415;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1629 0/1:36,29:65:99:.:698,0,976:19,17,10,19 +chrX 1478792 . T C 586 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.63;BaseQRankSum=-0.845;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=6.842;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.172;SOR=1.532;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1629 0/1:39,25:64:99:.:616,0,1103:19,20,8,17 +chrX 1478828 . A G 542 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.59;BaseQRankSum=-1.249;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=5.471;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=1.080;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1629 0/1:31,23:54:99:.:572,0,884:17,14,9,14 +chrX 1478856 . A G 501 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.02;BaseQRankSum=-0.013;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=7.971;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.992;SOR=1.420;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1629 0/1:32,21:53:99:.:531,0,892:18,14,7,14 +chrX 1478898 . T C 705 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.97;BaseQRankSum=-0.835;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.958;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.817;SOR=0.525;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1629 0/1:38,29:67:99:.:735,0,1089:24,14,17,12 +chrX 1479395 . A G 837 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=11.56;BaseQRankSum=0.086;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=6.494;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.623;SOR=0.258;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1629 0/1:41,34:75:99:.:867,0,1121:11,30,14,20 +chrX 1479705 . C G 812 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.59;BaseQRankSum=-0.341;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=0.636;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1629 0/1:23,31:54:99:.:842,0,608:10,13,14,17 +chrX 1480296 . CT C 493.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=15.68;BaseQRankSum=0.701;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.928;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=1.244;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1629 0|1:18,16:34:99:.:0|1:1480296_CT_C:533,0,643:1480296:9,9,10,6 +chrX 1480318 . G A 610 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=17.78;BaseQRankSum=3.015;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.012;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=1.493;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1629 0|1:18,18:36:99:.:0|1:1480296_CT_C:640,0,644:1480296:9,9,12,6 +chrX 1480383 . C T 686 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=15.57;BaseQRankSum=2.468;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.678;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.321;SOR=1.276;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1629 0|1:26,20:46:99:.:0|1:1480383_C_T:716,0,1022:1480383:15,11,14,6 +chrX 1480393 . GTTT GTTTT,G 758.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=27,20;AS_QD=0.86,9.16;BaseQRankSum=1.336;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=7.628;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.997;SOR=1.364;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,27,0:51:74:.:.:74,0,702:.:11,13,16,11 0|2:35,0,20:55:99:0|1:1480383_C_T:724,830,2279,0,1449,1389:1480383:20,15,15,5 +chrX 1480420 . T G 687 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.28;BaseQRankSum=0.599;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.079;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=1.371;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1413 0|1:34,20:54:99:.:0|1:1480383_C_T:717,0,1315:1480383:19,15,14,6 +chrX 1480446 . A G 556 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.10;BaseQRankSum=0.394;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.224;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=1.051;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1413 0/1:34,24:58:99:.:586,0,878:17,17,14,10 +chrX 1480516 . TA T 857.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.47;BaseQRankSum=1.083;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.070;MQ=59.91;MQRankSum=-1.034;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.861;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1413 0/1:33,29:62:99:.:897,0,1042:17,16,13,16 +chrX 1480687 . A G 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=-3.069;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=6.639;MQ=59.90;MQRankSum=-0.895;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.141;SOR=0.160;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1413 0/1:22,25:47:99:.:607,0,624:5,17,11,14 +chrX 1480752 . C A 880 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=8.27;BaseQRankSum=0.697;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=11.127;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.813;SOR=0.217;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,34:61:99:237,0:8,19,13,21 0/1:23,26:49:99:673,0,567:6,17,14,12 +chrX 1480905 . G GA 426.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=8.79;BaseQRankSum=-0.899;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.357;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.365;SOR=1.069;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,1800 0|1:30,23:53:99:.:0|1:1480905_G_GA:466,0,1191:1480905:17,13,15,8 +chrX 1480916 . A C 1314 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=11.59;BaseQRankSum=-0.308;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=4.688;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.362;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,30:58:78:.:.:78,0:.:20,8,17,13 0|1:26,32:58:99:1|0:1480905_G_GA:1266,0,960:1480905:16,10,18,14 +chrX 1480917 . A C 1314 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=11.59;BaseQRankSum=-0.366;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.688;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.833;SOR=0.362;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,30:58:78:.:.:78,0:.:20,8,17,13 0|1:26,32:58:99:1|0:1480905_G_GA:1266,0,960:1480905:16,10,18,14 +chrX 1480942 . G A 1349 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=11.03;BaseQRankSum=1.485;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.465;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.172;SOR=0.535;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,35:63:99:.:.:176,0:.:19,9,21,14 0|1:29,33:62:99:1|0:1480905_G_GA:1203,0,936:1480905:17,12,19,14 +chrX 1481171 . A AT 522.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=9.69;BaseQRankSum=2.659;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.554;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.584;SOR=1.179;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1178 0/1:30,28:58:99:.:562,0,619:15,15,17,11 +chrX 1482160 . GGT G 1406.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=18.78;BaseQRankSum=1.064;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=-0.941;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.593;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,17:34:14:14,0:8,9,10,7 1/1:0,43:43:99:1432,130,0:0,0,20,23 +chrX 1482206 . T TCAA 2020.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=30.79;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.78;SOR=0.780;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:51:27:.:.:0,51 1|1:0,46:46:99:.:0|1:1482206_T_TCAA:2060,138,0:1482206:0,0,22,24 +chrX 1482214 . A T 1995 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=32.87;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.737;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:51:27:.:.:0,51 1|1:0,45:45:99:.:0|1:1482206_T_TCAA:2025,135,0:1482206:0,0,22,23 +chrX 1482697 . TAG T 5863.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=27.38;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=44.72;SOR=0.755;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,73:73:99:.:.:3256,0:.:0,0,36,37 1|1:0,59:59:99:0|1:1482697_TAG_T:2647,178,0:1482697:0,0,32,27 +chrX 1482700 . T TAC 5863.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=26.00;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=44.72;SOR=0.755;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,73:73:99:.:.:3256,0:.:0,0,36,37 1|1:0,59:59:99:0|1:1482697_TAG_T:2647,178,0:1482697:0,0,32,27 +chrX 1482810 . C G 3337 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=33.34;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.54;QD=33.34;SOR=0.713;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1592,0:0,0,22,25 1/1:0,54:54:99:1775,161,0:0,0,28,26 +chrX 1482859 . T C 3094 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=31.88;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.80;QD=31.88;SOR=0.914;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1417,0:0,0,24,21 1/1:0,53:53:99:1707,158,0:0,0,30,23 +chrX 1482991 . C T 5704 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=29.92;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.90;QD=42.47;SOR=0.801;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2518,0:.:0,0,27,30 1|1:0,78:78:99:0|1:1482991_C_T:3216,234,0:1482991:0,0,44,34 +chrX 1482996 . T C 5705 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=26.99;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.15;QD=42.48;SOR=0.801;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2509,0:.:0,0,27,30 1|1:0,78:78:99:0|1:1482991_C_T:3226,234,0:1482991:0,0,44,34 +chrX 1483088 . G A 4553 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=140;AS_QD=32.74;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.89;QD=32.74;SOR=0.844;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2344,0:0,0,44,28 1/1:0,68:68:99:2239,204,0:0,0,31,37 +chrX 1484492 . T A 2089 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=65;AS_QD=32.60;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=1.000;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:77:.:77:0,0 1/1:0,65:65:99:.:2119,195,0:0,0,28,37 +chrX 1484669 . A T 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=2.78;BaseQRankSum=1.125;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.709;MQ=59.74;MQRankSum=1.125;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=0.673;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,22:41:99:.:114,0:11,8,10,12 0/0:.:34:36:31:0,36,630 +chrX 1484724 . T TAAAAA,TAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAAAAAA 1068.97 . AC=1,2,0;AF=0.333,0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=16,10,0;AS_QD=30.22,24.62,30.32;BaseQRankSum=-0.385;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.033;MQ=56.01;MQRankSum=-0.541;QD=39.57;ReadPosRankSum=1.078;SOR=1.981;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,16,0,0:18:99:544,0,635,635:1,1,7,9 2/2:0,0,10,0:10:31:564,516,510,37,39,0,458,460,31,452:0,0,0,10 +chrX 1484749 . G *,A 777 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,12;AS_QD=29.88,25.49;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.75;QD=67.25;SOR=3.611;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,252,252 2|2:0,0,12:12:41:.:0|1:1484749_G_*:807,550,605,60,41,0:1484749:0,0,1,11 +chrX 1484752 . G *,A 834 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,13;AS_QD=24.95,34.43;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.87;QD=66.46;SOR=2.833;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,252,252 2/2:0,0,13:13:41:.:864,553,605,62,41,0:0,0,2,11 +chrX 1484755 . G *,A 818 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,12;AS_QD=26.60,30.24;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.99;QD=70.67;SOR=3.611;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,252,252 2|2:0,0,12:12:41:.:0|1:1484749_G_*:848,550,605,60,41,0:1484749:0,0,1,11 +chrX 1484986 . CT C 480.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.76;BaseQRankSum=0.369;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;MQRankSum=0;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.392;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,16:18:99:290,0:0,2,8,8 1/1:2,13:15:20:230,20,0:1,1,4,9 +chrX 1485233 . C G 3915 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=32.34;BaseQRankSum=2.587;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.382;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=32.34;ReadPosRankSum=0.924;SOR=0.520;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,59:60:99:1935,0:0,1,40,19 1/1:0,62:62:99:2010,186,0:0,0,26,36 +chrX 1485287 . A G 3553 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=31.71;BaseQRankSum=2.137;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.71;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.253;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1677,0:1,0,30,23 1/1:0,59:59:99:1906,177,0:0,0,28,31 +chrX 1485926 . G A 5168 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=160;AS_QD=32.49;DP=165;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=1.003;VarDP=160 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,80:80:99:2578,0:0,0,41,39 1/1:0,80:80:99:2620,240,0:0,0,50,30 +chrX 1485981 . A G 5203 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=158;AS_QD=33.12;DP=165;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.12;SOR=0.884;VarDP=158 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,81:81:99:2674,0:0,0,39,42 1/1:0,77:77:99:2559,231,0:0,0,47,30 +chrX 1486144 . G A 914 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=13.30;BaseQRankSum=-0.256;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=-0.986;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.5;SOR=0.651;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,336 0/1:36,35:71:99:.:944,0,956:13,23,13,22 +chrX 1486575 . G C 1367 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=10.12;BaseQRankSum=-0.011;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.035;SOR=0.649;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,37:63:99:381,0:10,16,17,20 0/1:36,39:75:99:1016,0,926:17,19,17,22 +chrX 1486918 . G A 1193 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=9.94;BaseQRankSum=2.037;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.677;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.825;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,41:69:99:477,0:17,11,22,19 0/1:27,27:54:99:746,0,766:12,15,16,11 +chrX 1487118 . C G 4681 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=145;AS_QD=32.49;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=0.854;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2262,0:0,0,27,41 1/1:0,77:77:99:2449,231,0:0,0,40,37 +chrX 1487350 . G A 986 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=8.00;BaseQRankSum=1.589;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=12.858;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.813;SOR=1.153;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,39:73:99:220,0:17,17,29,10 0/1:25,29:54:99:796,0,647:9,16,13,16 +chrX 1488257 . C T 3672 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=33.65;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.65;SOR=0.767;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1860,0:0,0,25,30 1/1:0,55:55:99:1842,165,0:0,0,28,27 +chrX 1488733 . GGT G,GGTGT 476.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,20;AS_QD=0.00,14.74;BaseQRankSum=1.855;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.887;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.516;SOR=0.896;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:24:56:0,24,24 0/2:15,2,20:37:99:.:516,569,1318,0,376,417:9,6,9,13 +chrX 1488819 . ACACT A 1548.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=13.02;BaseQRankSum=1.308;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=3.253;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.638;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,35:63:99:326,0:16,12,18,17 0/1:27,32:59:99:1262,0,1026:14,13,14,18 +chrX 1488878 . T C 4139 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=33.62;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=33.62;SOR=0.828;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2005,0:0,0,32,28 1/1:0,64:64:99:2164,192,0:0,0,34,30 +chrX 1489093 . C T 769 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=8.59;BaseQRankSum=-0.033;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.782;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.768;SOR=0.596;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,23:44:28:28,0:9,12,10,13 0/1:21,28:49:99:771,0,553:8,13,12,16 +chrX 1489120 . G A 661 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.34;BaseQRankSum=-0.234;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=7.142;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.34;ReadPosRankSum=2.018;SOR=1.211;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:31:43:0,31 0/1:29,27:56:99:.:691,0,789:16,13,10,17 +chrX 1489436 . G T 293 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=3.59;BaseQRankSum=0.789;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=4.028;MQ=58.48;MQRankSum=-0.157;QD=3.59;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=1.132;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,34:64:99:112,0:15,13,20,14 0/1:17,9:26:99:211,0,405:9,8,7,2 +chrX 1489726 . C G 260 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=11.60;BaseQRankSum=-1.36;DP=26;ExcessHet=0.0000;FS=1.580;MQ=54.12;MQRankSum=0.928;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.49;SOR=0.625;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:20:35:1:.:.:0,35 0|1:12,13:25:99:.:0|1:1489726_C_G:290,0,444:1489726:5,7,7,6 +chrX 1489727 . G A 277 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=12.28;BaseQRankSum=2.294;DP=27;ExcessHet=0.0000;FS=3.682;MQ=53.65;MQRankSum=-0.271;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.232;SOR=1.152;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:20:35:1:.:.:0,35 0|1:14,11:25:99:.:1|0:1489726_C_G:307,0,512:1489726:8,6,4,7 +chrX 1490665 . A G 275 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=12.71;BaseQRankSum=-2.786;DP=25;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=39.12;MQRankSum=-0.294;QD=12.71;ReadPosRankSum=-2.171;SOR=0.883;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:35:1:0,35 0/1:10,14:24:99:.:305,0,249:6,4,9,5 +chrX 1491793 . A AAATG 832.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=22.36;BaseQRankSum=0.854;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=1.243;MQ=54.23;MQRankSum=-0.524;QD=22.36;ReadPosRankSum=1.289;SOR=0.791;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:35:1:0,35 0/1:17,22:39:99:.:872,0,612:9,8,10,12 +chrX 1491983 . C T 1107 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=8.81;BaseQRankSum=0.235;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=4.272;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.493;SOR=0.612;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,50:86:99:442,0:16,20,25,25 0/1:19,24:43:99:695,0,506:8,11,14,10 +chrX 1492360 . A G 4143 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=32.60;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=0.790;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2356,0:0,0,35,39 1/1:0,54:54:99:1817,162,0:0,0,26,28 +chrX 1492724 . C G 917 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=17.22;BaseQRankSum=-0.388;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.610;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,170 0/1:21,34:55:99:.:947,0,505:11,10,17,17 +chrX 1493056 . A G 700 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.97;BaseQRankSum=-0.86;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.992;MQ=59.81;MQRankSum=-1.474;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.557;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,170 0/1:32,29:61:99:.:730,0,869:11,21,11,18 +chrX 1493161 . G A 909 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=9.30;BaseQRankSum=1.275;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=10.967;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.079;SOR=0.193;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,23:45:40:40,0:7,15,10,13 0/1:25,31:56:99:899,0,670:2,23,9,22 +chrX 1493337 . AGGGG A 1067.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=31.99;BaseQRankSum=1.569;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.97;MQRankSum=0;QD=35.71;ReadPosRankSum=-1.265;SOR=3.193;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:762,0:.:0,0,18,2 1|1:1,10:11:23:0|1:1493337_AGGGG_A:345,23,0:1493337:1,0,10,0 +chrX 1493342 . AG A 1066.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=29.58;BaseQRankSum=1.064;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.86;MQRankSum=0;QD=35.68;ReadPosRankSum=-1.265;SOR=3.193;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:762,0:.:0,0,18,2 1|1:1,10:11:23:0|1:1493337_AGGGG_A:344,23,0:1493337:1,0,10,0 +chrX 1493395 . GGGAAGGA G 185.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=0;DP=37;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=0.524;QD=15.00;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=1.230;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:21:47:20:.:.:0,47 0|1:9,6:15:99:.:0|1:1493395_GGGAAGGA_G:225,0,360:1493395:8,1,6,0 +chrX 1493421 . GA G 179.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=12.88;BaseQRankSum=-1.162;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;MQRankSum=0.862;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.651;SOR=0.963;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:21:47:20:.:.:0,47 0|1:11,6:17:99:.:0|1:1493395_GGGAAGGA_G:219,0,444:1493395:10,1,6,0 +chrX 1493422 . A *,AAAG 444.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=10,11;AS_QD=0.00,32.25;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=3.004;MQ=60.00;QD=23.05;SOR=1.949;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,10,11:21:47:.:.:484,47,0:.:0,0,20,1 0|1:11,6,0:17:99:0|1:1493395_GGGAAGGA_G:219,0,444,252,462,714:1493395:10,1,6,0 +chrX 1493425 . G GGAGGA 86.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=5.04;BaseQRankSum=0.126;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=-0.806;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.073;SOR=0.990;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:11,14:25:99:.:126,0:9,2,12,2 0/0:.:17:45:17:0,45,675 +chrX 1493426 . AGGAGGGAGGGAAGG A 176.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=-1.231;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=0.825;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.106;SOR=0.859;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:23:23:23:.:.:0,23 0|1:12,6:18:99:.:0|1:1493395_GGGAAGGA_G:216,0,476:1493395:11,1,6,0 +chrX 1493445 . G A 257 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.63;BaseQRankSum=-1.072;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;MQRankSum=-1.05;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.416;SOR=0.627;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:10,17:27:99:.:287,0:8,2,13,4 0/0:.:20:33:16:0,33,466 +chrX 1493447 . A G 247 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.89;BaseQRankSum=-0.035;DP=46;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=-1.106;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.936;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:11,17:28:99:.:277,0:8,3,13,4 0/0:.:20:33:16:0,33,466 +chrX 1493460 . G GAA 317.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=22.31;BaseQRankSum=1.42;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.04;MQRankSum=-0.645;QD=22.31;ReadPosRankSum=-1.358;SOR=0.412;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,764 0/1:6,10:16:99:.:357,0,226:6,0,9,1 +chrX 1493461 . G A,GGAGGA 2489 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=40,10;AS_QD=35.31,25.59;BaseQRankSum=1.858;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=5.315;MQ=59.52;MQRankSum=-0.123;QD=49.39;ReadPosRankSum=0.05;SOR=1.846;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,34,0:35:99:1377,0,1386:0,1,21,13 1/2:0,6,10:16:99:1142,431,388,303,0,226:0,0,15,1 +chrX 1493548 . G C 877 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=12.42;BaseQRankSum=-0.391;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=3.169;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.022;SOR=1.148;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:16:65:0,16 0/1:38,35:73:99:.:907,0,1007:19,19,21,14 +chrX 1493797 . T C 4358 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=32.26;BaseQRankSum=1.408;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=6.314;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.26;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.266;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,69:71:99:2209,0:0,2,35,34 1/1:0,65:65:99:2179,195,0:0,0,35,30 +chrX 1493927 . C G 2381 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.49;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.49;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,448 1/1:0,72:72:99:.:2411,217,0:0,0,37,35 +chrX 1494202 . C G 2042 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=30.93;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.93;SOR=0.849;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,448 1/1:0,67:67:99:.:2072,200,0:0,0,31,36 +chrX 1494306 . C T 6876 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=155;AS_QD=30.96;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.55;SOR=0.966;VarDP=155 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,70:70:99:.:.:3140,0:.:0,0,36,34 1|1:0,85:85:99:0|1:1494306_C_T:3766,256,0:1494306:0,0,32,53 +chrX 1494310 . T C 6972 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=158;AS_QD=30.12;DP=162;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.32;SOR=0.914;VarDP=158 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,73:73:99:.:.:3238,0:.:0,0,38,35 1|1:0,85:85:99:0|1:1494306_C_T:3764,256,0:1494306:0,0,33,52 +chrX 1494528 . A T 4081 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=26.58;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.44;SOR=0.877;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2454,0:0,0,34,30 1/1:0,52:52:99:1657,155,0:0,0,29,23 +chrX 1494697 . G A 1885 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.60;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.60;SOR=1.047;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,110 1/1:0,57:57:99:.:1915,171,0:0,0,33,24 +chrX 1494869 . ATTT A,ATT,ATTTTT 1340.97 . AC=0,1,2;AF=0.00,0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=20,22,26;AS_QD=21.85,24.91,32.00;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=20.29;SOR=1.644;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,20,22,0:42:99:548,111,0,780:0,0,12,30 3/3:0,0,0,26:26:78:832,832,833,832,833,833,78,78,78,0:0,0,10,16 +chrX 1494964 . C T 1583 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.92;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;QD=32.92;SOR=1.609;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:84:52:0,84 1/1:0,49:49:99:.:1613,146,0:0,0,16,33 +chrX 1494984 . CT C 115.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=2.15;BaseQRankSum=-0.411;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=3.132;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.412;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,38:72:99:.:155,0:14,20,19,19 0/0:.:53:91:53:0,91,1508 +chrX 1495126 . C T 1689 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=33.71;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.71;SOR=1.565;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:78:99:78:0,1800 1/1:0,51:51:99:.:1719,153,0:0,0,34,17 +chrX 1495355 . G A 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=1.56;BaseQRankSum=1.857;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.148;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.56;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=1.121;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,37:73:99:.:114,0:18,18,15,22 0/0:.:58:99:58:0,101,1478 +chrX 1495461 . A C 2632 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=28.96;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.34;QD=36.97;SOR=0.934;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,72:72:99:.:2662,0:0,0,32,40 0/0:.:58:99:58:0,101,1478 +chrX 1495488 . A G 484 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.94;BaseQRankSum=-2.78;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=18.372;MQ=57.78;MQRankSum=-3.334;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.235;SOR=0.207;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:55:61:0,55 0/1:24,23:47:99:.:514,0,674:4,20,12,11 +chrX 1495556 . G C 117 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=3.77;BaseQRankSum=0.267;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=6.234;MQ=57.06;MQRankSum=-2.908;QD=3.77;ReadPosRankSum=-2.302;SOR=0.148;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:55:61:0,55 0/1:30,9:39:99:.:147,0,796:7,23,4,5 +chrX 1495599 . T C 2701 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=26.33;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=35.47;SOR=1.012;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:1683,0:.:0,0,22,30 1|1:0,25:25:75:0|1:1495599_T_C:1048,75,0:1495599:0,0,11,14 +chrX 1495622 . A G 1061 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=32.80;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.04;QD=43.64;SOR=0.770;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,248 1|1:0,25:25:75:.:0|1:1495599_T_C:1091,75,0:1495599:0,0,12,13 +chrX 1495791 . C G 763 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=22.66;BaseQRankSum=-1.484;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=5.290;MQ=58.58;MQRankSum=-0.173;QD=22.66;ReadPosRankSum=-1.277;SOR=0.334;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,248 0|1:14,21:35:99:.:0|1:1495791_C_G:793,0,525:1495791:10,4,10,11 +chrX 1495795 . C T 764 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=22.69;BaseQRankSum=-1.375;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=5.073;MQ=58.58;MQRankSum=-0.173;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.636;SOR=0.220;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,248 0|1:14,21:35:99:.:0|1:1495791_C_G:794,0,525:1495791:10,4,11,10 +chrX 1495800 . A G 703 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=22.21;BaseQRankSum=-1.193;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=5.440;MQ=58.53;MQRankSum=-0.256;QD=22.21;ReadPosRankSum=-1.66;SOR=0.348;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,248 0|1:14,19:33:99:.:0|1:1495791_C_G:733,0,531:1495791:10,4,9,10 +chrX 1496061 . T C 3526 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=23.87;BaseQRankSum=-0.885;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=9.660;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.87;ReadPosRankSum=2.247;SOR=0.226;VarDP=149 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2490,0:0,0,38,38 0/1:32,41:73:99:1066,0,834:10,22,19,22 +chrX 1496222 . C G 2227 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=17.63;BaseQRankSum=1.431;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=2.790;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.434;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,41:72:99:377,0:10,21,14,27 1/1:0,56:56:99:1880,168,0:0,0,25,31 +chrX 1496303 . A G 4019 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=32.39;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.39;SOR=0.709;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2314,0:0,0,34,37 1/1:0,54:54:99:1735,161,0:0,0,29,25 +chrX 1496494 . A G 618 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.79;BaseQRankSum=0.018;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=4.125;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=0.907;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,497 0/1:23,24:47:99:.:648,0,629:13,10,10,14 +chrX 1496603 . A G 632 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.51;BaseQRankSum=-2.518;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.59;SOR=0.749;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,497 0/1:24,25:49:99:.:662,0,687:7,17,7,18 +chrX 1496644 . G A 3598 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=25.50;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.02;SOR=1.014;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1766,0:0,0,26,22 1/1:0,50:50:99:1862,150,0:0,0,16,34 +chrX 1496655 . T A 544 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.48;BaseQRankSum=-0.027;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.202;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.373;SOR=1.041;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,516 0/1:27,23:50:99:.:574,0,729:9,18,6,17 +chrX 1496765 . T A 219 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=13.83;BaseQRankSum=-0.674;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;MQRankSum=0;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.693;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,516 0/1:9,9:18:99:.:249,0,259:0,9,0,9 +chrX 1496901 . G A 387 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=34.75;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.79;QD=34.75;SOR=5.136;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,516 1/1:0,12:12:36:.:417,36,0:0,0,12,0 +chrX 1496970 . G A 316 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=10.81;BaseQRankSum=-0.324;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.814;MQ=58.95;MQRankSum=1.717;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.115;SOR=1.329;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,516 0/1:17,15:32:99:.:346,0,422:13,4,13,2 +chrX 1497047 . T C 4051 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=26.27;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;QD=40.01;SOR=1.656;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2330,0:.:0,0,39,23 1|1:0,40:40:99:0|1:1497047_T_C:1751,120,0:1497047:0,0,30,10 +chrX 1497048 . G A 1721 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=32.66;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;QD=43.78;SOR=2.191;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,287 1|1:0,40:40:99:.:0|1:1497047_T_C:1751,120,0:1497047:0,0,30,10 +chrX 1497119 . G C 175 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=3.73;BaseQRankSum=-3.15;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.282;MQ=59.61;MQRankSum=-1.277;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.655;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,30:55:99:.:205,0:14,11,14,16 0/0:.:41:71:41:0,71,973 +chrX 1497141 . C G 230 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=5.00;BaseQRankSum=-1.816;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.052;MQ=59.58;MQRankSum=-1.244;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.632;SOR=0.532;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,29:52:99:.:260,0:13,10,15,14 0/0:.:41:71:41:0,71,973 +chrX 1497179 . G A 387 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=9.48;BaseQRankSum=0.909;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=4.635;MQ=59.61;MQRankSum=-0.709;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.223;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,28:44:99:.:417,0:11,5,14,14 0/0:.:41:71:41:0,71,973 +chrX 1497221 . C CA,CAA 682.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,15;AS_QD=31.92,32.73;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.83;QD=25.79;SOR=2.147;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:59:43:0,59,59 1/2:0,13,15:28:99:.:722,299,218,281,0,231:0,0,7,21 +chrX 1497529 . G A 600 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.50;BaseQRankSum=0.516;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.201;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.15;SOR=1.064;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1404 0/1:35,25:60:99:.:630,0,907:17,18,10,15 +chrX 1497573 . G A 585 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=8.20;BaseQRankSum=-0.147;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;MQRankSum=2.107;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.617;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,44:75:99:.:615,0:12,19,18,26 0/0:.:54:99:54:0,120,1800 +chrX 1497598 . C T 515 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=8.93;BaseQRankSum=-1.002;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;MQRankSum=2.133;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.595;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,36:61:99:.:545,0:9,16,14,22 0/0:.:54:99:54:0,120,1800 +chrX 1497602 . G A 899 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.59;BaseQRankSum=1.371;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=10.144;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.241;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1305 0/1:23,33:56:99:.:929,0,561:6,17,17,16 +chrX 1497639 . C CAA 661.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.75;BaseQRankSum=0.803;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=17.863;MQ=59.70;MQRankSum=-1.257;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.682;SOR=2.937;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1305 0/1:32,19:51:99:.:701,0,1234:17,15,3,16 +chrX 1497656 . A AAAAT 490.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=16.06;BaseQRankSum=1.464;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=7.791;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.328;SOR=1.149;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1305 0/1:19,14:33:99:.:530,0,756:12,7,5,9 +chrX 1498278 . T C 2555 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=23.29;BaseQRankSum=-0.493;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.889;MQ=55.44;MQRankSum=-3.214;QD=23.29;ReadPosRankSum=2.635;SOR=0.921;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,33:59:99:.:.:404,0:.:10,16,9,24 1|1:0,52:52:99:0|1:1498278_T_C:2181,156,0:1498278:0,0,20,32 +chrX 1498302 . A G 2456 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=27.02;BaseQRankSum=-0.66;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.89;MQRankSum=-2.524;QD=27.02;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.622;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:18,32:50:99:.:.:607,0:.:5,13,9,23 1|1:0,42:42:99:0|1:1498278_T_C:1879,126,0:1498278:0,0,14,28 +chrX 1498330 . T C 691 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=9.61;BaseQRankSum=-1.355;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.845;MQ=51.80;MQRankSum=-0.264;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=1.362;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,26:43:99:263,0:7,10,7,19 0/1:18,14:32:99:458,0,693:7,11,4,10 +chrX 1498337 . C T 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=20.89;BaseQRankSum=1.523;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=3.969;MQ=49.96;MQRankSum=0.424;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.169;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:29:32:0,29 0/1:12,16:28:99:.:585,0,432:2,10,6,10 +chrX 1498355 . G A 1095 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=40.38;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.11;QD=45.00;SOR=0.941;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:29:32:.:.:0,29 1|1:0,25:25:75:.:0|1:1498355_G_A:1125,75,0:1498355:0,0,11,14 +chrX 1498368 . T C 985 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=34.64;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.84;QD=44.13;SOR=0.776;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:29:32:.:.:0,29 1|1:0,23:23:69:.:0|1:1498355_G_A:1015,69,0:1498355:0,0,12,11 +chrX 1498400 . T C 921 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=25.65;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.89;QD=36.58;SOR=1.697;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:29:32:0,29 1/1:0,26:26:78:.:951,78,0:0,0,18,8 +chrX 1498405 . C CA 189.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=6.94;BaseQRankSum=0.403;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.423;MQ=56.15;MQRankSum=-1.634;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.301;SOR=1.065;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:29:32:0,29 0/1:16,17:33:99:.:229,0,246:10,6,12,5 +chrX 1498522 . AT A 920.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.84;BaseQRankSum=-0.85;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;MQRankSum=0;QD=16.84;ReadPosRankSum=-1.196;SOR=0.638;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:29:32:.:.:0,29 0|1:29,28:57:99:.:0|1:1498522_AT_A:960,0,1009:1498522:17,12,16,12 +chrX 1498540 . G A 906 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.86;BaseQRankSum=1.481;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;MQRankSum=0;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.765;SOR=0.689;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:29:32:.:.:0,29 0|1:36,27:63:99:.:0|1:1498522_AT_A:936,0,1200:1498522:20,16,15,12 +chrX 1498566 . A G 518 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=6.09;BaseQRankSum=1.913;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=2.766;MQ=59.35;MQRankSum=0;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.47;SOR=0.857;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,19:35:99:102,0:11,5,10,9 0/1:36,19:55:99:446,0,881:14,22,11,8 +chrX 1498708 . C G 615 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=26;AS_QD=14.33;BaseQRankSum=-0.405;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;MQRankSum=-1.19;QD=14.33;ReadPosRankSum=1.862;SOR=0.693;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:58:.:58:0,0 0/1:19,26:45:99:.:645,0,460:11,8,15,11 +chrX 1498948 . C T 926 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=8.54;BaseQRankSum=-0.175;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=14.357;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.787;SOR=0.954;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,29:55:99:111,0:16,10,17,12 0/1:26,31:57:99:845,0,706:4,22,19,12 +chrX 1499022 . A G 896 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=7.29;BaseQRankSum=-0.007;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=1.429;MQ=59.75;MQRankSum=1.31;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.885;SOR=0.549;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,37:72:74:74,0:21,14,22,15 0/1:21,34:55:99:852,0,530:12,9,17,17 +chrX 1499113 . A G 1209 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=9.46;BaseQRankSum=-0.577;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.665;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.586;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,42:76:99:213,0:12,22,23,19 0/1:17,38:55:99:1026,0,391:15,2,17,21 +chrX 1499161 . TTC T 1460.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=12.61;BaseQRankSum=2.587;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.322;MQ=59.26;MQRankSum=1.323;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.856;SOR=0.460;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,34:61:99:.:.:264,0:.:10,17,16,18 0|1:25,33:58:99:0|1:1499161_TTC_T:1236,0,931:1499161:20,5,18,15 +chrX 1499165 . T G 1470 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=12.61;BaseQRankSum=0.583;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.322;MQ=59.25;MQRankSum=1.323;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.776;SOR=0.460;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,34:61:99:.:.:264,0:.:10,17,16,18 0|1:25,33:58:99:0|1:1499161_TTC_T:1236,0,931:1499161:20,5,18,15 +chrX 1499168 . T C 1174 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=21.12;BaseQRankSum=0.995;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=10.482;MQ=58.93;MQRankSum=1.29;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.123;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,1236 0|1:25,32:57:99:.:0|1:1499161_TTC_T:1204,0,934:1499161:20,5,18,14 +chrX 1499510 . T C 864 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=12.96;BaseQRankSum=-2.095;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.918;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.713;SOR=0.527;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,168 0/1:33,36:69:99:.:894,0,880:14,19,17,19 +chrX 1499547 . T A 853 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.12;BaseQRankSum=0.974;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=6.730;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.67;SOR=0.403;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:84:84,0:12,18,19,13 0/1:31,31:62:99:799,0,806:12,19,13,18 +chrX 1499840 . TTTTTGTTTTG T 426.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=8.47;BaseQRankSum=-1.03;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=22.983;MQ=59.45;MQRankSum=1.262;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.23;SOR=1.872;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,33:55:99:.:466,0:7,15,24,9 0/0:.:66:99:66:0,120,1800 +chrX 1499944 . C T 813 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.60;BaseQRankSum=2.543;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.161;MQ=57.45;MQRankSum=-2.903;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.998;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:38,24:62:99:.:0|1:1499944_C_T:843,0,1435:1499944:21,17,15,9 +chrX 1499958 . C A 772 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.59;BaseQRankSum=1.576;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.027;MQ=57.33;MQRankSum=-3.016;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.101;SOR=0.852;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:37,22:59:99:.:0|1:1499944_C_T:802,0,1460:1499944:22,15,14,8 +chrX 1499959 . C T 772 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.59;BaseQRankSum=1.804;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.027;MQ=57.33;MQRankSum=-3.016;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.448;SOR=0.852;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:37,22:59:99:.:0|1:1499944_C_T:802,0,1460:1499944:22,15,14,8 +chrX 1499966 . C G 656 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.25;BaseQRankSum=0.506;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.098;MQ=57.24;MQRankSum=-3.299;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.02;SOR=0.947;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:37,19:56:99:.:0|1:1499944_C_T:686,0,1449:1499944:21,16,12,7 +chrX 1499997 . T C 224 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=5.91;BaseQRankSum=-1.154;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.556;MQ=56.27;MQRankSum=-4.413;QD=5.91;ReadPosRankSum=-2.346;SOR=1.022;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:34,9:43:99:.:0|1:1499997_T_C:254,0,1350:1499997:23,11,7,2 +chrX 1500003 . CGTGT C 222.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=5.95;BaseQRankSum=1.056;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.579;MQ=56.77;MQRankSum=-5.019;QD=5.95;ReadPosRankSum=-2.914;SOR=1.127;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:35,9:44:99:.:0|1:1499997_T_C:262,0,1422:1499997:23,12,7,2 +chrX 1500007 . T TACCC 155.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=4.88;BaseQRankSum=0.365;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.45;MQRankSum=-5.606;QD=4.88;ReadPosRankSum=-3.125;SOR=0.874;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:33,7:40:99:.:0|1:1499997_T_C:195,0,1365:1499997:21,12,5,2 +chrX 1500015 . T C 36 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=1.74;BaseQRankSum=0.799;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=5.593;MQ=56.98;MQRankSum=-5.387;QD=1.74;ReadPosRankSum=-2.181;SOR=2.621;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:34,4:38:66:.:0|1:1499997_T_C:66,0,1416:1499997:20,14,4,0 +chrX 1500019 . C T 39 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=1.86;BaseQRankSum=0.992;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=5.591;MQ=56.62;MQRankSum=-5.312;QD=1.86;ReadPosRankSum=-2.076;SOR=2.712;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:33,4:37:69:.:0|1:1499997_T_C:69,0,1374:1499997:19,14,4,0 +chrX 1500020 . A G 39 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=1.86;BaseQRankSum=-0.224;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=5.591;MQ=56.62;MQRankSum=-5.312;QD=1.86;ReadPosRankSum=-2.102;SOR=2.712;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1146 0|1:33,4:37:69:.:0|1:1499997_T_C:69,0,1374:1499997:19,14,4,0 +chrX 1500060 . G A 2131 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=21.19;BaseQRankSum=1.735;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=6.811;MQ=56.92;MQRankSum=-3.267;QD=21.19;ReadPosRankSum=-1.308;SOR=0.801;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1956,0:0,0,23,36 0/1:33,10:43:99:205,0,887:19,14,7,3 +chrX 1500148 . G A 1095 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=16.54;BaseQRankSum=-0.955;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=0.931;MQ=57.64;MQRankSum=-2.936;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.189;SOR=0.551;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:99:74:.:.:0,431 0|1:38,30:68:99:.:0|1:1500148_G_A:1125,0,1489:1500148:15,23,13,17 +chrX 1500153 . C A 1079 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.84;BaseQRankSum=0.404;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=0.913;MQ=58.10;MQRankSum=-2.739;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.426;SOR=0.568;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:99:74:.:.:0,431 0|1:40,30:70:99:.:0|1:1500148_G_A:1109,0,1553:1500148:16,24,13,17 +chrX 1500162 . G T 1051 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.67;BaseQRankSum=-1.363;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.51;MQRankSum=-2.081;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.604;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:99:74:.:.:0,431 0|1:39,30:69:99:.:0|1:1500148_G_A:1081,0,1500:1500148:16,23,13,17 +chrX 1500182 . T C 515 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=7.57;BaseQRankSum=-0.299;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=18.291;MQ=59.27;MQRankSum=1.043;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.774;SOR=1.221;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,45:72:99:.:545,0:18,9,16,29 0/0:.:73:26:58:0,26,1414 +chrX 1500616 . TG T 1013.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=-1.984;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=-0.824;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.079;SOR=0.674;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1800 0/1:23,31:54:99:.:1053,0,767:11,12,15,16 +chrX 1500680 . C T 57 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=1.28;BaseQRankSum=0.16;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=2.086;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=1.071;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,35:68:87:.:87,0:14,19,12,23 0/0:.:63:99:63:0,107,1558 +chrX 1500694 . A C 68 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=1.44;BaseQRankSum=-1.598;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.958;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=0.922;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,35:68:98:.:98,0:13,20,12,23 0/0:.:63:99:63:0,107,1558 +chrX 1500699 . A T 109 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=2.07;BaseQRankSum=-0.547;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.403;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.49;SOR=1.140;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,35:67:99:.:139,0:13,19,11,24 0/0:.:63:99:63:0,107,1558 +chrX 1501258 . T G 883 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.83;BaseQRankSum=0.433;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=1.998;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.83;ReadPosRankSum=2.086;SOR=0.484;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1524 0/1:32,34:66:99:.:913,0,834:18,14,17,17 +chrX 1501593 . T A 1199 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=33.22;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.22;SOR=1.432;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1524 1/1:0,37:37:99:.:1229,111,0:0,0,24,13 +chrX 1501739 . G A 420 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.23;BaseQRankSum=0.961;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.186;MQ=59.18;MQRankSum=-1.102;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.521;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,27:44:99:.:450,0:11,6,16,11 0/0:.:52:52:52:0,52,1122 +chrX 1501743 . A C 395 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=9.44;BaseQRankSum=-0.345;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.18;MQRankSum=-1.135;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.638;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,27:45:99:.:425,0:11,7,16,11 0/0:.:52:52:52:0,52,1122 +chrX 1501755 . G A 248 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=5.56;BaseQRankSum=1.38;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.113;MQ=59.27;MQRankSum=-1.29;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.976;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,27:50:99:.:278,0:13,10,17,10 0/0:.:52:52:52:0,52,1122 +chrX 1501944 . T C 736 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.21;BaseQRankSum=-2.037;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.076;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.483;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:54:60:0,54 0/1:27,31:58:99:.:766,0,725:19,8,20,11 +chrX 1502069 . T C 2544 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.98;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=36.25;SOR=0.721;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:54:60:0,54 1/1:0,71:71:99:.:2574,213,0:0,0,35,36 +chrX 1502088 . A T 691 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.27;BaseQRankSum=0.437;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.112;MQ=59.79;MQRankSum=-0.795;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.44;SOR=1.038;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:54:60:0,54 0/1:36,28:64:99:.:721,0,987:17,19,11,17 +chrX 1502158 . A G 843 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.47;BaseQRankSum=0.696;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=1.990;MQ=59.57;MQRankSum=-1.141;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.33;SOR=0.763;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:54:60:0,54 0/1:37,33:70:99:.:873,0,967:20,17,15,18 +chrX 1502486 . A T 720 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.39;BaseQRankSum=-0.871;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.533;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.812;SOR=1.561;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:54:60:0,54 0/1:28,28:56:99:.:750,0,785:15,13,9,19 +chrX 1502817 . A G 5165 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=32.65;BaseQRankSum=3.981;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.275;MQ=56.95;MQRankSum=0.47;QD=38.77;ReadPosRankSum=0.663;SOR=1.022;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,79:82:99:.:.:3379,0:.:1,2,44,35 0|1:7,45:52:99:0|1:1502817_A_G:1816,0,158:1502817:4,3,27,18 +chrX 1502823 . C A 5229 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=29.32;BaseQRankSum=2.604;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.257;MQ=57.00;MQRankSum=0.47;QD=39.25;ReadPosRankSum=0.704;SOR=0.981;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,79:82:99:.:.:3420,0:.:1,2,44,35 0|1:7,45:52:99:0|1:1502817_A_G:1839,0,158:1502817:4,3,26,19 +chrX 1502829 . A G 5284 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=32.33;BaseQRankSum=2.708;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.02;MQRankSum=0.481;QD=39.36;ReadPosRankSum=0.801;SOR=0.882;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,80:83:99:.:.:3465,0:.:1,2,44,36 0|1:7,45:52:99:0|1:1502817_A_G:1849,0,158:1502817:4,3,24,21 +chrX 1502833 . C T 5180 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=30.77;BaseQRankSum=1.997;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.21;MQRankSum=0.507;QD=39.47;ReadPosRankSum=0.926;SOR=0.656;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,79:82:99:.:.:3400,0:.:1,2,42,37 0|1:6,44:50:99:0|1:1502817_A_G:1810,0,120:1502817:4,2,24,20 +chrX 1502842 . A G 5163 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=28.48;BaseQRankSum=1.735;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.056;MQ=57.20;MQRankSum=-1.182;QD=41.54;ReadPosRankSum=1.18;SOR=0.273;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,75:75:99:.:.:3334,0:.:0,0,38,37 0|1:4,46:50:30:0|1:1502817_A_G:1859,0,30:1502817:3,1,26,20 +chrX 1503405 . A G 4083 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=32.90;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.90;SOR=0.845;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1870,0:0,0,30,26 1/1:0,69:69:99:2243,206,0:0,0,37,32 +chrX 1503859 . T A 817 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.66;BaseQRankSum=0.676;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=9.305;MQ=59.54;MQRankSum=1.496;QD=13.66;ReadPosRankSum=2.043;SOR=1.911;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1785 0/1:30,32:62:99:.:847,0,772:15,15,9,23 +chrX 1504110 . A G 3994 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=33.53;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=33.53;SOR=0.950;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:2005,0:0,0,32,27 1/1:0,61:61:99:2019,183,0:0,0,35,26 +chrX 1504209 . G A 654 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.44;BaseQRankSum=0.672;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.52;MQRankSum=0;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.665;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,154 0/1:30,25:55:99:.:684,0,823:13,17,11,14 +chrX 1504315 . C CAA,CA 2323.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=58,20;AS_QD=23.47,7.83;BaseQRankSum=-0.587;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=16.403;MQ=59.56;MQRankSum=0;QD=22.50;ReadPosRankSum=-0.14;SOR=0.106;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58,0:58:99:1995,0,1996:0,0,26,32 0/2:27,0,20:47:99:368,449,1122,0,673,613:6,21,12,8 +chrX 1504524 . G A 759 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.52;BaseQRankSum=0.19;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.014;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.487;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:44:68:0,44 0/1:34,29:63:99:.:789,0,952:23,11,18,11 +chrX 1504641 . T C 633 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.69;BaseQRankSum=-0.547;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=2.155;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.428;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:44:68:0,44 0/1:35,27:62:99:.:663,0,956:14,21,13,14 +chrX 1504707 . T C 4129 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=31.27;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=31.27;SOR=0.770;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,79:79:99:2474,0:0,0,38,41 1/1:0,54:54:99:1685,161,0:0,0,26,28 +chrX 1504903 . C T 778 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=5.46;BaseQRankSum=-0.085;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;MQRankSum=-0.826;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.349;SOR=0.704;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,37:72:59:59,0:17,18,18,19 0/1:44,32:76:99:749,0,1140:21,23,15,17 +chrX 1505007 . A G 801 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.58;BaseQRankSum=0.669;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.341;MQ=59.64;MQRankSum=-0.414;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.877;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,124 0/1:26,31:57:99:.:831,0,648:15,11,13,18 +chrX 1505054 . C T 676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.84;BaseQRankSum=0.331;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.387;MQ=59.60;MQRankSum=-0.463;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.522;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,124 0/1:24,27:51:99:.:706,0,577:10,14,14,13 +chrX 1505137 . C CAAAAAAA,CA 1375.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=40,16;AS_QD=18.96,15.52;BaseQRankSum=-1.282;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.490;MQ=58.33;MQRankSum=-1.182;QD=19.93;ReadPosRankSum=-2.406;SOR=0.929;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,22,0:37:99:250,0,927:8,7,8,14 1/2:0,18,16:34:99:1165,372,603,748,0,684:0,0,16,18 +chrX 1505414 . A G 1718 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=30.67;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.67;SOR=0.877;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1448 1/1:0,57:57:99:.:1748,170,0:0,0,31,26 +chrX 1505526 . C A 4318 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=33.19;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=33.19;SOR=1.061;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2071,0:0,0,39,22 1/1:0,70:70:99:2277,210,0:0,0,37,33 +chrX 1505549 . G C 88 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=1.90;BaseQRankSum=-0.36;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.060;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.479;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,33:62:99:.:118,0:21,8,22,11 0/0:.:72:99:72:0,120,1800 +chrX 1505644 . G A 1859 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=31.48;BaseQRankSum=2.334;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.802;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.48;ReadPosRankSum=-1.617;SOR=0.843;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,939 1/1:1,59:60:99:.:1889,170,0:0,1,35,24 +chrX 1505667 . G A 2015 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.98;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.98;SOR=0.976;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,939 1/1:0,62:62:99:.:2045,186,0:0,0,35,27 +chrX 1505855 . G A 2062 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=32.18;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.18;SOR=1.078;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,939 1/1:0,65:65:99:.:2092,195,0:0,0,27,38 +chrX 1505987 . CTT C 442.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=21.91;BaseQRankSum=0;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=12.632;MQ=59.01;MQRankSum=-0.265;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.383;SOR=1.402;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,939 0/1:3,19:22:4:.:482,0,4:3,0,6,13 +chrX 1506079 . G A 1230 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=14.32;BaseQRankSum=0.711;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=4.621;MQ=59.65;MQRankSum=1.488;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.54;SOR=0.946;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,25:49:55:55,0:13,11,13,12 1/1:0,39:39:99:1205,116,0:0,0,14,25 +chrX 1506682 . CT C 885.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=26.43;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=26.43;SOR=1.148;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1648 1/1:0,35:35:99:.:925,106,0:0,0,14,21 +chrX 1506815 . T C 2292 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=21.70;BaseQRankSum=0.561;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.268;MQ=57.13;MQRankSum=-0.318;QD=21.70;ReadPosRankSum=-0.98;SOR=0.539;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,36:63:99:.:.:364,0:.:11,16,20,16 1|1:0,44:44:99:0|1:1506815_T_C:1958,132,0:1506815:0,0,22,22 +chrX 1506823 . A G 4676 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=26.52;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.91;QD=44.40;SOR=0.731;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2748,0:.:0,0,31,31 1|1:0,44:44:99:0|1:1506815_T_C:1958,132,0:1506815:0,0,23,21 +chrX 1506878 . G T 3510 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=33.08;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.92;QD=33.08;SOR=0.830;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2169,0:0,0,40,25 1/1:0,42:42:99:1371,126,0:0,0,17,25 +chrX 1506968 . G A 1513 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=30.25;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.07;QD=30.25;SOR=1.201;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:12:56:0,12 1/1:0,51:51:99:.:1543,152,0:0,0,20,31 +chrX 1507025 . C CCCCATGGCTAAAGTTAAGATGCAATTTAGGTGGAAGCGA,CCCCATGGCTAAAGTTAAGATGCAATTTAGTTGGAAGCGA 4902.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=3,92;AS_QD=29.50,28.60;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=52.02;SOR=0.714;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,3,43:46:99:2747,1396,0:0,0,20,26 2/2:0,0,49:49:99:2195,2199,2202,144,147,0:0,0,27,22 +chrX 1507164 . T C 1652 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=16.17;BaseQRankSum=3.097;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=0.746;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,32:60:99:247,0:14,14,16,16 1/1:0,44:44:99:1435,131,0:0,0,23,21 +chrX 1507210 . G C 1996 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=19.11;BaseQRankSum=1.81;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=11.888;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.76;SOR=0.937;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,29:52:99:234,0:9,14,19,10 1/1:1,53:54:99:1792,128,0:0,1,30,23 +chrX 1507317 . A G 226 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=6.56;BaseQRankSum=-1.618;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.294;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=0.399;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,24:39:99:.:256,0:9,6,12,12 0/0:.:57:72:57:0,72,1419 +chrX 1507351 . T G 1697 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=32.58;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.58;SOR=0.808;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:1727,0:0,0,28,25 0/0:.:57:72:57:0,72,1419 +chrX 1507378 . C G 1796 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.61;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.61;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:1826,0:0,0,30,26 0/0:.:57:72:57:0,72,1419 +chrX 1508601 . CATCT C 252.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=4.95;BaseQRankSum=-0.836;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.239;MQ=57.73;MQRankSum=-3.027;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.102;SOR=0.850;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,33:59:99:.:292,0:15,11,14,19 0/0:.:57:72:57:0,72,1419 +chrX 1508704 . TTCTATCTA T,TTCTA 1010.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,10;AS_QD=29.34,31.42;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.26;QD=40.38;SOR=1.022;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,919,919 1/2:0,16,10:26:99:.:1050,419,483,629,0,598:0,0,15,11 +chrX 1508853 . TCATC T 854.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=19.02;BaseQRankSum=-0.128;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=8.463;MQ=50.02;MQRankSum=-3.554;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.759;SOR=0.459;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,919 0/1:23,24:47:99:.:894,0,858:16,7,11,13 +chrX 1509002 . TCATCCATC T,TCATCCATCCATC,TCATCCATCCATCCATC,TCATTCATCCATCCATC 2414.97 . AC=0,1,1,0;AF=0.00,0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=4,35,23,0;AS_QD=0.00,28.25,23.34,13.33;BaseQRankSum=-1.546;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.608;MQ=57.25;MQRankSum=-0.285;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.539;SOR=0.368;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,4,35,0,0:39:99:1497,1896,0,1951,1951:0,0,18,21 0/3:18,0,0,23,0:41:99:957,927,1825,927,1825,1825,0,794,794,691,717,1682,1682,764,1822:11,7,13,10 +chrX 1509099 . GTATCTATC G,GTATCTATCTATC 1423.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=20,17;AS_QD=29.43,36.57;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;QD=39.54;SOR=2.242;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1165,1165 1/2:0,20,17:37:99:.:1463,713,780,755,0,718:0,0,9,28 +chrX 1509161 . TTCTATCTA T,TTCTA,TTCTATCTATCTATCTATCTA 1880.97 . AC=0,1,1;AF=0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=15,24,24;AS_QD=12.34,18.34,15.95;BaseQRankSum=1.83;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.798;MQ=59.17;MQRankSum=-1.1;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=0.501;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,15,24,0:40:99:1027,447,0,1100:0,0,17,22 0/3:31,0,0,24:55:99:893,1029,2566,1029,2566,2566,0,1308,1308,1190:12,19,11,13 +chrX 1509263 . CATCT C 89.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=3.39;BaseQRankSum=0.616;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=4.815;MQ=58.83;MQRankSum=-1.322;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.929;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,20:38:99:.:129,0:7,11,12,8 0/0:.:55:51:55:0,51,1196 +chrX 1509374 . TTCTATCTATCTATCTATCTA T,TTCTATCTATCTATCTA,TTCTATCTATCTATCTATCTATCTA,TCCATTTCTATCTATCTATCTATCTATCTA 1167.97 . AC=1,1,1,0;AF=0.333,0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=22,14,13,0;AS_QD=4.73,17.34,15.84,0.00;BaseQRankSum=0;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=13.020;MQ=54.96;MQRankSum=-2.123;QD=18.01;ReadPosRankSum=-1.914;SOR=1.492;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,22,0,0,0:40:99:189,0,987,987,987:11,7,9,13 2/3:0,0,14,13,0:27:99:1018,1032,1120,463,544,501,527,576,0,537,1071,1121,542,585,1778:0,0,7,20 +chrX 1509421 . T TTATC 663.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=25.11;BaseQRankSum=0.253;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=10.089;MQ=48.86;MQRankSum=-0.125;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.36;SOR=0.058;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,1407 0/1:10,18:28:99:.:703,0,361:1,9,8,10 +chrX 1509515 . TCATC TCATCCATC,T 294.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=17,7;AS_QD=2.14,5.68;BaseQRankSum=0.994;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.034;MQ=51.11;MQRankSum=-3.261;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.978;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,17,0:32:99:107,0,759:6,9,6,11 0/2:18,0,7:25:99:227,282,1026,0,744,723:10,8,4,3 +chrX 1509668 . T TCATC 524.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=25.64;BaseQRankSum=0;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=19.633;MQ=55.08;MQRankSum=-0.261;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.811;SOR=3.901;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,199 0/1:8,14:22:99:.:564,0,294:3,5,13,1 +chrX 1509751 . G GTCTATCTATCTATCTATCTA 713.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=20.92;BaseQRankSum=-1.901;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.301;MQ=57.84;MQRankSum=-2.624;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=0.459;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,199 0/1:15,21:36:99:.:753,0,549:9,6,11,10 +chrX 1509982 . C CATCT 983.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=10.77;BaseQRankSum=2.457;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.730;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,25:48:99:109,0:17,6,19,6 0/1:21,26:47:99:914,0,774:12,9,15,11 +chrX 1511536 . A T 1161 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=9.23;BaseQRankSum=0.058;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.170;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.472;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,45:76:99:442,0:19,12,25,20 0/1:26,27:53:99:749,0,718:14,12,12,15 +chrX 1511712 . C T 1002 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=8.53;BaseQRankSum=0.405;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.446;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.542;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,33:61:99:206,0:14,14,14,19 0/1:31,29:60:99:826,0,894:18,13,17,12 +chrX 1512546 . C CA,CAA 1340.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=42,19;AS_QD=25.98,30.16;BaseQRankSum=2.209;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.89;MQRankSum=-0.198;QD=22.26;ReadPosRankSum=0.61;SOR=0.563;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,6,19:25:99:705,263,0:0,0,17,8 1/1:1,36,0:37:96:675,96,0,679,105,687:1,0,22,14 +chrX 1512836 . AATTATT A 3763.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=30.24;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=44.22;SOR=1.065;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:2103,0:0,0,23,25 1/1:0,38:38:99:1700,115,0:0,0,13,25 +chrX 1512901 . C G 4328 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=29.44;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.54;QD=43.58;SOR=0.818;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48:48:99:.:.:2099,0:.:0,0,25,23 1|1:0,52:52:99:0|1:1512901_C_G:2259,156,0:1512901:0,0,28,24 +chrX 1512926 . G A 4878 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=25.07;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;QD=44.62;SOR=0.931;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2329,0:.:0,0,30,22 1|1:0,58:58:99:0|1:1512901_C_G:2579,175,0:1512901:0,0,31,27 +chrX 1512928 . A G 4844 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=27.43;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.36;QD=44.72;SOR=0.912;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2329,0:.:0,0,30,22 1|1:0,57:57:99:0|1:1512901_C_G:2545,172,0:1512901:0,0,30,27 +chrX 1513022 . C T 2393 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.74;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.10;QD=32.74;SOR=1.457;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1347,0:0,0,12,30 1/1:0,32:32:96:1076,96,0:0,0,14,18 +chrX 1513207 . T C 618 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=6.42;BaseQRankSum=1.201;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.014;SOR=0.714;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,31:62:71:71,0:15,16,17,14 0/1:16,23:39:99:577,0,414:10,6,12,11 +chrX 1513214 . A G 3862 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=30.32;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=38.16;SOR=0.815;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2355,0:0,0,32,31 1/1:0,39:39:99:1537,117,0:0,0,22,17 +chrX 1513246 . C CT 2775.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=27.87;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=27.87;SOR=0.713;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1581,0:0,0,27,30 1/1:0,44:44:99:1234,132,0:0,0,23,21 +chrX 1513488 . C G 618 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=6.17;BaseQRankSum=0.584;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=7.764;MQ=59.92;MQRankSum=0.948;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.384;SOR=0.280;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,28:52:28:28,0:7,17,14,14 0/1:29,24:53:99:620,0,779:11,18,11,13 +chrX 1514046 . C T 945 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=12.66;BaseQRankSum=0.355;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=3.043;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.414;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1379 0/1:40,37:77:99:.:975,0,1059:16,24,18,19 +chrX 1514180 . C T 3610 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=32.79;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=0.711;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1960,0:0,0,31,29 1/1:0,51:51:99:1680,153,0:0,0,25,26 +chrX 1514329 . TCTTTC T 69.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=1.82;BaseQRankSum=-2.047;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=2.177;MQ=59.02;MQRankSum=1.498;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.751;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,31:60:99:.:109,0:13,16,17,14 0/0:.:22:28:19:0,28,585 +chrX 1514804 . C T 546 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=23.04;BaseQRankSum=2.655;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=27.681;MQ=56.97;MQRankSum=-0.098;QD=23.04;ReadPosRankSum=1.527;SOR=4.034;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,193 0|1:10,15:25:99:.:0|1:1514804_C_T:576,0,349:1514804:7,3,1,14 +chrX 1514811 . T TCCTTCCCTTTC 539.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=24.13;BaseQRankSum=2.387;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=31.270;MQ=56.33;MQRankSum=0;QD=24.13;ReadPosRankSum=0.269;SOR=4.032;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,193 0|1:9,15:24:99:.:0|1:1514804_C_T:579,0,320:1514804:7,2,1,14 +chrX 1514827 . C T 350 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=20.00;BaseQRankSum=2.122;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=22.614;MQ=55.94;MQRankSum=0.23;QD=20.00;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=3.224;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,193 0|1:9,10:19:99:.:0|1:1514804_C_T:380,0,335:1514804:7,2,1,9 +chrX 1514835 . T TTCCCTTTTCCTTTCCTTCCCTTCCC,TTCCCTTCCC 713.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=10,9;AS_QD=25.56,25.21;BaseQRankSum=-0.723;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=1.958;MQ=55.11;MQRankSum=0.349;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.368;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,6,0:12:38:38,0,249:1,5,1,5 1/2:0,4,9:13:99:715,370,344,168,0,252:0,0,5,8 +chrX 1514883 . TCTCCCCTCCCCTTCCC T 387.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=26.69;BaseQRankSum=-0.774;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=5.119;MQ=57.75;MQRankSum=-0.539;QD=26.69;ReadPosRankSum=-1.567;SOR=0.419;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:40:8:0,40 0/1:5,11:16:99:.:427,0,177:1,4,6,5 +chrX 1515333 . T C 676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.97;BaseQRankSum=-0.295;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=5.293;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.507;SOR=1.244;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:47:99:47:0,391 0/1:32,27:59:99:.:706,0,895:15,17,17,10 +chrX 1515376 . CT C,CTT 754.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=42,22;AS_QD=8.73,5.95;BaseQRankSum=1.37;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=1.666;MQ=59.49;MQRankSum=0.839;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.672;SOR=0.529;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,18,22:40:99:351,104,0:0,0,21,19 0/1:37,24,0:61:99:443,0,779,554,852,1406:22,15,14,10 +chrX 1515425 . G T 883 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.49;BaseQRankSum=-1.361;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=5.062;MQ=59.56;MQRankSum=-0.862;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.861;SOR=0.604;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:39:47:0,39 0/1:28,35:63:99:.:913,0,983:17,11,16,19 +chrX 1515448 . C T 685 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.12;BaseQRankSum=2.977;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=7.160;MQ=59.52;MQRankSum=0.922;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=1.082;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:39:47:0,39 0/1:33,26:59:99:.:715,0,1276:14,19,16,10 +chrX 1515801 . A C 87 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=1.72;BaseQRankSum=-2.404;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.908;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.197;SOR=0.571;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,37:68:99:.:117,0:17,14,19,18 0/0:.:67:99:67:0,120,1800 +chrX 1515812 . C T 548 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.17;BaseQRankSum=0.474;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.195;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.214;SOR=0.434;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1800 0/1:40,23:63:99:.:578,0,1131:24,16,12,11 +chrX 1515830 . G A 167 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=3.46;BaseQRankSum=-0.373;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.032;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.534;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,32:57:99:.:197,0:16,9,19,13 0/0:.:63:99:63:0,118,1573 +chrX 1515946 . T TG 362.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.57;BaseQRankSum=-1.291;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=5.229;MQ=59.74;MQRankSum=-1.528;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=1.769;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,158 0|1:30,12:42:99:.:0|1:1515946_T_TG:402,0,1183:1515946:16,14,9,3 +chrX 1515947 . C G 400 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=9.77;BaseQRankSum=2.113;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=7.035;MQ=59.75;MQRankSum=-1.494;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.376;SOR=1.833;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,158 0|1:31,13:44:99:.:0|1:1515946_T_TG:430,0,1210:1515946:17,14,10,3 +chrX 1515954 . T G 369 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.28;BaseQRankSum=0.041;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=7.857;MQ=59.74;MQRankSum=-1.555;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.265;SOR=2.116;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,158 0|1:31,12:43:99:.:0|1:1515946_T_TG:399,0,1222:1515946:18,13,10,2 +chrX 1516020 . TAAA T,CAAA 1331 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=46,1;AS_QD=16.40,0.00;BaseQRankSum=0.765;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.835;MQ=59.01;MQRankSum=-1.415;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.995;SOR=0.998;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:11,23,1:35:99:.:.:495,0,1000:.:3,8,8,15 0|1:26,23,0:49:99:0|1:1516020_TAAA_T:866,0,1001,944,1070,2014:1516020:14,12,10,13 +chrX 1516038 . A G 1445 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=15.69;BaseQRankSum=-0.465;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.910;MQ=59.27;MQRankSum=-1.385;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.408;SOR=1.139;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:12,26:38:99:.:.:572,0:.:4,8,9,17 0|1:31,25:56:99:0|1:1516020_TAAA_T:903,0,1148:1516020:17,14,11,14 +chrX 1516216 . C CA,CAAA 3094.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=31,72;AS_QD=30.88,35.23;BaseQRankSum=2.214;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.836;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.845;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,31,23:55:99:988,0,347:0,1,33,21 2/2:0,0,49:49:99:2146,2146,2146,147,147,0:0,0,28,21 +chrX 1516298 . CT C 1192.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=18.67;BaseQRankSum=1.425;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.399;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.856;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:39:56:0,39 0/1:29,37:66:99:.:1232,0,943:13,16,21,16 +chrX 1516393 . G T 2542 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=22.17;BaseQRankSum=1.594;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.05;MQRankSum=-0.41;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=0.681;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,52:54:99:1673,0:1,1,24,28 0/1:28,34:62:99:899,0,779:11,17,11,23 +chrX 1516433 . A G 1497 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=33.20;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.16;QD=33.20;SOR=1.085;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,46:46:99:.:1527,0:0,0,19,27 0/0:.:61:99:61:0,109,1800 +chrX 1516459 . T C 3274 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=31.47;BaseQRankSum=0.424;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=4.370;MQ=59.14;MQRankSum=-1.851;QD=31.47;ReadPosRankSum=1.142;SOR=1.230;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2378,0:.:0,0,23,31 0|1:27,24:51:99:0|1:1516459_T_C:926,0,1051:1516459:13,14,6,18 +chrX 1516468 . G A 3246 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=30.33;BaseQRankSum=0.161;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=7.120;MQ=58.86;MQRankSum=-1.218;QD=30.33;ReadPosRankSum=0.528;SOR=1.350;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2320,0:.:0,0,22,30 0|1:31,25:56:99:0|1:1516459_T_C:956,0,1226:1516459:16,15,6,19 +chrX 1516482 . G A 3235 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=29.95;BaseQRankSum=0.505;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=8.574;MQ=58.67;MQRankSum=-1.511;QD=29.95;ReadPosRankSum=-0.97;SOR=1.001;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,53:53:99:.:.:2314,0:.:0,0,25,28 0|1:30,26:56:99:0|1:1516459_T_C:951,0,1181:1516459:17,13,7,19 +chrX 1516491 . T C 771 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.05;BaseQRankSum=-0.088;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=14.808;MQ=59.26;MQRankSum=1.498;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.850;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1800 0/1:27,30:57:99:.:801,0,1033:8,19,18,12 +chrX 1516736 . A G 2463 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=24.93;BaseQRankSum=-1.029;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.93;ReadPosRankSum=1.733;SOR=0.680;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2009,0:0,0,31,30 0/1:21,18:39:99:484,0,613:11,10,10,8 +chrX 1516772 . G A 2066 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=22.06;BaseQRankSum=1.997;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.909;MQ=59.44;MQRankSum=0;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.830;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,50:53:99:1507,0:1,2,27,23 0/1:19,23:42:99:589,0,463:11,8,15,8 +chrX 1517112 . T G 3332 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.29;BaseQRankSum=-0.614;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=7.915;MQ=54.74;MQRankSum=-3.216;QD=33.29;ReadPosRankSum=0.719;SOR=0.741;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59:59:99:.:.:2633,0:.:0,0,28,31 0|1:23,19:42:99:0|1:1517112_T_G:729,0,909:1517112:14,9,6,13 +chrX 1517113 . A G,* 3332 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=78,2;AS_QD=33.29,0.00;BaseQRankSum=-0.179;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=8.070;MQ=54.69;MQRankSum=-3.011;QD=32.64;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.810;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59,0:59:99:.:.:2633,0,2633:.:0,0,28,31 0|1:23,19,2:44:99:0|1:1517112_T_G:729,0,909,758,926,1719:1517112:14,9,6,15 +chrX 1517118 . T C 3441 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.70;BaseQRankSum=0.704;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=8.070;MQ=54.61;MQRankSum=-3.11;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.810;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2700,0:.:0,0,27,33 0|1:23,20:43:99:0|1:1517112_T_G:771,0,906:1517112:14,9,7,13 +chrX 1517119 . G A,* 3438 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=80,2;AS_QD=33.67,0.00;BaseQRankSum=1.148;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=8.113;MQ=54.61;MQRankSum=-2.833;QD=33.03;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.877;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59,0:59:99:.:.:2655,0,2655:.:0,0,26,33 0|1:23,21,2:46:99:0|1:1517112_T_G:813,0,903,842,926,1803:1517112:14,9,8,15 +chrX 1517122 . T C 3474 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.06;BaseQRankSum=2.579;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=5.984;MQ=54.77;MQRankSum=-3.055;QD=33.06;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.702;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59:59:99:.:.:2655,0:.:0,0,26,33 0|1:25,22:47:99:0|1:1517112_T_G:849,0,984:1517112:15,10,10,12 +chrX 1517137 . GCT G,ACT 3613 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=2,78;AS_QD=32.76,34.70;BaseQRankSum=1.974;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=13.277;MQ=55.13;MQRankSum=-3.0;QD=34.05;ReadPosRankSum=-0.999;SOR=0.647;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,2,51:53:99:.:.:2591,1641,0:.:0,0,23,30 0|2:27,0,27:54:99:0|1:1517112_T_G:1052,1134,2267,0,1134,1052:1517112:18,9,12,15 +chrX 1517138 . C *,A 3526 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=4,78;AS_QD=0.00,34.19;BaseQRankSum=0.055;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=11.526;MQ=54.99;MQRankSum=-2.8;QD=32.93;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=0.735;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,2,51:53:99:.:.:2501,1641,0:.:0,0,23,30 0|2:26,2,27:55:99:0|1:1517112_T_G:1055,1094,2181,0,1052,1010:1517112:17,9,12,17 +chrX 1517158 . C G 3842 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=33.09;BaseQRankSum=1.719;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=7.300;MQ=55.52;MQRankSum=-3.583;QD=33.09;ReadPosRankSum=-0.763;SOR=0.245;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2904,0:.:0,0,33,32 0|1:27,25:52:99:0|1:1517112_T_G:968,0,1048:1517112:18,9,12,13 +chrX 1517165 . C A 4069 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=32.53;BaseQRankSum=2.508;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=10.785;MQ=55.91;MQRankSum=0.549;QD=32.53;ReadPosRankSum=1.632;SOR=0.181;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,71:72:99:.:.:3067,0:.:1,0,36,35 0|1:27,27:54:99:0|1:1517112_T_G:1032,0,1032:1517112:19,8,14,13 +chrX 1517862 . G A 2742 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=24.32;BaseQRankSum=-0.482;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.982;MQ=59.98;MQRankSum=0;QD=24.32;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.296;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2039,0:0,0,36,26 0/1:25,27:52:99:733,0,653:18,7,16,11 +chrX 1517925 . A G 2115 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=21.03;BaseQRankSum=1.67;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=9.888;MQ=59.40;MQRankSum=1.267;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.188;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,51:55:99:1512,0:3,1,31,20 0/1:22,25:47:99:633,0,594:17,5,13,12 +chrX 1517979 . C T 2602 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=21.93;BaseQRankSum=2.01;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.644;MQ=59.12;MQRankSum=-1.041;QD=21.93;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.563;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1821,0:0,0,27,29 0/1:33,31:64:99:811,0,770:18,15,16,15 +chrX 1518065 . T C 2477 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=20.55;BaseQRankSum=-2.097;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.690;MQ=59.78;MQRankSum=0.986;QD=20.55;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=0.903;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1730,0:0,0,19,38 0/1:34,31:65:99:777,0,957:13,21,11,20 +chrX 1518119 . TA T 2436.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=21.53;BaseQRankSum=1.079;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=1.45;QD=21.53;ReadPosRankSum=-0.804;SOR=0.744;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1718,0:0,0,33,22 0/1:30,30:60:99:758,0,753:17,13,16,14 +chrX 1518232 . C T 2716 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=20.96;BaseQRankSum=-0.5;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.623;MQ=59.75;MQRankSum=0.371;QD=20.96;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.520;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,66:67:99:2094,0:1,0,42,24 0/1:37,27:64:99:652,0,995:25,12,17,10 +chrX 1518425 . C CA 1844.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=17.28;BaseQRankSum=-1.301;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=5.730;MQ=58.98;MQRankSum=0.664;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.926;SOR=1.339;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:1412,0:.:0,0,22,34 0|1:28,25:53:99:0|1:1518425_C_CA:472,0,1077:1518425:14,14,8,17 +chrX 1518438 . AT A 1140.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.73;BaseQRankSum=0.537;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=4.987;MQ=58.53;MQRankSum=-0.823;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=0.658;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1607 0|1:32,31:63:99:.:1|0:1518425_C_CA:1180,0,1228:1518425:13,19,17,14 +chrX 1518441 . AT A 1140.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.73;BaseQRankSum=-0.797;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=4.987;MQ=58.53;MQRankSum=-0.823;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.658;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1607 0|1:32,31:63:99:.:1|0:1518425_C_CA:1180,0,1228:1518425:13,19,17,14 +chrX 1518557 . T G 2229 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=20.92;BaseQRankSum=-2.042;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=9.310;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.32;SOR=0.208;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1608,0:0,0,30,22 0/1:29,27:56:99:651,0,796:22,7,16,11 +chrX 1520114 . G A 2041 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=20.50;BaseQRankSum=0.108;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.766;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.402;SOR=0.604;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1726,0:0,0,26,26 0/1:34,15:49:99:345,0,950:15,19,9,6 +chrX 1521033 . TC T 1663.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=19.57;BaseQRankSum=0.975;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=14.532;MQ=58.04;MQRankSum=0.975;QD=19.57;ReadPosRankSum=1.895;SOR=0.315;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1595,0:0,0,28,22 0/1:26,11:37:99:108,0,726:19,7,1,10 +chrX 1521236 . C T 368 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=8.12;BaseQRankSum=1.454;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;MQRankSum=-1.329;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.656;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,998 0/1:32,17:49:99:.:398,0,835:13,19,7,10 +chrX 1521478 . T C 2879 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=24.65;BaseQRankSum=-2.58;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=12.851;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.65;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.827;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2147,0:0,0,41,27 0/1:21,29:50:99:762,0,580:7,14,16,13 +chrX 1521680 . G T 3329 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=27.76;BaseQRankSum=1.215;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.072;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.76;ReadPosRankSum=1.713;SOR=0.446;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2590,0:0,0,38,38 0/1:19,26:45:99:769,0,515:8,11,13,13 +chrX 1521853 . C T 421 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.40;BaseQRankSum=0.911;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.656;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,927 0/1:29,19:48:99:.:451,0,744:12,17,8,11 +chrX 1521944 . C CTTTT,CTTTTTTTT,CTTTTTT 806.97 . AC=0,1,1;AF=0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=4,8,0;AS_QD=29.59,36.25,30.13;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.21;QD=65.08;SOR=0.223;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,4,8,0:12:99:732,106,0,505:0,0,6,6 0/3:1,0,0,0:1:8:114,8,96,72,82,130,0,44,52,36:0,1,0,0 +chrX 1522817 . G C 2800 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=23.78;BaseQRankSum=1.491;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.446;MQ=59.96;MQRankSum=-0.916;QD=23.78;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=0.459;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1970,0:0,0,31,29 0/1:28,31:59:99:860,0,716:11,17,16,15 +chrX 1523048 . G A 2542 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=26.24;BaseQRankSum=0.214;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.215;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.966;SOR=1.096;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1916,0:0,0,19,37 0/1:18,24:42:99:656,0,445:9,9,14,10 +chrX 1523078 . A AAAAT,AAAATAAAT 2267.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=38,17;AS_QD=34.64,26.12;BaseQRankSum=-1.555;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.428;MQ=59.67;MQRankSum=-0.991;QD=36.05;ReadPosRankSum=0.809;SOR=0.381;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38,0:38:99:1628,0,1630:0,0,15,23 0/2:9,0,17:26:99:679,708,1052,0,344,293:3,6,10,7 +chrX 1523364 . G A 1676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=31.02;BaseQRankSum=-0.392;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.254;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.02;ReadPosRankSum=1.103;SOR=0.458;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,54:55:99:.:1706,0:1,0,25,29 0/0:.:61:95:61:0,95,1375 +chrX 1523758 . T C 4946 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=151;AS_QD=32.95;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=32.95;SOR=0.909;VarDP=151 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,82:82:99:2679,0:0,0,35,47 1/1:0,69:69:99:2297,207,0:0,0,33,36 +chrX 1523796 . C T 781 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.10;BaseQRankSum=0.119;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=4.902;MQ=59.74;MQRankSum=0.93;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=1.303;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1692 0/1:37,30:67:99:.:811,0,1044:18,19,19,11 +chrX 1524301 . C T 3845 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=34.91;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.53;QD=34.91;SOR=0.748;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:2338,0:.:0,0,38,31 1|1:0,42:42:99:0|1:1524301_C_T:1537,125,0:1524301:0,0,19,23 +chrX 1524307 . C T 390 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=9.55;BaseQRankSum=-0.244;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=4.461;MQ=59.44;MQRankSum=-1.156;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=1.034;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,889 0|1:26,18:44:99:.:0|1:1524301_C_T:420,0,732:1524301:15,11,7,11 +chrX 1524349 . TCATC T 339.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=10.83;BaseQRankSum=0.873;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=11.591;MQ=57.92;MQRankSum=1.016;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=2.472;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,889 0|1:24,11:35:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:379,0,924:1524349:13,11,2,9 +chrX 1524402 . CATG C 446.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=14.73;BaseQRankSum=-0.467;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.85;MQRankSum=1.053;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.836;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,889 0|1:20,13:33:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:486,0,780:1524349:7,13,4,9 +chrX 1524406 . CATGCA C,* 488.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=14,0;AS_QD=15.53,0.00;BaseQRankSum=-0.182;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.00;MQRankSum=1.153;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.646;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,889,889 0|1:20,14,0:34:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:528,0,777,588,807,1390:1524349:7,13,5,9 +chrX 1524409 . G C,GCATC,GCATGCATC,* 2324 . AC=0,0,2,1;AF=0.00,0.00,0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=8,3,46,13;AS_QD=28.00,33.56,24.97,0.00;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.40;QD=33.63;SOR=0.941;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 3:0,8,3,27,0:38:99:1132,908,602,0,1096:0,0,20,18 3/4:0,0,0,19,13:32:99:1222,1239,1332,1246,1334,1340,545,543,545,486,702,788,797,0,763:0,0,11,21 +chrX 1524421 . C G 507 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=17.32;BaseQRankSum=1.431;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.17;MQRankSum=1.419;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.79;SOR=0.665;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,435 0|1:17,14:31:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:537,0,651:1524349:6,11,5,9 +chrX 1524425 . C G 591 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=18.82;BaseQRankSum=0.05;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.45;MQRankSum=1.605;QD=18.82;ReadPosRankSum=-1.602;SOR=0.610;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,435 0|1:17,16:33:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:621,0,645:1524349:6,11,6,10 +chrX 1524429 . C G 594 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=0.472;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.31;MQRankSum=1.71;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.997;SOR=0.693;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,435 0|1:16,16:32:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:624,0,603:1524349:6,10,6,10 +chrX 1524433 . C G 597 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=20.23;BaseQRankSum=0.49;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.17;MQRankSum=1.824;QD=20.23;ReadPosRankSum=-2.246;SOR=0.793;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,435 0|1:15,16:31:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:627,0,561:1524349:6,9,6,10 +chrX 1524434 . CATCCATTCATCCATCT C 584.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=1.442;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.22;MQRankSum=1.972;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.78;SOR=0.948;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,435 0|1:16,16:32:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:624,0,603:1524349:7,9,6,10 +chrX 1524485 . C A 663 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=21.66;BaseQRankSum=-1.738;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.07;MQRankSum=0.709;QD=21.66;ReadPosRankSum=1.751;SOR=0.593;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,435 0|1:14,18:32:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:693,0,534:1524349:5,9,7,11 +chrX 1524501 . G GCATC 606.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=24.85;BaseQRankSum=-0.166;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=1.596;MQ=57.41;MQRankSum=-0.329;QD=24.85;ReadPosRankSum=1.322;SOR=1.112;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:33:99:33:.:.:0,435 0|1:9,17:26:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:646,0,327:1524349:4,5,6,11 +chrX 1524543 . A C 808 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=28.51;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.75;QD=38.09;SOR=1.329;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:838,0:0,0,8,14 0/0:.:18:0:18:0,0,336 +chrX 1524549 . C CCATG 436.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=26.44;BaseQRankSum=-1.063;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=4.868;MQ=54.71;MQRankSum=-0.939;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=1.518;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:20:99:20:.:.:0,496 0|1:5,13:18:99:.:0|1:1524349_TCATC_T:476,0,171:1524349:3,2,4,9 +chrX 1524557 . GCATC G 554.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=33.00;BaseQRankSum=0.703;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=3.522;MQ=53.62;MQRankSum=-0.488;QD=33.00;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.761;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,17:18:99:.:594,0:1,0,7,10 0/0:.:39:0:39:0,0,326 +chrX 1524617 . C CCATT 148.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=15.67;BaseQRankSum=-1.335;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=2.533;MQ=52.38;MQRankSum=-2.0;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.707;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:24:99:24:.:.:0,548 0|1:7,5:12:99:.:0|1:1524617_C_CCATT:188,0,279:1524617:2,5,3,2 +chrX 1524625 . T C 153 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=13.07;BaseQRankSum=0.15;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=5.756;MQ=51.38;MQRankSum=-1.645;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.755;SOR=0.651;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:24:99:24:.:.:0,548 0|1:9,5:14:99:.:0|1:1524617_C_CCATT:183,0,363:1524617:2,7,3,2 +chrX 1524637 . C A 153 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=13.07;BaseQRankSum=-1.151;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=5.756;MQ=50.58;MQRankSum=-1.645;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.59;SOR=0.651;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:24:99:24:.:.:0,548 0|1:9,5:14:99:.:0|1:1524617_C_CCATT:183,0,363:1524617:2,7,3,2 +chrX 1524645 . A ACATCCATGCATC,ACATCCATG,ACATCCATGCATCCATC,G 743 . AC=0,1,0,1;AF=0.00,0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,18,1,5;AS_QD=0.00,21.54,5.78,21.62;BaseQRankSum=1.932;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=3.812;MQ=51.73;MQRankSum=0.663;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.193;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,1,18,1,0:21:99:492,603,0,440,550:1,0,9,11 0/4:7,0,0,0,5:12:99:281,272,655,213,581,624,272,655,581,655,0,348,295,348,354:1,6,3,2 +chrX 1524653 . C G 209 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=11.95;BaseQRankSum=-1.838;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=8.022;MQ=49.82;MQRankSum=1.781;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.974;SOR=2.566;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,765 0|1:13,7:20:99:.:0|1:1524653_C_G:239,0,434:1524653:7,6,1,6 +chrX 1524669 . T C,TCATC,TCATCCATC 903 . AC=1,0,2;AF=0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=22,5,10;AS_QD=26.70,1.83,29.10;BaseQRankSum=2.302;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.81;MQRankSum=2.279;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.306;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 3:0,8,5,5:18:99:238,156,227,0:0,0,10,8 1/3:1,14,0,5:20:99:695,163,462,720,354,887,509,0,554,515:0,1,9,10 +chrX 1524677 . C T 466 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=17.10;BaseQRankSum=0.911;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.44;MQRankSum=2.149;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.246;SOR=0.582;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:99:32:.:.:0,389 0|1:15,14:29:99:.:0|1:1524653_C_G:496,0,476:1524653:8,7,7,7 +chrX 1524741 . GCATCCATC G,CCATCCATC,GCATC 1698 . AC=1,0,2;AF=0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=20,1,16;AS_QD=27.03,0.00,34.58;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.47;QD=46.70;SOR=2.494;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20,1,0:21:99:1056,0,1109,1104:0,0,17,4 3/3:0,0,0,16:16:48:672,672,672,672,672,672,48,48,48,0:0,0,12,4 +chrX 1524796 . T A 1069 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=28.27;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.64;QD=40.70;SOR=2.303;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:1099,0:0,0,11,3 0/0:.:22:41:22:0,41,571 +chrX 1524805 . TCATCCATCCATCCATC T,TCATCCATCCATC 753.97 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;AS_AltDP=10,11;AS_QD=28.00,32.71;BaseQRankSum=1.654;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.61;MQRankSum=3.673;QD=33.04;ReadPosRankSum=-0.473;SOR=0.730;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:29:.:29:0,0,0 1/2:3,10,11:24:99:.:793,429,746,337,0,335:2,1,13,8 +chrX 1524822 . C T 167 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=9.85;BaseQRankSum=0.859;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.24;MQRankSum=2.438;QD=9.85;ReadPosRankSum=2.475;SOR=0.941;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:9,11:20:99:.:197,0:7,2,9,2 0/0:.:38:60:38:0,60,1002 +chrX 1524826 . CATCCATCCATCCATCCATCCATCCACTCATCCATTCAACCATCCACTCATCCATCCATCCATCT TATCCATCCATCCATCCATCCATCCACTCATCCATTCAACCATCCACTCATCCATCCATCCATCT,C 346 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,11;AS_QD=0.00,23.50;BaseQRankSum=1.882;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.445;MQ=54.81;MQRankSum=1.493;QD=19.79;ReadPosRankSum=2.448;SOR=1.802;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:5,3,11:19:99:.:376,987,0:3,2,11,3 0/0:.:38:60:38:0,60,1002,60,1002,1002 +chrX 1524890 . TATCC *,T,TATCCATCC 1405.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,20,16;AS_QD=27.41,29.25,27.92;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.84;QD=40.14;SOR=0.992;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:5,11,0,0:19:99:376,0,773,773:3,2,11,3 2/3:0,0,20,16:36:99:1445,1444,1458,619,637,591,821,820,0,771:0,0,21,15 +chrX 1525004 . A G 768 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=11.40;BaseQRankSum=-0.958;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.889;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=0.818;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1440 0/1:38,32:70:99:.:798,0,1029:19,19,17,15 +chrX 1525194 . A G 1031 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=16.32;BaseQRankSum=1.187;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=0.683;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1440 0/1:28,37:65:99:.:1061,0,726:12,16,16,21 +chrX 1525359 . G A 3350 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=32.50;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.50;SOR=0.693;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1414,0:0,0,24,21 1/1:0,59:59:99:1966,177,0:0,0,28,31 +chrX 1525385 . C T 949 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.30;BaseQRankSum=-1.106;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.962;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.693;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,1181 0/1:28,36:64:99:.:979,0,736:13,15,19,17 +chrX 1525440 . T C 854 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.24;BaseQRankSum=2.082;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.99;SOR=0.557;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,1181 0/1:27,31:58:99:.:884,0,664:15,12,16,15 +chrX 1525950 . A T 2617 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=24.28;BaseQRankSum=-0.463;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.248;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.859;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1955,0:0,0,38,23 0/1:22,26:48:99:692,0,576:10,12,11,15 +chrX 1526322 . C A 623 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.56;BaseQRankSum=-1.248;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.077;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=0.456;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1423 0/1:27,25:52:99:.:653,0,737:16,11,13,12 +chrX 1526421 . T C 3622 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.20;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.50;SOR=0.836;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47:47:99:.:.:2094,0:.:0,0,23,24 1|1:0,41:41:99:0|1:1526421_T_C:1558,123,0:1526421:0,0,18,23 +chrX 1526443 . G A 3073 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=29.84;BaseQRankSum=0.123;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=4.856;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.84;ReadPosRankSum=0.73;SOR=0.777;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2430,0:.:0,0,23,24 0|1:21,26:47:99:0|1:1526421_T_C:673,0,504:1526421:12,9,7,14 +chrX 1526531 . T G 2409 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=22.17;BaseQRankSum=-2.038;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.126;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.413;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1544,0:0,0,27,29 0/1:19,35:54:99:895,0,489:7,12,15,20 +chrX 1526680 . T TCATC 465.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=13.29;BaseQRankSum=1.565;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.961;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.591;SOR=1.329;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1531 0/1:24,14:38:99:.:505,0,958:12,12,9,5 +chrX 1526923 . C T 807 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.50;BaseQRankSum=2.003;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.998;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=13.50;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.471;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1531 0/1:31,31:62:99:.:837,0,766:20,11,18,13 +chrX 1526959 . T C 740 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.03;BaseQRankSum=-0.559;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.107;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.412;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1531 0/1:34,30:64:99:.:770,0,919:20,14,15,15 +chrX 1527233 . C T 1046 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=17.08;BaseQRankSum=-1.735;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=6.768;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.491;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1531 0|1:33,30:63:99:.:0|1:1527233_C_T:1076,0,1222:1527233:12,21,16,14 +chrX 1527243 . G A 1025 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.75;BaseQRankSum=-0.044;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=4.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.310;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1531 0|1:34,29:63:99:.:0|1:1527233_C_T:1055,0,1197:1527233:12,22,14,15 +chrX 1527380 . C A 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.45;BaseQRankSum=2.025;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.933;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.791;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1531 0/1:28,23:51:99:.:635,0,774:16,12,10,13 +chrX 1527706 . TATCC T 320.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=8.00;BaseQRankSum=0.556;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.81;SOR=0.859;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1531 0/1:34,11:45:99:.:360,0,1372:17,17,5,6 +chrX 1527851 . G A 707 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.93;BaseQRankSum=0.385;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=0.653;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1531 0|1:35,22:57:99:.:0|1:1527851_G_A:737,0,1335:1527851:24,11,15,7 +chrX 1527872 . C T 530 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=10.57;BaseQRankSum=0.275;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.190;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.941;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1531 0|1:37,16:53:99:.:0|1:1527851_G_A:560,0,1422:1527851:23,14,11,5 +chrX 1528201 . G A 742 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.54;BaseQRankSum=-0.729;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=7.398;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.54;ReadPosRankSum=0;SOR=1.688;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1531 0/1:28,29:57:99:.:772,0,772:14,14,20,9 +chrX 1528231 . G A 4229 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=33.80;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.80;SOR=1.099;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2362,0:0,0,42,28 1/1:0,56:56:99:1897,168,0:0,0,32,24 +chrX 1528306 . A C 546 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.29;BaseQRankSum=-0.117;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.305;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.552;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1189 0/1:33,23:56:99:.:576,0,882:19,14,11,12 +chrX 1528804 . T A 875 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.12;BaseQRankSum=0.009;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=12.623;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.254;SOR=0.812;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1189 0/1:35,34:69:99:.:905,0,924:12,23,20,14 +chrX 1528916 . G T 1120 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=16.43;BaseQRankSum=-0.08;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.601;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.368;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1189 0/1:30,40:70:99:.:1150,0,798:7,23,13,27 +chrX 1529312 . T A 740 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.53;BaseQRankSum=0.162;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=16.056;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.606;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1189 0/1:25,28:53:99:.:770,0,665:19,6,12,16 +chrX 1529504 . T G 700 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.28;BaseQRankSum=-0.62;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.908;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.094;SOR=0.679;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1189 0/1:42,29:71:99:.:730,0,1182:20,22,15,14 +chrX 1529623 . C T 2698 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=22.55;BaseQRankSum=0.009;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.788;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.55;ReadPosRankSum=-1.877;SOR=0.557;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1921,0:0,0,27,31 0/1:32,31:63:99:807,0,1219:12,20,10,21 +chrX 1529625 . C A 756 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.28;BaseQRankSum=0.969;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.28;ReadPosRankSum=2.297;SOR=0.606;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1800 0/1:33,31:64:99:.:786,0,1260:11,22,11,20 +chrX 1529665 . C T 957 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.95;BaseQRankSum=2.17;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.949;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.17;SOR=0.914;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1800 0/1:31,35:66:99:.:987,0,774:14,17,14,21 +chrX 1529777 . C T 2698 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=21.65;BaseQRankSum=1.058;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.717;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=0.808;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2276,0:0,0,34,34 0/1:39,19:58:99:452,0,1077:20,19,13,6 +chrX 1529884 . T G 710 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.09;BaseQRankSum=1.682;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.785;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.654;SOR=1.385;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,1796 0|1:20,26:46:99:.:0|1:1529884_T_G:740,0,750:1529884:12,8,19,7 +chrX 1529890 . G A 2455 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=24.13;BaseQRankSum=-2.564;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=10.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.13;ReadPosRankSum=-1.378;SOR=0.281;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,61:61:99:.:.:2016,0:.:0,0,28,33 0|1:23,19:42:99:1|0:1529884_T_G:469,0,909:1529884:16,7,11,8 +chrX 1529989 . C A 802 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.60;BaseQRankSum=0.732;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.037;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.481;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1663 0/1:27,30:57:99:.:832,0,653:10,17,13,17 +chrX 1530066 . C T 2528 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=23.47;BaseQRankSum=-2.048;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=7.298;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.47;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.266;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1876,0:0,0,30,26 0/1:27,26:53:99:682,0,769:9,18,10,16 +chrX 1530149 . GTATGTATGATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC GTATCTATCTATCTATC,G,GTATCTATCTATCTATCTATC 2662.97 . AC=1,0,1;AF=0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=45,0,14;AS_QD=31.10,8.78,23.22;BaseQRankSum=-0.093;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.055;MQ=59.77;MQRankSum=6.857;QD=35.09;ReadPosRankSum=2.224;SOR=0.524;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,45,0,0:46:99:1959,0,1974,1974:1,0,28,17 0/3:17,0,0,14:31:99:743,725,1611,585,1432,1533,0,805,678,816:11,6,8,6 +chrX 1530157 . GATCTATCTATCTATCTATC *,G,GTATCTATCTATCTATCTATC 1793.97 . AC=2,1,0;AF=0.667,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=20,9,0;AS_QD=0.00,32.92,31.18;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.53;QD=63.21;SOR=0.423;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,45,0,0:46:99:1959,0,1974,1974:1,0,28,17 1/2:0,20,9,0:29:99:1833,661,605,998,0,937,1355,365,803,1314:0,0,16,13 +chrX 1530180 . C *,G 420 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,9;AS_QD=0.00,16.07;BaseQRankSum=0.094;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=1.691;MQ=59.53;MQRankSum=-1.376;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.567;SOR=0.307;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:47:99:47:.:.:0,1215,1215 0|2:19,0,9:28:99:.:0|1:1530180_C_*:450,365,1432,0,804,988:1530180:13,6,5,4 +chrX 1530184 . C *,G 415 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,9;AS_QD=0.00,14.83;BaseQRankSum=-1.34;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.654;MQ=59.56;MQRankSum=-1.455;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.243;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:47:99:47:.:.:0,1215,1215 0|2:21,0,9:30:99:.:0|1:1530180_C_*:445,365,1505,0,877,1062:1530180:15,6,5,4 +chrX 1530203 . T C 2738 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=30.42;BaseQRankSum=2.222;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=7.143;QD=30.42;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.822;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,49:50:99:1943,0:1,0,26,23 0/1:19,22:41:99:825,0,642:10,9,15,7 +chrX 1530269 . T TTATC,TTATCTACCTATC 1308.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,28;AS_QD=6.20,16.88;BaseQRankSum=-0.588;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.832;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.101;SOR=0.511;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,22,0:37:99:335,0,970:6,9,13,9 0/2:17,0,28:45:99:1013,1064,1728,0,663,580:13,4,14,14 +chrX 1530334 . A ATATC 549.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=14.37;BaseQRankSum=-0.523;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.210;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.495;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1474 0/1:25,16:41:99:.:589,0,980:14,11,8,8 +chrX 1530414 . C T 774 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.18;BaseQRankSum=1.222;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=0.713;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1474 0/1:36,30:66:99:.:804,0,948:17,19,14,16 +chrX 1530513 . C CTAATTTA 898.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.05;BaseQRankSum=-0.776;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.049;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.473;SOR=0.973;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1474 0/1:30,25:55:99:.:938,0,1175:14,16,10,15 +chrX 1530573 . G GATCT 709.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.98;BaseQRankSum=2.005;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.989;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.258;SOR=1.053;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1474 0/1:30,20:50:99:.:749,0,1150:16,14,8,12 +chrX 1530761 . A G 2751 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=22.43;BaseQRankSum=1.162;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=6.319;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.43;ReadPosRankSum=0.554;SOR=1.173;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2070,0:0,0,38,24 0/1:35,27:62:99:711,0,1358:17,18,16,11 +chrX 1530765 . C CTATT 1319.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=20.91;BaseQRankSum=-1.537;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=3.413;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.459;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1718 0|1:30,35:65:99:.:0|1:1530765_C_CTATT:1359,0,1134:1530765:18,12,17,18 +chrX 1530789 . TTCTA T 1291.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=21.47;BaseQRankSum=0.323;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.134;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.47;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.442;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1718 0|1:28,34:62:99:.:0|1:1530765_C_CTATT:1331,0,1073:1530765:17,11,18,16 +chrX 1530868 . T TTCTATCTA 1180.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=21.03;BaseQRankSum=0.603;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.668;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1718 0/1:27,31:58:99:.:1220,0,1021:15,12,17,14 +chrX 1530906 . CATCT C 942.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.54;BaseQRankSum=1.401;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=0.693;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1718 0|1:30,26:56:99:.:0|1:1530906_CATCT_C:982,0,1161:1530906:15,15,13,13 +chrX 1530938 . GTATC G 904.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.73;BaseQRankSum=1.095;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.197;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=0.431;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1718 0|1:35,25:60:99:.:0|1:1530906_CATCT_C:944,0,1394:1530906:14,21,12,13 +chrX 1530964 . C CATGT 1192.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=17.86;BaseQRankSum=-0.053;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=6.352;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.86;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.836;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1718 0|1:36,33:69:99:.:0|1:1530906_CATCT_C:1232,0,1413:1530906:15,21,19,14 +chrX 1531056 . G A 4037 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=31.53;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=31.53;SOR=0.912;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2291,0:0,0,45,28 1/1:0,56:56:99:1776,167,0:0,0,26,30 +chrX 1531068 . G GTCTATCTA,GTCTATCTATCTA 2577.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=51,26;AS_QD=29.38,33.48;BaseQRankSum=-0.42;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=4.984;MQ=59.88;MQRankSum=0;QD=26.98;ReadPosRankSum=-0.763;SOR=0.645;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,23,26:50:94:1540,94,0:0,1,29,20 0/1:19,28,0:47:99:1077,0,699,1135,783,1918:8,11,13,15 +chrX 1531402 . A T 728 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.30;BaseQRankSum=0.957;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.24;SOR=0.650;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:30,27:57:99:.:758,0,826:17,13,15,12 +chrX 1531639 . A G 542 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.43;BaseQRankSum=1.324;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.452;SOR=0.631;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:25,21:46:99:.:572,0,691:8,17,7,14 +chrX 1531700 . A C 736 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.98;BaseQRankSum=-0.45;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.248;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.423;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:30,29:59:99:.:766,0,824:10,20,12,17 +chrX 1531770 . T C 728 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.30;BaseQRankSum=-0.533;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.449;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:26,27:53:99:.:758,0,734:10,16,14,13 +chrX 1531809 . G C 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=2.553;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.1;SOR=0.622;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:25,24:49:99:.:687,0,661:12,13,12,12 +chrX 1531820 . C T 596 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.04;BaseQRankSum=0.354;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.711;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:25,23:48:99:.:626,0,670:12,13,12,11 +chrX 1531861 . T C 564 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.81;BaseQRankSum=-0.789;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=1.204;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:21,22:43:99:.:594,0,581:11,10,14,8 +chrX 1531954 . C T 672 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.50;BaseQRankSum=1.072;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.693;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:26,26:52:99:.:702,0,673:17,9,17,9 +chrX 1531973 . G C 712 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.58;BaseQRankSum=0.46;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.670;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.667;SOR=1.274;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:30,29:59:99:.:742,0,771:16,14,19,10 +chrX 1532082 . C T 720 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.71;BaseQRankSum=-0.362;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.770;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1662 0/1:30,29:59:99:.:750,0,794:13,17,12,17 +chrX 1532138 . G A 2459 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=23.70;BaseQRankSum=2.726;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=11.548;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=23.70;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.163;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1776,0:0,0,24,29 0/1:27,25:52:99:713,0,712:7,20,13,12 +chrX 1532323 . C CAT 3418.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=29.55;BaseQRankSum=0.67;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=5.910;MQ=59.41;MQRankSum=1.104;QD=36.02;ReadPosRankSum=-1.397;SOR=0.526;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2892,0:0,0,38,29 0/1:14,15:29:99:566,0,543:5,9,6,9 +chrX 1532337 . T *,TATGTATATGATGTGTATATATACACATATGTATATGATGTGTATATACACAC 463.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,3;AS_QD=0.00,29.59;BaseQRankSum=0.832;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.702;MQ=58.15;MQRankSum=-3.883;QD=29.59;ReadPosRankSum=-1.704;SOR=0.959;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1800,1800 0/2:14,0,3:17:69:.:503,69,633,0,541,571:5,9,2,1 +chrX 1532370 . C T,* 3083 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=79,0;AS_QD=28.78,29.75;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.33;QD=39.41;SOR=0.881;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62,0:62:99:2066,0,2066:0,0,35,27 1/1:0,17,0:17:53:1047,87,0,664,53,726:0,0,8,9 +chrX 1532390 . G A 163 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=13.79;BaseQRankSum=0.15;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=8.616;MQ=54.68;MQRankSum=-2.968;QD=13.79;ReadPosRankSum=-2.458;SOR=2.245;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1468 0|1:8,6:14:99:.:0|1:1532390_G_A:193,0,312:1532390:3,5,5,1 +chrX 1532408 . G GTGTGTATATACACA 227.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=8.61;BaseQRankSum=0.746;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=14.289;MQ=54.00;MQRankSum=-4.666;QD=8.61;ReadPosRankSum=-2.552;SOR=2.800;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1468 0|1:23,8:31:99:.:0|1:1532408_G_GTGTGTATATACACA:267,0,942:1532408:9,14,7,1 +chrX 1532414 . G GTATAT 224.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=8.25;BaseQRankSum=1.388;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=13.866;MQ=54.25;MQRankSum=-4.75;QD=8.25;ReadPosRankSum=-2.005;SOR=2.806;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1468 0|1:24,8:32:99:.:0|1:1532408_G_GTGTGTATATACACA:264,0,984:1532408:10,14,7,1 +chrX 1532421 . A G 279 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=20.60;BaseQRankSum=1.282;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=13.919;MQ=54.25;MQRankSum=-3.229;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=2.788;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1468 0|1:7,8:15:99:.:0|1:1532390_G_A:309,0,266:1532390:2,5,7,1 +chrX 1532448 . T TATG 361.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=28.64;BaseQRankSum=0;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=23.015;MQ=55.18;MQRankSum=-1.804;QD=28.64;ReadPosRankSum=2.622;SOR=3.220;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1468 0|1:4,10:14:99:.:0|1:1532390_G_A:401,0,135:1532390:0,4,9,1 +chrX 1532453 . GTATATATACACATATA G 2013.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=33.11;BaseQRankSum=0;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=10.268;MQ=56.46;MQRankSum=1.64;QD=33.11;ReadPosRankSum=-2.454;SOR=0.093;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48:48:99:.:.:1981,0:.:0,0,26,22 0|1:11,3:14:72:0|1:1532453_GTATATATACACATATA_G:72,0,446:1532453:9,2,0,3 +chrX 1532455 . A *,G 439 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,10;AS_QD=0.00,34.90;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.18;QD=36.08;SOR=1.022;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48,0:48:99:.:.:1981,0,1981:.:0,0,26,22 1|2:0,3,10:13:99:0|1:1532408_G_GTGTGTATATACACA:469,364,348,120,0,978:1532408:0,0,9,4 +chrX 1532471 . GTATAGATGTATATGTGTA G 2002.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=31.42;BaseQRankSum=0.897;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=11.167;MQ=56.42;MQRankSum=1.402;QD=31.42;ReadPosRankSum=-2.494;SOR=0.113;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48:48:99:.:.:1980,0:.:0,0,26,22 0|1:14,3:17:62:0|1:1532453_GTATATATACACATATA_G:62,0,572:1532453:11,3,0,3 +chrX 1532476 . G *,T 1404 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,12;AS_QD=0.00,31.44;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.44;QD=95.60;SOR=0.933;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48,0:48:99:.:.:1980,0,1980:.:0,0,26,22 1|2:0,3,12:15:87:0|1:1532390_G_A:1434,557,488,170,0,87:1532390:0,0,9,6 +chrX 1532482 . T *,TATG 599.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,14;AS_QD=0.00,30.73;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.04;QD=37.59;SOR=1.000;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48,0:48:99:.:.:1980,0,1980:.:0,0,26,22 1|2:0,3,14:17:99:0|1:1532408_G_GTGTGTATATACACA:639,535,519,119,0,924:1532408:0,0,11,6 +chrX 1532489 . A *,G 1488 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,14;AS_QD=0.00,36.76;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.04;QD=89.29;SOR=1.000;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48,0:48:99:.:.:1980,0,1980:.:0,0,26,22 1|2:0,3,14:17:81:0|1:1532390_G_A:1518,641,572,170,0,81:1532390:0,0,11,6 +chrX 1532510 . G T 412 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=12.28;BaseQRankSum=-0.505;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=7.666;MQ=58.33;MQRankSum=-1.049;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.28;SOR=1.144;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:75:99:75:.:.:0,1003 0|1:22,14:36:99:.:0|1:1532408_G_GTGTGTATATACACA:442,0,873:1532408:8,14,9,5 +chrX 1532592 . G A 542 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.95;BaseQRankSum=-0.507;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=4.558;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.562;SOR=0.574;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1003 0/1:19,22:41:99:.:572,0,468:12,7,10,12 +chrX 1532660 . G A 718 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.96;BaseQRankSum=0.758;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.448;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.392;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1003 0/1:23,27:50:99:.:748,0,569:15,8,15,12 +chrX 1532727 . T C 634 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.07;BaseQRankSum=-1.287;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=2.346;MQ=59.95;MQRankSum=0.983;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.961;SOR=1.162;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1003 0/1:29,26:55:99:.:664,0,813:16,13,17,9 +chrX 1532791 . G C 3136 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=25.95;BaseQRankSum=1.31;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=4.539;MQ=59.59;MQRankSum=0.301;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.027;SOR=0.574;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2278,0:0,0,28,41 0/1:22,31:53:99:888,0,555:13,9,19,12 +chrX 1532933 . A G 3015 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.74;BaseQRankSum=3.238;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=32.74;ReadPosRankSum=-0.452;SOR=0.324;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1552,0:0,0,27,20 1/1:1,45:46:99:1493,113,0:1,0,24,21 +chrX 1532997 . T C 1050 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=18.00;BaseQRankSum=-0.247;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=8.323;MQ=59.55;MQRankSum=0.81;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.56;SOR=0.148;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:773,0:0,0,16,8 0/1:23,13:36:99:307,0,661:19,4,7,6 +chrX 1533002 . CAAA C,CA 641.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,14;AS_QD=16.09,13.55;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=78.483;MQ=58.26;MQRankSum=2.166;QD=14.19;SOR=3.151;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:10,13,0:23:99:288,0,509:0,10,12,1 0/2:5,6,14:25:17:393,134,375,0,17,46:0,5,16,4 +chrX 1533125 . C T 2091 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=22.33;BaseQRankSum=2.206;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.858;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.33;ReadPosRankSum=2.363;SOR=0.899;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1760,0:0,0,29,24 0/1:28,14:42:99:361,0,737:15,13,10,4 +chrX 1533213 . G C 2240 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=21.83;BaseQRankSum=1.059;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=8.549;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.569;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1805,0:0,0,28,26 0/1:32,18:50:99:465,0,912:12,20,11,7 +chrX 1533290 . T C 1032 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=18.31;BaseQRankSum=-0.274;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=9.766;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.45;SOR=1.181;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,238 0/1:20,38:58:99:.:1062,0,477:12,8,14,24 +chrX 1533480 . A G 875 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=15.34;BaseQRankSum=0.176;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.598;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,238 0/1:24,35:59:99:.:905,0,649:13,11,18,17 +chrX 1533541 . TTATATATTATATACTTATATATTTATTATTTAAA T 1050.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=19.82;BaseQRankSum=1.337;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=5.456;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=0.908;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,238 0/1:26,29:55:99:.:1090,0,961:11,15,17,12 +chrX 1533566 . AT A,* 5065.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=97,31;AS_QD=29.36,0.00;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.88;SOR=0.824;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,74,0:74:99:.:.:2933,0,2933:.:0,0,33,41 1|2:0,23,31:54:99:0|1:1533566_AT_*:2172,1215,1142,756,0,624:1533566:0,0,27,27 +chrX 1533569 . ATTTAAATATATTATATACTTATATATTTATT A,* 5025.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=97,31;AS_QD=26.02,0.00;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=5.832;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=37.52;SOR=0.425;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:7,74,0:81:99:.:.:2905,0,2933:.:5,2,33,41 1|2:0,23,31:54:99:0|1:1533566_AT_*:2160,1220,1298,741,0,606:1533566:0,0,27,27 +chrX 1533803 . T C 1853 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=20.69;BaseQRankSum=2.144;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=5.889;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.339;SOR=0.846;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,45:46:99:.:.:1419,0:.:0,1,25,20 0|1:27,18:45:99:0|1:1533803_T_C:464,0,927:1533803:12,15,11,7 +chrX 1533838 . T TTTA 560.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=17.65;BaseQRankSum=-0.505;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.57;SOR=0.512;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:71:99:71:.:.:0,1449 0|1:18,16:34:99:.:1|0:1533803_T_C:600,0,698:1533803:8,10,8,8 +chrX 1534032 . C G 516 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=9.93;BaseQRankSum=-0.616;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=12.789;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=0.717;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1449 0/1:31,24:55:99:.:546,0,808:22,9,10,14 +chrX 1534175 . A G 3744 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=22.73;BaseQRankSum=1.761;DP=172;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.73;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.667;VarDP=166 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,91:92:99:2724,0:0,1,42,49 0/1:34,40:74:99:1050,0,850:16,18,19,21 +chrX 1534746 . G C 729 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.40;BaseQRankSum=0.402;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=6.499;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.246;SOR=1.542;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1170 0/1:42,31:73:99:.:759,0,1121:23,19,22,9 +chrX 1534758 . G A 776 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.89;BaseQRankSum=1.625;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=8.152;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.871;SOR=1.619;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1170 0/1:43,31:74:99:.:806,0,1117:23,20,22,9 +chrX 1535184 . C CTTT,CTTTTT,CTT 2027.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=11,20,6;AS_QD=22.60,32.24,32.25;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.71;QD=55.86;SOR=0.746;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,4,0:15:99:1068,0,257,696:0,0,6,9 2/3:0,0,16,6:22:99:999,867,834,189,210,157,527,515,0,446:0,0,12,10 +chrX 1535718 . CACACACACAG C 651.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.55;BaseQRankSum=0.522;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=-0.981;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.931;SOR=0.634;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,655 0|1:26,25:51:99:.:0|1:1535718_CACACACACAG_C:691,0,991:1535718:10,16,10,15 +chrX 1535726 . CAG C,* 2662.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=49,25;AS_QD=29.03,0.00;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=36.51;SOR=0.864;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28,0:28:99:.:.:1181,0,1183:.:0,0,15,13 1|2:0,21,25:46:99:1|0:1535718_CACACACACAG_C:1521,818,1035,797,0,985:1535718:0,0,19,27 +chrX 1537516 . C G 4355 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=137;AS_QD=31.78;BaseQRankSum=1.799;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=3.074;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.78;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.293;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,67:68:99:2158,0:0,1,35,32 1/1:0,70:70:99:2227,209,0:0,0,35,35 +chrX 1537818 . A G 3920 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=32.92;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.92;SOR=0.726;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2039,0:0,0,25,36 1/1:0,59:59:99:1911,177,0:0,0,34,25 +chrX 1537954 . T C 2065 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=32.23;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.23;SOR=0.723;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,65:65:99:.:2095,0:0,0,33,32 0/0:.:59:13:59:0,13,1633 +chrX 1538072 . A G 3158 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=32.53;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=32.53;SOR=0.776;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1994,0:0,0,31,31 1/1:0,36:36:99:1194,108,0:0,0,16,20 +chrX 1538171 . C CAAACAAACAAACAAACAAAG 2667.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.26;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.86;QD=43.66;SOR=0.826;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:2707,0:0,0,33,29 0/0:.:48:20:37:0,20,1015 +chrX 1538189 . T G 2369 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=30.98;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.75;QD=40.66;SOR=0.871;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2399,0:0,0,32,27 0/0:.:48:20:37:0,20,1015 +chrX 1538320 . A G 2471 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=30.57;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=43.88;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2501,0:0,0,30,27 0/0:.:48:20:37:0,20,1015 +chrX 1538331 . T G 2574 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=26.71;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=43.40;SOR=0.986;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,60:60:99:.:2604,0:0,0,34,26 0/0:.:48:20:37:0,20,1015 +chrX 1538438 . A G 792 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=29.36;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.43;QD=29.36;SOR=1.382;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:822,0:0,0,18,10 0/0:.:48:20:37:0,20,1015 +chrX 1538456 . C CAAA 1172.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=32.28;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.10;SOR=1.044;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:1212,0:0,0,13,18 0/0:.:48:20:37:0,20,1015 +chrX 1538619 . G A 1449 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=31.47;BaseQRankSum=3.668;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.104;MQ=59.68;MQRankSum=4.849;QD=31.47;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=0.182;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,45:47:99:.:1479,0:0,2,23,22 0/0:.:48:20:37:0,20,1015 +chrX 1538677 . A G 1607 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.74;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=32.74;SOR=0.952;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:1637,0:0,0,28,22 0/0:.:48:20:37:0,20,1015 +chrX 1538737 . G A 1582 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=29.04;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;QD=37.49;SOR=1.609;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1612,0:0,0,29,14 0/0:.:48:20:37:0,20,1015 +chrX 1538749 . C CA 1500.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=26.55;BaseQRankSum=0.599;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.28;MQRankSum=-0.527;QD=26.55;ReadPosRankSum=-1.151;SOR=0.503;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1293,0:0,0,24,13 0/1:6,15:21:51:247,0,51:4,2,6,9 +chrX 1538843 . C G 1829 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.05;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=32.05;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1859,0:0,0,27,31 0/0:.:55:34:49:0,34,1126 +chrX 1538984 . G A 1476 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=33.47;BaseQRankSum=4.851;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.47;ReadPosRankSum=-1.656;SOR=0.303;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,44:45:99:.:1506,0:0,1,20,24 0/0:.:55:34:49:0,34,1126 +chrX 1539036 . G C 1337 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=31.07;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=31.07;SOR=0.693;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,44:44:99:.:1367,0:0,0,22,22 0/0:.:55:34:49:0,34,1126 +chrX 1539050 . C A,CAA 1064 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,29;AS_QD=0.00,31.04;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.54;QD=34.19;SOR=1.284;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,3,29:32:99:.:1094,1117,0:0,0,20,12 0/0:.:55:34:49:0,34,1126,34,1126,1126 +chrX 1539449 . A C 1552 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.29;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.29;SOR=0.733;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,49:49:99:.:1582,0:0,0,24,25 0/0:.:55:34:49:0,34,1126 +chrX 1539482 . G C 1830 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.07;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;QD=32.07;SOR=1.085;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1860,0:0,0,24,34 0/0:.:55:34:49:0,34,1126 +chrX 1539512 . C T 809 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=11.82;BaseQRankSum=-0.436;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.265;SOR=0.752;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1701 0/1:36,35:71:99:.:839,0,879:17,19,16,19 +chrX 1539539 . C A 1839 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.79;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;QD=32.79;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:1869,0:0,0,27,30 0/0:.:41:31:30:0,31,873 +chrX 1540050 . G T 1979 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=32.40;BaseQRankSum=2.928;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.274;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,61:62:99:.:2009,0:1,0,30,31 0/0:.:41:31:30:0,31,873 +chrX 1540219 . C CA 898.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=24.05;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=24.05;SOR=0.850;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,39:39:99:.:938,0:0,0,18,21 0/0:.:41:31:30:0,31,873 +chrX 1540657 . C T 2155 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=27.55;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.03;SOR=0.726;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2185,0:0,0,29,30 0/0:.:41:31:30:0,31,873 +chrX 1540734 . T C 1414 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=32.82;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=32.82;SOR=0.990;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,44:44:99:.:1444,0:0,0,25,19 0/0:.:41:31:30:0,31,873 +chrX 1540819 . CAAAAAA C,CAAAAA 393.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=10,7;AS_QD=15.63,2.76;BaseQRankSum=0.21;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=44.143;MQ=58.45;MQRankSum=-0.249;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.389;SOR=2.645;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,10,0:13:99:375,0,452:0,3,8,2 0/2:11,0,7:18:58:58,90,234,0,144,124:1,10,6,1 +chrX 1541077 . C A 2357 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=33.62;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.62;SOR=0.840;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,71:71:99:.:2387,0:0,0,38,33 0/0:.:58:54:58:0,54,1250 +chrX 1541201 . G T 2396 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=31.10;BaseQRankSum=2.208;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.10;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.233;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,77:78:99:.:2426,0:0,1,38,39 0/0:.:58:54:58:0,54,1250 +chrX 1541225 . G C 3508 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=28.27;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.23;SOR=0.743;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,80:80:99:.:3538,0:0,0,39,41 0/0:.:58:54:58:0,54,1250 +chrX 1541230 . C G 3477 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=28.55;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.39;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,79:79:99:.:3507,0:0,0,39,40 0/0:.:58:54:58:0,54,1250 +chrX 1541278 . G A 2283 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=33.04;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.04;SOR=1.011;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,70:70:99:.:2313,0:0,0,30,40 0/0:.:58:54:58:0,54,1250 +chrX 1541376 . A G 2335 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.40;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.40;SOR=1.257;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,73:73:99:.:2365,0:0,0,28,45 0/0:.:58:54:58:0,54,1250 +chrX 1541533 . C T 1989 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.56;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.56;SOR=1.143;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:2019,0:0,0,37,25 0/0:.:58:54:58:0,54,1250 +chrX 1541900 . A G 1518 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=30.96;BaseQRankSum=3.087;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.43;MQRankSum=-0.301;QD=30.96;ReadPosRankSum=1.114;SOR=1.426;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,48:50:99:.:1548,0:1,1,17,31 0/0:.:58:54:58:0,54,1250 +chrX 1541934 . T C 1538 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=30.75;BaseQRankSum=-0.507;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=-0.101;QD=30.75;ReadPosRankSum=-1.665;SOR=0.335;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,50:51:99:.:1568,0:0,1,22,28 0/0:.:58:54:58:0,54,1250 +chrX 1542252 . C T 566 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.84;BaseQRankSum=1.73;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.258;MQ=59.24;MQRankSum=-1.143;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.032;SOR=1.022;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1325 0/1:32,23:55:99:.:596,0,781:17,15,14,9 +chrX 1543418 . G A 2065 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=33.79;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.79;SOR=0.693;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:2095,0:0,0,31,31 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1543610 . T A 1596 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.52;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.52;SOR=1.051;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:1626,0:0,0,29,21 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1543633 . A G 1881 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.95;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.95;SOR=1.085;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1911,0:0,0,34,24 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1543885 . G C 1300 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=32.44;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.44;SOR=0.954;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,41:41:99:.:1330,0:0,0,23,18 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1543977 . C G 1773 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=31.09;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.09;SOR=0.693;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1803,0:0,0,29,29 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1544028 . C T 1911 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=33.47;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.47;SOR=0.914;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1941,0:0,0,32,26 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1544124 . C G 1924 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=32.03;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.03;SOR=1.022;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,61:61:99:.:1954,0:0,0,26,35 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1544200 . A ATTTT 1829.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=24.89;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;QD=43.47;SOR=1.312;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1869,0:0,0,16,27 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1544317 . C T 1772 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=34.00;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=34.00;SOR=1.287;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:1802,0:0,0,33,20 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1544722 . A T 2294 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=34.18;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.18;SOR=1.022;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,68:68:99:.:2324,0:0,0,39,29 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1544754 . A G 2058 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=31.16;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.16;SOR=1.230;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,67:67:99:.:2088,0:0,0,41,26 0/0:.:58:47:54:0,47,1050 +chrX 1544963 . A G 60 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=3.21;BaseQRankSum=-1.597;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;MQRankSum=-1.074;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.36;SOR=0.665;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,1300 0|1:23,5:28:90:.:0|1:1544963_A_G:90,0,829:1544963:17,6,4,1 +chrX 1544965 . A C 60 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=3.21;BaseQRankSum=-1.691;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;MQRankSum=-1.074;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.3;SOR=0.665;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,1300 0|1:23,5:28:90:.:0|1:1544963_A_G:90,0,829:1544963:17,6,4,1 +chrX 1544983 . CA C,CAA,CAAA 228.97 . AC=1,0,1;AF=0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=15,1,1;AS_QD=9.58,1.08,1.58;BaseQRankSum=-0.645;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=6.029;MQ=59.29;MQRankSum=0;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.157;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,15,0,0:17:99:249,0,278,278:1,1,10,5 0/3:9,0,1,1:11:6:19,34,222,6,168,144,0,208,153,230:8,1,0,2 +chrX 1545058 . T C 2092 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=31.21;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=31.21;SOR=0.949;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,68:68:99:.:2122,0:0,0,38,30 0/0:.:54:33:49:0,33,1215 +chrX 1545201 . C CAA 986.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=29.31;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.03;QD=29.31;SOR=2.115;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1026,0:0,0,9,26 0/0:.:41:0:41:0,0,986 +chrX 1545411 . A G 1698 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.23;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.23;SOR=0.770;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:1728,0:0,0,27,25 0/0:.:60:42:60:0,42,884 +chrX 1545499 . A T 2212 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=33.97;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.97;SOR=0.957;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2242,0:0,0,37,29 0/0:.:60:42:60:0,42,884 +chrX 1545604 . A G 2974 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=30.54;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.91;SOR=1.011;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,70:70:99:.:3004,0:0,0,40,30 0/0:.:60:42:60:0,42,884 +chrX 1545620 . C A 3052 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=29.23;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.22;SOR=1.032;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,73:73:99:.:3082,0:0,0,42,31 0/0:.:60:42:60:0,42,884 +chrX 1545777 . A AT 2818.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=29.04;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.73;SOR=0.850;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,80:80:99:.:2858,0:0,0,43,37 0/0:.:60:42:60:0,42,884 +chrX 1545873 . A G 2585 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=30.76;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.76;SOR=0.867;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,85:85:99:.:2615,0:0,0,39,46 0/0:.:60:42:60:0,42,884 +chrX 1547491 . G T 2056 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.61;BaseQRankSum=1.684;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.61;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=0.892;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,64:66:99:.:2086,0:1,1,35,29 0/0:.:63:43:63:0,43,1285 +chrX 1548307 . C T 1641 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=31.53;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.53;SOR=0.981;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:1671,0:0,0,30,23 0/0:.:66:29:62:0,29,1333 +chrX 1548588 . C G 1851 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.00;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;QD=33.00;SOR=0.728;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:1881,0:0,0,28,29 0/0:.:66:29:62:0,29,1333 +chrX 1548846 . A AC 2974.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=33.38;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;QD=42.45;SOR=1.042;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,71:71:99:.:3014,0:0,0,30,41 0/0:.:49:28:48:0,28,982 +chrX 1548847 . A ACACACAC,ACACACACACAC 3016.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,47;AS_QD=28.71,33.17;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.47;QD=63.67;SOR=1.179;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,1,47:48:99:.:3056,1928,0:0,0,19,29 0/0:.:49:28:48:0,28,982,28,982,982 +chrX 1548863 . A C 2654 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=30.60;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.35;QD=44.73;SOR=1.160;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,60:60:99:.:2684,0:0,0,24,36 0/0:.:49:28:48:0,28,982 +chrX 1548865 . A C 2654 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=26.97;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.35;QD=44.73;SOR=1.160;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,60:60:99:.:2684,0:0,0,24,36 0/0:.:49:28:48:0,28,982 +chrX 1548867 . A C 2597 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=30.44;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;QD=44.53;SOR=1.123;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2627,0:0,0,24,35 0/0:.:49:28:48:0,28,982 +chrX 1548869 . A C 2552 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.17;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;QD=44.52;SOR=1.085;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2582,0:0,0,24,34 0/0:.:49:28:48:0,28,982 +chrX 1550008 . C A 32 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=1.41;BaseQRankSum=-2.587;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=33.701;MQ=59.69;MQRankSum=0;QD=1.41;ReadPosRankSum=3.258;SOR=4.397;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,945 0/1:36,8:44:62:.:62,0,1005:25,11,0,8 +chrX 1550022 . CA C,AA 859 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,25;AS_QD=13.50,32.93;BaseQRankSum=2.036;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.123;MQ=58.55;MQRankSum=-0.306;QD=32.93;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.121;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:2,0,25:27:99:.:889,862,0:0,2,12,13 0/0:.:64:93:64:0,93,1216,93,1216,1216 +chrX 1550023 . A *,C,AC 804 . AC=0,1,0;AF=0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,19,1;AS_QD=0.00,30.76,33.41;BaseQRankSum=1.191;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=7.104;MQ=58.55;MQRankSum=-0.158;QD=37.91;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.787;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:2,0,19,1:22:99:.:834,806,0,533:0,2,12,8 0/0:.:64:93:64:0,93,1216,93,1216,1216,93,1216,1216,1216 +chrX 1550390 . A G 3692 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=32.65;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.65;SOR=0.765;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1808,0:0,0,25,30 1/1:0,59:59:99:1914,177,0:0,0,30,29 +chrX 1550510 . C T 2010 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.38;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=0.933;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,63:63:99:.:2040,0:0,0,28,35 0/0:.:54:22:45:0,22,1261 +chrX 1550851 . CG C 1576.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=33.67;BaseQRankSum=-0.758;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.67;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.277;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,47:48:99:.:1616,0:1,0,25,22 0/0:.:54:22:45:0,22,1261 +chrX 1550943 . C T 1597 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=31.90;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=31.90;SOR=0.900;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,51:51:99:.:1627,0:0,0,23,28 0/0:.:54:22:45:0,22,1261 +chrX 1550973 . C T 2397 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=30.92;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=42.58;SOR=0.960;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2427,0:0,0,25,32 0/0:.:54:22:45:0,22,1261 +chrX 1550995 . A G 2605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=30.95;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=0.796;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2635,0:0,0,28,31 0/0:.:54:22:45:0,22,1261 +chrX 1551001 . G A 2755 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=26.09;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.21;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,63:63:99:.:2785,0:0,0,34,29 0/0:.:54:22:45:0,22,1261 +chrX 1551005 . GA G 2520.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=33.46;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=0.997;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2560,0:0,0,33,25 0/0:.:54:22:45:0,22,1261 +chrX 1551971 . T A 102 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=3.57;BaseQRankSum=-1.863;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.399;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.996;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,692 0|1:27,10:37:99:.:0|1:1551971_T_A:132,0,905:1551971:14,13,6,4 +chrX 1551989 . AAGAG A 2249.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=30.93;BaseQRankSum=0.938;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.93;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.749;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,36:37:99:.:.:1506,0:.:1,0,26,10 0|1:16,21:37:99:0|1:1551971_T_A:783,0,567:1551971:10,6,11,10 +chrX 1552425 . GGAAA G 443.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=14.21;BaseQRankSum=-0.233;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=16.236;MQ=59.36;MQRankSum=0.847;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.762;SOR=3.597;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:47:48:.:.:0,47 0|1:21,13:34:99:.:0|1:1552425_GGAAA_G:483,0,811:1552425:11,10,12,1 +chrX 1552480 . AAAGG A,GAAGG 559 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=16,2;AS_QD=17.32,0.00;BaseQRankSum=0.188;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.480;MQ=59.42;MQRankSum=-0.944;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.324;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:47:48:0,47,47 0/1:18,16,2:36:99:.:589,0,823,641,560,1241:14,4,12,6 +chrX 1553084 . T C 835 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=-2.526;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=4.927;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.583;SOR=1.371;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:47:48:0,47 0/1:34,33:67:99:.:865,0,969:16,18,11,22 +chrX 1553193 . C G 2827 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=24.01;BaseQRankSum=-0.928;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.01;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.741;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1781,0:0,0,26,28 0/1:26,39:65:99:1076,0,678:14,12,25,14 +chrX 1553205 . G A 2643 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=23.65;BaseQRankSum=-0.862;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.995;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.65;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.391;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1732,0:0,0,25,27 0/1:26,35:61:99:941,0,666:16,10,20,15 +chrX 1553391 . C CTTTTT 729.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=19.23;BaseQRankSum=-0.937;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=6.928;MQ=59.92;MQRankSum=-0.854;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.381;SOR=1.170;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:94:65:0,94 0/1:18,22:40:99:.:769,0,615:11,7,8,14 +chrX 1553544 . T C 774 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.11;BaseQRankSum=-0.209;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=8.257;MQ=54.49;MQRankSum=-5.109;QD=17.11;ReadPosRankSum=-1.42;SOR=0.692;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:94:65:.:.:0,94 0|1:26,21:47:99:.:0|1:1553544_T_C:804,0,1028:1553544:9,17,12,9 +chrX 1553545 . C G 855 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.70;BaseQRankSum=-0.436;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=8.094;MQ=54.43;MQRankSum=-5.363;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=0.964;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:94:65:.:.:0,94 0|1:27,23:50:99:.:0|1:1553544_T_C:885,0,1064:1553544:10,17,14,9 +chrX 1553548 . C T 896 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.16;BaseQRankSum=2.048;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=10.225;MQ=54.07;MQRankSum=-5.455;QD=18.16;ReadPosRankSum=-1.113;SOR=1.076;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:94:65:.:.:0,94 0|1:27,24:51:99:.:0|1:1553544_T_C:926,0,1061:1553544:10,17,15,9 +chrX 1553552 . TA T 886.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.16;BaseQRankSum=0.152;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=7.823;MQ=53.71;MQRankSum=-5.684;QD=18.16;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=0.803;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:94:65:.:.:0,94 0|1:27,24:51:99:.:0|1:1553544_T_C:926,0,1061:1553544:10,17,14,10 +chrX 1553560 . TGTA T 809.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=18.06;BaseQRankSum=0.339;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=6.062;MQ=53.08;MQRankSum=-6.057;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.49;SOR=0.889;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:94:65:.:.:0,94 0|1:25,22:47:99:.:0|1:1553544_T_C:849,0,983:1553544:10,15,13,9 +chrX 1553667 . G T 729 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.44;BaseQRankSum=2.332;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.175;MQ=57.72;MQRankSum=-3.09;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=1.101;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:94:65:0,94 0/1:33,28:61:99:.:759,0,829:16,17,11,17 +chrX 1553683 . T C 990 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.72;BaseQRankSum=-0.214;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.82;MQRankSum=-2.037;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.652;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:94:65:.:.:0,94 0|1:34,27:61:99:.:0|1:1553683_T_C:1020,0,1335:1553683:16,18,13,14 +chrX 1553685 . C T 990 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.72;BaseQRankSum=1.338;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.84;MQRankSum=-2.037;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=0.652;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:94:65:.:.:0,94 0|1:34,27:61:99:.:0|1:1553683_T_C:1020,0,1335:1553683:16,18,13,14 +chrX 1553718 . G C 796 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.54;BaseQRankSum=1.456;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=6.913;MQ=59.92;MQRankSum=1.049;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.837;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:94:65:0,94 0/1:30,31:61:99:.:826,0,760:12,18,18,13 +chrX 1554082 . CA C 458.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=5.53;BaseQRankSum=1.425;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.844;MQ=59.90;MQRankSum=0.031;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.714;SOR=1.047;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,23:46:7:7,0:16,7,14,9 0/1:24,20:44:99:491,0,611:11,13,14,6 +chrX 1554390 . C T 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.37;BaseQRankSum=1.879;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=6.575;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.999;SOR=0.883;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,224 0/1:39,29:68:99:.:705,0,932:16,23,17,12 +chrX 1554444 . C T 656 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.45;BaseQRankSum=0.473;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=10.318;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.707;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,224 0/1:25,26:51:99:.:686,0,624:8,17,15,11 +chrX 1554644 . C G 486 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.22;BaseQRankSum=0.555;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=6.734;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.61;SOR=1.765;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,224 0/1:26,20:46:99:.:516,0,692:10,16,4,16 +chrX 1554949 . G A 658 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.04;BaseQRankSum=-3.152;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.83;SOR=0.600;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,224 0/1:22,27:49:99:.:688,0,618:10,12,13,14 +chrX 1555541 . C T 3707 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=33.07;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.07;SOR=0.784;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1935,0:0,0,29,31 1/1:0,53:53:99:1802,159,0:0,0,25,28 +chrX 1555828 . C G 49 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=1.39;BaseQRankSum=1.434;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.023;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.39;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.618;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,33:57:79:.:79,0:11,13,17,16 0/0:.:52:93:52:0,93,1340 +chrX 1555851 . G A 628 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.65;BaseQRankSum=1.039;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.933;MQ=59.88;MQRankSum=-1.042;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.894;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,253 0/1:28,24:52:99:.:658,0,752:16,12,10,14 +chrX 1555899 . C T 59 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=1.35;BaseQRankSum=0.814;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;MQRankSum=0.062;QD=1.35;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=0.687;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,34:66:89:.:89,0:17,15,18,16 0/0:.:65:99:65:0,120,1800 +chrX 1555901 . C T 59 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=1.35;BaseQRankSum=1.741;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;MQRankSum=0.062;QD=1.35;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.687;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,34:66:89:.:89,0:17,15,18,16 0/0:.:65:99:65:0,120,1800 +chrX 1555923 . C T 1015 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.14;BaseQRankSum=-0.801;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=4.870;MQ=59.22;MQRankSum=0.284;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.78;SOR=1.387;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,154 0/1:30,39:69:99:.:1045,0,795:15,15,25,14 +chrX 1555931 . T A 6150 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=139;AS_QD=26.15;BaseQRankSum=2.964;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=3.468;MQ=59.25;MQRankSum=4.245;QD=44.14;ReadPosRankSum=1.68;SOR=0.578;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,69:70:99:.:.:3030,0:.:0,1,37,32 1|1:0,70:70:99:0|1:1555931_T_A:3150,211,0:1555931:0,0,40,30 +chrX 1555940 . G A 5990 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=28.37;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.36;QD=44.93;SOR=0.851;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2780,0:.:0,0,31,31 1|1:0,72:72:99:0|1:1555931_T_A:3240,217,0:1555931:0,0,41,31 +chrX 1555945 . G A 6074 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=137;AS_QD=30.13;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.34;QD=44.55;SOR=0.898;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2874,0:.:0,0,33,32 1|1:0,72:72:99:0|1:1555931_T_A:3230,217,0:1555931:0,0,42,30 +chrX 1556234 . G GA 584.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.73;BaseQRankSum=0.822;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=8.135;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.862;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:30:62:0,30 0/1:22,27:49:99:.:624,0,483:8,14,16,11 +chrX 1556357 . T A 782 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=7.81;BaseQRankSum=0.848;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.705;SOR=0.633;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,23:44:60:60,0:9,12,9,14 0/1:32,28:60:99:752,0,832:12,20,12,16 +chrX 1556657 . T C 2546 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=23.21;BaseQRankSum=0.381;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=23.21;ReadPosRankSum=0.459;SOR=0.631;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1840,0:0,0,29,26 0/1:29,27:56:99:736,0,797:14,15,12,15 +chrX 1556697 . C G 316 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=5.67;BaseQRankSum=2.758;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=2.199;MQ=59.62;MQRankSum=1.155;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.886;SOR=1.148;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,34:61:99:.:346,0:14,13,21,13 0/0:.:69:99:69:0,106,1718 +chrX 1556701 . C G 375 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=6.86;BaseQRankSum=0.148;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.256;MQ=59.61;MQRankSum=1.2;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.169;SOR=1.141;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,34:59:99:.:405,0:13,12,21,13 0/0:.:69:99:69:0,106,1718 +chrX 1556795 . G C 2522 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=23.20;BaseQRankSum=0.886;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=13.752;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.20;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.599;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1781,0:0,0,32,24 0/1:26,28:54:99:771,0,667:8,18,15,13 +chrX 1556835 . A ATT 512.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=7.08;BaseQRankSum=0.348;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.45;MQRankSum=0.901;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.793;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,25:42:99:206,0:9,8,13,12 0/1:21,15:36:99:346,0,610:10,11,8,7 +chrX 1556980 . T C 2868 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=24.35;BaseQRankSum=-1.84;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.840;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=24.35;ReadPosRankSum=1.693;SOR=0.815;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2147,0:0,0,28,37 0/1:25,29:54:99:751,0,687:13,12,15,14 +chrX 1557111 . T G 108 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=2.12;BaseQRankSum=0.425;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.10;MQRankSum=0.627;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.408;SOR=0.625;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,35:65:99:.:138,0:14,16,17,18 0/0:.:61:99:61:0,113,1379 +chrX 1557386 . T C 2644 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=20.26;BaseQRankSum=0.023;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.26;ReadPosRankSum=-1.116;SOR=0.703;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2216,0:0,0,40,28 0/1:44,20:64:99:458,0,1265:27,17,14,6 +chrX 1557651 . TATCCATCC T,TATCC 1956.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=23,41;AS_QD=21.17,24.77;BaseQRankSum=0.686;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.894;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=22.43;ReadPosRankSum=-0.848;SOR=0.759;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23,15:38:99:1016,0,361:0,0,16,22 0/2:25,0,26:51:99:980,1055,2083,0,1028,949:13,12,14,12 +chrX 1557724 . T TTATC 3375.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.22;BaseQRankSum=-2.028;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=4.356;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=32.22;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.365;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:2273,0:0,0,28,23 0/1:25,30:55:99:1142,0,918:16,9,15,15 +chrX 1557763 . C CATCT 421.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=8.70;BaseQRankSum=-0.997;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.449;MQ=59.92;MQRankSum=1.273;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.346;SOR=0.376;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,32:53:99:.:461,0:14,7,18,14 0/0:.:65:99:65:0,120,1800 +chrX 1557817 . TTATCTATCTATG T 955.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.79;BaseQRankSum=0.092;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=3.599;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.726;SOR=0.343;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,246 0/1:36,27:63:99:.:995,0,1408:24,12,15,12 +chrX 1557829 . GTATC G,* 1122.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=28,0;AS_QD=29.29,0.00;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=7.130;MQ=60.00;QD=37.48;SOR=0.255;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,28,0:31:99:1162,0,1201:0,0,13,15 0/2:36,0,27:63:99:995,1104,2594,0,1490,1408:24,12,15,12 +chrX 1557935 . GTATC G 1400.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=20.87;BaseQRankSum=1.796;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=6.381;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.87;ReadPosRankSum=1.047;SOR=0.772;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,207 0/1:32,37:69:99:.:1440,0,1227:19,13,16,21 +chrX 1558159 . TCTAC T 1970.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=17.63;BaseQRankSum=-1.238;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=2.480;MQ=59.88;MQRankSum=0;QD=17.63;ReadPosRankSum=1.287;SOR=0.473;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,33:51:99:665,0:8,10,17,16 0/1:28,35:63:99:1345,0,1014:10,18,14,21 +chrX 1558213 . AATCT A,AATCTATCTATCT 3189.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=14,74;AS_QD=29.14,26.77;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=36.69;SOR=0.786;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,14,27:41:99:1205,797,0:0,0,22,19 2/2:0,0,47:47:99:2024,2024,2025,140,141,0:0,0,20,27 +chrX 1558613 . GTATC G 1085.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=10.23;BaseQRankSum=-0.435;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=4.790;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.634;SOR=0.378;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,32:57:99:275,0:13,12,15,17 0/1:29,24:53:99:850,0,1090:5,24,9,15 +chrX 1558654 . A AATCTATCTATCTATCTATCT,AATCTATCT 4434.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=79,19;AS_QD=33.72,30.60;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;QD=45.65;SOR=1.237;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60,0:60:99:2643,0,2646:0,0,30,30 1/2:0,19,19:38:99:1831,816,742,806,0,729:0,0,8,30 +chrX 1558706 . CATCTATCTATCT C,CATCT 918.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=11,12;AS_QD=25.42,32.27;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.65;SOR=0.776;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:94:68:0,94,94 1/2:0,11,12:23:99:.:958,502,542,458,0,420:0,0,12,11 +chrX 1559161 . C T 489 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.80;BaseQRankSum=2.418;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.434;SOR=0.883;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:94:68:0,94 0/1:25,19:44:99:.:519,0,617:11,14,11,8 +chrX 1559453 . C CA 875.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.30;BaseQRankSum=-1.5;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.597;SOR=0.660;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:94:68:0,94 0/1:23,27:50:99:.:915,0,779:13,10,15,12 +chrX 1559688 . G A 652 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.37;BaseQRankSum=-1.827;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.996;MQ=59.98;MQRankSum=-1.072;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.498;SOR=0.498;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:94:68:0,94 0/1:33,27:60:99:.:682,0,937:19,14,14,13 +chrX 1559746 . A G 2510 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=21.17;BaseQRankSum=2.174;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.658;MQ=59.65;MQRankSum=-0.091;QD=21.17;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.497;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,62:63:99:1962,0:1,0,29,33 0/1:32,25:57:99:578,0,892:13,19,13,12 +chrX 1559783 . T C 4316 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=137;AS_QD=31.72;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=31.72;SOR=0.737;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2179,0:0,0,35,34 1/1:0,68:68:99:2167,204,0:0,0,35,33 +chrX 1559820 . T C 2397 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.25;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.25;SOR=0.720;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,73:73:99:.:2427,0:0,0,37,36 0/0:.:69:99:69:0,120,1800 +chrX 1560253 . A T 2078 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=31.94;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=31.94;SOR=1.112;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2108,0:0,0,27,39 0/0:.:35:36:35:0,36,972 +chrX 1560317 . A G 1453 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=32.96;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.46;QD=32.96;SOR=1.038;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:1483,0:0,0,19,26 0/0:.:35:36:35:0,36,972 +chrX 1560630 . C CA 160.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=9.52;BaseQRankSum=0;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=9.103;MQ=58.99;MQRankSum=-0.527;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.041;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:42:99:42:0,635 0/1:6,15:21:47:.:200,0,47:6,0,9,6 +chrX 1560955 . A G 581 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=6.79;BaseQRankSum=-0.076;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=19.718;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.872;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,26:49:94:94,0:18,5,8,18 0/1:22,19:41:99:517,0,607:13,9,10,9 +chrX 1561104 . C T 304 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=9.82;BaseQRankSum=0.831;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.128;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.14;SOR=0.283;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,185 0/1:20,14:34:99:.:334,0,492:7,13,7,7 +chrX 1561202 . T TCTCC 177.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=6.03;BaseQRankSum=-2.618;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=10.184;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.623;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,21:36:99:.:217,0:4,11,12,9 0/0:.:46:48:46:0,48,720 +chrX 1561264 . TC T 640.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=20.61;BaseQRankSum=1.279;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=5.485;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.193;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:39:99:39:.:.:0,139 0|1:15,18:33:99:.:0|1:1561264_TC_T:680,0,563:1561264:3,12,7,11 +chrX 1561268 . TCTC T 640.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=20.61;BaseQRankSum=0.251;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=5.485;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.193;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:39:99:39:.:.:0,139 0|1:15,18:33:99:.:0|1:1561264_TC_T:680,0,563:1561264:3,12,7,11 +chrX 1561289 . TTC T 625.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=21.45;BaseQRankSum=0.068;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=5.599;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.45;ReadPosRankSum=-1.057;SOR=0.180;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:39:99:39:.:.:0,139 0|1:13,18:31:99:.:0|1:1561264_TC_T:665,0,463:1561264:3,10,8,10 +chrX 1561418 . C CTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT 729.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=19.23;BaseQRankSum=0.665;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.22;MQRankSum=-1.747;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.527;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:99:39:0,139 0/1:20,20:40:99:.:769,0,735:9,11,10,10 +chrX 1561542 . C T 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.00;BaseQRankSum=-1.281;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.683;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.317;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1755 0/1:26,19:45:99:.:495,0,744:17,9,10,9 +chrX 1561657 . G A 711 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.56;BaseQRankSum=0.363;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.770;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1755 0/1:30,29:59:99:.:741,0,736:17,13,17,12 +chrX 1561688 . T C 1128 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=8.77;BaseQRankSum=2.183;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.383;MQ=59.96;MQRankSum=1.173;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.486;SOR=0.874;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,42:74:99:428,0:15,17,20,22 0/1:30,28:58:99:730,0,764:16,14,18,10 +chrX 1561717 . G A 98 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=1.83;BaseQRankSum=-0.477;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=4.681;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.324;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,38:70:99:.:128,0:12,20,19,19 0/0:.:58:99:58:0,120,1800 +chrX 1561747 . T TA 433.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.65;BaseQRankSum=-1.234;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=2.425;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.621;SOR=0.832;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,188 0/1:24,25:49:99:.:473,0,474:13,11,11,14 +chrX 1561978 . G A 809 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.32;BaseQRankSum=1.582;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.972;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.454;SOR=0.906;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,188 0/1:32,31:63:99:.:839,0,764:14,18,12,19 +chrX 1562124 . G T 2525 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.76;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.76;SOR=1.108;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,188 1/1:0,78:78:99:.:2555,234,0:0,0,46,32 +chrX 1562169 . T C 747 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=9.71;BaseQRankSum=-0.44;DP=159;ExcessHet=0.0000;FS=0.853;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.297;SOR=0.577;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,188 0/1:48,32:80:99:.:777,0,1314:27,21,17,15 +chrX 1562198 . A G 3783 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=23.25;BaseQRankSum=-0.925;DP=171;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.806;SOR=0.688;VarDP=164 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:37,44:81:99:.:.:194,0:.:18,19,16,28 1|1:0,83:83:99:0|1:1562198_A_G:3619,250,0:1562198:0,0,46,37 +chrX 1562209 . T C 3734 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=23.38;BaseQRankSum=0.574;DP=166;ExcessHet=0.0000;FS=0.693;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.607;VarDP=161 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:37,44:81:99:.:.:239,0:.:17,20,17,27 1|1:0,80:80:99:0|1:1562198_A_G:3525,241,0:1562198:0,0,43,37 +chrX 1562270 . C T 3025 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=19.97;BaseQRankSum=1.031;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=0.744;MQ=59.97;MQRankSum=-0.808;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.239;SOR=0.578;VarDP=153 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,46:78:99:498,0:14,18,19,27 1/1:0,75:75:99:2557,226,0:0,0,38,37 +chrX 1562281 . TA T 378.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=5.43;BaseQRankSum=-2.278;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=-0.817;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.794;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,45:77:99:.:418,0:15,17,20,25 0/0:.:74:99:74:0,113,1800 +chrX 1562447 . T C 1126 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=14.63;BaseQRankSum=-2.244;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.19;MQRankSum=0.951;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.631;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,501 0/1:34,45:79:99:.:1156,0,894:13,21,18,27 +chrX 1562460 . A G 808 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=11.03;BaseQRankSum=-0.183;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.03;MQRankSum=-1.296;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.682;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,501 0/1:41,35:76:99:.:838,0,1057:14,27,12,23 +chrX 1562759 . C G 962 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.81;BaseQRankSum=-0.584;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.007;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:99:69:.:.:0,501 0|1:33,26:59:99:.:0|1:1562759_C_G:992,0,1257:1562759:17,16,15,11 +chrX 1562761 . C T 962 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.81;BaseQRankSum=-0.877;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.007;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:99:69:.:.:0,501 0|1:33,26:59:99:.:0|1:1562759_C_G:992,0,1257:1562759:17,16,15,11 +chrX 1562847 . T C 972 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.56;BaseQRankSum=1.06;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=0.870;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:99:69:.:.:0,501 0|1:27,27:54:99:.:0|1:1562847_T_C:1002,0,1020:1562847:13,14,15,12 +chrX 1562855 . C T 964 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.75;BaseQRankSum=1.095;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=0.922;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:99:69:.:.:0,501 0|1:26,27:53:99:.:0|1:1562847_T_C:994,0,979:1562847:13,13,15,12 +chrX 1562927 . G A 764 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.98;BaseQRankSum=2.21;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=9.901;MQ=59.83;MQRankSum=-0.872;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.983;SOR=1.346;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,501 0/1:24,29:53:99:.:794,0,560:10,14,19,10 +chrX 1563005 . A AG 817.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=-1.723;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.100;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.763;SOR=0.481;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,501 0/1:23,26:49:99:.:857,0,612:10,13,13,13 +chrX 1563076 . A G 668 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.54;BaseQRankSum=1.262;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=6.534;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.54;ReadPosRankSum=-2.135;SOR=0.181;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,501 0/1:25,23:48:99:.:698,0,882:19,6,13,10 +chrX 1563077 . AAAAG AAAAGAAAGAAAG,AAAGAAAGAAAG,AAAAGAAAGAAAGAAAG,AAAGAAAGAAAGAAAG,A 2423.97 . AC=2,0,0,0,1;AF=0.667,0.00,0.00,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,0,0,11,23;AS_QD=30.74,34.72,30.50,29.86,32.46;BaseQRankSum=2.495;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=5.290;MQ=59.26;MQRankSum=-0.226;QD=34.69;ReadPosRankSum=1.618;SOR=1.816;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,17,0,0,11,0:29:99:928,0,512,614,191,868:0,1,22,6 1/5:0,19,0,0,0,23:42:99:1535,758,699,1546,775,1630,1546,775,1630,1630,1546,775,1630,1630,1630,756,0,865,865,865,881:0,0,28,14 +chrX 1563187 . G GGA 1271.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=24.74;BaseQRankSum=0.113;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.541;MQ=59.63;MQRankSum=0;QD=24.74;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=0.337;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1089 0/1:18,35:53:99:.:1311,0,615:12,6,19,16 +chrX 1563499 . CA C 691.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=21.50;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=7.899;MQ=59.41;MQRankSum=-0.269;QD=21.50;SOR=1.001;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1089 1/1:2,32:34:56:.:731,56,0:0,2,20,12 +chrX 1563503 . AAAAAAAAAAAAAG A 66.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=1.83;BaseQRankSum=1.777;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.30;MQRankSum=1.207;QD=1.83;ReadPosRankSum=-1.986;SOR=0.633;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,31:58:99:.:106,0:10,17,12,19 0/0:.:60:79:60:0,79,1737 +chrX 1563616 . T C 1995 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=16.20;BaseQRankSum=-0.13;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.731;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.943;SOR=0.462;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,36:67:99:179,0:20,11,24,12 1/1:0,58:58:99:1846,174,0:0,0,30,28 +chrX 1564015 . CTT CTTT,C,CT 1777.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=47,18,18;AS_QD=19.06,28.21,31.16;BaseQRankSum=-0.635;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.115;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=21.63;ReadPosRankSum=-1.13;SOR=0.338;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,45,0,0:46:99:915,0,938,938:1,0,21,24 2/3:0,2,18,18:38:99:902,946,1178,366,371,429,395,358,0,310:0,0,19,19 +chrX 1564529 . A C 6005 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=26.67;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=44.38;SOR=0.816;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:3188,0:.:0,0,30,42 1|1:0,64:64:99:0|1:1564529_A_C:2847,193,0:1564529:0,0,34,30 +chrX 1564534 . C A 5970 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=28.22;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=44.44;SOR=0.801;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3154,0:.:0,0,30,41 1|1:0,64:64:99:0|1:1564529_A_C:2846,193,0:1564529:0,0,34,30 +chrX 1564696 . G T 3036 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=25.34;BaseQRankSum=2.705;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.889;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.34;ReadPosRankSum=1.195;SOR=0.593;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,57:58:99:1861,0:1,0,30,27 0/1:20,43:63:99:1205,0,486:8,12,16,27 +chrX 1564718 . G C 3824 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=31.85;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.85;SOR=0.968;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1786,0:0,0,27,29 1/1:0,65:65:99:2068,194,0:0,0,26,39 +chrX 1565178 . T C 3402 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=23.19;BaseQRankSum=-2.72;DP=156;ExcessHet=0.0000;FS=3.726;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.19;ReadPosRankSum=-1.384;SOR=1.093;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2216,0:0,0,45,24 0/1:32,47:79:99:1216,0,855:16,16,23,24 +chrX 1565414 . T G 390 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=5.92;BaseQRankSum=-2.724;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=18.073;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.883;SOR=1.086;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,43:71:99:.:420,0:19,9,16,27 0/0:.:73:99:73:0,120,1800 +chrX 1565481 . T C 3343 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=23.26;BaseQRankSum=-1.567;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=1.712;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=23.26;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=0.709;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,79:79:99:2484,0:0,0,36,43 0/1:28,38:66:99:889,0,692:15,13,19,19 +chrX 1565595 . TG T 794.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.35;BaseQRankSum=0.623;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=2.418;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.370;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:83:99:83:.:.:0,1800 0|1:24,27:51:99:.:0|1:1565595_TG_T:834,0,888:1565595:15,9,14,13 +chrX 1565603 . GT G 2174.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=18.76;BaseQRankSum=2.513;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=3.29;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.811;SOR=0.656;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,65:67:99:.:.:1755,0:.:1,1,32,33 0|1:29,22:51:99:1|0:1565595_TG_T:459,0,1058:1565595:15,14,12,10 +chrX 1565923 . G GTTTTTTTTTCCCCCAAAAGGGGACCTAGGCGTGGTGGTACAAAACAC 3318.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=30.10;DP=166;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.40;QD=44.18;SOR=0.746;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,76:76:99:.:3358,0:0,0,39,37 0/0:.:85:0:85:0,0,1830 +chrX 1565924 . T TTTTTTTTTTCCCCCAAAAGGGGACCTAGGCGTGGTGGTACAAAACAC 1302.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.43;BaseQRankSum=0.882;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=4.437;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=1.094;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,1404 0|1:42,35:77:99:.:0|1:1565924_T_TTTTTTTTTTCCCCCAAAAGGGGACCTAGGCGTGGTGGTACAAAACAC:1342,0,1630:1565924:20,22,21,14 +chrX 1565925 . T C 1132 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=14.90;BaseQRankSum=-0.696;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=4.295;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=0.547;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,1404 0|1:36,42:78:99:.:1|0:1565924_T_TTTTTTTTTTCCCCCAAAAGGGGACCTAGGCGTGGTGGTACAAAACAC:1162,0,1374:1565924:21,15,20,22 +chrX 1566007 . C T 1994 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=33.18;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.47;QD=33.18;SOR=0.865;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,61:61:99:.:2024,0:0,0,33,28 0/0:.:71:0:71:0,0,1670 +chrX 1566094 . GAA G,GA 2283.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=52,21;AS_QD=26.68,10.73;BaseQRankSum=-0.827;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=8.957;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.781;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52,0:52:99:1894,0,1894:0,0,25,27 0/2:19,0,21:40:99:429,486,921,0,436,373:12,7,6,15 +chrX 1566333 . A T 2115 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=33.00;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=1.000;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,65:65:99:.:2145,0:0,0,37,28 0/0:.:64:90:64:0,90,1593 +chrX 1566627 . A G 4803 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=147;AS_QD=32.88;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=1.052;VarDP=147 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,77:77:99:2606,0:0,0,42,35 1/1:0,70:70:99:2227,209,0:0,0,43,27 +chrX 1566746 . G C 3442 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=25.53;BaseQRankSum=1.185;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.53;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.680;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,79:79:99:2565,0:0,0,41,38 0/1:24,33:57:99:907,0,588:13,11,19,14 +chrX 1566808 . C T 3274 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=26.22;BaseQRankSum=2.651;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.22;ReadPosRankSum=2.128;SOR=0.693;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,81:81:99:2718,0:0,0,44,37 0/1:24,21:45:99:586,0,563:13,11,11,10 +chrX 1566840 . GTGAGATGAATTTATGTTGCAAATATAACATATATGGTAGATATTATACACGATATGATATATTTATATA G 319.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=6.90;BaseQRankSum=-0.382;DP=163;ExcessHet=0.0000;FS=1.236;MQ=59.83;MQRankSum=-1.688;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.719;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:87:99:87:0,1800 0/1:39,13:52:99:.:359,0,1560:21,18,6,7 +chrX 1567045 . TATATA T 1269.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=18.70;BaseQRankSum=-0.336;DP=162;ExcessHet=0.0000;FS=6.257;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.115;SOR=1.418;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:87:99:87:.:.:0,1800 0|1:36,34:70:99:.:0|1:1567045_TATATA_T:1309,0,1409:1567045:18,18,12,22 +chrX 1567068 . A G 2410 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=30.50;BaseQRankSum=-0.505;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=4.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=1.048;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,79:80:99:.:2440,0:1,0,30,49 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 1567098 . G T 808 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.70;BaseQRankSum=0.335;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.278;SOR=0.536;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:79:99:79:.:.:0,1800 0|1:33,24:57:99:.:0|1:1567045_TATATA_T:838,0,1144:1567045:18,15,12,12 +chrX 1567146 . T C 2859 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=28.61;BaseQRankSum=1.612;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=40.69;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=0.980;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,69:71:99:.:2889,0:1,1,30,39 0/0:.:62:99:62:0,120,1800 +chrX 1567156 . A C 3902 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=28.70;BaseQRankSum=0.149;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=3.502;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.70;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.862;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,68:69:99:2894,0:0,1,29,39 0/1:37,31:68:99:1038,0,1262:20,17,15,16 +chrX 1567194 . GTATATA G,GTA 4984.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=85,33;AS_QD=27.26,30.42;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.58;SOR=0.874;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55,0:55:99:2450,0,2450:0,0,25,30 1/2:0,30,33:63:99:2574,1315,1361,1166,0,1047:0,0,29,34 +chrX 1567382 . GATATA G 4066.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=32.33;BaseQRankSum=-0.584;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=6.940;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.33;ReadPosRankSum=1.268;SOR=1.402;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2873,0:0,0,26,39 0/1:30,32:62:99:1233,0,1119:15,15,9,23 +chrX 1567744 . TTATATATATATA T 653.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=31.50;BaseQRankSum=2.355;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.11;MQRankSum=1.952;QD=31.50;ReadPosRankSum=1.93;SOR=0.724;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:21:49:.:.:0,21 0|1:5,17:22:99:.:0|1:1567744_TTATATATATATA_T:693,0,147:1567744:3,2,10,7 +chrX 1567779 . T G,TATA 941 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=48,2;AS_QD=12.95,2.00;BaseQRankSum=1.436;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.928;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=12.61;ReadPosRankSum=2.07;SOR=0.803;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,26,0:49:99:127,0,1099:12,11,12,14 0/1:4,22,2:28:52:844,0,60,786,52,995:2,2,11,13 +chrX 1568282 . C CA 762.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=7.94;BaseQRankSum=1.371;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=6.352;MQ=59.69;MQRankSum=0.169;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.592;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,28:51:99:152,0:9,14,15,13 0/1:24,26:50:99:650,0,596:10,14,14,12 +chrX 1568442 . TAA T 120.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=4.10;BaseQRankSum=-2.035;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.360;MQ=59.23;MQRankSum=-2.246;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.906;SOR=0.755;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,984 0/1:28,11:39:99:.:160,0,1129:15,13,5,6 +chrX 1568448 . A G 198 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=4.85;BaseQRankSum=-2.208;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.85;ReadPosRankSum=-2.411;SOR=0.674;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,27:47:99:.:228,0:8,12,11,16 0/0:.:44:99:44:0,100,1414 +chrX 1568450 . AAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATAT AATATATATATATATATATAT,A 1277.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=29,28;AS_QD=2.83,16.22;BaseQRankSum=0.957;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=1.652;MQ=59.29;MQRankSum=2.534;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.513;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,29,0:51:99:198,0,1188:9,13,12,17 0/2:19,0,28:47:99:1119,1176,1956,0,779,695:9,10,16,12 +chrX 1568522 . A ATGTATATATGTATATGTG 451.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.59;BaseQRankSum=-0.203;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=2.984;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.557;SOR=1.358;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,25:39:99:.:491,0:7,7,9,16 0/0:.:40:75:40:0,75,1125 +chrX 1568550 . GTA G 944.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=22.88;BaseQRankSum=-0.871;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.174;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=22.88;ReadPosRankSum=0.91;SOR=0.941;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,154 0|1:18,25:43:99:.:0|1:1568550_GTA_G:984,0,670:1568550:9,9,11,14 +chrX 1568573 . G A 1058 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=23.15;BaseQRankSum=0.825;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.128;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.69;SOR=0.906;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,154 0|1:18,29:47:99:.:0|1:1568550_GTA_G:1088,0,624:1568550:9,9,13,16 +chrX 1568640 . C A 89 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=1.83;BaseQRankSum=-0.77;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.33;SOR=0.749;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,35:65:99:.:119,0:15,15,18,17 0/0:.:53:93:53:0,93,1380 +chrX 1568856 . T A 562 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.80;BaseQRankSum=-0.532;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;MQRankSum=0;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.567;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,447 0|1:23,17:40:99:.:0|1:1568856_T_A:592,0,849:1568856:13,10,9,8 +chrX 1568878 . G A 664 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.09;BaseQRankSum=0.258;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.566;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:19:54:.:.:0,19 0|1:25,21:46:99:.:0|1:1568856_T_A:694,0,924:1568856:14,11,11,10 +chrX 1569013 . T C 56 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=1.51;BaseQRankSum=-1.775;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.269;MQ=59.71;MQRankSum=1.127;QD=1.51;ReadPosRankSum=-2.212;SOR=0.387;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,31:57:86:.:86,0:16,10,16,15 0/0:.:48:89:48:0,89,1292 +chrX 1569149 . T C 1007 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.85;BaseQRankSum=0.636;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.354;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=0.407;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,143 0|1:28,27:55:99:.:0|1:1569149_T_C:1037,0,1083:1569149:19,9,16,11 +chrX 1569150 . G A 3132 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=28.49;BaseQRankSum=0.948;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.994;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=28.49;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=0.399;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2125,0:.:0,0,32,23 0|1:28,27:55:99:0|1:1569149_T_C:1037,0,1083:1569149:19,9,16,11 +chrX 1569336 . G C 3368 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=32.06;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=32.06;SOR=1.036;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1876,0:0,0,25,32 1/1:0,49:49:99:1522,145,0:0,0,20,29 +chrX 1569433 . G A 209 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=4.78;BaseQRankSum=0.858;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=10.640;MQ=57.71;MQRankSum=-3.065;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.294;SOR=1.207;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,28:50:99:.:239,0:8,14,18,10 0/0:.:54:43:54:0,43,1211 +chrX 1569444 . A AT 679.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=8.17;BaseQRankSum=0.317;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=7.546;MQ=58.81;MQRankSum=0;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.444;SOR=1.155;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,26:50:67:.:.:67,0:.:9,15,14,5 0|1:20,18:38:99:0|1:1569444_A_AT:652,0,736:1569444:11,9,7,8 +chrX 1569445 . A *,AAT,AATAATAATAAT,AATAATAAT 678.97 . AC=0,0,1,1;AF=0.00,0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,0,18,15;AS_QD=0.00,0.00,1.06,11.05;BaseQRankSum=-0.272;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=6.019;MQ=58.81;MQRankSum=0;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.551;SOR=1.084;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 3:24,0,0,18,0:42:66:.:.:66,831,797,0,834:.:9,15,13,5 0|4:20,0,0,0,15:35:99:0|1:1569444_A_AT:652,621,1417,672,1420,1461,672,1420,1461,1461,0,782,791,791,736:1569444:11,9,7,8 +chrX 1569451 . A T,AATAATAAT,AAATAATAATAATAAT,AATAATAATAATAATAAT,AAATAATAATAATAATAATAATAAT,AAATAAT,AATAATAATAATAAT,AAATAATAATAATAATAATAAT 2701 . AC=3,0,0,0,0,0,0,0;AF=1.00,0.00,0.00,0.00,0.00,0.00,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=50,11,0,0,0,0,0,0;AS_QD=28.93,25.37,35.53,33.90,34.07,30.56,27.35,32.29;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.83;QD=44.77;SOR=1.071;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:SB 1:0,19,11,0,0,0,0,0,0:30:99:0,0,19,11 1/1:0,31,0,0,0,0,0,0,0:31:99:0,0,16,14 +chrX 1569503 . C T 166 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=3.21;BaseQRankSum=-1.379;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.597;MQ=58.93;MQRankSum=-2.045;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.317;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,34:61:99:.:196,0:17,10,17,17 0/0:.:53:70:53:0,70,1395 +chrX 1569786 . C A 639 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.38;BaseQRankSum=0.014;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.425;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.790;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1716 0/1:25,25:50:99:.:669,0,667:14,11,11,14 +chrX 1569933 . A G 1052 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=22.08;BaseQRankSum=-0.278;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;MQRankSum=-1.208;QD=22.08;ReadPosRankSum=-1.273;SOR=0.741;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,1716 0|1:21,28:49:99:.:0|1:1569933_A_G:1082,0,760:1569933:11,10,15,13 +chrX 1569945 . G A 3265 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=28.16;BaseQRankSum=1.029;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;MQRankSum=-1.208;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.587;SOR=0.637;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,68:68:99:.:.:2203,0:.:0,0,38,30 0|1:21,28:49:99:0|1:1569933_A_G:1092,0,760:1569933:12,9,15,13 +chrX 1570021 . G C 915 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=21.00;BaseQRankSum=0.845;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.00;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.610;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:71:99:71:.:.:0,1293 0|1:21,24:45:99:.:0|1:1570021_G_C:945,0,789:1570021:11,10,12,12 +chrX 1570025 . A G 915 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=21.00;BaseQRankSum=-0.185;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.00;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.610;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:71:99:71:.:.:0,1293 0|1:21,24:45:99:.:0|1:1570021_G_C:945,0,799:1570021:11,10,12,12 +chrX 1570037 . C G 851 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=20.02;BaseQRankSum=0.494;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.511;SOR=0.686;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:71:99:71:.:.:0,1293 0|1:21,23:44:99:.:0|1:1570021_G_C:881,0,802:1570021:11,10,12,11 +chrX 1570208 . CAAA C,CAAAA 1073.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,14;AS_QD=31.89,18.73;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.92;SOR=0.297;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1293,1293 1/2:1,21,14:36:99:.:1113,293,593,861,0,832:0,1,16,19 +chrX 1570249 . C CA 568.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.16;BaseQRankSum=-2.336;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=10.571;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.417;SOR=1.498;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1293 0/1:25,25:50:99:.:608,0,611:15,10,8,17 +chrX 1570289 . C T 629 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.67;BaseQRankSum=1.913;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=5.759;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.249;SOR=0.835;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1293 0/1:28,24:52:99:.:659,0,692:17,11,10,14 +chrX 1570636 . G A 5406 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=162;AS_QD=33.35;BaseQRankSum=3.265;DP=168;ExcessHet=0.0000;FS=3.257;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=33.35;ReadPosRankSum=-0.604;SOR=0.423;VarDP=163 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,85:86:99:2862,0:0,1,45,40 1/1:0,77:77:99:2574,232,0:0,0,41,36 +chrX 1570902 . C T 3953 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=32.38;BaseQRankSum=2.83;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.38;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.265;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2201,0:0,0,35,33 1/1:1,54:55:99:1782,155,0:1,0,29,25 +chrX 1570939 . A G 3578 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.80;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.80;SOR=0.931;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2085,0:0,0,32,31 1/1:0,47:47:99:1523,140,0:0,0,29,18 +chrX 1571220 . A G 3674 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=32.21;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.21;SOR=0.710;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1769,0:0,0,27,28 1/1:0,60:60:99:1935,179,0:0,0,31,29 +chrX 1571250 . A G 3602 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=32.72;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=0.825;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1712,0:0,0,24,28 1/1:0,59:59:99:1920,177,0:0,0,28,31 +chrX 1571417 . G GT,GTT 945.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=35,11;AS_QD=24.42,30.74;BaseQRankSum=1.965;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.711;MQ=59.45;MQRankSum=-0.129;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.38;SOR=0.793;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,4,11:15:99:452,106,0:0,0,6,9 1/1:1,31,0:32:72:533,72,0,536,90,554:0,1,21,10 +chrX 1571560 . A C 3647 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=34.36;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=34.36;SOR=1.056;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1996,0:0,0,21,32 1/1:0,54:54:99:1681,162,0:0,0,24,30 +chrX 1571682 . T C 1022 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=15.47;BaseQRankSum=-0.584;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.485;MQ=59.65;MQRankSum=0.255;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=1.206;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,975 0/1:28,40:68:99:.:1052,0,720:16,12,27,13 +chrX 1572224 . A C 549 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.58;BaseQRankSum=-0.162;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=5.987;MQ=59.96;MQRankSum=-1.043;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.09;SOR=0.372;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,975 0/1:27,23:50:99:.:579,0,689:18,9,11,12 +chrX 1572545 . G A 337 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=5.40;BaseQRankSum=0.127;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.030;MQ=59.76;MQRankSum=-0.807;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.977;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,40:68:99:.:367,0:13,15,16,24 0/0:.:53:33:52:0,33,962 +chrX 1573199 . GA G 1480.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=21.11;BaseQRankSum=-0.755;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;MQRankSum=2.233;QD=21.11;ReadPosRankSum=1.245;SOR=0.693;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,31:34:99:674,0:2,1,15,16 1/1:1,37:38:99:846,104,0:0,1,19,18 +chrX 1573507 . A G 933 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=28;AS_QD=34.39;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.62;QD=34.39;SOR=0.997;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:963,0:0,0,16,12 ./.:.:37:.:37:0,0,0 +chrX 1573555 . C CAAA,CAAAA 1204.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,21;AS_QD=32.30,28.13;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.98;QD=54.09;SOR=1.426;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,2,21:23:99:.:1244,310,0:0,0,8,15 0/0:.:50:0:50:0,0,94,0,94,94 +chrX 1573655 . C G 758 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.76;BaseQRankSum=0.891;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.144;MQ=58.92;MQRankSum=1.441;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.435;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1062 0/1:21,29:50:99:.:788,0,480:7,14,12,17 +chrX 1573919 . CAA C,CA 2911.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=69,53;AS_QD=34.83,26.13;BaseQRankSum=2.269;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=3.739;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.99;ReadPosRankSum=0.883;SOR=0.773;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40,30:70:99:1466,0,271:0,0,36,34 1/2:1,29,23:53:99:1485,518,513,748,0,632:0,1,35,17 +chrX 1574150 . T A 764 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.70;BaseQRankSum=-1.514;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=10.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.70;ReadPosRankSum=-2.161;SOR=1.329;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1026 0/1:25,29:54:99:.:794,0,691:15,10,10,19 +chrX 1574171 . T C 34 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=2.00;BaseQRankSum=0.525;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.307;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.00;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=1.550;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,17:32:64:.:64,0:7,8,5,12 0/0:.:60:99:60:0,120,1800 +chrX 1574305 . G A 601 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.69;BaseQRankSum=-0.583;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=2.236;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.069;SOR=1.136;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:99:43:0,972 0/1:34,25:59:99:.:631,0,944:17,17,15,10 +chrX 1574324 . A G 3490 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=31.15;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=31.15;SOR=1.179;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1770,0:0,0,39,18 1/1:0,56:56:99:1750,168,0:0,0,29,27 +chrX 1574388 . C T 99 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=2.11;BaseQRankSum=-0.571;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.053;MQ=59.91;MQRankSum=-0.888;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.109;SOR=0.516;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,33:61:99:.:129,0:20,8,22,11 0/0:.:66:99:66:0,112,1742 +chrX 1575560 . G A 579 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.53;BaseQRankSum=-2.409;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.164;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.07;SOR=0.906;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1344 0/1:21,24:45:99:.:609,0,596:8,13,8,16 +chrX 1575968 . T C 620 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.44;BaseQRankSum=-0.376;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.150;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.922;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:15:51:0,15 0/1:21,24:45:99:.:650,0,535:9,12,9,15 +chrX 1576350 . T C 182 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=2.65;BaseQRankSum=0.884;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=4.250;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=0.455;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:37,43:80:99:.:212,0:15,22,22,21 0/0:.:58:68:58:0,68,1096 +chrX 1576848 . A G 4451 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=33.44;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.44;SOR=0.818;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2114,0:0,0,33,29 1/1:0,72:72:99:2367,216,0:0,0,30,42 +chrX 1577093 . A G 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.05;BaseQRankSum=-2.194;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=5.645;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.243;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,629 0/1:30,26:56:99:.:675,0,865:21,9,14,12 +chrX 1577325 . CTGGATGGA C,CTGGA 1147.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=27,19;AS_QD=27.81,27.26;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.01;MQRankSum=0;QD=23.74;SOR=0.627;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,15,11:30:93:369,0,93:0,1,9,12 1/2:0,12,8:20:99:818,325,336,492,0,467:0,0,5,15 +chrX 1577535 . AGATG A,AGATGGATG 663.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=11,7;AS_QD=31.12,28.52;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.21;QD=39.06;SOR=2.303;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,665,665 1/2:0,11,7:18:99:.:703,271,238,425,0,402:0,0,14,4 +chrX 1577632 . TATGG T 1747.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=30.83;BaseQRankSum=0.534;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.54;MQRankSum=0;QD=38.02;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=1.280;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,16:18:99:492,0:1,1,10,6 1/1:0,29:29:88:1295,88,0:0,0,18,11 +chrX 1577707 . A G 2335 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=31.53;BaseQRankSum=2.823;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=7.758;MQ=57.79;MQRankSum=1.015;QD=31.53;ReadPosRankSum=2.19;SOR=0.859;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,36:38:99:1141,0:0,2,23,13 1/1:0,37:37:99:1224,111,0:0,0,21,16 +chrX 1577728 . CTGGA CTGGATGGATGGA,C 2508.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=44,16;AS_QD=29.27,25.98;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.39;QD=42.47;SOR=0.831;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34,0:34:99:1487,0,1487:0,0,18,16 1/2:0,10,16:26:99:1061,626,588,397,0,531:0,0,14,12 +chrX 1577840 . T G 4899 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=33.22;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;MQRankSum=0;QD=42.86;SOR=0.237;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:2370,0:.:0,0,30,25 1|1:1,59:60:99:0|1:1577840_T_G:2559,171,0:1577840:0,1,26,33 +chrX 1577843 . G A 4865 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=30.28;BaseQRankSum=2.187;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;MQRankSum=0;QD=42.94;ReadPosRankSum=1.704;SOR=0.230;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,54:54:99:.:.:2336,0:.:0,0,30,24 1|1:1,59:60:99:0|1:1577840_T_G:2559,171,0:1577840:0,1,26,33 +chrX 1578351 . A C 3147 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=33.44;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.44;SOR=0.848;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1639,0:0,0,22,26 1/1:0,47:47:99:1538,141,0:0,0,22,25 +chrX 1578615 . G A 3504 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=33.66;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.66;SOR=0.967;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1965,0:0,0,25,34 1/1:0,46:46:99:1569,138,0:0,0,21,25 +chrX 1578752 . T C 2391 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.28;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.28;SOR=0.719;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1286,0:0,0,23,18 1/1:0,34:34:99:1135,102,0:0,0,14,20 +chrX 1579327 . G A 305 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=6.32;BaseQRankSum=1.332;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.051;MQ=59.92;MQRankSum=-0.804;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=0.892;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,31:53:99:.:335,0:11,11,17,14 0/0:.:54:85:54:0,85,1116 +chrX 1579505 . A T 3470 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=32.41;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.41;SOR=0.849;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1734,0:0,0,25,28 1/1:0,55:55:99:1766,165,0:0,0,33,22 +chrX 1579777 . T C 4320 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=32.22;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=32.22;SOR=0.801;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2162,0:0,0,35,33 1/1:0,67:67:99:2188,200,0:0,0,36,31 +chrX 1580436 . AAAT A 3895.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=27.64;BaseQRankSum=-1.011;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.039;MQ=59.97;MQRankSum=-0.103;QD=42.77;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.124;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,47:49:99:2013,0:2,0,28,19 1/1:0,43:43:99:1922,130,0:0,0,19,24 +chrX 1580510 . A AT 3654.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=24.40;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.39;QD=39.72;SOR=0.758;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1849,0:0,0,22,25 1/1:0,46:46:99:1845,138,0:0,0,23,23 +chrX 1580882 . T C 809 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=7.42;BaseQRankSum=0.225;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=0.075;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.720;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,29:57:80:80,0:13,15,16,13 0/1:26,30:56:99:759,0,705:13,13,12,18 +chrX 1581166 . C T 1033 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=8.24;BaseQRankSum=0.193;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=5.411;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.906;SOR=0.360;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,33:63:85:85,0:19,11,19,14 0/1:31,35:66:99:978,0,839:18,13,15,20 +chrX 1581206 . C T 915 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=13.70;BaseQRankSum=-0.605;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=2.021;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.445;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,126 0/1:34,35:69:99:.:945,0,915:21,13,19,16 +chrX 1581621 . A G 573 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.08;BaseQRankSum=-0.164;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=1.252;MQ=56.81;MQRankSum=0.63;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=0.888;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,126 0/1:17,23:40:99:.:603,0,451:9,8,10,13 +chrX 1581689 . C T 348 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=7.13;BaseQRankSum=0.648;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.159;MQ=54.70;MQRankSum=-0.774;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.5;SOR=1.371;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,126 0/1:36,17:53:99:.:378,0,733:18,18,6,11 +chrX 1581903 . G T 147 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=5.71;BaseQRankSum=0.542;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.467;MQ=54.61;MQRankSum=-0.027;QD=5.71;ReadPosRankSum=-2.127;SOR=2.030;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,126 0/1:25,6:31:99:.:177,0,955:13,11,5,1 +chrX 1581908 . TATTA T,* 1347.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=55,14;AS_QD=15.37,0.00;BaseQRankSum=-0.539;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.17;MQRankSum=-0.991;QD=14.60;ReadPosRankSum=0;SOR=0.661;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,31,0:57:99:235,0,1364:15,11,20,11 1/2:0,24,14:38:99:1152,142,241,910,0,897:0,0,19,19 +chrX 1581911 . TA *,T 1116.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,2;AS_QD=0.00,25.44;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.42;QD=30.42;SOR=0.661;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,31,0:57:99:.:.:235,0,1364:.:15,11,20,11 1|2:0,36,2:38:28:0|1:1581906_GATA_G:1156,69,28,982,0,1022:1581906:0,0,19,19 +chrX 1581971 . T A 1120 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=13.86;BaseQRankSum=1.636;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.894;MQ=55.55;MQRankSum=1.048;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.191;SOR=0.909;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,26:53:29:.:.:29,0:.:14,13,17,9 1|1:3,27:30:47:0|1:1581971_T_A:1121,47,0:1581971:1,0,14,13 +chrX 1582002 . G C 1374 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=15.26;BaseQRankSum=0;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.11;MQRankSum=1.265;QD=15.26;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=0.725;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,28:55:75:.:.:75,0:.:17,10,20,8 1|1:3,34:37:68:0|1:1581971_T_A:1329,68,0:1581971:1,0,20,14 +chrX 1582223 . C T 2593 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.63;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.66;QD=33.63;SOR=0.798;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1608,0:0,0,24,26 1/1:0,28:28:84:1015,84,0:0,0,17,11 +chrX 1582244 . G T 216 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=7.24;BaseQRankSum=1.244;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=11.938;MQ=51.61;MQRankSum=-2.617;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.405;SOR=2.462;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,233 0/1:23,11:34:99:.:246,0,613:10,13,9,2 +chrX 1582283 . T C 819 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=18.06;BaseQRankSum=-1.033;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=1.121;MQ=55.92;MQRankSum=-3.154;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=0.815;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:25,22:47:99:.:0|1:1582283_T_C:849,0,973:1582283:12,13,12,10 +chrX 1582292 . A G 822 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=18.52;BaseQRankSum=0.221;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.145;MQ=55.82;MQRankSum=-3.076;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=0.757;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:24,22:46:99:.:0|1:1582283_T_C:852,0,942:1582283:11,13,12,10 +chrX 1582311 . A G 932 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.81;BaseQRankSum=-1.162;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.85;MQRankSum=-3.565;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.580;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:29,25:54:99:.:0|1:1582283_T_C:962,0,1142:1582283:13,16,12,13 +chrX 1582320 . TGTAA T 961.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.88;BaseQRankSum=-0.207;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=57.47;MQRankSum=-3.679;QD=17.88;ReadPosRankSum=0.77;SOR=0.869;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:30,26:56:99:.:0|1:1582283_T_C:1001,0,1181:1582283:14,16,11,15 +chrX 1582337 . C T 958 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.33;BaseQRankSum=0.489;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.269;MQ=58.25;MQRankSum=-3.276;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.089;SOR=1.136;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:31,26:57:99:.:0|1:1582283_T_C:988,0,1223:1582283:15,16,10,16 +chrX 1582344 . T A 955 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.98;BaseQRankSum=0.311;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.225;MQ=58.34;MQRankSum=-3.325;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.892;SOR=1.060;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:32,26:58:99:.:0|1:1582283_T_C:985,0,1245:1582283:15,17,10,16 +chrX 1582460 . C CATTTATTT 762.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.42;BaseQRankSum=-1.292;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.419;MQ=59.82;MQRankSum=0.929;QD=15.42;ReadPosRankSum=-2.673;SOR=1.145;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:29,23:52:99:.:0|1:1582460_C_CATTTATTT:802,0,1143:1582460:13,16,8,15 +chrX 1582463 . T TAA 1246.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=21.08;BaseQRankSum=1.295;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=-0.888;QD=21.08;ReadPosRankSum=2.285;SOR=0.693;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:28,33:61:99:.:1|0:1582460_C_CATTTATTT:1286,0,1056:1582460:11,17,13,20 +chrX 1582464 . T TTAATTA 1246.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=21.08;BaseQRankSum=0.909;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=-0.888;QD=21.08;ReadPosRankSum=1.832;SOR=0.693;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:28,33:61:99:.:1|0:1582460_C_CATTTATTT:1286,0,1056:1582460:11,17,13,20 +chrX 1582479 . T C 1253 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=20.69;BaseQRankSum=0.163;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=-0.905;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.91;SOR=0.641;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:99:54:.:.:0,233 0|1:29,33:62:99:.:1|0:1582460_C_CATTTATTT:1283,0,1068:1582460:11,18,13,20 +chrX 1582608 . CTT C 614.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.53;BaseQRankSum=-0.722;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=12.058;MQ=59.15;MQRankSum=1.006;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.089;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,21:27:99:466,0:6,0,10,11 0/1:10,8:18:99:188,0,227:7,3,5,3 +chrX 1582706 . G A 3113 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.80;BaseQRankSum=-0.08;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.493;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.80;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.916;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,53:53:99:.:.:2363,0:.:0,0,20,33 0|1:20,20:40:99:0|1:1582706_G_A:780,0,780:1582706:11,9,11,9 +chrX 1582721 . T C 3126 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.57;BaseQRankSum=-1.788;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=6.573;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.57;ReadPosRankSum=0.17;SOR=0.958;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2295,0:.:0,0,19,32 0|1:21,22:43:99:0|1:1582706_G_A:861,0,816:1582706:12,9,11,11 +chrX 1582722 . G C 3148 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=33.10;BaseQRankSum=-1.312;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=4.838;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.10;ReadPosRankSum=0.158;SOR=1.038;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2320,0:.:0,0,19,33 0|1:22,22:44:99:0|1:1582706_G_A:858,0,837:1582706:12,10,11,11 +chrX 1582733 . C A 3162 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.24;BaseQRankSum=-0.983;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=7.971;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.24;ReadPosRankSum=0.223;SOR=1.070;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:2379,0:.:0,0,20,35 0|1:23,21:44:99:0|1:1582706_G_A:813,0,872:1582706:13,10,10,11 +chrX 1582830 . G C 2521 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=21.62;BaseQRankSum=0.077;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.751;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.946;SOR=0.791;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1778,0:0,0,22,31 0/1:34,31:65:99:773,0,867:17,17,18,13 +chrX 1582850 . C T 2492 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=21.56;BaseQRankSum=-0.282;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.691;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.709;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1730,0:0,0,23,30 0/1:33,31:64:99:792,0,841:18,15,16,15 +chrX 1583017 . T TA,TAA 1838.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=14,56;AS_QD=18.51,23.77;BaseQRankSum=-0.132;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=4.633;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.19;SOR=0.446;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,14,30:44:99:1098,413,0:0,0,24,20 0/2:23,0,26:49:99:780,850,1616,0,766,688:9,14,12,14 +chrX 1583083 . G T 4077 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=34.51;BaseQRankSum=0.884;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.897;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.51;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=0.481;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,66:66:99:.:.:2936,0:.:0,0,34,32 0|1:23,30:53:99:0|1:1583083_G_T:1171,0,809:1583083:13,10,14,16 +chrX 1583089 . C T 4130 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=34.38;BaseQRankSum=0.516;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.871;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.38;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.474;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,67:67:99:.:.:2992,0:.:0,0,36,31 0|1:24,30:54:99:0|1:1583083_G_T:1168,0,851:1583083:14,10,14,16 +chrX 1583095 . T A 4107 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=34.76;BaseQRankSum=-0.337;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.866;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.76;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.582;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2925,0:.:0,0,36,29 0|1:23,31:54:99:0|1:1583083_G_T:1212,0,872:1583083:13,10,15,16 +chrX 1583105 . A G 3989 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=33.49;BaseQRankSum=-0.896;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.851;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.49;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.593;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,68:68:99:.:.:2956,0:.:0,0,38,30 0|1:24,28:52:99:0|1:1583083_G_T:1063,0,913:1583083:14,10,15,13 +chrX 1583152 . G T 2646 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=23.47;BaseQRankSum=0.012;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.47;ReadPosRankSum=0.085;SOR=0.684;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2030,0:0,0,35,28 0/1:26,25:51:99:646,0,666:14,12,12,13 +chrX 1583419 . T C 3207 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=28.15;BaseQRankSum=-0.276;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.15;ReadPosRankSum=-1.91;SOR=0.738;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,53:53:99:.:.:2265,0:.:0,0,20,33 0|1:34,28:62:99:0|1:1583419_T_C:972,0,1271:1583419:15,19,15,13 +chrX 1583445 . A G 3121 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=27.88;BaseQRankSum=-1.37;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.638;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.543;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2318,0:.:0,0,25,31 0|1:34,23:57:99:0|1:1583419_T_C:833,0,1296:1583419:14,20,11,12 +chrX 1583576 . CT C 500.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=28.42;BaseQRankSum=-0.781;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.73;MQRankSum=1.897;QD=28.42;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.892;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:12:99:12:0,180 0/1:5,14:19:99:.:540,0,117:1,4,3,11 +chrX 1583580 . CTTTCTTTCTTT C,CCTTT 465.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=10,0;AS_QD=33.67,23.40;BaseQRankSum=0;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.76;MQRankSum=1.579;QD=33.67;ReadPosRankSum=1.226;SOR=0.495;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:12:99:12:0,180,180 0/1:5,10,0:15:99:.:505,0,443,388,170,753:1,4,3,7 +chrX 1583587 . T C,* 100 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=4,0;AS_QD=32.50,27.48;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.87;QD=32.50;SOR=0.892;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,4,0:4:99:130,0,130:0,0,0,4 0/2:5,0,10:15:99:505,503,898,0,361,443:1,4,3,7 +chrX 1583591 . T C,TTC,TCTTCCTTC,*,TCTTC 1864 . AC=1,0,1,1,0;AF=0.333,0.00,0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=4,0,4,10,0;AS_QD=28.96,30.22,25.27,0.00,29.55;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.05;QD=105.22;SOR=2.833;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,4,0,0,0,0:4:99:495,0,164,255,214,214:0,0,0,4 3/4:0,0,0,4,10,0:14:99:1399,761,733,1256,771,1230,760,587,770,731,501,150,465,0,423,1029,534,994,558,408,966:0,0,3,11 +chrX 1583654 . T TTCTC 2034.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=27.65;BaseQRankSum=0.678;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;MQRankSum=-2.006;QD=27.65;ReadPosRankSum=1.588;SOR=0.627;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1352,0:0,0,14,17 0/1:25,19:44:99:722,0,946:11,14,9,10 +chrX 1583742 . A G 3769 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=33.92;BaseQRankSum=-0.146;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=6.231;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=33.92;ReadPosRankSum=-0.713;SOR=1.011;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2578,0:.:0,0,34,24 0|1:23,31:54:99:0|1:1583742_A_G:1221,0,852:1583742:10,13,19,12 +chrX 1583749 . G A 3766 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=33.59;BaseQRankSum=1.815;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=5.967;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=33.59;ReadPosRankSum=0.068;SOR=1.052;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2578,0:.:0,0,34,24 0|1:24,31:55:99:0|1:1583742_A_G:1218,0,884:1583742:11,13,19,12 +chrX 1583787 . C G 3840 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.52;BaseQRankSum=0.886;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.922;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=32.52;ReadPosRankSum=1.878;SOR=1.062;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2703,0:.:0,0,37,25 0|1:27,30:57:99:0|1:1583787_C_G:1167,0,982:1583787:14,13,18,12 +chrX 1583803 . G A 3894 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=33.83;BaseQRankSum=1.737;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.888;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.171;SOR=0.954;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2748,0:.:0,0,37,25 0|1:24,30:54:99:0|1:1583787_C_G:1176,0,887:1583787:13,11,18,12 +chrX 1584064 . G C 2614 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=21.15;BaseQRankSum=0.312;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.627;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.508;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2103,0:0,0,38,29 0/1:36,22:58:99:541,0,956:23,13,14,8 +chrX 1584225 . A T 3623 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=26.47;BaseQRankSum=1.147;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=1.496;MQ=59.83;MQRankSum=0.789;QD=26.47;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.916;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,67:67:99:.:.:2746,0:.:0,0,21,33 0|1:45,26:71:99:0|1:1584225_A_T:907,0,1717:1584225:22,23,14,12 +chrX 1584226 . T A 2307 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=18.40;BaseQRankSum=2.125;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=2.325;MQ=59.83;MQRankSum=0.789;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.918;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,54:56:99:.:.:1430,0:.:1,1,21,33 0|1:45,26:71:99:0|1:1584225_A_T:907,0,1717:1584225:22,23,14,12 +chrX 1584673 . C G 528 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=5.21;BaseQRankSum=-0.047;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.538;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.132;SOR=1.007;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,31:60:24:24,0:14,15,11,20 0/1:26,21:47:99:534,0,713:11,15,9,12 +chrX 1584714 . T C 750 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=7.72;BaseQRankSum=-2.224;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.603;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.57;SOR=0.733;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,34:56:99:261,0:11,11,16,18 0/1:24,21:45:99:519,0,690:11,13,13,8 +chrX 1584943 . AAG A 3586.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.09;BaseQRankSum=1.59;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.873;MQ=59.98;MQRankSum=0;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.936;SOR=1.025;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:2535,0:0,0,35,23 0/1:26,29:55:99:1091,0,991:14,12,18,11 +chrX 1584971 . A G 2837 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=22.75;BaseQRankSum=-0.646;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=4.309;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.75;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=1.199;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2093,0:0,0,41,27 0/1:26,32:58:99:774,0,636:14,12,23,9 +chrX 1585103 . A G 196 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=3.59;BaseQRankSum=-1.729;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.20;MQRankSum=-1.916;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.596;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,36:63:99:.:226,0:12,15,17,19 0/0:.:71:92:71:0,92,1800 +chrX 1585115 . T C 3445 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=26.73;BaseQRankSum=-2.252;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.30;MQRankSum=-3.021;QD=26.73;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.641;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2494,0:0,0,28,37 0/1:26,39:65:99:981,0,690:10,16,14,25 +chrX 1585153 . C T 1402 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=24.27;BaseQRankSum=-0.282;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.922;MQ=57.06;MQRankSum=-3.143;QD=24.27;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=1.360;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1800 0|1:23,36:59:99:.:0|1:1585153_C_T:1432,0,857:1585153:10,13,11,25 +chrX 1585154 . A G 4172 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=34.44;BaseQRankSum=-0.637;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.256;MQ=56.78;MQRankSum=-3.143;QD=34.44;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=1.162;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2770,0:.:0,0,23,40 0|1:23,36:59:99:0|1:1585153_C_T:1432,0,857:1585153:10,13,11,25 +chrX 1585168 . T A 4076 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=33.38;BaseQRankSum=0.287;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.880;MQ=56.78;MQRankSum=-3.246;QD=33.38;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.914;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,64:64:99:.:.:2805,0:.:0,0,23,41 0|1:25,34:59:99:0|1:1585153_C_T:1301,0,927:1585153:10,15,12,22 +chrX 1585199 . G A 902 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=8.40;BaseQRankSum=1.28;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.488;MQ=57.18;MQRankSum=-2.179;QD=8.40;ReadPosRankSum=2.138;SOR=0.476;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,29:59:6:6,0:12,18,14,15 0/1:20,32:52:99:926,0,504:7,13,13,19 +chrX 1585367 . A C 2473 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=30.90;BaseQRankSum=-2.814;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=20.751;MQ=59.35;MQRankSum=2.915;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.169;SOR=0.051;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,41:42:99:.:.:1757,0:.:1,0,22,19 0|1:19,20:39:99:0|1:1585367_A_C:746,0,682:1585367:16,3,9,11 +chrX 1585376 . G A 2417 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=29.84;BaseQRankSum=-0.302;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=19.379;MQ=59.35;MQRankSum=2.872;QD=29.84;ReadPosRankSum=1.3;SOR=0.067;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,40:41:99:.:.:1707,0:.:1,0,21,19 0|1:21,20:41:99:0|1:1585367_A_C:740,0,745:1585367:17,4,9,11 +chrX 1585386 . CAAAA C 1829.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=29.20;BaseQRankSum=-0.422;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=8.759;MQ=59.56;MQRankSum=3.672;QD=29.20;ReadPosRankSum=1.136;SOR=0.148;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,32:34:99:1250,0:1,0,17,11 0/1:14,16:30:99:619,0,511:11,3,8,8 +chrX 1585450 . C T 2894 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=22.67;BaseQRankSum=0.153;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.753;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=22.67;ReadPosRankSum=1.364;SOR=0.554;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1916,0:0,0,30,28 0/1:34,37:71:99:1008,0,904:20,14,22,15 +chrX 1585902 . GT G 2549.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=21.22;BaseQRankSum=1.441;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=21.22;ReadPosRankSum=-1.743;SOR=0.743;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1766,0:0,0,26,32 0/1:30,34:64:99:823,0,773:13,17,13,21 +chrX 1585939 . TTTG T 3741.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=31.77;BaseQRankSum=1.286;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.794;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=31.77;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.562;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2779,0:.:0,0,33,30 0|1:30,26:56:99:0|1:1585939_TTTG_T:1002,0,1139:1585939:17,13,14,12 +chrX 1585967 . GTTTGTT G 3994.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.62;BaseQRankSum=0.177;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=5.724;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=33.62;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.315;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,67:67:99:.:.:2985,0:.:0,0,38,29 0|1:26,27:53:99:0|1:1585939_TTTG_T:1049,0,1010:1585939:18,8,15,12 +chrX 1585984 . T C 3788 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.36;BaseQRankSum=-0.953;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=4.450;MQ=59.90;MQRankSum=-0.981;QD=32.36;ReadPosRankSum=1.103;SOR=0.335;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2844,0:.:0,0,40,25 0|1:27,26:53:99:0|1:1585939_TTTG_T:974,0,1013:1585939:20,7,17,9 +chrX 1586174 . C T 3151 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=23.74;BaseQRankSum=1.965;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=3.915;MQ=59.49;MQRankSum=1.588;QD=23.74;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.732;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2216,0:0,0,38,32 0/1:29,35:64:99:965,0,670:13,16,19,16 +chrX 1586882 . G C 2884 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=24.08;BaseQRankSum=-1.338;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.08;ReadPosRankSum=-1.896;SOR=0.675;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2109,0:0,0,31,34 0/1:25,31:56:99:805,0,642:11,14,12,19 +chrX 1587451 . T TG 2500.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=26.46;BaseQRankSum=-1.899;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.082;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.46;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=1.005;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1855,0:0,0,17,39 0/1:16,24:40:99:685,0,431:7,9,13,11 +chrX 1587608 . TTCCCCTCCCCTCCCTTCCCCTCCTCTACCTTCCCTTCCCCTCCCC T 35.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=-0.674;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.10;MQRankSum=0;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.112;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,3:5:72:72,0:1,1,0,3 0/1:5,1:6:3:3,0,205:0,5,0,1 +chrX 1587633 . CTACCT *,C 635.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,5;AS_QD=0.00,24.16;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=7.404;MQ=58.79;QD=112.50;SOR=4.615;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,3,0:5:72:.:.:72,0,103:.:1,1,0,3 1|2:0,1,5:6:18:0|1:1587633_CTACCT_*:675,246,199,65,0,18:1587633:0,0,0,6 +chrX 1587643 . TTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCCCTTCCCCTCCTCTCCCTTCCCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCCCTTCCCCTCCCTTCCCCTCCCCTCCTCTCCCCTCCCTTCCCC *,T 635.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,5;AS_QD=0.00,28.66;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=7.404;MQ=57.72;QD=112.50;SOR=4.615;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,3,0:5:72:.:.:72,0,103:.:1,1,0,3 1|2:0,1,5:6:18:0|1:1587633_CTACCT_*:675,246,199,65,0,18:1587633:0,0,0,6 +chrX 1587701 . C *,T 229 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,3;AS_QD=36.75,27.84;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.12;QD=86.33;SOR=4.615;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,3:3:99:.:.:259,121,0:.:0,0,0,3 1|1:0,5,0:6:47:0|1:1587633_CTACCT_*:675,65,18,497,68,460:1587633:0,0,0,6 +chrX 1587713 . TTCCCC *,T 219.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,3;AS_QD=26.26,22.50;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.12;QD=86.33;SOR=4.615;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,3:3:99:.:.:259,121,0:.:0,0,0,3 1|1:0,5,0:6:47:0|1:1587633_CTACCT_*:675,65,18,497,68,460:1587633:0,0,0,6 +chrX 1587729 . TCCC *,T 219.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,3;AS_QD=36.56,24.46;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.12;QD=86.33;SOR=4.615;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,3:3:99:.:.:259,121,0:.:0,0,0,3 1|1:0,5,0:6:47:0|1:1587633_CTACCT_*:675,65,18,497,68,460:1587633:0,0,0,6 +chrX 1587735 . CCT *,C 219.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,3;AS_QD=28.71,33.20;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.12;QD=86.33;SOR=4.615;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,3:3:99:.:.:259,121,0:.:0,0,0,3 1|1:0,5,0:6:47:0|1:1587633_CTACCT_*:675,65,18,497,68,460:1587633:0,0,0,6 +chrX 1587756 . CCTTCCCCTCCCCTCT C 81.97 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=3;AS_QD=29.70;DP=7;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.12;QD=40.33;SOR=2.833;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,3:3:99:.:121,0:0,0,0,3 ./.:.:3:.:1:0,0,0 +chrX 1587788 . T C,TTCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCCTTCCCC 58 . AC=1,0;AF=1.00,0.00;AN=1;AS_AltDP=2,0;AS_QD=32.32,32.73;DP=5;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.08;QD=44.00;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,2,0:2:88:.:88,0,178:0,0,0,2 ./.:.:3:.:1:0,0,0,0,0,0 +chrX 1590283 . A C 2425 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=22.52;BaseQRankSum=1.602;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.775;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=22.52;ReadPosRankSum=-2.11;SOR=0.858;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1849,0:0,0,30,27 0/1:29,23:52:99:606,0,772:14,15,14,9 +chrX 1590887 . A C 3992 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=30.01;BaseQRankSum=-0.361;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=4.782;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.01;ReadPosRankSum=1.771;SOR=0.532;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,66:67:99:.:.:2816,0:.:0,1,28,38 0|1:35,32:67:99:0|1:1590887_A_C:1206,0,1314:1590887:21,14,19,13 +chrX 1590894 . A G 3955 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=30.19;BaseQRankSum=-0.686;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=2.548;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.19;ReadPosRankSum=1.225;SOR=0.666;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,63:64:99:.:.:2722,0:.:0,1,27,36 0|1:34,34:68:99:0|1:1590887_A_C:1263,0,1278:1590887:19,15,19,15 +chrX 1591035 . A C 2864 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=23.15;BaseQRankSum=-1.116;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=10.487;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.525;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2133,0:0,0,39,27 0/1:29,30:59:99:761,0,802:10,19,13,17 +chrX 1591176 . T G 2777 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=23.01;BaseQRankSum=-1.674;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.692;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.01;ReadPosRankSum=-1.924;SOR=0.481;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2060,0:0,0,29,33 0/1:31,29:60:99:747,0,852:13,18,15,14 +chrX 1591874 . C T 1121 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=17.98;BaseQRankSum=-1.279;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=3.991;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=1.302;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:823,0:0,0,21,5 0/1:23,15:38:99:328,0,627:15,8,10,5 +chrX 1592272 . A G 3002 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=25.48;BaseQRankSum=-0.664;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.007;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.48;ReadPosRankSum=0.569;SOR=0.900;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1945,0:0,0,35,23 0/1:21,40:61:99:1087,0,477:10,11,20,20 +chrX 1594128 . C T 3388 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=21.91;BaseQRankSum=1.607;DP=161;ExcessHet=0.0000;FS=4.419;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.91;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.416;VarDP=156 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,77:77:99:2415,0:0,0,26,51 0/1:41,38:79:99:1003,0,1008:14,27,23,15 +chrX 1594275 . C T 2680 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=23.57;BaseQRankSum=-3.09;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.147;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.57;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.368;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:1959,0:0,0,34,29 0/1:23,29:52:99:751,0,638:14,9,12,17 +chrX 1595230 . TGGGTCTGCACCGGACATGAGTGGTGAGC T 4572.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=30.14;BaseQRankSum=-0.531;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.14;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=0.651;VarDP=153 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,80:80:99:3585,0:0,0,39,41 0/1:45,28:73:99:1027,0,1805:22,23,15,13 +chrX 1595720 . C T 2307 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=20.32;BaseQRankSum=1.186;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.779;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1687,0:0,0,22,30 0/1:38,25:63:99:650,0,1026:16,22,9,16 +chrX 1596226 . T TA 1296.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=15.53;BaseQRankSum=2.256;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.015;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.583;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,56:58:99:1159,0:1,1,33,23 0/1:16,12:28:99:177,0,289:7,9,2,10 +chrX 1596431 . CTCCTCCTCCTCCTCCTCCATCCCTCCCACCCTCCTAGTGAGGTGGAT C 1336.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=28.94;BaseQRankSum=3.148;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;MQRankSum=-0.43;QD=36.21;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.990;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,34:38:99:.:1376,0:1,3,9,25 0/0:.:50:45:50:0,45,1090 +chrX 1596474 . T *,C 175 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,7;AS_QD=0.00,7.88;BaseQRankSum=1.465;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.080;MQ=56.02;MQRankSum=0.378;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.12;SOR=0.988;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:4,34,0:38:99:.:.:1376,0,1492:.:1,3,9,25 0|2:19,0,7:26:99:0|1:1596474_T_C:205,262,1019,0,757,736:1596474:7,12,3,4 +chrX 1596478 . T *,A 150 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,6;AS_QD=0.00,7.83;BaseQRankSum=0.173;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.954;MQ=55.50;MQRankSum=0.34;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.294;SOR=1.276;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:4,34,0:38:99:.:.:1376,0,1492:.:1,3,9,25 0|2:17,0,6:23:99:0|1:1596474_T_C:180,231,925,0,694,676:1596474:7,10,2,4 +chrX 1596487 . C T 73 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=4.68;BaseQRankSum=0.41;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.30;MQRankSum=-0.116;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=0.368;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:37:99:37:.:.:0,315 0|1:18,4:22:99:.:0|1:1596474_T_C:103,0,702:1596474:7,11,2,2 +chrX 1596539 . C T 1288 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=29.62;BaseQRankSum=2.559;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=2.811;MQ=55.96;MQRankSum=1.054;QD=39.94;ReadPosRankSum=0.291;SOR=1.897;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,30:33:99:.:1318,0:1,2,6,24 0/0:.:26:0:26:0,0,199 +chrX 1596547 . C A 1033 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=33.22;BaseQRankSum=1.257;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=6.422;MQ=55.58;MQRankSum=2.367;QD=33.22;ReadPosRankSum=0.806;SOR=2.636;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:5,27:32:99:.:1063,0:2,3,4,23 0/0:.:26:0:26:0,0,229 +chrX 1596892 . G A 1072 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=19.68;BaseQRankSum=2.767;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.17;MQRankSum=0;QD=19.68;ReadPosRankSum=-1.519;SOR=0.792;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,14:15:99:422,0:0,1,9,5 0/1:18,23:41:99:680,0,405:12,6,15,8 +chrX 1597507 . A G 2563 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=24.70;BaseQRankSum=0.341;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=8.210;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.70;ReadPosRankSum=-0.686;SOR=0.261;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1726,0:0,0,28,25 0/1:22,30:52:99:867,0,588:15,7,13,17 +chrX 1598378 . C G 3236 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=23.67;BaseQRankSum=-0.199;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.67;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=0.763;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,78:78:99:2518,0:0,0,33,45 0/1:32,28:60:99:748,0,902:15,17,15,13 +chrX 1599115 . T G 3571 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=33.04;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.04;SOR=0.956;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1706,0:0,0,28,25 1/1:0,56:56:99:1895,168,0:0,0,33,23 +chrX 1599467 . G A 724 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.57;BaseQRankSum=1.278;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=20.097;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.733;SOR=2.176;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:63:54:0,63 0/1:31,29:60:99:.:754,0,758:18,13,7,22 +chrX 1599754 . G A 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.90;BaseQRankSum=0.989;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.35;SOR=0.666;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:63:54:0,63 0/1:28,23:51:99:.:607,0,725:12,16,10,13 +chrX 1601004 . C G 839 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=5.91;BaseQRankSum=0.88;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.669;VarDP=147 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,39:73:99:115,0:18,16,22,17 0/1:45,29:74:99:754,0,1261:22,23,12,17 +chrX 1601730 . C T 858 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=0.911;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=0.507;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1725 0/1:29,32:61:99:.:888,0,750:12,17,15,17 +chrX 1601928 . C T 194 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=4.39;BaseQRankSum=2.591;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.139;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=1.022;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,28:51:99:.:224,0:14,9,19,9 0/0:.:66:99:66:0,116,1609 +chrX 1602822 . C CT 1229.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=11.86;BaseQRankSum=-0.734;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=6.282;MQ=59.43;MQRankSum=-0.723;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=0.786;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,43:55:99:807,0:4,8,27,16 0/1:27,25:52:99:462,0,568:13,14,11,14 +chrX 1602856 . G C 1334 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=20.06;BaseQRankSum=-1.777;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.024;MQ=59.76;MQRankSum=-1.075;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.890;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,49:68:99:.:1364,0:9,10,21,28 0/0:.:66:42:66:0,42,1558 +chrX 1602857 . A G 1334 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=20.06;BaseQRankSum=-0.267;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.024;MQ=59.76;MQRankSum=-1.075;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.658;SOR=0.890;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,49:68:99:.:1364,0:9,10,21,28 0/0:.:66:42:66:0,42,1558 +chrX 1602867 . G C 844 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=12.31;BaseQRankSum=-0.073;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=1.998;MQ=59.87;MQRankSum=-1.425;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=1.018;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,149 0/1:36,35:71:99:.:874,0,909:16,20,13,22 +chrX 1602897 . G A 1339 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=19.56;BaseQRankSum=0.36;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;MQRankSum=-0.943;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.165;SOR=0.675;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,149 0|1:34,36:70:99:.:0|1:1602897_G_A:1369,0,1217:1602897:14,20,15,21 +chrX 1602911 . G A 1313 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=20.04;BaseQRankSum=1.104;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.924;MQ=59.66;MQRankSum=-0.926;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.859;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,149 0|1:32,35:67:99:.:0|1:1602897_G_A:1343,0,1157:1602897:15,17,15,20 +chrX 1603010 . A G 570 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.77;BaseQRankSum=0.719;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.488;MQ=58.53;MQRankSum=-1.212;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.32;SOR=0.711;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,149 0/1:25,22:47:99:.:600,0,688:14,11,10,12 +chrX 1603025 . T C 652 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.37;BaseQRankSum=2.213;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.369;MQ=58.50;MQRankSum=-1.195;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.404;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,149 0/1:27,24:51:99:.:682,0,706:16,11,12,12 +chrX 1603065 . T C 3430 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=26.21;BaseQRankSum=-0.406;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=1.664;MQ=59.13;MQRankSum=-0.803;QD=26.21;ReadPosRankSum=0.932;SOR=0.598;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2819,0:0,0,38,38 0/1:31,25:56:99:641,0,848:17,14,11,14 +chrX 1603070 . T C 34 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=0.88;BaseQRankSum=1.45;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.96;MQRankSum=0.508;QD=0.877;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.641;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,37:73:64:.:64,0:19,17,19,18 0/0:.:54:99:54:0,120,1800 +chrX 1603092 . T G 541 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.77;BaseQRankSum=-0.794;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.05;SOR=0.776;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:77:99:77:0,1800 0/1:30,23:53:99:.:571,0,838:15,15,11,12 +chrX 1603154 . A G 3841 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=25.47;BaseQRankSum=-1.216;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=5.751;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.339;SOR=1.050;VarDP=152 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,81:81:99:3117,0:0,0,48,33 0/1:40,31:71:99:754,0,1118:19,21,18,13 +chrX 1603162 . C T 288 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=4.08;BaseQRankSum=-0.19;DP=159;ExcessHet=0.0000;FS=3.046;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.08;ReadPosRankSum=-2.006;SOR=0.432;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,44:78:99:.:318,0:22,12,25,19 0/0:.:76:99:76:0,120,1800 +chrX 1603300 . A G 1595 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=11.28;BaseQRankSum=-0.212;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=3.022;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.45;SOR=0.789;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,49:77:99:680,0:13,15,21,28 0/1:31,36:67:99:945,0,792:18,13,18,18 +chrX 1603520 . G A 716 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.22;BaseQRankSum=2.227;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.100;MQ=59.45;MQRankSum=-0.458;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=0.481;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:49:63:0,49 0/1:23,26:49:99:.:746,0,577:10,13,13,13 +chrX 1603561 . T C 40 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=1.13;BaseQRankSum=1.102;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=5.124;MQ=50.48;MQRankSum=-1.011;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.088;SOR=1.220;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,32:62:70:.:70,0:14,16,20,12 0/0:.:50:69:50:0,69,1074 +chrX 1603562 . G A 40 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=1.13;BaseQRankSum=-1.47;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=5.124;MQ=50.48;MQRankSum=-1.011;QD=1.13;ReadPosRankSum=-0.986;SOR=1.220;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,32:62:70:.:70,0:14,16,20,12 0/0:.:50:69:50:0,69,1074 +chrX 1603620 . T C 110 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=3.11;BaseQRankSum=0;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.561;MQ=45.78;MQRankSum=0.836;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.972;SOR=0.669;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,24:45:99:.:140,0:12,9,11,13 0/0:.:50:69:50:0,69,1074 +chrX 1603628 . A G 174 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=4.98;BaseQRankSum=0.637;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.216;MQ=45.09;MQRankSum=1.359;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.57;SOR=0.611;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,23:41:99:.:204,0:10,8,11,12 0/0:.:50:69:50:0,69,1074 +chrX 1603646 . G T 502 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=15.20;BaseQRankSum=1.695;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.958;MQ=52.85;MQRankSum=-2.937;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.635;SOR=1.057;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,109 0/1:15,20:35:99:.:532,0,317:8,7,8,12 +chrX 1603907 . C A 1031 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=34.23;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.51;QD=34.23;SOR=0.892;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:1061,0:0,0,17,14 0/0:.:25:35:20:0,35,605 +chrX 1604306 . A G 3066 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=24.97;BaseQRankSum=-0.312;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=7.547;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.97;ReadPosRankSum=-1.66;SOR=0.565;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,70:71:99:2300,0:1,0,39,31 0/1:23,30:53:99:796,0,621:8,15,15,15 +chrX 1604640 . T TTCCC 2641.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=31.92;BaseQRankSum=-1.014;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=31.92;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.535;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1828,0:0,0,18,24 0/1:17,25:42:99:853,0,597:7,10,13,12 +chrX 1604913 . G A 1067 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=8.50;BaseQRankSum=0.147;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.412;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=0.893;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,36:70:69:69,0:15,19,16,20 0/1:23,36:59:99:1028,0,598:13,10,16,20 +chrX 1605036 . G A 1238 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=11.63;BaseQRankSum=-0.414;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.698;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.44;SOR=0.558;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,32:54:99:227,0:14,8,12,20 0/1:18,37:55:99:1041,0,430:9,9,21,16 +chrX 1605191 . T C 376 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=8.83;BaseQRankSum=-2.574;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.729;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.83;ReadPosRankSum=0;SOR=0.317;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:51:41:0,51 0/1:28,18:46:99:.:406,0,805:9,19,8,10 +chrX 1605238 . C T 413 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.23;BaseQRankSum=-1.352;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=6.116;MQ=58.95;MQRankSum=-1.735;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.696;SOR=0.414;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:42:35:0,42 0/1:29,19:48:99:.:443,0,720:10,19,10,9 +chrX 1605527 . G A 91 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=2.33;BaseQRankSum=2.661;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=13.159;MQ=59.83;MQRankSum=-0.962;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.55;SOR=0.662;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,26:52:99:.:121,0:19,7,11,15 0/0:.:37:31:32:0,31,763 +chrX 1605989 . C T 2834 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=22.91;BaseQRankSum=-1.716;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=11.883;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.193;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2062,0:0,0,26,34 0/1:34,31:65:99:802,0,942:8,26,12,19 +chrX 1606018 . T A 2643 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=22.85;BaseQRankSum=-2.597;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=4.002;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.85;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.479;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1937,0:0,0,31,29 0/1:29,28:57:99:736,0,828:12,17,14,14 +chrX 1606109 . G A 2694 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=25.22;BaseQRankSum=0.336;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.539;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.639;SOR=0.371;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1935,0:0,0,34,26 0/1:18,30:48:99:789,0,422:12,6,16,14 +chrX 1606241 . C G 2726 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=23.76;BaseQRankSum=1.407;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=11.692;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.75;SOR=0.595;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1825,0:0,0,35,23 0/1:24,34:58:99:931,0,550:8,16,16,18 +chrX 1606816 . T TA 1306.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=16.22;BaseQRankSum=1.019;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=8.951;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.015;SOR=1.661;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,44:45:99:1064,0:0,1,30,14 0/1:22,16:38:99:282,0,453:11,11,11,5 +chrX 1606898 . C T 277 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=4.26;BaseQRankSum=-0.605;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=8.131;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=4.26;ReadPosRankSum=-2.11;SOR=1.265;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,41:72:99:.:307,0:14,17,26,15 0/0:.:56:40:56:0,40,1464 +chrX 1606940 . C G 975 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=7.91;BaseQRankSum=0.904;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=11.171;MQ=59.92;MQRankSum=1.169;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.538;SOR=0.885;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,39:69:99:252,0:12,18,24,15 0/1:30,28:58:99:753,0,809:13,17,15,13 +chrX 1606985 . C T 1738 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=13.29;BaseQRankSum=1.659;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=4.134;MQ=59.66;MQRankSum=0.329;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.196;SOR=0.844;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,49:80:99:.:.:759,0:.:11,20,28,21 0|1:26,27:53:99:0|1:1606985_C_T:1009,0,988:1606985:16,10,14,13 +chrX 1606987 . T C 1738 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=13.29;BaseQRankSum=0.671;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=4.134;MQ=59.66;MQRankSum=0.329;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.844;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,49:80:99:.:.:759,0:.:11,20,28,21 0|1:26,27:53:99:0|1:1606985_C_T:1009,0,988:1606985:16,10,14,13 +chrX 1607627 . G C 4375 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=32.39;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=32.39;SOR=0.816;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2192,0:0,0,36,33 1/1:0,67:67:99:2213,201,0:0,0,28,39 +chrX 1607879 . G A 2997 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=23.83;BaseQRankSum=0.01;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.74;MQRankSum=-3.255;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.34;SOR=0.725;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,34:62:99:.:.:228,0:.:16,12,18,16 1|1:0,65:65:99:0|1:1607879_G_A:2799,196,0:1607879:0,0,39,26 +chrX 1607901 . G T 2889 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=24.74;BaseQRankSum=0.261;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=5.983;MQ=51.05;MQRankSum=-4.233;QD=24.74;ReadPosRankSum=1.188;SOR=1.266;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,27:52:99:.:.:100,0:.:12,13,16,11 1|1:0,66:66:99:0|1:1607879_G_A:2819,198,0:1607879:0,0,42,24 +chrX 1607946 . C T 2655 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=30.60;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.92;QD=43.31;SOR=1.647;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:23:53:.:.:0,23 1|1:0,62:62:99:.:0|1:1607946_C_T:2685,187,0:1607946:0,0,42,20 +chrX 1607962 . A G 3017 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=29.88;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.40;QD=41.74;SOR=1.340;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:23:53:.:.:0,23 1|1:0,73:73:99:.:0|1:1607946_C_T:3047,220,0:1607946:0,0,46,27 +chrX 1608008 . C T 3880 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=23.55;BaseQRankSum=1.455;DP=167;ExcessHet=0.0000;FS=3.332;MQ=54.49;MQRankSum=-5.357;QD=23.55;ReadPosRankSum=-2.0;SOR=0.577;VarDP=166 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:39,46:85:99:.:.:327,0:.:22,17,22,24 1|1:0,81:81:99:0|1:1608008_C_T:3583,244,0:1608008:0,0,39,42 +chrX 1608020 . G A 3831 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=23.26;BaseQRankSum=2.709;DP=167;ExcessHet=0.0000;FS=4.385;MQ=54.93;MQRankSum=-5.268;QD=23.26;ReadPosRankSum=-1.521;SOR=0.570;VarDP=166 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:40,46:86:99:.:.:312,0:.:23,17,22,24 1|1:0,80:80:99:0|1:1608008_C_T:3549,241,0:1608008:0,0,38,42 +chrX 1608051 . C T 2694 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=17.46;BaseQRankSum=1.472;DP=163;ExcessHet=0.0000;FS=8.699;MQ=57.52;MQRankSum=-3.563;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.662;VarDP=156 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:38,45:83:99:277,0:23,15,21,24 1/1:0,73:73:99:2447,220,0:0,0,32,41 +chrX 1608110 . A G 2841 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=18.76;BaseQRankSum=-2.206;DP=157;ExcessHet=0.0000;FS=9.784;MQ=58.88;MQRankSum=-2.319;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.386;SOR=1.334;VarDP=153 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,38:70:99:138,0:17,15,14,24 1/1:0,83:83:99:2733,249,0:0,0,30,53 +chrX 1608280 . C A 1104 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.32;BaseQRankSum=2.169;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=4.444;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.3;SOR=0.449;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:80:99:80:0,1800 0/1:35,39:74:99:.:1134,0,937:21,14,19,20 +chrX 1608319 . A G 2442 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=17.05;BaseQRankSum=-3.717;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=9.856;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.05;ReadPosRankSum=-1.303;SOR=0.233;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,42:72:99:231,0:9,21,20,22 1/1:0,73:73:99:2241,217,0:0,0,34,39 +chrX 1608432 . A G 2672 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=20.63;BaseQRankSum=-0.507;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=3.150;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.63;ReadPosRankSum=1.52;SOR=0.485;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,45:66:99:738,0:12,9,26,19 1/1:1,64:65:99:1964,159,0:1,0,27,37 +chrX 1608446 . T C 3306 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=25.27;BaseQRankSum=-1.403;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=5.982;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.27;ReadPosRankSum=-0.539;SOR=0.284;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,44:67:99:827,0:15,8,26,18 1/1:0,65:65:99:2509,195,0:0,0,29,36 +chrX 1608455 . G T 1780 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=14.14;BaseQRankSum=3.083;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=1.442;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.32;SOR=0.902;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,41:64:99:770,0:14,9,26,15 0/1:28,36:64:99:1040,0,651:12,16,17,19 +chrX 1608472 . C T 2818 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=22.97;BaseQRankSum=0.286;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.739;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,38:58:99:616,0:11,9,25,13 1/1:0,66:66:99:2232,199,0:0,0,33,33 +chrX 1608577 . A G 2637 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=18.27;BaseQRankSum=-2.041;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=3.904;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.856;SOR=0.533;VarDP=146 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,43:72:99:371,0:17,12,24,19 1/1:0,74:74:99:2296,222,0:0,0,32,42 +chrX 1608619 . G A 1041 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=7.19;BaseQRankSum=0.317;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=14.762;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.897;VarDP=149 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,43:79:99:230,0:20,16,22,21 0/1:38,32:70:99:841,0,957:24,14,9,23 +chrX 1608726 . TTGTCCAGGC T 5172.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=27.27;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.55;SOR=0.710;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:3010,0:0,0,28,40 1/1:0,49:49:99:2202,148,0:0,0,30,19 +chrX 1608758 . C T 534 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=4.90;BaseQRankSum=1.621;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.399;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.712;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,35:65:99:158,0:11,19,16,19 0/1:34,16:50:99:406,0,981:19,15,11,5 +chrX 1608768 . A G 4048 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=29.88;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.07;SOR=0.730;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2332,0:0,0,24,37 1/1:0,49:49:99:1746,147,0:0,0,32,17 +chrX 1608859 . ACTCCAGGCCACCCCTGACCCTACTCCAGCCAAGC A 1408.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=24.13;BaseQRankSum=0.588;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=9.299;MQ=59.59;MQRankSum=-0.754;QD=24.13;ReadPosRankSum=-1.506;SOR=0.689;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,983 0/1:23,37:60:99:.:1448,0,830:15,8,16,21 +chrX 1609159 . G A,T 1780 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=34,26;AS_QD=33.26,33.00;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.63;QD=30.17;SOR=1.255;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,983,983 1/2:0,34,26:60:99:.:1810,781,679,1030,0,952:0,0,37,23 +chrX 1609191 . A G 829 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.21;BaseQRankSum=-1.445;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.08;MQRankSum=-0.875;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.46;SOR=0.616;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,983 0/1:22,31:53:99:.:859,0,581:14,8,19,12 +chrX 1609228 . C T 588 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.61;BaseQRankSum=1.825;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.13;MQRankSum=-2.212;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.451;SOR=0.818;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,983 0/1:26,23:49:99:.:618,0,612:15,11,14,9 +chrX 1609241 . C A,CA 149 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,11;AS_QD=0.00,6.39;BaseQRankSum=-0.052;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.21;MQRankSum=-1.416;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.750;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,983,983 0/2:17,2,11:30:99:.:179,225,1357,0,377,323:8,9,7,6 +chrX 1609444 . T G 2480 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=23.03;BaseQRankSum=-0.717;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.045;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.03;ReadPosRankSum=1.06;SOR=0.395;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1907,0:0,0,28,29 0/1:29,23:52:99:603,0,821:11,18,10,13 +chrX 1609502 . G C 3989 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=28.14;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.21;SOR=0.825;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2334,0:0,0,24,36 1/1:0,51:51:99:1685,152,0:0,0,28,23 +chrX 1609514 . C T 243 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=4.33;BaseQRankSum=-0.598;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=0.534;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,36:63:99:.:273,0:10,17,15,21 0/0:.:54:72:54:0,72,1511 +chrX 1609558 . C CCTT 511.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=9.50;BaseQRankSum=-1.384;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.040;MQ=59.12;MQRankSum=-1.408;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=0.479;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,35:58:99:.:551,0:9,14,16,19 0/0:.:54:72:54:0,72,1511 +chrX 1609573 . C G 3027 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=70;AS_QD=30.48;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.33;QD=43.67;SOR=1.418;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,70:70:99:.:3057,0:0,0,25,45 ./.:.:60:.:60:0,0,0 +chrX 1609597 . T C 2823 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=65;AS_QD=35.55;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.21;QD=43.89;SOR=1.539;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,65:65:99:.:2853,0:0,0,22,43 ./.:.:65:.:65:0,0,0 +chrX 1609622 . C T 341 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=5.98;BaseQRankSum=1.312;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=12.793;MQ=58.76;MQRankSum=1.792;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.324;SOR=2.303;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,278 0|1:44,18:62:99:.:0|1:1609622_C_T:371,0,1232:1609622:22,22,4,14 +chrX 1609690 . G A 249 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=4.43;BaseQRankSum=-2.433;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=7.439;MQ=58.37;MQRankSum=0.355;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.43;SOR=1.437;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,278 0|1:42,21:63:99:.:1|0:1609622_C_T:279,0,1101:1609622:19,23,14,7 +chrX 1609732 . G C 69 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=5.21;BaseQRankSum=2.083;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.13;MQRankSum=-1.452;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.738;SOR=0.859;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:8,11:19:99:.:99,0:4,4,6,5 0/0:.:55:0:55:0,0,699 +chrX 1609889 . G A 181 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=5.15;BaseQRankSum=-1.092;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=7.502;MQ=59.69;MQRankSum=-1.969;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.084;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,307 0|1:33,8:41:99:.:0|1:1609889_G_A:211,0,1303:1609889:26,7,4,4 +chrX 1609890 . C G 181 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=5.15;BaseQRankSum=-1.762;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=7.502;MQ=59.69;MQRankSum=-1.969;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.084;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,307 0|1:33,8:41:99:.:0|1:1609889_G_A:211,0,1303:1609889:26,7,4,4 +chrX 1610004 . C G 1370 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=17.50;BaseQRankSum=2.423;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.114;MQ=59.18;MQRankSum=0;QD=17.50;ReadPosRankSum=0;SOR=0.430;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:20,24:44:99:.:.:139,0:.:13,7,10,14 1|1:2,34:36:90:0|1:1610004_C_G:1261,90,0:1610004:1,1,22,12 +chrX 1610017 . CTCCAGCCAAAGCTCCAGGCCGCCCCGCCCCTGCTCCAGCCAACCCTCCAGGCCGCCCCTGCCCCTGT C 713.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=17.11;BaseQRankSum=2.121;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.157;MQ=58.53;MQRankSum=-1.915;QD=17.11;ReadPosRankSum=-1.44;SOR=0.929;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:42:99:42:.:.:0,900 0|1:24,20:44:99:.:0|1:1610004_C_G:753,0,946:1610004:13,11,12,8 +chrX 1610080 . C T,* 1562 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=38,0;AS_QD=31.61,0.00;BaseQRankSum=2.108;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.900;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=39.80;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.848;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,38,0:40:99:.:.:1592,0,1606:.:1,1,19,15 0|2:24,0,20:44:99:0|1:1610004_C_G:753,825,1833,0,1008,946:1610004:13,11,12,8 +chrX 1610084 . T C,* 1715 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=41,0;AS_QD=29.33,31.18;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.919;MQ=60.00;QD=42.56;SOR=0.836;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41,0:41:99:.:.:1745,0,1637:.:0,0,19,15 0|2:24,0,20:44:99:0|1:1610004_C_G:753,825,1833,0,1008,946:1610004:13,11,12,8 +chrX 1610102 . G A 3523 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=34.50;BaseQRankSum=1.842;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.08;MQRankSum=0;QD=34.50;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.765;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,65:66:99:.:.:2779,0:.:0,1,29,36 0|1:17,20:37:99:0|1:1610004_C_G:774,0,572:1610004:9,8,12,8 +chrX 1610167 . C T 194 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=2.84;BaseQRankSum=0.157;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=3.006;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=0.674;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,43:79:99:.:224,0:16,20,23,20 0/0:.:58:63:58:0,63,1523 +chrX 1610194 . T A 51 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=1.07;BaseQRankSum=2.005;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.07;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.696;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:37,39:76:81:.:81,0:18,19,20,19 0/0:.:58:63:58:0,63,1523 +chrX 1610271 . C T 3510 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=25.11;BaseQRankSum=1.357;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=2.913;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.881;SOR=0.906;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,82:84:99:2605,0:2,0,34,48 0/1:23,34:57:99:935,0,584:11,12,17,17 +chrX 1610524 . G A 2648 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.88;BaseQRankSum=0.494;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.449;MQ=59.13;MQRankSum=0;QD=31.88;ReadPosRankSum=1.594;SOR=0.355;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2152,0:.:0,0,23,14 0|1:19,14:33:99:0|1:1610524_G_A:526,0,735:1610524:14,5,7,4 +chrX 1610527 . T C 2715 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=31.92;BaseQRankSum=-1.714;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=2.429;MQ=58.72;MQRankSum=-1.192;QD=31.92;ReadPosRankSum=0.742;SOR=0.394;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2177,0:.:0,0,24,14 0|1:19,15:34:99:0|1:1610524_G_A:568,0,732:1610524:14,5,8,4 +chrX 1610536 . G A 2531 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=30.86;BaseQRankSum=-1.316;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.60;MQRankSum=-1.26;QD=30.86;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.620;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2080,0:.:0,0,24,14 0|1:21,13:34:99:0|1:1610524_G_A:481,0,792:1610524:14,7,8,4 +chrX 1610558 . T TCCCCTGCCCCTACTCCAGCCAAGCCCCCAGGTCACTCCTACTCCAGCCAAACCTCCAGGCCA,TCCCCTGCCCCTACTCCAGCCAAGCCCCCAGGTCACTCCTACTCCAGCCAAACCTCCAGGCCACCCCTGCCCCTACTCCAGCTAAGACTCCAGGCCA 2649.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=49,24;AS_QD=24.54,16.16;BaseQRankSum=-0.225;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.11;MQRankSum=-2.519;QD=26.89;ReadPosRankSum=-4.379;SOR=0.704;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49,0:49:99:1865,0,2406:0,0,24,25 0/2:27,0,24:51:99:824,943,2237,0,1133,1032:14,13,14,10 +chrX 1610994 . G A 2718 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=21.81;BaseQRankSum=-0.088;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.704;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1851,0:0,0,27,29 0/1:35,35:70:99:897,0,877:18,17,20,15 +chrX 1611317 . T C 2843 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=23.94;BaseQRankSum=-1.309;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=7.295;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.94;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.596;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1896,0:0,0,32,25 0/1:26,37:63:99:977,0,726:10,16,19,18 +chrX 1611353 . G C 3057 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=23.56;BaseQRankSum=0.349;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=9.884;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.465;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2119,0:0,0,37,27 0/1:31,36:67:99:968,0,796:11,20,16,20 +chrX 1611378 . A G 2944 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=22.70;BaseQRankSum=0.342;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=19.702;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.70;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.253;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2028,0:0,0,37,29 0/1:29,36:65:99:946,0,713:7,22,16,20 +chrX 1611444 . T C 3311 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=23.04;BaseQRankSum=0.99;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=2.563;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.04;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.443;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2212,0:0,0,32,38 0/1:34,41:75:99:1129,0,866:13,21,19,22 +chrX 1611574 . C T 2715 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=25.42;BaseQRankSum=1.997;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=25.247;MQ=57.99;MQRankSum=-3.871;QD=25.42;ReadPosRankSum=0.62;SOR=1.219;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46:46:99:.:.:2018,0:.:0,0,16,30 0|1:41,21:62:99:0|1:1611574_C_T:727,0,1611:1611574:27,14,8,13 +chrX 1611584 . C T 2549 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=25.04;BaseQRankSum=2.734;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=25.981;MQ=57.87;MQRankSum=-4.076;QD=25.04;ReadPosRankSum=2.186;SOR=1.102;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,43:43:99:.:.:1915,0:.:0,0,15,28 0|1:41,19:60:99:0|1:1611574_C_T:664,0,1647:1611574:28,13,8,11 +chrX 1611589 . T G 2399 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=24.29;BaseQRankSum=2.61;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=25.976;MQ=57.59;MQRankSum=-4.239;QD=24.29;ReadPosRankSum=2.461;SOR=1.032;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,40:40:99:.:.:1800,0:.:0,0,14,26 0|1:42,18:60:99:0|1:1611574_C_T:629,0,1680:1611574:29,13,8,10 +chrX 1611624 . T G 1052 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=13.04;BaseQRankSum=-1.188;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=18.028;MQ=56.75;MQRankSum=-4.421;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.989;SOR=0.958;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:728,0:0,0,9,13 0/1:42,19:61:99:354,0,1128:28,14,7,12 +chrX 1611701 . C T 39 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=34.50;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.99;QD=34.50;SOR=0.693;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,2:2:69:.:69,0:0,0,1,1 0/0:.:34:0:34:0,0,903 +chrX 1611971 . T C 306 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=33.60;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.26;QD=33.60;SOR=1.609;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,10:10:99:.:336,0:0,0,7,3 0/0:.:35:30:33:0,30,630 +chrX 1612062 . C T 2848 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.28;BaseQRankSum=2.174;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.29;MQRankSum=-1.133;QD=31.28;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.364;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,43:44:99:1325,0:1,0,25,18 1/1:0,48:48:99:1553,144,0:0,0,27,21 +chrX 1612103 . C T 2764 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=26.36;BaseQRankSum=1.658;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.743;MQ=53.80;MQRankSum=-4.627;QD=26.36;ReadPosRankSum=-1.997;SOR=0.445;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2055,0:.:0,0,28,23 0|1:34,21:55:99:0|1:1612103_C_T:739,0,1293:1612103:21,13,11,10 +chrX 1612127 . A G 2900 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=27.38;BaseQRankSum=0.562;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=3.793;MQ=55.01;MQRankSum=-4.068;QD=27.38;ReadPosRankSum=-2.326;SOR=0.461;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,43:43:99:.:.:1904,0:.:0,0,21,22 0|1:36,28:64:99:0|1:1612103_C_T:1026,0,1427:1612103:21,15,14,14 +chrX 1612128 . T A 2900 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=27.38;BaseQRankSum=0.718;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.793;MQ=55.09;MQRankSum=-4.068;QD=27.38;ReadPosRankSum=-2.533;SOR=0.461;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,43:43:99:.:.:1904,0:.:0,0,21,22 0|1:36,28:64:99:0|1:1612103_C_T:1026,0,1427:1612103:21,15,14,14 +chrX 1612179 . G C 2030 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=20.00;BaseQRankSum=0.294;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.815;MQ=57.39;MQRankSum=-2.772;QD=20.00;ReadPosRankSum=0.954;SOR=0.606;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1282,0:0,0,18,25 0/1:30,30:60:99:778,0,766:16,14,18,12 +chrX 1612285 . CAA C 1967.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=22.55;BaseQRankSum=0.38;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.981;MQ=59.54;MQRankSum=1.625;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.652;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1342,0:0,0,19,18 0/1:28,23:51:99:665,0,823:11,17,14,9 +chrX 1612605 . C T 741 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.83;BaseQRankSum=1.819;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.304;MQ=59.56;MQRankSum=-0.852;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.563;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1262 0/1:23,29:52:99:.:771,0,544:10,13,15,14 +chrX 1613131 . CCTTT C 755.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.90;BaseQRankSum=2.153;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.102;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.988;SOR=0.515;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1262 0/1:29,21:50:99:.:795,0,1134:11,18,9,12 +chrX 1613176 . C CTTCT 1872.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=31.84;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.49;SOR=1.154;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:1912,0:0,0,18,27 0/0:.:49:99:49:0,99,1380 +chrX 1613199 . C CTT 514.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.97;BaseQRankSum=-0.062;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.593;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:19,18:37:99:.:554,0,671:9,6,8,6 +chrX 1613709 . C G 913 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=12.74;BaseQRankSum=0.965;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=4.537;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.848;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:39,35:74:99:.:943,0,1043:22,17,15,20 +chrX 1613820 . C T 575 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.87;BaseQRankSum=1.988;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.153;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=1.022;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:25,22:47:99:.:605,0,602:11,14,8,14 +chrX 1613931 . G A 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.06;BaseQRankSum=0.579;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.313;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:23,25:48:99:.:675,0,577:8,15,12,13 +chrX 1614164 . G T 383 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=11.47;BaseQRankSum=1.541;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.81;MQRankSum=-1.127;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.465;SOR=0.559;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:21,15:36:99:.:413,0,592:9,12,7,8 +chrX 1614372 . ACAC A 875.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=20.80;BaseQRankSum=-0.995;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=6.473;MQ=59.50;MQRankSum=1.6;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=1.112;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:20,24:44:99:.:915,0,701:8,12,15,9 +chrX 1614455 . G T 716 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.76;BaseQRankSum=-0.564;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=4.506;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.743;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,228 0|1:21,21:42:99:.:0|1:1614455_G_T:746,0,808:1614455:8,13,12,9 +chrX 1614478 . C T 723 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.51;BaseQRankSum=-1.187;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=4.388;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.51;ReadPosRankSum=1.185;SOR=1.143;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,228 0|1:22,21:43:99:.:0|1:1614455_G_T:753,0,840:1614455:10,12,13,8 +chrX 1614890 . G A 683 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.17;BaseQRankSum=-1.142;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.110;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.557;SOR=0.881;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:21,26:47:99:.:713,0,578:9,12,10,16 +chrX 1614999 . G C 928 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.09;BaseQRankSum=1.075;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=10.276;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.505;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:33,35:68:99:.:958,0,858:22,11,16,19 +chrX 1615027 . G A 742 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.45;BaseQRankSum=-0.155;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.468;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.663;SOR=1.174;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:33,29:62:99:.:772,0,896:17,16,18,11 +chrX 1615101 . T C 727 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=-2.175;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.419;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.226;SOR=0.383;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 0/1:23,29:52:99:.:757,0,634:8,15,13,16 +chrX 1615493 . T A 1552 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=32.96;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=32.96;SOR=0.693;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,228 1/1:0,48:48:99:.:1582,144,0:0,0,24,24 +chrX 1615772 . C A 3759 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=32.11;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.11;SOR=0.798;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1821,0:0,0,21,35 1/1:0,62:62:99:1968,186,0:0,0,35,27 +chrX 1615847 . G A 160 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=4.32;BaseQRankSum=0.443;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=6.514;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.19;SOR=0.914;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,25:44:99:.:190,0:12,7,10,15 0/0:.:72:99:72:0,120,1800 +chrX 1616030 . C CT 648.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.28;BaseQRankSum=-0.426;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.28;ReadPosRankSum=2.453;SOR=0.760;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:70:64:0,70 0/1:31,30:61:99:.:688,0,746:16,15,16,14 +chrX 1616045 . T C 1985 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.50;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.50;SOR=0.899;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:70:64:0,70 1/1:0,62:62:99:.:2015,186,0:0,0,34,28 +chrX 1616195 . ATTTTTGTAT A 2021.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=24.92;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=44.80;SOR=1.329;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:70:64:0,70 1/1:0,46:46:99:.:2061,139,0:0,0,29,17 +chrX 1616331 . T G 2272 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.42;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=32.42;SOR=1.042;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:70:64:0,70 1/1:0,71:71:99:.:2302,212,0:0,0,30,41 +chrX 1616530 . T C 669 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.98;BaseQRankSum=0.021;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.98;ReadPosRankSum=2.339;SOR=0.856;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:70:64:0,70 0/1:25,25:50:99:.:699,0,698:14,11,15,10 +chrX 1617024 . T C 1081 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=16.83;BaseQRankSum=0.01;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=6.830;MQ=59.60;MQRankSum=-0.775;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.733;SOR=0.787;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:70:64:0,70 0/1:26,40:66:99:.:1111,0,641:10,16,23,17 +chrX 1617655 . G A 717 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.65;BaseQRankSum=1.119;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=6.168;MQ=59.52;MQRankSum=1.668;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.2;SOR=1.664;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:70:64:0,70 0/1:22,29:51:99:.:747,0,463:12,10,21,8 +chrX 1617973 . T C 109 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=2.07;BaseQRankSum=0.214;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.603;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,36:67:99:.:139,0:18,13,20,16 0/0:.:65:49:65:0,49,1404 +chrX 1619549 . TATAATA T,TATAATAATA 661.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=14,17;AS_QD=26.34,27.74;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;QD=22.61;SOR=0.892;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,14,17:31:99:.:701,201,0:0,0,14,17 0/0:.:60:40:60:0,40,1193,40,1193,1193 +chrX 1620166 . C CT 119.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=10.60;BaseQRankSum=0.772;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=24.362;MQ=59.46;MQRankSum=-0.452;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.59;SOR=3.411;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,521 0/1:4,11:15:35:.:159,0,35:0,4,10,1 +chrX 1620927 . C CA 938.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=26.43;BaseQRankSum=-0.261;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=3.641;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.761;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,36:37:99:.:978,0:1,0,15,21 0/0:.:43:20:28:0,20,775 +chrX 1621037 . C A 115 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=2.84;BaseQRankSum=-0.638;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.907;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.534;SOR=1.132;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,28:51:99:.:145,0:12,11,11,17 0/0:.:43:20:28:0,20,775 +chrX 1621893 . G C 1294 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=32.29;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=32.29;SOR=0.843;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,41:41:99:.:1324,0:0,0,19,22 0/0:.:43:20:28:0,20,775 +chrX 1622288 . G A 153 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=3.00;BaseQRankSum=0.738;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.130;MQ=59.91;MQRankSum=1.119;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.601;SOR=1.022;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,33:61:99:.:183,0:14,14,14,19 0/0:.:43:20:28:0,20,775 +chrX 1622950 . T A 89 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=1.63;BaseQRankSum=0.769;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.63;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=0.716;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:35,38:73:99:.:119,0:21,14,23,15 0/0:.:43:20:28:0,20,775 +chrX 1623054 . T C 1143 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=8.56;BaseQRankSum=0.262;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=1.412;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.545;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,43:75:99:368,0:20,12,30,13 0/1:28,34:62:99:805,0,739:19,9,17,17 +chrX 1623440 . A T 136 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=2.34;BaseQRankSum=-1.687;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.607;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,39:71:99:.:166,0:18,14,21,18 0/0:.:54:53:54:0,53,1360 +chrX 1623744 . A G 633 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=7.45;BaseQRankSum=0.782;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=6.878;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.897;SOR=0.707;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,25:45:99:184,0:8,12,12,13 0/1:24,20:44:99:479,0,626:10,14,13,7 +chrX 1624016 . G A 143 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=3.20;BaseQRankSum=-0.349;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.054;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=0.703;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,30:54:99:.:173,0:13,11,14,16 0/0:.:48:29:41:0,29,994 +chrX 1625030 . G C 363 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=6.24;BaseQRankSum=2.993;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=3.785;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.24;ReadPosRankSum=-1.313;SOR=0.294;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,36:63:99:.:393,0:7,20,14,22 0/0:.:78:44:78:0,44,1356 +chrX 1625037 . G T 295 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=5.00;BaseQRankSum=2.867;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=7.233;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.206;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,36:65:99:.:325,0:7,22,15,21 0/0:.:78:44:78:0,44,1356 +chrX 1625104 . C CTT 142.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=3.79;BaseQRankSum=-2.116;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=16.407;MQ=59.09;MQRankSum=-1.672;QD=3.79;ReadPosRankSum=2.354;SOR=0.818;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,25:48:99:.:182,0:6,17,15,10 0/0:.:78:44:78:0,44,1356 +chrX 1625108 . CT TT,C 703 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=26,27;AS_QD=2.51,7.04;BaseQRankSum=-1.232;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.600;MQ=59.48;MQRankSum=0;QD=7.12;ReadPosRankSum=2.199;SOR=0.446;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,26,0:49:99:191,0,1074:6,17,15,11 0/2:27,0,27:54:99:542,623,1237,0,614,533:13,14,9,18 +chrX 1625260 . A G 904 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.83;BaseQRankSum=-1.01;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.292;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=1.121;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,1330 0/1:22,37:59:99:.:934,0,524:11,11,22,15 +chrX 1625528 . A AGAAG 492.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=26;AS_QD=10.23;BaseQRankSum=-0.539;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=7.621;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.117;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB .:11,11:22:.:1,0:9,2,7,4 0/1:15,15:30:99:531,0,524:14,1,11,4 +chrX 1625551 . A AGGGAGGGAGGGAGGGAAAGGGG 468.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=20.32;BaseQRankSum=0.473;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=6.576;MQ=59.71;MQRankSum=-0.881;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.899;SOR=2.746;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,762 0/1:12,13:25:99:.:508,0,466:10,2,13,0 +chrX 1625904 . A G 2491 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.32;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.79;QD=32.32;SOR=1.108;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1307,0:0,0,23,18 1/1:0,37:37:99:1214,111,0:0,0,23,14 +chrX 1625954 . CAA C,CA,CAAAA 1073.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=20,17,16;AS_QD=20.00,22.95,19.72;BaseQRankSum=-0.491;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.77;MQRankSum=-0.136;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=1.077;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,10,17,0:29:99:436,245,0,475:1,1,16,11 1/3:0,10,0,16:26:99:677,428,645,738,568,886,322,0,379,369:0,0,15,11 +chrX 1626234 . CT C 1054.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=19.89;BaseQRankSum=-0.701;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.589;MQ=59.30;MQRankSum=0;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.428;SOR=1.204;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:491,0:0,0,10,12 1/1:3,30:33:31:603,31,0:2,1,9,21 +chrX 1626407 . G C 4109 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=33.38;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.38;SOR=1.107;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1900,0:0,0,32,25 1/1:0,67:67:99:2239,201,0:0,0,41,26 +chrX 1626819 . C T 4136 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=30.97;BaseQRankSum=2.572;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.196;MQ=59.84;MQRankSum=3.831;QD=41.25;ReadPosRankSum=0;SOR=0.540;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2449,0:.:0,0,26,30 0|1:3,42:45:0:0|1:1626819_C_T:1717,0,0:1626819:2,1,20,22 +chrX 1626822 . G GT 4258.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=25.05;BaseQRankSum=1.301;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.190;MQ=59.84;MQRankSum=3.917;QD=40.93;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.533;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2516,0:.:0,0,26,32 1|1:3,44:47:6:0|1:1626819_C_T:1782,6,0:1626819:2,1,22,22 +chrX 1626825 . C T 4341 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=26.43;BaseQRankSum=-0.586;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=3.231;MQ=59.84;MQRankSum=6.93;QD=43.28;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=0.416;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:2387,0:0,0,24,30 1/1:1,46:47:99:1984,107,0:1,0,23,23 +chrX 1626953 . G C 2402 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=16.77;BaseQRankSum=0.219;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=3.585;MQ=59.69;MQRankSum=1.56;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.767;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,41:76:99:219,0:16,19,22,19 1/1:0,69:69:99:2213,207,0:0,0,38,31 +chrX 1627321 . A G 5386 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=32.40;BaseQRankSum=-0.658;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.295;MQ=58.47;MQRankSum=-0.215;QD=42.98;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=0.456;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2298,0:.:0,0,22,30 1|1:1,73:74:99:0|1:1627321_A_G:3118,178,0:1627321:1,0,36,37 +chrX 1627326 . C A 5346 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=33.36;BaseQRankSum=-0.417;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=3.153;MQ=58.56;MQRankSum=-0.185;QD=43.01;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=0.353;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,55:55:99:.:.:2376,0:.:0,0,25,29 1|1:1,69:70:99:0|1:1627321_A_G:3000,166,0:1627321:1,0,34,35 +chrX 1627360 . A G 4286 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=141;AS_QD=30.39;BaseQRankSum=-0.647;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.86;MQRankSum=-0.177;QD=30.39;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=0.307;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:1974,0:0,0,35,31 1/1:1,75:76:99:2342,193,0:1,0,42,33 +chrX 1627633 . C CGAAAT 769.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=21.29;BaseQRankSum=-1.799;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.742;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.705;SOR=0.542;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:53:58:0,53 0/1:17,21:38:99:.:809,0,642:10,7,10,11 +chrX 1627936 . A G 4586 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=147;AS_QD=31.40;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.40;SOR=0.792;VarDP=147 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1844,0:0,0,32,27 1/1:0,88:88:99:2772,263,0:0,0,45,43 +chrX 1627957 . A G 4632 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=145;AS_QD=32.15;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=32.15;SOR=0.854;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2013,0:0,0,34,28 1/1:0,83:83:99:2649,248,0:0,0,44,39 +chrX 1628063 . G A 2690 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=20.15;BaseQRankSum=-0.171;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=1.785;MQ=59.88;MQRankSum=-0.731;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.956;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,35:61:99:293,0:13,13,16,19 1/1:0,74:74:99:2427,222,0:0,0,45,29 +chrX 1628615 . C G 2106 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=30.96;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.96;SOR=2.015;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:997,0:0,0,7,24 1/1:0,38:38:99:1139,112,0:0,0,12,26 +chrX 1628781 . C T 672 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=7.63;BaseQRankSum=0.405;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.681;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,25:47:99:119,0:7,15,11,14 0/1:23,22:45:99:583,0,551:12,11,9,13 +chrX 1628830 . T TCTC 3839.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=24.54;BaseQRankSum=-0.583;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.58;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.295;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:2283,0:0,0,24,27 1/1:1,37:38:69:1596,69,0:0,1,21,16 +chrX 1628918 . G A 619 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.02;BaseQRankSum=1.025;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.040;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.709;SOR=0.529;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,136 0/1:25,29:54:99:.:649,0,480:15,10,16,13 +chrX 1628942 . CTT C 905.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=18.17;BaseQRankSum=1.14;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.077;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.844;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,136 0|1:23,29:52:99:.:0|1:1628942_CTT_C:945,0,863:1628942:12,11,13,16 +chrX 1628944 . T C,* 2459 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=48,32;AS_QD=22.67,0.00;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=29.63;SOR=0.850;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,26,0:30:99:591,0,832:0,0,11,15 1/2:0,22,32:54:99:1898,1310,1443,629,0,813:0,0,26,28 +chrX 1628947 . TTTCTTTCC *,T 1200.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,29;AS_QD=0.00,23.85;BaseQRankSum=0.028;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.077;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.85;ReadPosRankSum=1.115;SOR=0.844;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,312,312 0|2:23,0,29:52:99:.:0|1:1628942_CTT_C:1240,1085,2135,0,937,854:1628942:12,11,13,16 +chrX 1629036 . C T 145 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=3.24;BaseQRankSum=-0.751;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.079;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.406;SOR=0.941;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,29:54:99:.:175,0:10,15,10,19 0/0:.:62:95:62:0,95,1233 +chrX 1629038 . C T 145 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=3.24;BaseQRankSum=-0.982;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.079;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.371;SOR=0.941;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,29:54:99:.:175,0:10,15,10,19 0/0:.:62:95:62:0,95,1233 +chrX 1629082 . TTA T 3629.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=27.14;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=37.06;SOR=0.317;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1840,0:0,0,24,25 1/1:1,49:50:99:1829,119,0:0,1,20,29 +chrX 1629312 . G C 693 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.12;BaseQRankSum=1.289;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=11.109;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=1.425;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:95:67:0,95 0/1:38,27:65:99:.:723,0,1040:16,22,18,9 +chrX 1629381 . C T 517 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.73;BaseQRankSum=-0.08;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.656;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:95:67:0,95 0/1:30,21:51:99:.:547,0,849:14,16,10,11 +chrX 1629555 . C A 318 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=4.90;BaseQRankSum=-0.016;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.53;SOR=0.741;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,41:71:99:.:348,0:15,15,20,21 0/0:.:60:99:60:0,120,1552 +chrX 1629688 . A C 2862 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=24.30;BaseQRankSum=-2.302;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.882;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.30;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.433;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1985,0:0,0,31,28 0/1:27,33:60:99:907,0,758:16,11,16,17 +chrX 1630017 . T C 929 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=8.34;BaseQRankSum=-0.245;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=8.647;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=1.028;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,28:49:99:209,0:10,11,12,16 0/1:37,29:66:99:750,0,983:22,15,11,18 +chrX 1630144 . C CT 658.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=6.78;BaseQRankSum=1.264;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.621;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.585;SOR=0.523;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,25:46:99:121,0:13,8,14,11 0/1:31,26:57:99:577,0,755:20,11,16,10 +chrX 1630195 . A G 1070 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=18.33;BaseQRankSum=-1.53;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=-0.672;QD=18.33;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=0.693;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:99:50:0,193 0/1:20,40:60:99:.:1100,0,506:10,10,20,20 +chrX 1630300 . A ATTT 1374.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=34.49;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.18;QD=34.49;SOR=0.741;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:571,0:0,0,9,8 1/1:0,24:24:72:843,72,0:0,0,12,12 +chrX 1630383 . G A 365 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=17;AS_QD=10.13;BaseQRankSum=-0.501;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=5.498;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.185;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:41:.:41:0,0 0/1:22,17:39:99:.:395,0,582:4,18,6,11 +chrX 1630871 . T TTTTA 2713.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=27.31;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=44.40;SOR=1.234;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1517,0:0,0,12,22 1/1:0,28:28:84:1236,84,0:0,0,12,16 +chrX 1630921 . T A 1213 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=32.71;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=32.71;SOR=1.329;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,189 1/1:0,38:38:99:.:1243,114,0:0,0,24,14 +chrX 1631068 . G A 487 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.77;BaseQRankSum=1.885;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.129;MQ=58.10;MQRankSum=0.29;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.161;SOR=0.955;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,189 0/1:28,20:48:99:.:517,0,714:15,13,12,8 +chrX 1631084 . GT G 517.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.59;BaseQRankSum=-0.564;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.700;MQ=58.74;MQRankSum=-0.264;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=0.982;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,189 0/1:17,24:41:99:.:557,0,351:8,9,14,10 +chrX 1631167 . G A 993 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=9.05;BaseQRankSum=1.191;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=12.223;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.915;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,34:60:99:298,0:17,9,18,16 0/1:26,27:53:99:725,0,655:14,12,7,20 +chrX 1631199 . C G 596 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.27;BaseQRankSum=-0.224;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=7.843;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.494;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,208 0/1:27,24:51:99:.:626,0,746:9,18,13,11 +chrX 1631417 . C T 650 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.33;BaseQRankSum=1.951;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.556;SOR=0.503;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,208 0/1:26,25:51:99:.:680,0,656:9,17,10,15 +chrX 1631644 . G A 848 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.57;BaseQRankSum=-0.447;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.482;MQ=59.88;MQRankSum=-0.772;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.418;SOR=0.405;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,208 0/1:21,32:53:99:.:878,0,539:15,6,20,12 +chrX 1631845 . T C 3695 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=31.57;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=31.57;SOR=0.727;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2198,0:0,0,41,28 1/1:0,49:49:99:1527,145,0:0,0,19,30 +chrX 1631915 . A G 496 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.84;BaseQRankSum=-1.95;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=13.84;ReadPosRankSum=1.082;SOR=0.892;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:14:71:0,14 0/1:18,20:38:99:.:526,0,511:9,9,9,11 +chrX 1632389 . C T 679 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=6.50;BaseQRankSum=0.92;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.711;MQ=59.90;MQRankSum=-0.914;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.602;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,30:57:99:130,0:15,12,16,14 0/1:30,22:52:99:579,0,801:16,14,11,11 +chrX 1632518 . G C 592 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.52;BaseQRankSum=-0.606;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;MQRankSum=-1.879;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.996;SOR=0.703;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1499 0/1:29,25:54:99:.:622,0,771:14,15,12,13 +chrX 1632709 . T C 3930 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=32.46;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=32.46;SOR=0.795;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2223,0:0,0,40,28 1/1:0,54:54:99:1737,162,0:0,0,24,30 +chrX 1632812 . A G 593 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=5.15;BaseQRankSum=0.689;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=1.525;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.211;SOR=0.668;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,38:72:25:25,0:22,12,21,17 0/1:27,22:49:99:598,0,721:17,10,17,5 +chrX 1632831 . C T 574 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=5.30;BaseQRankSum=2.413;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.517;MQ=59.95;MQRankSum=1.078;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.430;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,34:65:75:75,0:20,11,16,18 0/1:29,20:49:99:529,0,750:19,10,15,5 +chrX 1633016 . GA G 3572.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=30.35;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.35;SOR=0.744;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2148,0:0,0,39,32 1/1:0,48:48:99:1464,144,0:0,0,19,29 +chrX 1633124 . G T 44 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=0.95;BaseQRankSum=0.614;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=1.883;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=0.949;ReadPosRankSum=0.85;SOR=1.019;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:38,40:78:74:.:74,0:18,20,16,24 0/0:.:62:64:62:0,64,1306 +chrX 1633642 . A ATTTT 1014.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=15.50;BaseQRankSum=0.697;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.08;MQRankSum=-1.107;QD=15.50;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.642;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,25:40:99:413,0:7,8,12,13 0/1:11,17:28:99:641,0,390:5,6,8,9 +chrX 1633683 . G A 534 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=15.24;BaseQRankSum=2.024;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.271;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.990;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:59:62:0,59 0/1:17,20:37:99:.:564,0,415:8,9,8,12 +chrX 1633756 . A G 615 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.44;BaseQRankSum=0.541;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.20;MQRankSum=1.001;QD=13.44;ReadPosRankSum=0;SOR=0.711;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:59:62:0,59 0/1:25,23:48:99:.:645,0,694:11,14,10,13 +chrX 1633930 . A G 904 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=14.59;BaseQRankSum=-1.195;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.124;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.704;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:59:62:0,59 0/1:27,37:64:99:.:934,0,687:12,15,20,17 +chrX 1634225 . G A 1022 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=14.82;BaseQRankSum=2.474;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.895;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.53;SOR=0.850;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:59:62:0,59 0/1:34,37:71:99:.:1052,0,849:18,16,21,16 +chrX 1634414 . A G 949 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.19;BaseQRankSum=1.445;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=4.697;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.860;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:59:62:0,59 0/1:34,35:69:99:.:979,0,890:19,15,15,20 +chrX 1634653 . A AC 493.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=4.94;BaseQRankSum=1.118;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=7.497;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.175;SOR=1.106;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,24:45:75:75,0:8,13,14,10 0/1:39,24:63:99:458,0,910:20,19,15,9 +chrX 1634726 . G A 656 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.91;BaseQRankSum=-0.653;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.182;MQ=59.51;MQRankSum=-0.795;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=0.512;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:99:45:0,133 0/1:19,27:46:99:.:686,0,458:6,13,10,17 +chrX 1634884 . T C 767 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=11.90;BaseQRankSum=-2.017;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.853;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.71;SOR=0.404;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:99:45:0,133 0/1:32,35:67:99:.:797,0,853:12,20,18,17 +chrX 1634976 . C CT 291.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=13.24;BaseQRankSum=0.295;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.569;MQ=59.27;MQRankSum=-1.143;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.399;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,133 0|1:15,10:25:99:.:0|1:1634976_C_CT:331,0,600:1634976:9,6,5,5 +chrX 1634993 . G C 289 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=11.00;BaseQRankSum=0.482;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.65;MQRankSum=0;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.602;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,133 0|1:19,10:29:99:.:0|1:1634976_C_CT:319,0,768:1634976:9,10,5,5 +chrX 1634997 . T C 224 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=9.07;BaseQRankSum=1.694;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.90;MQRankSum=-0.237;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.941;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,133 0|1:20,8:28:99:.:0|1:1634976_C_CT:254,0,816:1634976:9,11,3,5 +chrX 1635006 . G A 252 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=10.85;BaseQRankSum=1.815;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.01;MQRankSum=-1.175;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=0.502;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,133 0|1:18,8:26:99:.:0|1:1634976_C_CT:282,0,732:1634976:6,12,3,5 +chrX 1635014 . A G 219 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=11.32;BaseQRankSum=-1.544;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.82;MQRankSum=-1.925;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.626;SOR=0.784;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,133 0|1:15,7:22:99:.:0|1:1634976_C_CT:249,0,609:1634976:5,10,2,5 +chrX 1635024 . G A 216 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=10.70;BaseQRankSum=-0.864;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.01;MQRankSum=-2.006;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.906;SOR=0.693;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,133 0|1:16,7:23:99:.:0|1:1634976_C_CT:246,0,651:1634976:5,11,2,5 +chrX 1635035 . T C 345 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=0.698;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.544;MQ=55.19;MQRankSum=-2.821;QD=15.00;ReadPosRankSum=-3.052;SOR=0.260;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,133 0|1:15,10:25:99:.:0|1:1634976_C_CT:375,0,600:1634976:5,10,5,5 +chrX 1635037 . G T 345 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=0.12;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.544;MQ=55.19;MQRankSum=-2.821;QD=15.00;ReadPosRankSum=-3.082;SOR=0.260;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,133 0|1:15,10:25:99:.:0|1:1634976_C_CT:375,0,600:1634976:5,10,5,5 +chrX 1635124 . A G 580 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.88;BaseQRankSum=-1.309;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.680;MQ=54.51;MQRankSum=-1.795;QD=14.88;ReadPosRankSum=2.888;SOR=0.385;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:99:45:0,133 0/1:16,25:41:99:.:610,0,389:6,10,12,13 +chrX 1635141 . A AT 128.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=4.54;BaseQRankSum=1.983;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.053;MQ=55.40;MQRankSum=1.08;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.883;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:99:45:0,133 0/1:25,12:37:99:.:168,0,495:11,14,7,5 +chrX 1635276 . G A 660 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=7.11;BaseQRankSum=2.108;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=3.779;MQ=59.31;MQRankSum=0.095;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.484;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,23:45:51:51,0:9,13,13,10 0/1:28,24:52:99:639,0,667:12,16,11,13 +chrX 1635963 . C CTTTT 635.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.50;BaseQRankSum=-0.38;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.517;MQ=59.91;MQRankSum=0.857;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.03;SOR=1.219;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1122 0/1:30,20:50:99:.:675,0,1135:16,14,13,7 +chrX 1636056 . T C 227 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=7.34;BaseQRankSum=-0.806;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.501;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.835;SOR=0.323;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1122 0/1:24,11:35:99:.:257,0,709:8,16,5,6 +chrX 1636567 . TG T 1167.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=10.32;BaseQRankSum=2.318;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.663;SOR=0.744;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,36:66:99:.:.:236,0:.:11,19,16,20 0|1:23,28:51:99:0|1:1636567_TG_T:971,0,737:1636567:12,11,11,17 +chrX 1636913 . C G 453 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.98;BaseQRankSum=1.206;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=4.300;MQ=57.94;MQRankSum=1.35;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.707;SOR=1.254;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:35:1:0,35 0/1:25,19:44:99:.:483,0,627:13,12,7,12 +chrX 1637089 . A G 200 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=33.78;DP=7;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=42.61;QD=38.33;SOR=1.329;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:2:35:1:.:.:0,35 1|1:0,6:6:18:.:0|1:1637089_A_G:230,18,0:1637089:0,0,2,4 +chrX 1637094 . T C 175 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=30.52;DP=6;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.73;QD=41.00;SOR=1.981;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:2:35:1:.:.:0,35 1|1:0,5:5:15:.:0|1:1637089_A_G:205,15,0:1637089:0,0,1,4 +chrX 1637095 . G A 140 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=30.26;DP=5;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.38;QD=42.50;SOR=3.258;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:2:35:1:.:.:0,35 1|1:0,4:4:12:.:0|1:1637089_A_G:170,12,0:1637089:0,0,0,4 +chrX 1638617 . C T 69 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=4;AS_QD=24.75;DP=4;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.04;QD=24.75;SOR=0.693;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,4:4:99:.:99,0:0,0,2,2 ./.:.:0:.:0:0,0,0 +chrX 1639386 . A T 60 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=34.74;DP=3;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=34.53;QD=45.00;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:1:35:1:.:.:0,35 1|1:0,2:2:6:.:0|1:1639386_A_T:90,6,0:1639386:0,0,2,0 +chrX 1639390 . A G 60 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=29.71;DP=3;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=34.53;QD=45.00;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:1:35:1:.:.:0,35 1|1:0,2:2:6:.:0|1:1639386_A_T:90,6,0:1639386:0,0,2,0 +chrX 1639396 . T A 60 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=27.16;DP=3;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=34.53;QD=45.00;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:1:35:1:.:.:0,35 1|1:0,2:2:6:.:0|1:1639386_A_T:90,6,0:1639386:0,0,2,0 +chrX 1640596 . T C 229 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=19.92;BaseQRankSum=0.31;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=42.33;MQRankSum=-0.597;QD=19.92;ReadPosRankSum=-1.608;SOR=0.446;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:59:31:.:.:0,59 0|1:3,10:13:90:.:1|0:1640568_A_G:259,0,90:1640568:3,0,8,2 +chrX 1640898 . A G 176 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=22.89;BaseQRankSum=-0.282;DP=10;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.88;MQRankSum=-0.812;QD=22.89;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=2.093;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:3:25:1:0,25 0/1:2,7:9:42:.:206,0,42:2,0,7,0 +chrX 1641362 . T A 108 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=34.50;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.33;QD=34.50;SOR=0.693;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:84:64:0,84 1/1:0,4:4:12:.:138,12,0:0,0,2,2 +chrX 1641421 . T C 163 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=7.72;BaseQRankSum=-1.087;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.623;MQ=57.65;MQRankSum=1.523;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.083;SOR=1.012;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:84:64:0,84 0/1:15,10:25:99:.:193,0,397:8,7,4,6 +chrX 1641500 . G A 566 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.69;BaseQRankSum=-1.017;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.388;MQ=59.78;MQRankSum=1.02;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=1.136;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:84:64:0,84 0/1:26,25:51:99:.:596,0,677:13,13,15,10 +chrX 1641970 . G A 441 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=6.83;BaseQRankSum=-0.803;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=3.279;MQ=58.96;MQRankSum=0.407;QD=6.83;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=0.859;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,41:69:99:.:471,0:15,13,18,23 0/0:.:54:25:27:0,25,659 +chrX 1641981 . C CT 394.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=6.29;BaseQRankSum=2.176;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.243;MQ=58.92;MQRankSum=0.345;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.668;SOR=0.977;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,40:69:99:.:434,0:15,14,17,23 0/0:.:54:25:27:0,25,659 +chrX 1642149 . C T 163 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=3.22;BaseQRankSum=1.363;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=5.062;MQ=59.12;MQRankSum=0.119;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.66;SOR=0.537;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,32:60:99:.:193,0:11,17,17,15 0/0:.:54:25:27:0,25,659 +chrX 1642309 . A G 129 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=3.12;BaseQRankSum=1.329;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.53;MQRankSum=-0.904;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.444;SOR=0.596;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,27:51:99:.:159,0:14,10,15,12 0/0:.:54:25:27:0,25,659 +chrX 1642661 . G C 680 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=1.238;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.749;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=1.020;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:49:52:0,49 0/1:28,27:55:99:.:710,0,674:13,15,16,11 +chrX 1643460 . C T 950 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=13.61;BaseQRankSum=1.71;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=9.744;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=1.193;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:49:52:0,49 0/1:37,35:72:99:.:980,0,984:16,21,22,13 +chrX 1643665 . A G 1051 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=8.01;BaseQRankSum=1.464;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.644;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.633;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,38:72:99:188,0:13,21,17,21 0/1:31,32:63:99:893,0,803:12,19,11,21 +chrX 1643667 . T C 158 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=2.61;BaseQRankSum=-3.076;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.960;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.61;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.473;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,38:72:99:.:188,0:13,21,17,21 0/0:.:63:99:63:0,118,1713 +chrX 1643753 . G T 309 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=4.08;BaseQRankSum=1.059;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=4.208;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.43;SOR=0.690;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:37,46:83:99:.:339,0:16,21,25,21 0/0:.:63:99:63:0,118,1713 +chrX 1643914 . A C 331 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=5.39;BaseQRankSum=-0.561;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.39;ReadPosRankSum=-2.422;SOR=0.743;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,39:67:99:.:361,0:14,14,19,20 0/0:.:63:99:63:0,118,1713 +chrX 1643996 . C T 801 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.98;BaseQRankSum=0.759;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=8.790;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.933;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1800 0/1:34,30:64:99:.:831,0,920:21,13,12,18 +chrX 1644058 . A C 143 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=2.88;BaseQRankSum=-1.379;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.191;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.55;SOR=0.974;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,33:60:99:.:173,0:14,13,14,19 0/0:.:61:48:61:0,48,1800 +chrX 1644219 . T TTTATTA,TTTATTATTA 1533.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,34;AS_QD=34.00,31.06;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=46.26;SOR=1.085;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,238,238 2/2:0,0,34:34:99:.:1573,1361,1289,106,101,0:0,0,14,20 +chrX 1644389 . T C 566 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.69;BaseQRankSum=-1.477;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.807;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:5:64:0,5 0/1:28,23:51:99:.:596,0,800:15,13,13,10 +chrX 1645139 . A AT 31.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=7.10;BaseQRankSum=0.589;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.7;SOR=0.693;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,466 0/1:5,5:10:71:.:71,0,72:3,2,3,2 +chrX 1645165 . C T 115 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=3.63;BaseQRankSum=1.078;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=4.789;MQ=58.88;MQRankSum=-0.854;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.705;SOR=0.228;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,22:40:99:.:145,0:5,13,10,12 0/0:.:50:43:50:0,43,843 +chrX 1645403 . TTG T 340.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=4.32;BaseQRankSum=2.041;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.756;MQ=59.46;MQRankSum=0.65;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.574;SOR=0.937;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,26:46:99:154,0:8,12,14,12 0/1:31,11:42:99:226,0,1101:18,13,7,4 +chrX 1645493 . T C 677 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=9.18;BaseQRankSum=1.047;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.046;MQ=59.60;MQRankSum=0;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.394;SOR=1.096;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:13,19:32:99:178,0:8,5,11,8 0/1:25,20:45:99:529,0,664:11,14,12,8 +chrX 1645685 . A G 601 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.27;BaseQRankSum=1.507;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.847;MQ=59.71;MQRankSum=-1.119;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=1.340;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:45:54:0,45 0/1:32,24:56:99:.:631,0,864:15,17,8,16 +chrX 1646081 . G C 1752 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=15.77;BaseQRankSum=0.841;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=5.545;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=1.020;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,38:66:99:344,0:13,15,20,18 1/1:0,47:47:99:1438,140,0:0,0,30,17 +chrX 1646213 . T TC 612.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.07;BaseQRankSum=0.55;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=4.032;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.113;SOR=1.372;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1440 0/1:29,25:54:99:.:652,0,806:17,12,18,7 +chrX 1646312 . T C 658 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.23;BaseQRankSum=0.162;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=5.881;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.778;SOR=0.202;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:5:69:0,5 0/1:26,26:52:99:.:688,0,657:18,8,13,13 +chrX 1646442 . T C 902 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.28;BaseQRankSum=-0.434;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.211;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.721;SOR=0.434;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,168 0/1:27,34:61:99:.:932,0,726:9,18,14,20 +chrX 1646510 . T C 793 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=7.22;BaseQRankSum=0.466;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.526;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.457;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,29:57:57:57,0:7,21,11,18 0/1:30,27:57:99:766,0,833:12,18,11,16 +chrX 1646549 . T C 640 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=5.78;BaseQRankSum=-0.28;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.500;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.517;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,33:62:44:44,0:9,20,14,19 0/1:30,24:54:99:626,0,801:15,15,12,12 +chrX 1646658 . CTTTCT C 279.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=7.98;BaseQRankSum=1.043;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=6.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.527;SOR=1.219;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,114 0/1:23,17:40:99:.:319,0,769:14,9,6,11 +chrX 1646718 . T C 440 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=12.70;BaseQRankSum=-0.563;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.273;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.842;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,114 0/1:19,18:37:99:.:470,0,530:10,9,8,10 +chrX 1646958 . CTCTTTCTT C,CTCTT 1078.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=28,20;AS_QD=5.23,11.86;BaseQRankSum=1.287;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=8.599;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=12.29;ReadPosRankSum=2.31;SOR=0.248;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,28,0:47:99:371,0,1203:6,13,11,17 0/2:24,0,20:44:99:747,819,1815,0,996,935:7,17,11,9 +chrX 1647070 . T C 481 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.65;BaseQRankSum=-2.874;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=4.201;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.773;SOR=0.247;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1144 0/1:24,24:48:99:.:511,0,661:8,16,12,12 +chrX 1647117 . C CTCTT 681.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=18.03;BaseQRankSum=0.962;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=12.597;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.596;SOR=1.041;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:11:54:0,11 0/1:21,19:40:99:.:721,0,814:15,6,7,12 +chrX 1647160 . CCTTT C 734.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=18.43;BaseQRankSum=1.798;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=6.740;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.43;ReadPosRankSum=1.235;SOR=0.525;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1800 0/1:22,20:42:99:.:774,0,863:15,7,9,11 +chrX 1647386 . G A 1193 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=8.61;BaseQRankSum=-1.082;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=3.982;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.313;SOR=0.434;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,45:77:99:351,0:14,18,22,23 0/1:32,33:65:99:872,0,862:13,19,17,16 +chrX 1647453 . C G 1064 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=9.51;BaseQRankSum=0.245;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.422;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.273;SOR=0.550;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,31:55:99:227,0:10,14,15,16 0/1:29,31:60:99:867,0,818:13,16,17,14 +chrX 1647683 . C T 818 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=6.63;BaseQRankSum=-0.253;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=5.404;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.676;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,34:64:99:132,0:17,13,18,16 0/1:37,27:64:99:716,0,1068:21,16,10,17 +chrX 1647976 . T C 1166 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=14.77;BaseQRankSum=0.538;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=7.499;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=0.408;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:50:70:0,50 0/1:37,44:81:99:.:1196,0,923:24,13,21,23 +chrX 1648906 . C CTTTT 365.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=4.45;BaseQRankSum=-0.402;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.728;MQ=59.92;MQRankSum=1.055;QD=4.45;ReadPosRankSum=2.113;SOR=0.968;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,28:55:19:19,0:13,14,18,10 0/1:25,11:36:99:386,0,966:13,12,4,7 +chrX 1648953 . G A 320 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=7.95;BaseQRankSum=-0.636;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=16.088;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.115;SOR=2.406;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1581 0/1:29,15:44:99:.:350,0,811:17,12,3,12 +chrX 1649351 . C G 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.34;BaseQRankSum=1.253;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=10.484;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.278;SOR=0.424;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:34:46:0,34 0/1:29,24:53:99:.:654,0,787:21,8,11,13 +chrX 1649597 . CAAAAA C 858.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=11.82;BaseQRankSum=0.665;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=7.802;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.034;SOR=1.319;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,25:42:99:385,0:7,10,16,9 0/1:20,14:34:99:513,0,740:10,10,9,5 +chrX 1650376 . G A 533 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.80;BaseQRankSum=-2.173;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.693;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,229 0/1:22,22:44:99:.:563,0,608:13,9,13,9 +chrX 1650492 . CTTTTTTTTTT C 442.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=13.77;BaseQRankSum=0.065;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.29;MQRankSum=1.285;QD=13.77;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.631;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,229 0/1:20,15:35:99:.:482,0,721:11,9,8,7 +chrX 1650673 . AT A 588.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=7.48;BaseQRankSum=0.967;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=4.109;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.783;SOR=0.383;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,21:37:99:156,0:10,6,11,10 0/1:25,22:47:99:472,0,527:15,10,11,11 +chrX 1651100 . T C 476 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.32;BaseQRankSum=-0.785;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.54;MQRankSum=-1.395;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.904;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1439 0/1:19,19:38:99:.:506,0,516:10,9,11,8 +chrX 1651112 . G GTT,GTTT 771.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=10,26;AS_QD=7.36,13.77;BaseQRankSum=0.986;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.124;MQ=59.08;MQRankSum=0.436;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.678;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:9,10,5:24:99:206,0,205:4,5,7,8 0/2:9,0,21:30:99:605,632,894,0,263,200:3,6,13,8 +chrX 1652075 . C A 884 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=4.91;BaseQRankSum=-0.013;DP=193;ExcessHet=0.0000;FS=2.532;MQ=55.26;MQRankSum=0.049;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.893;VarDP=186 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:42,50:92:99:178,0:19,23,30,20 0/1:56,38:94:99:736,0,1462:31,25,19,19 +chrX 1652853 . A G 883 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=6.66;BaseQRankSum=0.31;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=2.155;MQ=59.74;MQRankSum=0.146;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.569;SOR=0.510;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,41:77:99:125,0:17,19,19,22 0/1:31,29:60:99:788,0,832:13,18,16,13 +chrX 1652883 . A G 899 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=7.04;BaseQRankSum=0.611;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;MQRankSum=0.076;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.835;SOR=0.729;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,39:75:98:98,0:17,19,15,24 0/1:26,31:57:99:831,0,693:11,15,16,15 +chrX 1653090 . CA C 486.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.22;BaseQRankSum=-0.436;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.38;MQRankSum=-1.015;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=0.760;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,331 0/1:13,24:37:99:.:526,0,229:5,8,9,15 +chrX 1653115 . TG T 891.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=18.25;BaseQRankSum=1.081;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.058;MQ=59.76;MQRankSum=-1.216;QD=18.25;ReadPosRankSum=2.064;SOR=0.864;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,331 0/1:22,29:51:99:.:931,0,667:10,12,12,17 +chrX 1653571 . T C 874 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=8.78;BaseQRankSum=1.127;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.602;MQ=59.32;MQRankSum=0.205;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.499;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,31:56:99:241,0:11,14,16,15 0/1:21,26:47:99:663,0,543:9,12,12,14 +chrX 1653592 . CTTTT C 845.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=10.29;BaseQRankSum=2.031;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.813;MQ=58.88;MQRankSum=0.676;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.705;SOR=0.713;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,21:42:99:114,0:12,9,12,9 0/1:23,21:44:99:771,0,862:11,12,8,13 +chrX 1653833 . T C 758 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=7.04;BaseQRankSum=0.858;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=16.283;MQ=59.84;MQRankSum=0.055;QD=7.04;ReadPosRankSum=2.9;SOR=0.564;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,31:60:99:105,0:8,21,14,17 0/1:25,27:52:99:683,0,703:10,15,18,9 +chrX 1653980 . C T 903 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=7.18;BaseQRankSum=1.558;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.652;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=0.590;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,27:54:55:55,0:16,11,15,12 0/1:41,35:76:99:878,0,1117:21,20,17,18 +chrX 1654143 . A C 845 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.51;BaseQRankSum=-0.338;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.107;MQ=58.59;MQRankSum=-3.188;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.481;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:84:67:.:.:0,84 0|1:30,23:53:99:.:0|1:1654143_A_C:875,0,1169:1654143:10,20,9,14 +chrX 1654145 . G A 845 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.51;BaseQRankSum=0.21;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.107;MQ=58.59;MQRankSum=-3.188;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.481;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:84:67:.:.:0,84 0|1:30,23:53:99:.:0|1:1654143_A_C:875,0,1169:1654143:10,20,9,14 +chrX 1654369 . G A 1163 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=17.81;BaseQRankSum=1.771;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.812;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:84:67:.:.:0,84 0|1:36,31:67:99:.:0|1:1654369_G_A:1193,0,1408:1654369:21,15,19,12 +chrX 1654373 . G A 1166 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.12;BaseQRankSum=3.35;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.742;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:9:64:.:.:0,9 0|1:35,31:66:99:.:0|1:1654369_G_A:1196,0,1376:1654369:21,14,19,12 +chrX 1654382 . G A 1124 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=30;AS_QD=17.75;BaseQRankSum=2.789;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.806;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:65:.:65:.:.:0,0 0|1:35,30:65:99:.:0|1:1654369_G_A:1154,0,1359:1654369:20,15,18,12 +chrX 1654529 . T C 324 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=4.16;BaseQRankSum=-1.25;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.687;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,26:50:37:37,0:10,14,11,15 0/1:22,13:35:99:317,0,649:10,12,6,7 +chrX 1654610 . C CA,CAAAAAAAA 205.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,9;AS_QD=0.00,9.07;BaseQRankSum=0.953;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=32.403;MQ=58.93;MQRankSum=-1.983;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.31;SOR=3.011;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:24:65:0,24,24 0/2:18,0,9:27:99:.:245,287,630,0,355,599:15,3,1,8 +chrX 1655234 . T C 654 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=10.06;BaseQRankSum=0.567;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=3.358;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.932;SOR=1.179;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:24:65:0,24 0/1:40,28:68:99:.:684,0,1056:20,20,11,17 +chrX 1655448 . C A 979 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=8.93;BaseQRankSum=1.085;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=7.366;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=1.173;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,31:57:99:171,0:17,9,7,24 0/1:25,31:56:99:838,0,561:10,15,17,14 +chrX 1655559 . G GT 532.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.17;BaseQRankSum=-2.371;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.606;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.459;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,134 0/1:18,29:47:99:.:572,0,313:11,7,14,15 +chrX 1655800 . A G 542 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.43;BaseQRankSum=-1.178;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.154;MQ=59.61;MQRankSum=0;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.420;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,134 0/1:23,23:46:99:.:572,0,632:14,9,12,11 +chrX 1656504 . TAC T 784.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=19.16;BaseQRankSum=-0.663;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.171;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.695;SOR=0.963;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,134 0/1:20,23:43:99:.:824,0,675:10,10,10,13 +chrX 1656652 . CGTGTGTACACACATATATACACGTGTGTACACGCATATATACACGT C 665.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=18.08;BaseQRankSum=-0.1;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=9.548;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=1.499;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,134 0/1:20,19:39:99:.:705,0,780:8,12,13,6 +chrX 1656782 . A ATG 652.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=20.97;BaseQRankSum=-0.658;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.43;MQRankSum=-0.643;QD=20.97;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.569;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,134 0/1:11,22:33:99:.:692,0,308:7,4,13,9 +chrX 1657197 . G C 1065 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=8.69;BaseQRankSum=1.267;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=5.434;MQ=59.87;MQRankSum=-0.848;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=0.489;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,39:69:99:323,0:12,18,19,20 0/1:28,29:57:99:772,0,697:12,16,16,13 +chrX 1657989 . G A 827 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.58;BaseQRankSum=-0.549;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.038;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.526;SOR=0.623;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:44:51:0,44 0/1:24,31:55:99:.:857,0,649:11,13,16,15 +chrX 1658065 . C G 778 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=5.69;BaseQRankSum=0.959;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=3.968;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.760;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,41:75:99:125,0:15,19,23,18 0/1:40,27:67:99:683,0,1073:19,21,14,13 +chrX 1658113 . G A 679 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=5.06;BaseQRankSum=1.06;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=1.320;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.763;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:39,43:82:99:139,0:18,21,25,18 0/1:36,22:58:99:570,0,1007:19,17,9,13 +chrX 1658204 . C G 839 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.09;BaseQRankSum=-0.736;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.902;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:78:99:78:.:.:0,112 0|1:30,24:54:99:.:0|1:1658204_C_G:869,0,1155:1658204:17,13,10,14 +chrX 1658214 . G C 955 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.98;BaseQRankSum=-0.288;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=3.657;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.839;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:78:99:78:.:.:0,112 0|1:30,28:58:99:.:0|1:1658204_C_G:985,0,1143:1658204:17,13,12,16 +chrX 1658540 . G GT 5496.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=148;AS_QD=30.76;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.41;SOR=1.257;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,79:79:99:2956,0:0,0,30,49 1/1:0,69:69:99:2580,208,0:0,0,27,42 +chrX 1658562 . TTTTG T 5165.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=23.50;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.74;SOR=1.402;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2665,0:0,0,21,40 1/1:0,58:58:99:2540,174,0:0,0,22,36 +chrX 1658605 . A ATACT 6182.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=139;AS_QD=27.96;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.76;SOR=1.076;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:3308,0:0,0,30,44 1/1:0,65:65:99:2914,196,0:0,0,28,37 +chrX 1658646 . TTC T 3618.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=26.66;BaseQRankSum=-0.226;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=6.023;MQ=59.45;MQRankSum=2.736;QD=35.86;ReadPosRankSum=1.213;SOR=0.079;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,45:47:99:.:.:1394,0:.:2,0,23,22 1|1:1,54:55:99:0|1:1658646_TTC_T:2264,153,0:1658646:1,0,30,24 +chrX 1658657 . T C 4004 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=29.53;BaseQRankSum=-0.289;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=5.990;MQ=58.63;MQRankSum=2.421;QD=35.39;ReadPosRankSum=0.924;SOR=0.083;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,52:54:99:.:.:1611,0:.:2,0,27,25 1|1:1,59:60:99:0|1:1658646_TTC_T:2423,168,0:1658646:1,0,33,26 +chrX 1658699 . G C 614 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.10;BaseQRankSum=0.496;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=7.067;MQ=52.22;MQRankSum=0.015;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.691;SOR=1.087;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:46:53:0,46 0/1:16,24:40:99:.:644,0,397:6,10,15,9 +chrX 1658775 . A G 1672 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=33.36;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=44.44;QD=42.55;SOR=0.793;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:46:53:.:.:0,46 1|1:0,40:40:99:.:0|1:1658775_A_G:1702,120,0:1658775:0,0,19,21 +chrX 1658792 . C T 1850 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=28.77;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.05;QD=44.76;SOR=1.005;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:46:53:.:.:0,46 1|1:0,42:42:99:.:0|1:1658775_A_G:1880,126,0:1658775:0,0,18,24 +chrX 1658795 . C T 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.77;BaseQRankSum=-0.185;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.287;MQ=40.00;MQRankSum=-1.655;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.229;SOR=0.389;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:46:53:.:.:0,46 0|1:16,23:39:99:.:0|1:1658775_A_G:654,0,414:1658775:6,10,11,12 +chrX 1658808 . C T 1994 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=21.31;BaseQRankSum=-0.261;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.155;MQ=47.10;MQRankSum=-5.891;QD=21.31;ReadPosRankSum=-0.834;SOR=0.394;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,30:55:99:.:.:224,0:.:9,16,14,16 1|1:0,40:40:99:0|1:1658775_A_G:1800,120,0:1658775:0,0,18,22 +chrX 1658848 . T C 2085 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=23.24;BaseQRankSum=-1.618;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=4.741;MQ=51.14;MQRankSum=-3.47;QD=23.24;ReadPosRankSum=1.166;SOR=0.608;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,25:47:99:.:.:135,0:.:9,13,13,12 1|1:0,44:44:99:0|1:1658775_A_G:1980,132,0:1658775:0,0,24,20 +chrX 1658855 . G C 2265 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=25.22;BaseQRankSum=-0.371;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.115;MQ=51.52;MQRankSum=-3.27;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.226;SOR=0.698;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:20,27:47:99:.:.:315,0:.:9,11,14,13 1|1:0,44:44:99:0|1:1658775_A_G:1980,132,0:1658775:0,0,24,20 +chrX 1658858 . A C 2275 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=24.78;BaseQRankSum=-1.758;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=3.321;MQ=51.72;MQRankSum=-3.373;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.606;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:21,27:48:99:.:.:290,0:.:9,12,14,13 1|1:0,45:45:99:0|1:1658775_A_G:2015,135,0:1658775:0,0,24,21 +chrX 1658922 . C T 2340 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=22.15;BaseQRankSum=-0.057;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.390;MQ=55.86;MQRankSum=-2.512;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.102;SOR=0.883;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,31:55:99:.:.:320,0:.:13,11,13,18 1|1:0,52:52:99:0|1:1658775_A_G:2050,156,0:1658775:0,0,23,29 +chrX 1659032 . C T 2961 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=21.67;BaseQRankSum=1.485;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=2.519;MQ=56.74;MQRankSum=-1.779;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.79;SOR=1.000;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:36,38:74:99:.:.:111,0:.:18,18,19,19 1|1:0,64:64:99:0|1:1659032_C_T:2880,193,0:1659032:0,0,25,39 +chrX 1659033 . A *,G 2961 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=10,102;AS_QD=0.00,21.67;BaseQRankSum=1.707;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=2.470;MQ=56.69;MQRankSum=-1.694;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.47;SOR=0.970;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:36,10,38:84:99:.:.:111,1646,0:.:18,18,24,24 2|2:0,0,64:64:99:0|1:1659032_C_T:2880,2880,2880,193,193,0:1659032:0,0,25,39 +chrX 1659054 . A G 5679 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=140;AS_QD=31.49;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.67;QD=40.78;SOR=0.889;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,73:73:99:.:.:2786,0:.:0,0,33,32 1|1:0,67:67:99:0|1:1659032_C_T:2923,202,0:1659032:0,0,27,40 +chrX 1659209 . T C 2083 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=32.02;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.02;SOR=2.035;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,119 1/1:0,66:66:99:.:2113,197,0:0,0,48,18 +chrX 1659411 . C CTT 6696.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=154;AS_QD=28.60;DP=161;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.74;SOR=0.801;VarDP=154 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:3278,0:0,0,43,32 1/1:0,79:79:99:3458,237,0:0,0,38,41 +chrX 1659527 . G A 3971 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=29.20;BaseQRankSum=-0.119;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=4.962;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.20;ReadPosRankSum=1.542;SOR=0.936;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,76:76:99:.:.:2981,0:.:0,0,35,41 0|1:32,29:61:99:0|1:1659527_G_A:1020,0,1143:1659527:17,15,10,19 +chrX 1659543 . G C 2583 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=18.80;BaseQRankSum=2.997;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.718;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.622;SOR=0.845;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,41:77:99:195,0:17,19,19,22 1/1:1,61:62:99:2418,161,0:1,0,27,34 +chrX 1659551 . TTGTG T 1207.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=9.24;BaseQRankSum=0.442;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=4.075;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=0.875;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:37,39:76:70:.:.:70,0:.:19,18,18,21 0|1:28,31:59:99:0|1:1659527_G_A:1177,0,1062:1659527:15,13,13,18 +chrX 1659591 . G A 879 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.23;BaseQRankSum=1.935;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.662;MQ=59.66;MQRankSum=-0.83;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.590;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,119 0/1:24,32:56:99:.:909,0,893:14,10,15,17 +chrX 1659592 . G A 561 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.55;BaseQRankSum=-1.258;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.244;MQ=59.66;MQRankSum=0.871;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.15;SOR=0.921;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,119 0/1:33,23:56:99:.:591,0,1276:16,17,13,10 +chrX 1659639 . G GTT 2477.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=20.30;BaseQRankSum=2.145;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=5.158;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.356;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,34:66:85:85,0:22,10,22,12 1/1:2,56:58:99:2432,125,0:2,0,32,24 +chrX 1659770 . T C 796 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=0.249;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.611;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1169 0/1:28,31:59:99:.:826,0,707:12,16,14,17 +chrX 1659811 . ATT A 1289.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=21.10;BaseQRankSum=1.343;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.208;SOR=0.614;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1169 0|1:29,34:63:99:.:0|1:1659811_ATT_A:1329,0,1103:1659811:13,16,16,18 +chrX 1659819 . TTGTG T 1280.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=20.95;BaseQRankSum=2.274;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.952;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.17;SOR=0.864;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1169 0|1:29,34:63:99:.:0|1:1659811_ATT_A:1320,0,1115:1659811:14,15,15,19 +chrX 1659879 . C CTA 968.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=19.38;BaseQRankSum=-0.927;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=7.883;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.505;SOR=1.259;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1169 0/1:24,28:52:99:.:1008,0,895:14,10,10,18 +chrX 1659947 . A AG 444.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.00;BaseQRankSum=-1.814;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=14.507;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.948;SOR=1.905;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1169 0/1:25,19:44:99:.:484,0,676:15,10,5,14 +chrX 1660849 . T TAAATATAATAATAAAAATAA 2448.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.74;BaseQRankSum=-0.38;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=42.17;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.317;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1169 1/1:1,58:59:99:.:2488,131,0:1,0,32,26 +chrX 1660881 . A T 1574 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=31.45;BaseQRankSum=-0.377;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.45;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.562;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1169 1/1:1,50:51:99:.:1604,118,0:1,0,32,18 +chrX 1660998 . T C 1478 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=32.09;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.09;SOR=0.823;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1169 1/1:0,47:47:99:.:1508,140,0:0,0,25,22 +chrX 1661156 . A T 1779 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=21.28;BaseQRankSum=2.206;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.09;MQRankSum=-1.17;QD=21.28;ReadPosRankSum=-2.727;SOR=0.646;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:17,24:41:99:.:.:314,0:.:9,8,14,10 1|1:0,44:44:99:0|1:1661150_G_A:1495,132,0:1661150:0,0,21,23 +chrX 1661605 . C A 935 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=23.54;BaseQRankSum=3.124;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=9.412;MQ=58.27;MQRankSum=-0.418;QD=23.54;ReadPosRankSum=-1.805;SOR=1.598;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:19:62:0,19 1/1:5,36:41:71:.:965,71,0:1,3,25,11 +chrX 1662265 . C G 1306 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=13.10;BaseQRankSum=-0.447;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.775;MQ=59.80;MQRankSum=1.096;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.31;SOR=0.500;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,34:64:99:125,0:12,18,16,18 1/1:0,38:38:99:1211,114,0:0,0,17,21 +chrX 1662452 . T TAAAAA 935.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=16.53;BaseQRankSum=0.423;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.027;MQ=59.52;MQRankSum=0.96;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=0.556;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:10,16:26:99:269,0:6,4,8,8 0/1:13,20:33:99:706,0,476:9,4,14,6 +chrX 1662479 . T C 1076 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=1.935;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.082;MQ=59.92;MQRankSum=1.193;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.425;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,23:35:99:433,0:5,7,11,12 0/1:19,25:44:99:673,0,469:15,4,16,9 +chrX 1662582 . A G 2632 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=20.02;BaseQRankSum=-0.384;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=9.367;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.212;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,32:56:99:263,0:7,17,16,16 1/1:0,77:77:99:2399,230,0:0,0,36,41 +chrX 1662689 . A T 1805 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=16.83;BaseQRankSum=2.356;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.588;MQ=59.94;MQRankSum=1.415;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.46;SOR=0.838;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:21,33:54:99:.:.:559,0:.:12,9,17,16 0|1:19,36:55:99:0|1:1662689_A_T:1276,0,561:1662689:7,12,21,15 +chrX 1662722 . T G 1568 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=15.51;BaseQRankSum=-0.574;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.676;MQ=59.94;MQRankSum=1.71;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.705;SOR=0.990;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,31:54:99:.:.:349,0:.:13,10,18,13 0|1:13,36:49:99:0|1:1662689_A_T:1249,0,388:1662689:5,8,20,16 +chrX 1662777 . A G 1655 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=15.32;BaseQRankSum=-1.615;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.799;MQ=59.94;MQRankSum=1.894;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.576;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,39:57:99:594,0:8,10,21,18 0/1:12,41:53:99:1091,0,249:6,6,19,22 +chrX 1662857 . G GTATATATATATATATA 381.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=10.79;BaseQRankSum=-2.103;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.366;MQ=58.90;MQRankSum=0.995;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.404;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,1215 0/1:27,12:39:99:.:421,0,1099:11,16,6,6 +chrX 1662876 . TATA T 1043.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=24.07;BaseQRankSum=-0.944;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.727;MQ=58.50;MQRankSum=-0.082;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.138;SOR=1.255;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,1215 0|1:16,29:45:99:.:0|1:1662876_TATA_T:1083,0,571:1662876:8,8,11,18 +chrX 1662878 . TA T,* 1052.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,0;AS_QD=23.23,0.00;BaseQRankSum=-0.125;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.860;MQ=59.51;MQRankSum=0.97;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.844;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:11,36,0:47:99:.:.:1092,0,1587:.:5,6,18,18 0|2:16,0,29:45:99:0|1:1662876_TATA_T:1083,1132,1790,0,658,571:1662876:8,8,11,18 +chrX 1662880 . TA T 1007.97 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=36;AS_QD=21.81;BaseQRankSum=-0.496;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.288;MQ=59.52;MQRankSum=0.894;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.446;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:12,36:48:99:.:1047,0:5,7,18,18 ./.:.:50:.:50:0,0,0 +chrX 1662881 . A *,T 1149 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,29;AS_QD=0.00,26.20;BaseQRankSum=-0.848;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.835;MQ=58.71;MQRankSum=-0.054;QD=25.63;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.801;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:12,36,0:48:99:.:.:1047,0,1587:.:5,7,18,18 0|2:16,1,29:46:99:0|1:1662876_TATA_T:1179,1112,1766,0,638,579:1662876:8,8,11,19 +chrX 1662883 . A T,* 2164 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=64,1;AS_QD=23.85,0.00;BaseQRankSum=0.404;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.11;MQRankSum=0.872;QD=23.59;ReadPosRankSum=1.123;SOR=0.772;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:12,35,0:47:99:.:.:1015,0,1555:.:5,7,18,17 0|1:16,29,1:46:99:0|1:1662876_TATA_T:1179,0,579,1112,638,1766:1662876:8,8,11,19 +chrX 1662885 . A T 2194 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=24.44;BaseQRankSum=1.468;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.29;MQRankSum=-0.054;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.505;SOR=0.730;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:11,34:45:99:1035,0:4,7,18,16 0/1:16,30:46:99:1189,0,581:8,8,10,20 +chrX 1663482 . T A 697 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.46;BaseQRankSum=0.746;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;MQRankSum=-1.401;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.693;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:49:60:0,49 0/1:27,27:54:99:.:727,0,736:14,13,14,13 +chrX 1664019 . C T 2065 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=33.79;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.79;SOR=0.826;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:49:60:0,49 1/1:0,62:62:99:.:2095,186,0:0,0,29,33 +chrX 1664140 . T C 515 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.98;BaseQRankSum=0.662;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.561;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.98;ReadPosRankSum=-1.057;SOR=0.388;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:49:60:0,49 0/1:21,21:42:99:.:545,0,538:7,14,11,10 +chrX 1664366 . A G 1985 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=18.49;BaseQRankSum=1.985;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=3.083;MQ=59.91;MQRankSum=-1.256;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.214;SOR=1.104;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,31:56:99:253,0:12,13,14,17 1/1:0,53:53:99:1762,159,0:0,0,19,34 +chrX 1664488 . G A 710 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.42;BaseQRankSum=2.735;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.611;SOR=0.693;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,421 0/1:22,26:48:99:.:740,0,515:11,11,13,13 +chrX 1664619 . A T 713 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.18;BaseQRankSum=-2.656;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=13.837;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.78;SOR=1.031;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,421 0/1:32,29:61:99:.:743,0,919:21,11,11,18 +chrX 1664733 . C CAA 442.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.95;BaseQRankSum=-0.017;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=12.092;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.675;SOR=1.623;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,421 0/1:27,17:44:99:.:482,0,822:10,17,12,5 +chrX 1664846 . A T 925 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.40;BaseQRankSum=-1.155;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=11.371;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.693;SOR=1.274;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,421 0/1:28,34:62:99:.:955,0,777:11,17,22,12 +chrX 1665109 . G A 2075 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=23.10;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=36.93;SOR=0.728;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,421 1|1:0,57:57:99:.:0|1:1665109_G_A:2105,171,0:1665109:0,0,29,28 +chrX 1665125 . G A 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.24;BaseQRankSum=0.897;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=-1.124;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.304;SOR=0.722;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,421 0|1:31,23:54:99:.:0|1:1665109_G_A:607,0,845:1665109:16,15,11,12 +chrX 1665535 . C G 768 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.35;BaseQRankSum=1.768;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.077;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.696;SOR=0.844;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,421 0/1:23,29:52:99:.:798,0,534:11,12,16,13 +chrX 1665865 . C CT 741.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=13.47;BaseQRankSum=-0.761;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.399;MQ=58.97;MQRankSum=0;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.390;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:10,16:26:99:105,0:7,3,8,8 1/1:0,32:32:94:676,94,0:0,0,20,12 +chrX 1666381 . C T 722 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=5.88;BaseQRankSum=1.235;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=1.413;MQ=59.97;MQRankSum=0.892;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.12;SOR=0.853;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,36:69:99:100,0:22,11,21,15 0/1:34,25:59:99:652,0,890:15,19,15,10 +chrX 1667534 . G T 1941 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.85;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.85;SOR=1.355;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,60:60:99:.:1971,180,0:0,0,22,38 +chrX 1667850 . C T 1765 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=33.24;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.24;SOR=0.931;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,54:54:99:.:1795,162,0:0,0,30,24 +chrX 1668509 . A AAATAAT 388.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=19.45;BaseQRankSum=1.453;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;MQRankSum=-0.909;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.740;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 0/1:11,11:22:99:.:428,0,416:6,5,5,6 +chrX 1669143 . C T 682 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=33.90;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.39;QD=33.90;SOR=1.230;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,21:21:63:.:712,63,0:0,0,8,13 +chrX 1669193 . C T 1508 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=32.72;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.85;QD=32.72;SOR=0.919;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,47:47:99:.:1538,140,0:0,0,21,26 +chrX 1669245 . C A 1983 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=33.55;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.12;QD=33.55;SOR=0.986;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,60:60:99:.:2013,180,0:0,0,26,34 +chrX 1669724 . T G 2120 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=31.62;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.43;QD=31.62;SOR=0.814;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,68:68:99:.:2150,203,0:0,0,36,32 +chrX 1669842 . G A 2370 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=24.89;BaseQRankSum=1.075;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=6.255;MQ=59.59;MQRankSum=-0.204;QD=42.11;ReadPosRankSum=2.387;SOR=0.297;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 1|1:2,55:57:99:.:0|1:1669842_G_A:2400,127,0:1669842:2,0,26,29 +chrX 1669849 . T C 2560 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=36.52;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.58;QD=44.66;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 1|1:0,58:58:99:.:0|1:1669842_G_A:2590,175,0:1669842:0,0,27,31 +chrX 1669850 . G A 2605 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=34.17;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;QD=44.66;SOR=0.796;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 1|1:0,59:59:99:.:0|1:1669842_G_A:2635,178,0:1669842:0,0,28,31 +chrX 1669858 . G A 2614 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=31.95;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=44.81;SOR=0.726;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 1|1:0,59:59:99:.:0|1:1669842_G_A:2644,178,0:1669842:0,0,29,30 +chrX 1669875 . G C 2611 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=29.06;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=43.30;SOR=0.793;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 1|1:0,61:61:99:.:0|1:1669842_G_A:2641,184,0:1669842:0,0,32,29 +chrX 1669935 . G A 2053 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=32.05;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.38;QD=32.05;SOR=1.000;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,65:65:99:.:2083,195,0:0,0,37,28 +chrX 1670071 . A G 1666 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=31.41;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;QD=31.41;SOR=0.931;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,54:54:99:.:1696,161,0:0,0,24,30 +chrX 1670306 . A G 2029 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.17;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.17;SOR=1.127;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,64:64:99:.:2059,191,0:0,0,38,26 +chrX 1670481 . T A 1770 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=31.03;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.03;SOR=0.997;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,58:58:99:.:1800,174,0:0,0,33,25 +chrX 1670620 . A ATTT 596.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=18.17;BaseQRankSum=-1.687;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=89.214;MQ=55.98;MQRankSum=0.302;QD=18.17;ReadPosRankSum=-2.578;SOR=6.356;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 0|1:12,23:35:99:.:0|1:1670620_A_ATTT:636,0,362:1670620:12,0,0,23 +chrX 1670646 . G T 339 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=7.85;BaseQRankSum=-0.323;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=72.153;MQ=54.84;MQRankSum=-1.254;QD=7.85;ReadPosRankSum=1.403;SOR=5.278;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 0|1:34,13:47:99:.:1|0:1670620_A_ATTT:369,0,1329:1670620:5,29,13,0 +chrX 1670648 . A T 333 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=7.41;BaseQRankSum=-0.138;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=65.299;MQ=55.01;MQRankSum=-1.354;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.203;SOR=5.278;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 0|1:36,13:49:99:.:1|0:1670620_A_ATTT:363,0,1413:1670620:7,29,13,0 +chrX 1670653 . TAG T 332.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=8.09;BaseQRankSum=-1.393;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=61.182;MQ=55.24;MQRankSum=-1.552;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.781;SOR=5.279;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 0|1:33,13:46:99:.:1|0:1670620_A_ATTT:372,0,1333:1670620:7,26,13,0 +chrX 1670655 . G GTTTTT 332.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=8.09;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=61.182;MQ=55.24;MQRankSum=-1.552;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.103;SOR=5.279;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,148 0|1:33,13:46:99:.:1|0:1670620_A_ATTT:372,0,1333:1670620:7,26,13,0 +chrX 1670915 . G C 2087 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=32.57;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.57;SOR=1.437;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,148 1/1:0,65:65:99:.:2117,195,0:0,0,42,23 +chrX 1670934 . A G 3608 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=30.57;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.57;SOR=1.015;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1680,0:0,0,29,27 1/1:0,63:63:99:1958,188,0:0,0,39,24 +chrX 1671324 . C T 2914 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=33.08;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.54;QD=33.08;SOR=0.965;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,89:89:99:.:2944,0:0,0,50,39 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1671571 . A G 1833 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=31.05;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.14;QD=31.05;SOR=0.906;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,60:60:99:.:1863,0:0,0,27,33 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1671766 . G A 2078 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.43;BaseQRankSum=2.723;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.358;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.43;ReadPosRankSum=0.72;SOR=0.525;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,64:65:99:.:2108,0:1,0,29,35 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1672055 . C G 1831 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=33.23;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.23;SOR=1.199;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:1861,0:0,0,34,22 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1672556 . GTC G 1761.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=29.04;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=40.02;SOR=1.714;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:1801,0:0,0,31,14 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1672570 . C CTGTG 2315.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=37.95;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=42.82;SOR=1.666;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2355,0:0,0,28,13 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1673390 . T C 1836 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=33.32;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.32;SOR=1.009;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:1866,0:0,0,32,24 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1674196 . C CTTT 1499.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=29.46;BaseQRankSum=2.266;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=37.54;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.223;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,40:41:99:.:1539,0:0,1,20,20 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1675440 . A G 1626 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=30.67;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.67;SOR=0.693;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:1656,0:0,0,27,27 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1675609 . G GTGTATATA 1801.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=28.91;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.84;SOR=0.784;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,44:44:99:.:1841,0:0,0,21,23 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1675709 . C T 146 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=4.09;BaseQRankSum=1.385;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.696;MQ=59.40;MQRankSum=0;QD=4.09;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=0.324;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,23:43:99:.:176,0:7,13,11,12 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1675714 . CT C 86.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=2.80;BaseQRankSum=-1.554;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.597;MQ=59.08;MQRankSum=1.067;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.352;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,23:45:99:.:126,0:8,14,11,12 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1675912 . G A 1916 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.98;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=32.98;SOR=1.034;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1946,0:0,0,34,25 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1676370 . GTATATATA G,GTATATATATATA,GTATATATATATATA 1377.97 . AC=1,0,0;AF=0.333,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=37,14,1;AS_QD=26.88,29.14,28.70;BaseQRankSum=-0.522;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.74;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.290;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,37,14,1:53:99:.:1417,0,725,1091:0,1,24,28 0/0:.:59:25:53:0,25,978,25,978,978,25,978,978,978 +chrX 1676536 . C A 2251 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=30.27;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=38.02;SOR=0.906;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,60:60:99:.:2281,0:0,0,27,33 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1676639 . G A 254 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=4.73;BaseQRankSum=-1.03;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.208;MQ=59.49;MQRankSum=0.33;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.621;SOR=0.950;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,35:60:99:.:284,0:13,12,15,20 0/0:.:59:25:53:0,25,978 +chrX 1676663 . T G 546 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.52;BaseQRankSum=0.15;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=5.964;MQ=59.84;MQRankSum=0.927;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.549;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,140 0/1:28,22:50:99:.:576,0,792:18,10,10,12 +chrX 1676726 . G A 751 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.98;BaseQRankSum=1.394;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=-0.795;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.862;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,140 0/1:19,27:46:99:.:781,0,465:12,7,18,9 +chrX 1676997 . G A 1222 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=10.79;BaseQRankSum=1.816;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.464;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.819;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,36:64:99:303,0:15,13,21,15 0/1:19,33:52:99:949,0,414:7,12,17,16 +chrX 1677029 . A G 1004 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=8.84;BaseQRankSum=-0.569;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.485;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.653;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,32:57:99:173,0:11,14,17,15 0/1:26,34:60:99:861,0,704:13,13,17,17 +chrX 1677446 . C CT,CTT,T 809 . AC=2,1,0;AF=0.667,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=27,12,0;AS_QD=29.39,31.34,0.00;BaseQRankSum=-0.443;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.37;MQRankSum=0;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.132;SOR=0.657;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,10,12,0:23:16:496,16,0,372:0,1,5,17 1/1:0,17,0,0:17:52:343,52,0,421,103,720,424,102,798,1096:0,0,8,9 +chrX 1677616 . C T 3125 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=32.86;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=32.86;SOR=0.693;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1509,0:0,0,25,21 1/1:0,50:50:99:1646,150,0:0,0,23,27 +chrX 1677717 . G A 1840 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=18.33;BaseQRankSum=-0.694;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.998;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.33;ReadPosRankSum=1.762;SOR=0.446;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,33:55:99:342,0:13,9,18,15 1/1:0,47:47:99:1528,141,0:0,0,23,24 +chrX 1678026 . T C 2547 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=29.31;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=43.68;SOR=0.871;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:24:66:.:.:0,24 1|1:0,59:59:99:.:0|1:1678026_T_C:2577,177,0:1678026:0,0,32,27 +chrX 1678035 . T C 2561 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=27.29;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;QD=43.92;SOR=0.726;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:24:66:.:.:0,24 1|1:0,59:59:99:.:0|1:1678026_T_C:2591,178,0:1678026:0,0,30,29 +chrX 1678061 . T A 2012 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.42;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=31.42;SOR=0.723;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:24:66:0,24 1/1:0,65:65:99:.:2042,194,0:0,0,33,32 +chrX 1678252 . GA G,AA 1980 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=24,71;AS_QD=16.92,22.04;BaseQRankSum=-0.644;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=4.382;MQ=59.50;MQRankSum=-0.112;QD=20.94;ReadPosRankSum=-1.61;SOR=1.220;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,24,17:42:99:423,0,514:1,0,17,24 2/2:0,0,54:54:99:1587,1587,1587,162,162,0:0,0,17,37 +chrX 1678321 . T C 3132 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=30.11;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.21;QD=30.11;SOR=0.833;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1666,0:0,0,29,25 1/1:0,51:51:99:1496,150,0:0,0,20,31 +chrX 1678942 . C G 408 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=6.17;BaseQRankSum=2.007;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=17.481;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.169;SOR=1.347;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,41:71:99:.:438,0:11,19,27,14 0/0:.:61:52:61:0,52,1395 +chrX 1679066 . C CGG 2595.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=34.45;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.92;SOR=0.831;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:71:99:71:.:.:0,1260 1|1:0,60:60:99:.:0|1:1679066_C_CGG:2635,181,0:1679066:0,0,32,28 +chrX 1679067 . A G,AG 3670 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=30,88;AS_QD=30.71,28.59;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.36;SOR=0.798;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30,28:58:91:.:.:1065,0,91:.:0,0,30,28 2|2:0,0,60:60:99:0|1:1679066_C_CGG:2635,2635,2636,181,181,0:1679066:0,0,32,28 +chrX 1679393 . A G 1973 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.79;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.79;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,214 1/1:0,63:63:99:.:2003,188,0:0,0,29,34 +chrX 1680176 . C T 70 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=1.41;BaseQRankSum=0.806;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.955;MQ=59.21;MQRankSum=-0.964;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.885;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:35,36:71:99:.:100,0:17,18,20,16 0/0:.:64:76:64:0,76,1397 +chrX 1680503 . C T 1892 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.72;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.72;SOR=0.728;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,517 1/1:0,57:57:99:.:1922,171,0:0,0,29,28 +chrX 1680630 . G C 1743 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=31.66;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.66;SOR=1.009;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,517 1/1:0,56:56:99:.:1773,167,0:0,0,24,32 +chrX 1681022 . A G 608 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=9.52;BaseQRankSum=-0.038;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=3.358;MQ=59.73;MQRankSum=0;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.12;SOR=0.672;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,517 0/1:41,26:67:99:.:638,0,1142:18,23,14,12 +chrX 1681124 . C CA 6430.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=144;AS_QD=31.19;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=44.93;SOR=0.749;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,83:83:99:.:.:3725,0:.:0,0,46,37 1|1:0,61:61:99:0|1:1681124_C_CA:2745,184,0:1681124:0,0,24,37 +chrX 1681127 . G A 6475 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=145;AS_QD=36.04;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=44.86;SOR=0.735;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,83:83:99:.:.:3725,0:.:0,0,46,37 1|1:0,62:62:99:0|1:1681124_C_CA:2780,187,0:1681124:0,0,25,37 +chrX 1681452 . C CT 472.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=9.48;BaseQRankSum=0.284;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.524;SOR=0.653;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,119 0/1:30,24:54:99:.:512,0,682:11,19,9,15 +chrX 1681598 . TTGTCTCTCTGTCTCTC T,TTGTCTCTC 531.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=8,15;AS_QD=10.08,17.30;BaseQRankSum=-0.09;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=-0.836;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.776;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,119,119 0/2:18,8,15:41:99:.:571,309,1188,0,426,702:9,9,12,11 +chrX 1681636 . GTCTC G 665.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=20.14;BaseQRankSum=1.345;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.320;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.127;SOR=1.038;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,119 0|1:17,18:35:99:.:0|1:1681636_GTCTC_G:705,0,656:1681636:8,9,7,11 +chrX 1681676 . CCT C 501.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=19.32;BaseQRankSum=-0.229;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.12;MQRankSum=-0.038;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.976;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,119 0|1:14,14:28:99:.:0|1:1681636_GTCTC_G:541,0,530:1681636:7,7,6,8 +chrX 1681771 . T TTCTCTCTCTCTTTC 327.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=28.23;BaseQRankSum=-0.292;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.11;MQRankSum=-0.914;QD=28.23;ReadPosRankSum=1.03;SOR=1.022;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,119 0/1:3,10:13:80:.:367,0,80:1,2,3,7 +chrX 1681871 . T TC 198.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=29.75;BaseQRankSum=0;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=6.021;MQ=42.73;MQRankSum=0.18;QD=29.75;ReadPosRankSum=0.319;SOR=3.912;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,119 0|1:2,6:8:51:.:0|1:1681871_T_TC:238,0,51:1681871:1,1,0,6 +chrX 1681872 . T TTTCTC 198.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=29.75;BaseQRankSum=-0.619;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=6.021;MQ=42.73;MQRankSum=0.18;QD=29.75;ReadPosRankSum=0;SOR=3.912;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,119 0|1:2,6:8:51:.:0|1:1681871_T_TC:238,0,51:1681871:1,1,0,6 +chrX 1682075 . GTTTCTC G 362.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=25.13;BaseQRankSum=2.482;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.64;MQRankSum=-1.639;QD=25.13;ReadPosRankSum=1.522;SOR=0.534;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:20:35:15:0,35 0/1:6,10:16:99:.:402,0,222:4,2,6,4 +chrX 1682187 . CTG C 140.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=25.47;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.55;QD=45.00;SOR=1.609;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:20:35:15:.:.:0,35 1|1:0,4:4:12:.:0|1:1682187_CTG_C:180,12,0:1682187:0,0,3,1 +chrX 1682191 . T C 150 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=31.86;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.46;QD=45.00;SOR=1.609;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:20:35:15:.:.:0,35 1|1:0,4:4:12:.:0|1:1682187_CTG_C:180,12,0:1682187:0,0,3,1 +chrX 1682201 . C CTCTT,CTCTCTCTTTCTCTCTT 582.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=4,0;AS_QD=29.48,23.36;BaseQRankSum=1.282;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=3.979;MQ=56.96;MQRankSum=0;QD=124.40;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.447;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:20:35:15:0,35,35 1/1:1,4,0:5:22:.:622,22,0,212,32,443:0,1,3,1 +chrX 1682231 . C T,CTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT 51 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,2;AS_QD=0.00,3.52;BaseQRankSum=-0.95;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.132;MQ=58.30;MQRankSum=0.463;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.382;SOR=2.147;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:21,0,2:23:81:.:81,82,0:11,10,2,0 0/0:.:43:0:43:0,0,313,0,313,313 +chrX 1682321 . CTCTTTCTCTCTT C 626.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=20.18;BaseQRankSum=1.005;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=0;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.554;SOR=0.804;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1255 0/1:16,17:33:99:.:666,0,588:8,8,8,9 +chrX 1682460 . T C 664 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.39;BaseQRankSum=-0.156;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.354;MQ=59.76;MQRankSum=-0.964;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.55;SOR=0.356;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1255 0/1:28,28:56:99:.:694,0,723:9,19,12,16 +chrX 1682497 . G A 2148 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=20.17;BaseQRankSum=-0.682;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.303;MQ=59.74;MQRankSum=0.251;QD=20.17;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=0.753;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,26:46:99:184,0:11,9,13,13 1/1:0,62:62:99:1994,185,0:0,0,27,35 +chrX 1684243 . T C 3922 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.87;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.87;SOR=0.793;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2073,0:0,0,30,34 1/1:0,60:60:99:1879,178,0:0,0,29,31 +chrX 1684327 . C A 1044 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=16.52;BaseQRankSum=-0.117;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.058;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.52;ReadPosRankSum=-2.237;SOR=0.475;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1388 0/1:27,38:65:99:.:1074,0,684:11,16,18,20 +chrX 1684781 . C A 698 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=7.21;BaseQRankSum=1.756;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.605;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.995;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,32:58:99:248,0:12,14,15,17 0/1:24,19:43:99:480,0,705:11,13,5,14 +chrX 1685001 . G A 689 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.89;BaseQRankSum=-0.239;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.394;MQ=41.66;MQRankSum=-0.614;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.131;SOR=1.182;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,284 0/1:37,29:66:99:.:719,0,978:19,18,18,11 +chrX 1685113 . G A 811 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.55;BaseQRankSum=0.977;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=2.029;MQ=45.23;MQRankSum=0.165;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.716;SOR=0.917;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,284 0/1:35,32:67:99:.:841,0,877:18,17,14,18 +chrX 1685548 . A G 891 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.17;BaseQRankSum=0.157;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.942;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.527;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,284 0/1:31,34:65:99:.:921,0,818:17,14,17,17 +chrX 1686004 . G T 426 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.13;BaseQRankSum=1.408;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.580;MQ=42.74;MQRankSum=-3.785;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.598;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,284 0/1:28,17:45:99:.:456,0,793:12,16,9,8 +chrX 1686635 . C T 1066 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=9.06;BaseQRankSum=1.348;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.308;MQ=59.90;MQRankSum=1.093;QD=9.06;ReadPosRankSum=2.074;SOR=0.678;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,37:66:99:293,0:13,16,19,18 0/1:26,29:55:99:803,0,673:12,14,16,13 +chrX 1686687 . T C 984 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=8.59;BaseQRankSum=-0.984;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.073;SOR=0.721;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,35:61:99:237,0:14,12,19,16 0/1:27,30:57:99:777,0,708:15,12,17,13 +chrX 1687285 . T TAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAA 784.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=19,1;AS_QD=24.24,2.88;BaseQRankSum=-1.085;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.38;MQRankSum=-2.087;QD=23.54;ReadPosRankSum=0.474;SOR=0.582;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,2,1:18:19:65,0,19:7,8,2,1 1/1:0,17,0:17:51:759,51,0,760,51,760:0,0,8,9 +chrX 1687494 . T C 342 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=13.29;BaseQRankSum=-2.214;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.41;MQRankSum=-0.343;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.406;SOR=0.941;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:20:42:0,20 0/1:13,15:28:99:.:372,0,368:7,6,9,6 +chrX 1687579 . C CAAAAA,CAAAAAA,CAAAAAAA,CAAAAAAAA 1028.97 . AC=0,1,1,0;AF=0.00,0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,7,2,0;AS_QD=29.60,31.50,35.55,32.63;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.82;QD=118.67;SOR=2.093;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:20:42:0,20,20,20,20 2/3:0,0,7,2,0:9:65:.:1068,574,511,143,125,68,165,142,0,90,532,338,65,141,468:0,0,7,2 +chrX 1687593 . A AT 271.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=7.23;BaseQRankSum=-0.23;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.661;MQ=58.74;MQRankSum=2.717;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.596;SOR=0.382;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,27:43:99:.:311,0:6,10,13,14 0/0:.:30:63:30:0,63,909 +chrX 1687599 . C A 475 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.30;BaseQRankSum=0.324;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.453;MQ=57.40;MQRankSum=-1.551;QD=15.30;ReadPosRankSum=-1.498;SOR=1.230;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,158 0/1:12,21:33:99:.:505,0,241:6,6,13,8 +chrX 1687637 . A G 1111 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=22.37;BaseQRankSum=0.377;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.95;MQRankSum=-1.516;QD=22.37;ReadPosRankSum=0.19;SOR=0.824;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:99:56:.:.:0,158 0|1:22,29:51:99:.:0|1:1687637_A_G:1141,0,826:1687637:13,9,18,11 +chrX 1687651 . G A 1289 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=23.98;BaseQRankSum=3.18;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.13;MQRankSum=-1.419;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.765;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:99:56:.:.:0,158 0|1:22,33:55:99:.:0|1:1687637_A_G:1319,0,824:1687637:13,9,20,13 +chrX 1687655 . A G 1247 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=23.65;BaseQRankSum=-0.217;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.11;MQRankSum=-1.441;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.846;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:99:56:.:.:0,158 0|1:22,32:54:99:.:0|1:1687637_A_G:1277,0,827:1687637:13,9,20,12 +chrX 1687804 . A G 816 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=6.31;BaseQRankSum=0.807;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.552;SOR=0.641;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,33:62:99:144,0:12,17,14,19 0/1:43,29:72:99:702,0,1238:25,18,17,12 +chrX 1688102 . T G 2748 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=22.05;BaseQRankSum=2.731;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.925;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.05;ReadPosRankSum=2.069;SOR=0.761;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,27:48:99:284,0:11,10,14,13 1/1:0,78:78:99:2494,234,0:0,0,35,43 +chrX 1688173 . T A 1145 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=15.88;BaseQRankSum=-1.142;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=3.171;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.724;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1717 0/1:32,42:74:99:.:1175,0,860:14,18,23,19 +chrX 1688285 . C T 1223 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=9.71;BaseQRankSum=2.007;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=1.390;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.861;SOR=0.830;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,37:63:99:423,0:13,13,26,11 0/1:35,31:66:99:830,0,923:20,15,13,18 +chrX 1688516 . C A 2439 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=19.60;BaseQRankSum=-0.578;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.856;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.08;SOR=0.591;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,35:57:99:377,0:9,13,16,19 1/1:1,68:69:99:2092,171,0:1,0,32,36 +chrX 1689117 . G A 816 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.67;BaseQRankSum=0.813;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.775;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,334 0/1:23,31:54:99:.:846,0,538:7,16,9,22 +chrX 1689187 . CAA C 969.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=23.47;BaseQRankSum=0.351;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=5.136;MQ=59.91;MQRankSum=-0.761;QD=23.47;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.207;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,334 0|1:17,26:43:99:.:0|1:1689187_CAA_C:1009,0,623:1689187:3,14,9,17 +chrX 1689197 . A T 1000 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=21.91;BaseQRankSum=-1.047;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.202;MQ=59.90;MQRankSum=-0.818;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.614;SOR=0.459;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,334 0|1:20,27:47:99:.:0|1:1689187_CAA_C:1030,0,697:1689187:6,14,10,17 +chrX 1689231 . C T 757 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.69;BaseQRankSum=2.113;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.528;MQ=58.78;MQRankSum=0.476;QD=12.69;ReadPosRankSum=2.045;SOR=0.597;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,334 0/1:34,28:62:99:.:787,0,931:20,14,13,15 +chrX 1689531 . AATTTATTTTTT A 483.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.67;BaseQRankSum=1.485;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=6.230;MQ=58.29;MQRankSum=0.249;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.184;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,334 0/1:27,22:49:99:.:523,0,993:8,19,11,11 +chrX 1689659 . T C 610 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.64;BaseQRankSum=0.022;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.037;MQ=51.16;MQRankSum=-0.147;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.941;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,334 0/1:29,26:55:99:.:640,0,734:15,14,15,11 +chrX 1689818 . G A 711 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=8.42;BaseQRankSum=0.978;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.735;MQ=59.45;MQRankSum=1.423;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.512;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,27:47:99:204,0:5,15,9,18 0/1:22,19:41:99:537,0,631:12,10,12,7 +chrX 1690094 . C T 927 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=15.19;BaseQRankSum=0.148;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=3.468;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.677;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,234 0/1:28,35:63:99:.:957,0,724:12,16,19,16 +chrX 1690422 . A AAAT 930.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=20.21;BaseQRankSum=-1.292;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=6.021;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.229;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,234 0/1:23,25:48:99:.:970,0,873:7,16,12,13 +chrX 1690711 . G GGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 768.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.19;BaseQRankSum=-0.691;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=6.062;MQ=58.81;MQRankSum=-1.511;QD=17.19;ReadPosRankSum=-1.671;SOR=0.698;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,234 0|1:24,23:47:99:.:0|1:1690711_G_GGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT:808,0,902:1690711:15,9,10,13 +chrX 1690715 . G T 527 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=14.28;BaseQRankSum=-0.84;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.943;MQ=58.45;MQRankSum=-2.087;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.505;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,234 0|1:24,15:39:99:.:0|1:1690711_G_GGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT:557,0,925:1690711:15,9,7,8 +chrX 1690893 . ATTAT A 527.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=17.72;BaseQRankSum=0;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.340;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.682;SOR=0.976;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,234 0/1:17,15:32:99:.:567,0,668:9,8,9,6 +chrX 1690935 . C T 558 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.31;BaseQRankSum=-0.301;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.381;SOR=0.866;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,234 0/1:30,22:52:99:.:588,0,866:22,8,17,5 +chrX 1691468 . CAAGG C 753.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=16.87;BaseQRankSum=0.346;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.820;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,234 0|1:26,21:47:99:.:0|1:1691468_CAAGG_C:793,0,1029:1691468:14,12,12,9 +chrX 1691472 . G GCCTT 753.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=16.87;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.820;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,234 0|1:26,21:47:99:.:0|1:1691468_CAAGG_C:793,0,1029:1691468:14,12,12,9 +chrX 1692360 . A G 716 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=6.49;BaseQRankSum=-0.668;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.484;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.864;SOR=0.672;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,31:58:74:74,0:13,14,16,15 0/1:30,27:57:99:672,0,862:14,16,14,13 +chrX 1692396 . A G 712 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=5.54;BaseQRankSum=-1.908;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.294;SOR=0.693;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,37:71:9:9,0:15,19,18,19 0/1:33,30:63:99:733,0,948:16,17,13,17 +chrX 1692440 . G T 679 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=5.29;BaseQRankSum=0.214;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.644;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,37:73:39:39,0:20,16,22,15 0/1:34,27:61:99:670,0,898:13,21,9,18 +chrX 1692563 . C CA 1262.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=13.71;BaseQRankSum=-0.792;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.449;SOR=0.602;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,32:54:99:246,0:13,9,17,15 1/1:0,41:41:99:1056,123,0:0,0,24,17 +chrX 1692612 . C T 1832 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=16.93;BaseQRankSum=-0.23;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.295;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.353;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,36:63:99:278,0:18,9,18,18 1/1:0,47:47:99:1584,141,0:0,0,28,19 +chrX 1692758 . G T 627 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.93;BaseQRankSum=-1.999;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.93;ReadPosRankSum=-1.716;SOR=0.560;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,221 0|1:26,18:44:99:.:0|1:1692758_G_T:657,0,1007:1692758:14,12,9,9 +chrX 1692761 . C T 606 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.79;BaseQRankSum=0.66;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.194;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=0.686;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,221 0|1:26,17:43:99:.:0|1:1692758_G_T:636,0,1010:1692758:14,12,8,9 +chrX 1692833 . A G 535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.87;BaseQRankSum=-1.878;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=10.058;MQ=58.12;MQRankSum=0.883;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.873;SOR=1.878;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,221 0/1:16,22:38:99:.:565,0,432:7,9,16,6 +chrX 1692942 . T A 428 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=4.92;BaseQRankSum=0.166;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.705;MQ=59.65;MQRankSum=0.772;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.909;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,28:52:99:125,0:11,13,10,18 0/1:27,14:41:99:333,0,815:11,16,6,8 +chrX 1693002 . AT A 2002.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=22.20;BaseQRankSum=-1.045;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.335;MQ=59.83;MQRankSum=0.062;QD=22.20;ReadPosRankSum=2.061;SOR=0.565;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1433,0:0,0,21,25 0/1:22,24:46:99:609,0,537:13,9,12,12 +chrX 1693221 . A G 590 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.42;BaseQRankSum=-0.266;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.754;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,228 0/1:19,24:43:99:.:620,0,482:10,9,13,11 +chrX 1693404 . CT C 658.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=6.29;BaseQRankSum=-0.439;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;MQRankSum=-0.026;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.633;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,27:55:3:3,0:16,12,17,10 0/1:25,31:56:99:695,0,480:15,10,16,15 +chrX 1693487 . C T 500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.60;BaseQRankSum=-1.077;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.964;MQ=59.47;MQRankSum=1.295;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.549;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,199 0/1:28,22:50:99:.:530,0,759:18,10,10,12 +chrX 1693854 . A C 1225 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=9.30;BaseQRankSum=0.957;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=12.469;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.233;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,42:70:99:462,0:8,20,21,21 0/1:35,30:65:99:793,0,917:13,22,15,15 +chrX 1693892 . G A 1310 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=9.85;BaseQRankSum=-0.289;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=3.109;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.332;SOR=0.456;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,44:70:99:586,0:9,17,19,25 0/1:34,32:66:99:754,0,914:16,18,18,14 +chrX 1693906 . C T 1137 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=8.28;BaseQRankSum=-0.308;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.625;MQ=59.88;MQRankSum=0;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.574;SOR=0.758;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,45:75:99:477,0:9,21,16,29 0/1:38,28:66:99:690,0,1038:20,18,14,14 +chrX 1694071 . G A 1074 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=9.60;BaseQRankSum=2.684;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=0.053;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.723;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,28:54:99:145,0:18,8,20,8 0/1:27,34:61:99:959,0,660:15,12,19,15 +chrX 1694601 . T G 3630 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=30.76;BaseQRankSum=1.002;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.764;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=30.76;ReadPosRankSum=-2.077;SOR=0.602;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2477,0:.:0,0,30,26 0|1:32,31:63:99:0|1:1694601_T_G:1183,0,1193:1694601:17,15,14,17 +chrX 1694606 . T C 3663 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=30.78;BaseQRankSum=-0.83;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.78;ReadPosRankSum=-1.922;SOR=0.623;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2478,0:.:0,0,30,26 0|1:32,32:64:99:0|1:1694601_T_G:1215,0,1190:1694601:17,15,15,17 +chrX 1694792 . C G 1121 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=8.16;BaseQRankSum=-0.936;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=6.331;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=1.185;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,48:82:99:345,0:17,17,31,17 0/1:29,30:59:99:806,0,786:17,12,19,11 +chrX 1694962 . T A 940 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=7.64;BaseQRankSum=0.192;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=8.041;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.842;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,33:63:99:105,0:15,15,14,19 0/1:32,32:64:99:865,0,866:20,12,14,18 +chrX 1695046 . T G 291 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=4.28;BaseQRankSum=-0.096;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=2.446;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.387;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1718 0/1:58,17:75:99:.:321,0,1670:39,19,10,7 +chrX 1695154 . T C 218 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=4.77;BaseQRankSum=-0.767;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=5.796;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.713;SOR=1.536;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,30:52:99:.:248,0:11,11,20,10 0/0:.:69:99:69:0,120,1800 +chrX 1695326 . A G 2766 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=23.11;BaseQRankSum=2.728;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.873;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.914;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,58:59:99:1911,0:0,1,14,44 0/1:26,36:62:99:885,0,687:10,16,17,19 +chrX 1695381 . T C 2737 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=22.87;BaseQRankSum=-1.451;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.804;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.746;SOR=0.543;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1959,0:0,0,25,36 0/1:31,29:60:99:808,0,895:11,20,11,18 +chrX 1695394 . A G 2945 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=22.88;BaseQRankSum=-2.295;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=2.634;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.88;ReadPosRankSum=0.43;SOR=0.483;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2122,0:0,0,29,37 0/1:32,32:64:99:853,0,920:12,20,14,18 +chrX 1695486 . T C 2228 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=20.34;BaseQRankSum=-0.41;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.650;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.948;SOR=0.815;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1583,0:0,0,29,21 0/1:35,26:61:99:675,0,1003:17,18,12,14 +chrX 1695848 . A G 2157 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=24.30;BaseQRankSum=1.138;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.300;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=0.962;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1676,0:0,0,30,25 0/1:17,18:35:99:511,0,456:8,9,12,6 +chrX 1695918 . C CTT 1431.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=22.98;BaseQRankSum=1.118;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=22.538;MQ=59.65;MQRankSum=-0.39;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.228;SOR=1.442;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1011,0:0,0,24,14 0/1:5,21:26:74:460,0,74:0,5,16,5 +chrX 1695972 . A C 217 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=7.48;BaseQRankSum=-0.911;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=1.423;MQ=59.86;MQRankSum=-0.693;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.561;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:12,21:33:99:.:247,0:5,7,11,10 0/0:.:24:28:19:0,28,567 +chrX 1696118 . T C 739 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=9.15;BaseQRankSum=0.707;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=4.208;MQ=58.32;MQRankSum=0;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.744;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,24:44:99:159,0:9,11,9,15 0/1:17,23:40:99:610,0,451:12,5,12,11 +chrX 1696717 . GTAATA G 626.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.57;BaseQRankSum=-2.088;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=7.966;MQ=57.17;MQRankSum=-1.184;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=0.368;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1080 0/1:44,19:63:99:.:666,0,1790:14,30,10,9 +chrX 1696810 . C T 1465 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=19.93;BaseQRankSum=-1.036;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=23.446;MQ=51.02;MQRankSum=-4.15;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=3.360;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1108,0:0,0,3,31 0/1:25,16:41:99:387,0,726:10,15,2,14 +chrX 1696897 . C G 818 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.13;BaseQRankSum=1.137;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=45.303;MQ=41.57;MQRankSum=-1.276;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.275;SOR=6.264;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:722,0:0,0,0,21 0/1:32,7:39:99:126,0,905:14,18,0,7 +chrX 1698997 . G A 334 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.33;BaseQRankSum=2.025;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=5.357;MQ=42.14;MQRankSum=-2.76;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=1.863;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:12:35:1:.:.:0,35 0|1:27,12:39:99:.:1|0:1698985_GTAATA_G:364,0,1057:1698985:13,14,3,9 +chrX 1699011 . C T 225 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=7.29;BaseQRankSum=1.744;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=1.547;MQ=44.85;MQRankSum=-2.274;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.985;SOR=1.085;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:12:35:1:.:.:0,35 0|1:27,8:35:99:.:1|0:1698985_GTAATA_G:255,0,1110:1698985:13,14,3,5 +chrX 1699012 . A G 225 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=7.29;BaseQRankSum=0.27;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=1.547;MQ=44.85;MQRankSum=-2.274;QD=7.29;ReadPosRankSum=-2.122;SOR=1.085;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:12:35:1:.:.:0,35 0|1:27,8:35:99:.:1|0:1698985_GTAATA_G:255,0,1110:1698985:13,14,3,5 +chrX 1699137 . A C 861 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.36;BaseQRankSum=-0.272;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.019;MQ=57.48;MQRankSum=-3.363;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.745;SOR=0.514;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:12:65:0,12 0/1:24,34:58:99:.:891,0,624:14,10,18,16 +chrX 1699176 . C G 1282 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=23.02;BaseQRankSum=-0.273;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.037;MQ=58.25;MQRankSum=-2.464;QD=23.02;ReadPosRankSum=0.73;SOR=0.481;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,139 0|1:23,34:57:99:.:0|1:1699176_C_G:1312,0,796:1699176:13,10,17,17 +chrX 1699190 . G C 1437 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=24.45;BaseQRankSum=-0.217;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=1.007;MQ=58.39;MQRankSum=-2.105;QD=24.45;ReadPosRankSum=-0.22;SOR=0.540;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,139 0|1:22,38:60:99:.:0|1:1699176_C_G:1467,0,777:1699176:12,10,19,19 +chrX 1700528 . T A 2573 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=21.87;BaseQRankSum=-0.333;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=21.87;ReadPosRankSum=0.599;SOR=0.631;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:1968,0:0,0,32,32 0/1:29,26:55:99:635,0,718:14,15,13,13 +chrX 1701065 . G A 570 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=5.83;BaseQRankSum=1.986;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.722;SOR=0.678;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,29:56:99:145,0:12,15,15,14 0/1:29,18:47:99:455,0,842:18,11,10,8 +chrX 1701094 . G GTT,T 567 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=35,5;AS_QD=10.47,0.89;BaseQRankSum=1.363;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=14.782;MQ=59.07;MQRankSum=-1.114;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.589;SOR=0.666;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:10,24,0:34:99:333,0,629:1,9,15,9 0/1:12,11,5:28:99:264,0,284,240,247,1304:5,7,8,8 +chrX 1701382 . GC G 1041.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=17.16;BaseQRankSum=-1.145;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=5.123;MQ=59.60;MQRankSum=0;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.264;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:33:55:0,33 0/1:29,34:63:99:.:1081,0,894:19,10,17,17 +chrX 1701640 . A AGTGGCCTCTGCCAGGTGTCTCCAGTGTTGATGACTCAGCGGAG 1146.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=17.70;BaseQRankSum=1.809;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.706;MQ=57.70;MQRankSum=0.346;QD=17.70;ReadPosRankSum=-2.039;SOR=1.154;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:12,28:40:99:.:.:651,0:.:8,4,8,20 0|1:9,18:27:99:0|1:1701640_A_AGTGGCCTCTGCCAGGTGTCTCCAGTGTTGATGACTCAGCGGAG:535,0,301:1701640:3,6,10,8 +chrX 1701665 . C T 276 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=8.05;BaseQRankSum=1.176;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=3.368;MQ=57.90;MQRankSum=-0.964;QD=8.05;ReadPosRankSum=3.832;SOR=1.609;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:99:51:.:.:0,203 0|1:28,10:38:99:.:1|0:1701640_A_AGTGGCCTCTGCCAGGTGTCTCCAGTGTTGATGACTCAGCGGAG:306,0,934:1701640:14,14,3,7 +chrX 1701679 . C CGGAGGTGGCCTCTGCCAGGTGTCTCCAGCATTGATG 281.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=8.23;BaseQRankSum=1.27;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=5.357;MQ=58.27;MQRankSum=-1.878;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.509;SOR=1.863;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:99:51:.:.:0,203 0|1:27,12:39:99:.:1|0:1701640_A_AGTGGCCTCTGCCAGGTGTCTCCAGTGTTGATGACTCAGCGGAG:321,0,949:1701640:13,14,3,9 +chrX 1701681 . C CTCAGCGG 283.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=8.50;BaseQRankSum=1.229;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=7.497;MQ=58.36;MQRankSum=-1.827;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.005;SOR=1.981;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:99:51:.:.:0,203 0|1:26,12:38:99:.:1|0:1701640_A_AGTGGCCTCTGCCAGGTGTCTCCAGTGTTGATGACTCAGCGGAG:323,0,918:1701640:13,13,3,9 +chrX 1702030 . G A 376 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=12;AS_QD=31.23;BaseQRankSum=-0.491;DP=23;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=34.36;MQRankSum=-0.134;QD=31.23;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.368;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,12:13:99:.:406,0:1,0,7,5 ./.:.:10:.:10:0,0,0 +chrX 1702038 . T C 322 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=10;AS_QD=32.00;BaseQRankSum=2.021;DP=22;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=32.06;MQRankSum=-0.159;QD=32.00;ReadPosRankSum=0.316;SOR=0.693;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,10:11:99:.:352,0:1,0,7,3 ./.:.:11:.:11:0,0,0 +chrX 1702066 . C T 249 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=9;AS_QD=19.93;BaseQRankSum=-1.198;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=2.363;MQ=35.14;MQRankSum=0.322;QD=19.93;ReadPosRankSum=3.481;SOR=1.609;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:5,9:14:99:.:279,0:3,2,7,2 ./.:.:13:.:13:0,0,0 +chrX 1702169 . G C 522 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.81;BaseQRankSum=0.923;DP=32;ExcessHet=0.0000;FS=1.951;MQ=46.39;MQRankSum=1.426;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.9;SOR=1.609;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,15:18:99:361,0:2,1,11,4 0/1:3,10:13:42:191,0,42:1,2,6,4 +chrX 1703719 . T A 560 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.93;BaseQRankSum=-1.728;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=5.483;MQ=58.44;MQRankSum=-2.62;QD=10.93;ReadPosRankSum=2.36;SOR=1.206;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:40:48:0,40 0/1:30,24:54:99:.:590,0,840:16,14,9,15 +chrX 1703759 . T TTA 1162.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=19.39;BaseQRankSum=0.066;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.30;MQRankSum=-2.033;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.07;SOR=0.824;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:40:48:0,40 0/1:31,31:62:99:.:1202,0,1133:14,17,13,18 +chrX 1703857 . C A 284 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=8.26;BaseQRankSum=1.592;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=7.684;MQ=52.57;MQRankSum=-0.052;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=1.498;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:40:48:0,40 0/1:25,13:38:99:.:314,0,630:10,15,9,4 +chrX 1704218 . G A 412 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=10.78;BaseQRankSum=-0.103;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.709;MQ=40.62;MQRankSum=-3.463;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.999;SOR=0.747;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:40:48:0,40 0/1:23,18:41:99:.:442,0,616:13,10,8,10 +chrX 1704408 . A C 622 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.31;BaseQRankSum=0.094;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.093;MQ=44.59;MQRankSum=-3.109;QD=13.31;ReadPosRankSum=1.551;SOR=0.639;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:40:48:0,40 0/1:24,25:49:99:.:652,0,623:13,11,12,13 +chrX 1705247 . T G 276 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=9.27;BaseQRankSum=1.136;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=44.19;MQRankSum=-2.63;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.194;SOR=0.573;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:40:48:.:.:0,40 0|1:24,9:33:99:.:0|1:1705247_T_G:306,0,970:1705247:14,10,5,4 +chrX 1705251 . C T 270 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=8.57;BaseQRankSum=-1.297;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.01;MQRankSum=-2.794;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.472;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:40:48:.:.:0,40 0|1:26,9:35:99:.:0|1:1705247_T_G:300,0,1033:1705247:16,10,5,4 +chrX 1705584 . C G 881 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.80;BaseQRankSum=3.125;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.968;MQ=47.45;MQRankSum=-4.372;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.930;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:40:48:0,40 0/1:32,34:66:99:.:911,0,794:19,13,22,12 +chrX 1706088 . G A 118 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=5.69;BaseQRankSum=1.868;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.69;MQRankSum=-2.582;QD=5.69;ReadPosRankSum=2.401;SOR=0.871;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:40:48:0,40 0/1:19,7:26:99:.:148,0,496:10,9,3,4 +chrX 1706452 . T G 998 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=10.82;BaseQRankSum=-0.392;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.654;MQ=48.64;MQRankSum=-1.002;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.554;SOR=0.824;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,26:50:94:.:.:94,0:.:9,15,15,11 0|1:21,24:45:99:0|1:1706452_T_G:934,0,798:1706452:13,8,12,12 +chrX 1706453 . C T 998 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=10.82;BaseQRankSum=-0.26;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.654;MQ=48.64;MQRankSum=-1.002;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.67;SOR=0.824;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,26:50:94:.:.:94,0:.:9,15,15,11 0|1:21,24:45:99:0|1:1706452_T_G:934,0,798:1706452:13,8,12,12 +chrX 1706606 . A G 729 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=7.23;BaseQRankSum=1.081;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=9.254;MQ=52.83;MQRankSum=-3.906;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=0.741;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,29:57:80:80,0:15,13,16,13 0/1:22,26:48:99:679,0,590:5,17,15,11 +chrX 1706689 . A C 3368 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=29.81;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.42;QD=29.81;SOR=0.802;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1739,0:0,0,29,31 1/1:0,54:54:99:1659,161,0:0,0,31,23 +chrX 1707110 . G GT 98.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=4.06;BaseQRankSum=0.836;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.46;MQRankSum=-3.146;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.859;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:37:42:0,37 0/1:27,7:34:99:.:138,0,862:13,14,3,4 +chrX 1707394 . T C 462 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.93;BaseQRankSum=-0.381;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.143;MQ=47.28;MQRankSum=-1.017;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=0.495;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:37:42:0,37 0/1:25,20:45:99:.:492,0,683:14,11,10,10 +chrX 1707777 . A G 469 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.34;BaseQRankSum=-0.213;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=4.455;MQ=44.91;MQRankSum=-4.735;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.507;SOR=1.476;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:37:42:0,37 0/1:24,20:44:99:.:499,0,682:13,11,14,6 +chrX 1708125 . C T 818 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=-1.11;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.99;MQRankSum=0.381;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.762;SOR=0.576;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:37:42:0,37 0/1:20,33:53:99:.:848,0,497:9,11,16,17 +chrX 1708175 . C G 659 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.31;BaseQRankSum=0.616;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.76;MQRankSum=1.817;QD=15.31;ReadPosRankSum=2.185;SOR=0.547;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:37:42:0,37 0/1:21,24:45:99:.:689,0,553:7,14,9,15 +chrX 1708415 . G T 306 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=12.92;BaseQRankSum=0.555;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=1.721;MQ=40.31;MQRankSum=0.494;QD=12.92;ReadPosRankSum=-2.437;SOR=0.260;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:37:42:.:.:0,37 0|1:13,13:26:99:.:0|1:1708415_G_T:336,0,364:1708415:3,10,5,8 +chrX 1708814 . A G 464 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=8.67;BaseQRankSum=0.011;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.040;MQ=54.32;MQRankSum=-2.805;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.01;SOR=0.693;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:37:42:0,37 0/1:36,21:57:99:.:494,0,965:17,19,11,10 +chrX 1708831 . G A 361 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=6.86;BaseQRankSum=-0.497;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=3.796;MQ=54.60;MQRankSum=4.028;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.639;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,35:57:99:.:391,0:9,13,19,16 0/0:.:45:90:45:0,90,1232 +chrX 1709012 . G A 3498 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=31.66;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=35.13;QD=44.10;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1834,0:.:0,0,23,18 1|1:0,39:39:99:0|1:1709012_G_A:1694,117,0:1709012:0,0,19,20 +chrX 1709018 . G T 3509 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.59;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=34.79;QD=44.24;SOR=0.850;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,43:43:99:.:.:1904,0:.:0,0,25,18 1|1:0,37:37:99:0|1:1709012_G_A:1635,111,0:1709012:0,0,18,19 +chrX 1709118 . G C 320 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=9.72;BaseQRankSum=0.614;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=35.20;MQRankSum=-0.988;QD=9.72;ReadPosRankSum=2.248;SOR=0.724;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:85:63:0,85 0/1:21,15:36:99:.:350,0,518:10,11,7,8 +chrX 1709534 . C T 1005 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.92;BaseQRankSum=0.012;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=9.026;MQ=59.94;MQRankSum=-0.839;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.239;SOR=1.802;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:85:63:0,85 0/1:28,37:65:99:.:1035,0,734:14,14,11,26 +chrX 1709602 . G A 1655 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=26.33;BaseQRankSum=-1.179;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.288;MQ=59.94;MQRankSum=-0.691;QD=26.33;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=1.161;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:85:63:.:.:0,85 0|1:22,42:64:99:.:0|1:1709602_G_A:1685,0,786:1709602:10,12,15,27 +chrX 1709609 . G C 1652 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=25.88;BaseQRankSum=-1.242;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.671;MQ=59.94;MQRankSum=-0.708;QD=25.88;ReadPosRankSum=-1.697;SOR=1.284;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:85:63:.:.:0,85 0|1:23,42:65:99:.:0|1:1709602_G_A:1682,0,818:1709602:11,12,15,27 +chrX 1709634 . C T 479 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.79;BaseQRankSum=0.401;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.950;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.988;SOR=0.324;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:85:63:0,85 0/1:32,20:52:99:.:509,0,880:12,20,10,10 +chrX 1709893 . T G 740 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=7.00;BaseQRankSum=-0.412;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=7.00;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.693;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,34:62:99:145,0:15,13,16,18 0/1:24,24:48:99:625,0,670:11,13,13,11 +chrX 1710231 . G A 894 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.15;BaseQRankSum=0.109;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.752;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:19:68:0,19 0/1:27,34:61:99:.:924,0,691:13,14,18,16 +chrX 1710315 . T C 997 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=8.42;BaseQRankSum=-2.052;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.303;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.35;SOR=0.446;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,38:63:99:301,0:16,9,20,18 0/1:29,30:59:99:726,0,791:15,14,14,16 +chrX 1710616 . GATAA G 1117.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=20.66;BaseQRankSum=-1.127;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.995;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.66;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.560;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:42:26:0,42 0/1:26,30:56:99:.:1157,0,968:12,14,15,15 +chrX 1711234 . CT C 40.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=2.86;BaseQRankSum=-0.711;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.690;MQ=58.01;MQRankSum=-1.639;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=1.080;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:42:26:0,42 0/1:20,8:28:80:.:80,0,294:11,9,3,5 +chrX 1711528 . G A 721 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.41;BaseQRankSum=1.547;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.274;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=1.025;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:42:26:0,42 0/1:27,29:56:99:.:751,0,596:14,13,12,17 +chrX 1711683 . CTT C 202.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=7.12;BaseQRankSum=-2.068;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=15.933;MQ=58.77;MQRankSum=1.038;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.153;SOR=2.436;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:42:26:0,42 0/1:23,11:34:99:.:242,0,545:15,8,2,9 +chrX 1712008 . T TTC 336.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=14.46;BaseQRankSum=-1.347;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.41;SOR=0.195;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:42:26:0,42 0/1:13,13:26:99:.:376,0,386:0,13,1,12 +chrX 1712103 . CTCT C 711.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.47;BaseQRankSum=-0.171;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=4.388;MQ=59.53;MQRankSum=0;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.058;SOR=1.143;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:42:26:0,42 0/1:22,21:43:99:.:751,0,861:10,12,13,8 +chrX 1712111 . AT A,ATT 319.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,15;AS_QD=20.44,23.93;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=11.58;SOR=1.044;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,16,15:31:32:.:359,32,0:0,0,18,13 0/0:.:47:52:47:0,52,1220,52,1220,1220 +chrX 1712185 . A G 44 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=2.06;BaseQRankSum=-1.388;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.157;MQ=59.55;MQRankSum=-0.839;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.494;SOR=1.356;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,20:36:74:.:74,0:10,6,15,5 0/0:.:47:52:47:0,52,1220 +chrX 1712274 . ATTTTTTT A 219.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=13.63;BaseQRankSum=-1.0;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=4.775;MQ=57.70;MQRankSum=1.465;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.39;SOR=2.066;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:42:99:42:0,190 0/1:12,7:19:99:.:259,0,433:5,7,1,6 +chrX 1712581 . C CTTCT 4543.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=25.11;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=44.07;SOR=0.813;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:2397,0:0,0,24,31 1/1:0,49:49:99:2186,147,0:0,0,25,24 +chrX 1712610 . TTC T 951.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=20.22;BaseQRankSum=0.33;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.765;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1158 0/1:22,27:49:99:.:991,0,766:11,11,14,13 +chrX 1713008 . A G 825 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=7.31;BaseQRankSum=0.124;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=4.470;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.547;SOR=0.782;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,39:65:99:346,0:15,11,21,18 0/1:31,21:52:99:509,0,826:16,15,6,15 +chrX 1713081 . A C 935 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=8.69;BaseQRankSum=0.11;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.720;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=0.785;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,36:63:99:231,0:18,9,22,14 0/1:22,26:48:99:734,0,601:11,11,16,10 +chrX 1713111 . T C 825 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.25;BaseQRankSum=-0.132;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.628;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,114 0/1:28,32:60:99:.:855,0,743:18,10,20,12 +chrX 1713896 . G A 788 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.58;BaseQRankSum=0.727;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.459;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=1.239;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,114 0/1:34,31:65:99:.:818,0,892:18,16,20,11 +chrX 1714143 . A G 1052 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=16.91;BaseQRankSum=-0.809;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.045;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.91;ReadPosRankSum=-1.349;SOR=0.976;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,114 0|1:34,30:64:99:.:0|1:1714143_A_G:1082,0,1316:1714143:17,17,13,17 +chrX 1714153 . G A 1033 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.15;BaseQRankSum=0.879;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.962;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.417;SOR=0.862;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,114 0|1:34,28:62:99:.:0|1:1714143_A_G:1063,0,1343:1714143:16,18,12,16 +chrX 1714157 . A G 1033 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.15;BaseQRankSum=0.904;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.962;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.861;SOR=0.862;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,114 0|1:34,28:62:99:.:0|1:1714143_A_G:1063,0,1343:1714143:16,18,12,16 +chrX 1714245 . G T 708 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.35;BaseQRankSum=1.004;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=2.074;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.623;SOR=0.713;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,114 0/1:37,28:65:99:.:738,0,1000:20,17,13,15 +chrX 1714540 . C G 723 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.07;BaseQRankSum=-0.283;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=4.842;MQ=59.87;MQRankSum=-1.096;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.317;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,114 0/1:38,30:68:99:.:753,0,1037:25,13,16,14 +chrX 1714584 . T C 978 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=10.84;BaseQRankSum=-1.816;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.794;MQ=59.35;MQRankSum=1.826;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.387;SOR=0.572;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,25:41:99:197,0:10,6,12,13 0/1:23,29:52:99:811,0,642:13,10,18,11 +chrX 1714699 . T C 1052 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=9.02;BaseQRankSum=1.361;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=8.884;MQ=59.83;MQRankSum=1.722;QD=9.02;ReadPosRankSum=2.07;SOR=1.454;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,31:53:99:341,0:10,12,12,19 0/1:36,31:67:99:741,0,990:15,21,6,25 +chrX 1714752 . G A 1208 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=10.40;BaseQRankSum=1.977;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=1.193;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.631;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,35:61:99:349,0:12,14,14,21 0/1:26,32:58:99:889,0,660:5,21,9,23 +chrX 1714769 . AAG A 90.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=1.94;BaseQRankSum=0.993;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=1.076;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.622;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,35:67:99:.:130,0:18,14,19,16 0/0:.:63:91:63:0,91,1539 +chrX 1715091 . C A 981 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.31;BaseQRankSum=1.604;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=5.208;MQ=59.93;MQRankSum=1.171;QD=16.31;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.269;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:10:73:0,10 0/1:27,35:62:99:.:1011,0,687:9,18,17,18 +chrX 1715350 . C T 504 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.68;BaseQRankSum=1.499;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.172;MQ=59.67;MQRankSum=-1.184;QD=10.68;ReadPosRankSum=-2.516;SOR=0.976;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,759 0/1:30,20:50:99:.:534,0,831:11,19,6,14 +chrX 1715389 . T C 1575 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=30.28;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.28;SOR=1.287;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,759 1/1:0,53:53:99:.:1605,158,0:0,0,20,33 +chrX 1715522 . C CAAAA 1305.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=29.54;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.81;QD=42.03;SOR=1.284;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,759 1/1:0,32:32:96:.:1345,96,0:0,0,20,12 +chrX 1715734 . A G 2842 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=27.09;BaseQRankSum=-1.232;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.955;MQ=59.71;MQRankSum=1.114;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.717;SOR=0.525;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,61:61:99:.:.:1989,0:.:0,0,23,38 0|1:21,24:45:99:0|1:1715734_A_G:883,0,757:1715734:7,14,10,14 +chrX 1715756 . A G 850 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=19.13;BaseQRankSum=-0.463;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.671;SOR=0.826;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,1471 0|1:22,24:46:99:.:0|1:1715734_A_G:880,0,779:1715734:8,14,8,16 +chrX 1716681 . A ATCTG 5283.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=33.89;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=44.73;SOR=0.853;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:3139,0:0,0,42,28 1/1:0,49:49:99:2184,147,0:0,0,22,27 +chrX 1716825 . A G 598 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.42;BaseQRankSum=-0.796;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.435;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.815;SOR=1.426;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,139 0/1:31,24:55:99:.:628,0,862:16,15,16,8 +chrX 1717353 . T G 4510 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=140;AS_QD=32.43;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.43;SOR=1.054;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2145,0:0,0,42,23 1/1:0,75:75:99:2395,224,0:0,0,39,36 +chrX 1717905 . C CT 444.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=5.20;BaseQRankSum=-0.148;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=6.673;MQ=59.54;MQRankSum=-0.62;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.324;SOR=0.962;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,32:54:99:123,0:11,11,18,14 0/1:18,21:39:99:361,0,331:7,11,13,8 +chrX 1717930 . A C 3610 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=28.75;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;QD=35.00;SOR=0.732;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:2086,0:0,0,30,29 1/1:0,45:45:99:1554,134,0:0,0,21,24 +chrX 1718002 . G A 932 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=-1.995;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.334;MQ=53.93;MQRankSum=0.493;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.855;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1749 0/1:19,36:55:99:.:962,0,465:10,9,16,20 +chrX 1718054 . T C 4505 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=31.47;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.91;QD=37.48;SOR=0.814;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2415,0:0,0,31,32 1/1:0,58:58:99:2120,174,0:0,0,26,32 +chrX 1718057 . C G 557 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.95;BaseQRankSum=0.018;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=7.045;MQ=54.35;MQRankSum=0.663;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.906;SOR=0.677;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,144 0/1:34,25:59:99:.:587,0,854:13,21,14,11 +chrX 1718326 . T C 3946 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=29.89;BaseQRankSum=2.021;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=3.109;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.89;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.320;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2136,0:0,0,33,38 1/1:1,61:62:99:1840,175,0:0,1,35,26 +chrX 1718376 . CATTG C 2121.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=25.18;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.02;SOR=0.866;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,635 1/1:0,48:48:99:.:2161,145,0:0,0,26,22 +chrX 1718763 . G GTA 2603.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=30.03;BaseQRankSum=-0.686;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=11.135;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=30.03;ReadPosRankSum=0.611;SOR=0.741;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1910,0:0,0,22,29 0/1:14,23:37:99:733,0,408:10,4,9,14 +chrX 1719223 . C G 1929 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=16.89;BaseQRankSum=-1.284;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=4.119;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.89;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=0.907;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,31:59:53:53,0:15,13,15,16 1/1:0,57:57:99:1906,171,0:0,0,23,34 +chrX 1719464 . G A 610 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.55;BaseQRankSum=0.437;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.161;SOR=0.656;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,496 0/1:27,24:51:99:.:640,0,711:11,16,10,14 +chrX 1719864 . T TCCTTCTTTC,TCCTTCCTTCTTTC 668.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,14;AS_QD=22.40,29.50;BaseQRankSum=1.562;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.569;MQ=58.61;MQRankSum=-1.759;QD=29.50;ReadPosRankSum=-1.611;SOR=0.412;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:3:49:0,3,3 0/2:10,0,14:24:99:.:708,484,1218,0,439,370:4,6,7,7 +chrX 1719983 . T A 250 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=10.77;BaseQRankSum=1.305;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=3.909;MQ=59.27;MQRankSum=-1.09;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=0.217;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:35:33:0,35 0/1:15,11:26:99:.:280,0,398:3,12,4,7 +chrX 1720038 . TTCCC T 1034.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=26.85;BaseQRankSum=0.571;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=21.779;MQ=59.72;MQRankSum=2.721;QD=26.85;ReadPosRankSum=-1.146;SOR=1.474;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:35:33:0,35 1/1:5,35:40:31:.:1074,31,0:5,0,11,24 +chrX 1720105 . A G 1353 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=16.08;BaseQRankSum=-1.248;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=-1.301;QD=16.08;ReadPosRankSum=-2.546;SOR=0.811;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,23:43:59:59,0:7,13,9,14 1/1:0,43:43:99:1324,127,0:0,0,13,30 +chrX 1720166 . A T 2216 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=22.24;BaseQRankSum=1.363;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.873;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=22.24;ReadPosRankSum=1.182;SOR=0.717;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,27:52:99:.:.:143,0:.:14,11,14,13 1|1:1,48:49:99:0|1:1720166_A_T:2103,102,0:1720166:0,1,21,27 +chrX 1720167 . A C 2216 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=22.24;BaseQRankSum=0.897;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.873;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=22.24;ReadPosRankSum=1.118;SOR=0.717;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,27:52:99:.:.:143,0:.:14,11,14,13 1|1:1,48:49:99:0|1:1720166_A_T:2103,102,0:1720166:0,1,21,27 +chrX 1720226 . ATT A 1669.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=18.18;BaseQRankSum=1.767;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.979;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.501;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,24:46:86:86,0:15,7,15,9 1/1:1,47:48:99:1623,108,0:0,1,27,20 +chrX 1720316 . G A 1618 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.96;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.96;SOR=0.952;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,106 1/1:0,50:50:99:.:1648,150,0:0,0,28,22 +chrX 1720636 . G A 723 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=7.46;BaseQRankSum=2.236;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.590;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.791;SOR=0.864;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,24:45:99:153,0:12,9,12,12 0/1:33,23:56:99:600,0,911:14,19,14,9 +chrX 1720665 . G A 717 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=6.67;BaseQRankSum=2.441;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.574;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.481;SOR=1.115;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,25:51:56:56,0:16,10,15,10 0/1:35,26:61:99:691,0,893:18,17,18,8 +chrX 1721036 . TC T 1542.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=34.39;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.39;SOR=1.085;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1575 1/1:0,46:46:99:.:1582,138,0:0,0,27,19 +chrX 1721637 . G A 1165 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=9.96;BaseQRankSum=3.508;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.697;MQ=59.87;MQRankSum=-0.875;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.396;SOR=0.569;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,31:58:99:270,0:11,16,13,18 0/1:28,34:62:99:925,0,787:10,18,14,20 +chrX 1721808 . T C 884 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.32;BaseQRankSum=1.215;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.523;MQ=58.92;MQRankSum=-0.276;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=1.207;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,458 0/1:24,32:56:99:.:914,0,615:11,13,20,12 +chrX 1721916 . C T 1157 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=10.06;BaseQRankSum=2.746;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;MQRankSum=0.642;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.182;SOR=0.674;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,32:53:99:358,0:9,12,16,16 0/1:35,30:65:99:829,0,842:16,19,12,18 +chrX 1722231 . T C 691 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.42;BaseQRankSum=1.24;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.051;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.551;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,165 0/1:24,26:50:99:.:721,0,624:13,11,13,13 +chrX 1722262 . G A 633 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.11;BaseQRankSum=0.483;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.602;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,165 0/1:23,24:47:99:.:663,0,618:14,9,14,10 +chrX 1722871 . A ATAAATAAG 929.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.71;BaseQRankSum=1.996;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.68;SOR=0.719;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,165 0/1:32,26:58:99:.:969,0,1255:15,17,12,14 +chrX 1723287 . G C 878 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=7.96;BaseQRankSum=0.903;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=6.250;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.96;ReadPosRankSum=0;SOR=1.295;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,34:63:99:178,0:16,13,21,13 0/1:23,28:51:99:730,0,577:15,8,23,5 +chrX 1723373 . G GTAGA 1036.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=20.69;BaseQRankSum=1.785;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.565;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.69;ReadPosRankSum=-1.451;SOR=0.529;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:95:57:0,95 0/1:24,28:52:99:.:1076,0,924:9,15,15,13 +chrX 1723512 . A G 785 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=16.63;BaseQRankSum=-2.419;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.145;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=1.017;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:95:57:0,95 0/1:19,30:49:99:.:815,0,513:9,10,12,18 +chrX 1723797 . TGATA T 1022.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=20.82;BaseQRankSum=0.32;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.82;ReadPosRankSum=2.067;SOR=0.748;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:95:57:0,95 0/1:24,27:51:99:.:1062,0,904:13,11,15,12 +chrX 1723880 . GATAC G 748.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.07;BaseQRankSum=-0.793;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.740;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.846;SOR=1.015;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:95:57:0,95 0/1:34,22:56:99:.:788,0,1124:16,18,13,9 +chrX 1723968 . T C 599 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.48;BaseQRankSum=-0.643;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.626;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.337;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:95:57:0,95 0/1:33,27:60:99:.:629,0,883:12,21,13,14 +chrX 1724072 . A AATAG 991.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.83;BaseQRankSum=-1.678;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.402;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=1.197;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:95:57:.:.:0,95 0|1:25,27:52:99:.:0|1:1724072_A_AATAG:1031,0,969:1724072:12,13,10,17 +chrX 1724100 . T TGATA 5325.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=33.52;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.98;SOR=0.693;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2496,0:.:0,0,27,29 1|1:0,66:66:99:0|1:1724072_A_AATAG:2869,198,0:1724072:0,0,34,32 +chrX 1724160 . C T 307 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=8.02;BaseQRankSum=0.138;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=15.389;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=0.931;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,26:42:99:.:337,0:4,12,16,10 0/0:.:62:69:62:0,69,1683 +chrX 1724685 . C T 278 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=7.33;BaseQRankSum=-0.819;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.492;SOR=0.846;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,26:42:99:.:308,0:8,8,12,14 0/0:.:62:69:62:0,69,1683 +chrX 1724818 . C T 795 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.98;BaseQRankSum=0.516;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.576;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.958;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1458 0/1:28,31:59:99:.:825,0,710:15,13,13,18 +chrX 1725049 . CCTGT C 1171.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=10.72;BaseQRankSum=0.389;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=4.572;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.663;SOR=0.801;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,32:56:99:353,0:11,13,18,14 0/1:33,24:57:99:858,0,1272:15,18,13,11 +chrX 1725326 . T A 703 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.10;BaseQRankSum=0.682;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.379;MQ=59.89;MQRankSum=-0.924;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.321;SOR=1.054;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1563 0/1:25,27:52:99:.:733,0,608:12,13,16,11 +chrX 1725524 . C T 563 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.27;BaseQRankSum=0.327;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.573;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.716;SOR=1.287;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1563 0/1:39,25:64:99:.:593,0,999:19,20,9,16 +chrX 1725845 . G C 3774 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=33.96;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.96;SOR=0.970;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1719,0:0,0,22,28 1/1:0,62:62:99:2085,186,0:0,0,41,21 +chrX 1726018 . A G 2434 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=19.40;BaseQRankSum=0.228;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=4.371;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.642;SOR=1.189;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,29:54:99:124,0:11,14,11,18 1/1:0,73:73:99:2340,218,0:0,0,24,49 +chrX 1726033 . G C 2331 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=19.20;BaseQRankSum=-1.418;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=4.630;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.306;SOR=1.253;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,31:55:99:139,0:10,14,12,19 1/1:0,68:68:99:2222,203,0:0,0,19,49 +chrX 1726535 . G C 3056 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=33.18;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.26;QD=33.18;SOR=0.804;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1393,0:0,0,17,25 1/1:0,51:51:99:1693,153,0:0,0,27,24 +chrX 1726733 . A T 757 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.12;BaseQRankSum=-0.479;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.267;MQ=48.35;MQRankSum=-1.005;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.381;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,1370 0/1:31,29:60:99:.:787,0,867:20,11,14,15 +chrX 1727126 . C T 3435 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=33.32;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.97;QD=33.32;SOR=1.257;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1326,0:0,0,24,16 1/1:0,64:64:99:2139,192,0:0,0,40,24 +chrX 1727519 . T TA 2359.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=24.48;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=24.48;SOR=0.914;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1235,0:0,0,25,26 1/1:0,47:47:99:1164,141,0:0,0,19,28 +chrX 1728026 . A C 370 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=14;AS_QD=10.81;BaseQRankSum=2.177;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=5.155;MQ=57.35;MQRankSum=0.269;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.701;SOR=0.678;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:31:.:31:.:.:0,1 0|1:23,14:37:99:.:0|1:1728026_A_C:400,0,766:1728026:8,15,8,6 +chrX 1728027 . C CTTTTT,CTTTTTTTTTTT 1078.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,12;AS_QD=21.79,15.35;BaseQRankSum=1.271;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=2.843;MQ=57.74;MQRankSum=-1.083;QD=24.84;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.895;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19,0:19:99:.:.:719,0,720:.:0,0,8,11 0|2:14,0,12:26:99:1|0:1728026_A_C:399,442,915,0,473,437:1728026:8,6,5,7 +chrX 1728055 . TTTG T 266.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=9.87;BaseQRankSum=0.756;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=1.523;MQ=57.31;MQRankSum=0.66;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.97;SOR=1.030;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:24:99:24:.:.:0,270 0|1:21,10:31:99:.:0|1:1728026_A_C:306,0,730:1728026:10,11,6,4 +chrX 1728058 . G T,* 386 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=17,0;AS_QD=16.64,0.00;BaseQRankSum=0.561;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.15;MQRankSum=-1.189;QD=16.64;ReadPosRankSum=2.084;SOR=0.576;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:8,17,0:25:99:.:.:416,0,749:.:6,2,8,9 0|2:21,0,10:31:99:0|1:1728026_A_C:306,367,1127,0,760,730:1728026:10,11,6,4 +chrX 1728060 . G A 536 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.58;BaseQRankSum=1.327;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=6.235;MQ=58.73;MQRankSum=-0.687;QD=12.58;ReadPosRankSum=2.009;SOR=0.877;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:8,16:24:99:.:.:371,0:.:6,2,7,9 0|1:15,6:21:99:0|1:1728026_A_C:195,0,530:1728026:8,7,2,4 +chrX 1728876 . AT A 599.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.04;BaseQRankSum=0.117;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=4.018;MQ=59.63;MQRankSum=-1.639;QD=13.04;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=1.176;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,372 0/1:23,26:49:99:.:639,0,549:12,11,10,16 +chrX 1728947 . G A 567 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=24;AS_QD=13.57;BaseQRankSum=-0.585;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;MQRankSum=1.229;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.214;SOR=0.801;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:59:.:59:0,0 0/1:20,24:44:99:.:597,0,503:8,12,9,15 +chrX 1728954 . A G 1988 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=28.22;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.35;QD=43.87;SOR=1.329;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:24:45:.:.:0,24 1|1:0,46:46:99:.:0|1:1728954_A_G:2018,138,0:1728954:0,0,17,29 +chrX 1728962 . T C 1919 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=30.49;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.34;QD=44.30;SOR=1.364;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:24:45:.:.:0,24 1|1:0,44:44:99:.:0|1:1728954_A_G:1949,132,0:1728954:0,0,16,28 +chrX 1728995 . G A 1796 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.61;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;QD=32.61;SOR=1.302;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:24:45:0,24 1/1:0,56:56:99:.:1826,168,0:0,0,21,35 +chrX 1729167 . A G 1667 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=32.63;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.63;SOR=0.853;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:24:45:0,24 1/1:0,52:52:99:.:1697,155,0:0,0,24,28 +chrX 1729204 . C A 1677 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=34.14;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.14;SOR=0.952;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:24:45:0,24 1/1:0,50:50:99:.:1707,150,0:0,0,28,22 +chrX 1729547 . GAAAA G,AAAAA 993 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=49,3;AS_QD=11.37,0.00;BaseQRankSum=1.474;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=2.781;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.573;SOR=1.053;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,26,0:49:99:174,0,1172:9,14,9,17 0/1:18,23,3:44:99:849,0,943,870,479,1700:10,8,11,15 +chrX 1730168 . A G 439 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.42;BaseQRankSum=-0.215;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=6.249;MQ=59.00;MQRankSum=0.399;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.787;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:95:62:0,95 0/1:26,19:45:99:.:469,0,719:10,16,11,8 +chrX 1730340 . T C 1243 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=30.31;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=30.31;SOR=1.005;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:95:62:0,95 1/1:0,42:42:99:.:1273,125,0:0,0,18,24 +chrX 1730679 . C G 1884 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=17.09;BaseQRankSum=1.502;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.819;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.843;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,31:59:99:144,0:14,14,14,17 1/1:0,53:53:99:1770,159,0:0,0,25,28 +chrX 1730854 . T C 636 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.88;BaseQRankSum=0.97;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.119;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.88;ReadPosRankSum=1.579;SOR=0.595;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1233 0/1:25,23:48:99:.:666,0,692:11,14,12,11 +chrX 1731025 . T TA,TAAA 1866.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=17,52;AS_QD=28.47,30.35;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=27.62;SOR=0.980;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,17,23:40:99:.:.:670,186,0:.:0,0,22,18 2|2:0,0,29:29:87:0|1:1731025_T_TAAA:1236,1236,1237,87,87,0:1731025:0,0,17,12 +chrX 1731048 . C T 1753 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=18.97;BaseQRankSum=2.25;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.911;MQ=59.82;MQRankSum=1.119;QD=18.97;ReadPosRankSum=0.707;SOR=0.521;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,28:52:99:.:.:193,0:.:15,9,16,12 1|1:0,42:42:99:0|1:1731025_T_TAAA:1590,126,0:1731025:0,0,24,18 +chrX 1731217 . T C 2228 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=33.21;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=33.21;SOR=0.814;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1409,0:0,0,22,21 1/1:0,25:25:75:849,75,0:0,0,10,15 +chrX 1731279 . C G 1534 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=30.62;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=37.24;SOR=1.005;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:1042,0:0,0,15,12 1/1:0,15:15:45:522,45,0:0,0,9,6 +chrX 1731303 . GAC G 374.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.56;BaseQRankSum=1.29;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=1.760;MQ=59.36;MQRankSum=1.543;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.525;SOR=1.371;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:8,17:25:99:.:414,0:4,4,11,6 0/0:.:15:20:14:0,20,387 +chrX 1731308 . A T 384 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.56;BaseQRankSum=-0.495;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=1.760;MQ=59.33;MQRankSum=1.543;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=1.371;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:8,17:25:99:.:414,0:4,4,11,6 0/0:.:15:20:14:0,20,387 +chrX 1731310 . CA C 455.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=21.52;BaseQRankSum=0;DP=37;ExcessHet=0.0000;FS=1.918;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=1.371;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:6,17:23:99:.:495,0:3,3,11,6 0/0:.:15:20:14:0,20,387 +chrX 1731312 . A T 510 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=24.55;BaseQRankSum=-0.707;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.976;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:5,17:22:99:.:540,0:3,2,11,6 0/0:.:14:17:14:0,17,427 +chrX 1731323 . CAAAAAAAAAAAAAAAAA CAAAAAAA,C 704.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=17,12;AS_QD=7.00,11.66;BaseQRankSum=0;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=23.576;MQ=59.17;MQRankSum=1.167;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.420;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:14,17,0:31:99:301,0,767:3,11,11,6 0/2:12,0,12:24:99:443,479,957,0,478,440:1,11,5,7 +chrX 1731360 . G T 801 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=9.23;BaseQRankSum=0.685;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.832;MQ=59.30;MQRankSum=1.323;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.980;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,33:53:99:525,0:9,11,12,21 0/1:24,13:37:99:306,0,786:7,17,2,11 +chrX 1731617 . A G 3249 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=32.47;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=0.930;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1750,0:0,0,22,33 1/1:0,46:46:99:1529,138,0:0,0,23,23 +chrX 1731702 . C T 647 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.54;BaseQRankSum=0.779;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=5.379;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.325;SOR=1.149;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:45:48:0,45 0/1:28,26:54:99:.:677,0,716:13,15,16,10 +chrX 1731860 . A C 932 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=-1.597;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.944;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.347;SOR=1.197;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:45:48:0,45 0/1:21,34:55:99:.:962,0,565:11,10,13,21 +chrX 1732194 . CTTT C 762.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=21.11;BaseQRankSum=-0.919;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=25.167;MQ=58.57;MQRankSum=1.98;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.708;SOR=1.293;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,10:16:99:232,0:6,0,1,9 0/1:5,17:22:33:570,0,33:4,1,8,9 +chrX 1732268 . G A 2278 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.62;BaseQRankSum=2.354;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;MQRankSum=0;QD=31.62;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.430;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1355,0:0,0,13,29 1/1:1,30:31:82:953,82,0:0,1,16,14 +chrX 1732483 . C A 795 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.69;BaseQRankSum=-1.156;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.046;SOR=0.634;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,129 0/1:32,33:65:99:.:825,0,846:15,17,16,17 +chrX 1732772 . A T 1014 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=16.84;BaseQRankSum=-0.249;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.556;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.591;SOR=0.971;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,129 0/1:26,36:62:99:.:1044,0,687:14,12,15,21 +chrX 1733075 . C T 1007 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.95;BaseQRankSum=1.054;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=6.907;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.44;SOR=0.500;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,129 0/1:26,39:65:99:.:1037,0,564:9,17,21,18 +chrX 1733286 . AG A 3348.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=27.17;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.66;SOR=1.227;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1642,0:0,0,34,12 1/1:0,49:49:99:1746,147,0:0,0,24,25 +chrX 1733501 . C CAAA,CAAAA 1269.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=1,54;AS_QD=0.00,15.22;BaseQRankSum=-0.118;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.822;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.804;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:22,1,23:46:99:184,480,0:11,11,10,14 0/2:10,0,31:41:99:1125,1156,1576,0,420,328:5,5,16,15 +chrX 1733547 . A G 672 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.95;BaseQRankSum=-2.688;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.267;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.636;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,164 0/1:14,30:44:99:.:702,0,357:8,6,14,16 +chrX 1733817 . T G 423 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=8.09;BaseQRankSum=-1.36;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.693;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,164 0/1:36,20:56:99:.:453,0,1004:18,18,10,10 +chrX 1733926 . A ATT 543.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.67;BaseQRankSum=-1.144;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.454;MQ=59.71;MQRankSum=-1.047;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.809;SOR=0.937;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,164 0/1:25,21:46:99:.:583,0,718:13,12,9,12 +chrX 1733975 . G C 584 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.77;BaseQRankSum=1.368;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.273;MQ=59.64;MQRankSum=-1.137;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.196;SOR=1.012;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,164 0/1:33,24:57:99:.:614,0,882:17,16,10,14 +chrX 1734521 . G A 2574 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=23.46;BaseQRankSum=1.454;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.822;MQ=59.98;MQRankSum=-1.088;QD=23.46;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=0.595;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2010,0:0,0,29,32 0/1:28,22:50:99:594,0,753:13,15,13,9 +chrX 1734730 . G A 2229 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=19.14;BaseQRankSum=-0.254;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.456;MQ=59.78;MQRankSum=0.28;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.109;SOR=0.495;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,44:66:99:.:.:1031,0:.:12,10,24,20 0|1:21,31:52:99:0|1:1734730_G_A:1228,0,763:1734730:14,7,17,14 +chrX 1734731 . C A 2229 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=19.14;BaseQRankSum=-0.161;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.456;MQ=59.78;MQRankSum=0.28;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.456;SOR=0.495;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,44:66:99:.:.:1031,0:.:12,10,24,20 0|1:21,31:52:99:0|1:1734730_G_A:1228,0,763:1734730:14,7,17,14 +chrX 1735070 . TCCTCCTTCTTTCCC T 679.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=21.15;BaseQRankSum=1.404;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=5.402;MQ=59.62;MQRankSum=-0.829;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=1.781;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:44:62:.:.:0,44 0|1:15,19:34:99:.:0|1:1735070_TCCTCCTTCTTTCCC_T:719,0,540:1735070:7,8,5,14 +chrX 1735118 . T C 1686 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=33.86;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.30;SOR=1.931;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:778,0:.:0,0,5,15 1|1:0,26:26:77:0|1:1735070_TCCTCCTTCTTTCCC_T:938,77,0:1735070:0,0,8,18 +chrX 1735416 . T TCTCCCTCCTCTC 323.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=11.71;BaseQRankSum=0.498;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=1.736;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.085;SOR=0.296;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,9:13:99:192,0:3,1,6,3 0/1:13,5:18:99:171,0,501:11,2,4,1 +chrX 1735462 . T TCTCCTCCTTCTCC 848.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=31.71;BaseQRankSum=2.053;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=2.063;MQ=58.33;MQRankSum=-1.352;QD=31.71;ReadPosRankSum=-2.118;SOR=1.445;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12:12:99:509,0:0,0,8,4 0/1:6,10:16:99:379,0,224:4,2,9,1 +chrX 1735468 . CTTT C 206.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=12.30;BaseQRankSum=-0.734;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=5.379;MQ=57.98;MQRankSum=1.402;QD=12.30;ReadPosRankSum=2.036;SOR=0.093;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:11:99:11:.:.:0,228 0|1:13,7:20:99:.:0|1:1735468_CTTT_C:246,0,503:1735468:11,2,4,3 +chrX 1735472 . CTCCCTCCTCT C 203.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=11.57;BaseQRankSum=-0.14;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=4.506;MQ=57.45;MQRankSum=1.348;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.67;SOR=0.160;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:11:99:11:.:.:0,228 0|1:14,7:21:99:.:0|1:1735468_CTTT_C:243,0,534:1735468:11,3,4,3 +chrX 1735537 . CCT C 50.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=11.25;BaseQRankSum=0;DP=29;ExcessHet=0.0000;FS=7.068;MQ=56.86;MQRankSum=0;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.157;SOR=0.610;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,5:8:90:.:90,0:0,3,3,2 0/0:.:19:22:16:0,22,513 +chrX 1735557 . G A 261 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=11.19;BaseQRankSum=2.263;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=1.721;MQ=58.40;MQRankSum=1.006;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.78;SOR=1.473;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,5:8:90:90,0:0,3,3,2 0/1:10,8:18:99:201,0,176:5,5,0,8 +chrX 1735677 . C CTCCT,CT 714.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=17,1;AS_QD=29.90,33.16;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.50;QD=41.89;SOR=1.863;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,0:11:99:495,0,495:0,0,3,8 1/2:0,6,1:7:43:259,43,107,216,0,212:0,0,2,5 +chrX 1735684 . C CCTCTTTCTCTCCCTCCTT 40.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=7.27;BaseQRankSum=0;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=12.175;MQ=56.26;MQRankSum=-0.301;QD=7.27;ReadPosRankSum=-2.362;SOR=2.784;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:17:99:17:0,303 0/1:8,3:11:80:.:80,0,295:2,6,3,0 +chrX 1735700 . T TTTCTCTCCCTCCTC,* 93.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=4,0;AS_QD=19.00,0.00;BaseQRankSum=-1.068;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=8.451;MQ=57.25;MQRankSum=-0.18;QD=19.00;ReadPosRankSum=1.006;SOR=1.402;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:90:25:0,90,90 0/1:3,4,0:7:99:.:133,0,199,154,139,416:3,0,1,3 +chrX 1735788 . TCTTTCTCCCTCCTC T 344.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=29.54;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.19;QD=29.54;SOR=1.609;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:90:25:0,90 1/1:0,13:13:37:.:384,37,0:0,0,9,4 +chrX 1736120 . A G 3285 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=33.15;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.15;SOR=0.733;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1583,0:0,0,29,19 1/1:0,52:52:99:1732,156,0:0,0,22,30 +chrX 1736280 . G T 586 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.33;BaseQRankSum=0.121;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=4.461;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.766;SOR=0.250;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,124 0/1:21,22:43:99:.:616,0,564:14,7,11,11 +chrX 1736705 . A G 572 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=7.00;BaseQRankSum=-0.745;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;MQRankSum=-1.055;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.938;SOR=0.665;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,27:46:99:117,0:11,8,20,7 0/1:22,18:40:99:485,0,634:13,9,6,12 +chrX 1736842 . G A 1035 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=8.80;BaseQRankSum=1.446;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.673;MQ=56.91;MQRankSum=-1.689;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.790;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,27:54:25:25,0:14,13,12,15 0/1:31,36:67:99:1040,0,865:15,16,18,18 +chrX 1736926 . G T 873 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.31;BaseQRankSum=-0.816;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.233;MQ=51.02;MQRankSum=3.634;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.385;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:45:53:0,45 0/1:26,33:59:99:.:903,0,981:16,10,17,16 +chrX 1736932 . T C 634 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=25;AS_QD=11.86;BaseQRankSum=0.652;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=5.411;MQ=50.47;MQRankSum=-3.648;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=1.329;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:55:.:55:0,0 0/1:31,25:56:99:.:664,0,1205:15,16,16,9 +chrX 1736992 . A G 3425 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=31.99;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.19;QD=31.99;SOR=0.892;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1718,0:0,0,25,30 1/1:0,53:53:99:1737,159,0:0,0,24,29 +chrX 1737046 . T C 697 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=7.27;BaseQRankSum=-1.516;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.689;MQ=57.20;MQRankSum=-1.792;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.96;SOR=1.022;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,29:52:99:132,0:9,14,11,18 0/1:25,23:48:99:595,0,700:11,14,7,16 +chrX 1737080 . A AG 1144.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=11.96;BaseQRankSum=1.488;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.770;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,25:46:99:161,0:8,13,11,14 0/1:22,31:53:99:1023,0,724:12,10,14,17 +chrX 1737177 . C T 945 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.86;BaseQRankSum=0.671;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.430;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.955;SOR=0.833;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,32:60:99:129,0:12,16,19,13 0/1:33,31:64:99:846,0,865:18,15,15,16 +chrX 1737252 . A G 969 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=9.42;BaseQRankSum=0.338;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.572;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.865;SOR=0.871;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,29:49:99:228,0:11,9,19,10 0/1:28,29:57:99:771,0,742:16,12,16,13 +chrX 1737290 . G T 1357 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=11.85;BaseQRankSum=0.566;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.507;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.554;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,34:52:99:470,0:11,7,19,15 0/1:31,34:65:99:917,0,787:19,12,20,14 +chrX 1737430 . TTTTTTG T 629.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.38;BaseQRankSum=-0.689;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.571;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.914;SOR=0.333;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,273 0/1:31,19:50:99:.:669,0,1220:11,20,9,10 +chrX 1737448 . GTT G 1115.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=22.21;BaseQRankSum=-0.209;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=5.796;MQ=59.44;MQRankSum=0;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=1.536;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,273 0/1:22,30:52:99:.:1155,0,830:11,11,10,20 +chrX 1737465 . GT G 275.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=7.68;BaseQRankSum=-0.439;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=32.864;MQ=58.82;MQRankSum=0.818;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.262;SOR=2.208;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:44:99:44:0,540 0/1:23,18:41:99:.:315,0,422:18,5,4,14 +chrX 1737498 . T C 1218 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=15.80;BaseQRankSum=-0.644;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=9.997;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=15.80;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.484;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,24:36:99:388,0:4,8,15,9 0/1:15,28:43:99:860,0,382:5,10,13,15 +chrX 1737538 . T C 4244 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=29.41;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=44.52;SOR=0.969;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1833,0:.:0,0,22,19 1|1:0,55:55:99:0|1:1737538_T_C:2441,166,0:1737538:0,0,20,35 +chrX 1737548 . T C 4257 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=32.20;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=44.20;SOR=0.892;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,44:44:99:.:.:1914,0:.:0,0,23,21 1|1:0,53:53:99:0|1:1737538_T_C:2373,160,0:1737538:0,0,21,32 +chrX 1737869 . TC T 822.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.39;BaseQRankSum=0.534;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.282;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.368;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,481 0/1:28,28:56:99:.:862,0,872:11,17,14,14 +chrX 1737899 . T C 731 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.59;BaseQRankSum=3.113;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.008;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=0.859;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,481 0/1:29,27:56:99:.:761,0,700:13,16,11,16 +chrX 1738163 . T C 576 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=5.88;BaseQRankSum=1.222;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.615;MQ=59.96;MQRankSum=1.055;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.941;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,28:55:75:75,0:16,11,18,10 0/1:27,21:48:99:531,0,712:14,13,12,9 +chrX 1738188 . C A,CA 291 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,15;AS_QD=0.00,8.92;BaseQRankSum=1.835;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=5.002;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=1.577;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1215,1215 0/2:21,1,15:37:99:.:321,351,1529,0,546,441:10,11,11,5 +chrX 1738253 . C A 4214 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=32.90;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.90;SOR=1.068;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2388,0:0,0,42,29 1/1:0,58:58:99:1856,173,0:0,0,33,25 +chrX 1738376 . T A 4473 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=141;AS_QD=31.94;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.94;SOR=0.707;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2316,0:0,0,38,35 1/1:0,68:68:99:2187,204,0:0,0,33,35 +chrX 1738487 . A G 4567 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=139;AS_QD=33.07;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.07;SOR=1.001;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2283,0:0,0,27,42 1/1:0,70:70:99:2314,210,0:0,0,33,37 +chrX 1738737 . ATTTTTT A 482.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=14.50;BaseQRankSum=0.07;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.050;MQ=59.61;MQRankSum=0.855;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.802;SOR=0.772;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,160 0|1:22,14:36:99:.:0|1:1738737_ATTTTTT_A:522,0,863:1738737:13,9,6,8 +chrX 1738766 . T C 349 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=10.24;BaseQRankSum=-1.987;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.289;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.775;SOR=1.051;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,160 0|1:19,18:37:99:.:1|0:1738737_ATTTTTT_A:379,0,685:1738737:9,10,7,11 +chrX 1738962 . T C 1044 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=17.90;BaseQRankSum=-1.283;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=-0.726;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.798;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,160 0/1:22,38:60:99:.:1074,0,573:11,11,20,18 +chrX 1739040 . C T 816 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=7.49;BaseQRankSum=1.159;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.854;MQ=59.97;MQRankSum=0.881;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.481;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,34:60:99:300,0:14,12,15,19 0/1:31,22:53:99:546,0,780:20,11,12,10 +chrX 1739201 . A G 3719 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=31.24;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.28;QD=31.24;SOR=0.726;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1984,0:0,0,26,35 1/1:0,59:59:99:1765,176,0:0,0,35,24 +chrX 1739245 . TTG T 324.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=8.27;BaseQRankSum=-1.111;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=8.957;MQ=59.86;MQRankSum=-1.156;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.541;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,990 0/1:26,18:44:99:.:364,0,987:18,8,8,10 +chrX 1739248 . TG T 981.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=9.12;BaseQRankSum=0.983;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.58;MQRankSum=1.093;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.698;SOR=0.697;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,29:55:73:.:.:73,0:.:15,11,11,18 0|1:31,26:57:99:0|1:1739248_TG_T:948,0,1156:1739248:15,16,18,8 +chrX 1739250 . TGTGTGTGTGTGTG T 899.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.65;BaseQRankSum=1.378;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=9.328;MQ=59.88;MQRankSum=0.908;QD=15.65;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=1.660;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:2:61:.:.:0,2 0|1:34,26:60:99:.:0|1:1739248_TG_T:939,0,1266:1739248:16,18,18,8 +chrX 1739632 . G A 341 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=6.63;BaseQRankSum=1.075;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.293;MQ=58.90;MQRankSum=-3.913;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=1.071;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:44,12:56:99:.:0|1:1739632_G_A:371,0,1780:1739632:19,25,4,8 +chrX 1739637 . T G 341 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=6.63;BaseQRankSum=2.303;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.293;MQ=58.88;MQRankSum=-3.913;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=1.071;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:44,12:56:99:.:0|1:1739632_G_A:371,0,1791:1739632:19,25,4,8 +chrX 1739644 . T C 347 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=6.98;BaseQRankSum=2.246;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.298;MQ=59.29;MQRankSum=-3.826;QD=6.98;ReadPosRankSum=-2.219;SOR=1.055;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:42,12:54:99:.:0|1:1739632_G_A:377,0,1727:1739632:18,24,4,8 +chrX 1739645 . G A 302 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=6.15;BaseQRankSum=2.269;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.067;MQ=59.29;MQRankSum=-4.044;QD=6.15;ReadPosRankSum=-2.005;SOR=1.445;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:43,11:54:99:.:0|1:1739632_G_A:332,0,1772:1739632:19,24,3,8 +chrX 1739646 . T C 305 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=6.32;BaseQRankSum=1.002;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.855;MQ=59.27;MQRankSum=-3.998;QD=6.32;ReadPosRankSum=-2.231;SOR=1.508;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:42,11:53:99:.:0|1:1739632_G_A:335,0,1730:1739632:19,23,3,8 +chrX 1739653 . T G 218 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=4.77;BaseQRankSum=1.305;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.462;MQ=59.26;MQRankSum=-4.476;QD=4.77;ReadPosRankSum=-2.408;SOR=1.207;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:43,9:52:99:.:0|1:1739632_G_A:248,0,1778:1739632:20,23,3,6 +chrX 1739655 . G C 218 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=4.77;BaseQRankSum=2.282;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.462;MQ=59.26;MQRankSum=-4.476;QD=4.77;ReadPosRankSum=-2.747;SOR=1.207;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:43,9:52:99:.:0|1:1739632_G_A:248,0,1778:1739632:20,23,3,6 +chrX 1739659 . T C 215 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=4.62;BaseQRankSum=1.148;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.455;MQ=59.27;MQRankSum=-4.526;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.837;SOR=1.151;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:44,9:53:99:.:0|1:1739632_G_A:245,0,1820:1739632:20,24,3,6 +chrX 1739669 . C T 102 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=2.87;BaseQRankSum=0.979;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=6.732;MQ=59.16;MQRankSum=-5.306;QD=2.87;ReadPosRankSum=-3.017;SOR=2.133;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:40,6:46:99:.:0|1:1739632_G_A:132,0,1662:1739632:19,21,1,5 +chrX 1739671 . T C 60 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=2.00;BaseQRankSum=1.456;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=4.408;MQ=59.68;MQRankSum=-4.97;QD=2.00;ReadPosRankSum=-3.2;SOR=1.819;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,539 0|1:40,5:45:90:.:0|1:1739632_G_A:90,0,1665:1739632:19,21,1,4 +chrX 1739804 . A G 1759 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=29.33;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.99;QD=29.33;SOR=1.022;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:907,0:0,0,19,12 1/1:0,30:30:89:882,89,0:0,0,16,14 +chrX 1739901 . TTGTGTG T 1600.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=27.83;BaseQRankSum=-0.162;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=3.118;MQ=57.77;MQRankSum=-0.353;QD=40.00;ReadPosRankSum=-1.621;SOR=0.194;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,19:21:99:749,0:2,0,9,10 1/1:0,20:20:61:891,61,0:0,0,10,10 +chrX 1740233 . T TTG 831.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=10.37;BaseQRankSum=0.598;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=5.679;MQ=59.40;MQRankSum=-0.91;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.14;SOR=0.317;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,23:44:81:81,0:14,7,11,12 0/1:15,25:40:99:790,0,420:10,5,15,10 +chrX 1740794 . A G 804 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.38;BaseQRankSum=-0.923;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=5.223;MQ=59.00;MQRankSum=-0.387;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.829;SOR=0.521;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,386 0/1:26,32:58:99:.:834,0,690:16,10,15,17 +chrX 1741477 . A G 916 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=8.76;BaseQRankSum=-1.685;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.609;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.904;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,36:60:99:336,0:14,10,23,13 0/1:24,24:48:99:610,0,660:15,9,16,8 +chrX 1741635 . C T 590 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.78;BaseQRankSum=1.77;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.755;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.323;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,154 0/1:22,23:45:99:.:620,0,529:6,16,9,14 +chrX 1741693 . G GAA 305.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=11.90;BaseQRankSum=-1.247;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.550;MQ=59.62;MQRankSum=-0.897;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.048;SOR=1.123;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,154 0/1:14,15:29:99:.:345,0,370:5,9,4,11 +chrX 1741979 . A G 606 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=5.63;BaseQRankSum=1.995;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.503;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=0.619;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,29:56:72:72,0:11,16,16,13 0/1:35,22:57:99:564,0,871:18,17,10,12 +chrX 1742181 . G A 1046 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=7.91;BaseQRankSum=3.248;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=2.240;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.684;SOR=0.913;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,37:69:99:234,0:22,10,25,12 0/1:37,30:67:99:842,0,959:20,17,19,11 +chrX 1742239 . C T 1139 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=15.59;BaseQRankSum=-0.201;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.422;SOR=0.656;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:99:74:0,423 0/1:30,45:75:99:.:1169,0,694:17,13,25,20 +chrX 1742415 . G A 833 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=6.64;BaseQRankSum=0.671;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=5.240;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=6.64;ReadPosRankSum=1.528;SOR=0.883;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,40:73:99:254,0:17,16,17,23 0/1:33,24:57:99:609,0,876:18,15,11,13 +chrX 1742508 . T C 4127 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=33.80;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=33.80;SOR=0.885;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2241,0:0,0,26,40 1/1:0,57:57:99:1916,171,0:0,0,30,27 +chrX 1742679 . A C 497 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.58;BaseQRankSum=-1.738;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=19.284;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.867;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,204 0/1:32,23:55:99:.:527,0,909:8,24,14,9 +chrX 1742692 . G GA 2352.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=25.72;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=25.72;SOR=0.953;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1259,0:0,0,21,28 1/1:0,44:44:99:1133,130,0:0,0,20,24 +chrX 1743023 . A G,T 4624 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=62,66;AS_QD=29.96,30.65;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=36.36;SOR=0.971;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,33,38:71:99:2281,259,0:0,0,34,37 1/2:0,29,28:57:99:2373,883,722,909,0,747:0,0,22,35 +chrX 1743025 . C G 5755 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=27.14;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=44.16;SOR=0.945;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:3242,0:0,0,36,38 1/1:0,57:57:99:2543,172,0:0,0,22,35 +chrX 1743240 . G A 860 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=6.36;BaseQRankSum=1.2;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=1.382;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.11;SOR=0.853;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,36:71:76:76,0:24,11,22,14 0/1:37,32:69:99:814,0,983:20,17,22,10 +chrX 1743505 . C A 540 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=5.70;BaseQRankSum=1.424;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=4.990;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.815;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,29:58:55:55,0:16,13,11,18 0/1:23,19:42:99:515,0,618:13,10,10,9 +chrX 1743798 . CT C 868.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=58;AS_QD=7.50;BaseQRankSum=0.714;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.699;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB .:31,31:62:.:1,0:16,15,20,11 0/1:32,27:59:99:907,0,1093:23,9,16,11 +chrX 1743989 . ATT A 964.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=10.46;BaseQRankSum=0.293;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.769;MQ=59.85;MQRankSum=1.163;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.626;SOR=0.839;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,25:45:99:171,0:9,11,15,10 0/1:24,27:51:99:833,0,715:14,10,14,13 +chrX 1744034 . G A 1160 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=10.35;BaseQRankSum=0.685;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.635;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,28:52:99:165,0:12,12,15,13 0/1:24,39:63:99:1025,0,636:16,8,23,16 +chrX 1744089 . C T 1383 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=10.95;BaseQRankSum=1.09;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.390;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.79;SOR=0.836;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,28:46:99:307,0:7,11,13,15 0/1:41,42:83:99:1106,0,1016:22,19,19,23 +chrX 1744126 . T C 3766 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=32.17;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.17;SOR=0.874;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1271,0:0,0,16,23 1/1:0,79:79:99:2525,237,0:0,0,38,41 +chrX 1744213 . C T 1128 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=9.73;BaseQRankSum=3.673;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=19.987;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.893;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,24:48:59:59,0:9,15,15,9 0/1:33,38:71:99:1099,0,739:11,22,22,16 +chrX 1744353 . C T 1021 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.40;BaseQRankSum=1.123;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=6.131;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.353;SOR=1.302;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,626 0/1:35,38:73:99:.:1051,0,900:17,18,24,14 +chrX 1745221 . T C 1150 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=9.15;BaseQRankSum=-0.547;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.643;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,39:65:99:395,0:14,12,22,17 0/1:35,29:64:99:785,0,1004:20,15,15,14 +chrX 1745974 . T C 762 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.77;BaseQRankSum=-0.152;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.979;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.452;SOR=0.880;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,155 0/1:33,29:62:99:.:792,0,931:14,19,11,18 +chrX 1746749 . C T 364 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=6.57;BaseQRankSum=-1.267;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.706;SOR=1.002;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,155 0/1:40,20:60:99:.:394,0,1129:21,19,12,8 +chrX 1747324 . A G 3641 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=31.92;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.92;SOR=0.899;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1826,0:0,0,26,30 1/1:0,59:59:99:1845,176,0:0,0,37,22 +chrX 1747489 . T TTG,TTTG 512.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=34,16;AS_QD=1.99,4.80;BaseQRankSum=0.775;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=7.462;MQ=59.57;MQRankSum=-0.805;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.298;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,34,0:58:99:187,0,1142:7,17,16,18 0/2:36,0,16:52:99:365,472,1748,0,1275,1228:15,21,9,7 +chrX 1747895 . G A 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=9.62;BaseQRankSum=-1.57;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=7.139;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.039;SOR=0.205;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,233 0/1:37,29:66:99:.:635,0,1004:27,10,16,13 +chrX 1748039 . C T 801 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=7.29;BaseQRankSum=0.902;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.695;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.726;SOR=0.783;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,26:51:67:67,0:16,9,14,12 0/1:35,28:63:99:764,0,977:16,19,16,12 +chrX 1748690 . C T 501 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.06;BaseQRankSum=0.77;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.293;SOR=0.743;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,208 0/1:28,20:48:99:.:531,0,779:15,13,11,9 +chrX 1749570 . G A 3613 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=32.24;BaseQRankSum=3.695;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.24;ReadPosRankSum=0.043;SOR=0.786;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1836,0:0,0,29,27 1/1:2,55:57:99:1807,151,0:1,1,24,31 +chrX 1749803 . C T 166 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=2.76;BaseQRankSum=0.876;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=1.974;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.446;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,38:71:99:.:196,0:19,14,19,19 0/0:.:60:99:60:0,115,1375 +chrX 1750446 . C A 1363 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=9.41;BaseQRankSum=0.468;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.439;SOR=0.737;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,45:71:99:656,0:10,16,23,22 0/1:46,31:77:99:737,0,1294:23,23,11,20 +chrX 1750486 . T C 1109 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=16.27;BaseQRankSum=-0.106;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=4.869;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.26;SOR=0.383;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,625 0/1:27,43:70:99:.:1139,0,648:10,17,22,21 +chrX 1751786 . A C 2282 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=30.42;BaseQRankSum=2.564;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=6.314;MQ=59.36;MQRankSum=0;QD=30.42;ReadPosRankSum=0;SOR=0.297;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,39:40:99:.:.:1261,0:.:0,1,22,17 1|1:1,35:36:96:0|1:1751786_A_C:1051,96,0:1751786:0,1,17,18 +chrX 1752056 . C T 409 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=9.34;BaseQRankSum=-0.319;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=8.698;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=1.961;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:71:63:0,71 0/1:29,18:47:99:.:439,0,826:13,16,4,14 +chrX 1752639 . G C 759 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.09;BaseQRankSum=-2.057;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.284;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.74;SOR=1.143;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:71:63:0,71 0/1:26,30:56:99:.:789,0,726:13,13,18,12 +chrX 1753501 . C T 677 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=25;AS_QD=16.07;BaseQRankSum=0.438;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.187;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.73;SOR=1.011;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:74:.:74:0,0 0/1:19,25:44:99:.:707,0,481:9,10,10,15 +chrX 1753613 . A G 643 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=5.75;BaseQRankSum=-0.293;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.359;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.648;SOR=0.622;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:24:24,0:14,16,15,17 0/1:29,26:55:99:649,0,769:18,11,13,13 +chrX 1753791 . A G 868 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=7.88;BaseQRankSum=1.564;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=10.230;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.052;SOR=1.236;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,29:54:99:159,0:13,12,10,19 0/1:33,27:60:99:739,0,900:18,15,11,16 +chrX 1753975 . C T 988 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=8.85;BaseQRankSum=0.456;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.537;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.542;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:80:80,0:19,11,19,13 0/1:19,34:53:99:938,0,502:12,7,20,14 +chrX 1754184 . T C 1173 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=9.86;BaseQRankSum=1.504;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.623;SOR=0.693;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,33:61:94:94,0:15,13,15,18 0/1:22,39:61:99:1109,0,487:10,12,21,18 +chrX 1754282 . G A 609 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=6.26;BaseQRankSum=0.146;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.963;SOR=0.667;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,28:50:99:199,0:9,13,12,16 0/1:34,18:52:99:440,0,951:15,19,8,10 +chrX 1754557 . C G 4123 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=32.96;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.96;SOR=1.016;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2317,0:0,0,29,41 1/1:0,56:56:99:1836,167,0:0,0,25,31 +chrX 1754773 . G A 731 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=6.50;BaseQRankSum=1.486;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.813;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.807;SOR=1.226;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,41:73:99:308,0:17,15,31,10 0/1:26,18:44:99:453,0,681:14,12,7,11 +chrX 1754821 . T C 3450 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=30.53;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.53;SOR=0.922;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2245,0:0,0,43,33 1/1:0,38:38:99:1235,114,0:0,0,20,18 +chrX 1755829 . A G 1354 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=10.73;BaseQRankSum=-0.286;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=9.696;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.35;SOR=1.144;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,43:72:99:444,0:14,15,17,26 0/1:23,34:57:99:940,0,588:14,9,13,21 +chrX 1756550 . A G 3606 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=32.76;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=32.76;SOR=0.711;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2104,0:0,0,32,32 1/1:0,47:47:99:1532,141,0:0,0,23,24 +chrX 1756841 . A AAAAT 1020.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=10.29;BaseQRankSum=1.17;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.754;MQ=59.96;MQRankSum=0.027;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.362;SOR=0.563;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,27:53:69:69,0:11,15,11,16 0/1:24,26:50:99:991,0,909:8,16,11,15 +chrX 1757343 . CA C 2331.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=30.01;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=30.01;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1141,0:0,0,18,20 1/1:0,41:41:99:1230,123,0:0,0,22,19 +chrX 1757501 . C CAA,CAAAA 2399.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=28,39;AS_QD=24.68,32.26;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.76;QD=36.40;SOR=0.917;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,15,23:38:99:1177,209,0:0,0,22,16 1/2:0,13,16:29:99:1262,491,379,374,0,295:0,0,15,14 +chrX 1758013 . T C 1146 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=20.28;BaseQRankSum=-0.013;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=6.140;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.888;SOR=0.759;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,218 0/1:16,42:58:99:.:1176,0,338:10,6,18,24 +chrX 1758112 . A G 3705 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=31.92;BaseQRankSum=1.706;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.869;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.92;ReadPosRankSum=1.371;SOR=0.866;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,66:67:99:2073,0:0,1,38,28 1/1:0,50:50:99:1662,150,0:0,0,31,19 +chrX 1759413 . A G 4405 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=137;AS_QD=32.37;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.37;SOR=0.708;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2432,0:0,0,37,37 1/1:0,63:63:99:2003,189,0:0,0,31,32 +chrX 1759496 . A G 3940 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.51;BaseQRankSum=2.941;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.51;ReadPosRankSum=0.114;SOR=1.022;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1980,0:0,0,32,29 1/1:2,63:65:99:1990,144,0:1,1,39,24 +chrX 1760079 . T TTCCC 258.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=11.92;BaseQRankSum=-0.579;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;MQRankSum=-1.25;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.389;SOR=1.022;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,675 0|1:16,9:25:99:.:0|1:1760079_T_TTCCC:298,0,645:1760079:5,11,2,7 +chrX 1760087 . CTCCCTCCT C,TTCCCTCCT 263 . AC=0,1;AF=0.00,0.500;AN=2;AS_AltDP=0,9;AS_QD=0.00,11.72;BaseQRankSum=0.286;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.95;MQRankSum=-0.421;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.719;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:34:.:34:0,0,0 0/2:16,0,9:25:99:.:293,368,1393,0,696,729:4,12,2,7 +chrX 1760091 . C *,T 266 . AC=0,1;AF=0.00,0.500;AN=2;AS_AltDP=0,9;AS_QD=0.00,12.33;BaseQRankSum=-0.044;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.29;MQRankSum=-1.205;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.567;SOR=0.515;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:32:.:32:.:.:0,0,0 0|2:15,0,9:24:99:.:0|1:1760079_T_TTCCC:296,362,1261,0,648,687:1760079:3,12,2,7 +chrX 1760095 . T *,C 263 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,9;AS_QD=0.00,11.72;BaseQRankSum=-1.181;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.85;MQRankSum=-0.421;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.719;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:51:32:.:.:0,51,51 0|2:16,0,9:25:99:.:0|1:1760079_T_TTCCC:293,359,1258,0,687,729:1760079:4,12,2,7 +chrX 1760126 . C T,CTTCT,CTTCCTTCCTTCT 1833 . AC=1,0,2;AF=0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=29,0,4;AS_QD=33.72,30.19,32.15;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.85;QD=56.45;SOR=1.022;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 3:0,14,0,1:15:99:596,233,177,0:0,0,9,6 1/3:0,15,0,3:18:99:1267,652,793,736,267,852,618,0,590,570:0,0,5,13 +chrX 1760130 . CTTCCTTCT C 524.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=15.24;BaseQRankSum=1.529;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.320;MQ=58.66;MQRankSum=-0.915;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.999;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:37:99:37:0,139 0/1:22,15:37:99:.:564,0,865:9,13,5,10 +chrX 1760200 . CTT C 446.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=13.14;BaseQRankSum=1.186;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.14;ReadPosRankSum=-1.072;SOR=0.879;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:37:99:37:.:.:0,139 0|1:23,14:37:99:.:0|1:1760200_CTT_C:486,0,913:1760200:11,12,6,8 +chrX 1760210 . CTT C 413.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=12.24;BaseQRankSum=0.172;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=1.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=0.713;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:37:99:37:.:.:0,139 0|1:24,13:37:99:.:0|1:1760200_CTT_C:453,0,948:1760200:13,11,6,7 +chrX 1760222 . C T,CTCTT 2630 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=27,40;AS_QD=31.90,28.92;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.70;SOR=0.784;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,16,18:34:99:1017,294,0:0,0,18,16 1/2:0,11,22:33:99:1643,929,953,477,0,390:0,0,17,16 +chrX 1760299 . C T 1127 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=9.64;BaseQRankSum=0.175;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.337;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.597;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,35:65:99:.:.:234,0:.:15,15,16,19 0|1:30,25:55:99:0|1:1760299_C_T:923,0,1148:1760299:18,12,13,12 +chrX 1760302 . A G 1096 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=9.46;BaseQRankSum=0.859;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.640;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,35:65:99:.:.:234,0:.:15,15,16,19 0|1:30,24:54:99:0|1:1760299_C_T:892,0,1151:1760299:18,12,12,12 +chrX 1760379 . C T 348 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=6.75;BaseQRankSum=1.106;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=8.947;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.98;SOR=2.066;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:49:61:0,49 0/1:40,16:56:99:.:378,0,1135:23,17,13,3 +chrX 1761406 . AT A,ATT 2707.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=97,3;AS_QD=28.32,0.00;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=27.47;SOR=0.863;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38,2:40:99:1075,0,1391:0,0,22,18 1/1:0,59,1:60:99:1672,170,0,1797,142,2216:0,0,32,28 +chrX 1761505 . G A 887 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.89;BaseQRankSum=1.871;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.895;MQ=59.83;MQRankSum=1.03;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.488;SOR=1.085;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:45:10:45:0,10 0/1:33,33:66:99:.:917,0,740:18,15,13,20 +chrX 1761566 . G GT 550.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.41;BaseQRankSum=-0.782;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.194;MQ=59.15;MQRankSum=0.455;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.694;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,153 0/1:18,26:44:99:.:590,0,376:8,10,14,12 +chrX 1761789 . C T 745 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.36;BaseQRankSum=0.309;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.369;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,153 0/1:29,29:58:99:.:775,0,784:10,19,13,16 +chrX 1762130 . C CG 980.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=16.72;BaseQRankSum=-0.16;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=5.105;MQ=59.92;MQRankSum=-0.984;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=1.040;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,153 0/1:31,30:61:99:.:1020,0,1025:17,14,12,18 +chrX 1762255 . T C 823 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.01;BaseQRankSum=1.671;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=6.795;MQ=59.93;MQRankSum=-1.076;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.381;SOR=1.583;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,153 0/1:39,32:71:99:.:853,0,1039:23,16,24,8 +chrX 1762432 . CTTT C 49.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=4.05;BaseQRankSum=-2.095;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.02;MQRankSum=0.589;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.585;SOR=0.368;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,153 0/1:18,4:22:89:.:89,0,660:4,14,1,3 +chrX 1762452 . TTTTTTTTTG T 630.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.89;BaseQRankSum=1.107;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=22.228;MQ=59.09;MQRankSum=-1.073;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.015;SOR=2.477;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:3:67:0,3 0/1:25,20:45:99:.:670,0,837:16,9,4,16 +chrX 1762532 . A G 3160 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=32.22;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=32.22;SOR=0.985;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1603,0:0,0,21,28 1/1:0,50:50:99:1587,149,0:0,0,22,28 +chrX 1762856 . G C 734 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.13;BaseQRankSum=-1.559;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=11.025;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.833;SOR=0.655;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:36:62:0,36 0/1:33,30:63:99:.:764,0,909:22,11,13,17 +chrX 1762937 . T TATTA 1456.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=14.52;BaseQRankSum=-1.014;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=9.408;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=0.734;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,31:49:99:579,0:13,5,13,18 0/1:30,24:54:99:917,0,1188:16,14,11,13 +chrX 1763141 . C T 664 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.42;BaseQRankSum=-1.048;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.280;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.611;SOR=0.446;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,144 0/1:20,25:45:99:.:694,0,534:5,15,8,17 +chrX 1763480 . C T 1068 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=16.64;BaseQRankSum=0.073;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.460;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.163;SOR=0.345;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,144 0/1:27,39:66:99:.:1098,0,671:17,10,20,19 +chrX 1763583 . C A,* 3732 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=66,0;AS_QD=30.62,26.46;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.46;QD=57.00;SOR=1.033;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47,0:47:99:.:.:1952,0,1952:.:0,0,26,21 1|1:0,19,0:19:57:1|0:1763582_CCTG_C:1810,133,0,851,57,844:1763582:0,0,12,7 +chrX 1763599 . C T 714 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=19.08;BaseQRankSum=-1.875;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.979;MQ=55.31;MQRankSum=-1.985;QD=19.08;ReadPosRankSum=0;SOR=1.477;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:43:88:43:.:.:0,88 0|1:19,20:39:99:.:0|1:1763599_C_T:744,0,738:1763599:12,7,0,1 +chrX 1763600 . T G,* 714 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,0;AS_QD=31.04,25.90;BaseQRankSum=-1.742;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.979;MQ=55.31;MQRankSum=-1.985;QD=37.20;ReadPosRankSum=0.173;SOR=1.477;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:43:88:43:.:.:0,88,88 0|1:19,1,0:20:33:.:0|1:1763599_C_T:744,0,738,33,741,771:1763599:12,7,0,1 +chrX 1763602 . CCACGGCTGCCTTGAAGGTTGTGAAATTGCTCACGGCTGCCTTGAAGGTTGTGAAATTGCT C,TCACGGCTGCCTTGAAGGTTGTGAAATTGCTCACGGCTGCCTTGAAGGTTGTGAAATTGCT 1410 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,37;AS_QD=22.64,29.73;BaseQRankSum=-0.524;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=7.513;MQ=52.96;MQRankSum=0.29;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.419;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22,18:40:13:747,0,13:0,0,22,18 0/2:11,0,19:30:99:693,726,1152,0,411,1013:3,8,0,1 +chrX 1763655 . A *,C 346 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,4;AS_QD=0.00,20.89;BaseQRankSum=-0.608;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=4.464;MQ=45.97;MQRankSum=1.225;QD=20.89;ReadPosRankSum=2.497;SOR=0.575;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22,0:40:99:747,0,936:0,0,22,18 0/2:14,0,4:18:99:376,104,700,0,567,555:5,9,2,2 +chrX 1763778 . T G 55 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=4;AS_QD=17.00;BaseQRankSum=-0.253;DP=11;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=33.57;MQRankSum=-0.842;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.981;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,4:5:85:.:85,0:0,1,0,4 ./.:.:6:.:6:0,0,0 +chrX 1763931 . C G 77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=4;AS_QD=21.40;BaseQRankSum=0;DP=8;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=28.36;MQRankSum=0;QD=21.40;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.981;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:3:.:3:0,0 0/1:1,4:5:15:.:107,0,15:0,1,0,4 +chrX 1765253 . G A 4159 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=32.98;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.98;SOR=0.916;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2054,0:0,0,29,34 1/1:0,64:64:99:2135,192,0:0,0,28,36 +chrX 1765474 . G T 1164 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=9.48;BaseQRankSum=-0.212;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=4.335;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.831;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,35:65:99:151,0:15,15,18,17 0/1:24,37:61:99:1043,0,621:10,14,22,15 +chrX 1765526 . T G 4286 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=138;AS_QD=31.28;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.28;SOR=1.059;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2072,0:0,0,26,40 1/1:0,72:72:99:2244,215,0:0,0,32,40 +chrX 1765686 . A G 477 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=8.31;BaseQRankSum=-0.854;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.026;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.873;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,302 0/1:39,22:61:99:.:507,0,1088:23,16,14,8 +chrX 1765902 . G A 619 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=6.98;BaseQRankSum=1.793;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.798;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.023;SOR=0.842;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,24:46:80:80,0:7,15,10,14 0/1:25,22:47:99:569,0,603:12,13,7,15 +chrX 1766002 . C CA 417.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=18;AS_QD=12.35;BaseQRankSum=0.321;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.03;SOR=0.804;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:48:.:48:0,0 0/1:19,18:37:99:.:457,0,495:10,9,10,8 +chrX 1766154 . CGCAAAACAAAAGCAAA C 865.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=20.57;BaseQRankSum=1.933;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.08;MQRankSum=1.092;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.809;SOR=0.700;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,1414 0|1:21,23:44:99:.:0|1:1766154_CGCAAAACAAAAGCAAA_C:905,0,799:1766154:11,10,11,12 +chrX 1766155 . G T,* 3240 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=67,23;AS_QD=31.12,0.00;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;QD=36.33;SOR=1.292;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49,0:49:99:1601,0,1723:0,0,11,30 1/2:0,18,23:41:99:1669,982,911,569,0,715:0,0,20,21 +chrX 1766171 . A T 879 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=21.64;BaseQRankSum=1.914;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.64;ReadPosRankSum=1.163;SOR=0.693;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:73:99:73:.:.:0,441 0|1:19,23:42:99:.:0|1:1766154_CGCAAAACAAAAGCAAA_C:909,0,729:1766154:10,9,11,12 +chrX 1766182 . A G 514 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=4.61;BaseQRankSum=0.443;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.405;MQ=59.68;MQRankSum=1.232;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.1;SOR=0.953;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,45:76:99:102,0:12,19,12,33 0/1:25,17:42:99:442,0,970:12,13,11,6 +chrX 1766466 . T C 1235 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=10.72;BaseQRankSum=-1.164;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.501;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=0.525;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,41:65:99:456,0:16,8,21,20 0/1:24,29:53:99:809,0,665:11,13,15,14 +chrX 1766678 . G A 1612 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=11.99;BaseQRankSum=1.291;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.695;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,38:62:99:497,0:10,14,15,23 0/1:35,40:75:99:1145,0,951:18,17,22,18 +chrX 1766996 . A G 873 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.84;BaseQRankSum=-0.446;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.393;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.976;SOR=0.275;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1419 0/1:23,34:57:99:.:903,0,579:15,8,17,17 +chrX 1767510 . T A 3584 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=33.46;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.46;SOR=0.981;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2006,0:0,0,32,28 1/1:0,48:48:99:1608,144,0:0,0,29,19 +chrX 1767783 . G A 418 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.93;BaseQRankSum=-0.335;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.24;MQRankSum=1.241;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.722;SOR=0.701;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1498 0/1:24,17:41:99:.:448,0,689:10,14,7,10 +chrX 1767813 . A G 2382 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.59;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.83;QD=32.59;SOR=0.927;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1405,0:0,0,18,25 1/1:0,31:31:92:1007,92,0:0,0,15,16 +chrX 1767842 . C T 1384 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=24.38;BaseQRankSum=1.339;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=4.464;MQ=57.49;MQRankSum=-1.331;QD=24.38;ReadPosRankSum=1.534;SOR=0.575;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1107,0:0,0,13,20 0/1:14,11:25:99:307,0,391:9,5,7,4 +chrX 1767863 . C CAAAA,CAA,CAAA 1965.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=31,8,14;AS_QD=31.81,28.43,29.58;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.32;QD=37.83;SOR=0.892;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31,0,0:31:99:1190,0,1191,1191:0,0,9,22 2/3:0,0,8,14:22:94:815,647,585,273,267,196,169,162,0,94:0,0,15,7 +chrX 1768517 . A T 835 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=22.76;BaseQRankSum=-1.679;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.655;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.589;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,1052 0|1:16,22:38:99:.:0|1:1768517_A_T:865,0,581:1768517:10,6,10,12 +chrX 1768518 . T C 835 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=22.76;BaseQRankSum=-0.062;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=4.655;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.589;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:49:99:49:.:.:0,1052 0|1:16,22:38:99:.:0|1:1768517_A_T:865,0,581:1768517:10,6,10,12 +chrX 1768552 . T TTC 2671.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=29.74;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=37.65;SOR=1.778;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1497,0:0,0,27,13 1/1:0,32:32:96:1214,96,0:0,0,23,9 +chrX 1768619 . T C 747 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.86;BaseQRankSum=-0.21;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.977;SOR=0.582;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1326 0/1:20,29:49:99:.:777,0,479:11,9,15,14 +chrX 1768730 . ATTATT A 714.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=19.84;BaseQRankSum=0.29;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=4.536;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.634;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1326 0/1:18,20:38:99:.:754,0,675:11,7,9,11 +chrX 1768760 . C A 2710 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=22.10;BaseQRankSum=1.724;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.794;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.10;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.848;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,71:72:99:2237,0:0,1,43,28 0/1:30,22:52:99:503,0,1053:18,12,14,8 +chrX 1768825 . G A 1354 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=22.69;BaseQRankSum=0.476;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.610;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.75;SOR=0.535;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:34:55:.:.:0,34 0|1:25,36:61:99:.:0|1:1768825_G_A:1384,0,931:1768825:15,10,17,19 +chrX 1768834 . T C 1399 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=21.65;BaseQRankSum=-2.832;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=4.958;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.48;SOR=0.882;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:34:55:.:.:0,34 0|1:28,38:66:99:.:0|1:1768825_G_A:1429,0,1010:1768825:16,12,16,22 +chrX 1769088 . A C 707 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=21.06;BaseQRankSum=0;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.984;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.06;ReadPosRankSum=-1.145;SOR=1.270;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:34:55:.:.:0,34 0|1:16,19:35:99:.:0|1:1769088_A_C:737,0,604:1769088:7,9,6,13 +chrX 1769092 . T C 677 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=20.79;BaseQRankSum=0.127;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.394;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.449;SOR=1.165;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:34:55:.:.:0,34 0|1:16,18:34:99:.:0|1:1769088_A_C:707,0,607:1769088:7,9,6,12 +chrX 1769296 . TTTATGCTGCTATAAGAAATACCTGAGTACCTGAGAC T 439.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=10.64;BaseQRankSum=0.36;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=11.776;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.214;SOR=1.782;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:34:55:.:.:0,34 0|1:27,18:45:99:.:0|1:1769296_TTTATGCTGCTATAAGAAATACCTGAGTACCTGAGAC_T:479,0,1071:1769296:16,11,5,13 +chrX 1769298 . T C,* 3223 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=69,18;AS_QD=27.29,0.00;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.39;SOR=0.917;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49,0:49:99:1542,0,1542:0,0,21,28 1/2:0,20,18:38:99:1711,653,685,708,0,818:0,0,18,20 +chrX 1769335 . AGGTATTTCT A,* 611.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=18,0;AS_QD=13.85,0.00;BaseQRankSum=0.328;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=11.540;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=1.786;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:99:58:.:.:0,1364,1364 0|1:29,18,0:47:99:.:0|1:1769296_TTTATGCTGCTATAAGAAATACCTGAGTACCTGAGAC_T:651,0,1142,598,1202,1792:1769296:17,12,5,13 +chrX 1769695 . A G 602 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.09;BaseQRankSum=-2.935;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.671;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.09;ReadPosRankSum=2.006;SOR=0.346;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1364 0/1:30,27:57:99:.:632,0,839:19,11,14,13 +chrX 1769729 . T C 2532 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=21.71;BaseQRankSum=0.169;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=5.105;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.724;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1718,0:1,0,19,34 0/1:31,33:64:99:844,0,774:17,14,20,13 +chrX 1769851 . C CA 1765.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=18.05;BaseQRankSum=-0.112;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.015;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=18.05;ReadPosRankSum=1.569;SOR=0.440;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,41:42:99:.:.:1103,0:.:0,1,24,17 0|1:26,32:58:99:0|1:1769851_C_CA:702,0,654:1769851:11,15,13,19 +chrX 1769853 . A AC 604.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.56;BaseQRankSum=-0.255;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=0.602;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1551 0|1:35,26:61:99:.:1|0:1769851_C_CA:644,0,993:1769851:14,21,11,15 +chrX 1770302 . C T 2651 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=24.15;BaseQRankSum=1.476;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.831;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.15;ReadPosRankSum=0.402;SOR=0.821;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2099,0:0,0,39,23 0/1:27,22:49:99:582,0,692:15,12,10,12 +chrX 1770364 . C T 851 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.94;BaseQRankSum=1.135;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.121;SOR=0.616;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1215 0/1:21,31:52:99:.:881,0,493:9,12,14,17 +chrX 1770996 . AT A,ATT,ATTTTTTTTT 578.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=35,13,4;AS_QD=13.50,8.43,3.60;BaseQRankSum=-0.81;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.614;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,9,13,0:23:99:118,143,0,268:0,1,6,16 1/3:0,26,0,4:30:14:500,63,14,555,83,770,482,0,745,932:0,0,12,18 +chrX 1772331 . C T 1697 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.21;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.21;SOR=1.136;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:15:66:0,15 1/1:0,52:52:99:.:1727,155,0:0,0,21,31 +chrX 1772412 . C T 1573 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=33.40;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=33.40;SOR=0.963;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:40:56:0,40 1/1:0,48:48:99:.:1603,144,0:0,0,27,21 +chrX 1772457 . T C 1771 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.16;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.16;SOR=0.765;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:40:56:0,40 1/1:0,56:56:99:.:1801,168,0:0,0,27,29 +chrX 1772494 . A G 1831 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=31.02;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.02;SOR=0.760;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:40:56:0,40 1/1:0,60:60:99:.:1861,179,0:0,0,31,29 +chrX 1772733 . C CA 663.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=25.11;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=25.11;SOR=0.836;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:40:56:0,40 1/1:0,28:28:83:.:703,83,0:0,0,13,15 +chrX 1773254 . CCTTTCTTTCTTT C 305.97 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=8;AS_QD=28.55;BaseQRankSum=-0.431;DP=24;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.72;MQRankSum=-0.589;QD=38.33;ReadPosRankSum=0;SOR=1.609;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,8:9:99:.:345,0:0,1,1,7 ./.:.:13:.:13:0,0,0 +chrX 1773356 . CT C 385.97 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=13;AS_QD=32.69;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.32;QD=32.69;SOR=1.179;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,13:13:99:.:425,0:0,0,5,8 ./.:.:23:.:23:0,0,0 +chrX 1773453 . T C 1573 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=49;AS_QD=32.71;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.48;QD=32.71;SOR=0.909;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:73:.:73:0,0 1/1:0,49:49:99:.:1603,147,0:0,0,22,27 +chrX 1774155 . C T 2041 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=16.31;BaseQRankSum=3.396;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=4.948;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.34;SOR=0.743;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,37:71:99:241,0:19,15,13,24 1/1:0,56:56:99:1830,168,0:0,0,29,27 +chrX 1774196 . C T 2064 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.72;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=1.044;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,421 1/1:0,64:64:99:.:2094,192,0:0,0,37,27 +chrX 1774322 . T G 1803 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=15.40;BaseQRankSum=-0.552;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.806;MQ=59.88;MQRankSum=1.625;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.384;SOR=1.036;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,38:68:99:244,0:16,14,20,18 1/1:0,51:51:99:1589,152,0:0,0,34,17 +chrX 1774579 . GACCCCTGAGTTACAGC G 2934.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=27.86;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.06;SOR=0.754;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:99:73:0,286 1/1:0,66:66:99:.:2974,201,0:0,0,32,34 +chrX 1775075 . CTTTTTTT C 1349.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=29.55;BaseQRankSum=-1.141;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=44.476;MQ=59.37;MQRankSum=1.735;QD=29.55;ReadPosRankSum=0.812;SOR=1.870;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,16:22:99:585,0:6,0,5,11 0/1:4,21:25:2:804,0,2:4,0,5,16 +chrX 1775224 . G A 4099 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=32.26;BaseQRankSum=-0.243;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.26;ReadPosRankSum=-1.234;SOR=0.271;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,58:59:99:1931,0:0,1,29,29 1/1:0,69:69:99:2198,206,0:0,0,31,38 +chrX 1775457 . C T 2914 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.00;BaseQRankSum=1.634;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.058;MQ=59.83;MQRankSum=-0.102;QD=32.00;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.184;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,48:50:99:.:.:1504,0:.:2,0,24,24 1|1:0,42:42:99:0|1:1775457_C_T:1440,126,0:1775457:0,0,20,22 +chrX 1775671 . G C 3549 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=32.54;BaseQRankSum=3.561;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=32.54;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=0.316;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,57:58:99:1932,0:0,1,23,34 1/1:0,52:52:99:1647,155,0:0,0,26,26 +chrX 1775805 . CT C 616.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.12;BaseQRankSum=-0.063;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.01;SOR=0.682;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,634 0/1:21,29:50:99:.:656,0,403:10,11,15,14 +chrX 1775970 . ATT A 1822.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=27.79;BaseQRankSum=-0.897;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=22.595;MQ=58.49;MQRankSum=1.838;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.835;SOR=1.440;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1216,0:0,0,13,24 0/1:5,25:30:61:646,0,61:5,0,7,18 +chrX 1776031 . C T 4169 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=34.06;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;QD=44.67;SOR=0.976;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,53:53:99:.:.:2375,0:.:0,0,22,31 1|1:0,41:41:99:0|1:1776031_C_T:1824,123,0:1776031:0,0,19,22 +chrX 1776044 . C A 4335 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=25.66;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=45.00;SOR=0.992;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2565,0:.:0,0,23,34 1|1:0,40:40:99:0|1:1776031_C_T:1800,120,0:1776031:0,0,19,21 +chrX 1776069 . C T 4784 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=33.23;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=44.99;SOR=0.830;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,66:66:99:.:.:2970,0:.:0,0,30,36 1|1:0,41:41:99:0|1:1776031_C_T:1844,123,0:1776031:0,0,20,21 +chrX 1776070 . C G 4784 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.52;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=44.99;SOR=0.830;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,66:66:99:.:.:2970,0:.:0,0,30,36 1|1:0,41:41:99:0|1:1776031_C_T:1844,123,0:1776031:0,0,20,21 +chrX 1777272 . T C 4673 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=31.22;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=43.15;SOR=1.002;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,53:53:99:.:.:2266,0:.:0,0,27,26 1|1:0,56:56:99:0|1:1777272_T_C:2437,169,0:1777272:0,0,20,36 +chrX 1777281 . A G 4521 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=28.51;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=43.34;SOR=1.064;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2193,0:.:0,0,24,27 1|1:0,54:54:99:0|1:1777272_T_C:2358,163,0:1777272:0,0,20,34 +chrX 1777431 . G A 4203 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=32.81;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.81;SOR=0.806;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2402,0:0,0,33,40 1/1:0,56:56:99:1831,168,0:0,0,35,21 +chrX 1777539 . G A 3510 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.18;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.18;SOR=0.767;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1963,0:0,0,30,30 1/1:0,50:50:99:1577,149,0:0,0,23,27 +chrX 1777621 . AAGTC A 5012.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=25.01;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=1.121;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2879,0:0,0,39,27 1/1:0,49:49:99:2173,148,0:0,0,29,20 +chrX 1777721 . G C 4291 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=32.73;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.73;SOR=1.038;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2416,0:0,0,44,31 1/1:0,57:57:99:1905,171,0:0,0,32,25 +chrX 1778546 . T C 3826 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=32.68;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.68;SOR=0.798;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2035,0:0,0,32,30 1/1:0,56:56:99:1821,168,0:0,0,30,26 +chrX 1779435 . G T 4365 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=32.32;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=32.32;SOR=0.953;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2243,0:0,0,28,40 1/1:0,68:68:99:2152,203,0:0,0,32,36 +chrX 1779450 . C A 4465 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=33.05;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=33.05;SOR=0.849;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2281,0:0,0,31,40 1/1:0,65:65:99:2214,195,0:0,0,32,33 +chrX 1779482 . C G 4032 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=31.98;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.98;SOR=0.774;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2257,0:0,0,35,35 1/1:0,57:57:99:1805,170,0:0,0,31,26 +chrX 1779555 . C T 4160 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=34.07;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.07;SOR=0.924;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2403,0:0,0,38,32 1/1:0,53:53:99:1787,159,0:0,0,30,23 +chrX 1779939 . TTAGAG T 5509.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=28.69;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.39;SOR=0.882;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:2625,0:0,0,27,32 1/1:0,66:66:99:2924,199,0:0,0,41,25 +chrX 1779973 . T G 4164 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=31.53;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.53;SOR=0.708;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2048,0:0,0,26,37 1/1:0,70:70:99:2146,208,0:0,0,40,30 +chrX 1780139 . T C 734 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.24;BaseQRankSum=2.259;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.932;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.763;SOR=0.529;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1569 0/1:39,29:68:99:.:764,0,986:17,22,14,15 +chrX 1780290 . CT C 366.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=8.46;BaseQRankSum=-1.894;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.127;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.811;SOR=0.615;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1569 0/1:27,21:48:99:.:406,0,556:12,15,11,10 +chrX 1780457 . C T 727 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=20.46;BaseQRankSum=1.139;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.884;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.677;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,1569 0|1:17,20:37:99:.:0|1:1780457_C_T:757,0,612:1780457:7,10,11,9 +chrX 1780476 . C T 2397 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=26.97;BaseQRankSum=1.463;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=5.108;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.989;SOR=0.790;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:1644,0:.:0,0,19,31 0|1:19,21:40:99:0|1:1780457_C_T:783,0,652:1780457:11,8,12,9 +chrX 1781035 . C CT 96.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=3.58;BaseQRankSum=0.901;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=10.043;MQ=59.61;MQRankSum=1.226;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=1.483;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,22:38:99:.:136,0:10,6,7,15 0/0:.:59:53:59:0,53,1262 +chrX 1781364 . AAG A 225.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=4.57;BaseQRankSum=-0.407;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.591;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,32:58:99:.:265,0:17,9,20,12 0/0:.:59:53:59:0,53,1262 +chrX 1781419 . T C 189 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=2.92;BaseQRankSum=0.061;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.943;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.480;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,41:75:99:.:219,0:22,12,24,17 0/0:.:59:53:59:0,53,1262 +chrX 1782242 . C CTT 32.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=3.43;BaseQRankSum=0.881;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=12.555;MQ=58.36;MQRankSum=-3.013;QD=3.43;ReadPosRankSum=-2.427;SOR=1.414;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:56:41:0,56 0/1:14,7:21:72:.:72,0,350:3,11,5,2 +chrX 1782894 . G C 109 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=3.02;BaseQRankSum=0.362;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.142;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.07;SOR=0.498;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,25:46:99:.:139,0:13,8,14,11 0/0:.:54:33:39:0,33,870 +chrX 1786554 . T C 58 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=1.44;BaseQRankSum=-1.077;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.130;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.304;SOR=1.022;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,33:61:88:.:88,0:14,14,19,14 0/0:.:54:33:39:0,33,870 +chrX 1788188 . A G 120 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=2.17;BaseQRankSum=1.183;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.015;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.17;ReadPosRankSum=2.932;SOR=0.976;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,36:69:99:.:150,0:14,19,13,23 0/0:.:54:33:39:0,33,870 +chrX 1788217 . C CCTGA 567.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=8.32;BaseQRankSum=-1.526;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=3.224;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.774;SOR=1.094;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,43:73:99:.:607,0:13,17,15,28 0/0:.:54:33:39:0,33,870 +chrX 1789358 . T C 332 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=5.25;BaseQRankSum=-0.263;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=3.605;MQ=59.85;MQRankSum=0.272;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.645;SOR=1.251;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,40:69:99:.:362,0:18,11,29,11 0/0:.:54:33:39:0,33,870 +chrX 1789402 . G A 176 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=2.75;BaseQRankSum=2.806;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.977;MQ=59.78;MQRankSum=-0.469;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.947;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,39:75:99:.:206,0:23,13,27,12 0/0:.:54:33:39:0,33,870 +chrX 1790144 . A C 373 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=7.90;BaseQRankSum=1.469;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.756;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,31:51:99:.:403,0:10,10,16,15 0/0:.:54:33:39:0,33,870 +chrX 1790593 . C T 99 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=2.30;BaseQRankSum=-0.708;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=7.530;MQ=59.84;MQRankSum=-1.303;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=1.481;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,30:56:99:.:129,0:14,12,10,20 0/0:.:54:33:39:0,33,870 +chrX 1790723 . T TA 177.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=10.33;BaseQRankSum=0.171;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.86;MQRankSum=-1.473;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=1.022;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:58:99:58:.:.:0,1023 0|1:7,14:21:75:.:0|1:1790723_T_TA:217,0,75:1790723:3,4,5,9 +chrX 1790732 . A AC 214.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=5.29;BaseQRankSum=-1.044;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.01;MQRankSum=-0.506;QD=5.29;ReadPosRankSum=-2.82;SOR=0.675;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,27:48:99:.:254,0:10,11,13,14 0/0:.:41:54:36:0,54,990 +chrX 1790734 . A AAAAACAAAAAAC 259.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=6.10;BaseQRankSum=0.658;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.01;MQRankSum=-0.461;QD=6.10;ReadPosRankSum=-2.653;SOR=0.610;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,28:49:99:.:299,0:10,11,14,14 0/0:.:41:54:36:0,54,990 +chrX 1791141 . C T 287 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=4.95;BaseQRankSum=-0.716;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.49;SOR=0.683;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,37:64:99:.:317,0:13,14,19,18 0/0:.:49:36:45:0,36,1157 +chrX 1791167 . AC A,CC 244 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=34,2;AS_QD=4.72,0.00;BaseQRankSum=-0.535;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.646;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,34,2:60:99:.:274,0,1491:13,11,19,17 0/0:.:49:36:45:0,36,1157,36,1157,1157 +chrX 1791355 . T C 164 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=3.08;BaseQRankSum=0.945;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.794;SOR=0.578;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,34:63:99:.:194,0:11,18,14,20 0/0:.:49:36:45:0,36,1157 +chrX 1791797 . G GT 711.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=10.58;BaseQRankSum=1.482;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=10.524;MQ=59.94;MQRankSum=-0.754;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.043;SOR=1.429;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,44:71:99:.:751,0:12,15,29,15 0/0:.:49:36:45:0,36,1157 +chrX 1791798 . C T 721 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=10.58;BaseQRankSum=-0.189;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=10.524;MQ=59.94;MQRankSum=-0.754;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.132;SOR=1.429;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,44:71:99:.:751,0:12,15,29,15 0/0:.:49:36:45:0,36,1157 +chrX 1791941 . A AAAT 40.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=1.33;BaseQRankSum=-1.199;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.617;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.791;SOR=1.329;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,30:60:80:.:80,0:15,15,11,19 0/0:.:49:36:45:0,36,1157 +chrX 1792756 . T C 603 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.11;BaseQRankSum=-0.176;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.004;MQ=59.98;MQRankSum=-1.096;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.512;SOR=0.544;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:41:99:41:0,214 0/1:32,25:57:99:.:633,0,881:18,14,13,12 +chrX 1793922 . T TA 362.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=7.58;BaseQRankSum=-1.044;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.286;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.941;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,31:53:99:.:402,0:7,15,5,14 0/0:.:62:78:62:0,78,1340 +chrX 1794201 . TGATAGATA T,TGATA 2753.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=23,59;AS_QD=28.81,27.35;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.063;MQ=59.67;MQRankSum=6.559;QD=33.65;SOR=0.300;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23,18:41:99:972,0,174:0,0,20,21 2/2:1,0,41:42:99:1821,1823,1824,122,124,0:0,1,22,19 +chrX 1794271 . GTAGA G 197.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=3.89;BaseQRankSum=-0.297;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.130;MQ=59.95;MQRankSum=-0.888;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.721;SOR=1.022;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,33:61:99:.:237,0:14,14,19,14 0/0:.:61:96:61:0,96,1269 +chrX 1796037 . G A 56 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=1.10;BaseQRankSum=0.458;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=5.896;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.887;SOR=0.758;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:39,39:78:86:.:86,0:16,23,22,17 0/0:.:36:23:29:0,23,790 +chrX 1796049 . ATG A 150.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=2.44;BaseQRankSum=0.149;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=9.361;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.492;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:37,41:78:99:.:190,0:13,24,22,19 0/0:.:36:23:29:0,23,790 +chrX 1796175 . C CGTGT 569.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=10.15;BaseQRankSum=-1.284;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=3.652;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=1.071;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,37:60:99:.:609,0:11,12,22,15 0/0:.:36:23:29:0,23,790 +chrX 1796186 . GTA G 545.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=9.59;BaseQRankSum=-0.838;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.008;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.984;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,37:61:99:.:585,0:12,12,21,16 0/0:.:36:23:29:0,23,790 +chrX 1796198 . A G 486 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=9.05;BaseQRankSum=0.539;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.004;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.293;SOR=0.846;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,34:57:99:.:516,0:12,11,19,15 0/0:.:36:23:29:0,23,790 +chrX 1796252 . ATG A 175.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=4.22;BaseQRankSum=-0.111;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.072;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.506;SOR=0.769;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,28:51:99:.:215,0:12,11,13,15 0/0:.:36:23:29:0,23,790 +chrX 1796398 . A G 1381 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=45;AS_QD=31.36;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.36;SOR=0.829;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:70:.:70:0,0 1/1:0,45:45:99:.:1411,134,0:0,0,21,24 +chrX 1796448 . G GTGTGCA 46.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=1.41;BaseQRankSum=1.819;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.050;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.41;ReadPosRankSum=2.551;SOR=0.609;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,32:61:86:.:86,0:13,16,13,12 0/0:.:56:40:56:0,40,649 +chrX 1796452 . G GTATA 81.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=1.98;BaseQRankSum=1.831;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.050;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.98;ReadPosRankSum=2.404;SOR=0.609;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,32:61:99:.:121,0:13,16,13,12 0/0:.:56:40:56:0,40,649 +chrX 1796528 . T C 242 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=3.78;BaseQRankSum=-1.053;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=6.248;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.939;SOR=1.408;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,41:72:99:.:272,0:15,16,14,27 0/0:.:56:40:56:0,40,649 +chrX 1799212 . A T 471 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=7.71;BaseQRankSum=-0.024;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=6.708;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.02;SOR=0.442;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,40:65:99:.:501,0:16,9,19,21 0/0:.:56:40:56:0,40,649 +chrX 1801487 . TTATC T 557.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=11.71;BaseQRankSum=-1.338;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=5.839;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=0.957;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,32:51:99:.:597,0:11,8,13,19 0/0:.:56:40:56:0,40,649 +chrX 1803576 . CATCTAT C 500.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=10.38;BaseQRankSum=-1.681;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.83;SOR=0.818;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,32:52:99:.:540,0:10,10,17,15 0/0:.:56:40:56:0,40,649 +chrX 1803586 . CT C 455.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=9.34;BaseQRankSum=-0.587;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.067;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.865;SOR=0.745;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,32:53:99:.:495,0:10,11,17,15 0/0:.:56:40:56:0,40,649 +chrX 1803593 . TC T 410.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=8.33;BaseQRankSum=-0.62;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.801;SOR=0.818;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,32:54:99:.:450,0:11,11,17,15 0/0:.:56:40:56:0,40,649 +chrX 1803878 . A G 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=11.02;BaseQRankSum=-1.285;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.15;SOR=0.746;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,43:64:99:.:705,0:9,12,18,25 0/0:.:56:40:56:0,40,649 +chrX 1805259 . G A 46 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=1.07;BaseQRankSum=1.273;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=4.670;MQ=59.93;MQRankSum=1.042;QD=1.07;ReadPosRankSum=0.443;SOR=1.291;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:35,36:71:76:.:76,0:18,17,23,13 0/0:.:50:65:50:0,65,1003 +chrX 1805589 . C T 270 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=4.55;BaseQRankSum=0.861;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.945;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.806;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,37:66:99:.:300,0:14,15,20,17 0/0:.:50:65:50:0,65,1003 +chrX 1806933 . C CAAT,CAATAAT 1896.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=29,17;AS_QD=29.66,31.75;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.09;SOR=1.203;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,689,689 1/2:0,29,17:46:99:.:1936,689,583,1108,0,1030:0,0,18,28 +chrX 1807548 . G T 53 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=1.66;BaseQRankSum=-0.194;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=49.061;MQ=58.87;MQRankSum=-1.129;QD=1.66;ReadPosRankSum=3.286;SOR=5.890;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,689 0/1:32,18:50:83:.:83,0,882:13,19,18,0 +chrX 1807691 . CG C 169.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=4.64;BaseQRankSum=2.085;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=4.579;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=1.593;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,25:45:99:.:209,0:11,9,18,7 0/0:.:61:67:61:0,67,958 +chrX 1807772 . G A 269 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=6.50;BaseQRankSum=0.388;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=8.705;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=1.429;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,27:46:99:.:299,0:8,11,18,9 0/0:.:61:67:61:0,67,958 +chrX 1807878 . A G 142 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=3.07;BaseQRankSum=-1.064;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.149;SOR=0.818;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,32:56:99:.:172,0:12,12,15,17 0/0:.:61:67:61:0,67,958 +chrX 1807913 . G A 458 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=8.00;BaseQRankSum=1.473;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.998;MQ=59.73;MQRankSum=-0.772;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.96;SOR=0.611;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,37:61:99:.:488,0:13,11,18,19 0/0:.:61:67:61:0,67,958 +chrX 1808939 . T TTA 717.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.11;BaseQRankSum=-1.918;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=0.732;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1375 0/1:22,25:47:99:.:757,0,668:9,13,10,15 +chrX 1809568 . CATAT CAT,C 698.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=18,15;AS_QD=3.55,15.10;BaseQRankSum=0.69;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=5.587;MQ=59.87;MQRankSum=1.197;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.799;SOR=1.542;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:14,18,0:32:99:149,0,588:8,6,3,15 0/2:10,0,15:25:99:589,620,1039,0,420,374:4,6,8,7 +chrX 1810649 . C T 336 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=6.42;BaseQRankSum=1.373;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=11.823;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.116;SOR=0.475;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,33:57:99:.:366,0:7,17,18,15 0/0:.:57:34:36:0,34,952 +chrX 1810712 . T C 232 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=4.76;BaseQRankSum=2.376;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.549;MQ=59.75;MQRankSum=1.132;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.581;SOR=0.369;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,30:55:99:.:262,0:6,19,10,20 0/0:.:57:34:36:0,34,952 +chrX 1811275 . C T 100 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=3.33;BaseQRankSum=0.755;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=9.750;MQ=59.45;MQRankSum=1.584;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.628;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,21:39:99:.:130,0:5,13,12,9 0/0:.:57:34:36:0,34,952 +chrX 1812520 . G A 33 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=0.98;BaseQRankSum=-1.848;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=6.623;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=0.984;ReadPosRankSum=0.72;SOR=0.476;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,34:64:63:.:63,0:19,11,16,18 0/0:.:57:34:36:0,34,952 +chrX 1813077 . G A 210 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=2.76;BaseQRankSum=2.945;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.894;MQ=59.64;MQRankSum=-1.358;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.178;SOR=1.035;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:42,45:87:99:.:240,0:27,15,32,13 0/0:.:57:34:36:0,34,952 +chrX 1813119 . T C 160 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=2.26;BaseQRankSum=0.535;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=4.484;MQ=59.81;MQRankSum=-0.93;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=1.236;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:40,44:84:99:.:190,0:25,15,32,12 0/0:.:57:34:36:0,34,952 +chrX 1813221 . C T 133 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=2.59;BaseQRankSum=3.537;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=3.663;MQ=59.24;MQRankSum=1.426;QD=2.59;ReadPosRankSum=1.293;SOR=1.279;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,31:63:99:.:163,0:13,19,9,22 0/0:.:57:34:36:0,34,952 +chrX 1815665 . A ATATTT 843.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=24.53;BaseQRankSum=-1.505;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=-0.468;QD=24.53;ReadPosRankSum=0.362;SOR=0.871;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:8,28:36:99:.:883,0:6,2,21,7 0/0:.:57:34:36:0,34,952 +chrX 1817115 . C CACAACAGTAATATGATACTACCGCCGCATGGGAGCAGTAATAACA 328.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=16.73;BaseQRankSum=0.811;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.971;MQ=55.55;MQRankSum=-1.456;QD=16.73;ReadPosRankSum=-1.763;SOR=0.654;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:6,16:22:99:.:368,0:4,2,7,9 0/0:.:46:46:46:0,46,997 +chrX 1818167 . T TGA 1589.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=30.26;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=44.82;QD=44.03;SOR=0.859;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:709,0:0,0,8,8 1/1:0,21:21:63:920,63,0:0,0,12,9 +chrX 1822158 . C T 494 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.08;BaseQRankSum=0.358;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=23.647;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.69;SOR=1.689;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,547 0/1:31,21:52:99:.:524,0,797:22,9,6,15 +chrX 1823508 . G A 53 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=1.63;BaseQRankSum=0.994;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=7.826;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.63;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=1.051;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,26:51:83:.:83,0:15,10,10,16 0/0:.:61:48:61:0,48,1117 +chrX 1825337 . C T 219 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=7.55;BaseQRankSum=0.65;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.414;MQ=59.61;MQRankSum=1.302;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=0.368;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:13,20:33:99:.:249,0:5,8,10,10 0/0:.:55:36:55:0,36,1236 +chrX 1825558 . T C 73 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=2.24;BaseQRankSum=-3.023;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.411;MQ=59.19;MQRankSum=1.117;QD=2.24;ReadPosRankSum=1.965;SOR=0.994;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,406 0|1:36,10:46:99:.:0|1:1825558_T_C:103,0,1258:1825558:22,14,7,3 +chrX 1825578 . T C 75 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=2.02;BaseQRankSum=-4.366;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=4.983;MQ=59.20;MQRankSum=1.295;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.128;SOR=0.223;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,406 0|1:40,12:52:99:.:0|1:1825558_T_C:105,0,1399:1825558:27,13,6,6 +chrX 1825788 . T C 52 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=1.91;BaseQRankSum=-1.74;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.29;MQRankSum=0.946;QD=1.91;ReadPosRankSum=2.255;SOR=0.892;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,406 0/1:34,9:43:82:.:82,0,840:17,17,4,5 +chrX 1833437 . C T 233 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=5.84;BaseQRankSum=1.307;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.559;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,26:45:99:.:263,0:8,11,12,14 0/0:.:46:29:44:0,29,893 +chrX 1834391 . A G 588 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=7.45;BaseQRankSum=-1.307;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=7.346;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.626;SOR=0.338;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,23:41:99:124,0:13,5,10,13 0/1:22,20:42:99:494,0,607:13,9,11,9 +chrX 1836007 . ATTC A 95.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=2.87;BaseQRankSum=-1.257;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.119;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.87;ReadPosRankSum=-1.546;SOR=0.922;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,25:47:99:.:135,0:12,10,15,10 0/0:.:29:27:25:0,27,630 +chrX 1836024 . A C 90 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=2.18;BaseQRankSum=0.294;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.732;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,29:55:99:.:120,0:15,11,17,12 0/0:.:29:27:25:0,27,630 +chrX 1836558 . C T 115 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=2.96;BaseQRankSum=2.142;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.96;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.541;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,26:49:99:.:145,0:7,16,9,17 0/0:.:29:27:25:0,27,630 +chrX 1839423 . C T 208 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=4.10;BaseQRankSum=-0.216;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.796;MQ=59.80;MQRankSum=-1.514;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.11;SOR=0.302;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,33:58:99:.:238,0:17,8,18,15 0/0:.:61:21:40:0,21,947 +chrX 1839460 . T C 135 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=3.11;BaseQRankSum=-0.122;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=7.933;MQ=59.81;MQRankSum=-1.272;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.289;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,29:53:99:.:165,0:17,7,14,15 0/0:.:61:21:40:0,21,947 +chrX 1840685 . A ATGAT 111.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=2.48;BaseQRankSum=0.413;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.614;SOR=0.608;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,32:61:99:.:151,0:17,12,18,14 0/0:.:61:21:40:0,21,947 +chrX 1840865 . CTTTT C 426.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.65;BaseQRankSum=1.887;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=12.548;MQ=59.88;MQRankSum=0.444;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.216;SOR=0.227;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,25:40:99:.:466,0:3,12,13,12 0/0:.:61:21:40:0,21,947 +chrX 1842441 . G A 30 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=1.22;BaseQRankSum=-0.924;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=4.041;MQ=59.54;MQRankSum=0;QD=1.22;ReadPosRankSum=1.954;SOR=1.325;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,26:49:60:.:60,0:12,11,17,9 0/0:.:58:24:49:0,24,1096 +chrX 1844855 . A T 1594 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=27.07;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.07;SOR=1.316;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,324 1/1:0,60:60:99:.:1624,179,0:0,0,22,37 +chrX 1845181 . T C 119 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=2.26;BaseQRankSum=2.102;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.998;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.484;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,34:66:99:.:149,0:14,18,17,17 0/0:.:53:61:53:0,61,1155 +chrX 1845287 . A T 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.21;BaseQRankSum=-1.508;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.371;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.21;ReadPosRankSum=-1.721;SOR=0.639;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:64:57:0,64 0/1:26,26:52:99:.:687,0,728:15,11,12,14 +chrX 1845708 . C CTTTT,CT 464.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=30,2;AS_QD=11.29,18.08;BaseQRankSum=1.62;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=61.195;MQ=57.46;MQRankSum=0;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.88;SOR=3.081;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:10,20,0:30:73:73,0,481:0,10,19,1 1/2:1,10,2:13:41:431,41,46,231,0,196:0,1,8,4 +chrX 1845813 . G A 56 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=2.39;BaseQRankSum=2.117;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=1.320;MQ=59.40;MQRankSum=-2.059;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.368;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,18:36:86:.:86,0:7,11,9,9 0/0:.:54:25:20:0,25,616 +chrX 1849154 . A G 151 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=2.74;BaseQRankSum=-1.762;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.584;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=0.357;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,37:66:99:.:181,0:8,21,14,23 0/0:.:54:25:20:0,25,616 +chrX 1853839 . AAAGGAAGG A 498.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.23;BaseQRankSum=0.445;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.28;SOR=0.892;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,28:44:99:.:538,0:9,7,17,11 0/0:.:58:45:58:0,45,919 +chrX 1854543 . AT A,ATT 528.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,35;AS_QD=0.00,12.35;BaseQRankSum=1.688;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.330;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.740;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:11,2,35:48:99:.:568,1199,0:6,5,17,20 0/0:.:58:45:58:0,45,919,45,919,919 +chrX 1854642 . C T 253 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=5.78;BaseQRankSum=-0.619;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=25.561;MQ=59.89;MQRankSum=0.326;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.855;SOR=2.492;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,29:49:99:.:283,0:13,7,6,23 0/0:.:58:45:58:0,45,919 +chrX 1856483 . CT C 137.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=4.12;BaseQRankSum=1.457;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=3.061;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.172;SOR=1.247;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:35:1:0,35 0/1:32,11:43:99:.:177,0,724:13,19,3,8 +chrX 1857181 . G C 806 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=6.38;BaseQRankSum=0.258;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=3.141;MQ=59.87;MQRankSum=0.119;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.75;SOR=0.462;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,38:72:99:104,0:22,12,21,17 0/1:32,27:59:99:732,0,864:16,16,12,15 +chrX 1858801 . C T 1026 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.53;BaseQRankSum=1.736;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=2.039;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.327;SOR=1.012;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,849 0/1:30,38:68:99:.:1056,0,723:14,16,15,23 +chrX 1859052 . C CA 1321.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=16.40;BaseQRankSum=-0.326;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=6.127;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=16.40;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.219;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,51:52:99:1084,0:1,0,27,24 0/1:13,18:31:99:277,0,207:9,4,9,9 +chrX 1859952 . C T 792 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=-0.942;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.21;MQRankSum=0.411;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.593;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1757 0/1:17,30:47:99:.:822,0,429:8,9,15,15 +chrX 1860376 . C T 3710 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.24;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=32.24;SOR=0.877;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2261,0:0,0,39,31 1/1:0,46:46:99:1479,138,0:0,0,24,22 +chrX 1860412 . A G 3776 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=31.72;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=31.72;SOR=1.034;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2221,0:0,0,40,30 1/1:0,50:50:99:1585,149,0:0,0,29,21 +chrX 1860552 . T C 5509 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=32.94;BaseQRankSum=2.618;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=-0.086;QD=42.94;ReadPosRankSum=0.519;SOR=0.879;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,67:69:99:.:.:2862,0:.:1,1,32,35 1|1:0,60:60:99:0|1:1860552_T_C:2677,181,0:1860552:0,0,26,34 +chrX 1860558 . A G 5519 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=28.53;BaseQRankSum=1.986;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=-0.086;QD=43.02;ReadPosRankSum=0.34;SOR=0.916;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,68:70:99:.:.:2906,0:.:1,1,32,36 1|1:0,59:59:99:0|1:1860552_T_C:2643,178,0:1860552:0,0,25,34 +chrX 1860606 . T C 6191 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=143;AS_QD=35.89;BaseQRankSum=-0.609;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.20;ReadPosRankSum=-1.557;SOR=0.370;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,78:79:99:.:.:3353,0:.:0,1,37,41 1|1:0,65:65:99:0|1:1860606_T_C:2868,196,0:1860606:0,0,24,41 +chrX 1860608 . C T 6226 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=144;AS_QD=31.98;BaseQRankSum=-0.506;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.14;ReadPosRankSum=-1.525;SOR=0.360;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,78:79:99:.:.:3353,0:.:0,1,37,41 1|1:0,66:66:99:0|1:1860606_T_C:2903,199,0:1860606:0,0,25,41 +chrX 1860628 . T C 5655 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=34.58;BaseQRankSum=-0.599;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.07;ReadPosRankSum=-0.149;SOR=0.474;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,71:72:99:.:.:3047,0:.:0,1,33,38 1|1:0,60:60:99:0|1:1860606_T_C:2638,181,0:1860606:0,0,18,42 +chrX 1860876 . G A 3388 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=31.94;BaseQRankSum=2.205;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.573;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.94;ReadPosRankSum=1.155;SOR=0.660;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2118,0:0,0,36,29 1/1:1,41:42:99:1300,116,0:0,1,24,17 +chrX 1860902 . C T 3955 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=33.21;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.21;SOR=0.871;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2402,0:0,0,37,35 1/1:0,48:48:99:1583,144,0:0,0,28,20 +chrX 1861944 . C T 519 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.98;BaseQRankSum=0.498;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=12.331;MQ=59.88;MQRankSum=-1.188;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=1.140;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,744 0/1:33,22:55:99:.:549,0,861:21,12,8,14 +chrX 1862472 . C G 433 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=8.57;BaseQRankSum=0.05;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.232;SOR=0.826;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,744 0/1:35,19:54:99:.:463,0,1015:19,16,11,8 +chrX 1862650 . AAAGGAAGGAAGGAAGG A 233.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=22.75;BaseQRankSum=-0.319;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.618;SOR=0.818;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,9:12:99:.:273,0:3,0,8,1 0/0:.:45:41:45:0,41,849 +chrX 1862672 . AGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAG A 481.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=20.04;BaseQRankSum=-1.852;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.74;MQRankSum=-1.28;QD=20.04;ReadPosRankSum=2.19;SOR=0.914;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:19:99:19:0,397 0/1:12,14:26:99:.:521,0,428:8,4,10,4 +chrX 1862761 . AAAGG A 251.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=7.66;BaseQRankSum=0.966;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;MQRankSum=-0.8;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.774;SOR=0.693;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,22:38:99:.:291,0:8,8,11,11 0/0:.:56:29:53:0,29,960 +chrX 1863041 . GAGAAAGAA G,GAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAGAAAGAA 790.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=9,15;AS_QD=33.76,32.33;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.55;QD=34.58;SOR=4.091;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:50:40:0,50,50 1/2:0,9,15:24:99:.:830,499,520,345,0,566:0,0,22,2 +chrX 1863496 . T G 31 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=1.05;BaseQRankSum=-0.162;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.982;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.05;ReadPosRankSum=1.759;SOR=0.560;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,30:58:61:.:61,0:12,16,14,16 0/0:.:52:38:52:0,38,1233 +chrX 1864013 . C T 504 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.13;BaseQRankSum=-2.122;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.557;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.13;ReadPosRankSum=2.173;SOR=1.179;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1703 0/1:26,22:48:99:.:534,0,740:15,11,15,7 +chrX 1865162 . G A 4201 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=33.05;BaseQRankSum=3.811;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.05;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.256;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2376,0:0,0,35,37 1/1:1,55:56:99:1855,158,0:0,1,26,29 +chrX 1865569 . C G 44 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=1.16;BaseQRankSum=-1.439;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.073;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.460;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,34:64:74:.:74,0:12,18,16,18 0/0:.:61:89:61:0,89,1211 +chrX 1866302 . C T 606 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=7.66;BaseQRankSum=1.313;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=4.451;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.011;SOR=1.268;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:19,21:40:80:.:.:80,0:.:11,8,14,7 0|1:23,20:43:99:0|1:1866302_C_T:556,0,828:1866302:14,9,15,5 +chrX 1866325 . A G 467 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.81;BaseQRankSum=-0.299;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.81;ReadPosRankSum=-1.189;SOR=0.641;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,1170 0|1:17,19:36:99:.:1|0:1866302_C_T:497,0,626:1866302:11,6,12,7 +chrX 1866345 . CA C,CAA 60.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=10,5;AS_QD=4.35,0.50;BaseQRankSum=0.764;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.39;MQRankSum=-0.859;QD=3.57;ReadPosRankSum=2.414;SOR=0.678;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1170,1170 0/1:13,10,5:28:91:.:100,0,391,91,141,368:7,6,8,7 +chrX 1866495 . CT C,CTT 1428.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=69,19;AS_QD=19.84,6.71;BaseQRankSum=0.295;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=1.893;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.22;SOR=0.333;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,21,19:43:99:280,0,119:2,1,27,13 1/1:2,48,0:50:99:1188,104,0,1194,144,1235:2,0,27,21 +chrX 1866630 . C T 1003 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=12.75;BaseQRankSum=0.939;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.750;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,103 0/1:42,39:81:99:.:1033,0,1067:20,22,18,21 +chrX 1866661 . C T 1041 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.47;BaseQRankSum=1.405;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=3.142;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.406;SOR=0.971;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,103 0/1:36,38:74:99:.:1071,0,989:17,19,22,16 +chrX 1866977 . T C 719 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.70;BaseQRankSum=1.021;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;MQRankSum=-0.207;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.28;SOR=0.749;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,103 0/1:41,29:70:99:.:749,0,1070:19,22,13,16 +chrX 1867791 . G A 1402 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=10.69;BaseQRankSum=0.218;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.42;SOR=0.693;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,50:76:99:683,0:15,11,23,27 0/1:30,28:58:99:749,0,808:13,17,16,12 +chrX 1867903 . GA G 889.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=8.08;BaseQRankSum=1.787;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.703;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.835;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,34:60:99:254,0:12,14,17,17 0/1:27,28:55:99:675,0,640:12,15,9,19 +chrX 1868811 . A G 763 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.86;BaseQRankSum=-2.284;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=13.682;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.209;SOR=1.379;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:15:72:0,15 0/1:20,30:50:99:.:793,0,546:13,7,10,20 +chrX 1869551 . CA *,C,AA 253 . AC=0,1,0;AF=0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=4,13,4;AS_QD=0.00,13.48,0.92;BaseQRankSum=-0.928;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=13.532;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.561;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,844,844,844 0/2:8,4,13,4:29:99:.:283,244,889,0,124,217,272,844,99,1008:7,1,9,12 +chrX 1869884 . C A 1213 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=9.14;BaseQRankSum=0.044;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.639;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.796;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,39:69:99:279,0:12,18,20,19 0/1:31,36:67:99:964,0,833:19,12,20,16 +chrX 1870093 . G A 925 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=8.30;BaseQRankSum=1.71;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.766;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.294;SOR=0.869;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,34:61:99:274,0:15,12,21,13 0/1:28,26:54:99:681,0,780:10,18,13,13 +chrX 1871076 . CT C 244.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=3.38;BaseQRankSum=-0.061;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.641;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.763;SOR=1.247;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,24:45:95:95,0:10,11,8,16 0/1:26,13:39:99:189,0,448:14,12,6,7 +chrX 1871511 . G A 2462 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=17.43;BaseQRankSum=1.142;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=7.830;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.43;SOR=0.629;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,38:71:99:202,0:20,13,16,22 1/1:0,72:72:99:2290,216,0:0,0,34,38 +chrX 1871708 . A C 2326 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.84;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=31.84;SOR=0.992;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:53:64:0,53 1/1:0,74:74:99:.:2356,221,0:0,0,42,32 +chrX 1872174 . A T 1820 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.46;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:53:64:0,53 1/1:0,57:57:99:.:1850,171,0:0,0,27,30 +chrX 1872244 . AT A 1025.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=24.77;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.39;MQRankSum=6.635;QD=24.77;SOR=0.569;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:53:64:0,53 1/1:1,42:43:99:.:1065,105,0:0,1,15,27 +chrX 1873152 . G A 1603 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=14.08;BaseQRankSum=2.804;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.441;SOR=0.664;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,35:69:99:105,0:18,16,18,17 1/1:1,46:47:99:1528,131,0:0,1,23,23 +chrX 1873476 . A G 537 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=6.03;BaseQRankSum=0.611;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=5.196;MQ=59.84;MQRankSum=0.172;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.727;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,27:50:54:54,0:10,13,13,14 0/1:24,20:44:99:513,0,622:10,14,13,7 +chrX 1873711 . TCTCTCCTTTCTCAGTCTCCTTTCTCTCTCTCTTTCC T 281.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=24.74;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.21;QD=45.86;SOR=1.609;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,7:7:99:.:321,0:0,0,2,5 0/0:.:35:26:31:0,26,857 +chrX 1874675 . CTTTTT C,CTTTT,CT 669.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,5,12;AS_QD=19.92,1.45,33.78;BaseQRankSum=-0.743;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=14.939;MQ=58.10;MQRankSum=0;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.248;SOR=2.669;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:4,11,5,0:20:16:16,451,0,495:3,1,3,13 1/3:2,8,0,12:22:85:693,195,359,563,332,634,100,0,166,85:1,1,4,16 +chrX 1875454 . T C 1974 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.81;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.81;SOR=1.573;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:35:55:0,35 1/1:0,63:63:99:.:2004,189,0:0,0,42,21 +chrX 1875577 . A G 1539 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=30.76;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.76;SOR=0.813;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:35:55:0,35 1/1:0,51:51:99:.:1569,152,0:0,0,27,24 +chrX 1876770 . T C 3468 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=32.39;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.39;SOR=0.936;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1686,0:0,0,24,27 1/1:0,57:57:99:1812,171,0:0,0,24,33 +chrX 1877361 . C A 495 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=6.73;BaseQRankSum=-0.453;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.113;MQ=59.69;MQRankSum=0;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.23;SOR=0.789;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,47:78:99:.:525,0:14,17,26,21 0/0:.:54:73:54:0,73,1451 +chrX 1877384 . C CT 831.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=22.33;BaseQRankSum=-0.866;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.54;MQRankSum=0;QD=22.33;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.437;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1760 1/1:3,36:39:37:.:871,37,0:2,1,19,17 +chrX 1877615 . T C 679 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=10.28;BaseQRankSum=1.372;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=-0.772;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.762;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,42:69:99:.:709,0:12,15,18,24 0/0:.:66:86:66:0,86,1366 +chrX 1877622 . G A 621 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=9.43;BaseQRankSum=2.594;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=-0.797;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.321;SOR=0.755;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,41:69:99:.:651,0:12,16,17,24 0/0:.:66:86:66:0,86,1366 +chrX 1877739 . T C 1964 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=32.69;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.69;SOR=0.725;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:40:50:0,40 1/1:0,61:61:99:.:1994,183,0:0,0,30,31 +chrX 1877966 . T C 393 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=6.93;BaseQRankSum=2.035;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.182;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.694;SOR=0.628;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,36:61:99:.:423,0:14,11,17,19 0/0:.:61:56:61:0,56,1350 +chrX 1878083 . CA C,CAA 969.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=19,50;AS_QD=14.74,17.46;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=14.62;SOR=1.131;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19,16:35:99:280,0,136:0,0,21,14 2/2:0,0,34:34:99:729,729,729,100,100,0:0,0,20,14 +chrX 1878307 . T A 704 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=12.88;BaseQRankSum=-0.95;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.121;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.122;SOR=0.822;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,40:57:99:.:734,0:9,8,18,22 0/0:.:53:76:53:0,76,1210 +chrX 1878547 . C T 2254 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=33.59;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=33.59;SOR=1.098;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:41:67:0,41 1/1:0,68:68:99:.:2284,204,0:0,0,40,28 +chrX 1878671 . C T 5491 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=157;AS_QD=29.75;DP=160;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=35.17;SOR=0.994;VarDP=157 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2925,0:0,0,46,30 1/1:0,81:81:99:2596,243,0:0,0,43,38 +chrX 1878691 . A G 351 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=5.08;BaseQRankSum=-1.508;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.183;MQ=59.60;MQRankSum=-0.625;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.59;SOR=1.106;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,45:75:99:.:381,0:16,14,28,17 0/0:.:44:24:31:0,24,939 +chrX 1878915 . CA C,CAA 71.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=4,9;AS_QD=0.00,12.33;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.90;QD=8.54;SOR=0.836;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,4,9:13:99:.:111,300,0:0,0,7,6 0/0:.:43:0:43:0,0,233,0,233,233 +chrX 1879605 . T C 4172 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=32.08;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.08;SOR=0.739;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2386,0:0,0,39,35 1/1:0,57:57:99:1816,171,0:0,0,28,29 +chrX 1880173 . CATAATA C 5270.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=24.58;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=0.779;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2661,0:0,0,33,27 1/1:0,59:59:99:2649,178,0:0,0,29,30 +chrX 1880217 . C CA 4755.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=130;AS_QD=26.04;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.88;SOR=0.892;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2344,0:0,0,36,27 1/1:0,67:67:99:2451,201,0:0,0,35,32 +chrX 1880582 . C T 2268 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.92;BaseQRankSum=2.482;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.92;ReadPosRankSum=-0.12;SOR=0.378;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,317 1/1:1,71:72:99:.:2298,206,0:1,0,41,30 +chrX 1880728 . T C 1973 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=21.54;BaseQRankSum=0.094;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.870;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=21.54;ReadPosRankSum=0.754;SOR=0.831;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,45:46:99:1454,0:0,1,20,25 0/1:26,21:47:99:549,0,698:14,12,10,11 +chrX 1880891 . GGAAA G 602.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.66;BaseQRankSum=0.675;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=15.66;ReadPosRankSum=1.82;SOR=0.601;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:42:99:42:0,138 0/1:24,17:41:99:.:642,0,922:16,8,11,6 +chrX 1880909 . CAAGA C 599.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.21;BaseQRankSum=1.138;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.033;SOR=0.702;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:42:99:42:0,138 0/1:25,17:42:99:.:639,0,959:16,9,11,6 +chrX 1880918 . AAG A 916.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=10.86;BaseQRankSum=0;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=0;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.211;SOR=0.702;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,22:44:11:11,0:16,6,15,7 0/1:19,25:44:99:945,0,715:11,8,16,9 +chrX 1880943 . AGGAAGGAG A 3356.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=31.91;BaseQRankSum=-0.462;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=4.717;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=42.45;ReadPosRankSum=-1.032;SOR=1.447;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1645,0:0,0,27,11 1/1:1,41:42:82:1751,82,0:0,1,26,15 +chrX 1881209 . G GGAA 3028.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.99;BaseQRankSum=-0.226;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.978;MQ=59.66;MQRankSum=-1.157;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.941;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1931,0:0,0,29,15 0/1:20,29:49:99:1137,0,752:11,9,15,14 +chrX 1881423 . ACAGAGCAAG A 99.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.93;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.55;QD=9.93;SOR=1.802;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,12:14:99:.:139,0:0,0,8,3 0/0:.:30:21:17:0,21,405 +chrX 1881433 . A *,AT 99.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,11;AS_QD=0.00,12.64;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.55;QD=10.69;SOR=2.147;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,2,11:13:99:.:139,394,0:0,0,10,3 0/0:.:13:0:13:0,0,223,0,223,223 +chrX 1881447 . AGCGAGAGAAGGAAGG A 99.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.93;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.55;QD=9.93;SOR=1.802;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,12:14:99:.:139,0:0,0,8,3 0/0:.:11:0:11:0,0,292 +chrX 1881468 . GCGAGAGAAGGAAGGAAGGACAGAGCAAGAGAAGGAAGGAAGGAGCGAGAGAAGGAAGGAAGGAGCGAGAGAAGGAAGGAAGGACAGAGCAAGAGAAGGAAGGAAGGAGCGAGAGAAGGAAGGAAGGAATGAAGGAATGAAGGAAGGAA G 108.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=4.48;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.04;QD=4.48;SOR=1.609;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,31:33:99:.:148,0:0,0,7,3 0/0:.:11:27:11:0,27,307 +chrX 1881605 . T G 1275 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=27.22;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.17;QD=45.00;SOR=1.071;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:1305,0:0,0,17,12 0/0:.:33:0:33:0,0,155 +chrX 1881613 . G A 1453 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=25.04;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;QD=44.94;SOR=1.179;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,33:33:99:.:1483,0:0,0,20,13 0/0:.:36:0:36:0,0,446 +chrX 1881615 . A G 1488 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=37.87;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.29;QD=44.65;SOR=1.085;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:1518,0:0,0,20,14 0/0:.:36:0:36:0,0,426 +chrX 1881619 . A G 1488 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=30.44;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;QD=44.65;SOR=1.085;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:1518,0:0,0,20,14 0/0:.:39:0:39:0,0,301 +chrX 1881802 . T C 2779 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=21.61;BaseQRankSum=0.231;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=6.049;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.321;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2155,0:0,0,31,34 0/1:39,26:65:99:654,0,1045:25,14,16,10 +chrX 1881878 . T C 460 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=4.30;BaseQRankSum=0.545;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.950;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.93;SOR=0.338;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,35:61:28:28,0:14,12,18,17 0/1:34,19:53:99:462,0,902:25,9,11,8 +chrX 1882339 . C CTTT,CTTTTTTTTTT 1986.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=41,23;AS_QD=31.63,29.76;BaseQRankSum=1.144;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.932;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.944;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,23,23:46:2:1369,2,0:0,0,24,22 0/1:23,18,0:41:99:657,0,875,726,929,1655:12,11,13,5 +chrX 1882365 . C G 1567 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=19.72;BaseQRankSum=-1.931;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.688;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1266,0:0,0,17,22 0/1:25,17:42:99:331,0,650:13,12,12,5 +chrX 1882696 . G A 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.74;BaseQRankSum=0.232;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=4.556;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.569;SOR=1.019;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,110 0/1:36,34:70:99:.:892,0,952:19,17,14,20 +chrX 1882751 . C T 135 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=2.70;BaseQRankSum=3.278;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=5.105;MQ=57.68;MQRankSum=-1.343;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.902;SOR=1.146;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,31:61:99:.:165,0:14,16,19,12 0/0:.:77:99:77:0,120,1800 +chrX 1882836 . C T 4605 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=34.08;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.90;QD=34.08;SOR=0.883;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2391,0:0,0,35,35 1/1:0,66:66:99:2244,199,0:0,0,27,39 +chrX 1883084 . T A 417 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=5.26;BaseQRankSum=0.344;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=0.833;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.820;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,49:85:99:.:447,0:15,21,19,30 0/0:.:64:94:64:0,94,1333 +chrX 1883197 . C CT 263.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=7.97;BaseQRankSum=-2.409;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=1.625;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.579;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:11,27:38:99:.:303,0:4,7,11,16 0/0:.:64:94:64:0,94,1333 +chrX 1883448 . C T 578 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.41;BaseQRankSum=3.973;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.418;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=12.41;ReadPosRankSum=2.142;SOR=0.404;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,148 0/1:27,22:49:99:.:608,0,631:11,16,11,11 +chrX 1884023 . C T 2717 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=21.63;BaseQRankSum=1.178;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=7.894;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=0.257;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1949,0:0,0,31,31 0/1:35,30:65:99:798,0,906:23,12,15,15 +chrX 1884061 . TG T 1040.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=9.31;BaseQRankSum=-0.584;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.390;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.460;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,30:57:99:124,0:14,13,16,14 0/1:31,28:59:99:956,0,1051:19,12,13,15 +chrX 1884091 . C G 611 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.08;BaseQRankSum=-2.019;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=8.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.61;SOR=0.919;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,104 0/1:24,25:49:99:.:641,0,666:15,9,10,15 +chrX 1884814 . C T 3219 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=24.43;BaseQRankSum=2.526;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=3.788;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.43;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.661;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2360,0:0,0,38,32 0/1:32,31:63:99:889,0,846:14,18,16,15 +chrX 1885116 . CA C 1929.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=19.30;BaseQRankSum=-0.647;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.562;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.08;SOR=0.612;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1511,0:0,0,35,27 0/1:16,24:40:99:458,0,269:6,10,12,12 +chrX 1885321 . TG T 1162.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=19.70;BaseQRankSum=0.541;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.988;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.502;SOR=0.549;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:43:75:0,43 0/1:24,37:61:99:.:1202,0,699:10,14,17,20 +chrX 1886208 . C G 208 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=4.03;BaseQRankSum=-1.567;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.266;SOR=0.587;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,34:59:99:.:238,0:14,11,18,16 0/0:.:59:99:59:0,103,1449 +chrX 1886240 . G A 118 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=2.47;BaseQRankSum=0.6;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.960;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.47;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.569;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,32:60:99:.:148,0:15,13,16,16 0/0:.:59:99:59:0,103,1449 +chrX 1886325 . T G 3056 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=22.53;BaseQRankSum=-0.349;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=5.130;MQ=59.85;MQRankSum=0.046;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.387;SOR=1.099;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2304,0:0,0,32,43 0/1:31,31:62:99:782,0,807:16,15,11,20 +chrX 1886382 . C CA 169.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=3.60;BaseQRankSum=-0.807;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.062;MQ=59.90;MQRankSum=1.184;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.887;SOR=1.007;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,33:58:99:.:209,0:10,15,11,22 0/0:.:57:99:57:0,112,1462 +chrX 1886446 . G A 523 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.29;BaseQRankSum=0.347;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=10.927;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.819;SOR=2.200;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,278 0/1:28,21:49:99:.:553,0,775:14,14,16,5 +chrX 1886554 . CTTG C 3901.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=35.32;BaseQRankSum=1.092;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.976;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.16;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.530;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2735,0:0,0,31,30 0/1:18,30:48:99:1206,0,665:8,10,14,16 +chrX 1886811 . T C 460 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=9.80;BaseQRankSum=1.54;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.111;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=0.538;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,32:50:99:.:490,0:7,11,14,18 0/0:.:50:73:50:0,73,1107 +chrX 1886920 . G C 1959 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.08;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.08;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,229 1/1:0,64:64:99:.:1989,191,0:0,0,30,34 +chrX 1887050 . C CT 1186.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=15.14;BaseQRankSum=-0.145;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.929;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.33;SOR=0.506;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,41:42:99:958,0:1,0,24,17 0/1:23,16:39:99:268,0,448:13,10,6,10 +chrX 1890827 . C T 733 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.72;BaseQRankSum=0.566;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=3.667;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.356;SOR=1.251;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 0/1:32,28:60:99:.:763,0,882:18,14,19,9 +chrX 1891510 . TCC T,TC 561.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=9,24;AS_QD=0.00,18.78;BaseQRankSum=1.358;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=45.027;MQ=56.93;MQRankSum=2.6;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.267;SOR=2.773;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:3,9,9:21:99:258,459,0:3,0,6,12 0/2:5,0,15:20:27:343,357,429,0,72,27:5,0,0,15 +chrX 1891542 . T C 1591 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=31.78;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;QD=31.78;SOR=3.215;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:749,0:0,0,3,20 1/1:0,28:28:83:872,83,0:0,0,5,23 +chrX 1891810 . C T 3146 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.79;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.39;QD=33.79;SOR=0.736;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1643,0:0,0,24,25 1/1:0,45:45:99:1533,135,0:0,0,22,23 +chrX 1891834 . C G 2886 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.70;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.10;QD=31.70;SOR=0.782;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1428,0:0,0,22,24 1/1:0,46:46:99:1488,137,0:0,0,22,24 +chrX 1891880 . C T 604 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=6.74;BaseQRankSum=0.21;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.685;MQ=59.20;MQRankSum=0.729;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.915;SOR=0.664;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,26:44:99:258,0:8,10,14,12 0/1:34,16:50:99:376,0,946:20,14,6,10 +chrX 1892589 . AT A 3876.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.58;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.58;SOR=1.064;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2174,0:0,0,43,25 1/1:0,56:56:99:1742,168,0:0,0,29,27 +chrX 1892854 . C CTT 605.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.13;BaseQRankSum=0.805;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=9.829;MQ=59.50;MQRankSum=-0.723;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.552;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1413 0/1:15,25:40:99:.:645,0,393:4,11,14,11 +chrX 1893102 . C T 865 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.97;BaseQRankSum=1.653;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=1.385;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.654;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1413 0/1:36,33:69:99:.:895,0,954:20,16,18,15 +chrX 1893195 . ATTTT A,AT 1951.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=16,50;AS_QD=29.61,29.21;BaseQRankSum=-1.471;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=19.608;MQ=58.52;MQRankSum=2.647;QD=28.04;ReadPosRankSum=0.907;SOR=0.970;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,16,17:33:41:1032,41,0:0,0,16,17 2/2:5,0,33:38:24:959,972,1046,24,97,0:5,0,9,24 +chrX 1893236 . G T 641 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.98;BaseQRankSum=-1.346;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.247;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.426;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,239 0/1:17,25:42:99:.:671,0,427:6,11,11,14 +chrX 1893322 . G A 699 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=7.15;BaseQRankSum=2.128;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=6.303;MQ=59.51;MQRankSum=0.857;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.298;SOR=0.849;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,29:52:99:184,0:18,5,11,18 0/1:30,20:50:99:545,0,832:12,18,10,10 +chrX 1893429 . G A 625 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.70;BaseQRankSum=-0.61;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.869;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,267 0/1:30,26:56:99:.:655,0,804:14,16,11,15 +chrX 1893553 . G A 2800 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=23.98;BaseQRankSum=0.46;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.800;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.573;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1995,0:0,0,28,31 0/1:29,30:59:99:835,0,791:16,13,18,12 +chrX 1894265 . GTC G 1625.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=33.84;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.72;SOR=0.941;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,160 1/1:0,43:43:99:.:1665,130,0:0,0,19,24 +chrX 1894345 . G A 1139 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=30.76;BaseQRankSum=2.245;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.76;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.245;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,160 1/1:1,37:38:99:.:1169,103,0:0,1,18,19 +chrX 1894404 . C T 1388 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=33.76;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.76;SOR=0.892;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,160 1/1:0,42:42:99:.:1418,126,0:0,0,23,19 +chrX 1894420 . C CCTCT 43.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=1.60;BaseQRankSum=-0.602;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=10.268;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.183;SOR=1.407;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,27:52:83:.:83,0:15,10,9,18 0/0:.:42:44:42:0,44,953 +chrX 1894548 . GTCTC G 1221.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=29.63;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.48;SOR=1.071;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:40:36:37:0,36 1/1:0,29:29:87:.:1261,87,0:0,0,12,17 +chrX 1894666 . A T 2558 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.35;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=32.35;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1374,0:0,0,21,22 1/1:0,37:37:99:1214,110,0:0,0,21,16 +chrX 1895510 . C CACACACACACAG 3368.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=34.78;BaseQRankSum=0.426;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=14.213;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=34.78;ReadPosRankSum=0.61;SOR=1.005;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1920,0:0,0,16,27 0/1:18,37:55:99:1488,0,585:12,6,15,22 +chrX 1895644 . CACAGACACAA C 1436.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=27.46;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.73;SOR=1.981;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:74:56:0,74 1/1:0,33:33:99:.:1476,100,0:0,0,9,24 +chrX 1895716 . TACACAGAC T,CACACAGAC 1851 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=58,0;AS_QD=25.42,0.56;BaseQRankSum=0.333;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.074;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=25.42;ReadPosRankSum=-2.515;SOR=0.892;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,23,0:39:99:306,0,1022:7,9,9,14 1/1:0,35,0:35:99:1575,105,0,1568,105,1566:0,0,14,21 +chrX 1895732 . GAC G 1838.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=23.48;BaseQRankSum=-1.447;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=23.48;ReadPosRankSum=-2.846;SOR=0.629;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,24:42:99:261,0:7,11,9,15 1/1:1,37:38:90:1617,90,0:0,1,15,22 +chrX 1895854 . GAC G,CAC 1751 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=64,2;AS_QD=22.54,0.00;BaseQRankSum=-1.839;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=10.502;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=21.99;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=0.849;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,29,2:46:99:520,0,1322:5,10,20,11 1/1:0,35,0:35:99:1261,105,0,1261,105,1261:0,0,19,16 +chrX 1896577 . A G 4564 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=34.80;BaseQRankSum=0.864;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=3.497;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.80;ReadPosRankSum=-0.96;SOR=0.601;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,64:65:99:.:.:1808,0:.:1,0,29,35 1|1:0,67:67:99:0|1:1896577_A_G:2786,201,0:1896577:0,0,29,38 +chrX 1896606 . T C 4686 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=30.41;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.84;SOR=1.010;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:1905,0:.:0,0,26,34 1|1:0,68:68:99:0|1:1896577_A_G:2811,204,0:1896577:0,0,29,39 +chrX 1896652 . G A 2100 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=17.90;BaseQRankSum=2.192;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.54;MQRankSum=-0.149;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=0.698;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,31:56:99:209,0:11,14,12,19 1/1:1,62:63:99:1921,178,0:1,0,31,31 +chrX 1896809 . C A 2503 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=26.39;BaseQRankSum=1.766;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.53;MQRankSum=2.544;QD=26.39;ReadPosRankSum=1.042;SOR=0.990;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,47:50:99:1308,0:2,1,30,17 1/1:3,43:46:67:1225,67,0:1,2,21,22 +chrX 1896885 . C T 2046 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=29.36;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.46;QD=43.25;SOR=1.179;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:59:61:.:.:0,59 1|1:0,48:48:99:.:0|1:1896885_C_T:2076,144,0:1896885:0,0,19,29 +chrX 1896896 . C T 2289 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=34.18;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.92;QD=44.60;SOR=0.941;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:59:61:.:.:0,59 1|1:0,52:52:99:.:0|1:1896885_C_T:2319,157,0:1896885:0,0,23,29 +chrX 1896905 . A G 2153 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=30.73;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.09;QD=44.55;SOR=0.818;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:59:61:.:.:0,59 1|1:0,49:49:99:.:0|1:1896885_C_T:2183,147,0:1896885:0,0,23,26 +chrX 1896908 . G T 2008 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=33.54;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.10;QD=44.30;SOR=0.976;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:59:61:.:.:0,59 1|1:0,46:46:99:.:0|1:1896885_C_T:2038,138,0:1896885:0,0,20,26 +chrX 1897046 . T C 1968 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=31.04;BaseQRankSum=1.344;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.79;MQRankSum=-0.996;QD=39.18;ReadPosRankSum=-0.413;SOR=0.818;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:59:61:.:.:0,59 1|1:2,49:51:69:.:0|1:1897046_T_C:1998,69,0:1897046:1,1,26,23 +chrX 1897066 . A G 2249 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=24.95;BaseQRankSum=1.406;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.16;MQRankSum=-0.944;QD=41.44;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=0.730;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:59:61:.:.:0,59 1|1:2,53:55:81:.:0|1:1897046_T_C:2279,81,0:1897046:1,1,26,27 +chrX 1897069 . A G 2249 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=29.78;BaseQRankSum=2.72;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.25;MQRankSum=-0.944;QD=41.44;ReadPosRankSum=-0.697;SOR=0.730;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:59:61:.:.:0,59 1|1:2,53:55:81:.:0|1:1897046_T_C:2279,81,0:1897046:1,1,26,27 +chrX 1897124 . G C 1815 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=33.55;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.78;QD=33.55;SOR=0.729;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:59:61:0,59 1/1:0,55:55:99:.:1845,165,0:0,0,28,27 +chrX 1897825 . C G 1989 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=33.65;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.65;SOR=0.986;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:59:61:0,59 1/1:0,60:60:99:.:2019,180,0:0,0,26,34 +chrX 1898076 . C A 2277 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=17.35;BaseQRankSum=2.039;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=3.705;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.419;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,33:66:99:101,0:13,20,17,16 1/1:0,67:67:99:2206,201,0:0,0,31,36 +chrX 1898428 . C CA 790.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.09;BaseQRankSum=0.841;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.317;SOR=0.627;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,535 0|1:27,28:55:99:.:0|1:1898428_C_CA:830,0,1039:1898428:13,14,14,14 +chrX 1898430 . A G 703 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.33;BaseQRankSum=-0.379;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.33;ReadPosRankSum=-1.507;SOR=0.765;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,535 0|1:28,27:55:99:.:1|0:1898428_C_CA:733,0,1093:1898428:14,14,13,14 +chrX 1898610 . CT C 322.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=9.28;BaseQRankSum=1.677;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=4.643;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.916;SOR=0.646;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,535 0/1:21,18:39:99:.:362,0,437:13,8,8,10 +chrX 1898669 . A G 736 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=7.58;BaseQRankSum=-1.287;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=3.693;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.542;SOR=1.084;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,28:49:99:197,0:9,12,17,11 0/1:28,24:52:99:569,0,753:16,12,14,10 +chrX 1898947 . C T 3460 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=21.95;BaseQRankSum=2.297;DP=163;ExcessHet=0.0000;FS=10.935;MQ=59.98;MQRankSum=0;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.883;VarDP=159 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,85:85:99:2733,0:0,0,48,37 0/1:45,29:74:99:757,0,1145:19,26,18,11 +chrX 1899124 . C T 669 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.05;BaseQRankSum=0.89;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.586;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:76:99:76:0,248 0/1:31,27:58:99:.:699,0,798:14,17,13,14 +chrX 1899276 . CT C 641.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=5.92;BaseQRankSum=-0.663;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.425;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.684;SOR=1.051;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,36:64:99:233,0:13,15,20,16 0/1:30,21:51:99:448,0,701:17,13,14,7 +chrX 1899294 . A G 881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=7.01;BaseQRankSum=1.307;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=6.473;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.01;ReadPosRankSum=1.636;SOR=0.968;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,41:71:99:418,0:13,17,22,19 0/1:36,23:59:99:493,0,968:18,18,15,8 +chrX 1899333 . C T 894 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.66;BaseQRankSum=0.417;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.833;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:76:99:76:0,461 0/1:23,36:59:99:.:924,0,858:11,12,16,20 +chrX 1899341 . C G 627 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=5.02;BaseQRankSum=0.372;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.31;SOR=0.659;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,43:72:99:105,0:11,18,17,26 0/1:36,23:59:99:552,0,1419:16,20,11,12 +chrX 1899432 . A G 707 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=6.46;BaseQRankSum=0.685;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=6.282;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.593;SOR=1.349;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,35:60:99:266,0:6,19,10,25 0/1:35,19:54:99:471,0,1014:18,17,5,14 +chrX 1900240 . G T 2044 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=17.00;BaseQRankSum=-0.22;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.771;MQ=59.38;MQRankSum=-0.784;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.167;SOR=0.981;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,44:73:99:447,0:13,16,16,28 1/1:0,49:49:99:1627,147,0:0,0,20,29 +chrX 1900300 . A G 4011 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=32.85;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=32.85;SOR=0.812;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2491,0:0,0,34,42 1/1:0,47:47:99:1550,141,0:0,0,24,23 +chrX 1900503 . AT A 3392.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=32.39;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=35.75;SOR=0.870;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47:47:99:.:.:1658,0:.:0,0,17,30 1|1:0,49:49:99:0|1:1900484_G_A:1774,147,0:1900484:0,0,27,22 +chrX 1900593 . A T 634 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.76;BaseQRankSum=-1.306;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.66;SOR=0.327;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,154 0/1:21,24:45:99:.:664,0,592:7,14,11,13 +chrX 1900658 . G C 627 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.88;BaseQRankSum=-0.587;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.978;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.306;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,154 0/1:26,25:51:99:.:657,0,681:9,17,12,13 +chrX 1900737 . G C 1352 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=15.36;BaseQRankSum=1.85;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.774;MQ=59.73;MQRankSum=1.135;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.569;SOR=0.942;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:16,28:44:99:.:.:470,0:.:5,11,13,15 0|1:21,25:46:99:0|1:1900737_G_C:912,0,734:1900737:11,10,7,18 +chrX 1900743 . ATTT A,AT 1696.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=37,26;AS_QD=24.29,18.71;BaseQRankSum=0.241;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=9.640;MQ=59.54;MQRankSum=0.197;QD=21.17;ReadPosRankSum=0.86;SOR=1.360;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,12,26:38:99:.:.:842,376,0:.:0,0,16,22 0|1:19,25,0:44:99:0|1:1900737_G_C:894,0,690,951,764,1715:1900737:11,8,6,19 +chrX 1900808 . C A 651 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=10.32;BaseQRankSum=-0.156;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=2.021;MQ=59.75;MQRankSum=1.001;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.411;SOR=0.473;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:9,15:24:99:182,0:5,4,5,10 0/1:22,20:42:99:499,0,598:8,14,12,8 +chrX 1900907 . AAT A 827.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.06;BaseQRankSum=2.286;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.040;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.175;SOR=0.890;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:99:43:0,822 0/1:31,23:54:99:.:867,0,1181:15,16,10,13 +chrX 1900959 . T C 1099 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.53;BaseQRankSum=1.216;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.028;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.649;SOR=0.892;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:43:99:43:.:.:0,822 0|1:26,29:55:99:.:0|1:1900959_T_C:1129,0,983:1900959:14,12,17,12 +chrX 1900961 . T C 1099 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.53;BaseQRankSum=0.911;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.028;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.677;SOR=0.892;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:43:99:43:.:.:0,822 0|1:26,29:55:99:.:0|1:1900959_T_C:1129,0,983:1900959:14,12,17,12 +chrX 1900985 . C T 794 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=8.16;BaseQRankSum=2.695;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=3.774;MQ=59.95;MQRankSum=1.188;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.342;SOR=1.120;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,29:51:99:294,0:11,11,17,12 0/1:29,21:50:99:530,0,773:17,12,15,6 +chrX 1901069 . C T 900 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.03;BaseQRankSum=-0.553;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=21.078;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.98;SOR=0.957;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1591 0/1:24,34:58:99:.:930,0,651:18,6,13,21 +chrX 1901239 . G A 665 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.41;BaseQRankSum=2.171;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.670;MQ=59.90;MQRankSum=-1.038;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.479;SOR=1.220;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1591 0/1:30,26:56:99:.:695,0,695:15,15,16,10 +chrX 1901334 . C T 771 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.40;BaseQRankSum=0.258;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.050;MQ=59.90;MQRankSum=-0.817;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.787;SOR=0.540;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1591 0/1:22,30:52:99:.:801,0,549:10,12,15,15 +chrX 1901465 . CA C 2370.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=25.91;BaseQRankSum=-0.264;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.91;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=0.260;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,50:51:99:1311,0:0,1,28,22 1/1:0,42:42:99:1099,126,0:0,0,16,26 +chrX 1901811 . C CT 853.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=27.91;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;QD=27.91;SOR=1.284;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:79:99:79:0,471 1/1:0,32:32:96:.:893,96,0:0,0,20,12 +chrX 1901856 . T C 2495 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=29.71;BaseQRankSum=2.974;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=7.057;MQ=57.77;MQRankSum=-0.301;QD=29.71;ReadPosRankSum=-0.644;SOR=0.584;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,48:50:99:1487,0:2,0,19,29 1/1:0,35:35:99:1038,104,0:0,0,17,18 +chrX 1902028 . A C 682 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.24;BaseQRankSum=0.511;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.441;MQ=58.28;MQRankSum=-2.22;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.185;SOR=0.404;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,993 0/1:24,26:50:99:.:712,0,634:16,8,15,11 +chrX 1902119 . C CTT 623.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.79;BaseQRankSum=1.013;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.38;MQRankSum=-1.267;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.850;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,993 0/1:19,23:42:99:.:663,0,581:9,10,10,13 +chrX 1902406 . T C 860 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=11.87;BaseQRankSum=-4.028;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;MQRankSum=-0.987;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.749;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,993 0/1:38,37:75:99:.:890,0,1087:18,20,17,20 +chrX 1902671 . T G 486 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.75;BaseQRankSum=0.419;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.611;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,993 0/1:28,20:48:99:.:516,0,770:12,16,9,11 +chrX 1903449 . G C 324 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=5.21;BaseQRankSum=-1.531;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=12.986;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.714;SOR=0.707;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,40:68:99:.:354,0:9,19,23,17 0/0:.:62:99:62:0,99,1360 +chrX 1903465 . A G 5619 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=31.15;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=0.840;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,70:70:99:.:.:3073,0:.:0,0,33,37 1|1:0,59:59:99:0|1:1903465_A_G:2576,178,0:1903465:0,0,27,32 +chrX 1903474 . T C 5461 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=30.49;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.28;SOR=0.865;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2915,0:.:0,0,30,35 1|1:0,59:59:99:0|1:1903465_A_G:2576,178,0:1903465:0,0,27,32 +chrX 1903552 . A G 346 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=5.37;BaseQRankSum=-2.138;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=8.448;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=0.929;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,42:70:99:.:376,0:17,11,17,25 0/0:.:57:99:57:0,120,1800 +chrX 1903606 . G A 1042 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=17.02;BaseQRankSum=1.623;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.02;ReadPosRankSum=2.467;SOR=0.623;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1471 0/1:25,38:63:99:.:1072,0,570:15,10,22,16 +chrX 1903649 . C T 1062 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=17.06;BaseQRankSum=0.951;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.978;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.06;ReadPosRankSum=-1.005;SOR=0.790;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1471 0/1:25,39:64:99:.:1092,0,606:12,13,21,18 +chrX 1904183 . T C 917 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=10.52;BaseQRankSum=0.27;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=2.838;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.329;SOR=0.416;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,31:48:99:435,0:9,8,17,14 0/1:23,19:42:99:512,0,642:16,7,10,9 +chrX 1904208 . A G 794 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=8.77;BaseQRankSum=0.08;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.778;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.848;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,30:50:99:310,0:8,12,16,14 0/1:23,21:44:99:514,0,646:14,9,12,9 +chrX 1904275 . C A 3047 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=33.45;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.45;SOR=0.737;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1549,0:0,0,22,24 1/1:0,46:46:99:1528,138,0:0,0,23,23 +chrX 1904627 . A ATGATGATAATGGTGATGATGTGATGGTGATGATAGTGATGGTGATGATGGTGATGGTGAGGATGCTGATGGTGATGACGGTGATAATGGTGAGAATGATGACAGTGATGATGTGATGGTGATGATGATGATAGGGTGAAAATGTGATGATGATGATGGTGATGATATGGTGATGGTGATGGTGATGATAGTGATGTATGGTGATGGTGATGG,ATGATGATAATGGTGATGATGTGATGGTGATGATAGTGATGGTGATGATGGTGATGGTGAGGATGCTGATGGTGATGACGGTGATAATGGTGATAATGATGACAGTGATGATGTGATGGTGATGATGATGATAGGGTGAAAATGTGATGATGATGATGGTGATGATATGGTGATGGTGATGGTGATGATAGTGATGTATGGTGATGGTGATGG,ATGATGATAATGGTGATGATGTGATGGTGATGATAGTGATGGTGATGATGGTGATGATGATGATGGAGATGAGGATGATGGTGATGATGGTGATAATGGTGAGAATGATGACAGTGATGATGTGATGGTGATGATGATGATAGGGTGAAAATGTGATGATGATGATGGTGATGATATGGTGATGGTGATGGTGATGATAGTGATGTATGGTGATGGTGATGG,ATGATGATAATGGTGATGATGTGATGGTGATGATAGTGATGGTGATGATGGTGATGATGATGATGGAGATGAGGATGATGGTGATGATGGTGATAATGGTGATAATGATGACAGTGATGATGTGATGGTGATGATGATGATAGGGTGAAAATGTGATGATGATGATGGTGATGATATGGTGATGGTGATGGTGATGATAGTGATGTATGGTGATGGTGATGG,ATGATGATAATGGTGATGATGTGATGGTGATGATAGTGATGGTGATGATGGTGATGGTGAGGATGCTGATGGTGATGACGGTGATGGTGATGATGGTGATAATGGTGATAATGATGACAGTGATGATGTGATGGTGATGATGATGATAGGGTGAAAATGTGATGATGATGATGGTGATGATATGGTGATGGTGATGGTGATGATAGTGATGTATGGTGATGGTGATGG 3859.97 . AC=1,0,0,1,1;AF=0.333,0.00,0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,0,0,5,10;AS_QD=35.77,33.34,31.16,26.55,34.25;BaseQRankSum=2.357;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=8.280;MQ=55.71;MQRankSum=-1.719;QD=185.67;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.766;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,0,0,0,3,0:3:0:1815,0,0,377,273,1127:0,0,2,1 4/5:6,0,0,0,2,10:18:56:2084,1381,1284,1381,1284,1284,1381,1284,1284,1284,473,485,485,485,367,180,193,193,193,0,56:5,1,4,8 +chrX 1905209 . A G 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.12;BaseQRankSum=-2.008;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.455;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.346;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,491 0/1:23,28:51:99:.:720,0,637:8,15,13,15 +chrX 1905769 . G A 830 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.83;BaseQRankSum=0.15;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.685;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,491 0/1:27,31:58:99:.:860,0,964:14,13,16,15 +chrX 1905791 . A G 1139 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=9.91;BaseQRankSum=0.627;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=8.497;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.089;SOR=0.640;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,34:57:99:292,0:16,7,15,19 0/1:29,32:61:99:877,0,1089:15,14,15,17 +chrX 1905851 . T C 1849 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=16.34;BaseQRankSum=-1.498;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=4.089;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=0.382;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,31:59:44:44,0:17,11,14,17 1/1:0,56:56:99:1835,168,0:0,0,30,26 +chrX 1906144 . G A 323 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=6.66;BaseQRankSum=-1.109;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.264;SOR=0.724;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,32:53:99:.:353,0:10,11,15,17 0/0:.:58:98:58:0,98,1440 +chrX 1906512 . G A 859 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.57;BaseQRankSum=0.529;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.725;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1415 0/1:29,32:61:99:.:889,0,775:17,12,19,13 +chrX 1906951 . T C 820 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.41;BaseQRankSum=-0.589;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.008;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.495;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1415 0/1:28,31:59:99:.:850,0,765:17,11,17,14 +chrX 1906998 . G C 3747 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.28;BaseQRankSum=-1.252;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=5.497;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=32.28;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.309;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2689,0:.:0,0,30,30 0|1:29,28:57:99:0|1:1906998_G_C:1088,0,1133:1906998:19,10,16,12 +chrX 1906999 . A G 3747 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.28;BaseQRankSum=-2.633;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=5.497;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=32.28;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.309;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2689,0:.:0,0,30,30 0|1:29,28:57:99:0|1:1906998_G_C:1088,0,1133:1906998:19,10,16,12 +chrX 1907272 . G A 640 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.96;BaseQRankSum=0.487;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.551;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:59:61:0,59 0/1:24,24:48:99:.:670,0,660:11,13,12,12 +chrX 1907407 . T G 965 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.58;BaseQRankSum=-1.002;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.626;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.66;SOR=1.103;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:59:61:0,59 0/1:25,35:60:99:.:995,0,679:13,12,14,21 +chrX 1907469 . G T 986 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=16.13;BaseQRankSum=-1.019;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=5.067;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=0.805;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:59:61:0,59 0/1:26,37:63:99:.:1016,0,684:15,11,16,21 +chrX 1907893 . A G 3798 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=31.38;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=31.38;SOR=0.868;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2088,0:0,0,29,38 1/1:0,55:55:99:1740,165,0:0,0,27,28 +chrX 1908879 . G A 2722 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=23.72;BaseQRankSum=2.786;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.766;MQ=59.83;MQRankSum=-0.206;QD=23.72;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.941;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2178,0:0,0,25,42 0/1:28,21:49:99:574,0,671:14,14,14,7 +chrX 1909078 . T G 679 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.82;BaseQRankSum=0.744;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.053;MQ=59.74;MQRankSum=-0.504;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.792;SOR=0.818;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,1493 0|1:40,20:60:99:.:0|1:1909078_T_G:709,0,1578:1909078:21,19,9,11 +chrX 1909080 . G A 679 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.82;BaseQRankSum=1.227;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.053;MQ=59.74;MQRankSum=-0.504;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.754;SOR=0.818;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,1493 0|1:40,20:60:99:.:0|1:1909078_T_G:709,0,1578:1909078:21,19,9,11 +chrX 1909571 . G A 3505 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=33.35;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.35;SOR=0.731;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1862,0:0,0,26,29 1/1:0,51:51:99:1673,153,0:0,0,28,23 +chrX 1909947 . A G 3924 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=32.15;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.15;SOR=0.963;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2049,0:0,0,28,36 1/1:0,59:59:99:1905,176,0:0,0,26,33 +chrX 1909999 . C CCT 3559.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=31.57;BaseQRankSum=1.892;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.072;MQ=59.60;MQRankSum=-0.944;QD=31.57;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.409;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2651,0:0,0,25,36 0/1:26,27:53:99:948,0,986:8,18,10,17 +chrX 1910000 . C CTGTGTGTG 912.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.96;BaseQRankSum=-2.493;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.43;MQRankSum=0.983;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=0.850;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,1453 0/1:28,25:53:99:.:952,0,1014:10,18,8,17 +chrX 1910061 . CCTCTTTCTCCCACTCT C 523.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=7.13;BaseQRankSum=0.901;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.646;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,18:36:17:17,0:7,11,8,10 0/1:28,15:43:99:546,0,1109:12,16,6,9 +chrX 1910228 . C CCTCT 1431.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=29.42;BaseQRankSum=1.151;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=3.017;MQ=59.45;MQRankSum=0;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.154;SOR=0.292;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23:24:99:929,0:0,1,9,14 0/1:12,14:26:99:542,0,458:3,9,5,9 +chrX 1910280 . TCTCA T 834.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=14.81;BaseQRankSum=-1.018;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=1.026;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.695;SOR=0.897;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:11,18:29:99:236,0:6,5,7,11 0/1:12,18:30:99:638,0,407:4,8,7,11 +chrX 1910439 . A T 1945 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=32.38;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=0.941;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:923,0:0,0,12,16 1/1:0,33:33:99:1052,99,0:0,0,15,18 +chrX 1910489 . CCTT C 307.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.57;BaseQRankSum=-0.34;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.477;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.194;SOR=1.078;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:11,19:30:99:.:347,0:5,6,7,12 0/0:.:47:32:41:0,32,876 +chrX 1910620 . CTCT C 365.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.97;BaseQRankSum=0.244;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.49;MQRankSum=-1.492;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.853;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:10,19:29:99:.:405,0:4,6,7,12 0/0:.:43:36:43:0,36,997 +chrX 1910635 . CCCCTCTTCCTGCCTCTCTTCCTCTCTTCCT C 188.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=6.51;BaseQRankSum=1.112;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.958;MQ=56.87;MQRankSum=-0.482;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.22;SOR=1.057;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,20:35:99:.:228,0:8,7,8,12 0/0:.:47:49:47:0,49,1085 +chrX 1910655 . CCTCTCTTCCTCCCTCTTCCTGCCTCTCTTCCT *,C 156.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,7;AS_QD=0.00,5.60;BaseQRankSum=0.774;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.418;MQ=57.46;MQRankSum=-0.261;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.551;SOR=1.197;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,20,0:35:99:228,0,876:8,7,8,12 0/2:28,0,7:35:99:196,280,1392,0,1112,1085:11,17,1,6 +chrX 1910676 . G *,C 755 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;AS_AltDP=7,18;AS_QD=0.00,28.65;BaseQRankSum=0.217;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.35;MQRankSum=-0.424;QD=29.07;ReadPosRankSum=2.086;SOR=1.609;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:49:.:49:0,0,0 1/2:2,7,18:27:99:.:785,465,813,222,0,212:1,1,8,17 +chrX 1910760 . G C 3768 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=28.99;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.78;QD=28.99;SOR=0.838;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2044,0:0,0,31,39 1/1:0,61:61:99:1754,183,0:0,0,30,31 +chrX 1911735 . T TCACA 290.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=6.23;BaseQRankSum=0.41;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.910;MQ=59.61;MQRankSum=-0.804;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.668;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,31:53:99:.:330,0:13,9,14,17 0/0:.:31:36:30:0,36,610 +chrX 1913663 . AAC A 1133.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=18.05;BaseQRankSum=1.744;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.950;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.05;ReadPosRankSum=-1.26;SOR=0.538;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1388 0/1:33,32:65:99:.:1173,0,1280:13,20,14,18 +chrX 1914200 . C T 965 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=8.43;BaseQRankSum=-1.171;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.695;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.271;SOR=0.580;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,40:68:99:381,0:18,10,24,16 0/1:25,25:50:99:614,0,719:13,12,12,13 +chrX 1914470 . A G 1021 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=7.96;BaseQRankSum=0.113;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=3.139;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.96;ReadPosRankSum=2.066;SOR=0.894;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,42:75:99:314,0:15,18,16,26 0/1:29,28:57:99:737,0,792:17,12,15,13 +chrX 1914747 . G A 606 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.36;BaseQRankSum=1.167;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.770;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:34:63:0,34 0/1:32,24:56:99:.:636,0,864:14,18,10,14 +chrX 1915360 . G A 852 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=11.92;BaseQRankSum=0.321;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=1.936;MQ=59.95;MQRankSum=-1.087;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.186;SOR=0.773;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:34:63:0,34 0/1:41,33:74:99:.:882,0,1143:19,22,18,15 +chrX 1915859 . C G 838 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.23;BaseQRankSum=1.393;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.518;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:34:63:0,34 0/1:29,32:61:99:.:868,0,723:16,13,16,16 +chrX 1916708 . C T 1293 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=25.24;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.38;QD=38.91;SOR=0.941;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:42:99:42:.:.:0,155 1|1:0,34:34:99:.:0|1:1916708_C_T:1323,102,0:1916708:0,0,19,15 +chrX 1916760 . T C 575 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.44;BaseQRankSum=-0.666;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.174;MQ=53.76;MQRankSum=1.908;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.898;SOR=0.459;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:42:99:42:.:.:0,155 0|1:22,23:45:99:.:0|1:1916708_C_T:605,0,492:1916708:14,8,13,10 +chrX 1916783 . C T 2883 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=22.93;BaseQRankSum=2.139;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.413;MQ=57.91;MQRankSum=-0.448;QD=36.87;ReadPosRankSum=-1.46;SOR=0.556;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,37:38:99:.:.:1227,0:.:0,1,18,19 1|1:0,41:41:99:0|1:1916708_C_T:1686,123,0:1916708:0,0,25,16 +chrX 1917333 . T C 568 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.49;BaseQRankSum=-0.345;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.642;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.48;SOR=0.501;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:44:49:0,44 0/1:32,25:57:99:.:598,0,847:13,19,13,12 +chrX 1917658 . A AG 2741.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=27.81;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.81;SOR=0.957;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1071,0:0,0,24,14 1/1:0,62:62:99:1710,185,0:0,0,32,30 +chrX 1917734 . T C 2484 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=22.05;BaseQRankSum=0.636;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.729;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.05;ReadPosRankSum=0.02;SOR=0.901;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1588,0:0,0,28,21 0/1:29,36:65:99:926,0,663:15,14,20,16 +chrX 1918007 . A G 1741 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=33.42;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=0.981;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1514 1/1:0,53:53:99:.:1771,159,0:0,0,23,30 +chrX 1918250 . T TTTC 1799.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=33.34;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.38;QD=44.85;SOR=0.741;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1514 1/1:0,41:41:99:.:1839,123,0:0,0,20,21 +chrX 1918307 . G A 154 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=2.79;BaseQRankSum=2.233;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.761;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,35:66:99:.:184,0:19,12,22,13 0/0:.:34:65:34:0,65,913 +chrX 1918316 . G A 426 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=16.29;BaseQRankSum=0.938;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=28.290;MQ=58.88;MQRankSum=-0.208;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=1.839;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1800 0|1:16,12:28:99:.:0|1:1918316_G_A:456,0,615:1918316:14,2,3,9 +chrX 1918319 . G T 420 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=0.492;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=20.959;MQ=58.88;MQRankSum=-0.294;QD=15.00;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=1.850;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1800 0|1:18,12:30:99:.:0|1:1918316_G_A:450,0,699:1918316:14,4,3,9 +chrX 1918323 . AACG A 413.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=15.62;BaseQRankSum=-1.083;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=20.209;MQ=58.84;MQRankSum=-0.252;QD=15.62;ReadPosRankSum=-1.092;SOR=1.853;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1800 0|1:17,12:29:99:.:0|1:1918316_G_A:453,0,678:1918316:13,4,3,9 +chrX 1918329 . G GGCA 410.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=0.91;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=20.959;MQ=58.88;MQRankSum=-0.294;QD=15.00;ReadPosRankSum=-1.706;SOR=1.850;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1800 0|1:18,12:30:99:.:0|1:1918316_G_A:450,0,720:1918316:14,4,3,9 +chrX 1918331 . G A 420 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=1.617;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=20.959;MQ=58.88;MQRankSum=-0.294;QD=15.00;ReadPosRankSum=-1.32;SOR=1.850;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1800 0|1:18,12:30:99:.:0|1:1918316_G_A:450,0,720:1918316:14,4,3,9 +chrX 1918332 . A G 336 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=13.07;BaseQRankSum=1.615;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=22.668;MQ=58.79;MQRankSum=-0.429;QD=13.07;ReadPosRankSum=-1.512;SOR=2.209;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1800 0|1:18,10:28:99:.:0|1:1918316_G_A:366,0,726:1918316:14,4,2,8 +chrX 1918336 . T C 333 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=12.52;BaseQRankSum=-1.215;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=23.447;MQ=58.84;MQRankSum=-0.47;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.906;SOR=2.208;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1800 0|1:19,10:29:99:.:0|1:1918316_G_A:363,0,768:1918316:15,4,2,8 +chrX 1918356 . T C 2912 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.98;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.45;QD=31.98;SOR=1.154;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2002,0:0,0,38,27 1/1:0,27:27:81:940,81,0:0,0,17,10 +chrX 1918359 . T C 111 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=5.04;BaseQRankSum=0.3;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.521;MQ=58.46;MQRankSum=-1.209;QD=5.04;ReadPosRankSum=-2.391;SOR=0.739;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:29:50:.:.:0,29 0|1:23,5:28:99:.:0|1:1918316_G_A:141,0,951:1918316:15,8,2,3 +chrX 1918360 . T C 111 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=5.04;BaseQRankSum=1.184;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.521;MQ=58.46;MQRankSum=-1.209;QD=5.04;ReadPosRankSum=-2.527;SOR=0.739;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:29:50:.:.:0,29 0|1:23,5:28:99:.:0|1:1918316_G_A:141,0,951:1918316:15,8,2,3 +chrX 1918797 . G T 56 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=2.15;BaseQRankSum=0.018;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=38.634;MQ=59.64;MQRankSum=0.786;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.695;SOR=3.895;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:29:50:0,29 0/1:26,14:40:86:.:86,0,620:7,19,13,1 +chrX 1918858 . G A 563 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.89;BaseQRankSum=0.671;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=6.235;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.991;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:29:50:0,29 0/1:23,23:46:99:.:593,0,572:9,14,14,9 +chrX 1918983 . TTTATTTATTTATTTA T 854.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.90;BaseQRankSum=0.246;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=14.024;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.045;SOR=1.496;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:29:50:0,29 0/1:35,25:60:99:.:894,0,1237:14,21,17,8 +chrX 1919419 . C T 804 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.74;BaseQRankSum=0.694;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.672;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.855;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1429 0/1:22,31:53:99:.:834,0,541:13,9,13,18 +chrX 1919817 . AACACACAC AACAC,AACACACACAC,A 1030.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,20,17;AS_QD=2.00,12.85,19.40;BaseQRankSum=-0.518;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.206;MQ=59.63;MQRankSum=0.333;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.635;SOR=0.440;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,16,3,0:31:58:58,0,341,552:7,5,8,11 2/3:1,0,17,17:35:99:1012,1077,1323,610,657,588,430,728,0,892:1,0,20,14 +chrX 1919901 . T C 635 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=5.99;BaseQRankSum=-0.486;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=7.378;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.602;SOR=1.332;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,26:50:49:49,0:9,15,17,9 0/1:35,26:61:99:616,0,969:22,13,17,9 +chrX 1920370 . C G 603 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.55;BaseQRankSum=-0.111;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=6.916;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.97;SOR=1.108;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:29:63:0,29 0/1:34,26:60:99:.:633,0,921:19,15,10,16 +chrX 1921338 . C A 152 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=2.84;BaseQRankSum=0.726;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.962;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.84;ReadPosRankSum=-1.043;SOR=0.927;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,34:64:99:.:182,0:16,14,20,14 0/0:.:58:55:58:0,55,1103 +chrX 1921493 . T C 124 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=2.41;BaseQRankSum=-1.546;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.112;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.916;SOR=0.440;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,35:64:99:.:154,0:11,18,16,19 0/0:.:58:55:58:0,55,1103 +chrX 1923125 . C G 3066 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=31.92;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.77;QD=31.92;SOR=0.799;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1662,0:0,0,26,26 1/1:0,45:45:99:1434,134,0:0,0,20,25 +chrX 1923735 . C T 824 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=22.47;BaseQRankSum=-0.176;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;MQRankSum=1.857;QD=22.47;ReadPosRankSum=0.137;SOR=1.008;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,805 0/1:9,29:38:99:.:854,0,189:4,5,11,18 +chrX 1923857 . C G 686 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.27;BaseQRankSum=0.861;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.624;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.47;SOR=0.364;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,805 0/1:19,25:44:99:.:716,0,483:7,12,12,13 +chrX 1925650 . T C 671 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.93;BaseQRankSum=-1.768;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.723;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,805 0/1:18,26:44:99:.:701,0,483:11,7,16,10 +chrX 1925874 . C T 4407 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=32.87;BaseQRankSum=2.991;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=3.669;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=32.87;ReadPosRankSum=1.707;SOR=0.722;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2323,0:0,0,41,29 1/1:1,64:65:99:2114,185,0:0,1,36,28 +chrX 1927184 . GA G 503.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.93;BaseQRankSum=-1.774;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=9.322;MQ=59.70;MQRankSum=-0.818;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.432;SOR=1.746;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:61:55:0,61 0/1:18,24:42:99:.:543,0,351:10,8,7,17 +chrX 1927599 . G A 549 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.53;BaseQRankSum=0.393;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.53;ReadPosRankSum=2.049;SOR=0.743;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:61:55:0,61 0/1:32,23:55:99:.:579,0,862:19,13,14,9 +chrX 1927707 . A C 819 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.15;BaseQRankSum=-0.268;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.299;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.580;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:61:55:.:.:0,61 0|1:36,24:60:99:.:0|1:1927707_A_C:849,0,1374:1927707:14,22,13,11 +chrX 1927729 . C T 870 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.29;BaseQRankSum=0.985;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.960;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.551;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:61:55:.:.:0,61 0|1:37,26:63:99:.:0|1:1927707_A_C:900,0,1399:1927707:17,20,13,13 +chrX 1927765 . CT C 309.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=7.93;BaseQRankSum=-1.176;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.187;MQ=59.63;MQRankSum=0;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.012;SOR=0.452;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:61:55:0,61 0/1:25,19:44:99:.:349,0,516:10,15,9,10 +chrX 1928280 . G A 726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.19;BaseQRankSum=0.348;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.940;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=0.826;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:61:55:0,61 0/1:32,30:62:99:.:756,0,806:16,16,16,14 +chrX 1928405 . C CT 316.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.13;BaseQRankSum=-0.558;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=11.498;MQ=58.80;MQRankSum=-1.443;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.691;SOR=1.901;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:61:55:.:.:0,61 0|1:13,19:32:99:.:0|1:1928405_C_CT:356,0,173:1928405:5,8,14,5 +chrX 1928645 . G C 784 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.36;BaseQRankSum=1.891;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.666;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:61:55:0,61 0/1:25,28:53:99:.:814,0,664:14,11,13,15 +chrX 1928757 . C G 938 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=14.03;BaseQRankSum=-1.519;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=6.381;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.03;ReadPosRankSum=3.317;SOR=0.772;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:61:55:0,61 0/1:32,37:69:99:.:968,0,835:19,13,16,21 +chrX 1929322 . C CT 465.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=6.23;BaseQRankSum=1.829;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=11.494;MQ=59.68;MQRankSum=1.391;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.885;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,27:42:99:194,0:6,9,17,10 0/1:17,22:39:99:311,0,231:6,11,12,10 +chrX 1929461 . A G 811 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.75;BaseQRankSum=1.577;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.35;MQRankSum=-1.931;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.614;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1010 0/1:27,30:57:99:.:841,0,696:15,12,16,14 +chrX 1929913 . G A 1769 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=12.16;BaseQRankSum=2.698;DP=156;ExcessHet=0.0000;FS=2.094;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.512;SOR=0.682;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,48:76:99:695,0:15,13,24,24 0/1:34,38:72:99:1104,0,905:14,20,21,17 +chrX 1930051 . T A 1374 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=10.25;BaseQRankSum=-0.286;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=1.396;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.543;SOR=0.872;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,48:81:99:481,0:20,13,28,20 0/1:21,35:56:99:923,0,517:9,12,20,15 +chrX 1930180 . T A 787 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=7.71;BaseQRankSum=1.013;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.530;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.579;SOR=0.442;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,28:52:99:161,0:14,10,13,15 0/1:29,25:54:99:656,0,756:17,12,14,11 +chrX 1930231 . C A 228 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=4.69;BaseQRankSum=-1.046;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.038;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.750;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,32:55:99:.:258,0:12,11,15,17 0/0:.:67:99:67:0,120,1800 +chrX 1930678 . G A 1067 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=7.41;BaseQRankSum=3.094;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=3.860;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.578;SOR=0.742;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:40,41:81:99:192,0:24,16,17,24 0/1:34,33:67:99:905,0,830:16,18,17,16 +chrX 1931114 . CA C 310.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.67;BaseQRankSum=0.391;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.905;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.174;SOR=1.109;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,481 0/1:11,19:30:99:.:350,0,163:4,7,12,7 +chrX 1931194 . A C 874 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.73;BaseQRankSum=1.061;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=10.543;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.068;SOR=1.570;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,31:61:65:65,0:14,16,20,11 0/1:24,32:56:99:839,0,645:14,10,23,9 +chrX 1931575 . CT C 255.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=8.19;BaseQRankSum=-0.709;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.880;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.53;SOR=1.244;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,148 0/1:20,16:36:99:.:295,0,413:10,10,10,6 +chrX 1931924 . T TTTA 601.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=13.35;BaseQRankSum=1.039;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.163;MQ=59.36;MQRankSum=0.818;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.14;SOR=1.012;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,148 0/1:30,18:48:99:.:641,0,1148:16,14,11,7 +chrX 1932289 . G A 1142 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=21.31;BaseQRankSum=2.416;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=7.527;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.31;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=0.693;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,148 0|1:25,30:55:99:.:0|1:1932289_G_A:1172,0,959:1932289:16,9,13,17 +chrX 1932293 . A C 1133 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=21.15;BaseQRankSum=1.727;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.527;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.693;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,148 0|1:25,30:55:99:.:0|1:1932289_G_A:1163,0,959:1932289:16,9,13,17 +chrX 1932355 . T C 946 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.81;BaseQRankSum=1.328;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.722;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,33:62:99:184,0:18,11,18,15 0/1:33,30:63:99:792,0,868:16,17,17,13 +chrX 1932424 . G T 603 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.91;BaseQRankSum=-2.393;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.304;SOR=0.710;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,129 0/1:33,25:58:99:.:633,0,962:17,16,13,12 +chrX 1933035 . CA C,CAA,CAAA 222.97 . AC=0,1,0;AF=0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=10,11,4;AS_QD=0.00,21.83,3.80;BaseQRankSum=-0.344;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.34;MQRankSum=0;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.544;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:1,10,11,4:26:99:.:262,369,0,243:1,0,16,9 0/0:.:44:0:44:0,0,943,0,943,943,0,943,943,943 +chrX 1933691 . CA C 537.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=24.04;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.17;QD=24.04;SOR=1.051;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:577,0:0,0,14,10 0/0:.:48:0:48:0,0,1052 +chrX 1934169 . G C 46 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=1.00;BaseQRankSum=-2.641;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.872;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.00;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.798;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:35,41:76:76:.:76,0:17,18,22,19 0/0:.:46:46:42:0,46,943 +chrX 1934344 . A G 357 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=5.53;BaseQRankSum=0.765;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.912;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.556;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,41:70:99:.:387,0:13,16,20,21 0/0:.:46:46:42:0,46,943 +chrX 1934548 . T C 853 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=7.01;BaseQRankSum=0.054;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=14.964;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.811;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,39:67:99:312,0:10,18,20,19 0/1:36,23:59:99:571,0,994:14,22,16,7 +chrX 1934930 . A G 405 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.76;BaseQRankSum=0.334;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=4.815;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.79;SOR=0.627;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:39:44:0,39 0/1:19,18:37:99:.:435,0,490:12,7,8,10 +chrX 1935080 . A AGGAG 793.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=24.50;BaseQRankSum=-0.185;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.646;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.50;ReadPosRankSum=0.372;SOR=2.066;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:39:44:0,39 0/1:13,21:34:99:.:833,0,483:11,2,20,1 +chrX 1935397 . G T 733 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=6.20;BaseQRankSum=1.376;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.668;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.670;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,31:62:73:73,0:16,15,18,13 0/1:33,28:61:99:690,0,867:15,18,12,16 +chrX 1936517 . G A 589 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.38;BaseQRankSum=-0.637;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=6.180;MQ=59.81;MQRankSum=0.963;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.451;SOR=1.680;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,129 0/1:27,23:50:99:.:619,0,768:15,12,17,6 +chrX 1936553 . C CTT 707.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=16.60;BaseQRankSum=0.423;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=16.049;MQ=59.76;MQRankSum=0.573;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.602;SOR=1.340;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:17:54:0,17 0/1:15,30:45:99:.:747,0,329:4,11,20,10 +chrX 1936889 . T C 1310 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=9.93;BaseQRankSum=0.305;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=5.362;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=0.359;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,35:64:99:186,0:14,15,15,20 0/1:28,43:71:99:1154,0,665:7,21,22,21 +chrX 1936995 . G A 1261 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=10.17;BaseQRankSum=-0.23;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.711;SOR=0.666;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,36:64:99:231,0:13,15,20,16 0/1:22,41:63:99:1060,0,521:10,12,16,25 +chrX 1937298 . G T 803 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=7.86;BaseQRankSum=3.018;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.726;MQ=59.68;MQRankSum=0.917;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=0.636;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,27:51:99:185,0:9,15,12,15 0/1:31,24:55:99:648,0,892:17,14,14,10 +chrX 1937453 . G A 1556 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=14.96;BaseQRankSum=-1.382;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=6.467;MQ=59.95;MQRankSum=0.729;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.532;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,29:41:99:538,0:10,2,14,15 0/1:26,39:65:99:1048,0,706:13,13,18,21 +chrX 1938120 . A T 1094 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=9.53;BaseQRankSum=-0.117;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.681;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,35:58:99:354,0:14,9,21,14 0/1:30,30:60:99:770,0,802:18,12,18,12 +chrX 1938233 . T C 995 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.24;BaseQRankSum=-0.287;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=3.195;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.24;ReadPosRankSum=-2.685;SOR=0.758;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,149 0/1:34,38:72:99:.:1025,0,890:15,19,21,17 +chrX 1939670 . T C 591 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=15.15;BaseQRankSum=-0.435;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.731;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.898;SOR=1.179;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,149 0/1:19,22:41:99:.:621,0,527:8,11,7,15 +chrX 1939691 . T C 525 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.88;BaseQRankSum=-0.563;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.264;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.88;ReadPosRankSum=2.517;SOR=1.140;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,149 0/1:20,20:40:99:.:555,0,565:9,11,7,13 +chrX 1939720 . A G 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.48;BaseQRankSum=1.248;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.192;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.465;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,149 0/1:18,26:44:99:.:769,0,466:11,7,14,12 +chrX 1940154 . T C 906 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=7.43;BaseQRankSum=1.741;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=4.302;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.881;SOR=0.466;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,34:62:99:279,0:15,13,17,17 0/1:39,25:64:99:657,0,1073:13,26,13,12 +chrX 1940283 . A G 747 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=5.89;BaseQRankSum=2.471;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.365;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.766;SOR=0.826;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,35:71:36:36,0:19,17,18,17 0/1:32,29:61:99:741,0,840:16,16,17,12 +chrX 1940816 . C T 1008 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=7.92;BaseQRankSum=1.46;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.711;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,31:60:99:125,0:14,15,16,15 0/1:34,37:71:99:913,0,895:20,14,21,16 +chrX 1940865 . T C 814 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.84;BaseQRankSum=-0.492;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.84;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.518;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,202 0/1:29,32:61:99:.:844,0,816:16,13,16,16 +chrX 1941073 . A ATT 543.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.58;BaseQRankSum=-1.106;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;MQRankSum=1.101;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.65;SOR=0.859;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,202 0/1:19,21:40:99:.:583,0,557:8,11,8,13 +chrX 1941292 . A G 907 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.04;BaseQRankSum=-0.782;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=12.128;MQ=59.53;MQRankSum=-1.911;QD=17.04;ReadPosRankSum=-1.37;SOR=0.570;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,202 0|1:30,25:55:99:.:0|1:1941292_A_G:937,0,1151:1941292:9,21,14,11 +chrX 1941296 . A G 907 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.04;BaseQRankSum=1.213;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=12.128;MQ=59.53;MQRankSum=-1.911;QD=17.04;ReadPosRankSum=-1.565;SOR=0.570;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,202 0|1:30,25:55:99:.:0|1:1941292_A_G:937,0,1151:1941292:9,21,14,11 +chrX 1941799 . G T 825 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.27;BaseQRankSum=1.058;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.274;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.877;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,202 0/1:26,30:56:99:.:855,0,695:12,14,17,13 +chrX 1941904 . T C 709 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.49;BaseQRankSum=1.519;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.371;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.416;SOR=0.811;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,202 0/1:24,27:51:99:.:739,0,611:11,13,15,12 +chrX 1941965 . T C 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.06;BaseQRankSum=-0.137;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.965;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.021;SOR=0.473;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,202 0/1:23,25:48:99:.:675,0,600:14,9,12,13 +chrX 1942009 . A G 824 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=-0.34;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=1.049;QD=14.00;ReadPosRankSum=1.616;SOR=0.756;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,202 0/1:30,31:61:99:.:854,0,829:15,15,15,16 +chrX 1942145 . C G 774 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.11;BaseQRankSum=1.897;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=6.121;MQ=59.44;MQRankSum=0.48;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.706;SOR=1.093;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,202 0|1:26,21:47:99:.:0|1:1942145_C_G:804,0,893:1942145:15,11,8,13 +chrX 1942152 . T G 783 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=18.48;BaseQRankSum=1.213;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=6.439;MQ=59.89;MQRankSum=-1.001;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.207;SOR=1.052;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,202 0|1:23,21:44:99:.:0|1:1942145_C_G:813,0,818:1942145:14,9,8,13 +chrX 1942193 . T C 707 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.65;BaseQRankSum=0.757;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=1.057;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,202 0/1:27,27:54:99:.:737,0,701:14,13,11,16 +chrX 1942245 . T G 402 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=5.76;BaseQRankSum=-0.082;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=0.685;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,44:75:99:.:432,0:14,17,20,24 0/0:.:63:99:63:0,120,1800 +chrX 1942272 . G A 985 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=13.72;BaseQRankSum=0.786;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=6.020;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.293;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,794 0/1:36,38:74:99:.:1015,0,911:23,13,19,19 +chrX 1942503 . CAAAAAAAAAAAAAAAAA CAAAAAAAAAAAAAAA,C 359.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,11;AS_QD=2.27,10.97;BaseQRankSum=1.079;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=31.863;MQ=59.73;MQRankSum=0.878;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=3.356;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,6,0:9:59:59,0,150:2,1,6,0 0/2:17,0,11:28:99:340,389,1048,0,658,624:4,13,9,2 +chrX 1942825 . G C 1391 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=21.53;BaseQRankSum=-0.467;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.53;ReadPosRankSum=1.295;SOR=0.654;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:76:99:76:.:.:0,405 0|1:30,36:66:99:.:0|1:1942825_G_C:1421,0,1141:1942825:17,13,20,16 +chrX 1942829 . C G 1391 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=21.53;BaseQRankSum=1.365;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.53;ReadPosRankSum=1.32;SOR=0.654;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:76:99:76:.:.:0,405 0|1:30,36:66:99:.:0|1:1942825_G_C:1421,0,1141:1942825:17,13,20,16 +chrX 1943233 . C T 193 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=3.38;BaseQRankSum=-0.84;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.946;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.905;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,37:66:99:.:223,0:14,15,16,21 0/0:.:69:85:69:0,85,1398 +chrX 1944414 . A C 547 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=13.11;BaseQRankSum=1.106;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.223;MQ=59.60;MQRankSum=0;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.845;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:50:54:.:.:0,50 0|1:28,16:44:99:.:0|1:1944414_A_C:577,0,1126:1944414:13,15,9,7 +chrX 1944419 . C A 546 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=13.09;BaseQRankSum=1.987;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.223;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.09;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=0.845;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:50:54:.:.:0,50 0|1:28,16:44:99:.:0|1:1944414_A_C:576,0,1126:1944414:13,15,9,7 +chrX 1944579 . CA C 195.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=7.83;BaseQRankSum=0.725;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=5.469;MQ=59.58;MQRankSum=-1.002;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.18;SOR=1.765;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:50:54:0,50 0/1:16,14:30:99:.:235,0,295:8,8,10,4 +chrX 1944807 . C A 724 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.71;BaseQRankSum=0.803;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=5.572;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=1.501;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:50:54:0,50 0/1:27,28:55:99:.:754,0,684:14,13,19,9 +chrX 1944863 . C T 734 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.75;BaseQRankSum=1.207;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.092;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.738;SOR=1.071;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:50:54:0,50 0/1:35,30:65:99:.:764,0,862:18,17,18,12 +chrX 1944949 . G A 760 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=-0.576;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=-1.048;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.649;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:50:54:0,50 0/1:36,31:67:99:.:790,0,976:17,19,15,16 +chrX 1945483 . CA C 192.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=5.16;BaseQRankSum=2.48;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.892;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=1.307;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:50:54:0,50 0/1:30,15:45:99:.:232,0,653:18,12,11,4 +chrX 1945797 . T C 768 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=11.74;BaseQRankSum=-2.549;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=4.832;MQ=59.99;MQRankSum=-1.0;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.400;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:50:54:0,50 0/1:35,33:68:99:.:798,0,958:13,22,17,16 +chrX 1946213 . G A 658 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.07;BaseQRankSum=0.734;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.012;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.796;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:50:54:0,50 0/1:31,26:57:99:.:688,0,847:15,16,14,12 +chrX 1946466 . TATAAA T 704.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=20.11;BaseQRankSum=-1.357;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.273;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=1.022;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:50:54:0,50 0/1:18,19:37:99:.:744,0,698:9,9,11,8 +chrX 1946549 . G A 735 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=19.62;BaseQRankSum=1.795;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=1.235;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.990;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:50:54:.:.:0,50 0|1:18,21:39:99:.:0|1:1946549_G_A:765,0,592:1946549:9,9,9,12 +chrX 1946589 . A T 786 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=18.98;BaseQRankSum=0.31;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.704;MQ=59.61;MQRankSum=-0.977;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.024;SOR=1.258;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:50:54:.:.:0,50 0|1:22,21:43:99:.:0|1:1946549_G_A:816,0,861:1946549:10,12,7,14 +chrX 1946590 . T A 786 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=18.98;BaseQRankSum=0.019;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.704;MQ=59.61;MQRankSum=-0.977;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=1.258;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:50:54:.:.:0,50 0|1:22,21:43:99:.:0|1:1946549_G_A:816,0,861:1946549:10,12,7,14 +chrX 1946627 . C T 719 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=22;AS_QD=15.60;BaseQRankSum=0.288;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=8.144;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.60;ReadPosRankSum=-1.273;SOR=1.558;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:56:.:56:.:.:0,0 0|1:26,22:48:99:.:0|1:1946549_G_A:749,0,911:1946549:14,12,7,15 +chrX 1946859 . A AATATATTT 721.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=8.01;BaseQRankSum=0.419;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.733;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,29:57:21:21,0:16,12,15,14 0/1:19,19:38:99:740,0,721:8,11,10,9 +chrX 1947455 . A G 547 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.69;BaseQRankSum=-1.135;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=10.090;MQ=56.39;MQRankSum=-0.121;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=1.255;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:16,21:37:99:.:.:219,0:.:9,7,6,15 0|1:7,10:17:99:1|0:1947453_G_T:358,0,234:1947453:5,2,5,5 +chrX 1947457 . A G 544 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.44;BaseQRankSum=0.507;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=9.624;MQ=56.19;MQRankSum=0.212;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.148;SOR=1.281;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:16,21:37:99:.:.:219,0:.:9,7,6,15 0|1:8,10:18:99:1|0:1947453_G_T:355,0,256:1947453:5,3,5,5 +chrX 1947460 . TATATATATATATAC T 102.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=4.18;BaseQRankSum=-1.189;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=5.287;MQ=55.18;MQRankSum=-0.851;QD=4.18;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=1.567;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,19:34:99:.:142,0:8,7,6,13 0/0:.:16:30:16:0,30,450 +chrX 1947474 . CATATATATATAT *,C,TATATATATATAT 371 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,7,5;AS_QD=29.29,32.86,29.45;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=4.670;MQ=51.37;QD=33.42;SOR=1.349;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,19,0,0:34:99:142,0,817,817:8,7,6,13 2/3:0,0,7,5:12:99:401,398,484,171,198,177,192,283,0,341:0,0,5,7 +chrX 2137011 . CCAT C 266.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=9.27;BaseQRankSum=1.319;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=3.715;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.542;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:35:1:0,35 0/1:24,9:33:99:.:306,0,977:8,16,5,4 +chrX 2137054 . T C 337 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=10.49;BaseQRankSum=1.406;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=14.508;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.692;SOR=2.070;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:35:1:0,35 0/1:22,13:35:99:.:367,0,590:8,14,10,3 +chrX 2137069 . TACCATCATCATCACCATCCTC T 367.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=8.48;BaseQRankSum=-1.171;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=-0.767;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.880;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,29:48:99:.:407,0:8,11,11,18 0/0:.:38:51:33:0,51,818 +chrX 2137121 . T TCCC,TCTCCCATCATCATCACGATCACCATCTTTATTACCTCCC,TCCCCCATCATCATCATCACCATCACCATCTTCATTACCTCTCCCATCATCATCACGATCACCATCTTTATTACCTCCC 1032.97 . AC=1,0,0;AF=0.333,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=3,0,0;AS_QD=31.06,30.99,29.66;BaseQRankSum=-1.098;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.392;MQ=56.56;MQRankSum=-2.006;QD=63.06;ReadPosRankSum=0;SOR=1.049;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:37:99:37:0,180,180,180 0/1:14,3,0,0:17:99:.:1072,0,469,496,532,1012,123,491,632,597:8,6,1,2 +chrX 2137273 . G C 505 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=19.11;BaseQRankSum=-0.247;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=1.720;MQ=53.81;MQRankSum=-1.309;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.504;SOR=0.407;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:37:99:37:0,180 0/1:6,22:28:75:.:535,0,75:4,2,12,10 +chrX 2137766 . T TATC 803.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=20.07;BaseQRankSum=0.981;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.587;MQ=59.46;MQRankSum=0;QD=20.07;ReadPosRankSum=-2.004;SOR=0.392;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:70:57:0,70 0/1:20,22:42:99:.:843,0,752:8,12,11,11 +chrX 2138063 . AT A 620.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.37;BaseQRankSum=-0.673;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.37;ReadPosRankSum=1.278;SOR=0.675;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:70:57:0,70 0/1:17,21:38:99:.:660,0,512:8,9,10,11 +chrX 2138110 . T C 881 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=18.59;BaseQRankSum=0.541;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.981;SOR=0.880;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:70:57:0,70 0/1:16,33:49:99:.:911,0,329:8,8,18,15 +chrX 2138309 . A T 794 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.21;BaseQRankSum=0.807;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=6.937;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.741;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:70:57:0,70 0/1:28,30:58:99:.:824,0,747:17,11,13,17 +chrX 2138510 . C T 768 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.76;BaseQRankSum=-0.635;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.24;SOR=0.693;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:70:57:0,70 0/1:27,31:58:99:.:798,0,703:14,13,15,16 +chrX 2138596 . T G 652 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.50;BaseQRankSum=-1.274;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=4.404;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.50;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=1.180;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:70:57:0,70 0/1:20,24:44:99:.:682,0,563:11,9,9,15 +chrX 2138651 . C A 472 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=15.21;BaseQRankSum=2.258;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.036;SOR=0.582;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:70:57:0,70 0/1:15,18:33:99:.:502,0,348:8,7,9,9 +chrX 2138698 . GC G 77.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=6;AS_QD=6.88;BaseQRankSum=2.105;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=2.884;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.708;SOR=2.368;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:25:.:25:0,0 0/1:11,6:17:84:.:117,0,84:3,8,0,6 +chrX 2139237 . T G 972 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=17.28;BaseQRankSum=-0.332;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=7.664;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.28;ReadPosRankSum=-1.371;SOR=0.190;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,224 0/1:22,36:58:99:.:1002,0,561:6,16,17,19 +chrX 2139338 . G A 757 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.74;BaseQRankSum=0.229;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.765;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,224 0/1:22,28:50:99:.:787,0,594:9,13,11,17 +chrX 2139429 . GCCAT G 1280.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=25.88;BaseQRankSum=1.824;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=4.197;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.88;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=0.281;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,224 0/1:18,33:51:99:.:1320,0,635:12,6,17,16 +chrX 2139600 . T C 514 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=0.344;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.377;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.715;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,224 0/1:14,20:34:99:.:544,0,335:6,8,11,9 +chrX 2139987 . C T 764 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.60;BaseQRankSum=-0.637;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=0.756;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,224 0/1:32,31:63:99:.:794,0,849:16,16,15,16 +chrX 2140130 . T G 1028 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.63;BaseQRankSum=-0.085;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=11.118;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=1.245;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,224 0|1:32,28:60:99:.:0|1:2140130_T_G:1058,0,1218:2140130:13,19,18,10 +chrX 2140131 . C T 1028 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.63;BaseQRankSum=0.226;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=11.118;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.022;SOR=1.245;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,224 0|1:32,28:60:99:.:0|1:2140130_T_G:1058,0,1218:2140130:13,19,18,10 +chrX 2140261 . G T 780 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.97;BaseQRankSum=0.417;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.042;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.489;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,224 0/1:26,32:58:99:.:810,0,617:9,17,13,19 +chrX 2140622 . T C 1061 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=24.24;BaseQRankSum=0.279;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=6.901;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.24;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.156;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,224 0|1:16,29:45:99:.:0|1:2140622_T_C:1091,0,544:2140622:12,4,15,14 +chrX 2140640 . A C 1074 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=25.09;BaseQRankSum=-1.52;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.263;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.09;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.451;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,224 0|1:15,29:44:99:.:0|1:2140622_T_C:1104,0,532:2140622:10,5,17,12 +chrX 2141084 . T C 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.26;BaseQRankSum=0.317;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=5.364;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.510;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,224 0/1:30,28:58:99:.:769,0,828:11,19,15,13 +chrX 2141131 . G A 729 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.09;BaseQRankSum=0.629;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=7.247;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.09;ReadPosRankSum=-1.891;SOR=1.000;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,224 0/1:30,28:58:99:.:759,0,793:12,18,17,11 +chrX 2141228 . AAGATAGAT A,AAGAT 1077.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=27,24;AS_QD=30.74,31.31;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=21.90;SOR=0.900;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27,24:51:65:.:1117,0,65:0,0,23,28 0/0:.:62:96:62:0,96,1440,96,1440,1440 +chrX 2141256 . TA T 1173.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=22.46;BaseQRankSum=0.546;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=5.795;MQ=59.88;MQRankSum=-0.76;QD=22.46;ReadPosRankSum=0.417;SOR=0.340;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1192 0|1:21,33:54:99:.:0|1:2141256_TA_T:1213,0,724:2141256:7,14,17,16 +chrX 2141258 . GATAGATAGATA G 1169.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=21.98;BaseQRankSum=0.034;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.900;MQ=59.88;MQRankSum=-0.779;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.393;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1192 0|1:22,33:55:99:.:0|1:2141256_TA_T:1209,0,755:2141256:8,14,17,16 +chrX 2141493 . T C 790 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.64;BaseQRankSum=0.564;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.64;ReadPosRankSum=1.797;SOR=0.826;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:27,29:56:99:.:820,0,740:13,14,13,16 +chrX 2141543 . T C 805 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.05;BaseQRankSum=-0.591;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.626;SOR=0.693;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:32,32:64:99:.:835,0,860:16,16,16,16 +chrX 2141732 . C G 448 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.02;BaseQRankSum=0.63;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.473;SOR=0.782;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:32,21:53:99:.:478,0,800:13,19,8,13 +chrX 2142078 . C A 545 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.50;BaseQRankSum=1.415;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.064;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.223;SOR=0.874;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:28,22:50:99:.:575,0,708:14,14,10,12 +chrX 2142190 . T C 590 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.92;BaseQRankSum=0.228;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.268;SOR=0.541;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:24,24:48:99:.:620,0,641:8,16,9,15 +chrX 2142219 . A G 508 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.23;BaseQRankSum=1.425;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.210;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.932;SOR=0.460;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:24,20:44:99:.:538,0,652:8,16,8,12 +chrX 2142316 . A G 681 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=17.34;BaseQRankSum=1.111;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=6.684;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=1.148;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1192 0|1:22,19:41:99:.:0|1:2142316_A_G:711,0,856:2142316:9,13,12,7 +chrX 2142326 . A G 644 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=16.05;BaseQRankSum=0.646;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=6.740;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.971;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1192 0|1:24,18:42:99:.:0|1:2142316_A_G:674,0,897:2142316:9,15,11,7 +chrX 2142937 . GCA G 877.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.98;BaseQRankSum=0.917;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=59.25;MQRankSum=-1.569;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=0.902;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:30,24:54:99:.:917,0,1182:13,17,14,10 +chrX 2143100 . A G 684 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.52;BaseQRankSum=-1.025;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=5.972;MQ=59.94;MQRankSum=-1.047;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.65;SOR=1.118;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1192 0|1:25,21:46:99:.:0|1:2143100_A_G:714,0,945:2143100:14,11,8,13 +chrX 2143129 . T G 478 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=11.81;BaseQRankSum=0.552;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.51;MQRankSum=-1.744;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.646;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1192 0|1:28,15:43:99:.:0|1:2143100_A_G:508,0,1048:2143100:17,11,9,6 +chrX 2143413 . G A 1115 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=17.35;BaseQRankSum=2.412;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=-1.032;QD=17.35;ReadPosRankSum=-2.307;SOR=0.713;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1192 0|1:35,31:66:99:.:0|1:2143413_G_A:1145,0,1315:2143413:16,19,14,17 +chrX 2143435 . C T 1092 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.75;BaseQRankSum=0;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.492;SOR=0.792;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,1192 0|1:36,31:67:99:.:0|1:2143413_G_A:1122,0,1336:2143413:16,20,13,18 +chrX 2143493 . T C 825 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.36;BaseQRankSum=-0.067;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.704;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:33,31:64:99:.:855,0,924:18,15,17,14 +chrX 2143564 . G A 735 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.54;BaseQRankSum=-0.115;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=-1.018;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.641;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:32,29:61:99:.:765,0,854:15,17,14,15 +chrX 2143635 . T C 583 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.22;BaseQRankSum=-0.43;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.736;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.135;SOR=1.358;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:35,25:60:99:.:613,0,986:16,19,8,17 +chrX 2143707 . CAAG C 749.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.17;BaseQRankSum=0.637;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=10.128;MQ=59.77;MQRankSum=-1.176;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.795;SOR=1.401;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192 0/1:31,21:52:99:.:789,0,1238:18,13,7,14 +chrX 2143780 . G GTATATATATATATATATATATATA,GTATATATATATATATATATATA 433.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=11,2;AS_QD=12.13,4.17;BaseQRankSum=0.878;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=10.778;MQ=57.51;MQRankSum=-3.805;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=2.584;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192,1192 0/1:28,11,2:41:99:.:473,0,1123,348,1098,1495:15,13,11,2 +chrX 2143798 . GTA G,ATA 676 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=19,2;AS_QD=13.32,0.75;BaseQRankSum=0.967;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=6.048;MQ=57.92;MQRankSum=-3.249;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.968;SOR=1.628;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1192,1192 0/1:34,19,2:55:99:.:706,0,1386,679,1347,2075:20,14,16,5 +chrX 2144078 . C G 3849 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=32.33;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.33;SOR=0.693;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2024,0:0,0,28,35 1/1:0,57:57:99:1855,171,0:0,0,32,25 +chrX 2144263 . T C 1131 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.14;BaseQRankSum=0.222;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.486;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=0.332;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,1240 0|1:33,31:64:99:.:0|1:2144263_T_C:1161,0,1270:2144263:21,12,16,15 +chrX 2144266 . T C 1131 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.14;BaseQRankSum=1.334;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.486;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.332;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,1240 0|1:33,31:64:99:.:0|1:2144263_T_C:1161,0,1270:2144263:21,12,16,15 +chrX 2144365 . T C 647 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.54;BaseQRankSum=0.55;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.055;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.473;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1240 0/1:29,25:54:99:.:677,0,796:17,12,13,12 +chrX 2144409 . C T 818 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.85;BaseQRankSum=-1.043;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.816;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1240 0/1:33,33:66:99:.:848,0,873:15,18,14,19 +chrX 2144533 . T C 854 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.39;BaseQRankSum=-1.924;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.058;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.856;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1240 0/1:32,34:66:99:.:884,0,869:15,17,19,15 +chrX 2145043 . A G 927 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.95;BaseQRankSum=0.777;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.617;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.997;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1240 0/1:26,34:60:99:.:957,0,669:12,14,20,14 +chrX 2146278 . A G 762 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.23;BaseQRankSum=0.467;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=11.392;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.23;ReadPosRankSum=0.756;SOR=2.399;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1240 0/1:23,29:52:99:.:792,0,582:11,12,6,23 +chrX 2146597 . A G 2181 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=21.06;BaseQRankSum=-3.142;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.725;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.06;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.892;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1756,0:0,0,29,26 0/1:30,20:50:99:455,0,894:15,15,12,8 +chrX 2146970 . T TG 204.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=15.25;BaseQRankSum=0;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.25;ReadPosRankSum=2.041;SOR=1.609;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,586 0/1:5,11:16:90:.:244,0,90:5,0,11,0 +chrX 2148424 . G A 641 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=0.449;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.336;SOR=0.716;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,586 0/1:31,25:56:99:.:671,0,859:15,16,13,12 +chrX 2148635 . T C 977 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.78;BaseQRankSum=1.873;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.652;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.58;SOR=0.345;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,586 0|1:33,27:60:99:.:0|1:2148635_T_C:1007,0,1292:2148635:11,22,12,15 +chrX 2148636 . C T 977 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.78;BaseQRankSum=-0.228;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.652;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.345;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,586 0|1:33,27:60:99:.:0|1:2148635_T_C:1007,0,1292:2148635:11,22,12,15 +chrX 2148666 . G A 922 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.35;BaseQRankSum=1.602;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.512;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.374;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,586 0|1:36,26:62:99:.:0|1:2148666_G_A:952,0,1411:2148666:13,23,12,14 +chrX 2148675 . A C 935 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.82;BaseQRankSum=-0.334;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.009;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.506;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,586 0|1:35,26:61:99:.:0|1:2148666_G_A:965,0,1380:2148666:13,22,11,15 +chrX 2149142 . C T 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.71;BaseQRankSum=-0.622;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.303;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.12;SOR=0.880;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,586 0/1:15,23:38:99:.:635,0,387:8,7,10,13 +chrX 2149307 . G A 528 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.13;BaseQRankSum=2.902;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=8.659;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.754;SOR=1.247;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,586 0/1:26,20:46:99:.:558,0,631:16,10,7,13 +chrX 2149493 . A C 721 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.73;BaseQRankSum=1.485;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=7.859;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=1.356;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,586 0/1:25,26:51:99:.:751,0,666:11,14,17,9 +chrX 2149900 . T C 695 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.22;BaseQRankSum=-1.612;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.596;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,586 0/1:22,29:51:99:.:725,0,568:12,10,15,14 +chrX 2150826 . AT A 3605.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=30.63;BaseQRankSum=-0.522;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=9.939;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.63;ReadPosRankSum=1.171;SOR=0.313;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2803,0:.:0,0,32,31 0|1:33,23:56:99:0|1:2150826_AT_A:842,0,1262:2150826:22,11,10,13 +chrX 2150832 . T C 3650 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=30.67;BaseQRankSum=-0.841;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=9.828;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.67;ReadPosRankSum=1.125;SOR=0.276;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,64:64:99:.:.:2838,0:.:0,0,33,31 0|1:33,23:56:99:0|1:2150826_AT_A:842,0,1262:2150826:22,11,10,13 +chrX 2156423 . AG A 636.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.52;BaseQRankSum=-0.597;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=5.608;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.970;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:51:49:0,51 0/1:29,25:54:99:.:676,0,769:17,12,10,15 +chrX 2156424 . G *,A 996 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=17,20;AS_QD=0.00,34.19;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=5.846;MQ=59.66;QD=27.73;SOR=0.777;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,17,20:37:17:1026,17,0:0,0,17,20 0/1:29,25,0:54:99:676,0,769,763,844,1607:17,12,10,15 +chrX 2156521 . T G 2128 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=20.36;BaseQRankSum=0.135;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.777;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.567;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,48:49:99:1569,0:0,1,25,23 0/1:34,23:57:99:589,0,921:15,19,8,15 +chrX 2156615 . T C 571 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.78;BaseQRankSum=-0.464;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.418;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.897;SOR=1.172;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,659 0/1:27,24:51:99:.:601,0,700:14,13,15,9 +chrX 2156833 . C T 802 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=5.70;BaseQRankSum=1.694;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.617;MQ=57.21;MQRankSum=-0.514;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.807;VarDP=146 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:44,45:89:99:120,0:21,23,20,25 0/1:29,28:57:99:712,0,772:12,17,11,17 +chrX 2156888 . A G 652 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=29;AS_QD=10.49;BaseQRankSum=-2.317;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=6.789;MQ=57.04;MQRankSum=-4.82;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=1.415;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:63:.:63:0,0 0/1:36,29:65:99:.:682,0,1016:19,17,10,19 +chrX 2156933 . A G 3526 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=30.92;BaseQRankSum=-2.84;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.883;MQ=53.05;MQRankSum=-4.954;QD=30.92;ReadPosRankSum=-1.727;SOR=0.818;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2432,0:.:0,0,27,30 0|1:28,30:58:99:0|1:2156933_A_G:1124,0,1054:2156933:15,13,12,18 +chrX 2156941 . C T 3654 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.49;BaseQRankSum=-0.084;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.961;MQ=53.24;MQRankSum=-4.622;QD=31.49;ReadPosRankSum=-2.268;SOR=0.531;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59:59:99:.:.:2491,0:.:0,0,30,29 0|1:26,32:58:99:0|1:2156933_A_G:1193,0,974:2156933:15,11,14,18 +chrX 2156954 . A AT 3127.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=27.54;BaseQRankSum=-0.055;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.898;MQ=53.72;MQRankSum=-4.893;QD=27.54;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.495;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:2125,0:0,0,27,26 0/1:31,31:62:99:1042,0,986:18,13,14,17 +chrX 2157066 . G C 1992 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=24.07;BaseQRankSum=-0.401;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;MQRankSum=-1.393;QD=24.07;ReadPosRankSum=-2.05;SOR=0.639;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1613,0:0,0,29,21 0/1:17,17:34:99:409,0,435:10,7,9,8 +chrX 2157344 . C G 203 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=3.48;BaseQRankSum=-1.671;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.335;SOR=0.631;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,38:67:99:.:233,0:15,14,19,19 0/0:.:59:76:59:0,76,1369 +chrX 2157703 . C T 1604 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=12.57;BaseQRankSum=0.284;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.419;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.672;SOR=0.831;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,53:79:99:848,0:13,13,23,30 0/1:23,28:51:99:786,0,597:11,12,14,14 +chrX 2157888 . G C 2873 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=22.86;BaseQRankSum=-1.204;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.499;SOR=0.782;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2113,0:0,0,35,31 0/1:28,33:61:99:790,0,706:15,13,20,13 +chrX 2158098 . C A 1446 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=20.79;BaseQRankSum=-0.352;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.915;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.509;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:70:99:70:.:.:0,1760 0|1:33,38:71:99:.:0|1:2158098_C_A:1476,0,1238:2158098:20,13,21,17 +chrX 2158101 . C T 1777 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=14.34;BaseQRankSum=0;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.234;MQ=59.93;MQRankSum=0.285;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.511;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,33:56:99:.:.:328,0:.:11,12,14,19 0|1:32,38:70:99:0|1:2158098_C_A:1479,0,1208:2158098:20,12,21,17 +chrX 2159203 . C G 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.90;BaseQRankSum=-0.703;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.632;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:10:50:0,10 0/1:29,21:50:99:.:495,0,773:12,17,9,12 +chrX 2159642 . G T 889 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=6.52;BaseQRankSum=1.045;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=12.129;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.325;SOR=0.240;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,34:67:44:44,0:12,21,13,21 0/1:38,36:74:99:875,0,1020:12,26,22,14 +chrX 2159676 . G A 900 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=6.94;BaseQRankSum=-0.273;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=12.536;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.339;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,35:68:41:41,0:12,21,16,19 0/1:31,35:66:99:889,0,784:10,21,20,15 +chrX 2160058 . C G 637 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.35;BaseQRankSum=0.375;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.576;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,164 0/1:28,26:54:99:.:667,0,731:12,16,12,14 +chrX 2160271 . T A 750 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.82;BaseQRankSum=0.54;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.85;SOR=0.713;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,164 0/1:36,30:66:99:.:780,0,959:19,17,16,14 +chrX 2160420 . T C 458 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.04;BaseQRankSum=-0.907;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.336;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.95;SOR=0.425;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,164 0/1:33,21:54:99:.:488,0,935:13,20,10,11 +chrX 2160554 . C T 394 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=3.85;BaseQRankSum=2.12;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.541;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.85;ReadPosRankSum=2.474;SOR=0.505;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,31:61:34:34,0:13,17,17,14 0/1:33,16:49:99:390,0,830:14,19,7,9 +chrX 2160602 . A G 730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.07;BaseQRankSum=-0.161;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.715;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.07;ReadPosRankSum=-2.053;SOR=0.350;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:27:63:0,27 0/1:26,28:54:99:.:760,0,684:10,16,14,14 +chrX 2160769 . T C 641 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.69;BaseQRankSum=0.752;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=4.022;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.69;ReadPosRankSum=-2.161;SOR=1.047;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:27:63:0,27 0/1:24,25:49:99:.:671,0,617:11,13,15,10 +chrX 2160807 . C T 882 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=8.85;BaseQRankSum=1.654;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.850;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.472;SOR=1.009;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,32:56:99:299,0:12,12,15,17 0/1:24,23:47:99:613,0,569:11,13,17,6 +chrX 2160848 . G A 760 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=9.29;BaseQRankSum=2.743;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=7.431;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.29;ReadPosRankSum=2.52;SOR=1.561;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,26:45:99:259,0:11,8,16,10 0/1:21,19:40:99:531,0,490:10,11,15,4 +chrX 2160892 . C CAAAAA,A,CAAAAAAA 879 . AC=2,0,0;AF=0.667,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=29,2,5;AS_QD=15.15,0.00,18.69;BaseQRankSum=-1.286;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=18.917;MQ=59.80;MQRankSum=0.111;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=0.709;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,23,0,0:41:99:147,0,917,917:13,5,11,12 0/1:13,6,2,5:26:89:762,0,489,768,395,1398,89,443,483,579:10,3,4,9 +chrX 2160951 . A G 876 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=17.76;BaseQRankSum=1.93;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=10.314;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.387;SOR=1.403;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,109 0|1:27,24:51:99:.:0|1:2160951_A_G:906,0,1040:2160951:16,11,8,16 +chrX 2160968 . G GA 928.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=18.62;BaseQRankSum=2.729;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.738;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.476;SOR=0.961;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,109 0|1:27,25:52:99:.:0|1:2160951_A_G:968,0,1058:2160951:16,11,10,15 +chrX 2160969 . G A 938 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=18.62;BaseQRankSum=2.441;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.738;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.961;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,109 0|1:27,25:52:99:.:0|1:2160951_A_G:968,0,1058:2160951:16,11,10,15 +chrX 2161025 . C A 701 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.39;BaseQRankSum=0.09;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.904;SOR=0.646;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,109 0/1:31,28:59:99:.:731,0,841:17,14,15,13 +chrX 2161156 . CAAATT C 1193.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=17.87;BaseQRankSum=2.002;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=3.240;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.395;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,109 0/1:37,32:69:99:.:1233,0,1437:22,15,16,16 +chrX 2161186 . C G 820 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.50;BaseQRankSum=1.138;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.908;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.719;SOR=0.833;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:15:64:0,15 0/1:36,32:68:99:.:850,0,933:19,17,18,14 +chrX 2161245 . T C 1225 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=17.19;BaseQRankSum=2.375;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.752;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:23:69:.:.:0,23 0|1:40,33:73:99:.:0|1:2161245_T_C:1255,0,1559:2161245:20,20,17,16 +chrX 2161255 . G A 1312 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=9.07;BaseQRankSum=1.864;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.531;SOR=0.650;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:35,37:72:71:.:.:71,0:.:19,16,20,17 0|1:42,34:76:99:0|1:2161245_T_C:1271,0,1620:2161245:22,20,17,17 +chrX 2161331 . G A 1114 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=8.06;BaseQRankSum=0.748;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=5.008;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.406;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,42:76:99:300,0:19,15,25,17 0/1:34,32:66:99:844,0,912:21,13,12,20 +chrX 2161370 . C T 1830 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=13.98;BaseQRankSum=-0.734;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.646;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.600;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,41:69:99:.:.:569,0:.:14,14,25,16 0|1:31,33:64:99:0|1:2161370_C_T:1291,0,1151:2161370:17,14,12,21 +chrX 2161377 . C G 1922 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=14.57;BaseQRankSum=0.359;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.370;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.125;SOR=0.569;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,42:69:99:.:.:629,0:.:14,13,25,17 0|1:31,34:65:99:0|1:2161370_C_T:1323,0,1148:2161370:17,14,13,21 +chrX 2161443 . A G 1202 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=10.10;BaseQRankSum=2.14;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.464;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.718;SOR=0.556;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,37:62:99:335,0:11,14,20,17 0/1:29,31:60:99:897,0,786:10,19,9,22 +chrX 2161667 . T C 948 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=8.15;BaseQRankSum=-0.194;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.461;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=2.275;SOR=0.527;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:32,34:66:99:.:.:116,0:.:16,16,18,16 0|1:31,23:54:99:0|1:2161667_T_C:862,0,1199:2161667:19,12,11,12 +chrX 2161671 . C T 978 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=8.47;BaseQRankSum=0.494;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.335;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.47;ReadPosRankSum=2.055;SOR=0.499;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,34:65:99:.:.:146,0:.:16,15,18,16 0|1:31,23:54:99:0|1:2161667_T_C:862,0,1199:2161667:19,12,11,12 +chrX 2161745 . C T 489 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=4.12;BaseQRankSum=0.128;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.664;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.711;SOR=0.587;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:39,40:79:50:50,0:20,19,22,18 0/1:28,19:47:99:469,0,802:16,12,8,11 +chrX 2161802 . A G 440 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=12.37;BaseQRankSum=0.536;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=1.336;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=1.112;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:23:49:.:.:0,23 0|1:24,14:38:99:.:0|1:2161802_A_G:470,0,884:2161802:13,11,9,5 +chrX 2161823 . T C 529 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=13.98;BaseQRankSum=0.69;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.551;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:23:49:.:.:0,23 0|1:24,16:40:99:.:0|1:2161802_A_G:559,0,868:2161802:13,11,8,8 +chrX 2161903 . T C 643 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.81;BaseQRankSum=-1.431;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.007;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.48;SOR=0.656;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:23:49:0,23 0/1:30,27:57:99:.:673,0,817:14,16,14,13 +chrX 2162305 . G GC 948.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=17.33;BaseQRankSum=0.704;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.614;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:23:49:0,23 0/1:26,31:57:99:.:988,0,793:12,14,15,16 +chrX 2162356 . AG A 954.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.49;BaseQRankSum=-1.031;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.069;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.155;SOR=0.786;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:23:49:.:.:0,23 0|1:25,26:51:99:.:0|1:2162356_AG_A:994,0,959:2162356:13,12,12,14 +chrX 2162364 . G A 956 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.33;BaseQRankSum=-0.205;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.371;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.679;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:23:49:.:.:0,23 0|1:25,26:51:99:.:0|1:2162356_AG_A:986,0,961:2162356:14,11,12,14 +chrX 2162430 . G T 936 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=12.71;BaseQRankSum=1.191;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.869;MQ=59.78;MQRankSum=1.0;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.617;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:23:49:0,23 0/1:39,37:76:99:.:966,0,982:18,21,19,18 +chrX 2162711 . C G 1170 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=9.45;BaseQRankSum=0.806;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.660;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.752;SOR=0.765;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,30:52:99:270,0:12,10,16,14 0/1:39,36:75:99:930,0,995:23,16,23,13 +chrX 2162983 . T C 923 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=12.22;BaseQRankSum=-0.066;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=4.255;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=0.888;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,164 0/1:41,37:78:99:.:953,0,1094:22,19,16,21 +chrX 2163003 . A C 750 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.26;BaseQRankSum=0.864;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;MQRankSum=0.857;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.628;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,164 0/1:45,31:76:99:.:780,0,1179:21,24,15,16 +chrX 2163358 . CT C 363.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=7.46;BaseQRankSum=-0.493;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=4.079;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.735;SOR=1.371;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,164 0/1:34,20:54:99:.:403,0,790:15,19,6,14 +chrX 2163977 . T C 783 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.34;BaseQRankSum=-1.329;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.045;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.551;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,164 0/1:22,31:53:99:.:813,0,576:9,13,14,17 +chrX 2164044 . CAA C,CA 1191.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=41,19;AS_QD=19.44,17.23;BaseQRankSum=1.066;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;MQRankSum=-0.95;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.705;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,21,19:40:45:672,45,0:0,0,17,23 0/1:20,20,0:40:99:559,0,543,620,604,1223:9,11,10,10 +chrX 2164526 . T C 829 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.02;BaseQRankSum=-0.785;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.466;MQ=59.43;MQRankSum=1.03;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=1.282;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:70:61:0,70 0/1:33,33:66:99:.:859,0,874:18,15,22,11 +chrX 2164570 . C G 636 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.92;BaseQRankSum=0.412;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.182;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.864;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:70:61:0,70 0/1:36,25:61:99:.:666,0,1026:17,19,14,11 +chrX 2164625 . C T 500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.64;BaseQRankSum=2.136;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.332;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=1.055;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:70:61:0,70 0/1:35,20:55:99:.:530,0,981:18,17,12,8 +chrX 2164683 . C CA 629.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.95;BaseQRankSum=-1.066;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.251;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=1.056;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:70:61:0,70 0/1:31,25:56:99:.:669,0,896:15,16,10,15 +chrX 2164894 . AGTGT A 441.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=15.52;BaseQRankSum=-0.497;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=5.449;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.804;SOR=0.991;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:70:61:0,70 0/1:18,13:31:99:.:481,0,706:7,11,8,5 +chrX 2165141 . T C 609 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.02;BaseQRankSum=-1.868;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.013;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.907;SOR=0.484;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:70:61:0,70 0/1:32,26:58:99:.:639,0,919:18,14,13,13 +chrX 2165256 . A G 773 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.55;BaseQRankSum=-2.548;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=5.067;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=1.473;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:70:61:0,70 0/1:32,32:64:99:.:803,0,899:16,16,21,11 +chrX 2165449 . G A 934 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=9.45;BaseQRankSum=0.138;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=3.720;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.66;SOR=0.401;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,28:48:99:238,0:10,10,17,11 0/1:25,29:54:99:726,0,627:8,17,11,18 +chrX 2165480 . T C 299 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=7.15;BaseQRankSum=-1.748;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=8.629;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.402;SOR=1.752;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,27:46:99:.:329,0:9,10,19,8 0/0:.:23:31:22:0,31,639 +chrX 2165484 . G A 344 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=7.96;BaseQRankSum=1.344;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=8.846;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.092;SOR=1.836;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,28:47:99:.:374,0:9,10,20,8 0/0:.:23:31:22:0,31,639 +chrX 2165485 . C T 285 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=7.00;BaseQRankSum=-0.084;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=6.611;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.172;SOR=1.665;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,26:45:99:.:315,0:9,10,18,8 0/0:.:23:31:22:0,31,639 +chrX 2165498 . C A 263 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=6.10;BaseQRankSum=0.415;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=6.153;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.303;SOR=1.302;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,28:48:99:.:293,0:9,11,18,10 0/0:.:23:31:22:0,31,639 +chrX 2165664 . G A 115 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=3.30;BaseQRankSum=2.339;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=1.354;MQ=59.10;MQRankSum=-0.538;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.294;SOR=1.071;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,23:44:99:.:145,0:6,15,5,18 0/0:.:23:31:22:0,31,639 +chrX 2165784 . C CATCA 411.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=22.55;BaseQRankSum=-0.755;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=2.128;MQ=56.48;MQRankSum=-0.984;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.188;SOR=1.445;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:5,15:20:99:.:451,0:2,3,4,11 0/0:.:24:31:22:0,31,655 +chrX 2165807 . G GTATA 248.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=22.15;BaseQRankSum=-1.242;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.66;MQRankSum=-1.05;QD=22.15;ReadPosRankSum=-1.761;SOR=0.569;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:17:99:17:0,135 0/1:4,9:13:99:.:288,0,141:3,1,6,3 +chrX 2165826 . T C 375 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=28.49;BaseQRankSum=0;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=4.393;MQ=49.95;MQRankSum=-0.404;QD=36.82;ReadPosRankSum=1.645;SOR=1.447;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,10:11:99:.:405,0:1,0,3,7 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165828 . T C 330 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=27.13;DP=32;ExcessHet=0.0000;FS=5.229;MQ=49.09;MQRankSum=-0.385;QD=36.00;SOR=1.996;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,9:10:99:.:360,0:1,0,2,7 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165830 . T C 375 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=30.30;DP=31;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.07;QD=45.00;SOR=2.093;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,9:9:99:.:405,0:0,0,2,7 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165832 . T C 330 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=28.76;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.84;QD=45.00;SOR=1.863;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,8:8:99:.:360,0:0,0,2,6 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165834 . T C 330 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=34.50;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.84;QD=45.00;SOR=1.863;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,8:8:99:.:360,0:0,0,2,6 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165836 . T C 330 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=31.52;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.84;QD=45.00;SOR=1.863;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,8:8:99:.:360,0:0,0,2,6 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165838 . T C 375 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=27.46;DP=31;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.78;QD=45.00;SOR=1.402;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,9:9:99:.:405,0:0,0,3,6 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165840 . T C 375 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=30.44;DP=31;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.78;QD=45.00;SOR=1.402;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,9:9:99:.:405,0:0,0,3,6 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165842 . T C 420 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=30.85;DP=32;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.03;QD=45.00;SOR=1.609;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,10:10:99:.:450,0:0,0,3,7 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165844 . T C 420 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=27.19;DP=32;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.03;QD=45.00;SOR=1.609;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,10:10:99:.:450,0:0,0,3,7 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165846 . T C 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=28.52;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.07;QD=45.00;SOR=1.270;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,4,7 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165847 . ATATGTG A 455.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=29.77;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.07;QD=45.00;SOR=1.270;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,4,7 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165854 . T C 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=33.25;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.07;QD=45.00;SOR=1.270;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,4,7 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165862 . T C 510 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=27.39;DP=34;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.22;QD=45.00;SOR=0.693;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,12:12:99:.:540,0:0,0,6,6 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165864 . T C 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=28.30;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.17;QD=45.00;SOR=0.859;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,6,5 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165866 . T C 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=33.09;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.17;QD=45.00;SOR=0.859;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,6,5 0/0:.:22:38:19:0,38,485 +chrX 2165868 . CGT C,TGT 466 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=11,2;AS_QD=15.00,0.04;BaseQRankSum=-0.276;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=5.153;MQ=53.18;MQRankSum=-1.726;QD=14.17;ReadPosRankSum=1.15;SOR=1.015;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,11,0:11:99:.:.:495,0,495:.:0,0,6,5 0|2:22,0,2:24:1:0|1:2165868_C_T:1,67,747,0,680,674:2165868:9,13,2,0 +chrX 2165873 . ATATATATATGT A 455.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=28.35;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.17;QD=45.00;SOR=0.859;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,6,5 0/0:.:25:54:25:0,54,810 +chrX 2165885 . A C 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=30.08;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.42;QD=45.00;SOR=0.859;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,6,5 0/0:.:26:57:26:0,57,855 +chrX 2165894 . TAC T 298.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=16.10;BaseQRankSum=-0.9;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.86;MQRankSum=0;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.859;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:11:99:11:0,278 0/1:10,11:21:99:.:338,0,308:5,5,5,6 +chrX 2165900 . CACACACACA C 410.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=32.14;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.64;MQRankSum=-0.802;QD=32.14;SOR=0.307;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,12:14:99:.:450,0:2,0,8,4 0/0:.:29:24:25:0,24,700 +chrX 2165913 . ACACAC A 455.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=33.00;BaseQRankSum=-0.204;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.20;MQRankSum=-0.764;QD=33.00;ReadPosRankSum=2.29;SOR=0.368;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,13:15:99:.:495,0:2,0,9,4 0/0:.:29:24:25:0,24,700 +chrX 2165918 . C CTGT 455.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=33.00;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.20;MQRankSum=-0.764;QD=33.00;ReadPosRankSum=2.038;SOR=0.368;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,13:15:99:.:495,0:2,0,9,4 0/0:.:29:24:25:0,24,700 +chrX 2165923 . AC A 423.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=27.24;BaseQRankSum=0;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.12;MQRankSum=-0.932;QD=27.24;ReadPosRankSum=1.201;SOR=1.148;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,14:17:99:.:463,0:2,1,10,4 0/0:.:29:24:25:0,24,700 +chrX 2165929 . T C 310 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=21.25;BaseQRankSum=-0.738;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.59;MQRankSum=-0.738;QD=21.25;ReadPosRankSum=1.945;SOR=1.473;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,12:16:99:.:340,0:3,1,10,2 0/0:.:29:24:25:0,24,700 +chrX 2166056 . C CTATA 1451.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=28.13;BaseQRankSum=0.033;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=1.193;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.605;SOR=1.084;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,26:27:99:1119,0:0,1,16,10 0/1:16,10:26:99:372,0,621:10,6,8,2 +chrX 2166088 . G GAT,GATAT 573.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=9,13;AS_QD=30.84,28.89;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.86;SOR=0.693;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,9,13:22:99:.:613,138,0:0,0,11,11 0/0:.:42:52:42:0,52,809,52,809,809 +chrX 2166292 . G T 1057 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=31.47;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.37;QD=37.48;SOR=0.906;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:1087,0:0,0,16,13 0/0:.:42:52:42:0,52,809 +chrX 2166451 . C A 977 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=28;AS_QD=23.98;BaseQRankSum=1.459;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=4.918;MQ=58.63;MQRankSum=-0.976;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.621;SOR=1.609;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:25:.:25:.:.:0,0 0|1:14,28:42:99:.:0|1:2166451_C_A:1007,0,425:2166451:7,7,9,19 +chrX 2166491 . T TAC 946.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=23.48;BaseQRankSum=-0.088;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=4.638;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.48;ReadPosRankSum=-1.591;SOR=1.108;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:44:2:44:.:.:0,2 0|1:16,26:42:99:.:0|1:2166451_C_A:986,0,563:2166451:9,7,10,16 +chrX 2166587 . T C,TTC 312 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=12,8;AS_QD=28.50,15.00;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=17.10;SOR=1.127;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,12,8:20:99:.:342,0,222:0,0,12,8 0/0:.:57:53:57:0,53,1011,53,1011,1011 +chrX 2166685 . ATGTG A,GTGTG 1181 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=27,17;AS_QD=29.82,30.50;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=27.52;SOR=1.105;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27,17:44:99:.:1211,0,448:0,0,26,18 0/0:.:57:53:57:0,53,1011,53,1011,1011 +chrX 2166706 . TATATATACACAC T 287.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=6.67;BaseQRankSum=-0.711;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.129;MQ=59.74;MQRankSum=1.196;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.242;SOR=0.432;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,28:49:99:.:327,0:13,8,15,13 0/0:.:57:53:57:0,53,1011 +chrX 2167621 . T C 2286 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.62;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.62;SOR=1.195;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,71:71:99:.:2316,0:0,0,28,43 0/0:.:57:53:57:0,53,1011 +chrX 2168168 . T A 312 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=7.43;BaseQRankSum=0.973;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.836;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,28:46:99:.:342,0:9,9,15,13 0/0:.:68:54:68:0,54,1440 +chrX 2168370 . T C 164 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=3.96;BaseQRankSum=1.099;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.114;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.461;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,27:49:99:.:194,0:9,13,13,14 0/0:.:68:54:68:0,54,1440 +chrX 2169329 . A AT 79.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=3.22;BaseQRankSum=-1.571;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=7.848;MQ=59.91;MQRankSum=-0.771;QD=3.22;ReadPosRankSum=-2.569;SOR=2.093;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,22:37:99:.:119,0:7,8,5,17 0/0:.:68:54:68:0,54,1440 +chrX 2169461 . CT C 161.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=6.48;BaseQRankSum=-0.371;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.151;MQ=59.57;MQRankSum=-1.192;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.988;SOR=1.302;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:99:48:0,1017 0/1:19,12:31:99:.:201,0,343:9,10,4,8 +chrX 2169693 . T C 1637 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=33.34;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.58;QD=33.34;SOR=1.270;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:1667,0:0,0,19,31 0/0:.:54:50:54:0,50,1121 +chrX 2169752 . T C 1507 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=32.02;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.02;SOR=1.298;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,48:48:99:.:1537,0:0,0,18,30 0/0:.:54:50:54:0,50,1121 +chrX 2169831 . C CT 291.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.34;BaseQRankSum=0.835;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=11.339;MQ=59.58;MQRankSum=1.086;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.502;SOR=1.773;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:7,25:32:99:.:331,0:2,5,18,7 0/0:.:54:50:54:0,50,1121 +chrX 2170322 . G A 179 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=3.67;BaseQRankSum=1.129;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.004;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.67;ReadPosRankSum=2.7;SOR=0.846;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,31:57:99:.:209,0:11,15,12,19 0/0:.:61:75:61:0,75,1046 +chrX 2170358 . A C 2021 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.05;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.05;SOR=1.044;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2051,0:0,0,27,37 0/0:.:61:75:61:0,75,1046 +chrX 2170465 . ATGTGTG A,ATG 1542.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=32,26;AS_QD=27.33,25.72;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.395;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.81;SOR=0.556;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,32,26:59:99:.:1582,0,189:1,0,26,32 0/0:.:61:75:61:0,75,1046,75,1046,1046 +chrX 2170737 . T C 1562 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.62;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=30.62;SOR=0.770;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:1592,0:0,0,27,25 0/0:.:61:75:61:0,75,1046 +chrX 2170914 . CT C 1302.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=25.81;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;MQRankSum=4.122;QD=25.81;SOR=0.311;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,51:52:99:.:1342,0:1,0,28,23 0/0:.:61:75:61:0,75,1046 +chrX 2172068 . C T 475 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.53;BaseQRankSum=-0.282;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=1.087;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.847;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:54:71:0,54 0/1:33,20:53:99:.:505,0,944:16,17,11,9 +chrX 2173478 . A G 961 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.16;BaseQRankSum=-0.101;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=10.460;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.693;SOR=1.630;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:54:71:0,54 0/1:32,38:70:99:.:991,0,804:17,15,12,26 +chrX 2173817 . A AT 459.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.62;BaseQRankSum=1.316;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=14.400;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.182;SOR=2.636;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:54:71:0,54 0/1:26,21:47:99:.:499,0,652:13,13,17,4 +chrX 2173900 . C T 639 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.53;BaseQRankSum=1.18;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=7.023;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.736;SOR=1.103;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:54:71:0,54 0/1:32,26:58:99:.:669,0,816:14,18,16,10 +chrX 2174460 . C G 702 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.08;BaseQRankSum=-0.513;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.963;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.645;SOR=1.212;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:54:71:0,54 0/1:23,29:52:99:.:732,0,583:11,12,18,11 +chrX 2174574 . G GT 182.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=6.73;BaseQRankSum=0.022;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=5.618;MQ=58.76;MQRankSum=-0.396;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.348;SOR=1.828;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:12,21:33:99:.:222,0:6,6,6,15 0/0:.:56:93:56:0,93,1405 +chrX 2174581 . TTTTTTG T 611.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=16.69;BaseQRankSum=1.349;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=4.920;MQ=58.15;MQRankSum=-0.716;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.142;SOR=1.552;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:54:80:54:.:.:0,80 0|1:21,18:39:99:.:0|1:2174581_TTTTTTG_T:651,0,756:2174581:8,13,4,14 +chrX 2175101 . C A 300 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=12.69;BaseQRankSum=0.043;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;MQRankSum=1.077;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.226;SOR=0.425;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:80:54:0,80 0/1:13,13:26:99:.:330,0,337:10,3,9,4 +chrX 2175249 . T C 836 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=7.94;BaseQRankSum=-1.368;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.131;SOR=0.648;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,27:51:59:59,0:13,11,15,12 0/1:27,31:58:99:807,0,745:14,13,15,16 +chrX 2175520 . T C 1134 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=9.54;BaseQRankSum=0.456;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.423;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.630;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,36:60:99:437,0:9,15,15,21 0/1:33,29:62:99:727,0,836:18,15,18,11 +chrX 2175575 . T C 1165 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=8.54;BaseQRankSum=1.525;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=1.333;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.570;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,45:78:99:412,0:17,16,24,21 0/1:32,30:62:99:783,0,762:19,13,15,15 +chrX 2176251 . C T 1433 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=11.17;BaseQRankSum=2.831;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.651;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.17;ReadPosRankSum=2.86;SOR=0.657;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,42:67:99:611,0:13,12,20,22 0/1:33,31:64:99:852,0,776:15,18,17,14 +chrX 2176434 . A G 1148 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=7.85;BaseQRankSum=0.499;DP=155;ExcessHet=0.0000;FS=3.839;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.267;SOR=0.543;VarDP=150 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:42,46:88:99:149,0:23,19,22,24 0/1:24,38:62:99:1029,0,588:14,10,19,19 +chrX 2177265 . G A 462 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=9.84;BaseQRankSum=0.487;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=4.116;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.537;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,32:50:99:.:492,0:7,11,17,15 0/0:.:63:96:63:0,96,1345 +chrX 2177302 . C T 812 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.89;BaseQRankSum=-1.081;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.078;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.89;ReadPosRankSum=-1.427;SOR=0.452;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,124 0/1:23,30:53:99:.:842,0,628:9,14,14,16 +chrX 2177500 . T G 885 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.52;BaseQRankSum=1.747;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.709;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,124 0/1:30,33:63:99:.:915,0,763:19,11,21,12 +chrX 2177891 . T C 1100 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.69;BaseQRankSum=3.92;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=3.243;MQ=59.59;MQRankSum=1.568;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.22;SOR=1.141;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,124 0/1:33,39:72:99:.:1130,0,771:15,18,14,25 +chrX 2177959 . G T 1081 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=10.68;BaseQRankSum=1.826;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=4.844;MQ=59.52;MQRankSum=1.485;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.376;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,26:51:56:.:.:56,0:.:8,17,11,15 0|1:26,27:53:99:0|1:2177959_G_T:1055,0,1000:2177959:11,15,14,13 +chrX 2177961 . C A 1081 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=10.68;BaseQRankSum=1.768;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.844;MQ=59.51;MQRankSum=1.485;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.376;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,26:51:56:.:.:56,0:.:8,17,11,15 0|1:26,27:53:99:0|1:2177959_G_T:1055,0,1000:2177959:11,15,14,13 +chrX 2178648 . TAC T,TCCACACACACAC,TCCACACAC 1242.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,23,21;AS_QD=21.21,13.84,30.26;BaseQRankSum=-0.384;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.45;MQRankSum=-0.253;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.693;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,13,23,0:38:51:346,51,0,677:1,1,23,13 1/3:0,9,0,21:30:99:936,728,722,990,768,1182,240,0,467,587:0,0,10,20 +chrX 2178696 . T C 612 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=7.38;BaseQRankSum=2.25;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;MQRankSum=-1.604;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.662;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,26:48:99:114,0:12,10,14,12 0/1:23,16:39:99:528,0,747:8,15,5,11 +chrX 2178818 . CT C 362.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=5.66;BaseQRankSum=1.127;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.977;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.614;SOR=0.543;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,17:32:57:57,0:10,5,14,3 0/1:21,18:39:99:345,0,443:16,5,10,8 +chrX 2179338 . A G 896 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.94;BaseQRankSum=0.23;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=5.094;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.289;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:44:57:0,44 0/1:28,34:62:99:.:926,0,697:18,10,17,17 +chrX 2179394 . A G 620 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.21;BaseQRankSum=1.806;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.244;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.544;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:44:57:0,44 0/1:33,25:58:99:.:650,0,839:19,14,12,13 +chrX 2179569 . G A 357 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=10.18;BaseQRankSum=0.355;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.378;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.418;SOR=1.038;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:44:57:0,44 0/1:23,15:38:99:.:387,0,645:8,15,4,11 +chrX 2180204 . T C 546 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.87;BaseQRankSum=-1.527;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=5.672;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.284;SOR=1.049;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:44:57:0,44 0/1:30,23:53:99:.:576,0,878:13,17,14,9 +chrX 2180713 . C CTCTATCTA,CTCTATCTATCTA 506.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=22,0;AS_QD=10.71,0.00;BaseQRankSum=1.6;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.648;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.46;SOR=0.230;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:44:57:0,44,44 0/1:29,22,0:51:99:.:546,0,1064,692,1134,2062:7,21,4,6 +chrX 2180748 . G T 983 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.47;BaseQRankSum=2.211;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=10.824;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.47;ReadPosRankSum=1.194;SOR=0.123;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:44:57:0,44 0/1:30,28:58:99:.:1013,0,1065:7,23,11,12 +chrX 2180854 . GTATC G 712.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=7.23;BaseQRankSum=-0.734;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.601;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.910;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,30:58:85:.:.:85,0:.:15,13,16,14 0|1:28,18:46:99:0|1:2180854_GTATC_G:667,0,1104:2180854:16,12,13,5 +chrX 2180884 . T TCTGC 809.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.44;BaseQRankSum=-0.044;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.698;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:80:99:80:.:.:0,1485 0|1:32,23:55:99:.:0|1:2180854_GTATC_G:849,0,1264:2180854:18,14,13,10 +chrX 2180926 . C CT 855.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.43;BaseQRankSum=1.472;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=3.922;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.43;ReadPosRankSum=2.448;SOR=0.307;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:80:99:80:.:.:0,1485 0|1:34,24:58:99:.:0|1:2180926_C_CT:895,0,1304:2180926:24,10,14,10 +chrX 2180928 . T TCAC 877.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.54;BaseQRankSum=0.309;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=5.503;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.54;ReadPosRankSum=2.164;SOR=0.264;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:80:99:80:.:.:0,1485 0|1:34,25:59:99:.:0|1:2180926_C_CT:917,0,1302:2180926:24,10,14,11 +chrX 2181152 . A G 705 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.35;BaseQRankSum=-0.697;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.912;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.850;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:10:74:0,10 0/1:41,30:71:99:.:735,0,1127:23,18,18,12 +chrX 2181248 . AT A 619.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=9.69;BaseQRankSum=-0.283;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=3.512;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.681;SOR=1.270;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,868 0/1:37,31:68:99:.:659,0,812:22,15,22,9 +chrX 2181648 . CATCT C 1018.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=9.98;BaseQRankSum=-0.355;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.525;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.564;SOR=1.022;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,28:55:41:41,0:14,13,16,12 0/1:25,26:51:99:1017,0,966:12,13,15,11 +chrX 2182365 . G C 669 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.85;BaseQRankSum=-0.971;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.657;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=1.302;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:58:64:0,58 0/1:32,27:59:99:.:699,0,891:16,16,17,10 +chrX 2182638 . G A 585 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.81;BaseQRankSum=-0.955;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.992;SOR=0.711;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:58:64:0,58 0/1:25,23:48:99:.:615,0,702:13,12,11,12 +chrX 2183113 . A G 1150 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=10.83;BaseQRankSum=1.264;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;MQRankSum=-0.708;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.677;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,38:59:99:545,0:9,12,21,17 0/1:26,24:50:99:635,0,679:17,9,13,11 +chrX 2183673 . T C 779 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.95;BaseQRankSum=0.21;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.150;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.304;SOR=0.460;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:5:61:0,5 0/1:28,30:58:99:.:809,0,724:12,16,15,15 +chrX 2183833 . T C 3233 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.63;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.63;SOR=1.284;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1755,0:0,0,35,19 1/1:0,46:46:99:1508,138,0:0,0,27,19 +chrX 2184026 . C G 626 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.26;BaseQRankSum=-1.713;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=11.360;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.26;ReadPosRankSum=2.051;SOR=1.272;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,269 0/1:20,26:46:99:.:656,0,538:13,7,9,17 +chrX 2184580 . A C 3029 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=33.62;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.24;QD=33.62;SOR=0.959;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46:46:99:.:.:1440,0:.:0,0,22,24 1|1:0,45:45:99:0|1:2184580_A_C:1619,135,0:2184580:0,0,18,27 +chrX 2184629 . CT C 674.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=15.19;BaseQRankSum=2.196;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=2.591;MQ=59.50;MQRankSum=0;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=1.292;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:18:43:.:.:0,18 0|1:28,19:47:99:.:0|1:2184580_A_C:714,0,1077:2184580:14,14,7,12 +chrX 2184631 . A C 684 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=15.19;BaseQRankSum=2.011;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.591;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=1.292;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:18:43:.:.:0,18 0|1:28,19:47:99:.:0|1:2184580_A_C:714,0,1077:2184580:14,14,7,12 +chrX 2184793 . CATCTATCTATCT C,CATCTATCT 2226.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=56,22;AS_QD=28.68,22.62;BaseQRankSum=-1.013;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.900;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.267;SOR=0.520;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34,22:56:99:1463,0,445:0,0,27,29 0/1:23,22,0:45:99:803,0,878,872,945,1817:13,10,13,9 +chrX 2184846 . TTCTA T,TTCTATCTA 358.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=11,0;AS_QD=15.31,0.00;BaseQRankSum=-0.826;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.707;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.506;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:63:64:0,63,63 0/1:15,11,0:26:99:.:398,0,738,440,625,1099:10,5,5,6 +chrX 2184889 . T C,TATCC,TATCTATCC 813 . AC=0,0,1;AF=0.00,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,0,14;AS_QD=13.22,13.67,26.34;BaseQRankSum=0.414;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.270;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.845;SOR=1.445;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:63:64:0,63,63,63 0/3:18,0,0,14:32:99:.:843,605,1398,597,1363,1381,0,666,698,653:10,8,10,4 +chrX 2184950 . A T 1064 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=9.04;BaseQRankSum=1.455;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.450;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.538;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,40:67:99:432,0:14,13,20,20 0/1:30,24:54:99:662,0,830:17,13,12,12 +chrX 2185177 . T TTCTA 1324.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=11.66;BaseQRankSum=2.452;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.485;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.536;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,31:55:99:291,0:8,16,15,16 0/1:34,28:62:99:1073,0,1323:16,18,12,16 +chrX 2185664 . G A 1133 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=9.38;BaseQRankSum=-0.039;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=6.737;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.396;SOR=0.630;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,32:57:99:208,0:11,14,17,15 0/1:32,35:67:99:955,0,831:13,19,19,16 +chrX 2185923 . A C 641 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.42;BaseQRankSum=0.443;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.31;MQRankSum=0.943;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.846;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:84:99:84:.:.:0,691 0|1:24,26:50:99:.:0|1:2185923_A_C:671,0,636:2185923:12,12,14,12 +chrX 2186079 . T C 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=17.68;BaseQRankSum=0.36;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=4.883;MQ=59.39;MQRankSum=-1.03;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.747;SOR=1.290;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:84:99:84:.:.:0,691 0|1:20,17:37:99:.:0|1:2186079_T_C:654,0,768:2186079:11,9,6,11 +chrX 2186084 . T TCA 645.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=18.03;BaseQRankSum=-0.04;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=6.784;MQ=59.69;MQRankSum=-1.001;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.666;SOR=1.422;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:84:99:84:.:.:0,691 0|1:20,18:38:99:.:0|1:2186079_T_C:685,0,786:2186079:11,9,6,12 +chrX 2186085 . AGG A 642.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=1.398;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=4.763;MQ=59.72;MQRankSum=-1.029;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.614;SOR=1.456;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:84:99:84:.:.:0,691 0|1:21,18:39:99:.:0|1:2186079_T_C:682,0,807:2186079:11,10,6,12 +chrX 2186343 . T A 461 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.42;BaseQRankSum=-2.434;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.172;MQ=57.07;MQRankSum=0.233;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.645;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:84:99:84:0,691 0/1:22,21:43:99:.:491,0,724:12,10,10,11 +chrX 2186367 . C G 263 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=5.53;BaseQRankSum=0.597;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.65;MQRankSum=-0.728;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.502;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:84:99:84:.:.:0,691 0|1:42,11:53:99:.:0|1:2186367_C_G:293,0,1710:2186367:25,17,6,5 +chrX 2186370 . T C 2772 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=21.23;BaseQRankSum=0.684;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=3.660;MQ=56.75;MQRankSum=0.422;QD=21.23;ReadPosRankSum=1.537;SOR=0.590;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,49:79:99:945,0:12,18,23,26 1/1:5,48:53:10:1857,10,0:3,2,28,20 +chrX 2186398 . C A 105 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=1.90;BaseQRankSum=0.559;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.57;MQRankSum=-1.826;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.759;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:77:99:77:.:.:0,164 0|1:63,8:71:99:.:0|1:2186367_C_G:135,0,2620:2186367:37,26,5,3 +chrX 2186431 . C A 528 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=6.98;BaseQRankSum=-1.289;DP=159;ExcessHet=0.0000;FS=2.016;MQ=57.10;MQRankSum=-0.495;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.634;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:77:99:77:0,164 0/1:57,23:80:99:.:558,0,1693:31,26,11,12 +chrX 2186500 . G A 315 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=4.01;BaseQRankSum=2.442;DP=163;ExcessHet=0.0000;FS=11.787;MQ=57.95;MQRankSum=-0.784;QD=4.01;ReadPosRankSum=-1.188;SOR=1.374;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:77:99:77:0,164 0/1:68,18:86:99:.:345,0,2288:40,28,6,12 +chrX 2186598 . G A 1741 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=14.06;BaseQRankSum=1.406;DP=196;ExcessHet=0.0000;FS=1.483;MQ=55.54;MQRankSum=-0.528;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.899;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,49:72:99:1121,0:15,8,30,19 0/1:25,29:54:99:650,0,472:9,15,13,15 +chrX 2186620 . A G 202 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=14;AS_QD=4.94;BaseQRankSum=1.393;DP=177;ExcessHet=0.0000;FS=1.303;MQ=55.59;MQRankSum=-1.955;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.925;SOR=0.446;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:91:.:91:0,0 0/1:33,14:47:99:.:232,0,844:14,19,6,6 +chrX 2187355 . G A,* 1408 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=50,2;AS_QD=26.15,0.00;BaseQRankSum=1.997;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=1.907;MQ=57.73;MQRankSum=1.966;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.34;SOR=0.867;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:4,28,0:32:99:.:.:769,0,848:.:2,2,16,12 1|1:1,22,2:25:1:1|0:2187319_TGGTGGAAGGTACCATTTCCGGGCAAGTGGGTCACCGCCTTCAATGGAAGGTACCATTGCCGGGAAAATGGGTCACTGCCTTG_T:669,44,0,659,1,923:2187319:0,1,14,10 +chrX 2187543 . C G 687 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.04;BaseQRankSum=-0.627;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.038;MQ=59.14;MQRankSum=-0.972;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.501;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,124 0/1:27,28:55:99:.:717,0,719:16,11,15,13 +chrX 2187696 . T A 619 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=5.90;BaseQRankSum=1.746;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.782;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.1;SOR=0.357;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,31:63:17:17,0:13,19,16,15 0/1:24,23:47:99:632,0,671:7,17,9,14 +chrX 2187901 . C T 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.72;BaseQRankSum=1.585;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.329;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.72;SOR=0.520;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:70:65:0,70 0/1:29,25:54:99:.:687,0,775:17,12,12,13 +chrX 2189165 . G C 898 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=-0.511;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.618;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:70:65:0,70 0/1:23,35:58:99:.:928,0,559:10,13,16,19 +chrX 2189219 . G A 868 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=-1.142;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.791;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:70:65:0,70 0/1:26,32:58:99:.:898,0,719:12,14,14,18 +chrX 2189288 . C A 1009 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=17.03;BaseQRankSum=-0.494;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.981;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.783;SOR=0.859;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:70:65:0,70 0/1:24,37:61:99:.:1039,0,600:12,12,17,20 +chrX 2189325 . ATTT A,ATTTT,ATTTTT 676.97 . AC=1,0,2;AF=0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=20,2,30;AS_QD=5.15,0.75,15.50;BaseQRankSum=-0.469;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=20.311;MQ=59.43;MQRankSum=0;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.608;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 3:1,12,2,15:30:99:242,325,236,0:1,0,12,17 1/3:5,8,0,15:28:99:474,340,701,553,585,845,158,0,332,365:5,0,10,13 +chrX 2190291 . G GA 897.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=6.84;BaseQRankSum=-0.606;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=7.660;MQ=59.95;MQRankSum=1.099;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.540;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,33:62:89:89,0:16,13,15,18 0/1:38,37:75:99:848,0,907:24,14,18,19 +chrX 2190441 . A C 659 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.44;BaseQRankSum=-0.508;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.946;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.518;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,292 0/1:37,29:66:99:.:689,0,987:16,21,14,15 +chrX 2191519 . T C 974 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=9.56;BaseQRankSum=-0.627;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.597;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.54;SOR=0.889;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,28:51:99:139,0:9,14,17,11 0/1:23,31:54:99:865,0,627:13,10,16,15 +chrX 2191810 . A G 1142 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=8.25;BaseQRankSum=-0.89;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.617;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.628;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,48:81:99:482,0:17,16,28,20 0/1:34,27:61:99:690,0,969:19,15,11,16 +chrX 2192122 . C A,CA 452 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=2,43;AS_QD=0.00,6.10;BaseQRankSum=-0.972;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.850;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.521;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:19,2,18:39:61:61,887,0:11,8,11,9 0/2:17,0,25:42:99:421,472,823,0,351,277:10,7,13,12 +chrX 2193129 . T C 1045 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=10.24;BaseQRankSum=0.084;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.582;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.511;SOR=0.579;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,29:47:99:291,0:6,12,13,16 0/1:28,30:58:99:784,0,729:15,13,17,13 +chrX 2193159 . C G 587 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.46;BaseQRankSum=1.091;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.565;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.513;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,283 0/1:34,25:59:99:.:617,0,859:20,14,12,13 +chrX 2193915 . C CATCT 1086.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=10.14;BaseQRankSum=0.205;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=5.943;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.349;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,28:51:99:210,0:12,11,12,16 0/1:35,25:60:99:916,0,1341:25,10,16,9 +chrX 2193960 . T G 515 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.28;BaseQRankSum=-0.974;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.09;SOR=0.806;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:11:66:0,11 0/1:30,23:53:99:.:545,0,814:20,10,16,7 +chrX 2194098 . A C 716 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.63;BaseQRankSum=2.089;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.63;ReadPosRankSum=2.065;SOR=0.693;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,138 0|1:31,20:51:99:.:0|1:2194098_A_C:746,0,1231:2194098:17,14,11,9 +chrX 2194100 . CTATT C 701.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.98;BaseQRankSum=1.127;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.98;ReadPosRankSum=2.001;SOR=0.704;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,138 0|1:33,20:53:99:.:0|1:2194098_A_C:741,0,1292:2194098:18,15,11,9 +chrX 2194267 . C G 1261 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=10.94;BaseQRankSum=0.463;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=8.606;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=1.040;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,36:58:99:446,0:14,8,20,16 0/1:29,31:60:99:845,0,767:9,20,20,11 +chrX 2194301 . G C 1184 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=10.03;BaseQRankSum=-0.7;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.322;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=0.610;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,34:56:99:367,0:14,8,17,17 0/1:32,33:65:99:847,0,872:10,22,18,15 +chrX 2194328 . A G 1234 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=10.11;BaseQRankSum=-2.059;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=2.266;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.3;SOR=0.910;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,35:56:99:380,0:15,6,19,16 0/1:35,34:69:99:884,0,988:13,22,19,15 +chrX 2194409 . C T 1584 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=11.45;BaseQRankSum=1.569;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=3.952;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.953;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:37,44:81:99:.:.:295,0:.:20,17,20,24 0|1:26,34:60:99:0|1:2194409_C_T:1319,0,968:2194409:12,14,14,20 +chrX 2194416 . TTA T 1553.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=11.38;BaseQRankSum=1.188;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=4.032;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.324;SOR=0.821;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:38,44:82:99:.:.:269,0:.:21,17,21,23 0|1:24,34:58:99:0|1:2194409_C_T:1324,0,905:2194409:12,12,14,20 +chrX 2194543 . T G 1214 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=10.03;BaseQRankSum=0.34;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.298;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.921;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,37:64:99:348,0:10,17,24,13 0/1:28,32:60:99:896,0,793:19,9,16,16 +chrX 2195067 . G C 537 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.61;BaseQRankSum=-0.114;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=1.025;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.113;SOR=0.892;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:80:69:0,80 0/1:37,22:59:99:.:567,0,1078:20,17,13,9 +chrX 2195750 . A C 3426 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=32.60;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.60;SOR=1.189;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1747,0:0,0,17,35 1/1:0,54:54:99:1709,161,0:0,0,25,29 +chrX 2195778 . T TTTTC 511.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.48;BaseQRankSum=-3.218;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.541;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.549;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1125 0/1:29,19:48:99:.:551,0,886:17,12,9,10 +chrX 2195790 . C CTTT 797.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.20;BaseQRankSum=0.645;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.593;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.871;SOR=1.041;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1125 0/1:19,27:46:99:.:837,0,577:9,10,16,11 +chrX 2196428 . G A 4173 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=33.36;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=33.36;SOR=0.862;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2218,0:0,0,28,37 1/1:0,61:61:99:1985,183,0:0,0,30,31 +chrX 2196906 . AT A 58.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=6.53;BaseQRankSum=-1.426;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=9.249;MQ=58.53;MQRankSum=-0.623;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.847;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,585 0/1:7,8:15:89:.:98,0,89:6,1,3,5 +chrX 2197083 . G A 713 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.38;BaseQRankSum=-0.896;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=11.872;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.192;SOR=0.392;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,585 0|1:32,28:60:99:.:0|1:2197083_G_A:743,0,1217:2197083:9,23,15,13 +chrX 2197090 . T G 1191 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=12.09;BaseQRankSum=0.712;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=11.654;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.216;SOR=1.345;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:15,28:43:99:.:.:458,0:.:8,7,13,15 0|1:27,31:58:99:1|0:2197083_G_A:763,0,1029:2197083:15,12,8,23 +chrX 2197413 . CT C 473.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=5.83;BaseQRankSum=1.186;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=1.216;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.709;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,22:39:99:138,0:8,9,12,10 0/1:29,20:49:99:375,0,603:17,12,11,9 +chrX 2197891 . A T,G 4176 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=6,125;AS_QD=0.00,33.65;DP=158;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.03;QD=32.11;SOR=0.739;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,6,65:71:99:2224,2617,0:0,0,35,36 2/2:0,0,60:60:99:1982,1982,1982,180,180,0:0,0,32,28 +chrX 2198075 . T C 4634 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=145;AS_QD=32.17;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.17;SOR=0.854;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2134,0:0,0,30,35 1/1:0,80:80:99:2530,240,0:0,0,37,43 +chrX 2198239 . T C 3426 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.30;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.30;SOR=0.830;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2052,0:0,0,28,36 1/1:0,43:43:99:1404,129,0:0,0,22,21 +chrX 2198372 . A G 3990 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=32.16;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.16;SOR=0.882;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2126,0:0,0,26,40 1/1:0,59:59:99:1894,177,0:0,0,31,28 +chrX 2198498 . T C 4952 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=29.84;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.95;SOR=0.763;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2487,0:.:0,0,32,26 1|1:0,58:58:99:0|1:2198498_T_C:2495,175,0:2198498:0,0,24,34 +chrX 2198521 . A G 5129 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.25;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=0.763;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,58:58:99:.:.:2600,0:.:0,0,34,24 1|1:0,58:58:99:0|1:2198498_T_C:2559,175,0:2198498:0,0,26,32 +chrX 2198522 . A T 5034 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=25.64;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.81;SOR=0.784;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2565,0:.:0,0,34,23 1|1:0,56:56:99:0|1:2198498_T_C:2499,169,0:2198498:0,0,25,31 +chrX 2199008 . C CCA 3935.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=28.70;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.30;QD=43.68;SOR=0.906;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1620,0:0,0,17,21 1/1:0,53:53:99:2355,159,0:0,0,24,29 +chrX 2199123 . C T 910 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=17.41;BaseQRankSum=-1.449;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.124;MQ=58.64;MQRankSum=0.05;QD=17.41;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.437;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:64:46:0,64 0/1:18,36:54:99:.:940,0,415:7,11,17,19 +chrX 2199146 . T C 4247 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=31.22;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.83;QD=42.35;SOR=0.725;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46:46:99:.:.:1874,0:.:0,0,3,3 1|1:0,55:55:99:0|1:2199146_T_C:2403,166,0:2199146:0,0,27,28 +chrX 2199184 . G C 3851 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=33.21;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.72;QD=43.12;SOR=0.754;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1673,0:.:0,0,9,6 1|1:0,51:51:99:0|1:2199146_T_C:2208,153,0:2199146:0,0,25,26 +chrX 2199186 . C T 3851 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=25.28;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.78;QD=43.12;SOR=0.754;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1673,0:.:0,0,9,6 1|1:0,51:51:99:0|1:2199146_T_C:2208,153,0:2199146:0,0,25,26 +chrX 2199308 . C T 2189 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=27.40;BaseQRankSum=3.604;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=6.926;MQ=58.54;MQRankSum=2.036;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.152;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,31:33:99:900,0:0,2,16,15 1/1:4,44:48:89:1319,89,0:1,3,22,22 +chrX 2199414 . T C 5814 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=26.97;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.89;QD=44.61;SOR=0.838;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,67:67:99:.:.:2975,0:.:0,0,35,32 1|1:0,64:64:99:0|1:2199414_T_C:2869,193,0:2199414:0,0,26,38 +chrX 2199415 . G A 5814 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=31.48;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.90;QD=44.61;SOR=0.838;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,67:67:99:.:.:2975,0:.:0,0,35,32 1|1:0,64:64:99:0|1:2199414_T_C:2869,193,0:2199414:0,0,26,38 +chrX 2199563 . C T 4122 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=32.69;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.69;SOR=0.709;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2228,0:0,0,29,39 1/1:0,59:59:99:1924,177,0:0,0,34,25 +chrX 2199634 . GT G 5605.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=27.05;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=0.791;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2810,0:.:0,0,36,27 1|1:0,63:63:99:0|1:2199634_GT_G:2835,190,0:2199634:0,0,30,33 +chrX 2199636 . G GCC 5605.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=29.88;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=0.791;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2810,0:.:0,0,36,27 1|1:0,63:63:99:0|1:2199634_GT_G:2835,190,0:2199634:0,0,30,33 +chrX 2199845 . C T 915 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=30.84;BaseQRankSum=2.281;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;MQRankSum=3.753;QD=39.38;ReadPosRankSum=-1.451;SOR=0.340;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,12:13:99:.:.:486,0:.:1,0,7,5 1|1:0,11:11:39:0|1:2199845_C_T:459,39,0:2199845:0,0,6,5 +chrX 2199848 . ATCTCTGCTAAAAATAAACATTAAAAAATGTTTTATGTTTGAGATAGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAGATGTAGTGAGATCCCCG A,GTCTCTGCTAAAAATAAACATTAAAAAATGTTTTATGTTTGAGATAGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAGATGTAGTGAGATCCCCG 4347 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,65;AS_QD=34.73,27.70;BaseQRankSum=1.967;DP=192;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;MQRankSum=5.834;QD=66.32;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=0.322;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,0,32:33:99:2211,3175,0:1,0,17,15 2/2:0,0,33:33:99:2166,1539,3037,168,191,0:0,0,19,14 +chrX 2199872 . AAAAT *,A 3796.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,53;AS_QD=0.00,27.75;BaseQRankSum=0;DP=162;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;MQRankSum=5.295;QD=71.04;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.271;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:1,0,26:27:99:.:.:1939,2580,0:.:1,0,12,14 2|2:0,0,27:27:99:0|1:2199845_C_T:1897,1297,2484,145,149,0:2199845:0,0,16,11 +chrX 2199934 . G *,A 4303 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,65;AS_QD=28.74,32.77;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=66.66;SOR=0.925;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,32:32:99:.:.:2195,1897,0:.:0,0,17,15 2|2:0,0,33:33:99:0|1:2199845_C_T:2138,1428,1827,157,112,0:2199845:0,0,19,14 +chrX 2199992 . G A 5501 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=139;AS_QD=24.73;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.79;SOR=1.076;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,77:77:99:.:.:3068,0:.:0,0,46,31 1|1:0,62:62:99:0|1:2199845_C_T:2463,186,0:2199845:0,0,35,27 +chrX 2200819 . G A 3535 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=31.27;BaseQRankSum=2.461;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=31.27;ReadPosRankSum=1.449;SOR=0.245;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,60:61:99:1920,0:0,1,26,34 1/1:0,53:53:99:1645,158,0:0,0,29,24 +chrX 2201168 . A G 2877 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.95;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.58;QD=31.95;SOR=0.959;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1517,0:0,0,26,23 1/1:0,42:42:99:1390,126,0:0,0,25,17 +chrX 2201296 . C CA,A,CAA 1680 . AC=1,0,2;AF=0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=27,7,37;AS_QD=26.98,0.00,22.35;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.24;QD=24.08;SOR=0.721;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 3:0,13,7,18:38:99:789,185,1161,0:0,0,18,20 1/3:0,14,0,19:33:99:921,404,295,812,388,762,283,0,281,207:0,0,18,15 +chrX 2201420 . A G 5148 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=32.64;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.79;SOR=1.052;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,68:68:99:.:.:2945,0:.:0,0,44,24 1|1:0,53:53:99:0|1:2201420_A_G:2233,159,0:2201420:0,0,26,27 +chrX 2201442 . A C 5310 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=27.90;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.72;SOR=1.039;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,75:75:99:.:.:3186,0:.:0,0,48,27 1|1:0,50:50:99:0|1:2201420_A_G:2154,150,0:2201420:0,0,24,26 +chrX 2201974 . A ATGTGTG 1957.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=28.13;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.93;QD=44.38;SOR=1.154;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:1017,0:.:0,0,9,14 1|1:0,22:22:67:0|1:2201974_A_ATGTGTG:980,67,0:2201974:0,0,9,13 +chrX 2201991 . G T 335 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=8.49;BaseQRankSum=0.802;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.71;MQRankSum=-1.8;QD=8.49;ReadPosRankSum=2.771;SOR=0.859;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:47:99:47:.:.:0,571 0|1:32,11:43:99:.:0|1:2201974_A_ATGTGTG:365,0,1300:2201974:16,16,5,6 +chrX 2201998 . A ATGTGTATATATATAT,ATGTGTATATATATATAT 1420.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=28,31;AS_QD=25.29,27.74;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.98;QD=24.75;SOR=0.726;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,13,18:31:99:376,264,0:0,0,14,17 1/2:0,15,13:28:99:1084,488,738,600,0,1103:0,0,15,13 +chrX 2202000 . G GAT 526.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=17.69;BaseQRankSum=-0.033;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.69;MQRankSum=0.953;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.706;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:50:99:50:.:.:0,1242 0|1:17,15:32:99:.:0|1:2202000_G_GAT:566,0,671:2202000:9,8,8,7 +chrX 2202004 . TAG T 609.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=17;AS_QD=17.08;BaseQRankSum=-0.1;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.52;MQRankSum=-1.244;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.373;SOR=0.836;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:54:.:53:.:.:0,0 0|1:21,17:38:99:.:1|0:2202000_G_GAT:649,0,825:2202000:8,8,7,6 +chrX 2202006 . G *,GGAT 1504.97 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;AS_AltDP=17,15;AS_QD=0.00,34.42;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.49;QD=48.25;SOR=0.818;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:54:.:53:.:.:0,0,0 1|2:0,17,15:32:99:.:0|1:2202000_G_GAT:1544,636,616,728,0,667:2202000:0,0,17,15 +chrX 2202010 . G GGAT 608.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=17.05;BaseQRankSum=-1.782;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.49;MQRankSum=-1.007;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.904;SOR=0.764;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:5:52:.:.:0,5 0|1:21,17:38:99:.:1|0:2202000_G_GAT:648,0,828:2202000:10,11,7,6 +chrX 2202152 . C T 3140 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=33.02;BaseQRankSum=2.443;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=3.388;MQ=59.40;MQRankSum=-0.165;QD=33.02;ReadPosRankSum=1.533;SOR=0.531;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,51:52:99:1661,0:1,0,27,24 1/1:0,44:44:99:1509,132,0:0,0,16,28 +chrX 2202488 . C A 2940 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=30.31;BaseQRankSum=1.938;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;MQRankSum=-0.099;QD=30.31;ReadPosRankSum=1.504;SOR=0.608;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,52:53:99:1497,0:1,0,32,20 1/1:0,45:45:99:1473,135,0:0,0,31,14 +chrX 2202556 . T C 4559 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=25.31;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=44.99;SOR=0.905;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,45:45:99:.:.:2024,0:.:0,0,22,23 1|1:0,57:57:99:0|1:2202556_T_C:2565,172,0:2202556:0,0,24,33 +chrX 2202557 . G A 4644 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=32.44;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=44.94;SOR=0.856;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46:46:99:.:.:2069,0:.:0,0,23,23 1|1:0,58:58:99:0|1:2202556_T_C:2605,175,0:2202556:0,0,25,33 +chrX 2202580 . A AT 823.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=7.92;BaseQRankSum=1.545;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.712;MQ=59.96;MQRankSum=1.129;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.837;SOR=0.731;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,26:48:99:133,0:13,9,14,12 0/1:31,30:61:99:730,0,845:14,17,13,17 +chrX 2202581 . A AAT,AT 4125.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=53,56;AS_QD=26.61,32.43;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=38.21;SOR=0.711;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,22,26:48:99:1558,133,0:0,0,27,21 1/2:0,31,30:61:99:2607,914,730,1009,0,845:0,0,27,34 +chrX 2202704 . G GTATA 1126.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=13.10;BaseQRankSum=1.894;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.755;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.916;SOR=0.501;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,24:47:99:118,0:16,7,13,11 0/1:14,28:42:99:1048,0,482:6,8,15,13 +chrX 2202896 . C T 3706 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=32.49;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=32.49;SOR=0.941;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1698,0:0,0,19,32 1/1:0,64:64:99:2038,192,0:0,0,32,32 +chrX 2203037 . C T 581 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=5.71;BaseQRankSum=2.606;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=6.208;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.363;SOR=1.332;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,27:54:80:80,0:10,17,18,9 0/1:29,24:53:99:531,0,781:19,10,15,9 +chrX 2203040 . G GATC 4646.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=29.14;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=43.79;SOR=1.008;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:2437,0:0,0,27,29 1/1:0,51:51:99:2249,153,0:0,0,34,17 +chrX 2203093 . C T 3710 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=31.97;BaseQRankSum=-0.449;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.380;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,55:56:99:1766,0:0,1,17,38 1/1:0,61:61:99:1974,183,0:0,0,32,29 +chrX 2203238 . A T 2937 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=34.10;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.10;SOR=1.153;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1261,0:0,0,16,21 1/1:0,50:50:99:1706,150,0:0,0,19,31 +chrX 2203291 . C T 3023 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=33.55;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.55;SOR=0.715;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1253,0:0,0,20,18 1/1:0,53:53:99:1800,159,0:0,0,26,27 +chrX 2203323 . C T 856 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=9.84;BaseQRankSum=-0.789;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=1.701;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.526;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,21:36:99:199,0:9,6,13,8 0/1:29,25:54:99:687,0,845:17,12,12,13 +chrX 2203387 . T C 3434 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=31.21;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.21;SOR=0.786;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1794,0:0,0,31,26 1/1:0,54:54:99:1670,162,0:0,0,22,32 +chrX 2203527 . T C 2803 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.56;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.56;SOR=0.763;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1508,0:0,0,22,24 1/1:0,41:41:99:1325,122,0:0,0,20,21 +chrX 2203616 . C T 4192 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=31.27;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.27;SOR=1.049;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2038,0:0,0,37,28 1/1:0,70:70:99:2184,210,0:0,0,41,29 +chrX 2203672 . G A 1315 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=9.61;BaseQRankSum=-1.501;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=3.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.339;SOR=0.807;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,42:71:99:397,0:13,16,24,18 0/1:32,37:69:99:948,0,845:16,16,19,18 +chrX 2203722 . T C 4612 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=145;AS_QD=32.01;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=32.01;SOR=0.764;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2371,0:0,0,36,38 1/1:0,71:71:99:2271,213,0:0,0,34,37 +chrX 2203867 . A G 3923 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=31.62;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=31.62;SOR=0.742;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2228,0:0,0,35,33 1/1:0,57:57:99:1725,170,0:0,0,29,28 +chrX 2204157 . T A 4838 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=145;AS_QD=33.57;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.57;SOR=0.707;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,81:81:99:2655,0:0,0,44,37 1/1:0,64:64:99:2213,193,0:0,0,29,35 +chrX 2204322 . G A 5367 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=26.28;BaseQRankSum=-0.427;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;MQRankSum=-0.189;QD=40.89;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.315;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,66:67:99:.:.:2688,0:.:0,1,26,40 1|1:0,65:65:99:0|1:2204322_G_A:2709,195,0:2204322:0,0,33,32 +chrX 2204345 . T C 4882 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=33.69;BaseQRankSum=-0.617;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.20;MQRankSum=-0.096;QD=41.63;ReadPosRankSum=1.578;SOR=0.389;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,55:56:99:.:.:2312,0:.:0,1,18,37 1|1:0,62:62:99:0|1:2204322_G_A:2600,186,0:2204322:0,0,31,31 +chrX 2204427 . T A 3148 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=34.54;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=34.54;SOR=0.737;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1450,0:0,0,21,21 1/1:0,50:50:99:1728,150,0:0,0,26,24 +chrX 2204858 . T C 3867 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=30.21;BaseQRankSum=-0.731;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.182;MQ=54.51;MQRankSum=-0.569;QD=30.21;ReadPosRankSum=1.23;SOR=0.374;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,61:62:99:1851,0:1,0,28,33 1/1:0,67:67:99:2046,201,0:0,0,33,34 +chrX 2205249 . T C 5399 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=30.09;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=43.09;SOR=0.693;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2696,0:.:0,0,32,30 1|1:0,64:64:99:0|1:2205249_T_C:2733,193,0:2205249:0,0,31,33 +chrX 2205256 . C T 5303 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=31.65;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=0.709;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2717,0:.:0,0,31,32 1|1:0,60:60:99:0|1:2205249_T_C:2616,181,0:2205249:0,0,30,30 +chrX 2205508 . G T 2901 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.21;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.26;QD=32.21;SOR=1.460;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1459,0:0,0,31,14 1/1:0,46:46:99:1472,138,0:0,0,28,18 +chrX 2205537 . G A 3095 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=32.55;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.41;QD=32.55;SOR=1.076;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1706,0:0,0,33,19 1/1:0,44:44:99:1419,132,0:0,0,23,21 +chrX 2205567 . T G 2884 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=30.35;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.29;QD=30.35;SOR=0.969;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1704,0:0,0,33,24 1/1:0,39:39:99:1210,117,0:0,0,21,18 +chrX 2205614 . T C 522 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=5.52;BaseQRankSum=0.024;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.552;MQ=58.07;MQRankSum=2.415;QD=5.52;ReadPosRankSum=1.901;SOR=0.634;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,37:65:99:166,0:17,11,20,17 0/1:20,15:35:99:386,0,550:9,11,5,10 +chrX 2205718 . G A 3379 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=32.47;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=32.47;SOR=0.751;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1960,0:0,0,29,32 1/1:0,44:44:99:1449,131,0:0,0,22,22 +chrX 2205761 . C T 3011 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=31.68;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=31.68;SOR=0.870;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1732,0:0,0,22,32 1/1:0,42:42:99:1309,124,0:0,0,22,20 +chrX 2205821 . T TCAC 3442.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=35.29;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=44.64;SOR=0.693;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1778,0:0,0,19,21 1/1:0,38:38:99:1704,114,0:0,0,20,18 +chrX 2205870 . C T 4034 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=28.09;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=43.23;SOR=0.736;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47:47:99:.:.:2001,0:.:0,0,24,23 1|1:0,47:47:99:0|1:2205870_C_T:2063,141,0:2205870:0,0,24,23 +chrX 2205902 . T C 4249 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=29.31;BaseQRankSum=-0.167;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=3.274;MQ=59.84;MQRankSum=-0.101;QD=41.95;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.447;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2136,0:.:0,0,28,23 1|1:1,50:51:99:0|1:2205870_C_T:2143,119,0:2205870:0,1,26,24 +chrX 2206057 . G A 5466 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=29.31;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;QD=44.32;SOR=0.759;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3132,0:.:0,0,33,38 1|1:0,53:53:99:0|1:2206057_G_A:2364,160,0:2206057:0,0,31,22 +chrX 2206067 . C T 5747 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=31.25;BaseQRankSum=2.431;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=3.278;MQ=59.67;MQRankSum=-0.083;QD=43.11;ReadPosRankSum=1.234;SOR=0.442;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,73:74:99:.:.:3181,0:.:0,1,34,39 1|1:0,60:60:99:0|1:2206057_G_A:2596,181,0:2206057:0,0,37,23 +chrX 2206086 . C T 4424 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=32.75;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=32.75;SOR=0.953;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2396,0:0,0,34,39 1/1:0,63:63:99:2058,189,0:0,0,42,21 +chrX 2206153 . C T 4621 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=141;AS_QD=32.75;BaseQRankSum=2.798;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=3.394;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=32.75;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.525;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2487,0:0,0,32,43 1/1:1,66:67:99:2164,191,0:1,0,32,34 +chrX 2206244 . A G 909 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=6.61;BaseQRankSum=-0.274;DP=155;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=1.173;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=0.696;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,42:74:99:287,0:17,15,20,22 0/1:41,27:68:99:652,0,1151:20,21,14,13 +chrX 2206296 . A C 559 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=4.12;BaseQRankSum=-2.569;DP=156;ExcessHet=0.0000;FS=2.958;MQ=59.97;MQRankSum=1.085;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.495;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,38:72:18:18,0:20,14,18,20 0/1:45,26:71:99:571,0,1312:24,21,14,12 +chrX 2206407 . T C 3652 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=32.30;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.30;SOR=0.965;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1806,0:0,0,22,34 1/1:0,58:58:99:1876,174,0:0,0,28,30 +chrX 2206480 . T C 3830 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=30.16;DP=160;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=30.16;SOR=1.051;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1635,0:0,0,25,29 1/1:0,74:74:99:2225,220,0:0,0,29,45 +chrX 2207097 . A G 3733 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=32.16;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.16;SOR=1.208;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2278,0:0,0,42,29 1/1:0,46:46:99:1485,137,0:0,0,29,17 +chrX 2207232 . CAA C,CA 1576.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=28,30;AS_QD=30.55,22.34;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=3.085;MQ=59.66;MQRankSum=0;QD=26.93;SOR=0.226;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,17,6:25:3:81,3,0:0,2,9,14 1/2:0,11,24:35:99:1535,624,536,310,0,183:0,0,21,14 +chrX 2207247 . A C 1946 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=26.38;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.58;QD=37.28;SOR=0.892;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:38:94:38:0,94 1/1:0,53:53:99:.:1976,158,0:0,0,29,24 +chrX 2207296 . T TGC 838.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=10.33;BaseQRankSum=1.115;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.866;MQ=58.90;MQRankSum=0.664;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.009;SOR=0.597;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:13,19:32:99:259,0:8,5,8,11 0/1:28,25:53:99:619,0,1079:15,13,13,12 +chrX 2207300 . T TGC 638.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.04;BaseQRankSum=0.335;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.58;MQRankSum=-0.775;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.907;SOR=0.560;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:99:39:0,945 0/1:26,26:52:99:.:678,0,939:14,12,13,13 +chrX 2207306 . T TGTGTGTGTGC,TGTGTGTGTGTGC,TGTGTGTGTGTGTGC,TGTGTGTGTGTGTGTGC,TGC,TGTGC 3678.97 . AC=2,0,0,1,0,0;AF=0.667,0.00,0.00,0.333,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=37,1,0,36,0,1;AS_QD=26.53,31.89,30.16,27.83,36.15,32.28;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.98;QD=49.57;SOR=0.719;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0,0,13,0,0:30:99:1188,0,598,687,218,879,879:0,0,15,15 1/4:0,20,1,0,23,0,1:45:99:2530,1282,1175,1885,1082,1787,1901,940,1487,1833,1025,0,728,956,947,1967,1172,1632,1697,761,1876,1887,869,1548,1677,984,1611,1780:0,0,22,23 +chrX 2207563 . A AT,ATT 2845.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=100,0;AS_QD=28.28,30.85;BaseQRankSum=-0.511;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=-0.098;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=1.408;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,52,0:54:99:1424,0,1464:1,1,32,20 1/1:0,48,0:48:99:1461,156,0,1355,144,1346:0,0,32,16 +chrX 2207592 . C T 3925 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=32.42;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.42;SOR=1.160;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1925,0:0,0,34,26 1/1:0,62:62:99:2030,186,0:0,0,39,23 +chrX 2207652 . T C 3936 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.98;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=31.98;SOR=0.725;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2040,0:0,0,32,33 1/1:0,59:59:99:1926,177,0:0,0,29,30 +chrX 2207757 . G A 3867 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=33.31;BaseQRankSum=2.584;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.31;ReadPosRankSum=-1.197;SOR=0.506;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,54:55:99:1807,0:0,1,25,29 1/1:0,62:62:99:2090,186,0:0,0,19,43 +chrX 2208039 . G A 522 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.46;BaseQRankSum=0.437;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.204;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.487;SOR=0.824;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,109 0/1:21,20:41:99:.:552,0,576:10,11,11,9 +chrX 2208064 . T TCAC 982.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=11.23;BaseQRankSum=0.151;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=8.412;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=1.232;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,25:47:99:120,0:11,11,16,9 0/1:21,23:44:99:902,0,813:9,12,14,9 +chrX 2208194 . G GA 151.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=5.46;BaseQRankSum=-0.156;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.451;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.967;SOR=0.641;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1485 0/1:24,11:35:99:.:191,0,951:10,14,6,5 +chrX 2208202 . AAAAG A 1335.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=14.03;BaseQRankSum=1.909;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.670;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.201;SOR=0.496;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,32:56:99:382,0:9,15,16,16 0/1:16,26:42:99:993,0,541:8,8,12,14 +chrX 2208248 . C T 473 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.27;BaseQRankSum=-1.448;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.819;SOR=0.648;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,115 0/1:28,21:49:99:.:503,0,761:13,15,10,11 +chrX 2208411 . A T 501 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.35;BaseQRankSum=2.342;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.600;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.387;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,115 0/1:24,19:43:99:.:531,0,645:15,9,10,9 +chrX 2208546 . AT A 2638.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=27.90;BaseQRankSum=1.628;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=3.802;MQ=59.73;MQRankSum=0;QD=27.90;ReadPosRankSum=1.261;SOR=0.824;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,54:55:99:1515,0:1,0,19,35 1/1:0,41:41:99:1163,123,0:0,0,20,21 +chrX 2208708 . T C 815 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=8.28;BaseQRankSum=-0.19;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.96;MQRankSum=-0.414;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.35;SOR=0.661;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,23:43:72:72,0:8,12,11,12 0/1:29,30:59:99:773,0,769:11,18,10,20 +chrX 2208791 . A C 3031 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=32.22;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=32.22;SOR=1.289;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1385,0:0,0,17,26 1/1:0,52:52:99:1676,156,0:0,0,19,33 +chrX 2208957 . C G 3976 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=28.75;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.52;QD=38.89;SOR=1.292;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:1998,0:.:0,0,31,21 1|1:0,51:51:99:0|1:2208957_C_G:2008,153,0:2208957:0,0,33,18 +chrX 2208965 . T C 757 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.13;BaseQRankSum=0.265;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=6.106;MQ=59.88;MQRankSum=1.119;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.209;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,194 0|1:24,28:52:99:.:0|1:2208957_C_G:787,0,631:2208957:18,6,16,12 +chrX 2209156 . C T 6153 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=142;AS_QD=32.97;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=0.874;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,78:78:99:.:.:3405,0:.:0,0,37,41 1|1:0,64:64:99:0|1:2209156_C_T:2778,193,0:2209156:0,0,28,36 +chrX 2209162 . TGG T 6157.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=142;AS_QD=29.99;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.64;SOR=0.874;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,78:78:99:.:.:3412,0:.:0,0,38,40 1|1:0,64:64:99:0|1:2209156_C_T:2785,193,0:2209156:0,0,27,37 +chrX 2209223 . AG A 767.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=5.68;BaseQRankSum=1.338;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.649;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:40,42:82:47:.:.:47,0:.:18,22,21,21 0|1:39,21:60:99:0|1:2209223_AG_A:760,0,1535:2209223:15,24,6,15 +chrX 2209231 . AT A 780.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.02;BaseQRankSum=1.741;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=1.044;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.02;ReadPosRankSum=-1.255;SOR=0.873;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:79:30:76:.:.:0,30 0|1:40,23:63:99:.:0|1:2209223_AG_A:820,0,1545:2209223:14,26,7,16 +chrX 2209359 . ATT A,AT 1966.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=47,47;AS_QD=30.49,31.55;BaseQRankSum=1.946;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=-0.204;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.826;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,25,30:57:99:882,116,0:1,1,27,28 1/2:0,22,17:39:99:1124,396,400,568,0,460:0,0,23,16 +chrX 2209539 . G A 3870 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=33.91;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.91;SOR=0.899;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2076,0:0,0,27,34 1/1:0,54:54:99:1824,162,0:0,0,25,29 +chrX 2209570 . C T 840 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=7.07;BaseQRankSum=0.124;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.667;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.07;ReadPosRankSum=2.073;SOR=0.667;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,34:62:99:184,0:16,12,18,16 0/1:34,27:61:99:686,0,893:16,18,12,15 +chrX 2209602 . C T 3916 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=32.61;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.61;SOR=0.710;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2214,0:0,0,36,31 1/1:0,54:54:99:1732,162,0:0,0,25,29 +chrX 2210001 . C CA 591.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.72;BaseQRankSum=-1.356;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.72;ReadPosRankSum=1.161;SOR=0.812;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,508 0/1:19,27:46:99:.:631,0,406:10,9,15,12 +chrX 2210208 . G A 999 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=9.19;BaseQRankSum=2.196;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=4.660;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.19;ReadPosRankSum=2.046;SOR=0.359;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,24:43:99:164,0:9,10,13,11 0/1:37,32:69:99:865,0,934:13,24,15,17 +chrX 2210328 . T C 677 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=6.26;BaseQRankSum=0.374;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=12.278;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.825;SOR=1.283;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,29:54:41:41,0:13,12,18,11 0/1:33,26:59:99:666,0,880:13,20,17,9 +chrX 2210749 . G A 69 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=1.71;BaseQRankSum=1.488;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.676;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,30:58:99:.:99,0:12,16,13,17 0/0:.:55:92:55:0,92,1364 +chrX 2210809 . C T 1017 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=9.10;BaseQRankSum=0.885;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=4.512;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=0.959;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,30:57:99:124,0:13,14,12,18 0/1:25,33:58:99:923,0,650:14,11,15,18 +chrX 2210870 . C CAA 5174.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=28.32;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=0.818;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2684,0:0,0,29,31 1/1:0,57:57:99:2530,171,0:0,0,33,24 +chrX 2210963 . A G 4004 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=32.27;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.27;SOR=0.742;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2376,0:0,0,36,39 1/1:0,50:50:99:1658,150,0:0,0,25,25 +chrX 2211248 . G GATGGATGGATGA 4968.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=32.62;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.55;SOR=0.899;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2890,0:0,0,41,25 1/1:0,49:49:99:2118,146,0:0,0,22,27 +chrX 2211287 . G GGATGGATA 5076.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=26.43;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.49;SOR=0.899;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:3071,0:.:0,0,41,28 1|1:0,46:46:99:0|1:2211287_G_GGATGGATA:2045,138,0:2211287:0,0,22,24 +chrX 2211316 . A C 4976 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=28.69;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.72;SOR=0.833;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,68:68:99:.:.:2879,0:.:0,0,39,29 1|1:0,52:52:99:0|1:2211287_G_GGATGGATA:2127,156,0:2211287:0,0,25,27 +chrX 2211438 . T A 4262 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=32.52;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=32.52;SOR=0.820;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2277,0:0,0,34,37 1/1:0,61:61:99:2015,183,0:0,0,36,25 +chrX 2211503 . A G 506 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.57;BaseQRankSum=-2.65;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=5.699;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.571;SOR=1.609;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,577 0/1:34,22:56:99:.:536,0,1004:17,17,15,7 +chrX 2211565 . A G 4087 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=32.67;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.67;SOR=1.188;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1959,0:0,0,22,38 1/1:0,66:66:99:2158,197,0:0,0,28,38 +chrX 2211678 . A G 3775 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=31.71;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.71;SOR=0.796;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2133,0:0,0,33,34 1/1:0,53:53:99:1672,158,0:0,0,30,23 +chrX 2211743 . C T 583 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=-1.442;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.379;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.666;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:35:50:0,35 0/1:28,24:52:99:.:613,0,796:16,12,11,13 +chrX 2211888 . G C 1046 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=10.76;BaseQRankSum=2.667;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.755;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,30:48:99:467,0:9,9,19,11 0/1:29,23:52:99:609,0,807:16,13,10,13 +chrX 2211991 . CA C 294.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=6.55;BaseQRankSum=1.137;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=6.082;MQ=57.20;MQRankSum=3.38;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.05;SOR=1.588;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,248 0/1:32,19:51:99:.:334,0,1202:18,14,14,5 +chrX 2212006 . AT A 1540.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=13.74;BaseQRankSum=-0.143;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.736;MQ=56.43;MQRankSum=-4.319;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.706;SOR=0.600;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,29:55:99:.:.:114,0:.:17,9,20,9 0|1:22,38:60:99:0|1:2212006_AT_A:1466,0,779:2212006:15,7,23,15 +chrX 2212019 . G A 1586 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=12.24;BaseQRankSum=0.759;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.665;MQ=56.13;MQRankSum=-5.389;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.596;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,33:64:90:.:.:90,0:.:19,12,20,13 0|1:27,41:68:99:0|1:2212006_AT_A:1526,0,889:2212006:17,10,24,17 +chrX 2212049 . G A 1174 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=8.92;BaseQRankSum=1.092;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=2.189;MQ=56.00;MQRankSum=-4.948;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.248;SOR=0.522;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,35:70:55:55,0:20,15,19,16 0/1:22,43:65:99:1149,0,505:12,10,21,22 +chrX 2212087 . C T 916 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=14.55;BaseQRankSum=1.265;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.18;MQRankSum=-4.727;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.735;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:19:70:0,19 0/1:29,36:65:99:.:946,0,668:14,15,17,19 +chrX 2212134 . C T 930 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=1.839;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=3.502;MQ=57.97;MQRankSum=-3.965;QD=15.00;ReadPosRankSum=-0.56;SOR=0.350;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,124 0/1:29,35:64:99:.:960,0,701:10,19,16,19 +chrX 2212175 . A T 997 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=8.85;BaseQRankSum=-0.196;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.489;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.806;SOR=0.899;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,35:58:99:318,0:11,12,14,21 0/1:32,26:58:99:709,0,910:16,16,13,13 +chrX 2212804 . A C 722 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.90;BaseQRankSum=-1.027;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.283;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.648;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,299 0/1:14,28:42:99:.:752,0,341:8,6,13,15 +chrX 2212907 . G A 821 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=18.50;BaseQRankSum=-0.148;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.211;MQ=59.42;MQRankSum=0;QD=18.50;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.257;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,299 0|1:23,23:46:99:.:0|1:2212907_G_A:851,0,876:2212907:18,5,11,6 +chrX 2212917 . G A 565 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.51;BaseQRankSum=0.3;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=5.691;MQ=59.17;MQRankSum=0;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.154;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,299 0|1:24,17:41:99:.:0|1:2212907_G_A:595,0,947:2212907:20,4,11,6 +chrX 2212928 . A G 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.41;BaseQRankSum=0;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=6.011;MQ=59.10;MQRankSum=0;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.136;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:20:17:.:.:0,20 0|1:20,17:37:99:.:0|1:2212907_G_A:607,0,789:2212907:17,3,11,6 +chrX 2212943 . G GGAAA,GGAAGGAAA 777.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=17,0;AS_QD=24.03,8.18;BaseQRankSum=-1.393;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=10.683;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=24.03;ReadPosRankSum=-2.136;SOR=0.040;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20,20 0/1:17,17,0:34:99:.:817,0,651,678,702,1383:16,1,11,6 +chrX 2214597 . A G 560 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.54;BaseQRankSum=-1.41;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=7.460;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.233;SOR=1.697;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20 0/1:30,26:56:99:.:590,0,806:15,15,18,8 +chrX 2214721 . G A 846 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.13;BaseQRankSum=-0.788;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.693;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20 0/1:29,33:62:99:.:876,0,781:14,15,17,16 +chrX 2214762 . C T 861 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.37;BaseQRankSum=-0.67;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.414;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.496;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20 0/1:29,33:62:99:.:891,0,767:12,17,17,16 +chrX 2214856 . C T 810 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.24;BaseQRankSum=1.974;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.576;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.69;SOR=0.846;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20 0/1:29,30:59:99:.:840,0,771:13,16,17,13 +chrX 2215259 . A G 630 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=-0.313;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.039;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=0.507;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20 0/1:31,25:56:99:.:660,0,869:12,19,11,14 +chrX 2215750 . G C 798 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.28;BaseQRankSum=0.82;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=9.206;MQ=57.27;MQRankSum=0.761;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.428;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20 0/1:28,30:58:99:.:828,0,739:9,19,16,14 +chrX 2217606 . G A 634 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.13;BaseQRankSum=1.32;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=6.243;MQ=59.52;MQRankSum=1.064;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.200;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20 0/1:23,24:47:99:.:664,0,554:7,16,12,12 +chrX 2217774 . T C 541 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.15;BaseQRankSum=-1.881;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=8.405;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.469;SOR=0.163;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20 0/1:25,22:47:99:.:571,0,716:18,7,11,11 +chrX 2218374 . T C 461 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.23;BaseQRankSum=2.003;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.866;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:20:17:0,20 0/1:29,19:48:99:.:491,0,773:12,17,7,12 +chrX 2218876 . G A 961 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=8.33;BaseQRankSum=1.135;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.685;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.585;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:90:90,0:14,16,15,17 0/1:25,32:57:99:901,0,638:11,14,16,16 +chrX 2219726 . T G 891 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=7.25;BaseQRankSum=1.616;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.166;SOR=0.639;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,34:66:8:8,0:14,18,16,18 0/1:28,33:61:99:913,0,684:12,16,14,19 +chrX 2220017 . A G 1064 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=9.43;BaseQRankSum=-0.348;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=7.259;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.554;SOR=0.532;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,36:65:99:210,0:16,13,18,18 0/1:19,32:51:99:884,0,488:13,6,14,18 +chrX 2220219 . C T 1344 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=10.25;BaseQRankSum=1.214;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.651;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.591;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,39:68:99:317,0:12,17,21,18 0/1:27,39:66:99:1057,0,670:13,14,16,23 +chrX 2221159 . T C 501 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.16;BaseQRankSum=0.175;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=17.955;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.625;SOR=1.844;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:30:60:0,30 0/1:36,22:58:99:.:531,0,947:14,22,16,6 +chrX 2221645 . A G 825 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=8.55;BaseQRankSum=2.007;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.750;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.67;SOR=0.773;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,23:46:60:60,0:11,12,10,13 0/1:24,30:54:99:795,0,621:12,12,18,12 +chrX 2222460 . T C 702 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=6.72;BaseQRankSum=-0.532;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.457;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.678;SOR=0.303;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,26:51:24:24,0:9,16,12,14 0/1:32,26:58:99:708,0,938:11,21,13,13 +chrX 2223063 . A G 989 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=8.35;BaseQRankSum=-1.094;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.340;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.454;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,38:65:99:322,0:18,9,21,17 0/1:28,29:57:99:697,0,743:17,11,17,12 +chrX 2223375 . A G 1391 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=9.29;BaseQRankSum=-1.265;DP=155;ExcessHet=0.0000;FS=2.018;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.544;VarDP=153 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,38:68:99:198,0:16,14,16,22 0/1:39,46:85:99:1223,0,1050:14,25,24,22 +chrX 2224254 . AG A 1364.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=12.42;BaseQRankSum=-0.555;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=7.408;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.288;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,33:56:99:.:.:451,0:.:10,13,15,18 0|1:32,25:57:99:0|1:2224254_AG_A:953,0,1268:2224254:9,23,13,12 +chrX 2224256 . G A 1374 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=12.42;BaseQRankSum=0.093;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.408;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.966;SOR=0.288;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,33:56:99:.:.:451,0:.:10,13,15,18 0|1:32,25:57:99:0|1:2224254_AG_A:953,0,1268:2224254:9,23,13,12 +chrX 2224258 . C T 1374 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=12.42;BaseQRankSum=2.63;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=7.408;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.8;SOR=0.288;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,33:56:99:.:.:451,0:.:10,13,15,18 0|1:32,25:57:99:0|1:2224254_AG_A:953,0,1268:2224254:9,23,13,12 +chrX 2224448 . G A 965 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.46;BaseQRankSum=-0.054;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.46;ReadPosRankSum=-1.681;SOR=0.749;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:89:67:0,89 0/1:22,35:57:99:.:995,0,563:11,11,17,18 +chrX 2224734 . A G 917 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.22;BaseQRankSum=-1.272;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.22;ReadPosRankSum=-3.401;SOR=0.622;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:89:67:.:.:0,89 0|1:27,28:55:99:.:0|1:2224734_A_G:947,0,978:2224734:15,12,15,13 +chrX 2224750 . T C 832 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.58;BaseQRankSum=1.993;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.035;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.58;ReadPosRankSum=-1.77;SOR=0.859;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:89:67:.:.:0,89 0|1:28,24:52:99:.:0|1:2224734_A_G:862,0,1022:2224734:14,14,13,11 +chrX 2224865 . T C 653 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.13;BaseQRankSum=-1.091;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.304;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.054;SOR=1.045;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:89:67:0,89 0/1:27,25:52:99:.:683,0,772:14,13,15,10 +chrX 2224965 . C CACAT 940.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.56;BaseQRankSum=1.095;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=5.136;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=1.139;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:89:67:0,89 0/1:37,26:63:99:.:980,0,1476:20,17,10,16 +chrX 2225295 . TACAC T 985.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.80;BaseQRankSum=0.89;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.80;ReadPosRankSum=-2.23;SOR=0.667;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:89:67:0,89 0/1:34,27:61:99:.:1025,0,1235:18,16,13,14 +chrX 2225824 . C T 704 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.19;BaseQRankSum=-0.337;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=10.109;MQ=58.61;MQRankSum=1.814;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.371;SOR=0.309;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:89:67:0,89 0/1:41,31:72:99:.:734,0,1070:13,28,16,15 +chrX 2226119 . G T 944 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=7.27;BaseQRankSum=2.21;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=3.113;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.702;SOR=1.011;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:37,39:76:81:81,0:17,20,18,21 0/1:27,31:58:99:893,0,703:15,12,12,19 +chrX 2226181 . T C 1014 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=18.32;BaseQRankSum=-0.849;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.226;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.6;SOR=0.951;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,119 0|1:29,28:57:99:.:0|1:2226181_T_C:1044,0,1132:2226181:15,14,12,16 +chrX 2226184 . C T 983 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.09;BaseQRankSum=-0.121;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=2.182;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.09;ReadPosRankSum=1.329;SOR=0.873;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:99:57:.:.:0,119 0|1:29,27:56:99:.:0|1:2226181_T_C:1013,0,1135:2226181:15,14,12,15 +chrX 2226576 . G A 758 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=9.06;BaseQRankSum=2.761;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.799;MQ=59.73;MQRankSum=0;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.794;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,29:50:99:328,0:9,12,10,19 0/1:19,18:37:99:460,0,484:9,10,10,8 +chrX 2226695 . G GGAAGCT 731.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=19.77;BaseQRankSum=1.331;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=16.048;MQ=58.24;MQRankSum=-2.001;QD=19.77;ReadPosRankSum=-1.279;SOR=1.170;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,945 0/1:19,20:39:99:.:771,0,738:14,5,7,13 +chrX 2227345 . G A 1387 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=13.63;BaseQRankSum=3.458;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.588;MQ=59.80;MQRankSum=-0.791;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.387;SOR=0.910;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,32:54:99:.:.:518,0:.:8,14,14,18 0|1:26,24:50:99:0|1:2227345_G_A:899,0,954:2227345:15,11,10,14 +chrX 2227358 . G A 1388 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=14.18;BaseQRankSum=2.905;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.609;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.039;SOR=0.463;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:20,30:50:99:.:.:508,0:.:6,14,14,16 0|1:26,24:50:99:0|1:2227345_G_A:910,0,941:2227345:13,13,12,12 +chrX 2227594 . GA G 325.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.04;BaseQRankSum=1.139;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.818;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:8,20:28:99:.:365,0:1,7,3,17 0/0:.:30:30:28:0,30,540 +chrX 2228429 . AAGGG A 32.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=0;DP=25;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.94;MQRankSum=0;QD=12.00;ReadPosRankSum=0;SOR=0.307;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:14:6:14:0,6 0/1:4,2:6:72:.:72,0,125:4,0,2,0 +chrX 2229936 . T C 914 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=7.49;BaseQRankSum=0.08;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=4.294;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.573;SOR=0.516;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,26:52:15:15,0:11,15,16,10 0/1:38,36:74:99:929,0,1029:16,22,16,20 +chrX 2231585 . A ATCC 877.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.34;BaseQRankSum=-1.0;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.34;ReadPosRankSum=-1.496;SOR=0.588;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,153 0/1:26,24:50:99:.:917,0,1020:8,18,8,16 +chrX 2231611 . TCTC T 536.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=13.09;BaseQRankSum=1.052;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.831;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=1.184;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,153 0/1:28,16:44:99:.:576,0,1100:10,18,4,12 +chrX 2231699 . A G 342 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=11.27;BaseQRankSum=-1.071;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=5.188;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.76;SOR=0.910;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,153 0/1:18,15:33:99:.:372,0,496:7,11,9,6 +chrX 2231952 . C CTCT 873.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=9.82;BaseQRankSum=-0.488;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.820;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.824;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,31:55:99:.:.:307,0:.:7,17,10,21 0|1:22,16:38:99:0|1:2231952_C_CTCT:606,0,876:2231952:9,13,5,11 +chrX 2231967 . CCTT C 767.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=8.87;BaseQRankSum=-0.206;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.863;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.151;SOR=0.851;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,27:49:99:.:.:225,0:.:5,17,7,20 0|1:26,16:42:99:0|1:2231952_C_CTCT:582,0,1044:2231952:10,16,5,11 +chrX 2232033 . C CCTCCTCCCTTACTT,CCTCCTCCCTTTCTT 1108.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=42,2;AS_QD=14.53,8.05;BaseQRankSum=1.307;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.458;SOR=0.631;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,27,0:46:99:382,0,1215:5,14,8,19 0/1:18,15,2:35:99:766,0,696,452,726,1153:7,11,7,10 +chrX 2232202 . A T 1136 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=9.56;BaseQRankSum=1.096;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.474;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.605;SOR=0.899;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,35:63:99:273,0:17,11,21,14 0/1:24,35:59:99:893,0,600:11,13,20,15 +chrX 2232233 . C T 1041 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=17.56;BaseQRankSum=0.326;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.803;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:80:66:0,80 0/1:21,40:61:99:.:1071,0,462:11,10,22,18 +chrX 2232332 . A AAACAAC 1309.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=22.48;BaseQRankSum=-0.818;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.998;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.693;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:80:66:0,80 0/1:26,34:60:99:.:1349,0,990:14,12,16,18 +chrX 2232355 . G C 852 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.21;BaseQRankSum=-1.833;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=7.023;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.21;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.705;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:80:66:0,80 0/1:26,32:58:99:.:882,0,730:16,10,14,18 +chrX 2232613 . C T 861 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=7.62;BaseQRankSum=0.045;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=11.802;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.817;SOR=0.471;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,34:64:99:99,0:18,12,16,18 0/1:23,30:53:99:792,0,570:16,7,14,16 +chrX 2232804 . C T 706 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.67;BaseQRankSum=-1.067;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=6.436;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=1.460;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:70:22:51:.:.:0,22 0|1:39,30:69:99:.:0|1:2232804_C_T:736,0,1477:2232804:20,19,20,10 +chrX 2232814 . C T 1019 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=14.57;BaseQRankSum=0.558;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=4.631;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.326;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:70:22:51:.:.:0,22 0|1:33,39:72:99:.:1|0:2232804_C_T:1049,0,1165:2232804:21,12,20,19 +chrX 2232908 . C G 1051 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=14.22;BaseQRankSum=0.145;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=0.783;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:51:0,22 0/1:35,41:76:99:.:1081,0,884:18,17,22,19 +chrX 2232935 . T C 908 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=12.85;BaseQRankSum=-0.147;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.951;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.450;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:51:0,22 0/1:35,38:73:99:.:938,0,878:14,21,18,20 +chrX 2233035 . T C 1074 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=15.33;BaseQRankSum=-0.509;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.693;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:51:0,22 0/1:32,40:72:99:.:1104,0,841:16,16,20,20 +chrX 2233059 . AAAAGAAAGAAAG A 1457.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=21.39;BaseQRankSum=0.032;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=1.118;QD=21.39;ReadPosRankSum=1.965;SOR=0.761;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:51:0,22 0/1:32,38:70:99:.:1497,0,1199:18,14,22,16 +chrX 2233241 . C T 806 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.48;BaseQRankSum=0.559;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=16.228;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.006;SOR=2.213;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:51:0,22 0/1:34,33:67:99:.:836,0,870:18,16,8,25 +chrX 2233371 . CTT C,CT 1746.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=54,26;AS_QD=21.52,18.71;BaseQRankSum=2.355;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.753;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.39;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=0.797;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35,26:61:99:1246,0,217:0,0,30,31 0/1:29,19,0:48:99:540,0,904,628,962,1589:15,14,7,12 +chrX 2233820 . T A 550 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.15;BaseQRankSum=-1.872;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.741;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,386 0/1:29,23:52:99:.:580,0,831:16,13,13,10 +chrX 2234508 . T G 1025 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=8.31;BaseQRankSum=2.307;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=8.156;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.996;SOR=1.356;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,32:60:99:199,0:12,16,11,21 0/1:35,32:67:99:856,0,964:19,16,12,20 +chrX 2235739 . GAA G 343.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=12.77;BaseQRankSum=1.352;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=11.831;MQ=59.34;MQRankSum=1.002;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=1.627;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,225 0/1:16,14:30:99:.:383,0,452:5,11,10,4 +chrX 2235883 . G A 744 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.38;BaseQRankSum=0.443;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.643;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,225 0/1:38,30:68:99:.:774,0,1021:22,16,17,13 +chrX 2236060 . T C 946 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=14.79;BaseQRankSum=-2.037;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=2.270;MQ=59.62;MQRankSum=0;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.51;SOR=0.418;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,225 0/1:26,40:66:99:.:976,0,657:7,19,14,26 +chrX 2236711 . T C 594 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.48;BaseQRankSum=-0.741;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=1.001;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=0.716;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,225 0/1:26,24:50:99:.:624,0,699:15,11,14,10 +chrX 2236883 . T TA 617.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=6.99;BaseQRankSum=1.504;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.03;SOR=0.683;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,26:44:99:188,0:9,9,14,12 0/1:26,24:50:99:469,0,549:14,12,12,12 +chrX 2237014 . C A 1439 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=21.29;BaseQRankSum=-0.909;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.933;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.867;SOR=0.941;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:89:62:.:.:0,89 0|1:31,38:69:99:.:0|1:2237014_C_A:1469,0,1143:2237014:17,14,23,15 +chrX 2237018 . G A 1414 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=21.55;BaseQRankSum=1.714;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.55;ReadPosRankSum=1.247;SOR=0.811;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:89:62:.:.:0,89 0|1:30,37:67:99:.:0|1:2237014_C_A:1444,0,1118:2237014:17,13,22,15 +chrX 2237230 . T C 704 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.11;BaseQRankSum=0.719;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.995;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.32;SOR=0.846;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:89:62:0,89 0/1:29,27:56:99:.:734,0,800:15,14,15,12 +chrX 2238331 . T G 930 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=7.62;BaseQRankSum=0.37;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=6.767;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.259;SOR=1.087;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,37:68:99:192,0:14,17,19,18 0/1:28,30:58:99:768,0,739:14,14,21,9 +chrX 2238677 . A G 574 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.84;BaseQRankSum=-1.102;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.359;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.420;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:46:67:0,46 0/1:28,23:51:99:.:604,0,800:11,17,11,12 +chrX 2238750 . AT A 467.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.79;BaseQRankSum=-2.258;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.770;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:46:67:0,46 0/1:23,24:47:99:.:507,0,459:12,11,13,11 +chrX 2239405 . C CA 175.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=7.17;BaseQRankSum=0.565;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.468;MQ=59.63;MQRankSum=0;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.382;SOR=0.607;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:46:67:0,46 0/1:17,13:30:99:.:215,0,310:10,7,6,7 +chrX 2239718 . G A 730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=11.18;BaseQRankSum=-0.406;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=1.975;MQ=59.63;MQRankSum=-1.031;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.018;SOR=0.957;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:46:67:0,46 0/1:36,32:68:99:.:760,0,923:18,18,14,18 +chrX 2239756 . A G 710 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.75;BaseQRankSum=-1.049;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.971;MQ=59.59;MQRankSum=-1.017;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.825;SOR=0.922;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:46:67:0,46 0/1:33,30:63:99:.:740,0,883:15,18,12,18 +chrX 2240291 . C CA 959.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=17.84;BaseQRankSum=-2.952;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=2.268;MQ=59.71;MQRankSum=-1.351;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.821;SOR=0.758;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:46:67:.:.:0,46 0|1:27,29:56:99:.:0|1:2240291_C_CA:999,0,932:2240291:12,15,16,13 +chrX 2240312 . A T 1066 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=17.13;BaseQRankSum=-0.5;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.124;MQ=59.72;MQRankSum=-1.403;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.755;SOR=1.119;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:15:59:.:.:0,15 0|1:32,32:64:99:.:0|1:2240291_C_CA:1096,0,1050:2240291:17,15,20,12 +chrX 2241052 . C T 1429 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=10.42;BaseQRankSum=0.466;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=4.039;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.962;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,45:77:99:442,0:14,18,21,24 0/1:25,38:63:99:1017,0,580:14,11,26,12 +chrX 2241145 . C T 1226 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=8.72;BaseQRankSum=1.557;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=2.075;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.639;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,38:74:99:130,0:18,18,19,19 0/1:30,40:70:99:1126,0,718:17,13,19,21 +chrX 2241203 . C T 814 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.41;BaseQRankSum=-0.292;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=10.771;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=1.786;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:24:49:0,24 0/1:34,34:68:99:.:844,0,869:18,16,10,24 +chrX 2241596 . C T 718 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.96;BaseQRankSum=-0.162;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=3.905;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.465;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:24:49:0,24 0/1:23,27:50:99:.:748,0,614:9,14,14,13 +chrX 2241725 . G A 1090 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=10.09;BaseQRankSum=0.134;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.552;MQ=59.96;MQRankSum=1.059;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.594;SOR=0.588;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,26:51:50:50,0:11,14,11,15 0/1:21,39:60:99:1070,0,509:9,12,23,16 +chrX 2241751 . A C 1170 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=11.21;BaseQRankSum=-0.661;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=1.18;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.753;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,30:53:99:222,0:12,11,13,17 0/1:19,35:54:99:978,0,479:10,9,22,13 +chrX 2242251 . T G 467 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.75;BaseQRankSum=0.079;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=15.832;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.59;SOR=1.100;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,477 0/1:29,22:51:99:.:497,0,746:20,9,8,14 +chrX 2243088 . C G 3077 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=33.41;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.41;SOR=0.758;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1804,0:0,0,29,25 1/1:0,39:39:99:1303,117,0:0,0,16,23 +chrX 2243354 . T C 636 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.29;BaseQRankSum=-1.503;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=3.731;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.759;SOR=1.329;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1786 0/1:31,28:59:99:.:666,0,805:14,17,9,19 +chrX 2243483 . T A 754 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=7.00;BaseQRankSum=-0.846;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.708;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=7.00;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.822;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,35:64:99:138,0:15,14,20,15 0/1:24,24:48:99:646,0,668:13,11,13,11 +chrX 2243631 . T C 593 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=6.17;BaseQRankSum=-0.593;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.574;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.952;SOR=0.900;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,32:61:19:19,0:14,15,18,14 0/1:18,22:40:99:604,0,485:9,9,12,10 +chrX 2243768 . C A 760 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=15.80;BaseQRankSum=-0.789;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=2.453;MQ=59.91;MQRankSum=0.927;QD=15.80;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=0.368;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:39:34:37:.:.:0,34 0|1:28,22:50:99:.:0|1:2243768_C_A:790,0,1032:2243768:11,17,11,11 +chrX 2243785 . CCTGTTTTTTTTTTTTTTTTT C 802.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.31;BaseQRankSum=0.031;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.943;MQ=59.61;MQRankSum=1.236;QD=15.31;ReadPosRankSum=1.902;SOR=0.315;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:39:34:37:.:.:0,34 0|1:32,23:55:99:.:0|1:2243768_C_A:842,0,1264:2243768:10,22,10,13 +chrX 2243798 . T TG,* 2588.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=43,22;AS_QD=28.57,0.00;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;QD=40.43;SOR=1.249;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20,0:20:99:.:.:856,0,923:.:0,0,6,14 1|2:0,23,22:45:99:1|0:2243768_C_A:1772,905,833,880,0,941:2243768:0,0,19,26 +chrX 2243802 . T TGTTTTG,* 2661.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=46,22;AS_QD=25.01,0.00;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.47;QD=39.72;SOR=1.352;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,22,0:22:99:.:.:914,0,997:.:0,0,6,16 1|2:0,24,22:46:99:1|0:2243768_C_A:1787,906,833,893,0,942:2243768:0,0,19,27 +chrX 2243808 . T G 812 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=19.58;BaseQRankSum=-0.28;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.704;MQ=59.50;MQRankSum=1.498;QD=19.58;ReadPosRankSum=2.435;SOR=0.335;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:37:53:37:.:.:0,53 0|1:21,22:43:99:.:0|1:2243768_C_A:842,0,816:2243768:7,14,10,12 +chrX 2243809 . T TTTG 764.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=9.80;BaseQRankSum=1.148;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.862;MQ=59.46;MQRankSum=-1.326;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.165;SOR=1.002;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:19,21:40:67:.:.:67,0:.:7,12,8,13 0|1:21,21:42:99:1|0:2243768_C_A:737,0,802:2243768:10,11,7,14 +chrX 2244302 . C CCTCTCT,CCTCTCTCT 4487.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=57,55;AS_QD=30.12,29.57;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.42;SOR=1.109;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,22,33:55:99:1940,359,0:0,0,32,23 1/2:0,35,22:57:99:2587,760,581,1230,0,1058:0,0,34,23 +chrX 2244618 . A G 559 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=5.08;BaseQRankSum=-0.537;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.486;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.859;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,32:61:4:4,0:12,17,14,18 0/1:31,24:55:99:585,0,828:15,16,9,15 +chrX 2244671 . C T 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.52;BaseQRankSum=2.301;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=5.699;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.028;SOR=1.269;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,109 0/1:30,22:52:99:.:599,0,781:16,14,8,14 +chrX 2244683 . TTA T 3452.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.54;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=37.96;SOR=0.693;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1741,0:0,0,23,23 1/1:0,46:46:99:1751,139,0:0,0,23,23 +chrX 2244752 . A C 727 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.21;BaseQRankSum=1.822;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.661;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=1.493;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:90:64:0,90 0/1:34,28:62:99:.:757,0,881:22,12,22,6 +chrX 2244852 . T C 1156 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=10.22;BaseQRankSum=1.752;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=14.059;MQ=59.65;MQRankSum=0;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.063;SOR=1.481;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,31:53:99:352,0:10,12,19,12 0/1:32,31:63:99:834,0,828:15,17,22,9 +chrX 2244944 . A T 3826 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=33.24;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=33.24;SOR=1.047;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1841,0:0,0,24,32 1/1:0,60:60:99:2015,180,0:0,0,25,35 +chrX 2245062 . A G 4186 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=33.20;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.20;SOR=0.709;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2127,0:0,0,35,29 1/1:0,63:63:99:2089,189,0:0,0,29,34 +chrX 2245530 . G A 428 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=6.11;BaseQRankSum=1.297;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.247;MQ=59.61;MQRankSum=1.491;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.395;SOR=1.201;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,24:47:20:20,0:10,13,6,18 0/1:12,16:28:99:438,0,279:5,7,7,9 +chrX 2245695 . T C 2582 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=31.47;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=31.47;SOR=1.248;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1238,0:0,0,27,13 1/1:0,43:43:99:1374,129,0:0,0,24,19 +chrX 2245729 . G A 908 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=12.51;BaseQRankSum=1.382;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=-0.89;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.650;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:11,26:37:99:491,0:8,3,18,8 0/1:21,17:38:99:447,0,533:14,7,11,6 +chrX 2245763 . C T 571 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=9.85;BaseQRankSum=0.316;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=9.799;MQ=59.89;MQRankSum=-0.748;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.758;SOR=0.152;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,18:30:99:214,0:10,2,9,9 0/1:16,15:31:99:387,0,433:12,4,10,5 +chrX 2245970 . C A 2487 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=30.45;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.82;QD=36.48;SOR=1.054;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,42:42:99:.:.:1558,0:.:0,0,25,17 1|1:0,27:27:81:0|1:2245961_C_A:959,81,0:2245961:0,0,15,12 +chrX 2246364 . C T 420 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.57;BaseQRankSum=1.359;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=11.114;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.221;SOR=1.194;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:54:52:0,54 0/1:30,17:47:99:.:450,0,854:19,11,6,11 +chrX 2246669 . GA G 36.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=4.00;BaseQRankSum=1.193;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.754;MQ=59.50;MQRankSum=0;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.3;SOR=1.675;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:54:52:.:.:0,54 0|1:15,4:19:76:.:0|1:2246669_GA_G:76,0,620:2246669:11,4,4,0 +chrX 2246676 . AAG A 30.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=3.33;BaseQRankSum=0.992;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.740;MQ=59.51;MQRankSum=0;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.945;SOR=1.845;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:54:52:.:.:0,54 0|1:17,4:21:70:.:0|1:2246669_GA_G:70,0,704:2246669:12,5,4,0 +chrX 2246696 . A AGAAAG 34.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=3.70;BaseQRankSum=1.321;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.754;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.514;SOR=1.981;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:54:52:.:.:0,54 0|1:16,4:20:74:.:0|1:2246669_GA_G:74,0,661:2246669:11,5,4,0 +chrX 2246706 . G GAA,GAGAAAGAAAGAA 416.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=4,0;AS_QD=32.57,31.20;BaseQRankSum=1.516;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=6.008;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.57;ReadPosRankSum=0.283;SOR=2.621;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:54:52:0,54,54 0/1:10,4,0:14:99:.:456,0,634,144,398,943:6,4,4,0 +chrX 2246746 . AAG A 902.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=13.08;BaseQRankSum=0.864;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=3.363;MQ=59.35;MQRankSum=2.752;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.350;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:10,23:33:99:449,0:8,2,15,8 0/1:23,16:39:99:493,0,869:15,8,8,8 +chrX 2246804 . C T 829 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=8.86;BaseQRankSum=0.679;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=5.065;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.795;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,30:48:99:291,0:8,10,16,14 0/1:27,22:49:99:568,0,682:12,15,13,9 +chrX 2246906 . A G 3481 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=31.92;BaseQRankSum=-0.275;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.693;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.92;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.744;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,60:61:99:1960,0:0,1,33,27 1/1:0,49:49:99:1551,146,0:0,0,30,19 +chrX 2247035 . G C 3459 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=32.31;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;QD=32.31;SOR=0.849;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1781,0:0,0,27,27 1/1:0,54:54:99:1708,162,0:0,0,23,31 +chrX 2247254 . A G 3667 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=32.15;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.15;SOR=1.028;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1707,0:0,0,21,32 1/1:0,62:62:99:1990,186,0:0,0,28,34 +chrX 2247539 . A C 1063 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=13.17;BaseQRankSum=-0.367;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.936;MQ=59.09;MQRankSum=0.309;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.742;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:11,31:42:99:655,0:6,5,18,13 0/1:24,17:41:99:438,0,666:10,14,8,9 +chrX 2247655 . CAA C 1051.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=19.48;BaseQRankSum=1.293;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=11.081;MQ=59.38;MQRankSum=0.872;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.075;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,28:34:99:654,0:0,6,11,17 0/1:4,18:22:26:437,0,26:1,3,8,10 +chrX 2247967 . G C 3165 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=32.27;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=32.27;SOR=0.713;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1801,0:0,0,26,30 1/1:0,43:43:99:1394,128,0:0,0,24,19 +chrX 2248128 . C T 3238 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.36;BaseQRankSum=2.506;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=3.141;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=32.36;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.351;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1661,0:0,0,23,27 1/1:1,50:51:99:1607,142,0:0,1,29,21 +chrX 2248285 . T C 813 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=7.14;BaseQRankSum=-0.029;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.744;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,36:67:73:.:.:73,0:.:18,13,20,16 0|1:23,28:51:99:0|1:2248285_T_C:770,0,606:2248285:10,13,14,14 +chrX 2248293 . T C 4534 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=26.28;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=36.81;SOR=0.759;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,64:64:99:.:.:2363,0:.:0,0,36,28 1|1:0,60:60:99:0|1:2248285_T_C:2201,179,0:2248285:0,0,24,36 +chrX 2248432 . C CAAAAAA,CAAAAAAA 1747.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=14,23;AS_QD=31.18,29.38;BaseQRankSum=-0.297;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.245;MQ=57.17;MQRankSum=2.32;QD=47.03;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=0.477;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,7,13:21:99:843,162,0:1,0,9,11 1/2:0,7,10:17:99:944,244,176,175,0,107:0,0,8,9 +chrX 2248627 . G A 3042 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=27.00;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.44;QD=43.27;SOR=1.085;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1754,0:0,0,16,24 1/1:0,31:31:93:1318,93,0:0,0,13,17 +chrX 2248628 . A AAG,AAAG 2325.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=24,25;AS_QD=30.56,34.69;BaseQRankSum=-0.183;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.44;MQRankSum=0;QD=47.30;ReadPosRankSum=0.511;SOR=0.361;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,14,19:33:71:1415,71,0:0,0,13,20 1/2:1,10,6:17:50:950,117,50,266,0,215:0,1,8,8 +chrX 2248657 . A AGAAAAG 3203.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=30.05;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.22;QD=43.82;SOR=0.693;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1640,0:0,0,17,20 1/1:0,37:37:99:1603,111,0:0,0,20,17 +chrX 2249076 . T C 3561 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=32.35;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.35;SOR=0.748;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1697,0:0,0,24,27 1/1:0,60:60:99:1894,179,0:0,0,33,27 +chrX 2249191 . C T,CTT 2170 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,74;AS_QD=32.00,29.73;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.95;QD=29.73;SOR=1.371;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,31:31:99:1014,1546,0:0,0,21,10 2/2:0,0,43:43:99:1186,1186,1186,129,129,0:0,0,26,17 +chrX 2249482 . T C 2911 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=30.96;BaseQRankSum=-0.466;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.150;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=30.96;ReadPosRankSum=0.482;SOR=0.359;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1855,0:0,0,32,27 1/1:1,35:36:73:1086,73,0:0,1,17,18 +chrX 2249513 . C CT 140.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=7.50;BaseQRankSum=0.653;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=7.650;MQ=57.54;MQRankSum=-0.629;QD=7.50;ReadPosRankSum=-1.842;SOR=0.275;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:44:47:0,44 0/1:7,17:24:66:.:180,0,66:1,6,9,8 +chrX 2249579 . G A 490 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.86;BaseQRankSum=1.086;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.399;MQ=59.55;MQRankSum=-0.915;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.392;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:44:47:0,44 0/1:17,18:35:99:.:520,0,475:5,12,7,11 +chrX 2250161 . C CA,CAA 1416.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=19,37;AS_QD=33.38,34.71;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.32;QD=26.00;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,8,19:27:99:741,211,0:0,0,15,12 1/2:0,11,18:29:99:715,326,233,198,0,127:0,0,15,14 +chrX 2251282 . T C 1044 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=8.88;BaseQRankSum=1.724;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=5.588;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.88;ReadPosRankSum=3.578;SOR=0.780;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,36:63:99:250,0:10,17,20,16 0/1:29,29:58:99:824,0,782:15,14,16,13 +chrX 2251916 . C T 1268 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=10.64;BaseQRankSum=1.857;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.726;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,39:64:99:482,0:12,13,21,18 0/1:28,30:58:99:816,0,635:16,12,16,14 +chrX 2252000 . G T 3886 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=33.47;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=33.47;SOR=0.710;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1856,0:0,0,31,23 1/1:0,63:63:99:2060,189,0:0,0,27,36 +chrX 2252190 . C T 1136 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=8.64;BaseQRankSum=1.446;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=1.388;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.75;SOR=0.551;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:37,45:82:99:208,0:14,23,22,23 0/1:19,34:53:99:958,0,427:10,9,15,19 +chrX 2252239 . AAAAT A 857.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=7.87;BaseQRankSum=0;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.431;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.750;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,40:74:99:252,0:16,18,16,24 0/1:23,17:40:99:645,0,897:15,8,10,7 +chrX 2252435 . C T 3694 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=32.96;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.96;SOR=0.711;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2079,0:0,0,30,33 1/1:0,50:50:99:1645,149,0:0,0,27,23 +chrX 2252942 . AG A 736.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.52;BaseQRankSum=-0.487;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.979;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.892;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,321 0/1:34,28:62:99:.:776,0,928:19,15,17,11 +chrX 2253347 . A T 744 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.33;BaseQRankSum=1.152;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=7.565;MQ=59.76;MQRankSum=0.899;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=1.349;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:9:68:.:.:0,9 0|1:31,23:54:99:.:0|1:2253347_A_T:774,0,1126:2253347:14,17,15,8 +chrX 2253357 . GGGAGGCGGACATGGCCGTGAGCCAAGATGGCGCCACGGCACTCCAGCCTA G 669.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.28;BaseQRankSum=1.551;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=6.790;MQ=59.53;MQRankSum=1.221;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.344;SOR=1.270;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:72:64:.:.:0,72 0|1:47,22:69:99:.:0|1:2253347_A_T:709,0,1805:2253347:22,25,14,8 +chrX 2253598 . G T 1221 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=9.13;BaseQRankSum=-0.521;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=2.155;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.015;SOR=0.779;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,34:60:99:233,0:15,11,20,14 0/1:36,41:77:99:1018,0,890:17,19,15,26 +chrX 2253626 . C T 4395 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=32.30;BaseQRankSum=2.313;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=3.172;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.30;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.365;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2144,0:0,0,38,27 1/1:1,71:72:99:2281,206,0:0,1,33,38 +chrX 2253841 . A C 762 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=5.46;BaseQRankSum=-0.992;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=1.305;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.011;SOR=0.572;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:37,41:78:85:85,0:18,19,19,22 0/1:37,30:67:99:707,0,1046:15,22,15,15 +chrX 2253986 . G A 798 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=7.33;BaseQRankSum=1.585;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=7.190;MQ=59.95;MQRankSum=0.852;QD=7.33;ReadPosRankSum=2.013;SOR=0.544;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,24:46:99:110,0:11,11,11,13 0/1:40,27:67:99:718,0,1119:14,26,16,11 +chrX 2254059 . C CA 677.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=6.83;BaseQRankSum=0.89;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.605;MQ=59.95;MQRankSum=1.037;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.622;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,28:51:99:127,0:10,13,13,15 0/1:27,27:54:99:590,0,593:12,15,16,11 +chrX 2254709 . C T 1092 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=8.83;BaseQRankSum=3.442;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=1.428;MQ=59.65;MQRankSum=1.364;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.857;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,32:59:99:303,0:15,12,20,12 0/1:36,32:68:99:819,0,867:21,15,19,13 +chrX 2254945 . CG C 200.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=8.57;BaseQRankSum=-0.132;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=6.451;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.648;SOR=2.303;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,348 0/1:18,10:28:99:.:240,0,588:9,9,2,8 +chrX 2255233 . A G 144 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=2.85;BaseQRankSum=-0.801;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=16.678;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.447;SOR=1.388;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,33:61:99:.:174,0:18,10,11,22 0/0:.:49:29:36:0,29,1109 +chrX 2255297 . C T 775 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=6.60;BaseQRankSum=0.01;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.575;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.107;SOR=0.661;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,32:63:53:53,0:10,21,21,11 0/1:30,29:59:99:752,0,781:16,14,12,17 +chrX 2255311 . T C 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.05;BaseQRankSum=-0.266;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.995;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.846;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,189 0/1:30,26:56:99:.:675,0,814:15,15,12,14 +chrX 2255758 . C T 1199 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=10.24;BaseQRankSum=0.808;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=5.800;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.826;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,31:60:99:114,0:18,11,16,15 0/1:18,42:60:99:1115,0,437:8,10,16,26 +chrX 2256167 . T A 859 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=8.23;BaseQRankSum=0.558;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.741;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,26:51:70:70,0:11,14,12,14 0/1:24,33:57:99:819,0,563:12,12,15,18 +chrX 2256337 . C T 674 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.64;BaseQRankSum=-0.225;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=6.611;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=1.665;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,162 0/1:19,26:45:99:.:704,0,481:9,10,18,8 +chrX 2256480 . G C 585 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.83;BaseQRankSum=2.125;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;MQRankSum=-1.576;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.484;SOR=0.612;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,162 0/1:29,23:52:99:.:615,0,682:17,12,13,10 +chrX 2256791 . C CA 870.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=8.58;BaseQRankSum=0.082;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.544;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.277;SOR=0.909;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,31:51:99:275,0:12,8,15,16 0/1:25,30:55:99:635,0,530:10,15,19,11 +chrX 2256854 . TC T 4237.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=32.40;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.40;SOR=0.854;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2212,0:0,0,39,29 1/1:0,64:64:99:2065,193,0:0,0,32,32 +chrX 2257084 . T C 838 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.50;BaseQRankSum=-1.605;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.356;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.50;ReadPosRankSum=-0.966;SOR=0.371;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:99:73:0,258 0/1:22,34:56:99:.:868,0,557:8,14,16,18 +chrX 2257334 . C T 973 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=8.72;BaseQRankSum=1.472;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=4.548;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.402;SOR=0.814;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:99:105,0:12,18,18,14 0/1:20,33:53:99:898,0,507:11,9,18,15 +chrX 2257930 . G C 926 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=8.39;BaseQRankSum=0.278;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.506;MQ=59.96;MQRankSum=1.171;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.764;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,35:62:99:273,0:13,14,17,18 0/1:25,27:52:99:683,0,642:14,11,12,15 +chrX 2258301 . A G 1126 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=12.04;BaseQRankSum=1.646;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.713;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.65;SOR=0.851;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,30:48:99:451,0:10,8,18,12 0/1:22,26:48:99:705,0,546:9,13,13,13 +chrX 2259109 . C G 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=-0.501;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=4.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.321;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:60:62:0,60 0/1:22,27:49:99:.:687,0,579:15,7,15,12 +chrX 2259365 . GATATATATAGATATAT G 1291.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=25.60;BaseQRankSum=0.647;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.491;MQ=59.85;MQRankSum=-1.055;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.354;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:60:62:.:.:0,60 0|1:19,33:52:99:.:0|1:2259365_GATATATATAGATATAT_G:1331,0,685:2259365:7,12,16,17 +chrX 2259375 . G *,GAT 1966.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=33,16;AS_QD=0.00,30.16;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=40.94;SOR=0.909;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:60:62:.:.:0,60,60 1|2:0,33,16:49:99:.:1|0:2259365_GATATATATAGATATAT_G:2006,639,687,1376,0,1328:2259365:0,0,22,27 +chrX 2259383 . T G 891 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=14.62;BaseQRankSum=0.784;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=59.38;MQRankSum=-0.673;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.16;SOR=0.536;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,42:63:99:.:921,0:9,12,20,22 0/0:.:49:99:49:0,120,1800 +chrX 2259387 . GATATATAGATATAT G 904.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=14.75;BaseQRankSum=1.431;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.019;MQ=59.38;MQRankSum=-0.666;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.28;SOR=0.499;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,43:64:99:.:944,0:9,12,21,22 0/0:.:49:99:49:0,120,1800 +chrX 2259395 . GAT *,G,GATAT 2039.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,37,14;AS_QD=35.32,32.24,25.08;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=40.76;SOR=0.602;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,43,0,0:64:99:944,0,1879,1879:9,12,21,22 2/3:0,0,37,14:51:99:2079,2086,2103,569,592,498,1515,1518,0,1473:0,0,22,29 +chrX 2259401 . T *,G 1404 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,36;AS_QD=0.00,28.68;BaseQRankSum=0.282;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.825;MQ=59.83;MQRankSum=-0.859;QD=28.68;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.388;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:21,43,0:64:99:.:.:944,0,1879:.:9,12,21,22 0|2:14,0,36:50:99:0|1:2259365_GATATATATAGATATAT_G:1434,1476,2043,0,567,459:2259365:4,10,16,20 +chrX 2259622 . G T 3576 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=33.08;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.08;SOR=1.049;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1711,0:0,0,33,19 1/1:0,57:57:99:1895,171,0:0,0,30,27 +chrX 2259672 . G A 643 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.81;BaseQRankSum=1.135;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;MQRankSum=0.951;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.676;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:3:66:0,3 0/1:31,26:57:99:.:673,0,766:18,13,15,11 +chrX 2259912 . G T 4009 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=33.11;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.11;SOR=0.906;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2490,0:0,0,40,36 1/1:0,46:46:99:1549,138,0:0,0,27,19 +chrX 2260011 . G A 800 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=6.43;BaseQRankSum=1.117;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.472;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.883;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,37:70:99:149,0:23,10,24,13 0/1:32,27:59:99:681,0,795:18,14,19,8 +chrX 2260183 . C T 747 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.53;BaseQRankSum=0.334;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=-0.818;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.674;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,108 0/1:20,27:47:99:.:777,0,534:8,12,11,16 +chrX 2260595 . G A 511 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.04;BaseQRankSum=-0.09;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.097;MQ=59.85;MQRankSum=-1.113;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=0.882;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,108 0/1:28,21:49:99:.:541,0,776:12,16,8,13 +chrX 2260665 . T G 727 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=0.314;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.775;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.612;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,108 0/1:24,28:52:99:.:757,0,615:10,14,15,13 +chrX 2260724 . G C 802 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.13;BaseQRankSum=-1.638;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=5.563;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.605;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,108 0/1:24,31:55:99:.:832,0,649:9,15,17,14 +chrX 2261081 . A G 616 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.67;BaseQRankSum=-2.86;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=6.035;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.348;SOR=0.223;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,108 0/1:26,25:51:99:.:646,0,750:19,7,14,11 +chrX 2261432 . T C 3745 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=32.26;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.26;SOR=0.710;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1895,0:0,0,31,27 1/1:0,59:59:99:1880,177,0:0,0,27,32 +chrX 2261628 . T C 910 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=7.34;BaseQRankSum=0.897;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=7.872;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.739;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,33:62:99:159,0:11,18,21,12 0/1:34,32:66:99:781,0,943:16,18,15,17 +chrX 2261678 . A G 832 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=17.24;BaseQRankSum=-1.806;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.91;SOR=0.492;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,119 0/1:19,31:50:99:.:862,0,511:8,11,15,16 +chrX 2261883 . G T 1243 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=10.97;BaseQRankSum=0.934;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.439;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.474;SOR=0.808;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,44:70:99:584,0:12,14,19,25 0/1:20,26:46:99:689,0,517:12,8,13,13 +chrX 2262717 . T C 856 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.26;BaseQRankSum=-0.54;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.290;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.987;SOR=0.733;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,37:67:99:188,0:15,15,17,20 0/1:29,26:55:99:698,0,813:17,12,12,14 +chrX 2262835 . CAG C 4862.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=35.71;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=44.56;SOR=1.022;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:2453,0:0,0,33,22 1/1:0,55:55:99:2449,166,0:0,0,30,25 +chrX 2262867 . A G 3836 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=32.76;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.76;SOR=1.131;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2020,0:0,0,39,23 1/1:0,56:56:99:1846,168,0:0,0,31,25 +chrX 2263286 . T C 662 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.65;BaseQRankSum=-1.906;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.902;SOR=0.673;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:37:36:0,37 0/1:35,30:65:99:.:692,0,963:15,20,13,17 +chrX 2263512 . CT C 111.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=4.08;BaseQRankSum=-0.153;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=10.673;MQ=59.67;MQRankSum=0.836;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.974;SOR=1.098;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:37:36:.:.:0,37 0|1:23,14:37:99:.:0|1:2263512_CT_C:151,0,419:2263512:16,7,5,9 +chrX 2264067 . T C 3817 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=32.88;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=1.022;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2155,0:0,0,28,36 1/1:0,53:53:99:1692,158,0:0,0,22,31 +chrX 2264317 . C T 676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.86;BaseQRankSum=-1.421;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=6.650;MQ=59.65;MQRankSum=-0.142;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.11;SOR=1.101;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,328 0|1:34,31:65:99:.:0|1:2264317_C_T:706,0,936:2264317:19,15,12,19 +chrX 2264694 . C T 903 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=17.60;BaseQRankSum=0.513;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=14.558;MQ=59.56;MQRankSum=0;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.801;SOR=1.616;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,328 0/1:17,36:53:99:.:933,0,333:6,11,25,11 +chrX 2264739 . A C 512 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=4.93;BaseQRankSum=-0.651;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;MQRankSum=1.583;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.716;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,31:57:5:5,0:14,12,19,12 0/1:31,22:53:99:537,0,869:19,12,12,10 +chrX 2264864 . T TGCAGGGAGCACTGTACGCAGAGCACTTGTGCCAAGCACAC 1563.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=25.44;BaseQRankSum=-0.953;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;MQRankSum=-1.021;QD=25.44;ReadPosRankSum=0.036;SOR=0.762;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:1:0,35 0/1:22,41:63:99:.:1603,0,797:10,12,18,23 +chrX 2264954 . C T 833 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.98;BaseQRankSum=0.247;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.818;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:1:0,35 0/1:22,32:54:99:.:863,0,466:11,11,17,15 +chrX 2265838 . G A 276 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=8.50;BaseQRankSum=-0.631;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=7.162;MQ=50.38;MQRankSum=1.208;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=1.374;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:62:28:0,62 0/1:21,15:36:99:.:306,0,496:9,12,10,5 +chrX 2266201 . T C 90 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=4.00;BaseQRankSum=-1.85;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=9.265;MQ=52.51;MQRankSum=0.591;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.381;SOR=2.042;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:62:28:0,62 0/1:21,9:30:99:.:120,0,537:9,12,7,2 +chrX 2266522 . G A 1920 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=27.86;BaseQRankSum=2.071;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=8.973;MQ=57.89;MQRankSum=1.169;QD=27.86;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=1.406;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,36:40:99:1004,0:1,3,21,15 1/1:0,30:30:89:946,89,0:0,0,23,7 +chrX 2267520 . G A 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.65;BaseQRankSum=0.799;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=4.351;MQ=59.52;MQRankSum=-1.279;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.364;SOR=1.473;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,318 0/1:21,25:46:99:.:720,0,557:11,10,17,8 +chrX 2267543 . C CA 558.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=6.95;BaseQRankSum=0.344;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.924;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.402;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,24:42:99:128,0:11,7,12,12 0/1:19,25:44:99:470,0,359:12,7,14,11 +chrX 2267900 . T C 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=-0.274;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.931;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:25:64:0,25 0/1:29,24:53:99:.:635,0,809:16,13,10,14 +chrX 2268141 . T C 515 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.91;BaseQRankSum=-0.035;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.299;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.604;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:25:64:0,25 0/1:34,21:55:99:.:545,0,971:15,19,11,10 +chrX 2268390 . A G 805 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.15;BaseQRankSum=-0.413;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.713;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.746;SOR=0.301;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:25:64:0,25 0/1:27,32:59:99:.:835,0,711:18,9,17,15 +chrX 2269118 . T C 1037 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.46;BaseQRankSum=-1.808;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=10.205;MQ=59.93;MQRankSum=-0.848;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.926;SOR=1.284;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:25:64:0,25 0/1:30,39:69:99:.:1067,0,799:13,17,25,14 +chrX 2269426 . G A 858 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=-0.292;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.56;ReadPosRankSum=-1.187;SOR=0.620;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:25:64:0,25 0/1:28,33:61:99:.:888,0,721:13,15,16,17 +chrX 2269648 . T C 265 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=3.73;BaseQRankSum=-1.078;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.855;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.636;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,45:79:99:.:295,0:18,16,22,23 0/0:.:66:99:66:0,120,1800 +chrX 2269886 . G A 5912 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=26.56;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;QD=44.01;SOR=0.708;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:3196,0:.:0,0,34,38 1|1:0,63:63:99:0|1:2269886_G_A:2746,189,0:2269886:0,0,33,30 +chrX 2269892 . G C 5844 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=33.32;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;QD=43.84;SOR=0.723;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:3162,0:.:0,0,33,39 1|1:0,62:62:99:0|1:2269886_G_A:2712,186,0:2269886:0,0,33,29 +chrX 2270543 . A G 4361 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=34.71;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.52;SOR=0.693;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2374,0:.:0,0,29,31 1|1:0,54:54:99:0|1:2270543_A_G:2017,162,0:2270543:0,0,28,26 +chrX 2270544 . G T 1451 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=12.99;BaseQRankSum=-0.721;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=0.691;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,36:60:99:.:.:529,0:.:12,12,17,19 0|1:29,25:54:99:0|1:2270543_A_G:952,0,1111:2270543:14,15,14,11 +chrX 2270545 . A T 1451 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=12.99;BaseQRankSum=-0.443;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.599;SOR=0.691;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:24,36:60:99:.:.:529,0:.:12,12,17,19 0|1:29,25:54:99:0|1:2270543_A_G:952,0,1111:2270543:14,15,14,11 +chrX 2270778 . C A 3399 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=32.66;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.66;SOR=0.921;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1804,0:0,0,33,21 1/1:0,51:51:99:1625,153,0:0,0,25,26 +chrX 2270856 . C G 627 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.73;BaseQRankSum=1.724;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.594;SOR=0.665;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1623 0/1:31,25:56:99:.:657,0,780:20,11,16,9 +chrX 2270886 . A G 3647 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=34.36;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=34.36;SOR=1.265;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1666,0:0,0,31,23 1/1:0,53:53:99:2011,159,0:0,0,35,18 +chrX 2270973 . G GACCAATCAGCACTCTGTAAAATGC 1074.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.38;BaseQRankSum=1.411;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=2.021;MQ=59.23;MQRankSum=-2.03;QD=16.38;ReadPosRankSum=-1.945;SOR=0.860;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1530 0/1:34,34:68:99:.:1114,0,1042:18,16,15,19 +chrX 2271482 . C A 1122 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=10.97;BaseQRankSum=1.15;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=6.161;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.910;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,36:59:99:451,0:12,11,20,16 0/1:21,25:46:99:701,0,591:8,13,15,10 +chrX 2271822 . A G 1046 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=8.34;BaseQRankSum=-0.009;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.189;MQ=59.89;MQRankSum=0.716;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.265;SOR=0.614;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,34:64:67:67,0:16,14,15,19 0/1:28,37:65:99:1009,0,718:16,12,19,18 +chrX 2272192 . C T 1090 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=16.72;BaseQRankSum=1.949;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.101;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.116;SOR=0.507;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:35:61:0,35 0/1:26,41:67:99:.:1120,0,603:11,15,21,20 +chrX 2272394 . C G 4183 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=127;AS_QD=33.17;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.17;SOR=1.448;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2298,0:0,0,26,43 1/1:0,58:58:99:1915,174,0:0,0,19,39 +chrX 2272724 . A C 3798 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=34.18;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.18;SOR=0.844;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2157,0:0,0,33,30 1/1:0,49:49:99:1671,147,0:0,0,27,22 +chrX 2273207 . C A 3574 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=33.06;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.06;SOR=0.749;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2016,0:0,0,26,34 1/1:0,49:49:99:1588,147,0:0,0,30,19 +chrX 2273930 . A C 4534 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=144;AS_QD=31.69;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.69;SOR=0.749;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2381,0:0,0,33,43 1/1:0,68:68:99:2183,204,0:0,0,37,31 +chrX 2274147 . C T 1213 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=9.49;BaseQRankSum=0.19;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=7.961;MQ=59.93;MQRankSum=1.178;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.29;SOR=0.624;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,41:72:99:373,0:21,10,20,21 0/1:28,31:59:99:870,0,772:14,14,13,18 +chrX 2274585 . C CT 169.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=6.33;BaseQRankSum=1.086;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=5.170;MQ=59.58;MQRankSum=-0.22;QD=6.33;ReadPosRankSum=-1.313;SOR=0.709;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:47:16:47:0,16 0/1:19,14:33:99:.:209,0,306:12,7,6,8 +chrX 2275266 . G T 718 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.96;BaseQRankSum=-0.64;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.113;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.96;ReadPosRankSum=1.149;SOR=0.976;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,100 0/1:23,27:50:99:.:748,0,629:13,10,17,10 +chrX 2275343 . C CA,CAAAAAA 1428.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=28,34;AS_QD=28.64,31.82;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=23.68;SOR=1.765;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,16,18:34:71:504,71,0:0,0,24,10 1/2:0,12,16:28:99:964,650,595,262,0,411:0,0,19,9 +chrX 2275514 . CA C 2529.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=27.04;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.04;SOR=1.354;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1315,0:0,0,18,31 1/1:0,46:46:99:1254,138,0:0,0,17,29 +chrX 2275805 . A G 503 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.88;BaseQRankSum=0.448;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.730;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:94:56:0,94 0/1:28,21:49:99:.:533,0,731:11,17,8,13 +chrX 2275837 . A T 4111 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=25.45;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.53;SOR=0.758;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:2237,0:.:0,0,25,25 1|1:0,43:43:99:0|1:2275837_A_T:1904,129,0:2275837:0,0,20,23 +chrX 2275838 . A T 4111 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=29.87;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.53;SOR=0.758;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:2237,0:.:0,0,25,25 1|1:0,43:43:99:0|1:2275837_A_T:1904,129,0:2275837:0,0,20,23 +chrX 2276138 . G A 969 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=36;AS_QD=17.53;BaseQRankSum=-1.193;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=2.349;MQ=59.80;MQRankSum=-0.727;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.217;SOR=1.005;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:72:.:72:0,0 0/1:21,36:57:99:.:999,0,539:10,11,21,15 +chrX 2276348 . G A 753 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=5.33;BaseQRankSum=0.808;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=4.954;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.586;SOR=1.033;VarDP=147 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:38,44:82:99:219,0:19,19,19,25 0/1:42,23:65:99:564,0,1153:22,20,9,14 +chrX 2276419 . G A 1038 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=20.94;BaseQRankSum=-1.412;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.834;SOR=0.601;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:79:39:62:0,39 0/1:14,37:51:99:.:1068,0,333:6,8,17,20 +chrX 2282343 . A G 501 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=17;AS_QD=29.50;BaseQRankSum=-0.177;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.58;MQRankSum=2.117;QD=29.50;ReadPosRankSum=1.737;SOR=0.269;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,17:18:99:.:531,0:1,0,9,8 ./.:.:33:.:33:0,0,0 +chrX 2282502 . TAGAG T 541.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=13.51;BaseQRankSum=0.764;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.309;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.188;SOR=1.032;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:99:39:0,709 0/1:27,16:43:99:.:581,0,1030:14,10,10,5 +chrX 2282581 . A AGAGAGAGAAGAAAGAGGG 179.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=14.60;BaseQRankSum=1.111;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=3.310;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=2.546;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:99:39:0,709 0/1:8,7:15:99:.:219,0,288:6,2,7,0 +chrX 2282603 . A AGAGAAGAAAGAGGGGAGG 296.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=12.44;BaseQRankSum=-1.349;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.44;ReadPosRankSum=-2.837;SOR=1.022;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:9,18:27:99:.:336,0:6,3,13,5 0/0:.:29:33:26:0,33,708 +chrX 2282812 . AAGAG A 319.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.56;BaseQRankSum=2.404;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.534;SOR=0.631;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,14:26:80:80,0:8,4,10,4 0/1:1,7:8:21:279,0,21:1,0,4,3 +chrX 2283004 . G A 268 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=10.64;BaseQRankSum=0.423;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.51;SOR=0.941;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,352 0/1:16,12:28:99:.:298,0,431:11,5,9,3 +chrX 2283340 . C G 886 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=8.04;BaseQRankSum=0.464;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=4.583;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.347;SOR=0.388;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,34:62:99:179,0:12,16,15,19 0/1:25,27:52:99:737,0,673:9,16,15,12 +chrX 2283893 . C T 604 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.94;BaseQRankSum=1.153;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=4.348;MQ=59.59;MQRankSum=-1.022;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=1.552;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:73:99:73:.:.:0,243 0|1:26,23:49:99:.:0|1:2283893_C_T:634,0,662:2283893:15,11,17,6 +chrX 2283895 . TTCATTCCTTTGAATTCACTCATTCCTTTGAATTCAC T 3350.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=28.56;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.24;QD=40.36;SOR=1.075;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,47:47:99:.:.:1871,0:.:0,0,25,22 1|1:0,37:37:99:0|1:2283893_C_T:1519,114,0:2283893:0,0,24,13 +chrX 2284187 . TTTCAA T 1030.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.83;BaseQRankSum=2.003;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=7.370;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.83;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=0.204;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,245 0|1:32,28:60:99:.:0|1:2284187_TTTCAA_T:1070,0,1228:2284187:9,23,13,15 +chrX 2284196 . A C 959 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=7.67;BaseQRankSum=-0.161;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=21.272;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.611;SOR=1.563;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:27,41:68:99:.:.:127,0:.:18,9,14,27 0|1:28,33:61:99:1|0:2284187_TTTCAA_T:862,0,1067:2284187:13,15,10,23 +chrX 2284365 . C CAA 5957.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=27.26;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.75;SOR=0.957;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:3219,0:0,0,41,31 1/1:0,62:62:99:2778,187,0:0,0,34,28 +chrX 2284404 . TTGAA T 4661.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=25.73;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.77;SOR=0.751;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2791,0:0,0,32,30 1/1:0,43:43:99:1910,130,0:0,0,19,24 +chrX 2284462 . A AC 908.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.29;BaseQRankSum=-0.775;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.410;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.29;ReadPosRankSum=-1.67;SOR=0.921;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:64:68:0,64 0/1:34,28:62:99:.:948,0,1189:18,16,12,16 +chrX 2284746 . T G 652 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.18;BaseQRankSum=-0.129;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.251;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.031;SOR=1.056;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:64:68:0,64 0/1:31,25:56:99:.:682,0,860:16,15,15,10 +chrX 2286692 . G GA 2677.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=25.63;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=25.63;SOR=0.731;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:1726,0:0,0,34,33 1/1:0,39:39:99:991,115,0:0,0,18,21 +chrX 2288126 . TA T 2990.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=30.00;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.00;SOR=0.941;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1555,0:0,0,18,30 1/1:0,49:49:99:1475,147,0:0,0,25,24 +chrX 2288434 . A G 3715 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.01;BaseQRankSum=2.135;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.692;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=32.01;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.742;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2078,0:0,0,38,25 1/1:1,53:54:99:1667,152,0:0,1,29,24 +chrX 2289891 . C T 580 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.71;BaseQRankSum=1.81;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.497;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.673;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,238 0/1:26,22:48:99:.:610,0,699:11,15,12,10 +chrX 2290429 . T C 717 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=6.44;BaseQRankSum=-0.964;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.694;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.482;SOR=0.576;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,30:55:99:113,0:15,10,14,16 0/1:35,26:61:99:634,0,974:18,17,15,11 +chrX 2290589 . A G 1230 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=10.16;BaseQRankSum=1.665;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.675;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.673;SOR=0.746;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,40:67:99:467,0:12,15,20,20 0/1:26,31:57:99:793,0,617:14,12,17,14 +chrX 2290643 . A G 594 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.40;BaseQRankSum=1.435;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.986;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.859;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,589 0/1:36,24:60:99:.:624,0,956:18,18,13,11 +chrX 2291048 . G A 1490 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=12.36;BaseQRankSum=-0.789;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.459;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.864;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,44:64:99:794,0:6,14,23,21 0/1:31,28:59:99:726,0,860:18,13,8,20 +chrX 2291097 . G A 1313 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=12.55;BaseQRankSum=-0.498;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.559;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.97;SOR=0.988;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,41:60:99:750,0:9,10,21,20 0/1:24,23:47:99:593,0,663:12,12,6,17 +chrX 2291143 . C T 481 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.46;BaseQRankSum=-0.321;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.694;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.487;SOR=0.709;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,665 0/1:21,20:41:99:.:511,0,540:12,9,9,11 +chrX 2291287 . T C 631 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=4.90;BaseQRankSum=2.064;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=5.240;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.786;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,38:72:99:175,0:15,19,19,19 0/1:43,20:63:99:486,0,1155:20,23,13,7 +chrX 2291631 . C G 633 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=9.47;BaseQRankSum=0.468;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.728;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,169 0/1:41,29:70:99:.:663,0,1584:16,25,11,18 +chrX 2291634 . G C 997 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=41;AS_QD=14.46;BaseQRankSum=-1.439;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.740;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:65:.:65:0,0 0/1:30,41:71:99:.:1027,0,1084:12,18,16,25 +chrX 2291708 . AC A 555.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=5.22;BaseQRankSum=1.232;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.394;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.594;SOR=0.937;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:32,32:64:25:.:.:25,0:.:20,12,21,11 0|1:27,23:50:99:0|1:2291708_AC_A:570,0,769:2291708:11,16,11,12 +chrX 2291709 . CT *,C 1480.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=23,23;AS_QD=0.00,28.26;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.762;MQ=60.00;QD=33.04;SOR=0.453;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,32,0:64:25:25,0,1072:20,12,21,11 1/2:0,23,23:46:99:1520,622,769,701,0,570:0,0,22,24 +chrX 2291710 . T *,G 2541 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=49,55;AS_QD=0.00,33.65;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=24.72;SOR=0.994;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,26,32:58:25:.:.:1051,25,0:.:0,0,37,21 1|2:0,23,23:46:99:0|1:2291708_AC_A:1520,701,570,622,0,769:2291708:0,0,22,24 +chrX 2291896 . A ATTT 537.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=9.02;BaseQRankSum=1.09;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=4.933;MQ=57.76;MQRankSum=-0.625;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.925;SOR=0.414;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,21:38:99:130,0:6,11,11,10 0/1:12,14:26:99:447,0,349:5,7,7,7 +chrX 2292030 . A G 588 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.88;BaseQRankSum=-1.727;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;MQRankSum=-1.001;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.678;SOR=0.698;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,167 0/1:27,25:52:99:.:618,0,738:13,14,12,13 +chrX 2292382 . G C 4011 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=33.96;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.96;SOR=1.512;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2175,0:0,0,41,23 1/1:0,55:55:99:1866,165,0:0,0,37,18 +chrX 2293147 . G C 506 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.24;BaseQRankSum=-2.627;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=9.206;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=1.239;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:45:68:0,45 0/1:33,25:58:99:.:536,0,876:14,19,16,9 +chrX 2293185 . A G 3955 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=32.66;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.66;SOR=0.760;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2198,0:0,0,31,37 1/1:0,54:54:99:1787,162,0:0,0,28,26 +chrX 2293253 . GT G,GTT 1916.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=50,49;AS_QD=21.18,27.82;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=19.76;SOR=0.797;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,25,30:55:99:739,218,0:0,0,27,28 1/2:0,25,19:44:99:1217,706,679,593,0,936:0,0,25,19 +chrX 2293270 . C T 838 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=7.68;BaseQRankSum=1.916;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.698;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.667;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,34:60:99:212,0:10,16,20,14 0/1:32,21:53:99:656,0,1111:18,14,8,13 +chrX 2293890 . G A 690 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=7.50;BaseQRankSum=1.397;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.767;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.76;SOR=0.549;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,26:46:99:189,0:11,9,13,13 0/1:29,21:50:99:531,0,764:16,13,11,10 +chrX 2294058 . C CAG 3678.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=31.43;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.94;SOR=0.776;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2352,0:0,0,37,25 1/1:0,36:36:99:1366,108,0:0,0,14,22 +chrX 2294664 . C CA,CAA 2087.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,48;AS_QD=25.90,29.54;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=25.32;SOR=0.843;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19,19:38:43:747,0,43:0,0,17,21 1/2:0,17,29:46:99:1380,681,544,404,0,302:0,0,28,18 +chrX 2294808 . G GA 933.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=9.36;BaseQRankSum=0.665;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.617;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=0.558;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,29:51:99:215,0:10,12,15,14 0/1:24,29:53:99:758,0,608:10,14,15,14 +chrX 2294885 . T C 3304 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=32.06;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.06;SOR=1.201;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1640,0:0,0,18,34 1/1:0,52:52:99:1694,155,0:0,0,23,29 +chrX 2295041 . G A 4346 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=32.18;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=32.18;SOR=0.693;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1995,0:0,0,31,31 1/1:0,74:74:99:2381,222,0:0,0,37,37 +chrX 2295245 . TA T 3752.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=31.08;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.98;QD=31.08;SOR=0.945;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1613,0:0,0,30,22 1/1:0,70:70:99:2179,211,0:0,0,38,32 +chrX 2295423 . T TG 717.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=6.20;BaseQRankSum=0.108;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=10.197;MQ=51.87;MQRankSum=0.126;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=1.549;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,31:57:99:149,0:12,14,8,23 0/1:39,26:65:99:608,0,1019:19,20,10,16 +chrX 2296956 . A G 307 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.04;BaseQRankSum=-2.574;DP=29;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.21;MQRankSum=0.809;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.804;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:35:1:0,35 0/1:12,16:28:99:.:337,0,321:8,4,11,5 +chrX 2297730 . A C 3103 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=30.42;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.42;SOR=0.793;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1422,0:0,0,28,19 1/1:0,56:56:99:1711,167,0:0,0,26,30 +chrX 2297762 . G GT,GTTTT 2017.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=39,42;AS_QD=31.90,29.08;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=25.40;SOR=0.876;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,20,22:42:55:755,55,0:0,0,27,15 1/2:0,19,20:39:99:1302,829,758,488,0,703:0,0,17,22 +chrX 2298000 . C A 785 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.98;BaseQRankSum=-1.016;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.752;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.335;SOR=0.250;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:99:74:0,249 0/1:21,30:51:99:.:815,0,557:14,7,15,15 +chrX 2298015 . C G 750 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.29;BaseQRankSum=-1.11;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.098;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.465;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:99:74:0,249 0/1:21,30:51:99:.:780,0,544:12,9,15,15 +chrX 2298068 . A G 1011 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=7.71;BaseQRankSum=1.447;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=2.168;MQ=59.93;MQRankSum=0.197;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.789;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,45:80:99:393,0:15,20,22,23 0/1:29,26:55:99:648,0,757:16,13,16,10 +chrX 2298184 . T C 3842 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=32.00;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=0.850;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2266,0:0,0,26,45 1/1:0,50:50:99:1606,149,0:0,0,30,20 +chrX 2298317 . G GTTT 874.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=23.44;BaseQRankSum=-0.451;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=0.723;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,1002 0/1:13,26:39:99:.:914,0,413:5,8,10,16 +chrX 2298394 . T TA 1767.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=23.47;BaseQRankSum=-0.437;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;MQRankSum=-0.118;QD=23.47;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.892;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,36:38:99:863,0:1,1,20,16 1/1:0,39:39:99:944,116,0:0,0,21,18 +chrX 2298456 . C T 3276 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=33.73;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.73;SOR=1.426;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1861,0:0,0,35,20 1/1:0,43:43:99:1445,129,0:0,0,28,15 +chrX 2298525 . A G 619 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.42;BaseQRankSum=-1.015;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.626;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=1.129;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,203 0/1:21,24:45:99:.:649,0,575:13,8,17,7 +chrX 2298601 . TACACACACACAC T,CACACACACACAC 3524 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=50,67;AS_QD=27.95,37.91;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=30.38;SOR=0.745;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,27,34:61:99:1358,141,0:0,0,28,33 1/2:0,23,33:56:99:2196,1237,1203,967,0,1024:0,0,29,27 +chrX 2298614 . A ACACACACACACG 1219.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=10.95;BaseQRankSum=0.86;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.695;MQ=59.72;MQRankSum=-0.875;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=0.590;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,34:62:99:238,0:11,17,18,16 0/1:25,28:53:99:1021,0,943:14,11,13,15 +chrX 2298731 . T A 837 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.21;BaseQRankSum=0.354;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=6.240;MQ=59.93;MQRankSum=0.96;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.539;SOR=0.843;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,318 0|1:38,33:71:99:.:0|1:2298731_T_A:867,0,1023:2298731:22,16,14,19 +chrX 2298756 . C T 4190 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=31.31;BaseQRankSum=2.648;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;MQRankSum=-0.283;QD=35.17;ReadPosRankSum=0.53;SOR=0.762;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,54:56:99:.:.:1815,0:.:1,1,30,24 1|1:0,64:64:99:0|1:2298731_T_A:2405,192,0:2298731:0,0,31,33 +chrX 2298985 . CAAAAAAAAAA C 637.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=17.82;BaseQRankSum=0.2;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.50;MQRankSum=0.934;QD=17.82;ReadPosRankSum=1.843;SOR=0.527;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:36:41:0,36 0/1:20,18:38:99:.:677,0,784:11,9,9,9 +chrX 2299014 . A T,AAT 2678 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=37,38;AS_QD=27.77,25.51;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.72;QD=36.11;SOR=0.832;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19,18:37:53:933,0,53:0,0,20,17 1/2:0,18,20:38:99:1775,711,784,778,0,677:0,0,20,18 +chrX 2299199 . A C 3731 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=32.70;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.70;SOR=0.782;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1678,0:0,0,20,30 1/1:0,65:65:99:2083,194,0:0,0,35,30 +chrX 2299280 . T C 1142 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=20.21;BaseQRankSum=0.05;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.492;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.21;ReadPosRankSum=-1.846;SOR=1.008;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:15:58:0,15 0/1:17,41:58:99:.:1172,0,357:8,9,24,17 +chrX 2299349 . A G 3801 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=31.66;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.66;SOR=0.928;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:1941,0:0,0,32,31 1/1:0,58:58:99:1890,174,0:0,0,22,36 +chrX 2299854 . CAA C,CAAA 1078.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=46,22;AS_QD=15.32,7.96;BaseQRankSum=1.454;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=4.295;MQ=59.85;MQRankSum=-1.148;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.482;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27,22:49:99:559,0,169:0,0,23,26 0/1:27,19,0:46:99:559,0,843,640,900,1540:11,16,12,7 +chrX 2299954 . G A 636 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.06;BaseQRankSum=0.014;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=7.859;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.06;ReadPosRankSum=-0.886;SOR=1.239;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,154 0/1:26,25:51:99:.:666,0,686:15,11,9,16 +chrX 2300226 . G A 814 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.41;BaseQRankSum=1.627;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.952;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.486;SOR=0.909;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,154 0/1:37,31:68:99:.:844,0,962:22,15,20,11 +chrX 2302095 . T C 786 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=7.77;BaseQRankSum=1.785;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.592;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.51;SOR=0.713;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,30:53:99:208,0:11,12,11,19 0/1:30,22:52:99:608,0,845:18,12,13,9 +chrX 2302311 . T TA 826.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=7.94;BaseQRankSum=0.257;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.719;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.771;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,28:52:99:144,0:17,7,17,11 0/1:33,24:57:99:722,0,1057:17,16,15,9 +chrX 2302438 . T C 802 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.80;BaseQRankSum=-0.494;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.795;SOR=0.455;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:66:56:0,66 0/1:34,31:65:99:.:832,0,945:20,14,16,15 +chrX 2302612 . A AAAATAAAT 836.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.52;BaseQRankSum=-1.112;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.52;ReadPosRankSum=-2.191;SOR=0.779;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:66:56:0,66 0/1:27,23:50:99:.:876,0,1050:10,17,8,15 +chrX 2303414 . A G 326 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=6.47;BaseQRankSum=0.404;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.142;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.01;SOR=0.478;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:66:56:0,66 0/1:39,16:55:99:.:356,0,1120:22,17,8,8 +chrX 2303524 . G T 545 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=5.09;BaseQRankSum=0.506;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.412;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.747;SOR=0.635;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,34:65:99:114,0:18,13,19,15 0/1:30,18:48:99:461,0,879:10,20,8,10 +chrX 2303619 . A G 801 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=7.84;BaseQRankSum=0.901;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.693;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,31:58:99:161,0:16,11,14,17 0/1:24,24:48:99:670,0,660:10,14,13,11 +chrX 2303785 . A ATGGATGGG 187.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=9.46;BaseQRankSum=1.915;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.73;MQRankSum=-0.934;QD=9.46;ReadPosRankSum=-2.489;SOR=0.917;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,630 0/1:15,9:24:99:.:227,0,414:9,6,6,3 +chrX 2303789 . ATGGG A 1123.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=27.05;BaseQRankSum=-1.281;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=7.562;MQ=54.26;MQRankSum=0.129;QD=27.05;ReadPosRankSum=2.737;SOR=0.381;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:729,0:.:0,0,8,10 0|1:11,14:25:99:0|1:2303789_ATGGG_A:434,0,270:2303789:8,3,7,7 +chrX 2303801 . G A 1108 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=25.86;BaseQRankSum=-0.56;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=13.519;MQ=53.08;MQRankSum=0.304;QD=25.86;ReadPosRankSum=1.643;SOR=0.406;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,18:19:99:.:.:694,0:.:1,0,8,10 0|1:10,15:25:99:0|1:2303789_ATGGG_A:444,0,236:2303789:8,2,7,8 +chrX 2303845 . ATGGATGGG A 828.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=18.08;BaseQRankSum=1.598;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=8.646;MQ=54.36;MQRankSum=2.08;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.568;SOR=1.203;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,23:29:99:520,0:4,2,9,14 0/1:3,16:19:81:348,0,81:2,1,5,11 +chrX 2304095 . T G 46 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=4.47;BaseQRankSum=-0.781;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=6.021;MQ=57.75;MQRankSum=0.819;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=2.584;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,302 0|1:13,4:17:76:.:0|1:2304095_T_G:76,0,459:2304095:7,6,3,0 +chrX 2304112 . GATGGATGGATAA G 332.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=17.71;BaseQRankSum=0.073;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.60;MQRankSum=-0.801;QD=17.71;ReadPosRankSum=2.083;SOR=0.551;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,302 0|1:11,10:21:99:.:0|1:2304112_GATGGATGGATAA_G:372,0,341:2304112:5,6,5,5 +chrX 2304140 . A G 46 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=3.17;BaseQRankSum=-1.445;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=12.161;MQ=55.59;MQRankSum=0.083;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.946;SOR=2.229;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,405 0/1:18,6:24:76:.:76,0,683:12,6,1,5 +chrX 2304171 . T G 602 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.64;BaseQRankSum=-1.167;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=1.166;MQ=55.61;MQRankSum=-0.378;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.518;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:10,17:27:99:.:.:260,0:.:8,2,11,6 0|1:12,11:23:99:0|1:2304112_GATGGATGGATAA_G:372,0,357:2304112:8,4,8,3 +chrX 2304204 . AATGG A 873.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=23.32;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.43;QD=43.48;SOR=2.636;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,8:8:99:352,0:0,0,7,1 1/1:0,13:13:39:561,39,0:0,0,10,3 +chrX 2304293 . G A 513 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.65;BaseQRankSum=-0.61;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=15.894;MQ=52.89;MQRankSum=-0.367;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.045;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:9,15:24:99:149,0:8,1,8,7 0/1:11,16:27:99:394,0,275:10,1,10,6 +chrX 2304339 . T TGATGGATG 818.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.62;BaseQRankSum=0.482;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.952;MQ=57.35;MQRankSum=-0.542;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=0.846;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,18:30:99:280,0:8,4,9,9 0/1:17,16:33:99:578,0,636:8,9,11,5 +chrX 2304979 . G A 574 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.08;BaseQRankSum=-1.714;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.447;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.350;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:60:32:0,60 0/1:26,24:50:99:.:604,0,707:16,10,12,12 +chrX 2305418 . G A 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.39;BaseQRankSum=1.188;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.58;MQRankSum=1.319;QD=12.39;ReadPosRankSum=-1.397;SOR=0.681;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:60:32:0,60 0/1:27,22:49:99:.:607,0,751:16,11,13,9 +chrX 2305801 . G A 404 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.76;BaseQRankSum=-0.596;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;MQRankSum=0;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=0.807;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:60:32:0,60 0/1:18,16:34:99:.:434,0,499:13,5,12,4 +chrX 2306019 . CT C 3815.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=29.51;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.37;SOR=0.749;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:2055,0:0,0,31,27 1/1:0,51:51:99:1800,153,0:0,0,25,26 +chrX 2306294 . C T 712 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=5.98;BaseQRankSum=1.138;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.659;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.762;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,34:68:35:35,0:19,15,17,17 0/1:29,27:56:99:707,0,706:14,15,16,11 +chrX 2306406 . C G 617 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.78;BaseQRankSum=-0.689;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.883;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.183;SOR=1.392;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,134 0/1:18,23:41:99:.:647,0,478:8,10,7,16 +chrX 2306463 . C CT 418.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.74;BaseQRankSum=-0.473;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=5.035;MQ=59.67;MQRankSum=-0.695;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=1.251;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,134 0/1:14,25:39:99:.:458,0,222:6,8,16,9 +chrX 2306515 . G A 806 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=0.711;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.759;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,134 0/1:23,31:54:99:.:836,0,493:10,13,13,18 +chrX 2306596 . A G 1066 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.61;BaseQRankSum=0.804;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.683;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,134 0|1:37,29:66:99:.:0|1:2306596_A_G:1096,0,1422:2306596:14,23,11,18 +chrX 2306598 . G A 1066 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.61;BaseQRankSum=0.586;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.683;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,134 0|1:37,29:66:99:.:0|1:2306596_A_G:1096,0,1422:2306596:14,23,11,18 +chrX 2306631 . G T 751 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.70;BaseQRankSum=0.826;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.661;SOR=0.417;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,134 0/1:29,28:57:99:.:781,0,794:10,19,12,16 +chrX 2306699 . G A 1062 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=8.53;BaseQRankSum=0.734;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=1.388;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.518;SOR=0.631;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,39:70:99:288,0:17,14,21,18 0/1:28,30:58:99:804,0,744:11,17,14,16 +chrX 2306745 . T A 1077 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=8.58;BaseQRankSum=0.079;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.415;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.607;SOR=0.846;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,42:75:99:293,0:20,13,24,18 0/1:23,31:54:99:814,0,598:11,12,19,12 +chrX 2306926 . CTT C 634.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=8.12;BaseQRankSum=-0.556;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.800;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.252;SOR=0.881;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,21:38:99:209,0:4,13,13,8 0/1:28,17:45:99:465,0,850:18,10,8,9 +chrX 2306988 . C T 722 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.04;BaseQRankSum=1.436;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.707;SOR=0.764;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:59:48:.:.:0,59 0|1:29,21:50:99:.:0|1:2306988_C_T:752,0,1057:2306988:13,16,9,12 +chrX 2307011 . C T 731 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.63;BaseQRankSum=-0.241;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.102;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.986;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:59:48:.:.:0,59 0|1:30,22:52:99:.:0|1:2306988_C_T:761,0,1110:2306988:13,17,8,14 +chrX 2307100 . C G 636 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=6.22;BaseQRankSum=0.144;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.147;SOR=0.768;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,29:55:88:88,0:8,18,9,20 0/1:29,23:52:99:578,0,822:12,17,9,14 +chrX 2307147 . T G 906 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=9.09;BaseQRankSum=-1.626;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=9.467;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.713;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,24:45:29:29,0:10,11,13,11 0/1:25,33:58:99:907,0,705:8,17,19,14 +chrX 2307540 . G C 938 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=9.40;BaseQRankSum=-1.171;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.607;MQ=59.54;MQRankSum=0;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.715;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,32:56:99:181,0:14,10,18,14 0/1:18,29:47:99:787,0,475:8,10,11,18 +chrX 2307764 . CA C 1374.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=23.18;BaseQRankSum=1.162;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=9.294;MQ=59.35;MQRankSum=0;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.042;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,26:27:99:654,0:0,1,11,15 1/1:3,31:34:54:760,54,0:0,3,17,14 +chrX 2307798 . T A 711 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.25;BaseQRankSum=1.843;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.356;MQ=59.34;MQRankSum=0.298;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.991;SOR=1.085;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,139 0|1:30,22:52:99:.:0|1:2307798_T_A:741,0,1102:2307798:15,15,13,9 +chrX 2307803 . T A 705 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.61;BaseQRankSum=1.906;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.064;MQ=59.40;MQRankSum=0.244;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.498;SOR=0.936;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,139 0|1:32,22:54:99:.:0|1:2307798_T_A:735,0,1165:2307798:17,15,13,9 +chrX 2307929 . A G 872 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.32;BaseQRankSum=-1.22;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=4.972;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.32;ReadPosRankSum=1.593;SOR=1.208;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,139 0/1:29,34:63:99:.:902,0,779:14,15,21,13 +chrX 2308007 . C T 698 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=-0.407;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.56;ReadPosRankSum=-1.84;SOR=0.492;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,139 0/1:23,27:50:99:.:728,0,609:8,15,11,16 +chrX 2308136 . A G 3780 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=32.02;BaseQRankSum=2.341;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.02;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.356;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1717,0:0,0,30,23 1/1:1,65:66:99:2093,188,0:1,0,37,28 +chrX 2308302 . G C 678 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.36;BaseQRankSum=-0.834;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.36;ReadPosRankSum=-1.255;SOR=0.622;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,403 0/1:26,27:53:99:.:708,0,690:12,14,13,14 +chrX 2308421 . C G 1302 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=12.11;BaseQRankSum=-0.686;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=7.663;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.558;SOR=0.914;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,42:65:99:589,0:11,12,26,16 0/1:18,27:45:99:743,0,470:7,11,14,13 +chrX 2308505 . G C 3458 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=31.71;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.71;SOR=0.931;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2138,0:0,0,37,31 1/1:0,42:42:99:1350,126,0:0,0,24,18 +chrX 2308899 . A AGGAAG 997.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=22.54;BaseQRankSum=0.974;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.581;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.54;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=1.167;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,397 0/1:19,27:46:99:.:1037,0,690:10,9,17,10 +chrX 2308964 . C A 1067 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=18.59;BaseQRankSum=1.636;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.854;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.16;SOR=0.599;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,397 0/1:20,39:59:99:.:1097,0,448:12,8,18,21 +chrX 2309002 . T G 3860 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.37;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.759;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1906,0:0,0,33,29 1/1:0,62:62:99:1984,186,0:0,0,31,31 +chrX 2310092 . T C 3673 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=33.36;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.36;SOR=0.907;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1844,0:0,0,31,23 1/1:0,57:57:99:1859,171,0:0,0,30,27 +chrX 2310528 . C CTG 991.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=11.58;BaseQRankSum=2.001;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.119;SOR=0.701;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,26:44:99:291,0:7,11,13,13 0/1:21,24:45:99:740,0,670:11,10,10,14 +chrX 2310858 . C T 682 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.82;BaseQRankSum=0.014;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=6.369;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.124;SOR=0.897;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,273 0/1:18,27:45:99:.:712,0,430:11,7,11,16 +chrX 2311061 . CAA C,CA 1532.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=28,38;AS_QD=32.00,32.71;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=23.82;SOR=0.754;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,11,22:33:99:677,307,0:0,0,17,16 1/2:0,17,16:33:99:895,369,429,418,0,329:0,0,15,18 +chrX 2311750 . G A 783 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.26;BaseQRankSum=2.39;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.313;SOR=0.836;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:5:62:0,5 0/1:22,28:50:99:.:813,0,554:11,11,13,15 +chrX 2311903 . A G 3680 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=32.54;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=0.841;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2010,0:0,0,27,34 1/1:0,53:53:99:1700,158,0:0,0,26,27 +chrX 2312128 . T G 3602 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=32.14;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.14;SOR=0.747;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1936,0:0,0,26,34 1/1:0,53:53:99:1696,159,0:0,0,29,24 +chrX 2312860 . C A 917 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=8.09;BaseQRankSum=0.326;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.363;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.361;SOR=0.739;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,29:56:46:46,0:13,14,16,13 0/1:28,33:61:99:901,0,749:13,15,17,16 +chrX 2313006 . A AT 436.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.82;BaseQRankSum=-1.156;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=4.185;MQ=59.47;MQRankSum=-0.867;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.610;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,120 0/1:20,24:44:99:.:476,0,392:12,8,11,13 +chrX 2313285 . G C 586 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.57;BaseQRankSum=-1.461;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=59.78;MQRankSum=1.021;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.66;SOR=0.957;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,120 0/1:25,24:49:99:.:616,0,691:12,13,10,14 +chrX 2313515 . A C 2835 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=31.83;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;QD=31.83;SOR=1.105;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1640,0:0,0,31,21 1/1:0,38:38:99:1225,114,0:0,0,22,16 +chrX 2313619 . G A 845 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=7.74;BaseQRankSum=0.142;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=4.613;MQ=59.58;MQRankSum=-0.052;QD=7.74;ReadPosRankSum=1.187;SOR=0.566;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,41:72:99:343,0:14,17,21,20 0/1:21,20:41:99:532,0,571:8,13,11,9 +chrX 2313656 . G C 500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.25;BaseQRankSum=0.348;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.236;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.25;ReadPosRankSum=-1.434;SOR=0.758;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,298 0/1:20,20:40:99:.:530,0,535:11,9,9,11 +chrX 2313706 . A G 704 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=5.97;BaseQRankSum=1.437;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.429;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.551;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,35:69:59:59,0:14,20,19,16 0/1:29,25:54:99:675,0,796:15,14,11,14 +chrX 2313765 . C T 915 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=17.18;BaseQRankSum=-1.054;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=3.850;MQ=59.65;MQRankSum=0;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=0.767;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,204 0/1:21,34:55:99:.:945,0,545:9,12,19,15 +chrX 2313953 . C T 4097 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=31.75;BaseQRankSum=2.303;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=31.75;ReadPosRankSum=-1.362;SOR=0.285;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2356,0:0,0,34,40 1/1:1,55:56:99:1771,158,0:0,1,26,29 +chrX 2314124 . C T 2278 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.51;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=32.51;SOR=1.451;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1157,0:0,0,10,25 1/1:0,36:36:99:1151,107,0:0,0,15,21 +chrX 2314205 . AGAGGGAGGGAAGGAGGGAAGGAAGG A 212.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=0.825;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=4.506;MQ=59.00;MQRankSum=0;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.160;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,450 0/1:14,7:21:99:.:252,0,473:3,11,3,4 +chrX 2314206 . GAGGGAGGGAAGGAGGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAAGGA G,* 725.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,7;AS_QD=28.17,0.00;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.99;MQRankSum=0;QD=30.60;SOR=1.426;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,2,0:4:61:61,0,175:0,0,0,2 1/2:3,11,7:21:99:704,258,327,419,0,435:1,2,5,13 +chrX 2314746 . G C 651 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.61;BaseQRankSum=-1.618;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.636;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.511;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:94:65:0,94 0/1:28,26:54:99:.:681,0,791:10,18,14,12 +chrX 2314991 . T C 916 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=6.81;BaseQRankSum=2.353;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=1.346;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=6.81;ReadPosRankSum=-1.116;SOR=0.571;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,33:67:55:55,0:19,15,20,13 0/1:37,35:72:99:891,0,970:23,14,18,17 +chrX 2315161 . TA T 365.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.38;BaseQRankSum=0.845;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;MQRankSum=1.077;QD=10.38;ReadPosRankSum=-2.432;SOR=0.551;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,381 0|1:19,20:39:99:.:0|1:2315161_TA_T:405,0,376:2315161:5,14,6,14 +chrX 2315176 . C G 4284 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=28.40;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=38.86;SOR=1.089;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,64:64:99:.:.:2465,0:.:0,0,31,33 1|1:0,47:47:99:0|1:2315161_TA_T:1849,141,0:2315161:0,0,15,32 +chrX 2315189 . G C 696 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.82;BaseQRankSum=0.97;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.167;MQ=59.83;MQRankSum=0.146;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.14;SOR=0.425;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:85:99:85:.:.:0,174 0|1:23,26:49:99:.:0|1:2315161_TA_T:726,0,602:2315161:7,16,10,16 +chrX 2315301 . A G 950 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=6.85;BaseQRankSum=0.694;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=7.439;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.397;SOR=1.257;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:38,41:79:99:100,0:21,17,26,15 0/1:32,32:64:99:880,0,860:14,18,19,13 +chrX 2315354 . G C 681 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.66;BaseQRankSum=2.481;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.97;SOR=0.674;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:78:80:78:0,80 0/1:35,26:61:99:.:711,0,918:19,16,14,12 +chrX 2315562 . G C 4011 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=33.12;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.12;SOR=1.071;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1886,0:0,0,24,34 1/1:0,64:64:99:2155,192,0:0,0,27,37 +chrX 2315652 . T C 3655 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=33.20;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.20;SOR=1.138;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1756,0:0,0,20,33 1/1:0,58:58:99:1929,174,0:0,0,25,33 +chrX 2316339 . C G 661 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.02;BaseQRankSum=-1.186;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=1.135;QD=15.02;ReadPosRankSum=-1.722;SOR=0.786;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,283 0/1:21,25:46:99:.:691,0,582:8,13,9,16 +chrX 2316387 . A G 572 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.68;BaseQRankSum=-1.747;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=6.439;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.68;ReadPosRankSum=1.855;SOR=1.190;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,283 0/1:22,22:44:99:.:602,0,633:9,13,14,8 +chrX 2317256 . C CTTTT,CTTTTTTTTTTT,CTTT 2394.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,19,18;AS_QD=28.36,27.78,29.35;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.87;QD=45.92;SOR=1.654;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16,10,0:26:99:1333,0,243,1006:0,0,12,14 2/3:0,0,9,18:27:99:1101,1095,1103,730,745,730,351,350,0,291:0,0,5,22 +chrX 2317286 . G C 291 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=7.83;BaseQRankSum=1.945;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.64;MQRankSum=-1.846;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.551;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:42:99:42:0,218 0/1:28,13:41:99:.:321,0,672:8,20,4,9 +chrX 2317331 . A C 3979 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=24.51;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.07;QD=44.05;SOR=1.255;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2153,0:.:0,0,22,27 1|1:0,42:42:99:0|1:2317331_A_C:1856,126,0:2317331:0,0,13,29 +chrX 2317332 . G A 296 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=8.36;BaseQRankSum=0.706;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.408;MQ=58.40;MQRankSum=-1.697;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.26;SOR=0.400;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:47:99:47:0,234 0/1:25,14:39:99:.:326,0,643:7,18,5,9 +chrX 2317338 . A G 3935 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=31.67;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;QD=44.06;SOR=1.230;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,48:48:99:.:.:2118,0:.:0,0,22,26 1|1:0,42:42:99:0|1:2317331_A_C:1847,126,0:2317331:0,0,13,29 +chrX 2317509 . C A 1156 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=10.50;BaseQRankSum=-0.733;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.524;MQ=59.27;MQRankSum=1.976;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.525;SOR=0.521;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:26,32:58:99:.:.:244,0:.:13,13,17,15 0|1:29,26:55:99:0|1:2317509_C_A:942,0,1068:2317509:20,9,15,11 +chrX 2317532 . G A 1363 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=12.44;BaseQRankSum=0.216;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=9.090;MQ=59.39;MQRankSum=2.299;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.009;SOR=0.253;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:21,35:56:99:.:.:512,0:.:12,9,17,18 0|1:32,24:56:99:0|1:2317509_C_A:881,0,1159:2317509:24,8,14,10 +chrX 2317636 . AAAG A 959.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=18.85;BaseQRankSum=1.428;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.054;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.85;ReadPosRankSum=1.379;SOR=0.936;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,154 0/1:27,26:53:99:.:999,0,1026:14,13,15,11 +chrX 2318003 . G A 877 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.49;BaseQRankSum=-1.471;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.310;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.754;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,154 0/1:22,33:55:99:.:907,0,590:12,10,15,18 +chrX 2318192 . GAA G,GAAA 872.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=32,23;AS_QD=21.09,11.04;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=16.58;SOR=0.884;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,11:25:77:171,0,77:0,0,13,12 1/2:0,18,12:30:99:741,237,406,581,0,663:0,0,17,13 +chrX 2318542 . C A 1084 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=8.57;BaseQRankSum=1.223;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.659;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.823;SOR=0.606;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,32:61:99:149,0:11,18,15,17 0/1:33,36:69:99:965,0,846:14,19,14,22 +chrX 2319542 . C A,CA 1309 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=8,52;AS_QD=15.00,25.75;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.93;QD=22.32;SOR=0.760;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,8,22:30:99:728,608,0:0,0,13,17 2/2:0,0,30:30:88:611,611,611,88,88,0:0,0,18,12 +chrX 2320411 . A C 2683 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.30;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.30;QD=32.30;SOR=2.476;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1399,0:0,0,9,33 1/1:0,42:42:99:1314,126,0:0,0,10,32 +chrX 2320516 . C A 1604 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=30.08;BaseQRankSum=-0.288;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=8.921;MQ=56.45;MQRankSum=0;QD=41.90;ReadPosRankSum=1.553;SOR=3.897;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:869,0:.:0,0,3,17 1|1:1,18:19:12:0|1:2320516_C_A:765,12,0:2320516:1,0,1,17 +chrX 2320522 . C T 1580 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=30.33;BaseQRankSum=-0.289;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=9.777;MQ=56.40;MQRankSum=0;QD=42.37;ReadPosRankSum=1.096;SOR=4.341;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19:19:99:.:.:845,0:.:0,0,2,17 1|1:1,18:19:12:0|1:2320516_C_A:765,12,0:2320516:1,0,1,17 +chrX 2320531 . A G 1350 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=33.66;BaseQRankSum=0;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=23.442;MQ=56.45;MQRankSum=-0.28;QD=33.66;ReadPosRankSum=1.79;SOR=4.226;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,18:21:99:.:.:675,0:.:1,2,2,16 0|1:3,17:20:75:0|1:2320516_C_A:705,0,75:2320516:3,0,1,16 +chrX 2320533 . T C 1263 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=33.15;BaseQRankSum=3.147;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=30.604;MQ=55.87;MQRankSum=-0.289;QD=33.15;ReadPosRankSum=2.634;SOR=5.608;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,17:20:99:.:.:630,0:.:1,2,1,16 0|1:3,16:19:78:0|1:2320516_C_A:663,0,78:2320516:3,0,0,16 +chrX 2320541 . C T 990 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=26.84;BaseQRankSum=3.424;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=41.572;MQ=55.94;MQRankSum=-0.546;QD=26.84;ReadPosRankSum=2.552;SOR=5.279;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:4,14:18:99:.:.:450,0:.:2,2,1,13 0|1:6,14:20:99:0|1:2320516_C_A:570,0,210:2320516:5,1,0,14 +chrX 2320542 . C G 990 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=26.84;BaseQRankSum=2.663;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=41.572;MQ=55.94;MQRankSum=-0.546;QD=26.84;ReadPosRankSum=2.735;SOR=5.279;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:4,14:18:99:.:.:450,0:.:2,2,1,13 0|1:6,14:20:99:0|1:2320516_C_A:570,0,210:2320516:5,1,0,14 +chrX 2320543 . A G 942 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=25.58;BaseQRankSum=3.312;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=45.580;MQ=56.01;MQRankSum=-0.606;QD=25.58;ReadPosRankSum=2.613;SOR=5.206;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:4,13:17:99:.:.:405,0:.:2,2,1,12 0|1:7,14:21:99:0|1:2320516_C_A:567,0,252:2320516:6,1,0,14 +chrX 2320545 . C T 894 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=24.32;BaseQRankSum=3.312;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=49.122;MQ=56.01;MQRankSum=-0.661;QD=24.32;ReadPosRankSum=2.613;SOR=5.131;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:4,12:16:99:.:.:360,0:.:2,2,1,11 0|1:8,14:22:99:0|1:2320516_C_A:564,0,294:2320516:7,1,0,14 +chrX 2320551 . T C 714 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=19.08;BaseQRankSum=2.948;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=52.821;MQ=56.20;MQRankSum=-0.909;QD=19.08;ReadPosRankSum=1.954;SOR=4.886;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:5,12:17:99:.:.:315,0:.:3,2,1,11 0|1:11,11:22:99:0|1:2320516_C_A:429,0,429:2320516:9,2,0,11 +chrX 2320558 . A T 537 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.92;BaseQRankSum=1.931;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=53.001;MQ=56.32;MQRankSum=-1.058;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.311;SOR=4.606;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:6,11:17:99:.:.:225,0:.:4,2,1,10 0|1:12,9:21:99:0|1:2320516_C_A:342,0,477:2320516:10,2,0,9 +chrX 2320561 . G A 534 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.46;BaseQRankSum=2.583;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=56.556;MQ=56.43;MQRankSum=-1.109;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.352;SOR=4.606;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:6,11:17:99:.:.:225,0:.:4,2,1,10 0|1:13,9:22:99:0|1:2320516_C_A:339,0,519:2320516:11,2,0,9 +chrX 2320570 . G A 1419 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=26.89;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.53;QD=37.15;SOR=0.850;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:643,0:0,0,6,11 1/1:0,22:22:66:806,66,0:0,0,12,10 +chrX 2320576 . A G 174 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=9.27;BaseQRankSum=1.429;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=34.257;MQ=57.36;MQRankSum=-1.531;QD=9.27;ReadPosRankSum=-2.882;SOR=3.893;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:18:9:18:.:.:0,9 0|1:16,6:22:99:.:0|1:2320516_C_A:204,0,654:2320516:14,2,0,6 +chrX 2321507 . T TG 658.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=6.07;BaseQRankSum=1.029;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.08;SOR=0.730;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,31:57:99:154,0:12,14,16,15 0/1:36,22:58:99:544,0,1066:19,17,11,11 +chrX 2321610 . T C 3449 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=32.21;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.21;SOR=0.981;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1816,0:0,0,25,32 1/1:0,51:51:99:1663,153,0:0,0,22,29 +chrX 2321782 . G A 775 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=9.82;BaseQRankSum=2.305;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.816;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.023;SOR=0.904;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,29:48:99:420,0:7,12,16,13 0/1:20,14:34:99:385,0,543:12,8,8,6 +chrX 2321835 . G C 2486 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=31.85;BaseQRankSum=-0.116;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.066;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.85;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.304;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1280,0:0,0,18,22 1/1:1,38:39:82:1236,82,0:1,0,20,18 +chrX 2322164 . T G 430 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=13.14;BaseQRankSum=0.927;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.480;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.017;SOR=1.186;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:26:46:0,26 0/1:18,17:35:99:.:460,0,491:6,12,4,13 +chrX 2322555 . CA C,AA 359 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=22,3;AS_QD=9.49,0.00;BaseQRankSum=-0.201;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=1.193;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.829;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:26:46:0,26,26 0/1:19,22,3:44:99:.:389,0,385,448,360,1484:9,10,11,14 +chrX 2322673 . C T 965 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=8.88;BaseQRankSum=2.436;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.568;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.161;SOR=1.056;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:33,33:66:91:.:.:91,0:.:19,14,22,11 0|1:14,32:46:99:0|1:2322673_C_T:904,0,288:2322673:7,7,19,13 +chrX 2322681 . T TA 4383.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=35.36;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=36.86;SOR=1.217;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,70:70:99:.:.:2508,0:.:0,0,44,26 1|1:0,50:50:99:0|1:2322673_C_T:1915,150,0:2322673:0,0,29,21 +chrX 2322876 . A G 3652 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=32.58;BaseQRankSum=2.452;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.58;ReadPosRankSum=-1.643;SOR=0.238;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,57:58:99:1840,0:1,0,29,28 1/1:0,55:55:99:1842,165,0:0,0,28,27 +chrX 2322955 . G A 514 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.88;BaseQRankSum=0.857;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=16.555;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=2.513;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:95:62:0,95 0/1:30,20:50:99:.:544,0,883:14,16,16,4 +chrX 2323067 . G GCGCCAGC 5051.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=31.18;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=44.27;SOR=1.121;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:3043,0:0,0,26,42 1/1:0,47:47:99:2048,141,0:0,0,21,26 +chrX 2323221 . T C 849 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=7.92;BaseQRankSum=0.65;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=4.660;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.689;SOR=0.757;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,43:72:99:376,0:17,12,18,25 0/1:20,19:39:99:503,0,518:10,10,10,9 +chrX 2324057 . GAAA G,GA 2689.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=45,36;AS_QD=29.92,29.06;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=33.69;SOR=1.497;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,15,17:32:99:873,112,0:0,0,11,21 1/2:0,30,19:49:99:1856,464,347,774,0,628:0,0,17,32 +chrX 2324489 . C T 508 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=4.20;BaseQRankSum=-0.271;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.662;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.025;SOR=0.600;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:40,41:81:24:24,0:23,17,23,18 0/1:27,20:47:99:514,0,777:16,11,11,9 +chrX 2324909 . T C 3542 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=33.07;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.07;SOR=1.077;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1553,0:0,0,23,24 1/1:0,61:61:99:2019,183,0:0,0,22,39 +chrX 2324946 . GTT G,GTTT 2174.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=59,36;AS_QD=28.49,16.39;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=23.31;SOR=1.109;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24,14:38:99:577,0,393:0,0,18,20 1/2:0,35,22:57:99:1637,533,855,1231,0,1356:0,0,21,36 +chrX 2325851 . T TTTCTC 5195.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=33.77;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.99;SOR=0.816;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:2440,0:0,0,34,21 1/1:0,64:64:99:2795,192,0:0,0,29,35 +chrX 2326748 . G T 2445 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=21.90;BaseQRankSum=1.791;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.099;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.90;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.851;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1911,0:0,0,30,28 0/1:33,22:55:99:564,0,851:15,18,15,7 +chrX 2326775 . A C 2554 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=22.28;BaseQRankSum=0.902;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.244;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.28;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.595;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1896,0:0,0,28,30 0/1:32,26:58:99:688,0,867:13,19,17,9 +chrX 2326809 . CT C 665.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=7.92;BaseQRankSum=-1.678;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=14.653;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.542;SOR=1.061;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:14,23:37:99:237,0:6,8,13,10 0/1:28,24:52:99:468,0,570:10,18,16,8 +chrX 2327170 . G T 63 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=1.43;BaseQRankSum=-0.114;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=9.137;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.43;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=0.162;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,34:65:93:.:93,0:23,8,18,16 0/0:.:58:99:58:0,104,1523 +chrX 2327262 . T C 755 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=1.216;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.268;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.976;SOR=0.907;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:99:74:0,199 0/1:28,28:56:99:.:785,0,755:13,15,16,12 +chrX 2327466 . C T 1013 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.49;BaseQRankSum=-0.48;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.904;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.388;SOR=0.555;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:99:74:0,199 0/1:34,38:72:99:.:1043,0,925:21,13,22,16 +chrX 2327776 . A G 1631 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=12.40;BaseQRankSum=-0.126;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=5.200;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.656;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,41:61:99:719,0:7,13,20,21 0/1:39,34:73:99:942,0,1115:19,20,20,14 +chrX 2327972 . T C 3741 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.51;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.22;QD=32.51;SOR=0.877;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1537,0:0,0,26,23 1/1:0,67:67:99:2234,201,0:0,0,37,30 +chrX 2328079 . C CAAAAAAAAA,CAAA 3939.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=70,15;AS_QD=32.46,31.69;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.83;QD=46.81;SOR=1.039;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44,0:44:99:1945,0,1948:0,0,23,21 1/2:0,26,15:41:99:2034,639,533,1085,0,1010:0,0,26,15 +chrX 2328270 . C T 757 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.81;BaseQRankSum=0.888;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.023;MQ=59.97;MQRankSum=-0.948;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.504;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,371 0/1:28,29:57:99:.:787,0,688:11,17,13,16 +chrX 2328504 . C G 850 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=8.63;BaseQRankSum=0.852;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.603;MQ=59.21;MQRankSum=1.038;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.9;SOR=0.848;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,26:52:6:6,0:15,11,13,13 0/1:18,32:50:99:874,0,382:8,10,13,19 +chrX 2329038 . T C 3693 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=31.03;BaseQRankSum=1.356;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.549;MQ=59.99;MQRankSum=0;QD=31.03;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=0.640;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,71:72:99:2160,0:1,0,27,44 1/1:0,48:48:99:1563,144,0:0,0,25,23 +chrX 2329348 . T C 4218 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=31.47;BaseQRankSum=-0.447;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.47;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.321;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,67:68:99:2130,0:0,1,33,34 1/1:0,67:67:99:2118,200,0:0,0,27,40 +chrX 2329752 . G C 610 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.22;BaseQRankSum=-0.267;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.154;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.58;SOR=0.465;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:70:56:0,70 0/1:21,24:45:99:.:640,0,525:12,9,12,12 +chrX 2329789 . G A 583 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.60;BaseQRankSum=-0.36;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.112;SOR=0.850;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:70:56:0,70 0/1:19,23:42:99:.:613,0,494:9,10,10,13 +chrX 2329810 . A G 685 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=6.75;BaseQRankSum=0.151;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.714;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.618;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,34:62:99:173,0:13,15,19,15 0/1:23,21:44:99:542,0,618:11,12,8,13 +chrX 2330062 . C G 2187 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.99;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.36;QD=42.63;SOR=2.393;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1233,0:0,0,24,5 1/1:0,23:23:69:984,69,0:0,0,16,7 +chrX 2330070 . CGGCGGGGGGG C,CGGGGG,CGG 1490.97 . AC=0,2,1;AF=0.00,0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=9,22,3;AS_QD=28.16,34.30,27.14;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=12.430;MQ=49.30;MQRankSum=1.863;QD=42.50;SOR=2.515;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,9,12,0:23:99:689,114,0,649:0,2,18,3 2/3:0,0,10,3:13:96:841,707,682,147,147,96,424,422,0,388:0,0,9,4 +chrX 2330076 . G *,A 1416 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=12,20;AS_QD=0.00,26.60;BaseQRankSum=0;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=6.734;MQ=50.65;MQRankSum=3.329;QD=43.82;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=2.717;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:1,9,10:20:45:.:.:630,45,0:.:0,1,17,2 1|2:0,3,10:13:96:0|1:2330076_G_*:816,421,388,144,0,96:2330076:0,0,9,4 +chrX 2330078 . G *,A 1485 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=12,22;AS_QD=0.00,28.99;BaseQRankSum=0;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=6.410;MQ=48.98;MQRankSum=2.905;QD=43.29;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=2.526;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:1,9,12:22:99:.:.:699,135,0:.:0,1,18,3 1|2:0,3,10:13:96:0|1:2330076_G_*:816,421,388,144,0,96:2330076:0,0,9,4 +chrX 2330079 . G A 66 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=3;AS_QD=7.38;BaseQRankSum=0;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.85;MQRankSum=-1.643;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=0.446;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB . 0|1:10,3:13:96:0|1:2330079_G_A:96,0,388:2330079:7,3,2,1 +chrX 2330081 . G A 66 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=3;AS_QD=7.38;BaseQRankSum=0.73;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.85;MQRankSum=-1.643;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.446;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:45:.:27:.:.:0,0 0|1:10,3:13:96:.:0|1:2330079_G_A:96,0,388:2330079:7,3,2,1 +chrX 2330082 . G A 359 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=10;AS_QD=29.92;BaseQRankSum=-0.408;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.97;MQRankSum=2.008;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.931;SOR=1.022;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:45:.:27:.:.:0,0 0|1:3,10:13:96:.:0|1:2330076_G_*:389,0,96:2330076:2,1,7,3 +chrX 2330084 . G A 356 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=27.57;BaseQRankSum=-0.955;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.363;MQ=47.35;MQRankSum=1.739;QD=27.57;ReadPosRankSum=1.602;SOR=1.609;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:17:60:.:.:0,17 0|1:4,10:14:99:.:0|1:2330076_G_*:386,0,114:2330076:2,2,7,3 +chrX 2330086 . G A 294 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=27.00;BaseQRankSum=-0.799;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.616;MQ=46.01;MQRankSum=0.967;QD=27.00;ReadPosRankSum=1.242;SOR=1.863;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:17:63:.:.:0,17 0|1:4,8:12:99:.:0|1:2330076_G_*:324,0,120:2330076:2,2,6,2 +chrX 2330101 . GGAGA G,GGA 1140.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=26,17;AS_QD=29.12,33.44;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.91;QD=27.44;SOR=1.312;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19,10:29:99:720,0,341:0,0,17,12 1/2:0,7,7:14:99:460,205,227,233,0,209:0,0,10,4 +chrX 2330169 . T A 1973 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.30;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.30;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1181,0:0,0,19,17 1/1:0,28:28:83:822,83,0:0,0,15,13 +chrX 2330220 . A AG 770.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=18.00;BaseQRankSum=-1.608;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.755;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.00;ReadPosRankSum=1.06;SOR=0.573;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:38:47:29:0,47 0/1:15,30:45:99:.:810,0,363:6,9,16,14 +chrX 2330521 . G GA 411.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.89;BaseQRankSum=0.469;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.377;MQ=59.51;MQRankSum=1.283;QD=12.89;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.357;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:38:47:29:0,47 0/1:14,21:35:99:.:451,0,273:9,5,11,10 +chrX 2330688 . TAGG T 815.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=10.96;BaseQRankSum=-0.382;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.817;SOR=0.708;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,20:36:99:176,0:12,4,13,7 0/1:24,18:42:99:679,0,920:11,13,9,9 +chrX 2331221 . C T 3558 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=32.32;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.32;SOR=0.786;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1917,0:0,0,26,32 1/1:0,53:53:99:1671,159,0:0,0,27,26 +chrX 2331436 . GTTTTTTTTTT G,GTTTTTTTTTTTTTTTT 696.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=18,7;AS_QD=23.55,25.78;BaseQRankSum=-0.788;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=9.890;MQ=57.76;MQRankSum=2.294;QD=27.26;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=1.750;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:80:56:0,80,80 1/2:2,18,7:27:99:.:736,265,430,504,0,744:2,0,7,18 +chrX 2331503 . C A 1302 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=16.86;BaseQRankSum=0.026;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.148;MQ=57.78;MQRankSum=-0.574;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.957;SOR=1.007;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:17,26:43:99:.:.:383,0:.:5,12,11,15 0|1:12,24:36:99:0|1:2331503_C_A:949,0,428:2331503:10,2,10,14 +chrX 2331506 . A G 1302 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=16.86;BaseQRankSum=-0.715;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.148;MQ=57.78;MQRankSum=-0.574;QD=16.86;ReadPosRankSum=1.113;SOR=1.007;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:17,26:43:99:.:.:383,0:.:5,12,11,15 0|1:12,24:36:99:0|1:2331503_C_A:949,0,428:2331503:10,2,10,14 +chrX 2332372 . T G 817 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=7.99;BaseQRankSum=-0.152;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=4.836;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.212;SOR=1.220;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,28:51:99:149,0:11,12,9,19 0/1:29,26:55:99:698,0,803:15,14,12,14 +chrX 2332399 . T C 535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.66;BaseQRankSum=-1.754;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=0.518;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:39:57:0,39 0/1:29,24:53:99:.:565,0,810:16,13,12,12 +chrX 2332940 . G T 897 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.45;BaseQRankSum=1.416;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.198;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.45;ReadPosRankSum=-1.092;SOR=1.085;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:39:57:0,39 0/1:27,33:60:99:.:927,0,672:14,13,20,13 +chrX 2333022 . T C 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.59;BaseQRankSum=-2.184;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.803;SOR=0.567;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:39:57:0,39 0/1:28,28:56:99:.:705,0,775:16,12,15,13 +chrX 2333229 . G C 923 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=7.50;BaseQRankSum=0.787;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.203;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.704;SOR=0.738;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,42:78:99:201,0:20,16,22,20 0/1:22,27:49:99:752,0,553:11,11,10,17 +chrX 2333334 . T C 681 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.47;BaseQRankSum=-2.308;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.979;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.880;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:99:73:0,328 0/1:33,29:62:99:.:711,0,941:19,14,18,11 +chrX 2333475 . T C 3845 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=32.29;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.29;SOR=0.726;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1974,0:0,0,29,32 1/1:0,59:59:99:1901,177,0:0,0,32,27 +chrX 2333816 . A G 458 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.96;BaseQRankSum=-0.234;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=10.441;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.871;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:29:64:0,29 0/1:29,20:49:99:.:488,0,822:10,19,12,8 +chrX 2333949 . C T 470 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.11;BaseQRankSum=-0.043;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.192;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=1.085;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:29:64:0,29 0/1:25,20:45:99:.:500,0,648:14,11,13,7 +chrX 2334170 . C CTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTT 2652.97 . AC=0,2,1;AF=0.00,0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,21,4;AS_QD=31.63,30.94,37.87;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.31;QD=84.13;SOR=1.112;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,3,15,0:18:99:972,189,0,612:0,0,14,4 2/3:0,4,6,4:14:27:1720,394,272,153,27,30,219,51,0,97:0,0,5,9 +chrX 2334362 . A G 3910 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=28.46;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=39.40;SOR=0.733;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,51:51:99:.:.:2047,0:.:0,0,26,25 1|1:0,49:49:99:0|1:2334362_A_G:1893,147,0:2334362:0,0,25,24 +chrX 2334370 . C T 1018 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=10.48;BaseQRankSum=0.117;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.749;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.591;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:19,30:49:99:.:.:372,0:.:9,10,16,14 0|1:26,25:51:99:0|1:2334362_A_G:676,0,695:2334362:16,10,13,12 +chrX 2334556 . T C 945 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=7.93;BaseQRankSum=-0.504;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.673;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.590;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,32:60:18:18,0:15,13,17,15 0/1:28,35:63:99:957,0,729:15,13,17,18 +chrX 2334572 . A G 1032 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=8.23;BaseQRankSum=0.456;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.649;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,35:66:99:169,0:17,14,19,16 0/1:29,34:63:99:893,0,735:15,14,17,17 +chrX 2334598 . T C 4266 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=32.79;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=0.771;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2296,0:0,0,34,38 1/1:0,59:59:99:2000,177,0:0,0,29,30 +chrX 2335184 . C A,CA 518 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=2,41;AS_QD=0.00,6.94;BaseQRankSum=-0.295;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.833;MQ=59.64;MQRankSum=0.147;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.719;SOR=0.824;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:18,2,19:39:99:155,1088,0:11,7,12,9 0/2:20,0,22:42:99:393,453,885,0,432,367:9,11,12,10 +chrX 2335450 . G GGT 680.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=0.253;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.00;ReadPosRankSum=2.196;SOR=0.570;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,208 0/1:21,24:45:99:.:720,0,581:8,13,10,14 +chrX 2335576 . G A 817 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.03;BaseQRankSum=0.755;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.950;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.895;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,208 0/1:33,32:65:99:.:847,0,818:15,18,13,19 +chrX 2336269 . G A 441 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=3.83;BaseQRankSum=0.546;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=4.370;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.465;SOR=0.706;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:4:4,0:10,20,17,15 0/1:41,20:61:99:467,0,1152:22,19,11,9 +chrX 2336604 . G GT 523.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=6.26;BaseQRankSum=-0.424;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.892;MQ=59.96;MQRankSum=1.132;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.931;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,21:39:99:99,0:9,9,15,6 0/1:28,23:51:99:464,0,588:13,15,10,13 +chrX 2336725 . A C 1007 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=8.04;BaseQRankSum=0.8;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=4.212;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.381;SOR=1.024;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,34:60:99:271,0:12,14,15,19 0/1:39,30:69:99:766,0,1053:21,18,12,18 +chrX 2336848 . TATAG T,TATAGATAG 3151.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=61,51;AS_QD=33.46,30.44;BaseQRankSum=1.198;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.884;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,28,27:57:94:853,94,0:1,1,26,29 1/2:0,33,24:57:99:2338,999,989,1345,0,1296:0,0,25,32 +chrX 2337101 . A G 613 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=9.32;BaseQRankSum=1.154;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.314;MQ=59.70;MQRankSum=0.808;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.687;SOR=0.679;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:46:59:0,46 0/1:43,26:69:99:.:643,0,1137:24,19,12,14 +chrX 2337212 . T C 985 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=7.75;BaseQRankSum=-0.217;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.645;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.618;SOR=0.784;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,36:64:99:213,0:13,15,22,14 0/1:36,31:67:99:802,0,961:19,17,13,18 +chrX 2337672 . C T 694 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.09;BaseQRankSum=0.845;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=21.190;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.354;SOR=2.139;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:85:62:0,85 0/1:20,25:45:99:.:724,0,525:13,7,6,19 +chrX 2337972 . G T 322 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=7.82;BaseQRankSum=-0.283;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.308;SOR=0.559;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,26:45:99:.:352,0:8,11,12,14 0/0:.:63:88:63:0,88,1504 +chrX 2337974 . C A 322 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=7.82;BaseQRankSum=-0.289;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.119;SOR=0.559;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,26:45:99:.:352,0:8,11,12,14 0/0:.:63:88:63:0,88,1504 +chrX 2338006 . CA C,CAAAA,CAA 1101.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=39,21,10;AS_QD=16.40,20.93,6.56;BaseQRankSum=-0.444;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.52;MQRankSum=-0.424;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.750;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,15,21,0:36:99:607,319,0,786:0,0,16,20 1/3:8,24,0,10:42:51:534,51,263,621,287,911,416,0,687,720:4,4,20,14 +chrX 2338162 . G A 521 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.12;BaseQRankSum=2.404;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.283;MQ=59.89;MQRankSum=-0.657;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.508;SOR=0.648;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,28:42:99:.:551,0:8,6,13,15 0/0:.:59:50:59:0,50,873 +chrX 2338953 . A G 178 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=3.06;BaseQRankSum=-0.695;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.931;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=0.859;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,38:68:99:.:208,0:13,17,15,23 0/0:.:59:50:59:0,50,873 +chrX 2339558 . A C 124 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=2.17;BaseQRankSum=-1.696;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.914;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.505;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,39:71:99:.:154,0:19,13,21,18 0/0:.:59:50:59:0,50,873 +chrX 2340519 . T G 238 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=4.62;BaseQRankSum=2.86;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.683;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.674;SOR=1.027;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,32:58:99:.:268,0:14,12,13,19 0/0:.:59:50:59:0,50,873 +chrX 2340554 . C T 229 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=3.70;BaseQRankSum=0.722;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=4.742;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=1.202;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,39:70:99:.:259,0:16,15,15,24 0/0:.:59:50:59:0,50,873 +chrX 2340577 . C A 85 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=1.83;BaseQRankSum=2.654;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=6.768;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.923;SOR=1.293;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,33:63:99:.:115,0:16,14,12,21 0/0:.:59:50:59:0,50,873 +chrX 2340941 . C G 3249 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=25.03;BaseQRankSum=-0.546;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=7.547;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.03;ReadPosRankSum=2.048;SOR=0.331;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2491,0:0,0,42,34 0/1:23,32:55:99:788,0,561:8,15,13,19 +chrX 2341651 . CTT C,TTT 359 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=14,2;AS_QD=10.81,0.00;BaseQRankSum=-1.721;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=4.901;MQ=59.85;MQRankSum=0.906;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.863;SOR=0.223;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,233,233 0/1:22,14,2:38:99:.:389,0,721,450,576,1311:15,7,8,8 +chrX 2341744 . C CCCTGATAAGAAATAAAATATTACAAAATGCTT,T 4087 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=77,0;AS_QD=25.30,31.89;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=53.47;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41,0:41:99:1699,0,1705:0,0,21,20 1/1:0,36,0:36:99:2418,165,0,1154,130,1327:0,0,14,22 +chrX 2341890 . T C 743 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.05;BaseQRankSum=0.069;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.017;SOR=0.760;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:45:66:0,45 0/1:26,29:55:99:.:773,0,699:13,13,14,15 +chrX 2342086 . G A 673 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.72;BaseQRankSum=0.439;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.972;MQ=59.94;MQRankSum=-1.036;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.855;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:45:66:0,45 0/1:32,28:60:99:.:703,0,812:17,15,16,12 +chrX 2342253 . T C 4941 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=151;AS_QD=32.92;DP=157;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.92;SOR=0.818;VarDP=151 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2342,0:0,0,34,37 1/1:0,80:80:99:2629,241,0:0,0,37,43 +chrX 2342707 . T A 467 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.20;BaseQRankSum=2.413;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=8.209;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=1.888;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:81:70:0,81 0/1:35,19:54:99:.:497,0,1001:17,18,5,14 +chrX 2342892 . C T 474 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=5.31;BaseQRankSum=1.962;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=3.836;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.236;SOR=0.819;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,29:60:77:77,0:17,14,11,18 0/1:19,16:35:99:427,0,491:10,9,9,7 +chrX 2343692 . C T 905 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=6.98;BaseQRankSum=0.472;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.640;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.617;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:37,37:74:3:3,0:17,20,17,20 0/1:26,34:60:99:932,0,659:11,15,16,18 +chrX 2344025 . T C 3228 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=31.63;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.63;SOR=0.752;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1791,0:0,0,25,32 1/1:0,46:46:99:1467,137,0:0,0,25,21 +chrX 2344134 . C T 3482 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=31.64;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.64;SOR=0.865;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1662,0:0,0,22,30 1/1:0,59:59:99:1850,176,0:0,0,29,30 +chrX 2344872 . CATATATATATATAT C,CATATATAT,CATAT,CATATATATATAT 1292.97 . AC=1,0,1,1;AF=0.333,0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=20,7,17,7;AS_QD=20.96,0.00,33.75,17.60;BaseQRankSum=-0.819;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.563;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,20,7,0,0:29:99:482,0,489,721,721:1,1,13,14 3/4:1,0,0,17,7:25:99:850,879,1010,879,1010,1010,175,331,331,387,676,707,707,0,674:0,1,9,15 +chrX 2345596 . A G 2582 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.65;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.65;SOR=1.096;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:955,0:.:0,0,20,15 1|1:0,45:45:99:0|1:2345596_A_G:1657,135,0:2345596:0,0,27,18 +chrX 2345617 . C T 564 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.64;BaseQRankSum=-0.06;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.134;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.001;SOR=0.976;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:38:99:38:.:.:0,957 0|1:24,23:47:99:.:0|1:2345596_A_G:594,0,628:2345596:13,11,14,9 +chrX 2345655 . CA C,TA 1624 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=79,0;AS_QD=20.68,0.00;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;MQRankSum=-0.116;QD=20.68;SOR=0.263;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,38,0:39:99:789,0,810:0,1,16,22 1/1:0,41,0:41:99:865,105,0,1003,130,1968:0,0,24,17 +chrX 2346255 . C CT,CCT 5889.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=1,132;AS_QD=31.36,29.27;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.58;SOR=1.016;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,1,71:72:99:3212,2291,0:0,0,33,39 2/2:0,0,61:61:99:2717,2717,2717,184,184,0:0,0,24,37 +chrX 2346562 . A C 1810 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=33.45;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.45;SOR=1.061;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:1840,0:0,0,23,32 0/0:.:62:99:62:0,106,1337 +chrX 2346653 . T TTGTTG,TTTGTTG 2611.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=59,3;AS_QD=29.68,31.80;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.76;SOR=0.976;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:36:57:0,36,36 1/1:0,59,3:62:99:.:2651,192,0,1769,103,1606:0,0,27,35 +chrX 2346721 . C A 864 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=17.19;BaseQRankSum=-0.268;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=5.565;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=1.202;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:36:57:.:.:0,36 0|1:28,24:52:99:.:0|1:2346721_C_A:894,0,1103:2346721:13,15,15,9 +chrX 2346724 . T C 864 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=17.19;BaseQRankSum=-0.22;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=5.565;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=1.202;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:36:57:.:.:0,36 0|1:28,24:52:99:.:0|1:2346721_C_A:894,0,1103:2346721:13,15,15,9 +chrX 2346857 . T A 641 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.82;BaseQRankSum=-1.374;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=5.162;MQ=59.80;MQRankSum=0.883;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.563;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:36:57:0,36 0/1:36,26:62:99:.:671,0,1054:22,14,12,14 +chrX 2347428 . T G 811 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=11.68;BaseQRankSum=-2.515;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=1.028;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.49;SOR=0.593;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:36:57:0,36 0/1:36,36:72:99:.:841,0,957:17,19,18,18 +chrX 2347463 . A G 1924 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.52;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.52;QD=31.52;SOR=0.758;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:36:57:0,36 1/1:0,62:62:99:.:1954,185,0:0,0,32,30 +chrX 2348441 . C T 997 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=16.05;BaseQRankSum=2.958;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.152;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.413;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:36:57:0,36 0/1:28,36:64:99:.:1027,0,671:10,18,16,20 +chrX 2348692 . AT A 300.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=6.54;BaseQRankSum=-0.829;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.854;SOR=0.693;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:36:57:.:.:0,36 0|1:33,19:52:99:.:0|1:2348692_AT_A:340,0,1101:2348692:14,19,8,11 +chrX 2348698 . T A 823 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.23;BaseQRankSum=0.871;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=1.052;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.23;ReadPosRankSum=0.207;SOR=0.487;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:5:72:.:.:0,5 0|1:24,32:56:99:.:1|0:2348692_AT_A:853,0,683:2348692:9,15,14,18 +chrX 2348963 . G C 942 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=13.69;BaseQRankSum=-0.659;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.743;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:46:55:0,46 0/1:32,39:71:99:.:972,0,774:16,16,20,19 +chrX 2349257 . A G 649 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.71;BaseQRankSum=-1.283;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.224;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.834;SOR=1.051;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:46:55:0,46 0/1:31,27:58:99:.:679,0,863:17,14,17,10 +chrX 2349338 . C A,CA 69 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,27;AS_QD=0.00,1.87;BaseQRankSum=0.016;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.386;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=1.109;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:26,0,27:53:99:.:99,1198,0:11,15,9,18 0/0:.:65:99:65:0,120,1800,120,1800,1800 +chrX 2349514 . C T 281 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=5.76;BaseQRankSum=2.092;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=5.636;MQ=59.76;MQRankSum=0.186;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.984;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,30:54:99:.:311,0:14,10,12,18 0/0:.:65:99:65:0,120,1800 +chrX 2349515 . G A 646 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.80;BaseQRankSum=1.979;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.093;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.15;SOR=0.495;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,1747 0|1:25,24:49:99:.:0|1:2349515_G_A:676,0,662:2349515:11,14,12,12 +chrX 2349517 . G C 2135 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=20.82;BaseQRankSum=1.358;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=6.009;MQ=59.87;MQRankSum=0.156;QD=20.82;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.711;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:25,30:55:99:.:.:277,0:.:15,10,12,18 1|1:0,49:49:99:0|1:2349515_G_A:1888,147,0:2349515:0,0,23,26 +chrX 2349779 . C T 64 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=1.45;BaseQRankSum=-0.045;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.938;MQ=59.35;MQRankSum=-0.488;QD=1.45;ReadPosRankSum=-0.775;SOR=0.758;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,34:65:94:.:94,0:15,16,18,16 0/0:.:59:72:59:0,72,1620 +chrX 2349789 . T C 2260 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=32.44;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.30;QD=43.21;SOR=0.981;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1800 1/1:0,53:53:99:.:2290,160,0:0,0,30,23 +chrX 2349808 . G A 1173 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=22.70;BaseQRankSum=2.811;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=5.893;MQ=57.95;MQRankSum=3.344;QD=22.70;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=1.609;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:9:60:.:.:0,9 0|1:22,31:53:99:.:0|1:2349808_G_A:1203,0,830:2349808:11,11,21,10 +chrX 2349811 . G C 1143 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=22.56;BaseQRankSum=-0.69;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=5.796;MQ=57.83;MQRankSum=3.294;QD=22.56;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=1.536;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:70:63:.:.:0,70 0|1:22,30:52:99:.:0|1:2349808_G_A:1173,0,833:2349808:11,11,20,10 +chrX 2349812 . C T 1079 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=28;AS_QD=22.18;BaseQRankSum=0.713;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.076;MQ=57.74;MQRankSum=3.191;QD=22.18;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=1.382;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:59:.:59:.:.:0,0 0|1:22,28:50:99:.:0|1:2349808_G_A:1109,0,839:2349808:11,11,18,10 +chrX 2349813 . G A 778 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=16.16;BaseQRankSum=-0.694;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.076;MQ=57.74;MQRankSum=-3.158;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.289;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1800 0/1:28,22:50:99:.:808,0,1110:18,10,11,11 +chrX 2349817 . G A 999 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=26;AS_QD=21.89;BaseQRankSum=1.607;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=4.094;MQ=57.29;MQRankSum=3.161;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=1.314;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:58:.:58:.:.:0,0 0|1:21,26:47:99:.:0|1:2349808_G_A:1029,0,804:2349808:11,10,17,9 +chrX 2349854 . G C 513 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.93;BaseQRankSum=0.117;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.242;MQ=56.93;MQRankSum=-3.612;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.712;SOR=0.839;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:94:59:.:.:0,94 0|1:26,16:42:99:.:0|1:2349854_G_C:543,0,1012:2349854:14,12,7,9 +chrX 2349868 . T C 390 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=10.50;BaseQRankSum=0.81;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.70;MQRankSum=-4.347;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.299;SOR=0.859;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:94:59:.:.:0,94 0|1:28,12:40:99:.:0|1:2349854_G_C:420,0,1140:2349854:13,15,5,7 +chrX 2349871 . C T 387 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=10.17;BaseQRankSum=1.478;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.78;MQRankSum=-4.416;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.152;SOR=0.791;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:94:59:.:.:0,94 0|1:29,12:41:99:.:0|1:2349854_G_C:417,0,1182:2349854:13,16,5,7 +chrX 2349882 . CA C 371.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.56;BaseQRankSum=1.229;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.13;MQRankSum=-5.3;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.157;SOR=0.804;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:94:59:.:.:0,94 0|1:31,12:43:99:.:0|1:2349854_G_C:411,0,1266:2349854:14,17,5,7 +chrX 2349891 . T G 417 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=9.72;BaseQRankSum=0;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.40;MQRankSum=-5.909;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.106;SOR=0.656;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:94:59:.:.:0,94 0|1:33,13:46:99:.:0|1:2349854_G_C:447,0,1347:2349854:15,18,6,7 +chrX 2349896 . A G 372 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=8.74;BaseQRankSum=0.216;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.40;MQRankSum=-6.244;QD=8.74;ReadPosRankSum=-1.213;SOR=0.885;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:94:59:.:.:0,94 0|1:34,12:46:99:.:0|1:2349854_G_C:402,0,1371:2349854:16,18,5,7 +chrX 2349908 . A G 328 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=7.31;BaseQRankSum=-0.941;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.260;MQ=56.70;MQRankSum=-6.467;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.023;SOR=0.957;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:94:59:.:.:0,94 0|1:37,12:49:99:.:0|1:2349854_G_C:358,0,1467:2349854:18,19,5,7 +chrX 2349912 . G A 2012 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=18.56;BaseQRankSum=0.992;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.834;MQ=58.36;MQRankSum=-0.881;QD=18.56;ReadPosRankSum=-2.1;SOR=0.597;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,31:57:99:193,0:11,15,13,18 1/1:0,53:53:99:1849,159,0:0,0,25,28 +chrX 2349983 . A G 265 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=5.46;BaseQRankSum=-0.056;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.58;MQRankSum=-5.07;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.237;SOR=0.657;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1717 0/1:40,14:54:99:.:295,0,1133:17,23,6,8 +chrX 2350018 . G A 1840 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=16.55;BaseQRankSum=-0.024;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.820;MQ=58.93;MQRankSum=1.601;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.539;SOR=0.813;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,33:60:99:158,0:13,14,14,19 1/1:0,53:53:99:1712,159,0:0,0,25,28 +chrX 2350231 . G A 1488 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=32.30;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.30;SOR=0.919;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,279 1/1:0,47:47:99:.:1518,141,0:0,0,26,21 +chrX 2351068 . C T 596 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.59;BaseQRankSum=-0.739;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.840;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=0.734;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,279 0/1:29,25:54:99:.:626,0,786:12,17,14,11 +chrX 2351110 . C T 1792 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=16.87;BaseQRankSum=0.817;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=5.884;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.673;SOR=0.272;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,29:56:99:106,0:8,19,14,15 1/1:0,52:52:99:1716,155,0:0,0,22,30 +chrX 2352016 . A G 1799 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=14.18;BaseQRankSum=-0.054;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.727;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,37:71:94:94,0:18,16,18,19 1/1:0,58:58:99:1735,172,0:0,0,33,25 +chrX 2352077 . T C 541 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.42;BaseQRankSum=0.716;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=12.860;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.684;SOR=1.492;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:99:74:0,1800 0/1:28,22:50:99:.:571,0,734:11,17,15,7 +chrX 2352082 . A G 1870 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=15.45;BaseQRankSum=-1.056;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=0.756;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,38:73:18:18,0:19,16,22,16 1/1:0,50:50:99:1882,150,0:0,0,27,23 +chrX 2352685 . C T 829 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.81;BaseQRankSum=-1.426;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=9.206;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.81;ReadPosRankSum=-2.215;SOR=0.753;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1578 0/1:25,33:58:99:.:859,0,636:9,16,19,14 +chrX 2353258 . C G 1949 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=14.24;BaseQRankSum=2.621;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.155;SOR=0.704;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:38,44:82:99:149,0:21,17,23,21 1/1:1,56:57:99:1830,161,0:0,1,31,25 +chrX 2353541 . G A 709 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=5.77;BaseQRankSum=0.163;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=4.263;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.715;SOR=0.392;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,39:72:99:141,0:18,15,22,17 0/1:31,25:56:99:598,0,785:8,23,10,15 +chrX 2353584 . A ATT,ATTTT 780.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=34,16;AS_QD=3.21,10.16;BaseQRankSum=-0.235;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.47;MQRankSum=0;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.773;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,34,0:56:99:241,0,1014:12,10,15,19 0/2:19,0,16:35:99:579,636,1409,0,773,725:6,13,6,10 +chrX 2353755 . GT G 1248.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=29.27;BaseQRankSum=-0.331;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.27;ReadPosRankSum=1.694;SOR=0.283;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,267 1/1:1,43:44:99:.:1288,127,0:1,0,23,20 +chrX 2354660 . C T 206 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=4.07;BaseQRankSum=-1.091;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=5.212;MQ=59.92;MQRankSum=1.184;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.982;SOR=0.633;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,33:58:99:.:236,0:15,10,15,18 0/0:.:61:83:61:0,83,1414 +chrX 2355278 . G A 3022 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=26.54;BaseQRankSum=0.798;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.129;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.07;SOR=0.646;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,31:54:99:.:.:359,0:.:10,13,16,15 1|1:0,61:61:99:0|1:2355278_G_A:2693,184,0:2355278:0,0,33,28 +chrX 2355283 . C G 2996 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=27.02;BaseQRankSum=-0.609;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.222;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.02;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.531;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:22,31:53:99:.:.:393,0:.:9,13,16,15 1|1:0,59:59:99:0|1:2355278_G_A:2633,178,0:2355278:0,0,31,28 +chrX 2355332 . T C 558 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.31;BaseQRankSum=-0.715;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=5.855;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.236;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,1350 0/1:29,23:52:99:.:588,0,807:20,9,12,11 +chrX 2355441 . C G 1568 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=23.50;BaseQRankSum=3.229;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=1.092;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.50;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.495;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,24:40:99:359,0:7,9,11,13 1/1:0,28:28:84:1239,84,0:0,0,15,13 +chrX 2355444 . A T 864 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=13.15;BaseQRankSum=0.474;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.907;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.576;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,24:40:99:359,0:7,9,11,13 0/1:14,14:28:99:535,0,534:7,7,8,6 +chrX 2355446 . A AGGTTG 494.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=19.07;BaseQRankSum=0;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.473;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,624 0/1:14,14:28:99:.:534,0,546:8,6,7,7 +chrX 2355500 . G A 350 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=15.83;BaseQRankSum=1.171;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.65;MQRankSum=-0.836;QD=15.83;ReadPosRankSum=-1.277;SOR=0.673;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,624 0/1:11,13:24:99:.:380,0,285:5,6,6,7 +chrX 2355511 . TAAAAAAAAAAAA T,TAAAAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAA 38.97 . AC=0,1,1;AF=0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,4,0;AS_QD=0.00,17.50,31.74;BaseQRankSum=0.18;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=7.129;MQ=57.72;MQRankSum=0.253;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=2.144;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,12,4,0:16:70:70,127,0,350:0,0,3,13 0/3:9,0,0,1:10:8:8,35,251,35,251,251,0,216,216,212:5,4,1,0 +chrX 2355586 . T C 224 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=6.51;BaseQRankSum=-1.907;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=0.776;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,358 0/1:27,12:39:99:.:254,0,797:15,12,7,5 +chrX 2355796 . G C 655 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.27;BaseQRankSum=0.865;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.119;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.27;ReadPosRankSum=-1.858;SOR=0.882;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,358 0/1:23,25:48:99:.:685,0,594:12,11,11,14 +chrX 2356023 . G A 503 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=13.67;BaseQRankSum=-0.894;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=9.750;MQ=59.36;MQRankSum=0;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.628;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,358 0/1:18,21:39:99:.:533,0,454:5,13,12,9 +chrX 2356066 . C CA,CAA 611.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,16;AS_QD=30.47,33.92;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.68;QD=28.30;SOR=0.776;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,358,358 1/2:0,7,16:23:76:.:651,326,253,137,0,76:0,0,11,12 +chrX 2356409 . T C 1189 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=9.99;BaseQRankSum=0.388;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.687;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,31:55:99:241,0:11,13,17,14 0/1:31,36:67:99:978,0,836:17,14,17,19 +chrX 2356460 . AGAT A 872.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.29;BaseQRankSum=-1.505;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=9.868;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.29;ReadPosRankSum=1.897;SOR=1.767;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1648 0/1:32,24:56:99:.:912,0,1246:15,17,17,7 +chrX 2356582 . T C 382 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=8.58;BaseQRankSum=1.042;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=2.701;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.324;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1648 0/1:32,16:48:99:.:412,0,948:20,12,8,8 +chrX 2356732 . G A 895 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=7.71;BaseQRankSum=1.914;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.467;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.908;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,30:58:80:80,0:12,16,12,18 0/1:32,30:62:99:845,0,865:16,16,13,17 +chrX 2357307 . C T 643 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.94;BaseQRankSum=-0.044;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.050;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.037;SOR=0.874;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1493 0/1:27,25:52:99:.:673,0,724:15,12,15,10 +chrX 2357417 . C T 199 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=3.09;BaseQRankSum=2.661;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=1.873;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.602;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:35,39:74:99:.:229,0:16,19,20,19 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 2357700 . TAAAA TAAAAA,T 968.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,24;AS_QD=1.70,16.39;BaseQRankSum=4.018;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.117;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.112;SOR=0.402;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,21,0:37:90:90,0,413:11,5,10,11 0/2:16,0,24:40:99:918,966,1603,0,637,564:9,7,14,10 +chrX 2357859 . C T 499 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.28;BaseQRankSum=1.051;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.997;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.123;SOR=0.279;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:54:58:0,54 0/1:35,22:57:99:.:529,0,900:11,24,10,12 +chrX 2357965 . G A 684 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.87;BaseQRankSum=0.755;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.87;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.770;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:54:58:0,54 0/1:20,25:45:99:.:714,0,530:10,10,13,12 +chrX 2358265 . G A 264 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=4.52;BaseQRankSum=2.31;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.977;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.04;SOR=0.929;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,36:65:99:.:294,0:12,17,13,23 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 2358362 . C T 770 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.29;BaseQRankSum=-0.75;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.742;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.947;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1800 0/1:27,29:56:99:.:800,0,750:15,12,12,17 +chrX 2358405 . C T 4030 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=32.48;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.48;SOR=0.845;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2162,0:0,0,36,30 1/1:0,59:59:99:1898,176,0:0,0,31,28 +chrX 2358824 . C G 233 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=5.37;BaseQRankSum=1.319;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.180;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.250;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,28:49:99:.:263,0:14,7,14,14 0/0:.:57:33:57:0,33,1369 +chrX 2358950 . G GA 475.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.44;BaseQRankSum=1.005;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.023;SOR=0.593;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1076 0/1:17,28:45:99:.:515,0,280:9,8,14,14 +chrX 2359397 . G A 99 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=2.02;BaseQRankSum=-0.212;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=6.775;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.887;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,34:64:99:.:129,0:12,18,20,14 0/0:.:67:99:67:0,120,1800 +chrX 2359417 . C T 713 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.51;BaseQRankSum=-1.165;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=0.912;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1717 0/1:27,28:55:99:.:743,0,754:13,14,12,16 +chrX 2359449 . G A 812 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.19;BaseQRankSum=0.687;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.392;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.7;SOR=1.095;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1717 0/1:21,31:52:99:.:842,0,489:10,11,12,19 +chrX 2360230 . G T 2570 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=23.01;BaseQRankSum=2.667;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.800;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=23.01;ReadPosRankSum=1.36;SOR=0.603;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,64:65:99:2124,0:1,0,30,34 0/1:29,19:48:99:476,0,844:15,14,11,8 +chrX 2360311 . G A 2803 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=23.22;BaseQRankSum=1.08;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;MQRankSum=0;QD=23.22;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.750;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2055,0:0,0,32,30 0/1:31,29:60:99:778,0,807:17,14,19,10 +chrX 2360400 . T C 866 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.93;BaseQRankSum=0.318;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=17.743;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.33;SOR=0.179;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:94:62:0,94 0/1:25,35:60:99:.:896,0,584:5,20,18,17 +chrX 2360763 . C T 666 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.13;BaseQRankSum=2.324;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.512;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.392;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:94:62:0,94 0/1:21,25:46:99:.:696,0,512:13,8,13,12 +chrX 2360791 . G C 153 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=2.90;BaseQRankSum=-1.272;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.671;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,35:63:99:.:183,0:17,11,21,14 0/0:.:55:99:55:0,100,1434 +chrX 2361373 . A G 866 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.93;BaseQRankSum=-1.412;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.197;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=1.049;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1216 0/1:25,35:60:99:.:896,0,649:12,13,14,21 +chrX 2361425 . T C 974 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=7.66;BaseQRankSum=0.064;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.652;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.587;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,35:69:54:54,0:19,15,19,16 0/1:27,35:62:99:950,0,687:15,12,18,17 +chrX 2362410 . T C 696 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.44;BaseQRankSum=-2.228;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.055;MQ=59.69;MQRankSum=0;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.976;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,445 0/1:25,29:54:99:.:726,0,662:12,13,12,17 +chrX 2363429 . ACT A 613.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=15.55;BaseQRankSum=-0.469;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.53;MQRankSum=-0.251;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=0.741;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,445 0|1:24,18:42:99:.:0|1:2363429_ACT_A:653,0,927:2363429:13,11,10,8 +chrX 2363495 . C T 500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=16.06;BaseQRankSum=0.11;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.352;MQ=55.55;MQRankSum=-1.138;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.857;SOR=0.446;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,445 0|1:19,14:33:99:.:0|1:2363429_ACT_A:530,0,756:2363429:8,11,7,7 +chrX 2363506 . A C 497 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=15.50;BaseQRankSum=-3.066;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.69;MQRankSum=-1.217;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.948;SOR=0.583;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,445 0|1:20,14:34:99:.:0|1:2363429_ACT_A:527,0,798:2363429:8,12,6,8 +chrX 2363559 . T C 318 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=10.88;BaseQRankSum=-0.291;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=1.533;MQ=55.33;MQRankSum=-2.451;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.327;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,445 0|1:21,11:32:99:.:0|1:2363429_ACT_A:348,0,754:2363429:14,7,6,5 +chrX 2363706 . T TCCATTTTATCACCGTTCTATGGTATCATGCCG 320.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=10.91;BaseQRankSum=-0.193;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.562;MQ=55.26;MQRankSum=-3.941;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.464;SOR=0.368;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:99:61:.:.:0,445 0|1:18,15:33:99:.:0|1:2363706_T_TCCATTTTATCACCGTTCTATGGTATCATGCCG:360,0,636:2363706:7,11,5,5 +chrX 2363982 . TGGA T 1055.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=19.91;BaseQRankSum=0.244;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.310;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=1.088;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,445 0/1:27,28:55:99:.:1095,0,1049:12,15,10,18 +chrX 2364713 . TTATC T 1115.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=18.93;BaseQRankSum=1.865;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.139;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.932;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,445 0/1:31,30:61:99:.:1155,0,1207:16,15,13,17 +chrX 2364867 . T A 360 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=7.50;BaseQRankSum=1.221;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.166;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.864;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,445 0/1:36,16:52:99:.:390,0,1023:17,19,9,7 +chrX 2365018 . A G 946 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.27;BaseQRankSum=-1.006;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=7.179;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=1.206;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,445 0/1:25,35:60:99:.:976,0,668:11,14,22,13 +chrX 2365360 . G A 788 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.36;BaseQRankSum=0.916;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=0.682;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,445 0/1:21,29:50:99:.:818,0,528:10,11,15,14 +chrX 2367435 . C CA 313.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=8.83;BaseQRankSum=-0.296;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=5.012;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.808;SOR=1.034;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:12,28:40:99:.:353,0:7,5,11,17 0/0:.:57:49:57:0,49,1026 +chrX 2368146 . G C 60 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=1.96;BaseQRankSum=1.103;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=4.040;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.595;SOR=0.627;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,24:46:90:.:90,0:9,13,13,11 0/0:.:57:49:57:0,49,1026 +chrX 2368242 . C CA 336.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=8.74;BaseQRankSum=-0.14;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=-0.977;QD=8.74;ReadPosRankSum=-2.092;SOR=0.793;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1205 0/1:22,21:43:99:.:376,0,436:12,10,12,9 +chrX 2369488 . GT G 607.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.76;BaseQRankSum=-1.057;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=5.572;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=0.252;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1205 0/1:28,27:55:99:.:647,0,647:19,9,14,13 +chrX 2369546 . G C 709 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.44;BaseQRankSum=0.664;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.017;SOR=0.618;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1205 0/1:26,29:55:99:.:739,0,645:14,12,15,14 +chrX 2369810 . AT A 709.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.14;BaseQRankSum=0.786;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=5.393;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.846;SOR=1.460;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1205 0/1:28,29:57:99:.:749,0,718:14,14,19,10 +chrX 2369844 . T G 152 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=3.57;BaseQRankSum=-2.232;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.096;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.57;ReadPosRankSum=-3.568;SOR=0.458;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,29:51:99:.:182,0:13,9,15,14 0/0:.:58:99:58:0,112,1547 +chrX 2370180 . C CT 424.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.31;BaseQRankSum=-0.606;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.41;SOR=0.646;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:42:44:0,42 0/1:24,21:45:99:.:464,0,550:10,14,9,12 +chrX 2370408 . G C 362 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=10.32;BaseQRankSum=-1.168;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=10.043;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.819;SOR=1.000;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:42:44:0,42 0/1:22,16:38:99:.:392,0,604:15,7,6,10 +chrX 2370590 . GA G 123.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=5.43;BaseQRankSum=1.98;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=9.232;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.43;ReadPosRankSum=2.043;SOR=2.272;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:42:44:0,42 0/1:20,10:30:99:.:163,0,351:9,11,8,2 +chrX 2371022 . T G 1013 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=10.75;BaseQRankSum=-0.672;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.794;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.67;SOR=1.082;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:20,30:50:99:.:.:271,0:.:9,11,15,15 0|1:26,21:47:99:0|1:2371022_T_G:772,0,958:2371022:12,14,4,17 +chrX 2371043 . G T 777 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=17.17;BaseQRankSum=-1.014;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=8.653;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.128;SOR=1.911;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,1376 0|1:25,22:47:99:.:0|1:2371022_T_G:807,0,923:2371022:13,12,6,16 +chrX 2371231 . TC T 460.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=13.16;BaseQRankSum=0.887;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.909;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.79;SOR=0.283;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,945 0/1:20,18:38:99:.:500,0,555:7,13,9,9 +chrX 2371404 . A ATTACCATAGACCCTCCTTCCG 1338.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=16.02;BaseQRankSum=-1.126;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.281;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=16.02;ReadPosRankSum=-1.51;SOR=1.205;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,28:46:99:431,0:9,9,16,12 0/1:15,25:40:99:947,0,556:8,7,17,8 +chrX 2371527 . CGTTACCATAGTCCGTCCTTCT C 807.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=17.65;BaseQRankSum=-0.09;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.156;MQ=59.64;MQRankSum=0;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.596;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,1122 0/1:26,22:48:99:.:847,0,993:16,10,10,12 +chrX 2371668 . TCCCTCCTCCTCCCATTATCACCGC T 523.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=25.59;BaseQRankSum=0.404;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.59;ReadPosRankSum=-0.149;SOR=0.976;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,1122 0|1:8,14:22:99:.:0|1:2371668_TCCCTCCTCCTCCCATTATCACCGC_T:563,0,285:2371668:4,4,8,6 +chrX 2371690 . C A,* 2693 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=50,14;AS_QD=27.28,0.00;BaseQRankSum=3.16;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=7.539;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=41.26;ReadPosRankSum=0.705;SOR=0.787;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,42,0:44:99:.:.:1320,0,1339:.:0,2,26,16 1|2:0,8,14:22:99:1|0:2371668_TCCCTCCTCCTCCCATTATCACCGC_T:1403,632,560,333,0,289:2371668:0,0,12,10 +chrX 2372603 . T C 556 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.06;BaseQRankSum=3.065;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.067;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.683;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,446 0|1:32,21:53:99:.:0|1:2372603_T_C:586,0,1085:2372603:15,17,11,10 +chrX 2372612 . GT G 311.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.32;BaseQRankSum=-1.911;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.309;SOR=0.715;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,446 0|1:17,17:34:99:.:1|0:2372603_T_C:351,0,632:2372603:9,8,8,9 +chrX 2372840 . A G 1068 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=10.36;BaseQRankSum=0.235;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=6.349;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.808;SOR=1.306;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,30:53:99:264,0:13,10,16,14 0/1:22,31:53:99:834,0,512:11,11,24,7 +chrX 2372894 . C G 887 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.79;BaseQRankSum=0.676;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.962;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.168;SOR=0.548;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1752 0/1:28,34:62:99:.:917,0,663:16,12,18,16 +chrX 2373024 . A G 295 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=5.51;BaseQRankSum=0.86;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.026;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.948;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,34:59:99:.:325,0:14,11,21,13 0/0:.:68:99:68:0,120,1800 +chrX 2373213 . A T 678 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.24;BaseQRankSum=-0.138;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.105;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.678;SOR=0.707;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:35,28:63:99:.:708,0,972:19,16,13,15 +chrX 2373603 . G A 726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.39;BaseQRankSum=-0.284;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.262;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.178;SOR=1.151;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:32,29:61:99:.:756,0,823:13,19,9,20 +chrX 2373630 . G A 762 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.40;BaseQRankSum=-2.554;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.611;SOR=0.787;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:24,31:55:99:.:792,0,655:9,15,11,20 +chrX 2374097 . A G 655 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.92;BaseQRankSum=-1.585;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=5.587;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.575;SOR=0.822;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:27,26:53:99:.:685,0,729:11,16,15,11 +chrX 2374448 . T C 834 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.90;BaseQRankSum=-0.979;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=9.576;MQ=58.66;MQRankSum=-2.553;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.626;SOR=0.445;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:32,26:58:99:.:0|1:2374448_T_C:864,0,1204:2374448:10,22,14,12 +chrX 2374483 . A C 629 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=13.18;BaseQRankSum=-0.136;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.33;MQRankSum=-3.086;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.284;SOR=0.582;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:32,18:50:99:.:0|1:2374448_T_C:659,0,1289:2374448:15,17,9,9 +chrX 2374504 . C T 549 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.32;BaseQRankSum=2.229;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.145;MQ=58.22;MQRankSum=-3.23;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=0.527;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:31,16:47:99:.:0|1:2374448_T_C:579,0,1254:2374448:14,17,8,8 +chrX 2374515 . A G 471 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=11.65;BaseQRankSum=1.629;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.267;MQ=58.05;MQRankSum=-3.352;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=0.929;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:29,14:43:99:.:0|1:2374448_T_C:501,0,1176:2374448:14,15,8,6 +chrX 2374517 . TCA T 416.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=10.60;BaseQRankSum=0.16;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.267;MQ=58.05;MQRankSum=-3.539;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.431;SOR=0.735;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:30,13:43:99:.:0|1:2374448_T_C:456,0,1221:2374448:14,16,7,6 +chrX 2374521 . C T 387 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=10.17;BaseQRankSum=0.685;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.96;MQRankSum=-3.63;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.705;SOR=0.631;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:29,12:41:99:.:0|1:2374448_T_C:417,0,1182:2374448:14,15,6,6 +chrX 2374529 . G A 384 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.86;BaseQRankSum=2.17;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.60;MQRankSum=-3.157;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.755;SOR=0.576;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:30,12:42:99:.:0|1:2374448_T_C:414,0,1224:2374448:16,14,6,6 +chrX 2374533 . G GAC 374.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.86;BaseQRankSum=2.388;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.60;MQRankSum=-3.157;QD=9.86;ReadPosRankSum=-2.031;SOR=0.576;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:30,12:42:99:.:0|1:2374448_T_C:414,0,1224:2374448:16,14,6,6 +chrX 2374534 . TTC T 377.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=10.17;BaseQRankSum=1.693;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.54;MQRankSum=-3.099;QD=10.17;ReadPosRankSum=-2.13;SOR=0.518;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:29,12:41:99:.:0|1:2374448_T_C:417,0,1182:2374448:16,13,6,6 +chrX 2374540 . G A 219 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=6.73;BaseQRankSum=1.707;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=6.345;MQ=57.29;MQRankSum=-3.384;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.867;SOR=1.812;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:29,8:37:99:.:0|1:2374448_T_C:249,0,1194:2374448:16,13,2,6 +chrX 2374544 . G T 180 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=6.00;BaseQRankSum=1.6;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=3.960;MQ=57.13;MQRankSum=-3.592;QD=6.00;ReadPosRankSum=-1.857;SOR=1.561;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:28,7:35:99:.:0|1:2374448_T_C:210,0,1155:2374448:15,13,2,5 +chrX 2374549 . A C 177 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=5.75;BaseQRankSum=1.576;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=3.960;MQ=57.21;MQRankSum=-3.656;QD=5.75;ReadPosRankSum=-2.297;SOR=1.543;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:29,7:36:99:.:0|1:2374448_T_C:207,0,1186:2374448:16,13,2,5 +chrX 2376276 . A T 599 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=31.45;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.45;SOR=0.892;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,20:20:60:.:629,60,0:0,0,9,11 +chrX 2376598 . C T 859 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=32.93;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.93;SOR=1.101;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,27:27:81:.:889,81,0:0,0,11,16 +chrX 2376949 . A G 758 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=17.51;BaseQRankSum=-2.092;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.164;MQ=59.07;MQRankSum=-1.513;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.906;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:16,29:45:99:.:788,0,421:8,8,16,13 +chrX 2376990 . T C 1008 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=25.32;BaseQRankSum=0.324;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=10.201;MQ=58.87;MQRankSum=-1.577;QD=25.32;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.363;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:13,28:41:99:.:0|1:2376990_T_C:1038,0,391:2376990:10,3,13,15 +chrX 2376995 . CA C 1030.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=23.78;BaseQRankSum=0.881;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=12.414;MQ=59.03;MQRankSum=-1.633;QD=23.78;ReadPosRankSum=1.008;SOR=0.837;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:15,30:45:99:.:0|1:2376990_T_C:1070,0,432:2376990:11,4,12,18 +chrX 2377027 . G A 1597 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.54;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=32.54;SOR=1.051;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,50:50:99:.:1627,149,0:0,0,21,29 +chrX 2377218 . G A 640 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.89;BaseQRankSum=1.095;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.89;ReadPosRankSum=1.616;SOR=0.591;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:21,24:45:99:.:670,0,514:9,12,11,13 +chrX 2377491 . T C 1869 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=31.13;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=31.13;SOR=0.865;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,61:61:99:.:1899,182,0:0,0,33,28 +chrX 2378018 . A G 2014 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.94;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.94;SOR=1.306;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,64:64:99:.:2044,191,0:0,0,40,24 +chrX 2378309 . C T 997 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=13.51;BaseQRankSum=-1.569;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.567;SOR=0.691;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:37,39:76:99:.:1027,0,1003:19,18,20,19 +chrX 2378361 . C A 946 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=13.94;BaseQRankSum=-0.701;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.676;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:33,37:70:99:.:976,0,847:18,15,20,17 +chrX 2378530 . T G 828 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.62;BaseQRankSum=0.715;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=3.928;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.396;SOR=1.362;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:32,31:63:99:.:858,0,873:11,21,7,24 +chrX 2378722 . G A 499 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.23;BaseQRankSum=0.964;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.694;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.962;SOR=1.169;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:21,19:40:99:.:529,0,580:10,11,7,12 +chrX 2378925 . A G 918 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.34;BaseQRankSum=0.06;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.694;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.197;SOR=1.244;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:24,34:58:99:.:948,0,590:12,12,21,13 +chrX 2379350 . T C 687 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.58;BaseQRankSum=-1.051;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.720;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.317;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:27,30:57:99:.:717,0,698:10,17,15,15 +chrX 2379595 . G GTTT,GTTTT 384.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=6,1;AS_QD=14.13,13.16;BaseQRankSum=-0.735;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=7.186;MQ=59.30;MQRankSum=0;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=2.584;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75,75 0/1:24,6,1:31:95:.:424,0,801,95,805,899:12,12,1,6 +chrX 2379608 . T G 559 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.27;BaseQRankSum=0.087;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=5.864;MQ=59.24;MQRankSum=1.084;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.064;SOR=0.389;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:23,25:48:99:.:0|1:2379608_T_G:589,0,768:2379608:8,15,13,12 +chrX 2379632 . G C 383 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=12.52;BaseQRankSum=-0.044;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=5.460;MQ=59.38;MQRankSum=0;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=1.911;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:18,15:33:99:.:1|0:2379608_T_G:413,0,645:2379608:9,9,4,11 +chrX 2379766 . A G 499 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.30;BaseQRankSum=-1.895;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.29;SOR=0.773;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:17,20:37:99:.:529,0,479:8,9,9,11 +chrX 2380091 . C T 479 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.79;BaseQRankSum=0.66;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=13.888;MQ=59.76;MQRankSum=-1.225;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.815;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:32,20:52:99:.:509,0,871:23,9,8,12 +chrX 2380684 . C T 1270 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=33.33;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.33;SOR=0.743;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,39:39:99:.:1300,117,0:0,0,19,20 +chrX 2380928 . G A 619 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=10.30;BaseQRankSum=-2.547;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.468;MQ=59.90;MQRankSum=0.926;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=0.889;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:35,28:63:99:.:649,0,977:19,16,12,16 +chrX 2381797 . CAAAA C,CAAAAA 528.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,9;AS_QD=34.00,16.78;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.87;QD=27.05;SOR=0.784;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75,75 1/2:0,12,9:21:99:.:568,160,443,435,0,417:0,0,10,11 +chrX 2382200 . C A 1901 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.88;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.88;SOR=1.140;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,57:57:99:.:1931,171,0:0,0,23,34 +chrX 2382739 . C T 404 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.59;BaseQRankSum=1.227;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.298;MQ=56.97;MQRankSum=-0.177;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.549;SOR=1.042;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:24,17:41:99:.:0|1:2382739_C_T:434,0,570:2382739:9,15,5,12 +chrX 2382978 . C CCAT 813.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=24.37;BaseQRankSum=1.251;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=3.220;MQ=59.81;MQRankSum=-0.662;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.307;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:12,23:35:99:.:0|1:2382978_C_CCAT:853,0,425:2382978:9,3,14,9 +chrX 2382984 . T TCAG 374.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=11.83;BaseQRankSum=0.417;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=3.220;MQ=59.79;MQRankSum=0.783;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.417;SOR=1.329;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:23,12:35:99:.:414,0,853:14,9,9,3 +chrX 2382987 . G T 811 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=21.56;BaseQRankSum=1.844;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.309;MQ=59.80;MQRankSum=-0.782;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.446;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:16,23:39:99:.:0|1:2382978_C_CCAT:841,0,562:2382978:11,5,14,9 +chrX 2383071 . T G 520 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.22;BaseQRankSum=0.856;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.154;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.52;SOR=0.834;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:25,20:45:99:.:550,0,698:12,13,11,9 +chrX 2384359 . C T 849 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.41;BaseQRankSum=-1.534;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=5.205;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.484;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:27,34:61:99:.:879,0,726:10,17,18,16 +chrX 2384774 . AG A 168.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=11.56;BaseQRankSum=1.682;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.133;SOR=0.976;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 0|1:8,10:18:99:.:0|1:2384774_AG_A:208,0,187:2384774:6,2,8,2 +chrX 2384950 . A T 539 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.93;BaseQRankSum=1.489;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=6.422;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.059;SOR=1.696;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:23,21:44:99:.:569,0,560:12,11,15,6 +chrX 2385108 . A ATG,ATGTGTG 359.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,11;AS_QD=0.00,9.50;BaseQRankSum=0.102;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.392;MQ=59.69;MQRankSum=-1.625;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.517;SOR=1.184;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75,75 0/2:31,0,11:42:99:.:399,403,1517,0,1049,1103:16,15,7,4 +chrX 2385110 . A G,ATGTG,ATGTGTGTG 1583 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=15,18,0;AS_QD=32.37,35.60,26.82;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=48.88;SOR=0.752;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75,75,75 1/2:0,15,18,0:33:99:.:1613,714,980,579,0,497,1284,702,485,1254:0,0,17,16 +chrX 2385138 . A ATG 596.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=14.45;BaseQRankSum=-0.101;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=59.64;MQRankSum=-1.608;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.913;SOR=0.883;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:25,19:44:99:.:636,0,907:11,14,11,8 +chrX 2385586 . G A 755 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=3.097;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.268;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=0.907;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:28,28:56:99:.:785,0,655:15,13,12,16 +chrX 2386022 . T G 545 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.50;BaseQRankSum=-0.23;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.627;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:28,22:50:99:.:575,0,753:11,17,9,13 +chrX 2386156 . ATTATTTATTTAT A,ATTATTTATTTATTTAT 1212.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=18,13;AS_QD=34.42,26.68;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.39;SOR=1.044;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75,75 1/2:0,18,13:31:99:.:1252,526,699,732,0,694:0,0,18,13 +chrX 2386346 . G A 638 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.13;BaseQRankSum=-0.41;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=0.938;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.617;SOR=0.730;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:33,27:60:99:.:668,0,862:18,15,15,12 +chrX 2387078 . C T 833 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.69;BaseQRankSum=1.1;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.363;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=0.358;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:36,32:68:99:.:863,0,977:23,13,17,15 +chrX 2387550 . T C 1562 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.49;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=1.007;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,49:49:99:.:1592,146,0:0,0,21,28 +chrX 2387904 . C CA,CAA 396.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=9,7;AS_QD=29.78,29.96;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.25;SOR=1.609;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75,75 1/2:0,9,7:16:92:.:436,152,92,170,0,134:0,0,11,5 +chrX 2388219 . C T 617 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.97;BaseQRankSum=-1.508;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.13;SOR=0.641;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:30,29:59:99:.:647,0,762:12,18,12,17 +chrX 2389381 . A G 2331 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.34;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.34;SOR=1.032;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,73:73:99:.:2361,218,0:0,0,42,31 +chrX 2389584 . T G 611 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.87;BaseQRankSum=-1.013;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.703;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:29,25:54:99:.:641,0,811:14,15,12,13 +chrX 2390144 . CT C,CTT 518.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,18;AS_QD=15.08,15.67;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;QD=18.00;SOR=1.044;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75,75 1/2:0,13,18:31:99:.:558,362,492,276,0,318:0,0,13,18 +chrX 2390440 . AT A 415.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.34;BaseQRankSum=0.295;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.223;SOR=0.700;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:23,21:44:99:.:455,0,473:12,11,11,10 +chrX 2390836 . T C 1672 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=32.73;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=32.73;SOR=0.693;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,52:52:99:.:1702,156,0:0,0,26,26 +chrX 2391257 . A C 1946 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.93;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.93;SOR=0.906;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,60:60:99:.:1976,180,0:0,0,33,27 +chrX 2391872 . G A 885 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.08;BaseQRankSum=0.792;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=10.934;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.458;SOR=0.595;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:31,34:65:99:.:915,0,792:21,10,15,19 +chrX 2392276 . C A 923 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=13.42;BaseQRankSum=0.909;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=6.240;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=1.032;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:36,35:71:99:.:953,0,942:20,16,14,21 +chrX 2392452 . G A 936 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.42;BaseQRankSum=0.123;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.955;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.955;SOR=0.637;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:36,36:72:99:.:966,0,935:20,16,17,19 +chrX 2392765 . T TATAA 2348.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=27.73;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=1.022;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,54:54:99:.:2388,162,0:0,0,23,31 +chrX 2392820 . C CAT 2421.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=26.60;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.75;SOR=0.804;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,55:55:99:.:2461,166,0:0,0,29,26 +chrX 2392902 . TTA T 1261.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=20.65;BaseQRankSum=-3.148;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.122;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=0.420;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:29,34:63:99:.:1301,0,1115:12,17,17,17 +chrX 2392982 . C G 872 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.82;BaseQRankSum=0.27;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.825;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.968;SOR=1.299;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:23,34:57:99:.:902,0,539:12,11,22,12 +chrX 2393419 . T C 1719 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=31.80;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.80;SOR=1.262;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:75:63:.:.:0,75 1|1:0,55:55:99:.:0|1:2393419_T_C:1749,164,0:2393419:0,0,21,34 +chrX 2393996 . T C 1533 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=34.73;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.73;SOR=0.737;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,45:45:99:.:1563,135,0:0,0,22,23 +chrX 2394096 . C T 1776 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=32.84;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.84;SOR=0.884;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,55:55:99:.:1806,165,0:0,0,30,25 +chrX 2394567 . G C 1000 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=16.61;BaseQRankSum=-0.378;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=7.285;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=1.582;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:25,37:62:99:.:1030,0,649:12,13,25,12 +chrX 2395001 . GT G 787.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.88;BaseQRankSum=-1.315;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.02;SOR=0.582;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:23,26:49:99:.:827,0,703:9,14,11,15 +chrX 2395154 . C T 664 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.97;BaseQRankSum=-0.32;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.019;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=0.898;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:31,27:58:99:.:694,0,827:18,13,17,10 +chrX 2395507 . A T 2312 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.08;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.08;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,73:73:99:.:2342,219,0:0,0,34,39 +chrX 2395727 . G A 1955 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.02;BaseQRankSum=2.721;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.02;ReadPosRankSum=1.853;SOR=0.758;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:2,62:64:99:.:1985,143,0:1,1,30,32 +chrX 2395891 . C A 1344 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=32.71;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.71;SOR=0.892;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,42:42:99:.:1374,125,0:0,0,23,19 +chrX 2396375 . C CT,CTTTTT 887.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=8,20;AS_QD=34.15,22.56;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.56;QD=33.11;SOR=1.179;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75,75 1/2:0,8,20:28:99:.:927,664,604,173,0,237:0,0,17,11 +chrX 2396448 . G C 937 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=30.20;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.29;SOR=0.859;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,24:24:72:.:967,72,0:0,0,13,11 +chrX 2396451 . C T 350 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=15.83;BaseQRankSum=0;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.524;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.986;SOR=0.529;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:11,13:24:99:.:380,0,310:7,4,6,7 +chrX 2396481 . C A 1026 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=33.00;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=0.818;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,32:32:96:.:1056,96,0:0,0,17,15 +chrX 2396765 . CT C 284.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.45;BaseQRankSum=0.307;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=3.365;MQ=59.55;MQRankSum=0;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.232;SOR=0.227;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:14,17:31:99:.:324,0,248:4,10,8,9 +chrX 2396850 . C T 480 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.75;BaseQRankSum=-0.109;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.780;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.42;SOR=0.863;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 0/1:21,19:40:99:.:510,0,580:12,9,8,11 +chrX 2397459 . G A 1817 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=33.58;BaseQRankSum=4.402;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.254;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.58;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.458;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:1,54:55:99:.:1847,155,0:0,1,29,25 +chrX 2397571 . CA C 1172.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=28.19;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.19;SOR=0.836;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:75:63:0,75 1/1:0,43:43:99:.:1212,129,0:0,0,23,20 +chrX 2397636 . AT A 2340.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=19.51;BaseQRankSum=0.434;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.653;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.490;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2149,0:0,0,32,43 0/1:34,13:47:99:231,0,824:13,21,7,6 +chrX 2397930 . G GCACA 2388.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.72;BaseQRankSum=0.439;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.130;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.72;ReadPosRankSum=0.24;SOR=0.986;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1886,0:0,0,27,16 0/1:15,14:29:99:542,0,588:8,7,7,7 +chrX 2397955 . T C 2080 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=28.99;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.06;SOR=1.473;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,49:49:99:.:2110,0:0,0,32,17 0/0:.:53:61:53:0,61,1195 +chrX 2398448 . C T 1816 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=34.19;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.19;SOR=0.693;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:1846,0:0,0,27,27 0/0:.:53:61:53:0,61,1195 +chrX 2398670 . C CT 324.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.74;BaseQRankSum=0.99;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=13.675;MQ=58.59;MQRankSum=-1.013;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.61;SOR=1.547;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,1036 0/1:8,23:31:94:.:364,0,94:2,6,16,7 +chrX 2399001 . C T 2595 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=30.84;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=43.75;SOR=0.831;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,60:60:99:.:2625,0:0,0,28,32 0/0:.:55:48:55:0,48,1021 +chrX 2399009 . A C 3785 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=29.57;BaseQRankSum=0.545;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=4.120;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=29.57;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.385;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2659,0:0,0,30,31 0/1:26,42:68:99:1156,0,640:10,16,20,22 +chrX 2399128 . A AAAATTAAACC 3951.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=34.11;BaseQRankSum=0.764;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=4.415;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.11;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.342;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:2552,0:0,0,29,28 0/1:24,36:60:99:1439,0,849:15,9,18,18 +chrX 2399172 . A G 3543 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=33.08;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.08;SOR=0.769;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1558,0:0,0,23,24 1/1:0,61:61:99:2015,183,0:0,0,33,28 +chrX 2399406 . T TAA 671.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.16;BaseQRankSum=-1.534;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.652;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=1.079;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,793 0/1:19,25:44:99:.:711,0,548:9,10,15,10 +chrX 2399719 . A G 993 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=30.38;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.35;SOR=1.981;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:1023,0:0,0,19,7 0/0:.:38:33:36:0,33,955 +chrX 2399742 . AC A 432.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=7.87;BaseQRankSum=0.298;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=11.552;MQ=59.10;MQRankSum=0;QD=7.87;ReadPosRankSum=2.026;SOR=1.410;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,11:14:99:220,0:2,1,6,5 0/1:33,13:46:99:252,0,1040:13,20,10,3 +chrX 2400279 . A G 2736 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=23.05;BaseQRankSum=-0.968;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.774;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.05;ReadPosRankSum=0.793;SOR=0.633;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2214,0:0,0,31,35 0/1:32,22:54:99:552,0,910:15,17,14,8 +chrX 2401108 . CTT CT,C 860.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=35,13;AS_QD=10.67,10.13;BaseQRankSum=-0.052;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=9.685;MQ=59.41;MQRankSum=0;QD=13.43;ReadPosRankSum=1.798;SOR=1.315;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,35,0:38:99:576,0,689:3,0,15,20 0/2:16,0,13:29:99:324,372,780,0,408,368:8,8,2,11 +chrX 2401826 . T G 2625 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.38;BaseQRankSum=2.111;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=4.225;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.38;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=1.120;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,81:82:99:.:2655,0:1,0,30,51 0/0:.:54:38:42:0,38,1080 +chrX 2401987 . A C 1804 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=28.66;BaseQRankSum=0.445;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.66;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.758;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,62:64:99:.:1834,0:1,1,30,32 0/0:.:54:38:42:0,38,1080 +chrX 2402412 . G C 1681 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=33.55;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.55;SOR=0.732;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,51:51:99:.:1711,0:0,0,25,26 0/0:.:54:38:42:0,38,1080 +chrX 2402695 . C T 2658 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=28.75;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=1.270;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,63:63:99:.:2688,0:0,0,39,24 0/0:.:54:38:42:0,38,1080 +chrX 2402706 . TA T 2581.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=28.97;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.68;SOR=1.255;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,60:60:99:.:2621,0:0,0,37,23 0/0:.:54:38:42:0,38,1080 +chrX 2402727 . C T 2589 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=26.15;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.57;SOR=1.010;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,63:63:99:.:2619,0:0,0,36,27 0/0:.:54:38:42:0,38,1080 +chrX 2403744 . T G 2241 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=23.41;BaseQRankSum=0.974;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.906;MQ=59.31;MQRankSum=-1.369;QD=23.41;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=0.522;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1598,0:0,0,23,27 0/1:23,24:47:99:673,0,603:10,13,13,11 +chrX 2403856 . C CAA 245.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=6.33;BaseQRankSum=1.635;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.211;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.33;ReadPosRankSum=-2.497;SOR=0.459;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,28:45:99:.:285,0:11,6,16,12 0/0:.:56:87:56:0,87,1265 +chrX 2404114 . T C 2801 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=25.05;BaseQRankSum=0.387;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=25.177;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.555;SOR=0.559;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1953,0:0,0,27,33 0/1:21,32:53:99:878,0,521:17,4,13,19 +chrX 2404741 . C T 831 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=7.24;BaseQRankSum=0.839;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=8.423;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.916;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,35:67:99:138,0:14,18,22,13 0/1:25,27:52:99:723,0,642:11,14,14,13 +chrX 2404968 . T C 3348 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=24.30;BaseQRankSum=-1.217;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=2.745;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.30;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.420;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,77:77:99:2546,0:0,0,39,38 0/1:29,33:62:99:832,0,717:17,12,16,17 +chrX 2405003 . C T 3530 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=24.90;BaseQRankSum=-0.363;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=4.051;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.90;ReadPosRankSum=1.001;SOR=0.497;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,81:81:99:2629,0:0,0,37,44 0/1:27,35:62:99:931,0,663:16,11,19,16 +chrX 2405447 . T C 2686 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=23.82;BaseQRankSum=1.715;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.904;MQ=59.71;MQRankSum=-0.779;QD=23.82;ReadPosRankSum=0.043;SOR=0.929;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1814,0:0,0,24,35 0/1:22,33:55:99:902,0,484:11,11,17,16 +chrX 2405918 . A AC 3184.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=29.58;BaseQRankSum=-0.317;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.213;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=29.58;ReadPosRankSum=1.217;SOR=0.355;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,57:58:99:.:.:2344,0:.:0,1,32,25 0|1:27,24:51:99:0|1:2405918_A_AC:880,0,1020:2405918:18,9,11,13 +chrX 2405919 . A G 850 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=17.25;BaseQRankSum=-2.001;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=7.843;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.494;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:67:99:67:.:.:0,174 0|1:27,24:51:99:.:0|1:2405918_A_AC:880,0,1020:2405918:18,9,11,13 +chrX 2406032 . G A 859 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=11.70;BaseQRankSum=3.513;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=1.912;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.777;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,174 0/1:43,33:76:99:.:889,0,1070:20,23,18,15 +chrX 2406443 . GT G 1851.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=19.91;BaseQRankSum=0.835;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=3.202;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.402;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1382,0:0,0,25,24 0/1:23,23:46:99:509,0,509:14,9,12,11 +chrX 2406646 . A G 2312 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=22.30;BaseQRankSum=-1.672;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=9.375;MQ=59.51;MQRankSum=-1.261;QD=22.30;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.212;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1508,0:0,0,26,21 0/1:26,32:58:99:834,0,706:18,8,14,18 +chrX 2406684 . A G 2876 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=25.72;BaseQRankSum=-0.317;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=10.618;MQ=59.94;MQRankSum=1.141;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.797;SOR=0.196;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,46:46:99:.:.:1484,0:.:0,0,23,23 0|1:30,37:67:99:0|1:2406684_A_G:1422,0,1128:2406684:21,9,19,18 +chrX 2406693 . G A 1456 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=21.54;BaseQRankSum=1.703;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=8.731;MQ=59.91;MQRankSum=1.169;QD=21.54;ReadPosRankSum=-1.943;SOR=0.187;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:51:99:51:.:.:0,1349 0|1:30,39:69:99:.:0|1:2406684_A_G:1486,0,1132:2406684:22,8,21,18 +chrX 2407039 . C G 2569 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=24.06;BaseQRankSum=-0.974;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.850;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.06;ReadPosRankSum=-1.666;SOR=0.616;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2043,0:0,0,28,32 0/1:26,22:48:99:556,0,714:12,14,14,8 +chrX 2408170 . G T 1147 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=10.42;BaseQRankSum=0.749;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=7.408;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.642;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,27:52:95:95,0:17,8,12,15 0/1:22,39:61:99:1082,0,511:11,11,18,21 +chrX 2408701 . G GA 432.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.98;BaseQRankSum=-0.693;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.213;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.416;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:79:13:79:0,13 0/1:19,24:43:99:.:472,0,399:12,7,13,11 +chrX 2408876 . C CA 693.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=7.26;BaseQRankSum=0.784;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.746;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.43;SOR=0.605;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,36:60:99:301,0:14,10,18,18 0/1:20,21:41:99:432,0,471:11,9,13,8 +chrX 2409322 . T C 786 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.18;BaseQRankSum=1.192;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=4.788;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.548;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:99:74:0,403 0/1:35,32:67:99:.:816,0,875:14,21,17,15 +chrX 2409920 . G C 308 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=7.04;BaseQRankSum=-1.788;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.128;SOR=0.826;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,30:48:99:.:338,0:9,9,16,14 0/0:.:62:99:62:0,120,1800 +chrX 2410061 . T C 698 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.00;BaseQRankSum=-0.727;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.859;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:50:50:0,50 0/1:28,28:56:99:.:728,0,765:9,19,8,20 +chrX 2410735 . A G 2757 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=23.23;BaseQRankSum=1.139;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=3.892;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.23;ReadPosRankSum=-0.258;SOR=0.844;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2264,0:0,0,40,29 0/1:30,21:51:99:523,0,745:14,16,10,11 +chrX 2411317 . G A 30 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=1.18;BaseQRankSum=1.703;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.18;ReadPosRankSum=1.084;SOR=0.610;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,26:51:60:.:60,0:10,15,11,15 0/0:.:61:94:61:0,94,1429 +chrX 2411480 . G A 410 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.36;BaseQRankSum=1.23;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.230;MQ=59.90;MQRankSum=0.797;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.418;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:99:49:0,973 0/1:30,17:47:99:.:440,0,804:20,10,10,7 +chrX 2411683 . C T 136 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=3.07;BaseQRankSum=0.763;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.050;MQ=59.91;MQRankSum=-0.927;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.997;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,28:54:99:.:166,0:13,13,16,12 0/0:.:52:75:52:0,75,1125 +chrX 2411752 . C CA 629.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=7.87;BaseQRankSum=-0.901;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;MQRankSum=-0.748;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.289;SOR=0.784;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,34:55:99:362,0:12,9,14,20 0/1:16,14:30:99:307,0,369:5,11,7,7 +chrX 2412084 . A G 786 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.18;BaseQRankSum=-0.927;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.34;SOR=0.603;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:2:67:0,2 0/1:36,31:67:99:.:816,0,1010:24,12,20,11 +chrX 2412252 . A T 2519 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=24.28;BaseQRankSum=-0.777;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=1.856;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=24.28;ReadPosRankSum=1.163;SOR=0.790;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1823,0:0,0,26,27 0/1:25,27:52:99:726,0,701:13,12,11,16 +chrX 2412373 . T C 2453 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=21.22;BaseQRankSum=-0.318;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.706;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.22;ReadPosRankSum=-1.306;SOR=0.467;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1830,0:0,0,29,31 0/1:31,26:57:99:653,0,811:13,18,13,13 +chrX 2413056 . A G 1879 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=21.69;BaseQRankSum=-1.826;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.887;MQ=59.33;MQRankSum=-1.549;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.899;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1291,0:0,0,21,17 0/1:26,24:50:99:618,0,744:13,13,13,11 +chrX 2413151 . C T 736 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=28;AS_QD=13.68;BaseQRankSum=1.389;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=7.677;MQ=59.50;MQRankSum=0.051;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.59;SOR=1.863;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:50:.:50:0,0 0/1:28,28:56:99:.:766,0,695:14,14,8,20 +chrX 2413350 . C CT 3046.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=25.93;BaseQRankSum=-0.045;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.774;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.93;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=0.614;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2328,0:0,0,34,29 0/1:31,25:56:99:758,0,975:18,13,15,10 +chrX 2413708 . G C 75 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=1.57;BaseQRankSum=0.18;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.57;ReadPosRankSum=0.797;SOR=0.631;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,35:67:99:.:105,0:15,17,17,18 0/0:.:64:99:64:0,110,1529 +chrX 2413797 . T C 2572 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=24.09;BaseQRankSum=0.578;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.035;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.09;ReadPosRankSum=-0.021;SOR=0.430;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1970,0:0,0,34,27 0/1:24,23:47:99:632,0,644:10,14,8,15 +chrX 2415062 . T C 2355 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=24.59;BaseQRankSum=-0.689;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=24.59;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.796;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1632,0:0,0,20,30 0/1:20,27:47:99:753,0,530:9,11,13,14 +chrX 2416175 . C T 532 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.61;BaseQRankSum=-1.591;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.61;ReadPosRankSum=-1.284;SOR=0.603;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,973 0/1:15,21:36:99:.:562,0,402:9,6,12,9 +chrX 2416892 . T TA 2889.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=27.37;BaseQRankSum=0.778;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.819;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.37;ReadPosRankSum=0.323;SOR=0.742;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:2175,0:0,0,28,27 0/1:29,23:52:99:754,0,1000:14,15,13,10 +chrX 2416942 . T C 728 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=6.95;BaseQRankSum=-1.626;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.720;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.44;SOR=0.570;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,33:58:99:132,0:16,9,17,16 0/1:26,25:51:99:626,0,731:13,13,14,11 +chrX 2417146 . G A 2765 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=24.30;BaseQRankSum=-0.187;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=6.019;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.356;SOR=0.277;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1929,0:0,0,28,32 0/1:24,31:55:99:866,0,648:8,16,16,15 +chrX 2417282 . A C 3100 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=24.84;BaseQRankSum=-0.485;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.793;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.84;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.386;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2216,0:0,0,33,36 0/1:24,33:57:99:914,0,616:15,9,17,16 +chrX 2417331 . G T 43 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=1.11;BaseQRankSum=1.173;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.370;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.11;ReadPosRankSum=1.931;SOR=0.911;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,33:66:73:.:73,0:15,18,19,14 0/0:.:55:85:55:0,85,1254 +chrX 2417462 . G A 2561 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=23.13;BaseQRankSum=0.508;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.13;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.727;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1933,0:0,0,36,24 0/1:26,26:52:99:658,0,653:15,11,14,12 +chrX 2418328 . G A 2180 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=22.78;BaseQRankSum=1.745;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.991;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.78;ReadPosRankSum=1.595;SOR=1.047;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1458,0:0,0,27,19 0/1:24,27:51:99:752,0,616:13,11,18,9 +chrX 2418921 . AC A 4319.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=33.27;BaseQRankSum=1.699;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=6.927;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.27;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.860;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:3033,0:.:0,0,38,31 0|1:28,34:62:99:0|1:2418921_AC_A:1326,0,1035:2418921:12,16,21,13 +chrX 2418923 . C A 4329 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=33.27;BaseQRankSum=1.774;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=6.927;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.27;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.860;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:3033,0:.:0,0,38,31 0|1:28,34:62:99:0|1:2418921_AC_A:1326,0,1035:2418921:12,16,21,13 +chrX 2419892 . A G 2202 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=20.86;BaseQRankSum=-2.973;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.832;MQ=52.80;MQRankSum=-1.04;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.595;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1785,0:0,0,28,29 0/1:27,23:50:99:447,0,742:11,16,7,16 +chrX 2420151 . G C 3258 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=23.83;BaseQRankSum=0.957;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=3.724;MQ=59.71;MQRankSum=1.0;QD=23.83;ReadPosRankSum=-1.492;SOR=0.798;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2482,0:0,0,42,32 0/1:33,31:64:99:806,0,884:15,18,16,15 +chrX 2420811 . T G 2881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=22.57;BaseQRankSum=2.339;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=4.926;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=22.57;ReadPosRankSum=1.117;SOR=0.738;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1985,0:0,0,30,31 0/1:34,34:68:99:926,0,754:15,19,22,12 +chrX 2420855 . G A 1207 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=9.90;BaseQRankSum=0.626;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=13.104;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.734;SOR=0.954;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,35:61:99:307,0:11,15,20,15 0/1:30,34:64:99:930,0,766:12,18,21,13 +chrX 2421062 . T C 1184 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=10.20;BaseQRankSum=1.182;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.326;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.448;SOR=0.913;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,32:57:99:279,0:13,12,20,12 0/1:28,34:62:99:935,0,752:14,14,17,17 +chrX 2421076 . C G 2959 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=24.50;BaseQRankSum=-0.626;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.50;ReadPosRankSum=0.32;SOR=0.618;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2050,0:0,0,35,26 0/1:27,34:61:99:939,0,710:16,11,19,15 +chrX 2421650 . A G 3514 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=25.87;BaseQRankSum=-1.452;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.865;MQ=59.88;MQRankSum=1.319;QD=25.87;ReadPosRankSum=0.715;SOR=0.869;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2500,0:0,0,33,43 0/1:23,38:61:99:1044,0,596:11,12,17,21 +chrX 2421769 . C T 3277 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=23.13;BaseQRankSum=2.636;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=6.439;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.13;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.453;VarDP=143 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2245,0:0,0,37,36 0/1:31,39:70:99:1062,0,704:19,12,17,22 +chrX 2421911 . G C 3556 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=26.37;BaseQRankSum=1.002;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=3.111;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.37;ReadPosRankSum=-1.817;SOR=1.150;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2462,0:0,0,45,27 0/1:24,40:64:99:1124,0,567:13,11,26,14 +chrX 2421962 . C T 3357 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=24.90;BaseQRankSum=0.731;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=2.872;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.90;ReadPosRankSum=2.243;SOR=1.101;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2476,0:0,0,46,28 0/1:28,34:62:99:911,0,691:15,13,21,13 +chrX 2422178 . A G 2892 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=24.55;BaseQRankSum=0.404;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.876;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.547;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1985,0:0,0,24,37 0/1:24,34:58:99:937,0,600:9,15,16,18 +chrX 2422380 . A G 2474 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=20.69;BaseQRankSum=-2.577;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=11.591;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.173;SOR=0.282;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1880,0:0,0,28,30 0/1:35,28:63:99:624,0,968:24,11,14,14 +chrX 2423085 . A G 224 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=6.51;BaseQRankSum=0.966;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=-0.782;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.0;SOR=0.711;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,23:39:99:.:254,0:7,9,10,13 0/0:.:58:79:58:0,79,1095 +chrX 2423411 . CA C 2186.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=23.94;BaseQRankSum=-1.173;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=9.744;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.94;ReadPosRankSum=1.767;SOR=0.517;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1614,0:0,0,31,22 0/1:16,24:40:99:612,0,365:5,11,11,13 +chrX 2423485 . A G 2614 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=22.60;BaseQRankSum=0.886;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=4.257;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.834;SOR=1.125;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1916,0:0,0,41,21 0/1:27,28:55:99:728,0,679:13,14,13,15 +chrX 2423667 . G A 3281 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=25.27;BaseQRankSum=0.282;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=5.801;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.27;ReadPosRankSum=1.924;SOR=0.290;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2174,0:0,0,35,30 0/1:25,41:66:99:1137,0,596:17,8,22,19 +chrX 2423901 . C T 2727 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=24.18;BaseQRankSum=-0.218;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=8.577;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.18;ReadPosRankSum=-1.316;SOR=1.312;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1932,0:0,0,20,30 0/1:32,32:64:99:825,0,819:17,15,10,22 +chrX 2424521 . T C 2915 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=23.37;BaseQRankSum=-1.162;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=5.346;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.37;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=1.117;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1789,0:0,0,22,31 0/1:29,44:73:99:1156,0,735:15,14,17,27 +chrX 2424815 . G A 2677 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=22.75;BaseQRankSum=0.321;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.647;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.538;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1881,0:0,0,30,27 0/1:32,30:62:99:826,0,886:18,14,15,15 +chrX 2425142 . G GA 1590.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=16.98;BaseQRankSum=-0.889;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=1.127;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.264;SOR=0.662;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:995,0:0,0,17,22 0/1:26,31:57:99:635,0,490:12,14,16,15 +chrX 2425172 . C T 30 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=1.28;BaseQRankSum=0.49;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=-0.936;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.616;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,24:47:60:.:60,0:11,12,12,12 0/0:.:55:99:55:0,108,1390 +chrX 2425413 . T A 3325 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=26.42;BaseQRankSum=0.429;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=4.428;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.421;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2396,0:0,0,35,36 0/1:23,33:56:99:959,0,596:14,9,16,17 +chrX 2425572 . A G 975 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=8.31;BaseQRankSum=-0.125;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.798;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.498;SOR=0.330;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,39:70:99:190,0:12,19,19,20 0/1:21,30:51:99:815,0,537:6,15,13,17 +chrX 2428453 . G A 724 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=6.61;BaseQRankSum=0.656;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.496;MQ=59.40;MQRankSum=-1.127;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.25;SOR=0.864;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,28:53:94:94,0:13,12,18,10 0/1:35,26:61:99:660,0,889:19,16,13,13 +chrX 2429047 . G A 737 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=7.10;BaseQRankSum=1.018;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.719;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.772;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,28:52:99:120,0:13,11,12,16 0/1:29,27:56:99:647,0,671:13,16,17,10 +chrX 2429171 . G A 504 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.27;BaseQRankSum=-1.032;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.226;SOR=0.719;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:55:55:0,55 0/1:29,23:52:99:.:534,0,760:15,14,11,12 +chrX 2429205 . T A 719 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.98;BaseQRankSum=0.564;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=5.783;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.46;SOR=0.510;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:55:55:0,55 0/1:22,28:50:99:.:749,0,524:14,8,13,15 +chrX 2429451 . CT C 500.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=9.64;BaseQRankSum=1.331;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;MQRankSum=0;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.706;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:55:55:0,55 0/1:29,27:56:99:.:540,0,577:15,14,13,14 +chrX 2429478 . T C 766 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.05;BaseQRankSum=0.619;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.524;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.468;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:55:55:0,55 0/1:30,31:61:99:.:796,0,741:12,18,16,15 +chrX 2429626 . ATT A 1017.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=22.02;BaseQRankSum=2.696;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=6.457;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.02;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.169;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:55:55:0,55 0/1:18,30:48:99:.:1057,0,554:5,13,15,15 +chrX 2430195 . C T 648 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.56;BaseQRankSum=1.593;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.735;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:55:55:0,55 0/1:28,26:54:99:.:678,0,672:18,10,17,9 +chrX 2430258 . C CA 283.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=4.31;BaseQRankSum=0.686;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=4.501;MQ=59.55;MQRankSum=0.168;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.694;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,24:43:65:65,0:11,8,9,15 0/1:14,18:32:99:258,0,231:8,6,10,8 +chrX 2430729 . T C 841 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.28;BaseQRankSum=-2.405;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=7.618;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.065;SOR=1.579;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,115 0/1:23,34:57:99:.:871,0,604:11,12,23,11 +chrX 2431326 . C A,CAA 453 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,17;AS_QD=0.00,16.10;BaseQRankSum=-1.513;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;MQRankSum=0;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.881;SOR=0.509;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,115,115 0/2:13,1,17:31:99:.:483,518,1138,0,361,356:8,5,10,8 +chrX 2431344 . CA C 507.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.68;BaseQRankSum=-1.472;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.627;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,115 0/1:18,22:40:99:.:547,0,417:11,7,13,9 +chrX 2431802 . G A 1050 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=10.29;BaseQRankSum=1.866;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.822;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.29;ReadPosRankSum=0;SOR=0.379;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,32:53:99:397,0:14,7,19,13 0/1:27,25:52:99:683,0,732:16,11,11,14 +chrX 2435461 . GA G 393.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=8.66;BaseQRankSum=1.869;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=4.127;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.404;SOR=1.382;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,326 0/1:27,23:50:99:.:433,0,505:15,12,16,7 +chrX 2435698 . A G 796 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.33;BaseQRankSum=-0.585;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;MQRankSum=0.958;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.447;SOR=0.773;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,326 0/1:36,31:67:99:.:826,0,1034:17,19,14,17 +chrX 2436003 . A G 2553 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=23.48;BaseQRankSum=0.948;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=8.759;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.505;SOR=0.722;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1850,0:0,0,25,30 0/1:28,27:55:99:733,0,738:17,11,11,16 +chrX 2436209 . C T 471 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.22;BaseQRankSum=-0.998;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=9.282;MQ=59.40;MQRankSum=1.025;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=1.645;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1542 0/1:21,20:41:99:.:501,0,587:12,9,6,14 +chrX 2436275 . G A 464 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.23;BaseQRankSum=0.875;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.813;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1542 0/1:25,19:44:99:.:494,0,658:19,6,15,4 +chrX 2436461 . A ATATTAT,ATATTATTAT 555.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=29,0;AS_QD=9.30,1.46;BaseQRankSum=0.052;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.454;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.30;ReadPosRankSum=-2.029;SOR=0.720;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,19,0:41:99:131,0,828:14,8,8,11 0/1:13,10,0:23:99:464,0,511,413,542,952:6,7,5,5 +chrX 2436497 . TTAC T 426.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=12;AS_QD=18.64;BaseQRankSum=1.041;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.64;ReadPosRankSum=-0.681;SOR=0.859;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:56:.:56:.:.:0,0 0|1:13,12:25:99:.:0|1:2436497_TTAC_T:466,0,474:2436497:6,7,5,7 +chrX 2436500 . C T,* 2412 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=38,12;AS_QD=30.45,0.00;BaseQRankSum=3.479;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=47.88;ReadPosRankSum=-1.436;SOR=0.336;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28,0:28:99:.:.:1092,0,1086:.:0,0,8,11 1|2:1,10,12:23:99:1|0:2436497_TTAC_T:1350,534,511,443,0,464:2436497:0,1,10,12 +chrX 2436703 . T C 2358 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=23.18;BaseQRankSum=-0.295;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=5.792;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=0.459;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1866,0:0,0,28,29 0/1:26,20:46:99:522,0,746:10,16,12,8 +chrX 2437135 . T C 3074 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=24.06;BaseQRankSum=1.448;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=2.757;MQ=59.57;MQRankSum=-1.084;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.447;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,77:77:99:2471,0:0,0,39,38 0/1:29,23:52:99:633,0,802:17,12,12,11 +chrX 2437289 . A G 3682 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=30.93;BaseQRankSum=3.041;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=-0.199;QD=30.93;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.955;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,58:60:99:1877,0:1,1,24,34 1/1:0,60:60:99:1835,179,0:0,0,28,32 +chrX 2437619 . AG A 3360.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=28.74;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=36.96;SOR=0.782;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1646,0:0,0,21,24 1/1:0,47:47:99:1754,141,0:0,0,23,24 +chrX 2437696 . AGAGTGTGTGTGTGTGTGT A,AGTGTGT 420.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,18;AS_QD=0.00,11.79;BaseQRankSum=1.078;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=13.081;MQ=59.72;MQRankSum=1.363;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.028;SOR=2.261;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:43:99:43:0,1256,1256 0/2:21,0,18:39:99:.:460,604,1789,0,648,952:12,9,4,14 +chrX 2437698 . AGTGTGTGTGTGTGTGT A,*,AGTGTGT 3316.97 . AC=2,1,0;AF=0.667,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=50,18,0;AS_QD=30.66,0.00,30.64;BaseQRankSum=-0.311;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=4.239;MQ=59.37;MQRankSum=-0.118;QD=48.64;ReadPosRankSum=-1.597;SOR=1.136;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,37,0,0:38:99:1606,0,1637,1637:1,0,15,22 1/2:0,13,18,0:31:99:1750,952,1202,414,0,473,1406,782,420,1522:0,0,10,21 +chrX 2438008 . G GAA 2890.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=29.67;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.73;SOR=0.846;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1395,0:0,0,26,13 1/1:0,43:43:99:1535,129,0:0,0,18,25 +chrX 2438178 . GA G 1973.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=23.68;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=23.68;SOR=0.581;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,37:38:99:868,0:0,1,16,21 1/1:0,47:47:99:1145,141,0:0,0,14,33 +chrX 2438306 . T TACACACAC,TACACACACAC,C 2598 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=44,16,0;AS_QD=27.47,16.79,1.23;BaseQRankSum=-0.474;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=8.086;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.56;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.202;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44,0,0:44:99:1923,0,1924,1924:0,0,22,22 0/2:26,0,16,0:42:99:705,808,2088,0,1112,1025,673,1986,1104,2173:18,8,8,8 +chrX 2438446 . T G 3792 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=31.33;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=31.33;SOR=0.906;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2023,0:0,0,37,28 1/1:0,57:57:99:1799,170,0:0,0,30,27 +chrX 2438672 . T TAA,TA 2829.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=78,17;AS_QD=33.12,33.01;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=30.20;SOR=0.999;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52,0:52:99:1697,0,1698:0,0,37,15 1/2:0,26,17:43:99:1172,370,286,590,0,469:0,0,17,26 +chrX 2438973 . T C 3353 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=32.53;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=32.53;SOR=0.946;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1775,0:0,0,27,29 1/1:0,48:48:99:1608,144,0:0,0,19,29 +chrX 2439516 . G A 3526 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=30.92;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.92;SOR=0.984;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1862,0:0,0,23,38 1/1:0,54:54:99:1694,161,0:0,0,27,27 +chrX 2439878 . G T 2836 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=22.75;BaseQRankSum=-1.093;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.670;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.415;SOR=0.798;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2079,0:0,0,33,31 0/1:31,31:62:99:787,0,848:16,15,11,20 +chrX 2440099 . T A 3819 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=32.90;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.90;SOR=0.978;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2006,0:0,0,21,40 1/1:0,56:56:99:1843,168,0:0,0,30,26 +chrX 2442048 . T C 4648 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=34.65;BaseQRankSum=-0.566;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=34.65;ReadPosRankSum=-0.41;SOR=0.289;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,75:76:99:.:.:2356,0:.:0,1,33,42 1|1:0,59:59:99:0|1:2442048_T_C:2322,177,0:2442048:0,0,29,30 +chrX 2442062 . A G 1054 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=16.94;BaseQRankSum=-0.274;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.978;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.790;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:60:99:60:.:.:0,1732 0|1:25,39:64:99:.:0|1:2442048_T_C:1084,0,606:2442048:12,13,21,18 +chrX 2442260 . T C 3506 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.15;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.15;SOR=1.445;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1722,0:0,0,36,17 1/1:0,57:57:99:1814,170,0:0,0,35,22 +chrX 2442700 . A G 3269 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=32.34;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.34;SOR=1.157;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1657,0:0,0,19,32 1/1:0,51:51:99:1642,152,0:0,0,22,29 +chrX 2443425 . G C 709 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.32;BaseQRankSum=2.215;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.516;SOR=0.705;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1033 0/1:33,27:60:99:.:739,0,850:16,17,13,14 +chrX 2444010 . G A,GA 268 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,16;AS_QD=2.69,8.51;BaseQRankSum=-0.539;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.210;MQ=58.94;MQRankSum=-1.86;QD=7.10;ReadPosRankSum=-2.086;SOR=0.895;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1033,1033 0/2:19,7,16:42:99:.:298,228,1100,0,311,336:10,9,10,13 +chrX 2444458 . T C 3521 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=31.99;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.99;SOR=0.825;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2094,0:0,0,34,30 1/1:0,47:47:99:1457,140,0:0,0,18,29 +chrX 2445487 . T A 1634 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=30.25;BaseQRankSum=-0.51;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=3.602;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.221;SOR=0.707;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,252 1/1:1,54:55:99:.:1664,129,0:0,1,31,23 +chrX 2445560 . C T 2262 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=30.97;BaseQRankSum=2.234;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.97;ReadPosRankSum=-1.241;SOR=0.340;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,252 1/1:1,73:74:99:.:2292,211,0:1,0,41,32 +chrX 2445874 . T G 799 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.07;BaseQRankSum=-0.032;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.142;MQ=59.31;MQRankSum=-1.184;QD=15.07;ReadPosRankSum=2.083;SOR=0.508;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,252 0/1:23,32:55:99:.:829,0,550:6,17,10,22 +chrX 2445915 . C A 968 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.84;BaseQRankSum=-0.867;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=7.262;MQ=59.36;MQRankSum=0.299;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.197;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,252 0/1:26,37:63:99:.:998,0,652:7,19,17,20 +chrX 2446094 . G C 548 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.80;BaseQRankSum=-1.704;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=10.571;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.99;SOR=0.746;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,252 0/1:25,24:49:99:.:578,0,698:17,8,10,14 +chrX 2446339 . G A 731 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.90;BaseQRankSum=0.546;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.053;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.236;SOR=0.951;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,252 0/1:30,29:59:99:.:761,0,858:19,11,20,9 +chrX 2446475 . G A 649 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.35;BaseQRankSum=0.681;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.268;MQ=59.70;MQRankSum=-0.982;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.550;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,252 0/1:28,27:55:99:.:679,0,714:12,16,14,13 +chrX 2447559 . C T 2143 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=32.92;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.92;SOR=0.886;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2173,0:0,0,30,36 0/0:.:60:23:59:0,23,1216 +chrX 2447683 . G A 1401 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=33.28;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.24;QD=33.28;SOR=1.455;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1431,0:0,0,15,28 0/0:.:60:23:59:0,23,1216 +chrX 2447728 . A G 717 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=25.86;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.54;QD=35.57;SOR=1.828;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:747,0:0,0,6,15 0/0:.:60:23:59:0,23,1216 +chrX 2447749 . A G 438 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=27.92;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.92;QD=36.00;SOR=2.147;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,13:13:99:.:468,0:0,0,3,10 0/0:.:60:23:59:0,23,1216 +chrX 2447769 . A G 799 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.02;BaseQRankSum=2.222;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=4.324;MQ=57.77;MQRankSum=-0.901;QD=18.02;ReadPosRankSum=-1.125;SOR=0.944;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,6:6:99:229,0:0,0,2,4 0/1:19,21:40:99:600,0,490:11,8,9,12 +chrX 2447787 . A C 55 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=34.98;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=40.00;QD=42.50;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,2:2:85:.:85,0:0,0,0,2 0/0:.:41:71:41:0,71,1191 +chrX 2447788 . T A 55 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=29.97;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=40.00;QD=42.50;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,2:2:85:.:85,0:0,0,0,2 0/0:.:41:71:41:0,71,1191 +chrX 2447802 . G A 909 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=18.41;BaseQRankSum=2.864;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=1.069;MQ=58.68;MQRankSum=-2.962;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.786;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:3:35:1:.:.:0,35 0|1:25,26:51:99:.:0|1:2447802_G_A:939,0,879:2447802:13,12,12,14 +chrX 2447822 . C T 1051 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=19.65;BaseQRankSum=1.13;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=1.028;MQ=57.25;MQRankSum=-3.887;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.892;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:3:35:1:.:.:0,35 0|1:24,31:55:99:.:0|1:2447802_G_A:1081,0,842:2447802:12,12,17,14 +chrX 2447835 . A C 251 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=31.22;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=32.85;QD=31.22;SOR=0.892;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,9:9:99:.:281,0:0,0,5,4 0/0:.:53:99:53:0,120,1800 +chrX 2447871 . CTTCA C 1896.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=28.47;BaseQRankSum=0.771;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=3.630;MQ=53.73;MQRankSum=-4.223;QD=28.47;ReadPosRankSum=0.15;SOR=0.741;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,15:15:99:.:.:655,0:.:0,0,10,5 0|1:21,32:53:99:0|1:2447871_CTTCA_C:1281,0,785:2447871:9,12,16,16 +chrX 2447878 . A G 1905 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=28.46;BaseQRankSum=0.988;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=3.630;MQ=53.73;MQRankSum=-4.223;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.555;SOR=0.741;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,15:15:99:.:.:655,0:.:0,0,10,5 0|1:21,32:53:99:0|1:2447871_CTTCA_C:1280,0,785:2447871:9,12,16,16 +chrX 2447887 . T G 1209 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=23.83;BaseQRankSum=-0.253;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=2.350;MQ=56.86;MQRankSum=-4.306;QD=23.83;ReadPosRankSum=1.642;SOR=0.543;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:25:99:25:.:.:0,530 0|1:21,31:52:99:.:0|1:2447871_CTTCA_C:1239,0,778:2447871:9,12,16,15 +chrX 2447930 . T C 2314 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=24.16;BaseQRankSum=-0.031;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.836;MQ=55.08;MQRankSum=-0.984;QD=24.16;ReadPosRankSum=1.736;SOR=0.533;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32:33:99:1395,0:1,0,19,13 0/1:29,35:64:99:949,0,766:17,12,18,17 +chrX 2447935 . C G 1365 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=29.13;BaseQRankSum=-0.211;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.63;MQRankSum=-0.984;QD=42.27;ReadPosRankSum=1.734;SOR=0.412;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,32:33:99:.:1395,0:1,0,19,13 0/0:.:57:99:57:0,113,1594 +chrX 2447945 . A T 1500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=32.80;BaseQRankSum=-0.121;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.38;MQRankSum=-0.875;QD=42.50;ReadPosRankSum=1.397;SOR=0.430;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,35:36:99:.:1530,0:1,0,21,14 0/0:.:57:99:57:0,113,1594 +chrX 2447946 . A G 1500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=30.34;BaseQRankSum=-0.201;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.63;MQRankSum=-0.875;QD=42.50;ReadPosRankSum=1.348;SOR=0.430;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,35:36:99:.:1530,0:1,0,21,14 0/0:.:57:99:57:0,113,1594 +chrX 2448057 . G A 1213 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=21.43;BaseQRankSum=1.514;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.012;MQ=59.98;MQRankSum=-0.867;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.701;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:38:60:37:.:.:0,60 0|1:26,32:58:99:.:0|1:2448057_G_A:1243,0,943:2448057:14,12,15,17 +chrX 2448062 . G A 1154 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=21.53;BaseQRankSum=1.435;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=59.98;MQRankSum=-0.876;QD=21.53;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.764;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:38:60:37:.:.:0,60 0|1:25,30:55:99:.:0|1:2448057_G_A:1184,0,928:2448057:13,12,14,16 +chrX 2448073 . T G 1093 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=32.09;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.91;QD=32.09;SOR=1.148;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1123,0:0,0,21,14 0/0:.:56:99:56:0,110,1594 +chrX 2448118 . A G 846 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=28.26;BaseQRankSum=-0.617;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=4.500;MQ=51.02;MQRankSum=-0.797;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.84;SOR=1.360;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,30:31:99:.:876,0:0,1,20,10 0/0:.:56:99:56:0,110,1594 +chrX 2448155 . T C 1509 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=32.20;BaseQRankSum=-0.406;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.798;MQ=52.17;MQRankSum=-0.918;QD=40.50;ReadPosRankSum=-1.643;SOR=2.159;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,37:38:99:.:1539,0:0,1,28,9 0/0:.:56:99:56:0,110,1594 +chrX 2448163 . T C 1549 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=30.16;BaseQRankSum=4.185;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.798;MQ=52.03;MQRankSum=-0.958;QD=41.55;ReadPosRankSum=-1.635;SOR=2.159;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,37:38:99:.:1579,0:0,1,28,9 0/0:.:56:99:56:0,110,1594 +chrX 2448167 . A ATC 1400.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=33.88;BaseQRankSum=0;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=6.284;MQ=51.04;MQRankSum=-1.052;QD=42.35;ReadPosRankSum=-1.63;SOR=2.455;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,33:34:99:.:1440,0:0,1,26,7 0/0:.:56:99:56:0,110,1594 +chrX 2448172 . CAT C 1344.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=28.21;BaseQRankSum=-0.129;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=6.154;MQ=51.78;MQRankSum=-1.033;QD=41.94;ReadPosRankSum=-1.41;SOR=2.381;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,32:33:99:.:1384,0:0,1,25,7 0/0:.:56:99:56:0,110,1594 +chrX 2448372 . C G 4541 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=34.63;BaseQRankSum=2.176;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=1.832;MQ=58.91;MQRankSum=-1.531;QD=34.63;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.936;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,77:77:99:.:.:3393,0:.:0,0,34,43 0|1:24,31:55:99:0|1:2448372_C_G:1178,0,873:2448372:12,12,14,17 +chrX 2448376 . A G 3397 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=26.39;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.79;QD=43.94;SOR=0.914;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,78:78:99:.:3427,0:0,0,35,43 0/0:.:54:99:54:0,120,1800 +chrX 2448394 . A T 3588 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=27.20;BaseQRankSum=0.55;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=4.072;MQ=58.04;MQRankSum=-2.635;QD=27.20;ReadPosRankSum=1.553;SOR=0.747;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,76:76:99:.:.:2460,0:.:0,0,33,43 0|1:27,30:57:99:0|1:2448372_C_G:1158,0,1002:2448372:15,12,15,15 +chrX 2448414 . C G 3476 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=27.83;BaseQRankSum=0.171;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=10.068;MQ=56.50;MQRankSum=-2.845;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.678;SOR=0.787;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:2299,0:.:0,0,30,42 0|1:22,32:54:99:0|1:2448372_C_G:1207,0,816:2448372:14,8,14,18 +chrX 2448467 . A G 3148 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=33.10;BaseQRankSum=-0.809;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=13.313;MQ=54.29;MQRankSum=-3.761;QD=33.10;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.583;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2288,0:.:0,0,22,30 0|1:21,23:44:99:0|1:2448467_A_G:890,0,811:2448467:15,6,11,12 +chrX 2448472 . G C 3023 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=33.18;BaseQRankSum=-0.573;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=15.971;MQ=54.14;MQRankSum=-3.858;QD=33.18;ReadPosRankSum=0.729;SOR=0.707;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2195,0:.:0,0,20,29 0|1:21,22:43:99:0|1:2448467_A_G:858,0,814:2448467:15,6,10,12 +chrX 2448506 . T C 2267 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=30.63;BaseQRankSum=-1.03;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=24.555;MQ=51.25;MQRankSum=-4.392;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=0.821;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,38:38:99:.:.:1664,0:.:0,0,16,22 0|1:20,17:37:99:0|1:2448506_T_C:633,0,778:2448506:16,4,6,11 +chrX 2448513 . AAG A 2281.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=30.95;BaseQRankSum=1.284;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=19.666;MQ=51.40;MQRankSum=-4.815;QD=30.95;ReadPosRankSum=-2.101;SOR=0.643;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1754,0:.:0,0,17,22 0|1:21,15:36:99:0|1:2448506_T_C:567,0,826:2448506:16,5,6,9 +chrX 2448516 . G GAA 2284.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=31.41;BaseQRankSum=-0.166;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=21.076;MQ=51.27;MQRankSum=-4.722;QD=31.41;ReadPosRankSum=-2.137;SOR=0.623;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1754,0:.:0,0,17,22 0|1:20,15:35:99:0|1:2448506_T_C:570,0,795:2448506:16,4,6,9 +chrX 2448523 . G A 2138 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=30.97;BaseQRankSum=0.915;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=21.655;MQ=50.73;MQRankSum=-5.029;QD=30.97;ReadPosRankSum=-2.725;SOR=0.734;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,38:38:99:.:.:1679,0:.:0,0,16,22 0|1:19,13:32:99:0|1:2448506_T_C:489,0,759:2448506:15,4,5,8 +chrX 2448531 . T A 1804 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=28.66;BaseQRankSum=0.83;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=22.200;MQ=50.87;MQRankSum=-4.944;QD=28.66;ReadPosRankSum=-2.09;SOR=0.820;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33:33:99:.:.:1398,0:.:0,0,13,20 0|1:19,12:31:99:0|1:2448506_T_C:436,0,739:2448506:15,4,5,7 +chrX 2448561 . G C 2045 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=27.30;BaseQRankSum=1.422;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.992;MQ=55.76;MQRankSum=-3.372;QD=27.30;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.655;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,36:36:99:.:.:1610,0:.:0,0,16,20 0|1:27,13:40:99:0|1:2448561_G_C:465,0,1095:2448561:15,12,7,6 +chrX 2448563 . T A 2135 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=27.76;BaseQRankSum=1.47;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.976;MQ=56.04;MQRankSum=-3.372;QD=27.76;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.649;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,38:38:99:.:.:1700,0:.:0,0,17,21 0|1:27,13:40:99:0|1:2448561_G_C:465,0,1095:2448561:15,12,7,6 +chrX 2448571 . G A 2085 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=26.11;BaseQRankSum=1.012;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.877;MQ=57.55;MQRankSum=-2.608;QD=26.11;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.621;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,36:36:99:.:.:1620,0:.:0,0,16,20 0|1:31,14:45:99:0|1:2448561_G_C:495,0,1260:2448561:17,14,8,6 +chrX 2448576 . T A 2117 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=26.18;BaseQRankSum=0.539;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.845;MQ=57.70;MQRankSum=-2.608;QD=26.18;ReadPosRankSum=0.871;SOR=0.573;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,37:37:99:.:.:1652,0:.:0,0,17,20 0|1:31,14:45:99:0|1:2448561_G_C:495,0,1260:2448561:17,14,8,6 +chrX 2448583 . T C 2277 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=26.83;BaseQRankSum=-1.302;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.844;MQ=57.84;MQRankSum=-2.398;QD=26.83;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.576;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,40:40:99:.:.:1746,0:.:0,0,18,22 0|1:30,16:46:99:0|1:2448561_G_C:561,0,1212:2448561:16,14,10,6 +chrX 2449045 . T C 2383 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=23.20;BaseQRankSum=-2.445;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=23.20;ReadPosRankSum=-0.45;SOR=0.693;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1960,0:0,0,32,28 0/1:25,19:44:99:453,0,727:12,13,6,13 +chrX 2449138 . A G 2282 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=23.35;BaseQRankSum=0.717;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.970;MQ=59.66;MQRankSum=0.721;QD=23.35;ReadPosRankSum=0.436;SOR=1.059;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:1866,0:.:0,0,37,20 0|1:29,13:42:99:0|1:2449138_A_G:446,0,1168:2449138:16,13,7,6 +chrX 2449141 . A G 385 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=10.12;BaseQRankSum=1.039;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=0.697;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.791;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:45:99:45:.:.:0,1245 0|1:29,12:41:99:.:0|1:2449138_A_G:415,0,1171:2449138:16,13,7,5 +chrX 2449189 . CAA C 1687.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=23.34;BaseQRankSum=1.617;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=17.119;MQ=59.59;MQRankSum=0;QD=23.34;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=1.756;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1233,0:0,0,24,10 0/1:23,17:40:99:494,0,675:9,14,12,5 +chrX 2449218 . C T 1720 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=20.83;BaseQRankSum=3.933;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=23.139;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.887;SOR=1.716;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,40:42:99:1315,0:2,0,27,13 0/1:25,17:42:99:435,0,732:8,17,13,4 +chrX 2449262 . A C 2160 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=22.12;BaseQRankSum=0.041;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=7.600;MQ=57.86;MQRankSum=-2.996;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.531;SOR=1.300;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1692,0:0,0,33,19 0/1:28,19:47:99:498,0,802:13,15,12,7 +chrX 2449536 . C T 3177 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=26.50;BaseQRankSum=-0.037;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.314;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.50;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=1.161;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2348,0:0,0,44,26 0/1:21,30:51:99:859,0,576:11,10,18,12 +chrX 2449653 . A G 2823 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=25.70;BaseQRankSum=0.985;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.952;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.70;ReadPosRankSum=-0.885;SOR=0.546;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2114,0:0,0,34,32 0/1:19,26:45:99:739,0,455:11,8,15,11 +chrX 2449734 . G A 57 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=1.12;BaseQRankSum=-0.463;DP=149;ExcessHet=0.0000;FS=4.295;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.912;SOR=0.458;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:37,41:78:87:.:87,0:22,15,20,21 0/0:.:68:99:68:0,120,1800 +chrX 2449749 . A G 722 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.13;BaseQRankSum=-1.215;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=3.514;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.6;SOR=0.711;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:83:99:83:0,1800 0/1:33,29:62:99:.:752,0,921:19,14,13,16 +chrX 2449991 . A G 2634 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=23.58;BaseQRankSum=-0.534;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.850;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.58;ReadPosRankSum=1.328;SOR=0.764;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2005,0:0,0,27,33 0/1:28,25:53:99:659,0,774:15,13,12,13 +chrX 2450101 . A G 2887 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=24.31;BaseQRankSum=1.034;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=9.147;MQ=59.89;MQRankSum=-1.148;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=1.208;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2405,0:0,0,28,46 0/1:27,19:46:99:512,0,757:15,12,7,12 +chrX 2450127 . CA C 2045.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=20.05;BaseQRankSum=0.414;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=5.925;MQ=59.89;MQRankSum=-1.189;QD=20.05;ReadPosRankSum=0.94;SOR=1.099;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1727,0:0,0,24,37 0/1:26,17:43:99:358,0,612:14,12,7,10 +chrX 2450150 . CAATA C 3033.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=30.13;BaseQRankSum=2.172;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.13;ReadPosRankSum=1.775;SOR=0.659;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:2575,0:0,0,25,33 0/1:30,14:44:99:498,0,1192:13,17,7,7 +chrX 2450232 . G A 2892 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=24.55;BaseQRankSum=1.169;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.952;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.886;SOR=0.529;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2226,0:0,0,34,34 0/1:26,25:51:99:696,0,699:11,15,14,11 +chrX 2450888 . A G 2457 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=23.69;BaseQRankSum=1.302;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.853;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.69;ReadPosRankSum=1.292;SOR=0.675;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1994,0:0,0,32,29 0/1:25,19:44:99:493,0,667:12,13,9,10 +chrX 2450921 . T C 2481 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=22.83;BaseQRankSum=0.092;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=4.124;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.83;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.436;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1985,0:0,0,32,30 0/1:27,21:48:99:526,0,714:11,16,10,11 +chrX 2451233 . TA T,TAA 897.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=32,14;AS_QD=17.05,9.21;BaseQRankSum=0.449;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;MQRankSum=5.834;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.693;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32,0:33:99:716,0,738:0,1,14,18 0/2:9,0,14:23:99:221,248,418,0,170,128:4,5,5,9 +chrX 2451349 . T C 2687 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=25.39;BaseQRankSum=2.781;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=25.39;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.716;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,63:64:99:2084,0:0,1,29,34 0/1:19,24:43:99:633,0,509:10,9,15,9 +chrX 2451709 . A G 3296 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=24.82;BaseQRankSum=1.265;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=2.764;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.82;ReadPosRankSum=0.787;SOR=0.920;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2436,0:0,0,36,37 0/1:29,32:61:99:890,0,725:15,14,10,22 +chrX 2452068 . G T 2299 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=21.17;BaseQRankSum=-0.015;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.766;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.17;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.895;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1753,0:0,0,22,35 0/1:31,22:53:99:576,0,860:16,15,13,9 +chrX 2452134 . C T 2382 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=20.62;BaseQRankSum=3.627;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.777;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.608;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,56:60:99:1716,0:1,3,23,33 0/1:28,29:57:99:696,0,733:16,12,19,10 +chrX 2452232 . T C 2377 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=21.88;BaseQRankSum=-1.853;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.88;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.742;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1662,0:0,0,27,26 0/1:28,29:57:99:745,0,772:14,14,13,16 +chrX 2452444 . T A 2969 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.57;BaseQRankSum=-0.05;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.925;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.57;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.566;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1704,0:.:0,0,25,14 0|1:23,33:56:99:0|1:2452444_T_A:1295,0,856:2452444:15,8,19,14 +chrX 2452453 . G A 2954 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.41;BaseQRankSum=0.878;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.41;ReadPosRankSum=0.05;SOR=0.698;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1724,0:.:0,0,24,15 0|1:24,32:56:99:0|1:2452444_T_A:1260,0,880:2452444:15,9,20,12 +chrX 2452676 . T G 3802 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=29.48;BaseQRankSum=-0.256;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.48;ReadPosRankSum=-1.051;SOR=0.693;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2575,0:.:0,0,29,31 0|1:36,34:70:99:0|1:2452676_T_G:1257,0,1387:2452676:18,18,18,16 +chrX 2452694 . A G 3654 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=28.12;BaseQRankSum=-2.369;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=1.508;MQ=59.88;MQRankSum=0;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.557;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,56:56:99:.:.:2383,0:.:0,0,27,29 0|1:39,36:75:99:0|1:2452676_T_G:1301,0,1456:2452676:21,18,19,17 +chrX 2452743 . G T 2618 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=20.53;BaseQRankSum=2.487;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.469;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=20.53;ReadPosRankSum=2.115;SOR=0.964;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,54:55:99:1737,0:0,1,33,21 0/1:40,34:74:99:911,0,944:20,20,17,17 +chrX 2452822 . A G 2525 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=19.65;BaseQRankSum=1.436;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.366;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.65;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.467;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2033,0:0,0,34,30 0/1:45,21:66:99:522,0,1286:19,26,9,12 +chrX 2453542 . T C 2122 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=22.42;BaseQRankSum=-0.408;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=17.492;MQ=58.88;MQRankSum=-0.872;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.492;SOR=0.419;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1379,0:0,0,23,20 0/1:24,29:53:99:773,0,635:6,18,16,13 +chrX 2453754 . T C 1421 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=34.55;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;QD=34.55;SOR=0.693;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1451,0:0,0,21,21 0/0:.:56:80:56:0,80,1300 +chrX 2453767 . A G 511 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.24;BaseQRankSum=-0.239;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=4.655;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.255;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1264 0/1:18,20:38:99:.:541,0,481:12,6,10,10 +chrX 2454179 . G T 3365 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=23.41;BaseQRankSum=-1.062;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=0.745;MQ=58.79;MQRankSum=-1.921;QD=23.41;ReadPosRankSum=0.856;SOR=0.813;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,83:83:99:2703,0:0,0,49,34 0/1:34,28:62:99:692,0,936:20,14,19,9 +chrX 2454255 . T G 3341 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=23.41;BaseQRankSum=-0.117;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=2.612;MQ=58.23;MQRankSum=-1.596;QD=23.41;ReadPosRankSum=-1.734;SOR=0.573;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2361,0:0,0,38,36 0/1:32,38:70:99:1010,0,821:18,14,16,22 +chrX 2454352 . C T 2962 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=21.84;BaseQRankSum=-0.97;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=2.436;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=21.84;ReadPosRankSum=-2.022;SOR=0.876;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2029,0:0,0,28,33 0/1:39,37:76:99:963,0,1063:20,19,16,21 +chrX 2454527 . C CAA 1999.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=21.46;BaseQRankSum=-0.258;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;MQRankSum=0;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.693;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1623,0:0,0,20,28 0/1:31,16:47:99:416,0,937:14,17,9,7 +chrX 2454627 . A C 2064 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=19.75;BaseQRankSum=-1.212;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=6.591;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.515;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1717,0:0,0,27,26 0/1:36,17:53:99:377,0,1060:14,22,10,7 +chrX 2454840 . T C 3726 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=30.54;BaseQRankSum=-2.877;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=5.633;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.476;SOR=0.953;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,69:69:99:.:.:2858,0:.:0,0,42,27 0|1:27,27:54:99:0|1:2454840_T_C:898,0,960:2454840:12,15,14,13 +chrX 2454865 . A C 3504 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=31.27;BaseQRankSum=-1.963;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.779;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=31.27;ReadPosRankSum=0.34;SOR=0.791;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2676,0:.:0,0,36,26 0|1:26,25:51:99:0|1:2454840_T_C:858,0,945:2454840:11,15,13,12 +chrX 2455112 . C CA 1301.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=16.56;BaseQRankSum=-0.335;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.076;MQ=59.61;MQRankSum=0;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.001;SOR=1.016;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:885,0:0,0,21,13 0/1:24,23:47:99:456,0,480:14,10,16,7 +chrX 2455192 . G C 1677 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=31.04;BaseQRankSum=-0.392;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.786;MQ=59.57;MQRankSum=0;QD=31.04;ReadPosRankSum=-1.513;SOR=0.837;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,54:55:99:.:1707,0:1,0,22,32 0/0:.:69:99:69:0,120,1800 +chrX 2455234 . T C 2618 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=21.70;BaseQRankSum=1.902;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.001;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.986;SOR=1.179;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,57:58:99:1837,0:1,0,22,35 0/1:33,31:64:99:811,0,890:16,17,13,18 +chrX 2455561 . A G 2397 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=22.06;BaseQRankSum=1.054;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.782;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.582;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,64:65:99:2086,0:1,0,31,33 0/1:31,14:45:99:341,0,882:16,15,8,6 +chrX 2455741 . C CA,CAA 277.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,7;AS_QD=10.87,13.21;BaseQRankSum=0.28;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.515;MQ=58.95;MQRankSum=-1.076;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.392;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,555,555 0/2:17,6,7:30:67:.:317,67,315,0,215,404:12,5,8,5 +chrX 2455788 . C T 3263 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=32.60;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=32.60;SOR=0.930;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1790,0:0,0,27,28 1/1:0,46:46:99:1503,137,0:0,0,18,28 +chrX 2456613 . CA C,CAA 410.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=15,23;AS_QD=2.41,8.76;BaseQRankSum=-1.304;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=6.006;MQ=59.59;MQRankSum=0;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.214;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,15,0:27:82:82,0,344:8,4,8,7 0/2:7,0,23:30:62:368,389,520,0,130,62:6,1,13,10 +chrX 2457202 . G A 623 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.53;BaseQRankSum=1.007;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.237;SOR=0.659;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,506 0/1:37,25:62:99:.:653,0,1005:21,16,14,11 +chrX 2457686 . A G 875 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=18.85;BaseQRankSum=0.016;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=6.662;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.711;SOR=1.387;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,506 0/1:16,32:48:99:.:905,0,379:7,9,21,11 +chrX 2458073 . T A 777 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.16;BaseQRankSum=-0.407;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=7.296;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.593;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,506 0/1:28,29:57:99:.:807,0,781:18,10,13,16 +chrX 2458108 . G C 1320 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=22.13;BaseQRankSum=2.147;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.017;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.13;ReadPosRankSum=-1.147;SOR=0.503;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,506 0|1:24,37:61:99:.:0|1:2458108_G_C:1350,0,901:2458108:15,9,21,16 +chrX 2458109 . G C 1320 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=22.13;BaseQRankSum=1.445;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.017;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.13;ReadPosRankSum=-1.255;SOR=0.503;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,506 0|1:24,37:61:99:.:0|1:2458108_G_C:1350,0,901:2458108:15,9,21,16 +chrX 2458181 . A G 1061 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=19.48;BaseQRankSum=-1.034;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.262;SOR=0.693;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,506 0|1:28,28:56:99:.:0|1:2458181_A_G:1091,0,1061:2458181:18,10,18,10 +chrX 2458185 . T C 1061 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=19.48;BaseQRankSum=0.521;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.844;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,506 0|1:28,28:56:99:.:0|1:2458181_A_G:1091,0,1061:2458181:17,11,18,10 +chrX 2458282 . A G 1385 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=20.81;BaseQRankSum=-0.549;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.318;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=0.986;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,506 0|1:32,36:68:99:.:0|1:2458282_A_G:1415,0,1215:2458282:15,17,21,15 +chrX 2458288 . T C 1500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=21.55;BaseQRankSum=0.186;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=3.193;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.55;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=0.885;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,506 0|1:32,39:71:99:.:0|1:2458282_A_G:1530,0,1206:2458282:15,17,22,17 +chrX 2458303 . T G 1394 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=19.51;BaseQRankSum=-0.211;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.926;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.567;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,506 0|1:36,37:73:99:.:0|1:2458282_A_G:1424,0,1348:2458282:16,20,19,18 +chrX 2458450 . A G 1049 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=14.01;BaseQRankSum=-0.111;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=1.876;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.468;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,506 0/1:37,40:77:99:.:1079,0,982:21,16,20,20 +chrX 2458518 . A G 1038 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=-0.043;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=2.019;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.535;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,506 0/1:30,39:69:99:.:1068,0,775:17,13,19,20 +chrX 2458595 . G C 1228 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=18.23;BaseQRankSum=1.159;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=6.619;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.23;ReadPosRankSum=1.307;SOR=0.257;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,506 0/1:26,43:69:99:.:1258,0,641:8,18,20,23 +chrX 2458642 . G C 988 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=16.69;BaseQRankSum=-1.967;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.684;MQ=59.92;MQRankSum=-0.538;QD=16.69;ReadPosRankSum=-1.526;SOR=0.510;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,506 0/1:23,38:61:99:.:1018,0,607:9,14,20,18 +chrX 2458674 . CTTCA C 1268.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=22.17;BaseQRankSum=-0.776;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.209;MQ=59.92;MQRankSum=-0.788;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.521;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,506 0|1:26,33:59:99:.:0|1:2458674_CTTCA_C:1308,0,972:2458674:11,15,17,16 +chrX 2458681 . A G 1281 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=22.60;BaseQRankSum=-0.568;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.178;MQ=59.92;MQRankSum=-0.751;QD=22.60;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.566;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,506 0|1:25,33:58:99:.:0|1:2458674_CTTCA_C:1311,0,930:2458674:11,14,17,16 +chrX 2459550 . GTATATATA G,GTA,GTATATATATA 2345.97 . AC=0,2,1;AF=0.00,0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,42,13;AS_QD=31.84,30.56,31.69;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=31.38;SOR=0.859;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,21,27,0:48:99:1398,215,0,1173:0,0,22,26 2/3:0,0,15,13:28:99:987,1021,1108,409,522,563,614,620,0,575:0,0,13,15 +chrX 2459757 . T C 487 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.14;BaseQRankSum=1.357;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.190;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.457;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:74:64:0,74 0/1:31,20:51:99:.:517,0,864:22,9,13,7 +chrX 2460399 . C T 619 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.24;BaseQRankSum=2.894;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=4.054;MQ=48.30;MQRankSum=-0.636;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.03;SOR=1.099;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1587 0/1:26,23:49:99:.:649,0,676:14,12,9,14 +chrX 2460488 . G A 682 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.30;BaseQRankSum=3.046;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.43;MQRankSum=-3.741;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.585;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1587 0/1:37,26:63:99:.:712,0,975:16,21,12,14 +chrX 2460582 . C CT,CTTTTTTT 396.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,12;AS_QD=3.29,16.15;BaseQRankSum=-0.448;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.11;MQRankSum=-3.378;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.311;SOR=0.859;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1587,1587 0/2:15,2,12:29:99:.:436,380,675,0,312,627:6,9,5,9 +chrX 2460735 . C A 97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=2.27;BaseQRankSum=0.852;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.031;MQ=54.69;MQRankSum=-1.933;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.362;SOR=0.976;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,30:56:99:.:127,0:13,13,13,17 0/0:.:52:72:52:0,72,1171 +chrX 2461644 . T C 238 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=4.79;BaseQRankSum=0.283;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.657;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,32:56:99:.:268,0:13,11,17,15 0/0:.:52:72:52:0,72,1171 +chrX 2461706 . T G 817 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.44;BaseQRankSum=-2.527;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=2.122;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.228;SOR=0.420;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1662 0/1:29,34:63:99:.:847,0,789:17,12,17,17 +chrX 2462184 . CA C 176.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=4.32;BaseQRankSum=0.671;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=1.186;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.32;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.504;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:71:99:71:.:.:0,1662 0|1:36,14:50:99:.:0|1:2462184_CA_C:216,0,1375:2462184:16,20,7,7 +chrX 2462199 . A G 661 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.15;BaseQRankSum=-0.641;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.15;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=0.756;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:71:99:71:.:.:0,1662 0|1:39,23:62:99:.:0|1:2462184_CA_C:691,0,1053:2462184:16,23,9,14 +chrX 2462535 . CA C 1982.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=19.63;BaseQRankSum=0.036;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=4.459;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.321;SOR=0.320;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1513,0:0,0,18,35 0/1:27,23:50:99:509,0,619:8,19,14,9 +chrX 2463210 . A G 3725 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=34.14;BaseQRankSum=-1.322;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=9.890;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=34.14;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.597;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,64:64:99:.:.:2859,0:.:0,0,26,38 0|1:23,23:46:99:0|1:2463210_A_G:896,0,890:2463210:15,8,13,10 +chrX 2463211 . G A 3725 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=34.14;BaseQRankSum=0.023;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=9.890;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=34.14;ReadPosRankSum=0.22;SOR=0.597;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,64:64:99:.:.:2859,0:.:0,0,26,38 0|1:23,23:46:99:0|1:2463210_A_G:896,0,890:2463210:15,8,13,10 +chrX 2463274 . C G 323 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=6.09;BaseQRankSum=-2.02;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=59.92;MQRankSum=-0.775;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.087;SOR=1.362;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,35:58:99:.:353,0:11,12,12,23 0/0:.:49:99:49:0,105,1345 +chrX 2463333 . G A 1538 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=32.67;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.67;SOR=0.776;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,258 1/1:0,48:48:99:.:1568,144,0:0,0,25,23 +chrX 2463397 . T C 728 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.54;BaseQRankSum=0.261;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.968;SOR=0.689;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,258 0/1:27,29:56:99:.:758,0,674:14,13,15,14 +chrX 2463851 . G T 783 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=7.07;BaseQRankSum=1.65;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.411;MQ=59.68;MQRankSum=-0.867;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.485;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,36:65:99:253,0:13,16,17,19 0/1:29,21:50:99:560,0,733:10,19,9,12 +chrX 2463881 . G A 905 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=8.82;BaseQRankSum=1.793;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.727;MQ=59.72;MQRankSum=-1.084;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.387;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,31:54:99:322,0:9,14,16,15 0/1:29,23:52:99:613,0,779:12,17,11,12 +chrX 2464163 . G A 778 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.43;BaseQRankSum=-1.077;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.010;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.43;ReadPosRankSum=1.286;SOR=0.544;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1355 0/1:25,31:56:99:.:808,0,672:11,14,15,16 +chrX 2464205 . G GCCA,A 3954 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=90,2;AS_QD=34.05,10.55;BaseQRankSum=-0.278;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=12.831;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.860;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67,0:67:99:2991,0,2992:0,0,25,42 0/1:27,23,2:52:99:993,0,1002,687,1031,1809:17,10,13,12 +chrX 2464324 . GGTTCCCTAGCAATCCGGCCAAGGGCCGCTGATGTGCACACACTGAAGAC G 558.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.97;BaseQRankSum=0.051;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=12.403;MQ=59.88;MQRankSum=-1.379;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=1.236;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,1260 0|1:40,20:60:99:.:0|1:2464324_GGTTCCCTAGCAATCCGGCCAAGGGCCGCTGATGTGCACACACTGAAGAC_G:598,0,1625:2464324:25,15,7,13 +chrX 2464340 . G A,* 1021 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=32,0;AS_QD=32.84,30.77;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=5.354;MQ=60.00;QD=32.84;SOR=0.321;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32,0:32:99:.:.:1051,0,1313:.:0,0,19,13 0|2:40,0,20:60:99:0|1:2464324_GGTTCCCTAGCAATCCGGCCAAGGGCCGCTGATGTGCACACACTGAAGAC_G:598,718,2398,0,1680,1625:2464324:25,15,7,13 +chrX 2464404 . A G 858 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=8.71;BaseQRankSum=-0.03;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.612;MQ=58.84;MQRankSum=-2.055;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.908;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:23,32:55:99:.:.:354,0:.:13,10,23,9 0|1:32,15:47:99:0|1:2464324_GGTTCCCTAGCAATCCGGCCAAGGGCCGCTGATGTGCACACACTGAAGAC_G:534,0,1299:2464324:17,15,5,10 +chrX 2464411 . ACACACTGAAGATGTTCCCTAAGAATGTGGGTAAGGGACCGCCGCCATGTTCGCACTGAAGACGCTCCCTAAGAATGCGTCCAGGGGACTGCTGCCGTGTG A 360.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=6.35;BaseQRankSum=0.088;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=8.675;MQ=59.55;MQRankSum=-2.64;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.825;SOR=1.728;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,900 0|1:49,14:63:99:.:0|1:2464324_GGTTCCCTAGCAATCCGGCCAAGGGCCGCTGATGTGCACACACTGAAGAC_G:400,0,1959:2464324:26,23,4,10 +chrX 2465143 . A T 1148 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=8.99;BaseQRankSum=0.228;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=1.384;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.962;SOR=0.665;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,33:62:99:139,0:16,13,13,20 0/1:32,37:69:99:1039,0,865:16,16,21,16 +chrX 2465433 . G A 78 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=1.69;BaseQRankSum=-1.811;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=8.503;MQ=59.93;MQRankSum=1.063;QD=1.69;ReadPosRankSum=-1.143;SOR=0.552;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,33:64:99:.:108,0:20,11,15,18 0/0:.:75:67:75:0,67,1658 +chrX 2465436 . G C 46 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=1.21;BaseQRankSum=0.42;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=8.818;MQ=59.93;MQRankSum=1.048;QD=1.21;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=0.658;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,32:63:76:.:76,0:20,11,14,18 0/0:.:75:67:75:0,67,1658 +chrX 2465521 . G A 123 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=2.07;BaseQRankSum=0.334;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=6.127;MQ=59.94;MQRankSum=1.083;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=0.280;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:35,39:74:99:.:153,0:12,23,19,20 0/0:.:75:67:75:0,67,1658 +chrX 2465600 . C T 677 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=6.04;BaseQRankSum=3.148;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=1.489;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.04;ReadPosRankSum=-1.174;SOR=0.907;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,34:63:99:174,0:12,17,13,21 0/1:34,20:54:99:533,0,874:18,16,10,10 +chrX 2465809 . CAA C,CAAAAAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAAA,CAAAAAA 489.97 . AC=1,0,0,0;AF=0.333,0.00,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=16,0,1,14;AS_QD=33.06,30.80,33.53,33.50;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.32;QD=17.06;SOR=0.756;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,16,0,1,14:31:60:.:529,0,559,432,60:0,0,16,15 0/0:.:44:19:44:0,19,1162,19,1162,1162,19,1162,1162,1162,19,1162,1162,1162,1162 +chrX 2466659 . T C 640 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=10.47;BaseQRankSum=-1.398;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.223;SOR=0.651;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,43:64:99:.:670,0:10,11,21,22 0/0:.:67:56:67:0,56,921 +chrX 2467041 . G A 763 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.55;BaseQRankSum=0.434;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.665;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.676;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,37:51:99:.:793,0:8,6,17,20 0/0:.:67:56:67:0,56,921 +chrX 2467077 . A AC 673.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.55;BaseQRankSum=-1.415;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=4.263;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.302;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,33:49:99:.:713,0:5,11,15,18 0/0:.:56:76:56:0,76,1162 +chrX 2467349 . C T 30 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=0.85;BaseQRankSum=-1.99;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=0.845;ReadPosRankSum=0.75;SOR=0.722;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,38:71:60:.:60,0:18,15,21,17 0/0:.:56:76:56:0,76,1162 +chrX 2467442 . T A 208 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=2.80;BaseQRankSum=0.579;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.896;SOR=0.646;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:39,46:85:99:.:238,0:20,19,23,23 0/0:.:56:76:56:0,76,1162 +chrX 2467531 . A T 934 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.21;BaseQRankSum=1.721;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=3.262;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=0.490;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:71:99:71:.:.:0,252 0|1:44,29:73:99:.:0|1:2467531_A_T:964,0,1648:2467531:18,26,15,14 +chrX 2467555 . C A 964 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.29;BaseQRankSum=2.185;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.941;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.29;ReadPosRankSum=-2.461;SOR=0.551;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:71:99:71:.:.:0,252 0|1:37,28:65:99:.:0|1:2467531_A_T:994,0,1439:2467531:17,20,14,14 +chrX 2467628 . TG T 649.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=10.28;BaseQRankSum=-1.889;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.09;SOR=0.807;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,42:67:99:.:689,0:12,13,19,23 0/0:.:56:99:56:0,116,1619 +chrX 2467800 . C T 835 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=18.80;BaseQRankSum=-0.05;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.545;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,173 0|1:23,23:46:99:.:0|1:2467800_C_T:865,0,834:2467800:10,13,11,12 +chrX 2467818 . T C 914 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=20.52;BaseQRankSum=0.448;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.52;ReadPosRankSum=-1.319;SOR=0.655;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,173 0|1:20,26:46:99:.:0|1:2467800_C_T:944,0,721:2467800:9,11,12,14 +chrX 2467898 . G A 2415 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=26.01;BaseQRankSum=3.16;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=26.01;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.622;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,54:55:99:1794,0:0,1,29,25 0/1:16,23:39:99:651,0,394:8,8,10,13 +chrX 2467952 . A G 442 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=6.05;BaseQRankSum=0.14;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.085;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=6.05;ReadPosRankSum=1.566;SOR=0.406;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,25:46:62:62,0:14,7,14,11 0/1:16,16:32:99:410,0,392:10,6,9,7 +chrX 2467978 . AAAT A 605.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=14.66;BaseQRankSum=-0.985;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.573;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,292 0/1:25,19:44:99:.:645,0,951:11,14,9,10 +chrX 2468105 . G T 560 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.75;BaseQRankSum=-0.165;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.317;MQ=59.52;MQRankSum=-1.577;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.997;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,198 0/1:18,22:40:99:.:590,0,475:12,6,16,6 +chrX 2468106 . A G 178 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=2.89;BaseQRankSum=0.403;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=8.085;MQ=58.32;MQRankSum=-2.914;QD=2.89;ReadPosRankSum=-1.13;SOR=0.891;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,39:72:99:.:208,0:13,20,23,16 0/0:.:38:94:38:0,94,1122 +chrX 2468117 . T A 313 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=4.97;BaseQRankSum=-0.347;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=8.288;MQ=58.32;MQRankSum=-2.784;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=0.901;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,39:69:99:.:343,0:12,18,23,16 0/0:.:38:94:38:0,94,1122 +chrX 2468138 . C T 579 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.40;BaseQRankSum=0.567;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.493;MQ=59.74;MQRankSum=-0.993;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.356;SOR=0.409;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,354 0/1:12,23:35:99:.:609,0,262:9,3,15,8 +chrX 2468291 . C G 689 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=1.341;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.726;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,354 0/1:32,28:60:99:.:719,0,781:14,18,12,16 +chrX 2468526 . T C 392 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=7.28;BaseQRankSum=1.355;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.880;MQ=59.86;MQRankSum=1.269;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.684;SOR=1.303;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,35:58:99:.:422,0:13,10,24,11 0/0:.:55:63:55:0,63,1303 +chrX 2468621 . G A 2985 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=28.99;BaseQRankSum=2.433;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.967;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.88;SOR=0.667;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59:59:99:.:.:2456,0:.:0,0,27,32 0|1:27,18:45:99:0|1:2468621_G_A:559,0,918:2468621:15,12,9,9 +chrX 2468655 . A C 2865 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=29.24;BaseQRankSum=0.594;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.871;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.24;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.963;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2377,0:.:0,0,22,35 0|1:26,16:42:99:0|1:2468621_G_A:518,0,951:2468621:13,13,10,6 +chrX 2468695 . C T 1915 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.37;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=1.647;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:1945,0:0,0,20,42 0/0:.:59:63:59:0,63,1380 +chrX 2468805 . G C 56 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=1.62;BaseQRankSum=-1.065;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=22.352;MQ=59.25;MQRankSum=0.135;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=1.528;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,29:53:86:.:86,0:7,17,20,9 0/0:.:59:63:59:0,63,1380 +chrX 2468962 . A G 2622 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=21.56;BaseQRankSum=-0.26;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=1.720;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.85;SOR=0.513;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1671,0:0,0,29,26 0/1:29,39:68:99:981,0,704:17,12,21,18 +chrX 2469828 . A G 2907 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=23.31;BaseQRankSum=-0.459;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.924;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.76;SOR=0.882;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2370,0:0,0,41,33 0/1:30,22:52:99:567,0,846:14,16,13,9 +chrX 2470313 . G A 1875 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=28.01;BaseQRankSum=0.294;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.292;MQ=59.46;MQRankSum=-0.188;QD=28.01;ReadPosRankSum=1.278;SOR=1.721;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,64:68:99:.:1905,0:2,2,44,20 0/0:.:56:72:56:0,72,939 +chrX 2470445 . C T 2267 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.81;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=32.81;SOR=1.011;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,70:70:99:.:2297,0:0,0,40,30 0/0:.:56:72:56:0,72,939 +chrX 2470586 . T C 626 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.26;BaseQRankSum=-1.19;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=1.143;MQ=58.74;MQRankSum=-0.128;QD=14.26;ReadPosRankSum=-1.064;SOR=0.494;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:82:99:82:0,1800 0/1:20,26:46:99:.:656,0,513:12,8,14,12 +chrX 2470648 . T C 3729 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=30.56;BaseQRankSum=1.337;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=3.265;MQ=58.59;MQRankSum=-0.368;QD=30.56;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.435;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2205,0:0,0,31,39 1/1:1,52:53:99:1554,132,0:1,0,26,26 +chrX 2470890 . GA G 737.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.95;BaseQRankSum=0.216;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=4.883;MQ=58.52;MQRankSum=1.688;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.606;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,1746 0/1:39,26:65:99:.:777,0,1288:23,16,12,14 +chrX 2471209 . C G 2032 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=31.24;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.24;SOR=0.818;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2062,0:0,0,31,35 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471378 . A C 1854 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.48;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=32.48;SOR=1.382;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1884,0:0,0,21,37 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471472 . C CAGA 1805.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=32.33;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.741;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,41:41:99:.:1845,0:0,0,20,21 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471564 . C CA 837.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=25.79;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=25.79;SOR=0.941;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:877,0:0,0,19,15 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471615 . T C 1443 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=30.69;BaseQRankSum=-0.494;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=30.69;ReadPosRankSum=1.661;SOR=0.422;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,47:48:99:.:1473,0:1,0,28,19 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471718 . T C 2086 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=30.92;BaseQRankSum=1.648;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=40.69;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.311;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,51:52:99:.:2116,0:1,0,28,23 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471736 . G A 2060 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=26.90;BaseQRankSum=-0.349;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=40.98;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.293;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,50:51:99:.:2090,0:1,0,27,23 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471764 . C T 1523 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=33.04;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.04;SOR=0.735;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,47:47:99:.:1553,0:0,0,24,23 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471816 . T C 1522 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=30.43;BaseQRankSum=-0.506;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=3.854;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=30.43;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.888;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,50:51:99:.:1552,0:1,0,20,30 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471847 . T G 1572 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.23;BaseQRankSum=-0.647;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=30.23;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=0.223;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,52:53:99:.:1602,0:1,0,26,26 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471888 . A G 1641 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=29.84;BaseQRankSum=1.284;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=29.84;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.238;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,55:56:99:.:1671,0:1,0,28,27 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471921 . A G 2198 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=26.69;BaseQRankSum=1.572;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=42.85;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.284;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,51:52:99:.:2228,0:1,0,25,26 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471927 . A C 2188 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=33.56;BaseQRankSum=-0.533;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=42.65;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.284;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,51:52:99:.:2218,0:1,0,25,26 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2471984 . A G 2332 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=30.03;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.95;SOR=0.970;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2362,0:0,0,31,24 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472006 . G A 2421 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=31.36;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.26;SOR=0.914;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2451,0:0,0,32,26 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472032 . T C 1726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=32.52;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.52;SOR=0.931;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:1756,0:0,0,30,24 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472061 . C G 1791 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=33.72;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.72;SOR=1.220;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:1821,0:0,0,33,21 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472093 . C T 103 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=2.51;BaseQRankSum=1.892;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=-0.907;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.557;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,28:53:99:.:133,0:17,8,18,10 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472143 . C CAAA 1342.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=28.03;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=38.39;SOR=1.061;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1382,0:0,0,21,15 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472189 . C T 1285 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=32.88;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=32.88;SOR=0.902;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,40:40:99:.:1315,0:0,0,22,18 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472220 . T C 1542 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.08;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;QD=32.08;SOR=0.909;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,49:49:99:.:1572,0:0,0,27,22 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472254 . C T 1886 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=31.93;BaseQRankSum=2.45;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=-0.093;QD=31.93;ReadPosRankSum=1.444;SOR=0.237;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,59:60:99:.:1916,0:1,0,30,29 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472460 . A G 1943 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=30.83;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=30.83;SOR=1.127;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:1973,0:0,0,38,26 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472686 . T C 2048 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=30.12;BaseQRankSum=2.619;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=1.318;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,67:69:99:.:2078,0:1,1,25,42 0/0:.:69:34:56:0,34,1251 +chrX 2472692 . C A 650 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.17;BaseQRankSum=0.472;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=4.168;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=1.320;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1800 0/1:23,25:48:99:.:680,0,656:12,11,9,16 +chrX 2472815 . T C 1890 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=33.10;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.10;SOR=1.085;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1920,0:0,0,34,24 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2472856 . T C 2930 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=33.19;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=0.990;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,67:67:99:.:2960,0:0,0,38,29 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2472874 . G C 3059 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.97;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=0.971;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,71:71:99:.:3089,0:0,0,40,31 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2472908 . A G 2028 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=31.18;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.18;SOR=0.818;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2058,0:0,0,35,31 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2472981 . T C 2467 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=29.28;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.90;QD=44.59;SOR=1.101;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:2497,0:0,0,23,33 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2472988 . G A 2433 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=30.11;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.74;QD=44.78;SOR=1.061;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2463,0:0,0,23,32 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473026 . A C 2169 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=26.78;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.61;QD=43.98;SOR=1.157;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2199,0:0,0,20,30 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473032 . C G 2169 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=29.99;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.40;QD=43.98;SOR=1.270;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2199,0:0,0,19,31 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473127 . T G 2187 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.72;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.41;QD=44.34;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2217,0:0,0,24,26 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473133 . A C 2214 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=34.67;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.26;QD=44.88;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2244,0:0,0,24,26 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473147 . A AT 2545.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=35.71;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.63;QD=43.81;SOR=0.726;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2585,0:0,0,30,29 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473193 . C T 1764 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=31.47;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.40;QD=31.47;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:1794,0:0,0,30,27 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473255 . C A 2310 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=31.01;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.02;QD=45.00;SOR=0.770;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:2340,0:0,0,27,25 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473259 . C T 2355 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=27.16;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.37;QD=45.00;SOR=0.808;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:2385,0:0,0,28,25 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473265 . G A 2355 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=32.02;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=44.97;QD=45.00;SOR=0.892;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:2385,0:0,0,29,24 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473275 . C G 2220 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=27.77;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.60;QD=45.00;SOR=0.859;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2250,0:0,0,27,23 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473290 . G A 2220 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=29.45;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.27;QD=45.00;SOR=0.693;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2250,0:0,0,25,25 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473305 . C T 2032 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=29.10;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.26;QD=42.96;SOR=0.776;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,48:48:99:.:2062,0:0,0,23,25 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473339 . C T 2466 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=34.07;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.10;QD=44.57;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:2496,0:0,0,26,30 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473343 . G T 2432 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=28.39;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.97;QD=44.76;SOR=0.884;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2462,0:0,0,25,30 0/0:.:51:68:51:0,68,1007 +chrX 2473349 . C A 776 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.45;BaseQRankSum=-1.208;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.115;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.465;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1691 0/1:21,28:49:99:.:806,0,583:12,9,14,14 +chrX 2473373 . T C 2480 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=27.65;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.69;QD=44.82;SOR=0.922;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:2510,0:0,0,25,31 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473375 . A G 2525 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=26.40;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.87;QD=44.82;SOR=0.960;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2555,0:0,0,25,32 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473378 . T C 2535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=31.80;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.07;QD=45.00;SOR=0.960;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2565,0:0,0,25,32 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473394 . C A 2445 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=29.53;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.55;QD=45.00;SOR=1.262;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2475,0:0,0,21,34 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473410 . A G 2409 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=35.86;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.31;QD=44.35;SOR=1.262;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2439,0:0,0,21,34 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473487 . G C 1104 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=32.40;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.72;QD=32.40;SOR=1.885;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1134,0:0,0,10,25 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473562 . A G 902 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=36.55;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.56;QD=40.52;SOR=3.352;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:932,0:0,0,3,20 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473572 . G C 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=27.11;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.94;QD=43.60;SOR=2.448;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,15:15:99:.:654,0:0,0,3,12 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473625 . C T 479 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=31.42;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=36.60;QD=42.42;SOR=5.136;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,12:12:99:.:509,0:0,0,0,12 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473630 . CA C 604.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=30.35;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=36.52;QD=42.93;SOR=5.549;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,15:15:99:.:644,0:0,0,0,15 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473656 . G A 499 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=32.16;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=36.60;QD=44.08;SOR=5.136;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,12:12:99:.:529,0:0,0,0,12 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473679 . G T 330 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=29.21;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=35.68;QD=45.00;SOR=4.407;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,8:8:99:.:360,0:0,0,0,8 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473699 . C G 240 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=30.61;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=34.12;QD=45.00;SOR=3.912;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,6:6:99:.:270,0:0,0,0,6 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473857 . G A 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=30.25;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=33.92;QD=45.00;SOR=4.977;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,11,0 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473865 . G T 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=29.08;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=33.92;QD=45.00;SOR=4.977;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,11,0 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473867 . C T 465 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=29.65;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=33.92;QD=45.00;SOR=4.977;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:495,0:0,0,11,0 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473874 . A C 542 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=28.76;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=35.29;QD=44.00;SOR=5.283;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,13:13:99:.:572,0:0,0,13,0 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473875 . T A 542 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=29.55;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=36.16;QD=44.00;SOR=5.283;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,13:13:99:.:572,0:0,0,13,0 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473973 . C G 1494 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=24.62;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.19;QD=43.54;SOR=2.964;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1524,0:0,0,29,6 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2473987 . G A 1525 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=24.51;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=42.94;QD=44.43;SOR=2.964;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1555,0:0,0,29,6 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474001 . C T 1860 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=29.79;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.79;QD=45.00;SOR=2.303;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1890,0:0,0,32,10 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474004 . G C 1860 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=29.89;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.79;QD=45.00;SOR=2.303;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1890,0:0,0,32,10 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474005 . G A 1860 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=31.14;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.55;QD=45.00;SOR=2.303;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1890,0:0,0,32,10 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474160 . G GT 2691.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=27.98;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.99;QD=44.05;SOR=0.693;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:2731,0:0,0,31,31 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474169 . G A 2609 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=29.10;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.86;QD=44.73;SOR=0.726;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2639,0:0,0,30,29 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474173 . C A 2580 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=34.08;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.17;QD=45.00;SOR=0.762;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2610,0:0,0,28,30 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474185 . C T 2715 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=30.49;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=45.00;SOR=0.793;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,61:61:99:.:2745,0:0,0,29,32 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474198 . T G 2850 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=27.43;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.756;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2880,0:0,0,31,33 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474214 . A C 2940 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=24.34;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.754;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2970,0:0,0,32,34 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474230 . C T 2850 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.22;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.693;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2880,0:0,0,32,32 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474231 . C T 2850 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.51;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.693;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2880,0:0,0,32,32 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474254 . A C 2803 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=36.99;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.58;SOR=0.787;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,65:65:99:.:2833,0:0,0,31,34 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474297 . A G 1661 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=30.75;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.75;SOR=0.804;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:1691,0:0,0,26,29 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474374 . A G 2127 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=30.70;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=43.14;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:2157,0:0,0,24,26 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474380 . A G 2201 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=32.46;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;QD=42.09;SOR=0.808;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:2231,0:0,0,25,28 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474468 . A G 2018 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=28.44;BaseQRankSum=3.299;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=6.472;MQ=59.12;MQRankSum=2.104;QD=40.96;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.398;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,48:50:99:.:2048,0:0,2,26,22 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474470 . G T 2064 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=26.73;BaseQRankSum=2.945;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=6.284;MQ=58.80;MQRankSum=2.134;QD=41.06;ReadPosRankSum=-0.834;SOR=0.320;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,49:51:99:.:2094,0:0,2,26,23 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474485 . G A 2300 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=25.21;BaseQRankSum=1.454;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=6.756;MQ=58.66;MQRankSum=1.919;QD=41.61;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.500;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,54:56:99:.:2330,0:0,2,30,24 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474486 . C T 2535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=28.62;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.66;QD=45.00;SOR=0.877;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2565,0:0,0,31,26 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474493 . A G 2504 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=24.68;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.66;QD=44.46;SOR=0.877;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2534,0:0,0,31,26 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474495 . A C 2504 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=30.86;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.30;QD=44.46;SOR=0.877;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2534,0:0,0,31,26 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474559 . G C 1814 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=31.25;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=31.25;SOR=0.796;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1844,0:0,0,28,31 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474607 . G C 2462 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=25.06;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.24;SOR=1.123;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2492,0:0,0,24,35 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474615 . G T 2440 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=28.97;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.59;SOR=0.997;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2470,0:0,0,25,33 0/0:.:64:29:59:0,29,1477 +chrX 2474650 . A C 2770 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=24.56;BaseQRankSum=-2.317;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.998;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=24.56;ReadPosRankSum=-1.315;SOR=0.834;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2099,0:0,0,32,33 0/1:21,28:49:99:701,0,563:11,10,10,18 +chrX 2474685 . T C 2619 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=28.25;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.07;QD=42.05;SOR=0.724;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,63:63:99:.:2649,0:0,0,31,32 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474697 . G A 2432 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.01;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.97;QD=43.19;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2462,0:0,0,27,30 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474736 . G A 2399 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.90;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.48;QD=43.38;SOR=0.922;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:2429,0:0,0,31,25 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474752 . G A 2550 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=23.53;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.90;QD=44.48;SOR=0.914;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2580,0:0,0,32,26 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474761 . T C 2625 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.14;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.91;QD=45.00;SOR=1.034;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2655,0:0,0,34,25 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474782 . A G 2715 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=33.61;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.95;QD=45.00;SOR=1.022;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,61:61:99:.:2745,0:0,0,35,26 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474800 . T C 2760 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=26.66;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;QD=45.00;SOR=1.057;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:2790,0:0,0,36,26 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474801 . G C 2805 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.50;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.08;QD=45.00;SOR=1.092;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,63:63:99:.:2835,0:0,0,37,26 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474807 . A G 3030 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=28.77;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.36;QD=45.00;SOR=1.098;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,68:68:99:.:3060,0:0,0,40,28 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474834 . C G 3434 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=27.75;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;QD=44.99;SOR=1.150;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,77:77:99:.:3464,0:0,0,46,31 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474849 . C G 3524 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=29.07;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=44.99;SOR=1.136;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,79:79:99:.:3554,0:0,0,47,32 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474854 . G A 3344 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=28.92;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=44.99;SOR=0.955;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,75:75:99:.:3374,0:0,0,42,33 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474868 . T G 3179 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=30.20;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=44.57;SOR=0.869;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,72:72:99:.:3209,0:0,0,39,33 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474873 . C T 3179 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.05;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;QD=44.57;SOR=0.869;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,72:72:99:.:3209,0:0,0,39,33 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474987 . A C 2494 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=28.29;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.28;SOR=1.140;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2524,0:0,0,23,34 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2474988 . T C 2494 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=30.96;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.28;SOR=1.140;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,57:57:99:.:2524,0:0,0,23,34 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475038 . T C 1730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=32.59;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;QD=32.59;SOR=1.220;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,54:54:99:.:1760,0:0,0,21,33 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475079 . T C 1944 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=29.70;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.87;SOR=1.038;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:1974,0:0,0,19,26 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475087 . G A 2030 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=30.95;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.78;SOR=1.085;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,46:46:99:.:2060,0:0,0,19,27 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475100 . G A 2130 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=34.08;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.866;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,48:48:99:.:2160,0:0,0,22,26 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475115 . A G 2040 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=25.48;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.780;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,46:46:99:.:2070,0:0,0,22,24 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475121 . G T 1905 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=34.31;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.836;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1935,0:0,0,20,23 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475123 . G C 1950 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=27.35;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.784;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,44:44:99:.:1980,0:0,0,21,23 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475124 . AC A 1895.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=32.27;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.739;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1935,0:0,0,21,22 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475140 . G C 1874 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=32.92;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=44.28;SOR=0.836;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1904,0:0,0,20,23 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475175 . T G 1995 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=32.64;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.80;QD=45.00;SOR=0.829;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:2025,0:0,0,21,24 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475176 . C G 2040 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=35.67;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.83;QD=45.00;SOR=0.874;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,46:46:99:.:2070,0:0,0,21,25 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475198 . A G 1985 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=28.71;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.80;QD=44.78;SOR=0.737;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:2015,0:0,0,22,23 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475216 . T C 2204 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=38.92;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.74;QD=43.80;SOR=0.813;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,51:51:99:.:2234,0:0,0,24,27 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475242 . TA T 1603.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=27.57;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;QD=37.34;SOR=0.883;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,44:44:99:.:1643,0:0,0,20,24 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475269 . A AC 1698.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=32.64;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=40.42;SOR=0.836;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1738,0:0,0,20,23 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475299 . A G 1728 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=30.65;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.88;SOR=0.741;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,41:41:99:.:1758,0:0,0,21,20 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475305 . T C 1627 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=27.29;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.61;SOR=0.914;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,38:38:99:.:1657,0:0,0,21,17 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475354 . A G 1864 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=29.07;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=1.179;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1894,0:0,0,17,26 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475360 . A C 1984 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=27.23;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=44.76;SOR=1.038;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:2014,0:0,0,19,26 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475395 . A G 1995 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=28.59;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=45.00;SOR=0.737;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:2025,0:0,0,23,22 0/0:.:69:86:69:0,86,1558 +chrX 2475399 . AG A,GG 2561 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=42,29;AS_QD=24.87,11.13;BaseQRankSum=-0.139;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=0.955;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.159;SOR=0.718;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42,0:42:99:1890,0,1890:0,0,22,20 0/2:34,0,29:63:99:701,802,1770,0,968,882:19,15,18,11 +chrX 2475404 . C T 1850 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=28.01;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=44.76;SOR=0.788;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1880,0:0,0,22,20 0/0:.:65:89:65:0,89,1369 +chrX 2475443 . T A 1907 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=26.88;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.04;SOR=1.559;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,45:45:99:.:1937,0:0,0,30,15 0/0:.:65:89:65:0,89,1369 +chrX 2475455 . C A 1828 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=29.68;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.24;SOR=1.556;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1858,0:0,0,28,14 0/0:.:65:89:65:0,89,1369 +chrX 2475491 . A G 1816 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=32.65;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.93;SOR=1.312;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1846,0:0,0,27,16 0/0:.:65:89:65:0,89,1369 +chrX 2475494 . G C 1814 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=31.15;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=1.402;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1844,0:0,0,27,15 0/0:.:65:89:65:0,89,1369 +chrX 2475564 . G T 1457 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=31.64;BaseQRankSum=2.537;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=3.104;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=31.64;ReadPosRankSum=0.922;SOR=0.359;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,46:47:99:.:1487,0:0,1,24,22 0/0:.:65:89:65:0,89,1369 +chrX 2476240 . A AC 2320.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=21.85;BaseQRankSum=-0.294;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=21.85;ReadPosRankSum=3.37;SOR=0.766;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,58:59:99:1699,0:0,1,24,29 0/1:22,27:49:99:661,0,656:11,11,12,13 +chrX 2476642 . A G 2810 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=21.35;BaseQRankSum=-1.728;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.35;ReadPosRankSum=1.41;SOR=0.624;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2256,0:0,0,41,32 0/1:35,25:60:99:584,0,1006:20,15,13,12 +chrX 2477280 . C G 1677 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=25.48;BaseQRankSum=-0.756;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=11.152;MQ=58.15;MQRankSum=8.135;QD=25.48;ReadPosRankSum=-2.153;SOR=0.040;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:6,61:67:99:.:1707,0:6,0,36,25 0/0:.:60:99:60:0,104,1286 +chrX 2477455 . G A 2336 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=19.72;BaseQRankSum=2.018;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.518;MQ=59.03;MQRankSum=6.598;QD=19.72;ReadPosRankSum=-1.133;SOR=0.765;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:8,53:61:99:1556,0:4,4,30,23 0/1:30,29:59:99:810,0,785:14,16,14,15 +chrX 2477767 . C T 593 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.26;BaseQRankSum=0.438;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=1.134;MQ=47.59;MQRankSum=-0.598;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.490;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:80:99:80:0,165 0/1:24,23:47:99:.:623,0,649:9,15,10,13 +chrX 2478195 . C G 3902 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=27.12;BaseQRankSum=-0.236;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=8.603;MQ=51.50;MQRankSum=-0.718;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.615;SOR=1.244;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,87:87:99:3114,0:0,0,30,57 0/1:28,30:58:99:818,0,759:15,13,14,16 +chrX 2478226 . G C 4752 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=140;AS_QD=34.16;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.83;QD=34.16;SOR=0.945;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,85:85:99:2991,0:0,0,31,54 1/1:0,55:55:99:1791,164,0:0,0,31,24 +chrX 2478609 . C CATGTGGCCCTGGGACATCCACAGTGTACACACTGAAGACATTCCCTAAGA 4132.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=34.48;BaseQRankSum=-1.319;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.58;MQRankSum=0;QD=34.48;ReadPosRankSum=-3.481;SOR=0.713;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2953,0:0,0,36,32 0/1:20,33:53:99:1219,0,692:10,10,15,18 +chrX 2478653 . A G 2370 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=22.22;BaseQRankSum=-1.093;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.22;ReadPosRankSum=1.865;SOR=0.646;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1635,0:0,0,28,24 0/1:26,30:56:99:765,0,696:14,12,15,15 +chrX 2478742 . C T 2821 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=25.68;BaseQRankSum=-1.677;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.955;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.498;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1970,0:0,0,28,31 0/1:21,31:52:99:881,0,570:9,12,16,15 +chrX 2478806 . G A 2990 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=25.38;BaseQRankSum=0.117;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=6.238;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.460;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2248,0:0,0,32,37 0/1:22,28:50:99:772,0,560:14,8,14,14 +chrX 2478880 . G C 3289 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=23.71;BaseQRankSum=2.448;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.757;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.71;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.841;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,79:79:99:2495,0:0,0,46,33 0/1:32,29:61:99:824,0,854:17,15,15,14 +chrX 2478959 . C G 2714 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=21.95;BaseQRankSum=1.095;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.580;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=21.95;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=1.022;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2039,0:0,0,36,26 0/1:36,27:63:99:705,0,965:18,18,15,12 +chrX 2479022 . T A 193 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=4.13;BaseQRankSum=0.464;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.055;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.976;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,30:54:99:.:223,0:12,12,17,13 0/0:.:63:52:63:0,52,1523 +chrX 2479037 . G A 2241 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.65;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.85;SOR=0.760;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,60:60:99:.:2271,0:0,0,29,31 0/0:.:63:52:63:0,52,1523 +chrX 2479361 . C A 1359 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=32.30;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=32.30;SOR=1.455;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1389,0:0,0,15,28 0/0:.:65:42:65:0,42,1588 +chrX 2479863 . G T 1826 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=28.55;BaseQRankSum=3.841;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=12.748;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.55;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=0.347;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,61:65:99:.:1856,0:0,4,33,28 0/0:.:71:68:71:0,68,1800 +chrX 2480021 . G A 2919 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=24.17;BaseQRankSum=0.166;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=6.936;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.17;ReadPosRankSum=1.01;SOR=0.289;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2089,0:0,0,34,29 0/1:28,31:59:99:860,0,756:10,18,13,18 +chrX 2480076 . GC G 2390.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=31.67;BaseQRankSum=-0.427;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=4.281;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.27;ReadPosRankSum=1.423;SOR=1.166;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,66:67:99:.:2430,0:0,1,42,24 0/0:.:54:61:54:0,61,945 +chrX 2480280 . T C 510 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=18.00;BaseQRankSum=-0.475;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.24;MQRankSum=0.026;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.409;SOR=0.527;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:84:99:84:0,1800 0/1:11,19:30:99:.:540,0,282:4,7,8,11 +chrX 2480289 . G A 1535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=21.15;BaseQRankSum=0.105;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=14.162;MQ=55.10;MQRankSum=4.456;QD=21.15;ReadPosRankSum=2.478;SOR=0.076;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,60:74:99:.:1565,0:2,12,27,33 0/0:.:36:40:36:0,40,790 +chrX 2480499 . T G 529 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.11;BaseQRankSum=1.372;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.566;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1800 0/1:16,21:37:99:.:559,0,385:7,9,10,11 +chrX 2480516 . TAA T,TA 1647.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=14,56;AS_QD=10.28,18.35;BaseQRankSum=1.04;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=5.370;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.883;SOR=0.697;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,2,56:59:99:1358,1534,0:1,0,32,26 0/1:17,12,0:29:99:329,0,446,380,483,862:6,11,7,5 +chrX 2480627 . G A 541 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.28;BaseQRankSum=-1.175;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=18.042;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.109;SOR=3.401;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1800 0/1:21,22:43:99:.:571,0,581:12,9,20,2 +chrX 2481096 . T C 1964 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.65;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.65;SOR=0.724;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,63:63:99:.:1994,0:0,0,31,32 0/0:.:72:99:72:0,105,1385 +chrX 2481162 . C T 4751 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=144;AS_QD=33.20;DP=150;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.20;SOR=1.079;VarDP=144 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2431,0:0,0,33,41 1/1:0,70:70:99:2350,211,0:0,0,27,43 +chrX 2481437 . G A 2103 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=32.82;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=32.82;SOR=1.078;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,65:65:99:.:2133,0:0,0,27,38 0/0:.:56:99:56:0,109,1552 +chrX 2481779 . T C 2310 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=20.35;BaseQRankSum=-1.736;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.773;MQ=56.25;MQRankSum=-3.238;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.01;SOR=0.816;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:1921,0:0,0,36,27 0/1:33,19:52:99:419,0,951:18,15,11,8 +chrX 2481815 . C T 2481 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=28.14;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.09;QD=43.29;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2511,0:0,0,31,27 0/0:.:56:99:56:0,120,1800 +chrX 2481827 . AC A 3005.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=27.19;BaseQRankSum=0.878;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.616;MQ=55.97;MQRankSum=-3.919;QD=27.19;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=0.567;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:2466,0:0,0,30,26 0/1:36,20:56:99:579,0,1161:16,20,9,11 +chrX 2482036 . T C 1741 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=19.25;BaseQRankSum=1.714;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.090;MQ=43.03;MQRankSum=-6.038;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=0.503;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1321,0:0,0,14,26 0/1:34,18:52:99:450,0,975:20,14,14,4 +chrX 2482129 . C CTTT,CTT 2071.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=38,25;AS_QD=23.66,13.14;BaseQRankSum=0.412;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=6.362;MQ=48.61;MQRankSum=-4.298;QD=24.26;ReadPosRankSum=0.75;SOR=0.561;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38,0:38:99:1467,0,1468:0,0,18,20 0/2:24,0,25:49:99:644,716,1453,0,737,662:9,15,16,9 +chrX 2482579 . T A 2613 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=22.78;BaseQRankSum=1.753;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.777;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=22.78;ReadPosRankSum=-0.11;SOR=0.816;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1933,0:0,0,28,30 0/1:32,26:58:99:710,0,842:15,17,9,17 +chrX 2482616 . T C 2534 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=22.69;BaseQRankSum=-0.272;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.805;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=22.69;ReadPosRankSum=1.537;SOR=0.823;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,61:62:99:1995,0:1,0,35,26 0/1:28,23:51:99:569,0,759:14,14,11,12 +chrX 2482794 . G A 2713 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=24.71;BaseQRankSum=-0.949;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.906;MQ=53.91;MQRankSum=0.376;QD=24.71;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.527;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1905,0:0,0,27,31 0/1:22,31:53:99:838,0,555:9,13,14,17 +chrX 2482868 . A G 425 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=11.38;BaseQRankSum=1.12;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=5.014;MQ=45.05;MQRankSum=-4.937;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=1.765;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1260 0/1:23,17:40:99:.:455,0,624:10,13,4,13 +chrX 2483063 . CA C 881.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=18.42;BaseQRankSum=-1.342;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.62;MQRankSum=-0.982;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.583;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1260 0/1:21,29:50:99:.:921,0,635:13,8,17,12 +chrX 2483328 . T G 2565 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=23.17;BaseQRankSum=-0.956;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=4.114;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.17;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.435;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1861,0:0,0,28,29 0/1:27,28:55:99:734,0,729:16,11,14,14 +chrX 2483424 . T A 2543 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=22.57;BaseQRankSum=1.732;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=16.659;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.57;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=1.107;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1864,0:0,0,34,22 0/1:32,26:58:99:709,0,857:12,20,17,9 +chrX 2483789 . CAAAAA C 2754.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=34.49;BaseQRankSum=-0.866;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=34.49;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.647;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,48:49:99:2070,0:0,1,22,26 0/1:13,19:32:99:724,0,410:6,7,8,11 +chrX 2483831 . G C 3585 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=34.43;BaseQRankSum=0.593;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.122;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.43;ReadPosRankSum=0.152;SOR=0.505;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,63:63:99:.:.:2728,0:.:0,0,32,31 0|1:19,23:42:99:0|1:2483831_G_C:887,0,708:2483831:8,11,12,11 +chrX 2483853 . C T 3878 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=30.23;BaseQRankSum=-0.727;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=35.21;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=0.738;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,67:67:99:.:.:3005,0:.:0,0,37,30 0|1:21,23:44:99:0|1:2483831_G_C:903,0,813:2483831:11,10,11,12 +chrX 2483876 . G A 3965 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=34.74;BaseQRankSum=1.316;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.873;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.74;ReadPosRankSum=-2.123;SOR=0.836;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,67:67:99:.:.:3015,0:.:0,0,38,29 0|1:23,25:48:99:0|1:2483831_G_C:980,0,879:2483831:12,11,13,12 +chrX 2483879 . C A 3920 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=34.65;BaseQRankSum=-0.641;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.882;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.65;ReadPosRankSum=-1.65;SOR=0.863;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,66:66:99:.:.:2970,0:.:0,0,38,28 0|1:23,25:48:99:0|1:2483831_G_C:980,0,879:2483831:12,11,13,12 +chrX 2484015 . G A 1976 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=33.43;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=33.43;SOR=0.760;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,60:60:99:.:2006,0:0,0,31,29 0/0:.:64:99:64:0,107,1598 +chrX 2484111 . T G 3710 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=31.97;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=31.97;SOR=0.745;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2183,0:0,0,34,33 1/1:0,50:50:99:1557,149,0:0,0,26,24 +chrX 2484263 . A G 2428 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=20.15;BaseQRankSum=-1.032;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.477;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.959;SOR=0.469;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1796,0:0,0,25,30 0/1:41,26:67:99:662,0,1193:17,24,14,12 +chrX 2484823 . G C 2189 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=36.48;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.98;SOR=0.831;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1101 1/1:0,60:60:99:.:2219,180,0:0,0,32,28 +chrX 2484843 . C T 787 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=7.04;BaseQRankSum=0.692;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=12.019;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.959;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,28:55:42:42,0:11,16,16,12 0/1:32,29:61:99:775,0,854:13,19,18,11 +chrX 2484904 . A G 3918 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=32.36;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=32.36;SOR=1.071;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2138,0:0,0,27,38 1/1:0,57:57:99:1810,170,0:0,0,24,33 +chrX 2485067 . A C 1776 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.25;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.25;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,555 1/1:0,56:56:99:.:1806,168,0:0,0,26,30 +chrX 2485643 . A G 210 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=30.00;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.00;SOR=4.407;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:6:27:0,6 1/1:0,8:8:24:.:240,24,0:0,0,8,0 +chrX 2485729 . G A 217 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=20.58;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.92;QD=20.58;SOR=1.085;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,10:12:99:.:247,0:0,0,6,4 0/0:.:18:36:13:0,36,412 +chrX 2485741 . AGAAGGGAGGGAAGGAAGGGAGAGAAGGAAGGAAGGGAGAAAAGGGAGAGAAGGGAGAGAAGGAAG A 612.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=33.46;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.92;QD=43.47;SOR=5.136;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:59:99:59:.:.:0,192 1|1:0,15:15:50:.:0|1:2485741_AGAAGGGAGGGAAGGAAGGGAGAGAAGGAAGGAAGGGAGAAAAGGGAGAGAAGGGAGAGAAGGAAG_A:652,50,0:2485741:0,0,12,0 +chrX 2485939 . G T 623 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=20.41;BaseQRankSum=-0.924;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=1.841;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=1.453;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,192 0/1:8,24:32:99:.:653,0,171:5,3,18,6 +chrX 2486578 . G A 1680 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=31.67;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.67;SOR=0.767;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,192 1/1:0,54:54:99:.:1710,162,0:0,0,28,26 +chrX 2487001 . T C 2510 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=19.10;BaseQRankSum=-0.321;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=2.856;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.128;SOR=0.404;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,35:62:99:265,0:11,16,17,18 1/1:0,71:71:99:2275,213,0:0,0,36,35 +chrX 2487355 . C A 2492 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.33;BaseQRankSum=-0.391;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.33;ReadPosRankSum=-1.666;SOR=0.255;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,437 1/1:1,77:78:99:.:2522,200,0:0,1,37,40 +chrX 2488489 . A G 2246 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=18.97;BaseQRankSum=-2.488;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=0.674;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,37:60:99:356,0:11,12,14,23 1/1:0,60:60:99:1920,180,0:0,0,33,27 +chrX 2491066 . G GT 547.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=17.79;BaseQRankSum=1.969;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.73;MQRankSum=-0.211;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.103;SOR=0.337;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,580 1/1:1,32:33:84:.:587,84,0:0,1,14,18 +chrX 2491447 . T C 4203 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=32.31;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=32.31;SOR=0.708;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,76:76:99:2425,0:0,0,39,37 1/1:0,55:55:99:1808,165,0:0,0,26,29 +chrX 2493751 . T C 1971 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.27;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;QD=32.27;SOR=0.758;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:23:57:0,23 1/1:0,62:62:99:.:2001,185,0:0,0,30,32 +chrX 2494572 . A G 1514 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=32.85;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.85;SOR=0.823;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:23:57:0,23 1/1:0,47:47:99:.:1544,141,0:0,0,25,22 +chrX 2495610 . G GT 1017.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.32;BaseQRankSum=1.508;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.261;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.382;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:23:57:0,23 0/1:35,34:69:99:.:1057,0,1103:14,21,17,17 +chrX 2497106 . G A 765 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.69;BaseQRankSum=1.489;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=8.450;MQ=59.25;MQRankSum=-1.959;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.822;SOR=1.496;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:23:57:0,23 0/1:38,30:68:99:.:795,0,968:18,20,20,10 +chrX 2497192 . T C 939 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.14;BaseQRankSum=-1.039;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.19;MQRankSum=-1.339;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.266;SOR=0.774;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:23:57:0,23 0/1:28,36:64:99:.:969,0,741:15,13,20,16 +chrX 2498625 . G GA,GAA 444.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=24,17;AS_QD=2.22,7.54;BaseQRankSum=-0.671;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=6.300;MQ=59.66;MQRankSum=0.135;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=1.110;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,24,0:40:99:122,0,472:9,7,9,15 0/2:15,0,17:32:99:362,407,836,0,429,379:8,7,7,10 +chrX 2498751 . C T 449 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.89;BaseQRankSum=-0.641;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.261;SOR=0.729;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,124 0/1:25,19:44:99:.:479,0,667:12,13,10,9 +chrX 2499126 . A G 754 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.79;BaseQRankSum=-0.896;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=9.971;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.954;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,124 0/1:25,28:53:99:.:784,0,700:16,9,11,17 +chrX 2499996 . A C 1189 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=18.75;BaseQRankSum=-1.435;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.765;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,124 0/1:22,43:65:99:.:1219,0,544:9,13,17,26 +chrX 2500497 . C T 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.90;BaseQRankSum=-0.778;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.847;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,124 0/1:27,24:51:99:.:607,0,716:10,17,8,16 +chrX 2500642 . A AG 1838.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=29.73;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.83;SOR=2.110;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1069,0:.:0,0,8,19 1|1:0,19:19:57:0|1:2500642_A_AG:809,57,0:2500642:0,0,4,15 +chrX 2500654 . GC G 878.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=30.39;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.73;SOR=2.737;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:26:46:22:.:.:0,46 1|1:0,22:22:66:.:0|1:2500642_A_AG:918,66,0:2500642:0,0,4,18 +chrX 2500664 . C A 174 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=10.74;BaseQRankSum=-0.287;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.715;SOR=1.609;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:21:13:21:.:.:0,13 0|1:10,9:19:99:.:0|1:2500642_A_AG:204,0,246:2500642:1,9,0,9 +chrX 2501132 . A G 381 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=14.68;BaseQRankSum=0.686;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=15.433;MQ=59.97;MQRankSum=1.146;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.659;SOR=3.786;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:99:46:0,331 0/1:13,15:28:99:.:411,0,333:6,7,1,14 +chrX 2501220 . A C,AC 46 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,4;AS_QD=2.57,9.50;BaseQRankSum=-0.341;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=1.270;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:99:46:0,331,331 0/2:4,3,4:11:58:.:76,58,311,0,59,131:0,4,0,7 +chrX 2501820 . C G 664 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=11.02;BaseQRankSum=-0.576;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.771;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:11,22:33:99:322,0:5,6,11,11 0/1:15,15:30:99:372,0,412:6,9,4,11 +chrX 2502351 . C G 317 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=7.54;BaseQRankSum=-1.317;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.287;SOR=0.786;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,29:46:99:.:347,0:9,8,16,13 0/0:.:48:32:34:0,32,901 +chrX 2502681 . A T 598 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.36;BaseQRankSum=1.244;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=1.134;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.49;SOR=0.473;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,219 0/1:23,24:47:99:.:628,0,568:9,14,11,13 +chrX 2503035 . A T 1482 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=11.54;BaseQRankSum=1.281;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.645;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.3;SOR=0.784;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,40:70:99:.:.:481,0:.:13,17,22,18 0|1:34,27:61:99:0|1:2503035_A_T:1031,0,1346:2503035:19,15,13,14 +chrX 2503037 . G T 1482 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=11.54;BaseQRankSum=0.15;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.645;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.784;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,40:70:99:.:.:481,0:.:13,17,22,18 0|1:34,27:61:99:0|1:2503035_A_T:1031,0,1346:2503035:19,15,13,14 +chrX 2503229 . CT C 742.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=8.69;BaseQRankSum=1.246;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.125;MQ=59.44;MQRankSum=0.127;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.104;SOR=1.145;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,29:45:99:318,0:6,10,9,20 0/1:21,24:45:99:464,0,373:10,11,9,15 +chrX 2503269 . T C 2156 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=21.64;BaseQRankSum=-1.091;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.253;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.64;ReadPosRankSum=0.25;SOR=1.063;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:17,29:46:99:359,0:8,9,10,19 1/1:0,55:55:99:1827,165,0:0,0,23,32 +chrX 2503510 . A G 755 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=7.85;BaseQRankSum=2.202;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=3.729;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.758;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,28:52:99:139,0:10,14,17,11 0/1:25,23:48:99:646,0,640:12,13,11,12 +chrX 2504042 . TAA T 198.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=3.35;BaseQRankSum=0.047;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=10.097;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.991;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,38:71:99:.:238,0:13,20,23,15 0/0:.:60:99:60:0,114,1510 +chrX 2504045 . G GT 198.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=3.35;BaseQRankSum=-0.753;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=10.097;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.991;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,38:71:99:.:238,0:13,20,23,15 0/0:.:60:99:60:0,114,1510 +chrX 2504076 . C CCTCAGGTGTGGCCAGGTGTG,CCTTG 1426.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=32,26;AS_QD=5.59,12.31;BaseQRankSum=-0.22;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=3.408;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.3;SOR=0.584;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,32,0:53:99:481,0,1429:7,14,17,15 0/2:33,0,26:59:99:985,1085,2459,0,1375,1296:17,16,13,13 +chrX 2504105 . G A 674 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=6.07;BaseQRankSum=0.758;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.372;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.63;SOR=1.017;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,33:61:79:79,0:12,16,14,19 0/1:32,23:55:99:625,0,887:17,15,9,14 +chrX 2504267 . A G 277 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=5.29;BaseQRankSum=-0.479;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=3.708;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.49;SOR=0.330;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,34:58:99:.:307,0:9,15,17,17 0/0:.:62:83:62:0,83,1134 +chrX 2504742 . C A,CA 602 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=3,44;AS_QD=0.00,7.71;BaseQRankSum=0.29;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.815;SOR=0.618;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:19,3,24:46:99:231,1365,0:9,10,14,13 0/2:19,0,20:39:99:401,458,899,0,441,381:8,11,8,12 +chrX 2505326 . G A 634 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.54;BaseQRankSum=0.765;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.58;SOR=0.818;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1286 0/1:37,26:63:99:.:664,0,981:23,14,17,9 +chrX 2505598 . TTTTTG T 980.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.62;BaseQRankSum=0.936;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.62;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.698;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1286 0/1:25,27:52:99:.:1020,0,968:12,13,14,13 +chrX 2505691 . T C 1836 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=13.42;BaseQRankSum=2.866;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=0.977;QD=13.42;ReadPosRankSum=2.099;SOR=0.682;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:43,39:82:10:10,0:23,20,19,20 1/1:0,57:57:99:1856,171,0:0,0,32,25 +chrX 2506392 . C T 243 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=6.35;BaseQRankSum=0.887;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=8.856;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.35;ReadPosRankSum=0;SOR=1.204;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,25:43:99:.:273,0:7,11,16,9 0/0:.:60:93:60:0,93,1548 +chrX 2507064 . CAAAT C 86.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=3.82;BaseQRankSum=0.251;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.356;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.826;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:15,18:33:99:.:126,0:7,8,10,8 0/0:.:60:93:60:0,93,1548 +chrX 2507388 . T TG 847.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.74;BaseQRankSum=0.465;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.432;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.470;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1089 0/1:20,33:53:99:.:887,0,470:12,8,16,17 +chrX 2509159 . A AT 440.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.06;BaseQRankSum=0.308;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.359;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.65;SOR=1.075;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1089 0/1:31,22:53:99:.:480,0,772:14,17,8,14 +chrX 2509269 . C T 380 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=7.59;BaseQRankSum=-1.552;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=6.289;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=1.675;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,31:54:99:.:410,0:14,9,24,7 0/0:.:65:99:65:0,120,1800 +chrX 2509285 . A G 1545 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=12.30;BaseQRankSum=-1.115;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=11.570;MQ=59.93;MQRankSum=-0.757;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.088;SOR=1.094;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,35:60:99:490,0:12,13,25,10 0/1:26,42:68:99:1085,0,660:10,16,22,20 +chrX 2509345 . AC A 1282.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=12.13;BaseQRankSum=2.291;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.715;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,30:52:99:301,0:9,13,16,14 0/1:25,32:57:99:1021,0,760:15,10,16,16 +chrX 2509431 . T TAAA,TAA 1330.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,11;AS_QD=24.18,32.68;BaseQRankSum=-0.579;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=8.992;MQ=58.53;MQRankSum=-0.162;QD=22.46;ReadPosRankSum=-1.124;SOR=1.048;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:13,27,0:40:99:451,0,950:8,5,7,20 1/2:1,9,11:21:99:919,221,161,176,0,102:1,0,11,9 +chrX 2509977 . T TA 139.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=9.42;BaseQRankSum=-0.088;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.16;MQRankSum=-0.781;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.657;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,143 0/1:5,14:19:40:.:179,0,40:2,3,6,8 +chrX 2510044 . T C 524 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=14.58;BaseQRankSum=0;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=9.513;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=1.506;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,143 0|1:22,16:38:99:.:0|1:2510044_T_C:554,0,855:2510044:13,9,5,11 +chrX 2510076 . T A 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=1.261;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=12.712;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.00;ReadPosRankSum=-1.997;SOR=1.620;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,143 0|1:22,17:39:99:.:0|1:2510044_T_C:585,0,852:2510044:14,8,5,12 +chrX 2510500 . A G 1018 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=8.73;BaseQRankSum=-0.089;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.470;MQ=59.96;MQRankSum=1.13;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.559;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,35:64:99:183,0:11,18,14,21 0/1:23,33:56:99:865,0,552:10,13,16,17 +chrX 2510848 . T C 646 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.07;BaseQRankSum=-0.14;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.085;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.08;SOR=0.665;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:89:64:.:.:0,89 0|1:37,19:56:99:.:0|1:2510848_T_C:676,0,1454:2510848:17,20,10,9 +chrX 2510849 . G A 646 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.07;BaseQRankSum=0.338;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.085;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.19;SOR=0.665;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:89:64:.:.:0,89 0|1:37,19:56:99:.:0|1:2510848_T_C:676,0,1454:2510848:17,20,10,9 +chrX 2510996 . A AT 327.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.12;BaseQRankSum=-0.151;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=18.178;MQ=59.91;MQRankSum=-0.797;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=1.865;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:89:64:.:.:0,89 0|1:14,19:33:99:.:0|1:2510996_A_AT:367,0,215:2510996:4,10,14,5 +chrX 2512186 . A T 626 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.62;BaseQRankSum=1.582;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.052;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.885;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:89:64:0,89 0/1:28,24:52:99:.:656,0,747:13,15,10,14 +chrX 2512415 . C T 724 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.00;BaseQRankSum=1.221;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.222;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.00;ReadPosRankSum=-1.541;SOR=0.648;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:89:64:0,89 0/1:30,28:58:99:.:754,0,784:13,17,15,13 +chrX 2512446 . T A 899 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.52;BaseQRankSum=0.249;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.956;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.52;ReadPosRankSum=-2.228;SOR=0.707;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:89:64:0,89 0/1:30,34:64:99:.:929,0,790:14,16,18,16 +chrX 2514119 . TAAAAAAAAAAA T 818.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=18.26;BaseQRankSum=-1.444;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.593;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,33:47:99:.:858,0:9,5,20,13 0/0:.:59:41:59:0,41,1119 +chrX 2516488 . CA C,AA 1854 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=44,11;AS_QD=20.60,2.11;BaseQRankSum=2.293;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=8.257;MQ=59.61;MQRankSum=0.572;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.261;SOR=1.171;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,44,0:46:99:1772,0,1795:2,0,21,23 0/2:40,0,11:51:99:112,229,1245,0,1016,985:21,19,0,11 +chrX 2516502 . CA C 1869.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=29.55;BaseQRankSum=2.285;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=3.100;MQ=59.56;MQRankSum=-0.301;QD=38.18;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.251;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,48:50:99:.:1909,0:2,0,23,25 0/0:.:58:47:58:0,47,990 +chrX 2517657 . CA C,CAAA 2158.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=63,9;AS_QD=30.79,27.67;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.80;QD=30.53;SOR=1.577;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37,0:37:99:945,0,945:0,0,15,22 1/2:0,26,9:35:99:1253,258,341,1023,0,1004:0,0,9,26 +chrX 2517673 . A G 2936 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=33.33;BaseQRankSum=-0.616;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=4.403;MQ=58.84;MQRankSum=1.52;QD=33.33;ReadPosRankSum=1.163;SOR=0.292;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1944,0:0,0,22,26 0/1:13,28:41:99:1022,0,424:3,10,7,21 +chrX 2517810 . CCTTTCTTTCTCTTT C 593.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.39;BaseQRankSum=0.015;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.615;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=1.627;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1501 0/1:27,17:44:99:.:633,0,1052:13,14,5,12 +chrX 2517895 . T G 1626 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=17.81;BaseQRankSum=1.565;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.814;MQ=59.68;MQRankSum=0.78;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.962;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1203,0:0,0,14,28 0/1:33,18:51:99:453,0,878:14,19,8,10 +chrX 2517949 . C T 1459 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=22.91;BaseQRankSum=4.477;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=1.337;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.026;SOR=1.042;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,37:38:99:1267,0:0,1,6,31 0/1:18,9:27:99:222,0,517:4,14,2,7 +chrX 2518162 . C G 2575 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=24.12;BaseQRankSum=0.485;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=11.663;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.12;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.495;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1906,0:0,0,29,29 0/1:25,25:50:99:699,0,689:8,17,16,9 +chrX 2518206 . G T 2936 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=26.02;BaseQRankSum=-2.093;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=3.377;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.02;ReadPosRankSum=-1.1;SOR=0.853;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2138,0:0,0,34,30 0/1:20,30:50:99:828,0,545:9,11,19,11 +chrX 2518393 . C T 3058 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=24.51;BaseQRankSum=0.089;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.843;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.51;ReadPosRankSum=1.884;SOR=0.542;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,66:67:99:2119,0:1,0,33,33 0/1:24,35:59:99:969,0,607:13,11,19,16 +chrX 2518729 . CAAA C,CAA 2223.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=43,20;AS_QD=32.86,11.47;BaseQRankSum=1.007;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=11.179;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=29.39;ReadPosRankSum=-0.627;SOR=0.669;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43,0:43:99:1873,0,1873:0,0,22,21 0/2:14,0,20:34:99:390,432,733,0,301,241:4,10,14,6 +chrX 2518869 . A G 1946 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.49;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.49;SOR=0.796;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1976,0:0,0,31,28 0/0:.:75:99:75:0,100,1414 +chrX 2518956 . T C 3494 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=22.88;BaseQRankSum=-1.521;DP=157;ExcessHet=0.0000;FS=3.547;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.88;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=0.414;VarDP=154 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,77:77:99:2431,0:0,0,40,37 0/1:35,42:77:99:1093,0,936:21,14,21,21 +chrX 2519005 . A G 2421 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=31.83;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=31.83;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,77:77:99:.:2451,0:0,0,42,35 0/0:.:63:94:63:0,94,1255 +chrX 2519227 . A G 2595 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.23;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.23;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,79:79:99:.:2625,0:0,0,37,42 0/0:.:63:94:63:0,94,1255 +chrX 2519433 . A C 2746 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=27.67;BaseQRankSum=-0.632;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=37.01;ReadPosRankSum=0.85;SOR=1.103;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,73:75:99:.:2776,0:1,1,30,43 0/0:.:63:94:63:0,94,1255 +chrX 2519445 . G C 88 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=1.57;BaseQRankSum=0.808;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=1.925;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.62;SOR=0.951;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:36,39:75:99:.:118,0:15,21,14,25 0/0:.:63:94:63:0,94,1255 +chrX 2519952 . G A 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=23.40;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.62;QD=23.40;SOR=0.818;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:585,0:0,0,8,7 0/0:.:23:0:23:0,0,541 +chrX 2520063 . A C 886 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=26.17;BaseQRankSum=1.0;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.15;MQRankSum=-0.847;QD=26.17;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=1.542;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,33:35:99:.:916,0:1,1,11,22 0/0:.:40:37:40:0,37,1022 +chrX 2520186 . ATCACCATCATCATCC A 304.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=28.67;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.67;QD=28.67;SOR=1.402;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,10:12:99:.:344,0:0,0,3,6 0/0:.:35:31:34:0,31,884 +chrX 2520220 . CCAT C 31.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=3.38;BaseQRankSum=-0.911;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=6.410;MQ=53.77;MQRankSum=-0.06;QD=3.38;ReadPosRankSum=-1.509;SOR=2.833;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,99 0/1:18,3:21:71:.:71,0,472:9,9,0,3 +chrX 2520373 . C CCAT 507.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=18.86;BaseQRankSum=0.101;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.59;MQRankSum=-1.433;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.304;SOR=0.976;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,99 0/1:11,18:29:99:.:547,0,331:5,6,7,11 +chrX 2520673 . CCAA C 44.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=1.68;BaseQRankSum=-1.904;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=1.107;MQ=59.79;MQRankSum=1.081;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.641;SOR=1.013;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,26:50:84:.:84,0:13,11,16,10 0/0:.:54:31:51:0,31,1213 +chrX 2520686 . T *,C 979 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=24,24;AS_QD=0.00,23.38;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=21.02;SOR=1.067;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,24,24:48:1:.:1009,1,0:0,0,28,20 0/0:.:54:31:51:0,31,1213,31,1213,1213 +chrX 2521085 . A G 2345 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.67;BaseQRankSum=2.271;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.67;ReadPosRankSum=0.023;SOR=0.323;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,74:75:99:.:2375,0:1,0,41,33 0/0:.:54:31:51:0,31,1213 +chrX 2521161 . T TA 2175.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=30.34;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.34;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,73:73:99:.:2215,0:0,0,39,34 0/0:.:54:31:51:0,31,1213 +chrX 2521611 . C T 2407 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.38;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.38;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,73:73:99:.:2437,0:0,0,33,40 0/0:.:54:31:51:0,31,1213 +chrX 2522039 . A G 1659 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=33.78;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.78;SOR=1.051;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:1689,0:0,0,29,21 0/0:.:54:31:51:0,31,1213 +chrX 2522113 . C A,CA 239 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,14;AS_QD=3.18,7.47;BaseQRankSum=1.705;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=4.360;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.411;SOR=1.402;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:99:50:0,1141,1141 0/2:22,6,14:42:99:.:269,180,1418,0,386,356:11,11,13,7 +chrX 2522130 . A AG 858.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=25.66;BaseQRankSum=0.765;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=12.548;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.66;ReadPosRankSum=-1.061;SOR=1.231;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,32:35:99:.:898,0:0,3,21,11 0/0:.:63:88:63:0,88,1443 +chrX 2522132 . G GAA,A 2076 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,32;AS_QD=30.92,33.09;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=60.17;SOR=1.148;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,3,32:35:99:.:2106,935,0:0,0,21,14 0/0:.:63:88:63:0,88,1443,88,1443,1443 +chrX 2522545 . G T 2120 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=30.28;BaseQRankSum=-0.636;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.28;ReadPosRankSum=1.733;SOR=0.272;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,70:71:99:.:2150,0:1,0,37,33 0/0:.:63:88:63:0,88,1443 +chrX 2523225 . CTT C 131.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=8.55;BaseQRankSum=0.616;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=11.886;MQ=59.06;MQRankSum=0.248;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=1.724;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,327 0/1:12,8:20:99:.:171,0,252:9,3,2,6 +chrX 2523421 . T C 2136 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=21.24;BaseQRankSum=-1.22;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=7.168;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=21.24;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.267;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1756,0:0,0,25,30 0/1:30,17:47:99:410,0,872:10,20,10,7 +chrX 2524173 . G A 585 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.81;BaseQRankSum=0.572;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.756;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1615 0/1:25,23:48:99:.:615,0,665:8,17,7,16 +chrX 2524315 . A G 4172 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=32.57;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.57;SOR=0.740;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2168,0:0,0,28,39 1/1:0,62:62:99:2034,186,0:0,0,38,24 +chrX 2524430 . A G 690 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=5.29;BaseQRankSum=0.822;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=4.152;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.414;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:38,42:80:99:99,0:25,13,23,19 0/1:32,24:56:99:621,0,874:19,13,13,11 +chrX 2524626 . C T 953 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=11.99;BaseQRankSum=0.178;DP=155;ExcessHet=0.0000;FS=7.449;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.726;SOR=0.250;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1452 0/1:44,38:82:99:.:983,0,1203:29,15,19,19 +chrX 2524961 . G A 1090 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=-0.186;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=6.474;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=0.264;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1452 0/1:30,40:70:99:.:1120,0,791:9,21,18,22 +chrX 2525849 . C CCCTT 619.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=7.32;BaseQRankSum=0.432;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=10.420;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=1.662;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,27:53:44:44,0:12,14,6,21 0/1:20,17:37:99:615,0,748:11,9,8,9 +chrX 2526535 . C T 378 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=11.33;BaseQRankSum=0.734;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.320;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.513;SOR=0.814;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,109 0/1:20,16:36:99:.:408,0,502:9,11,9,7 +chrX 2527092 . G A 297 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=5.95;BaseQRankSum=-1.509;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.366;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.37;SOR=1.179;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,33:55:99:.:327,0:11,11,13,20 0/0:.:61:68:61:0,68,1211 +chrX 2528142 . C T 546 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=10.67;BaseQRankSum=1.737;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.576;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,35:54:99:.:576,0:11,8,19,16 0/0:.:61:68:61:0,68,1211 +chrX 2529179 . A G 110 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=1.94;BaseQRankSum=0.153;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=1.932;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.484;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,38:72:99:.:140,0:20,14,20,18 0/0:.:61:68:61:0,68,1211 +chrX 2529701 . C A 367 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=6.02;BaseQRankSum=1.303;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=30.516;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.96;SOR=0.838;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,38:66:99:.:397,0:5,23,23,15 0/0:.:61:68:61:0,68,1211 +chrX 2530086 . G A 64 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=1.74;BaseQRankSum=-0.803;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=10.009;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.274;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,29:54:94:.:94,0:18,7,14,15 0/0:.:61:68:61:0,68,1211 +chrX 2530301 . T C 267 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=4.43;BaseQRankSum=-1.272;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=3.400;MQ=59.62;MQRankSum=0.193;QD=4.43;ReadPosRankSum=-1.393;SOR=0.373;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,38:67:99:.:297,0:19,10,21,17 0/0:.:45:46:45:0,46,1071 +chrX 2530323 . C G 78 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=1.57;BaseQRankSum=-0.128;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.940;MQ=59.47;MQRankSum=0.062;QD=1.57;ReadPosRankSum=0.048;SOR=0.507;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,36:69:99:.:108,0:21,12,21,15 0/0:.:45:46:45:0,46,1071 +chrX 2531306 . A G 1688 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=14.94;BaseQRankSum=-0.298;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0.045;QD=14.94;ReadPosRankSum=1.592;SOR=0.729;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,33:64:54:54,0:10,21,12,21 1/1:0,51:51:99:1664,153,0:0,0,15,36 +chrX 2531870 . C T 766 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.61;BaseQRankSum=1.202;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=0.756;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1265 0/1:44,31:75:99:.:796,0,1194:22,22,15,16 +chrX 2531946 . G A 1029 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=-0.579;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=4.295;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.28;SOR=0.326;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1265 0/1:41,41:82:99:.:1059,0,1093:15,26,20,21 +chrX 2532011 . G A 1098 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=15.67;BaseQRankSum=0.058;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=12.395;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.613;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1265 0/1:31,41:72:99:.:1128,0,785:10,21,23,18 +chrX 2532088 . C A 823 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.51;BaseQRankSum=0.65;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.833;MQ=59.60;MQRankSum=-1.23;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.85;SOR=0.418;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1265 0/1:24,31:55:99:.:853,0,579:9,15,16,15 +chrX 2532153 . C CA 126.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=4.26;BaseQRankSum=1.189;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.26;ReadPosRankSum=-1.015;SOR=0.560;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,23:39:99:.:166,0:9,7,12,11 0/0:.:50:60:50:0,60,900 +chrX 2532598 . T C 39 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=1.19;BaseQRankSum=-0.157;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.150;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.19;ReadPosRankSum=-0.936;SOR=0.460;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,30:58:69:.:69,0:12,16,15,15 0/0:.:38:0:38:0,0,233 +chrX 2532623 . G GCA 3179.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=28.03;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.78;SOR=0.987;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:2246,0:0,0,27,31 1/1:0,25:25:75:973,75,0:0,0,9,16 +chrX 2532799 . G T 3562 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.36;BaseQRankSum=2.328;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.36;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.497;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,65:66:99:2098,0:1,0,40,25 1/1:0,45:45:99:1494,135,0:0,0,28,17 +chrX 2532934 . T A 667 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=-0.827;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=12.548;MQ=59.68;MQRankSum=-0.963;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.783;SOR=1.382;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:27,27:54:99:.:697,0,747:17,10,9,18 +chrX 2533134 . G A 1033 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=22.62;BaseQRankSum=-1.074;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=14.356;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.689;SOR=0.764;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,422 0|1:20,27:47:99:.:0|1:2533134_G_A:1063,0,728:2533134:5,15,16,11 +chrX 2533140 . T C 1033 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=22.62;BaseQRankSum=-0.449;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=14.356;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.54;SOR=0.764;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,422 0|1:20,27:47:99:.:0|1:2533134_G_A:1063,0,728:2533134:5,15,16,11 +chrX 2533361 . C G 367 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=9.23;BaseQRankSum=-0.314;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=6.868;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.05;SOR=1.539;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:27,16:43:99:.:397,0,769:12,15,11,5 +chrX 2533404 . A AC 1107.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=23.41;BaseQRankSum=0.647;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=4.189;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.41;ReadPosRankSum=-1.216;SOR=0.381;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,422 0|1:20,29:49:99:.:0|1:2533404_A_AC:1147,0,719:2533404:13,7,14,15 +chrX 2533414 . C A 1158 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=22.85;BaseQRankSum=0.115;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=5.683;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.85;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.617;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,422 0|1:21,31:52:99:.:0|1:2533404_A_AC:1188,0,748:2533404:13,8,14,17 +chrX 2533500 . C G 722 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.19;BaseQRankSum=-0.404;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.007;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.453;SOR=0.782;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:29,28:57:99:.:752,0,797:14,15,15,13 +chrX 2534073 . T C 664 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.02;BaseQRankSum=1.919;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=9.185;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.936;SOR=0.458;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:37,26:63:99:.:694,0,996:25,12,12,14 +chrX 2534155 . A G 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.91;BaseQRankSum=0.425;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=10.877;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=0.802;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:37,29:66:99:.:720,0,1422:24,13,12,17 +chrX 2534159 . A G 835 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=12.72;BaseQRankSum=-2.742;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=10.606;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.875;SOR=1.317;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:31,37:68:99:.:865,0,1161:13,18,24,13 +chrX 2534180 . A G 766 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.06;BaseQRankSum=2.102;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=6.336;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=0.757;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:42,30:72:99:.:796,0,1113:25,17,13,17 +chrX 2534250 . G A 717 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.25;BaseQRankSum=2.192;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.469;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=1.145;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:34,27:61:99:.:747,0,873:16,18,10,17 +chrX 2534316 . T C 554 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.68;BaseQRankSum=-1.455;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.102;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=0.460;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:27,23:50:99:.:584,0,769:11,16,11,12 +chrX 2534391 . A C 701 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.54;BaseQRankSum=-1.029;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.067;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.448;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,422 0/1:27,27:54:99:.:731,0,765:10,17,12,15 +chrX 2534869 . C T 3772 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=33.06;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=33.06;SOR=0.820;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2045,0:0,0,34,28 1/1:0,53:53:99:1757,159,0:0,0,27,26 +chrX 2534897 . A G 730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.46;BaseQRankSum=-0.197;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=-0.984;QD=12.46;ReadPosRankSum=3.117;SOR=0.638;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1364 0/1:31,30:61:99:.:760,0,824:17,14,16,14 +chrX 2535085 . C T 903 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.09;BaseQRankSum=-0.98;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.09;ReadPosRankSum=2.003;SOR=0.779;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1364 0/1:23,35:58:99:.:933,0,596:11,12,16,19 +chrX 2535194 . TAA T 803.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.91;BaseQRankSum=0.536;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=5.672;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.613;SOR=1.049;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:99:72:.:.:0,1364 0|1:30,23:53:99:.:0|1:2535194_TAA_T:843,0,1180:2535194:17,13,9,14 +chrX 2535204 . TG T 830.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.82;BaseQRankSum=2.572;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=3.786;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=0.938;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:72:99:72:.:.:0,1364 0|1:31,24:55:99:.:0|1:2535194_TAA_T:870,0,1176:2535194:17,14,10,14 +chrX 2535304 . A C 537 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.12;BaseQRankSum=-0.397;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=4.116;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.279;SOR=0.257;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1364 0/1:28,23:51:99:.:567,0,756:19,9,12,11 +chrX 2535666 . T G 749 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.43;BaseQRankSum=-2.084;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.693;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1364 0/1:25,29:54:99:.:779,0,685:13,12,14,15 +chrX 2535729 . A G 636 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.57;BaseQRankSum=0.226;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.404;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1364 0/1:27,26:53:99:.:666,0,687:16,11,13,13 +chrX 2535836 . A G 703 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.86;BaseQRankSum=2.779;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=2.215;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.93;SOR=0.434;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1364 0/1:31,26:57:99:.:733,0,811:13,18,13,13 +chrX 2536242 . A G 950 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=15.08;BaseQRankSum=-0.643;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=13.217;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.184;SOR=1.118;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1364 0/1:30,35:65:99:.:980,0,827:11,19,22,13 +chrX 2536675 . T G 332 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=7.10;BaseQRankSum=-1.72;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.573;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.10;ReadPosRankSum=-2.329;SOR=0.557;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1364 0/1:34,17:51:99:.:362,0,979:14,20,9,8 +chrX 2536689 . T C 241 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=5.42;BaseQRankSum=-3.225;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=1.114;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.36;SOR=0.529;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:19,31:50:99:.:271,0:7,12,13,18 0/0:.:61:99:61:0,120,1800 +chrX 2536830 . T C 3819 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=32.08;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=32.08;SOR=0.950;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1995,0:0,0,32,29 1/1:0,59:59:99:1854,177,0:0,0,35,24 +chrX 2536856 . A G 622 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.52;BaseQRankSum=-3.06;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.979;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.447;SOR=0.896;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1737 0/1:35,27:62:99:.:652,0,1010:19,16,16,11 +chrX 2536976 . T C 698 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.13;BaseQRankSum=-0.49;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.617;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=0.324;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1737 0/1:32,28:60:99:.:728,0,863:20,12,14,14 +chrX 2537354 . TAA T,TA 1448.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=27,49;AS_QD=32.00,28.22;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=19.58;SOR=0.801;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27,22:49:99:864,0,105:0,0,22,27 2/2:0,0,27:27:81:624,624,624,81,81,0:0,0,14,13 +chrX 2537628 . C T 619 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=8.89;BaseQRankSum=0.415;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=2.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.332;SOR=0.435;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1594 0/1:46,27:73:99:.:649,0,1237:17,29,12,15 +chrX 2537644 . A G 488 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=7.73;BaseQRankSum=-0.048;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=2.182;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.73;ReadPosRankSum=2.682;SOR=0.407;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1594 0/1:43,24:67:99:.:518,0,1195:16,27,11,13 +chrX 2538194 . T TTGTTTTGCACAAGG 2567.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=21.02;BaseQRankSum=1.324;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=11.779;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.485;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,36:69:99:133,0:11,22,20,16 1/1:0,55:55:99:2474,165,0:0,0,29,26 +chrX 2538299 . G C 635 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.55;BaseQRankSum=-0.178;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.828;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.764;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,1800 0/1:28,25:53:99:.:665,0,784:16,12,11,14 +chrX 2538408 . C T 4168 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=32.80;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.80;SOR=1.270;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2025,0:0,0,38,24 1/1:0,66:66:99:2173,198,0:0,0,41,25 +chrX 2539312 . G C 607 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=5.74;BaseQRankSum=-0.541;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.705;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.668;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,31:57:99:129,0:12,14,16,15 0/1:32,22:54:99:508,0,808:18,14,10,12 +chrX 2539334 . C G 3562 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.65;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=32.65;SOR=0.806;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2021,0:0,0,27,34 1/1:0,49:49:99:1571,147,0:0,0,25,24 +chrX 2539352 . A G 692 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.73;BaseQRankSum=0.638;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=4.055;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.706;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1394 0/1:22,27:49:99:.:722,0,518:9,13,15,12 +chrX 2539751 . G A 474 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.33;BaseQRankSum=0.597;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=6.326;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.2;SOR=0.193;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1394 0/1:34,20:54:99:.:504,0,920:25,9,11,9 +chrX 2540279 . C A 784 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=17.70;BaseQRankSum=-1.824;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=11.541;MQ=59.94;MQRankSum=1.415;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.188;SOR=1.399;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1394 0/1:16,30:46:99:.:814,0,408:10,6,10,20 +chrX 2540466 . A AT,ATT 1376.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=22,39;AS_QD=32.74,34.79;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=23.21;SOR=0.725;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22,23:45:59:886,0,59:0,0,23,22 2/2:0,0,16:16:48:530,530,530,48,48,0:0,0,7,9 +chrX 2540749 . C T 706 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=7.83;BaseQRankSum=-0.168;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.795;MQ=59.23;MQRankSum=0.039;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.836;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,37:73:25:25,0:18,18,16,21 1/1:0,21:21:63:711,63,0:0,0,11,10 +chrX 2540851 . CTTTTTTTT C,CTTTTTTT 1132.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=39,11;AS_QD=30.05,22.64;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=23.44;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26,11:37:99:609,0,360:0,0,17,20 1/1:0,13,0:13:40:563,40,0,563,40,563:0,0,9,4 +chrX 2541283 . C T 719 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=34.05;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.05;SOR=1.329;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:60:47:0,60 1/1:0,22:22:66:.:749,66,0:0,0,8,14 +chrX 2541489 . GCTTT G 383.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=10.85;BaseQRankSum=-0.754;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=12.046;MQ=59.82;MQRankSum=-1.444;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.949;SOR=0.631;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:49:60:47:0,60 0/1:27,12:39:99:.:423,0,1087:21,6,5,7 +chrX 2541582 . A T 60 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=3.00;BaseQRankSum=1.587;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=1.494;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.77;SOR=0.412;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:14,16:30:90:.:90,0:10,4,10,6 0/0:.:36:34:32:0,34,877 +chrX 2541594 . GAA G,GAAAA,GGAAAAAAAAAAAA 845.97 . AC=0,1,1;AF=0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,15,18;AS_QD=0.00,13.21,21.04;BaseQRankSum=0.338;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=8.711;MQ=57.91;MQRankSum=-1.228;QD=19.67;ReadPosRankSum=-2.571;SOR=0.511;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,3,15,0:18:99:317,690,0,553:0,0,9,9 0/3:9,0,0,18:27:99:568,596,840,596,840,840,0,244,244,190:7,2,7,11 +chrX 2541821 . A G 1704 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=18.06;BaseQRankSum=0.789;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.900;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.184;SOR=0.706;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,28:51:99:211,0:11,12,14,14 1/1:0,45:45:99:1523,135,0:0,0,24,21 +chrX 2541992 . C T 812 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.31;BaseQRankSum=0.446;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.732;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,307 0/1:23,32:55:99:.:842,0,550:11,12,15,17 +chrX 2542548 . A G 3164 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=31.31;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;QD=31.31;SOR=0.952;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1553,0:0,0,30,19 1/1:0,53:53:99:1641,158,0:0,0,27,26 +chrX 2543002 . AAAATAAATAAATAAATAAAT AAAATAAATAAAT,A 1909.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=40,23;AS_QD=19.69,24.45;BaseQRankSum=-1.721;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.170;MQ=59.96;MQRankSum=1.212;QD=24.99;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=1.055;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,20,0:35:99:178,0,853:6,9,3,17 1/2:0,20,23:43:99:1771,929,866,842,0,1052:0,0,18,25 +chrX 2543324 . T C 683 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.88;BaseQRankSum=-1.529;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.990;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.972;SOR=0.740;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,842 0/1:32,28:60:99:.:713,0,892:17,15,13,15 +chrX 2543766 . CA C,CAA 554.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=9,20;AS_QD=11.56,21.45;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;QD=20.48;SOR=1.460;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,842,842 1/2:0,9,20:29:99:.:594,490,590,165,0,171:0,0,19,10 +chrX 2544106 . C T 1139 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=20.16;BaseQRankSum=0.419;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=3.623;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.16;ReadPosRankSum=-1.603;SOR=0.352;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,1552 0|1:27,31:58:99:.:0|1:2544106_C_T:1169,0,999:2544106:10,17,15,16 +chrX 2544123 . T C 1091 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=19.00;BaseQRankSum=-1.4;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.248;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.405;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,1552 0|1:29,30:59:99:.:0|1:2544106_C_T:1121,0,1066:2544106:10,19,13,17 +chrX 2544710 . T C 747 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.53;BaseQRankSum=-0.65;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=4.921;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.53;ReadPosRankSum=-2.107;SOR=1.074;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1552 0/1:32,30:62:99:.:777,0,851:15,17,18,12 +chrX 2545328 . G A 4742 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=145;AS_QD=32.91;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.91;SOR=0.919;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2328,0:0,0,30,40 1/1:0,75:75:99:2444,225,0:0,0,50,25 +chrX 2546745 . T C 4187 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=31.95;BaseQRankSum=-0.52;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.95;ReadPosRankSum=-1.605;SOR=0.247;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1676,0:0,1,24,29 1/1:0,78:78:99:2541,234,0:0,0,42,36 +chrX 2547395 . T C 3532 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=31.80;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;QD=31.80;SOR=0.844;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,73:73:99:2276,0:0,0,36,37 1/1:0,39:39:99:1286,117,0:0,0,24,15 +chrX 2547688 . G A 680 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=8.35;BaseQRankSum=2.432;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=2.866;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.926;SOR=0.973;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,21:41:99:131,0:9,11,11,10 0/1:23,21:44:99:579,0,543:12,11,13,8 +chrX 2547732 . TTGTATGTG T 1742.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=29.79;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.55;SOR=3.611;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:935,0:0,0,18,3 1/1:0,19:19:58:847,58,0:0,0,17,2 +chrX 2548133 . TAA T 196.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=7.61;BaseQRankSum=0.772;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=1.515;MQ=59.63;MQRankSum=0.809;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.646;SOR=0.368;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:99:48:0,123 0/1:20,11:31:99:.:236,0,449:7,13,5,6 +chrX 2548230 . C CTT 364.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.92;BaseQRankSum=-2.773;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;MQRankSum=-1.357;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.593;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:48:99:48:0,123 0/1:18,19:37:99:.:404,0,476:8,10,9,10 +chrX 2548349 . C A 501 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=5.06;BaseQRankSum=-1.713;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.595;MQ=59.90;MQRankSum=1.051;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.495;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,30:59:5:5,0:16,13,14,16 0/1:25,21:46:99:526,0,721:15,10,11,10 +chrX 2549533 . C G 714 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=6.05;BaseQRankSum=1.576;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=3.255;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.05;ReadPosRankSum=1.015;SOR=0.767;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,35:70:60:60,0:17,18,18,17 0/1:27,26:53:99:684,0,759:12,15,15,11 +chrX 2549572 . T TG 686.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.13;BaseQRankSum=0.338;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=4.201;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.3;SOR=0.247;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:80:68:0,80 0/1:24,24:48:99:.:726,0,740:16,8,12,12 +chrX 2550033 . C T 1103 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=10.03;BaseQRankSum=1.336;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.982;SOR=0.678;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,26:49:99:99,0:15,8,14,12 0/1:27,37:64:99:1034,0,651:13,14,21,16 +chrX 2550391 . C T 881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=6.85;BaseQRankSum=1.559;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=4.145;MQ=54.94;MQRankSum=-5.527;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.144;SOR=1.053;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:35,35:70:21:.:.:21,0:.:15,20,12,23 0|1:39,24:63:99:0|1:2550391_C_T:890,0,1554:2550391:21,18,12,12 +chrX 2550392 . C G 881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=6.85;BaseQRankSum=1.286;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=4.145;MQ=54.98;MQRankSum=-5.527;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.156;SOR=1.053;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:35,35:70:21:.:.:21,0:.:15,20,12,23 0|1:39,24:63:99:0|1:2550391_C_T:890,0,1554:2550391:21,18,12,12 +chrX 2550499 . T C 4018 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=131;AS_QD=30.90;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.28;QD=30.90;SOR=0.739;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:1873,0:0,0,35,28 1/1:0,68:68:99:2175,204,0:0,0,32,36 +chrX 2551306 . ATT A 318.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=6.28;BaseQRankSum=1.506;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=7.296;MQ=59.82;MQRankSum=1.112;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.583;SOR=1.075;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:13,14:27:54:54,0:9,4,7,7 0/1:18,12:30:99:304,0,440:9,9,3,9 +chrX 2551343 . G T 1811 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=23.60;BaseQRankSum=1.6;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.771;MQ=59.43;MQRankSum=-0.915;QD=23.60;ReadPosRankSum=0.314;SOR=0.345;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1329,0:0,0,21,22 0/1:17,18:35:99:512,0,401:6,11,8,10 +chrX 2551600 . C T 140 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=2.30;BaseQRankSum=3.579;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=-0.973;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.801;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:37,37:74:99:.:170,0:18,19,17,20 0/0:.:65:93:65:0,93,1187 +chrX 2552213 . T C 1104 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=9.22;BaseQRankSum=-1.762;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=5.620;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.789;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,38:65:99:277,0:15,12,18,20 0/1:22,36:58:99:857,0,582:12,10,15,21 +chrX 2552352 . T G 812 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=8.34;BaseQRankSum=0.076;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.653;SOR=0.763;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,30:59:35:35,0:14,15,15,15 0/1:14,28:42:99:807,0,360:9,5,17,11 +chrX 2552458 . A G 816 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=11.75;BaseQRankSum=0.485;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=0.891;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.844;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,293 0/1:40,32:72:99:.:846,0,1093:19,21,14,18 +chrX 2552811 . A G 3935 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=32.77;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.77;SOR=0.850;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2278,0:0,0,36,34 1/1:0,51:51:99:1687,153,0:0,0,29,22 +chrX 2553051 . T G 1101 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=8.98;BaseQRankSum=0.397;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.181;SOR=0.733;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,36:62:99:236,0:13,13,20,16 0/1:31,33:64:99:895,0,845:17,14,17,16 +chrX 2553080 . G A 1097 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=9.09;BaseQRankSum=-0.014;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.671;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.790;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,37:66:99:243,0:17,12,21,16 0/1:26,32:58:99:884,0,670:12,14,17,15 +chrX 2553273 . A G 857 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.13;BaseQRankSum=-2.458;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.646;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:11:56:0,11 0/1:22,33:55:99:.:887,0,600:9,13,14,19 +chrX 2553449 . C G 627 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.17;BaseQRankSum=-1.896;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.277;MQ=59.90;MQRankSum=-1.04;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=1.051;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,329 0/1:29,25:54:99:.:657,0,836:14,15,10,15 +chrX 2553493 . G A 425 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=3.61;BaseQRankSum=0.591;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.426;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.155;SOR=0.548;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:36,37:73:9:9,0:15,21,20,17 0/1:35,18:53:99:446,0,997:17,18,7,11 +chrX 2553606 . C G 639 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.16;BaseQRankSum=0.892;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=7.405;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.654;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:77:99:77:0,135 0/1:30,25:55:99:.:669,0,828:11,19,14,11 +chrX 2553682 . G T 893 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.33;BaseQRankSum=1.498;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.417;MQ=59.96;MQRankSum=1.09;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.109;SOR=0.587;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,36:68:99:179,0:16,16,16,20 0/1:31,27:58:99:744,0,858:13,18,16,11 +chrX 2553875 . G C 4225 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=31.99;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=31.99;SOR=0.870;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2286,0:0,0,39,32 1/1:0,62:62:99:1969,185,0:0,0,33,29 +chrX 2553910 . T C 998 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=6.95;BaseQRankSum=-0.298;DP=153;ExcessHet=0.0000;FS=2.102;MQ=59.87;MQRankSum=1.073;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.294;SOR=0.518;VarDP=148 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:38,41:79:84:84,0:21,17,26,15 0/1:33,36:69:99:944,0,891:23,10,18,18 +chrX 2553933 . G T 970 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=13.33;BaseQRankSum=2.486;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=6.189;MQ=59.90;MQRankSum=1.013;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.274;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:76:47:61:0,47 0/1:38,37:75:99:.:1000,0,920:26,12,20,17 +chrX 2554386 . G A 4094 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=33.26;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.26;SOR=0.793;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2055,0:0,0,31,30 1/1:0,63:63:99:2069,189,0:0,0,28,35 +chrX 2554760 . A C 447 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.35;BaseQRankSum=-1.526;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;MQRankSum=0.811;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.671;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1673 0/1:32,19:51:99:.:477,0,933:15,17,9,10 +chrX 2554837 . C T 2275 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=21.15;BaseQRankSum=3.179;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.416;SOR=0.631;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,53:54:99:1782,0:0,1,29,24 0/1:34,21:55:99:523,0,952:21,13,14,7 +chrX 2555865 . T G 3343 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=30.94;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.94;SOR=0.827;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1476,0:0,0,22,23 1/1:0,64:64:99:1897,190,0:0,0,29,35 +chrX 2555935 . C T 3439 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=32.42;BaseQRankSum=1.971;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=3.481;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.42;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.595;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,55:56:99:1766,0:1,0,27,28 1/1:0,51:51:99:1703,153,0:0,0,20,31 +chrX 2557033 . A G 493 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=4.43;BaseQRankSum=-1.229;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=17.599;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.03;SOR=1.237;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,36:68:79:79,0:12,20,24,12 0/1:31,19:50:99:444,0,887:14,17,11,8 +chrX 2560698 . C T 3550 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=34.10;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.10;SOR=1.115;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1534,0:0,0,14,31 1/1:0,60:60:99:2046,180,0:0,0,29,31 +chrX 2561193 . GTA G 3540.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=28.57;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=37.68;SOR=0.802;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1506,0:0,0,19,21 1/1:0,55:55:99:2074,166,0:0,0,26,29 +chrX 2561210 . CT C 462.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.04;BaseQRankSum=1.471;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=4.022;MQ=59.73;MQRankSum=1.081;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.840;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,675 0/1:24,26:50:99:.:502,0,422:14,10,11,15 +chrX 2562402 . CTATATA C,CTA 2458.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,57;AS_QD=10.71,33.76;BaseQRankSum=-0.073;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.329;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.76;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.884;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,35:35:99:.:.:1690,1508,0:.:0,0,21,14 0|2:17,0,22:39:99:0|1:2562402_CTATA_C:808,859,1524,0,665,598:2562402:8,9,11,11 +chrX 2562404 . A *,C 1626 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,11;AS_QD=0.00,32.18;BaseQRankSum=3.618;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=48.71;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.302;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35,0:35:99:.:.:1690,0,1599:.:0,0,21,14 1|2:1,22,11:34:99:1|0:2562402_CTATA_C:1656,434,558,854,0,1078:2562402:1,0,16,17 +chrX 2562406 . A *,C 1626 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,11;AS_QD=0.00,29.34;BaseQRankSum=0;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=48.71;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=0.302;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35,0:35:99:.:.:1690,0,1599:.:0,0,21,14 1|2:1,22,11:34:99:1|0:2562402_CTATA_C:1656,434,558,854,0,1078:2562402:1,0,16,17 +chrX 2562408 . A *,C 1660 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,35;AS_QD=30.50,35.19;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=48.29;SOR=1.148;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,0,35:35:99:.:1690,1508,0:0,0,21,14 0/0:.:60:87:60:0,87,1412,87,1412,1412 +chrX 2562945 . C A 3539 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=30.77;BaseQRankSum=2.913;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.77;ReadPosRankSum=1.524;SOR=0.379;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,57:58:99:1778,0:0,1,32,25 1/1:2,56:58:99:1791,124,0:1,1,24,32 +chrX 2564134 . A AT 1075.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=15.27;BaseQRankSum=-1.011;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=29.263;MQ=59.42;MQRankSum=0;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.783;SOR=1.357;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:773,0:0,0,24,12 0/1:16,21:37:99:342,0,256:3,13,14,7 +chrX 2564298 . A G 715 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.30;BaseQRankSum=-1.567;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=9.804;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=1.535;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:94:63:0,94 0/1:25,31:56:99:.:745,0,647:11,14,21,10 +chrX 2564726 . T C 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.38;BaseQRankSum=-0.75;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.245;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.718;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:94:63:0,94 0/1:25,33:58:99:.:892,0,655:14,11,15,18 +chrX 2564788 . C A 3565 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=32.98;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.98;SOR=1.148;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1618,0:0,0,31,17 1/1:0,61:61:99:1977,183,0:0,0,34,27 +chrX 2565013 . A G 913 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=7.54;BaseQRankSum=0.217;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=6.967;MQ=59.85;MQRankSum=1.887;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.705;SOR=1.306;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,35:66:99:138,0:13,18,11,24 0/1:27,32:59:99:805,0,727:14,13,12,20 +chrX 2565047 . C A 970 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=8.00;BaseQRankSum=1.511;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=1.457;MQ=59.89;MQRankSum=1.448;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.088;SOR=0.892;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,32:64:81:81,0:11,21,13,19 0/1:27,34:61:99:919,0,611:14,13,12,22 +chrX 2565098 . CA C 2541.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=26.89;BaseQRankSum=-0.518;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.743;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=26.89;ReadPosRankSum=1.431;SOR=0.269;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,39:40:99:1071,0:0,1,16,23 1/1:1,55:56:99:1510,141,0:0,1,19,36 +chrX 2565126 . T C 785 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.35;BaseQRankSum=-0.496;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;MQRankSum=0.971;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.08;SOR=0.700;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1800 0/1:35,31:66:99:.:815,0,947:17,18,15,16 +chrX 2565248 . T G 4542 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=145;AS_QD=31.53;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.53;SOR=1.132;VarDP=145 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2315,0:0,0,47,25 1/1:0,73:73:99:2257,219,0:0,0,39,34 +chrX 2565404 . G A 975 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=16.21;BaseQRankSum=-0.164;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.993;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.21;SOR=0.914;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:69:99:69:.:.:0,312 0|1:24,38:62:99:.:0|1:2565404_G_A:1005,0,539:2565404:12,12,17,21 +chrX 2565420 . A G 5072 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=30.70;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.79;SOR=0.801;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:2608,0:.:0,0,33,38 1|1:0,64:64:99:0|1:2565404_G_A:2494,192,0:2565404:0,0,31,33 +chrX 2565704 . C T 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.31;BaseQRankSum=-1.059;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.561;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.796;SOR=1.034;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1792 0/1:23,22:45:99:.:599,0,653:12,11,9,13 +chrX 2565834 . T C 2436 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=23.49;BaseQRankSum=-1.326;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.858;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.49;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.464;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1852,0:0,0,26,29 0/1:26,24:50:99:614,0,694:15,11,14,10 +chrX 2565902 . G A 744 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=5.65;BaseQRankSum=3.512;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.65;ReadPosRankSum=1.828;SOR=0.743;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:42,38:80:32:32,0:25,17,20,18 0/1:29,28:57:99:742,0,732:15,14,18,10 +chrX 2566282 . C T 550 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.37;BaseQRankSum=0.407;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.388;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.730;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:50:66:0,50 0/1:29,22:51:99:.:580,0,787:13,16,12,10 +chrX 2567239 . C A 631 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.71;BaseQRankSum=-2.798;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.857;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:50:66:0,50 0/1:26,26:52:99:.:661,0,746:10,16,9,17 +chrX 2567642 . ATT A,AT 1613.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=3,68;AS_QD=0.00,17.97;BaseQRankSum=1.059;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.676;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,3,48:51:99:1259,1270,0:0,0,27,24 0/2:24,0,20:44:99:394,465,1000,0,534,474:13,11,11,9 +chrX 2568939 . TG T 793.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.12;BaseQRankSum=1.644;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.992;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.567;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,379 0/1:27,32:59:99:.:833,0,699:10,17,13,19 +chrX 2570081 . T C 4405 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=32.61;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.61;SOR=1.066;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:2352,0:0,0,43,29 1/1:0,64:64:99:2083,192,0:0,0,36,28 +chrX 2570221 . G A 788 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.10;BaseQRankSum=0.47;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.657;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=0.806;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:99:73:0,913 0/1:28,30:58:99:.:818,0,738:12,16,17,13 +chrX 2571823 . A G 712 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=7.13;BaseQRankSum=2.076;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.047;SOR=0.700;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,24:45:59:59,0:8,13,11,13 0/1:34,25:59:99:683,0,915:20,14,13,12 +chrX 2571935 . C T 861 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.14;BaseQRankSum=-0.629;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;MQRankSum=-0.862;QD=14.14;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=0.814;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:84:63:0,84 0/1:28,35:63:99:.:891,0,710:16,12,21,14 +chrX 2572719 . T C 489 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.38;BaseQRankSum=0.139;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=13.544;MQ=59.65;MQRankSum=0;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=0.973;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:84:63:0,84 0/1:29,21:50:99:.:519,0,809:9,20,13,8 +chrX 2573055 . C T 1443 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=11.33;BaseQRankSum=1.31;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.393;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.35;SOR=0.823;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:28,29:57:4:.:.:4,0:.:11,17,14,15 0|1:35,38:73:99:0|1:2573055_C_T:1469,0,1355:2573055:21,14,17,21 +chrX 2573059 . C G 1439 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=20.12;BaseQRankSum=0.359;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=6.137;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.696;SOR=0.672;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,134 0|1:35,38:73:99:.:0|1:2573055_C_T:1469,0,1355:2573055:21,14,17,21 +chrX 2573293 . A C 3409 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=32.44;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.44;SOR=0.853;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1533,0:0,0,24,24 1/1:0,58:58:99:1906,174,0:0,0,25,33 +chrX 2573378 . C G 3780 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=118;AS_QD=32.29;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.29;SOR=0.762;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1985,0:0,0,35,27 1/1:0,56:56:99:1825,167,0:0,0,22,34 +chrX 2573438 . T C 726 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=6.52;BaseQRankSum=1.514;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=3.397;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.908;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,31:61:67:.:.:67,0:.:15,15,19,12 0|1:36,19:55:99:0|1:2573438_T_C:689,0,1429:2573438:17,19,9,10 +chrX 2573442 . T C 783 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=7.01;BaseQRankSum=0.126;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.400;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.972;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:29,32:61:99:.:.:124,0:.:15,14,20,12 0|1:36,19:55:99:0|1:2573438_T_C:689,0,1429:2573438:17,19,9,10 +chrX 2573458 . T C 559 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.71;BaseQRankSum=-1.13;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.105;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.258;SOR=0.719;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:66:99:66:.:.:0,278 0|1:38,17:55:99:.:0|1:2573438_T_C:589,0,1478:2573438:18,20,9,8 +chrX 2573630 . G A 749 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.20;BaseQRankSum=1.108;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.188;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.44;SOR=0.420;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,278 0/1:29,30:59:99:.:779,0,721:12,17,15,15 +chrX 2573679 . C T 822 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.20;BaseQRankSum=-0.232;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;MQRankSum=-0.902;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.845;SOR=0.801;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:10:68:0,10 0/1:28,32:60:99:.:852,0,717:13,15,14,18 +chrX 2573854 . T C 2854 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=24.24;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;QD=37.95;SOR=1.270;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,43:43:99:.:.:1611,0:.:0,0,26,17 1|1:0,33:33:99:0|1:2573854_T_C:1273,99,0:2573854:0,0,21,12 +chrX 2573860 . CA C 2681.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=31.64;BaseQRankSum=-0.725;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=27.176;MQ=59.51;MQRankSum=4.3;QD=31.64;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.962;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,44:47:99:.:.:1509,0:.:0,3,27,17 1|1:4,35:39:36:0|1:2573854_T_C:1212,36,0:2573854:0,4,22,13 +chrX 2573899 . A G 565 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.66;BaseQRankSum=-0.807;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.290;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.015;SOR=1.085;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:94:68:0,94 0/1:17,21:38:99:.:595,0,442:8,9,8,13 +chrX 2573985 . ATGTGTGTGTGTGTG A,ATG 3832.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=71,37;AS_QD=25.87,27.49;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=35.85;SOR=0.849;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,32,37:69:99:.:.:2111,306,0:.:0,0,41,28 1|1:0,39,0:39:99:0|1:2573985_ATGTGTGTGTGTGTG_A:1761,120,0,1761,120,1761:2573985:0,0,17,22 +chrX 2574017 . GCGCGCGCGCGCGCGCGCGCACGCA G 275.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=4.44;BaseQRankSum=-0.823;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=12.431;MQ=59.41;MQRankSum=0;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.294;SOR=0.148;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,38:71:99:.:315,0:24,9,19,19 0/0:.:41:82:41:0,82,1215 +chrX 2574019 . GCGCGCGCGCGCGCGCGCACGCA *,G 1850.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,44;AS_QD=0.00,30.11;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=18.134;MQ=59.07;MQRankSum=4.797;QD=41.09;SOR=0.412;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:33,38,0:71:99:.:.:315,0,1328:.:24,9,19,19 2|2:2,0,44:46:48:0|1:2573985_ATGTGTGTGTGTGTG_A:1890,1896,1980,48,132,0:2573985:1,1,19,25 +chrX 2574261 . C T 3930 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=32.20;BaseQRankSum=-0.323;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.20;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.236;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,77:77:99:2491,0:0,0,36,41 1/1:1,45:46:99:1469,104,0:0,1,24,21 +chrX 2574493 . T C 681 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.17;BaseQRankSum=-1.218;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.562;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1448 0/1:27,27:54:99:.:711,0,756:11,16,12,15 +chrX 2574851 . A G 5250 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=33.61;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.28;SOR=1.255;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,68:68:99:.:.:2939,0:.:0,0,42,26 1|1:0,54:54:99:0|1:2574851_A_G:2341,162,0:2574851:0,0,33,21 +chrX 2574862 . T A 5070 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=33.03;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.59;SOR=1.473;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,65:65:99:.:.:2828,0:.:0,0,42,23 1|1:0,52:52:99:0|1:2574851_A_G:2272,156,0:2574851:0,0,34,18 +chrX 2575184 . C T 717 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=5.79;BaseQRankSum=1.788;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=6.581;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.604;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,39:72:99:188,0:19,14,15,24 0/1:36,21:57:99:559,0,1015:21,15,13,8 +chrX 2575221 . C T 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.98;BaseQRankSum=1.56;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.730;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:45:62:0,45 0/1:37,23:60:99:.:599,0,986:18,19,12,11 +chrX 2575263 . C T 1086 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=9.46;BaseQRankSum=0.234;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.04;SOR=0.735;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,33:64:34:34,0:14,17,19,14 0/1:16,38:54:99:1082,0,364:10,6,18,20 +chrX 2575344 . C G 621 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.86;BaseQRankSum=2.743;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.961;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.04;SOR=0.885;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1800 0/1:41,25:66:99:.:651,0,1051:20,21,11,14 +chrX 2575491 . T C 3747 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=31.74;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=31.74;SOR=0.816;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2076,0:0,0,34,33 1/1:0,52:52:99:1701,156,0:0,0,29,23 +chrX 2575535 . T C 815 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=7.16;BaseQRankSum=0.259;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=4.486;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.255;SOR=1.011;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,34:64:99:124,0:15,15,18,16 0/1:26,28:54:99:721,0,732:12,14,18,10 +chrX 2575943 . G A 1112 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=19.03;BaseQRankSum=2.077;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.818;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,125 0|1:29,31:60:99:.:0|1:2575943_G_A:1142,0,991:2575943:15,14,17,14 +chrX 2575972 . T TC 1113.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=20.59;BaseQRankSum=0.607;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=2.274;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.548;SOR=0.877;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,125 0|1:26,30:56:99:.:0|1:2575943_G_A:1153,0,988:2575943:12,14,17,13 +chrX 2576017 . T C 763 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.42;BaseQRankSum=-0.58;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.028;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.27;SOR=0.892;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,125 0/1:26,29:55:99:.:793,0,707:12,14,12,17 +chrX 2576056 . C A 868 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=18.71;BaseQRankSum=-2.557;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;MQRankSum=1.584;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.620;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,125 0|1:22,26:48:99:.:0|1:2576056_C_A:898,0,764:2576056:8,14,10,16 +chrX 2576078 . GTTTTTT G,GTT,GTTT 2059.97 . AC=0,2,1;AF=0.00,0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=28,36,21;AS_QD=9.74,31.86,28.21;BaseQRankSum=2.182;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.582;MQ=59.37;MQRankSum=-0.363;QD=22.82;ReadPosRankSum=0.888;SOR=0.321;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:7,28,11,0:46:41:382,41,0,872:2,5,21,18 2/3:0,0,25,21:46:99:1717,1736,1819,729,837,849,995,1000,0,927:0,0,17,29 +chrX 2576086 . T G 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.43;BaseQRankSum=-1.492;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.736;MQ=58.80;MQRankSum=-1.06;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.318;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:41:57:0,41 0/1:23,21:44:99:.:635,0,881:7,16,9,12 +chrX 2576087 . T G 847 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=19.49;BaseQRankSum=-1.331;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.660;MQ=58.80;MQRankSum=1.058;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.447;SOR=1.195;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:41:57:.:.:0,41 0|1:22,23:45:99:.:0|1:2576056_C_A:877,0,824:2576056:9,13,7,16 +chrX 2576090 . T G 821 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=20.26;BaseQRankSum=0.149;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.786;MQ=58.75;MQRankSum=1.113;QD=20.26;ReadPosRankSum=0.118;SOR=1.329;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:41:57:.:.:0,41 0|1:20,22:42:99:.:0|1:2576056_C_A:851,0,763:2576056:9,11,7,15 +chrX 2576247 . G A 743 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.05;BaseQRankSum=0.293;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.305;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.387;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:41:57:0,41 0/1:25,30:55:99:.:773,0,594:10,15,15,15 +chrX 2576274 . G GT 713.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.06;BaseQRankSum=0.828;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=4.076;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=1.208;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:41:57:0,41 0/1:21,29:50:99:.:753,0,505:10,11,18,11 +chrX 2576412 . T C 54 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=1.05;BaseQRankSum=-0.842;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=9.335;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.929;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:38,42:80:84:.:84,0:15,23,25,17 0/0:.:32:27:31:0,27,923 +chrX 2576692 . CAAAA C,CAAAAA 528.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,34;AS_QD=9.60,12.07;BaseQRankSum=2.209;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=9.892;MQ=59.36;MQRankSum=0;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.624;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,19,14:34:25:288,0,25:1,0,17,16 0/2:10,0,20:30:99:280,309,471,0,163,105:7,3,6,14 +chrX 2577478 . C T 593 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.75;BaseQRankSum=-1.462;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=5.667;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.341;SOR=1.175;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,313 0/1:29,24:53:99:.:623,0,825:16,13,9,15 +chrX 2578618 . G C 2509 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=22.27;BaseQRankSum=-2.373;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.829;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.27;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.459;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1749,0:0,0,22,31 0/1:30,31:61:99:790,0,823:10,20,12,19 +chrX 2578760 . G C 1564 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=19.68;BaseQRankSum=-0.826;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=1.021;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.887;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1189,0:0,0,12,29 0/1:22,18:40:99:405,0,571:7,15,5,13 +chrX 2578880 . G T 951 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=29.73;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.21;QD=29.73;SOR=1.179;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:699,0:0,0,10,14 1/1:0,9:9:27:282,27,0:0,0,3,6 +chrX 2578897 . CT C 662.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=28.08;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=28.08;SOR=0.770;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:425,0:0,0,7,8 1/1:0,10:10:30:277,30,0:0,0,6,4 +chrX 2578940 . T C 2220 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=29.69;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=1.802;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1080,0:.:0,0,18,6 1|1:0,26:26:78:0|1:2578940_T_C:1170,78,0:2578940:0,0,17,9 +chrX 2578954 . G A 2490 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=30.54;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=1.651;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1080,0:.:0,0,18,6 1|1:0,32:32:96:0|1:2578940_T_C:1440,96,0:2578940:0,0,20,12 +chrX 2578968 . G C 3165 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=29.62;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=1.545;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1215,0:.:0,0,19,8 1|1:0,44:44:99:0|1:2578968_G_C:1980,132,0:2578968:0,0,28,16 +chrX 2578975 . T G 3429 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=34.76;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.35;SOR=1.409;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1344,0:.:0,0,21,10 1|1:0,47:47:99:0|1:2578968_G_C:2115,141,0:2578968:0,0,29,18 +chrX 2578997 . C T 1883 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=23.80;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.49;SOR=1.179;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:41:99:41:.:.:0,1062 1|1:0,43:43:99:.:0|1:2578968_G_C:1913,129,0:2578968:0,0,26,17 +chrX 2579020 . A G 1535 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=19.56;BaseQRankSum=-1.561;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.629;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:1070,0:.:0,0,21,14 0|1:25,20:45:99:0|1:2578968_G_C:495,0,714:2578968:16,9,13,7 +chrX 2579377 . C CT 2588.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=26.55;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;QD=26.55;SOR=0.754;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1326,0:0,0,29,21 1/1:0,49:49:99:1302,147,0:0,0,19,30 +chrX 2579499 . T C 4625 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=28.63;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.33;SOR=0.751;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2166,0:.:0,0,25,24 1|1:0,56:56:99:0|1:2579499_T_C:2489,169,0:2579499:0,0,26,30 +chrX 2579500 . C T 4625 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=32.45;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.33;SOR=0.751;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,49:49:99:.:.:2166,0:.:0,0,25,24 1|1:0,56:56:99:0|1:2579499_T_C:2489,169,0:2579499:0,0,26,30 +chrX 2580141 . T C 1656 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=30.65;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.65;SOR=1.159;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1530 1/1:0,55:55:99:.:1686,164,0:0,0,33,22 +chrX 2580387 . TAC T 1798.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=30.63;BaseQRankSum=2.107;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.63;ReadPosRankSum=0.52;SOR=0.276;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,59:60:99:.:1838,0:1,0,29,30 0/0:.:37:21:35:0,21,968 +chrX 2581195 . GA G,GAA 508.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,20;AS_QD=16.83,15.30;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.25;QD=17.13;SOR=1.112;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1052,1052 1/2:0,12,20:32:99:.:548,346,443,242,0,260:0,0,13,19 +chrX 2583101 . G GT 616.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=10.25;BaseQRankSum=0;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=3.328;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.525;SOR=0.509;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1052 0/1:31,33:64:99:.:656,0,610:18,13,16,17 +chrX 2588136 . T C 318 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=5.61;BaseQRankSum=0.432;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.662;SOR=0.620;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,36:62:99:.:348,0:11,15,16,20 0/0:.:56:24:39:0,24,897 +chrX 2591308 . G GT 1854.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=23.38;BaseQRankSum=-0.511;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.252;SOR=0.315;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1093,0:0,0,29,16 1/1:1,35:36:81:801,81,0:1,0,15,20 +chrX 2593828 . TAA T 381.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=6.10;BaseQRankSum=1.652;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.001;MQ=59.87;MQRankSum=1.107;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.174;SOR=0.919;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,20:38:99:122,0:6,12,13,7 0/1:19,12:31:99:299,0,466:12,7,5,7 +chrX 2594651 . C T 888 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.93;BaseQRankSum=0.479;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=6.552;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.589;SOR=1.568;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,254 0/1:37,34:71:99:.:918,0,999:20,17,24,10 +chrX 2594676 . A G 292 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=4.47;BaseQRankSum=-1.506;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.895;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.943;SOR=0.816;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,42:72:99:.:322,0:17,13,25,17 0/0:.:59:99:59:0,111,1485 +chrX 2595193 . G T 847 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.53;BaseQRankSum=-1.114;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=6.434;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.361;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,204 0/1:37,33:70:99:.:877,0,1014:24,13,16,17 +chrX 2597422 . G A 79 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=2.37;BaseQRankSum=-1.186;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.119;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.453;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,25:46:99:.:109,0:13,8,12,13 0/0:.:60:74:60:0,74,1191 +chrX 2599084 . T G 128 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=3.04;BaseQRankSum=-1.683;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=7.905;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.079;SOR=1.082;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,29:52:99:.:158,0:9,14,18,11 0/0:.:60:74:60:0,74,1191 +chrX 2599210 . G A 105 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=2.55;BaseQRankSum=-0.68;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.933;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.55;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.289;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,29:53:99:.:135,0:7,17,15,14 0/0:.:60:74:60:0,74,1191 +chrX 2599489 . CA C 152.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=5.19;BaseQRankSum=-1.483;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.836;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:56:99:56:.:.:0,1386 0|1:24,13:37:99:.:0|1:2599489_CA_C:192,0,969:2599489:12,12,6,7 +chrX 2599505 . A AGAG,AG,AAGAG 3010.97 . AC=2,0,0;AF=0.667,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=57,1,19;AS_QD=35.41,3.68,25.98;BaseQRankSum=0.063;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.211;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=32.11;ReadPosRankSum=-0.562;SOR=0.740;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24,1,19:44:99:.:.:1786,0,1716,212:.:0,0,28,16 0|1:18,33,0,0:51:99:1|0:2599489_CA_C:1264,0,647,1318,746,2064,1318,746,2064,2064:2599489:8,10,14,19 +chrX 2600037 . C T 3991 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=33.23;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=33.23;SOR=0.888;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1886,0:0,0,30,27 1/1:0,64:64:99:2135,192,0:0,0,25,39 +chrX 2600368 . T TA 227.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=4.77;BaseQRankSum=1.062;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=0.741;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,33:56:99:.:267,0:13,10,19,14 0/0:.:63:97:63:0,97,1355 +chrX 2601933 . G A 308 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=4.90;BaseQRankSum=0.829;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=7.767;MQ=59.93;MQRankSum=1.169;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.938;SOR=1.735;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,39:69:99:.:338,0:10,20,7,32 0/0:.:63:97:63:0,97,1355 +chrX 2602613 . G T 1509 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=33.46;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.46;SOR=0.780;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,238 1/1:0,46:46:99:.:1539,138,0:0,0,22,24 +chrX 2603872 . G T 3300 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=31.42;BaseQRankSum=4.032;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=10.474;MQ=59.73;MQRankSum=-0.289;QD=31.42;ReadPosRankSum=1.624;SOR=0.535;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,51:54:99:1633,0:0,3,28,23 1/1:0,52:52:99:1697,156,0:0,0,30,22 +chrX 2603977 . G GA,GAA 1908.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=70,22;AS_QD=27.81,34.41;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=21.17;SOR=0.737;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,21,22:43:1:757,1,0:0,0,21,22 1/1:0,49,0:49:99:1191,147,0,1191,147,1191:0,0,24,25 +chrX 2604098 . G T 133 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=3.08;BaseQRankSum=0.88;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.304;SOR=0.906;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,29:53:99:.:163,0:12,12,13,16 0/0:.:63:56:63:0,56,1574 +chrX 2604811 . C T 938 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=14.03;BaseQRankSum=-0.053;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=8.229;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.939;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1509 0/1:32,37:69:99:.:968,0,800:13,19,22,15 +chrX 2605072 . T C 4370 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=135;AS_QD=32.59;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=32.59;SOR=0.738;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2323,0:0,0,33,38 1/1:0,64:64:99:2077,192,0:0,0,33,31 +chrX 2605162 . G A 2143 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=17.96;BaseQRankSum=-0.357;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.627;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,39:65:99:391,0:13,13,20,19 1/1:1,55:56:99:1782,133,0:0,1,27,28 +chrX 2605310 . A AAAAC 296.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=6.46;BaseQRankSum=-0.528;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.050;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.540;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,30:52:99:.:336,0:10,12,15,15 0/0:.:59:99:59:0,102,1371 +chrX 2606063 . C CT,CTT 205.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=9,4;AS_QD=8.75,6.30;BaseQRankSum=-1.058;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;MQRankSum=-1.145;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=0.732;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1488,1488 0/1:19,9,4:32:99:.:245,0,357,100,350,645:9,10,6,7 +chrX 2606066 . T C 286 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=7.02;BaseQRankSum=-0.494;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.649;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.260;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:18,27:45:99:.:316,0:5,10,12,12 0/0:.:55:99:55:0,111,1665 +chrX 2607048 . T TCCAC 1483.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=32.02;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=43.51;SOR=5.728;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:609,0:0,0,0,14 1/1:0,21:21:63:914,63,0:0,0,1,20 +chrX 2607827 . T C 3633 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=30.53;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=30.53;SOR=0.871;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:1958,0:0,0,27,38 1/1:0,55:55:99:1705,164,0:0,0,28,27 +chrX 2608773 . A C 253 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=4.80;BaseQRankSum=-0.31;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.256;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=1.141;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,34:59:99:.:283,0:12,13,13,21 0/0:.:65:85:65:0,85,1473 +chrX 2609048 . T G 3484 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=33.15;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.15;SOR=0.853;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1668,0:0,0,23,27 1/1:0,56:56:99:1846,168,0:0,0,26,30 +chrX 2609408 . GGCGCGCCGTGGC G 4570.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=31.58;BaseQRankSum=0.686;DP=163;ExcessHet=0.0000;FS=2.436;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.58;ReadPosRankSum=0.749;SOR=0.981;VarDP=146 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,72:72:99:3222,0:0,0,42,30 0/1:38,36:74:99:1388,0,1481:19,19,19,17 +chrX 2609836 . T G 901 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=11.94;BaseQRankSum=-0.819;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.037;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.952;SOR=1.077;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:36:39:0,36 0/1:41,37:78:99:.:931,0,1105:19,22,14,23 +chrX 2610313 . TTCCTCTCTCTCTCCTC T 579.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.87;BaseQRankSum=-0.051;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.814;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.116;SOR=0.958;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:36:39:0,36 0/1:22,17:39:99:.:619,0,848:10,12,10,7 +chrX 2610357 . CTCTCTCTCT C 497.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=15.34;BaseQRankSum=-0.726;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=13.359;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.181;SOR=2.421;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:36:39:0,36 0/1:20,15:35:99:.:537,0,763:11,9,3,12 +chrX 2610476 . T C,TTTCTCTCTCTCCCCCTC 131 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,4;AS_QD=0.00,17.89;BaseQRankSum=-0.967;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=3.522;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.464;SOR=2.712;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:36:39:0,36,36 0/2:5,0,4:9:99:.:161,162,804,0,220,725:2,3,0,4 +chrX 2610549 . C CCT 1787.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=28.39;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;QD=39.72;SOR=1.765;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:966,0:0,0,9,15 1/1:0,22:22:66:861,66,0:0,0,5,17 +chrX 2611203 . A AT 403.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=15.28;BaseQRankSum=0.279;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;MQRankSum=-0.653;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.734;SOR=0.853;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,315 0/1:10,19:29:99:.:443,0,195:6,4,12,7 +chrX 2611236 . TG T,TGG 652.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=40,0;AS_QD=12.36,0.00;BaseQRankSum=0.909;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.16;MQRankSum=1.769;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.224;SOR=0.693;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:8,23,0:31:99:.:.:297,0,871:.:5,3,17,6 0|1:8,17,0:25:99:0|1:2611236_TG_T:395,0,207,419,257,676:2611236:6,2,10,7 +chrX 2611239 . TTTTTTTG T 634.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=12.04;BaseQRankSum=1.032;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.20;MQRankSum=1.769;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.113;SOR=0.693;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:8,23:31:99:.:.:278,0:.:5,3,17,6 0|1:8,17:25:99:0|1:2611236_TG_T:396,0,207:2611236:6,2,10,7 +chrX 2611246 . G *,T 868 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=17,5;AS_QD=0.00,27.81;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=1.542;MQ=58.68;QD=40.82;SOR=1.106;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:8,23,0:31:99:278,0,638:5,3,17,6 1/2:0,17,5:22:99:898,149,147,465,0,402:0,0,14,8 +chrX 2611361 . T C 3863 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.40;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.40;SOR=0.793;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1726,0:0,0,28,27 1/1:0,69:69:99:2167,206,0:0,0,31,38 +chrX 2612105 . G A 595 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=0.898;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.079;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.706;SOR=1.007;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,207 0/1:29,24:53:99:.:625,0,744:16,13,15,9 +chrX 2612327 . A G 848 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=6.32;BaseQRankSum=-1.387;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=3.018;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.859;VarDP=139 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:35,43:78:99:153,0:18,17,28,15 0/1:33,28:61:99:725,0,929:15,18,11,17 +chrX 2612888 . G C 3409 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=32.44;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=32.44;SOR=1.036;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1900,0:0,0,22,38 1/1:0,46:46:99:1539,138,0:0,0,23,23 +chrX 2613604 . C G 798 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.28;BaseQRankSum=-0.752;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.296;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.28;ReadPosRankSum=-1.51;SOR=1.141;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,684 0/1:28,30:58:99:.:828,0,779:12,16,10,20 +chrX 2614564 . GA G 211.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=6.44;BaseQRankSum=1.141;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=13.142;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.191;SOR=2.425;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,684 0/1:24,15:39:99:.:251,0,484:11,13,12,3 +chrX 2614730 . C T 932 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=8.22;BaseQRankSum=2.195;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.686;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.796;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,33:60:99:284,0:12,15,18,15 0/1:31,26:57:99:678,0,796:18,13,14,12 +chrX 2614902 . G A 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.12;BaseQRankSum=-0.668;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=2.030;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.412;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1369 0/1:34,34:68:99:.:892,0,927:14,20,17,17 +chrX 2615057 . A G 821 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.93;BaseQRankSum=2.555;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.93;ReadPosRankSum=-1.903;SOR=0.751;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1369 0/1:27,30:57:99:.:851,0,662:14,13,16,14 +chrX 2615410 . A C 3424 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=32.90;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.90;SOR=0.791;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1534,0:0,0,24,23 1/1:0,58:58:99:1920,174,0:0,0,31,27 +chrX 2615601 . C T 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.75;BaseQRankSum=0.796;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.418;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.75;ReadPosRankSum=-2.036;SOR=1.043;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:99:51:0,1351 0/1:29,22:51:99:.:599,0,808:15,14,9,13 +chrX 2615663 . C T 3384 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=32.51;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.51;SOR=0.751;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1955,0:0,0,27,34 1/1:0,44:44:99:1459,132,0:0,0,24,20 +chrX 2615840 . C G 741 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.77;BaseQRankSum=0.61;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.460;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.693;SOR=0.202;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1396 0/1:26,30:56:99:.:771,0,587:18,8,15,15 +chrX 2616361 . G A 4425 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=137;AS_QD=32.28;BaseQRankSum=2.334;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.28;ReadPosRankSum=-1.21;SOR=0.459;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2461,0:0,0,31,44 1/1:1,62:63:99:1994,179,0:0,1,23,39 +chrX 2616558 . ATGTG A 962.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=24.44;BaseQRankSum=0.611;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=4.533;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.44;ReadPosRankSum=-0.695;SOR=1.014;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,296 0/1:16,25:41:99:.:1002,0,596:7,9,15,10 +chrX 2616799 . T A 618 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=7.36;BaseQRankSum=0.601;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.585;SOR=0.776;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,25:46:99:134,0:13,8,11,14 0/1:22,20:42:99:514,0,619:6,16,14,6 +chrX 2617404 . G A 4028 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=32.99;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.99;SOR=0.963;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1984,0:0,0,26,33 1/1:0,64:64:99:2074,192,0:0,0,28,36 +chrX 2617486 . A C 1883 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=30.37;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.37;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,278 1/1:0,63:63:99:.:1913,187,0:0,0,29,34 +chrX 2617563 . A G 2241 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=17.34;BaseQRankSum=1.125;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.664;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.406;SOR=0.574;VarDP=131 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,40:71:99:332,0:17,14,23,17 1/1:0,60:60:99:1939,179,0:0,0,26,34 +chrX 2617679 . CT C 59.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=1.48;BaseQRankSum=0.355;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=6.612;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.48;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.345;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,35:67:99:.:99,0:11,21,18,17 0/0:.:63:99:63:0,114,1438 +chrX 2618136 . C G 4266 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=32.06;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.06;SOR=1.153;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,80:80:99:2580,0:0,0,37,43 1/1:0,54:54:99:1716,161,0:0,0,17,37 +chrX 2618502 . TC T 894.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.10;BaseQRankSum=-0.85;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=9.496;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=1.019;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:78:99:78:.:.:0,1800 0|1:32,26:58:99:.:0|1:2618502_TC_T:934,0,1179:2618502:20,12,10,16 +chrX 2618506 . TC T 894.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.10;BaseQRankSum=-1.518;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=9.496;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.43;SOR=1.019;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:78:99:78:.:.:0,1800 0|1:32,26:58:99:.:0|1:2618502_TC_T:934,0,1179:2618502:20,12,10,16 +chrX 2618572 . C T 3594 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=29.70;BaseQRankSum=0.962;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.70;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.796;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,70:72:99:2087,0:1,1,30,40 1/1:0,50:50:99:1537,149,0:0,0,27,23 +chrX 2618896 . A T 901 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.52;BaseQRankSum=-0.118;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.989;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.532;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1683 0/1:26,34:60:99:.:931,0,673:15,11,18,16 +chrX 2619607 . T C 2106 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=17.37;BaseQRankSum=-0.584;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.784;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=0.991;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,35:63:99:208,0:13,15,14,21 1/1:0,60:60:99:1928,180,0:0,0,24,36 +chrX 2620094 . TTTA T 4378.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=34.81;BaseQRankSum=-0.381;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=3.416;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.74;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.549;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,49:50:99:2122,0:0,1,28,21 1/1:0,51:51:99:2296,154,0:0,0,27,24 +chrX 2621124 . C G 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=9.66;BaseQRankSum=-0.931;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.66;ReadPosRankSum=-2.012;SOR=0.504;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1419 0/1:36,26:62:99:.:599,0,951:20,16,13,13 +chrX 2621388 . T TTATCTC 5074.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=28.71;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=1.003;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,67:67:99:2966,0:0,0,38,29 1/1:0,49:49:99:2148,147,0:0,0,28,21 +chrX 2621843 . T G 204 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=4.25;BaseQRankSum=0.51;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=7.350;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=1.334;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,31:55:99:.:234,0:11,13,20,11 0/0:.:61:38:59:0,38,1261 +chrX 2622171 . CA C,CAA 912.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=38,31;AS_QD=15.97,13.88;BaseQRankSum=-0.634;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.316;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,17,18:36:26:230,26,0:0,1,18,17 1/2:0,21,13:34:99:722,303,401,508,0,623:0,0,13,21 +chrX 2622225 . A T 930 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.84;BaseQRankSum=-1.892;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=3.724;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.84;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=0.779;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,333 0/1:23,34:57:99:.:960,0,628:10,13,19,15 +chrX 2622631 . C T 3784 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.88;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.877;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2202,0:0,0,39,27 1/1:0,50:50:99:1612,149,0:0,0,24,26 +chrX 2622826 . T A 769 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.75;BaseQRankSum=1.38;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=2.037;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.670;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:77:99:77:0,1800 0/1:38,30:68:99:.:799,0,986:17,21,16,14 +chrX 2622827 . A C 4927 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=142;AS_QD=34.91;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.91;SOR=0.874;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2416,0:0,0,32,42 1/1:0,68:68:99:2541,204,0:0,0,33,35 +chrX 2622902 . G A 1018 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=15.19;BaseQRankSum=-0.652;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=4.870;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.809;SOR=1.258;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1543 0/1:29,40:69:99:.:1048,0,751:14,15,25,15 +chrX 2622962 . T C 3744 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=31.19;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.19;SOR=0.710;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1632,0:0,0,28,23 1/1:0,70:70:99:2142,209,0:0,0,33,37 +chrX 2623692 . GA G 5828.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=35.30;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.12;SOR=1.055;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2704,0:.:0,0,37,25 1|1:0,71:71:99:0|1:2623692_GA_G:3164,214,0:2623692:0,0,40,31 +chrX 2623694 . T C 5838 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=36.61;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.12;SOR=1.055;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,62:62:99:.:.:2704,0:.:0,0,37,25 1|1:0,71:71:99:0|1:2623692_GA_G:3164,214,0:2623692:0,0,40,31 +chrX 2624181 . T C 633 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.63;BaseQRankSum=-0.628;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.243;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.943;SOR=1.101;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,406 0/1:30,27:57:99:.:663,0,808:15,15,16,11 +chrX 2624371 . TA T 606.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.75;BaseQRankSum=1.754;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=5.871;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.235;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,406 0/1:28,27:55:99:.:646,0,644:7,21,11,16 +chrX 2624425 . CTT CT,C 2092.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=57,26;AS_QD=26.30,28.17;BaseQRankSum=0.117;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;MQRankSum=-0.247;QD=24.51;ReadPosRankSum=-1.78;SOR=0.717;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,37,0:41:99:846,0,928:2,2,18,19 1/2:0,20,26:46:99:1286,655,528,441,0,476:0,0,23,23 +chrX 2624973 . C CT 378.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.72;BaseQRankSum=0.033;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=9.057;MQ=59.75;MQRankSum=-0.801;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.554;SOR=0.878;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1151 0/1:18,25:43:99:.:418,0,311:6,12,15,10 +chrX 2625189 . C T 3757 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=34.12;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=34.12;SOR=0.907;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1966,0:0,0,32,26 1/1:0,53:53:99:1821,159,0:0,0,29,24 +chrX 2625370 . T C 1154 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=8.90;BaseQRankSum=0.198;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=3.164;MQ=59.97;MQRankSum=1.11;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.148;SOR=1.007;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,30:56:97:97,0:14,12,10,20 0/1:34,43:77:99:1087,0,869:14,20,19,24 +chrX 2625507 . A AT 3828.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.19;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=31.19;SOR=0.941;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1758,0:0,0,38,19 1/1:0,67:67:99:2110,201,0:0,0,31,36 +chrX 2625747 . C T 3841 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=33.37;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.37;SOR=0.763;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:2031,0:0,0,31,30 1/1:0,55:55:99:1840,165,0:0,0,25,30 +chrX 2625855 . T TTATATA 5204.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=30.94;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.07;SOR=0.973;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:3120,0:0,0,41,30 1/1:0,48:48:99:2124,144,0:0,0,26,22 +chrX 2625911 . C T 3798 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=33.29;BaseQRankSum=-0.227;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.29;ReadPosRankSum=0.828;SOR=0.268;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,66:67:99:2194,0:1,0,34,32 1/1:0,48:48:99:1634,144,0:0,0,26,22 +chrX 2626205 . C T 599 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=5.57;BaseQRankSum=-0.091;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.699;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.737;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:31,34:65:99:.:.:109,0:.:14,17,16,18 0|1:28,20:48:99:0|1:2626205_C_T:520,0,1064:2626205:15,13,12,8 +chrX 2626227 . G T 772 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.06;BaseQRankSum=-0.628;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.674;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:70:99:70:.:.:0,1800 0|1:19,28:47:99:.:1|0:2626205_C_T:802,0,693:2626205:11,8,16,12 +chrX 2626917 . G A 4104 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=125;AS_QD=33.07;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.07;SOR=0.810;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,74:74:99:2512,0:0,0,35,39 1/1:0,51:51:99:1622,153,0:0,0,24,27 +chrX 2627131 . C T 562 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.87;BaseQRankSum=1.649;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=5.972;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.21;SOR=1.118;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:64:57:0,64 0/1:25,21:46:99:.:592,0,686:11,14,13,8 +chrX 2627164 . GT G 809.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.02;BaseQRankSum=-0.012;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.800;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:64:57:.:.:0,64 0|1:30,23:53:99:.:0|1:2627164_GT_G:849,0,1165:2627164:13,17,13,10 +chrX 2627167 . G C 819 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.02;BaseQRankSum=0.451;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.26;SOR=0.800;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:64:57:.:.:0,64 0|1:30,23:53:99:.:0|1:2627164_GT_G:849,0,1165:2627164:13,17,13,10 +chrX 2627299 . GA G 620.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.48;BaseQRankSum=-1.156;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=19.956;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.316;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:64:57:0,64 0/1:33,30:63:99:.:660,0,737:26,7,14,16 +chrX 2628107 . C G 1132 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=16.37;BaseQRankSum=-0.766;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.922;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.627;SOR=0.925;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:64:57:0,64 0/1:29,42:71:99:.:1162,0,763:14,15,18,24 +chrX 2628264 . T G 877 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.49;BaseQRankSum=1.968;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.310;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=0.633;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:57:64:57:.:.:0,64 0|1:23,32:55:99:.:0|1:2628264_T_G:907,0,554:2628264:10,13,17,15 +chrX 2628280 . A G 4093 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=30.48;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.48;SOR=0.767;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,57:57:99:.:.:2035,0:.:0,0,27,30 1|1:0,53:53:99:0|1:2628264_T_G:2088,159,0:2628264:0,0,26,27 +chrX 2630042 . A G 3412 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=28.45;BaseQRankSum=-0.757;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=6.427;MQ=59.29;MQRankSum=4.561;QD=28.45;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.316;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2020,0:0,0,44,26 1/1:2,49:51:63:1422,63,0:0,2,19,30 +chrX 2630313 . G C 334 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=5.43;BaseQRankSum=-0.161;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=32.719;MQ=46.76;MQRankSum=-0.152;QD=5.43;ReadPosRankSum=2.324;SOR=3.753;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:54,13:67:99:.:0|1:2630313_G_C:364,0,1837:2630313:33,21,1,12 +chrX 2630332 . T G 347 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=6.98;BaseQRankSum=1.679;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=37.787;MQ=52.98;MQRankSum=-2.545;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.695;SOR=5.133;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:42,12:54:99:.:0|1:2630313_G_C:377,0,1726:2630313:25,17,0,12 +chrX 2630338 . A G 359 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=7.78;BaseQRankSum=1.879;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=39.921;MQ=52.68;MQRankSum=-2.348;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=5.132;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:38,12:50:99:.:0|1:2630313_G_C:389,0,1558:2630313:24,14,0,12 +chrX 2630350 . G C 324 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=7.53;BaseQRankSum=0.588;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=35.281;MQ=51.74;MQRankSum=-2.232;QD=7.53;ReadPosRankSum=-1.993;SOR=4.973;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:36,11:47:99:.:0|1:2630313_G_C:354,0,1477:2630313:22,14,0,11 +chrX 2630351 . G T 285 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=7.00;BaseQRankSum=0.803;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=31.395;MQ=51.40;MQRankSum=-2.326;QD=7.00;ReadPosRankSum=-2.076;SOR=4.800;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:35,10:45:99:.:0|1:2630313_G_C:315,0,1440:2630313:21,14,0,10 +chrX 2630359 . A C 249 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=6.64;BaseQRankSum=1.335;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=26.904;MQ=50.80;MQRankSum=-2.388;QD=6.64;ReadPosRankSum=-2.74;SOR=4.611;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:33,9:42:99:.:0|1:2630313_G_C:279,0,1359:2630313:19,14,0,9 +chrX 2630370 . A G 96 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=2.63;BaseQRankSum=1.094;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=16.588;MQ=52.01;MQRankSum=-3.578;QD=2.63;ReadPosRankSum=-2.625;SOR=3.904;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:42,6:48:99:.:0|1:2630313_G_C:126,0,1705:2630313:24,18,0,6 +chrX 2630380 . G A 54 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=1.79;BaseQRankSum=0.907;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=16.588;MQ=52.38;MQRankSum=-3.327;QD=1.79;ReadPosRankSum=-2.36;SOR=3.599;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:42,5:47:84:.:0|1:2630313_G_C:84,0,1677:2630313:24,18,0,5 +chrX 2630787 . ATAG A 922.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=18.86;BaseQRankSum=-2.067;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=56.86;MQRankSum=-1.008;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.829;SOR=0.503;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,332 0/1:26,25:51:99:.:962,0,1016:9,17,10,15 +chrX 2631522 . A G 814 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.55;BaseQRankSum=-0.459;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=8.273;MQ=52.36;MQRankSum=-1.68;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.284;SOR=1.265;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,332 0/1:20,31:51:99:.:844,0,500:12,8,11,20 +chrX 2631750 . T C 71 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=1.80;BaseQRankSum=-3.651;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.151;MQ=54.89;MQRankSum=-3.402;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.31;SOR=2.276;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:50,6:56:99:.:0|1:2631750_T_C:101,0,2020:2631750:23,27,5,1 +chrX 2631754 . C A 74 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=1.89;BaseQRankSum=-0.462;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.151;MQ=54.91;MQRankSum=-3.416;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.964;SOR=2.281;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,332 0|1:49,6:55:99:.:0|1:2631750_T_C:104,0,1989:2631750:23,26,5,1 +chrX 2631897 . GCACTTCCTGGTTCATAGGGACATTGTAA G 1301.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=34.38;BaseQRankSum=-0.566;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.49;MQRankSum=-0.935;QD=34.38;ReadPosRankSum=0.575;SOR=0.859;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,15:15:99:.:.:660,0:.:0,0,6,9 1|1:2,22:24:38:0|1:2631897_GCACTTCCTGGTTCATAGGGACATTGTAA_G:681,38,0:2631897:1,1,14,8 +chrX 2632177 . A G 607 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.55;BaseQRankSum=-0.584;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.56;MQRankSum=-1.489;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.419;SOR=0.605;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,604 0/1:22,25:47:99:.:637,0,584:12,10,13,12 +chrX 2632236 . TTCC T 584.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=13.28;BaseQRankSum=1.372;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.159;MQ=56.46;MQRankSum=-4.91;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.591;SOR=0.519;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,604 0|1:30,17:47:99:.:0|1:2632236_TTCC_T:624,0,1208:2632236:11,19,7,10 +chrX 2632242 . T TGG 584.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=13.28;BaseQRankSum=0.974;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.159;MQ=56.15;MQRankSum=-4.91;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.519;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,604 0|1:30,17:47:99:.:0|1:2632236_TTCC_T:624,0,1209:2632236:11,19,7,10 +chrX 2632250 . C G 620 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=12.26;BaseQRankSum=-0.483;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=2.541;MQ=56.07;MQRankSum=-4.55;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.808;SOR=1.250;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,604 0|1:35,18:53:99:.:0|1:2632236_TTCC_T:650,0,1415:2632236:16,19,6,12 +chrX 2632261 . G A 560 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.17;BaseQRankSum=-0.521;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=5.852;MQ=56.41;MQRankSum=-5.093;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.283;SOR=1.515;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,604 0|1:41,17:58:99:.:0|1:2632236_TTCC_T:590,0,1670:2632236:19,22,5,12 +chrX 2632264 . C T 557 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.95;BaseQRankSum=0.012;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=4.184;MQ=56.24;MQRankSum=-4.858;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.248;SOR=1.449;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,604 0|1:42,17:59:99:.:0|1:2632236_TTCC_T:587,0,1710:2632236:19,23,5,12 +chrX 2632267 . C T 635 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.56;BaseQRankSum=1.028;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.916;MQ=56.48;MQRankSum=-4.649;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.452;SOR=1.341;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,604 0|1:44,19:63:99:.:0|1:2632236_TTCC_T:665,0,1788:2632236:20,24,6,13 +chrX 2632271 . A G 629 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.14;BaseQRankSum=1.322;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.551;MQ=56.59;MQRankSum=-4.76;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.926;SOR=1.478;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,604 0|1:46,19:65:99:.:0|1:2632236_TTCC_T:659,0,1860:2632236:22,24,6,13 +chrX 2632306 . C T 5479 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=160;AS_QD=34.22;BaseQRankSum=2.519;DP=165;ExcessHet=0.0000;FS=3.092;MQ=57.06;MQRankSum=-0.496;QD=34.22;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.303;VarDP=161 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,84:84:99:2767,0:0,0,39,45 1/1:1,76:77:99:2742,221,0:1,0,39,37 +chrX 2632315 . G T 576 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=7.21;BaseQRankSum=-1.279;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.945;MQ=57.02;MQRankSum=-3.559;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=0.824;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:62,22:84:99:.:0|1:2632236_TTCC_T:606,0,2155:2632236:30,32,12,10 +chrX 2632363 . C T 893 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.26;BaseQRankSum=0.689;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=17.740;MQ=57.31;MQRankSum=-7.168;QD=11.26;ReadPosRankSum=3.425;SOR=1.920;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:56,26:82:99:.:0|1:2632363_C_T:923,0,2273:2632363:32,24,7,19 +chrX 2632364 . A G 890 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.08;BaseQRankSum=0.436;DP=146;ExcessHet=0.0000;FS=19.914;MQ=57.31;MQRankSum=-7.222;QD=11.08;ReadPosRankSum=3.344;SOR=1.916;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:57,26:83:99:.:0|1:2632363_C_T:920,0,2315:2632363:33,24,7,19 +chrX 2632383 . T C 887 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.92;BaseQRankSum=0.545;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=20.246;MQ=57.03;MQRankSum=-6.857;QD=10.92;ReadPosRankSum=2.102;SOR=1.911;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:58,26:84:99:.:0|1:2632363_C_T:917,0,2357:2632363:34,24,7,19 +chrX 2632384 . G A 887 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.92;BaseQRankSum=1.533;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=20.246;MQ=57.03;MQRankSum=-6.857;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.999;SOR=1.911;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:58,26:84:99:.:0|1:2632363_C_T:917,0,2357:2632363:34,24,7,19 +chrX 2632402 . G A 803 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.16;BaseQRankSum=2.247;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=15.609;MQ=57.43;MQRankSum=-6.645;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=2.096;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:58,24:82:99:.:0|1:2632363_C_T:833,0,2363:2632363:31,27,6,18 +chrX 2632404 . C T 812 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.66;BaseQRankSum=1.798;DP=142;ExcessHet=0.0000;FS=13.225;MQ=57.33;MQRankSum=-6.483;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=2.116;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:55,24:79:99:.:0|1:2632363_C_T:842,0,2237:2632363:28,27,6,18 +chrX 2632420 . T C 650 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.32;BaseQRankSum=0.642;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=9.492;MQ=57.62;MQRankSum=-6.49;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.863;SOR=1.904;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:53,20:73:99:.:0|1:2632363_C_T:680,0,2165:2632363:25,28,5,15 +chrX 2632439 . C T 188 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=3.52;BaseQRankSum=1.748;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=24.304;MQ=58.33;MQRankSum=-6.633;QD=3.52;ReadPosRankSum=-2.029;SOR=4.614;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:53,9:62:99:.:0|1:2632363_C_T:218,0,2198:2632363:27,26,0,9 +chrX 2632441 . G A 188 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=3.52;BaseQRankSum=1.589;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=24.304;MQ=58.33;MQRankSum=-6.633;QD=3.52;ReadPosRankSum=-2.159;SOR=4.614;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:53,9:62:99:.:0|1:2632363_C_T:218,0,2198:2632363:27,26,0,9 +chrX 2632446 . G T 146 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=2.89;BaseQRankSum=1.829;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=17.820;MQ=58.30;MQRankSum=-7.061;QD=2.89;ReadPosRankSum=-2.729;SOR=4.191;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:53,8:61:99:.:0|1:2632363_C_T:176,0,2201:2632363:25,28,0,8 +chrX 2632447 . C T 149 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=2.98;BaseQRankSum=1.774;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=17.700;MQ=58.27;MQRankSum=-6.997;QD=2.98;ReadPosRankSum=-2.997;SOR=4.114;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:52,8:60:99:.:0|1:2632363_C_T:179,0,2159:2632363:24,28,0,8 +chrX 2632453 . C T 161 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=3.41;BaseQRankSum=1.461;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=17.673;MQ=58.61;MQRankSum=-7.387;QD=3.41;ReadPosRankSum=-3.629;SOR=4.091;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:48,8:56:99:.:0|1:2632363_C_T:191,0,1991:2632363:22,26,0,8 +chrX 2632455 . T TTGTGGAAG 145.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=3.19;BaseQRankSum=1.028;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=17.177;MQ=58.66;MQRankSum=-7.522;QD=3.19;ReadPosRankSum=-3.117;SOR=3.950;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,257 0|1:50,8:58:99:.:0|1:2632363_C_T:185,0,2075:2632363:22,28,0,8 +chrX 2632609 . A G 3790 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.65;BaseQRankSum=3.377;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.278;MQ=59.50;MQRankSum=0;QD=32.65;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.446;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,59:60:99:1984,0:0,1,33,26 1/1:0,57:57:99:1836,171,0:0,0,29,28 +chrX 2633770 . T C 749 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.31;BaseQRankSum=-0.084;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.593;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:99:66:0,1487 0/1:17,28:45:99:.:779,0,396:9,8,14,14 +chrX 2633841 . G A 3145 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=33.07;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.07;SOR=0.778;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1458,0:0,0,18,26 1/1:0,52:52:99:1717,155,0:0,0,32,20 +chrX 2635620 . G A 818 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=2.846;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.492;SOR=0.760;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1276 0/1:24,29:53:99:.:848,0,600:12,12,14,15 +chrX 2635801 . A G 4283 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=132;AS_QD=32.67;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.67;SOR=1.249;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,80:80:99:2581,0:0,0,31,49 1/1:0,52:52:99:1732,156,0:0,0,20,32 +chrX 2636390 . C CA,CAA 1455.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=29,40;AS_QD=36.94,30.90;BaseQRankSum=1.966;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;MQRankSum=-0.12;QD=21.06;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.781;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:2,16,19:37:29:577,29,0:1,1,21,14 1/2:0,13,21:34:99:918,442,337,270,0,197:0,0,15,19 +chrX 2636698 . CAAA CA,C 2126.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=71,2;AS_QD=29.67,29.30;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=6.687;MQ=59.32;MQRankSum=-0.116;QD=28.88;SOR=0.448;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,35,0:36:99:1041,0,1050:0,1,18,17 1/1:1,36,2:39:93:1125,113,0,825,93,873:0,1,22,16 +chrX 2636855 . G T 4606 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=141;AS_QD=32.88;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.736;VarDP=141 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,70:70:99:2313,0:0,0,36,34 1/1:0,71:71:99:2323,213,0:0,0,33,38 +chrX 2637528 . G A 3621 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=33.19;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.19;SOR=0.846;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2133,0:0,0,32,32 1/1:0,46:46:99:1518,137,0:0,0,19,27 +chrX 2637983 . C G 996 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=9.24;BaseQRankSum=0.021;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.721;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=0.827;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,38:61:99:476,0:11,12,12,26 0/1:28,22:50:99:550,0,754:11,17,12,10 +chrX 2638020 . T C 957 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=8.51;BaseQRankSum=-1.818;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.498;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.532;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,35:60:99:253,0:10,15,15,20 0/1:27,29:56:99:734,0,741:12,15,15,14 +chrX 2638385 . C G 928 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.21;BaseQRankSum=1.3;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=6.916;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.642;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1603 0/1:27,36:63:99:.:958,0,625:10,17,20,16 +chrX 2638626 . C T 907 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.16;BaseQRankSum=0.756;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=7.380;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.303;SOR=1.101;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1603 0/1:24,34:58:99:.:937,0,590:14,10,13,21 +chrX 2639107 . C G 888 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=7.46;BaseQRankSum=-0.186;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=8.223;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.959;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,42:72:99:302,0:15,15,18,24 0/1:28,23:51:99:616,0,775:17,11,9,14 +chrX 2639243 . T C 1968 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=30.74;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.74;SOR=0.787;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,343 1/1:0,65:65:99:.:1998,194,0:0,0,34,31 +chrX 2639269 . T C 3859 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=33.24;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.24;SOR=0.818;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1954,0:0,0,32,26 1/1:0,59:59:99:1935,177,0:0,0,30,29 +chrX 2639580 . G T 3649 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=31.72;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.72;SOR=0.838;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1750,0:0,0,24,31 1/1:0,61:61:99:1929,182,0:0,0,30,31 +chrX 2639844 . TACAC T 371.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=7.09;BaseQRankSum=0.701;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.258;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.611;SOR=0.832;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,34:58:99:.:411,0:11,13,19,15 0/0:.:63:99:63:0,120,1800 +chrX 2640176 . A G 1867 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=17.90;BaseQRankSum=-2.286;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=1.933;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.90;ReadPosRankSum=2.247;SOR=0.453;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,30:54:99:151,0:9,15,14,16 1/1:0,52:52:99:1746,156,0:0,0,23,29 +chrX 2641206 . T G 2084 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=17.92;BaseQRankSum=-1.719;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=7.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.813;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,39:66:99:357,0:16,11,18,21 1/1:0,52:52:99:1757,156,0:0,0,21,31 +chrX 2641273 . C T 640 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.96;BaseQRankSum=0.882;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.301;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.454;SOR=0.238;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1564 0/1:24,24:48:99:.:670,0,647:17,7,13,11 +chrX 2641543 . A AT 525.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=9.11;BaseQRankSum=-2.366;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=9.506;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.804;SOR=1.888;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1564 0/1:32,30:62:99:.:565,0,645:14,18,7,23 +chrX 2641696 . A G 206 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=4.37;BaseQRankSum=-1.066;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.77;SOR=0.719;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,31:54:99:.:236,0:14,9,19,12 0/0:.:56:63:56:0,63,1346 +chrX 2641910 . G C 2732 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=22.27;BaseQRankSum=0.066;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.817;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=22.27;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.546;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,74:75:99:2190,0:1,0,32,42 0/1:27,22:49:99:572,0,751:10,17,10,12 +chrX 2641942 . A C 531 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.79;BaseQRankSum=0;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.139;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.935;SOR=0.914;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:75:99:75:0,537 0/1:31,21:52:99:.:561,0,898:14,14,10,8 +chrX 2642250 . CAAAG C 500.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=9.64;BaseQRankSum=1.889;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.896;SOR=0.636;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,34:56:99:.:540,0:8,14,13,21 0/0:.:62:99:62:0,112,1618 +chrX 2642324 . C A 798 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.55;BaseQRankSum=1.204;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=6.633;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.964;SOR=0.836;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,253 0/1:35,31:66:99:.:828,0,918:21,14,13,18 +chrX 2642537 . A T 189 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=3.32;BaseQRankSum=0.674;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=6.652;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.858;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,36:66:99:.:219,0:12,18,21,15 0/0:.:68:99:68:0,120,1800 +chrX 2642714 . C T 402 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=7.32;BaseQRankSum=0.575;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=1.025;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.481;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,36:59:99:.:432,0:13,10,18,18 0/0:.:68:99:68:0,120,1800 +chrX 2642997 . G A 203 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=3.28;BaseQRankSum=0.241;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=3.269;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.28;ReadPosRankSum=0;SOR=0.352;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,39:71:99:.:233,0:12,20,19,20 0/0:.:68:99:68:0,120,1800 +chrX 2643104 . A G 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.34;BaseQRankSum=-1.928;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.268;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.785;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1275 0/1:29,27:56:99:.:635,0,780:16,13,12,15 +chrX 2643614 . G A 3319 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=31.30;BaseQRankSum=2.369;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.30;ReadPosRankSum=0.882;SOR=0.876;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,49:50:99:1563,0:0,1,23,26 1/1:1,56:57:99:1786,160,0:1,0,25,31 +chrX 2643832 . G A 149 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=4.07;BaseQRankSum=1.711;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.829;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,24:44:99:.:179,0:9,11,10,14 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 2644012 . T C 1175 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=11.59;BaseQRankSum=-1.478;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.593;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.447;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,25:43:99:213,0:9,9,13,12 0/1:26,35:61:99:992,0,719:9,17,16,19 +chrX 2644095 . T G 1060 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=9.65;BaseQRankSum=2.286;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.453;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.32;SOR=0.552;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,30:54:99:254,0:15,9,16,14 0/1:29,30:59:99:836,0,716:15,14,13,17 +chrX 2644297 . C T 885 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.05;BaseQRankSum=3.107;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.997;SOR=0.738;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1530 0/1:25,32:57:99:.:915,0,608:12,13,15,17 +chrX 2644385 . C CT 1120.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.81;BaseQRankSum=0.774;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.928;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=0.546;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1530 0/1:35,34:69:99:.:1160,0,1199:22,13,20,14 +chrX 2644535 . G A 917 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=8.23;BaseQRankSum=1.29;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=5.818;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.964;SOR=0.467;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,29:56:99:100,0:17,10,16,13 0/1:28,31:59:99:847,0,717:16,12,13,18 +chrX 2644812 . G A 209 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=3.62;BaseQRankSum=2.454;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=2.138;MQ=59.83;MQRankSum=-0.911;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.375;SOR=0.430;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,35:66:99:.:239,0:10,21,14,21 0/0:.:66:99:66:0,120,1800 +chrX 2644986 . A G 477 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.56;BaseQRankSum=-0.068;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.521;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.368;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,153 0/1:28,20:48:99:.:507,0,774:11,17,10,10 +chrX 2645266 . AAAAAG A 261.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=8.60;BaseQRankSum=0;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.451;MQ=59.14;MQRankSum=0.739;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.459;SOR=0.641;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,153 0/1:24,11:35:99:.:301,0,877:14,10,5,6 +chrX 2645298 . T C 735 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=17.00;BaseQRankSum=-0.128;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=0.543;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,153 0|1:25,20:45:99:.:0|1:2645298_T_C:765,0,990:2645298:16,9,12,8 +chrX 2645299 . G A 735 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=17.00;BaseQRankSum=0.939;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=0.543;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,153 0|1:25,20:45:99:.:0|1:2645298_T_C:765,0,990:2645298:16,9,12,8 +chrX 2645360 . A G 522 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=-1.277;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.560;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,153 0/1:24,22:46:99:.:552,0,666:14,10,12,10 +chrX 2645405 . A AT 418.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=22;AS_QD=9.16;BaseQRankSum=-0.348;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.088;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.763;SOR=0.917;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:55:.:55:0,0 0/1:28,22:50:99:.:458,0,638:15,13,13,9 +chrX 2645638 . C A 717 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.98;BaseQRankSum=0.901;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=6.702;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.43;SOR=0.169;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:99:52:0,1330 0/1:18,26:44:99:.:747,0,474:5,13,13,13 +chrX 2645790 . G A 1058 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=23.15;BaseQRankSum=-0.086;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.15;ReadPosRankSum=1.509;SOR=0.602;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,1330 0|1:19,28:47:99:.:0|1:2645790_G_A:1088,0,682:2645790:10,9,14,14 +chrX 2645798 . C T 1063 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=24.29;BaseQRankSum=0.81;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.29;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.722;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:52:99:52:.:.:0,1330 0|1:17,28:45:99:.:0|1:2645790_G_A:1093,0,619:2645790:9,8,15,13 +chrX 2645818 . G A 455 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=50;AS_QD=4.45;BaseQRankSum=2.273;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.553;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.617;SOR=0.927;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB .:33,32:65:.:1,0:15,18,13,19 0/1:26,18:44:99:484,0,652:13,13,8,10 +chrX 2645850 . C G 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=16.19;BaseQRankSum=0.828;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.566;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,179 0/1:16,21:37:99:.:599,0,415:7,9,10,11 +chrX 2645910 . G C 3898 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=32.46;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=0.888;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1947,0:0,0,25,35 1/1:0,61:61:99:1981,183,0:0,0,30,31 +chrX 2645973 . C G 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.31;BaseQRankSum=3.45;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=4.853;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.22;SOR=1.255;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,99 0/1:35,32:67:99:.:892,0,821:18,17,12,20 +chrX 2646009 . T C 1943 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=30.83;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=30.83;SOR=1.044;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:53:99:53:0,99 1/1:0,64:64:99:.:1973,191,0:0,0,27,37 +chrX 2646057 . C CA 82.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=2.30;BaseQRankSum=-1.855;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=1.137;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.854;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,29:53:99:.:122,0:14,10,18,11 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 2646223 . T A,TA 464 . AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;AS_AltDP=24,0;AS_QD=9.69,0.00;BaseQRankSum=0.053;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=4.045;MQ=59.82;MQRankSum=0.982;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.397;SOR=1.413;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:74:.:74:0,0,0 0/1:27,24,0:51:99:.:494,0,731,630,718,1477:13,14,8,16 +chrX 2646369 . C T 588 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.44;BaseQRankSum=1.622;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=5.785;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.114;SOR=1.609;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:31,23:54:99:.:618,0,819:16,15,16,7 +chrX 2646642 . C T 955 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.89;BaseQRankSum=-0.207;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.452;SOR=0.627;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:25,37:62:99:.:985,0,608:14,11,20,17 +chrX 2646974 . C T 933 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=16.05;BaseQRankSum=-2.373;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.248;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.395;SOR=0.682;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:23,37:60:99:.:963,0,610:13,10,17,20 +chrX 2647008 . A C 974 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=16.19;BaseQRankSum=-1.117;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=6.985;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=1.256;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:24,38:62:99:.:1004,0,606:13,11,14,24 +chrX 2647255 . CGGTT GGGTT,C 708 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=29,2;AS_QD=12.10,0.00;BaseQRankSum=-0.061;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=5.150;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.285;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120,120 0/1:32,29,2:63:99:.:738,0,825,829,915,2473:22,10,17,14 +chrX 2647390 . C A 578 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.82;BaseQRankSum=-1.398;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.538;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:22,22:44:99:.:608,0,630:13,9,12,10 +chrX 2647401 . C A 617 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.05;BaseQRankSum=-0.386;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.171;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.778;SOR=0.963;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:20,23:43:99:.:647,0,541:10,10,13,10 +chrX 2647547 . T C 815 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.41;BaseQRankSum=-2.198;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=5.062;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.393;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:30,33:63:99:.:845,0,824:11,19,17,16 +chrX 2647579 . A G 1038 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=16.69;BaseQRankSum=-1.641;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=11.612;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.509;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:24,40:64:99:.:1068,0,597:7,17,22,18 +chrX 2647791 . G A 808 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.76;BaseQRankSum=-0.287;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=4.001;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.439;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:21,29:50:99:.:838,0,568:13,8,14,15 +chrX 2648075 . T A 1183 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=24.26;BaseQRankSum=-0.846;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=2.441;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.26;ReadPosRankSum=-1.209;SOR=0.526;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,120 0|1:19,31:50:99:.:0|1:2648075_T_A:1213,0,704:2648075:11,8,15,16 +chrX 2648082 . C T 1129 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=24.15;BaseQRankSum=-0.403;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=2.552;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.15;ReadPosRankSum=-0.359;SOR=0.711;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,120 0|1:19,29:48:99:.:0|1:2648075_T_A:1159,0,710:2648075:11,8,13,16 +chrX 2648225 . GTTT G 1120.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=18.41;BaseQRankSum=0.766;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=4.987;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.41;ReadPosRankSum=2.11;SOR=0.796;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,120 0|1:33,30:63:99:.:0|1:2648225_GTTT_G:1160,0,1295:2648225:19,14,13,17 +chrX 2648229 . C CCCAT 1120.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=18.41;BaseQRankSum=0.068;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=4.987;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.41;ReadPosRankSum=1.824;SOR=0.796;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,120 0|1:33,30:63:99:.:0|1:2648225_GTTT_G:1160,0,1295:2648225:19,14,13,17 +chrX 2648442 . A G 967 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=18.13;BaseQRankSum=2.685;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.120;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.976;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:21,34:55:99:.:997,0,480:13,8,23,11 +chrX 2648470 . A G 826 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=17.12;BaseQRankSum=-1.892;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=8.724;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.081;SOR=1.618;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:18,32:50:99:.:856,0,466:8,10,22,10 +chrX 2648543 . T C 1013 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.05;BaseQRankSum=0.159;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.398;SOR=0.813;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,120 0|1:37,28:65:99:.:0|1:2648543_T_C:1043,0,1448:2648543:13,24,9,19 +chrX 2648557 . A G 978 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.51;BaseQRankSum=-0.025;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.51;ReadPosRankSum=-1.605;SOR=0.716;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:64:99:64:.:.:0,120 0|1:38,27:65:99:.:0|1:2648543_T_C:1008,0,1483:2648543:13,25,9,18 +chrX 2648600 . A G 882 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.41;BaseQRankSum=0.671;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.172;SOR=0.613;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:35,33:68:99:.:912,0,962:11,24,11,22 +chrX 2648709 . T C 924 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=14.68;BaseQRankSum=-0.741;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=6.715;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.835;SOR=0.655;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,120 0/1:29,36:65:99:.:954,0,763:18,11,16,20 +chrX 2648861 . CT C 444.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=7.22;BaseQRankSum=-1.81;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=4.843;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.891;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,40:67:99:.:484,0:15,12,17,23 0/0:.:58:99:58:0,120,1562 +chrX 2648999 . G A 646 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.70;BaseQRankSum=-0.488;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=5.972;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.543;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1800 0/1:22,24:46:99:.:676,0,616:8,14,13,11 +chrX 2649162 . C T 710 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.76;BaseQRankSum=-0.308;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=9.829;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.142;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1800 0/1:30,28:58:99:.:740,0,789:22,8,14,14 +chrX 2649196 . C G 4484 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=34.20;BaseQRankSum=1.646;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.823;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.20;ReadPosRankSum=-1.161;SOR=0.853;VarDP=132 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,78:78:99:.:.:3448,0:.:0,0,42,36 0|1:26,28:54:99:0|1:2649196_C_G:1066,0,945:2649196:13,13,15,13 +chrX 2649204 . G C 4469 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=34.61;BaseQRankSum=1.041;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.61;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.752;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,76:76:99:.:.:3389,0:.:0,0,41,35 0|1:25,29:54:99:0|1:2649196_C_G:1110,0,920:2649196:13,12,15,14 +chrX 2649244 . C T 615 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.65;BaseQRankSum=2.775;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=2.388;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=0.869;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,144 0/1:28,23:51:99:.:645,0,722:15,13,10,13 +chrX 2649336 . T C 630 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.15;BaseQRankSum=-0.523;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=8.969;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.239;SOR=0.470;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,144 0/1:39,26:65:99:.:660,0,1065:13,26,14,12 +chrX 2649506 . G T 571 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.36;BaseQRankSum=-1.361;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.710;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,144 0/1:33,25:58:99:.:601,0,894:17,16,13,12 +chrX 2649606 . G C 394 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=9.64;BaseQRankSum=1.115;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=4.534;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.671;SOR=0.697;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,144 0/1:28,16:44:99:.:424,0,821:17,11,7,9 +chrX 2649791 . A G 1114 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=16.34;BaseQRankSum=-0.319;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=8.375;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=1.134;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,144 0/1:28,42:70:99:.:1144,0,699:16,12,16,26 +chrX 2649963 . TTGGATGGATGGATGGA T,TTGGATGGATGGA 974.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,27;AS_QD=0.00,18.44;BaseQRankSum=-1.448;DP=154;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.50;MQRankSum=1.754;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.742;SOR=0.634;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,144,144 0/2:28,0,27:55:99:.:1014,1138,2836,0,1163,1419:12,16,12,15 +chrX 2649979 . A AGGGATGGATGGGTGGTTGGATGGATATT,AGGGATGGATGGGTGTTTGGATGGATATT,*,AGGGATGGATGGGTGTTTGGATGGATGTT 2531.97 . AC=0,2,0,0;AF=0.00,0.667,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=1,50,0,4;AS_QD=9.85,28.57,0.00,0.00;BaseQRankSum=-0.144;DP=151;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.26;MQRankSum=-2.958;QD=27.06;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.668;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,1,40,0,0:41:99:1920,1516,0,2120,2120:0,0,11,19 0/2:40,0,10,0,4:54:99:651,827,2979,0,1838,1739,443,2524,1696,2707,690,2769,1701,2295,2743:17,23,8,6 +chrX 2650032 . CAGGT C 3164.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=29.67;BaseQRankSum=-0.476;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.819;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.67;ReadPosRankSum=1.688;SOR=0.566;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:2345,0:0,0,18,35 0/1:32,23:55:99:859,0,1254:11,21,11,12 +chrX 2650140 . A T 3186 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.16;BaseQRankSum=-1.711;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.966;MQ=59.98;MQRankSum=0;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.879;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,52:52:99:.:.:2117,0:.:0,0,23,29 0|1:19,29:48:99:0|1:2650140_A_T:1099,0,624:2650140:9,10,12,17 +chrX 2650163 . C A 3200 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.63;BaseQRankSum=-2.187;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=3.499;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.63;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.644;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,50:50:99:.:.:2100,0:.:0,0,24,26 0|1:19,30:49:99:0|1:2650140_A_T:1130,0,646:2650140:11,8,13,17 +chrX 2650263 . AGATG A,AGATGGATGGATG 619.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=26,0;AS_QD=14.64,0.00;BaseQRankSum=-0.638;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.154;MQ=59.55;MQRankSum=0;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.993;SOR=0.769;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:99:50:0,765,765 0/1:19,26,0:45:99:.:659,0,571,784,604,1793:9,10,14,12 +chrX 2650285 . ATGGT A 1233.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=18.19;BaseQRankSum=1.556;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;MQRankSum=0;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.617;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:799,0:0,0,9,7 0/1:30,19:49:99:474,0,770:17,13,9,8 +chrX 2650393 . G A 2053 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=21.93;BaseQRankSum=0.895;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.044;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.93;ReadPosRankSum=1.561;SOR=1.146;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1415,0:0,0,19,24 0/1:28,24:52:99:668,0,786:14,14,8,16 +chrX 2650794 . T C 651 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.80;BaseQRankSum=-0.957;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=10.698;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.474;SOR=0.876;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:28:47:0,28 0/1:21,25:46:99:.:681,0,572:7,14,15,10 +chrX 2650863 . C T 431 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=9.60;BaseQRankSum=0.808;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=0.644;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:51:28:47:0,28 0/1:30,18:48:99:.:461,0,838:13,17,8,10 +chrX 2651071 . C CAT 1113.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=11.42;BaseQRankSum=-0.372;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.767;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.842;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,36:61:99:489,0:9,16,11,25 0/1:22,18:40:99:664,0,864:10,12,9,9 +chrX 2651170 . G C 2596 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=26.80;BaseQRankSum=1.393;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.049;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.714;SOR=0.554;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1966,0:0,0,31,28 0/1:16,23:39:99:660,0,399:7,9,11,12 +chrX 2651376 . T G 2735 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=24.91;BaseQRankSum=-1.525;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.91;ReadPosRankSum=0.804;SOR=0.760;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1979,0:0,0,29,33 0/1:20,29:49:99:786,0,537:10,10,18,11 +chrX 2651467 . G A 421 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.89;BaseQRankSum=1.949;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.958;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.613;SOR=0.321;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:39:52:0,39 0/1:19,16:35:99:.:451,0,500:12,7,8,8 +chrX 2651531 . G A 552 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.38;BaseQRankSum=-0.18;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=6.118;MQ=59.84;MQRankSum=-1.023;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.832;SOR=1.229;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:39:52:0,39 0/1:25,22:47:99:.:582,0,682:14,11,8,14 +chrX 2651586 . T C 2554 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.30;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=32.30;SOR=0.968;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1345,0:0,0,27,15 1/1:0,38:38:99:1239,114,0:0,0,18,20 +chrX 2651641 . CA C 73.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=3.77;BaseQRankSum=-2.011;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.13;MQRankSum=-0.298;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.783;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:42:99:42:0,556 0/1:19,11:30:99:.:113,0,227:9,10,6,5 +chrX 2651672 . GGAAGAAGAA G,GGAAGAA 2313.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=32,43;AS_QD=28.99,30.15;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.26;QD=31.37;SOR=0.832;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,20,23:43:99:1027,253,0:0,0,26,17 1/2:0,12,20:32:99:1326,833,894,496,0,435:0,0,14,18 +chrX 2651792 . AT A 2858.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=28.41;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.41;SOR=0.815;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:1778,0:0,0,28,35 1/1:0,39:39:99:1120,117,0:0,0,20,19 +chrX 2652082 . C T 3497 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.36;BaseQRankSum=4.124;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=5.197;QD=32.36;ReadPosRankSum=0.137;SOR=1.056;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1788,0:0,0,23,32 1/1:2,52:54:99:1739,142,0:1,1,22,30 +chrX 2652353 . C T 673 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.26;BaseQRankSum=-0.44;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.974;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:65:63:0,65 0/1:27,26:53:99:.:703,0,748:14,13,11,15 +chrX 2652630 . T C 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.93;BaseQRankSum=-1.365;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=4.591;MQ=58.96;MQRankSum=-0.578;QD=13.93;ReadPosRankSum=-1.094;SOR=1.502;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:73:65:63:0,65 0/1:21,22:43:99:.:599,0,601:9,12,6,16 +chrX 2653684 . C T 100 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=3.02;BaseQRankSum=0.678;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.772;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=0.302;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,23:43:99:.:130,0:14,6,13,10 0/0:.:65:80:65:0,80,1350 +chrX 2654038 . A G 4322 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=32.48;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=32.48;SOR=0.818;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1935,0:0,0,30,31 1/1:0,73:73:99:2417,219,0:0,0,33,40 +chrX 2654383 . G A 703 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=8.14;BaseQRankSum=2.686;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.725;MQ=59.80;MQRankSum=1.078;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.966;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,27:52:99:196,0:17,8,11,16 0/1:18,20:38:99:537,0,442:4,14,9,11 +chrX 2654393 . GAAA GAA,G 1678.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=59,12;AS_QD=23.57,32.69;BaseQRankSum=-0.715;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=3.522;MQ=59.83;MQRankSum=-0.112;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.637;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,41,0:42:99:886,0,911:1,0,19,22 1/2:0,18,12:30:99:832,388,304,407,0,575:0,0,12,18 +chrX 2654888 . G A 5028 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=138;AS_QD=28.85;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.65;SOR=0.949;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,73:73:99:.:.:2683,0:.:0,0,43,30 1|1:0,65:65:99:0|1:2654888_G_A:2375,194,0:2654888:0,0,34,31 +chrX 2654910 . G A 599 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.48;BaseQRankSum=0.892;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=2.197;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.39;SOR=0.431;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:74:99:74:.:.:0,144 0|1:35,25:60:99:.:0|1:2654888_G_A:629,0,957:2654888:21,14,13,12 +chrX 2655298 . A G 4231 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=31.80;BaseQRankSum=1.816;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.80;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=0.298;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,68:69:99:2173,0:0,1,33,35 1/1:0,65:65:99:2088,194,0:0,0,28,37 +chrX 2655538 . C G 958 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=13.92;BaseQRankSum=-0.129;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.746;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,591 0/1:34,37:71:99:.:988,0,894:17,17,19,18 +chrX 2655639 . C T 1002 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=13.95;BaseQRankSum=1.59;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.779;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,591 0/1:35,39:74:99:.:1032,0,835:16,19,17,22 +chrX 2656563 . T A 863 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.40;BaseQRankSum=-2.39;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.270;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.438;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,591 0/1:24,34:58:99:.:893,0,650:8,16,14,20 +chrX 2656935 . A G 580 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.34;BaseQRankSum=-2.695;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=7.248;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.13;SOR=1.373;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,591 0/1:33,26:59:99:.:610,0,940:15,18,17,9 +chrX 2657110 . G T 918 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.15;BaseQRankSum=-1.586;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=2.046;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.642;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,591 0/1:29,38:67:99:.:948,0,722:13,16,20,18 +chrX 2657304 . C T 1074 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.77;BaseQRankSum=0.734;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=8.920;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.509;SOR=1.819;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,591 0/1:31,39:70:99:.:1104,0,809:17,14,29,10 +chrX 2657565 . T A 3845 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=33.41;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.41;SOR=1.003;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1889,0:0,0,27,30 1/1:0,59:59:99:1986,177,0:0,0,23,36 +chrX 2657703 . G A 1790 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=16.11;BaseQRankSum=-2.13;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.920;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.829;SOR=1.101;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,37:65:99:214,0:14,14,25,12 1/1:0,48:48:99:1606,144,0:0,0,25,23 +chrX 2658359 . G A 4360 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=32.52;BaseQRankSum=-0.35;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.248;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,77:77:99:2540,0:0,0,37,40 1/1:1,57:58:99:1850,139,0:1,0,32,25 +chrX 2658849 . C CT 3216.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=28.81;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.81;SOR=0.747;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:1771,0:0,0,31,31 1/1:0,51:51:99:1485,153,0:0,0,24,27 +chrX 2658898 . CAA C 3347.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.76;BaseQRankSum=-0.65;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.42;ReadPosRankSum=1.155;SOR=0.260;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1688,0:0,0,22,23 1/1:1,47:48:99:1699,118,0:0,1,22,25 +chrX 2659028 . C CGAGA 1974.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=19.00;BaseQRankSum=0.089;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.649;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,28:47:99:392,0:6,13,11,17 0/1:19,40:59:99:1622,0,667:8,11,15,25 +chrX 2659231 . CTCTCCTCCTCCCTCCCCCCT C 155.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=0.765;DP=12;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.693;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:35:1:0,35 0/1:5,5:10:99:.:195,0,195:0,5,0,5 +chrX 2660061 . G C 660 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.05;BaseQRankSum=-1.973;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=12.312;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.724;SOR=1.806;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:5:24:3:0,24 0/1:18,25:43:99:.:690,0,496:7,11,18,7 +chrX 2660244 . C T 3423 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=32.89;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=0.791;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1727,0:0,0,28,25 1/1:0,52:52:99:1726,156,0:0,0,27,25 +chrX 2660318 . T G 807 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.41;BaseQRankSum=-1.152;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.058;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.525;SOR=0.652;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,180 0/1:20,31:51:99:.:837,0,521:12,8,14,17 +chrX 2660670 . T C 1120 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=9.27;BaseQRankSum=0.857;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=5.619;MQ=59.86;MQRankSum=0.914;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.693;SOR=1.213;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,41:71:99:.:.:363,0:.:15,15,26,15 0|1:30,23:53:99:0|1:2660670_T_C:787,0,1118:2660670:17,13,15,8 +chrX 2660686 . T G 1082 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=9.27;BaseQRankSum=2.46;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=8.592;MQ=59.85;MQRankSum=0.929;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.27;SOR=1.448;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,38:68:99:.:.:294,0:.:14,16,24,14 0|1:29,23:52:99:0|1:2660670_T_C:818,0,1081:2660670:16,13,16,7 +chrX 2661210 . C A 914 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=9.35;BaseQRankSum=-0.027;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=1.620;MQ=59.83;MQRankSum=-0.824;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.528;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,26:47:99:124,0:9,12,13,13 0/1:23,31:54:99:820,0,598:9,14,13,18 +chrX 2661256 . G C 1210 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=11.59;BaseQRankSum=-0.334;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.559;MQ=59.83;MQRankSum=-0.771;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.27;SOR=0.790;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:18,27:45:99:294,0:9,9,13,14 0/1:27,35:62:99:946,0,708:14,13,16,19 +chrX 2661288 . C T 705 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.05;BaseQRankSum=1.442;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=6.843;MQ=59.85;MQRankSum=0.924;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=1.528;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:42:50:0,42 0/1:34,27:61:99:.:735,0,928:17,17,18,9 +chrX 2661626 . C G 769 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.08;BaseQRankSum=-1.32;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.294;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.08;ReadPosRankSum=-2.541;SOR=1.037;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:42:50:0,42 0/1:23,30:53:99:.:799,0,606:12,11,18,12 +chrX 2661764 . T C 583 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=6.13;BaseQRankSum=0.509;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.07;SOR=0.765;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,31:58:99:109,0:13,14,15,16 0/1:22,20:42:99:504,0,539:9,13,7,13 +chrX 2661848 . A C 724 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=7.25;BaseQRankSum=1.111;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=4.878;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.7;SOR=1.070;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,37:64:99:338,0:12,15,26,11 0/1:23,17:40:99:416,0,640:12,11,6,11 +chrX 2662029 . A T 290 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=11.85;BaseQRankSum=-0.568;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=11.146;MQ=58.80;MQRankSum=-1.336;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.117;SOR=3.126;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:54:99:54:0,164 0/1:13,14:27:99:.:320,0,431:8,5,13,1 +chrX 2662032 . CA C,CAAAAA 1060.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=14,31;AS_QD=3.93,32.42;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.75;QD=24.44;SOR=0.929;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,8,14:22:99:438,609,0:0,0,10,12 1/2:0,6,17:23:95:662,607,834,95,0,178:0,0,15,8 +chrX 2662393 . A G 612 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.59;BaseQRankSum=1.084;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.174;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=0.900;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,110 0/1:21,23:44:99:.:642,0,568:11,10,10,13 +chrX 2662548 . T C 548 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.51;BaseQRankSum=-0.915;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.265;SOR=0.772;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,110 0/1:31,24:55:99:.:578,0,863:20,11,16,8 +chrX 2662626 . C CA 269.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=7.92;BaseQRankSum=0.599;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.243;MQ=59.68;MQRankSum=-1.029;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.944;SOR=0.848;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,110 0/1:21,18:39:99:.:309,0,388:11,10,8,10 +chrX 2662829 . G A 750 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.79;BaseQRankSum=2.03;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.788;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,110 0/1:33,28:61:99:.:780,0,894:16,17,15,13 +chrX 2663629 . A G 1899 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=31.62;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.62;SOR=1.197;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,110 1/1:0,61:61:99:.:1929,182,0:0,0,37,24 +chrX 2663787 . C T 1775 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.23;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.23;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,110 1/1:0,56:56:99:.:1805,168,0:0,0,26,30 +chrX 2663905 . C A 1622 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=33.04;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.04;SOR=0.952;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,110 1/1:0,50:50:99:.:1652,150,0:0,0,28,22 +chrX 2663959 . T TAA 1514.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=17.08;BaseQRankSum=1.365;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.412;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.392;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,25:45:99:124,0:7,13,13,12 1/1:0,46:46:99:1430,137,0:0,0,19,27 +chrX 2665160 . GCCTT G 1958.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=33.28;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=41.63;SOR=0.866;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:1056,0:0,0,14,12 1/1:0,22:22:67:942,67,0:0,0,12,10 +chrX 2665273 . T TTC 3954.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=33.29;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=44.38;SOR=1.828;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:2045,0:0,0,14,32 1/1:0,44:44:99:1949,132,0:0,0,13,31 +chrX 2666024 . A G 4366 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=136;AS_QD=32.09;BaseQRankSum=-0.52;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=3.172;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.09;ReadPosRankSum=1.637;SOR=0.365;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,71:72:99:2202,0:1,0,29,42 1/1:0,65:65:99:2194,195,0:0,0,36,29 +chrX 2667074 . C T 3669 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=33.94;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.94;SOR=1.049;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1956,0:0,0,28,30 1/1:0,51:51:99:1743,153,0:0,0,18,33 +chrX 2667938 . G A 3949 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=31.33;BaseQRankSum=3.679;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=4.727;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.33;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.515;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,71:73:99:2267,0:0,2,39,32 1/1:2,52:54:99:1712,128,0:1,1,28,24 +chrX 2668319 . C T 4098 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=32.50;BaseQRankSum=2.778;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.328;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,68:68:99:2201,0:0,0,34,34 1/1:1,58:59:99:1927,167,0:1,0,36,22 +chrX 2668582 . G A 947 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.76;BaseQRankSum=0.115;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=1.976;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.53;SOR=0.993;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1607 0/1:35,36:71:99:.:977,0,928:16,19,14,22 +chrX 2668607 . C A 1093 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=15.18;BaseQRankSum=-1.214;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=0.888;MQ=59.78;MQRankSum=-0.846;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.862;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1607 0/1:32,42:74:99:.:1123,0,846:15,17,18,24 +chrX 2668621 . AAG A 1284.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=19.76;BaseQRankSum=-1.029;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=3.312;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.697;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1607 0/1:32,35:67:99:.:1324,0,1216:18,14,16,19 +chrX 2668676 . C T 875 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.51;BaseQRankSum=1.517;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.756;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1607 0/1:34,33:67:99:.:905,0,874:18,16,18,15 +chrX 2669004 . G C 578 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.16;BaseQRankSum=-0.144;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=7.790;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.962;SOR=1.463;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1607 0/1:26,24:50:99:.:608,0,679:14,12,8,16 +chrX 2669213 . G C 701 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.33;BaseQRankSum=0.566;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.933;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=1.179;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1607 0/1:25,26:51:99:.:731,0,671:12,13,16,10 +chrX 2669459 . A C 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.05;BaseQRankSum=-1.821;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=1.007;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.518;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1607 0/1:29,28:57:99:.:687,0,782:16,13,14,14 +chrX 2670187 . T A 745 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=5.96;BaseQRankSum=-0.796;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.635;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,41:75:99:166,0:17,17,21,20 0/1:31,24:55:99:609,0,862:18,13,13,11 +chrX 2670570 . CT C 109.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=7.84;BaseQRankSum=-0.525;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=11.563;MQ=59.30;MQRankSum=0;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=1.657;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:8,11:19:82:.:149,0,82:6,2,3,8 +chrX 2670718 . G A 444 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.67;BaseQRankSum=0.044;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.67;ReadPosRankSum=2.453;SOR=0.687;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:30,19:49:99:.:474,0,805:16,14,9,10 +chrX 2670878 . T G 746 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=10.63;BaseQRankSum=-1.814;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.880;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.12;SOR=0.568;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:40,33:73:99:.:776,0,1071:22,18,17,16 +chrX 2671003 . G A 625 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.29;BaseQRankSum=-0.47;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.702;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:31,27:58:99:.:655,0,824:16,15,14,13 +chrX 2671103 . C A 1070 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.94;BaseQRankSum=1.877;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.453;SOR=0.594;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:30,39:69:99:.:1100,0,701:17,13,21,18 +chrX 2671135 . G A 1218 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.83;BaseQRankSum=0.567;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.345;SOR=0.588;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:35,35:70:99:.:1248,0,865:21,14,20,15 +chrX 2671141 . G A 800 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.03;BaseQRankSum=1.066;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.949;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.495;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:37,32:69:99:.:830,0,1327:24,13,19,13 +chrX 2671165 . CA C 685.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.29;BaseQRankSum=-1.825;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=2.188;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=1.071;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:30,29:59:99:.:725,0,749:15,15,17,12 +chrX 2671220 . G A 674 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.83;BaseQRankSum=0.596;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.3;SOR=0.806;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:38,27:65:99:.:704,0,1003:20,18,15,12 +chrX 2671231 . A G 680 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.76;BaseQRankSum=-2.928;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.662;SOR=0.734;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:22:60:0,22 0/1:36,30:66:99:.:710,0,1034:20,16,17,13 +chrX 2671246 . C A 761 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=5.95;BaseQRankSum=-0.095;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=3.101;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=0.589;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,35:67:99:129,0:12,20,16,19 0/1:37,29:66:99:662,0,1001:19,18,17,12 +chrX 2671416 . A G 551 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.52;BaseQRankSum=1.17;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=5.480;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=1.547;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:54:68:0,54 0/1:38,23:61:99:.:581,0,1055:18,20,7,16 +chrX 2671476 . A G 414 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=8.22;BaseQRankSum=-1.379;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.251;SOR=0.693;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:54:68:0,54 0/1:34,20:54:99:.:444,0,956:17,17,10,10 +chrX 2671565 . C CTTTTT 598.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=8.51;BaseQRankSum=0.695;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.874;MQ=59.49;MQRankSum=0;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.869;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,24:44:99:213,0:10,10,11,13 0/1:19,12:31:99:425,0,685:9,10,5,7 +chrX 2671665 . C T 593 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.71;BaseQRankSum=2.282;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=4.018;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.581;SOR=0.465;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,148 0/1:26,23:49:99:.:623,0,631:10,16,12,11 +chrX 2671724 . G A 565 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.82;BaseQRankSum=-1.761;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=2.268;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.824;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,148 0/1:28,27:55:99:.:595,0,720:15,13,12,15 +chrX 2671793 . T C 1513 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=13.19;BaseQRankSum=-0.758;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=3.829;MQ=59.75;MQRankSum=-0.906;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.383;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,39:73:99:129,0:13,21,24,15 1/1:0,44:44:99:1414,132,0:0,0,16,28 +chrX 2672074 . C T 1725 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=13.60;BaseQRankSum=3.057;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.709;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.935;SOR=0.627;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:38,40:78:99:176,0:18,20,18,22 1/1:2,49:51:99:1579,119,0:1,1,27,22 +chrX 2672141 . A C 2869 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=22.65;BaseQRankSum=3.568;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.854;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.758;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:29,42:71:99:.:.:575,0:.:16,13,16,26 1|1:2,55:57:82:0|1:2672141_A_C:2324,82,0:2672141:1,1,28,27 +chrX 2672148 . C T 2869 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=22.30;BaseQRankSum=2.955;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=3.788;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.30;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.639;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:30,43:73:99:.:.:575,0:.:17,13,17,26 1|1:2,55:57:82:0|1:2672141_A_C:2324,82,0:2672141:1,1,29,26 +chrX 2672517 . G A 2428 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=27.09;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.89;SOR=1.101;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:30:60:.:.:0,30 1|1:0,56:56:99:.:0|1:2672517_G_A:2458,169,0:2672517:0,0,33,23 +chrX 2672533 . A G 2522 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=31.79;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=43.25;SOR=0.871;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:30:60:.:.:0,30 1|1:0,59:59:99:.:0|1:2672517_G_A:2552,178,0:2672517:0,0,32,27 +chrX 2672565 . A C 1933 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=15.70;BaseQRankSum=3.509;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=8.395;MQ=59.87;MQRankSum=1.572;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.240;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,33:61:57:57,0:20,8,13,20 1/1:3,61:64:78:1906,78,0:1,2,35,26 +chrX 2673088 . G A 678 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=5.45;BaseQRankSum=0.816;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=5.396;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.369;VarDP=130 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:37,36:73:26:26,0:13,24,19,17 0/1:31,26:57:99:682,0,836:13,18,11,15 +chrX 2673551 . A T 1482 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=11.37;BaseQRankSum=1.764;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.649;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.597;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,44:68:99:616,0:14,10,20,24 0/1:33,32:65:99:896,0,867:16,17,18,14 +chrX 2673847 . T A 581 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=5.36;BaseQRankSum=-0.411;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=1.478;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.549;SOR=0.846;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,31:59:7:7,0:16,12,16,15 0/1:32,23:55:99:604,0,917:14,18,13,10 +chrX 2674054 . CGATCCTGCCCTCCCTGTCATCTCGGT C 1124.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=20.07;BaseQRankSum=-0.369;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=3.698;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.07;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=1.329;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:44:66:0,44 0/1:28,30:58:99:.:1164,0,1085:14,14,11,19 +chrX 2674149 . A ATT 704.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=10.19;BaseQRankSum=1.154;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.202;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.035;SOR=0.555;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,22:38:99:153,0:6,10,14,8 0/1:15,20:35:99:591,0,421:7,8,8,12 +chrX 2674282 . GGTT G 1342.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=16.07;BaseQRankSum=1.212;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=4.139;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.3;SOR=0.385;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:14,23:37:99:404,0:10,4,14,9 0/1:24,25:49:99:978,0,920:15,9,13,12 +chrX 2674591 . C T 992 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=8.38;BaseQRankSum=1.481;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=4.501;MQ=59.80;MQRankSum=0.983;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.31;SOR=0.387;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:29,38:67:99:345,0:11,18,16,22 0/1:29,26:55:99:677,0,795:9,20,12,14 +chrX 2674782 . C T 828 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=7.21;BaseQRankSum=1.61;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=6.989;MQ=59.76;MQRankSum=-0.902;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.654;SOR=1.046;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,32:60:99:193,0:10,18,21,11 0/1:32,27:59:99:665,0,845:18,14,14,13 +chrX 2675057 . CAA C,CA,CAAAAA 216.97 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=14,4,5;AS_QD=8.78,4.15,0.00;BaseQRankSum=-0.66;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=34.427;MQ=57.86;MQRankSum=-0.167;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.231;SOR=2.776;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,5,4,5:14:54:54,156,0,114:0,0,12,2 0/1:9,9,0,0:18:99:202,0,135,228,162,391,228,162,391,391:1,8,7,2 +chrX 2675430 . C G 718 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=6.50;BaseQRankSum=0.195;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=14.125;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.624;SOR=1.572;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,34:65:99:104,0:17,14,20,14 0/1:26,24:50:99:644,0,733:10,16,19,5 +chrX 2675578 . CTTTTT CTTTTTTTTT,C,CTTT 888.97 . AC=2,1,0;AF=0.667,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=25,3,0;AS_QD=30.93,15.83,0.00;BaseQRankSum=1.273;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.696;MQ=58.39;MQRankSum=-0.541;QD=29.94;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.223;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,16,0,0:18:99:511,0,603,603:0,2,6,10 1/2:1,9,3,0:13:62:417,62,78,322,0,459,471,150,510,1084:0,1,3,9 +chrX 2675712 . A G 737 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=7.45;BaseQRankSum=1.605;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.733;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.1;SOR=0.795;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,33:61:99:183,0:17,11,21,12 0/1:21,21:42:99:584,0,529:9,12,9,12 +chrX 2675970 . C A 1067 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=7.95;BaseQRankSum=-0.449;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=10.491;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.673;SOR=0.634;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,40:74:99:148,0:12,22,20,20 0/1:29,35:64:99:949,0,796:13,16,21,14 +chrX 2677018 . G A 109 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=2.04;BaseQRankSum=1.372;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.706;SOR=0.678;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,35:68:99:.:139,0:14,19,15,20 0/0:.:64:81:64:0,81,1361 +chrX 2677142 . C CTT 174.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=4.12;BaseQRankSum=1.625;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.402;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.037;SOR=0.862;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,30:52:99:.:214,0:10,12,17,13 0/0:.:64:81:64:0,81,1361 +chrX 2678374 . T G 2221 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.90;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.15;SOR=1.217;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2251,0:0,0,23,36 0/0:.:64:81:64:0,81,1361 +chrX 2678378 . G A 39 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=1.15;BaseQRankSum=1.517;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.998;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.71;SOR=0.979;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,30:60:69:.:69,0:14,16,12,18 0/0:.:64:81:64:0,81,1361 +chrX 2678516 . G A 1772 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=34.00;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.00;SOR=0.808;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,202 1/1:0,53:53:99:.:1802,159,0:0,0,28,25 +chrX 2678681 . C G 1916 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=28.48;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.42;SOR=0.770;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:1946,0:0,0,25,27 0/0:.:61:66:61:0,66,1463 +chrX 2679134 . T A 1875 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.84;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.84;SOR=0.762;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:1905,0:0,0,28,30 0/0:.:61:66:61:0,66,1463 +chrX 2679450 . T TG 1834.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=31.30;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.36;SOR=0.892;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,53:53:99:.:1874,0:0,0,29,24 0/0:.:61:66:61:0,66,1463 +chrX 2680356 . C A 615 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=10.75;BaseQRankSum=0.01;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.077;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.458;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,40:60:99:.:645,0:13,7,23,17 0/0:.:61:66:61:0,66,1463 +chrX 2680540 . A G 1874 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.27;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.27;SOR=1.217;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1904,0:0,0,36,23 0/0:.:61:66:61:0,66,1463 +chrX 2680603 . CATCT C 275.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=5.53;BaseQRankSum=-2.505;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=5.333;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=0.986;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,32:57:99:.:315,0:11,14,19,13 0/0:.:61:66:61:0,66,1463 +chrX 2680624 . G A 302 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=4.88;BaseQRankSum=-0.32;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=6.542;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.88;ReadPosRankSum=1.184;SOR=1.049;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,38:68:99:.:332,0:13,17,23,15 0/0:.:61:66:61:0,66,1463 +chrX 2681278 . G A 1567 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=31.94;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.94;SOR=1.157;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:1597,0:0,0,30,20 0/0:.:28:28:26:0,28,741 +chrX 2681856 . CTT C 536.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=10.47;BaseQRankSum=0.229;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.354;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.234;SOR=0.610;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,34:55:99:.:576,0:12,9,16,18 0/0:.:28:28:26:0,28,741 +chrX 2682276 . T C 2973 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=29.84;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=0.723;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,67:67:99:.:3003,0:0,0,33,34 0/0:.:28:28:26:0,28,741 +chrX 2682278 . G A 2973 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=30.32;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=0.723;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,67:67:99:.:3003,0:0,0,33,34 0/0:.:28:28:26:0,28,741 +chrX 2682346 . A G 2609 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.58;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.58;SOR=0.934;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,81:81:99:.:2639,0:0,0,36,45 0/0:.:28:28:26:0,28,741 +chrX 2683892 . T C 266 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=8.46;BaseQRankSum=-0.702;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=1.348;MQ=56.85;MQRankSum=1.274;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.771;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:13,22:35:99:.:296,0:7,6,10,12 0/0:.:28:28:26:0,28,741 +chrX 2684319 . T C 70 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=1.79;BaseQRankSum=-1.896;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.639;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:26,30:56:99:.:100,0:16,10,18,12 0/0:.:65:42:65:0,42,1052 +chrX 2684514 . T C 226 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=3.88;BaseQRankSum=-1.131;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.944;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.536;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,37:66:99:.:256,0:12,17,17,20 0/0:.:65:42:65:0,42,1052 +chrX 2684605 . T C 111 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=2.31;BaseQRankSum=-0.86;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.154;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.534;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,33:61:99:.:141,0:12,16,17,16 0/0:.:65:42:65:0,42,1052 +chrX 2684790 . C CATT 1852.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=30.17;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.00;SOR=1.312;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,43:43:99:.:1892,0:0,0,16,27 0/0:.:65:42:65:0,42,1052 +chrX 2684870 . G A 64 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=1.57;BaseQRankSum=-1.025;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.57;ReadPosRankSum=1.608;SOR=0.770;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,32:60:94:.:94,0:17,11,20,12 0/0:.:65:42:65:0,42,1052 +chrX 2686275 . C T 160 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=3.73;BaseQRankSum=1.26;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.359;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.455;SOR=1.071;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,28:51:99:.:190,0:12,11,17,11 0/0:.:65:42:65:0,42,1052 +chrX 2686465 . T C 102 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=1.71;BaseQRankSum=-2.231;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=3.181;MQ=59.94;MQRankSum=-0.863;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.462;SOR=1.112;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:34,43:77:99:.:132,0:14,20,14,29 0/0:.:65:42:65:0,42,1052 +chrX 2688381 . C CT 921.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=22.88;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.53;QD=22.88;SOR=1.556;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:73:75:73:.:.:0,75 1|1:0,42:42:99:.:0|1:2688381_C_CT:961,125,0:2688381:0,0,28,14 +chrX 2689243 . G C 2480 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=22.21;BaseQRankSum=0.934;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.801;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.018;SOR=0.859;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1902,0:0,0,23,36 0/1:31,23:54:99:608,0,825:14,17,11,12 +chrX 2689712 . C CT 1527.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=28.49;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.49;SOR=1.371;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1628 1/1:0,55:55:99:.:1567,165,0:0,0,35,20 +chrX 2690094 . G A 2940 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=24.34;BaseQRankSum=1.703;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.829;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.34;ReadPosRankSum=-2.146;SOR=1.029;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,58:58:99:1921,0:0,0,20,38 0/1:28,36:64:99:1049,0,738:14,14,20,16 +chrX 2690784 . A C 206 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=5.62;BaseQRankSum=-2.781;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=1.203;MQ=59.82;MQRankSum=-0.735;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.399;SOR=0.495;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:16,26:42:99:.:236,0:9,7,13,13 0/0:.:16:20:15:0,20,411 +chrX 2690851 . T G 892 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=31.79;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;QD=31.79;SOR=1.255;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:922,0:0,0,18,11 0/0:.:59:52:59:0,52,744 +chrX 2690939 . G C 85 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=2.61;BaseQRankSum=1.28;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.61;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=0.672;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,23:44:99:.:115,0:9,12,10,13 0/0:.:59:52:59:0,52,744 +chrX 2691154 . G A 115 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=2.90;BaseQRankSum=0.258;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.806;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:23,27:50:99:.:145,0:13,10,16,11 0/0:.:59:52:59:0,52,744 +chrX 2691192 . C CCGGGG 1266.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=19.79;BaseQRankSum=-0.942;DP=144;ExcessHet=0.0000;FS=2.067;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=1.085;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,1771 0/1:32,34:66:99:.:1306,0,1231:16,16,20,14 +chrX 2691262 . C T 371 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=5.28;BaseQRankSum=-1.255;DP=159;ExcessHet=0.0000;FS=6.287;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.73;SOR=1.426;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,45:76:99:.:401,0:17,14,31,14 0/0:.:80:99:80:0,120,1800 +chrX 2691502 . G A 225 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=3.04;BaseQRankSum=-2.244;DP=165;ExcessHet=0.0000;FS=7.206;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.73;SOR=0.512;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:37,47:84:99:.:255,0:14,23,25,22 0/0:.:80:99:80:0,120,1800 +chrX 2691676 . G T 918 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=12.15;BaseQRankSum=0.688;DP=148;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.606;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:85:66:0,85 0/1:42,36:78:99:.:948,0,1125:20,22,18,18 +chrX 2691708 . T C 2458 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=34.08;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.08;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:85:66:0,85 1/1:0,73:73:99:.:2488,220,0:0,0,39,34 +chrX 2691942 . T C 3121 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=23.34;BaseQRankSum=-0.878;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=8.427;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.34;ReadPosRankSum=-1.423;SOR=0.849;VarDP=135 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1939,0:0,0,38,23 0/1:29,45:74:99:1212,0,732:12,17,23,22 +chrX 2692453 . T G 1083 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=18.86;BaseQRankSum=-2.359;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.413;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=1.158;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:52:24:45:0,24 0/1:19,40:59:99:.:1113,0,483:9,10,15,25 +chrX 2693204 . A G 68 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=2.18;BaseQRankSum=-1.356;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=6.176;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.388;SOR=1.609;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,25:45:98:.:98,0:10,10,17,8 0/0:.:35:53:34:0,53,1003 +chrX 2694519 . AG A 2590.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=23.91;BaseQRankSum=-0.852;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.728;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=23.91;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.488;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1812,0:0,0,28,23 0/1:31,28:59:99:818,0,926:18,13,13,15 +chrX 2694753 . A C 1592 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=31.80;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.80;SOR=1.436;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,51:51:99:.:1622,0:0,0,18,33 0/0:.:63:99:63:0,120,1800 +chrX 2694756 . G GA 465.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.48;BaseQRankSum=0.935;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=14.898;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=1.684;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,1463 0/1:20,24:44:99:.:505,0,410:7,13,17,7 +chrX 2695238 . C T 1579 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=31.55;BaseQRankSum=-0.411;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=4.065;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.55;ReadPosRankSum=0.238;SOR=1.033;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,50:51:99:.:1609,0:0,1,31,19 0/0:.:61:98:61:0,98,1235 +chrX 2695535 . T C 3344 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=30.67;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=30.67;SOR=0.976;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2027,0:0,0,28,38 1/1:0,44:44:99:1347,131,0:0,0,20,24 +chrX 2695637 . C CTT 1454.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=29.32;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;QD=40.38;SOR=1.121;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,37:37:99:.:1494,0:0,0,22,15 0/0:.:49:38:48:0,38,1288 +chrX 2695659 . T A 2713 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=34.72;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.07;QD=34.72;SOR=0.770;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1514,0:0,0,22,17 1/1:0,40:40:99:1229,119,0:0,0,19,21 +chrX 2696041 . A G 3657 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=31.78;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.78;SOR=0.693;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1847,0:0,0,28,32 1/1:0,56:56:99:1840,168,0:0,0,30,26 +chrX 2696071 . G A 1895 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=31.56;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.56;SOR=0.941;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1548 1/1:0,61:61:99:.:1925,182,0:0,0,34,27 +chrX 2696178 . A G 3539 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.45;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.45;SOR=1.118;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1597,0:0,0,29,21 1/1:0,60:60:99:1972,180,0:0,0,36,24 +chrX 2696226 . T C 1661 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=32.52;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.52;SOR=1.036;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,52:52:99:.:1691,0:0,0,30,22 0/0:.:69:99:69:0,120,1800 +chrX 2696439 . T C 3851 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=33.17;BaseQRankSum=-0.182;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.278;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=33.17;ReadPosRankSum=-1.42;SOR=0.446;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1505,0:0,0,27,18 1/1:1,71:72:99:2376,182,0:0,1,35,36 +chrX 2697338 . C T 1944 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.46;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.46;SOR=1.217;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1974,0:0,0,23,36 0/0:.:62:96:62:0,96,1301 +chrX 2697475 . T C 4787 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=31.56;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.85;SOR=0.828;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2858,0:0,0,32,32 1/1:0,60:60:99:1959,180,0:0,0,34,26 +chrX 2697482 . A G 2854 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.64;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.37;SOR=0.723;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,65:65:99:.:2884,0:0,0,32,33 0/0:.:63:99:63:0,120,1800 +chrX 2697555 . C A 2033 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.74;BaseQRankSum=1.996;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.815;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.74;ReadPosRankSum=-1.519;SOR=0.849;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1441 1/1:1,64:65:99:.:2063,170,0:1,0,26,38 +chrX 2697946 . T C 3081 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=32.75;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=0.848;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,48:48:99:1598,0:0,0,27,21 1/1:0,47:47:99:1513,141,0:0,0,24,23 +chrX 2698739 . C T 2254 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=33.59;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.59;SOR=0.752;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1239 1/1:0,68:68:99:.:2284,204,0:0,0,35,33 +chrX 2698851 . A G 1682 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=31.70;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.70;SOR=0.846;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1239 1/1:0,54:54:99:.:1712,162,0:0,0,25,29 +chrX 2699362 . A G 3086 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=31.16;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;QD=31.16;SOR=1.059;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,51:51:99:1645,0:0,0,25,26 1/1:0,49:49:99:1471,146,0:0,0,17,32 +chrX 2701436 . T C 2200 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.86;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.86;SOR=0.693;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1091 1/1:0,70:70:99:.:2230,210,0:0,0,35,35 +chrX 2701585 . GCCTC G 3189.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=29.62;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.85;SOR=0.869;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1091 1|1:0,72:72:99:.:0|1:2701585_GCCTC_G:3229,217,0:2701585:0,0,33,39 +chrX 2701590 . T TG 3189.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=27.77;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.85;SOR=0.869;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1091 1|1:0,72:72:99:.:0|1:2701585_GCCTC_G:3229,217,0:2701585:0,0,33,39 +chrX 2701613 . T G 2212 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.58;BaseQRankSum=2.348;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=3.599;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.58;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.693;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1091 1/1:1,70:71:99:.:2242,203,0:1,0,30,40 +chrX 2703079 . A G 1979 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.89;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.89;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1091 1/1:0,63:63:99:.:2009,188,0:0,0,29,34 +chrX 2703417 . G A 1340 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=34.25;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.25;SOR=1.981;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1091 1/1:0,40:40:99:.:1370,120,0:0,0,11,29 +chrX 2703605 . AGTGTGT A,AGTGTGTGT 2304.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=45,19;AS_QD=33.02,10.68;BaseQRankSum=-0.896;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.697;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,45,0:46:99:1981,0,2004:0,1,26,19 0/2:14,0,19:33:99:363,405,718,0,313,257:8,6,8,11 +chrX 2704041 . T C 1488 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=29.76;BaseQRankSum=-0.662;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.458;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.76;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=0.610;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1473 1/1:1,50:51:99:.:1518,118,0:1,0,22,28 +chrX 2704219 . G A 1637 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=32.69;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.69;SOR=0.732;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1473 1/1:0,51:51:99:.:1667,153,0:0,0,26,25 +chrX 2704349 . C T 240 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=4.43;BaseQRankSum=0.848;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=2.175;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.617;SOR=0.404;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:27,34:61:99:.:270,0:11,16,17,17 0/0:.:63:99:63:0,107,1800 +chrX 2704606 . C T 2186 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=23.96;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.62;SOR=1.136;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1271 1|1:0,52:52:99:.:0|1:2704606_C_T:2216,156,0:2704606:0,0,21,31 +chrX 2704624 . T G 2141 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=25.69;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.57;SOR=1.094;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:62:99:62:.:.:0,1271 1|1:0,51:51:99:.:0|1:2704606_C_T:2171,153,0:2704606:0,0,21,30 +chrX 2705002 . A G 2267 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.90;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.90;SOR=1.002;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1271 1/1:0,72:72:99:.:2297,216,0:0,0,41,31 +chrX 2705504 . C T 2091 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.63;BaseQRankSum=4.486;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.994;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.63;ReadPosRankSum=0.57;SOR=0.158;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1271 1/1:2,63:65:99:.:2121,176,0:2,0,35,28 +chrX 2706063 . G A,GAA 3398 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=4,95;AS_QD=31.70,30.24;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=34.63;SOR=0.797;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,4,45:49:99:1736,1579,0:0,0,25,24 2/2:0,0,50:50:99:1692,1692,1692,150,150,0:0,0,22,28 +chrX 2706145 . T G 3107 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=32.01;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.24;QD=32.01;SOR=0.963;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1775,0:0,0,32,23 1/1:0,43:43:99:1362,128,0:0,0,23,20 +chrX 2706354 . T C 5738 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=26.34;DP=137;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=43.04;SOR=1.284;VarDP=134 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,71:71:99:.:.:3071,0:.:0,0,22,49 1|1:0,63:63:99:0|1:2706354_T_C:2697,190,0:2706354:0,0,29,34 +chrX 2706368 . G A 5987 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=142;AS_QD=30.71;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=42.37;SOR=0.842;VarDP=142 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,76:76:99:.:.:3235,0:.:0,0,30,46 1|1:0,66:66:99:0|1:2706354_T_C:2782,199,0:2706354:0,0,36,30 +chrX 2706426 . A G 4467 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=145;AS_QD=30.80;BaseQRankSum=-0.566;DP=155;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.80;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.335;VarDP=146 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,71:72:99:2227,0:1,0,35,36 1/1:0,74:74:99:2270,221,0:0,0,46,28 +chrX 2706483 . C T 2209 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.45;BaseQRankSum=-0.344;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.45;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.302;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,68:69:99:.:2239,0:1,0,37,31 0/0:.:65:71:65:0,71,1491 +chrX 2707329 . C CAAAAG 2049.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=25.63;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=1.022;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:99:50:0,109 1/1:0,47:47:99:.:2089,140,0:0,0,27,20 +chrX 2707349 . G GAA,GAAAAGAA,GAAAAGAAAAGAA 120.97 . AC=0,1,0;AF=0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,20,0;AS_QD=0.00,4.21,0.00;BaseQRankSum=-1.952;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=6.784;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.21;ReadPosRankSum=2.135;SOR=0.548;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:18,0,20,0:38:99:.:160,1082,0,808:12,6,9,11 0/0:.:61:99:61:0,120,1800,120,1800,1800,120,1800,1800,1800 +chrX 2707402 . C A 4079 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=32.61;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.61;SOR=0.899;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:1937,0:0,0,29,31 1/1:0,66:66:99:2172,198,0:0,0,40,26 +chrX 2708121 . T C 3477 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.47;BaseQRankSum=-0.391;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=32.47;ReadPosRankSum=-1.589;SOR=0.253;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,60:60:99:2006,0:0,0,31,29 1/1:1,47:48:99:1501,109,0:0,1,23,24 +chrX 2708661 . A G 3791 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=32.66;BaseQRankSum=-0.37;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=3.522;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.66;ReadPosRankSum=-0.483;SOR=0.621;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,56:56:99:1861,0:0,0,32,24 1/1:1,60:61:99:1960,149,0:0,1,33,27 +chrX 2709203 . A ACATGCATGCACACTCATGCCATGCATATATG 1626.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.04;BaseQRankSum=-0.82;DP=152;ExcessHet=0.0000;FS=3.096;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.245;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:60:99:60:0,1405 1/1:2,50:52:99:.:1666,128,0:2,0,24,26 +chrX 2709310 . GCA G 2472.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=31.70;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.86;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:2512,0:0,0,30,26 0/0:.:82:25:79:0,25,1800 +chrX 2709663 . T C 4506 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=138;AS_QD=32.87;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.87;SOR=0.846;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2258,0:0,0,32,37 1/1:0,69:69:99:2278,207,0:0,0,32,37 +chrX 2709697 . A AACATAGACACACACATGCATGT 2222.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=27.89;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.13;SOR=0.804;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,55:55:99:.:2262,0:0,0,29,26 0/0:.:61:90:61:0,90,1623 +chrX 2709788 . C G 2103 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=31.37;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=1.263;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,68:68:99:.:2133,0:0,0,42,26 0/0:.:61:90:61:0,90,1623 +chrX 2710160 . A G 1915 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.97;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.97;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1945,0:0,0,33,26 0/0:.:61:90:61:0,90,1623 +chrX 2710175 . T TC 3820.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=31.94;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.12;SOR=0.772;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,54:54:99:1994,0:0,0,31,23 1/1:0,50:50:99:1866,150,0:0,0,23,27 +chrX 2710281 . A G 38 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=1.62;BaseQRankSum=0.102;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=6.740;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.62;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=1.546;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,22:42:68:.:68,0:11,9,7,15 0/0:.:48:66:46:0,66,1155 +chrX 2710375 . A C 1978 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.87;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.87;SOR=0.724;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1305 1/1:0,63:63:99:.:2008,188,0:0,0,31,32 +chrX 2710438 . G T 1934 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.68;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.68;SOR=0.976;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1305 1/1:0,62:62:99:.:1964,185,0:0,0,35,27 +chrX 2710514 . G GTTTT 2995.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=29.14;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.99;SOR=0.781;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,69:69:99:.:3035,0:0,0,36,33 0/0:.:53:32:47:0,32,1285 +chrX 2710867 . C CT 1211.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=20.51;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.01;QD=20.51;SOR=0.865;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:495,0:.:0,0,14,13 1|1:0,34:34:99:0|1:2710867_C_CT:756,100,0:2710867:0,0,19,15 +chrX 2710950 . A G 1254 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=30.57;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=30.57;SOR=0.693;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1284,0:0,0,21,21 0/0:.:45:26:30:0,26,814 +chrX 2711037 . A G 1419 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=31.50;BaseQRankSum=1.95;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=31.50;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.324;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,45:46:99:.:1449,0:1,0,25,20 0/0:.:45:26:30:0,26,814 +chrX 2711411 . AT A 1665.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=34.80;BaseQRankSum=0;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=4.349;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.80;ReadPosRankSum=0.071;SOR=1.227;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,48:49:99:.:1705,0:0,1,31,17 0/0:.:45:26:30:0,26,814 +chrX 2712340 . G A 1945 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.47;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.47;SOR=1.034;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1975,0:0,0,25,34 0/0:.:45:26:30:0,26,814 +chrX 2712422 . GA G 1274.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=29.20;BaseQRankSum=-0.368;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.522;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.20;ReadPosRankSum=1.733;SOR=0.663;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:77:99:77:0,1800 1/1:1,44:45:99:.:1314,105,0:1,0,19,25 +chrX 2712480 . G A 1568 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=31.33;BaseQRankSum=-0.411;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.33;ReadPosRankSum=-1.121;SOR=0.435;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:77:99:77:0,1800 1/1:1,50:51:99:.:1598,118,0:1,0,30,20 +chrX 2712579 . A G 3784 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=31.52;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.52;SOR=0.743;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,69:69:99:2178,0:0,0,32,37 1/1:0,52:52:99:1636,155,0:0,0,30,22 +chrX 2712994 . A G 2153 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=31.64;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.64;SOR=0.844;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,69:69:99:.:2183,0:0,0,32,37 0/0:.:59:92:59:0,92,1325 +chrX 2713131 . TACAC T 2754.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=30.85;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.66;SOR=1.214;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2794,0:0,0,39,25 0/0:.:59:92:59:0,92,1325 +chrX 2713315 . AAC A 1816.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=28.55;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.16;SOR=0.836;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:72:99:72:0,1761 1/1:0,43:43:99:.:1856,130,0:0,0,23,20 +chrX 2713400 . CACAT C 2571.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=31.03;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.02;SOR=0.914;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,58:58:99:.:2611,0:0,0,26,32 0/0:.:57:66:57:0,66,1417 +chrX 2713459 . T C 2132 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=33.26;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.26;SOR=0.925;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,65:65:99:.:2162,0:0,0,36,29 0/0:.:57:66:57:0,66,1417 +chrX 2714148 . A G 2247 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.07;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.07;SOR=0.721;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,71:71:99:.:2277,0:0,0,35,36 0/0:.:57:66:57:0,66,1417 +chrX 2714231 . A T 2198 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.76;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.76;SOR=0.814;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,68:68:99:.:2228,0:0,0,32,36 0/0:.:57:66:57:0,66,1417 +chrX 2714441 . C T 1851 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.00;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=0.960;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,1459 1/1:0,57:57:99:.:1881,171,0:0,0,25,32 +chrX 2714781 . G A 2065 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=33.79;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.79;SOR=0.693;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:2095,0:0,0,31,31 0/0:.:53:79:53:0,79,1049 +chrX 2715210 . C CT 2526.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=29.42;BaseQRankSum=-0.437;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=4.363;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.14;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=1.218;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1575 1/1:1,70:71:99:.:2566,176,0:0,1,45,25 +chrX 2715253 . G A 1900 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.71;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.71;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:1930,0:0,0,33,26 0/0:.:60:27:45:0,27,1240 +chrX 2715433 . A G 2168 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.81;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.81;SOR=0.849;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,67:67:99:.:2198,0:0,0,31,36 0/0:.:60:27:45:0,27,1240 +chrX 2715566 . A G 2089 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=33.11;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.11;SOR=1.306;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2119,0:0,0,24,40 0/0:.:60:27:45:0,27,1240 +chrX 2715583 . C G 2075 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.89;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=1.127;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2105,0:0,0,26,38 0/0:.:60:27:45:0,27,1240 +chrX 2715760 . T C 2863 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=31.58;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;QD=43.83;SOR=1.793;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2893,0:0,0,46,20 0/0:.:60:27:45:0,27,1240 +chrX 2715763 . C G 2930 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=27.90;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;QD=42.90;SOR=1.678;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,69:69:99:.:2960,0:0,0,47,22 0/0:.:60:27:45:0,27,1240 +chrX 2715792 . G C 2083 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=32.02;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.02;SOR=1.376;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,66:66:99:.:2113,0:0,0,42,24 0/0:.:60:27:45:0,27,1240 +chrX 2717084 . A C 3580 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=31.39;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=31.39;SOR=0.899;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,57:57:99:1821,0:0,0,29,28 1/1:0,58:58:99:1789,174,0:0,0,23,35 +chrX 2717347 . C CAA 2111.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=29.88;BaseQRankSum=-0.398;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=29.88;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.498;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1269,0:0,0,25,16 1/1:1,30:31:82:882,82,0:1,0,19,11 +chrX 2717448 . G C 3910 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=32.56;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.56;SOR=1.142;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,64:64:99:2089,0:0,0,30,34 1/1:0,57:57:99:1851,171,0:0,0,19,38 +chrX 2717937 . CTTT C 1400.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=32.73;BaseQRankSum=1.115;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=15.609;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.541;SOR=1.907;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22:23:99:882,0:1,0,4,18 1/1:2,19:21:43:558,43,0:2,0,7,12 +chrX 2718034 . C T 3553 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=29.91;BaseQRankSum=-0.294;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.876;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.17;ReadPosRankSum=-0.33;SOR=0.881;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,41:42:99:.:.:1759,0:.:1,0,15,26 1|1:0,41:41:99:0|1:2718034_C_T:1824,123,0:2718034:0,0,18,23 +chrX 2718041 . A G 3612 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=30.06;BaseQRankSum=-0.298;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.854;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=42.85;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.864;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,43:44:99:.:.:1818,0:.:1,0,16,27 1|1:0,41:41:99:0|1:2718034_C_T:1824,123,0:2718034:0,0,18,23 +chrX 2718210 . G C 3691 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=119;AS_QD=31.27;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=31.27;SOR=1.247;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:1997,0:0,0,41,22 1/1:0,56:56:99:1724,167,0:0,0,32,24 +chrX 2718369 . C CT 282.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=8.47;BaseQRankSum=0.257;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=1.210;MQ=58.82;MQRankSum=0.076;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.512;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:99:59:0,1033 0/1:18,20:38:99:.:322,0,292:8,10,10,10 +chrX 2718494 . A G 3596 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=31.53;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.43;QD=31.53;SOR=0.820;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,53:53:99:1667,0:0,0,27,26 1/1:0,62:62:99:1959,185,0:0,0,27,35 +chrX 2719189 . T C 3802 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=116;AS_QD=33.03;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.03;SOR=0.838;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,62:62:99:2055,0:0,0,33,29 1/1:0,54:54:99:1777,162,0:0,0,21,33 +chrX 2719398 . T TC 3290.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=32.65;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.65;SOR=1.000;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1528,0:0,0,25,22 1/1:0,55:55:99:1802,165,0:0,0,33,22 +chrX 2720071 . T G 3621 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=32.31;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.31;SOR=0.822;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1909,0:0,0,29,30 1/1:0,54:54:99:1742,162,0:0,0,24,30 +chrX 2720620 . CT C,CTT 729.97 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=10,49;AS_QD=0.00,15.38;BaseQRankSum=1.529;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=4.559;MQ=59.21;MQRankSum=-0.299;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.06;SOR=1.355;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,10,21:31:99:267,269,0:0,0,18,13 2/2:1,0,28:29:74:502,505,512,74,82,0:0,1,21,7 +chrX 2720986 . T G 3483 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.83;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=1.056;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:1687,0:0,0,19,33 1/1:0,55:55:99:1826,165,0:0,0,26,29 +chrX 2723161 . A C 2013 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.92;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.92;SOR=1.044;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2043,0:0,0,37,27 0/0:.:59:89:59:0,89,1380 +chrX 2723532 . T TC 1592.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=31.38;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.38;SOR=0.853;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1058 1/1:0,52:52:99:.:1632,156,0:0,0,28,24 +chrX 2724525 . C T 2238 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.87;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.87;SOR=1.131;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1058 1/1:0,69:69:99:.:2268,207,0:0,0,28,41 +chrX 2724771 . C G 1838 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=30.62;BaseQRankSum=-0.451;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.62;ReadPosRankSum=-0.994;SOR=0.280;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:57:99:57:0,1058 1/1:1,60:61:99:.:1868,147,0:1,0,32,28 +chrX 2725050 . A G 1685 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=30.63;BaseQRankSum=1.604;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.39;MQRankSum=4.44;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.3;SOR=0.436;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,55:56:99:.:1715,0:1,0,33,22 0/0:.:53:69:53:0,69,1096 +chrX 2725330 . T C 2152 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=30.73;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.73;SOR=1.042;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1457 1/1:0,71:71:99:.:2182,211,0:0,0,30,41 +chrX 2725652 . C T 608 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.57;BaseQRankSum=1.487;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=6.062;MQ=59.92;MQRankSum=-0.979;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.532;SOR=1.025;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1457 0/1:24,23:47:99:.:638,0,633:10,14,14,9 +chrX 2725878 . G C 1095 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=19.40;BaseQRankSum=-0.021;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=1.050;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=0.914;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1457 0/1:20,38:58:99:.:1125,0,511:10,10,17,21 +chrX 2726261 . C T 679 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.18;BaseQRankSum=2.37;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=2.429;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.921;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1457 0/1:24,26:50:99:.:709,0,554:11,13,15,11 +chrX 2726475 . G T 713 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=0.694;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.984;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.366;SOR=0.526;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1457 0/1:34,28:62:99:.:743,0,911:21,13,16,12 +chrX 2726690 . AGCC A 1160.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=20.69;BaseQRankSum=0.19;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=7.270;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.016;SOR=1.053;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1457 0/1:27,31:58:99:.:1200,0,1017:16,11,12,19 +chrX 2727325 . G C 2709 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=25.60;BaseQRankSum=0.138;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=9.665;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.141;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1933,0:0,0,28,33 0/1:17,29:46:99:806,0,394:4,13,15,14 +chrX 2728392 . C T 722 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.67;BaseQRankSum=-0.667;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.268;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.861;SOR=0.676;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:33:60:0,33 0/1:27,28:55:99:.:752,0,752:15,12,13,15 +chrX 2728834 . CT C 74.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=3.93;BaseQRankSum=-1.141;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=16.790;MQ=58.89;MQRankSum=0;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=2.225;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:33:60:0,33 0/1:19,10:29:99:.:114,0,267:13,6,2,8 +chrX 2728916 . A AACCTCC 1079.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=23.81;BaseQRankSum=-2.119;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=1.174;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.81;ReadPosRankSum=1.019;SOR=0.922;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:33:60:0,33 0/1:19,28:47:99:.:1119,0,708:7,12,9,19 +chrX 2729396 . C A 700 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.27;BaseQRankSum=0.692;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;MQRankSum=0;QD=13.27;ReadPosRankSum=-2.282;SOR=0.793;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:33:60:0,33 0/1:28,27:55:99:.:730,0,733:18,10,18,9 +chrX 2729440 . TA T 848.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.75;BaseQRankSum=0.174;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=5.608;MQ=59.80;MQRankSum=-1.322;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.781;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:33:60:0,33 0/1:25,28:53:99:.:888,0,773:10,15,16,12 +chrX 2729608 . C T 766 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.96;BaseQRankSum=-0.545;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=7.529;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.184;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:33:60:0,33 0/1:27,30:57:99:.:796,0,728:8,19,15,15 +chrX 2729629 . A T 705 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.41;BaseQRankSum=-2.18;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=5.870;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.356;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:33:60:0,33 0/1:24,27:51:99:.:735,0,681:8,16,14,13 +chrX 2730014 . C T 294 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=7.90;BaseQRankSum=0.456;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.376;SOR=0.850;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:33:60:0,33 0/1:27,14:41:99:.:324,0,696:18,9,10,4 +chrX 2730054 . C T 3120 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=26.03;BaseQRankSum=2.264;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.037;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.03;ReadPosRankSum=2.044;SOR=0.783;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,71:72:99:2299,0:0,1,31,40 0/1:18,31:49:99:851,0,409:10,8,16,15 +chrX 2730175 . CTT CT,C 1239.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=35,14;AS_QD=26.86,27.69;BaseQRankSum=2.147;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.29;MQRankSum=3.75;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.818;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,25,0:26:99:627,0,645:0,1,10,15 1/2:1,10,14:25:99:652,330,285,209,0,257:1,0,16,8 +chrX 2730929 . CAA CA,C,CAAA 1043.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=20,15,16;AS_QD=16.30,21.89,12.21;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=2.653;MQ=58.74;MQRankSum=-0.624;QD=20.06;SOR=0.182;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,20,0,0:23:99:375,0,438,438:0,3,9,11 2/3:0,0,15,16:31:99:708,783,983,314,516,628,476,542,0,528:0,0,9,22 +chrX 2731612 . A T 2698 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=24.80;BaseQRankSum=0.72;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=1.022;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.5;SOR=0.641;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2129,0:0,0,33,32 0/1:23,22:45:99:599,0,614:11,12,11,11 +chrX 2731791 . C T 3029 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=24.47;BaseQRankSum=0.056;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=4.160;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.824;VarDP=125 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,66:66:99:2184,0:0,0,27,39 0/1:27,32:59:99:875,0,715:15,12,16,16 +chrX 2731970 . T TA 1179.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=25.94;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=25.94;SOR=0.823;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,47:47:99:.:1219,0:0,0,25,22 0/0:.:55:91:55:0,91,1348 +chrX 2732242 . C T 1602 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.64;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.64;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,50:50:99:.:1632,0:0,0,26,24 0/0:.:55:91:55:0,91,1348 +chrX 2732269 . A G 2394 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=20.90;BaseQRankSum=-1.225;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=2.747;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.90;ReadPosRankSum=-1.234;SOR=0.669;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1850,0:0,0,29,30 0/1:31,26:57:99:574,0,813:17,14,11,15 +chrX 2732523 . T C,G 314 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,13;AS_QD=0.00,13.23;BaseQRankSum=0.152;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.473;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.741;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591,591 0/2:13,1,13:27:99:.:344,376,731,0,351,319:8,5,6,8 +chrX 2732562 . C CCT 298.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=12.52;BaseQRankSum=0.579;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.801;SOR=0.582;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,591 0|1:14,13:27:99:.:0|1:2732562_C_CCT:338,0,386:2732562:8,6,7,6 +chrX 2732571 . C CTT 409.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=0.19;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.449;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=1.061;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:63:99:63:.:.:0,591 0|1:13,16:29:99:.:1|0:2732562_C_CCT:449,0,345:2732562:7,6,10,6 +chrX 2732768 . T TC 398.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.17;BaseQRankSum=0.845;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.668;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:20,16:36:99:.:438,0,516:5,15,4,12 +chrX 2732851 . G T 536 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.15;BaseQRankSum=1.862;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.236;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.758;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:20,20:40:99:.:566,0,495:11,9,9,11 +chrX 2732938 . T C 256 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=9.23;BaseQRankSum=0.143;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;MQRankSum=-1.111;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.919;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:18,13:31:99:.:286,0,462:10,8,8,5 +chrX 2733059 . C CCT 573.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.57;BaseQRankSum=0.483;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.839;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:20,17:37:99:.:613,0,759:9,11,7,10 +chrX 2733085 . C T 474 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=-1.926;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.00;ReadPosRankSum=-1.112;SOR=0.724;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:23,19:42:99:.:504,0,673:12,11,9,10 +chrX 2733525 . C T 990 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.22;BaseQRankSum=-0.778;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=0.969;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=0.519;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:29,38:67:99:.:1020,0,742:10,19,15,23 +chrX 2734698 . A T 209 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=5.09;BaseQRankSum=-2.715;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=7.745;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.266;SOR=1.744;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:36,11:47:99:.:239,0,1047:20,16,3,8 +chrX 2735511 . C G 1741 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=32.20;BaseQRankSum=-0.21;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.20;ReadPosRankSum=0.662;SOR=0.253;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 1/1:1,54:55:99:.:1771,130,0:0,1,26,28 +chrX 2735872 . G A 2099 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=33.79;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.79;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 1/1:0,63:63:99:.:2129,189,0:0,0,29,34 +chrX 2736419 . A G 1790 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=34.34;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.34;SOR=1.077;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 1/1:0,53:53:99:.:1820,159,0:0,0,22,31 +chrX 2736813 . C T 591 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.29;BaseQRankSum=1.88;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.481;MQ=59.85;MQRankSum=-0.131;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.407;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:31,24:55:99:.:621,0,708:8,23,8,16 +chrX 2736884 . TAAATAAA T 401.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=9.59;BaseQRankSum=-0.145;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.227;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.349;SOR=0.976;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:32,14:46:99:.:441,0,1252:16,16,6,8 +chrX 2736968 . T C 656 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.25;BaseQRankSum=-1.084;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.027;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=0.540;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:99:63:0,591 0/1:27,29:56:99:.:686,0,646:17,10,17,12 +chrX 2737091 . T C 2362 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=23.68;BaseQRankSum=-0.128;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=18.761;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.308;SOR=1.472;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,55:55:99:1746,0:0,0,19,36 0/1:22,24:46:99:646,0,572:14,8,7,17 +chrX 2737166 . T C 636 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.59;BaseQRankSum=0.828;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=8.545;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.361;SOR=1.995;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,1723 0/1:25,24:49:99:.:666,0,682:13,12,18,6 +chrX 2737291 . T C 832 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.37;BaseQRankSum=0.964;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=2.182;MQ=57.78;MQRankSum=-0.146;QD=14.37;ReadPosRankSum=2.105;SOR=0.863;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1612 0/1:28,32:60:99:.:862,0,688:13,15,18,14 +chrX 2737310 . G T 2704 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=23.17;BaseQRankSum=1.328;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.850;MQ=58.49;MQRankSum=1.096;QD=23.17;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=0.546;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,28:53:99:167,0:14,11,14,14 1/1:0,65:65:99:2567,196,0:0,0,34,31 +chrX 2737322 . T C 1439 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=22.60;BaseQRankSum=-1.025;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.941;MQ=57.30;MQRankSum=-1.404;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.859;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,1438 0|1:28,37:65:99:.:0|1:2737322_T_C:1469,0,1018:2737322:14,14,20,17 +chrX 2737325 . A C 1468 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=22.36;BaseQRankSum=-0.509;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.43;MQRankSum=-1.42;QD=22.36;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.729;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,1438 0|1:29,38:67:99:.:0|1:2737322_T_C:1498,0,1057:2737322:15,14,20,18 +chrX 2737334 . C T 1556 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=22.99;BaseQRankSum=-0.532;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.936;MQ=57.54;MQRankSum=-1.249;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.539;SOR=0.496;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:55:99:55:.:.:0,1438 0|1:28,41:69:99:.:0|1:2737322_T_C:1586,0,1016:2737322:16,12,21,20 +chrX 2737422 . C T 975 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=16.75;BaseQRankSum=-0.84;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=1.032;MQ=57.61;MQRankSum=-2.523;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.395;SOR=0.883;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:99:55:0,1438 0/1:23,37:60:99:.:1005,0,578:9,14,13,24 +chrX 2737426 . T TG 4174.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=28.93;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.49;QD=38.31;SOR=1.274;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,50:50:99:1774,0:0,0,19,31 1/1:0,60:60:99:2440,181,0:0,0,23,37 +chrX 2737564 . G A 1103 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=8.27;BaseQRankSum=0.722;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=5.145;MQ=59.70;MQRankSum=1.578;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=1.114;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:31,37:68:99:234,0:16,15,24,13 0/1:35,34:69:99:899,0,885:18,17,19,15 +chrX 2737617 . C A 691 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.76;BaseQRankSum=-0.399;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.795;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1529 0/1:37,30:67:99:.:721,0,954:20,17,17,13 +chrX 2737662 . C G 694 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.66;BaseQRankSum=-0.314;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.608;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1529 0/1:25,28:53:99:.:724,0,640:11,14,13,15 +chrX 2737771 . C T 596 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.18;BaseQRankSum=1.517;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=3.773;MQ=59.71;MQRankSum=0.902;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.340;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1529 0/1:32,24:56:99:.:626,0,819:11,21,11,13 +chrX 2738139 . T C 887 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.89;BaseQRankSum=-1.24;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=4.912;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.915;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1529 0/1:30,36:66:99:.:917,0,782:13,17,21,15 +chrX 2738217 . G A 869 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.74;BaseQRankSum=0.182;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.970;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.74;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.880;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:62:99:62:0,1529 0/1:29,32:61:99:.:899,0,780:15,14,18,14 +chrX 2738394 . G A 638 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.72;BaseQRankSum=0.012;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=7.500;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=1.676;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:31,26:57:99:.:668,0,832:16,15,8,18 +chrX 2738809 . C T 1652 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=34.33;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.33;SOR=0.818;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 1/1:0,49:49:99:.:1682,147,0:0,0,23,26 +chrX 2739195 . A C 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.64;BaseQRankSum=-1.532;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.796;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:30,25:55:99:.:585,0,799:14,16,11,14 +chrX 2739313 . G T 1042 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=20.62;BaseQRankSum=0.762;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=2.391;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.055;SOR=1.179;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:34:58:.:.:0,34 0|1:24,28:52:99:.:0|1:2739313_G_T:1072,0,824:2739313:12,12,11,17 +chrX 2739337 . A C 1363 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=22.84;BaseQRankSum=1.168;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=2.222;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.84;ReadPosRankSum=-1.503;SOR=0.721;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:34:58:.:.:0,34 0|1:22,39:61:99:.:0|1:2739313_G_T:1393,0,719:2739313:10,12,21,18 +chrX 2739445 . A G 1357 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=19.00;BaseQRankSum=0.214;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.641;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:34:58:.:.:0,34 0|1:35,38:73:99:.:0|1:2739445_A_G:1387,0,1304:2739445:17,18,19,19 +chrX 2739460 . T A 1255 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=18.36;BaseQRankSum=1.728;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.335;SOR=0.593;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:34:58:.:.:0,34 0|1:36,34:70:99:.:0|1:2739445_A_G:1285,0,1323:2739445:19,17,17,17 +chrX 2739920 . T TA,TAA 363.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,8;AS_QD=30.72,32.63;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;QD=28.79;SOR=0.693;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34,34 1/2:0,6,8:14:77:.:403,160,107,116,0,77:0,0,7,7 +chrX 2740095 . AAAT A 925.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=19.69;BaseQRankSum=-1.709;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=4.055;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=19.69;ReadPosRankSum=1.25;SOR=1.358;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:24,25:49:99:.:965,0,925:12,12,9,16 +chrX 2740258 . G A 1887 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=30.92;BaseQRankSum=-0.431;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.92;ReadPosRankSum=1.296;SOR=0.871;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 1/1:2,60:62:99:.:1917,117,0:1,1,32,27 +chrX 2740275 . G T 1781 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=30.18;BaseQRankSum=-0.496;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.477;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.18;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.944;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 1/1:3,57:60:76:.:1811,76,0:1,2,34,23 +chrX 2740579 . A AT 320.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=8.18;BaseQRankSum=0.86;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=9.025;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.774;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:27,17:44:99:.:360,0,677:9,18,10,7 +chrX 2740657 . G A 533 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=-1.719;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=2.499;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.394;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:25,22:47:99:.:563,0,707:16,9,12,10 +chrX 2740742 . C A 772 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=16.37;BaseQRankSum=-0.216;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.055;SOR=0.681;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:34:58:.:.:0,34 0|1:27,22:49:99:.:0|1:2740742_C_A:802,0,961:2740742:16,11,13,9 +chrX 2740759 . T C 856 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.04;BaseQRankSum=-1.272;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=0.709;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:61:34:58:.:.:0,34 0|1:27,25:52:99:.:0|1:2740742_C_A:886,0,987:2740742:15,12,14,11 +chrX 2741191 . C T 597 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.00;BaseQRankSum=-2.667;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.304;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.296;SOR=1.179;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:31,26:57:99:.:627,0,881:14,17,9,17 +chrX 2741910 . G C 1061 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=15.59;BaseQRankSum=0.276;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=15.887;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.072;SOR=1.766;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:29,41:70:99:.:1091,0,674:17,12,12,29 +chrX 2741963 . A T 953 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.46;BaseQRankSum=0.879;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=8.261;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.327;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:33,35:68:99:.:983,0,875:22,11,17,18 +chrX 2742019 . CT C 173.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=5.07;BaseQRankSum=0.902;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=4.603;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.156;SOR=0.494;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:27,15:42:99:.:213,0,419:17,10,7,8 +chrX 2742164 . C T 607 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.80;BaseQRankSum=2.629;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=6.166;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.522;SOR=1.656;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:34:58:0,34 0/1:31,23:54:99:.:637,0,835:12,19,5,18 +chrX 2742607 . G A 499 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=19;AS_QD=12.30;BaseQRankSum=1.869;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.192;MQ=59.75;MQRankSum=0;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=1.022;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:54:.:54:0,0 0/1:24,19:43:99:.:529,0,650:12,12,8,11 +chrX 2742640 . C CTTTT,CTTTTTTT 614.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,2;AS_QD=36.63,33.03;BaseQRankSum=1.15;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.260;MQ=57.60;MQRankSum=-0.319;QD=81.75;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=1.447;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,158,158 1/2:1,5,2:8:5:.:654,51,5,117,0,99:0,1,5,2 +chrX 2742673 . C T 178 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=6.50;BaseQRankSum=-1.472;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=36.284;MQ=58.51;MQRankSum=0;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.761;SOR=4.160;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,158 0|1:25,7:32:99:.:0|1:2742673_C_T:208,0,1029:2742673:5,20,7,0 +chrX 2742675 . A T 172 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=5.94;BaseQRankSum=-0.568;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=31.952;MQ=58.35;MQRankSum=-0.076;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.775;SOR=4.161;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,158 0|1:27,7:34:99:.:0|1:2742673_C_T:202,0,1113:2742673:7,20,7,0 +chrX 2742678 . C T 163 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=5.22;BaseQRankSum=-1.008;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=27.238;MQ=58.47;MQRankSum=-0.18;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.068;SOR=4.163;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,158 0|1:30,7:37:99:.:0|1:2742673_C_T:193,0,1239:2742673:10,20,7,0 +chrX 2742681 . C T 166 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=5.44;BaseQRankSum=-1.415;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=26.327;MQ=58.87;MQRankSum=-0.5;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.165;SOR=4.164;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,158 0|1:29,7:36:99:.:0|1:2742673_C_T:196,0,1197:2742673:10,19,7,0 +chrX 2742686 . TAC T 105.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=3.82;BaseQRankSum=-2.741;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=21.723;MQ=59.34;MQRankSum=-1.241;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=3.900;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,158 0|1:32,6:38:99:.:0|1:2742673_C_T:145,0,1326:2742673:12,20,6,0 +chrX 2742690 . C T 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=3.08;BaseQRankSum=-1.981;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=17.065;MQ=59.71;MQRankSum=-2.451;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=3.597;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,158 0|1:32,5:37:99:.:0|1:2742673_C_T:114,0,1329:2742673:13,19,5,0 +chrX 2742693 . C T 36 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=1.74;BaseQRankSum=-0.59;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=13.824;MQ=59.72;MQRankSum=-2.83;QD=1.74;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=3.239;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,158 0|1:34,4:38:66:.:0|1:2742673_C_T:66,0,1416:2742673:14,20,4,0 +chrX 2742695 . G T 33 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=1.62;BaseQRankSum=0.128;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=14.294;MQ=59.72;MQRankSum=-2.874;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.5;SOR=3.237;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,158 0|1:35,4:39:63:.:0|1:2742673_C_T:63,0,1458:2742673:14,21,4,0 +chrX 2742696 . C T 33 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=1.62;BaseQRankSum=0.063;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=14.294;MQ=59.72;MQRankSum=-2.874;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=3.237;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,158 0|1:35,4:39:63:.:0|1:2742673_C_T:63,0,1458:2742673:14,21,4,0 +chrX 2743482 . G A 402 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=6.26;BaseQRankSum=-0.46;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.916;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.573;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,41:69:99:.:432,0:12,16,19,22 0/0:.:46:26:43:0,26,1117 +chrX 2743515 . A C 93 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=1.60;BaseQRankSum=2.334;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.864;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.550;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:38,39:77:99:.:123,0:16,22,18,21 0/0:.:46:26:43:0,26,1117 +chrX 2743651 . T G 524 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=13.19;BaseQRankSum=-2.331;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.73;SOR=0.884;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,862 0/1:21,21:42:99:.:554,0,604:11,10,12,9 +chrX 2743811 . A G 1161 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.61;BaseQRankSum=-1.161;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.54;SOR=0.704;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,862 0|1:33,31:64:99:.:0|1:2743811_A_G:1191,0,1260:2743811:18,15,17,14 +chrX 2743815 . A G 1164 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=18.95;BaseQRankSum=-1.462;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.98;SOR=0.641;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:68:99:68:.:.:0,862 0|1:32,31:63:99:.:0|1:2743811_A_G:1194,0,1229:2743811:18,14,17,14 +chrX 2743837 . C T 869 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.74;BaseQRankSum=1.585;DP=133;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.74;ReadPosRankSum=1.25;SOR=0.631;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,862 0/1:29,32:61:99:.:899,0,739:15,14,16,16 +chrX 2744076 . A G 496 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.96;BaseQRankSum=1.239;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=1.098;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.892;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,862 0/1:28,20:48:99:.:526,0,775:14,14,11,9 +chrX 2744852 . G A 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.16;BaseQRankSum=-1.154;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=2.143;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.65;SOR=0.402;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,862 0/1:28,35:63:99:.:892,0,724:11,17,17,18 +chrX 2744988 . T TA 266.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=4.78;BaseQRankSum=1.238;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=21.689;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.27;SOR=1.116;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:12,16:28:48:48,0:7,5,6,10 0/1:19,17:36:99:258,0,306:15,4,6,11 +chrX 2745435 . C CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG,CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG,CTGTGTGTGTGTGTGTG,CTGTGTGTGTGTGTGTGTG 2168.97 . AC=1,0,1,1;AF=0.333,0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,0,19,20;AS_QD=6.32,0.76,27.37,34.21;BaseQRankSum=0.891;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=8.134;MQ=58.94;MQRankSum=0;QD=36.20;ReadPosRankSum=0.867;SOR=0.339;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:16,5,0,0,0:21:99:139,0,126,495,495:12,4,5,0 3/4:1,0,0,19,20:40:99:2069,1619,1535,1619,1535,1535,531,565,565,426,513,548,548,0,409:0,1,16,23 +chrX 2745495 . T A 490 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.56;BaseQRankSum=-1.144;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.192;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=1.085;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:63:70:63:0,70 0/1:25,20:45:99:.:520,0,710:11,14,7,13 +chrX 2745927 . G A 1631 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=10.86;BaseQRankSum=0.206;DP=155;ExcessHet=0.0000;FS=7.210;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.603;SOR=0.776;VarDP=153 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:34,49:83:99:492,0:20,14,21,28 0/1:27,43:70:99:1169,0,689:14,13,20,23 +chrX 2746232 . G A 911 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=17.43;BaseQRankSum=1.11;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=1.102;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.991;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,328 0/1:21,33:54:99:.:941,0,498:9,12,12,21 +chrX 2747834 . C T 575 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.35;BaseQRankSum=2.247;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=4.112;MQ=57.28;MQRankSum=-2.222;QD=12.35;ReadPosRankSum=-3.167;SOR=1.294;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,204 0/1:27,22:49:99:.:605,0,711:14,13,8,14 +chrX 2747891 . G A 442 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.83;BaseQRankSum=0.114;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=1.183;MQ=52.04;MQRankSum=-2.309;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.793;SOR=0.430;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,204 0/1:29,19:48:99:.:472,0,796:19,10,11,8 +chrX 2748580 . CT C 306.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=8.05;BaseQRankSum=-1.124;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=14.833;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.358;SOR=1.454;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,204 0/1:24,19:43:99:.:346,0,445:16,8,6,13 +chrX 2748809 . G A 665 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.11;BaseQRankSum=0.013;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=13.254;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.009;SOR=0.096;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,204 0/1:27,26:53:99:.:695,0,714:6,21,13,13 +chrX 2748845 . T C 75 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=1.69;BaseQRankSum=0.826;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=3.651;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=1.293;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,32:62:99:.:105,0:13,17,10,22 0/0:.:53:87:53:0,87,1285 +chrX 2749117 . TTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCC TTCCCTCCCTCCC,T 335.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=22,2;AS_QD=8.72,0.00;BaseQRankSum=2.27;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.79;MQRankSum=0;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.37;SOR=0.427;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:8,8,0:16:14:14,0,353:0,8,0,8 0/1:13,14,2:29:99:361,0,462,415,449,1338:1,12,2,14 +chrX 2749236 . C CCCTT 397.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=11;AS_QD=23.00;BaseQRankSum=0.232;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=3.139;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.00;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=0.129;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:24:.:24:.:.:0,0 0|1:8,11:19:99:.:0|1:2749236_C_CCCTT:437,0,304:2749236:0,8,2,9 +chrX 2749280 . T TCCTTTCC 683.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=24.93;BaseQRankSum=1.281;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=1.735;MQ=59.94;MQRankSum=-0.711;QD=24.93;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=0.270;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,585 0|1:11,18:29:99:.:0|1:2749236_C_CCCTT:723,0,408:2749236:2,9,6,12 +chrX 2749300 . T TTGTTTC 802.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=24.76;BaseQRankSum=-1.765;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=3.086;MQ=59.95;MQRankSum=-0.726;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.745;SOR=1.306;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,585 0|1:13,21:34:99:.:0|1:2749236_C_CCCTT:842,0,483:2749236:6,7,7,14 +chrX 2749501 . T C 1339 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=14.72;BaseQRankSum=-1.353;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.794;MQ=59.95;MQRankSum=1.347;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.575;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:16,27:43:99:.:.:317,0:.:8,8,13,14 0|1:22,28:50:99:0|1:2749501_T_C:1052,0,828:2749501:14,8,17,11 +chrX 2749503 . G A 1022 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=21.04;BaseQRankSum=0.052;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.754;SOR=0.593;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:65:99:65:.:.:0,1315 0|1:22,28:50:99:.:0|1:2749501_T_C:1052,0,828:2749501:14,8,17,11 +chrX 2750077 . T C 848 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.32;BaseQRankSum=-0.869;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.851;SOR=0.753;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,35:65:99:135,0:13,17,16,19 0/1:27,28:55:99:743,0,774:16,11,17,11 +chrX 2750126 . G A 910 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=9.89;BaseQRankSum=-0.51;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=3.853;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.758;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:20,31:51:99:327,0:7,13,12,19 0/1:22,22:44:99:613,0,608:12,10,17,5 +chrX 2750696 . A ACACACATGCACACG 1308.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=12.04;BaseQRankSum=0.248;DP=147;ExcessHet=0.0000;FS=0.714;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.581;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,29:57:30:30,0:15,13,16,13 0/1:20,35:55:99:1318,0,706:12,8,18,17 +chrX 2751109 . CA C 416.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.13;BaseQRankSum=1.815;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=1.223;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=1.027;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,744 0/1:23,22:45:99:.:456,0,481:9,13,7,14 +chrX 2751622 . T TGTC 1598.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=12.70;BaseQRankSum=2.886;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=3.160;MQ=57.86;MQRankSum=-2.456;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.56;SOR=0.814;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,37:62:99:550,0:13,12,13,24 0/1:38,29:67:99:1088,0,1508:20,18,17,12 +chrX 2751904 . C T 879 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.17;BaseQRankSum=-0.811;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=12.623;MQ=59.52;MQRankSum=-0.986;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.812;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1404 0/1:35,34:69:99:.:909,0,979:23,12,14,20 +chrX 2752500 . G A 686 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.04;BaseQRankSum=-1.333;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=2.418;MQ=41.50;MQRankSum=1.001;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.642;SOR=0.370;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1404 0/1:24,27:51:99:.:716,0,648:9,15,13,14 +chrX 2752551 . G T 1705 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=32.13;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.25;QD=32.13;SOR=1.022;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1404 1/1:0,54:54:99:.:1735,162,0:0,0,23,31 +chrX 2752631 . A G 702 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.81;BaseQRankSum=3.19;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=5.608;MQ=50.84;MQRankSum=-0.716;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.721;SOR=1.115;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1404 0/1:27,26:53:99:.:732,0,654:15,12,10,16 +chrX 2753244 . G T 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.25;BaseQRankSum=-2.246;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.20;MQRankSum=0.913;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.602;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,1404 0/1:28,24:52:99:.:585,0,805:17,11,14,10 +chrX 2753325 . A G 431 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=8.09;BaseQRankSum=-1.945;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=5.625;MQ=59.05;MQRankSum=2.158;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.283;SOR=1.329;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:21,36:57:99:.:461,0:11,10,13,23 0/0:.:61:85:61:0,85,1276 +chrX 2753627 . G C 369 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=8.49;BaseQRankSum=-3.291;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=4.269;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.712;SOR=1.370;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:56:99:56:0,1339 0/1:27,20:47:99:.:399,0,767:14,13,7,13 +chrX 2753727 . T C 508 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=5.27;BaseQRankSum=0.476;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=3.679;MQ=57.06;MQRankSum=-2.975;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=0.942;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,27:49:98:98,0:9,13,17,10 0/1:36,17:53:99:440,0,1032:19,17,8,9 +chrX 2753912 . G A 710 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.21;BaseQRankSum=-0.049;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=-2.037;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.033;SOR=0.836;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,537 0/1:28,28:56:99:.:740,0,755:14,14,15,13 +chrX 2754174 . C G 896 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.82;BaseQRankSum=-1.085;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=18.309;MQ=59.78;MQRankSum=0.635;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.352;SOR=1.882;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,537 0/1:31,36:67:99:.:926,0,837:13,18,26,10 +chrX 2754651 . G A 973 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=14.75;BaseQRankSum=2.069;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=2.032;MQ=57.27;MQRankSum=-0.648;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.406;SOR=1.061;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,537 0/1:32,36:68:99:.:1003,0,803:16,16,15,21 +chrX 2755057 . C T 663 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.50;BaseQRankSum=-0.075;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=2.748;MQ=51.27;MQRankSum=-5.376;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.372;SOR=1.074;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,537 0/1:17,25:42:99:.:693,0,419:8,9,15,10 +chrX 2755162 . G A 668 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.96;BaseQRankSum=-3.012;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=4.001;MQ=57.21;MQRankSum=-2.524;QD=13.96;ReadPosRankSum=-2.035;SOR=0.310;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:61:99:61:0,537 0/1:23,27:50:99:.:698,0,649:15,8,14,13 +chrX 2755881 . T C 864 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=7.21;BaseQRankSum=1.925;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.193;MQ=49.01;MQRankSum=-7.071;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.658;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:30,32:62:99:117,0:15,15,11,21 0/1:31,31:62:99:777,0,872:18,13,19,12 +chrX 2756235 . C T 692 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.24;BaseQRankSum=-0.192;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=9.185;MQ=58.86;MQRankSum=-2.433;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=0.871;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:99:65:0,1538 0/1:32,27:59:99:.:722,0,880:20,12,11,16 +chrX 2756706 . G C 1151 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=10.01;BaseQRankSum=2.6;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.459;SOR=0.714;VarDP=118 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:27,32:59:99:207,0:15,12,19,13 0/1:24,35:59:99:974,0,531:16,8,22,13 +chrX 2757421 . G C 1330 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=34.00;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=34.00;SOR=1.022;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:30:47:0,30 1/1:0,40:40:99:.:1360,120,0:0,0,17,23 +chrX 2757971 . CAAAAAAAAAAAAA C,CAAAAAA 920.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=15,12;AS_QD=34.63,31.00;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.332;MQ=54.65;MQRankSum=-0.756;QD=34.29;SOR=0.568;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:50:30:47:0,30,30 1/2:1,15,12:28:99:.:960,406,765,557,0,570:0,1,15,12 +chrX 2758119 . T C 1198 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=10.68;BaseQRankSum=-1.256;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.96;MQRankSum=3.499;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.48;SOR=0.669;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,39:60:99:515,0:11,10,24,15 0/1:27,28:55:99:713,0,733:18,9,16,12 +chrX 2758874 . C G 3969 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=129;AS_QD=31.00;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.18;QD=31.00;SOR=0.840;VarDP=129 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,59:59:99:1833,0:0,0,29,30 1/1:0,70:70:99:2166,208,0:0,0,40,30 +chrX 2758956 . T TTATC 4951.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=26.92;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=44.17;SOR=1.129;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,52:52:99:2309,0:0,0,32,20 1/1:0,61:61:99:2682,183,0:0,0,35,26 +chrX 2759032 . GTATC G 3780.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=30.07;BaseQRankSum=2.46;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=9.839;MQ=57.35;MQRankSum=1.849;QD=37.82;ReadPosRankSum=1.288;SOR=0.365;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:3,41:44:99:.:.:1316,0:.:0,3,22,19 1|1:0,57:57:99:0|1:2759032_GTATC_G:2504,172,0:2759032:0,0,31,26 +chrX 2759050 . G A 4769 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=34.61;BaseQRankSum=2.34;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.385;MQ=56.30;MQRankSum=1.241;QD=42.10;ReadPosRankSum=1.615;SOR=0.525;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,53:53:99:.:.:2220,0:.:0,0,26,22 1|1:1,60:61:99:0|1:2759032_GTATC_G:2579,174,0:2759032:0,1,33,27 +chrX 2759093 . G A 5740 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=133;AS_QD=30.59;DP=135;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.58;QD=43.38;SOR=0.836;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:3128,0:.:0,0,36,36 1|1:0,61:61:99:0|1:2759093_G_A:2642,184,0:2759093:0,0,35,26 +chrX 2759094 . T C 133 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=2.26;BaseQRankSum=-0.545;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=1.962;MQ=57.08;MQRankSum=4.325;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.95;SOR=0.718;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:33,39:72:99:.:163,0:18,15,18,21 0/0:.:61:99:61:0,120,1800 +chrX 2759113 . A T 6063 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=137;AS_QD=33.12;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.72;QD=44.47;SOR=0.768;VarDP=137 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:3209,0:.:0,0,34,38 1|1:0,65:65:99:0|1:2759093_G_A:2884,196,0:2759093:0,0,37,28 +chrX 2759121 . T C 6129 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=138;AS_QD=29.87;DP=140;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.86;QD=44.63;SOR=0.722;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,72:72:99:.:.:3220,0:.:0,0,33,39 1|1:0,66:66:99:0|1:2759093_G_A:2939,199,0:2759093:0,0,35,31 +chrX 2759132 . G A 2483 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=30.96;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.86;QD=44.09;SOR=0.960;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:77:9:77:.:.:0,9 1|1:0,57:57:99:.:0|1:2759093_G_A:2513,172,0:2759093:0,0,32,25 +chrX 2759819 . A T 263 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=4.51;BaseQRankSum=-0.489;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=8.660;MQ=52.53;MQRankSum=-6.885;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.921;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,37:65:99:.:293,0:11,17,22,15 0/0:.:56:99:56:0,103,1420 +chrX 2759955 . T TCTGCATGTGGC 2077.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=15.34;BaseQRankSum=0.605;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=7.802;MQ=59.99;MQRankSum=0;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.314;VarDP=138 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:28,45:73:99:738,0:19,9,20,25 0/1:30,35:65:99:1379,0,1155:18,12,21,14 +chrX 2760579 . C CA 503.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.97;BaseQRankSum=0.435;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.48;MQRankSum=-0.78;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.384;SOR=0.593;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:42:46:41:0,46 0/1:6,28:34:44:.:543,0,44:4,2,17,11 +chrX 2760734 . CAAA CAA,C 1074.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,24;AS_QD=9.76,24.44;BaseQRankSum=0.713;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=24.312;MQ=59.20;MQRankSum=-0.306;QD=21.02;ReadPosRankSum=0.718;SOR=1.820;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:6,19,0:25:99:283,0,386:2,4,15,4 0/2:4,0,24:28:7:831,843,923,0,79,7:0,4,16,8 +chrX 2761052 . T C 253 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=3.88;BaseQRankSum=-0.731;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=1.994;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=1.021;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,41:73:99:.:283,0:14,18,15,26 0/0:.:52:38:50:0,38,1067 +chrX 2761908 . G T 1697 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=32.58;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.23;QD=32.58;SOR=0.981;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1425 1/1:0,53:53:99:.:1727,159,0:0,0,30,23 +chrX 2762116 . G A 1895 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.77;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.77;SOR=0.877;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1425 1/1:0,57:57:99:.:1925,171,0:0,0,26,31 +chrX 2762144 . C T 1850 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=34.18;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.18;SOR=0.884;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:64:99:64:0,1425 1/1:0,55:55:99:.:1880,165,0:0,0,25,30 +chrX 2762258 . T G 1977 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.37;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.37;SOR=0.826;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,62:62:99:.:2007,0:0,0,33,29 0/0:.:59:99:59:0,101,1583 +chrX 2762730 . A G 2023 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.08;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=32.08;SOR=0.892;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2053,0:0,0,35,29 0/0:.:59:99:59:0,101,1583 +chrX 2763471 . A G 3067 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=30.97;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.97;SOR=1.609;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1426,0:0,0,31,16 1/1:0,53:53:99:1671,158,0:0,0,36,17 +chrX 2763510 . C G 3078 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.06;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.06;SOR=1.396;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1564,0:0,0,28,19 1/1:0,47:47:99:1544,141,0:0,0,32,15 +chrX 2763790 . T A 1647 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=32.88;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.813;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1534 1/1:0,51:51:99:.:1677,153,0:0,0,27,24 +chrX 2763837 . A G 1548 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=32.88;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.866;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:58:99:58:0,1534 1/1:0,48:48:99:.:1578,143,0:0,0,26,22 +chrX 2763891 . T G 152 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=2.98;BaseQRankSum=0.642;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.693;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:28,33:61:99:.:182,0:17,11,20,13 0/0:.:54:99:54:0,113,1687 +chrX 2763925 . G C 1881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.95;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=32.95;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:69:99:69:0,1800 1/1:0,58:58:99:.:1911,174,0:0,0,27,31 +chrX 2763977 . G A 4010 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=122;AS_QD=33.11;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.61;QD=33.11;SOR=0.726;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,61:61:99:1980,0:0,0,34,27 1/1:0,61:61:99:2060,183,0:0,0,28,33 +chrX 2764108 . T C 3662 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=32.67;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.95;QD=32.67;SOR=0.903;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,71:71:99:2328,0:0,0,31,40 1/1:0,42:42:99:1364,126,0:0,0,20,22 +chrX 2764135 . T G 4145 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=32.87;BaseQRankSum=2.534;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.479;MQ=57.25;MQRankSum=-0.337;QD=32.87;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.589;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,75:75:99:2509,0:0,0,32,43 1/1:1,51:52:99:1666,146,0:1,0,24,27 +chrX 2764778 . T C 148 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=3.30;BaseQRankSum=-0.883;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=2.329;MQ=59.88;MQRankSum=-0.857;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.054;SOR=0.407;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,30:54:99:.:178,0:15,9,16,14 0/0:.:60:86:60:0,86,1443 +chrX 2764873 . A T 990 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=22.17;BaseQRankSum=0.016;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.143;MQ=59.64;MQRankSum=-0.833;QD=22.17;ReadPosRankSum=1.611;SOR=0.494;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,898 0|1:20,26:46:99:.:0|1:2764873_A_T:1020,0,751:2764873:8,12,12,14 +chrX 2764874 . T C 990 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=22.17;BaseQRankSum=0.928;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.143;MQ=59.64;MQRankSum=-0.833;QD=22.17;ReadPosRankSum=1.386;SOR=0.494;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:53:99:53:.:.:0,898 0|1:20,26:46:99:.:0|1:2764873_A_T:1020,0,751:2764873:8,12,12,14 +chrX 2765041 . C CA,CAA 430.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=21,5;AS_QD=13.43,16.32;BaseQRankSum=-0.962;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.302;MQ=59.35;MQRankSum=-1.502;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.007;SOR=0.661;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,9,5:14:43:.:.:353,0,43:.:0,0,7,7 0|1:14,12,0:26:99:0|1:2765041_C_CA:117,0,360,159,394,553:2765041:8,6,5,7 +chrX 2765057 . A AG 418.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=12.38;BaseQRankSum=0.363;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.887;MQ=58.87;MQRankSum=1.765;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=1.453;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:38:99:38:.:.:0,945 0|1:19,18:37:99:.:1|0:2765041_C_CA:458,0,446:2765041:9,10,12,6 +chrX 2765124 . G A 445 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.31;BaseQRankSum=0.74;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.249;MQ=59.69;MQRankSum=-0.138;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.46;SOR=1.049;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:38:99:38:0,945 0/1:24,18:42:99:.:475,0,923:14,10,12,6 +chrX 2765152 . C G 2211 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=26.36;BaseQRankSum=-0.344;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.118;MQ=59.69;MQRankSum=0.197;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.453;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,40:41:99:.:.:1279,0:.:0,1,19,21 0|1:19,25:44:99:0|1:2765152_C_G:962,0,697:2765152:12,7,15,10 +chrX 2765185 . A C 1228 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=22.07;BaseQRankSum=-0.649;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=1.001;MQ=59.87;MQRankSum=-0.849;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.564;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:48:99:48:.:.:0,487 0|1:25,32:57:99:.:0|1:2765152_C_G:1258,0,953:2765152:15,10,18,14 +chrX 2765200 . A G 984 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=0.404;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.852;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:48:99:48:.:.:0,487 0|1:26,26:52:99:.:0|1:2765152_C_G:1014,0,952:2765152:15,11,16,10 +chrX 2765220 . G A 639 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.38;BaseQRankSum=0.265;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=4.281;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=1.380;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:17,33:50:99:.:669,0:9,8,22,11 0/0:.:47:99:47:0,111,1300 +chrX 2765257 . G A 1282 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=12.99;BaseQRankSum=1.249;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.736;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.53;SOR=0.597;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,35:54:99:719,0:8,11,22,13 0/1:25,22:47:99:593,0,922:11,14,8,14 +chrX 2765283 . A G 1084 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=11.48;BaseQRankSum=-0.039;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=9.939;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.645;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,32:53:99:526,0:9,12,20,12 0/1:22,22:44:99:588,0,828:7,15,10,12 +chrX 2765376 . GGGAAGGAA G,GGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA 1723.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=47,19;AS_QD=26.31,20.36;BaseQRankSum=0.708;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.974;MQ=59.36;MQRankSum=0;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.966;SOR=0.598;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29,19:48:99:1103,0,309:0,0,23,25 0/1:20,18,0:38:99:660,0,785,721,840,1560:11,9,9,9 +chrX 2765769 . A G 1033 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=7.59;BaseQRankSum=0.995;DP=143;ExcessHet=0.0000;FS=2.135;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.071;SOR=0.941;VarDP=140 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,40:72:99:274,0:18,14,21,19 0/1:38,30:68:99:789,0,1001:17,21,18,12 +chrX 2765796 . C CATT 250.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=4.26;BaseQRankSum=-1.662;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=4.812;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.26;ReadPosRankSum=2.113;SOR=0.796;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:31,37:68:99:.:290,0:13,18,21,16 0/0:.:61:99:61:0,120,1800 +chrX 2766150 . C CT 378.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=8.36;BaseQRankSum=-1.572;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=8.135;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.782;SOR=1.170;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:74:99:74:0,1800 0/1:28,22:50:99:.:418,0,652:11,17,14,8 +chrX 2766176 . C G 1525 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=12.64;BaseQRankSum=-1.078;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;MQRankSum=-0.662;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.24;SOR=0.653;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:23,48:71:99:799,0:12,11,24,24 0/1:24,28:52:99:756,0,657:11,13,14,14 +chrX 2766287 . C T 1352 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=11.42;BaseQRankSum=1.377;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.698;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:19,38:57:99:605,0:9,10,15,23 0/1:34,30:64:99:777,0,825:16,18,17,13 +chrX 2766503 . TG T 2636.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=31.86;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=31.86;SOR=1.139;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1083,0:0,0,14,20 1/1:0,50:50:99:1593,150,0:0,0,20,30 +chrX 2766557 . CTTTTT C,CTTTT,CT 974.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,4,12;AS_QD=32.70,7.20,23.75;BaseQRankSum=-0.611;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.31;MQRankSum=0;QD=26.00;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.527;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:1,8,4,0:13:36:36,115,0,266:1,0,6,6 1/3:0,14,0,12:26:99:978,234,226,784,267,748,281,0,287,203:0,0,18,8 +chrX 2766658 . G A 1551 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=20.80;BaseQRankSum=2.189;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.078;MQ=55.39;MQRankSum=0.386;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.805;SOR=0.877;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:15,22:37:99:291,0:7,8,10,12 1/1:0,39:39:99:1290,117,0:0,0,16,23 +chrX 2766748 . C G 3668 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=30.25;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.68;QD=36.98;SOR=0.693;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,43:43:99:.:.:1440,0:.:0,0,22,21 1|1:0,57:57:99:0|1:2766748_C_G:2258,172,0:2766748:0,0,28,29 +chrX 2766756 . G A 844 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.07;BaseQRankSum=1.336;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=1.012;MQ=47.85;MQRankSum=-1.732;QD=15.07;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.701;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:48:99:48:.:.:0,1354 0|1:26,32:58:99:.:0|1:2766748_C_G:874,0,635:2766748:14,12,15,17 +chrX 2766801 . G A 35 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=1.33;BaseQRankSum=1.178;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.425;MQ=53.32;MQRankSum=-1.949;QD=1.33;ReadPosRankSum=-0.27;SOR=0.832;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:24,25:49:65:.:65,0:11,13,14,11 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 2767106 . G A 967 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.34;BaseQRankSum=0.176;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=6.553;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.928;SOR=1.202;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:55:4:55:0,4 0/1:28,37:65:99:.:997,0,674:13,15,23,14 +chrX 2767213 . T C 5618 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=128;AS_QD=32.07;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=0.790;VarDP=128 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,60:60:99:.:.:2654,0:.:0,0,33,27 1|1:0,68:68:99:0|1:2767213_T_C:2994,205,0:2767213:0,0,34,34 +chrX 2767220 . G A 5495 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=28.40;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=0.725;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,59:59:99:.:.:2631,0:.:0,0,31,28 1|1:0,65:65:99:0|1:2767213_T_C:2894,196,0:2767213:0,0,32,33 +chrX 2767767 . G A 1086 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=9.00;BaseQRankSum=1.673;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.251;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.642;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:25,31:56:99:213,0:16,9,13,18 0/1:35,33:68:99:903,0,931:16,19,18,15 +chrX 2768078 . C T 961 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.73;BaseQRankSum=-0.722;DP=132;ExcessHet=0.0000;FS=5.218;MQ=57.36;MQRankSum=-3.314;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.625;SOR=1.440;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,351 0/1:27,36:63:99:.:991,0,689:13,14,12,24 +chrX 2768124 . A G 752 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.72;BaseQRankSum=1.497;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=3.724;MQ=57.98;MQRankSum=-4.671;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.807;SOR=1.287;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,351 0/1:29,28:57:99:.:782,0,759:14,15,10,18 +chrX 2768461 . C T 1334 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.68;BaseQRankSum=0.181;DP=141;ExcessHet=0.0000;FS=2.040;MQ=59.91;MQRankSum=-0.715;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.499;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,351 0/1:26,47:73:99:.:1364,0,640:15,11,23,24 +chrX 2768545 . G A 1055 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=13.91;BaseQRankSum=-1.949;DP=145;ExcessHet=0.0000;FS=0.857;MQ=59.89;MQRankSum=-1.266;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.564;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,351 0/1:35,43:78:99:.:1085,0,929:20,15,23,20 +chrX 2768825 . T G 545 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.50;BaseQRankSum=0.044;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=2.453;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.368;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:67:99:67:0,351 0/1:28,22:50:99:.:575,0,758:11,17,11,11 +chrX 2769281 . T C 2369 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=19.66;BaseQRankSum=0.788;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=7.351;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.66;ReadPosRankSum=0.86;SOR=0.655;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:26,32:58:99:249,0:16,10,15,17 1/1:0,64:64:99:2150,192,0:0,0,28,36 +chrX 2769517 . A G 1026 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=7.94;BaseQRankSum=0.621;DP=134;ExcessHet=0.0000;FS=3.116;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.569;VarDP=133 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:32,41:73:99:298,0:17,15,21,20 0/1:31,29:60:99:758,0,837:11,20,15,14 +chrX 2769531 . C T 327 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=4.96;BaseQRankSum=2.777;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.82;SOR=0.693;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,40:72:99:.:357,0:16,16,20,20 0/0:.:57:99:57:0,110,1434 +chrX 2770248 . A T 859 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.88;BaseQRankSum=0.24;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.807;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:68:99:68:0,234 0/1:25,31:56:99:.:889,0,681:13,12,17,14 +chrX 2770410 . T C 613 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=6.99;BaseQRankSum=1.009;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=6.774;MQ=59.82;MQRankSum=1.022;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.446;SOR=1.013;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:21,24:45:29:29,0:8,13,9,15 0/1:24,23:47:99:614,0,604:17,7,10,13 +chrX 2770501 . T C 733 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.87;BaseQRankSum=1.01;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.87;ReadPosRankSum=-1.726;SOR=0.631;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:85:59:0,85 0/1:28,27:55:99:.:763,0,778:15,13,14,13 +chrX 2770918 . T C 846 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=11.84;BaseQRankSum=-0.919;DP=136;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.617;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:85:59:0,85 0/1:40,34:74:99:.:876,0,1105:22,18,18,16 +chrX 2771109 . T C 1894 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=33.17;DP=117;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.17;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:59:85:59:0,85 1/1:0,58:58:99:.:1924,174,0:0,0,27,31 +chrX 2771259 . A T 726 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=8.22;BaseQRankSum=1.783;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.663;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.86;SOR=0.534;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,25:49:99:131,0:13,11,12,13 0/1:20,23:43:99:625,0,555:7,13,12,11 +chrX 2771493 . T A 531 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=4.64;BaseQRankSum=-1.234;DP=126;ExcessHet=0.0000;FS=2.387;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.461;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:33,36:69:13:13,0:12,21,14,22 0/1:30,22:52:99:548,0,847:11,19,11,11 +chrX 2771534 . G A 726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=0.07;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.664;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:76:66:0,76 0/1:26,28:54:99:.:756,0,701:10,16,11,17 +chrX 2771845 . A C 985 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.20;BaseQRankSum=0.193;DP=127;ExcessHet=0.0000;FS=7.277;MQ=56.52;MQRankSum=-3.469;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.748;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:66:76:66:0,76 0/1:24,35:59:99:.:1015,0,612:9,15,20,15 +chrX 2772269 . T C 1209 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=9.76;BaseQRankSum=-0.821;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=6.753;MQ=49.15;MQRankSum=-1.188;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.488;VarDP=127 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:24,39:63:99:457,0:12,12,22,17 0/1:34,30:64:99:782,0,957:11,23,14,16 +chrX 2772360 . C G 447 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=7.45;BaseQRankSum=0.046;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.978;MQ=54.44;MQRankSum=-0.468;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.11;SOR=0.790;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:25,39:64:99:.:477,0:12,13,21,18 0/0:.:61:99:61:0,110,1406 +chrX 2772967 . G C 1074 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=16.48;BaseQRankSum=-0.699;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=3.400;MQ=58.65;MQRankSum=-2.263;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.373;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:65:34:60:0,34 0/1:27,40:67:99:.:1104,0,717:10,17,19,21 +chrX 2773048 . G A 2537 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=28.84;BaseQRankSum=2.591;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=2.503;MQ=58.38;MQRankSum=-1.123;QD=28.84;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=1.153;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,46:46:99:1793,0:0,0,32,14 0/1:17,26:43:99:774,0,422:11,6,20,6 +chrX 2773157 . C CAGGG 693.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=20.94;BaseQRankSum=-1.375;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.320;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.133;SOR=0.615;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:46:99:46:0,239 0/1:16,19:35:99:.:733,0,594:9,7,9,10 +chrX 2773521 . A G 278 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=28.87;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.43;QD=44.00;SOR=0.941;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,7:7:99:.:308,0:0,0,4,3 0/0:.:23:38:21:0,38,600 +chrX 2773537 . A G 188 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=24.22;BaseQRankSum=-0.812;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.86;MQRankSum=-0.035;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.941;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,7:9:99:.:218,0:1,1,4,3 0/0:.:23:38:21:0,38,600 +chrX 2773553 . A G 274 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=15.20;BaseQRankSum=-0.465;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.67;MQRankSum=0.917;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=0.473;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:14:99:14:.:.:0,272 0|1:11,9:20:99:.:0|1:2773553_A_G:304,0,349:2773553:8,3,6,3 +chrX 2773569 . A G 367 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=10.73;BaseQRankSum=0.455;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.92;MQRankSum=0.185;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.532;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:5,9:14:99:.:.:152,0:.:3,2,5,4 0|1:16,7:23:99:0|1:2773553_A_G:245,0,414:2773553:11,5,5,2 +chrX 2774018 . A ACC 1125.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=12.01;BaseQRankSum=0.43;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=5.104;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.416;SOR=0.356;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:22,25:47:99:108,0:16,6,15,10 0/1:22,28:50:99:1057,0,820:12,10,13,15 +chrX 2774420 . A G 2614 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.73;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=44.81;SOR=1.123;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,59:59:99:.:2644,0:0,0,35,24 0/0:.:54:83:54:0,83,1320 +chrX 2774422 . C CCCTGTG 5576.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=126;AS_QD=32.79;DP=130;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=44.57;SOR=1.099;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,63:63:99:2789,0:0,0,38,25 1/1:0,63:63:99:2827,189,0:0,0,36,27 +chrX 2774556 . T C 4264 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=134;AS_QD=31.57;BaseQRankSum=2.072;DP=139;ExcessHet=0.0000;FS=2.907;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.57;ReadPosRankSum=0.983;SOR=0.193;VarDP=136 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,75:76:99:2350,0:0,1,31,44 1/1:1,59:60:99:1944,146,0:0,1,25,34 +chrX 2775134 . A C 3790 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=31.31;BaseQRankSum=-0.5;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=3.155;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.355;VarDP=122 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,65:65:99:2071,0:0,0,36,29 1/1:1,56:57:99:1749,136,0:0,1,27,29 +chrX 2775583 . G A 3967 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=31.72;BaseQRankSum=2.732;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=5.588;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.72;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.124;VarDP=126 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,67:68:99:2196,0:0,1,28,39 1/1:2,56:58:99:1801,153,0:0,2,22,34 +chrX 2776553 . T G 121 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=2.16;BaseQRankSum=-1.088;DP=131;ExcessHet=0.0000;FS=3.291;MQ=46.11;MQRankSum=0.575;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=1.162;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:32,38:70:99:.:151,0:15,17,14,24 0/0:.:60:62:60:0,62,1220 +chrX 2776608 . A G 2171 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.37;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.99;QD=32.37;SOR=0.880;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,68:68:99:.:2201,0:0,0,31,37 0/0:.:60:62:60:0,62,1220 +chrX 2776765 . G A 409 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=6.46;BaseQRankSum=-0.582;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=1.189;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.62;SOR=0.678;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:29,39:68:99:.:439,0:14,15,19,20 0/0:.:60:62:60:0,62,1220 +chrX 2776772 . C T 318 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=5.12;BaseQRankSum=0.58;DP=129;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=1.155;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.335;SOR=0.798;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:30,38:68:99:.:348,0:15,15,18,20 0/0:.:60:62:60:0,62,1220 +chrX 2776845 . TCAA T 385.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=8.67;BaseQRankSum=0.364;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=8.103;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.153;SOR=1.094;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:20,29:49:99:.:425,0:8,12,18,11 0/0:.:60:62:60:0,62,1220 +chrX 2777789 . A G 1726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=31.36;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;QD=31.36;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,56:56:99:.:1756,0:0,0,30,26 0/0:.:60:62:60:0,62,1220 +chrX 2777819 . A G 2403 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=27.07;DP=125;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.52;QD=38.02;SOR=0.756;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,64:64:99:.:2433,0:0,0,33,31 0/0:.:60:62:60:0,62,1220 +chrX 2778519 . G A 2004 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.29;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.29;SOR=1.010;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,63:63:99:.:2034,0:0,0,27,36 0/0:.:60:62:60:0,62,1220 +chrX 2779021 . C T 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.83;BaseQRankSum=1.624;DP=138;ExcessHet=0.0000;FS=0.967;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.487;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:71:99:71:0,1648 0/1:36,29:65:99:.:769,0,931:14,22,13,16 +chrX 2779330 . TAA T,TA 507.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,21;AS_QD=19.80,22.79;BaseQRankSum=0.788;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=11.957;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.258;SOR=1.074;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:3,12,21:36:99:.:547,250,0:0,3,21,12 0/0:.:48:21:38:0,21,739,21,739,739 +chrX 2779558 . C A 183 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=2.92;BaseQRankSum=2.796;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=3.165;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.05;SOR=1.101;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:35,38:73:99:.:213,0:16,19,14,24 0/0:.:48:21:38:0,21,739 +chrX 2780288 . AAAG A 181.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=2.83;BaseQRankSum=-0.711;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.858;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.800;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:37,41:78:99:.:221,0:18,19,22,19 0/0:.:48:21:38:0,21,739 +chrX 2780425 . T TA 56.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=1.96;BaseQRankSum=1.233;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.96;ReadPosRankSum=-1.267;SOR=0.573;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:22,27:49:96:.:96,0:9,13,12,15 0/0:.:55:45:55:0,45,1161 +chrX 2780728 . AAG A 1982.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=24.91;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.65;SOR=1.436;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,51:51:99:.:2022,0:0,0,18,33 0/0:.:55:45:55:0,45,1161 +chrX 2780913 . G A 1742 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=31.64;BaseQRankSum=1.958;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.64;ReadPosRankSum=-1.3;SOR=0.238;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,55:56:99:.:1772,0:1,0,28,27 0/0:.:55:45:55:0,45,1161 +chrX 2781205 . C A 1954 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=22.29;BaseQRankSum=-1.374;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.925;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.29;ReadPosRankSum=-1.013;SOR=0.951;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1559,0:0,0,20,27 0/1:25,17:42:99:425,0,722:12,13,7,10 +chrX 2781514 . C A 1135 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=19.42;BaseQRankSum=0.022;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=9.935;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.475;SOR=1.461;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:764,0:0,0,14,9 0/1:21,16:37:99:401,0,564:9,12,12,4 +chrX 2781604 . G T 1311 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=19.72;BaseQRankSum=-0.209;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=2.253;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.399;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:687,0:0,0,12,9 0/1:22,25:47:99:654,0,539:15,7,15,10 +chrX 2782116 . G A 1838 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=19.46;BaseQRankSum=-1.061;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.794;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.502;SOR=0.795;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:988,0:0,0,17,12 0/1:33,34:67:99:880,0,885:17,16,17,17 +chrX 2782161 . A G 1811 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=20.23;BaseQRankSum=0.453;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.967;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.984;SOR=0.674;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1032,0:0,0,18,13 0/1:29,31:60:99:809,0,729:13,16,15,16 +chrX 2782567 . C T 1944 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=24.68;BaseQRankSum=2.504;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=4.753;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.465;SOR=0.639;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1115,0:0,0,10,15 0/1:25,30:55:99:859,0,564:15,10,15,15 +chrX 2782572 . A G 1115 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=29.29;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=0.846;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:1145,0:0,0,12,14 0/0:.:68:99:68:0,120,1800 +chrX 2783032 . T C 1689 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=20.46;BaseQRankSum=-0.127;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.954;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.689;SOR=0.446;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:867,0:0,0,14,13 0/1:26,31:57:99:852,0,686:15,11,15,16 +chrX 2783144 . C T 1761 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=19.90;BaseQRankSum=-0.22;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=5.733;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.90;ReadPosRankSum=1.797;SOR=0.307;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,14,11 0/1:30,35:65:99:962,0,762:19,11,16,19 +chrX 2785350 . T C 1814 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=17.90;BaseQRankSum=0.462;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=2.740;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.309;SOR=1.061;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1056,0:0,0,14,21 0/1:38,30:68:99:788,0,1036:17,21,10,20 +chrX 2785459 . A AT 1233.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=15.91;BaseQRankSum=0.414;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.859;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.775;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:769,0:0,0,11,14 0/1:33,22:55:99:504,0,1257:17,16,11,11 +chrX 2785460 . A T,ATT 1772 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=47,0;AS_QD=23.40,10.00;BaseQRankSum=0.202;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.139;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.40;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.633;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25,0:25:99:1089,0,857:0,0,11,14 0/1:30,22,0:52:99:713,0,1254,645,1168,1719:17,13,11,11 +chrX 2785503 . A G 1562 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=17.69;BaseQRankSum=-0.786;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;MQRankSum=0;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.966;SOR=0.670;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1017,0:0,0,15,17 0/1:33,25:58:99:575,0,868:16,17,13,12 +chrX 2785592 . A G 1572 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=16.18;BaseQRankSum=-0.274;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=0.623;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1086,0:0,0,17,19 0/1:41,22:63:99:516,0,1187:19,22,11,11 +chrX 2786260 . C CTTTTTTTTTT 1260.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=28.89;BaseQRankSum=-0.605;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=1.328;MQ=57.82;MQRankSum=-2.207;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.412;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:740,0:0,0,10,7 0/1:13,15:28:99:560,0,455:9,4,9,6 +chrX 2786294 . G C 616 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=15.02;BaseQRankSum=0.553;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=1.194;MQ=59.26;MQRankSum=-1.855;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.456;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,10:10:99:348,0:0,0,6,4 0/1:21,12:33:99:298,0,566:13,8,6,6 +chrX 2786428 . T C 1135 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=17.92;BaseQRankSum=-0.681;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=2.197;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.579;SOR=0.446;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23:24:99:657,0:0,1,12,11 0/1:21,20:41:99:508,0,607:8,13,7,13 +chrX 2786515 . A G 1514 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=19.30;BaseQRankSum=0.344;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.191;MQ=59.66;MQRankSum=-1.621;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.828;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:764,0:0,0,11,13 0/1:26,30:56:99:780,0,641:12,14,19,11 +chrX 2786568 . T C 1794 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=20.97;BaseQRankSum=2.377;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.159;MQ=59.87;MQRankSum=-1.223;QD=20.97;ReadPosRankSum=-1.276;SOR=1.093;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:882,0:0,0,14,13 0/1:26,34:60:99:942,0,602:14,12,24,10 +chrX 2786767 . T C 2095 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=21.46;BaseQRankSum=0.472;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.862;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.13;SOR=0.591;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1265,0:0,0,25,15 0/1:26,33:59:99:860,0,632:14,12,11,22 +chrX 2786948 . T C 1444 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.76;BaseQRankSum=1.907;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=7.722;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.715;SOR=1.574;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:849,0:1,0,8,19 0/1:18,25:43:99:625,0,496:9,9,9,16 +chrX 2787423 . T A 1657 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=18.74;BaseQRankSum=-0.315;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=2.890;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.74;ReadPosRankSum=-2.034;SOR=1.022;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:735,0:0,0,15,7 0/1:32,36:68:99:952,0,831:17,15,20,16 +chrX 2788855 . T TA 897.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=14.87;BaseQRankSum=0.928;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.51;SOR=0.593;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12:12:99:331,0:0,0,8,4 0/1:24,27:51:99:606,0,518:13,11,12,15 +chrX 2789019 . A G 1712 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=20.02;BaseQRankSum=0.245;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.850;MQ=59.94;MQRankSum=0.872;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.574;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1219,0:0,0,20,18 0/1:29,20:49:99:523,0,841:16,13,10,10 +chrX 2789101 . T C 1611 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=18.65;BaseQRankSum=-1.357;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.828;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.808;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:987,0:0,0,18,12 0/1:31,27:58:99:654,0,817:16,15,13,14 +chrX 2789937 . T C 1609 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=21.85;BaseQRankSum=-0.557;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=7.259;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.85;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=1.290;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1141,0:0,0,19,17 0/1:20,19:39:99:498,0,558:9,11,16,3 +chrX 2790505 . G GA 530.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=11.63;BaseQRankSum=-0.227;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=4.291;MQ=59.92;MQRankSum=-1.035;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.452;SOR=1.111;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:339,0:0,0,11,5 0/1:18,15:33:99:231,0,305:8,10,8,7 +chrX 2790967 . ATAAATT A 2140.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=24.49;BaseQRankSum=-0.829;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.49;ReadPosRankSum=-0.91;SOR=0.665;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1070,0:0,0,14,10 0/1:36,29:65:99:1110,0,1411:20,16,15,14 +chrX 2791006 . C T 1040 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.29;BaseQRankSum=0.267;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.743;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,675 0/1:32,38:70:99:.:1070,0,862:19,13,23,15 +chrX 2792465 . G C 1686 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=19.95;BaseQRankSum=2.219;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.95;ReadPosRankSum=1.275;SOR=0.693;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,33:34:99:1012,0:0,1,13,20 0/1:27,25:52:99:704,0,668:11,16,10,15 +chrX 2792545 . T TTGTG 2108.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=27.54;BaseQRankSum=-0.148;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.084;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=27.54;ReadPosRankSum=-1.735;SOR=0.446;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1298,0:0,0,18,12 0/1:25,23:48:99:850,0,936:17,8,14,9 +chrX 2792799 . C T 1550 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=18.16;BaseQRankSum=2.098;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=5.882;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.280;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:744,0:0,0,12,11 0/1:33,31:64:99:836,0,810:10,23,12,19 +chrX 2792954 . C T 1472 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=19.76;BaseQRankSum=1.686;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.906;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.705;SOR=0.560;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:803,0:0,0,12,12 0/1:26,26:52:99:699,0,603:14,12,13,13 +chrX 2793388 . G A 1790 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=23.33;BaseQRankSum=-2.006;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.018;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.33;ReadPosRankSum=0.68;SOR=0.523;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:953,0:0,0,11,17 0/1:19,31:50:99:867,0,510:7,12,14,17 +chrX 2793681 . C T 1382 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=20.46;BaseQRankSum=1.435;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=5.103;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.422;SOR=0.462;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:818,0:0,0,11,16 0/1:21,21:42:99:594,0,563:13,8,12,9 +chrX 2794242 . C T 1856 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=20.96;BaseQRankSum=2.124;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=10.078;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.96;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.469;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,36:37:99:1132,0:1,0,16,20 0/1:24,29:53:99:754,0,615:16,8,14,15 +chrX 2794971 . T C 2365 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=21.38;BaseQRankSum=-1.528;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=6.918;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.772;SOR=0.378;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1299,0:0,0,18,24 0/1:30,40:70:99:1096,0,806:19,11,22,18 +chrX 2795028 . G A 3482 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=30.81;BaseQRankSum=-2.891;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=12.257;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=0.749;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1755,0:.:0,0,13,26 0|1:30,45:75:99:0|1:2795028_G_A:1757,0,1113:2795028:19,11,23,22 +chrX 2795032 . C T 3510 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=30.52;BaseQRankSum=-1.224;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=6.657;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.52;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.722;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1755,0:.:0,0,13,26 0|1:31,46:77:99:0|1:2795028_G_A:1785,0,1153:2795028:18,13,25,21 +chrX 2795048 . A G 3332 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=28.98;BaseQRankSum=-2.244;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=8.077;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.552;VarDP=116 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1649,0:0,0,13,25 0/1:34,44:78:99:1713,0,917:21,13,25,19 +chrX 2795170 . G T 1513 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=15.91;BaseQRankSum=2.856;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.761;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.573;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:759,0:0,0,11,12 0/1:45,29:74:99:784,0,1092:21,24,15,14 +chrX 2795240 . G GTATT 2390.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=25.31;BaseQRankSum=0.491;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=8.600;MQ=59.82;MQRankSum=-1.517;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.737;SOR=0.246;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1292,0:0,0,17,14 0/1:35,30:65:99:1138,0,1379:11,24,12,18 +chrX 2795527 . G A 1310 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=33.50;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.50;SOR=0.793;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,40:40:99:.:1340,0:0,0,21,19 0/0:.:61:91:61:0,91,1474 +chrX 2795657 . G T 2190 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=23.13;BaseQRankSum=-0.927;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.871;MQ=59.60;MQRankSum=-0.927;QD=23.13;ReadPosRankSum=1.325;SOR=0.532;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1420,0:0,0,18,24 0/1:26,28:54:99:800,0,736:11,15,15,13 +chrX 2795722 . A G 2015 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=21.08;BaseQRankSum=-1.685;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=21.08;ReadPosRankSum=0.113;SOR=0.634;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1374,0:0,0,20,23 0/1:26,28:54:99:671,0,692:12,14,14,14 +chrX 2795766 . T C 2029 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=21.23;BaseQRankSum=-0.753;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.832;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=21.23;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.482;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1285,0:0,0,21,18 0/1:28,30:58:99:774,0,770:16,12,14,16 +chrX 2796236 . C T 2232 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=22.18;BaseQRankSum=1.477;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=5.847;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=1.371;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1365,0:0,0,16,25 0/1:28,33:61:99:897,0,700:14,14,11,22 +chrX 2796468 . A ATGTGTG,ATGTGTGTG 1637.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=35,0;AS_QD=24.66,9.76;BaseQRankSum=0.524;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.801;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.66;ReadPosRankSum=0.608;SOR=1.051;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16,0:16:99:828,0,642:0,0,5,11 0/1:33,19,0:52:99:849,0,1339,713,1367,2038:18,15,9,10 +chrX 2796490 . A G 1301 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=16.85;BaseQRankSum=0.429;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=6.137;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.254;SOR=1.037;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:717,0:0,0,5,11 0/1:38,21:59:99:614,0,1458:21,17,9,10 +chrX 2797384 . A G 1703 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=23.11;BaseQRankSum=-0.767;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.301;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.425;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:873,0:0,0,13,15 0/1:17,30:47:99:860,0,438:7,10,16,14 +chrX 2798992 . A G 1568 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=17.37;BaseQRankSum=0.078;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.797;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.972;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:937,0:0,0,12,18 0/1:36,26:62:99:661,0,1005:15,21,8,18 +chrX 2799026 . T C 1604 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=17.96;BaseQRankSum=-0.8;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.624;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:913,0:0,0,12,15 0/1:36,28:64:99:721,0,1038:15,21,12,16 +chrX 2799193 . C T 2201 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=21.87;BaseQRankSum=-0.821;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=9.464;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.87;ReadPosRankSum=2.124;SOR=0.209;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:987,0:0,0,14,18 0/1:27,43:70:99:1244,0,708:20,7,28,15 +chrX 2799497 . A C 1649 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=-1.709;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=0.675;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:967,0:0,0,16,13 0/1:37,30:67:99:712,0,1026:18,19,13,17 +chrX 2800094 . T C 2516 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=33.95;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.95;SOR=0.719;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1192,0:0,0,16,19 1/1:0,40:40:99:1354,120,0:0,0,21,19 +chrX 2800975 . C CA 96.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=6.48;BaseQRankSum=0.319;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=7.991;MQ=59.59;MQRankSum=0;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.967;SOR=2.649;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,405 0/1:9,12:21:99:.:136,0,107:5,4,2,10 +chrX 2801070 . G T 634 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.76;BaseQRankSum=0.584;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.150;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.423;SOR=0.922;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,405 0/1:21,24:45:99:.:664,0,564:12,9,15,9 +chrX 2801201 . CTG C 2314.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=27.37;BaseQRankSum=-0.961;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=4.401;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.733;SOR=1.100;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:1160,0:0,0,16,10 0/1:29,31:60:99:1194,0,1093:14,15,18,13 +chrX 2801257 . A G 1386 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=18.39;BaseQRankSum=2.1;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=3.244;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.39;ReadPosRankSum=1.574;SOR=0.510;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,24:25:99:769,0:1,0,14,10 0/1:26,26:52:99:647,0,687:10,16,12,14 +chrX 2801739 . C G 1655 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=20.30;BaseQRankSum=0.287;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.192;MQ=56.77;MQRankSum=-0.475;QD=20.30;ReadPosRankSum=1.085;SOR=0.860;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:889,0:0,0,12,15 0/1:26,30:56:99:796,0,621:12,14,20,10 +chrX 2801799 . C T 1832 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=21.40;BaseQRankSum=-1.03;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.83;MQRankSum=0.774;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=0.746;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:901,0:0,0,12,15 0/1:25,35:60:99:961,0,662:13,12,21,14 +chrX 2801918 . A G 413 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=8.86;BaseQRankSum=-1.584;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=6.147;MQ=59.35;MQRankSum=-0.986;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.179;SOR=1.721;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,685 0/1:30,20:50:99:.:443,0,842:15,15,6,14 +chrX 2801929 . G T 1465 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=21.06;BaseQRankSum=0.189;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=11.561;MQ=58.79;MQRankSum=1.064;QD=21.06;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=0.518;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:665,0:0,0,12,8 0/1:20,31:51:99:830,0,503:6,14,16,15 +chrX 2802661 . A G 1339 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=18.25;BaseQRankSum=-2.225;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.806;MQ=59.53;MQRankSum=-1.743;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=1.323;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:710,0:0,0,8,13 0/1:27,27:54:99:659,0,747:13,14,9,18 +chrX 2803605 . G T 1244 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=17.69;BaseQRankSum=1.705;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.55;MQRankSum=-0.302;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.699;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23:24:99:685,0:1,0,12,11 0/1:26,22:48:99:589,0,644:11,15,8,14 +chrX 2803747 . A G 1255 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=16.91;BaseQRankSum=-0.567;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.872;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.91;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=0.818;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:734,0:0,0,12,11 0/1:31,22:53:99:551,0,879:17,14,14,8 +chrX 2803937 . G C 667 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=0.47;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.828;MQ=59.24;MQRankSum=-0.61;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=0.700;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,655 0/1:27,27:54:99:.:697,0,657:11,16,15,12 +chrX 2804015 . A G 1670 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=18.48;BaseQRankSum=-0.378;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=10.493;MQ=59.41;MQRankSum=-0.183;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.684;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:998,0:0,0,15,15 0/1:35,27:62:99:702,0,965:22,13,10,17 +chrX 2805625 . C T 2262 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.83;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.67;QD=31.83;SOR=1.675;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:968,0:0,0,21,9 1/1:0,42:42:99:1324,125,0:0,0,28,14 +chrX 2806719 . T C 3365 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=33.28;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=33.28;SOR=0.952;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1275,0:0,0,19,20 1/1:0,63:63:99:2120,189,0:0,0,26,37 +chrX 2807133 . C CTG 3741.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=26.49;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.10;QD=42.48;SOR=0.859;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1401,0:0,0,19,14 1/1:0,56:56:99:2380,168,0:0,0,29,27 +chrX 2807258 . A C 3437 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=32.71;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.34;QD=32.71;SOR=0.811;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1144,0:0,0,20,17 1/1:0,69:69:99:2323,208,0:0,0,36,33 +chrX 2807477 . T C 5145 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=121;AS_QD=28.38;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.55;QD=42.77;SOR=0.814;VarDP=121 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,42:42:99:.:.:1791,0:.:0,0,21,21 1|1:0,79:79:99:0|1:2807477_T_C:3384,237,0:2807477:0,0,36,43 +chrX 2807502 . A T 5509 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=124;AS_QD=26.89;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.61;QD=44.67;SOR=0.902;VarDP=124 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,42:42:99:.:.:1878,0:.:0,0,22,20 1|1:0,82:82:99:0|1:2807477_T_C:3661,247,0:2807477:0,0,34,48 +chrX 2807504 . ACATGTGCACACATCGGTGTGTG A 5474.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=123;AS_QD=32.35;DP=124;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.61;QD=44.83;SOR=0.924;VarDP=123 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,42:42:99:.:.:1878,0:.:0,0,22,20 1|1:0,81:81:99:0|1:2807477_T_C:3636,244,0:2807477:0,0,33,48 +chrX 2807619 . T G 3550 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=108;AS_QD=33.15;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.04;QD=33.15;SOR=0.769;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1209,0:0,0,20,16 1/1:0,72:72:99:2371,216,0:0,0,32,40 +chrX 2807750 . T G 3011 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=31.68;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.68;SOR=0.778;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1439,0:0,0,25,20 1/1:0,51:51:99:1602,152,0:0,0,21,30 +chrX 2807842 . T C 2535 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.28;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.28;SOR=1.445;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1121,0:0,0,14,23 1/1:0,45:45:99:1444,135,0:0,0,15,30 +chrX 2808355 . A G 2566 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=33.71;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.71;SOR=0.719;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1023,0:0,0,15,15 1/1:0,47:47:99:1573,141,0:0,0,23,24 +chrX 2808606 . T G 2675 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.40;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.40;SOR=0.934;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1062,0:0,0,13,19 1/1:0,49:49:99:1643,146,0:0,0,23,26 +chrX 2809893 . T G 2486 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.06;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.06;SOR=1.058;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:915,0:0,0,8,20 1/1:0,53:53:99:1601,157,0:0,0,26,27 +chrX 2810180 . A C 2605 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.53;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=32.53;SOR=0.821;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:665,0:0,0,12,9 1/1:0,60:60:99:1970,180,0:0,0,31,29 +chrX 2810928 . GAAAT G 2501.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=34.86;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.81;SOR=0.914;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:1175,0:0,0,12,15 1/1:0,31:31:94:1366,94,0:0,0,20,11 +chrX 2811240 . A G 2022 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=31.09;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.09;SOR=0.818;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:972,0:0,0,14,16 1/1:0,36:36:99:1080,106,0:0,0,17,19 +chrX 2811499 . T TA 2082.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=26.20;BaseQRankSum=-0.481;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.20;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.265;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:799,0:0,0,16,14 1/1:1,50:51:99:1323,125,0:1,0,26,24 +chrX 2812078 . A AG 4043.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.39;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.87;SOR=1.014;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1833,0:.:0,0,21,20 1|1:0,50:50:99:0|1:2812078_A_AG:2250,150,0:2812078:0,0,18,32 +chrX 2812079 . C CCAAATATAGTT 4043.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=28.46;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.87;SOR=1.014;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,41:41:99:.:.:1833,0:.:0,0,21,20 1|1:0,50:50:99:0|1:2812078_A_AG:2250,151,0:2812078:0,0,18,32 +chrX 2812248 . G A 2408 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.40;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;QD=33.40;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:899,0:0,0,10,17 1/1:0,46:46:99:1539,138,0:0,0,29,17 +chrX 2814055 . C T 3191 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=33.21;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.21;SOR=0.714;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1449,0:0,0,19,25 1/1:0,53:53:99:1772,159,0:0,0,29,24 +chrX 2814125 . A T 2668 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.51;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.51;SOR=0.818;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1051,0:0,0,19,15 1/1:0,49:49:99:1647,147,0:0,0,25,24 +chrX 2814315 . C CT 2136.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=27.90;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.90;SOR=0.914;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:755,0:0,0,15,12 1/1:0,51:51:99:1421,153,0:0,0,28,23 +chrX 2815068 . T G 2080 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=33.49;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=33.49;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:859,0:0,0,16,9 1/1:0,38:38:99:1251,114,0:0,0,18,20 +chrX 2815169 . G A 2679 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.04;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.06;QD=33.04;SOR=0.742;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:932,0:0,0,15,15 1/1:0,52:52:99:1777,156,0:0,0,27,25 +chrX 2815235 . G A 2887 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.78;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;QD=32.78;SOR=1.481;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:819,0:0,0,17,8 1/1:0,64:64:99:2098,192,0:0,0,41,23 +chrX 2815600 . A G 2585 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.51;BaseQRankSum=-0.443;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.70;MQRankSum=-0.973;QD=31.51;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.432;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:844,0:0,0,11,15 1/1:1,56:57:99:1771,136,0:0,1,22,34 +chrX 2815627 . G A 2783 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=31.61;BaseQRankSum=2.502;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=2.160;MQ=51.31;MQRankSum=-1.337;QD=31.61;ReadPosRankSum=2.192;SOR=0.497;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,26:27:99:843,0:1,0,13,13 1/1:2,60:62:99:1970,142,0:1,1,28,32 +chrX 2815802 . C CAT 3053.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.42;BaseQRankSum=-0.711;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.048;MQ=59.64;MQRankSum=-0.226;QD=38.19;ReadPosRankSum=1.213;SOR=0.121;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1487,0:0,0,18,16 1/1:2,45:47:90:1606,90,0:0,2,20,25 +chrX 2815821 . A ACACACACACACC,ACACACACACACACC,ACACACACACACACACC,ACACACACACACACACACC 3609.97 . AC=0,2,1,0;AF=0.00,0.667,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=2,38,23,1;AS_QD=35.83,33.11,25.63,27.28;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;QD=57.02;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,2,25,0,0:27:99:1448,756,0,1121,1121:0,0,13,14 2/3:0,0,13,23,1:37:99:2201,1807,1762,762,735,605,411,369,0,251,1255,1212,612,335,1136:0,0,17,20 +chrX 2816629 . A G 659 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.44;BaseQRankSum=-0.049;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=3.391;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.672;SOR=1.070;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,651 0/1:39,27:66:99:.:689,0,1087:19,20,16,11 +chrX 2816680 . ATT A 2584.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=34.99;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.99;SOR=0.245;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:756,0:0,0,11,10 1/1:1,53:54:99:1868,128,0:1,0,27,26 +chrX 2816797 . G A 2624 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.59;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.42;QD=33.59;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:951,0:0,0,12,16 1/1:0,51:51:99:1703,153,0:0,0,25,26 +chrX 2816889 . G C 3165 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=34.18;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.34;QD=42.04;SOR=0.920;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1026,0:.:0,0,12,12 1|1:0,52:52:99:0|1:2816889_G_C:2169,156,0:2816889:0,0,22,30 +chrX 2816907 . AC A 3055.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=29.79;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=42.40;SOR=1.257;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1055,0:.:0,0,11,14 1|1:0,48:48:99:0|1:2816889_G_C:2040,144,0:2816889:0,0,17,31 +chrX 2817099 . G GAGAGAC 2400.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=29.26;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.14;QD=44.36;SOR=1.791;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,21:21:99:.:.:944,0:.:0,0,15,6 1|1:0,34:34:99:0|1:2817099_G_GAGAGAC:1496,102,0:2817099:0,0,22,10 +chrX 2817108 . A AG 2269.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=31.92;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.53;QD=44.40;SOR=1.656;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:900,0:.:0,0,14,6 1|1:0,32:32:96:0|1:2817099_G_GAGAGAC:1409,96,0:2817099:0,0,20,10 +chrX 2817111 . A AGGGAGAGAGGG 2337.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=28.66;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.62;QD=44.02;SOR=1.747;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:889,0:.:0,0,15,5 1|1:0,34:34:99:0|1:2817099_G_GAGAGAC:1488,102,0:2817099:0,0,21,11 +chrX 2817122 . A G 1965 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=34.78;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.23;QD=42.45;SOR=2.252;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:699,0:.:0,0,13,3 1|1:0,31:31:93:0|1:2817099_G_GAGAGAC:1296,93,0:2817099:0,0,21,8 +chrX 2817150 . A AGGAG 1769.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=28.98;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.68;QD=44.12;SOR=1.501;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:675,0:0,0,12,3 1/1:0,26:26:78:1134,78,0:0,0,15,11 +chrX 2817498 . G A 2982 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=31.71;BaseQRankSum=-0.452;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.71;ReadPosRankSum=-0.912;SOR=0.259;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,37:38:99:1171,0:0,1,21,16 1/1:0,57:57:99:1841,171,0:0,0,24,33 +chrX 2817580 . T C 2917 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=31.02;BaseQRankSum=-0.475;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.056;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=31.02;ReadPosRankSum=1.288;SOR=0.290;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,34:35:99:1052,0:0,1,18,16 1/1:0,60:60:99:1895,179,0:0,0,30,30 +chrX 2817700 . T A 2655 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.15;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.15;SOR=0.876;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1112,0:0,0,18,16 1/1:0,47:47:99:1573,141,0:0,0,26,21 +chrX 2817781 . C CATT 3480.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=30.42;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=44.56;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1473,0:0,0,17,16 1/1:0,46:46:99:2047,138,0:0,0,23,23 +chrX 2817885 . G A 3419 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=33.16;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.16;SOR=1.201;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1415,0:0,0,26,16 1/1:0,62:62:99:2034,186,0:0,0,37,25 +chrX 2818079 . TATTA T 4253.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=35.72;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=44.72;SOR=0.969;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1524,0:0,0,15,19 1/1:0,62:62:99:2769,187,0:0,0,27,35 +chrX 2818155 . C A 3209 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=33.39;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=33.39;SOR=0.892;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:912,0:0,0,17,11 1/1:0,69:69:99:2327,208,0:0,0,36,33 +chrX 2819056 . G A 3330 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=33.27;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=33.27;SOR=0.979;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1102,0:0,0,14,18 1/1:0,69:69:99:2258,207,0:0,0,30,39 +chrX 2819153 . C T 2631 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.68;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.68;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:834,0:0,0,11,13 1/1:0,55:55:99:1827,165,0:0,0,28,27 +chrX 2819426 . C CA,CAA 2122.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=76,1;AS_QD=28.08,3.00;BaseQRankSum=-0.58;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.72;ReadPosRankSum=-1.341;SOR=0.470;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,20,1:22:99:571,0,565:0,1,9,12 1/1:0,56,0:56:99:1591,168,0,1591,168,1591:0,0,21,35 +chrX 2819495 . A G 2369 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.32;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.32;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:836,0:0,0,17,8 1/1:0,47:47:99:1563,141,0:0,0,20,27 +chrX 2819792 . TC T 3198.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=30.69;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.98;SOR=0.821;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1287,0:0,0,13,19 1/1:0,49:49:99:1951,147,0:0,0,25,24 +chrX 2819810 . G T 2321 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=33.11;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.11;SOR=0.721;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:851,0:0,0,13,13 1/1:0,45:45:99:1500,135,0:0,0,22,23 +chrX 2822282 . G T 2998 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.56;BaseQRankSum=2.816;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.057;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=32.56;ReadPosRankSum=0.085;SOR=0.292;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1032,0:0,0,18,14 1/1:1,60:61:99:1996,173,0:1,0,27,33 +chrX 2822640 . G C 3607 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=112;AS_QD=32.47;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=1.159;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1280,0:0,0,20,19 1/1:0,73:73:99:2357,219,0:0,0,47,26 +chrX 2822850 . C T 2372 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.36;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=33.36;SOR=0.934;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:700,0:0,0,12,9 1/1:0,51:51:99:1702,153,0:0,0,20,31 +chrX 2823003 . C A 1933 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=32.18;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=32.18;SOR=0.865;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:789,0:0,0,8,15 1/1:0,38:38:99:1174,114,0:0,0,20,18 +chrX 2823037 . C A,T 600 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,23;AS_QD=0.00,14.32;BaseQRankSum=2.611;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.154;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.00;ReadPosRankSum=1.024;SOR=0.465;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:99:36:0,818,818 0/2:21,1,23:45:99:.:630,708,1754,0,570,518:12,9,12,12 +chrX 2824077 . G A 2841 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.26;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.26;SOR=1.481;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1066,0:0,0,18,15 1/1:0,56:56:99:1805,168,0:0,0,40,16 +chrX 2825018 . TTCA T 2368.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=32.91;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.78;SOR=1.262;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:572,0:0,0,9,5 1/1:0,41:41:99:1836,124,0:0,0,25,16 +chrX 2825586 . C A 3536 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=33.33;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.33;SOR=0.961;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1180,0:0,0,13,23 1/1:0,71:71:99:2386,214,0:0,0,34,37 +chrX 2825620 . G A 3086 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=33.87;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.87;SOR=1.038;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1022,0:0,0,13,17 1/1:0,62:62:99:2094,186,0:0,0,26,36 +chrX 2825913 . C T 2539 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.11;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.11;SOR=0.968;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:967,0:0,0,15,16 1/1:0,49:49:99:1602,147,0:0,0,20,29 +chrX 2826361 . A G 2560 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.78;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.78;SOR=1.003;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1275,0:0,0,23,16 1/1:0,40:40:99:1315,120,0:0,0,22,18 +chrX 2826724 . C T 2848 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.34;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.34;SOR=0.761;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:834,0:0,0,14,12 1/1:0,63:63:99:2044,189,0:0,0,32,31 +chrX 2827053 . CACTCATACATGCATGCACTCACACCATCATCACTCATTCA C 1940.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=28.10;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.66;QD=44.00;SOR=1.154;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:916,0:0,0,13,8 1/1:0,24:24:78:1064,78,0:0,0,14,10 +chrX 2828517 . T C 3358 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=32.58;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.58;SOR=0.772;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1403,0:0,0,19,25 1/1:0,60:60:99:1985,180,0:0,0,31,29 +chrX 2828821 . G A 3187 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=30.64;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.64;SOR=1.015;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1293,0:0,0,18,25 1/1:0,62:62:99:1924,185,0:0,0,27,35 +chrX 2828879 . T TG 3431.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=36.91;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.06;SOR=1.261;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1282,0:0,0,13,23 1/1:0,63:63:99:2189,188,0:0,0,25,38 +chrX 2829473 . C T 772 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=17.82;BaseQRankSum=0.123;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=3.086;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.82;ReadPosRankSum=-1.371;SOR=0.307;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:499,0:0,0,12,5 0/1:16,12:28:99:303,0,417:13,3,8,4 +chrX 2830010 . T C 3024 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=31.81;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=31.81;SOR=1.132;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1320,0:0,0,18,23 1/1:0,55:55:99:1734,165,0:0,0,21,34 +chrX 2830212 . G C 3293 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=32.58;BaseQRankSum=2.987;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.751;MQ=59.59;MQRankSum=-0.116;QD=32.58;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.787;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,38:39:99:1271,0:0,1,21,17 1/1:0,63:63:99:2052,189,0:0,0,38,25 +chrX 2830251 . C G 2922 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.09;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.28;QD=32.09;SOR=0.693;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1032,0:0,0,14,17 1/1:0,61:61:99:1920,182,0:0,0,32,29 +chrX 2830380 . G A 2556 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.73;BaseQRankSum=5.66;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=4.205;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=32.73;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=1.108;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,30:31:99:1018,0:1,0,8,22 1/1:0,48:48:99:1568,143,0:0,0,21,27 +chrX 2831480 . T C 2835 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=30.81;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.81;SOR=1.061;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1020,0:0,0,17,17 1/1:0,59:59:99:1845,177,0:0,0,37,22 +chrX 2832081 . C T 2795 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.85;BaseQRankSum=-0.2;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.112;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.85;ReadPosRankSum=-1.502;SOR=0.335;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:864,0:0,0,14,12 1/1:1,59:60:99:1961,145,0:0,1,30,29 +chrX 2832413 . C CT 3712.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=27.84;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=37.15;SOR=0.795;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1412,0:0,0,21,17 1/1:0,63:63:99:2340,190,0:0,0,32,31 +chrX 2832727 . G T 875 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.45;BaseQRankSum=0.604;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.45;ReadPosRankSum=-1.306;SOR=0.698;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,645 0/1:22,33:55:99:.:905,0,505:12,10,18,15 +chrX 2833119 . T C 2982 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=33.10;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.10;SOR=1.071;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1177,0:0,0,23,12 1/1:0,56:56:99:1835,168,0:0,0,30,26 +chrX 2833659 . T C 2453 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=33.55;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=33.55;SOR=0.864;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:780,0:0,0,9,14 1/1:0,51:51:99:1703,153,0:0,0,31,20 +chrX 2833863 . C G 1693 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=16.89;BaseQRankSum=-0.472;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=5.103;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.78;SOR=0.767;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:803,0:0,0,12,13 0/1:39,38:77:99:920,0,995:22,17,16,22 +chrX 2834029 . C T 1069 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=16.40;BaseQRankSum=2.549;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.81;SOR=0.641;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,461 0/1:29,38:67:99:.:1099,0,712:18,11,23,15 +chrX 2834292 . C T 1064 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=17.09;BaseQRankSum=1.296;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.619;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,461 0/1:23,41:64:99:.:1094,0,467:9,14,17,24 +chrX 2834575 . G GA 1005.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=20.90;BaseQRankSum=-0.076;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=4.116;MQ=59.67;MQRankSum=-0.708;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.394;SOR=0.537;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,461 0/1:18,32:50:99:.:1045,0,522:11,7,15,17 +chrX 2834666 . A G 725 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.48;BaseQRankSum=0.657;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=59.72;MQRankSum=-0.964;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.59;SOR=0.997;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,461 0/1:28,28:56:99:.:755,0,735:14,14,16,12 +chrX 2835141 . G C 653 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.42;BaseQRankSum=-1.529;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.381;SOR=0.922;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,461 0/1:28,27:55:99:.:683,0,753:14,14,15,12 +chrX 2835486 . T C 940 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.11;BaseQRankSum=1.605;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=5.952;MQ=53.23;MQRankSum=-1.667;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.871;SOR=1.154;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,461 0/1:38,36:74:99:.:970,0,973:18,20,22,14 +chrX 2836673 . CAAA C 418.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=14.77;BaseQRankSum=-2.959;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.412;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.681;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,461 0/1:18,13:31:99:.:458,0,564:10,8,6,7 +chrX 2836752 . T C 819 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.02;BaseQRankSum=-0.68;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.02;ReadPosRankSum=-2.146;SOR=0.610;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,461 0/1:21,32:53:99:.:849,0,515:10,11,16,16 +chrX 2836852 . T A 2437 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.79;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.79;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:908,0:0,0,13,14 1/1:0,46:46:99:1559,138,0:0,0,21,25 +chrX 2837838 . TACACACAC T 913.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.65;BaseQRankSum=1.419;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=0.723;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,546 0/1:29,25:54:99:.:953,0,1086:13,16,11,14 +chrX 2837884 . C T 1098 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=15.89;BaseQRankSum=-0.307;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=8.137;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.865;SOR=0.959;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:659,0:0,0,15,7 0/1:29,20:49:99:469,0,772:12,17,10,10 +chrX 2838029 . C CA,CAA 218.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=13,2;AS_QD=7.82,0.23;BaseQRankSum=0.213;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.4;SOR=0.511;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,301,301 0/1:20,13,2:35:99:.:258,0,406,253,454,908:7,13,6,9 +chrX 2838372 . T C 414 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.09;BaseQRankSum=-1.834;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.948;SOR=0.883;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,301 0/1:25,19:44:99:.:444,0,692:11,14,11,8 +chrX 2838452 . C CCCCTCCCTTCCTCCTT 2045.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=30.61;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;QD=44.36;SOR=1.981;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:809,0:0,0,5,13 1/1:0,29:29:87:1276,87,0:0,0,8,21 +chrX 2838775 . AT A 722.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.94;BaseQRankSum=-0.672;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.94;ReadPosRankSum=1.326;SOR=0.560;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,491 0/1:23,28:51:99:.:762,0,594:14,9,13,15 +chrX 2839192 . A G 705 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.41;BaseQRankSum=0.219;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.407;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.482;SOR=1.079;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,491 0/1:24,27:51:99:.:735,0,631:14,10,18,9 +chrX 2839358 . C T 770 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.56;BaseQRankSum=0.716;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;MQRankSum=0;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.047;SOR=0.765;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,491 0/1:30,29:59:99:.:800,0,814:14,16,13,16 +chrX 2839707 . G A 2726 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.35;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=37.24;SOR=0.992;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:744,0:0,0,10,12 1/1:0,52:52:99:2012,156,0:0,0,22,30 +chrX 2839713 . T C 746 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.37;BaseQRankSum=0.331;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.055;MQ=59.60;MQRankSum=-1.617;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.66;SOR=0.976;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:99:23:0,700 0/1:25,29:54:99:.:776,0,636:12,13,12,17 +chrX 2839742 . G A 1433 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=18.06;BaseQRankSum=0.691;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=4.378;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.06;ReadPosRankSum=-2.028;SOR=0.352;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:758,0:0,0,11,12 0/1:31,27:58:99:705,0,834:12,19,14,13 +chrX 2841004 . TATAG T 2937.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=28.66;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=0.784;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1065,0:0,0,11,13 1/1:0,43:43:99:1912,130,0:0,0,21,22 +chrX 2841364 . TGATA T 1884.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=25.32;BaseQRankSum=1.921;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.921;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=0.567;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:971,0:0,0,11,11 0/1:29,25:54:99:953,0,1142:16,13,12,13 +chrX 2841574 . C G 669 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.65;BaseQRankSum=1.797;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.172;SOR=0.588;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,685 0/1:34,26:60:99:.:699,0,931:16,18,13,13 +chrX 2842019 . T C 532 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.22;BaseQRankSum=0.23;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.454;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.937;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,685 0/1:25,21:46:99:.:562,0,675:12,13,12,9 +chrX 2842185 . C CTTTCTTT 1665.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=26.23;BaseQRankSum=2.035;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.645;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.23;ReadPosRankSum=-2.558;SOR=0.951;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:1008,0:0,0,15,8 0/1:22,20:42:99:697,0,798:10,12,10,10 +chrX 2842253 . A G 720 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.39;BaseQRankSum=0.927;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.310;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.713;SOR=1.189;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,392 0/1:28,28:56:99:.:750,0,735:15,13,18,10 +chrX 2842449 . G A 1054 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=19.71;BaseQRankSum=0.637;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=7.450;MQ=59.91;MQRankSum=-0.946;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.143;SOR=0.734;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,392 0|1:27,28:55:99:.:0|1:2842449_G_A:1084,0,982:2842449:17,10,12,16 +chrX 2842458 . A G 1085 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=19.91;BaseQRankSum=-0.329;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=11.697;MQ=59.92;MQRankSum=-0.929;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.73;SOR=0.786;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,392 0|1:27,29:56:99:.:0|1:2842449_G_A:1115,0,1005:2842449:18,9,12,17 +chrX 2842743 . GTGTTT G 2602.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=27.81;BaseQRankSum=0.845;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.837;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=27.81;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.511;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1520,0:0,0,10,24 0/1:32,29:61:99:1122,0,1256:10,22,13,16 +chrX 2842816 . A AT 618.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=12.19;BaseQRankSum=2.981;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.389;MQ=59.45;MQRankSum=0;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.517;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,16:17:99:342,0:0,1,8,8 0/1:18,19:37:99:316,0,313:8,10,10,9 +chrX 2842935 . T G 413 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=12.31;BaseQRankSum=-1.176;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.348;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.360;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,331 0/1:18,18:36:99:.:443,0,488:6,12,8,10 +chrX 2843683 . A G 594 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=9.60;BaseQRankSum=-1.401;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.960;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.539;SOR=0.922;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,331 0/1:38,27:65:99:.:624,0,1041:19,19,12,15 +chrX 2843876 . A G 942 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=12.96;BaseQRankSum=-1.742;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=3.087;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.149;SOR=1.096;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,331 0/1:36,39:75:99:.:972,0,933:18,18,23,16 +chrX 2844137 . G A 996 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.66;BaseQRankSum=1.016;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=12.554;MQ=59.69;MQRankSum=-1.596;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.265;SOR=0.544;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,331 0/1:32,38:70:99:.:1026,0,781:10,22,21,17 +chrX 2844366 . C G 897 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.85;BaseQRankSum=-0.8;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=4.076;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.263;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,331 0/1:20,35:55:99:.:927,0,475:6,14,16,19 +chrX 2844526 . A G 595 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=31.25;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.41;QD=31.25;SOR=0.892;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:625,0:0,0,11,9 0/0:.:41:60:41:0,60,900 +chrX 2845059 . G A 1584 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=29.83;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.69;QD=43.62;SOR=0.859;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:689,0:.:0,0,7,9 1|1:0,21:21:63:0|1:2845059_G_A:925,63,0:2845059:0,0,10,11 +chrX 2845083 . G A 1810 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=32.75;BaseQRankSum=-0.884;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=3.033;MQ=54.95;MQRankSum=0.872;QD=38.33;ReadPosRankSum=-1.124;SOR=0.144;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:670,0:.:0,0,8,10 0|1:2,28:30:0:0|1:2845059_G_A:1170,0,0:2845059:0,2,13,15 +chrX 2845107 . G A 1142 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=29;AS_QD=30.84;BaseQRankSum=0.225;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.79;MQRankSum=-0.397;QD=30.84;ReadPosRankSum=-0.74;SOR=0.598;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:19:.:19:.:.:0,0 0|1:9,29:38:99:.:0|1:2845059_G_A:1172,0,291:2845059:3,6,11,18 +chrX 2845131 . G A 1046 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=27;AS_QD=26.90;BaseQRankSum=0.956;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=1.349;MQ=53.67;MQRankSum=-0.972;QD=26.90;ReadPosRankSum=0.419;SOR=1.115;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:15:.:15:.:.:0,0 0|1:13,27:40:99:.:0|1:2845059_G_A:1076,0,378:2845059:6,7,10,17 +chrX 2845155 . G A 998 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=26;AS_QD=25.07;BaseQRankSum=0.52;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.67;MQRankSum=-1.295;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.54;SOR=0.775;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:0:.:0:.:.:0,0 0|1:15,26:41:99:.:0|1:2845059_G_A:1028,0,443:2845059:6,9,10,16 +chrX 2845995 . G GTA 316.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=14.83;BaseQRankSum=1.389;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=4.129;MQ=59.15;MQRankSum=1.713;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=1.781;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:18:99:18:0,302 0/1:13,11:24:99:.:356,0,436:5,8,2,9 +chrX 2846036 . C CATATATATAT,CATATATATATATAT 618.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=9,7;AS_QD=23.76,16.93;BaseQRankSum=0.045;DP=35;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;MQRankSum=-1.769;QD=27.42;ReadPosRankSum=-0;SOR=0.741;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9,0:9:99:404,0,405:0,0,4,5 0/2:8,0,7:15:99:254,280,618,0,338,317:3,5,2,5 +chrX 2846055 . ATTTTTTTTTTTTTTTT A 156.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=17.82;BaseQRankSum=0.366;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.34;MQRankSum=2.429;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.941;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,225 0/1:5,6:11:99:.:196,0,191:2,3,2,4 +chrX 2846128 . G A 318 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=15.13;BaseQRankSum=2.287;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;MQRankSum=1.132;QD=15.13;ReadPosRankSum=2.095;SOR=0.551;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,225 0/1:11,12:23:99:.:348,0,258:5,6,6,6 +chrX 2846635 . G C 662 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.73;BaseQRankSum=-0.675;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.452;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.633;SOR=1.118;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,225 0/1:18,26:44:99:.:692,0,460:10,8,10,16 +chrX 2846847 . A G 989 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.21;BaseQRankSum=-0.248;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.968;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.21;ReadPosRankSum=3.001;SOR=0.512;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,225 0/1:28,39:67:99:.:1019,0,691:18,10,23,16 +chrX 2847278 . A C 679 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.38;BaseQRankSum=1.389;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.054;MQ=59.72;MQRankSum=-0.981;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=0.509;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,225 0/1:27,26:53:99:.:709,0,719:16,11,14,12 +chrX 2847329 . A T 531 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.69;BaseQRankSum=0.737;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.163;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.177;SOR=1.012;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,225 0/1:27,21:48:99:.:561,0,765:16,11,14,7 +chrX 2847533 . CA C,CAA 296.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,7;AS_QD=13.25,7.00;BaseQRankSum=2.266;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=5.639;MQ=59.65;MQRankSum=0;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.227;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,9,0:10:99:176,0,183:0,1,8,1 1/2:3,7,7:17:71:160,71,170,83,0,159:1,2,7,7 +chrX 2847703 . A AAAAT 1089.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=22.14;BaseQRankSum=-0.335;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=4.035;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.14;ReadPosRankSum=1.281;SOR=0.275;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,14:14:99:.:.:624,0:.:0,0,6,8 0|1:23,14:37:99:0|1:2847703_A_AAAAT:505,0,843:2847703:8,15,8,6 +chrX 2847715 . TAA T 909.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.95;BaseQRankSum=-0.589;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=7.436;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.796;SOR=1.100;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:36:99:36:.:.:0,878 0|1:27,29:56:99:.:1|0:2847703_A_AAAAT:949,0,942:2847703:16,11,11,18 +chrX 2847719 . TAAATAA T 909.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.95;BaseQRankSum=-0.891;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=7.436;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=1.100;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:36:99:36:.:.:0,878 0|1:27,29:56:99:.:1|0:2847703_A_AAAAT:949,0,942:2847703:16,11,11,18 +chrX 2848312 . A G 3706 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=114;AS_QD=32.77;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=32.77;SOR=0.728;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1315,0:0,0,22,19 1/1:0,73:73:99:2421,218,0:0,0,36,37 +chrX 2848359 . T G 1037 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.03;BaseQRankSum=0.59;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.894;MQ=59.92;MQRankSum=-0.904;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.559;SOR=0.847;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,785 0/1:33,38:71:99:.:1067,0,882:16,17,17,21 +chrX 2848498 . AC A 713.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=15.37;BaseQRankSum=0.847;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=4.189;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.37;ReadPosRankSum=1.14;SOR=1.372;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:99:32:.:.:0,785 0|1:29,20:49:99:.:0|1:2848498_AC_A:753,0,1140:2848498:14,15,13,7 +chrX 2848504 . A C 744 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=0.017;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=4.001;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.314;SOR=1.194;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:99:32:.:.:0,785 0|1:29,21:50:99:.:0|1:2848498_AC_A:774,0,1137:2848498:14,15,13,8 +chrX 2848547 . GA G,GAAA 1988.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=46,25;AS_QD=24.96,30.80;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;QD=28.56;SOR=1.042;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29,0:29:99:805,0,805:0,0,13,16 1/2:0,17,25:42:99:1223,880,990,453,0,628:0,0,17,25 +chrX 2848630 . G C 993 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.50;BaseQRankSum=0.497;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.074;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.33;SOR=0.713;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,501 0/1:29,37:66:99:.:1023,0,713:16,13,17,20 +chrX 2848979 . A T 1399 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=33.23;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.23;SOR=0.941;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,501 1/1:0,43:43:99:.:1429,129,0:0,0,24,19 +chrX 2849145 . T C 809 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.11;BaseQRankSum=-1.633;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.262;SOR=0.818;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,501 0/1:32,32:64:99:.:839,0,890:16,16,15,17 +chrX 2849189 . T C 845 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.67;BaseQRankSum=-1.479;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.868;SOR=0.796;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,501 0/1:30,34:64:99:.:875,0,796:14,16,15,19 +chrX 2849331 . G A 813 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.05;BaseQRankSum=1.615;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=0.730;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,501 0|1:37,23:60:99:.:0|1:2849331_G_A:843,0,1464:2849331:18,19,12,11 +chrX 2849344 . C T 827 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.79;BaseQRankSum=1.282;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=2.108;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.36;SOR=0.755;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,501 0|1:43,24:67:99:.:0|1:2849331_G_A:857,0,1641:2849331:20,23,13,11 +chrX 2850570 . C G 1718 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.33;BaseQRankSum=-0.524;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.794;MQ=55.56;MQRankSum=0.921;QD=20.33;ReadPosRankSum=1.721;SOR=0.941;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1073,0:0,0,13,12 0/1:34,27:61:99:675,0,917:17,17,10,17 +chrX 2850595 . G A 3244 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=26.27;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.00;QD=39.45;SOR=0.766;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1073,0:0,0,12,13 1/1:0,58:58:99:2201,174,0:0,0,28,30 +chrX 2850672 . T C 1535 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=16.30;BaseQRankSum=-1.192;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.24;MQRankSum=-0.044;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.658;SOR=0.685;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:922,0:0,0,12,16 0/1:41,27:68:99:643,0,1125:21,20,15,12 +chrX 2850810 . C T 747 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=18.07;BaseQRankSum=-1.581;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=9.300;MQ=59.29;MQRankSum=1.96;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.454;SOR=0.273;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,619 0|1:20,23:43:99:.:0|1:2850810_C_T:777,0,759:2850810:15,5,11,12 +chrX 2850823 . A G 751 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.36;BaseQRankSum=-1.388;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=11.478;MQ=59.33;MQRankSum=1.825;QD=17.36;ReadPosRankSum=0.216;SOR=0.582;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,619 0|1:22,23:45:99:.:0|1:2850810_C_T:781,0,813:2850810:16,6,10,13 +chrX 2850868 . T C 2576 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.41;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.80;QD=33.41;SOR=0.914;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:902,0:0,0,11,17 1/1:0,50:50:99:1704,150,0:0,0,32,18 +chrX 2851062 . A T 1455 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=18.33;BaseQRankSum=0.924;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=4.365;MQ=58.93;MQRankSum=0.73;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.436;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:511,0:0,0,10,5 0/1:30,36:66:99:974,0,761:18,12,15,21 +chrX 2851293 . C T 3067 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=33.66;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.66;SOR=0.737;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1023,0:0,0,14,16 1/1:0,62:62:99:2074,186,0:0,0,33,29 +chrX 2853273 . C T 3142 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=33.04;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.04;SOR=1.190;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1144,0:0,0,22,14 1/1:0,60:60:99:2028,180,0:0,0,36,24 +chrX 2854234 . G T 543 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.46;BaseQRankSum=0.909;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=4.076;MQ=59.56;MQRankSum=0;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.762;SOR=0.289;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,727 0/1:28,22:50:99:.:573,0,721:18,10,11,11 +chrX 2854357 . T G 2741 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=30.12;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=30.12;SOR=0.782;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:952,0:0,0,16,15 1/1:0,61:61:99:1819,181,0:0,0,32,29 +chrX 2854619 . G A 1287 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=22.32;BaseQRankSum=4.217;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.58;SOR=0.739;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,745 0/1:16,43:59:99:.:1317,0,319:8,8,22,21 +chrX 2854653 . A G 1194 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=21.47;BaseQRankSum=2.275;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=4.218;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.47;ReadPosRankSum=-2.103;SOR=0.658;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,745 0/1:15,42:57:99:.:1224,0,290:6,9,23,19 +chrX 2854731 . T C 1661 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=21.41;BaseQRankSum=-1.528;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;MQRankSum=-1.215;QD=21.41;ReadPosRankSum=-2.351;SOR=0.733;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1258,0:0,0,14,16 0/1:30,19:49:99:433,0,821:15,15,10,9 +chrX 2854751 . C T 2940 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=25.98;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=38.57;SOR=0.719;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1244,0:0,0,14,15 1/1:0,48:48:99:1726,144,0:0,0,25,23 +chrX 2855480 . C T 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=13.00;BaseQRankSum=0.945;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.154;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.00;ReadPosRankSum=1.047;SOR=0.990;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,700 0/1:24,21:45:99:.:585,0,654:12,12,9,12 +chrX 2855739 . A C 408 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=8.59;BaseQRankSum=-1.62;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.562;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,700 0/1:32,19:51:99:.:438,0,940:14,18,9,10 +chrX 2855902 . T G 3081 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=31.74;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.74;SOR=0.866;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1260,0:0,0,20,20 1/1:0,58:58:99:1851,174,0:0,0,25,33 +chrX 2856005 . A G 2534 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.27;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.27;SOR=0.742;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1126,0:0,0,17,19 1/1:0,46:46:99:1438,137,0:0,0,25,21 +chrX 2856437 . A G 2870 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=30.53;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.53;SOR=0.848;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1213,0:0,0,25,17 1/1:0,53:53:99:1687,159,0:0,0,26,27 +chrX 2856659 . T G 712 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.02;BaseQRankSum=-0.909;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.007;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.644;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:38:99:38:0,870 0/1:28,29:57:99:.:742,0,752:15,13,14,15 +chrX 2856719 . CTCTA C 174.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=6.69;BaseQRankSum=0.371;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=4.210;MQ=59.75;MQRankSum=-1.814;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.595;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:38:99:38:0,870 0/1:25,7:32:99:.:214,0,1012:8,17,4,3 +chrX 2856748 . CTATG C 1181.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=25.14;BaseQRankSum=-0.288;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;MQRankSum=-0.131;QD=39.39;ReadPosRankSum=0;SOR=0.278;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,30:31:99:.:1221,0:1,0,16,14 0/0:.:55:61:55:0,61,1603 +chrX 2856752 . G *,C,GTATCTATC 797 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,28,0;AS_QD=0.00,21.21,0.00;BaseQRankSum=-0.238;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.771;MQ=59.46;MQRankSum=0.694;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=0.721;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,30,0,0:31:99:1221,0,1237,1237:1,0,16,14 0/2:11,0,28,0:39:99:827,921,1820,0,511,373,905,1875,505,2226:6,5,10,18 +chrX 2856788 . C CT 331.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=9.05;BaseQRankSum=0.414;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=5.654;MQ=59.46;MQRankSum=-1.596;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.450;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,829 0|1:30,11:41:99:.:0|1:2856788_C_CT:371,0,1227:2856788:9,21,6,5 +chrX 2856792 . T TATC 328.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=8.76;BaseQRankSum=0.04;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=5.513;MQ=59.47;MQRankSum=-1.625;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.746;SOR=0.477;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,829 0|1:31,11:42:99:.:0|1:2856788_C_CT:368,0,1260:2856788:10,21,6,5 +chrX 2856799 . C CATCT,CT 3684.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=68,0;AS_QD=29.84,27.00;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.54;QD=54.76;SOR=0.880;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28,0:28:99:1226,0,1227:0,0,15,13 1/1:0,40,0:40:99:2498,169,0,1838,122,1833:0,0,16,24 +chrX 2856949 . G T 1268 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=23.60;BaseQRankSum=-0.68;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=7.561;MQ=59.54;MQRankSum=-0.779;QD=23.60;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.316;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:37:99:37:.:.:0,684 0|1:22,33:55:99:.:0|1:2856949_G_T:1298,0,791:2856949:15,7,16,17 +chrX 2856956 . CATCTGTTTATCTATCT C 1382.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=24.52;BaseQRankSum=0.161;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=5.486;MQ=59.58;MQRankSum=-0.746;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.467;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:37:99:37:.:.:0,684 0|1:22,36:58:99:.:0|1:2856949_G_T:1422,0,794:2856949:14,8,17,19 +chrX 2856963 . TTATCTATCTATC TTATC,*,T 3192.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=26,35,16;AS_QD=29.45,0.00,32.49;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=41.97;SOR=0.719;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26,0,0:26:99:.:.:1133,0,1133,1133:.:0,0,11,15 2|3:0,0,35,16:51:99:1|0:2856949_G_T:2099,2122,2240,660,776,759,1444,1487,0,1448:2856949:0,0,28,23 +chrX 2857170 . G A 1199 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=20.83;BaseQRankSum=-1.997;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.617;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.83;ReadPosRankSum=2.67;SOR=0.679;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,770 0|1:26,33:59:99:.:0|1:2857170_G_A:1229,0,879:2857170:11,15,18,15 +chrX 2857218 . G A 1485 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=18.94;BaseQRankSum=-1.384;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.861;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.538;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,770 0|1:34,46:80:99:.:0|1:2857170_G_A:1515,0,1054:2857170:14,20,21,25 +chrX 2857289 . CT C 952.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.50;BaseQRankSum=1.066;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.139;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.236;SOR=1.449;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,770 0|1:37,27:64:99:.:0|1:2857289_CT_C:992,0,1434:2857289:18,19,9,18 +chrX 2857315 . C A 1056 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=16.97;BaseQRankSum=2.078;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.073;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.97;ReadPosRankSum=-1.42;SOR=0.997;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,770 0|1:34,30:64:99:.:0|1:2857289_CT_C:1086,0,1317:2857289:16,18,12,18 +chrX 2857406 . A ATATC 4050.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.27;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.46;SOR=0.737;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1260,0:0,0,17,11 1/1:0,64:64:99:2830,193,0:0,0,30,34 +chrX 2857560 . A G 668 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.63;BaseQRankSum=-0.114;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.693;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,768 0/1:32,28:60:99:.:698,0,842:16,16,14,14 +chrX 2857650 . G C 1901 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=18.39;BaseQRankSum=-2.581;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.763;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.881;SOR=0.821;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1102,0:0,0,16,18 0/1:37,34:71:99:829,0,1044:18,19,15,19 +chrX 2857835 . A G 1540 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=20.13;BaseQRankSum=-0.084;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.662;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:919,0:0,0,15,12 0/1:27,24:51:99:651,0,740:13,14,10,14 +chrX 2857957 . A T 894 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.44;BaseQRankSum=-0.71;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=5.014;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.808;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:99:39:0,909 0/1:29,35:64:99:.:924,0,755:17,12,15,20 +chrX 2858086 . A AT 1597.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=15.02;BaseQRankSum=-0.449;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=6.227;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.325;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1017,0:0,0,19,16 0/1:45,29:74:99:620,0,1123:30,15,16,13 +chrX 2858112 . T C 1939 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=17.58;BaseQRankSum=-1.402;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=2.611;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.463;VarDP=112 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1155,0:0,0,20,16 0/1:43,33:76:99:814,0,1192:29,14,22,11 +chrX 2858277 . AT A 2772.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=26.78;BaseQRankSum=0.556;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=10.758;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.78;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.199;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,44:45:99:1740,0:0,1,18,26 0/1:29,31:60:99:1072,0,990:8,21,16,15 +chrX 2858331 . T C 731 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.27;BaseQRankSum=-0.96;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=6.954;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.007;SOR=1.324;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:38:99:38:0,977 0/1:31,31:62:99:.:761,0,822:17,14,11,20 +chrX 2858645 . G T 1783 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=21.58;BaseQRankSum=0.172;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=4.766;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.298;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:988,0:0,0,15,15 0/1:25,29:54:99:825,0,687:17,8,17,12 +chrX 2859066 . T G 2868 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.93;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.93;SOR=1.179;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:963,0:0,0,9,19 1/1:0,60:60:99:1935,179,0:0,0,26,34 +chrX 2859273 . A G 3558 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=22.74;BaseQRankSum=-0.644;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=42.21;ReadPosRankSum=0.817;SOR=0.242;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1349,0:.:0,0,15,17 1|1:1,52:53:99:0|1:2859273_A_G:2239,114,0:2859273:0,1,26,26 +chrX 2859279 . ATAG A 3632.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=29.67;BaseQRankSum=-0.489;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=42.21;ReadPosRankSum=1.155;SOR=0.242;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33:33:99:.:.:1388,0:.:0,0,16,17 1|1:1,53:54:99:0|1:2859273_A_G:2284,117,0:2859273:0,1,26,27 +chrX 2859314 . C T 2610 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.00;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=0.743;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:884,0:0,0,14,12 1/1:0,54:54:99:1756,162,0:0,0,27,27 +chrX 2859519 . A G 2664 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.46;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=0.717;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:838,0:0,0,11,15 1/1:0,57:57:99:1856,171,0:0,0,31,26 +chrX 2859944 . C T 3037 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=32.98;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.98;SOR=0.804;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1012,0:0,0,13,18 1/1:0,62:62:99:2055,186,0:0,0,36,26 +chrX 2860281 . G A 3206 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.04;BaseQRankSum=2.223;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=3.141;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.04;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=0.351;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:988,0:0,0,15,14 1/1:1,71:72:99:2248,206,0:0,1,37,34 +chrX 2860392 . C G 2611 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.86;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.86;SOR=0.976;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:963,0:0,0,15,13 1/1:0,50:50:99:1678,150,0:0,0,19,31 +chrX 2860485 . A G 3628 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=28.77;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.55;SOR=0.897;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1420,0:.:0,0,14,18 1|1:0,52:52:99:0|1:2860485_A_G:2238,157,0:2860485:0,0,24,28 +chrX 2860505 . C A 3687 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=25.57;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.22;SOR=0.892;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:1514,0:.:0,0,16,19 1|1:0,51:51:99:0|1:2860485_A_G:2203,153,0:2860485:0,0,23,28 +chrX 2860546 . A G 2476 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.55;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.55;SOR=0.772;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:873,0:0,0,13,13 1/1:0,51:51:99:1633,152,0:0,0,27,24 +chrX 2860643 . CTT C 1231.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=30.26;BaseQRankSum=-0.868;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=4.771;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.26;ReadPosRankSum=0.744;SOR=1.513;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:428,0:0,0,3,11 1/1:1,27:28:74:843,74,0:1,0,10,17 +chrX 2860755 . A T 2652 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=34.38;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.38;SOR=1.493;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:904,0:0,0,18,8 1/1:0,52:52:99:1778,156,0:0,0,33,19 +chrX 2860791 . A G 2813 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.31;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.31;SOR=1.531;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:877,0:0,0,18,10 1/1:0,60:60:99:1966,180,0:0,0,40,20 +chrX 2860941 . G T 4073 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=29.72;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=43.19;SOR=0.848;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1256,0:.:0,0,14,15 1|1:0,66:66:99:0|1:2860941_G_T:2847,199,0:2860941:0,0,37,29 +chrX 2860955 . T C 4048 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=30.22;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=43.38;SOR=0.736;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1221,0:.:0,0,13,15 1|1:0,66:66:99:0|1:2860941_G_T:2857,199,0:2860941:0,0,35,31 +chrX 2861130 . G A 2976 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=33.40;BaseQRankSum=3.474;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.40;ReadPosRankSum=1.26;SOR=0.271;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1197,0:0,0,18,17 1/1:1,54:55:99:1809,155,0:0,1,24,30 +chrX 2861170 . G A 3055 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=33.53;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.53;SOR=0.737;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1241,0:0,0,21,16 1/1:0,55:55:99:1844,165,0:0,0,26,29 +chrX 2861289 . T C 2636 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.00;BaseQRankSum=1.768;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.00;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.274;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:873,0:0,0,11,16 1/1:1,58:59:99:1793,150,0:0,1,29,29 +chrX 2861529 . A G 2828 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.48;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.48;SOR=0.739;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:873,0:0,0,14,13 1/1:0,61:61:99:1985,183,0:0,0,31,30 +chrX 2862078 . T TGGAA,A 3535 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=79,1;AS_QD=29.28,25.97;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=0.850;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37,0:37:99:1652,0,1652:0,0,20,17 1/1:0,42,1:43:99:1913,129,0,1431,130,1430:0,0,23,20 +chrX 2862224 . G A 2863 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.51;BaseQRankSum=2.317;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.51;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.223;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1090,0:0,0,12,20 1/1:1,56:57:99:1803,161,0:1,0,32,24 +chrX 2862278 . A C 2732 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=31.75;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.75;SOR=0.763;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:928,0:0,0,13,15 1/1:0,59:59:99:1834,176,0:0,0,32,27 +chrX 2862492 . C T 2750 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.71;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.71;SOR=0.815;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1095,0:0,0,18,15 1/1:0,52:52:99:1685,156,0:0,0,27,25 +chrX 2862706 . C T 2450 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.63;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.63;SOR=0.920;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:823,0:0,0,9,15 1/1:0,52:52:99:1657,155,0:0,0,25,27 +chrX 2862785 . C T 3597 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=29.27;BaseQRankSum=-0.151;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=0;QD=43.70;ReadPosRankSum=1.157;SOR=0.289;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23:24:99:990,0:1,0,13,10 1/1:0,59:59:99:2637,180,0:0,0,30,27 +chrX 2862788 . T A 3591 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=26.87;BaseQRankSum=-0.39;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=0;QD=43.11;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.275;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,25:26:99:1049,0:1,0,13,12 1/1:0,58:58:99:2572,171,0:0,0,31,27 +chrX 2863080 . CT C 1597.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=27.75;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=27.75;SOR=1.123;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:498,0:0,0,12,6 1/1:0,41:41:99:1139,123,0:0,0,23,18 +chrX 2863179 . G A 2466 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.00;BaseQRankSum=1.993;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.736;MQ=59.13;MQRankSum=-0.134;QD=32.00;ReadPosRankSum=0.925;SOR=0.785;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,29:30:99:918,0:0,1,19,10 1/1:0,48:48:99:1578,144,0:0,0,26,22 +chrX 2863219 . T C 2306 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.15;BaseQRankSum=-0.471;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=4.601;MQ=59.07;MQRankSum=-0.134;QD=31.15;ReadPosRankSum=-1.503;SOR=1.373;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,29:30:99:887,0:0,1,20,9 1/1:0,45:45:99:1449,135,0:0,0,29,16 +chrX 2864264 . A T 2877 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=31.26;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.26;SOR=0.758;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1011,0:0,0,18,15 1/1:0,60:60:99:1896,180,0:0,0,27,33 +chrX 2864385 . AT A 1487.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=25.88;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=25.88;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:620,0:0,0,12,12 1/1:0,35:35:99:907,105,0:0,0,21,14 +chrX 2864414 . T C 2126 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.18;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.18;SOR=0.990;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:902,0:0,0,13,14 1/1:0,40:40:99:1254,119,0:0,0,25,15 +chrX 2864592 . G A 2497 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=33.69;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.69;SOR=0.719;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:844,0:0,0,13,13 1/1:0,49:49:99:1683,147,0:0,0,24,25 +chrX 2865066 . A G 2911 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.97;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.97;SOR=0.737;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1042,0:0,0,15,17 1/1:0,60:60:99:1899,180,0:0,0,30,30 +chrX 2865514 . T G 2644 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.46;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.46;SOR=1.233;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1007,0:0,0,22,10 1/1:0,53:53:99:1667,158,0:0,0,30,23 +chrX 2865735 . T C 2542 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.97;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.97;SOR=0.914;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1058,0:0,0,19,13 1/1:0,46:46:99:1514,138,0:0,0,24,22 +chrX 2865874 . T TCA 4656.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.27;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.89;SOR=0.750;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1811,0:0,0,22,19 1/1:0,66:66:99:2885,198,0:0,0,33,33 +chrX 2866010 . G A 3269 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=32.99;BaseQRankSum=3.75;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.468;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.133;SOR=0.587;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,38:39:99:1290,0:1,0,14,24 1/1:0,61:61:99:2009,183,0:0,0,30,31 +chrX 2866836 . TTA T 3696.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=28.45;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=0.867;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1496,0:0,0,23,11 1/1:0,51:51:99:2240,154,0:0,0,23,28 +chrX 2867297 . C CA 2664.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.58;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.58;SOR=0.766;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:880,0:0,0,15,12 1/1:0,56:56:99:1824,168,0:0,0,28,28 +chrX 2867387 . G T 2237 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.49;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.49;SOR=1.308;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:854,0:0,0,17,9 1/1:0,46:46:99:1413,137,0:0,0,28,18 +chrX 2867997 . G A 3125 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=33.21;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=33.21;SOR=0.848;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:798,0:0,0,11,12 1/1:0,72:72:99:2357,216,0:0,0,33,39 +chrX 2869016 . T TA 1848.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=24.21;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=24.21;SOR=0.798;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:546,0:0,0,7,15 1/1:0,56:56:99:1342,166,0:0,0,30,26 +chrX 2869414 . G A 2198 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.76;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.76;SOR=0.693;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:913,0:0,0,12,16 1/1:0,40:40:99:1315,120,0:0,0,22,18 +chrX 2869857 . C G 3076 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=32.69;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.69;SOR=0.714;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:977,0:0,0,17,13 1/1:0,65:65:99:2129,195,0:0,0,31,34 +chrX 2871005 . A AT 1997.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=25.15;BaseQRankSum=-0.344;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.048;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.15;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.121;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,21:23:99:493,0:2,0,12,9 1/1:0,58:58:99:1544,174,0:0,0,29,29 +chrX 2871383 . C T 3251 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=30.67;BaseQRankSum=2.745;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.661;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=41.53;ReadPosRankSum=-0.476;SOR=0.733;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1065,0:.:0,0,15,10 1|1:1,53:54:99:0|1:2871383_C_T:2216,144,0:2871383:0,1,30,23 +chrX 2871387 . TA T 3224.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=30.54;BaseQRankSum=-0.297;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.791;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=41.32;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1091,0:.:0,0,15,11 1|1:1,52:53:99:0|1:2871383_C_T:2173,141,0:2871383:0,1,31,21 +chrX 2871689 . CAAATAAATAAATAAAT C 3026.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.15;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.80;SOR=1.329;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1063,0:0,0,8,17 1/1:0,45:45:99:2003,139,0:0,0,18,27 +chrX 2871807 . T G 3306 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=30.33;BaseQRankSum=-0.608;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.33;ReadPosRankSum=-0.51;SOR=0.337;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1289,0:0,0,25,17 1/1:1,67:68:99:2047,168,0:1,0,36,31 +chrX 2872107 . T C 3271 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=32.05;BaseQRankSum=2.483;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.05;ReadPosRankSum=-0.35;SOR=0.839;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,37:39:99:1156,0:1,1,19,18 1/1:0,64:64:99:2145,192,0:0,0,28,36 +chrX 2873040 . T C 1713 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=21.52;BaseQRankSum=-0.713;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.942;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.7;SOR=0.871;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:858,0:0,0,16,11 0/1:23,31:54:99:885,0,626:13,10,19,12 +chrX 2876033 . CTTTTTTTT C,CTTTTTTTTT 1065.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=25,7;AS_QD=26.92,12.44;BaseQRankSum=-0.471;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=10.958;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.197;SOR=2.058;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,11,0:13:99:439,0,478:2,0,2,9 1/2:0,14,7:21:99:666,112,388,573,0,554:0,0,6,15 +chrX 2876420 . G T 1337 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=17.75;BaseQRankSum=2.37;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=6.102;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.598;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:670,0:0,0,10,10 0/1:31,26:57:99:697,0,780:19,12,11,15 +chrX 2876817 . T C 1045 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=29.86;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.58;QD=29.86;SOR=0.804;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1075,0:0,0,17,19 0/0:.:57:92:57:0,92,1310 +chrX 2879217 . A ATAT 1184.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=23.54;BaseQRankSum=-1.205;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.090;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.54;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.824;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,537 0/1:21,31:52:99:.:1224,0,789:10,11,17,14 +chrX 2879288 . G T 37 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=1.63;BaseQRankSum=-0.987;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=15.115;MQ=59.57;MQRankSum=-1.16;QD=1.63;ReadPosRankSum=1.786;SOR=3.956;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,537 0/1:34,7:41:67:.:67,0,973:18,16,7,0 +chrX 2879754 . T C 747 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.39;BaseQRankSum=0.847;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.720;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.39;ReadPosRankSum=2.1;SOR=0.477;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,537 0/1:25,29:54:99:.:777,0,632:15,10,14,15 +chrX 2879854 . T A 831 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.59;BaseQRankSum=-0.056;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.582;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.59;ReadPosRankSum=-2.627;SOR=1.214;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,537 0/1:28,31:59:99:.:861,0,716:14,14,12,19 +chrX 2880164 . A ATGTGTG 303.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=8.37;BaseQRankSum=-0.536;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.238;MQ=59.57;MQRankSum=0;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.536;SOR=1.061;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,537 0/1:24,17:41:99:.:343,0,894:12,12,10,7 +chrX 2880415 . AGT A 1421.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=20.29;BaseQRankSum=-1.589;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.940;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=0.358;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,28:29:99:.:.:926,0:.:1,0,16,12 0|1:24,19:43:99:0|1:2880415_AGT_A:535,0,950:2880415:8,16,8,11 +chrX 2880439 . T C 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.69;BaseQRankSum=-0.933;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.612;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=1.258;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:99:32:.:.:0,526 0|1:22,27:49:99:.:1|0:2880415_AGT_A:720,0,807:2880415:9,13,8,19 +chrX 2882254 . G C 2628 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.41;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.41;SOR=1.445;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1116,0:0,0,8,25 1/1:0,49:49:99:1542,146,0:0,0,21,28 +chrX 2882583 . G T 1495 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=21.48;BaseQRankSum=0.83;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=3.939;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.48;ReadPosRankSum=-0.954;SOR=1.288;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:966,0:0,0,19,14 0/1:17,21:38:99:559,0,396:9,8,16,5 +chrX 2882636 . A G 1425 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=19.93;BaseQRankSum=-1.764;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=5.318;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.13;SOR=0.764;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:921,0:0,0,18,14 0/1:20,21:41:99:534,0,552:8,12,12,9 +chrX 2882959 . G A 1594 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=18.45;BaseQRankSum=1.618;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=7.630;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.025;SOR=0.233;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1051,0:0,0,19,13 0/1:34,22:56:99:573,0,909:25,9,12,10 +chrX 2882985 . T A 1382 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=16.81;BaseQRankSum=0.344;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=5.679;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.317;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:947,0:0,0,14,15 0/1:36,19:55:99:465,0,1016:24,12,12,7 +chrX 2883114 . C A 1644 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=18.40;BaseQRankSum=0.504;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.862;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.821;SOR=0.624;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:978,0:0,0,15,15 0/1:34,27:61:99:696,0,878:15,19,15,12 +chrX 2883264 . T TATA 672.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=15.15;BaseQRankSum=0.176;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=6.129;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.672;SOR=1.609;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,600 0/1:28,19:47:99:.:712,0,1119:14,14,6,13 +chrX 2884020 . G GC 827.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.94;BaseQRankSum=2.988;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=2.063;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.179;SOR=1.074;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,600 0/1:37,30:67:99:.:867,0,1114:19,18,18,12 +chrX 2884141 . A C 950 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=-0.161;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.783;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.307;SOR=1.315;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,600 0/1:32,38:70:99:.:980,0,798:17,15,25,13 +chrX 2884315 . G A 1188 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=22.15;BaseQRankSum=0.719;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.15;ReadPosRankSum=2.071;SOR=0.655;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,600 0|1:24,31:55:99:.:0|1:2884315_G_A:1218,0,914:2884315:9,15,12,19 +chrX 2884327 . G A 1255 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=21.07;BaseQRankSum=1.142;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.988;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.07;ReadPosRankSum=1.947;SOR=0.549;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,600 0|1:27,34:61:99:.:0|1:2884315_G_A:1285,0,1000:2884315:10,17,14,20 +chrX 2884355 . T C 1307 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=22.28;BaseQRankSum=-1.09;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.28;ReadPosRankSum=0.709;SOR=0.599;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,600 0|1:26,34:60:99:.:0|1:2884355_T_C:1337,0,989:2884355:10,16,14,20 +chrX 2884356 . T C 1307 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=22.28;BaseQRankSum=0.75;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.28;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.599;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,600 0|1:26,34:60:99:.:0|1:2884355_T_C:1337,0,989:2884355:10,16,14,20 +chrX 2884685 . T C 2408 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.40;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.08;QD=33.40;SOR=0.720;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:909,0:0,0,16,11 1/1:0,46:46:99:1529,138,0:0,0,20,26 +chrX 2884950 . A T 1031 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.38;BaseQRankSum=0.693;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=13.193;MQ=57.69;MQRankSum=-1.705;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=1.815;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:99:36:0,769 0/1:31,38:69:99:.:1061,0,819:14,17,27,11 +chrX 2885087 . GC G 2855.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=30.81;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.65;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1034,0:0,0,9,19 1/1:0,51:51:99:1861,154,0:0,0,28,23 +chrX 2885235 . A G 2893 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.48;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.48;SOR=1.166;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1033,0:0,0,9,21 1/1:0,60:60:99:1890,180,0:0,0,27,33 +chrX 2885262 . A G 474 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=8.84;BaseQRankSum=0.694;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.729;SOR=0.784;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,576 0/1:36,21:57:99:.:504,0,960:18,18,10,11 +chrX 2885346 . G A 1672 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=19.12;BaseQRankSum=0.693;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.985;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.76;SOR=0.394;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:630,0:0,0,12,8 0/1:31,38:69:99:1072,0,820:19,12,18,20 +chrX 2885428 . T C 2762 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=31.73;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=31.73;SOR=0.739;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:743,0:0,0,14,9 1/1:0,65:65:99:2049,194,0:0,0,31,34 +chrX 2885574 . CAA CA,C 1220.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=28,24;AS_QD=26.68,25.44;BaseQRankSum=-0.425;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=6.241;MQ=59.63;MQRankSum=-0.198;QD=22.91;ReadPosRankSum=-1.04;SOR=0.061;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,0:14:99:340,0,340:0,0,5,9 1/2:3,14,24:41:99:920,487,433,233,0,399:0,3,19,15 +chrX 2885608 . AATTAAATC A 3517.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=28.30;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=43.91;SOR=0.768;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:891,0:0,0,10,10 1/1:0,61:61:99:2666,184,0:0,0,29,32 +chrX 2885647 . T G 2057 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=21.52;BaseQRankSum=-1.033;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=1.755;MQ=59.94;MQRankSum=-0.895;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.304;SOR=0.485;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:1005,0:0,0,14,9 0/1:34,40:74:99:1082,0,913:21,13,21,19 +chrX 2885648 . T C 975 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=31.25;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=1.179;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:1005,0:0,0,14,9 0/0:.:72:99:72:0,115,1800 +chrX 2885954 . AT A 1418.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=16.38;BaseQRankSum=0.831;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.829;MQ=54.49;MQRankSum=-5.727;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.473;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:792,0:0,0,10,16 0/1:35,28:63:99:666,0,868:12,23,12,16 +chrX 2886144 . G A 602 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.74;BaseQRankSum=0.476;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.145;MQ=59.29;MQRankSum=-0.989;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.583;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,640 0/1:23,23:46:99:.:632,0,606:13,10,11,12 +chrX 2886383 . CTTTTTT CTTTTTTTTTTT,C 2356.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,22;AS_QD=30.75,32.17;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;QD=41.31;SOR=1.382;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21,0:21:99:889,0,890:0,0,14,7 1/2:0,15,22:37:99:1507,900,856,612,0,604:0,0,23,14 +chrX 2887483 . AT ATT,A 1092.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=39,19;AS_QD=17.63,16.00;BaseQRankSum=-0.629;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=3.065;MQ=58.58;MQRankSum=-0.46;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.268;SOR=0.120;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16,0:16:99:351,0,351:0,0,7,9 1/2:2,23,19:44:99:781,409,515,445,0,613:0,2,21,21 +chrX 2887745 . T C 1776 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=21.00;BaseQRankSum=0.074;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.000;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=21.00;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.430;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:893,0:0,0,16,12 0/1:24,34:58:99:913,0,600:10,14,15,19 +chrX 2887763 . A AAAG 3602.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=28.46;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=42.85;SOR=0.716;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1169,0:0,0,16,12 1/1:0,57:57:99:2473,171,0:0,0,27,30 +chrX 2887866 . C CAA 1417.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=21.75;BaseQRankSum=-1.065;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=7.384;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.868;SOR=0.606;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:636,0:0,0,6,13 0/1:20,28:48:99:821,0,575:13,7,15,13 +chrX 2888155 . G A 2395 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.68;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=33.68;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:851,0:0,0,15,11 1/1:0,46:46:99:1574,138,0:0,0,22,24 +chrX 2888233 . A C 1487 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=32.28;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.28;SOR=1.022;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,610 1/1:0,47:47:99:.:1517,141,0:0,0,27,20 +chrX 2888548 . A G 2428 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.77;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.77;SOR=1.319;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:645,0:0,0,6,14 1/1:0,55:55:99:1813,165,0:0,0,22,33 +chrX 2890948 . T G 700 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=29.20;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.91;QD=29.20;SOR=0.770;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:730,0:0,0,13,12 0/0:.:53:59:53:0,59,864 +chrX 2891325 . C G 2472 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.92;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.50;QD=32.92;SOR=1.194;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:720,0:0,0,12,9 1/1:0,55:55:99:1782,164,0:0,0,34,21 +chrX 2891808 . A C 1548 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=17.15;BaseQRankSum=0.991;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=12.724;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.896;SOR=1.496;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:975,0:0,0,18,12 0/1:38,24:62:99:603,0,1045:17,21,18,6 +chrX 2891934 . T C 1756 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=24.47;BaseQRankSum=1.611;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.413;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.47;ReadPosRankSum=1.772;SOR=0.715;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:968,0:0,0,17,13 0/1:16,27:43:99:818,0,387:7,9,14,13 +chrX 2893813 . C T 594 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=33.58;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.60;SOR=0.818;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,15:15:99:.:624,0:0,0,7,8 0/0:.:53:49:53:0,49,946 +chrX 2893826 . G GTA 591.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=34.31;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.45;QD=42.07;SOR=1.112;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,15:15:99:.:631,0:0,0,6,9 0/0:.:53:49:53:0,49,946 +chrX 2893972 . T C,TAC,TATATATATAC,TATATATATATAC 958 . AC=1,0,1,0;AF=0.333,0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=16,1,2,1;AS_QD=20.27,16.05,10.35,9.59;BaseQRankSum=4.25;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.04;MQRankSum=0.559;QD=24.10;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.793;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,16,0,0,0:17:99:750,0,540,650,650:0,1,8,8 0/3:20,0,1,2,1:24:27:238,100,852,95,733,751,0,729,598,715,27,757,627,671,745:10,10,1,3 +chrX 2894400 . T A 1668 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=19.74;BaseQRankSum=0;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.850;MQ=59.90;MQRankSum=-0.967;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.361;SOR=0.941;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:863,0:0,0,9,17 0/1:30,30:60:99:835,0,842:14,16,14,16 +chrX 2895246 . T C 1818 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=20.31;BaseQRankSum=-0.054;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=4.555;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.31;ReadPosRankSum=0.687;SOR=0.314;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1165,0:0,0,20,19 0/1:26,26:52:99:683,0,698:9,17,11,15 +chrX 2895634 . CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA CA,C 874.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,13;AS_QD=12.03,11.13;BaseQRankSum=-0.595;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.371;MQ=57.34;MQRankSum=1.449;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.799;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,12,0:13:99:469,0,488:0,1,8,4 0/2:26,0,13:39:99:445,523,1590,0,1066,1024:12,14,6,7 +chrX 2895719 . A G 2339 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=29.61;BaseQRankSum=-1.62;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.328;MQ=59.04;MQRankSum=-1.675;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.121;SOR=0.618;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30:30:99:.:.:1350,0:.:0,0,16,14 0|1:24,26:50:99:0|1:2895719_A_G:1019,0,918:2895719:10,14,14,12 +chrX 2895724 . T C 2339 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=29.61;BaseQRankSum=-1.33;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.328;MQ=58.83;MQRankSum=-1.675;QD=29.61;ReadPosRankSum=0.451;SOR=0.618;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30:30:99:.:.:1350,0:.:0,0,16,14 0|1:24,26:50:99:0|1:2895719_A_G:1019,0,918:2895719:10,14,14,12 +chrX 2895729 . T C 2346 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=30.08;BaseQRankSum=-1.578;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.063;MQ=58.82;MQRankSum=-1.672;QD=30.08;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.568;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1395,0:.:0,0,16,15 0|1:23,25:48:99:0|1:2895719_A_G:981,0,891:2895719:10,13,13,12 +chrX 2895735 . A G 2338 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=29.97;BaseQRankSum=-1.69;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.328;MQ=58.84;MQRankSum=-1.369;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.660;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1429,0:.:0,0,17,15 0|1:23,24:47:99:0|1:2895719_A_G:939,0,894:2895719:10,13,13,11 +chrX 2895813 . T A 1448 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=18.48;BaseQRankSum=-0.58;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.257;MQ=59.17;MQRankSum=-1.594;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.433;SOR=1.127;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:727,0:0,0,9,14 0/1:26,31:57:99:751,0,640:12,14,11,20 +chrX 2895877 . A G 1055 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.28;BaseQRankSum=0.288;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=4.580;MQ=59.52;MQRankSum=-0.954;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.536;SOR=1.236;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:580,0:0,0,8,11 0/1:32,20:52:99:505,0,886:16,16,7,13 +chrX 2895923 . A G 1900 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=22.71;BaseQRankSum=-0.551;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.881;MQ=59.77;MQRankSum=-1.678;QD=22.71;ReadPosRankSum=-1.763;SOR=0.748;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,22:22:99:.:.:990,0:.:0,0,9,13 0|1:37,26:63:99:0|1:2895923_A_G:940,0,1403:2895923:20,17,13,13 +chrX 2895942 . TG T 2068.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=24.51;BaseQRankSum=-1.188;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.794;MQ=59.78;MQRankSum=-1.6;QD=24.51;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=0.858;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1080,0:.:0,0,10,14 0|1:35,27:62:99:0|1:2895923_A_G:1028,0,1358:2895923:18,17,13,14 +chrX 2895947 . A G 2123 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=25.03;BaseQRankSum=-1.153;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.807;MQ=59.78;MQRankSum=-1.548;QD=25.03;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.764;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1080,0:.:0,0,10,14 0|1:34,28:62:99:0|1:2895923_A_G:1073,0,1343:2895923:18,16,14,14 +chrX 2895952 . A G 2129 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=25.40;BaseQRankSum=-1.614;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.793;MQ=59.77;MQRankSum=-1.553;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.089;SOR=0.805;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1125,0:.:0,0,10,15 0|1:33,27:60:99:0|1:2895923_A_G:1034,0,1304:2895923:17,16,14,13 +chrX 2895954 . C T 2171 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=25.30;BaseQRankSum=-0.297;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.830;MQ=59.78;MQRankSum=-1.577;QD=25.30;ReadPosRankSum=0.55;SOR=0.892;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1170,0:.:0,0,10,16 0|1:34,27:61:99:0|1:2895923_A_G:1031,0,1346:2895923:17,17,14,13 +chrX 2895968 . AAAATAAAT A 2247.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=26.29;BaseQRankSum=-0.695;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;MQRankSum=-1.075;QD=26.29;ReadPosRankSum=1.249;SOR=0.614;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1305,0:.:0,0,14,15 0|1:32,26:58:99:0|1:2895923_A_G:982,0,1260:2895923:17,15,14,12 +chrX 2896119 . C T 2114 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=22.33;BaseQRankSum=-0.763;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=14.270;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.33;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.458;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1226,0:0,0,21,17 0/1:24,34:58:99:918,0,604:7,17,18,16 +chrX 2896613 . C CA 562.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=-0.18;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=7.319;MQ=59.73;MQRankSum=-0.82;QD=14.00;ReadPosRankSum=-1.222;SOR=0.766;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:354,0:0,0,6,10 0/1:12,15:27:99:248,0,187:8,4,7,8 +chrX 2896798 . A G 519 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=30.50;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=30.50;SOR=0.693;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,18:18:99:.:549,0:0,0,9,9 0/0:.:49:92:49:0,92,1320 +chrX 2896887 . A G 1694 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=20.05;BaseQRankSum=-3.1;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=2.891;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=20.05;ReadPosRankSum=-1.809;SOR=0.796;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,21:21:99:.:.:660,0:.:0,0,10,11 0|1:37,28:65:99:0|1:2896887_A_G:1064,0,1464:2896887:20,17,12,16 +chrX 2896888 . G C 1034 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.37;BaseQRankSum=-1.489;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.417;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.782;SOR=0.894;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:20:99:20:.:.:0,476 0|1:37,28:65:99:.:0|1:2896887_A_G:1064,0,1464:2896887:20,17,12,16 +chrX 2896933 . A G 405 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=22.89;BaseQRankSum=-0.989;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;MQRankSum=0;QD=22.89;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.223;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,18:19:99:.:435,0:1,0,9,9 0/0:.:67:99:67:0,106,1787 +chrX 2897146 . A C 1279 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=16.16;BaseQRankSum=-1.636;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=11.334;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.111;SOR=0.424;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:754,0:0,0,16,7 0/1:34,24:58:99:555,0,933:11,23,9,15 +chrX 2898041 . T C 1824 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=22.34;BaseQRankSum=0.576;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=10.687;MQ=59.49;MQRankSum=-0.065;QD=22.34;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=1.082;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1306,0:0,0,16,23 0/1:23,21:44:99:548,0,582:14,9,7,14 +chrX 2899088 . G A 162 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=3.20;BaseQRankSum=-1.103;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;MQRankSum=-2.823;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.693;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,630 0/1:48,12:60:99:.:192,0,1410:24,24,6,6 +chrX 2899651 . C CT 655.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=28.96;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.96;SOR=1.270;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:695,0:0,0,15,9 0/0:.:56:72:56:0,72,1405 +chrX 2899769 . A AT 282.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=18.94;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;QD=18.94;SOR=0.804;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:322,0:0,0,9,8 0/0:.:56:72:56:0,72,1405 +chrX 2900252 . GTTTTTTTTTTT G 470.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=30.00;BaseQRankSum=-0.552;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.72;MQRankSum=0;QD=30.00;ReadPosRankSum=0.812;SOR=1.609;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,14:17:99:.:510,0:1,2,3,11 0/0:.:51:36:50:0,36,540 +chrX 2900399 . G T 750 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=33.91;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.91;SOR=1.426;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:780,0:0,0,8,15 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2900778 . A C 1208 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=33.46;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.46;SOR=1.270;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,37:37:99:.:1238,0:0,0,23,14 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2900877 . T C 1026 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=32.00;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=0.752;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,33:33:99:.:1056,0:0,0,17,16 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2901341 . A G 938 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=33.38;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.38;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:968,0:0,0,15,14 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2901464 . C T 669 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=31.77;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.77;SOR=0.874;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:699,0:0,0,12,10 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2901496 . T TTCTCGTGATAGTGAATAAGTCTTTTGTGATATGCTGA 1020.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=30.92;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.66;QD=39.26;SOR=1.101;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:1060,0:0,0,11,16 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2901576 . C T 855 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=34.04;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.42;QD=34.04;SOR=0.693;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:885,0:0,0,13,13 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2902144 . A G 769 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=33.29;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.29;SOR=1.051;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:799,0:0,0,14,10 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2902291 . T C 866 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=30.90;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.90;SOR=1.688;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:896,0:0,0,9,20 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2902414 . G C 1032 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=32.18;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.18;SOR=1.751;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,33:33:99:.:1062,0:0,0,23,10 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2902667 . C T 1092 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=33.00;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=1.085;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:1122,0:0,0,20,14 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2902786 . CAG C 701.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=31.07;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.05;SOR=0.693;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:741,0:0,0,10,10 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2903163 . T C 1217 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=35.46;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.54;SOR=0.997;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:1247,0:0,0,12,16 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2903178 . C T 1314 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=33.79;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.35;SOR=1.044;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:1344,0:0,0,13,18 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2903311 . C T 625 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=32.75;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=1.721;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:655,0:0,0,6,14 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2903409 . G A 838 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=33.38;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.38;SOR=0.846;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:868,0:0,0,14,12 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2903827 . C T 680 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=28.40;BaseQRankSum=-0.319;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=3.010;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.40;ReadPosRankSum=0.15;SOR=0.165;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,23:25:99:.:710,0:2,0,13,10 0/0:.:33:29:30:0,29,931 +chrX 2903937 . A C 686 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.56;BaseQRankSum=-1.333;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.326;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.761;SOR=0.777;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,698 0|1:37,20:57:99:.:0|1:2903937_A_C:716,0,1493:2903937:20,17,9,11 +chrX 2903938 . G T 686 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.56;BaseQRankSum=-0.176;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.326;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.264;SOR=0.777;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,698 0|1:37,20:57:99:.:0|1:2903937_A_C:716,0,1493:2903937:20,17,9,11 +chrX 2904212 . C T 1002 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=33.29;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.29;SOR=1.402;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:1032,0:0,0,20,11 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2904560 . G T 813 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=33.72;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.72;SOR=1.358;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:843,0:0,0,9,16 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2904903 . CT C 327.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=21.59;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=21.59;SOR=1.061;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:367,0:0,0,7,10 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2905544 . C T 738 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=32.00;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=0.859;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:768,0:0,0,13,11 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2905617 . T A 872 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=30.07;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.07;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:902,0:0,0,14,16 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2905642 . T G 828 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=31.78;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.78;SOR=0.922;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:858,0:0,0,12,15 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2906136 . AT A 309.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=21.81;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=21.81;SOR=0.693;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,16:16:99:.:349,0:0,0,8,8 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2906169 . A G 550 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=32.22;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.22;SOR=0.914;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,18:18:99:.:580,0:0,0,8,10 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2907001 . T C 715 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=32.39;BaseQRankSum=3.545;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=3.617;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.39;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.793;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,22:23:99:.:745,0:0,1,13,9 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2907093 . A G 912 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=32.48;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;QD=32.48;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:942,0:0,0,14,15 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2907116 . C CAAAA 971.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=34.00;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.13;SOR=0.693;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:1011,0:0,0,12,12 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2907362 . A G 1012 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=32.56;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.56;SOR=0.818;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:1042,0:0,0,17,15 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2907713 . T A 1632 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=21.89;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.62;SOR=1.387;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,39:39:99:.:1662,0:0,0,25,14 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2907737 . G A 1682 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=34.80;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.76;SOR=1.127;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1712,0:0,0,25,17 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2907886 . G A 1304 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=32.54;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=1.206;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,41:41:99:.:1334,0:0,0,16,25 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2908129 . G A 802 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=32.00;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=1.022;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:832,0:0,0,15,11 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2908198 . T C 818 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=33.92;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.92;SOR=0.770;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:848,0:0,0,13,12 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2908535 . C CT 351.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=30.08;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.55;QD=30.08;SOR=1.445;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,13:13:99:.:391,0:0,0,4,8 0/0:.:48:29:44:0,29,972 +chrX 2908667 . C T 882 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=33.78;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.40;QD=33.78;SOR=1.101;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:912,0:0,0,16,11 0/0:.:46:37:42:0,37,688 +chrX 2909080 . G GCACACACACA 1173.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=28.30;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.22;QD=44.93;SOR=1.781;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:1213,0:0,0,19,8 0/0:.:46:37:42:0,37,688 +chrX 2909360 . G A 1146 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=33.60;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.60;SOR=1.885;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1176,0:0,0,10,25 0/0:.:46:37:42:0,37,688 +chrX 2909639 . A G 540 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=30.00;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.60;QD=30.00;SOR=0.793;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,19:19:99:.:570,0:0,0,9,10 0/0:.:46:37:42:0,37,688 +chrX 2909753 . T TA 207.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=27.44;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.44;SOR=0.892;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,9:9:99:.:247,0:0,0,4,5 0/0:.:40:23:29:0,23,800 +chrX 2910081 . C T 704 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.11;BaseQRankSum=0.967;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=9.587;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.11;ReadPosRankSum=-1.011;SOR=1.655;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,303 0/1:30,26:56:99:.:734,0,874:14,16,18,8 +chrX 2910316 . T TTAA 1469.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=30.49;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=0.811;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:1509,0:0,0,18,16 0/0:.:66:97:66:0,97,1558 +chrX 2910957 . C T 638 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.85;BaseQRankSum=0.628;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=5.738;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.293;SOR=0.961;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,720 0/1:27,25:52:99:.:668,0,717:16,11,10,15 +chrX 2911580 . G A 630 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=33.00;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.80;QD=33.00;SOR=1.402;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:660,0:0,0,7,13 0/0:.:46:36:40:0,36,1111 +chrX 2911669 . CA C 186.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=20.55;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=3.424;MQ=54.04;MQRankSum=1.615;QD=20.55;SOR=0.793;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,10:11:99:.:226,0:0,1,6,4 0/0:.:44:0:44:0,0,943 +chrX 2911686 . GA G 247.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=23.92;BaseQRankSum=0;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.771;MQ=53.09;MQRankSum=2.227;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.872;SOR=1.670;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,11:12:99:.:287,0:0,1,8,3 0/0:.:58:64:58:0,64,1254 +chrX 2911735 . T A 580 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=28.52;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.88;SOR=2.712;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:610,0:0,0,14,3 0/0:.:58:64:58:0,64,1254 +chrX 2911962 . C G 1126 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=32.11;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.11;SOR=0.927;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1156,0:0,0,20,16 0/0:.:58:64:58:0,64,1254 +chrX 2912250 . T C 960 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=33.00;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=1.143;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:990,0:0,0,12,18 0/0:.:58:64:58:0,64,1254 +chrX 2912593 . C G 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=30.76;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.76;SOR=1.255;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:892,0:0,0,11,18 0/0:.:58:64:58:0,64,1254 +chrX 2913960 . A G 381 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=8.56;BaseQRankSum=-3.234;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=6.285;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.56;ReadPosRankSum=-1.709;SOR=1.656;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,411 0/1:29,19:48:99:.:411,0,844:16,13,14,5 +chrX 2914235 . C CT 683.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=26.78;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=26.78;SOR=0.765;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:723,0:0,0,13,14 0/0:.:55:46:55:0,46,1121 +chrX 2914418 . TGGG T,TGG 1377.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=24,16;AS_QD=27.41,11.23;BaseQRankSum=0.554;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=25.76;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.627;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24,0:24:99:1069,0,1069:0,0,10,14 0/2:15,0,16:31:99:348,393,747,0,354,306:6,9,7,9 +chrX 2914698 . C T 1309 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=30.26;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.47;QD=44.63;SOR=0.976;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:1339,0:0,0,17,13 0/0:.:54:88:54:0,88,1229 +chrX 2914701 . G C 2230 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=25.98;BaseQRankSum=2.48;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.895;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.825;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1339,0:0,0,17,13 0/1:24,33:57:99:921,0,548:13,11,19,14 +chrX 2915099 . C G 1036 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=31.35;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.35;SOR=1.085;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:1066,0:0,0,14,20 0/0:.:63:99:63:0,102,1747 +chrX 2915257 . C T 1506 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=29.88;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=1.061;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1536,0:0,0,21,15 0/0:.:63:99:63:0,102,1747 +chrX 2915279 . C G 1457 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=29.39;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.74;SOR=0.811;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:1487,0:0,0,18,16 0/0:.:63:99:63:0,102,1747 +chrX 2915311 . C T 1052 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=33.81;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.81;SOR=0.693;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:1082,0:0,0,16,16 0/0:.:63:99:63:0,102,1747 +chrX 2915465 . G C 2016 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=21.31;BaseQRankSum=2.065;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=16.553;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=21.31;ReadPosRankSum=1.687;SOR=0.835;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,36:37:99:1151,0:1,0,17,19 0/1:24,35:59:99:895,0,623:16,8,12,23 +chrX 2915815 . T C 1849 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=19.17;BaseQRankSum=-0.082;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.799;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.17;ReadPosRankSum=-1.837;SOR=0.544;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1186,0:0,0,14,23 0/1:34,27:61:99:693,0,914:19,15,19,8 +chrX 2916032 . C T 1131 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=19.35;BaseQRankSum=-2.414;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.35;ReadPosRankSum=-1.138;SOR=0.656;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:522,0:0,0,8,7 0/1:21,24:45:99:639,0,595:10,11,11,13 +chrX 2916131 . C CA,CAAA 757.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,21;AS_QD=9.00,17.61;BaseQRankSum=-0.036;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=3.046;MQ=59.51;MQRankSum=0;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.412;SOR=1.302;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,12,0:13:99:216,0,236:1,0,3,9 0/2:11,0,21:32:99:581,615,986,0,371,309:4,7,7,14 +chrX 2916414 . C T 953 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=32.77;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.77;SOR=1.143;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:983,0:0,0,18,12 0/0:.:58:30:53:0,30,1412 +chrX 2916489 . G C 1714 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=18.75;BaseQRankSum=0.28;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.800;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.851;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:865,0:0,0,14,13 0/1:31,35:66:99:879,0,775:16,15,14,21 +chrX 2916682 . C T 773 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=30.88;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.88;SOR=0.846;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:803,0:0,0,12,14 0/0:.:64:99:64:0,102,1265 +chrX 2916799 . C T 1644 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=22.32;BaseQRankSum=-1.235;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.683;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1136,0:0,0,17,19 0/1:19,20:39:99:538,0,518:8,11,7,13 +chrX 2917066 . CA C,* 292.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=19,2;AS_QD=11.86,0.00;BaseQRankSum=0.917;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.022;SOR=0.756;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,14,0:15:99:.:.:269,0,289:.:0,1,12,2 0|1:8,5,2:15:63:1|0:2917065_TC_T:63,0,145,72,137,616:2917065:7,1,4,3 +chrX 2917996 . G C 652 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=9.47;BaseQRankSum=-0.759;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=6.457;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=1.239;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,600 0/1:45,27:72:99:.:682,0,1308:24,21,10,17 +chrX 2918695 . A G 4088 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=29.43;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.92;QD=44.76;SOR=1.280;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1384,0:.:0,0,13,18 1|1:0,61:61:99:0|1:2918695_A_G:2734,184,0:2918695:0,0,22,39 +chrX 2918696 . T C 4088 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=28.04;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.94;QD=44.76;SOR=1.280;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1384,0:.:0,0,13,18 1|1:0,61:61:99:0|1:2918695_A_G:2734,184,0:2918695:0,0,22,39 +chrX 2918746 . C T 2615 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.87;BaseQRankSum=2.11;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.28;MQRankSum=-0.397;QD=31.87;ReadPosRankSum=-0.284;SOR=0.312;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:745,0:0,0,12,10 1/1:1,60:61:99:1900,173,0:0,1,25,35 +chrX 2919218 . G GTCC 1466.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=33.39;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.06;QD=44.29;SOR=0.693;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12:12:99:540,0:0,0,5,7 1/1:0,22:22:66:966,66,0:0,0,12,10 +chrX 2919250 . A G 1299 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=32.41;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=42.86;QD=32.41;SOR=0.843;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:571,0:0,0,10,8 1/1:0,23:23:69:758,69,0:0,0,12,11 +chrX 2919317 . G A 607 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.16;BaseQRankSum=1.054;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=4.246;MQ=53.37;MQRankSum=0.16;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.804;SOR=0.897;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:19:99:19:0,357 0/1:21,24:45:99:.:637,0,533:9,12,14,10 +chrX 2919396 . G A 864 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.25;BaseQRankSum=-0.739;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=25.828;MQ=51.66;MQRankSum=1.32;QD=16.25;ReadPosRankSum=2.467;SOR=1.509;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:19:99:19:0,357 0/1:23,32:55:99:.:894,0,594:6,17,22,10 +chrX 2919415 . A C 2910 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=27.86;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.16;QD=37.22;SOR=0.941;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:536,0:0,0,11,5 1/1:0,63:63:99:2404,189,0:0,0,33,30 +chrX 2919700 . T C 3210 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=32.73;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=32.73;SOR=0.936;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:789,0:0,0,17,7 1/1:0,75:75:99:2451,225,0:0,0,38,37 +chrX 2919812 . TGTTGTTGAAA T 3865.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=31.14;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=44.89;SOR=0.716;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:900,0:.:0,0,11,9 1|1:0,67:67:99:0|1:2919812_TGTTGTTGAAA_T:3005,202,0:2919812:0,0,33,34 +chrX 2919824 . TC T 3865.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=28.53;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=44.89;SOR=0.716;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:900,0:.:0,0,11,9 1|1:0,67:67:99:0|1:2919812_TGTTGTTGAAA_T:3005,202,0:2919812:0,0,33,34 +chrX 2920983 . T C 2336 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=19.88;BaseQRankSum=0.497;DP=122;ExcessHet=0.0000;FS=6.054;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.343;VarDP=119 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1151,0:0,0,22,14 0/1:39,44:83:99:1215,0,1046:15,24,18,26 +chrX 2922782 . A G 2124 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=32.64;BaseQRankSum=2.766;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=32.64;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.271;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:893,0:0,0,14,13 1/1:1,38:39:99:1261,107,0:1,0,18,20 +chrX 2922842 . CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA C,CAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1651.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=40,5;AS_QD=31.03,16.33;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=9.494;MQ=58.83;MQRankSum=2.996;QD=34.51;SOR=0.121;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23,0:23:99:1017,0,1017:0,0,7,16 1/2:4,17,5:26:49:674,49,664,527,0,624:0,4,16,6 +chrX 2922973 . CGTGAGGCACGGTACT C 2856.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.18;BaseQRankSum=-1.048;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.346;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.18;ReadPosRankSum=0.505;SOR=0.373;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1576,0:0,0,19,16 0/1:22,33:55:99:1320,0,824:14,8,17,16 +chrX 2923884 . C T 522 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=8.63;BaseQRankSum=-0.969;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.12;MQRankSum=-0.607;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.576;SOR=0.754;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,581 0/1:40,24:64:99:.:552,0,1119:19,21,11,13 +chrX 2923903 . T C 466 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=8.13;BaseQRankSum=-1.423;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.88;MQRankSum=-0.903;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.288;SOR=0.802;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,581 0/1:38,23:61:99:.:496,0,1048:16,22,9,14 +chrX 2924812 . G A 978 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=16.52;BaseQRankSum=0.341;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.610;MQ=57.09;MQRankSum=-3.938;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.535;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,581 0/1:25,36:61:99:.:1008,0,636:10,15,19,17 +chrX 2925098 . T C 1577 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=16.92;BaseQRankSum=0.337;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=3.934;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.132;SOR=1.132;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:963,0:0,0,12,18 0/1:39,26:65:99:644,0,1056:19,20,10,16 +chrX 2925211 . A G 469 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.88;BaseQRankSum=-1.924;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=2.587;MQ=59.28;MQRankSum=-1.052;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.783;SOR=0.967;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,626 0/1:23,19:42:99:.:499,0,673:11,12,11,8 +chrX 2927240 . C CT 1189.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=17.07;BaseQRankSum=-0.37;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=0.659;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:768,0:0,0,12,16 0/1:23,21:44:99:461,0,517:12,11,12,9 +chrX 2928624 . G C 996 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=20.52;BaseQRankSum=2.406;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=1.275;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.52;ReadPosRankSum=1.001;SOR=0.465;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22:23:99:700,0:1,0,15,7 0/1:15,12:27:99:326,0,440:11,4,8,4 +chrX 2928661 . A G 477 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=0.881;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.874;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:37:99:37:.:.:0,400 0|1:12,14:26:99:.:0|1:2928661_A_G:507,0,399:2928661:10,2,12,2 +chrX 2928672 . TG T 434.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=18.96;BaseQRankSum=-0.53;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=3.188;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.844;SOR=1.863;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:37:99:37:.:.:0,400 0|1:12,13:25:99:.:0|1:2928661_A_G:474,0,400:2928661:11,1,13,0 +chrX 2928976 . T C 1736 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=23.24;BaseQRankSum=-1.017;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=9.691;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.24;ReadPosRankSum=0.333;SOR=0.693;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1115,0:0,0,14,19 0/1:18,25:43:99:651,0,463:12,6,11,14 +chrX 2929092 . A G 816 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.59;BaseQRankSum=-2.209;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.625;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.350;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:26,32:58:99:.:846,0,728:16,10,16,16 +chrX 2929116 . C G 703 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.64;BaseQRankSum=-2.174;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.369;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:29,29:58:99:.:733,0,804:19,10,16,13 +chrX 2930368 . T C 1322 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=31.44;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.44;SOR=0.836;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,43:43:99:.:1352,127,0:0,0,20,23 +chrX 2930467 . T C 1712 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=32.26;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.26;SOR=0.767;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,54:54:99:.:1742,162,0:0,0,26,28 +chrX 2930794 . C G 1767 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=32.09;BaseQRankSum=-0.388;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.09;ReadPosRankSum=-1.455;SOR=0.304;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:1,55:56:99:.:1797,133,0:1,0,30,25 +chrX 2931596 . T C 2303 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=31.96;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.96;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,73:73:99:.:2333,219,0:0,0,33,40 +chrX 2931718 . T TA 1503.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=30.25;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.25;SOR=0.732;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,51:51:99:.:1543,153,0:0,0,26,25 +chrX 2931940 . C T 1306 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=34.26;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.26;SOR=1.236;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,39:39:99:.:1336,117,0:0,0,15,24 +chrX 2932265 . G C 2158 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.18;BaseQRankSum=2.616;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=3.554;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.18;ReadPosRankSum=-1.478;SOR=0.663;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:1,67:68:99:.:2188,194,0:0,1,38,29 +chrX 2932392 . T TTTGC 2839.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=31.41;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.62;SOR=0.818;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 1|1:0,66:66:99:.:0|1:2932392_T_TTTGC:2879,197,0:2932392:0,0,31,35 +chrX 2932402 . T TCTTTTTCCTTCCTG 3208.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=27.62;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 1|1:0,77:77:99:.:0|1:2932392_T_TTTGC:3248,231,0:2932392:0,0,35,42 +chrX 2932488 . G A 2247 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=33.49;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.49;SOR=0.752;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,68:68:99:.:2277,204,0:0,0,33,35 +chrX 2932760 . G C 1919 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.48;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=32.48;SOR=1.255;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,60:60:99:.:1949,179,0:0,0,23,37 +chrX 2932860 . A G 1746 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=31.71;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.71;SOR=0.765;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,56:56:99:.:1776,167,0:0,0,27,29 +chrX 2934215 . C CT 188.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.91;BaseQRankSum=-0.871;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.24;MQRankSum=-0.495;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.804;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:6,17:23:52:.:228,0,52:3,3,8,9 +chrX 2934910 . G A 2116 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=30.66;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.18;QD=30.66;SOR=1.163;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,70:70:99:.:2146,208,0:0,0,42,28 +chrX 2935105 . C T 832 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.67;BaseQRankSum=2.101;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.307;MQ=59.91;MQRankSum=0.235;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.79;SOR=0.511;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:24,31:55:99:.:862,0,569:10,14,16,15 +chrX 2935686 . TC T 1337.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=26.31;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.77;QD=40.50;SOR=0.941;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 1|1:0,34:34:99:.:0|1:2935686_TC_T:1377,102,0:2935686:0,0,15,19 +chrX 2935688 . TTTTC T 1337.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=28.51;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.80;QD=40.50;SOR=0.941;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 1|1:0,34:34:99:.:0|1:2935686_TC_T:1377,102,0:2935686:0,0,15,19 +chrX 2938114 . C T 2011 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=34.59;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.59;SOR=1.123;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,59:59:99:.:2041,177,0:0,0,35,24 +chrX 2938380 . T TTC 1326.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=31.02;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.03;SOR=0.743;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,39:39:99:.:1366,117,0:0,0,20,19 +chrX 2939772 . C A 1802 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=33.31;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.31;SOR=0.729;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,55:55:99:.:1832,165,0:0,0,28,27 +chrX 2939864 . CTT C 401.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=18.38;BaseQRankSum=-0.509;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=21.813;MQ=58.34;MQRankSum=0.358;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.077;SOR=2.451;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 0|1:4,20:24:18:.:0|1:2939864_CTT_C:441,0,18:2939864:4,0,4,16 +chrX 2941247 . CTTTTTTTTTT C 1343.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=25.88;BaseQRankSum=-0.361;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.122;MQ=59.48;MQRankSum=4.244;QD=38.42;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.105;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:2,34:36:41:.:1383,41,0:2,0,17,17 +chrX 2942401 . T C 2516 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.68;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;QD=43.15;SOR=1.316;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 1|1:0,59:59:99:.:0|1:2942401_T_C:2546,178,0:2942401:0,0,37,22 +chrX 2942416 . T C 2422 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=26.09;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=43.02;SOR=1.238;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 1|1:0,57:57:99:.:0|1:2942401_T_C:2452,171,0:2942401:0,0,35,22 +chrX 2943418 . G C 2549 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.65;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.65;SOR=0.941;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1280,0:0,0,23,17 1/1:0,39:39:99:1299,117,0:0,0,21,18 +chrX 2943741 . C CA 85.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=8.33;BaseQRankSum=-0.319;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=6.990;MQ=57.42;MQRankSum=0.728;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.797;SOR=0.610;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,225 0/1:3,12:15:13:.:125,0,13:3,0,5,7 +chrX 2944473 . CAA C 1753.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=29.26;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;QD=37.35;SOR=1.067;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,225 1/1:0,48:48:99:.:1793,145,0:0,0,20,28 +chrX 2944680 . T C 1345 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=33.54;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.54;SOR=1.075;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,225 1/1:0,41:41:99:.:1375,123,0:0,0,24,17 +chrX 2945222 . G A 813 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=27.19;BaseQRankSum=1.746;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.19;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.760;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,29:31:99:.:843,0:1,1,14,15 0/0:.:57:62:57:0,62,1170 +chrX 2946322 . CTTTTTTTTT CTTTTTTTTTT,C 798.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=8,23;AS_QD=6.29,25.86;BaseQRankSum=1.097;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;MQRankSum=-0.241;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.892;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,8,0:11:88:88,0,139:1,2,8,0 2/2:3,0,23:26:33:750,758,794,33,69,0:3,0,13,10 +chrX 2946505 . AT A 144.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=8.00;BaseQRankSum=-0.874;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=49.123;MQ=53.89;MQRankSum=-1.258;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.935;SOR=5.278;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 0/1:10,13:23:72:.:184,0,72:9,1,0,13 +chrX 2947255 . G T 1955 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.64;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.64;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 1/1:0,59:59:99:.:1985,177,0:0,0,33,26 +chrX 2947889 . A G 2122 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=31.19;BaseQRankSum=1.679;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=4.075;MQ=59.64;MQRankSum=8.367;QD=31.19;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=1.025;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 1/1:1,68:69:99:.:2152,182,0:0,1,42,26 +chrX 2949001 . C A 1552 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=33.66;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.66;SOR=0.919;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 1/1:0,47:47:99:.:1582,141,0:0,0,26,21 +chrX 2949372 . C T 596 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.27;BaseQRankSum=0.953;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.933;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.791;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 0/1:28,23:51:99:.:626,0,769:16,12,10,13 +chrX 2950513 . A G 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.06;BaseQRankSum=-0.637;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=7.625;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.06;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=1.156;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 0/1:27,27:54:99:.:705,0,726:16,11,10,17 +chrX 2951614 . C A,CAAAAAAAAA 139 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,3;AS_QD=5.95,8.89;BaseQRankSum=-1.058;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=15.947;MQ=57.19;MQRankSum=-2.905;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=1.036;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85,85 0/2:16,3,3:22:56:.:169,56,812,0,361,541:14,2,2,4 +chrX 2951800 . TAA T,TA 225.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=10,8;AS_QD=10.19,8.58;BaseQRankSum=0.725;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.356;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.758;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85,85 0/1:16,10,8:34:59:.:265,0,571,59,191,343:9,7,8,10 +chrX 2951874 . GTTTTTTT G,TTTTTTTT 820 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=22,3;AS_QD=21.79,0.00;BaseQRankSum=1.074;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=6.729;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.885;SOR=1.571;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85,85 0/1:17,22,3:42:99:.:850,0,774,881,437,1403:9,8,8,17 +chrX 2952272 . C T 734 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.75;BaseQRankSum=1.544;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.584;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 0/1:36,29:65:99:.:764,0,906:16,20,15,14 +chrX 2952970 . G C 664 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.09;BaseQRankSum=0.307;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.316;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.818;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 0/1:26,27:53:99:.:694,0,664:12,14,15,12 +chrX 2953433 . G A 687 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.56;BaseQRankSum=1.392;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.948;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.836;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 0/1:34,28:62:99:.:717,0,840:17,17,13,15 +chrX 2955804 . C A 612 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.10;BaseQRankSum=0.929;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.657;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.333;SOR=0.307;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 0/1:26,23:49:99:.:642,0,726:19,7,14,9 +chrX 2959794 . G A 618 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.22;BaseQRankSum=0.756;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.39;SOR=0.497;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 0/1:25,24:49:99:.:648,0,632:10,15,11,13 +chrX 2959835 . T C 570 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.32;BaseQRankSum=-2.611;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.828;SOR=1.101;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:85:30:0,85 0/1:26,27:53:99:.:600,0,701:13,13,11,16 +chrX 2960255 . T C 1608 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=36.43;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.24;QD=38.09;SOR=0.739;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19:19:99:.:.:619,0:.:0,0,8,11 1|1:0,24:24:72:0|1:2960255_T_C:1019,72,0:2960255:0,0,13,11 +chrX 2960263 . C T 884 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=31.61;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.21;QD=43.52;SOR=1.230;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,352 1|1:0,21:21:63:.:0|1:2960255_T_C:914,63,0:2960255:0,0,13,8 +chrX 2960294 . AGAAGAG A 199.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=5.98;BaseQRankSum=-0.108;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=23.254;MQ=57.37;MQRankSum=-4.63;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.686;SOR=4.402;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,352 0|1:32,8:40:99:.:0|1:2960255_T_C:239,0,1269:2960255:14,18,8,0 +chrX 2962853 . T C 1546 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=18.99;BaseQRankSum=-2.482;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.899;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.871;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:903,0:0,0,19,9 0/1:26,29:55:99:673,0,685:14,12,14,15 +chrX 2963119 . G A 953 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=33.90;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.90;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:983,0:0,0,15,14 0/0:.:56:94:56:0,94,1245 +chrX 2963533 . C CT 43.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=4.37;BaseQRankSum=2.432;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=22.614;MQ=57.40;MQRankSum=-1.864;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.369;SOR=3.014;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,342 0/1:10,9:19:83:.:83,0,140:2,8,8,1 +chrX 2965549 . AT A 1337.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=31.97;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.22;SOR=0.746;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,342 1/1:0,37:37:99:.:1377,111,0:0,0,19,18 +chrX 2975005 . C CA,CAAAAA 141.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,6;AS_QD=11.77,12.93;BaseQRankSum=0;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=9.863;MQ=58.44;MQRankSum=-0.746;QD=9.53;ReadPosRankSum=0;SOR=0.031;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,342,342 0/2:8,5,6:19:28:.:181,28,131,0,48,396:8,0,7,4 +chrX 2988813 . CA CAA,*,C,AA 611 . AC=2,0,1,0;AF=0.667,0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=16,1,14,6;AS_QD=20.47,0.00,14.93,19.57;BaseQRankSum=3.166;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.65;MQRankSum=2.648;QD=16.87;ReadPosRankSum=-1.04;SOR=0.245;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,8,0,0,0:8:99:140,0,140,140,140:0,0,3,5 1/3:1,8,1,14,6:30:99:501,293,361,536,416,1276,277,0,368,354,364,358,1047,136,1159:1,0,16,13 +chrX 2996505 . CCTTT CCTTTCTTTCTTTCTTT,C 1565.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=29,13;AS_QD=29.72,31.54;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.98;QD=38.21;SOR=0.788;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,0:11:99:492,0,494:0,0,5,6 1/2:0,18,13:31:99:1113,435,452,703,0,744:0,0,15,16 +chrX 2998968 . T TACAC 2322.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=26.57;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.53;QD=40.72;SOR=0.762;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:714,0:0,0,8,10 1/1:0,40:40:99:1648,119,0:0,0,22,18 +chrX 3001051 . G C 1066 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=16.61;BaseQRankSum=-0.804;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=3.441;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.384;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,313 0/1:24,42:66:99:.:1096,0,587:9,15,20,22 +chrX 3001371 . C T 908 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.89;BaseQRankSum=0.568;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.956;MQ=59.91;MQRankSum=-0.892;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.31;SOR=0.755;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,313 0/1:29,34:63:99:.:938,0,767:14,15,18,16 +chrX 3007247 . TA T 1397.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=24.36;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=24.36;SOR=0.796;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:513,0:0,0,10,11 1/1:0,38:38:99:924,114,0:0,0,21,17 +chrX 3008449 . TTTTCTTTC TTTTC,T 1256.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,10;AS_QD=28.65,31.08;BaseQRankSum=-0.162;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=6.154;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=39.27;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=2.381;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12,0:12:99:541,0,541:0,0,5,7 1/2:1,10,10:21:99:755,351,349,367,0,449:1,0,2,18 +chrX 3008741 . GT G 1647.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=27.66;BaseQRankSum=-0.237;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=27.66;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.280;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:491,0:0,0,5,12 1/1:1,43:44:99:1196,103,0:1,0,27,16 +chrX 3009403 . A G 2599 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.46;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=0.934;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:943,0:0,0,14,15 1/1:0,52:52:99:1686,156,0:0,0,22,30 +chrX 3010514 . T C 2912 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.98;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.98;SOR=0.829;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1022,0:0,0,19,14 1/1:0,59:59:99:1920,177,0:0,0,30,29 +chrX 3011252 . C CT 1629.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=23.84;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=23.84;SOR=0.874;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:609,0:0,0,13,11 1/1:0,46:46:99:1060,136,0:0,0,25,21 +chrX 3012320 . G T 1850 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.98;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;QD=32.98;SOR=1.692;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:730,0:0,0,6,16 1/1:0,35:35:99:1150,105,0:0,0,12,23 +chrX 3012599 . A AT 156.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=28.00;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.86;QD=28.00;SOR=0.941;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:11:99:11:0,225 1/1:0,7:7:20:.:196,20,0:0,0,3,4 +chrX 3012603 . T TATATATATATA,TATA,TATATA,TATATATA 1838.97 . AC=1,1,0,1;AF=0.333,0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,1,1,3;AS_QD=29.73,28.57,27.80,32.25;DP=46;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.96;QD=78.25;SOR=1.802;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19,0,0,0:19:99:855,0,855,855,855:0,0,15,4 2/4:0,0,1,1,3:5:10:1023,223,159,178,59,117,102,45,16,30,126,74,0,10,58:0,0,2,3 +chrX 3012610 . G A 2130 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=29.13;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.49;QD=45.00;SOR=1.067;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:900,0:0,0,16,4 1/1:0,28:28:84:1260,84,0:0,0,12,16 +chrX 3012614 . G A 2207 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.25;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.90;QD=44.74;SOR=1.157;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:938,0:0,0,16,5 1/1:0,29:29:87:1299,87,0:0,0,14,15 +chrX 3012621 . TAC T 2185.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=35.14;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.39;QD=44.50;SOR=1.270;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:971,0:0,0,17,5 1/1:0,28:28:84:1254,84,0:0,0,14,14 +chrX 3013437 . C G 2758 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.42;BaseQRankSum=2.947;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.42;ReadPosRankSum=0.817;SOR=0.407;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1066,0:0,0,15,18 1/1:1,52:53:99:1722,149,0:0,1,20,32 +chrX 3013503 . G A 2566 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=33.71;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.71;SOR=1.223;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:978,0:0,0,19,11 1/1:0,47:47:99:1618,141,0:0,0,28,19 +chrX 3013551 . C T 2106 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=34.45;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.45;SOR=2.985;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:661,0:0,0,15,4 1/1:0,43:43:99:1475,129,0:0,0,36,7 +chrX 3016390 . T C 2625 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=30.87;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.87;SOR=0.947;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:565,0:0,0,9,10 1/1:0,67:67:99:2090,200,0:0,0,29,38 +chrX 3016674 . C T 2819 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.38;BaseQRankSum=-0.344;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.38;ReadPosRankSum=-1.132;SOR=0.319;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22:23:99:690,0:1,0,11,11 1/1:0,65:65:99:2159,195,0:0,0,37,28 +chrX 3016899 . G A 3113 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.44;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.44;SOR=0.780;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:951,0:0,0,13,15 1/1:0,66:66:99:2192,198,0:0,0,32,34 +chrX 3017627 . G A 1199 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=18.34;BaseQRankSum=0.246;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=3.490;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.341;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:884,0:0,0,12,14 0/1:27,14:41:99:345,0,713:9,18,6,8 +chrX 3019264 . CAA C 1050.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=26.59;BaseQRankSum=2.272;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=2.147;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.59;ReadPosRankSum=-0.727;SOR=0.245;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,16:19:99:449,0:3,0,9,7 1/1:1,21:22:45:641,45,0:0,1,10,11 +chrX 3019707 . T C 2872 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.61;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.61;SOR=0.715;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1230,0:0,0,17,21 1/1:0,51:51:99:1672,152,0:0,0,27,24 +chrX 3020226 . G C 2000 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=33.28;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.28;SOR=1.727;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:601,0:0,0,10,8 1/1:0,43:43:99:1429,129,0:0,0,32,11 +chrX 3020588 . C CA,CAA 907.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=27,18;AS_QD=26.32,27.37;BaseQRankSum=-0.384;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=3.840;MQ=58.50;MQRankSum=-0.226;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.884;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0:17:99:302,0,303:0,0,8,9 1/2:1,10,18:29:99:645,281,210,160,0,125:1,0,10,18 +chrX 3020899 . T C 2760 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=30.66;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.66;SOR=0.906;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:853,0:0,0,14,14 1/1:0,63:63:99:1937,187,0:0,0,27,36 +chrX 3021707 . C CT 1307.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=20.72;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=20.72;SOR=1.078;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:605,0:0,0,16,12 1/1:0,37:37:99:742,106,0:0,0,22,15 +chrX 3021881 . T TTGTG,TTGTGTG,TTG 2534.97 . AC=3,0,0;AF=1.00,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=53,2,2;AS_QD=28.21,28.42,32.46;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=45.16;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,2,0:16:99:826,0,379,625:0,0,8,8 1/1:0,39,0,2:41:59:1748,120,0,1539,120,1448,1204,59,1181,1084:0,0,22,19 +chrX 3024068 . T C 2665 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.87;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.87;SOR=0.846;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1005,0:0,0,15,16 1/1:0,51:51:99:1690,153,0:0,0,23,28 +chrX 3025546 . C CTA 2516.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=33.17;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.73;SOR=0.886;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:815,0:0,0,11,10 1/1:0,45:45:99:1741,135,0:0,0,19,26 +chrX 3026496 . A C 2789 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.03;BaseQRankSum=3.475;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=4.130;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.03;ReadPosRankSum=0.158;SOR=1.053;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32:33:99:1082,0:1,0,11,21 1/1:0,55:55:99:1737,164,0:0,0,22,33 +chrX 3029733 . G T 2601 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.89;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;QD=32.89;SOR=1.031;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:854,0:0,0,13,14 1/1:0,53:53:99:1777,159,0:0,0,21,32 +chrX 3030907 . C T 2610 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.42;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:933,0:0,0,18,10 1/1:0,51:51:99:1707,153,0:0,0,24,27 +chrX 3031132 . CAAA C 3148.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=30.80;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=42.51;SOR=0.898;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:1139,0:0,0,14,12 1/1:2,47:49:99:2049,112,0:1,1,19,28 +chrX 3032165 . A T 4031 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=27.32;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=43.67;SOR=0.852;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1129,0:.:0,0,10,16 1|1:0,67:67:99:0|1:3032165_A_T:2932,202,0:3032165:0,0,33,34 +chrX 3032176 . C T 4109 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=28.37;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=43.57;SOR=0.896;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1128,0:.:0,0,9,17 1|1:0,69:69:99:0|1:3032165_A_T:3011,208,0:3032165:0,0,34,35 +chrX 3032920 . A G 3208 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.38;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=1.007;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1176,0:0,0,17,19 1/1:0,64:64:99:2062,192,0:0,0,26,38 +chrX 3032957 . C T 3360 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=32.29;BaseQRankSum=2.942;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=3.491;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.29;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.602;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,39:40:99:1291,0:1,0,19,20 1/1:0,65:65:99:2099,195,0:0,0,27,38 +chrX 3033393 . C G 2703 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.78;BaseQRankSum=-0.552;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.78;ReadPosRankSum=0;SOR=0.233;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,35:36:99:1036,0:0,1,16,19 1/1:0,50:50:99:1697,150,0:0,0,26,24 +chrX 3033890 . G A 2217 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=33.04;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.04;SOR=1.098;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:923,0:0,0,19,9 1/1:0,40:40:99:1324,120,0:0,0,21,19 +chrX 3035369 . A C 2679 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=30.44;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;QD=30.44;SOR=1.022;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:975,0:0,0,12,21 1/1:0,56:56:99:1734,167,0:0,0,26,30 +chrX 3035464 . T C 2435 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.77;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.69;QD=33.77;SOR=0.720;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:800,0:0,0,14,9 1/1:0,50:50:99:1665,150,0:0,0,23,27 +chrX 3035482 . T TTGTGTGTGTGTGTG 3093.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.11;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.84;QD=44.76;SOR=0.811;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1169,0:.:0,0,18,8 1|1:0,44:44:99:0|1:3035482_T_TTGTGTGTGTGTGTG:1964,130,0:3035482:0,0,19,25 +chrX 3035501 . G GAGAGAGAGAGAGA 3335.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.70;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.73;QD=45.00;SOR=0.832;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1260,0:.:0,0,19,9 1|1:0,47:47:99:0|1:3035482_T_TTGTGTGTGTGTGTG:2115,141,0:3035482:0,0,21,26 +chrX 3035503 . G A 3299 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.56;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.73;QD=44.99;SOR=0.804;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1260,0:.:0,0,19,9 1|1:0,46:46:99:0|1:3035482_T_TTGTGTGTGTGTGTG:2069,138,0:3035482:0,0,20,26 +chrX 3035505 . G A 2893 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.10;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.62;QD=44.97;SOR=0.723;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1079,0:.:0,0,17,7 1|1:0,41:41:99:0|1:3035482_T_TTGTGTGTGTGTGTG:1844,123,0:3035482:0,0,16,25 +chrX 3035542 . G C 2024 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.60;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.85;QD=32.60;SOR=0.724;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:749,0:0,0,13,10 1/1:0,40:40:99:1305,120,0:0,0,19,21 +chrX 3035732 . C T 2183 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=34.58;BaseQRankSum=2.065;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;MQRankSum=6.167;QD=34.58;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.826;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,26:27:99:.:.:1063,0:.:1,0,11,15 1|1:1,36:37:86:0|1:3035732_C_T:1150,86,0:3035732:0,1,18,18 +chrX 3035757 . G C 2590 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=29.12;BaseQRankSum=1.673;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=41.59;ReadPosRankSum=-1.434;SOR=0.223;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,22:23:99:.:.:924,0:.:1,0,12,10 1|1:0,40:40:99:0|1:3035732_C_T:1696,120,0:3035732:0,0,19,21 +chrX 3036079 . G C 437 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.15;BaseQRankSum=0.286;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.720;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,575 0/1:27,19:46:99:.:467,0,729:13,14,9,10 +chrX 3036529 . T A 2272 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.97;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.85;QD=31.97;SOR=0.869;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:719,0:0,0,10,13 1/1:0,49:49:99:1583,147,0:0,0,23,26 +chrX 3038580 . C A,CTAA 650 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=22,0;AS_QD=12.83,0.03;BaseQRankSum=1.025;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.964;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.072;SOR=1.298;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,193,193 0/1:31,22,0:53:99:.:680,0,1034,679,934,2111:16,15,8,14 +chrX 3039241 . A G 2234 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=30.59;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.66;QD=30.59;SOR=0.747;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:693,0:0,0,10,14 1/1:0,50:50:99:1571,149,0:0,0,28,22 +chrX 3039261 . G GT 1279.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=21.27;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.42;QD=21.27;SOR=0.976;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:398,0:0,0,10,8 1/1:0,44:44:99:921,129,0:0,0,25,19 +chrX 3040032 . A G 3712 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=33.76;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=0.815;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30:30:99:.:.:1291,0:.:0,0,14,16 1|1:0,55:55:99:0|1:3040032_A_G:2451,166,0:3040032:0,0,26,29 +chrX 3040038 . C T 3668 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=27.13;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=0.843;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1222,0:.:0,0,12,16 1|1:0,56:56:99:0|1:3040032_A_G:2476,169,0:3040032:0,0,27,29 +chrX 3040259 . C T 2447 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.17;BaseQRankSum=-0.288;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.17;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.268;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:675,0:0,0,11,10 1/1:1,55:56:99:1802,133,0:1,0,29,26 +chrX 3041299 . C CT 1559.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=24.23;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.39;QD=24.23;SOR=1.112;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:514,0:.:0,0,14,9 1|1:0,43:43:99:0|1:3041299_C_CT:1085,129,0:3041299:0,0,25,18 +chrX 3041820 . C T 3297 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=32.30;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.30;SOR=0.836;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1050,0:0,0,18,14 1/1:0,71:71:99:2277,213,0:0,0,30,41 +chrX 3043658 . T C 2739 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=31.83;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.83;SOR=0.812;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1147,0:0,0,18,17 1/1:0,52:52:99:1622,155,0:0,0,23,29 +chrX 3043851 . G T 2534 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.46;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:849,0:0,0,12,14 1/1:0,53:53:99:1715,159,0:0,0,27,26 +chrX 3044070 . T C 2766 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=31.42;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=31.42;SOR=0.715;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1091,0:0,0,15,19 1/1:0,55:55:99:1705,164,0:0,0,30,25 +chrX 3044416 . T C 2216 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.63;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.63;SOR=0.721;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:749,0:0,0,11,12 1/1:0,48:48:99:1497,143,0:0,0,24,24 +chrX 3044666 . T A 2162 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=33.72;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.72;SOR=0.723;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:874,0:0,0,12,14 1/1:0,39:39:99:1318,117,0:0,0,21,18 +chrX 3045554 . CT C 225.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=7.16;BaseQRankSum=2.212;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.91;MQRankSum=-0.039;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.879;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:37:99:37:0,765 0/1:20,17:37:99:.:265,0,330:12,8,11,6 +chrX 3045642 . A G 2572 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=30.61;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.22;QD=30.61;SOR=0.815;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:927,0:0,0,13,17 1/1:0,55:55:99:1675,164,0:0,0,32,23 +chrX 3045712 . C T 3959 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=33.55;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=44.82;SOR=0.911;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1440,0:.:0,0,14,18 1|1:0,57:57:99:0|1:3045712_C_T:2549,172,0:3045712:0,0,26,31 +chrX 3045713 . A G 3993 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=27.47;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=44.70;SOR=0.935;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33:33:99:.:.:1474,0:.:0,0,14,19 1|1:0,57:57:99:0|1:3045712_C_T:2549,172,0:3045712:0,0,26,31 +chrX 3045716 . T C 3936 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=28.86;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.45;QD=44.56;SOR=0.859;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33:33:99:.:.:1462,0:.:0,0,15,18 1|1:0,56:56:99:0|1:3045712_C_T:2504,169,0:3045712:0,0,26,30 +chrX 3045944 . G A 2718 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=29.87;BaseQRankSum=1.88;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=6.868;MQ=59.59;MQRankSum=3.674;QD=29.87;ReadPosRankSum=1.907;SOR=0.506;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1097,0:0,0,23,10 1/1:2,57:59:99:1651,146,0:0,2,27,30 +chrX 3046133 . G A 2724 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.40;BaseQRankSum=2.58;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.062;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=32.40;ReadPosRankSum=-1.473;SOR=0.298;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:813,0:0,0,9,16 1/1:1,59:60:99:1941,170,0:0,1,34,25 +chrX 3047041 . A G 2589 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=31.55;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=31.55;SOR=0.717;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:818,0:0,0,16,10 1/1:0,57:57:99:1801,170,0:0,0,26,31 +chrX 3047125 . T C 2647 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=31.13;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=31.13;SOR=0.740;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1006,0:0,0,18,14 1/1:0,54:54:99:1671,161,0:0,0,26,28 +chrX 3047476 . A AG 3768.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.95;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.05;QD=44.80;SOR=0.867;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,36:36:99:.:.:1608,0:.:0,0,17,19 1|1:0,49:49:99:0|1:3047476_A_AG:2200,147,0:3047476:0,0,22,27 +chrX 3047481 . T G 3783 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.11;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.00;QD=44.86;SOR=0.922;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,36:36:99:.:.:1613,0:.:0,0,16,20 1|1:0,49:49:99:0|1:3047476_A_AG:2200,147,0:3047476:0,0,22,27 +chrX 3047485 . C T 3837 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=31.46;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.86;QD=44.45;SOR=0.863;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,37:37:99:.:.:1640,0:.:0,0,16,21 1|1:0,50:50:99:0|1:3047476_A_AG:2227,151,0:3047476:0,0,24,26 +chrX 3047840 . G A 3510 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=28.63;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.25;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1054,0:.:0,0,13,11 1|1:0,56:56:99:0|1:3047840_G_A:2486,169,0:3047840:0,0,29,27 +chrX 3047844 . T C 3623 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=33.16;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.01;SOR=0.766;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1054,0:.:0,0,13,11 1|1:0,59:59:99:0|1:3047840_G_A:2599,178,0:3047840:0,0,30,29 +chrX 3047905 . T C 2479 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=31.36;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.36;SOR=1.096;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:491,0:0,0,11,4 1/1:0,65:65:99:2018,194,0:0,0,36,29 +chrX 3047981 . A G 2128 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=32.70;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.70;SOR=0.818;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:467,0:0,0,8,6 1/1:0,52:52:99:1691,156,0:0,0,27,25 +chrX 3048180 . C T 2833 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.91;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=32.91;SOR=0.716;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:899,0:0,0,15,12 1/1:0,60:60:99:1964,180,0:0,0,28,32 +chrX 3048208 . T A 2857 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.73;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.73;SOR=0.906;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:884,0:0,0,15,13 1/1:0,63:63:99:2003,189,0:0,0,35,28 +chrX 3048441 . T C 3279 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=31.51;BaseQRankSum=2.215;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.51;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.255;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,31:32:99:965,0:0,1,17,14 1/1:0,73:73:99:2344,219,0:0,0,33,40 +chrX 3048965 . T A 2794 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=34.02;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=34.02;SOR=0.766;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1147,0:0,0,16,17 1/1:0,50:50:99:1677,150,0:0,0,27,23 +chrX 3048982 . C T 806 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=16.08;BaseQRankSum=0.226;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;MQRankSum=-0.817;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.741;SOR=0.652;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,929 0/1:22,30:52:99:.:836,0,554:12,10,16,14 +chrX 3049015 . A G 2729 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.85;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.52;QD=32.85;SOR=0.693;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1196,0:0,0,17,19 1/1:0,48:48:99:1563,144,0:0,0,25,23 +chrX 3049096 . G A 3222 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=33.18;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;QD=33.18;SOR=0.914;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1117,0:0,0,17,17 1/1:0,64:64:99:2135,192,0:0,0,37,27 +chrX 3049135 . A G 3134 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=32.29;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=32.29;SOR=0.693;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1080,0:0,0,15,19 1/1:0,64:64:99:2084,192,0:0,0,34,30 +chrX 3049659 . A G 2814 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.07;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.69;QD=33.07;SOR=0.892;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:779,0:0,0,15,9 1/1:0,62:62:99:2065,186,0:0,0,32,30 +chrX 3049929 . T C 2302 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.09;BaseQRankSum=2.146;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.601;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:635,0:0,0,12,8 1/1:1,54:55:99:1697,154,0:1,0,36,18 +chrX 3050069 . G C 2418 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.53;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=33.53;SOR=1.917;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:685,0:0,0,4,16 1/1:0,53:53:99:1763,159,0:0,0,17,36 +chrX 3050391 . G A 2289 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=31.77;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.77;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:754,0:0,0,17,7 1/1:0,49:49:99:1565,147,0:0,0,23,26 +chrX 3050546 . C CA 347.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=9.44;BaseQRankSum=0.018;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.31;MQRankSum=-2.968;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=0.627;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,549 0/1:17,24:41:99:.:387,0,258:11,6,15,9 +chrX 3050607 . T C 2490 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=31.90;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.79;QD=31.90;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:963,0:0,0,16,13 1/1:0,50:50:99:1557,149,0:0,0,26,24 +chrX 3050874 . G T 3018 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=33.49;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;QD=33.49;SOR=0.760;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1201,0:0,0,18,18 1/1:0,55:55:99:1847,165,0:0,0,29,26 +chrX 3050917 . C T 2936 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.96;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.34;QD=32.96;SOR=0.738;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1226,0:0,0,18,20 1/1:0,52:52:99:1740,156,0:0,0,28,24 +chrX 3052690 . CA C 984.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=22.76;BaseQRankSum=-0.824;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=3.745;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.76;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.820;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:365,0:0,0,9,6 1/1:1,29:30:66:659,66,0:1,0,9,20 +chrX 3053410 . A C 1949 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.54;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=33.54;SOR=0.796;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:863,0:0,0,10,16 1/1:0,33:33:99:1116,99,0:0,0,18,15 +chrX 3053639 . C T 2456 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.71;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.71;SOR=1.270;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:957,0:0,0,18,12 1/1:0,46:46:99:1529,138,0:0,0,29,17 +chrX 3053758 . A AT 560.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.04;BaseQRankSum=0.627;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=7.874;MQ=58.87;MQRankSum=-1.159;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.421;SOR=0.110;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:342,0:0,0,6,11 0/1:12,17:29:99:258,0,164:2,10,9,8 +chrX 3061628 . A C 2324 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=31.81;BaseQRankSum=-0.477;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=31.81;ReadPosRankSum=1.325;SOR=0.283;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:728,0:0,0,10,13 1/1:1,50:51:99:1626,125,0:0,1,24,26 +chrX 3066912 . CT C 1138.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=23.10;BaseQRankSum=-0.678;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=9.208;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.10;ReadPosRankSum=-0.705;SOR=1.414;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,16:18:99:355,0:2,0,4,12 1/1:0,33:33:99:823,99,0:0,0,12,21 +chrX 3067416 . C T 2377 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.97;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=32.97;SOR=0.720;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:814,0:0,0,13,12 1/1:0,48:48:99:1593,144,0:0,0,24,24 +chrX 3070368 . T C 2123 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.13;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.13;SOR=0.723;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:794,0:0,0,11,14 1/1:0,42:42:99:1359,126,0:0,0,23,19 +chrX 3070590 . A T 2879 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=33.06;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.06;SOR=0.997;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1087,0:0,0,19,14 1/1:0,55:55:99:1822,165,0:0,0,31,24 +chrX 3070938 . GGT G 1559.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=31.35;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.35;SOR=1.094;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:756,0:0,0,13,11 1/1:0,27:27:82:843,82,0:0,0,17,10 +chrX 3070994 . GGATA G 2706.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=30.91;BaseQRankSum=-0.52;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.59;ReadPosRankSum=1.517;SOR=0.346;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:1035,0:0,0,12,11 1/1:1,39:40:76:1711,76,0:1,0,23,16 +chrX 3073648 . A ATAATTATAAATATATAATTAAATATATAATTAATAAATAT 495.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=16.21;BaseQRankSum=-1.887;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=7.731;MQ=59.32;MQRankSum=-1.404;QD=16.21;ReadPosRankSum=-3.272;SOR=1.255;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,452 0/1:13,20:33:99:.:535,0,418:8,5,7,13 +chrX 3075488 . G GTC 2538.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=28.71;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.26;SOR=0.941;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:672,0:0,0,10,6 1/1:0,45:45:99:1906,135,0:0,0,17,28 +chrX 3075741 . G T 2367 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.29;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.29;SOR=1.002;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:717,0:0,0,13,8 1/1:0,51:51:99:1680,152,0:0,0,28,23 +chrX 3075897 . CTCTG C 2628.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=33.88;BaseQRankSum=-0.934;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;MQRankSum=0;QD=36.55;ReadPosRankSum=1.004;SOR=0.442;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,23:26:99:594,0:1,2,8,15 1/1:0,47:47:99:2074,142,0:0,0,25,22 +chrX 3075983 . G GTC 3180.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=28.89;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=41.28;SOR=0.855;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:670,0:0,0,9,7 1/1:0,62:62:99:2550,186,0:0,0,33,29 +chrX 3076336 . GTC G 2351.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.61;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=37.95;SOR=0.278;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:893,0:0,0,12,11 1/1:1,39:40:99:1498,111,0:0,1,17,22 +chrX 3076393 . T C 1953 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.48;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=31.48;SOR=0.859;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1001,0:0,0,20,11 1/1:0,32:32:95:982,95,0:0,0,14,18 +chrX 3077036 . G A 2057 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=30.69;BaseQRankSum=-0.177;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.319;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,17:18:99:536,0:1,0,7,10 1/1:0,50:50:99:1551,148,0:0,0,30,20 +chrX 3077554 . G A 2024 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.09;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=32.09;SOR=1.044;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:571,0:0,0,3,14 1/1:0,47:47:99:1483,140,0:0,0,24,23 +chrX 3077789 . T TTTATTATTATTATTA,TTTATTATTA,TTTTTTATTATTA,TTTATTATTATTATTATTA,TTTTTTATTATTATTATTATTA 2490.97 . AC=1,0,1,1,0;AF=0.333,0.00,0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=18,0,19,14,0;AS_QD=26.98,30.54,33.61,29.38,25.94;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.66;QD=49.61;SOR=1.314;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,0,0,0,0:18:99:796,0,798,798,798,798:0,0,12,6 3/4:0,0,0,19,14,0:33:99:1734,1635,1675,1554,1545,1532,613,667,532,640,1005,1012,984,0,953,1324,1378,1233,662,747,1390:0,0,20,13 +chrX 3077857 . T G 1902 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=31.67;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.95;QD=31.67;SOR=1.197;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:577,0:0,0,15,4 1/1:0,42:42:99:1355,126,0:0,0,22,20 +chrX 3078079 . T C 2564 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=31.25;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.53;QD=31.25;SOR=1.112;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1087,0:0,0,15,19 1/1:0,49:49:99:1507,146,0:0,0,19,30 +chrX 3078121 . A G 2806 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.23;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=32.23;SOR=0.739;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1199,0:0,0,19,20 1/1:0,49:49:99:1637,147,0:0,0,24,25 +chrX 3078239 . G A 559 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=31.00;BaseQRankSum=0;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=3.757;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.00;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=0.916;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,18:19:99:.:589,0:0,1,11,7 0/0:.:54:99:54:0,107,1539 +chrX 3078418 . G A 2921 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.79;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=0.832;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:917,0:0,0,14,15 1/1:0,61:61:99:2034,183,0:0,0,34,27 +chrX 3079028 . C T 2444 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.55;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.55;SOR=0.859;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:546,0:0,0,8,8 1/1:0,60:60:99:1928,179,0:0,0,27,33 +chrX 3079342 . ATT A 1210.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=29.76;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.14;MQRankSum=0;QD=29.76;SOR=0.298;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,16:17:99:488,0:0,1,10,6 1/1:0,25:25:75:762,75,0:0,0,11,14 +chrX 3080005 . A G 1401 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=26.02;BaseQRankSum=-0.731;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;MQRankSum=0;QD=26.02;ReadPosRankSum=-2.006;SOR=1.387;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:697,0:0,0,14,10 1/1:3,28:31:12:734,12,0:2,1,24,4 +chrX 3080255 . CATGAGGTCCGGAGATGCAGACCATCCTGGCCAACATG C 3994.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=30.79;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=44.82;SOR=0.832;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1343,0:0,0,15,15 1/1:0,60:60:99:2691,182,0:0,0,27,33 +chrX 3080433 . T C 2621 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.19;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.31;QD=31.19;SOR=0.922;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:955,0:0,0,18,15 1/1:0,52:52:99:1696,156,0:0,0,20,32 +chrX 3080459 . C T 2661 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.22;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.40;QD=33.22;SOR=0.718;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:978,0:0,0,14,16 1/1:0,51:51:99:1713,153,0:0,0,27,24 +chrX 3080472 . C CA 1607.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=23.87;BaseQRankSum=-0.427;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.066;MQ=59.64;MQRankSum=0;QD=23.87;ReadPosRankSum=1.258;SOR=0.111;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:699,0:1,0,11,17 1/1:1,39:40:92:948,92,0:1,0,23,16 +chrX 3081100 . G A 2715 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.07;BaseQRankSum=2.792;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.07;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=0.368;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,19:20:99:631,0:0,1,10,9 1/1:0,63:63:99:2114,189,0:0,0,25,38 +chrX 3081460 . T C 2146 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.00;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;QD=32.00;SOR=1.098;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:589,0:0,0,12,5 1/1:0,51:51:99:1587,153,0:0,0,28,23 +chrX 3083519 . TATCTATCTATCC T 471.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=1.277;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=24.405;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.093;SOR=3.903;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,450 0/1:19,14:33:99:.:511,0,713:11,8,1,13 +chrX 3083523 . TATCTATCC T,* 1396.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=25,14;AS_QD=33.86,0.00;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.82;SOR=2.613;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,10,0:10:99:451,0,451:0,0,0,10 1/2:0,15,14:29:99:985,561,563,469,0,710:0,0,8,21 +chrX 3084178 . T C 2640 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.56;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.56;SOR=0.846;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:778,0:0,0,15,8 1/1:0,59:59:99:1892,176,0:0,0,29,30 +chrX 3084646 . A G 3016 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=33.47;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.47;SOR=0.959;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1021,0:0,0,13,17 1/1:0,61:61:99:2025,182,0:0,0,27,34 +chrX 3085360 . A T 2320 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.19;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.19;SOR=1.032;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:724,0:0,0,17,5 1/1:0,51:51:99:1626,153,0:0,0,25,26 +chrX 3086602 . G A 2683 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.30;BaseQRankSum=-0.453;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.30;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.351;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:797,0:0,0,8,15 1/1:1,60:61:99:1916,148,0:0,1,28,32 +chrX 3086661 . CA C 2169.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.11;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.11;SOR=0.721;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:497,0:0,0,8,8 1/1:0,55:55:99:1712,165,0:0,0,27,28 +chrX 3087201 . G T 2956 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.46;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=0.878;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1035,0:0,0,13,20 1/1:0,59:59:99:1951,177,0:0,0,29,30 +chrX 3087369 . C T 646 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.07;BaseQRankSum=-0.778;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.995;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.846;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,591 0/1:30,26:56:99:.:676,0,803:15,15,14,12 +chrX 3088564 . CT C 1243.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=25.16;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.16;SOR=0.293;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23:24:99:585,0:1,0,12,11 1/1:0,27:27:81:698,81,0:0,0,15,12 +chrX 3089439 . G T 2541 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.14;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.14;SOR=1.310;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1051,0:0,0,11,21 1/1:0,48:48:99:1520,143,0:0,0,19,29 +chrX 3090231 . T C 2600 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.29;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.29;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:998,0:0,0,16,13 1/1:0,50:50:99:1632,149,0:0,0,23,27 +chrX 3090319 . T A 2589 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.58;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.58;SOR=1.040;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1041,0:0,0,15,17 1/1:0,46:46:99:1578,138,0:0,0,30,16 +chrX 3091047 . GCTAT G 3610.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=27.19;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=0.793;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1535,0:0,0,18,17 1/1:0,47:47:99:2115,142,0:0,0,25,22 +chrX 3091823 . T TGATA 3367.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=30.02;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.25;SOR=0.948;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1328,0:0,0,17,13 1/1:0,47:47:99:2079,141,0:0,0,17,30 +chrX 3092167 . TGATA T 1933.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=28.13;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.10;SOR=0.693;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:690,0:0,0,8,8 1/1:0,32:32:96:1283,96,0:0,0,16,16 +chrX 3092215 . A G 1925 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.14;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.14;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:709,0:0,0,11,11 1/1:0,37:37:99:1246,111,0:0,0,15,22 +chrX 3092459 . C A 2704 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.75;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.75;SOR=0.876;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1132,0:0,0,18,16 1/1:0,47:47:99:1602,141,0:0,0,26,21 +chrX 3092555 . C T 920 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.59;BaseQRankSum=-0.17;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=8.162;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.105;SOR=1.642;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,749 0/1:19,35:54:99:.:950,0,429:10,9,11,24 +chrX 3092653 . G T 2736 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=31.79;BaseQRankSum=2.945;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.267;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.79;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.447;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1102,0:0,0,16,19 1/1:1,51:52:99:1664,145,0:1,0,24,27 +chrX 3093040 . T C 1867 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=21.31;BaseQRankSum=1.351;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=3.180;MQ=59.82;MQRankSum=-0.91;QD=21.31;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.389;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1084,0:0,0,21,13 0/1:26,29:55:99:813,0,649:17,9,14,15 +chrX 3093292 . G A 822 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=30.43;BaseQRankSum=1.815;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.252;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,27:28:99:.:852,0:1,0,14,13 0/0:.:58:78:58:0,78,1206 +chrX 3093681 . G A 611 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.91;BaseQRankSum=-0.8;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.91;ReadPosRankSum=1.909;SOR=0.654;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,799 0/1:19,24:43:99:.:641,0,497:11,8,11,13 +chrX 3093710 . T G 984 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=29.82;BaseQRankSum=-0.483;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.82;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=0.368;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,33:34:99:.:1014,0:1,0,19,14 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3093839 . A C 882 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=30.40;BaseQRankSum=-0.417;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.250;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,29:30:99:.:912,0:0,1,14,15 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3094364 . A G 799 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=33.16;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.16;SOR=0.770;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:829,0:0,0,13,12 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3094991 . T G 977 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=32.48;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.48;SOR=0.892;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:1007,0:0,0,14,17 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3095138 . A C 828 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=34.32;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.32;SOR=0.770;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:858,0:0,0,12,13 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3095346 . A G 772 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=28.64;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.64;SOR=0.693;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:802,0:0,0,14,14 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3095751 . T C 1053 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=28.17;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.32;SOR=0.941;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:1083,0:0,0,14,11 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3095772 . G A 915 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=34.16;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.990;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:945,0:0,0,12,9 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3095881 . T C 867 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=30.93;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.93;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:897,0:0,0,14,15 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3096023 . G A 927 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=31.90;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.90;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:957,0:0,0,16,14 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3096816 . TC T 436.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=31.73;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.73;SOR=1.473;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,15:15:99:.:476,0:0,0,10,5 0/0:.:54:56:54:0,56,1175 +chrX 3098047 . A AACACACACACAC,AACAC,AACACAC 2198.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,15,18;AS_QD=36.10,28.41,32.31;BaseQRankSum=-0.442;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.188;MQ=59.28;MQRankSum=0;QD=44.76;ReadPosRankSum=1.632;SOR=0.416;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16,0,0:16:99:700,0,702,702:0,0,10,6 2/3:1,0,15,18:34:99:1538,1249,1177,466,484,378,399,417,0,309:1,0,13,20 +chrX 3098355 . T TAG 752.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=30.58;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.71;SOR=1.508;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:792,0:0,0,14,7 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3099029 . T C 897 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=30.90;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.90;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:927,0:0,0,16,14 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3100587 . G GTTTTTTGT 800.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=32.62;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.21;SOR=0.793;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,19:19:99:.:840,0:0,0,9,10 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3100644 . T C 1002 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=34.40;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.40;SOR=0.693;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:1032,0:0,0,15,15 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3100884 . C G 590 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=31.00;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.00;SOR=1.127;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:620,0:0,0,8,12 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3101073 . G A 729 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=29.19;BaseQRankSum=-0.454;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=3.736;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.19;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=0.861;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,25:26:99:.:759,0:0,1,15,10 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3101424 . T G 898 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=32.00;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:928,0:0,0,14,15 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3101833 . A G 734 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=34.73;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.73;SOR=0.693;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:764,0:0,0,11,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3102135 . T A,TA 672 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=26,0;AS_QD=27.00,29.92;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.00;SOR=1.220;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26,0:26:99:.:702,0,907:0,0,10,16 0/0:.:54:28:49:0,28,978,28,978,978 +chrX 3102195 . T C 932 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=30.06;BaseQRankSum=1.803;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.813;SOR=0.249;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,31:32:99:.:962,0:1,0,16,15 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3102308 . A G 908 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=32.34;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.34;SOR=1.255;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:938,0:0,0,18,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3102809 . G A 1265 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=36.35;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.76;QD=44.66;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:1295,0:0,0,14,15 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3102826 . G C 1275 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=27.19;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.44;QD=45.00;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:1305,0:0,0,14,15 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3102827 . G A 1309 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=35.27;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.49;QD=44.63;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:1339,0:0,0,14,16 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3102829 . G T 1309 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=28.15;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.49;QD=44.63;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:1339,0:0,0,14,16 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3103757 . T C 664 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=34.70;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.70;SOR=0.892;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:694,0:0,0,9,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3105266 . A G 728 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=30.32;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.32;SOR=0.941;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:758,0:0,0,11,14 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3105324 . C G 869 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=33.30;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.30;SOR=1.781;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:899,0:0,0,8,19 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3107133 . A G 1130 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=31.35;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.35;SOR=0.746;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,37:37:99:.:1160,0:0,0,18,19 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3107696 . A AC 920.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=31.09;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.40;SOR=1.358;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:960,0:0,0,16,9 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3111077 . C T 680 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=33.81;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.81;SOR=1.508;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:710,0:0,0,14,7 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3111344 . G A 1032 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=33.19;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.19;SOR=0.818;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:1062,0:0,0,15,17 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3111440 . T C 869 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=33.30;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.30;SOR=2.066;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:899,0:0,0,7,20 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3112535 . G GGGTCCTAACGAGAAGAGATAATTACAATCAGGCTACCAGAGGAAGCCTTT 589.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=27.35;BaseQRankSum=-0.253;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=10.809;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=2.097;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,21:23:99:.:629,0:2,0,5,16 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3112836 . C T 967 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=34.38;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.38;SOR=1.255;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:997,0:0,0,18,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3113052 . A C 1035 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=31.32;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.32;SOR=0.811;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:1065,0:0,0,16,18 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3113141 . C T 1031 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=30.31;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.31;SOR=1.002;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1061,0:0,0,15,20 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3113291 . G A 918 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=32.69;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;QD=32.69;SOR=1.688;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:948,0:0,0,20,9 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3113320 . G A 1062 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=32.12;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=32.12;SOR=1.418;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:1092,0:0,0,22,12 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3113631 . C T 764 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=31.76;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.76;SOR=1.136;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:794,0:0,0,15,10 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3113701 . G A 858 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=30.62;BaseQRankSum=-0.365;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.62;ReadPosRankSum=-1.375;SOR=0.446;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,28:29:99:.:888,0:1,0,17,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3114013 . A C 759 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=32.88;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=1.802;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:789,0:0,0,7,17 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3114383 . T TC 1001.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=25.56;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.56;SOR=0.765;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:1041,0:0,0,13,14 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3114410 . G A 828 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=31.78;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.78;SOR=0.922;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:858,0:0,0,12,15 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3114472 . A G 704 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=31.91;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.91;SOR=0.776;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:734,0:0,0,12,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3114527 . G T 551 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=34.18;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.18;SOR=1.739;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:581,0:0,0,12,5 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3114583 . C G 854 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=34.00;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.00;SOR=0.693;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:884,0:0,0,13,13 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3114840 . T A 875 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=33.52;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.01;QD=33.52;SOR=0.765;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:905,0:0,0,14,13 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3115354 . C G 856 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=32.81;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.81;SOR=1.101;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:886,0:0,0,11,16 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3115421 . C CA 868.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=33.63;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.63;SOR=0.765;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:908,0:0,0,14,13 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3115443 . C T 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=32.05;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.05;SOR=0.874;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:705,0:0,0,12,10 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3115687 . T C 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=33.42;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;QD=33.42;SOR=1.609;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,19:19:99:.:635,0:0,0,13,6 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3115699 . CAA C 723.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=22.64;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;QD=40.16;SOR=1.609;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,19:19:99:.:763,0:0,0,13,6 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3115901 . T C 595 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=31.25;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.25;SOR=0.693;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:625,0:0,0,10,10 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3116153 . C T 1107 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=32.49;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=0.749;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1137,0:0,0,17,18 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3116325 . G C 89 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=29.75;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=29.75;SOR=0.693;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,4:4:99:.:119,0:0,0,2,2 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3116584 . TA T 246.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=28.60;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.20;QD=28.60;SOR=2.303;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,10:10:99:.:286,0:0,0,2,8 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3116622 . T C 734 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=30.48;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.94;SOR=1.739;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:764,0:0,0,5,12 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3116632 . T C 818 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=32.00;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.40;SOR=2.093;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:848,0:0,0,5,15 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3116678 . G A 750 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=33.91;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.91;SOR=2.030;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:780,0:0,0,6,17 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3116937 . A G 952 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=31.68;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.68;SOR=1.402;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:982,0:0,0,20,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3117005 . A G 1330 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=34.00;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.00;SOR=1.022;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,40:40:99:.:1360,0:0,0,23,17 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3117295 . C G 959 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=31.90;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.38;QD=31.90;SOR=0.892;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:989,0:0,0,14,17 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3117364 . A C 1532 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=30.74;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.31;QD=43.39;SOR=0.804;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1562,0:0,0,17,19 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3117366 . T C 1532 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=31.30;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.73;QD=43.39;SOR=0.804;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1562,0:0,0,17,19 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3117740 . G A 935 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=32.17;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.86;QD=32.17;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:965,0:0,0,16,14 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3117951 . C A 1290 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=33.00;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=33.00;SOR=0.793;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,40:40:99:.:1320,0:0,0,21,19 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3118108 . C T 973 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=33.43;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.43;SOR=0.693;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:1003,0:0,0,15,15 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3118153 . C G 779 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=32.36;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=32.36;SOR=0.941;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:809,0:0,0,14,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3118195 . G A 764 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=33.08;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.08;SOR=0.693;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:794,0:0,0,12,12 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3118287 . T G 858 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=32.89;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=0.765;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:888,0:0,0,14,13 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3118846 . A G 650 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=32.38;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=1.828;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:680,0:0,0,6,15 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3119073 . CT C 961.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=35.32;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.71;SOR=1.270;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:1001,0:0,0,15,9 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3119077 . T C 1006 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=28.25;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.44;SOR=1.358;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:1036,0:0,0,16,9 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3119145 . T A 727 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=28.04;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.04;SOR=1.101;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:757,0:0,0,16,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3119473 . T A 689 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=34.24;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.24;SOR=0.990;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:719,0:0,0,12,9 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3119714 . T C 972 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=31.31;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.31;SOR=1.473;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:1002,0:0,0,21,11 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3120111 . T G 724 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=31.76;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.88;QD=41.89;SOR=0.914;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,18:18:99:.:754,0:0,0,10,8 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3120126 . T C 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=36.91;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.75;QD=45.00;SOR=0.693;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,16:16:99:.:720,0:0,0,8,8 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3120136 . C G 600 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=26.27;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.58;QD=45.00;SOR=0.976;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,14:14:99:.:630,0:0,0,8,6 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3120139 . ATT A 545.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=29.79;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.43;QD=45.00;SOR=0.836;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,13:13:99:.:585,0:0,0,7,6 0/0:.:54:28:49:0,28,978 +chrX 3121072 . C T 1559 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=31.78;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.87;QD=31.78;SOR=0.859;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,50:50:99:.:1589,150,0:0,0,23,27 +chrX 3121230 . T TAG 1174.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=30.57;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=39.95;QD=44.96;SOR=1.302;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,164 1|1:0,27:27:81:.:0|1:3121230_T_TAG:1214,81,0:3121230:0,0,10,17 +chrX 3121232 . C CAG 1175.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=30.92;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.12;QD=45.00;SOR=1.302;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,164 1|1:0,27:27:81:.:0|1:3121230_T_TAG:1215,81,0:3121230:0,0,10,17 +chrX 3121392 . GC G 225.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=32.07;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.35;QD=44.17;SOR=1.329;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,164 1|1:0,6:6:18:.:0|1:3121392_GC_G:265,18,0:3121392:0,0,4,2 +chrX 3121396 . G GA 260.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=31.17;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.48;QD=42.86;SOR=1.609;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,164 1|1:0,7:7:21:.:0|1:3121392_GC_G:300,21,0:3121392:0,0,5,2 +chrX 3121400 . G A 218 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=30.97;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.66;QD=41.33;SOR=2.303;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,164 1|1:0,6:6:18:.:0|1:3121392_GC_G:248,18,0:3121392:0,0,5,1 +chrX 3121421 . A C 318 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=34.80;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.31;QD=34.80;SOR=3.258;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,10:10:30:.:348,30,0:0,0,9,1 +chrX 3121440 . T A 422 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=34.77;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.89;QD=34.77;SOR=2.833;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,13:13:39:.:452,39,0:0,0,11,2 +chrX 3121496 . G A 794 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=29.43;BaseQRankSum=-0.553;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.61;MQRankSum=-1.156;QD=29.43;ReadPosRankSum=0.991;SOR=1.244;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:1,27:28:49:.:824,49,0:1,0,21,6 +chrX 3121545 . C G 1861 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=31.07;BaseQRankSum=-0.605;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.55;MQRankSum=-0.71;QD=42.02;ReadPosRankSum=-1.25;SOR=1.101;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,164 1|1:1,44:45:90:.:0|1:3121545_C_G:1891,90,0:3121545:1,0,33,11 +chrX 3121548 . A G 1885 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=30.68;BaseQRankSum=-0.577;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.69;MQRankSum=-0.699;QD=41.63;ReadPosRankSum=-1.356;SOR=0.997;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,164 1|1:1,45:46:93:.:0|1:3121545_C_G:1915,93,0:3121545:1,0,33,12 +chrX 3121862 . C T 2039 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.83;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.83;SOR=0.925;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,65:65:99:.:2069,195,0:0,0,29,36 +chrX 3121956 . G A 1913 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.38;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.03;QD=32.38;SOR=0.906;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,60:60:99:.:1943,180,0:0,0,33,27 +chrX 3122034 . C G 1064 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=28.79;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.79;QD=28.79;SOR=0.798;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,38:38:99:.:1094,113,0:0,0,18,20 +chrX 3122138 . G A 1604 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=34.77;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.58;QD=34.77;SOR=1.022;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,47:47:99:.:1634,141,0:0,0,20,27 +chrX 3122161 . T G 1573 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.71;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.79;QD=32.71;SOR=0.818;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,49:49:99:.:1603,146,0:0,0,26,23 +chrX 3122360 . A C 2149 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=31.58;BaseQRankSum=-0.492;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.91;MQRankSum=-0.98;QD=31.58;ReadPosRankSum=0.678;SOR=0.368;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:1,68:69:99:.:2179,173,0:1,0,39,29 +chrX 3122389 . TC T 2753.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.85;BaseQRankSum=-0.474;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.57;MQRankSum=-0.773;QD=38.26;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.471;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:1,72:73:99:.:2793,180,0:1,0,44,28 +chrX 3122568 . T C 1915 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.37;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.69;QD=31.37;SOR=0.976;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,62:62:99:.:1945,185,0:0,0,27,35 +chrX 3122659 . T C 1829 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=31.51;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.25;QD=31.51;SOR=1.034;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,59:59:99:.:1859,176,0:0,0,25,34 +chrX 3122905 . T C 1787 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=30.28;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=42.86;QD=30.28;SOR=0.831;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,60:60:99:.:1817,179,0:0,0,28,32 +chrX 3123210 . A G 1207 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=30.17;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.97;QD=30.17;SOR=1.075;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,41:41:99:.:1237,121,0:0,0,24,17 +chrX 3123424 . C T 2055 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=33.10;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.58;QD=33.10;SOR=1.179;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,63:63:99:.:2085,189,0:0,0,38,25 +chrX 3123576 . A G 1692 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=32.49;BaseQRankSum=-0.258;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.49;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.290;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:1,52:53:99:.:1722,125,0:0,1,24,28 +chrX 3123821 . C T 1572 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.69;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.69;SOR=0.733;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,49:49:99:.:1602,147,0:0,0,25,24 +chrX 3124076 . CAAAAAA C 963.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=31.10;BaseQRankSum=-0.711;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.447;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=37.15;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.835;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:3,24:27:23:.:1003,23,0:1,2,14,10 +chrX 3124188 . T G 1749 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=24.55;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.48;SOR=0.793;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,164 1|1:0,40:40:99:.:0|1:3124188_T_G:1779,120,0:3124188:0,0,21,19 +chrX 3124196 . G T 1747 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=32.14;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=0.793;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,164 1|1:0,40:40:99:.:0|1:3124188_T_G:1777,120,0:3124188:0,0,21,19 +chrX 3124511 . T C 1786 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=30.78;BaseQRankSum=1.567;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.78;ReadPosRankSum=-1.527;SOR=0.223;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:1,58:59:99:.:1816,152,0:0,1,29,29 +chrX 3124639 . T G 1219 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=32.03;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.81;QD=32.03;SOR=0.743;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,39:39:99:.:1249,117,0:0,0,19,20 +chrX 3125173 . G A 1702 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=33.31;BaseQRankSum=2.926;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.31;ReadPosRankSum=-1.1;SOR=0.273;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:1,51:52:99:.:1732,146,0:0,1,24,27 +chrX 3125410 . TC T 1868.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=39.17;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.41;SOR=0.994;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,51:51:99:.:1908,152,0:0,0,29,22 +chrX 3125574 . CTT C 1358.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=29.19;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.78;SOR=0.984;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,37:37:99:.:1398,111,0:0,0,16,21 +chrX 3125658 . T C 1793 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.55;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=32.55;SOR=1.199;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,56:56:99:.:1823,167,0:0,0,34,22 +chrX 3125867 . T C 1739 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=32.16;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.16;SOR=0.729;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,55:55:99:.:1769,164,0:0,0,28,27 +chrX 3126022 . T C 1735 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=30.96;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.96;SOR=1.047;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,57:57:99:.:1765,170,0:0,0,24,33 +chrX 3126071 . CA C 1455.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=27.69;BaseQRankSum=1.818;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.69;ReadPosRankSum=1.316;SOR=0.446;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:1,53:54:99:.:1495,136,0:0,1,21,32 +chrX 3126293 . C T 1702 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.31;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.31;SOR=0.941;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 1/1:0,52:52:99:.:1732,156,0:0,0,23,29 +chrX 3126625 . C T 1105 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=31.53;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.54;QD=31.53;SOR=0.804;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1135,0:0,0,17,19 0/0:.:59:85:59:0,85,1105 +chrX 3126901 . AAAAC A 654.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=22.39;BaseQRankSum=-1.63;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.385;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.39;ReadPosRankSum=-0.12;SOR=1.002;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,332 0/1:13,18:31:99:.:694,0,491:7,6,11,7 +chrX 3137133 . A AT 820.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=25.29;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=25.29;SOR=0.693;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:99:32:.:.:0,332 1|1:0,34:34:99:.:0|1:3137133_A_AT:860,101,0:3137133:0,0,17,17 +chrX 3144796 . G GTC 258.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=12.96;BaseQRankSum=-0.997;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=3.834;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.96;ReadPosRankSum=-2.53;SOR=1.139;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,332 0/1:12,11:23:99:.:298,0,344:7,5,4,7 +chrX 3146340 . CTCTTCTTCT C,CTCTTCTTCTTCTTCT 903.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,11;AS_QD=24.13,18.48;BaseQRankSum=-1.393;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=5.685;MQ=59.52;MQRankSum=1.591;QD=27.74;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=0.477;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13,0:13:99:555,0,555:0,0,7,6 0/2:10,0,11:21:99:388,420,821,0,401,369:7,3,4,7 +chrX 3146404 . T TCTC,TCTTCTTCTC 415.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=5,0;AS_QD=16.85,10.95;BaseQRankSum=-1.793;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=4.312;MQ=58.68;MQRankSum=-2.002;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.312;SOR=0.760;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,432,432 0/1:22,5,0:27:99:.:455,0,848,214,758,1190:8,14,3,2 +chrX 3155718 . A ATATC 494.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=23.22;BaseQRankSum=-0.676;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.22;ReadPosRankSum=-0.284;SOR=0.765;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,432 0/1:9,14:23:99:.:534,0,322:5,4,8,6 +chrX 3155790 . GTATC G,GTATCTATC 1201.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=17,14;AS_QD=22.87,19.00;BaseQRankSum=0.323;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.749;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0:17:99:709,0,709:0,0,9,8 0/2:14,0,14:28:99:532,575,1151,0,576,534:8,6,9,5 +chrX 3158638 . C CA,CAA 190.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=6,4;AS_QD=17.69,17.91;BaseQRankSum=-0.444;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=4.752;MQ=59.80;MQRankSum=-0.717;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.793;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,248,248 0/1:7,6,4:17:28:.:230,0,60,33,28,155:5,2,4,6 +chrX 3189855 . GTATATATATA G,GTATATATATATA,GTATATATATATATA,GTATATATATATATATA 1511.97 . AC=1,1,1,0;AF=0.333,0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=22,5,6,0;AS_QD=31.07,27.32,31.03,25.34;BaseQRankSum=-0.418;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=3.136;MQ=59.17;MQRankSum=0;QD=44.31;ReadPosRankSum=1.584;SOR=0.209;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,22,0,0,0:24:99:919,0,950,950,950:0,2,11,11 2/3:0,0,5,6,0:11:85:632,416,376,283,246,228,126,119,0,85,297,274,129,118,334:0,0,6,5 +chrX 3190710 . A G 2748 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.68;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.68;SOR=0.815;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:764,0:0,0,15,9 1/1:0,61:61:99:2014,183,0:0,0,25,36 +chrX 3191148 . CAG C 2337.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.69;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=31.69;SOR=1.240;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:824,0:0,0,17,9 1/1:0,49:49:99:1553,148,0:0,0,29,20 +chrX 3205941 . C G 774 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.17;BaseQRankSum=1.941;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=8.122;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=1.942;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,209 0/1:24,29:53:99:.:804,0,593:12,12,21,8 +chrX 3208875 . T A 513 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=15.08;BaseQRankSum=-0.159;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=1.258;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.08;ReadPosRankSum=1.592;SOR=0.495;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,209 0/1:16,20:36:99:.:543,0,414:9,7,10,10 +chrX 3209190 . G A 935 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.40;BaseQRankSum=1.997;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.937;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.40;ReadPosRankSum=2.405;SOR=0.518;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,209 0/1:32,35:67:99:.:965,0,771:19,13,19,16 +chrX 3209281 . T C 636 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.33;BaseQRankSum=1.024;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.807;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,209 0/1:29,25:54:99:.:666,0,765:13,16,14,11 +chrX 3209387 . A G 828 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.19;BaseQRankSum=-1.539;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.19;ReadPosRankSum=1.111;SOR=0.743;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,209 0/1:22,31:53:99:.:858,0,595:8,14,11,20 +chrX 3209794 . C T 516 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.65;BaseQRankSum=1.856;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=4.677;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.65;ReadPosRankSum=-2.003;SOR=1.324;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,209 0/1:20,20:40:99:.:546,0,465:9,11,13,7 +chrX 3209904 . CATCT CATCTATCT,C 1478.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,15;AS_QD=26.22,19.13;BaseQRankSum=0.495;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=6.289;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.76;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=0.427;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21,0:21:99:944,0,945:0,0,9,12 0/2:15,0,15:30:99:574,620,1236,0,617,571:5,10,10,5 +chrX 3209977 . CATCT C 805.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=20.12;BaseQRankSum=-0.94;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.701;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.12;ReadPosRankSum=1.462;SOR=0.976;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,501 0/1:20,22:42:99:.:845,0,773:9,11,13,9 +chrX 3212035 . C T 884 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.06;BaseQRankSum=1.871;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.002;MQ=56.78;MQRankSum=-1.968;QD=13.06;ReadPosRankSum=2.071;SOR=0.433;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,501 0/1:37,33:70:99:.:914,0,981:15,22,16,17 +chrX 3212799 . C T 974 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=17.02;BaseQRankSum=-1.625;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.025;MQ=59.94;MQRankSum=-0.765;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.481;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,501 0/1:23,36:59:99:.:1004,0,610:13,10,18,18 +chrX 3213202 . TTA T 903.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=22.45;BaseQRankSum=2.448;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=2.659;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.45;ReadPosRankSum=-0.397;SOR=0.368;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,501 0|1:18,24:42:99:.:0|1:3213202_TTA_T:943,0,657:3213202:7,11,12,12 +chrX 3213214 . A G 907 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=21.30;BaseQRankSum=1.277;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.130;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.30;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.527;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,501 0|1:20,24:44:99:.:0|1:3213202_TTA_T:937,0,720:3213202:9,11,12,12 +chrX 3213854 . T TTTC 551.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.43;BaseQRankSum=1.174;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.27;SOR=0.859;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,501 0/1:21,23:44:99:.:591,0,638:11,10,13,10 +chrX 3215107 . T C 809 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.72;BaseQRankSum=-0.326;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.022;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.223;SOR=0.495;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,501 0/1:27,30:57:99:.:839,0,745:16,11,16,14 +chrX 3215916 . T A 747 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=31.08;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.08;SOR=0.770;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:777,0:0,0,12,13 0/0:.:63:99:63:0,113,1549 +chrX 3216471 . G A 1091 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=16.98;BaseQRankSum=0.145;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=3.445;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=1.026;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,357 0/1:25,41:66:99:.:1121,0,611:13,12,17,24 +chrX 3216691 . T G 914 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=17.81;BaseQRankSum=0.163;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.443;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=1.179;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,357 0/1:20,33:53:99:.:944,0,486:10,10,13,20 +chrX 3218113 . C A 524 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.07;BaseQRankSum=0.949;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=12.331;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.052;SOR=1.140;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,357 0/1:33,22:55:99:.:554,0,857:12,21,14,8 +chrX 3218266 . C T 888 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=32.79;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=1.382;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:918,0:0,0,18,10 0/0:.:52:41:52:0,41,1195 +chrX 3218482 . A AG 657.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.15;BaseQRankSum=-0.287;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=10.098;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.73;SOR=1.739;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:26,27:53:99:.:697,0,724:12,14,19,8 +chrX 3218793 . AAGAT A 890.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.60;BaseQRankSum=-2.075;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.114;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.3;SOR=0.914;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:26,24:50:99:.:930,0,999:16,10,16,8 +chrX 3218857 . AAAG A 683.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=16.43;BaseQRankSum=0.794;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.358;MQ=59.88;MQRankSum=-1.101;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.441;SOR=1.035;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:25,19:44:99:.:0|1:3218857_AAAG_A:723,0,986:3218857:18,7,15,4 +chrX 3218874 . AGGAAGGGAGGAAG A 725.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=17.00;BaseQRankSum=0.026;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;MQRankSum=-1.073;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.882;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:25,20:45:99:.:0|1:3218857_AAAG_A:765,0,977:3218857:19,6,16,4 +chrX 3218940 . C A 730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=16.52;BaseQRankSum=1.178;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=6.474;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.191;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:25,21:46:99:.:0|1:3218940_C_A:760,0,919:3218940:18,7,11,10 +chrX 3218958 . AAG A 880.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.40;BaseQRankSum=-0.057;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=8.387;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.27;SOR=0.148;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:26,24:50:99:.:0|1:3218940_C_A:920,0,986:3218940:19,7,12,12 +chrX 3218999 . A G 978 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.38;BaseQRankSum=-1.605;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=7.513;MQ=59.53;MQRankSum=-0.924;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.621;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:25,27:52:99:.:0|1:3218999_A_G:1008,0,907:3218999:16,9,12,15 +chrX 3219011 . AAAGAGAG A 1099.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.71;BaseQRankSum=0.816;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=9.746;MQ=59.56;MQRankSum=-0.91;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=0.800;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:26,29:55:99:.:0|1:3218999_A_G:1139,0,973:3218999:17,9,12,17 +chrX 3219041 . G GAGAAAGA 1092.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=21.77;BaseQRankSum=-0.903;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=7.927;MQ=59.58;MQRankSum=-0.852;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.784;SOR=1.367;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:23,29:52:99:.:1132,0,845:13,10,10,19 +chrX 3219504 . T C 607 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.00;BaseQRankSum=-0.221;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.434;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.17;SOR=0.529;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:24,25:49:99:.:637,0,613:10,14,13,12 +chrX 3219650 . G A 661 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.70;BaseQRankSum=1.067;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.123;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.70;ReadPosRankSum=-1.301;SOR=1.041;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:22,25:47:99:.:691,0,554:12,10,10,15 +chrX 3219872 . T G 790 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.81;BaseQRankSum=0.575;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=2.073;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.997;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:34,30:64:99:.:820,0,939:18,16,18,12 +chrX 3220033 . C G 823 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.54;BaseQRankSum=0.586;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=3.305;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.405;SOR=0.790;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:34,34:68:99:.:853,0,817:15,19,19,15 +chrX 3220156 . T C 738 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.36;BaseQRankSum=-0.61;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=1.142;MQ=59.68;MQRankSum=-0.776;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.432;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:20,30:50:99:.:768,0,491:7,13,13,17 +chrX 3220174 . T G 637 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.27;BaseQRankSum=1.353;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=1.298;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.458;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:18,23:41:99:.:667,0,455:5,13,8,15 +chrX 3220318 . C G 542 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.95;BaseQRankSum=1.763;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=6.684;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.914;SOR=0.545;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:21,20:41:99:.:572,0,577:14,7,9,11 +chrX 3220886 . G A 1007 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=-0.644;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=0.680;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:39,28:67:99:.:0|1:3220886_G_A:1037,0,1551:3220886:18,21,13,15 +chrX 3220892 . C T 1070 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.94;BaseQRankSum=1.243;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.911;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.94;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=0.557;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:39,30:69:99:.:0|1:3220886_G_A:1100,0,1545:3220886:18,21,15,15 +chrX 3220921 . T G 757 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=11.08;BaseQRankSum=-0.757;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.009;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.116;SOR=0.418;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:39,32:71:99:.:787,0,1056:24,15,17,15 +chrX 3221022 . T C 735 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.97;BaseQRankSum=2.276;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=5.296;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.425;SOR=1.353;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:31,28:59:99:.:765,0,756:15,16,18,10 +chrX 3221260 . G T 1099 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=14.11;BaseQRankSum=3.279;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=1.859;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.496;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:39,41:80:99:.:1129,0,905:25,14,24,17 +chrX 3221330 . C T 821 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=11.82;BaseQRankSum=0.676;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.900;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=0.523;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:39,33:72:99:.:851,0,1004:22,17,17,16 +chrX 3221409 . A AT 768.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.84;BaseQRankSum=-0.475;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=15.894;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.84;ReadPosRankSum=-1.032;SOR=0.045;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:20,31:51:99:.:808,0,469:2,18,13,18 +chrX 3221913 . T C 360 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=8.67;BaseQRankSum=-0.02;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=9.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.095;SOR=2.033;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:29,16:45:99:.:390,0,834:15,14,4,12 +chrX 3222441 . T C 968 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.06;BaseQRankSum=-0.066;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.893;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.92;SOR=0.832;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:33,38:71:99:.:998,0,829:18,15,22,16 +chrX 3222872 . A G 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=10.83;BaseQRankSum=-1.947;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.009;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.538;SOR=0.418;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:39,32:71:99:.:769,0,1093:24,15,17,15 +chrX 3223332 . T C 451 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.08;BaseQRankSum=0.026;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.656;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:33,20:53:99:.:481,0,918:13,20,8,12 +chrX 3223507 . T TAAAA 1380.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=24.91;BaseQRankSum=0.413;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=7.728;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.91;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.594;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:21,36:57:99:.:1420,0,774:7,14,20,16 +chrX 3223543 . T C 893 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=15.91;BaseQRankSum=0.742;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=12.011;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.237;SOR=1.512;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:24,34:58:99:.:923,0,575:10,14,23,11 +chrX 3223632 . GA G 535.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.07;BaseQRankSum=0.066;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.614;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.294;SOR=0.517;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:17,27:44:99:.:575,0,291:7,10,14,13 +chrX 3223758 . C G 673 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.15;BaseQRankSum=0.72;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=9.551;MQ=59.60;MQRankSum=-0.75;QD=17.15;ReadPosRankSum=-2.126;SOR=0.861;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:16,25:41:99:.:703,0,393:11,5,10,15 +chrX 3223906 . C T 763 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=22.03;BaseQRankSum=1.003;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=3.018;MQ=58.69;MQRankSum=-0.268;QD=22.03;ReadPosRankSum=-1.334;SOR=1.270;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:15,21:36:99:.:0|1:3223906_C_T:793,0,567:3223906:9,6,15,6 +chrX 3223910 . T C 729 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=21.08;BaseQRankSum=0.121;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=3.157;MQ=58.90;MQRankSum=0.16;QD=21.08;ReadPosRankSum=-0.724;SOR=1.356;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:16,20:36:99:.:0|1:3223906_C_T:759,0,601:3223906:10,6,15,5 +chrX 3223919 . A G 582 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=19.13;BaseQRankSum=-0.968;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.76;MQRankSum=-0.033;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.963;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,362 0|1:16,16:32:99:.:0|1:3223906_C_T:612,0,603:3223906:10,6,11,5 +chrX 3223931 . C CA 130.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=6.80;BaseQRankSum=0.871;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.682;MQ=57.75;MQRankSum=1.417;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.849;SOR=0.715;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:11,14:25:99:.:170,0,147:7,4,6,8 +chrX 3223963 . T C 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=1.83;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=2.555;MQ=58.90;MQRankSum=-0.447;QD=15.00;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=1.148;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:21,24:45:99:.:675,0,515:10,11,9,15 +chrX 3224201 . A AT 573.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=0.191;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.356;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.459;SOR=0.412;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:24,28:52:99:.:613,0,522:15,9,15,13 +chrX 3224334 . T C 773 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.16;BaseQRankSum=-0.111;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.725;SOR=0.756;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:30,31:61:99:.:803,0,765:15,15,15,16 +chrX 3224451 . T TA 786.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.57;BaseQRankSum=0;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.664;SOR=0.819;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:21,26:47:99:.:826,0,627:7,14,8,18 +chrX 3224693 . G A 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.72;BaseQRankSum=1.311;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.767;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:29,25:54:99:.:687,0,786:18,11,16,9 +chrX 3225048 . T G 652 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.12;BaseQRankSum=-0.954;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.698;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:25,27:52:99:.:682,0,674:13,12,13,14 +chrX 3225062 . A G 640 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.14;BaseQRankSum=-1.642;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.612;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:24,27:51:99:.:670,0,640:11,13,13,14 +chrX 3225146 . C T 773 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=17.84;BaseQRankSum=-0.907;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.547;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,362 0/1:16,29:45:99:.:803,0,401:9,7,15,14 +chrX 3225970 . T C 2165 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=20.51;BaseQRankSum=0.65;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=2.703;MQ=59.96;MQRankSum=0;QD=20.51;ReadPosRankSum=2.634;SOR=0.745;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1110,0:0,0,14,18 0/1:35,40:75:99:1085,0,885:19,16,19,21 +chrX 3226768 . C A 2976 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.67;BaseQRankSum=-0.274;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.67;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=0.338;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,33:34:99:1070,0:1,0,19,14 1/1:0,58:58:99:1936,174,0:0,0,32,26 +chrX 3227524 . A G 3084 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.13;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.13;SOR=0.780;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1320,0:0,0,17,21 1/1:0,56:56:99:1794,168,0:0,0,28,28 +chrX 3227655 . A G 3270 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=32.67;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.67;SOR=0.839;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1086,0:0,0,19,16 1/1:0,66:66:99:2214,198,0:0,0,35,31 +chrX 3227783 . T C 2909 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=31.27;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=31.27;SOR=0.736;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:921,0:0,0,15,15 1/1:0,64:64:99:2018,191,0:0,0,31,33 +chrX 3228076 . A G 3281 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=32.46;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=0.952;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:770,0:0,0,8,15 1/1:0,79:79:99:2541,237,0:0,0,37,42 +chrX 3228170 . CT C 708.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.81;BaseQRankSum=1.955;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=13.893;MQ=59.54;MQRankSum=-0.483;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=0.803;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13:13:99:322,0:0,0,6,7 0/1:7,22:29:25:426,0,25:6,1,8,14 +chrX 3230047 . G A 3110 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=32.37;BaseQRankSum=-0.283;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.37;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.240;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,31:32:99:1003,0:0,1,15,16 1/1:0,65:65:99:2137,195,0:0,0,32,33 +chrX 3231007 . C T 2513 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=33.46;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.46;SOR=0.746;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:755,0:0,0,13,9 1/1:0,54:54:99:1788,162,0:0,0,26,28 +chrX 3231317 . C T 2407 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.07;BaseQRankSum=-0.273;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.07;ReadPosRankSum=-1.047;SOR=0.307;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:891,0:0,0,13,15 1/1:1,47:48:99:1546,110,0:0,1,21,26 +chrX 3232030 . T C 2862 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.49;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=1.080;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1132,0:0,0,18,16 1/1:0,55:55:99:1760,164,0:0,0,34,21 +chrX 3232574 . A AT,ATT 1625.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=69,4;AS_QD=24.13,29.19;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=22.81;SOR=1.032;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29,0:29:99:671,0,671:0,0,19,10 1/1:0,40,4:44:51:994,133,0,858,51,841:0,0,23,21 +chrX 3232708 . A G 3250 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=26.14;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.32;SOR=0.864;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1095,0:.:0,0,10,15 1|1:0,49:49:99:0|1:3232708_A_G:2185,147,0:3232708:0,0,24,25 +chrX 3232715 . G T 3500 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=31.47;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=0.850;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1165,0:.:0,0,11,16 1|1:0,53:53:99:0|1:3232708_A_G:2365,160,0:3232708:0,0,26,27 +chrX 3232740 . A C 3584 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=31.32;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.54;SOR=0.863;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1237,0:.:0,0,13,18 1|1:0,56:56:99:0|1:3232708_A_G:2377,169,0:3232708:0,0,27,29 +chrX 3233045 . C T 2576 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.58;BaseQRankSum=-0.241;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.233;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.58;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.426;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,25:26:99:804,0:1,0,11,14 1/1:0,54:54:99:1802,162,0:0,0,26,28 +chrX 3233673 . C T 2163 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.73;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.73;SOR=0.723;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:734,0:0,0,14,9 1/1:0,44:44:99:1459,132,0:0,0,19,25 +chrX 3233775 . G A 2636 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=31.36;BaseQRankSum=2.16;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.36;ReadPosRankSum=-0.681;SOR=0.263;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:941,0:0,0,15,14 1/1:1,55:56:99:1725,158,0:0,1,25,30 +chrX 3233849 . G A 2459 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.75;BaseQRankSum=3.169;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=3.623;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.75;ReadPosRankSum=1.549;SOR=0.707;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:958,0:0,0,18,11 1/1:1,46:47:99:1531,131,0:0,1,25,21 +chrX 3235041 . G A 2794 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=33.62;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.62;SOR=0.741;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:898,0:0,0,14,13 1/1:0,57:57:99:1926,171,0:0,0,27,30 +chrX 3235168 . T G 2321 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=30.93;BaseQRankSum=1.777;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.245;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.93;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.436;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:783,0:0,1,12,15 1/1:0,48:48:99:1568,143,0:0,0,28,20 +chrX 3235433 . T C 2633 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.88;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.821;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:859,0:0,0,10,15 1/1:0,56:56:99:1804,167,0:0,0,28,28 +chrX 3235680 . A T 2969 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.60;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=32.60;SOR=0.737;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1192,0:0,0,21,15 1/1:0,56:56:99:1807,168,0:0,0,26,30 +chrX 3236216 . A G 2968 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=33.31;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.31;SOR=1.046;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1161,0:0,0,20,15 1/1:0,55:55:99:1837,165,0:0,0,32,23 +chrX 3236711 . CT C 3880.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=31.56;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=37.33;SOR=0.876;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:972,0:0,0,9,17 1/1:0,79:79:99:2948,238,0:0,0,39,40 +chrX 3237100 . T G 2705 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.18;BaseQRankSum=2.645;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.18;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.223;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:884,0:0,1,15,12 1/1:0,57:57:99:1851,170,0:0,0,27,30 +chrX 3237947 . C A 1986 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=33.60;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.60;SOR=1.071;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:780,0:0,0,10,13 1/1:0,37:37:99:1236,111,0:0,0,15,22 +chrX 3238046 . C T 2503 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=33.33;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.33;SOR=0.746;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1092,0:0,0,15,17 1/1:0,44:44:99:1441,132,0:0,0,24,20 +chrX 3240082 . T A 2847 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.62;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.62;SOR=0.715;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:903,0:0,0,14,14 1/1:0,63:63:99:1974,189,0:0,0,31,32 +chrX 3240362 . T C 2355 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.13;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.13;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:721,0:0,0,10,12 1/1:0,50:50:99:1664,150,0:0,0,25,25 +chrX 3240411 . G A 750 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=33.91;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.91;SOR=1.179;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:780,0:0,0,14,9 0/0:.:52:57:52:0,57,981 +chrX 3240574 . TTTCCTTCC TTTCC,T 1066.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=11,18;AS_QD=19.04,18.52;BaseQRankSum=-0.63;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=1.579;MQ=59.48;MQRankSum=1.156;QD=25.14;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=0.322;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,0:11:99:495,0,495:0,0,2,9 0/2:15,0,18:33:99:611,656,1252,0,596,541:2,13,5,13 +chrX 3240680 . CTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTCTT C,CTCTT 358.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,7;AS_QD=9.13,17.30;BaseQRankSum=-1.152;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=4.365;MQ=58.52;MQRankSum=1.255;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.238;SOR=1.785;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:99:16:0,315,315 0/2:16,0,7:23:99:.:398,252,935,0,651,627:6,10,1,6 +chrX 3240686 . CTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT C,* 511.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,0;AS_QD=28.73,26.20;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.99;QD=42.38;SOR=0.963;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13,0:13:99:551,0,485:0,0,4,5 0/2:16,0,7:23:99:398,360,1022,0,664,627:6,10,1,6 +chrX 3240690 . CTTTCTTTCTTTCTTTCT *,C 1144.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=11,13;AS_QD=0.00,25.44;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.41;QD=49.33;SOR=1.179;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13,0:13:99:551,0,485:0,0,4,5 1/2:0,11,13:24:99:1184,486,447,470,0,408:0,0,9,15 +chrX 3240753 . T C 1090 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=29.46;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.80;QD=38.62;SOR=1.460;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9:9:99:368,0:0,0,4,5 1/1:0,20:20:62:752,62,0:0,0,6,14 +chrX 3240759 . C T,CTCTT 2027 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=29,0;AS_QD=36.27,29.18;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.26;QD=70.93;SOR=1.460;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9,0:9:99:702,0,485:0,0,4,5 1/1:0,20,0:20:81:1355,102,0,843,81,1125:0,0,6,14 +chrX 3240950 . G GA 3110.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=27.96;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.07;QD=40.38;SOR=0.914;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:727,0:0,0,8,10 1/1:0,60:60:99:2423,181,0:0,0,27,33 +chrX 3241640 . T A 2521 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.71;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=32.71;SOR=1.108;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:774,0:0,0,16,8 1/1:0,54:54:99:1777,162,0:0,0,30,24 +chrX 3242209 . T C 3058 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=31.84;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=31.84;SOR=0.892;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1269,0:0,0,20,20 1/1:0,57:57:99:1819,170,0:0,0,33,24 +chrX 3242357 . C G 4173 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=29.74;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.89;SOR=1.361;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,38:38:99:.:.:1576,0:.:0,0,13,25 1|1:0,60:60:99:0|1:3242357_C_G:2627,181,0:3242357:0,0,23,37 +chrX 3242370 . C T 4123 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=28.03;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.26;SOR=1.190;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,34:34:99:.:.:1467,0:.:0,0,13,21 1|1:0,62:62:99:0|1:3242357_C_G:2686,187,0:3242357:0,0,25,37 +chrX 3242497 . C A 2356 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.68;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.68;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:743,0:0,0,11,12 1/1:0,50:50:99:1643,150,0:0,0,22,28 +chrX 3242756 . C A 2565 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.27;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.27;SOR=1.040;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:749,0:0,0,9,14 1/1:0,55:55:99:1846,165,0:0,0,24,31 +chrX 3242944 . A C 2963 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.89;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=0.906;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:824,0:0,0,15,10 1/1:0,66:66:99:2169,198,0:0,0,35,31 +chrX 3242987 . T C 2737 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=30.74;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.74;SOR=0.784;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:709,0:0,0,11,12 1/1:0,67:67:99:2058,200,0:0,0,32,35 +chrX 3243080 . A G 2468 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.44;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.44;SOR=1.012;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1022,0:0,0,14,17 1/1:0,46:46:99:1476,137,0:0,0,19,27 +chrX 3243352 . C T 2315 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=32.57;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.57;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:878,0:0,0,11,17 1/1:0,44:44:99:1467,132,0:0,0,24,20 +chrX 3243636 . A AGAAG 1497.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=29.01;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.54;SOR=1.609;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13:13:99:541,0:0,0,10,3 1/1:0,24:24:72:996,72,0:0,0,15,9 +chrX 3243725 . GGAGGA G 1735.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=37.25;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.29;SOR=0.843;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:470,0:0,0,2,9 1/1:0,30:30:90:1305,90,0:0,0,20,10 +chrX 3244427 . T C 2456 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=31.87;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.87;SOR=0.855;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:914,0:0,0,11,18 1/1:0,49:49:99:1572,146,0:0,0,25,24 +chrX 3245311 . C T 2916 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.37;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.37;SOR=0.715;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:847,0:0,0,17,10 1/1:0,64:64:99:2099,192,0:0,0,28,36 +chrX 3247027 . T C 2750 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=33.49;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.49;SOR=0.717;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1043,0:0,0,15,15 1/1:0,53:53:99:1737,159,0:0,0,26,27 +chrX 3249061 . T C 2396 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.51;BaseQRankSum=-0.479;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.51;ReadPosRankSum=0.616;SOR=0.293;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1062,0:0,0,18,14 1/1:1,44:45:99:1364,100,0:1,0,23,21 +chrX 3249968 . G A 2620 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.13;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.13;SOR=0.850;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1102,0:0,0,15,17 1/1:0,48:48:99:1548,144,0:0,0,28,20 +chrX 3252169 . AT A 3431.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=28.81;BaseQRankSum=-0.231;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.54;ReadPosRankSum=-1.549;SOR=0.371;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:972,0:1,0,17,10 1/1:0,67:67:99:2499,202,0:0,0,37,30 +chrX 3254114 . CAG C 1191.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=31.56;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.56;SOR=1.096;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:538,0:0,0,7,10 1/1:0,22:22:67:693,67,0:0,0,9,13 +chrX 3254579 . G A 565 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=9.44;BaseQRankSum=0.265;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.542;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=1.159;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,522 0/1:39,24:63:99:.:595,0,1061:17,22,8,16 +chrX 3255869 . G C 2123 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=32.13;BaseQRankSum=2.329;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.13;ReadPosRankSum=-1.33;SOR=0.373;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:814,0:0,0,9,15 1/1:1,42:43:99:1339,118,0:0,1,19,23 +chrX 3259377 . T C 2838 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.35;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.35;SOR=1.065;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:899,0:0,0,15,12 1/1:0,59:59:99:1969,177,0:0,0,35,24 +chrX 3262230 . G GGT 264.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=10.48;BaseQRankSum=-1.142;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=5.649;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.349;SOR=1.184;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,154 0/1:15,14:29:99:.:304,0,345:9,6,5,9 +chrX 3267520 . C A 483 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.15;BaseQRankSum=2.695;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.720;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,154 0/1:27,19:46:99:.:513,0,660:13,14,9,10 +chrX 3272026 . G A 560 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.11;BaseQRankSum=-0.379;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.154;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.239;SOR=0.982;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,154 0/1:23,22:45:99:.:590,0,617:11,12,9,13 +chrX 3279507 . TTTATTA T 1125.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=29.54;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.61;SOR=0.693;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:599,0:0,0,8,6 1/1:0,14:14:42:566,42,0:0,0,6,8 +chrX 3289722 . C T 848 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.57;BaseQRankSum=0.944;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;MQRankSum=-0.804;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.592;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,307 0/1:22,31:53:99:.:878,0,555:10,12,15,16 +chrX 3293307 . T G 2568 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.48;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;QD=32.48;SOR=1.096;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1101,0:0,0,18,17 1/1:0,45:45:99:1497,135,0:0,0,29,16 +chrX 3294258 . A C 2039 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=33.37;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.37;SOR=0.899;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:672,0:0,0,12,8 1/1:0,42:42:99:1397,126,0:0,0,22,20 +chrX 3294383 . C G 2393 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=30.29;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.29;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:748,0:0,0,13,11 1/1:0,56:56:99:1675,166,0:0,0,29,27 +chrX 3294540 . T A 2571 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.35;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.35;SOR=0.976;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:968,0:0,0,9,20 1/1:0,49:49:99:1633,147,0:0,0,25,24 +chrX 3294782 . G A 2696 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.84;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.84;SOR=0.928;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:673,0:0,0,11,10 1/1:0,62:62:99:2053,186,0:0,0,35,27 +chrX 3294892 . A G 2302 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=32.39;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.39;SOR=0.934;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:789,0:0,0,14,10 1/1:0,48:48:99:1543,144,0:0,0,26,22 +chrX 3295019 . A G 2790 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=29.68;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=29.68;SOR=0.848;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:828,0:0,0,17,10 1/1:0,68:68:99:1992,202,0:0,0,34,34 +chrX 3295475 . G T 3155 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=32.17;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.17;SOR=0.888;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1013,0:0,0,17,13 1/1:0,69:69:99:2172,206,0:0,0,37,32 +chrX 3295541 . G A 3180 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=32.76;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.76;SOR=0.914;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:938,0:0,0,14,15 1/1:0,69:69:99:2272,207,0:0,0,30,39 +chrX 3295762 . C T 2452 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=34.47;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.47;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:849,0:0,0,13,12 1/1:0,47:47:99:1633,141,0:0,0,24,23 +chrX 3295870 . A G 2737 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=31.80;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.80;SOR=1.090;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:913,0:0,0,17,12 1/1:0,58:58:99:1854,173,0:0,0,34,24 +chrX 3296135 . C A 2619 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.92;BaseQRankSum=1.853;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.92;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.339;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:889,0:0,1,11,17 1/1:0,54:54:99:1760,162,0:0,0,25,29 +chrX 3296271 . T G 2976 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=32.32;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.32;SOR=0.953;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:873,0:0,0,13,14 1/1:0,66:66:99:2133,198,0:0,0,39,27 +chrX 3296772 . T TTTTA 3610.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=29.81;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.98;SOR=0.818;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:967,0:0,0,14,8 1/1:0,61:61:99:2683,183,0:0,0,30,31 +chrX 3296914 . T A 2688 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.15;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.15;SOR=0.961;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:979,0:0,0,18,12 1/1:0,52:52:99:1739,156,0:0,0,28,24 +chrX 3296925 . A G 2738 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.95;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.95;SOR=0.791;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:981,0:0,0,16,14 1/1:0,54:54:99:1787,162,0:0,0,28,26 +chrX 3297359 . G A 2607 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.16;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.16;SOR=0.961;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:986,0:0,0,16,15 1/1:0,51:51:99:1651,153,0:0,0,20,31 +chrX 3297408 . T A 2679 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.44;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.44;SOR=0.821;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:923,0:0,0,13,15 1/1:0,53:53:99:1786,159,0:0,0,25,28 +chrX 3297450 . A T 2879 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=33.44;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.44;SOR=0.863;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:849,0:0,0,11,14 1/1:0,62:62:99:2060,186,0:0,0,36,26 +chrX 3297611 . T C 2093 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=31.69;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.69;SOR=0.917;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:431,0:0,0,8,6 1/1:0,53:53:99:1692,158,0:0,0,22,31 +chrX 3297784 . A G 2345 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.25;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;QD=31.25;SOR=0.801;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:457,0:0,0,5,9 1/1:0,62:62:99:1918,186,0:0,0,31,31 +chrX 3297919 . A G 2385 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.54;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.54;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:521,0:0,0,8,7 1/1:0,57:57:99:1894,171,0:0,0,27,30 +chrX 3297974 . T C 2590 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.95;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.95;SOR=0.902;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:824,0:0,0,13,12 1/1:0,57:57:99:1796,171,0:0,0,24,33 +chrX 3298019 . C G 2624 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.37;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.37;SOR=0.793;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:863,0:0,0,14,12 1/1:0,56:56:99:1791,168,0:0,0,25,31 +chrX 3298076 . A G 2778 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=33.43;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.43;SOR=0.843;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:823,0:0,0,14,10 1/1:0,60:60:99:1985,180,0:0,0,31,29 +chrX 3298181 . C T 2703 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=31.41;BaseQRankSum=-0.424;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.061;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.41;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.297;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:863,0:1,0,11,17 1/1:0,58:58:99:1870,174,0:0,0,31,27 +chrX 3298216 . T C 2684 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.56;BaseQRankSum=-0.364;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.112;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.56;ReadPosRankSum=1.376;SOR=0.335;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:873,0:1,0,10,18 1/1:0,57:57:99:1841,170,0:0,0,31,26 +chrX 3298268 . C A 2922 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=33.55;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.55;SOR=0.941;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,12,13 1/1:0,63:63:99:2123,189,0:0,0,37,26 +chrX 3298285 . A G 2825 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.44;BaseQRankSum=2.038;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.317;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.44;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=0.483;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:776,0:0,0,9,14 1/1:1,64:65:99:2079,171,0:0,1,38,26 +chrX 3298524 . C T 3006 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=33.36;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.36;SOR=0.807;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:794,0:0,0,14,10 1/1:0,67:67:99:2242,201,0:0,0,34,33 +chrX 3298682 . A G 2496 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.81;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.81;SOR=0.948;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1057,0:0,0,16,17 1/1:0,44:44:99:1469,132,0:0,0,18,26 +chrX 3298867 . G A 2472 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=33.81;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.81;SOR=1.209;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:849,0:0,0,15,10 1/1:0,49:49:99:1653,147,0:0,0,30,19 +chrX 3299138 . A T 4194 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=27.61;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.94;SOR=0.780;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,37:37:99:.:.:1660,0:.:0,0,17,20 1|1:0,57:57:99:0|1:3299138_A_T:2564,172,0:3299138:0,0,28,29 +chrX 3299139 . G A 4194 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=22.42;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.94;SOR=0.780;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,37:37:99:.:.:1660,0:.:0,0,17,20 1|1:0,57:57:99:0|1:3299138_A_T:2564,172,0:3299138:0,0,28,29 +chrX 3299911 . G GGA,GGAGA,GGAGAGA 2487.97 . AC=2,0,1;AF=0.667,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=45,1,23;AS_QD=29.23,28.86,30.63;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=36.62;SOR=0.781;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23,0,0:23:99:774,0,774,774:0,0,9,14 1/3:0,22,1,23:46:99:1753,979,898,1401,719,1326,744,0,702,852:0,0,27,19 +chrX 3299964 . T C 2349 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.30;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.30;SOR=0.801;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:937,0:0,0,11,18 1/1:0,47:47:99:1442,140,0:0,0,29,18 +chrX 3300311 . A G 2595 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.41;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.41;SOR=0.995;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1007,0:0,0,18,13 1/1:0,50:50:99:1618,149,0:0,0,28,22 +chrX 3300329 . G T 2838 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.35;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.35;SOR=1.065;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1142,0:0,0,21,13 1/1:0,52:52:99:1726,156,0:0,0,29,23 +chrX 3300567 . G A 2404 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=34.28;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.28;SOR=0.721;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1007,0:0,0,16,13 1/1:0,42:42:99:1427,126,0:0,0,19,23 +chrX 3300704 . G A 2812 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.30;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.30;SOR=0.836;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1042,0:0,0,12,21 1/1:0,55:55:99:1800,164,0:0,0,29,26 +chrX 3300766 . T C 3902 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=28.37;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=0.965;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,37:37:99:.:.:1614,0:.:0,0,15,22 1|1:0,52:52:99:0|1:3300766_T_C:2318,157,0:3300766:0,0,24,28 +chrX 3300773 . T C 3913 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=28.87;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=1.022;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:1565,0:.:0,0,13,22 1|1:0,54:54:99:0|1:3300766_T_C:2378,163,0:3300766:0,0,25,29 +chrX 3301000 . A C 2462 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.36;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.36;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:665,0:0,0,7,13 1/1:0,57:57:99:1827,170,0:0,0,35,22 +chrX 3301088 . G A 2577 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.42;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=0.855;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:790,0:0,0,8,15 1/1:0,55:55:99:1817,165,0:0,0,28,27 +chrX 3301235 . A C 2553 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.29;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.29;SOR=0.743;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:808,0:0,0,15,11 1/1:0,54:54:99:1775,162,0:0,0,26,28 +chrX 3301302 . T C 2509 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.14;BaseQRankSum=-0.514;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.14;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.410;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,30:31:99:912,0:1,0,22,8 1/1:0,48:48:99:1627,144,0:0,0,24,24 +chrX 3301496 . G A 2946 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=29.07;BaseQRankSum=-0.141;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=42.51;ReadPosRankSum=-1.541;SOR=0.316;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,26:27:99:.:.:1061,0:.:0,1,12,14 1|1:0,43:43:99:0|1:3301496_G_A:1915,129,0:3301496:0,0,19,24 +chrX 3301503 . G A 2913 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=28.80;BaseQRankSum=-0.151;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=42.65;ReadPosRankSum=-1.156;SOR=0.302;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,25:26:99:.:.:1028,0:.:0,1,12,13 1|1:0,43:43:99:0|1:3301496_G_A:1915,129,0:3301496:0,0,19,24 +chrX 3301746 . G T 3518 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.97;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.35;SOR=1.310;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1150,0:.:0,0,18,8 1|1:0,54:54:99:0|1:3301746_G_T:2398,163,0:3301746:0,0,32,22 +chrX 3301750 . C T 3469 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.09;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.86;SOR=1.252;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1125,0:.:0,0,17,8 1|1:0,53:53:99:0|1:3301746_G_T:2374,160,0:3301746:0,0,31,22 +chrX 3301764 . G A 2421 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=33.12;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.12;SOR=1.288;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:824,0:0,0,16,8 1/1:0,50:50:99:1627,149,0:0,0,30,20 +chrX 3301815 . C CT 2069.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=28.12;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.12;SOR=0.774;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:711,0:0,0,16,9 1/1:0,50:50:99:1398,150,0:0,0,23,27 +chrX 3301905 . C T 2316 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.70;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.70;SOR=1.134;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:878,0:0,0,9,18 1/1:0,47:47:99:1468,140,0:0,0,21,26 +chrX 3302058 . A G 2346 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.68;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.68;SOR=0.955;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:888,0:0,0,14,14 1/1:0,47:47:99:1488,141,0:0,0,28,19 +chrX 3302630 . C G 2888 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.07;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.07;SOR=0.906;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1359,0:0,0,20,24 1/1:0,47:47:99:1559,141,0:0,0,21,26 +chrX 3302678 . G A 2978 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=33.42;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=0.784;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1226,0:0,0,14,23 1/1:0,53:53:99:1782,159,0:0,0,29,24 +chrX 3302702 . A G 2906 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.99;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.99;SOR=0.809;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1051,0:0,0,11,22 1/1:0,56:56:99:1885,168,0:0,0,31,25 +chrX 3302880 . T C 2913 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.34;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.34;SOR=0.760;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:799,0:0,0,11,14 1/1:0,66:66:99:2144,198,0:0,0,33,33 +chrX 3303016 . T C 2253 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.61;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.61;SOR=0.811;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:803,0:0,0,15,11 1/1:0,44:44:99:1480,132,0:0,0,18,26 +chrX 3303067 . CAGGCTTCTCACTG C 3326.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=25.50;BaseQRankSum=-0.495;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.424;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.71;ReadPosRankSum=0.949;SOR=0.565;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1080,0:0,0,12,12 1/1:1,52:53:99:2286,115,0:1,0,22,30 +chrX 3303097 . A C 2409 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=29.74;BaseQRankSum=-0.811;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.697;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.74;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.757;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:827,0:0,0,12,15 1/1:1,54:55:99:1612,130,0:1,0,22,32 +chrX 3303200 . C T 2242 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.00;BaseQRankSum=1.953;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.00;ReadPosRankSum=1.311;SOR=0.844;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:650,0:0,0,9,11 1/1:2,49:51:99:1622,109,0:1,1,28,21 +chrX 3303265 . T C 2423 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=31.45;BaseQRankSum=-0.584;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.358;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.45;ReadPosRankSum=-1.21;SOR=0.517;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:847,0:0,0,13,12 1/1:1,52:53:99:1606,124,0:0,1,29,23 +chrX 3303394 . CAA C 563.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=17.74;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=38.320;MQ=58.41;MQRankSum=0.842;QD=17.74;SOR=2.689;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,6:10:79:79,0:0,4,4,2 1/1:3,21:24:13:524,13,0:0,3,18,3 +chrX 3303440 . A G 2398 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.26;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.25;QD=33.26;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:674,0:0,0,10,10 1/1:0,53:53:99:1754,159,0:0,0,30,23 +chrX 3303559 . A G 3482 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=109;AS_QD=32.22;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.22;SOR=0.956;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:967,0:0,0,13,18 1/1:0,78:78:99:2545,233,0:0,0,35,43 +chrX 3303783 . G A 2101 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=30.44;BaseQRankSum=2.601;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.44;ReadPosRankSum=0.874;SOR=1.098;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,28:30:99:866,0:1,1,19,9 1/1:0,40:40:99:1265,119,0:0,0,21,19 +chrX 3303896 . T C 2371 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.35;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.35;SOR=1.002;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1052,0:0,0,19,13 1/1:0,40:40:99:1349,120,0:0,0,22,18 +chrX 3304088 . G A 2185 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.10;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.10;SOR=0.980;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:897,0:0,0,8,19 1/1:0,42:42:99:1318,125,0:0,0,22,20 +chrX 3304107 . C G 2198 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.76;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.76;SOR=1.098;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:958,0:0,0,9,20 1/1:0,39:39:99:1270,117,0:0,0,19,20 +chrX 3304130 . C A,CAA 2104 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=57,0;AS_QD=30.92,34.84;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.44;SOR=0.960;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24,0:24:99:872,0,951:0,0,8,16 1/1:0,33,0:33:99:1262,111,0,1201,102,1335:0,0,17,16 +chrX 3304191 . G A 2290 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=32.22;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.22;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:640,0:0,0,6,13 1/1:0,53:53:99:1680,158,0:0,0,31,22 +chrX 3304251 . T C 2515 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=33.05;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.05;SOR=1.012;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:644,0:0,0,8,12 1/1:0,57:57:99:1901,171,0:0,0,36,21 +chrX 3304397 . A G 2390 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.70;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.70;SOR=0.992;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:650,0:0,0,10,10 1/1:0,54:54:99:1770,162,0:0,0,32,22 +chrX 3304460 . T C 2444 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=30.54;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.54;SOR=0.876;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:576,0:0,0,10,8 1/1:0,63:63:99:1898,188,0:0,0,34,29 +chrX 3304506 . T G 2554 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.90;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=31.90;SOR=0.718;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:591,0:0,0,9,8 1/1:0,64:64:99:1993,191,0:0,0,31,33 +chrX 3305115 . G A 2718 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.33;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.33;SOR=0.922;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1121,0:0,0,20,14 1/1:0,51:51:99:1627,153,0:0,0,27,24 +chrX 3305452 . C T 2613 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.63;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.63;SOR=0.768;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:809,0:0,0,14,11 1/1:0,56:56:99:1834,167,0:0,0,25,31 +chrX 3305602 . A G 2557 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=33.60;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;QD=33.60;SOR=1.150;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1022,0:0,0,17,13 1/1:0,47:47:99:1565,141,0:0,0,29,18 +chrX 3305684 . T C 2910 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.96;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.96;SOR=1.038;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1080,0:0,0,19,16 1/1:0,57:57:99:1860,170,0:0,0,34,23 +chrX 3305828 . CT C 3849.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=34.42;DP=119;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.42;SOR=0.862;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1203,0:0,0,17,18 1/1:0,78:78:99:2686,235,0:0,0,35,43 +chrX 3305845 . C T 3509 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=31.88;DP=115;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.88;SOR=0.951;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1047,0:0,0,15,18 1/1:0,78:78:99:2492,234,0:0,0,34,44 +chrX 3306164 . G A 2398 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=28.56;BaseQRankSum=-1.413;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.872;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=0.833;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1440,0:.:0,0,12,20 0|1:27,26:53:99:0|1:3306164_G_A:988,0,1034:3306164:13,14,14,12 +chrX 3306165 . G A 2398 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=28.56;BaseQRankSum=-1.458;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.872;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.833;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1440,0:.:0,0,12,20 0|1:27,26:53:99:0|1:3306164_G_A:988,0,1034:3306164:13,14,14,12 +chrX 3306179 . C A 1743 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=20.15;BaseQRankSum=-1.193;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.857;SOR=0.756;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1092,0:0,0,14,20 0/1:28,26:54:99:681,0,780:13,15,13,13 +chrX 3306216 . A G 1804 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=19.93;BaseQRankSum=0.293;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.853;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.570;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1008,0:0,0,10,20 0/1:30,32:62:99:826,0,777:11,19,15,17 +chrX 3306839 . CATCTATCT C 565.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=25.62;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.21;SOR=2.303;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,14:14:99:.:605,0:0,0,3,11 0/0:.:61:72:61:0,72,1420 +chrX 3306946 . TC T 1697.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=26.72;BaseQRankSum=0.789;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;MQRankSum=-0.145;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.808;SOR=0.704;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1106,0:.:0,0,13,12 0|1:23,17:40:99:0|1:3306946_TC_T:631,0,901:3306946:11,12,7,10 +chrX 3306958 . C CA 1840.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=28.48;BaseQRankSum=1.547;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.40;MQRankSum=-0.507;QD=28.48;ReadPosRankSum=1.879;SOR=0.828;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1071,0:.:0,0,12,12 0|1:21,21:42:99:0|1:3306946_TC_T:809,0,814:3306946:10,11,8,13 +chrX 3306959 . T TCTATC 1885.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=28.73;BaseQRankSum=0.906;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.01;MQRankSum=-0.507;QD=28.73;ReadPosRankSum=1.111;SOR=0.776;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1116,0:.:0,0,13,12 0|1:21,21:42:99:0|1:3306946_TC_T:809,0,819:3306946:10,11,8,13 +chrX 3306962 . G C,GTATC 2386 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=42,15;AS_QD=28.13,26.87;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.97;QD=42.39;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22,0:22:99:990,0,990:0,0,12,10 1/2:0,20,15:35:99:1426,618,853,808,0,763:0,0,15,20 +chrX 3306974 . C G 1826 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=26.51;BaseQRankSum=-0.865;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.98;MQRankSum=-0.552;QD=26.51;ReadPosRankSum=0.17;SOR=0.625;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:1014,0:.:0,0,13,10 0|1:24,23:47:99:0|1:3306946_TC_T:842,0,887:3306946:11,13,9,14 +chrX 3307023 . CTATCTATCTATG C 804.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=25.22;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.72;QD=44.42;SOR=0.793;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,19:19:99:.:844,0:0,0,10,9 0/0:.:42:69:42:0,69,1035 +chrX 3307035 . GTATC *,G 760.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,21;AS_QD=0.00,21.05;BaseQRankSum=-0.111;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.621;SOR=0.892;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19,0:19:99:.:.:844,0,844:.:0,0,10,9 0|2:17,0,21:38:99:0|1:3307035_GTATC_G:800,586,1253,0,703,640:3307035:8,9,1,6 +chrX 3307055 . GTATCTATGTATC G 184.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=10.18;BaseQRankSum=0.369;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=7.829;MQ=59.75;MQRankSum=0;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.481;SOR=2.568;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,268 0|1:15,7:22:99:.:0|1:3307035_GTATC_G:224,0,608:3307035:8,7,1,6 +chrX 3307063 . GTATC *,G 872.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,7;AS_QD=0.00,25.59;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=65.14;SOR=1.329;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,268,268 1/2:0,7,7:14:99:.:912,282,527,283,0,778:0,0,5,9 +chrX 3307424 . T TTATC 1906.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=25.61;BaseQRankSum=-1.815;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.916;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.941;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:1204,0:0,0,12,15 0/1:29,20:49:99:742,0,1158:14,15,8,12 +chrX 3310370 . G A 1331 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=17.01;BaseQRankSum=0.323;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=26.099;MQ=46.11;MQRankSum=-1.583;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.467;SOR=1.945;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:828,0:0,0,4,22 0/1:32,22:54:99:533,0,848:20,12,9,13 +chrX 3310612 . G C 466 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=11.53;BaseQRankSum=1.275;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=7.009;MQ=53.11;MQRankSum=-5.275;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.277;SOR=1.744;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,6:6:99:.:.:270,0:.:0,0,4,2 0|1:29,8:37:99:0|1:3310612_G_C:226,0,1192:3310612:14,15,6,2 +chrX 3310622 . G C 402 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=10.29;BaseQRankSum=1.096;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=13.819;MQ=53.39;MQRankSum=-4.814;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.677;SOR=2.655;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,6:6:99:.:.:270,0:.:0,0,4,2 0|1:30,6:36:99:0|1:3310612_G_C:162,0,1230:3310612:14,16,6,0 +chrX 3310850 . A G 1214 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=15.55;BaseQRankSum=0.275;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.840;MQ=56.80;MQRankSum=-5.008;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.577;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:628,0:0,0,10,9 0/1:36,25:61:99:616,0,998:20,16,13,12 +chrX 3311993 . A T 1653 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=19.13;BaseQRankSum=2.38;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.840;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.866;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:878,0:0,0,14,13 0/1:32,29:61:99:805,0,829:15,17,10,19 +chrX 3312259 . C G 1327 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=15.96;BaseQRankSum=-0.399;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.792;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.465;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:864,0:0,0,13,13 0/1:38,21:59:99:493,0,1053:22,16,11,10 +chrX 3312730 . GT G 1373.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=19.63;BaseQRankSum=-1.075;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=5.246;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.947;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:842,0:0,0,12,16 0/1:21,23:44:99:571,0,506:12,9,9,14 +chrX 3313217 . A G 1556 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=19.11;BaseQRankSum=2.152;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=14.422;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.479;SOR=1.462;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32:33:99:992,0:1,0,13,19 0/1:28,22:50:99:594,0,802:16,12,5,17 +chrX 3313317 . C T 1752 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=18.00;BaseQRankSum=-0.923;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=21.405;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.674;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1097,0:0,0,13,20 0/1:38,28:66:99:685,0,1028:27,11,13,15 +chrX 3313370 . C T 2197 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=24.47;BaseQRankSum=-1.606;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=8.808;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=0.237;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1121,0:.:0,0,14,13 0|1:34,30:64:99:0|1:3313370_C_T:1106,0,1262:3313370:23,11,15,15 +chrX 3313394 . G A 2255 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=25.11;BaseQRankSum=-3.098;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=7.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.11;ReadPosRankSum=-1.021;SOR=0.572;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1130,0:.:0,0,12,15 0|1:32,32:64:99:0|1:3313370_C_T:1155,0,1183:3313370:20,12,15,17 +chrX 3313539 . T C 1181 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=13.46;BaseQRankSum=-1.176;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=1.740;MQ=59.94;MQRankSum=0.658;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=0.972;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:892,0:0,0,9,20 0/1:44,17:61:99:319,0,1213:20,24,9,8 +chrX 3313809 . G A 1673 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=15.77;BaseQRankSum=-1.16;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=6.240;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=1.247;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:923,0:0,0,19,10 0/1:45,34:79:99:780,0,1172:22,23,20,14 +chrX 3314063 . A G 1797 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=19.23;BaseQRankSum=-0.485;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.747;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.534;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:978,0:0,0,16,13 0/1:34,32:66:99:849,0,944:15,19,15,17 +chrX 3314280 . A C 2067 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=19.78;BaseQRankSum=0.723;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.633;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.542;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:998,0:0,0,20,9 0/1:37,40:77:99:1099,0,934:22,15,18,22 +chrX 3314658 . C A 1614 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=21.35;BaseQRankSum=1.344;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=4.883;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.891;SOR=0.791;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1027,0:0,0,16,15 0/1:24,22:46:99:617,0,641:10,14,14,8 +chrX 3314881 . CAGAT CAGATAGAT,C 1794.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,7;AS_QD=27.14,31.00;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=42.65;SOR=0.739;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,0:18:99:809,0,810:0,0,7,11 1/2:0,18,7:25:99:1025,285,231,743,0,860:0,0,15,10 +chrX 3315071 . C A 1310 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=21.97;BaseQRankSum=1.769;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.97;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.739;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:854,0:0,0,12,14 0/1:18,17:35:99:486,0,489:9,9,9,8 +chrX 3315141 . C T 1220 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=18.38;BaseQRankSum=3.742;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.955;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.38;ReadPosRankSum=1.008;SOR=0.545;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,26:28:99:849,0:2,0,11,15 0/1:24,16:40:99:401,0,694:14,10,13,3 +chrX 3315305 . A AC 1218.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=32.20;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.73;QD=43.38;SOR=1.255;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:1258,0:0,0,11,18 0/0:.:56:69:56:0,69,1035 +chrX 3315306 . A AGAC 1218.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=28.74;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.66;QD=43.38;SOR=1.255;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:1258,0:0,0,11,18 0/0:.:65:0:65:0,0,25 +chrX 3315340 . A AGAT 905.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=30.29;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.80;QD=45.00;SOR=0.784;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:945,0:0,0,10,11 0/0:.:57:0:57:0,0,1504 +chrX 3315347 . T TA 815.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=24.55;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.17;QD=45.00;SOR=1.022;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,19:19:99:.:855,0:0,0,8,11 0/0:.:58:67:58:0,67,1641 +chrX 3315363 . AGATAGATAGAATAGATAGATAGATAGAT A 128.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=3.82;BaseQRankSum=0.345;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=1.664;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=3.82;ReadPosRankSum=-1.959;SOR=1.220;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:15:45:15:.:.:0,45 0|1:37,7:44:99:.:0|1:3315363_AGATAGATAGAATAGATAGATAGATAGAT_A:168,0,1482:3315363:21,16,5,2 +chrX 3315373 . A ATAGATAGATAGATAGATGAAATAGGTAGAAGGATGGATAGATGATGG,* 995.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=23,0;AS_QD=25.48,25.63;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.98;QD=45.00;SOR=0.687;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23,0:23:99:.:.:1035,0,1035:.:0,0,12,11 0|2:37,0,7:44:99:0|1:3315363_AGATAGATAGAATAGATAGATAGATAGAT_A:168,279,1784,0,1504,1482:3315363:21,16,5,2 +chrX 3315391 . T TGATAGATAGATA,* 772.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,0;AS_QD=25.14,33.15;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=2.194;MQ=53.81;QD=42.74;SOR=1.077;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19,0:19:99:.:.:812,0,813:.:0,0,12,7 0|2:37,0,7:44:99:0|1:3315363_AGATAGATAGAATAGATAGATAGATAGAT_A:168,279,1784,0,1504,1482:3315363:21,16,5,2 +chrX 3315468 . T C 2830 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=28.04;BaseQRankSum=0.136;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.837;MQ=58.84;MQRankSum=-1.969;QD=28.04;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.927;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,38:38:99:.:.:1618,0:.:0,0,20,18 0|1:31,33:64:99:0|1:3315468_T_C:1242,0,1116:3315468:15,16,20,13 +chrX 3315488 . A T 2665 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=27.78;BaseQRankSum=0.401;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=7.004;MQ=59.17;MQRankSum=-1.77;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.96;SOR=0.699;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,34:34:99:.:.:1489,0:.:0,0,18,16 0|1:32,31:63:99:0|1:3315468_T_C:1206,0,1205:3315468:13,19,18,13 +chrX 3315531 . C T 2003 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=22.59;BaseQRankSum=-0.858;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=7.272;MQ=59.22;MQRankSum=-1.771;QD=22.59;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.332;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:968,0:.:0,0,14,15 0|1:31,30:61:99:0|1:3315468_T_C:1065,0,1109:3315468:11,20,16,14 +chrX 3315813 . T C 1612 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=18.45;BaseQRankSum=-1.665;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=4.223;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.04;SOR=0.971;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:893,0:0,0,11,17 0/1:32,29:61:99:749,0,908:17,15,13,16 +chrX 3316012 . TG T 1037.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.57;BaseQRankSum=0.341;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.07;MQRankSum=-2.263;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.757;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,15:15:99:.:.:676,0:.:0,0,6,9 0|1:31,12:43:99:0|1:3316012_TG_T:401,0,1266:3316012:12,19,4,8 +chrX 3316014 . AGTATTTGTTCTGGATCCGAGTTTAGAGGG A 1018.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.53;BaseQRankSum=0.161;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.961;MQ=58.21;MQRankSum=-2.476;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.831;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,15:15:99:.:.:675,0:.:0,0,6,9 0|1:37,12:49:99:0|1:3316012_TG_T:383,0,1518:3316012:15,22,4,8 +chrX 3316056 . T C 1008 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.90;BaseQRankSum=-0.252;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=1.042;MQ=56.93;MQRankSum=-3.357;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.951;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,14:14:99:.:.:630,0:.:0,0,5,9 0|1:32,12:44:99:0|1:3316012_TG_T:408,0,1308:3316012:13,19,4,8 +chrX 3316057 . G C 963 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.42;BaseQRankSum=-2.365;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=1.032;MQ=56.87;MQRankSum=-3.357;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.882;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,5,8 0|1:32,12:44:99:0|1:3316012_TG_T:408,0,1308:3316012:13,19,4,8 +chrX 3316060 . GAAAAAGCACA G 989.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.87;BaseQRankSum=-0.789;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=2.147;MQ=56.79;MQRankSum=-3.505;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.73;SOR=1.003;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,14:14:99:.:.:630,0:.:0,0,6,8 0|1:35,12:47:99:0|1:3316012_TG_T:399,0,1434:3316012:16,19,4,8 +chrX 3316072 . A ATT 914.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=17.35;BaseQRankSum=0.612;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=5.640;MQ=56.43;MQRankSum=-3.456;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=1.494;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,5,8 0|1:31,11:42:99:0|1:3316012_TG_T:369,0,1269:3316012:16,15,3,8 +chrX 3316073 . C T 921 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.98;BaseQRankSum=0.993;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=7.465;MQ=56.50;MQRankSum=-3.509;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.259;SOR=1.472;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,5,8 0|1:32,11:43:99:0|1:3316012_TG_T:366,0,1311:3316012:17,15,3,8 +chrX 3316077 . G GA 779.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.17;BaseQRankSum=-1.438;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=8.023;MQ=56.36;MQRankSum=-3.944;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.126;SOR=1.811;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,12:12:99:.:.:540,0:.:0,0,5,7 0|1:33,9:42:99:0|1:3316012_TG_T:279,0,1359:3316012:17,16,1,8 +chrX 3316078 . G GGT 779.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.17;BaseQRankSum=-0.153;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=8.023;MQ=56.36;MQRankSum=-3.944;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=1.811;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,12:12:99:.:.:540,0:.:0,0,5,7 0|1:33,9:42:99:0|1:3316012_TG_T:279,0,1359:3316012:17,16,1,8 +chrX 3316081 . G A 792 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.51;BaseQRankSum=0.815;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=10.186;MQ=56.29;MQRankSum=-3.887;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.34;SOR=1.794;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,12:12:99:.:.:540,0:.:0,0,5,7 0|1:32,9:41:99:0|1:3316012_TG_T:282,0,1317:3316012:17,15,1,8 +chrX 3316084 . C T 828 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=16.19;BaseQRankSum=1.462;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=7.625;MQ=55.96;MQRankSum=-3.828;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=1.586;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:573,0:.:0,0,6,7 0|1:31,9:40:99:0|1:3316012_TG_T:285,0,1275:3316012:16,15,1,8 +chrX 3316085 . GC G 821.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=16.56;BaseQRankSum=1.322;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=5.872;MQ=55.52;MQRankSum=-3.769;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=1.609;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:573,0:.:0,0,6,7 0|1:30,9:39:99:0|1:3316012_TG_T:288,0,1233:3316012:15,15,1,8 +chrX 3316171 . A G 840 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.82;BaseQRankSum=-0.304;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.81;MQRankSum=-5.452;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.2;SOR=0.746;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:577,0:0,0,8,9 0/1:25,13:38:99:293,0,705:13,12,8,5 +chrX 3316235 . AC A 1204.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=20.39;BaseQRankSum=1.779;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=5.091;MQ=49.73;MQRankSum=-5.78;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.895;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,14:14:99:.:.:620,0:.:0,0,7,7 0|1:30,17:47:99:0|1:3316235_AC_A:624,0,1187:3316235:13,17,11,6 +chrX 3316239 . G T 1208 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=19.65;BaseQRankSum=0.132;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=3.442;MQ=50.08;MQRankSum=-5.919;QD=19.65;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.968;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,14:14:99:.:.:620,0:.:0,0,7,7 0|1:32,17:49:99:0|1:3316235_AC_A:618,0,1271:3316235:15,17,11,6 +chrX 3316241 . G T 1208 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=19.65;BaseQRankSum=0.503;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=3.442;MQ=50.54;MQRankSum=-5.919;QD=19.65;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.968;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,14:14:99:.:.:620,0:.:0,0,7,7 0|1:32,17:49:99:0|1:3316235_AC_A:618,0,1271:3316235:15,17,11,6 +chrX 3316245 . C G 1179 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=20.15;BaseQRankSum=1.915;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=5.208;MQ=50.66;MQRankSum=-5.89;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.373;SOR=1.008;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,7,6 0|1:30,17:47:99:0|1:3316235_AC_A:624,0,1209:3316235:13,17,11,6 +chrX 3316249 . G A 1221 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=20.51;BaseQRankSum=0.19;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=6.913;MQ=51.15;MQRankSum=-5.27;QD=20.51;ReadPosRankSum=0.843;SOR=1.089;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,7,6 0|1:30,18:48:99:0|1:3316235_AC_A:666,0,1206:3316235:13,17,12,6 +chrX 3316263 . A G 1224 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=21.25;BaseQRankSum=-0.438;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=9.185;MQ=52.04;MQRankSum=-5.964;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.518;SOR=1.294;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,12:12:99:.:.:540,0:.:0,0,7,5 0|1:28,19:47:99:0|1:3316235_AC_A:714,0,1119:3316235:12,16,13,6 +chrX 3316268 . A C 1143 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.95;BaseQRankSum=-1.189;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=9.708;MQ=52.33;MQRankSum=-5.846;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.497;SOR=1.336;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,12:12:99:.:.:540,0:.:0,0,7,5 0|1:27,17:44:99:0|1:3316235_AC_A:633,0,1083:3316235:11,16,12,5 +chrX 3316289 . G A 1320 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=23.28;BaseQRankSum=-1.609;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=7.340;MQ=52.48;MQRankSum=-5.394;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=1.002;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,7,6 0|1:25,20:45:99:0|1:3316235_AC_A:765,0,990:3316235:10,15,13,7 +chrX 3316301 . G C 1233 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=22.16;BaseQRankSum=0.389;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=7.296;MQ=53.33;MQRankSum=-5.02;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.816;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,7,6 0|1:26,18:44:99:0|1:3316235_AC_A:678,0,1038:3316235:10,16,11,7 +chrX 3316305 . T C 1278 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=22.95;BaseQRankSum=1.495;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=5.393;MQ=53.66;MQRankSum=-4.791;QD=22.95;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.731;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,7,6 0|1:25,19:44:99:0|1:3316235_AC_A:723,0,993:3316235:10,15,11,8 +chrX 3316315 . AAAATAAATAAATAAATAAAT A 1218.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=20.62;BaseQRankSum=0.828;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=6.909;MQ=55.38;MQRankSum=-4.575;QD=20.62;ReadPosRankSum=-1.32;SOR=1.190;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,9:9:99:.:.:405,0:.:0,0,5,4 0|1:29,23:52:99:0|1:3316235_AC_A:853,0,1138:3316235:13,16,15,8 +chrX 3316472 . C T 1378 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=19.29;BaseQRankSum=1.733;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.596;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:744,0:0,0,11,12 0/1:26,24:50:99:664,0,668:14,12,13,11 +chrX 3316497 . T TTAATAATAATAATAA 1404.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=24.07;BaseQRankSum=1.585;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=5.275;MQ=59.65;MQRankSum=-1.164;QD=24.07;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.379;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:807,0:0,0,8,10 0/1:25,17:42:99:637,0,989:16,9,9,8 +chrX 3316558 . CT C 3409.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=30.98;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=41.06;SOR=1.013;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1074,0:0,0,9,16 1/1:0,59:59:99:2375,178,0:0,0,27,32 +chrX 3316580 . G A 1455 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=18.56;BaseQRankSum=3.189;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.868;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.963;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:865,0:0,0,6,14 0/1:37,23:60:99:620,0,961:16,21,10,13 +chrX 3317683 . C T 1840 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=19.68;BaseQRankSum=-0.837;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=22.897;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.513;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1260,0:0,0,25,14 0/1:32,24:56:99:610,0,912:8,24,10,14 +chrX 3318866 . TA T 1810.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=18.50;BaseQRankSum=-0.541;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.835;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.893;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1091,0:0,0,13,25 0/1:29,33:62:99:759,0,644:14,15,18,15 +chrX 3318998 . C T 1515 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=20.60;BaseQRankSum=0.564;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=6.668;MQ=59.52;MQRankSum=-1.157;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.473;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:690,0:0,0,9,12 0/1:22,32:54:99:855,0,518:8,14,19,13 +chrX 3319044 . T G 1457 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=20.37;BaseQRankSum=-0.582;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=4.929;MQ=59.49;MQRankSum=-1.244;QD=20.37;ReadPosRankSum=1.235;SOR=0.314;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:690,0:0,0,10,11 0/1:23,29:52:99:797,0,622:8,15,14,15 +chrX 3319055 . G T 2100 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=28.78;BaseQRankSum=-1.813;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=2.136;MQ=59.49;MQRankSum=-1.266;QD=28.78;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.431;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:1024,0:.:0,0,10,13 0|1:23,28:51:99:0|1:3319055_G_T:1106,0,881:3319055:8,15,12,16 +chrX 3319056 . G C 2100 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=28.78;BaseQRankSum=-1.746;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=2.136;MQ=59.49;MQRankSum=-1.266;QD=28.78;ReadPosRankSum=1.25;SOR=0.431;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:1024,0:.:0,0,10,13 0|1:23,28:51:99:0|1:3319055_G_T:1106,0,881:3319055:8,15,12,16 +chrX 3319063 . A G 2069 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=29.15;BaseQRankSum=-1.208;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.174;MQ=59.47;MQRankSum=-1.238;QD=29.15;ReadPosRankSum=0.667;SOR=0.399;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,22:22:99:.:.:990,0:.:0,0,11,11 0|1:22,28:50:99:0|1:3319055_G_T:1109,0,839:3319055:8,14,12,16 +chrX 3319073 . A T 2073 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=28.42;BaseQRankSum=-1.775;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=7.094;MQ=59.50;MQRankSum=-1.216;QD=28.42;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.206;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:983,0:.:0,0,10,13 0|1:22,29:51:99:0|1:3319055_G_T:1120,0,816:3319055:6,16,14,15 +chrX 3319186 . T C 1742 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=20.37;BaseQRankSum=-1.168;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.724;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:788,0:0,0,13,14 0/1:21,39:60:99:984,0,496:10,11,18,21 +chrX 3319543 . C T 1981 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=21.39;BaseQRankSum=1.292;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.879;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.39;ReadPosRankSum=-1.703;SOR=0.864;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1176,0:0,0,22,15 0/1:27,30:57:99:835,0,718:13,14,15,15 +chrX 3319683 . G A 1837 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=17.13;BaseQRankSum=0.551;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.721;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.13;ReadPosRankSum=1.043;SOR=0.612;VarDP=109 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1025,0:0,0,17,14 0/1:44,34:78:99:842,0,1125:24,20,17,17 +chrX 3320126 . T G 1722 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=22.75;BaseQRankSum=-0.662;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.013;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.75;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.539;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:968,0:0,0,16,13 0/1:18,30:48:99:784,0,453:10,8,14,16 +chrX 3320692 . G A 1454 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=17.26;BaseQRankSum=-0.538;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=5.685;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.26;ReadPosRankSum=-2.141;SOR=0.729;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:970,0:0,0,18,13 0/1:34,21:55:99:514,0,956:14,20,11,10 +chrX 3321504 . C T 1647 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=20.96;BaseQRankSum=-0.748;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.252;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.96;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=0.400;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1008,0:0,0,19,11 0/1:25,25:50:99:669,0,688:16,9,11,14 +chrX 3322302 . G A 1236 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=20.10;BaseQRankSum=3.246;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=0.610;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:586,0:0,0,10,8 0/1:21,24:45:99:680,0,470:11,10,11,13 +chrX 3323009 . G A 1912 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=22.85;BaseQRankSum=0.993;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=8.828;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=22.85;ReadPosRankSum=-0.763;SOR=0.545;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1028,0:0,0,16,15 0/1:21,33:54:99:914,0,497:7,14,19,14 +chrX 3323215 . T C 1601 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=23.64;BaseQRankSum=0.324;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=2.468;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.64;ReadPosRankSum=1.285;SOR=1.179;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:968,0:0,0,10,19 0/1:16,24:40:99:663,0,396:8,8,11,13 +chrX 3323243 . A G 1670 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=24.29;BaseQRankSum=-0.805;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=8.752;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.29;ReadPosRankSum=0.067;SOR=0.984;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:938,0:0,0,8,20 0/1:14,28:42:99:762,0,341:9,5,14,14 +chrX 3323276 . T C 1453 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=21.81;BaseQRankSum=-1.198;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=20.315;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.334;SOR=0.641;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:802,0:0,0,10,17 0/1:16,25:41:99:681,0,423:13,3,12,13 +chrX 3323750 . G A 2050 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=24.19;BaseQRankSum=1.244;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.624;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=24.19;ReadPosRankSum=1.95;SOR=0.812;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1221,0:0,0,16,22 0/1:18,30:48:99:859,0,431:10,8,14,16 +chrX 3325325 . A G 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.90;BaseQRankSum=0.524;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.505;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.947;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,605 0/1:34,26:60:99:.:654,0,877:18,16,11,15 +chrX 3325468 . ATC A 2503.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=27.95;BaseQRankSum=0.774;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=5.624;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.445;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1922,0:0,0,22,21 0/1:31,17:48:99:621,0,1243:12,19,9,8 +chrX 3325770 . G A 1254 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=21.05;BaseQRankSum=1.082;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=2.510;MQ=59.62;MQRankSum=-0.915;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.446;SOR=1.211;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:790,0:0,0,8,18 0/1:17,18:35:99:494,0,415:8,9,8,10 +chrX 3325805 . C CATATATTTATAAATAAATATATAATAATATATTTATAAATAAATATATAATA 3224.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=27.96;BaseQRankSum=0.374;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=5.721;MQ=59.17;MQRankSum=-0.834;QD=35.48;ReadPosRankSum=-3.596;SOR=1.241;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1604,0:0,0,21,15 0/1:15,41:56:99:1660,0,508:7,8,27,14 +chrX 3325847 . A AATAATTTATAATTATAATTTATAATATATAATTTATAATT 1046.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=32.05;DP=128;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=43.44;SOR=0.770;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:1086,0:0,0,13,12 0/0:.:89:99:89:0,120,1800 +chrX 3326004 . T C 2254 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=26.87;BaseQRankSum=2.652;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.891;MQ=59.67;MQRankSum=0.159;QD=26.87;ReadPosRankSum=1.706;SOR=0.501;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,29:31:99:.:.:1230,0:.:2,0,16,13 0|1:25,29:54:99:0|1:3326004_T_C:1054,0,870:3326004:9,16,11,18 +chrX 3326025 . T TTA 2605.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=29.72;BaseQRankSum=1.201;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.785;MQ=59.30;MQRankSum=-0.799;QD=29.72;ReadPosRankSum=-1.341;SOR=0.304;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33:33:99:.:.:1413,0:.:0,0,17,16 0|1:23,33:56:99:0|1:3326004_T_C:1232,0,831:3326004:8,15,15,18 +chrX 3326255 . G A 1030 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=24;AS_QD=27.02;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.17;SOR=0.859;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:1060,0:0,0,13,11 ./.:.:58:.:58:0,0,0 +chrX 3326296 . C A 1079 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=26;AS_QD=32.44;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=0.846;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:1109,0:0,0,14,12 ./.:.:47:.:47:0,0,0 +chrX 3326454 . G A 1964 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=22.92;BaseQRankSum=1.578;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.92;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.726;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1063,0:.:0,0,10,15 0|1:34,28:62:99:0|1:3326454_G_A:931,0,1176:3326454:15,19,13,15 +chrX 3326486 . T C 2310 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=27.86;BaseQRankSum=-2.786;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.945;MQ=59.88;MQRankSum=-0.914;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.079;SOR=0.471;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1183,0:.:0,0,10,17 0|1:27,30:57:99:0|1:3326454_G_A:1157,0,1012:3326454:10,17,15,15 +chrX 3326528 . C A 1932 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=25.82;BaseQRankSum=1.55;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.925;MQ=59.87;MQRankSum=-0.904;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.853;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:996,0:.:0,0,12,13 0|1:24,27:51:99:0|1:3326454_G_A:966,0,774:3326454:12,12,16,11 +chrX 3327125 . G A 1228 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=16.34;BaseQRankSum=0.645;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.863;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.038;SOR=0.829;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:789,0:0,0,13,12 0/1:32,20:52:99:469,0,857:16,16,8,12 +chrX 3327163 . A G 1371 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=17.96;BaseQRankSum=-0.56;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.812;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:640,0:0,0,6,13 0/1:31,28:59:99:761,0,860:12,19,11,17 +chrX 3327214 . GC G 1458.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=19.45;BaseQRankSum=1.284;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.882;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.623;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:607,0:0,0,8,9 0/1:30,30:60:99:891,0,857:16,14,15,15 +chrX 3327721 . A G 1515 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=20.88;BaseQRankSum=-0.688;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.88;ReadPosRankSum=2.616;SOR=0.727;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,12,13 0/1:23,26:49:99:716,0,632:11,12,12,14 +chrX 3329153 . AGAAGGAAG A 752.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=20.84;BaseQRankSum=-0.873;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=-1.208;QD=20.84;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.836;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9:9:99:405,0:0,0,5,4 0/1:18,11:29:99:387,0,675:13,5,10,1 +chrX 3329203 . T A 824 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.83;BaseQRankSum=1.475;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=1.420;MQ=59.88;MQRankSum=0;QD=20.83;ReadPosRankSum=-2.304;SOR=1.045;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12:12:99:415,0:0,0,6,6 0/1:12,17:29:99:439,0,256:8,4,15,2 +chrX 3329319 . A AGAAGGAAGGAATGAAGGAAAAAAGAAG 1523.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=30.65;BaseQRankSum=-0.061;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=2.762;MQ=59.67;MQRankSum=-1.113;QD=30.65;ReadPosRankSum=-0.591;SOR=0.954;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:798,0:0,0,11,7 0/1:13,20:33:99:765,0,487:6,7,11,9 +chrX 3329454 . A AAGATGAAGGAAGGGGAGAGAAGGAAGGAAGGAAGGC 1850.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=27.00;BaseQRankSum=0.123;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=2.175;MQ=59.56;MQRankSum=-1.63;QD=27.00;ReadPosRankSum=-2.772;SOR=1.139;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1307,0:0,0,10,20 0/1:23,17:40:99:583,0,863:11,12,8,9 +chrX 3329585 . G A 1770 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=20.69;BaseQRankSum=0.654;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=6.157;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.336;SOR=1.392;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:858,0:0,0,17,10 0/1:26,34:60:99:942,0,634:13,13,22,12 +chrX 3332308 . C G 1471 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=17.87;BaseQRankSum=-1.357;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.634;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:803,0:0,0,9,17 0/1:28,30:58:99:698,0,705:12,16,16,14 +chrX 3333302 . CAA CAAAAAAAAAAAA,C,CAAAA 504.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=9,6,8;AS_QD=24.40,17.86,15.22;BaseQRankSum=2.762;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.07;MQRankSum=0;QD=22.67;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=0.446;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9,0,0:9:99:244,0,245,245:0,0,0,9 2/3:1,0,6,8:15:99:300,340,449,175,271,323,163,217,0,222:0,1,9,5 +chrX 3333392 . A T 1885 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=29.92;BaseQRankSum=2.679;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.608;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.92;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.254;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,25:26:99:794,0:1,0,17,8 1/1:2,36:38:79:1121,79,0:2,0,25,11 +chrX 3335348 . T C 1241 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=16.72;BaseQRankSum=-0.716;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.874;MQ=59.66;MQRankSum=0;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.576;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:823,0:0,0,13,14 0/1:30,19:49:99:448,0,816:14,16,10,9 +chrX 3336087 . T C 1534 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=17.19;BaseQRankSum=0.183;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.126;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.351;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:907,0:0,0,10,19 0/1:36,26:62:99:657,0,975:13,23,16,10 +chrX 3336997 . C G 1345 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=19.10;BaseQRankSum=-0.926;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=6.818;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.547;SOR=1.541;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:684,0:0,0,8,13 0/1:25,26:51:99:691,0,671:12,13,7,19 +chrX 3338958 . T TTAGA 525.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=16.62;BaseQRankSum=0.148;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.944;SOR=0.821;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,515 0/1:19,15:34:99:.:565,0,733:12,7,10,5 +chrX 3339304 . A G 1772 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=19.17;BaseQRankSum=0.972;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=-1.092;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.39;SOR=0.672;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1126,0:0,0,20,15 0/1:33,26:59:99:676,0,869:16,17,11,15 +chrX 3341104 . A ATATAATATAATATATTATACATAATATATATTATGTATAATATAATATATTATACATAATATATATTATGTATAATATATTATATTATACATAATATATATTATGTATAATATATTATATTATG 1077.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=25.39;BaseQRankSum=2.343;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.263;MQ=56.11;MQRankSum=-1.317;QD=25.39;ReadPosRankSum=-1.52;SOR=1.092;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,180 1/1:18,26:44:51:.:1117,51,0:7,11,8,18 +chrX 3341427 . G A 48 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=3;AS_QD=8.67;BaseQRankSum=1.559;DP=13;ExcessHet=0.0000;FS=6.455;MQ=53.66;MQRankSum=0.712;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.51;SOR=0.859;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:3:.:3:0,0 0/1:6,3:9:78:.:78,0,112:1,5,2,1 +chrX 3341981 . T C 1936 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=25.53;BaseQRankSum=0.194;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=12.009;MQ=59.74;MQRankSum=-0.598;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.09;SOR=0.086;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1076,0:0,0,15,18 0/1:13,31:44:99:890,0,299:2,11,14,17 +chrX 3342016 . C CAACAATGATAGACTGGAAA 2557.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=28.22;BaseQRankSum=0.373;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.453;MQ=59.33;MQRankSum=-1.293;QD=35.09;ReadPosRankSum=-1.304;SOR=0.236;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1304,0:0,0,14,15 0/1:13,32:45:99:1293,0,450:4,9,16,16 +chrX 3342464 . G T 1617 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=17.90;BaseQRankSum=-0.015;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.743;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=0.601;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1022,0:0,0,14,16 0/1:38,24:62:99:625,0,1088:17,21,14,10 +chrX 3344095 . C G 1501 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=20.41;BaseQRankSum=-0.733;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.977;MQ=58.84;MQRankSum=-0.65;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.18;SOR=0.799;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:894,0:0,0,16,10 0/1:25,24:49:99:637,0,676:12,13,11,13 +chrX 3345490 . G A 1052 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=30.91;BaseQRankSum=-0.326;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.91;ReadPosRankSum=1.189;SOR=0.330;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,34:35:99:.:1082,0:1,0,19,15 0/0:.:36:34:34:0,34,933 +chrX 3345649 . T C 1968 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=21.72;BaseQRankSum=-0.684;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=4.575;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.72;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.593;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1208,0:0,0,20,18 0/1:25,29:54:99:790,0,687:10,15,16,13 +chrX 3345704 . G A 1734 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=19.60;BaseQRankSum=0.76;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.877;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.60;ReadPosRankSum=-1.39;SOR=0.544;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1065,0:0,0,16,19 0/1:27,28:55:99:699,0,680:12,15,16,12 +chrX 3346099 . C A 1294 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=20.69;BaseQRankSum=2.808;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=9.417;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.69;ReadPosRankSum=1.092;SOR=0.980;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,26:27:99:864,0:0,1,15,11 0/1:20,17:37:99:460,0,509:8,12,11,6 +chrX 3346414 . G A 1676 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=18.34;BaseQRankSum=-0.756;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.811;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.752;SOR=0.469;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:877,0:0,0,15,14 0/1:32,32:64:99:829,0,881:20,12,19,13 +chrX 3347102 . A G 1242 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=19.57;BaseQRankSum=0.081;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=7.360;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.57;ReadPosRankSum=1.327;SOR=0.197;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:800,0:0,0,10,14 0/1:23,18:41:99:472,0,636:17,6,13,5 +chrX 3348007 . A ATT 1769.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=24.45;BaseQRankSum=-2.333;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.45;ReadPosRankSum=-0.77;SOR=0.635;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:891,0:0,0,10,16 0/1:19,29:48:99:918,0,549:10,9,18,11 +chrX 3348094 . A C 2417 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.63;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.63;SOR=0.832;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1058,0:0,0,16,15 1/1:0,44:44:99:1389,131,0:0,0,24,20 +chrX 3349010 . C T 2229 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=23.53;BaseQRankSum=1.361;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.890;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=23.53;ReadPosRankSum=1.509;SOR=0.869;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1291,0:0,0,17,21 0/1:24,34:58:99:968,0,585:12,12,16,18 +chrX 3349192 . TTGAA T 2166.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=28.65;BaseQRankSum=-1.485;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.350;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.65;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=0.877;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:1171,0:0,0,10,16 0/1:24,27:51:99:1035,0,922:13,11,13,14 +chrX 3350539 . T G 1232 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=19.42;BaseQRankSum=2.225;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.496;SOR=0.814;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:794,0:0,0,11,13 0/1:24,17:41:99:468,0,650:10,14,5,12 +chrX 3350669 . A AATAT 405.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=17.12;BaseQRankSum=-0.879;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=1.580;MQ=59.36;MQRankSum=1.391;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.868;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,360 0/1:14,12:26:99:.:445,0,490:8,6,5,7 +chrX 3350695 . T TAC 1521.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=29.45;BaseQRankSum=0.723;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=6.734;MQ=58.86;MQRankSum=-1.158;QD=29.45;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.856;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19:19:99:.:.:826,0:.:0,0,12,7 0|1:14,20:34:99:0|1:3350695_T_TAC:735,0,514:3350695:5,9,11,9 +chrX 3350697 . T TATATATATATAC 1670.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=28.98;BaseQRankSum=-0.487;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=4.133;MQ=58.98;MQRankSum=-1.212;QD=28.98;ReadPosRankSum=-1.011;SOR=0.921;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,22:22:99:.:.:939,0:.:0,0,14,8 0|1:16,21:37:99:0|1:3350695_T_TAC:771,0,575:3350695:7,9,11,10 +chrX 3350718 . A G 1450 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=29.02;BaseQRankSum=-2.01;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=2.855;MQ=59.34;MQRankSum=-0.889;QD=29.02;ReadPosRankSum=0.122;SOR=1.104;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:962,0:.:0,0,16,8 0|1:13,14:27:99:0|1:3350695_T_TAC:518,0,454:3350695:6,7,7,7 +chrX 3350760 . G C 1476 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=22.15;BaseQRankSum=-0.385;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=2.334;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.41;SOR=0.431;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:987,0:0,0,18,13 0/1:18,19:37:99:519,0,494:12,6,11,8 +chrX 3351013 . G A 2020 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=21.81;BaseQRankSum=2.896;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.018;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.81;ReadPosRankSum=2.389;SOR=0.615;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1191,0:0,0,17,19 0/1:28,30:58:99:859,0,694:16,12,14,16 +chrX 3351938 . T C 1444 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=17.98;BaseQRankSum=1.377;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.052;MQ=57.18;MQRankSum=0.011;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.778;SOR=1.145;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:799,0:0,0,9,15 0/1:33,25:58:99:675,0,903:16,17,10,15 +chrX 3352581 . G A 1681 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=23.44;BaseQRankSum=-1.078;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=4.504;MQ=50.08;MQRankSum=-6.545;QD=23.44;ReadPosRankSum=-1.608;SOR=0.352;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,17:17:99:.:.:765,0:.:0,0,8,9 0|1:31,25:56:99:0|1:3352581_G_A:946,0,1226:3352581:12,19,13,12 +chrX 3352583 . T G 1681 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=23.44;BaseQRankSum=1.574;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=4.504;MQ=50.20;MQRankSum=-6.545;QD=23.44;ReadPosRankSum=-1.172;SOR=0.352;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,17:17:99:.:.:765,0:.:0,0,8,9 0|1:31,25:56:99:0|1:3352581_G_A:946,0,1226:3352581:12,19,13,12 +chrX 3352585 . T C 1643 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=22.61;BaseQRankSum=-0.133;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=4.582;MQ=50.58;MQRankSum=-6.65;QD=22.61;ReadPosRankSum=-1.262;SOR=0.324;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,17:17:99:.:.:765,0:.:0,0,8,9 0|1:33,24:57:99:0|1:3352581_G_A:908,0,1293:3352581:12,21,12,12 +chrX 3352590 . A G 1594 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=22.56;BaseQRankSum=-0.284;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=4.631;MQ=51.00;MQRankSum=-6.602;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=0.324;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,17:17:99:.:.:755,0:.:0,0,9,8 0|1:32,23:55:99:0|1:3352581_G_A:869,0,1244:3352581:12,20,11,12 +chrX 3352830 . G T 2638 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.54;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;QD=32.54;SOR=1.292;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1007,0:0,0,13,18 1/1:0,51:51:99:1661,152,0:0,0,18,33 +chrX 3353808 . C T 2196 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=23.68;BaseQRankSum=2.151;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;MQRankSum=1.198;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.796;SOR=0.642;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1320,0:0,0,17,23 0/1:23,31:54:99:906,0,570:11,12,18,13 +chrX 3354523 . G A 1637 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=18.94;BaseQRankSum=0.532;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=4.343;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.355;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:864,0:1,0,12,15 0/1:28,32:60:99:803,0,669:17,11,18,14 +chrX 3355506 . A ATAATTAT 2155.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=27.10;BaseQRankSum=1.088;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=2.236;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.10;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.387;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1030,0:0,0,6,6 0/1:27,30:57:99:1165,0,1043:17,10,11,9 +chrX 3355555 . A G,ATCATCTTTAATAATATTATAATTATTAATTATTAATG 1947 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=32,0;AS_QD=34.09,6.88;BaseQRankSum=-1.261;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.999;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.09;ReadPosRankSum=-1.02;SOR=0.538;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12,0:12:99:1041,0,966:0,0,6,6 0/1:26,20,0:46:99:936,0,1291,832,980,2166:15,11,11,9 +chrX 3356167 . T A 1830 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=20.22;BaseQRankSum=-2.12;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.767;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.909;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1241,0:0,0,23,14 0/1:30,25:55:99:619,0,857:13,17,13,12 +chrX 3356541 . T C 1456 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=19.55;BaseQRankSum=0.435;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=10.305;MQ=59.94;MQRankSum=-1.043;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=0.881;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:881,0:0,0,12,14 0/1:27,23:50:99:605,0,726:17,10,8,15 +chrX 3356623 . T G 1512 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=18.58;BaseQRankSum=1.259;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.828;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.58;ReadPosRankSum=1.715;SOR=0.803;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:903,0:0,0,14,14 0/1:31,24:55:99:639,0,817:16,15,10,14 +chrX 3357537 . C CT 342.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.32;BaseQRankSum=-1.07;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=6.205;MQ=59.08;MQRankSum=-0.621;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.29;SOR=0.124;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,557 0/1:10,21:31:99:.:382,0,140:8,2,11,10 +chrX 3357725 . C T 1476 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=20.08;BaseQRankSum=0.719;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.977;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=20.08;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.799;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:903,0:0,0,17,11 0/1:25,22:47:99:603,0,688:13,12,6,16 +chrX 3357965 . G A 1510 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.00;BaseQRankSum=0.782;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.00;ReadPosRankSum=-0.79;SOR=0.622;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:918,0:0,0,12,16 0/1:25,24:49:99:622,0,642:13,12,14,10 +chrX 3358177 . C T 1345 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=17.86;BaseQRankSum=0.01;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.087;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.826;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:556,0:0,0,8,8 0/1:30,31:61:99:819,0,799:14,16,18,13 +chrX 3358468 . G A 1544 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.18;BaseQRankSum=1.5;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=10.420;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.18;ReadPosRankSum=-1.519;SOR=1.061;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1047,0:0,0,23,9 0/1:26,20:46:99:527,0,675:10,16,9,11 +chrX 3358608 . G A 1670 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=21.79;BaseQRankSum=-1.217;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=8.962;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.193;SOR=1.230;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1062,0:0,0,13,20 0/1:21,24:45:99:638,0,560:12,9,8,16 +chrX 3358999 . G A 1633 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=18.90;BaseQRankSum=2.483;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=5.676;MQ=57.25;MQRankSum=-4.758;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.861;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1121,0:0,0,19,16 0/1:32,21:53:99:542,0,773:14,18,13,8 +chrX 3360209 . A T 1666 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=19.72;BaseQRankSum=0.895;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.861;MQ=59.63;MQRankSum=-1.753;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.744;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:958,0:0,0,16,13 0/1:29,28:57:99:738,0,728:14,15,14,14 +chrX 3360511 . G A 1864 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=19.53;BaseQRankSum=-1.417;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.748;MQ=57.39;MQRankSum=-3.319;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.847;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1097,0:0,0,12,21 0/1:33,31:64:99:797,0,910:17,16,17,14 +chrX 3360697 . G C 1347 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.12;BaseQRankSum=0.996;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.886;MQ=56.59;MQRankSum=0.237;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.148;SOR=0.843;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:891,0:0,0,13,15 0/1:29,19:48:99:486,0,766:14,15,8,11 +chrX 3361118 . C T 972 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=31.31;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.31;SOR=1.112;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:1002,0:0,0,13,19 0/0:.:52:50:52:0,50,928 +chrX 3361200 . T A 1670 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=21.79;BaseQRankSum=-0.134;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.79;ReadPosRankSum=-1.413;SOR=0.679;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1008,0:0,0,12,17 0/1:23,26:49:99:692,0,598:9,14,10,16 +chrX 3361735 . G A 1567 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=20.74;BaseQRankSum=1.366;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=3.377;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.74;ReadPosRankSum=0.38;SOR=1.225;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1082,0:0,0,13,19 0/1:26,19:45:99:515,0,718:12,14,5,14 +chrX 3361783 . C T 1671 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=19.55;BaseQRankSum=2.08;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.834;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.55;ReadPosRankSum=-2.56;SOR=0.831;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1057,0:0,0,12,19 0/1:32,24:56:99:644,0,829:15,17,12,12 +chrX 3361900 . A G 1692 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=19.35;BaseQRankSum=-0.804;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=7.189;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.14;SOR=0.812;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1058,0:0,0,17,14 0/1:31,27:58:99:664,0,808:13,18,16,11 +chrX 3361960 . C A 1387 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.40;BaseQRankSum=1.17;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.763;SOR=0.612;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:800,0:0,0,12,11 0/1:30,23:53:99:617,0,807:13,17,9,14 +chrX 3362072 . A G 1983 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=23.41;BaseQRankSum=-0.876;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=4.818;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.41;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=0.389;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1131,0:0,0,16,18 0/1:21,31:52:99:882,0,549:13,8,16,15 +chrX 3362337 . C T 725 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=1.321;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=2.122;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.958;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,555 0/1:35,28:63:99:.:755,0,917:17,18,16,12 +chrX 3363308 . G A 1755 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=18.59;BaseQRankSum=0.711;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.746;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.794;SOR=0.502;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1270,0:0,0,18,21 0/1:36,21:57:99:515,0,971:13,23,7,14 +chrX 3363478 . C G 1862 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=22.52;BaseQRankSum=0.471;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=6.614;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.497;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1013,0:0,0,12,18 0/1:22,32:54:99:879,0,563:14,8,17,15 +chrX 3364023 . G A 2109 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=27.08;BaseQRankSum=1.001;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=8.095;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=27.08;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=1.450;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:888,0:.:0,0,15,5 0|1:27,32:59:99:0|1:3364023_G_A:1251,0,1037:3364023:13,14,19,13 +chrX 3364027 . G C 2101 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=26.97;BaseQRankSum=-0.622;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=6.333;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=1.325;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:880,0:.:0,0,14,6 0|1:27,32:59:99:0|1:3364023_G_A:1251,0,1037:3364023:13,14,19,13 +chrX 3364218 . C A 1701 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=19.02;BaseQRankSum=-1.631;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.732;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.02;ReadPosRankSum=-0.209;SOR=1.222;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:966,0:0,0,18,12 0/1:31,30:61:99:765,0,850:15,16,19,11 +chrX 3364359 . G A 1951 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=23.31;BaseQRankSum=1.722;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.794;SOR=0.637;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1062,0:0,0,14,18 0/1:22,31:53:99:919,0,556:9,13,13,18 +chrX 3364713 . G A 2047 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=28.45;BaseQRankSum=-1.569;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=2.201;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=28.45;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.394;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1102,0:.:0,0,15,10 0|1:23,25:48:99:0|1:3364713_G_A:975,0,879:3364713:16,7,15,10 +chrX 3364715 . G C 2047 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=28.45;BaseQRankSum=-1.904;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.201;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=28.45;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.394;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1102,0:.:0,0,15,10 0|1:23,25:48:99:0|1:3364713_G_A:975,0,879:3364713:16,7,15,10 +chrX 3364716 . C T 2050 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=28.89;BaseQRankSum=-1.977;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=3.713;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.314;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1102,0:.:0,0,15,10 0|1:22,25:47:99:0|1:3364713_G_A:978,0,849:3364713:16,6,15,10 +chrX 3365118 . A T 2066 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=21.17;BaseQRankSum=1.669;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.908;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.17;ReadPosRankSum=-0.683;SOR=0.443;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1275,0:0,0,18,22 0/1:29,30:59:99:821,0,735:11,18,14,16 +chrX 3365166 . A G 1515 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=16.44;BaseQRankSum=1.091;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=8.360;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.605;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:922,0:0,0,15,15 0/1:39,25:64:99:623,0,1022:15,24,15,10 +chrX 3368939 . T TA 1102.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=15.64;BaseQRankSum=2.925;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=6.306;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.441;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:646,0:0,0,11,12 0/1:27,23:50:99:496,0,611:10,17,13,10 +chrX 3371723 . C T 1453 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=18.54;BaseQRankSum=0.867;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.54;ReadPosRankSum=-1.265;SOR=0.672;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1022,0:0,0,17,15 0/1:29,19:48:99:461,0,764:15,14,8,11 +chrX 3372600 . T A 1671 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=22.38;BaseQRankSum=2.053;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.003;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.38;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.542;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:651,0:0,0,8,11 0/1:21,36:57:99:1050,0,482:7,14,13,23 +chrX 3373551 . C T 1077 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.59;BaseQRankSum=-1.872;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.942;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.946;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,9,16 0/1:32,14:46:99:278,0,903:15,17,7,7 +chrX 3375709 . A G 1220 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=19.53;BaseQRankSum=-0.452;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=7.140;MQ=59.71;MQRankSum=-0.032;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.864;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:661,0:0,0,8,11 0/1:23,22:45:99:589,0,634:14,9,9,13 +chrX 3376246 . T C 1711 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=31.65;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.65;SOR=1.061;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:362,0:0,0,6,5 1/1:0,44:44:99:1379,132,0:0,0,17,27 +chrX 3376964 . C T 1618 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=32.96;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.96;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1072,0:0,0,18,14 1/1:0,18:18:54:576,54,0:0,0,6,12 +chrX 3376976 . G A 1632 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=32.59;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.59;SOR=0.732;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1142,0:0,0,21,13 1/1:0,17:17:50:520,50,0:0,0,5,12 +chrX 3377026 . C T 1583 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.92;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.92;SOR=0.818;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:864,0:0,0,13,13 1/1:0,23:23:69:749,69,0:0,0,13,10 +chrX 3377154 . G C 1429 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=32.42;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.42;SOR=0.829;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:834,0:0,0,8,18 1/1:0,19:19:57:625,57,0:0,0,13,6 +chrX 3377490 . CA C 969.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=25.87;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=25.87;SOR=1.096;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:500,0:0,0,10,9 1/1:0,20:20:60:509,60,0:0,0,13,7 +chrX 3377715 . ATG A 2090.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=28.03;BaseQRankSum=0.091;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.224;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=28.03;ReadPosRankSum=1.0;SOR=0.412;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1159,0:.:0,0,14,12 0|1:25,25:50:99:0|1:3377715_ATG_A:971,0,955:3377715:15,10,12,13 +chrX 3377735 . GTGTGTA G 2216.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=27.51;BaseQRankSum=0.07;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.895;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.51;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.536;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1198,0:.:0,0,15,12 0|1:27,28:55:99:0|1:3377715_ATG_A:1058,0,1044:3377715:16,11,15,13 +chrX 3377928 . CGT C 1833.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=22.04;BaseQRankSum=-0.078;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=1.845;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.501;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:941,0:0,0,9,16 0/1:31,29:60:99:932,0,996:12,19,15,14 +chrX 3377990 . T C 1862 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=18.37;BaseQRankSum=-2.149;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=6.610;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.79;SOR=0.298;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1049,0:0,0,17,15 0/1:38,33:71:99:843,0,1074:13,25,14,19 +chrX 3378029 . C T 1702 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=17.67;BaseQRankSum=-0.377;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.765;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.582;SOR=0.804;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:941,0:0,0,16,12 0/1:40,30:70:99:791,0,1121:19,21,10,20 +chrX 3378682 . A G 1218 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=17.33;BaseQRankSum=-0.06;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=6.312;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=0.534;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:767,0:0,0,11,13 0/1:29,19:48:99:481,0,834:11,18,12,7 +chrX 3378816 . G C 1447 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=21.10;BaseQRankSum=-1.919;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=9.388;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.10;ReadPosRankSum=-1.516;SOR=1.112;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:665,0:0,0,16,4 0/1:20,30:50:99:812,0,535:8,12,15,15 +chrX 3379463 . A G 1486 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=19.69;BaseQRankSum=-0.292;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.030;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.976;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:679,0:0,0,12,10 0/1:24,31:55:99:837,0,628:13,11,20,11 +chrX 3379660 . G A 814 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=30.14;BaseQRankSum=1.66;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.14;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.252;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,27:28:99:.:844,0:1,0,14,13 0/0:.:47:58:47:0,58,968 +chrX 3379826 . A AT 405.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.85;BaseQRankSum=1.38;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.653;SOR=0.610;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,768 0/1:21,20:41:99:.:445,0,478:11,10,10,10 +chrX 3380180 . T C 2033 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=21.95;BaseQRankSum=3.575;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.012;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.424;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1097,0:0,0,18,16 0/1:27,33:60:99:966,0,653:11,16,15,18 +chrX 3380779 . A G 1863 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=22.81;BaseQRankSum=-1.116;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.81;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.744;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1092,0:0,0,12,22 0/1:18,31:49:99:801,0,435:7,11,13,18 +chrX 3380856 . T C 2062 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=27.53;BaseQRankSum=-2.643;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.783;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.53;ReadPosRankSum=-0.66;SOR=0.317;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1264,0:.:0,0,14,15 0|1:25,22:47:99:0|1:3380856_T_C:828,0,973:3380856:9,16,11,11 +chrX 3380870 . C T 2011 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=26.17;BaseQRankSum=-0.837;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.927;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.17;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.859;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1215,0:.:0,0,14,13 0|1:29,22:51:99:0|1:3380856_T_C:826,0,1131:3380856:14,15,13,9 +chrX 3380893 . A G 1627 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=23.67;BaseQRankSum=-2.828;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.019;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.67;ReadPosRankSum=-2.787;SOR=1.005;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:1015,0:.:0,0,14,9 0|1:28,19:47:99:0|1:3380856_T_C:642,0,1098:3380856:14,14,10,9 +chrX 3380992 . G A 405 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=7.37;BaseQRankSum=0.867;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.37;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=0.836;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,565 0/1:39,20:59:99:.:435,0,939:20,19,11,9 +chrX 3381685 . A G 1591 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=19.77;BaseQRankSum=0.754;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=6.242;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.260;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:759,0:0,0,11,12 0/1:27,32:59:99:862,0,663:18,9,17,15 +chrX 3381947 . C CAAA 1189.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=24.58;BaseQRankSum=-1.603;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=11.322;MQ=58.74;MQRankSum=-1.09;QD=24.58;ReadPosRankSum=-3.112;SOR=0.636;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:530,0:0,0,7,8 0/1:10,25:35:99:699,0,257:8,2,10,15 +chrX 3382254 . G A 1934 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=23.38;BaseQRankSum=-0.051;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=14.252;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=0.894;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:982,0:0,0,14,17 0/1:19,34:53:99:982,0,466:13,6,12,22 +chrX 3382292 . AAAG A 2536.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=29.27;BaseQRankSum=-0.819;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=4.445;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=29.27;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.360;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1440,0:.:0,0,16,16 0|1:27,29:56:99:0|1:3382292_AAAG_A:1136,0,1046:3382292:18,9,18,11 +chrX 3382296 . T TC 2536.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=29.27;BaseQRankSum=-1.318;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=4.445;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=29.27;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.360;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1440,0:.:0,0,16,16 0|1:27,29:56:99:0|1:3382292_AAAG_A:1136,0,1046:3382292:18,9,18,11 +chrX 3382436 . C A 1591 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=20.26;BaseQRankSum=-1.138;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=4.623;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.26;ReadPosRankSum=-2.174;SOR=0.336;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1117,0:0,0,16,17 0/1:27,20:47:99:504,0,752:9,18,8,12 +chrX 3382567 . G A 1941 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=18.95;BaseQRankSum=0.619;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.768;MQ=59.96;MQRankSum=-1.102;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.814;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1244,0:0,0,20,20 0/1:36,28:64:99:727,0,945:18,18,16,12 +chrX 3382918 . A G 1630 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=21.56;BaseQRankSum=1.075;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.949;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.361;SOR=0.781;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:923,0:0,0,15,13 0/1:23,26:49:99:737,0,597:12,11,10,16 +chrX 3385096 . T C 1456 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=18.58;BaseQRankSum=-1.333;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.218;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=1.106;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:734,0:0,0,14,9 0/1:27,30:57:99:752,0,713:15,12,20,10 +chrX 3385371 . G A 1802 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=22.34;BaseQRankSum=2.236;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.34;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.712;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:864,0:0,0,14,12 0/1:23,33:56:99:968,0,565:11,12,14,19 +chrX 3385506 . T A 1290 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=20.95;BaseQRankSum=2.165;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=1.035;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.29;SOR=0.581;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23:24:99:742,0:1,0,15,8 0/1:19,20:39:99:578,0,502:8,11,7,13 +chrX 3385678 . T TGATA 1837.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=27.20;BaseQRankSum=-1.523;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.962;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.20;ReadPosRankSum=-1.289;SOR=0.548;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:1169,0:0,0,13,14 0/1:23,19:42:99:708,0,897:10,13,9,10 +chrX 3386722 . C T 2166 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=23.61;BaseQRankSum=-0.844;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.61;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.779;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1406,0:0,0,19,23 0/1:22,29:51:99:790,0,592:11,11,18,11 +chrX 3386942 . C T 1936 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=22.86;BaseQRankSum=0.968;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=6.727;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=22.86;ReadPosRankSum=2.02;SOR=0.660;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1131,0:0,0,19,16 0/1:21,30:51:99:835,0,511:8,13,17,13 +chrX 3387414 . A ATG 2246.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=24.06;BaseQRankSum=-0.557;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=1.792;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.377;SOR=0.920;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1337,0:0,0,11,24 0/1:30,30:60:99:949,0,990:14,16,16,14 +chrX 3387543 . GTA G 1430.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=21.94;BaseQRankSum=-0.015;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=2.017;MQ=59.39;MQRankSum=0.838;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.984;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:775,0:.:0,0,7,11 0|1:30,19:49:99:0|1:3387543_GTA_G:695,0,1166:3387543:15,15,9,10 +chrX 3387566 . T C 1558 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=21.46;BaseQRankSum=1.763;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.504;MQ=59.47;MQRankSum=0.881;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=0.524;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,20:21:99:.:.:823,0:.:1,0,9,11 0|1:31,22:53:99:0|1:3387543_GTA_G:765,0,1175:3387543:18,13,11,11 +chrX 3387669 . A ATG 1769.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=27.83;BaseQRankSum=-1.291;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.949;SOR=0.795;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1097,0:.:0,0,17,8 0|1:21,19:40:99:0|1:3387669_A_ATG:712,0,791:3387669:14,7,13,6 +chrX 3387694 . T C 1969 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=27.76;BaseQRankSum=-2.865;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.476;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.76;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=1.179;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30:30:99:.:.:1272,0:.:0,0,23,7 0|1:22,20:42:99:0|1:3387669_A_ATG:727,0,807:3387669:15,7,15,5 +chrX 3387783 . G A 2129 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=28.04;BaseQRankSum=-1.827;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=14.687;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.04;ReadPosRankSum=1.096;SOR=0.089;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,36:36:99:.:.:1423,0:.:0,0,17,19 0|1:20,21:41:99:0|1:3387783_G_A:736,0,716:3387783:16,4,12,9 +chrX 3387801 . ATG A 2278.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=27.60;BaseQRankSum=0.45;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=4.685;MQ=59.80;MQRankSum=0.939;QD=27.60;ReadPosRankSum=1.355;SOR=0.314;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,39:39:99:.:.:1619,0:.:0,0,19,20 0|1:25,20:45:99:0|1:3387783_G_A:699,0,901:3387783:16,9,11,9 +chrX 3387821 . T G 2357 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=28.08;BaseQRankSum=1.601;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=4.690;MQ=59.81;MQRankSum=0.981;QD=28.08;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.297;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,38:38:99:.:.:1624,0:.:0,0,16,22 0|1:25,22:47:99:0|1:3387783_G_A:763,0,874:3387783:16,9,14,8 +chrX 3388067 . T C 1557 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=16.71;BaseQRankSum=-1.319;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.915;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.416;SOR=0.730;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:801,0:0,0,17,9 0/1:38,31:69:99:786,0,1059:17,21,14,17 +chrX 3389324 . C T 1516 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=18.63;BaseQRankSum=0.041;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=4.462;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=1.270;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1012,0:0,0,19,12 0/1:31,21:52:99:534,0,861:16,15,14,7 +chrX 3389754 . A G 1994 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=23.81;BaseQRankSum=-0.367;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.81;ReadPosRankSum=1.64;SOR=0.589;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,36:37:99:1156,0:1,0,19,17 0/1:18,30:48:99:868,0,481:10,8,17,13 +chrX 3390046 . T C 1581 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=18.95;BaseQRankSum=0.357;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.848;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.375;SOR=0.822;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:873,0:0,1,13,15 0/1:29,27:56:99:738,0,784:16,13,18,9 +chrX 3390173 . A G 1956 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=22.83;BaseQRankSum=-1.823;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.301;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.83;ReadPosRankSum=1.295;SOR=0.452;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:991,0:0,0,17,13 0/1:22,35:57:99:995,0,593:9,13,16,19 +chrX 3390718 . T A 1284 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=20.22;BaseQRankSum=0.27;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.978;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.22;ReadPosRankSum=-1.82;SOR=0.719;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:800,0:0,0,10,13 0/1:23,19:42:99:514,0,643:11,12,12,7 +chrX 3390831 . G A 1419 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=22.64;BaseQRankSum=0;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=2.407;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.64;ReadPosRankSum=0.271;SOR=1.203;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1027,0:0,0,12,19 0/1:18,15:33:99:422,0,526:9,9,6,9 +chrX 3391177 . G C 1584 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=16.14;BaseQRankSum=0.162;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=2.689;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.324;SOR=1.029;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:837,0:0,0,17,11 0/1:41,31:72:99:777,0,1094:22,19,19,12 +chrX 3391723 . A G 1721 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=19.24;BaseQRankSum=0.152;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=2.967;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.24;ReadPosRankSum=-1.548;SOR=0.596;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:872,0:0,0,13,14 0/1:30,34:64:99:879,0,765:13,17,19,15 +chrX 3391901 . T G 1481 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=18.65;BaseQRankSum=1.401;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.060;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.430;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:640,0:0,0,12,7 0/1:29,33:62:99:871,0,678:18,11,16,17 +chrX 3392003 . CAAAA C 329.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=26.36;BaseQRankSum=0;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=10.227;MQ=58.68;MQRankSum=0;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.316;SOR=2.225;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,10:14:99:.:369,0:1,3,8,2 0/0:.:37:0:37:0,0,705 +chrX 3392297 . C T 1827 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=22.11;BaseQRankSum=-0.669;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=9.238;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.11;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.165;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1047,0:0,0,18,15 0/1:20,31:51:99:810,0,498:5,15,12,19 +chrX 3392768 . C G 1483 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=18.23;BaseQRankSum=-0.726;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=4.348;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.352;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:655,0:0,0,8,12 0/1:31,32:63:99:858,0,858:12,19,18,14 +chrX 3392838 . T A 1529 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=18.56;BaseQRankSum=-0.719;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.863;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.48;SOR=0.529;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:655,0:0,0,9,11 0/1:30,34:64:99:904,0,796:13,17,17,17 +chrX 3393082 . A C 1585 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=17.55;BaseQRankSum=0.416;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=5.415;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.945;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:615,0:0,0,12,8 0/1:35,37:72:99:1000,0,911:19,16,12,25 +chrX 3393438 . G A 1964 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=19.94;BaseQRankSum=-0.183;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.795;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.94;ReadPosRankSum=-2.181;SOR=0.542;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1023,0:0,0,14,16 0/1:34,36:70:99:971,0,911:15,19,18,18 +chrX 3393680 . A G 1654 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=20.29;BaseQRankSum=0.545;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.109;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=1.078;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:953,0:0,0,10,19 0/1:28,26:54:99:731,0,790:13,15,11,15 +chrX 3394371 . C T 1825 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=21.82;BaseQRankSum=0.877;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.82;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.684;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:839,0:0,0,12,13 0/1:25,35:60:99:1016,0,658:12,13,17,18 +chrX 3394893 . G T 1742 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=21.10;BaseQRankSum=0.649;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=4.604;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.997;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:918,0:0,0,15,13 0/1:26,30:56:99:854,0,705:12,14,19,11 +chrX 3395823 . T C 1323 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=16.11;BaseQRankSum=-0.279;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=5.550;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.646;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:568,0:0,0,8,10 0/1:36,30:66:99:785,0,973:15,21,18,12 +chrX 3396304 . G A 1258 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=16.73;BaseQRankSum=-1.066;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.992;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.466;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:789,0:0,0,15,10 0/1:32,20:52:99:499,0,923:22,10,13,7 +chrX 3396423 . C T 1760 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=18.08;BaseQRankSum=-0.011;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=1.673;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=0.527;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:992,0:0,0,14,17 0/1:38,30:68:99:798,0,1065:15,23,13,17 +chrX 3396445 . C T 1647 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=17.47;BaseQRankSum=1.704;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.299;SOR=0.693;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:967,0:0,0,13,18 0/1:38,27:65:99:710,0,992:15,23,10,17 +chrX 3396462 . T TG 1718.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=17.94;BaseQRankSum=0.56;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=2.767;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.430;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1062,0:0,0,16,17 0/1:37,28:65:99:696,0,1018:14,23,12,16 +chrX 3397324 . C A 1925 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=19.95;BaseQRankSum=1.507;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.732;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1291,0:0,0,17,21 0/1:35,25:60:99:664,0,962:17,18,13,12 +chrX 3397882 . G A 1484 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=21.32;BaseQRankSum=2.446;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.957;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.901;SOR=0.545;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:947,0:0,0,15,13 0/1:23,20:43:99:567,0,565:13,10,10,10 +chrX 3397986 . G A 1865 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=22.56;BaseQRankSum=-0.268;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.076;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.909;SOR=0.412;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1132,0:0,0,20,14 0/1:22,28:50:99:763,0,574:9,13,11,17 +chrX 3398449 . A G 2014 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=22.22;BaseQRankSum=-2.47;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=6.798;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.22;ReadPosRankSum=1.238;SOR=0.225;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:952,0:0,0,16,15 0/1:21,40:61:99:1092,0,547:15,6,22,18 +chrX 3398810 . A G 1387 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=19.41;BaseQRankSum=-1.948;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=0.818;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:744,0:0,0,12,11 0/1:24,26:50:99:673,0,663:12,12,11,15 +chrX 3398980 . G GTT 3499.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.40;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1305,0:0,0,19,10 1/1:0,50:50:99:2234,150,0:0,0,20,30 +chrX 3401406 . T C 1994 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=24.99;BaseQRankSum=-0.308;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.614;SOR=0.723;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:1114,0:0,0,12,15 0/1:29,25:54:99:910,0,1040:13,16,11,14 +chrX 3401412 . CT C,CTT 2472.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=50,22;AS_QD=29.80,25.32;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.89;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25,0:25:99:1038,0,1038:0,0,12,13 1/2:0,25,22:47:99:1474,554,976,983,0,917:0,0,23,24 +chrX 3406980 . C T 1923 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=22.98;BaseQRankSum=1.494;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=8.828;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.98;ReadPosRankSum=1.099;SOR=0.984;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1131,0:0,0,22,14 0/1:20,29:49:99:822,0,458:8,12,17,12 +chrX 3408901 . TACAC T,TACACAC 1400.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=29,11;AS_QD=33.24,25.17;BaseQRankSum=-0.38;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=35.12;ReadPosRankSum=0.435;SOR=0.432;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,11,0:12:99:462,0,485:1,0,6,5 1/2:0,18,11:29:99:978,286,449,713,0,676:0,0,18,11 +chrX 3409917 . A C 727 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=0.534;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.828;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.182;SOR=0.821;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,447 0/1:26,28:54:99:.:757,0,662:11,15,16,12 +chrX 3411233 . G A 822 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.49;BaseQRankSum=-0.582;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=-0.843;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.655;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,447 0/1:24,31:55:99:.:852,0,624:9,15,12,19 +chrX 3411552 . C T 1084 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=17.68;BaseQRankSum=0;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=2.216;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=0.967;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,13:14:99:392,0:1,0,9,4 0/1:22,27:49:99:722,0,571:10,12,14,13 +chrX 3413804 . G A 1701 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=20.61;BaseQRankSum=2.472;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.47;MQRankSum=1.878;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.651;SOR=0.762;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:844,0:0,1,15,12 0/1:25,31:56:99:887,0,620:13,12,15,16 +chrX 3414186 . C T 520 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.38;BaseQRankSum=-3.257;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=5.528;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=0.428;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,675 0/1:30,23:53:99:.:550,0,874:11,19,12,11 +chrX 3414747 . G A 1931 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=22.54;BaseQRankSum=0.5;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.819;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:932,0:0,0,16,12 0/1:22,37:59:99:1029,0,527:13,9,24,13 +chrX 3414919 . A T 2669 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.91;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.91;SOR=0.742;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:719,0:0,0,10,12 1/1:0,60:60:99:1980,180,0:0,0,32,28 +chrX 3415014 . A G 2505 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.50;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.50;SOR=0.744;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:546,0:0,0,7,10 1/1:0,61:61:99:1989,183,0:0,0,33,28 +chrX 3415781 . C G 1844 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=20.59;BaseQRankSum=-0.244;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.808;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.55;SOR=0.687;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:988,0:0,0,15,14 0/1:30,32:62:99:886,0,811:14,16,17,15 +chrX 3415910 . A G 1112 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=16.08;BaseQRankSum=-1.15;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=15.487;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.544;SOR=1.420;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,913 0/1:29,42:71:99:.:1142,0,750:11,18,28,14 +chrX 3415974 . T C 2905 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=31.56;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.56;SOR=0.852;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:822,0:0,0,12,13 1/1:0,68:68:99:2113,203,0:0,0,38,30 +chrX 3416385 . A G 854 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.63;BaseQRankSum=-0.528;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.1;SOR=0.737;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,794 0/1:37,33:70:99:.:884,0,1032:22,15,20,13 +chrX 3416462 . CTG C 602.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.10;BaseQRankSum=-0.627;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.460;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.107;SOR=1.041;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,794 0/1:27,22:49:99:.:642,0,805:14,13,9,13 +chrX 3416523 . G A 2792 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=33.60;BaseQRankSum=4.402;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.680;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.60;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.743;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:976,0:0,0,11,18 1/1:1,54:55:99:1846,155,0:1,0,24,30 +chrX 3417213 . TCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC TCTTCCTTCCTTC,T,TCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC 1583.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,18,11;AS_QD=28.79,36.38,30.12;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;QD=39.59;SOR=0.741;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12,0,0:12:99:479,0,479,479:0,0,9,3 2/3:0,0,18,11:29:99:1144,1170,1313,433,601,686,716,738,0,684:0,0,12,17 +chrX 3417807 . C A 614 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.88;BaseQRankSum=-1.476;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.569;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,444 0/1:26,24:50:99:.:644,0,744:15,11,13,11 +chrX 3418818 . G A 2375 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.95;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.95;SOR=0.720;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:853,0:0,0,11,15 1/1:0,47:47:99:1552,140,0:0,0,25,22 +chrX 3418852 . C T 2367 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.84;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.84;SOR=0.776;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:833,0:0,0,12,14 1/1:0,47:47:99:1564,141,0:0,0,26,21 +chrX 3418955 . A C 1149 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=18.14;BaseQRankSum=-1.144;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=2.173;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.410;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:660,0:0,0,11,9 0/1:25,20:45:99:519,0,714:9,16,7,13 +chrX 3419370 . C CAAAAAA,CAAAAAAAA 2922.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,30;AS_QD=30.31,26.41;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=0.957;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26,0:26:99:1101,0,1102:0,0,16,10 1/2:0,10,30:40:99:1861,1097,981,385,0,257:0,0,21,19 +chrX 3419629 . G A 1258 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=23.00;BaseQRankSum=-0.775;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=2.591;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.00;ReadPosRankSum=0.957;SOR=1.127;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:853,0:0,0,9,17 0/1:14,16:30:99:435,0,372:7,7,8,8 +chrX 3419975 . C T 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.22;BaseQRankSum=-1.499;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=5.884;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.22;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=0.214;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,655 0/1:21,34:55:99:.:892,0,535:15,6,18,16 +chrX 3419986 . G T 774 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=33.50;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.50;SOR=1.270;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:804,0:0,0,15,9 0/0:.:55:99:55:0,105,1325 +chrX 3420266 . T C 715 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.20;BaseQRankSum=-1.712;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=14.573;MQ=59.86;MQRankSum=-0.795;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.736;SOR=1.351;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,587 0/1:19,27:46:99:.:745,0,523:13,6,9,18 +chrX 3420305 . T C 755 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.39;BaseQRankSum=-0.048;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=5.785;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.39;ReadPosRankSum=1.77;SOR=0.887;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,587 0/1:22,29:51:99:.:785,0,567:13,9,12,17 +chrX 3420430 . A G 549 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.92;BaseQRankSum=1.475;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=10.430;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.793;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,587 0/1:31,22:53:99:.:579,0,859:10,21,13,9 +chrX 3420851 . C T 696 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.31;BaseQRankSum=0.909;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.849;SOR=0.665;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,587 0/1:32,27:59:99:.:726,0,885:18,14,15,12 +chrX 3421030 . C CA 1727.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=23.88;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=23.88;SOR=1.288;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:547,0:0,0,14,9 1/1:0,51:51:99:1220,152,0:0,0,32,19 +chrX 3421561 . A G 983 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.35;BaseQRankSum=1.95;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=8.392;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.634;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,213 0/1:30,36:66:99:.:1013,0,739:19,11,16,20 +chrX 3422232 . T C 523 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.57;BaseQRankSum=0.561;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=2.544;MQ=59.61;MQRankSum=0;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.845;SOR=1.119;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,213 0/1:23,21:44:99:.:553,0,617:11,12,8,13 +chrX 3422491 . G C 508 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.96;BaseQRankSum=-0.085;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=3.997;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=1.426;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,213 0/1:32,22:54:99:.:538,0,866:17,15,15,7 +chrX 3422693 . C T 791 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.49;BaseQRankSum=0.727;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=2.294;MQ=59.84;MQRankSum=0.836;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=1.037;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:475,0:0,0,12,4 0/1:23,14:37:99:346,0,589:12,11,6,8 +chrX 3422720 . CAAAAAA CAAAAAAA,C 396.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=28,0;AS_QD=9.08,0.00;BaseQRankSum=-0.416;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.098;MQ=58.97;MQRankSum=-0.436;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.338;SOR=0.527;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0:17:99:323,0,323:0,0,10,7 0/1:20,11,0:31:99:113,0,678,220,634,1468:11,9,4,7 +chrX 3422734 . A AG,AAAAAAAG,AAAAAAAAG 526.97 . AC=1,0,0;AF=0.333,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=12,0,0;AS_QD=21.77,14.64,15.43;BaseQRankSum=-0.111;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.471;MQ=59.56;MQRankSum=0;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.334;SOR=1.022;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,452,452,452 0/1:14,12,0,0:26:99:.:566,0,460,361,467,1118,350,420,1049,1032:7,7,7,5 +chrX 3423787 . C T 721 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.73;BaseQRankSum=-0.242;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=8.661;MQ=59.61;MQRankSum=-0.089;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=1.492;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,452 0/1:34,30:64:99:.:751,0,875:16,18,20,10 +chrX 3424179 . T C 649 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.09;BaseQRankSum=1.099;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=4.332;MQ=59.72;MQRankSum=1.114;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.785;SOR=1.385;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,452 0/1:21,24:45:99:.:679,0,540:12,9,17,7 +chrX 3424513 . C T 1152 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=16.42;BaseQRankSum=2.748;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=6.609;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.446;SOR=1.491;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,452 0/1:30,42:72:99:.:1182,0,687:13,17,12,30 +chrX 3424795 . T A 616 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.38;BaseQRankSum=-0.189;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.221;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.998;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,452 0/1:18,24:42:99:.:646,0,459:8,10,9,15 +chrX 3424846 . AT A 397.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.81;BaseQRankSum=1.017;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.602;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,452 0/1:19,18:37:99:.:437,0,456:9,10,9,9 +chrX 3426245 . A G 1510 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=19.49;BaseQRankSum=-0.464;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=7.833;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.347;SOR=0.839;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:899,0:0,0,11,16 0/1:27,25:52:99:641,0,718:16,11,11,14 +chrX 3426863 . T C 608 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=17.24;BaseQRankSum=-0.808;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.106;MQ=59.57;MQRankSum=0;QD=17.24;ReadPosRankSum=-1.273;SOR=1.202;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:13,24:37:99:.:638,0,306:6,7,15,9 +chrX 3427089 . G A 647 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=19.91;BaseQRankSum=0.075;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=1.491;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.976;SOR=1.201;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:11,23:34:99:.:677,0,270:5,6,8,15 +chrX 3428194 . G A 403 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.41;BaseQRankSum=1.478;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=6.286;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.865;SOR=1.634;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:29,17:46:99:.:433,0,780:15,14,12,5 +chrX 3428470 . G A 840 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.61;BaseQRankSum=-1.211;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=1.990;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.612;SOR=0.458;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:35,34:69:99:.:870,0,945:15,20,17,17 +chrX 3429136 . T TAA 908.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=21.55;BaseQRankSum=1.075;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=2.548;MQ=59.54;MQRankSum=0.836;QD=21.55;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.392;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,416 0|1:20,24:44:99:.:0|1:3429136_T_TAA:948,0,757:3429136:12,8,12,12 +chrX 3429141 . C A 944 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=21.17;BaseQRankSum=2.281;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.512;MQ=59.55;MQRankSum=0.824;QD=21.17;ReadPosRankSum=1.103;SOR=0.392;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,416 0|1:21,25:46:99:.:0|1:3429136_T_TAA:974,0,784:3429136:13,8,13,12 +chrX 3430104 . A G 949 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.79;BaseQRankSum=-1.818;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.020;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.79;ReadPosRankSum=1.062;SOR=0.869;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:25,37:62:99:.:979,0,653:16,9,25,12 +chrX 3430546 . C T 515 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.11;BaseQRankSum=0.867;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=1.276;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:24,21:45:99:.:545,0,650:13,11,14,7 +chrX 3430617 . T C 766 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.92;BaseQRankSum=0.274;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=4.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.275;SOR=1.329;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:21,29:50:99:.:796,0,527:11,10,19,10 +chrX 3430769 . G A 1023 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=17.26;BaseQRankSum=-1.101;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=1.008;MQ=59.82;MQRankSum=-0.772;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=0.984;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:24,37:61:99:.:1053,0,626:12,12,21,16 +chrX 3430896 . ACACC A 849.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.77;BaseQRankSum=-0.492;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=9.929;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=1.016;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:27,26:53:99:.:889,0,952:17,10,10,16 +chrX 3431221 . A G 700 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.59;BaseQRankSum=1.026;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.697;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.59;ReadPosRankSum=2.071;SOR=1.230;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:30,28:58:99:.:730,0,774:13,17,9,19 +chrX 3431606 . C CAAAAA 743.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=19.10;BaseQRankSum=-0.699;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.963;MQ=59.89;MQRankSum=-0.927;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.475;SOR=0.293;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:20,21:41:99:.:783,0,716:15,5,13,8 +chrX 3431800 . T A 287 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=8.34;BaseQRankSum=0.632;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.608;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:25,13:38:99:.:317,0,694:14,11,7,6 +chrX 3431902 . A G 1187 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=23.86;BaseQRankSum=-0.481;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=6.118;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.01;SOR=1.154;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,416 0|1:19,32:51:99:.:0|1:3431902_A_G:1217,0,669:3431902:8,11,20,12 +chrX 3431910 . A C 1152 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=22.73;BaseQRankSum=-0.169;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.73;ReadPosRankSum=0.804;SOR=1.165;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,416 0|1:21,31:52:99:.:0|1:3431902_A_G:1182,0,717:3431902:10,11,19,12 +chrX 3431957 . GCGCACA G 953.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=18.39;BaseQRankSum=0.057;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.840;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.39;ReadPosRankSum=1.114;SOR=1.099;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:26,28:54:99:.:993,0,947:12,14,17,11 +chrX 3432713 . T C 476 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.77;BaseQRankSum=0.753;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=6.638;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=1.555;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:24,19:43:99:.:506,0,675:13,11,6,13 +chrX 3432885 . CT C 612.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.78;BaseQRankSum=-1.13;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.110;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=1.028;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:22,29:51:99:.:652,0,508:12,10,18,11 +chrX 3432919 . T C 954 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.68;BaseQRankSum=0.533;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=2.230;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.741;SOR=0.432;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:24,35:59:99:.:984,0,647:15,9,19,16 +chrX 3433039 . C A 735 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.94;BaseQRankSum=0.399;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.509;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.55;SOR=0.745;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:21,27:48:99:.:765,0,541:12,9,12,15 +chrX 3433457 . T C 899 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.58;BaseQRankSum=-0.065;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.064;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.58;ReadPosRankSum=1.379;SOR=0.874;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,416 0|1:26,24:50:99:.:0|1:3433457_T_C:929,0,993:3433457:14,12,14,10 +chrX 3433458 . A C 899 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.58;BaseQRankSum=0.206;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.064;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.58;ReadPosRankSum=1.408;SOR=0.874;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,416 0|1:26,24:50:99:.:0|1:3433457_T_C:929,0,993:3433457:14,12,14,10 +chrX 3433617 . G T 633 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.79;BaseQRankSum=0.171;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=4.368;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.440;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:19,23:42:99:.:663,0,524:12,7,11,12 +chrX 3433938 . GTCTA G,GTCTATCTA 1783.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,25;AS_QD=31.02,26.67;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.43;SOR=0.990;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416,416 1/2:0,19,25:44:99:.:1823,1033,1033,795,0,721:0,0,19,25 +chrX 3434084 . C T 730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.57;BaseQRankSum=-0.693;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.268;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.575;SOR=0.758;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:27,29:56:99:.:760,0,705:15,12,13,16 +chrX 3434331 . C G 614 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.88;BaseQRankSum=-0.107;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.728;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:26,24:50:99:.:644,0,713:10,16,9,15 +chrX 3434599 . C G 962 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=16.53;BaseQRankSum=1.409;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.667;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.440;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,416 0/1:23,37:60:99:.:992,0,486:9,14,19,18 +chrX 3434787 . A G 2365 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.93;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.93;SOR=0.719;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1230,0:0,0,17,20 1/1:0,38:38:99:1165,114,0:0,0,20,18 +chrX 3434949 . C T 511 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.21;BaseQRankSum=0.736;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.417;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.519;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,456 0/1:32,21:53:99:.:541,0,868:19,13,10,11 +chrX 3435468 . A T 932 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=0.46;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=4.388;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.243;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:99:34:.:.:0,456 0|1:29,26:55:99:.:0|1:3435468_A_T:962,0,1117:3435468:6,23,9,17 +chrX 3435470 . A C 932 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=-1.432;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=4.388;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.243;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:99:34:.:.:0,456 0|1:29,26:55:99:.:0|1:3435468_A_T:962,0,1117:3435468:6,23,9,17 +chrX 3435800 . T C 664 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.61;BaseQRankSum=1.397;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.26;MQRankSum=-3.385;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.329;SOR=0.622;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,456 0/1:25,26:51:99:.:694,0,611:13,12,13,13 +chrX 3435834 . C CATAA 862.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=20.50;BaseQRankSum=-1.706;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.30;MQRankSum=-4.378;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.859;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,456 0/1:21,23:44:99:.:902,0,813:11,10,13,10 +chrX 3436023 . T C 574 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.10;BaseQRankSum=-0.545;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.254;MQ=55.13;MQRankSum=-3.901;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.443;SOR=0.437;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:99:34:.:.:0,456 0|1:23,17:40:99:.:0|1:3436023_T_C:604,0,903:3436023:9,14,8,9 +chrX 3436032 . C G 549 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=14.48;BaseQRankSum=-0.23;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.60;MQRankSum=-3.82;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.58;SOR=0.610;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:99:34:.:.:0,456 0|1:24,16:40:99:.:0|1:3436023_T_C:579,0,938:3436023:10,14,7,9 +chrX 3436263 . T G 1023 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=18.47;BaseQRankSum=-1.224;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=1.058;MQ=45.75;MQRankSum=1.436;QD=18.47;ReadPosRankSum=-1.304;SOR=0.465;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:643,0:0,0,11,9 0/1:21,16:37:99:410,0,582:9,12,7,9 +chrX 3436279 . C G 1275 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=24.17;BaseQRankSum=0.208;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=1.075;MQ=41.30;MQRankSum=2.178;QD=24.17;ReadPosRankSum=-1.45;SOR=0.811;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19:19:99:.:.:803,0:.:0,0,9,10 0|1:21,14:35:99:0|1:3436279_C_G:502,0,828:3436279:11,10,6,8 +chrX 3436282 . T C 1279 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=24.24;BaseQRankSum=0.252;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=1.075;MQ=40.83;MQRankSum=1.906;QD=24.24;ReadPosRankSum=-1.313;SOR=0.811;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:837,0:.:0,0,9,11 0|1:21,13:34:99:0|1:3436279_C_G:472,0,831:3436279:11,10,6,7 +chrX 3436448 . C T 923 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=17.02;BaseQRankSum=0.093;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=1.030;MQ=45.88;MQRankSum=-1.444;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.04;SOR=0.519;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:505,0:0,0,8,7 0/1:24,17:41:99:448,0,672:14,10,9,8 +chrX 3436853 . GTA G 1638.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=26.63;BaseQRankSum=-0.614;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=1.161;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.128;SOR=1.022;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1082,0:0,0,18,11 0/1:15,19:34:99:596,0,408:8,7,11,8 +chrX 3437397 . CTG C 1670.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=21.38;BaseQRankSum=-0.544;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=3.031;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.38;ReadPosRankSum=-1.573;SOR=1.051;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1151,0:0,0,16,15 0/1:30,19:49:99:559,0,948:15,15,13,6 +chrX 3437591 . T C 1142 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=1.161;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.916;SOR=0.792;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22:23:99:604,0:0,1,10,12 0/1:22,22:44:99:568,0,628:11,11,10,12 +chrX 3437715 . AGTGT A 1700.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=28.52;BaseQRankSum=0.161;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.52;ReadPosRankSum=0.675;SOR=0.628;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,22:22:99:.:.:953,0:.:0,0,9,13 0|1:18,21:39:99:0|1:3437715_AGTGT_A:787,0,645:3437715:8,10,11,10 +chrX 3438607 . G A 1751 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=17.63;BaseQRankSum=2.499;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.63;ReadPosRankSum=2.089;SOR=0.692;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,25:27:99:768,0:1,1,10,15 0/1:34,40:74:99:1013,0,919:19,15,26,14 +chrX 3438865 . A AT 1319.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=17.20;BaseQRankSum=0.37;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=4.629;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=0.694;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:784,0:0,0,15,12 0/1:26,26:52:99:575,0,625:11,15,14,12 +chrX 3439504 . C CA,CAA 93.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,3;AS_QD=13.14,16.63;BaseQRankSum=1.085;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.21;MQRankSum=-0.765;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.1;SOR=0.693;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,387,387 0/2:5,2,3:10:41:.:133,41,103,0,45,95:4,1,4,1 +chrX 3439563 . C T 1728 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=24.42;BaseQRankSum=-0.457;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=11.063;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=24.42;ReadPosRankSum=-2.099;SOR=0.110;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1018,0:0,0,16,15 0/1:15,26:41:99:740,0,378:12,3,14,12 +chrX 3441677 . G A 1863 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=21.27;BaseQRankSum=1.77;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=8.233;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.776;SOR=1.652;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1023,0:0,0,23,7 0/1:27,32:59:99:870,0,661:14,13,20,12 +chrX 3441813 . G A 2625 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=23.50;BaseQRankSum=-1.472;DP=114;ExcessHet=0.0000;FS=13.525;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.50;ReadPosRankSum=1.177;SOR=0.239;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1499,0:0,0,26,21 0/1:25,41:66:99:1156,0,644:7,18,19,22 +chrX 3442364 . A G 1328 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=20.89;BaseQRankSum=-1.771;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=12.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.207;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:779,0:0,0,14,9 0/1:20,22:42:99:579,0,544:5,15,9,13 +chrX 3442583 . GT G 911.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=13.39;BaseQRankSum=-0.271;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.798;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,24:25:99:645,0:0,1,15,9 0/1:28,18:46:99:306,0,549:18,10,12,6 +chrX 3443171 . C CT 574.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=10.41;BaseQRankSum=0.658;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.204;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.078;SOR=0.547;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,705 0/1:31,28:59:99:.:614,0,707:19,12,13,15 +chrX 3445593 . C T 2217 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.57;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=32.57;SOR=0.980;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:967,0:0,0,15,15 1/1:0,39:39:99:1280,117,0:0,0,24,15 +chrX 3446099 . CA C 268.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=7.51;BaseQRankSum=2.46;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=27.864;MQ=58.73;MQRankSum=1.038;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.75;SOR=2.014;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,11:14:99:154,0:0,3,7,4 0/1:14,13:27:99:154,0,165:4,10,11,2 +chrX 3446149 . A G 560 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.75;BaseQRankSum=0.351;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=2.699;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.75;ReadPosRankSum=-2.04;SOR=0.368;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,744 0/1:18,22:40:99:.:590,0,451:7,11,11,11 +chrX 3447667 . A C 3532 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=32.38;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=0.888;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1195,0:0,0,14,23 1/1:0,73:73:99:2367,218,0:0,0,36,37 +chrX 3448083 . ATC A 1931.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=26.64;BaseQRankSum=2.396;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=13.285;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.722;SOR=0.970;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,25:27:99:.:.:1004,0:.:1,1,11,14 0|1:21,26:47:99:0|1:3448083_ATC_A:967,0,741:3448083:14,7,9,17 +chrX 3448087 . ATC A 1925.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=25.86;BaseQRankSum=1.825;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=12.782;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.981;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,25:27:99:.:.:1004,0:.:1,1,11,14 0|1:23,26:49:99:0|1:3448083_ATC_A:961,0,805:3448083:15,8,9,17 +chrX 3448155 . A G 274 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=7.41;BaseQRankSum=-1.171;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.273;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.002;SOR=1.112;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,739 0/1:26,15:41:99:.:304,0,717:13,13,9,6 +chrX 3448220 . C T 2427 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.66;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.66;SOR=1.103;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:799,0:0,0,10,13 1/1:0,50:50:99:1658,150,0:0,0,33,17 +chrX 3448639 . G A 1333 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.67;BaseQRankSum=-0.436;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=8.288;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.67;ReadPosRankSum=0;SOR=0.462;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:839,0:0,0,12,14 0/1:26,21:47:99:524,0,713:9,17,13,8 +chrX 3449299 . C T 535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.56;BaseQRankSum=-1.154;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.145;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.655;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,432 0/1:24,21:45:99:.:565,0,689:13,11,10,11 +chrX 3449402 . C T 500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.72;BaseQRankSum=-1.454;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=0.693;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,432 0/1:16,20:36:99:.:530,0,438:8,8,10,10 +chrX 3450648 . C CT 264.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=8.44;BaseQRankSum=1.141;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.745;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,432 0/1:21,15:36:99:.:304,0,483:11,10,7,8 +chrX 3451314 . C T 1572 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=19.78;BaseQRankSum=1.194;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=9.839;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.78;ReadPosRankSum=-1.078;SOR=0.623;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:981,0:0,0,14,15 0/1:29,23:52:99:621,0,792:10,19,15,8 +chrX 3451839 . A G 477 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.08;BaseQRankSum=1.831;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=3.110;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.538;SOR=1.536;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,421 0/1:18,18:36:99:.:507,0,438:10,8,13,5 +chrX 3451893 . G GAA,GAAA 1528.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,19;AS_QD=31.68,27.45;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.29;QD=38.24;SOR=0.954;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,0:14:99:368,0,368:0,0,6,8 1/2:0,8,19:27:93:1200,389,277,206,0,93:0,0,12,15 +chrX 3452466 . CATCTATCTATCTATCT C,CATCTATCTATCT 1977.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=35,12;AS_QD=30.87,28.36;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.91;SOR=0.919;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16,0:16:99:721,0,721:0,0,5,11 1/2:0,19,12:31:99:1296,504,487,792,0,755:0,0,16,15 +chrX 3453784 . C T 1885 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=21.04;BaseQRankSum=0.291;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.27;SOR=0.796;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:957,0:0,0,15,14 0/1:27,35:62:99:958,0,675:12,15,12,23 +chrX 3454227 . G A 1862 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=22.26;BaseQRankSum=0;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.890;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.26;ReadPosRankSum=-2.357;SOR=0.693;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1270,0:0,0,22,16 0/1:25,22:47:99:622,0,728:12,13,9,13 +chrX 3454740 . A T 1697 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=19.40;BaseQRankSum=-1.391;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.614;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1042,0:0,0,19,14 0/1:30,26:56:99:685,0,855:18,12,15,11 +chrX 3454933 . T G 1573 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=20.82;BaseQRankSum=-1.225;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.82;ReadPosRankSum=0.599;SOR=0.640;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:814,0:0,0,9,15 0/1:24,29:53:99:789,0,655:10,14,14,15 +chrX 3455088 . T G 1708 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=22.28;BaseQRankSum=-0.468;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=7.308;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.28;ReadPosRankSum=0.4;SOR=0.784;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:919,0:0,0,16,11 0/1:19,32:51:99:819,0,437:7,12,18,14 +chrX 3455173 . T G 2677 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.42;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=1.058;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1109,0:0,0,24,11 1/1:0,46:46:99:1598,138,0:0,0,23,23 +chrX 3455501 . G A 2629 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.04;BaseQRankSum=-0.273;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.063;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.04;ReadPosRankSum=-1.53;SOR=0.300;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,33:34:99:1042,0:1,0,17,16 1/1:0,49:49:99:1617,147,0:0,0,23,26 +chrX 3455708 . A G 2557 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.94;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.94;SOR=0.821;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1132,0:0,0,15,19 1/1:0,47:47:99:1455,140,0:0,0,23,24 +chrX 3456599 . G A 504 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.14;BaseQRankSum=0.615;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.752;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,532 0/1:24,20:44:99:.:534,0,622:10,14,8,12 +chrX 3456605 . T TTCTCTCTCTCTCTCTC,TTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 1073.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,13;AS_QD=21.43,17.41;BaseQRankSum=1.241;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.836;MQ=58.71;MQRankSum=0.056;QD=25.88;ReadPosRankSum=1.308;SOR=1.255;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,16,0:17:99:643,0,670:0,1,5,11 0/2:13,0,13:26:99:470,512,997,0,484,445:7,6,6,7 +chrX 3456670 . TCCC T 1014.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=26.68;BaseQRankSum=0.787;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=22.143;MQ=58.40;MQRankSum=-0.189;QD=37.64;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=3.500;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,11:12:99:472,0:1,0,1,10 0/1:2,14:16:1:582,0,1:2,0,2,12 +chrX 3457400 . G T 784 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.96;BaseQRankSum=1.598;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.373;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.426;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,292 0/1:22,29:51:99:.:814,0,527:14,8,16,13 +chrX 3457838 . T C 684 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=18.31;BaseQRankSum=-1.363;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=1.307;MQ=59.50;MQRankSum=0;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.465;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,292 0/1:13,26:39:99:.:714,0,325:5,8,12,14 +chrX 3458263 . A G 3046 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=32.38;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=0.802;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1012,0:0,0,14,17 1/1:0,64:64:99:2064,192,0:0,0,36,28 +chrX 3459474 . G A 685 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=2.781;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.770;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,561 0/1:26,25:51:99:.:715,0,680:13,13,12,13 +chrX 3460018 . C A 780 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.88;BaseQRankSum=0.357;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.978;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.685;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,561 0/1:22,29:51:99:.:810,0,567:9,13,16,13 +chrX 3461118 . T C 1806 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=18.73;BaseQRankSum=-0.975;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.714;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1219,0:0,0,22,16 0/1:34,26:60:99:617,0,953:19,15,14,12 +chrX 3462637 . CCACACACA C,CCACA 2432.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=21,37;AS_QD=26.80,24.21;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.66;QD=42.62;SOR=1.179;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21,0:21:99:901,0,901:0,0,15,6 2/2:0,0,37:37:99:1571,1571,1571,111,111,0:0,0,20,17 +chrX 3463004 . T C 684 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.87;BaseQRankSum=1.183;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.170;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.87;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=0.442;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,665 0/1:20,25:45:99:.:714,0,518:8,12,12,13 +chrX 3463302 . C G 1762 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=21.08;BaseQRankSum=1.376;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.08;ReadPosRankSum=-0.98;SOR=0.636;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,44:44:99:1354,0:0,0,18,26 0/1:24,17:41:99:438,0,621:11,13,11,6 +chrX 3463471 . T C 1459 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=19.09;BaseQRankSum=-1.063;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=4.576;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.943;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:988,0:0,0,16,14 0/1:26,22:48:99:501,0,676:12,14,14,8 +chrX 3463844 . G A 550 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.50;BaseQRankSum=1.362;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.701;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,724 0/1:19,21:40:99:.:580,0,465:10,9,10,11 +chrX 3464528 . C CT 1331.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=26.37;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=26.37;SOR=1.358;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:632,0:0,0,15,9 1/1:0,28:28:84:739,84,0:0,0,18,10 +chrX 3464612 . T C 2178 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.00;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=0.910;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:888,0:0,0,13,15 1/1:0,41:41:99:1320,123,0:0,0,25,16 +chrX 3465167 . T TCCGGAAGAG 3940.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=29.30;BaseQRankSum=1.59;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=41.03;ReadPosRankSum=-2.645;SOR=0.668;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,34:37:99:1326,0:2,1,19,15 1/1:0,60:60:99:2654,180,0:0,0,37,23 +chrX 3465273 . G A 638 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.77;BaseQRankSum=0.543;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=17.050;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.691;SOR=1.568;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:37:99:37:0,759 0/1:36,26:62:99:.:668,0,909:23,13,8,18 +chrX 3465493 . C T 3235 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=31.70;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=31.70;SOR=0.752;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:909,0:0,0,14,15 1/1:0,74:74:99:2356,222,0:0,0,36,38 +chrX 3465761 . A T 656 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.43;BaseQRankSum=1.973;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.442;SOR=0.646;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,605 0/1:35,25:60:99:.:686,0,1026:20,15,14,11 +chrX 3466182 . A ATATATT 4541.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=31.41;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.91;SOR=0.773;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1702,0:0,0,17,21 1/1:0,64:64:99:2879,192,0:0,0,32,32 +chrX 3466362 . T C 3087 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.16;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.16;SOR=0.924;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1137,0:0,0,18,16 1/1:0,60:60:99:1980,180,0:0,0,34,26 +chrX 3466884 . A T 2189 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=34.14;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.14;SOR=1.000;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:615,0:0,0,9,9 1/1:0,47:47:99:1604,141,0:0,0,19,28 +chrX 3466949 . C CTTTT,CTTTTTT 2132.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=33,9;AS_QD=30.52,26.34;BaseQRankSum=1.651;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=3.324;MQ=56.53;MQRankSum=-0.456;QD=50.51;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.525;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0:17:99:636,0,637:0,0,9,8 1/2:1,16,9:26:99:1536,215,130,413,0,333:0,1,14,11 +chrX 3466996 . A C 1507 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=33.41;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=33.41;SOR=1.329;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:500,0:0,0,6,9 1/1:0,31:31:93:1037,93,0:0,0,11,20 +chrX 3467498 . C CA 103.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=17.88;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.91;QD=17.88;SOR=1.863;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,8:8:99:.:143,0:0,0,6,2 0/0:.:35:0:35:0,0,759 +chrX 3469458 . G A 721 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.73;BaseQRankSum=2.048;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.502;SOR=0.787;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,432 0/1:32,27:59:99:.:751,0,889:17,15,15,12 +chrX 3470465 . C T 301 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=7.88;BaseQRankSum=0.324;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=6.822;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.321;SOR=0.687;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,432 0/1:28,14:42:99:.:331,0,762:10,18,8,6 +chrX 3470873 . C CT 452.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.25;BaseQRankSum=0.46;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=2.479;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.25;ReadPosRankSum=-2.112;SOR=1.127;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,432 0/1:26,22:48:99:.:492,0,634:14,12,14,8 +chrX 3471378 . A G 686 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.51;BaseQRankSum=1.158;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.73;SOR=0.790;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,432 0/1:27,26:53:99:.:716,0,675:14,13,12,14 +chrX 3471471 . T C 744 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=18.00;BaseQRankSum=0;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.333;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.982;SOR=1.140;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,432 0/1:17,26:43:99:.:774,0,462:6,11,7,19 +chrX 3474697 . T A 1479 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.12;BaseQRankSum=-1.429;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.244;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.223;SOR=1.133;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:976,0:0,0,19,12 0/1:23,21:44:99:533,0,650:14,9,17,4 +chrX 3474878 . G GAAAGAAAAGAAA 1087.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.87;BaseQRankSum=-0.795;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.055;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.87;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=0.976;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,372 0/1:25,29:54:99:.:1127,0,941:12,13,12,17 +chrX 3475860 . C A 747 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.94;BaseQRankSum=-1.204;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.775;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.496;SOR=0.612;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,372 0/1:24,28:52:99:.:777,0,668:14,10,13,15 +chrX 3476342 . A AAAG 808.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=19.72;BaseQRankSum=0.265;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.363;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.512;SOR=1.080;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,372 0/1:20,23:43:99:.:848,0,711:9,11,14,9 +chrX 3477090 . A T 687 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.53;BaseQRankSum=-1.012;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=5.608;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.166;SOR=1.232;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,372 0/1:26,27:53:99:.:717,0,713:14,12,10,17 +chrX 3478216 . G C 370 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=10.81;BaseQRankSum=-0.827;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.532;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,372 0/1:21,16:37:99:.:400,0,599:14,7,10,6 +chrX 3479083 . A T 597 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.63;BaseQRankSum=2.003;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=6.311;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.77;SOR=0.517;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,372 0/1:24,22:46:99:.:627,0,641:8,16,12,10 +chrX 3479162 . A ACAG 992.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=25.80;BaseQRankSum=-0.366;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.302;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.661;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,372 0|1:14,26:40:99:.:0|1:3479162_A_ACAG:1032,0,473:3479162:6,8,14,12 +chrX 3479164 . C G 1002 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=25.80;BaseQRankSum=-0.069;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.302;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.661;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,372 0|1:14,26:40:99:.:0|1:3479162_A_ACAG:1032,0,473:3479162:6,8,14,12 +chrX 3479989 . AAAG A 764.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.11;BaseQRankSum=0.794;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.110;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.821;SOR=0.475;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,372 0|1:26,21:47:99:.:0|1:3479989_AAAG_A:804,0,1028:3479989:10,16,11,10 +chrX 3480375 . C CT 351.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.17;BaseQRankSum=0.484;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.377;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.357;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,372 0/1:15,20:35:99:.:391,0,277:5,10,9,11 +chrX 3481019 . G A 598 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.63;BaseQRankSum=2.522;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.713;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,372 0/1:31,23:54:99:.:628,0,785:16,15,12,11 +chrX 3481174 . C T 1077 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=31.63;BaseQRankSum=-0.269;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=3.680;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=31.63;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.793;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,34:35:99:.:1107,0:1,0,14,20 0/0:.:63:99:63:0,120,1800 +chrX 3481819 . AT A,ATTT 98.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=12,0;AS_QD=5.31,0.00;BaseQRankSum=0.366;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.770;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.721;SOR=0.307;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,566,566 0/1:14,12,0:26:99:.:138,0,310,215,270,765:3,11,4,8 +chrX 3482025 . T C 267 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.90;BaseQRankSum=0.193;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=3.399;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.799;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,566 0/1:18,12:30:99:.:297,0,485:11,7,5,7 +chrX 3482452 . C A 1562 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.68;BaseQRankSum=0.601;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=10.404;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.68;ReadPosRankSum=2.41;SOR=1.079;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1052,0:0,0,19,13 0/1:25,20:45:99:540,0,690:10,15,13,7 +chrX 3482475 . G A 534 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.82;BaseQRankSum=3.46;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=6.473;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.907;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:26:19:0,26 0/1:24,20:44:99:.:564,0,577:15,9,8,12 +chrX 3482715 . CT C,CTTTTTTTT 399.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,10;AS_QD=12.00,26.94;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.55;QD=29.27;SOR=1.473;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:26:19:0,26,26 1/2:0,5,10:15:76:.:439,379,477,76,0,161:0,0,10,5 +chrX 3482954 . C T 1528 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=19.72;BaseQRankSum=1.627;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.893;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.900;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,29:30:99:970,0:0,1,15,14 0/1:27,22:49:99:588,0,686:14,13,8,14 +chrX 3483463 . A G 701 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=-0.017;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.223;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=0.278;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,620 0/1:31,30:61:99:.:731,0,751:21,10,16,14 +chrX 3483702 . TTTCTTTCTTTC T 689.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=19.18;BaseQRankSum=0.08;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=3.053;MQ=58.72;MQRankSum=1.81;QD=19.18;ReadPosRankSum=2.347;SOR=0.250;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,620 0/1:19,19:38:99:.:729,0,710:5,14,8,11 +chrX 3483706 . TTTCTTTCTTTCTTTCTTTC T,* 2214.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,19;AS_QD=26.49,0.00;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.78;QD=40.98;SOR=1.609;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,0:18:99:749,0,749:0,0,6,12 1/2:0,18,19:37:99:1505,784,762,724,0,707:0,0,12,25 +chrX 3483800 . TTC T 454.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=14.53;BaseQRankSum=1.055;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=8.500;MQ=58.56;MQRankSum=0.896;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.595;SOR=2.303;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:17:99:17:0,264 0/1:20,14:34:99:.:494,0,737:8,12,2,12 +chrX 3483896 . CCTTT C 401.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=16.96;BaseQRankSum=0.627;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;MQRankSum=-1.003;QD=16.96;ReadPosRankSum=-1.333;SOR=0.829;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:17:99:17:0,264 0/1:14,12:26:99:.:441,0,492:4,10,3,9 +chrX 3484002 . C CTTCTTTCTTTCT,CTTCTTTCTTTTT 489.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=14,0;AS_QD=23.00,8.22;BaseQRankSum=-0.904;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=11.129;MQ=59.19;MQRankSum=-1.095;QD=23.00;ReadPosRankSum=0.378;SOR=2.233;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:17:99:17:0,264,264 0/1:9,14,0:23:99:.:529,0,356,455,413,1183:6,3,3,11 +chrX 3484057 . C CTTTCTTT,CTTT 1089.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=14,16;AS_QD=17.48,15.77;BaseQRankSum=-2.288;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=6.230;MQ=59.11;MQRankSum=-0.082;QD=23.04;ReadPosRankSum=-0.19;SOR=1.206;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,0:14:99:577,0,577:0,0,8,6 0/2:19,0,16:35:99:552,609,1371,0,762,714:8,11,11,5 +chrX 3484490 . A T 2678 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.86;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.86;SOR=0.815;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:818,0:0,0,11,15 1/1:0,59:59:99:1890,176,0:0,0,34,25 +chrX 3484638 . T A 2922 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.44;BaseQRankSum=2.646;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.156;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.44;ReadPosRankSum=1.453;SOR=0.365;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:928,0:0,0,15,14 1/1:1,61:62:99:2024,162,0:1,0,28,33 +chrX 3484707 . A G 1151 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=17.89;BaseQRankSum=1.933;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=9.048;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.89;ReadPosRankSum=-1.076;SOR=0.177;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,596 0/1:26,40:66:99:.:1181,0,665:7,19,19,21 +chrX 3485351 . C T 822 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.72;BaseQRankSum=1.751;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.305;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.613;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,596 0/1:35,32:67:99:.:852,0,855:20,15,15,17 +chrX 3486051 . A G 1689 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=21.49;BaseQRankSum=0;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.931;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.836;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:929,0:1,0,14,14 0/1:21,30:51:99:790,0,578:10,11,13,17 +chrX 3486140 . A C 1564 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=22.45;BaseQRankSum=2.617;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=5.309;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.45;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=0.431;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:698,0:0,0,10,12 0/1:19,30:49:99:896,0,473:12,7,15,15 +chrX 3486736 . A G 760 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.34;BaseQRankSum=-1.276;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.968;MQ=59.07;MQRankSum=-0.606;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.035;SOR=0.859;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,649 0/1:33,31:64:99:.:790,0,886:20,13,20,11 +chrX 3487271 . TATATATTATTATGTACAATAATATATAATATATTATTATGTACAATAATATATA T 1929.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=25.57;BaseQRankSum=-0.235;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=6.211;MQ=59.04;MQRankSum=-2.0;QD=25.57;ReadPosRankSum=0.775;SOR=0.575;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:806,0:.:0,0,13,5 0|1:29,30:59:99:0|1:3487271_TATATATTATTATGTACAATAATATATAATATATTATTATGTACAATAATATATA_T:1163,0,1118:3487271:11,18,13,17 +chrX 3487358 . TTA T 533.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.24;BaseQRankSum=-0.605;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.68;MQRankSum=1.537;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.767;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:99:34:.:.:0,178 0|1:40,22:62:99:.:1|0:3487271_TATATATTATTATGTACAATAATATATAATATATTATTATGTACAATAATATATA_T:573,0,1585:3487271:19,21,10,12 +chrX 3487362 . GTACAATAATATATAATATATTA G 514.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=8.03;BaseQRankSum=-0.333;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.956;MQ=58.84;MQRankSum=1.415;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=0.827;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:99:34:.:.:0,178 0|1:47,22:69:99:.:1|0:3487271_TATATATTATTATGTACAATAATATATAATATATTATTATGTACAATAATATATA_T:554,0,1753:3487271:23,24,10,12 +chrX 3487568 . A T 570 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.00;BaseQRankSum=1.56;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=5.366;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.7;SOR=0.744;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,178 0/1:37,23:60:99:.:600,0,984:22,15,10,13 +chrX 3487626 . T C 488 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.42;BaseQRankSum=-2.304;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=5.479;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=0.747;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,178 0/1:32,23:55:99:.:518,0,895:19,13,10,13 +chrX 3488003 . CATATA C 695.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=18.38;BaseQRankSum=-0.421;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=9.923;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.38;ReadPosRankSum=2.322;SOR=0.289;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,178 0/1:21,19:40:99:.:735,0,824:5,16,10,9 +chrX 3488049 . A G 1186 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=16.89;BaseQRankSum=1.307;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.939;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.551;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,29:30:99:772,0:0,1,16,13 0/1:23,19:42:99:444,0,879:11,12,8,11 +chrX 3488065 . TATA T 768.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=19.24;BaseQRankSum=-2.004;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.3;SOR=0.693;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,305 0/1:21,21:42:99:.:808,0,809:9,12,9,12 +chrX 3488109 . C T 523 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.84;BaseQRankSum=-0.296;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.04;MQRankSum=0.092;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.313;SOR=0.801;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,305 0/1:29,22:51:99:.:553,0,750:14,15,10,12 +chrX 3488752 . TATA T 755.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=17.67;BaseQRankSum=-0.581;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.457;SOR=0.784;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,305 0/1:24,21:45:99:.:795,0,934:12,12,10,11 +chrX 3488863 . CACTT C 648.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=16.38;BaseQRankSum=-0.344;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.172;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.38;ReadPosRankSum=-2.211;SOR=0.922;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,305 0/1:23,19:42:99:.:688,0,897:11,12,8,11 +chrX 3489131 . T C 883 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=18.26;BaseQRankSum=0.549;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.434;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.76;SOR=0.490;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,305 0|1:25,25:50:99:.:0|1:3489131_T_C:913,0,893:3489131:10,15,13,12 +chrX 3489150 . A G 861 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=19.37;BaseQRankSum=-1.68;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=4.040;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.211;SOR=0.627;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,305 0|1:22,24:46:99:.:0|1:3489131_T_C:891,0,831:3489131:9,13,13,11 +chrX 3489318 . G A 300 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=11.38;BaseQRankSum=-1.642;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=1.485;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.349;SOR=1.110;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,305 0/1:14,15:29:99:.:330,0,379:8,6,10,5 +chrX 3489570 . C T 883 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=31.48;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.48;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:913,0:0,0,15,14 0/0:.:55:63:55:0,63,758 +chrX 3490774 . T C 963 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=16.28;BaseQRankSum=-2.915;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.592;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,625 0/1:24,37:61:99:.:993,0,651:15,9,22,15 +chrX 3491239 . C A 629 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.98;BaseQRankSum=0.41;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.038;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.810;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,625 0/1:31,24:55:99:.:659,0,877:16,15,11,13 +chrX 3491296 . T C 564 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.80;BaseQRankSum=0.467;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.310;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.205;SOR=0.880;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,625 0/1:32,23:55:99:.:594,0,862:15,17,13,10 +chrX 3491523 . C T 1968 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=20.60;BaseQRankSum=1.079;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.60;ReadPosRankSum=-2.713;SOR=0.667;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1197,0:0,0,17,18 0/1:32,30:62:99:801,0,845:18,14,19,11 +chrX 3491699 . G A 2343 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=33.42;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;QD=33.42;SOR=0.971;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:859,0:0,0,12,14 1/1:0,45:45:99:1514,135,0:0,0,19,26 +chrX 3491936 . G A 2737 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.74;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=33.74;SOR=0.793;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1104,0:0,0,17,16 1/1:0,49:49:99:1663,147,0:0,0,22,27 +chrX 3492628 . A G 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.28;BaseQRankSum=-2.752;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=11.980;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.814;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,462 0/1:31,27:58:99:.:654,0,894:21,10,11,16 +chrX 3492787 . G C 750 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.93;BaseQRankSum=-2.295;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.302;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.412;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,462 0/1:26,30:56:99:.:780,0,726:9,17,13,17 +chrX 3494492 . C T 1952 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=22.02;BaseQRankSum=-0.197;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.278;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.02;ReadPosRankSum=-1.748;SOR=1.196;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:908,0:0,0,15,12 0/1:24,39:63:99:1074,0,595:12,12,25,14 +chrX 3495553 . T C 1412 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=18.25;BaseQRankSum=-1.887;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.960;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.143;SOR=0.443;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:794,0:0,0,11,13 0/1:28,27:55:99:648,0,758:11,17,13,14 +chrX 3495823 . A G 1773 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=21.46;BaseQRankSum=-0.705;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.945;MQ=57.06;MQRankSum=0.616;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.615;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,15,10 0/1:22,37:59:99:974,0,523:10,12,17,20 +chrX 3496584 . G T 1376 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=17.36;BaseQRankSum=1.081;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=9.163;MQ=57.45;MQRankSum=2.387;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=0.468;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:861,0:0,0,15,11 0/1:34,21:55:99:545,0,942:12,22,10,11 +chrX 3496669 . C T 1827 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=23.81;BaseQRankSum=-1.127;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.023;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.939;SOR=0.998;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1013,0:0,0,16,14 0/1:19,29:48:99:844,0,514:10,9,19,10 +chrX 3497669 . G T 1512 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=22.68;BaseQRankSum=0.831;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=9.687;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=22.68;ReadPosRankSum=-0.807;SOR=0.549;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:848,0:0,0,12,13 0/1:19,24:43:99:694,0,510:6,13,15,9 +chrX 3498111 . A G 896 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.25;BaseQRankSum=-0.515;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.735;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,843 0/1:31,34:65:99:.:926,0,842:17,14,19,15 +chrX 3498397 . G A 1029 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=32.09;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.09;SOR=0.752;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,33:33:99:.:1059,0:0,0,16,17 0/0:.:57:95:57:0,95,1306 +chrX 3499212 . G T 958 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=32.93;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.93;SOR=0.693;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:988,0:0,0,15,15 0/0:.:57:95:57:0,95,1306 +chrX 3499332 . A G 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.26;BaseQRankSum=-2.079;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=5.212;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.525;SOR=0.289;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,411 0/1:28,30:58:99:.:769,0,774:10,18,15,15 +chrX 3499504 . G T 538 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.14;BaseQRankSum=0.742;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.751;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.708;SOR=1.145;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,411 0/1:33,23:56:99:.:568,0,834:17,16,9,14 +chrX 3501146 . T C 839 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.58;BaseQRankSum=-1.28;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=2.043;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.475;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,411 0/1:31,33:64:99:.:869,0,855:18,13,17,16 +chrX 3501947 . T C 759 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.44;BaseQRankSum=-2.076;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.134;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.896;SOR=0.950;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,411 0/1:19,29:48:99:.:789,0,516:10,9,17,12 +chrX 3502237 . CA C 2040.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=28.49;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.49;SOR=0.776;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:716,0:0,0,13,12 1/1:0,48:48:99:1364,144,0:0,0,25,23 +chrX 3503102 . G A 665 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.41;BaseQRankSum=0.458;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=1.031;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=12.41;ReadPosRankSum=-2.145;SOR=0.473;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,591 0/1:30,26:56:99:.:695,0,814:17,13,13,13 +chrX 3503278 . C T 794 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.08;BaseQRankSum=1.608;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.962;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.883;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,591 0/1:31,32:63:99:.:824,0,693:17,14,19,13 +chrX 3503318 . A G 781 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.52;BaseQRankSum=-1.355;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.191;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.764;SOR=1.112;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,591 0/1:28,32:60:99:.:811,0,754:14,14,13,19 +chrX 3503378 . G A 886 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.88;BaseQRankSum=0.41;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.74;MQRankSum=1.061;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.56;SOR=0.658;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,591 0/1:32,34:66:99:.:916,0,863:11,21,12,22 +chrX 3503478 . C T 2788 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.39;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=32.39;SOR=0.716;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:952,0:0,0,17,13 1/1:0,57:57:99:1866,171,0:0,0,26,31 +chrX 3503581 . A G 1750 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=21.45;BaseQRankSum=1.822;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.45;ReadPosRankSum=-1.922;SOR=0.800;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1003,0:0,0,15,15 0/1:26,27:53:99:777,0,714:13,13,12,15 +chrX 3503626 . C T 654 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.79;BaseQRankSum=-1.12;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.667;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.722;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:99:36:0,898 0/1:31,27:58:99:.:684,0,838:18,13,12,15 +chrX 3504088 . G C 1409 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.56;BaseQRankSum=0.473;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.770;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:872,0:0,0,14,15 0/1:18,23:41:99:567,0,408:9,9,11,12 +chrX 3505309 . A G 1656 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=22.18;BaseQRankSum=0.694;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=2.172;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=1.095;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1011,0:0,0,12,18 0/1:22,24:46:99:675,0,597:10,12,8,16 +chrX 3506302 . CAAAAAA C,CAAAAA,CAAAAAAA 767.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=15,5,15;AS_QD=28.90,0.90,10.00;BaseQRankSum=0.696;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=2.000;MQ=59.21;MQRankSum=-0.183;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.243;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,15,0,0:17:99:578,0,611,611:0,2,6,9 2/3:3,0,5,15:23:29:229,279,395,220,353,414,29,82,0,38:1,2,9,11 +chrX 3508097 . CT C 1080.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=15.56;BaseQRankSum=1.178;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=4.711;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.901;SOR=1.024;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:744,0:0,0,16,10 0/1:28,18:46:99:376,0,657:13,15,10,8 +chrX 3508582 . C T 1986 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=21.91;BaseQRankSum=0.373;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.859;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=21.91;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.818;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1087,0:0,0,16,17 0/1:26,33:59:99:929,0,686:13,13,15,18 +chrX 3509590 . C T 1849 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=18.98;BaseQRankSum=-0.623;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.773;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.711;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1390,0:0,0,26,16 0/1:37,20:57:99:489,0,1090:18,19,6,14 +chrX 3511598 . C CA 626.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.86;BaseQRankSum=-1.638;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=1.464;MQ=58.54;MQRankSum=-1.023;QD=15.86;ReadPosRankSum=-3.252;SOR=0.744;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:392,0:0,0,9,8 0/1:9,16:25:99:274,0,131:5,4,6,10 +chrX 3514032 . G A 1774 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=20.04;BaseQRankSum=0.766;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=5.832;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.655;SOR=0.806;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:814,0:0,0,11,13 0/1:28,38:66:99:990,0,601:12,16,24,14 +chrX 3514410 . G T 3111 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=33.77;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.77;SOR=0.804;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1075,0:0,0,12,21 1/1:0,60:60:99:2066,181,0:0,0,32,28 +chrX 3514471 . T A 1802 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=18.51;BaseQRankSum=1.992;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=12.575;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.51;ReadPosRankSum=1.084;SOR=0.165;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,31:32:99:972,0:1,0,12,19 0/1:34,33:67:99:860,0,910:24,10,20,13 +chrX 3515214 . C A 1098 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=14.65;BaseQRankSum=0.302;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.882;MQ=59.99;MQRankSum=0.708;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.541;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:735,0:0,0,13,9 0/1:38,17:55:99:393,0,1074:24,14,10,7 +chrX 3515703 . CATCT C 1374.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=33.09;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.19;SOR=0.818;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,601 1/1:0,32:32:97:.:1414,97,0:0,0,17,15 +chrX 3515804 . ATATC A 1951.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=26.91;BaseQRankSum=-0.217;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.020;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.458;SOR=0.446;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1114,0:0,0,13,12 0/1:26,23:49:99:877,0,1001:15,11,11,12 +chrX 3516827 . AT A,ATT 83.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=10,1;AS_QD=6.83,0.00;BaseQRankSum=0;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.47;ReadPosRankSum=0;SOR=0.859;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,6,0:7:93:93,0,103:1,0,3,3 0/1:7,4,1:12:30:30,0,197,45,99,188:3,4,2,3 +chrX 3517358 . C G 1318 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.99;BaseQRankSum=-0.992;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.922;SOR=0.756;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:828,0:0,0,18,8 0/1:24,21:45:99:520,0,659:14,10,10,11 +chrX 3517568 . C T 1643 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=19.92;BaseQRankSum=0.812;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=4.486;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.01;SOR=0.742;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1096,0:0,0,17,17 0/1:28,22:50:99:577,0,771:12,16,14,8 +chrX 3518514 . G A 1486 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=18.27;BaseQRankSum=2.07;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.817;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.27;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=0.504;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:958,0:0,0,15,14 0/1:33,21:54:99:558,0,895:14,19,9,12 +chrX 3519303 . TGAGA T,TGA 2325.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,51;AS_QD=27.62,32.85;BaseQRankSum=-1.559;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.801;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,26:26:99:1255,951,0:0,0,14,12 0/2:21,0,25:46:99:1110,834,1758,0,881,975:11,10,14,11 +chrX 3519307 . A *,T 2335 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,51;AS_QD=0.00,32.85;BaseQRankSum=-1.873;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.801;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,26:26:99:1255,951,0:0,0,14,12 0/2:21,0,25:46:99:1110,834,1758,0,881,975:11,10,14,11 +chrX 3519397 . C T 2088 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=21.39;BaseQRankSum=-0.741;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.39;ReadPosRankSum=0.775;SOR=0.697;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1166,0:0,0,15,21 0/1:28,35:63:99:952,0,754:13,15,18,17 +chrX 3520904 . G A 1753 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=21.23;BaseQRankSum=1.652;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=4.904;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.23;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.287;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,36:38:99:1157,0:2,0,23,13 0/1:22,24:46:99:626,0,595:15,7,11,13 +chrX 3521958 . C G 2163 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=23.33;BaseQRankSum=2.042;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.33;ReadPosRankSum=1.832;SOR=0.767;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1274,0:.:0,0,15,14 0|1:40,25:65:99:0|1:3521958_C_G:919,0,1532:3521958:20,20,13,12 +chrX 3521962 . G A 2150 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=23.19;BaseQRankSum=1.162;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.783;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.846;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1239,0:.:0,0,15,13 0|1:40,26:66:99:0|1:3521958_C_G:941,0,1529:3521958:20,20,14,12 +chrX 3523023 . A C 1578 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=21.73;BaseQRankSum=-1.208;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.802;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:854,0:0,0,8,18 0/1:19,29:48:99:754,0,476:8,11,14,15 +chrX 3523607 . C T 1328 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=17.19;BaseQRankSum=-0.806;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.851;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.596;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:834,0:0,0,13,13 0/1:31,22:53:99:524,0,838:14,17,10,12 +chrX 3523879 . T C 1575 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=19.57;BaseQRankSum=0.82;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.904;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.57;ReadPosRankSum=-1.458;SOR=0.519;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:963,0:0,0,17,11 0/1:29,25:54:99:642,0,756:19,10,15,10 +chrX 3524198 . C CT 1405.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=21.57;BaseQRankSum=-0.4;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.666;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1076,0:0,0,10,20 0/1:21,16:37:99:369,0,680:7,14,6,10 +chrX 3524199 . C T,CT 1604 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=46,2;AS_QD=26.35,8.00;BaseQRankSum=1.65;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=25.53;ReadPosRankSum=-0.449;SOR=0.582;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30,0:30:99:1076,0,1076:0,0,10,20 0/1:16,16,2:34:99:558,0,633,414,248,619:5,11,7,11 +chrX 3524347 . G A 1423 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=18.87;BaseQRankSum=-1.092;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.811;SOR=0.758;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:878,0:0,0,10,17 0/1:28,22:50:99:575,0,787:13,15,12,10 +chrX 3524626 . C CCACCAT 354.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=26.27;BaseQRankSum=0;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.19;MQRankSum=-0.566;QD=26.27;ReadPosRankSum=1.102;SOR=1.179;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:70:99:70:0,720 0/1:5,10:15:99:.:394,0,150:2,3,3,7 +chrX 3524710 . T TCACCAC 830.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=22.31;BaseQRankSum=2.241;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.99;MQRankSum=2.359;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.18;SOR=0.919;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,19:21:99:644,0:1,1,13,6 0/1:10,8:18:99:226,0,308:6,4,4,4 +chrX 3524764 . T TCACCATCACCACCAC 430.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=22.38;BaseQRankSum=1.418;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.31;MQRankSum=-1.066;QD=22.38;ReadPosRankSum=-1.088;SOR=1.022;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:99:23:0,550 0/1:8,13:21:99:.:470,0,264:5,3,9,4 +chrX 3524767 . C CCATCACCACCACCAT 219.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=32.38;BaseQRankSum=-0.431;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=9.700;MQ=53.50;MQRankSum=0;QD=32.38;ReadPosRankSum=0.045;SOR=2.209;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,6:8:99:.:259,0:0,2,5,1 0/0:.:47:41:31:0,41,792 +chrX 3525133 . C T 1678 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=21.90;BaseQRankSum=0.528;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.942;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.90;ReadPosRankSum=0.758;SOR=0.854;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1077,0:0,0,20,12 0/1:23,23:46:99:631,0,592:13,10,13,10 +chrX 3525196 . A ATTTT 1831.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=30.18;BaseQRankSum=1.265;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=6.287;MQ=59.51;MQRankSum=0;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.217;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,26:27:99:.:.:1038,0:.:1,0,15,11 0|1:13,22:35:99:0|1:3525196_A_ATTTT:833,0,426:3525196:9,4,10,12 +chrX 3525197 . G T 1841 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=30.18;BaseQRankSum=1.082;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=6.287;MQ=59.51;MQRankSum=0;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.217;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,26:27:99:.:.:1038,0:.:1,0,15,11 0|1:13,22:35:99:0|1:3525196_A_ATTTT:833,0,426:3525196:9,4,10,12 +chrX 3527415 . T C 1289 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=19.69;BaseQRankSum=-1.441;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.670;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.613;SOR=0.809;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:610,0:0,0,11,8 0/1:21,27:48:99:709,0,566:12,9,9,18 +chrX 3527652 . C G 1608 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=1.337;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.866;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.50;ReadPosRankSum=1.414;SOR=0.547;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:951,0:0,0,17,13 0/1:29,25:54:99:687,0,771:16,13,11,14 +chrX 3527805 . A G 1709 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=20.46;BaseQRankSum=-0.311;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=4.626;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.319;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1012,0:0,0,17,14 0/1:26,28:54:99:727,0,698:17,9,14,14 +chrX 3528673 . T C 1534 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=20.85;BaseQRankSum=0;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.086;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.437;SOR=1.094;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1099,0:0,0,13,21 0/1:24,17:41:99:465,0,711:12,12,8,9 +chrX 3528803 . C T 1336 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=21.34;BaseQRankSum=-1.243;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.34;ReadPosRankSum=2.25;SOR=0.650;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:759,0:0,0,13,10 0/1:19,22:41:99:607,0,528:10,9,9,13 +chrX 3528881 . G A 1403 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=28.10;BaseQRankSum=1.72;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.10;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.818;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19:19:99:.:.:855,0:.:0,0,7,12 0|1:17,15:32:99:0|1:3528881_G_A:578,0,648:3528881:8,9,8,7 +chrX 3528889 . A G 1466 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=28.23;BaseQRankSum=-1.393;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.23;ReadPosRankSum=-0.362;SOR=0.693;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19:19:99:.:.:855,0:.:0,0,7,12 0|1:17,17:34:99:0|1:3528881_G_A:641,0,652:3528881:8,9,10,7 +chrX 3529119 . G T 1486 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=19.44;BaseQRankSum=2.304;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.865;SOR=0.673;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:999,0:0,0,17,13 0/1:29,19:48:99:517,0,762:14,15,8,11 +chrX 3529173 . A G 1841 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=19.29;BaseQRankSum=2.529;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=2.727;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.264;SOR=1.004;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1157,0:0,0,21,13 0/1:37,26:63:99:714,0,1017:19,18,14,12 +chrX 3529267 . T A 1682 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=19.91;BaseQRankSum=1.596;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=4.328;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.675;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1234,0:0,0,18,19 0/1:31,18:49:99:478,0,889:13,18,12,6 +chrX 3529721 . C T 1425 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.90;BaseQRankSum=2.895;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.158;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.683;SOR=1.132;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:973,0:0,0,8,21 0/1:30,18:48:99:482,0,759:15,15,11,7 +chrX 3529881 . C T 1544 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=20.71;BaseQRankSum=2.111;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=10.525;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.962;SOR=0.461;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:973,0:0,0,13,15 0/1:26,22:48:99:601,0,652:18,8,10,12 +chrX 3530339 . G A 1077 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=17.85;BaseQRankSum=0.331;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.627;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:487,0:0,0,7,7 0/1:25,23:48:99:620,0,695:11,14,10,13 +chrX 3530888 . T C 1527 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=19.22;BaseQRankSum=1.177;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.901;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.570;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:937,0:0,0,18,13 0/1:27,23:50:99:620,0,703:17,10,14,9 +chrX 3531488 . A G 1342 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.79;BaseQRankSum=-0.343;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.341;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.571;SOR=0.928;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:804,0:0,0,14,10 0/1:26,23:49:99:568,0,703:12,14,13,10 +chrX 3531532 . G T 440 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=9.22;BaseQRankSum=1.33;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=13.995;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.41;SOR=1.773;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,586 0/1:33,18:51:99:.:470,0,960:20,13,5,13 +chrX 3532109 . T TA 1489.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=18.88;BaseQRankSum=0.177;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=2.163;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.435;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:867,0:0,0,16,15 0/1:21,29:50:99:662,0,442:14,7,19,10 +chrX 3532526 . T C 1699 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=20.58;BaseQRankSum=0.711;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.798;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1051,0:0,0,18,14 0/1:27,25:52:99:678,0,743:16,11,17,8 +chrX 3533229 . T C 667 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.84;BaseQRankSum=-0.543;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.205;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.844;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,561 0/1:17,27:44:99:.:697,0,419:9,8,12,15 +chrX 3534231 . G A 530 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.44;BaseQRankSum=2.346;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=6.662;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.163;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,561 0/1:25,20:45:99:.:560,0,674:7,18,10,10 +chrX 3535274 . C T 1000 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=18.73;BaseQRankSum=1.197;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.096;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.446;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,561 0/1:19,36:55:99:.:1030,0,426:11,8,18,18 +chrX 3535643 . G T 604 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.49;BaseQRankSum=-0.433;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.552;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.98;SOR=1.164;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,561 0/1:23,24:47:99:.:634,0,589:13,10,16,8 +chrX 3536215 . TTGTG T,TTG 2120.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,15;AS_QD=27.72,30.61;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.736;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=41.54;SOR=0.804;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,19,0:20:99:826,0,856:1,0,9,10 1/2:0,17,15:32:99:1334,467,374,538,0,444:0,0,12,20 +chrX 3536251 . G C 2680 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=28.66;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=42.34;SOR=0.892;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1144,0:0,0,14,14 1/1:0,36:36:99:1566,108,0:0,0,15,21 +chrX 3536813 . TTTTA T 490.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=13.59;BaseQRankSum=0.856;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.327;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.88;SOR=0.281;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,630 0/1:22,17:39:99:.:530,0,873:18,4,12,5 +chrX 3538043 . C CA 598.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.51;BaseQRankSum=-0.525;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.824;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,630 0/1:20,31:51:99:.:638,0,376:9,11,13,18 +chrX 3538071 . C A 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.74;BaseQRankSum=-0.11;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.488;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=0.711;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,630 0/1:25,22:47:99:.:599,0,707:11,14,12,10 +chrX 3538665 . TGATA TGATAGATA,T 2078.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=37,13;AS_QD=30.83,27.33;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.36;SOR=1.390;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0:17:99:745,0,746:0,0,5,12 1/2:0,20,13:33:99:1373,534,475,839,0,931:0,0,13,20 +chrX 3539019 . C T 656 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.25;BaseQRankSum=2.333;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=7.470;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=0.760;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,516 0/1:30,26:56:99:.:686,0,750:19,11,11,15 +chrX 3540307 . G A 659 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.35;BaseQRankSum=-1.935;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=2.480;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.35;ReadPosRankSum=-2.11;SOR=0.388;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,516 0/1:21,27:48:99:.:689,0,566:13,8,14,13 +chrX 3540422 . A G 717 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.05;BaseQRankSum=-1.305;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.468;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.376;SOR=1.174;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,516 0/1:33,29:62:99:.:747,0,931:17,16,18,11 +chrX 3540768 . T C 1294 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=25.96;BaseQRankSum=-1.975;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.449;MQ=59.89;MQRankSum=-1.225;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.36;SOR=0.864;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,516 0|1:17,34:51:99:.:0|1:3540768_T_C:1324,0,601:3540768:8,9,19,15 +chrX 3540776 . G A 1210 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=25.83;BaseQRankSum=-1.66;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.231;MQ=59.88;MQRankSum=-1.285;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.607;SOR=1.156;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,516 0|1:17,31:48:99:.:0|1:3540768_T_C:1240,0,610:3540768:8,9,19,12 +chrX 3541180 . C T 521 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.81;BaseQRankSum=-1.273;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.784;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,516 0/1:22,21:43:99:.:551,0,614:11,11,10,11 +chrX 3541293 . T C 663 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.33;BaseQRankSum=0.778;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.582;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,516 0/1:27,25:52:99:.:693,0,742:10,17,10,15 +chrX 3541432 . C G 1175 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=30.90;BaseQRankSum=2.063;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.869;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.916;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,38:39:99:.:1205,0:0,1,23,15 0/0:.:52:96:52:0,96,1234 +chrX 3541760 . C T 950 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=20.00;BaseQRankSum=0.715;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.00;ReadPosRankSum=-1.606;SOR=0.673;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,515 0/1:15,34:49:99:.:980,0,344:9,6,20,14 +chrX 3542048 . C G 752 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.61;BaseQRankSum=-0.514;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.61;ReadPosRankSum=-1.235;SOR=0.701;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,515 0/1:33,29:62:99:.:782,0,916:17,16,15,14 +chrX 3542203 . C T 713 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.86;BaseQRankSum=1.156;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.846;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,515 0/1:24,26:50:99:.:743,0,639:12,12,12,14 +chrX 3542604 . T A 1623 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=33.06;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.06;SOR=1.270;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,515 1/1:0,50:50:99:.:1653,150,0:0,0,31,19 +chrX 3543001 . C T 569 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.89;BaseQRankSum=2.836;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.346;MQ=59.49;MQRankSum=0.306;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.284;SOR=1.048;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,515 0/1:33,22:55:99:.:599,0,859:17,16,9,13 +chrX 3543198 . T C 2199 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=30.53;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.58;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,515 1|1:0,50:50:99:.:0|1:3543198_T_C:2229,150,0:3543198:0,0,24,26 +chrX 3543200 . A G 2199 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=30.60;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.58;SOR=0.773;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,515 1|1:0,50:50:99:.:0|1:3543198_T_C:2229,150,0:3543198:0,0,24,26 +chrX 3543378 . T TA,TAA 1186.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=29,16;AS_QD=32.69,32.55;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=27.24;SOR=0.737;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,515,515 1/2:0,29,16:45:99:.:1226,412,278,681,0,625:0,0,22,23 +chrX 3543802 . GTC G 286.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=32.60;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=1.609;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,10:10:99:.:326,0:0,0,3,7 0/0:.:55:69:55:0,69,1035 +chrX 3543824 . CTCTCTATA C,CTA 289.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,12;AS_QD=0.00,12.65;BaseQRankSum=1.244;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.471;MQ=59.24;MQRankSum=0;QD=12.65;ReadPosRankSum=2.188;SOR=1.022;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397,397 0/2:14,0,12:26:99:.:329,400,1230,0,574,508:7,7,5,7 +chrX 3543828 . CTATA *,C,CTA 706.97 . AC=1,0,1;AF=0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,0,7;AS_QD=0.00,0.00,27.38;BaseQRankSum=1.534;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.20;MQRankSum=0;QD=37.30;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.368;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397,397,397 1/3:1,12,0,7:20:99:.:746,218,466,797,267,1208,391,0,763,731:0,1,8,11 +chrX 3543892 . C T 800 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.82;BaseQRankSum=1.661;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=7.142;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.05;SOR=0.614;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 0/1:27,29:56:99:.:830,0,695:10,17,16,13 +chrX 3543970 . T C 2033 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.75;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=1.010;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 1/1:0,63:63:99:.:2063,188,0:0,0,36,27 +chrX 3544003 . G A 2242 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.00;BaseQRankSum=2.109;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;MQRankSum=0;QD=32.00;ReadPosRankSum=0;SOR=0.330;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 1/1:1,70:71:99:.:2272,188,0:1,0,39,31 +chrX 3544073 . G T 1855 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=30.40;BaseQRankSum=1.256;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=-0.091;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=1.071;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 1/1:2,60:62:99:.:1885,141,0:1,1,35,25 +chrX 3544332 . G A 752 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.67;BaseQRankSum=-0.969;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=15.658;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.384;SOR=1.395;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 0/1:37,30:67:99:.:782,0,1030:14,23,20,10 +chrX 3545148 . C G 1821 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.47;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=1.342;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 1/1:0,57:57:99:.:1851,170,0:0,0,36,21 +chrX 3545200 . C T 1941 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.41;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.41;SOR=1.034;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 1/1:0,59:59:99:.:1971,177,0:0,0,34,25 +chrX 3545490 . G A 2080 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=33.49;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.49;SOR=1.685;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 1/1:0,63:63:99:.:2110,189,0:0,0,43,20 +chrX 3546033 . G A 2123 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=32.62;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.62;SOR=0.754;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 1/1:0,66:66:99:.:2153,198,0:0,0,32,34 +chrX 3546319 . A G 1817 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=31.31;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.31;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 1/1:0,59:59:99:.:1847,176,0:0,0,26,33 +chrX 3546824 . A G 1269 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=33.31;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.88;QD=33.31;SOR=1.552;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,397 1/1:0,39:39:99:.:1299,117,0:0,0,26,13 +chrX 3546863 . G GGGAA 210.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=19.23;BaseQRankSum=0.577;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=6.929;MQ=58.28;MQRankSum=2.832;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=2.245;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,10:13:99:.:250,0:1,2,8,2 0/0:.:38:75:38:0,75,1125 +chrX 3546894 . AAGGAAGGAAGGAAAAGAGGGAGGCAGGGAGGGAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGT A 43.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=2.02;BaseQRankSum=0.159;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.987;MQ=57.39;MQRankSum=-1.401;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.156;SOR=1.347;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 0/1:35,6:41:83:.:83,0,1340:15,8,5,1 +chrX 3546902 . A *,AAGGAAGGT,AAGGT,AAAAGAGGGAGGCAGGGAGGGAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGT,AAGGAAAAGAGGGAGGCAGGGAGGGAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGT 1105.97 . AC=1,1,0,0,0;AF=0.333,0.333,0.00,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=21,2,0,0,0;AS_QD=0.00,26.06,27.73,28.87,28.05;BaseQRankSum=0.431;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.388;MQ=56.72;MQRankSum=1.205;QD=47.71;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.626;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372,372,372,372,372 1/2:1,21,2,0,0,0:24:99:.:1145,456,633,672,0,825,825,300,856,1207,796,300,696,1042,1205,804,301,735,1081,1215,1254:0,1,13,10 +chrX 3547908 . A T 819 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.16;BaseQRankSum=0.429;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.754;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.330;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 0/1:25,31:56:99:.:849,0,641:16,9,16,15 +chrX 3548012 . A G 855 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.21;BaseQRankSum=-1.407;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.038;MQ=59.57;MQRankSum=0.772;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.481;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 0/1:31,36:67:99:.:885,0,818:20,11,21,15 +chrX 3548192 . C T 561 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.75;BaseQRankSum=2.904;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.369;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.397;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 0/1:33,22:55:99:.:591,0,807:12,21,10,12 +chrX 3548484 . T C 962 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=13.59;BaseQRankSum=-2.644;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=3.169;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.17;SOR=0.572;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 0/1:33,40:73:99:.:992,0,868:14,19,21,19 +chrX 3549222 . A G 1729 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=31.41;BaseQRankSum=-0.419;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.41;ReadPosRankSum=-0.402;SOR=0.304;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 1/1:1,55:56:99:.:1759,133,0:1,0,30,25 +chrX 3549355 . T TTCTCTCTC,TTCTCTCTCTC 2104.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,19;AS_QD=29.32,32.70;BaseQRankSum=-0.825;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=52.29;ReadPosRankSum=-1.396;SOR=0.507;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372,372 1/2:1,21,19:41:99:.:2144,510,398,587,0,476:0,1,15,25 +chrX 3549581 . G T 533 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=15.22;BaseQRankSum=1.167;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.122;SOR=0.744;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 0/1:17,20:37:99:.:563,0,425:10,7,12,8 +chrX 3550114 . G A 2188 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.14;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.14;SOR=0.781;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 1/1:0,69:69:99:.:2218,207,0:0,0,33,36 +chrX 3550835 . G A 550 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.60;BaseQRankSum=2.004;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=8.292;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.131;SOR=1.809;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 0/1:29,21:50:99:.:580,0,806:15,14,6,15 +chrX 3550996 . G A 388 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.20;BaseQRankSum=-0.846;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=6.637;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=1.739;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:99:32:.:.:0,372 0|1:24,17:41:99:.:0|1:3550996_G_A:418,0,656:3550996:12,12,12,5 +chrX 3551002 . A G 1434 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=30.44;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.54;SOR=0.968;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:99:32:.:.:0,372 1|1:0,39:39:99:.:0|1:3550996_G_A:1464,117,0:3550996:0,0,22,17 +chrX 3551669 . G A 1364 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=34.00;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.00;SOR=1.666;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 1/1:0,41:41:99:.:1394,123,0:0,0,28,13 +chrX 3553630 . A G 1548 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=32.88;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.54;QD=32.88;SOR=0.693;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,372 1/1:0,48:48:99:.:1578,144,0:0,0,24,24 +chrX 3553720 . A G 2312 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.99;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.52;QD=32.99;SOR=1.042;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:645,0:0,0,11,9 1/1:0,51:51:99:1697,153,0:0,0,19,32 +chrX 3554235 . G A 730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.46;BaseQRankSum=0.527;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.975;MQ=59.85;MQRankSum=-0.984;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.529;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,576 0/1:31,30:61:99:.:760,0,800:13,18,14,16 +chrX 3554857 . C T 398 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=16.46;BaseQRankSum=0.146;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=4.205;MQ=34.95;MQRankSum=3.879;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.208;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:6,20:26:99:.:428,0:5,1,12,8 0/0:.:56:87:56:0,87,1359 +chrX 3554877 . G A 415 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=7.67;BaseQRankSum=2.324;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=36.66;MQRankSum=1.551;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.101;SOR=0.610;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,495 0/1:40,18:58:99:.:445,0,1070:23,17,10,8 +chrX 3555216 . T C 539 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=11.38;BaseQRankSum=-0.118;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=2.602;MQ=54.17;MQRankSum=-6.421;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.29;SOR=1.112;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,495 0|1:34,16:50:99:.:0|1:3555216_T_C:569,0,1348:3555216:14,20,5,11 +chrX 3555223 . G C 543 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=11.69;BaseQRankSum=1.356;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.666;MQ=53.58;MQRankSum=-6.346;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.678;SOR=1.179;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,495 0|1:33,16:49:99:.:0|1:3555216_T_C:573,0,1317:3555216:14,19,5,11 +chrX 3555283 . G C 1818 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=28.86;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=47.19;QD=42.98;SOR=1.312;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,495 1|1:0,43:43:99:.:0|1:3555283_G_C:1848,129,0:3555283:0,0,16,27 +chrX 3555288 . C T 1784 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=29.22;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.33;QD=44.24;SOR=1.501;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,495 1|1:0,41:41:99:.:0|1:3555283_G_C:1814,123,0:3555283:0,0,14,27 +chrX 3555321 . G A 1365 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=33.21;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=43.49;QD=33.21;SOR=1.259;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,495 1/1:0,42:42:99:.:1395,126,0:0,0,16,26 +chrX 3555472 . C T 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=23.35;BaseQRankSum=-0.456;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.46;MQRankSum=3.666;QD=23.35;ReadPosRankSum=2.955;SOR=0.418;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,495 0/1:6,20:26:99:.:607,0,112:2,4,9,11 +chrX 3555488 . C T 282 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=10.06;BaseQRankSum=1.909;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.56;MQRankSum=-3.545;QD=10.06;ReadPosRankSum=-2.374;SOR=0.892;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,495 0|1:22,9:31:99:.:0|1:3555488_C_T:312,0,840:3555488:11,11,5,4 +chrX 3555490 . T A 282 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=10.06;BaseQRankSum=1.382;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.56;MQRankSum=-3.545;QD=10.06;ReadPosRankSum=-2.156;SOR=0.892;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,495 0|1:22,9:31:99:.:0|1:3555488_C_T:312,0,840:3555488:11,11,5,4 +chrX 3555599 . T C 604 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.41;BaseQRankSum=0.472;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=4.455;MQ=45.38;MQRankSum=4.509;QD=14.41;ReadPosRankSum=2.229;SOR=0.260;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,495 0/1:20,24:44:99:.:634,0,460:14,6,13,11 +chrX 3555642 . T A 399 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=10.21;BaseQRankSum=1.361;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=13.819;MQ=49.03;MQRankSum=-5.455;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.598;SOR=2.905;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,495 0/1:24,18:42:99:.:429,0,560:14,10,16,2 +chrX 3555973 . G C 1618 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=19.39;BaseQRankSum=0.519;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.874;MQ=55.82;MQRankSum=-3.035;QD=19.39;ReadPosRankSum=-2.237;SOR=0.540;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:794,0:0,0,9,15 0/1:28,33:61:99:854,0,701:16,12,21,12 +chrX 3556051 . G C 796 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=2.491;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.956;MQ=52.40;MQRankSum=-6.63;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.311;SOR=0.735;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,622 0/1:34,30:64:99:.:826,0,885:16,18,16,14 +chrX 3556056 . A G 2516 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.55;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.66;QD=38.00;SOR=0.723;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,622 1/1:0,67:67:99:.:2546,201,0:0,0,34,33 +chrX 3556064 . A G 882 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.61;BaseQRankSum=2.661;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=4.790;MQ=52.77;MQRankSum=-7.089;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.782;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,622 0/1:35,32:67:99:.:912,0,890:15,20,18,14 +chrX 3556168 . T A 2198 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=31.83;BaseQRankSum=-0.392;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.82;MQRankSum=2.192;QD=31.83;ReadPosRankSum=-1.658;SOR=0.348;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,622 1/1:1,69:70:99:.:2228,175,0:0,1,30,39 +chrX 3556181 . G T 700 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=10.90;BaseQRankSum=-0.703;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.30;MQRankSum=-4.295;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.132;SOR=0.607;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,622 0/1:37,30:67:99:.:730,0,984:14,23,12,18 +chrX 3556272 . T C 856 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.77;BaseQRankSum=-0.172;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.157;MQ=59.09;MQRankSum=-2.704;QD=14.77;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=0.444;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,622 0/1:27,33:60:99:.:886,0,698:11,16,16,17 +chrX 3556469 . C T 630 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.45;BaseQRankSum=-0.284;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.316;MQ=50.25;MQRankSum=3.748;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.57;SOR=0.689;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,622 0/1:27,26:53:99:.:660,0,680:15,12,12,14 +chrX 3556489 . G A 632 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.49;BaseQRankSum=1.379;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=46.50;MQRankSum=-4.356;QD=12.49;ReadPosRankSum=2.077;SOR=0.655;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,622 0/1:28,25:53:99:.:662,0,729:15,13,12,13 +chrX 3556619 . T C 1940 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=30.78;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.90;QD=30.78;SOR=0.966;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,622 1/1:0,64:64:99:.:1970,192,0:0,0,28,36 +chrX 3556815 . C T 2177 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.53;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;QD=31.53;SOR=1.163;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:629,0:0,0,10,11 1/1:0,49:49:99:1578,146,0:0,0,18,31 +chrX 3557085 . T C 610 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=0.571;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=2.911;MQ=53.98;MQRankSum=-0.357;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.296;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:17,23:40:99:.:640,0,416:5,12,10,13 +chrX 3557823 . A C 353 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=9.58;BaseQRankSum=1.867;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=4.837;MQ=42.06;MQRankSum=-1.382;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=0.922;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:25,15:40:99:.:383,0,644:15,10,6,9 +chrX 3557887 . G A 466 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.02;BaseQRankSum=1.125;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.597;MQ=45.71;MQRankSum=-3.114;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.115;SOR=0.928;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:26,19:45:99:.:496,0,684:14,12,8,11 +chrX 3558033 . G A 756 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=17.09;BaseQRankSum=1.236;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=9.764;MQ=49.87;MQRankSum=-0.191;QD=17.09;ReadPosRankSum=-2.645;SOR=0.105;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:19,27:46:99:.:786,0,512:16,3,16,11 +chrX 3558402 . G T 641 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.78;BaseQRankSum=-1.376;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=38.00;MQRankSum=4.468;QD=16.78;ReadPosRankSum=-1.076;SOR=0.527;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:15,25:40:99:.:671,0,555:4,11,8,17 +chrX 3558409 . C T 360 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=9.51;BaseQRankSum=0.272;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.342;MQ=38.20;MQRankSum=-4.397;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.990;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:25,16:41:99:.:390,0,981:8,17,4,12 +chrX 3558444 . A G 594 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.86;BaseQRankSum=1.674;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=1.271;MQ=38.45;MQRankSum=-3.295;QD=16.86;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=0.465;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,266 0|1:20,17:37:99:.:0|1:3558444_A_G:624,0,757:3558444:8,12,8,9 +chrX 3558461 . G A 546 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=17.45;BaseQRankSum=2.157;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=39.57;MQRankSum=-3.016;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.818;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,266 0|1:18,15:33:99:.:0|1:3558444_A_G:576,0,699:3558444:9,9,8,7 +chrX 3558616 . T C 362 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=11.88;BaseQRankSum=-1.923;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=1.363;MQ=52.68;MQRankSum=-0.974;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.47;SOR=0.465;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:18,15:33:99:.:392,0,527:12,6,9,6 +chrX 3559421 . G A 883 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.01;BaseQRankSum=-0.305;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=4.461;MQ=59.52;MQRankSum=0.449;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.223;SOR=1.244;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:42,34:76:99:.:913,0,1191:21,21,21,13 +chrX 3559582 . T C 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.23;BaseQRankSum=1.145;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.82;MQRankSum=-4.478;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.66;SOR=0.693;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:24,24:48:99:.:635,0,640:14,10,14,10 +chrX 3559808 . C A 838 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.97;BaseQRankSum=1.665;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=7.495;MQ=53.89;MQRankSum=-4.169;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.25;SOR=1.724;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:27,31:58:99:.:868,0,679:13,14,9,22 +chrX 3559845 . A G 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.84;BaseQRankSum=1.007;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=7.467;MQ=52.19;MQRankSum=-5.224;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=1.675;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:31,26:57:99:.:675,0,836:14,17,7,19 +chrX 3559856 . T C 457 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.94;BaseQRankSum=-0.303;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.600;MQ=51.14;MQRankSum=-5.28;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=1.222;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:29,20:49:99:.:487,0,811:12,17,6,14 +chrX 3559885 . G A 329 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=9.21;BaseQRankSum=1.321;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.048;MQ=48.71;MQRankSum=-4.648;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.264;SOR=1.410;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:25,14:39:99:.:359,0,680:11,14,4,10 +chrX 3560022 . A C 377 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=9.25;BaseQRankSum=1.977;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=4.442;MQ=39.10;MQRankSum=0.121;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.281;SOR=1.174;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:28,16:44:99:.:407,0,736:13,15,10,6 +chrX 3560366 . C A 499 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.58;BaseQRankSum=0.331;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.18;SOR=0.727;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:29,21:50:99:.:529,0,818:15,14,10,11 +chrX 3560909 . C G 557 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.23;BaseQRankSum=2.028;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.143;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.445;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:25,23:48:99:.:587,0,605:16,9,13,10 +chrX 3561324 . T C 612 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.46;BaseQRankSum=-2.311;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=1.309;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.46;ReadPosRankSum=-1.787;SOR=0.446;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:14,25:39:99:.:642,0,370:9,5,14,11 +chrX 3561507 . TTTTATTTA T 490.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=21.20;BaseQRankSum=2.089;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=1.580;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.20;ReadPosRankSum=-0.822;SOR=0.870;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:11,14:25:99:.:530,0,409:6,5,6,8 +chrX 3562680 . T C 492 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.00;BaseQRankSum=-1.554;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.427;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.289;SOR=1.101;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:36,22:58:99:.:522,0,1043:13,23,6,16 +chrX 3563457 . C G 755 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=19.15;BaseQRankSum=-1.392;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=8.917;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.15;ReadPosRankSum=-2.061;SOR=0.088;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:11,30:41:99:.:785,0,251:10,1,19,11 +chrX 3564639 . T G 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=10.68;BaseQRankSum=0.095;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.929;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.829;SOR=0.846;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,266 0/1:37,29:66:99:.:705,0,953:19,18,16,13 +chrX 3565126 . A C 957 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.62;BaseQRankSum=-1.968;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.834;SOR=1.101;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,266 0|1:26,27:53:99:.:0|1:3565126_A_C:987,0,891:3565126:13,13,11,16 +chrX 3565138 . TA T 1756.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=21.64;BaseQRankSum=-0.703;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=6.239;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.64;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=0.601;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:748,0:.:0,0,12,15 0|1:26,30:56:99:0|1:3565126_A_C:1048,0,852:3565126:16,10,14,16 +chrX 3565494 . TAC T 1062.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=34.36;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.08;SOR=1.609;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:1102,0:0,0,17,8 0/0:.:58:99:58:0,101,1414 +chrX 3565639 . T C 1303 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=14.65;BaseQRankSum=-1.195;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=14.65;ReadPosRankSum=1.83;SOR=0.714;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:680,0:0,0,13,8 0/1:44,26:70:99:653,0,1239:26,18,15,11 +chrX 3565745 . C T 1397 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=16.99;BaseQRankSum=-0.113;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.816;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.593;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:908,0:0,0,15,12 0/1:36,21:57:99:519,0,989:17,19,9,12 +chrX 3566101 . A G 2014 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=22.97;BaseQRankSum=-1.629;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.947;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.844;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1125,0:0,0,13,22 0/1:20,34:54:99:919,0,513:10,10,19,15 +chrX 3566767 . A C 3050 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=32.42;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.42;SOR=0.848;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:654,0:0,0,11,10 1/1:0,74:74:99:2426,222,0:0,0,40,34 +chrX 3567070 . C CT 217.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=5.71;BaseQRankSum=-0.086;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.71;ReadPosRankSum=2.156;SOR=0.818;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,655 0/1:30,15:45:99:.:257,0,649:15,15,8,7 +chrX 3567098 . A C 1380 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=18.08;BaseQRankSum=-0.144;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.08;ReadPosRankSum=-1.312;SOR=0.729;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:878,0:0,0,10,17 0/1:30,21:51:99:532,0,850:14,16,12,9 +chrX 3567544 . C G 990 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=29.14;BaseQRankSum=2.579;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.14;ReadPosRankSum=-0.782;SOR=1.542;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,33:35:99:.:1020,0:1,1,11,22 0/0:.:59:99:59:0,99,1270 +chrX 3568248 . G A 1745 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=18.68;BaseQRankSum=-0.366;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=5.611;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.389;SOR=1.330;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:963,0:0,0,19,9 0/1:34,33:67:99:812,0,836:18,16,21,12 +chrX 3568813 . CT C 753.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=30.50;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.50;SOR=1.697;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:793,0:0,0,18,8 0/0:.:51:74:51:0,74,1247 +chrX 3568953 . A C 1407 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=17.11;BaseQRankSum=2.305;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=0.841;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.659;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:858,0:0,0,16,12 0/1:34,22:56:99:579,0,867:18,16,10,12 +chrX 3569709 . C G 1664 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=20.17;BaseQRankSum=0.557;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.242;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.17;ReadPosRankSum=-0.37;SOR=0.409;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,34:35:99:1062,0:0,1,16,18 0/1:25,24:49:99:632,0,662:8,17,7,17 +chrX 3570008 . G GA,GAAAA 995.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=10,16;AS_QD=32.23,32.42;BaseQRankSum=-1.417;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=10.017;MQ=58.95;MQRankSum=-0.862;QD=35.69;ReadPosRankSum=0.955;SOR=0.610;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,10,0:10:99:419,0,420:0,0,5,5 0/2:3,0,16:19:2:616,625,676,0,50,2:0,3,10,6 +chrX 3570027 . A ATATG 350.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=28.34;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.69;QD=43.33;SOR=0.892;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,9:9:99:.:390,0:0,0,5,4 0/0:.:19:39:18:0,39,585 +chrX 3570033 . A ATATATATATGTATATATATG 344.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=26.34;DP=30;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.80;QD=38.40;SOR=0.693;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:11:99:11:0,112 1/1:0,10:10:29:.:384,29,0:0,0,5,5 +chrX 3570071 . G A 124 . AC=2;AF=1.00;AN=2;AS_AltDP=4;AS_QD=26.75;DP=23;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.13;QD=38.50;SOR=0.693;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:7:.:7:.:.:0,0 1|1:0,4:4:12:.:0|1:3570071_G_A:154,12,0:3570071:0,0,2,2 +chrX 3570073 . A G 124 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=29.47;DP=20;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.43;QD=38.50;SOR=0.693;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:5:25:5:.:.:0,25 1|1:0,4:4:11:.:0|1:3570071_G_A:154,11,0:3570071:0,0,2,2 +chrX 3570093 . ATATATG A 113.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=28.06;DP=26;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.99;QD=38.25;SOR=0.693;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:5:25:5:.:.:0,25 1|1:0,4:4:11:.:0|1:3570071_G_A:153,11,0:3570071:0,0,2,2 +chrX 3570131 . A *,AT 747.97 . AC=0,2;AF=0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,4;AS_QD=32.01,29.91;DP=29;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.42;QD=196.75;SOR=0.693;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:10:45:10:.:.:0,45,45 2|2:0,0,4:4:10:.:0|1:3570071_G_A:787,201,156,57,10,0:3570071:0,0,2,2 +chrX 3570266 . G GTATATATGTA,GTATATATGTATATATATGTATATATGTATATATGTA 572.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,0;AS_QD=31.03,28.14;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.34;QD=204.00;SOR=0.368;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90,90 0/1:3,0,0:3:5:.:612,0,71,5,74,77:2,1,0,0 +chrX 3570318 . G GTATATA,A 395 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,10;AS_QD=0.23,11.81;BaseQRankSum=1.419;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.94;MQRankSum=-0.782;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.936;SOR=0.905;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:35:21:0,35,35 0/2:26,0,10:36:99:.:425,419,1447,0,1035,1042:12,14,4,6 +chrX 3570330 . A ATATATATGTGTATATATG,ATATATGTATATATATGTGTATATATG 507.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,11;AS_QD=5.68,18.23;BaseQRankSum=1.641;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.66;MQRankSum=-2.587;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.689;SOR=0.569;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:35:21:0,35,35 0/2:19,0,11:30:99:.:547,439,1283,0,773,1034:8,11,5,6 +chrX 3571114 . T A 2854 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=33.15;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.15;SOR=1.090;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:755,0:0,0,16,6 1/1:0,65:65:99:2129,195,0:0,0,35,30 +chrX 3571150 . C T 1036 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=18.07;BaseQRankSum=0.772;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.022;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.647;SOR=0.544;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,620 0/1:21,38:59:99:.:1066,0,488:12,9,20,18 +chrX 3571786 . G C 1607 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=19.72;BaseQRankSum=-2.816;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.879;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.874;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1022,0:0,0,14,16 0/1:29,24:53:99:615,0,849:13,16,8,16 +chrX 3572746 . G C 693 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.66;BaseQRankSum=1.232;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.979;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=0.626;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,624 0/1:35,27:62:99:.:723,0,935:16,19,14,13 +chrX 3573020 . G T 1691 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=19.78;BaseQRankSum=2.49;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.670;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:922,0:0,0,14,15 0/1:30,28:58:99:799,0,794:14,16,13,15 +chrX 3573178 . G A 711 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.77;BaseQRankSum=0.865;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.134;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.581;SOR=0.611;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,909 0/1:20,27:47:99:.:741,0,490:9,11,14,13 +chrX 3573289 . G C 2012 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=20.02;BaseQRankSum=3.458;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=5.254;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.966;SOR=0.569;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1160,0:0,0,16,21 0/1:34,31:65:99:882,0,876:14,20,20,11 +chrX 3573446 . C T 917 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.78;BaseQRankSum=1.522;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=5.057;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.936;SOR=0.646;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,769 0/1:27,33:60:99:.:947,0,693:16,11,15,18 +chrX 3573671 . A G 1629 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=21.83;BaseQRankSum=-0.286;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.519;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.700;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:973,0:0,0,18,12 0/1:21,25:46:99:686,0,571:9,12,12,13 +chrX 3573741 . T C 1684 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=21.16;BaseQRankSum=1.071;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=4.988;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.16;ReadPosRankSum=1.063;SOR=1.322;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:958,0:0,0,19,10 0/1:25,27:52:99:756,0,683:15,10,21,6 +chrX 3574469 . G A 1621 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=21.44;BaseQRankSum=0.924;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=9.224;MQ=59.69;MQRankSum=0;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.167;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:948,0:0,0,14,15 0/1:22,26:48:99:703,0,561:5,17,10,16 +chrX 3576821 . C A 1238 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=16.47;BaseQRankSum=0.895;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.031;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=0.967;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:863,0:0,0,8,17 0/1:35,17:52:99:405,0,945:18,17,10,7 +chrX 3576846 . A G 903 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=33.32;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.07;QD=33.32;SOR=1.179;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:933,0:0,0,11,17 0/0:.:51:99:51:0,118,1444 +chrX 3577172 . G A 885 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.94;BaseQRankSum=2.072;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.636;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,630 0/1:23,31:54:99:.:915,0,607:13,10,17,14 +chrX 3577198 . G A 510 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.25;BaseQRankSum=1.843;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.527;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.25;ReadPosRankSum=-2.824;SOR=0.705;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,630 0/1:28,20:48:99:.:540,0,744:16,12,9,11 +chrX 3577488 . C T 2245 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=23.70;BaseQRankSum=1.648;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=2.066;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.70;ReadPosRankSum=-1.689;SOR=0.892;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1260,0:0,0,13,26 0/1:21,36:57:99:1015,0,489:11,10,20,16 +chrX 3577986 . G A 1786 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=21.88;BaseQRankSum=2.901;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=4.562;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.480;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:917,0:0,0,10,17 0/1:25,31:56:99:899,0,620:15,10,18,13 +chrX 3579045 . C G 2323 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=32.68;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.68;SOR=1.073;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:770,0:0,0,9,14 1/1:0,49:49:99:1583,146,0:0,0,21,28 +chrX 3579750 . AAAAG A 1631.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=28.81;BaseQRankSum=2.028;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=8.392;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=28.81;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=0.151;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:899,0:0,0,7,13 0/1:18,20:38:99:772,0,652:14,4,15,5 +chrX 3580516 . C T 1474 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=19.28;BaseQRankSum=0.574;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.244;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.28;ReadPosRankSum=-1.21;SOR=1.050;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:824,0:0,0,11,14 0/1:27,26:53:99:680,0,695:14,13,10,16 +chrX 3581998 . G A 1499 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=19.35;BaseQRankSum=-0.195;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.892;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.067;SOR=0.576;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1047,0:0,0,18,15 0/1:27,19:46:99:482,0,750:16,11,11,8 +chrX 3582957 . A G 1730 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=19.13;BaseQRankSum=1.282;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.818;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.746;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:768,0:0,0,12,12 0/1:33,35:68:99:992,0,893:17,16,16,19 +chrX 3583055 . A G 1860 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=18.35;BaseQRankSum=-0.527;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=5.035;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.315;SOR=1.096;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:869,0:0,0,10,15 0/1:39,39:78:99:1021,0,1040:20,19,16,23 +chrX 3583871 . G C 970 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=18.52;BaseQRankSum=0.031;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.39;SOR=0.662;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:698,0:0,0,13,9 0/1:20,12:32:99:302,0,537:12,8,7,5 +chrX 3584126 . TGAGA T 2026.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=28.69;BaseQRankSum=-1.875;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=5.138;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.69;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.423;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1088,0:0,0,12,13 0/1:22,25:47:99:978,0,848:8,14,14,11 +chrX 3584698 . A G 1701 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=21.37;BaseQRankSum=-1.96;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.947;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.509;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1061,0:0,0,18,15 0/1:23,25:48:99:670,0,656:14,9,14,11 +chrX 3584855 . CA C 1551.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=19.64;BaseQRankSum=-0.792;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=12.550;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.64;ReadPosRankSum=1.131;SOR=1.044;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:976,0:0,0,17,15 0/1:24,25:49:99:615,0,584:9,15,18,7 +chrX 3585538 . CTT C 1875.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=22.53;BaseQRankSum=0.881;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.698;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:933,0:0,0,15,10 0/1:29,31:60:99:982,0,812:15,14,14,17 +chrX 3587412 . A G 1825 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=18.55;BaseQRankSum=0.319;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=1.730;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.487;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1165,0:0,0,17,20 0/1:36,27:63:99:690,0,957:13,23,10,17 +chrX 3587807 . T C 1975 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=32.87;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.87;SOR=0.941;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,501 1/1:0,61:61:99:.:2005,183,0:0,0,27,34 +chrX 3588628 . C CA 711.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=18.78;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.87;QD=18.78;SOR=1.292;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,501 1/1:0,40:40:99:.:751,116,0:0,0,15,25 +chrX 3590378 . A G 2797 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.49;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=1.030;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:674,0:0,0,9,11 1/1:0,67:67:99:2153,200,0:0,0,28,39 +chrX 3590525 . C CA,CAAAAAAAAAA,CAAAA,CAAAAA 1209.97 . AC=1,0,1,1;AF=0.333,0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,2,5,12;AS_QD=20.29,1.00,32.18,34.98;BaseQRankSum=0.566;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=3.736;MQ=58.72;MQRankSum=-0.14;QD=48.04;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.861;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,6,2,0,0:9:99:142,0,139,186,186:0,1,5,3 3/4:0,0,0,5,12:17:34:1107,751,675,751,675,675,236,235,235,157,118,117,117,0,34:0,0,10,7 +chrX 3590652 . G A 1256 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=34.76;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=34.76;SOR=0.859;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:84:26:0,84 1/1:0,37:37:99:.:1286,111,0:0,0,20,17 +chrX 3590697 . C CA 330.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.09;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.04;QD=16.09;SOR=0.776;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:84:26:0,84 1/1:0,23:23:65:.:370,65,0:0,0,12,11 +chrX 3590875 . C T 1949 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.54;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.54;SOR=0.796;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:84:26:0,84 1/1:0,59:59:99:.:1979,177,0:0,0,28,31 +chrX 3591226 . T C 1661 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=28.66;BaseQRankSum=0.868;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;MQRankSum=3.329;QD=28.66;ReadPosRankSum=0.87;SOR=0.960;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,19:20:99:510,0:1,0,5,14 1/1:1,38:39:82:1181,82,0:0,1,20,18 +chrX 3591272 . C CA,CAA 1542.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=22,15;AS_QD=34.50,28.75;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.18;QD=42.76;SOR=0.859;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:18:99:18:0,352,352 1/2:0,22,15:37:99:.:1582,367,248,536,0,428:0,0,20,17 +chrX 3591287 . G GA 2433.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=34.15;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.26;QD=37.47;SOR=0.886;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:621,0:0,0,5,15 1/1:0,46:46:99:1852,138,0:0,0,25,21 +chrX 3591741 . C T 660 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=32.86;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=32.86;SOR=0.990;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:690,0:0,0,12,9 0/0:.:55:64:55:0,64,1150 +chrX 3591808 . CTGCT C 725.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=23.32;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=1.061;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:765,0:0,0,10,7 0/0:.:55:64:55:0,64,1150 +chrX 3591812 . T *,C 1900 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,60;AS_QD=30.97,32.17;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.17;SOR=0.828;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0:17:99:765,0,765:0,0,10,7 2/2:0,0,60:60:99:1930,1930,1930,179,179,0:0,0,31,29 +chrX 3592236 . A G 530 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.57;BaseQRankSum=0.151;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.407;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.57;ReadPosRankSum=2.092;SOR=0.352;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,481 0/1:30,23:53:99:.:560,0,773:11,19,11,12 +chrX 3593156 . G A 566 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.28;BaseQRankSum=2.026;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=5.380;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.434;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,481 0/1:35,23:58:99:.:596,0,897:13,22,12,11 +chrX 3595224 . AATATG A 2528.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=30.94;BaseQRankSum=-0.837;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;MQRankSum=0;QD=30.94;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.779;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1520,0:0,0,14,20 0/1:22,27:49:99:1048,0,832:9,13,10,17 +chrX 3595517 . C G 2254 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=33.59;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.59;SOR=1.098;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:576,0:0,0,9,9 1/1:0,50:50:99:1708,150,0:0,0,31,19 +chrX 3595636 . AC A 1725.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=22.92;BaseQRankSum=1.19;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.92;ReadPosRankSum=0.363;SOR=0.631;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1215,0:0,0,15,16 0/1:29,17:46:99:550,0,1017:15,14,9,8 +chrX 3596713 . GTATC G,GTATCTATC 286.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,13;AS_QD=0.00,9.31;BaseQRankSum=1.173;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.210;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.314;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,571,571 0/2:22,0,13:35:99:.:326,441,1662,0,928,1148:14,8,10,3 +chrX 3596726 . T C,TATCC,TATCTATCC 1154 . AC=2,0,0;AF=0.667,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=37,0,0;AS_QD=22.77,0.00,0.00;BaseQRankSum=-1.172;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=4.816;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.217;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16,0,0:16:99:560,0,944,752:0,0,10,6 0/1:15,21,0,0:36:99:624,0,670,723,632,1675,715,628,1630,1775:12,3,13,8 +chrX 3597295 . G A 2351 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.62;BaseQRankSum=2.447;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=7.241;MQ=58.67;MQRankSum=1.704;QD=32.62;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.666;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:755,0:0,0,8,14 1/1:2,49:51:99:1626,109,0:2,0,22,27 +chrX 3597347 . C T 2164 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=31.34;BaseQRankSum=2.506;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.041;MQ=57.90;MQRankSum=-0.171;QD=31.34;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.131;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,18:19:99:586,0:0,1,6,12 1/1:1,50:51:99:1608,142,0:0,1,26,24 +chrX 3597466 . G A 438 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=16.14;BaseQRankSum=1.179;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=8.557;MQ=57.20;MQRankSum=-1.9;QD=16.14;ReadPosRankSum=-1.516;SOR=1.000;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:20:99:20:0,551 0/1:13,16:29:99:.:468,0,354:9,4,6,10 +chrX 3597478 . CAA C,CAAAAAAAAAAA 573.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=24,5;AS_QD=18.03,0.00;BaseQRankSum=1.02;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=11.479;MQ=57.83;MQRankSum=-0.287;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.669;SOR=1.269;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,18,0:19:99:494,0,525:0,1,13,5 0/1:9,6,5:20:99:119,0,661,121,156,588:3,6,6,5 +chrX 3597499 . A C 1444 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=22.68;BaseQRankSum=1.212;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.88;MQRankSum=1.909;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.636;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:940,0:0,0,17,6 0/1:23,19:42:99:534,0,513:13,10,6,13 +chrX 3598592 . A AAAAGAAAG,AAAAAAAAGAAAG,AAAAAAAAAAAAAAAGAAAG,AAAAG,AAAAAAAAG,AAAAAAAAAG 1506.97 . AC=0,1,0,0,1,1;AF=0.00,0.333,0.00,0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,4,0,0,7,18;AS_QD=0.00,30.27,29.04,23.75,28.73,30.56;BaseQRankSum=1.655;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=14.768;MQ=59.44;MQRankSum=0;QD=46.85;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.935;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,4,0,0,0,0:4:99:634,645,0,246,535,535,535:0,0,2,2 5/6:4,0,0,0,0,7,18:29:70:912,747,892,747,892,892,747,892,892,892,817,976,976,976,1335,260,360,360,360,372,271,70,186,186,186,197,0,105:4,0,9,16 +chrX 3599061 . G GT 782.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.95;BaseQRankSum=0.743;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.973;SOR=0.868;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:559,0:0,0,14,5 0/1:23,13:36:99:263,0,811:15,8,8,5 +chrX 3599066 . T TAA,TTAA 431.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=16,0;AS_QD=15.70,4.43;BaseQRankSum=-0.747;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.165;SOR=0.892;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,452,452 0/1:14,16,0:30:99:.:471,0,636,409,414,938:9,5,11,5 +chrX 3599710 . C T 2347 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=24.76;BaseQRankSum=-1.59;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.848;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.338;SOR=0.551;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1428,0:.:0,0,13,19 0|1:28,36:64:99:0|1:3599710_C_T:949,0,731:3599710:12,16,19,17 +chrX 3599720 . T G 3951 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=32.31;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.04;SOR=0.845;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,34:34:99:.:.:1478,0:.:0,0,13,21 1|1:0,63:63:99:0|1:3599710_C_T:2503,189,0:3599710:0,0,32,31 +chrX 3599895 . A G 2816 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=31.62;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.62;SOR=0.990;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:852,0:0,0,17,11 1/1:0,62:62:99:1994,185,0:0,0,34,28 +chrX 3600335 . C T 2734 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.71;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.71;SOR=0.846;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1127,0:0,0,21,12 1/1:0,49:49:99:1637,147,0:0,0,23,26 +chrX 3600436 . G T 2867 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.55;BaseQRankSum=2.382;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.55;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.242;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,37:38:99:1211,0:1,0,21,16 1/1:0,51:51:99:1686,152,0:0,0,24,27 +chrX 3600513 . G GTGTAAAGTTTCAGTCA 3490.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=27.15;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.68;SOR=1.136;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1598,0:0,0,17,19 1/1:0,43:43:99:1932,128,0:0,0,15,28 +chrX 3600523 . A AAAAGTTCTGGAGATCTGCTGGAC 3148.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=26.40;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.28;SOR=1.148;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1086,0:0,0,13,12 1/1:0,47:47:99:2102,141,0:0,0,16,31 +chrX 3601278 . CT C 1142.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=22.73;BaseQRankSum=-0.643;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=3.037;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=22.73;ReadPosRankSum=-1.244;SOR=0.141;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:363,0:0,0,9,6 1/1:2,35:37:78:819,78,0:2,0,18,17 +chrX 3601857 . T A,TA 407 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=23,0;AS_QD=7.67,0.00;BaseQRankSum=-0.479;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.004;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.560;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,421,421 0/1:34,23,0:57:99:.:437,0,979,572,932,1584:19,15,12,11 +chrX 3601858 . T A,TA,TAA 2675 . AC=3,0,0;AF=1.00,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=73,0,0;AS_QD=35.11,29.51,33.72;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.05;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15,0,0:15:99:567,0,486,526:0,0,7,8 1/1:0,58,0,0:58:99:2138,195,0,2123,193,2261,2021,175,2163,2512:0,0,32,26 +chrX 3602325 . A G 629 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=10.98;BaseQRankSum=-1.369;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=10.165;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=2.019;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,661 0/1:33,27:60:99:.:659,0,911:13,20,5,22 +chrX 3602377 . TA T 4151.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=27.34;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.77;SOR=1.122;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1830,0:0,0,19,22 1/1:0,57:57:99:2361,172,0:0,0,21,36 +chrX 3602384 . AATTAT A 3038.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=31.41;BaseQRankSum=-0.608;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=8.012;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.41;ReadPosRankSum=-0.75;SOR=0.208;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1875,0:0,0,19,23 0/1:25,31:56:99:1203,0,956:7,18,15,16 +chrX 3603837 . C T 804 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.89;BaseQRankSum=-1.457;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.89;ReadPosRankSum=-1.325;SOR=0.741;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,219 0/1:24,32:56:99:.:834,0,626:10,14,13,19 +chrX 3604131 . G C 2422 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.59;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;QD=33.59;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:894,0:0,0,15,11 1/1:0,47:47:99:1558,141,0:0,0,25,22 +chrX 3605012 . GACACACACAC GACACACAC,G 808.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,12;AS_QD=13.40,17.15;BaseQRankSum=2.287;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=1.250;MQ=57.07;MQRankSum=0;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.985;SOR=0.473;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,16,0:17:99:402,0,412:0,1,6,10 0/2:13,0,12:25:99:446,485,1029,0,544,507:8,5,8,4 +chrX 3606268 . T C 3083 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=30.82;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.82;SOR=1.029;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:987,0:0,0,19,13 1/1:0,69:69:99:2126,206,0:0,0,39,30 +chrX 3606452 . T C 3196 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.26;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.26;SOR=0.775;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1147,0:0,0,17,18 1/1:0,65:65:99:2079,194,0:0,0,31,34 +chrX 3606562 . T C 2684 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.70;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=32.70;SOR=1.320;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:804,0:0,0,9,15 1/1:0,59:59:99:1910,177,0:0,0,22,37 +chrX 3606696 . TAC T 4217.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=31.84;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=0.778;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1769,0:0,0,20,20 1/1:0,56:56:99:2488,169,0:0,0,26,30 +chrX 3608578 . TACACACACACACACACAC TACACACACACACACACACAC,T,TAC 2037.97 . AC=1,0,2;AF=0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=12,3,40;AS_QD=18.71,27.82,23.21;BaseQRankSum=-0.669;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=2.788;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=36.44;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.248;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,12,0,0:14:99:262,0,321,321:2,0,4,8 3/3:0,0,3,40:43:35:1815,1659,1601,1345,1349,1287,130,133,35,0:0,0,30,13 +chrX 3610673 . G C 845 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=17.16;BaseQRankSum=-0.38;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=13.904;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=1.558;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:19,32:51:99:.:875,0,448:7,12,22,10 +chrX 3611876 . G A 1905 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=25.57;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.08;QD=45.00;SOR=0.739;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:90:31:.:.:0,90 1|1:0,43:43:99:.:0|1:3611876_G_A:1935,129,0:3611876:0,0,21,22 +chrX 3611884 . A G 1985 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=29.45;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.41;QD=44.78;SOR=0.737;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:90:31:.:.:0,90 1|1:0,45:45:99:.:0|1:3611876_G_A:2015,135,0:3611876:0,0,22,23 +chrX 3611888 . A G 1985 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=34.75;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.56;QD=44.78;SOR=0.737;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:90:31:.:.:0,90 1|1:0,45:45:99:.:0|1:3611876_G_A:2015,135,0:3611876:0,0,22,23 +chrX 3611928 . A G 1473 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=31.31;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.21;QD=31.31;SOR=0.776;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,48:48:99:.:1503,144,0:0,0,23,25 +chrX 3611941 . T C 1304 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=31.02;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.11;QD=31.02;SOR=0.836;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,43:43:99:.:1334,128,0:0,0,20,23 +chrX 3612153 . G T 1791 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=31.95;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.95;SOR=1.140;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,57:57:99:.:1821,170,0:0,0,23,34 +chrX 3612334 . C T 457 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.15;BaseQRankSum=0.482;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.552;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.899;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:29,19:48:99:.:487,0,789:13,16,11,8 +chrX 3612471 . A C 1677 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=33.47;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.64;QD=33.47;SOR=1.094;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,51:51:99:.:1707,153,0:0,0,30,21 +chrX 3612697 . A G 1869 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.74;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=32.74;SOR=1.179;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,58:58:99:.:1899,174,0:0,0,23,35 +chrX 3612748 . C G 1955 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.64;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=33.64;SOR=1.034;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,59:59:99:.:1985,177,0:0,0,25,34 +chrX 3613150 . CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA C 1081.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=32.22;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=6.854;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=40.04;SOR=0.636;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:2,26:28:42:.:1121,42,0:0,2,15,11 +chrX 3613854 . CAAAAAAA C 789.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=31.88;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=11.975;MQ=59.68;MQRankSum=-0.241;QD=31.88;SOR=1.170;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:3,23:26:7:.:829,7,0:0,3,15,8 +chrX 3614083 . T C 2335 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.12;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;QD=31.12;SOR=0.984;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,76:76:99:.:2365,226,0:0,0,33,43 +chrX 3614226 . A G 2097 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=31.75;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.75;SOR=0.784;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,67:67:99:.:2127,200,0:0,0,32,35 +chrX 3614834 . T G 1508 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=32.72;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=1.022;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,47:47:99:.:1538,141,0:0,0,27,20 +chrX 3615011 . A ATTT,T 914 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=22,4;AS_QD=33.04,28.22;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.36;QD=36.31;SOR=0.846;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90,90 1/1:0,22,4:26:21:.:944,86,0,521,21,763:0,0,14,12 +chrX 3615054 . T C 1032 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=32.18;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.10;QD=32.18;SOR=1.751;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,33:33:99:.:1062,99,0:0,0,10,23 +chrX 3615403 . C T 1657 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=32.44;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.44;SOR=0.770;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,52:52:99:.:1687,156,0:0,0,27,25 +chrX 3615921 . T C 1835 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=31.08;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.21;QD=31.08;SOR=0.831;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,60:60:99:.:1865,179,0:0,0,32,28 +chrX 3616417 . G A 1879 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.91;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.16;QD=32.91;SOR=0.914;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,58:58:99:.:1909,174,0:0,0,26,32 +chrX 3617161 . T TAC 2411.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=23.49;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;QD=42.26;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,58:58:99:.:2451,174,0:0,0,27,31 +chrX 3618068 . AG A 1013.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=30.97;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.14;QD=30.97;SOR=2.303;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,34:34:99:.:1053,102,0:0,0,4,14 +chrX 3618470 . T TAAGAG 3783.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=29.57;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=0.947;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1224,0:0,0,13,15 1/1:0,58:58:99:2599,175,0:0,0,25,33 +chrX 3618503 . G T 839 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.52;BaseQRankSum=0.452;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=1.071;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.791;SOR=1.018;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:23,33:56:99:.:869,0,547:10,13,12,21 +chrX 3622486 . A G 1373 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=30.50;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.50;SOR=0.874;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 1/1:0,46:46:99:.:1403,137,0:0,0,25,21 +chrX 3622833 . C A 1388 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=32.98;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.98;SOR=1.055;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 1/1:0,43:43:99:.:1418,129,0:0,0,25,18 +chrX 3623094 . GA G 1111.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=31.11;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.11;SOR=0.859;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 1/1:0,37:37:99:.:1151,111,0:0,0,20,17 +chrX 3625046 . G A 655 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.92;BaseQRankSum=2.035;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=-1.021;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.787;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:28,25:53:99:.:685,0,728:15,13,14,11 +chrX 3626308 . G A 714 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.88;BaseQRankSum=0.452;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.87;MQRankSum=-1.976;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.372;SOR=0.660;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:22,28:50:99:.:744,0,515:12,10,15,13 +chrX 3630285 . C T 3406 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.37;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.09;QD=44.05;SOR=0.798;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 1|1:0,78:78:99:.:0|1:3630285_C_T:3436,235,0:3630285:0,0,37,41 +chrX 3630297 . T C 3362 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=30.41;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.61;QD=44.05;SOR=0.719;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 1|1:0,77:77:99:.:0|1:3630285_C_T:3392,232,0:3630285:0,0,38,39 +chrX 3630347 . CA C 2297.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.58;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.51;QD=36.52;SOR=1.214;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 1/1:0,64:64:99:.:2337,192,0:0,0,25,39 +chrX 3630396 . C T 1990 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=33.67;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=51.45;QD=33.67;SOR=0.986;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 1/1:0,60:60:99:.:2020,180,0:0,0,26,34 +chrX 3630431 . G A 2479 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=31.28;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.13;QD=44.80;SOR=1.412;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 1|1:0,56:56:99:.:0|1:3630431_G_A:2509,169,0:3630431:0,0,20,36 +chrX 3630432 . C A 2479 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=24.76;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.35;QD=44.80;SOR=1.412;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 1|1:0,56:56:99:.:0|1:3630431_G_A:2509,169,0:3630431:0,0,20,36 +chrX 3630469 . G A 1772 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=34.00;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.44;QD=34.00;SOR=1.287;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 1/1:0,53:53:99:.:1802,159,0:0,0,20,33 +chrX 3630529 . C G 1737 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=33.34;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.34;SOR=1.179;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 1/1:0,53:53:99:.:1767,159,0:0,0,21,32 +chrX 3630710 . G C 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.80;BaseQRankSum=3.308;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.445;SOR=0.786;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:35,26:61:99:.:720,0,897:17,18,12,14 +chrX 3632463 . C CCCTGTCTGAATACAT 1216.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=27.30;BaseQRankSum=0.832;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.66;MQRankSum=-3.153;QD=27.30;ReadPosRankSum=1.418;SOR=0.760;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:15,31:46:99:.:1256,0,526:8,7,17,14 +chrX 3633414 . A C 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=-0.583;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=2.547;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=0.518;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 0|1:30,19:49:99:.:0|1:3633414_A_C:687,0,1128:3633414:18,12,9,10 +chrX 3633424 . T C 790 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.08;BaseQRankSum=-0.947;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=7.859;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.08;ReadPosRankSum=-2.32;SOR=0.991;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 0|1:28,23:51:99:.:0|1:3633414_A_C:820,0,1053:3633414:17,11,9,14 +chrX 3634025 . T G 810 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.24;BaseQRankSum=0.591;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.24;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.731;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:28,31:59:99:.:840,0,711:16,12,18,13 +chrX 3634773 . G C 732 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.29;BaseQRankSum=1.332;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.990;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.491;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:32,30:62:99:.:762,0,771:12,20,13,17 +chrX 3634980 . A G 988 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=14.75;BaseQRankSum=-0.905;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.927;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.827;SOR=0.518;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:29,40:69:99:.:1018,0,721:16,13,20,20 +chrX 3635875 . A G 784 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=11.46;BaseQRankSum=0.205;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.892;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.814;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:40,31:71:99:.:814,0,1092:18,22,13,18 +chrX 3637015 . G C 461 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=14.88;BaseQRankSum=-1.267;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=1.475;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.88;ReadPosRankSum=-1.05;SOR=0.330;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:15,18:33:99:.:491,0,423:11,4,11,7 +chrX 3637261 . A G 791 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.20;BaseQRankSum=0.739;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=3.801;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.636;SOR=0.330;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:24,30:54:99:.:821,0,604:15,9,15,15 +chrX 3637482 . C G 888 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=19.53;BaseQRankSum=1.584;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=4.125;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.907;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 0|1:23,24:47:99:.:0|1:3637482_C_G:918,0,862:3637482:10,13,14,10 +chrX 3637491 . T C 979 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=19.78;BaseQRankSum=-0.095;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=5.785;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.768;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 0|1:23,28:51:99:.:0|1:3637482_C_G:1009,0,850:3637482:9,14,16,12 +chrX 3637613 . A G 623 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.46;BaseQRankSum=-1.855;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=7.558;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.190;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:28,29:57:99:.:653,0,699:8,20,14,15 +chrX 3637729 . G A 842 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.45;BaseQRankSum=-1.887;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=4.017;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.027;SOR=1.238;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:21,32:53:99:.:872,0,561:11,10,12,20 +chrX 3637763 . CT C 333.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.56;BaseQRankSum=-1.141;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=12.506;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.872;SOR=1.198;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:19,20:39:99:.:373,0,416:13,6,7,13 +chrX 3637824 . T C 691 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=16.39;BaseQRankSum=0.535;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=1.187;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.294;SOR=0.452;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 0|1:25,19:44:99:.:0|1:3637824_T_C:721,0,961:3637824:15,10,10,9 +chrX 3637843 . C T 736 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.63;BaseQRankSum=1.278;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=0.648;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 0|1:28,21:49:99:.:0|1:3637824_T_C:766,0,1031:3637824:15,13,11,10 +chrX 3637894 . G A 370 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=7.69;BaseQRankSum=2.329;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=4.344;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.705;SOR=1.139;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:36,16:52:99:.:400,0,964:16,20,10,6 +chrX 3638240 . T G 844 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=16.19;BaseQRankSum=0.03;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.684;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:23,31:54:99:.:874,0,615:12,11,15,16 +chrX 3638284 . T TTC 904.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=20.98;BaseQRankSum=-0.476;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.735;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 0|1:20,25:45:99:.:0|1:3638284_T_TTC:944,0,765:3638284:11,9,14,11 +chrX 3638293 . C T 1011 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=24.21;BaseQRankSum=0.598;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.21;ReadPosRankSum=-1.591;SOR=0.593;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 0|1:17,26:43:99:.:0|1:3638284_T_TTC:1041,0,636:3638284:9,8,13,13 +chrX 3638306 . G A 966 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=23.16;BaseQRankSum=1.409;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.16;ReadPosRankSum=-1.154;SOR=0.770;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:8:30:6:.:.:0,30 0|1:18,25:43:99:.:0|1:3638284_T_TTC:996,0,670:3638284:9,9,12,13 +chrX 3638521 . G A 782 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.28;BaseQRankSum=0.954;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=2.628;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.356;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:19,28:47:99:.:812,0,489:6,13,12,16 +chrX 3638866 . C G 353 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=12.35;BaseQRankSum=0.672;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.246;SOR=0.836;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:16,15:31:99:.:383,0,408:7,9,6,9 +chrX 3638951 . G A 309 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=13.04;BaseQRankSum=1.391;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=1.770;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.133;SOR=0.307;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:8:30:6:0,30 0/1:14,12:26:99:.:339,0,374:3,11,4,8 +chrX 3639104 . T TGTGG 218.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=29.09;DP=37;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;QD=36.86;SOR=4.174;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:6:10:6:0,10 1/1:0,7:7:20:.:258,20,0:0,0,7,0 +chrX 3639235 . GGATGGATGAAGGGGTAGGTGGGTGGATGGATGGATGGATGGATGGATGAAGGGGTGGGGGGGTCGGGGGGTGGATGGATGAAGGGGTGGGGTGGTAGATGGATGAAGGGGTGGGGGTGGATGGATGAAGGGGTGGGGTGGTA G 298.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=28.17;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.42;MQRankSum=-0.223;QD=28.17;SOR=2.147;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:35:1:0,35 0/1:1,11:12:14:.:338,0,14:1,0,10,1 +chrX 3639459 . G A 194 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=24.89;BaseQRankSum=1.915;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.05;MQRankSum=0;QD=24.89;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=2.093;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:90:26:0,90 1/1:2,7:9:7:.:224,7,0:2,0,7,0 +chrX 3639515 . A G 580 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=34.10;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=5.421;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:26:90:26:.:.:0,90 1|1:0,14:14:42:.:0|1:3639515_A_G:610,42,0:3639515:0,0,14,0 +chrX 3639519 . GGT G 570.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=30.10;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=5.421;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:26:90:26:.:.:0,90 1|1:0,14:14:42:.:0|1:3639515_A_G:610,42,0:3639515:0,0,14,0 +chrX 3639536 . C A 637 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=30.07;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.69;SOR=5.670;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:26:90:26:.:.:0,90 1|1:0,16:16:48:.:0|1:3639515_A_G:667,48,0:3639515:0,0,16,0 +chrX 3639674 . T C 689 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.57;BaseQRankSum=-0.763;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=5.585;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.214;SOR=1.061;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:90:26:0,90 0/1:25,28:53:99:.:719,0,660:14,11,11,17 +chrX 3640098 . G A 602 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.05;BaseQRankSum=-1.863;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=2.885;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.307;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:90:26:0,90 0/1:19,23:42:99:.:632,0,534:5,14,9,14 +chrX 3643004 . CAA C 55.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=5.59;BaseQRankSum=0;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=20.434;MQ=59.48;MQRankSum=0.775;QD=5.59;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=3.588;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:90:26:0,90 0/1:12,5:17:95:.:95,0,239:3,9,5,0 +chrX 3643108 . A ACACCCC 571.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=17.46;BaseQRankSum=0.671;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.46;ReadPosRankSum=2.104;SOR=0.871;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:90:26:0,90 0/1:19,16:35:99:.:611,0,625:8,11,6,10 +chrX 3643555 . T C 673 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.72;BaseQRankSum=-1.817;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.988;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=0.876;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:90:26:0,90 0/1:32,28:60:99:.:703,0,892:14,18,11,17 +chrX 3643870 . C T 686 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=19.89;BaseQRankSum=2.38;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.716;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:90:26:0,90 0/1:12,24:36:99:.:716,0,269:7,5,14,10 +chrX 3644215 . C T 488 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=16.19;BaseQRankSum=-1.442;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.672;SOR=0.507;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:90:26:0,90 0/1:13,19:32:99:.:518,0,356:9,4,12,7 +chrX 3644234 . CAAA C 273.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=11.18;BaseQRankSum=0.292;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=5.969;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.38;SOR=1.770;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:90:26:0,90 0/1:17,11:28:99:.:313,0,491:8,9,8,3 +chrX 3644400 . C CA,CAA 420.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,9;AS_QD=29.67,32.33;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.22;QD=30.67;SOR=1.911;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:1:27:0,1,1 1/2:0,6,9:15:71:.:460,180,119,119,0,71:0,0,4,11 +chrX 3648606 . C CTG,CTGTG 1341.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=23,21;AS_QD=17.72,21.85;BaseQRankSum=-0.175;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.193;MQ=59.77;MQRankSum=-1.086;QD=24.23;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=0.671;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23,0:23:99:638,0,638:0,0,12,11 0/2:13,0,21:34:99:743,783,1299,0,516,453:6,7,11,10 +chrX 3650520 . C CA 750.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=19.27;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.48;QD=19.27;SOR=1.501;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:287,0:0,0,4,10 1/1:0,27:27:78:503,78,0:0,0,10,17 +chrX 3653624 . T C 402 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=10.29;BaseQRankSum=-0.509;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.218;MQ=58.94;MQRankSum=-0.137;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.821;SOR=0.430;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:23,19:42:99:.:432,0,610:14,9,10,9 +chrX 3653799 . ATATATATTATATACTATGTGATATATATAT A 54.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=3.36;BaseQRankSum=1.152;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=1.946;MQ=57.64;MQRankSum=-0.09;QD=3.36;ReadPosRankSum=-2.457;SOR=0.873;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:23,5:28:94:.:94,0,713:10,13,3,2 +chrX 3653981 . T A 341 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=11.59;BaseQRankSum=-0.55;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=1.406;MQ=59.44;MQRankSum=0.888;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.321;SOR=0.585;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:17,15:32:99:.:371,0,447:7,10,8,7 +chrX 3654483 . G T 45 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=1.42;BaseQRankSum=-1.672;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=26.600;MQ=58.93;MQRankSum=-1.013;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.682;SOR=1.231;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 0|1:38,15:53:75:.:0|1:3654478_G_T:75,0,1014:3654478:7,31,10,5 +chrX 3659721 . TTTTTTTTG T 199.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=7.71;BaseQRankSum=1.053;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.10;MQRankSum=-0.046;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.593;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:16,15:31:99:.:239,0,546:9,7,8,7 +chrX 3659723 . T G,* 2303 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=36,23;AS_QD=28.67,0.00;BaseQRankSum=3.395;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=7.506;MQ=58.51;MQRankSum=-0.466;QD=38.25;ReadPosRankSum=-1.586;SOR=0.781;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,21,0:23:99:765,0,791:0,2,12,9 1/2:0,15,23:38:99:1568,838,872,577,0,493:0,0,23,15 +chrX 3659727 . TTG T 725.97 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=21;AS_QD=33.26;BaseQRankSum=-0.154;DP=23;ExcessHet=0.0000;FS=6.628;MQ=57.41;MQRankSum=-0.466;QD=33.26;ReadPosRankSum=-1.584;SOR=0.588;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,21:23:99:765,0:0,2,12,9 . +chrX 3659728 . TG *,T 1558.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=25,6;AS_QD=0.00,27.76;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=7.525;MQ=58.99;QD=51.55;SOR=0.801;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,21,0:23:99:765,0,791:0,2,12,9 1/2:0,25,6:31:18:1598,141,18,911,0,866:0,0,19,12 +chrX 3659810 . C T 823 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.51;BaseQRankSum=1.139;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.618;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:570,0:0,0,8,9 0/1:26,12:38:99:283,0,699:12,14,6,6 +chrX 3661071 . T A 1596 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=19.36;BaseQRankSum=-1.11;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.939;MQ=54.41;MQRankSum=-3.929;QD=19.36;ReadPosRankSum=2.321;SOR=0.909;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:787,0:0,0,9,16 0/1:27,32:59:99:839,0,728:14,13,16,16 +chrX 3661438 . C T 1660 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=22.24;BaseQRankSum=0.017;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=7.748;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.24;ReadPosRankSum=-1.749;SOR=1.730;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:907,0:0,0,6,21 0/1:21,28:49:99:783,0,553:9,12,8,20 +chrX 3661515 . C G 1192 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=21.07;BaseQRankSum=-0.5;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=7.912;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.464;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:695,0:0,0,8,12 0/1:19,19:38:99:527,0,521:13,6,10,9 +chrX 3661596 . G GA 767.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.82;BaseQRankSum=0.62;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.582;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:371,0:0,0,6,9 0/1:15,21:36:99:436,0,280:8,7,12,9 +chrX 3661816 . A G 1537 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=18.65;BaseQRankSum=-0.459;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.843;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=0.931;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:818,0:0,0,13,13 0/1:30,28:58:99:749,0,828:15,15,17,11 +chrX 3662261 . A G 1766 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=19.96;BaseQRankSum=-0.925;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=4.445;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.669;SOR=0.355;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:838,0:0,0,13,15 0/1:27,35:62:99:958,0,722:9,18,15,20 +chrX 3662424 . A G 1891 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=21.83;BaseQRankSum=-1.136;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=6.226;MQ=59.62;MQRankSum=-0.332;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.278;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1041,0:0,0,17,13 0/1:25,32:57:99:880,0,678:17,8,16,16 +chrX 3662462 . A G 1801 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=20.81;BaseQRankSum=0.856;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.885;MQ=59.43;MQRankSum=-1.029;QD=20.81;ReadPosRankSum=1.979;SOR=0.460;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1077,0:0,0,19,14 0/1:28,27:55:99:754,0,752:16,12,11,16 +chrX 3662690 . A G 756 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.72;BaseQRankSum=-0.126;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.36;MQRankSum=-0.972;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.566;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12:12:99:345,0:0,0,6,6 0/1:18,17:35:99:441,0,490:8,10,8,9 +chrX 3662694 . C CA 533.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=12.19;BaseQRankSum=0.294;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=5.361;MQ=58.05;MQRankSum=-1.612;QD=12.19;ReadPosRankSum=-2.35;SOR=1.489;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:321,0:0,0,7,11 0/1:11,18:29:99:252,0,136:6,5,5,13 +chrX 3662754 . C T 1371 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=21.55;BaseQRankSum=-2.178;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=3.891;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.55;ReadPosRankSum=0.111;SOR=0.299;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:988,0:0,0,15,14 0/1:19,17:36:99:413,0,553:13,6,10,7 +chrX 3662998 . T TAAA,TA 1007.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=30,1;AS_QD=23.80,5.53;BaseQRankSum=2.288;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.273;MQ=59.32;MQRankSum=-1.259;QD=23.27;ReadPosRankSum=-1.058;SOR=0.418;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,0:14:99:549,0,550:0,0,7,7 0/1:14,16,1:31:99:498,0,447,415,246,608:5,9,7,10 +chrX 3663030 . G A 1508 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=18.99;BaseQRankSum=-0.092;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.868;MQ=59.60;MQRankSum=-1.001;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.712;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:804,0:0,0,13,12 0/1:29,27:56:99:734,0,818:15,14,12,15 +chrX 3663201 . A G 1525 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=23.21;BaseQRankSum=-0.818;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=2.414;MQ=59.78;MQRankSum=0;QD=23.21;ReadPosRankSum=-0.261;SOR=0.411;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:947,0:0,0,11,19 0/1:16,21:37:99:608,0,445:6,10,13,8 +chrX 3663382 . T C 1959 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.57;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.57;SOR=1.179;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:630,0:0,0,15,4 1/1:0,44:44:99:1359,131,0:0,0,23,21 +chrX 3663468 . A AC 940.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=22.79;BaseQRankSum=-1.186;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.25;MQRankSum=-1.186;QD=22.79;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.793;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:474,0:0,0,4,5 0/1:17,15:32:99:506,0,606:8,8,5,5 +chrX 3663469 . A *,ACACACACAC,C,ACACACAC 1684 . AC=0,1,1,1;AF=0.00,0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,9,15,10;AS_QD=29.44,36.08,31.07,28.31;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.22;QD=50.41;SOR=0.811;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,9,0,0:9:99:474,539,0,507,507:0,0,4,5 3/4:0,0,0,15,10:25:99:1240,762,845,992,781,1166,566,478,530,587,676,412,647,0,851:0,0,12,13 +chrX 3663471 . A C 915 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.29;BaseQRankSum=-2.131;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.48;MQRankSum=-1.451;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.235;SOR=0.724;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:474,0:0,0,4,5 0/1:23,15:38:99:471,0,794:12,11,5,5 +chrX 3664336 . G A 2833 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.91;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.91;SOR=0.972;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:893,0:0,0,12,15 1/1:0,60:60:99:1970,180,0:0,0,37,23 +chrX 3664662 . C T 2670 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.93;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.93;SOR=0.793;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1152,0:0,0,20,14 1/1:0,48:48:99:1548,143,0:0,0,23,25 +chrX 3665409 . C G 2768 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.92;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.92;SOR=0.765;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:923,0:0,0,14,14 1/1:0,57:57:99:1875,171,0:0,0,27,30 +chrX 3665727 . A G 2545 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.79;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=31.79;SOR=1.264;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:814,0:0,0,12,14 1/1:0,55:55:99:1761,164,0:0,0,19,36 +chrX 3665921 . T TGGATGG 2303.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=36.93;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.21;SOR=0.981;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:639,0:0,0,9,6 1/1:0,38:38:99:1704,114,0:0,0,21,17 +chrX 3665991 . A T 1931 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.68;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=32.68;SOR=0.986;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:610,0:0,0,10,10 1/1:0,40:40:99:1351,120,0:0,0,24,16 +chrX 3666020 . T G 2334 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.52;BaseQRankSum=-0.427;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=3.310;MQ=59.61;MQRankSum=5.003;QD=31.52;ReadPosRankSum=-1.661;SOR=0.484;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:856,0:0,0,13,14 1/1:1,47:48:99:1508,118,0:0,1,27,20 +chrX 3666152 . ATT A 1036.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=29.08;BaseQRankSum=-0.715;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;MQRankSum=0;QD=29.08;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.269;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:480,0:0,0,11,4 1/1:1,21:22:45:596,45,0:1,0,8,13 +chrX 3666248 . A G 3078 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=30.45;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.34;QD=43.17;SOR=0.934;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1352,0:.:0,0,17,15 1|1:0,40:40:99:0|1:3666248_A_G:1756,120,0:3666248:0,0,15,25 +chrX 3666259 . G A 3010 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=33.93;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.31;QD=44.06;SOR=0.980;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30:30:99:.:.:1318,0:.:0,0,14,16 1|1:0,39:39:99:0|1:3666248_A_G:1722,117,0:3666248:0,0,16,23 +chrX 3666911 . T TAAA,TAAAA 2132.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=28,3;AS_QD=33.77,29.75;BaseQRankSum=-0.781;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.74;MQRankSum=0;QD=67.88;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.569;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,11,1:13:99:661,0,188:0,1,3,9 1/1:0,17,2:19:35:1511,132,0,431,35,300:0,0,8,11 +chrX 3667424 . T C 1895 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.08;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.02;QD=32.08;SOR=0.760;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:662,0:0,0,12,8 1/1:0,40:40:99:1263,119,0:0,0,17,23 +chrX 3668274 . A G 3115 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=31.14;BaseQRankSum=-0.577;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.14;ReadPosRankSum=1.568;SOR=0.386;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,41:42:99:1255,0:1,0,25,16 1/1:0,59:59:99:1890,176,0:0,0,33,26 +chrX 3669316 . CTCCATCCA C 1802.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=31.21;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=0.693;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,472 1/1:0,42:42:99:.:1842,127,0:0,0,21,21 +chrX 3672133 . C T 2631 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=28.65;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.24;SOR=0.933;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:35:99:35:.:.:0,472 1|1:0,63:63:99:.:0|1:3672133_C_T:2661,190,0:3672133:0,0,28,35 +chrX 3672155 . A G 3603 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=32.05;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.24;SOR=1.053;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:972,0:.:0,0,17,15 1|1:0,63:63:99:0|1:3672133_C_T:2661,190,0:3672133:0,0,23,40 +chrX 3672982 . C A 1815 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.37;BaseQRankSum=2.871;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.409;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.37;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.568;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 1/1:1,56:57:99:.:1845,161,0:1,0,25,31 +chrX 3674684 . G A 1563 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.51;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.11;QD=32.51;SOR=0.818;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 1/1:0,49:49:99:.:1593,147,0:0,0,23,26 +chrX 3674806 . C T 1920 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=34.21;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.61;QD=34.21;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 1/1:0,57:57:99:.:1950,171,0:0,0,27,30 +chrX 3675315 . C T 1367 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=31.75;BaseQRankSum=2.583;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.75;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.330;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 1/1:1,43:44:99:.:1397,122,0:0,1,19,24 +chrX 3675618 . C G 1642 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=32.78;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.78;SOR=0.994;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 1/1:0,51:51:99:.:1672,152,0:0,0,22,29 +chrX 3675673 . TTCC T 1849.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=23.82;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=0.693;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 1/1:0,42:42:99:.:1889,127,0:0,0,21,21 +chrX 3677327 . C CT 331.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=21.82;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.42;QD=21.82;SOR=1.371;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:371,0:0,0,11,6 0/0:.:53:37:52:0,37,1398 +chrX 3677536 . G A,GA 1684 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=59,0;AS_QD=29.05,30.74;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=29.05;SOR=1.532;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,377,377 1/1:0,59,0:59:99:.:1714,183,0,1819,193,2289:0,0,20,39 +chrX 3678665 . C T 2163 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=33.74;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=33.74;SOR=0.787;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,377 1/1:0,65:65:99:.:2193,195,0:0,0,34,31 +chrX 3682260 . C T 1583 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.26;BaseQRankSum=2.598;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.74;MQRankSum=-0.663;QD=32.26;ReadPosRankSum=-1.56;SOR=0.470;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,377 1/1:1,49:50:99:.:1613,140,0:0,1,19,30 +chrX 3689539 . C T 1286 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=33.74;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.74;SOR=0.850;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,39:39:99:.:1316,0:0,0,21,18 0/0:.:54:54:54:0,54,986 +chrX 3689699 . T C 1374 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=31.91;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.59;QD=31.91;SOR=1.105;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,834 1/1:0,44:44:99:.:1404,132,0:0,0,18,26 +chrX 3689725 . C T 1986 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=27.67;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.03;QD=43.83;SOR=0.874;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:99:34:.:.:0,834 1|1:0,46:46:99:.:0|1:3689725_C_T:2016,138,0:3689725:0,0,25,21 +chrX 3689729 . A G 1928 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=34.87;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.98;QD=44.50;SOR=0.883;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:34:99:34:.:.:0,834 1|1:0,44:44:99:.:0|1:3689725_C_T:1958,132,0:3689725:0,0,24,20 +chrX 3689804 . T C 1311 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=16.35;BaseQRankSum=-1.434;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.818;MQ=59.25;MQRankSum=-1.853;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=0.583;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:912,0:0,0,12,18 0/1:33,19:52:99:429,0,941:18,15,12,7 +chrX 3689870 . A G 3043 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=39.79;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;QD=36.15;SOR=0.716;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:1161,0:0,0,12,15 1/1:0,58:58:99:1912,174,0:0,0,30,28 +chrX 3689894 . G A 1142 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=32.61;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;QD=41.86;SOR=1.382;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:1172,0:0,0,10,18 0/0:.:54:99:54:0,120,1800 +chrX 3689931 . G C 726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=-1.383;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;MQRankSum=-1.216;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.612;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,182 0|1:33,21:54:99:.:0|1:3689931_G_C:756,0,1312:3689931:18,15,11,10 +chrX 3689934 . A G 726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=-0.688;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.53;MQRankSum=-1.216;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.036;SOR=0.612;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,182 0|1:33,21:54:99:.:0|1:3689931_G_C:756,0,1312:3689931:18,15,11,10 +chrX 3690026 . T C 1802 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=29.08;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=29.08;SOR=0.790;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,63:63:99:.:1832,186,0:0,0,30,33 +chrX 3690448 . T C 878 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.41;BaseQRankSum=0.277;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=7.320;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=1.720;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 0/1:29,34:63:99:.:908,0,749:16,13,25,9 +chrX 3691178 . G A 1971 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.92;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.92;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,59:59:99:.:2001,177,0:0,0,33,26 +chrX 3691430 . CCCGGGGGAGTGGGCTACATTACATTCTACCTTCAAGAAAAATAACAATTTTTCGA C 1354.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=30.71;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.97;SOR=0.756;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,31:31:97:.:1394,97,0:0,0,15,16 +chrX 3691498 . T C 1071 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=32.38;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=0.811;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,34:34:99:.:1101,101,0:0,0,16,18 +chrX 3691850 . A ATGAT 1343.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=32.93;BaseQRankSum=4.415;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.93;ReadPosRankSum=-1.651;SOR=0.242;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:1,41:42:99:.:1383,101,0:1,0,21,20 +chrX 3692241 . T G 2418 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=27.92;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.95;SOR=0.728;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,182 1|1:0,57:57:99:.:0|1:3692241_T_G:2448,172,0:3692241:0,0,29,28 +chrX 3692263 . T C 2440 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=29.20;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.33;SOR=0.960;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,182 1|1:0,57:57:99:.:0|1:3692241_T_G:2470,172,0:3692241:0,0,32,25 +chrX 3693703 . T C 1617 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=31.08;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.08;SOR=0.892;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,53:53:99:.:1647,159,0:0,0,24,29 +chrX 3693872 . G T 260 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=9.35;BaseQRankSum=0.265;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=3.448;MQ=58.25;MQRankSum=-0.063;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.177;SOR=0.223;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 0/1:19,12:31:99:.:290,0,513:13,6,6,6 +chrX 3694040 . A G 1434 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=33.27;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=33.27;SOR=1.105;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,44:44:99:.:1464,132,0:0,0,26,18 +chrX 3694161 . T C 1681 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=30.55;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;QD=30.55;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,56:56:99:.:1711,167,0:0,0,26,30 +chrX 3694230 . T C 1494 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=33.87;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;QD=33.87;SOR=0.737;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,45:45:99:.:1524,135,0:0,0,23,22 +chrX 3694383 . A G 1928 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=30.59;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=30.59;SOR=1.214;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,64:64:99:.:1958,191,0:0,0,25,39 +chrX 3694421 . T A 1990 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.58;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.61;QD=32.58;SOR=0.899;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,62:62:99:.:2020,185,0:0,0,34,28 +chrX 3694505 . T C 1484 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=32.21;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.21;SOR=1.659;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,47:47:99:.:1514,141,0:0,0,32,15 +chrX 3694804 . T C 1463 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=31.77;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;QD=31.77;SOR=0.735;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,47:47:99:.:1493,141,0:0,0,24,23 +chrX 3695150 . T C 1811 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.30;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.30;SOR=0.728;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,57:57:99:.:1841,170,0:0,0,28,29 +chrX 3695161 . C T 1786 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=33.02;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.02;SOR=0.729;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,55:55:99:.:1816,165,0:0,0,28,27 +chrX 3695182 . T C 1692 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.12;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.12;SOR=0.853;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,52:52:99:.:1722,156,0:0,0,28,24 +chrX 3695532 . C A,T 1914 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=60,3;AS_QD=32.40,11.33;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=30.86;SOR=0.933;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182,182 1/1:0,60,3:63:99:.:1944,180,0,1911,147,1910:0,0,28,35 +chrX 3695715 . T C 1948 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=30.91;BaseQRankSum=2.791;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.91;ReadPosRankSum=-1.544;SOR=0.758;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:2,62:64:99:.:1978,142,0:1,1,30,32 +chrX 3695850 . G C 1995 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=33.75;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.75;SOR=0.831;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,60:60:99:.:2025,180,0:0,0,28,32 +chrX 3696045 . G A 1924 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.57;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.57;SOR=0.906;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,60:60:99:.:1954,180,0:0,0,27,33 +chrX 3696586 . G C 1541 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=30.80;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=30.80;SOR=0.732;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,51:51:99:.:1571,152,0:0,0,25,26 +chrX 3696746 . G A 2157 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.16;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.16;SOR=1.022;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,68:68:99:.:2187,204,0:0,0,39,29 +chrX 3696777 . C T 2073 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=31.39;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=31.39;SOR=0.990;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,67:67:99:.:2103,199,0:0,0,38,29 +chrX 3697007 . A G 1585 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=31.67;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.67;SOR=0.732;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,51:51:99:.:1615,153,0:0,0,25,26 +chrX 3697046 . GACAA G 1737.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=31.58;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=0.741;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,41:41:99:.:1777,123,0:0,0,21,20 +chrX 3697266 . C T 1558 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=33.08;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.08;SOR=1.067;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,48:48:99:.:1588,144,0:0,0,20,28 +chrX 3697720 . G T 1820 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=29.16;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=1.556;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,182 1|1:0,42:42:99:.:0|1:3697720_G_T:1850,126,0:3697720:0,0,28,14 +chrX 3697721 . T G 1820 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=32.73;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=1.556;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,182 1|1:0,42:42:99:.:0|1:3697720_G_T:1850,126,0:3697720:0,0,28,14 +chrX 3697755 . C T 2267 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=34.53;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=1.402;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,182 1|1:0,53:53:99:.:0|1:3697755_C_T:2297,159,0:3697755:0,0,34,19 +chrX 3697767 . C T 2257 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.86;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.98;SOR=1.136;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,182 1|1:0,52:52:99:.:0|1:3697755_C_T:2287,157,0:3697755:0,0,31,21 +chrX 3699852 . A G 1571 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.79;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.79;SOR=0.853;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,52:52:99:.:1601,155,0:0,0,28,24 +chrX 3700091 . A C 2114 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.00;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=0.917;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 1/1:0,67:67:99:.:2144,201,0:0,0,37,30 +chrX 3700749 . T TTTGTTGTTG 774.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=17.70;BaseQRankSum=1.34;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.162;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.435;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 0/1:24,22:46:99:.:814,0,920:9,15,10,12 +chrX 3701111 . TC T 954.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=21.61;BaseQRankSum=1.643;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=21.61;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.678;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 0/1:14,32:46:99:.:994,0,352:8,6,18,14 +chrX 3701275 . A ATTTT 1457.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=24.15;BaseQRankSum=0.928;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.15;ReadPosRankSum=-0.68;SOR=0.798;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,182 0/1:24,38:62:99:.:1497,0,890:12,12,20,18 +chrX 3701483 . G A 1211 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=31.03;BaseQRankSum=-0.438;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=3.468;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.03;ReadPosRankSum=-0.866;SOR=0.633;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,39:40:99:.:1241,0:0,1,22,17 0/0:.:59:59:59:0,59,1052 +chrX 3701618 . G C 1275 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=31.83;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.83;SOR=0.954;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,41:41:99:.:1305,0:0,0,18,23 0/0:.:59:59:59:0,59,1052 +chrX 3701976 . A G 853 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=31.54;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=31.54;SOR=0.997;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:883,0:0,0,16,12 0/0:.:59:59:59:0,59,1052 +chrX 3703668 . TG T 284.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=6.23;BaseQRankSum=-0.829;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=50.89;MQRankSum=-0.226;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.547;SOR=0.836;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:99:28:.:.:0,575 0|1:36,16:52:99:.:0|1:3703668_TG_T:324,0,985:3703668:15,21,6,10 +chrX 3703669 . GT G,* 508.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=20,16;AS_QD=11.52,0.00;BaseQRankSum=-1.156;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=7.679;MQ=49.05;MQRankSum=-3.441;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.078;SOR=1.692;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,8,0:8:99:.:.:174,0,175:.:0,0,2,6 1|2:11,12,16:39:32:1|0:3703668_TG_T:374,191,364,32,0,771:3703668:6,5,9,19 +chrX 3703869 . T C 795 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.28;BaseQRankSum=-0.968;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.273;MQ=59.39;MQRankSum=-1.498;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.47;SOR=0.557;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:23,31:54:99:.:825,0,596:10,13,16,15 +chrX 3703892 . C T 786 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.69;BaseQRankSum=-0.432;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=7.963;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.915;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:22,30:52:99:.:816,0,568:8,14,18,12 +chrX 3704745 . C T 750 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.93;BaseQRankSum=-0.191;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;MQRankSum=-0.929;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.607;SOR=0.689;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:27,29:56:99:.:780,0,720:14,13,15,14 +chrX 3705691 . C CT 485.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.71;BaseQRankSum=2.527;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=2.504;MQ=59.65;MQRankSum=-1.315;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=0.352;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:23,26:49:99:.:525,0,452:8,15,12,14 +chrX 3706002 . TA T 172.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=6.24;BaseQRankSum=1.9;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=5.294;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.39;SOR=1.577;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:21,13:34:99:.:212,0,398:10,11,9,4 +chrX 3706646 . G C 967 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=16.34;BaseQRankSum=0.775;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.182;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.740;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:24,37:61:99:.:997,0,556:11,13,20,17 +chrX 3707331 . C T 527 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.92;BaseQRankSum=-0.331;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=4.096;MQ=58.74;MQRankSum=-2.654;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.97;SOR=0.264;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:29,22:51:99:.:557,0,786:19,10,11,11 +chrX 3707557 . T C 782 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.10;BaseQRankSum=-0.584;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.530;MQ=58.48;MQRankSum=-2.679;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.839;SOR=0.365;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:30,32:62:99:.:812,0,793:10,20,14,18 +chrX 3709183 . C CA 152.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=7.68;BaseQRankSum=-0.268;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=3.624;MQ=59.30;MQRankSum=-1.221;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.85;SOR=1.516;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:11,14:25:99:.:192,0,128:5,6,4,10 +chrX 3709373 . A G 925 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.19;BaseQRankSum=-0.627;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.670;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.19;ReadPosRankSum=2.13;SOR=0.653;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:24,35:59:99:.:955,0,598:10,14,19,16 +chrX 3710386 . T C 691 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.71;BaseQRankSum=-0.148;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.101;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.76;SOR=0.623;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:22,27:49:99:.:721,0,553:12,10,13,14 +chrX 3710767 . C T 752 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.41;BaseQRankSum=2.698;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.414;MQ=59.89;MQRankSum=0.926;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.709;SOR=0.382;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:35,28:63:99:.:782,0,947:14,21,14,14 +chrX 3710801 . G C 769 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.10;BaseQRankSum=-1.115;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.561;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.354;SOR=1.241;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:31,30:61:99:.:799,0,864:15,16,11,19 +chrX 3711839 . T A 500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.25;BaseQRankSum=2.98;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=4.442;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=1.247;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:21,19:40:99:.:530,0,493:11,10,7,12 +chrX 3711877 . G C 461 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.23;BaseQRankSum=-0.284;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=1.048;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:28,20:48:99:.:491,0,744:15,13,8,12 +chrX 3712725 . C T 561 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.55;BaseQRankSum=0.865;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=5.557;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.725;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:33,23:56:99:.:591,0,888:13,20,13,10 +chrX 3713126 . A G 955 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.70;BaseQRankSum=0.127;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=6.476;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.119;SOR=1.020;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:32,35:67:99:.:985,0,881:18,14,14,21 +chrX 3713482 . G A 660 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.90;BaseQRankSum=0.562;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.779;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:31,27:58:99:.:690,0,799:20,11,18,9 +chrX 3713579 . G C 763 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.86;BaseQRankSum=0.156;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.888;SOR=0.727;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,461 0|1:29,21:50:99:.:0|1:3713579_G_C:793,0,1144:3713579:14,15,11,10 +chrX 3713581 . G T 763 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.86;BaseQRankSum=-1.655;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.597;SOR=0.727;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,461 0|1:29,21:50:99:.:0|1:3713579_G_C:793,0,1144:3713579:14,15,11,10 +chrX 3713920 . C T 737 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.37;BaseQRankSum=-1.064;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.940;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.826;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:32,30:62:99:.:767,0,831:16,16,14,16 +chrX 3714927 . C T 580 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.51;BaseQRankSum=-0.327;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.51;ReadPosRankSum=-1.355;SOR=0.800;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,461 0/1:30,23:53:99:.:610,0,852:17,13,10,13 +chrX 3714990 . C T 1075 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=33.48;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.48;SOR=1.022;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,33:33:99:.:1105,0:0,0,19,14 0/0:.:58:52:58:0,52,1126 +chrX 3716754 . C T 875 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=18.47;BaseQRankSum=-0.078;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.587;MQ=59.85;MQRankSum=-0.686;QD=18.47;ReadPosRankSum=-1.418;SOR=0.585;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:17,32:49:99:.:905,0,414:7,10,17,15 +chrX 3717050 . ATG A 820.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.23;BaseQRankSum=2.04;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.08;SOR=0.627;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:27,26:53:99:.:860,0,862:14,13,13,13 +chrX 3717498 . T C 1084 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=17.14;BaseQRankSum=-0.169;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=6.603;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.68;SOR=0.257;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,323 0|1:35,30:65:99:.:0|1:3717498_T_C:1114,0,1277:3717498:12,23,15,15 +chrX 3717514 . G A 1061 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=17.89;BaseQRankSum=-0.372;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.548;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.399;SOR=0.364;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,323 0|1:32,29:61:99:.:0|1:3717498_T_C:1091,0,1180:3717498:11,21,13,16 +chrX 3718284 . T C 841 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.52;BaseQRankSum=-1.296;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.990;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.52;ReadPosRankSum=1.03;SOR=0.709;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:28,32:60:99:.:871,0,772:15,13,15,17 +chrX 3719243 . G A 1057 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=17.82;BaseQRankSum=-1.416;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.091;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.982;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:20,41:61:99:.:1087,0,463:12,8,27,14 +chrX 3719510 . A G 1007 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=17.00;BaseQRankSum=-2.863;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=17.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.435;SOR=0.960;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:22,39:61:99:.:1037,0,582:16,6,15,24 +chrX 3720564 . C G 421 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.87;BaseQRankSum=-1.718;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.273;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.579;SOR=0.783;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:20,18:38:99:.:451,0,561:11,9,8,10 +chrX 3720591 . T G 467 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=13.81;BaseQRankSum=-1.395;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=1.311;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.772;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:18,18:36:99:.:497,0,514:8,10,10,8 +chrX 3720821 . ATGTGGGAAAGCAAAAACG A 427.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=11.68;BaseQRankSum=1.414;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.910;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:27,13:40:99:.:467,0,1072:12,15,5,8 +chrX 3721007 . T C 625 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.36;BaseQRankSum=0.083;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.507;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:27,26:53:99:.:655,0,710:15,12,13,13 +chrX 3721203 . T C 636 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.33;BaseQRankSum=-0.211;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.099;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.504;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:29,25:54:99:.:666,0,805:20,9,16,9 +chrX 3721452 . A G 464 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.15;BaseQRankSum=-0.572;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.398;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=1.085;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:34,20:54:99:.:494,0,995:19,15,13,7 +chrX 3721628 . C A 968 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=13.67;BaseQRankSum=1.394;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=12.805;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.507;SOR=0.132;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:36,37:73:99:.:998,0,877:9,27,18,19 +chrX 3733950 . G A 791 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.66;BaseQRankSum=2.128;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=7.470;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.192;SOR=1.206;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,323 0/1:26,30:56:99:.:821,0,591:15,11,11,19 +chrX 3734142 . C CT 215.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=18.21;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.33;QD=18.21;SOR=1.329;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,14:14:99:.:255,0:0,0,5,9 0/0:.:36:33:32:0,33,943 +chrX 3737945 . C T 694 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.14;BaseQRankSum=0.201;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.643;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,164 0/1:37,28:65:99:.:724,0,1016:18,19,14,14 +chrX 3740467 . C A 256 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=6.98;BaseQRankSum=0.798;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=42.959;MQ=58.75;MQRankSum=1.848;QD=6.98;ReadPosRankSum=3.379;SOR=4.706;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,164 0|1:20,21:41:99:.:1|0:3740464_T_G:286,0,462:3740464:13,7,1,20 +chrX 3740820 . C CAAA,CAAAAA 40.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=1,7;AS_QD=0.00,4.21;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=23.444;MQ=59.30;MQRankSum=0;QD=4.00;ReadPosRankSum=-3.599;SOR=2.777;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,164,164 0/2:12,1,7:20:80:.:80,151,975,0,439,480:10,2,1,7 +chrX 3740843 . G GAAAA,A 2556 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=55,3;AS_QD=29.99,32.31;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.80;QD=44.59;SOR=1.199;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,0:18:99:792,0,792:0,0,5,13 1/1:0,37,3:40:76:1794,122,0,1288,76,1209:0,0,17,21 +chrX 3741163 . T C 1121 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=32.89;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.35;QD=32.89;SOR=2.368;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1151,0:0,0,27,8 0/0:.:57:37:54:0,37,1243 +chrX 3741825 . T C 535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.77;BaseQRankSum=1.445;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=8.425;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=1.808;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,287 0/1:27,21:48:99:.:565,0,724:13,14,15,6 +chrX 3743806 . A C,ATC 939 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=27,0;AS_QD=24.45,29.25;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.72;QD=35.89;SOR=1.230;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,0:11:99:347,0,407:0,0,2,5 1/1:0,16,0:16:49:622,49,0,638,63,787:0,0,6,8 +chrX 3743810 . A C 341 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=15.46;BaseQRankSum=0.287;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.40;MQRankSum=0;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.791;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,540 0|1:13,11:24:99:.:0|1:3743810_A_C:371,0,491:3743810:6,7,5,4 +chrX 3743836 . C A 271 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=11.15;BaseQRankSum=1.327;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=4.684;MQ=59.49;MQRankSum=0;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.33;SOR=2.115;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,540 0|1:17,10:27:99:.:1|0:3743810_A_C:301,0,580:3743810:8,9,1,5 +chrX 3746974 . T C 360 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.29;BaseQRankSum=-0.78;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.221;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.705;SOR=0.460;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,540 0/1:25,17:42:99:.:390,0,668:15,10,9,8 +chrX 3747400 . A G 506 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.40;BaseQRankSum=-1.665;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;MQRankSum=-1.023;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.639;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,540 0/1:25,22:47:99:.:536,0,697:14,11,12,10 +chrX 3747423 . A AAAAAAAAG 996.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.19;BaseQRankSum=0.628;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.347;MQ=58.84;MQRankSum=-0.952;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.988;SOR=1.204;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,540 0/1:27,27:54:99:.:1036,0,876:14,13,17,10 +chrX 3747460 . GAAA G 1150.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=19.83;BaseQRankSum=-2.185;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.600;MQ=59.64;MQRankSum=-0.934;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=1.177;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,540 0/1:29,31:60:99:.:1190,0,1077:14,15,19,12 +chrX 3747595 . A G 841 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=13.00;BaseQRankSum=0.991;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=4.790;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.883;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,540 0/1:34,33:67:99:.:871,0,878:19,15,14,19 +chrX 3748329 . ATGTGTG A 666.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.84;BaseQRankSum=-1.463;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=-1.205;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.757;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,540 0|1:31,20:51:99:.:0|1:3748329_ATGTGTG_A:706,0,1170:3748329:18,13,12,8 +chrX 3748656 . A T 843 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=13.64;BaseQRankSum=-1.226;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.448;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.64;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=1.007;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,540 0/1:30,34:64:99:.:873,0,801:16,14,14,20 +chrX 3748693 . C G 916 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=14.55;BaseQRankSum=0.244;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.938;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.645;SOR=0.869;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,540 0/1:30,35:65:99:.:946,0,788:15,15,16,19 +chrX 3748930 . A G 1052 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=18.98;BaseQRankSum=-1.011;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.245;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.046;SOR=1.071;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,540 0|1:28,29:57:99:.:0|1:3748930_A_G:1082,0,997:3748930:13,15,11,18 +chrX 3748954 . A G 1229 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=20.98;BaseQRankSum=-0.996;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=5.246;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=1.216;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,540 0|1:28,32:60:99:.:0|1:3748930_A_G:1259,0,1032:3748930:15,13,12,20 +chrX 3748970 . C CT 1117.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=21.04;BaseQRankSum=-1.192;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.728;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=1.098;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,540 0|1:25,30:55:99:.:0|1:3748930_A_G:1157,0,902:3748930:13,12,12,18 +chrX 3749325 . A G 2862 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=30.77;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.77;SOR=0.736;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:828,0:0,0,16,10 1/1:0,68:68:99:2064,202,0:0,0,30,38 +chrX 3749402 . C T 775 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=11.67;BaseQRankSum=0.935;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.002;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.109;SOR=0.815;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,606 0/1:38,31:69:99:.:805,0,1013:18,20,17,14 +chrX 3749511 . A G 776 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.14;BaseQRankSum=-1.83;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.138;SOR=0.756;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,606 0/1:26,31:57:99:.:806,0,701:13,13,15,16 +chrX 3750305 . C G 949 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=14.19;BaseQRankSum=-1.575;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=3.240;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.692;SOR=1.121;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,606 0/1:32,37:69:99:.:979,0,885:16,16,22,15 +chrX 3750617 . T A 493 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.16;BaseQRankSum=0.937;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=9.350;MQ=45.50;MQRankSum=-5.786;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.125;SOR=2.143;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,606 0/1:24,19:43:99:.:523,0,680:11,13,4,15 +chrX 3752043 . C T 608 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.57;BaseQRankSum=1.807;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=1.117;MQ=59.98;MQRankSum=-0.979;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.16;SOR=0.646;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,606 0/1:24,23:47:99:.:638,0,608:11,13,12,11 +chrX 3752391 . A T 1817 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=19.65;BaseQRankSum=0.602;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=7.312;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.65;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.806;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,35:36:99:1048,0:1,0,18,17 0/1:28,30:58:99:799,0,689:16,12,10,20 +chrX 3752604 . GA G 551.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=11.82;BaseQRankSum=0.546;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=2.602;MQ=57.28;MQRankSum=-3.413;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.586;SOR=1.112;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,7:7:99:.:.:315,0:.:0,0,2,5 0|1:34,9:43:99:0|1:3752604_GA_G:276,0,1401:3752604:14,20,3,6 +chrX 3752606 . T TCA 551.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=11.82;BaseQRankSum=0.738;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=2.602;MQ=57.23;MQRankSum=-3.413;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.651;SOR=1.112;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,7:7:99:.:.:315,0:.:0,0,2,5 0|1:34,9:43:99:0|1:3752604_GA_G:276,0,1401:3752604:14,20,3,6 +chrX 3752609 . GA G 590.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=12.12;BaseQRankSum=1.234;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.34;MQRankSum=-3.283;QD=12.12;ReadPosRankSum=-2.12;SOR=0.861;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,7:7:99:.:.:315,0:.:0,0,2,5 0|1:35,10:45:99:0|1:3752604_GA_G:315,0,1440:3752604:14,21,4,6 +chrX 3752617 . C T 603 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=12.41;BaseQRankSum=-0.449;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=1.142;MQ=57.28;MQRankSum=-3.236;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.864;SOR=0.489;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,7:7:99:.:.:315,0:.:0,0,2,5 0|1:34,10:44:99:0|1:3752604_GA_G:318,0,1398:3752604:14,20,6,4 +chrX 3752623 . G T 780 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.58;BaseQRankSum=0.236;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.34;MQRankSum=-2.608;QD=15.58;ReadPosRankSum=-3.228;SOR=0.602;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,7:7:99:.:.:315,0:.:0,0,2,5 0|1:31,14:45:99:0|1:3752604_GA_G:495,0,1260:3752604:14,17,8,6 +chrX 3752627 . A T 732 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.94;BaseQRankSum=-0.497;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=2.422;MQ=57.28;MQRankSum=-2.518;QD=14.94;ReadPosRankSum=-3.165;SOR=0.758;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,5:5:99:.:.:225,0:.:0,0,2,3 0|1:31,15:46:99:0|1:3752604_GA_G:537,0,1257:3752604:14,17,9,6 +chrX 3752634 . T C 822 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=16.71;BaseQRankSum=0.14;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=2.418;MQ=58.11;MQRankSum=-2.286;QD=16.71;ReadPosRankSum=-3.674;SOR=1.043;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,5:5:99:.:.:225,0:.:0,0,3,2 0|1:29,17:46:99:0|1:3752604_GA_G:627,0,1167:3752604:14,15,10,7 +chrX 3752637 . C T 783 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=16.59;BaseQRankSum=1.794;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=2.498;MQ=58.52;MQRankSum=-1.859;QD=16.59;ReadPosRankSum=-3.283;SOR=1.230;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,5:5:99:.:.:225,0:.:0,0,3,2 0|1:28,16:44:99:0|1:3752604_GA_G:588,0,1128:3752604:14,14,10,6 +chrX 3752645 . C T 822 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=16.71;BaseQRankSum=1.762;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=4.035;MQ=58.58;MQRankSum=-1.835;QD=16.71;ReadPosRankSum=-2.1;SOR=1.297;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,5:5:99:.:.:225,0:.:0,0,3,2 0|1:29,17:46:99:0|1:3752604_GA_G:627,0,1167:3752604:14,15,11,6 +chrX 3752653 . A G 864 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.19;BaseQRankSum=0.862;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=3.951;MQ=58.61;MQRankSum=-1.783;QD=17.19;ReadPosRankSum=-1.912;SOR=1.329;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,5:5:99:.:.:225,0:.:0,0,3,2 0|1:29,18:47:99:0|1:3752604_GA_G:669,0,1164:3752604:15,14,12,6 +chrX 3752661 . A G 996 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.00;BaseQRankSum=-0.196;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=7.543;MQ=59.37;MQRankSum=-1.661;QD=19.00;ReadPosRankSum=-1.194;SOR=1.697;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,6:6:99:.:.:270,0:.:0,0,4,2 0|1:28,20:48:99:0|1:3752604_GA_G:756,0,1116:3752604:14,14,14,6 +chrX 3752664 . T C 999 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.06;BaseQRankSum=-0.938;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=12.835;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.44;SOR=2.303;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,7:7:99:.:.:315,0:.:0,0,5,2 0|1:28,19:47:99:0|1:3752604_GA_G:714,0,1119:3752604:14,14,15,4 +chrX 3752665 . T G 993 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=18.27;BaseQRankSum=-1.628;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=15.373;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=2.280;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,7:7:99:.:.:315,0:.:0,0,5,2 0|1:30,19:49:99:0|1:3752604_GA_G:708,0,1203:3752604:14,16,15,4 +chrX 3752670 . A G 1131 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.37;BaseQRankSum=-0.11;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=18.070;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.043;SOR=2.180;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,9:9:99:.:.:405,0:.:0,0,6,3 0|1:28,20:48:99:0|1:3752604_GA_G:756,0,1116:3752604:12,16,16,4 +chrX 3752671 . G A 1131 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.37;BaseQRankSum=2.291;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=18.070;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=2.180;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,9:9:99:.:.:405,0:.:0,0,6,3 0|1:28,20:48:99:0|1:3752604_GA_G:756,0,1116:3752604:12,16,16,4 +chrX 3752672 . T C 1134 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.79;BaseQRankSum=1.691;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=15.572;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.1;SOR=2.189;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,9:9:99:.:.:405,0:.:0,0,6,3 0|1:27,20:47:99:0|1:3752604_GA_G:759,0,1074:3752604:12,15,16,4 +chrX 3752677 . T C 1171 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=21.45;BaseQRankSum=1.13;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=15.647;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.721;SOR=2.277;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,10:10:99:.:.:439,0:.:0,0,7,3 0|1:26,20:46:99:0|1:3752604_GA_G:762,0,1020:3752604:12,14,16,4 +chrX 3752762 . C CT 438.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=20.78;BaseQRankSum=-0.479;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.203;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.263;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,21:23:99:.:478,0:2,0,10,11 0/0:.:59:53:59:0,53,1414 +chrX 3753097 . A G 1741 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=16.87;BaseQRankSum=1.515;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.736;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.790;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:852,0:0,0,13,15 0/1:42,35:77:99:919,0,1063:21,21,17,18 +chrX 3754431 . C T 597 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=29.86;BaseQRankSum=-0.272;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.93;MQRankSum=-2.288;QD=29.86;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.765;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,20:21:99:.:627,0:1,0,14,6 0/0:.:59:99:59:0,106,1424 +chrX 3754548 . G A 1692 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=20.75;BaseQRankSum=1.54;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=4.789;MQ=56.46;MQRankSum=-2.044;QD=20.75;ReadPosRankSum=1.834;SOR=1.033;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:868,0:0,0,12,16 0/1:24,31:55:99:854,0,575:13,11,12,19 +chrX 3755793 . CTTT C 244.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=13.52;BaseQRankSum=-0.529;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=4.123;MQ=59.21;MQRankSum=1.634;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=1.288;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,135 0/1:12,9:21:99:.:284,0,353:7,5,3,6 +chrX 3755926 . G A 714 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.04;BaseQRankSum=2.3;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.57;SOR=0.627;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,135 0/1:27,26:53:99:.:744,0,714:13,14,13,13 +chrX 3757517 . C CA 499.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.48;BaseQRankSum=0.258;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.835;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.48;ReadPosRankSum=-2.142;SOR=1.220;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,135 0/1:14,26:40:99:.:539,0,249:7,7,10,16 +chrX 3757670 . A G 799 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.05;BaseQRankSum=0.298;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.990;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.639;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,135 0/1:28,31:59:99:.:829,0,710:15,13,15,16 +chrX 3758685 . CTCCATCCA C 772.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=23.88;BaseQRankSum=-1.616;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=8.039;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.88;ReadPosRankSum=-1.809;SOR=0.982;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,135 0/1:13,21:34:99:.:812,0,482:9,4,8,13 +chrX 3759015 . T TCATC 163.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=20.30;BaseQRankSum=1.701;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.37;SOR=0.223;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,8:10:99:.:203,0:2,0,5,3 0/0:.:43:23:34:0,23,793 +chrX 3760275 . A G 658 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.07;BaseQRankSum=1.263;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.226;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.737;SOR=0.706;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:31,26:57:99:.:688,0,827:17,14,12,14 +chrX 3760371 . T A 669 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.87;BaseQRankSum=0.465;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.509;SOR=0.581;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:21,26:47:99:.:699,0,509:9,12,12,14 +chrX 3760615 . A T 746 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.51;BaseQRankSum=-0.254;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.826;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:20,27:47:99:.:776,0,529:8,12,10,17 +chrX 3760697 . C T 765 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.71;BaseQRankSum=0.814;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=7.495;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.986;SOR=0.869;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:36,22:58:99:.:0|1:3760697_C_T:795,0,1445:3760697:22,14,9,13 +chrX 3760700 . A G 765 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.71;BaseQRankSum=0.878;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=7.495;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.869;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:36,22:58:99:.:0|1:3760697_C_T:795,0,1445:3760697:22,14,9,13 +chrX 3761026 . T C 810 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.13;BaseQRankSum=-1.633;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.821;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:32,32:64:99:.:840,0,889:14,18,13,19 +chrX 3761100 . A G 832 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.96;BaseQRankSum=-0.383;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=13.281;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.53;SOR=2.390;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:31,23:54:99:.:0|1:3761100_A_G:862,0,1172:3761100:16,15,5,18 +chrX 3761110 . A G 884 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.62;BaseQRankSum=0.059;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=13.085;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.187;SOR=2.383;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:31,24:55:99:.:0|1:3761100_A_G:914,0,1208:3761100:15,16,5,19 +chrX 3761128 . C A 710 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.96;BaseQRankSum=-0.834;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=13.365;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.311;SOR=2.426;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:33,20:53:99:.:0|1:3761100_A_G:740,0,1262:3761100:16,17,4,16 +chrX 3761156 . T TGATGGATGGATGGATG 501.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=13.53;BaseQRankSum=-1.642;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=9.829;MQ=59.57;MQRankSum=-1.239;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=1.856;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:25,15:40:99:.:541,0,976:14,11,4,11 +chrX 3761212 . T C 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=14.27;BaseQRankSum=0.533;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.846;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.27;ReadPosRankSum=-1.992;SOR=1.270;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:25,16:41:99:.:0|1:3761212_T_C:585,0,969:3761212:11,14,5,11 +chrX 3761213 . G A 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=14.27;BaseQRankSum=1.951;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.846;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.27;ReadPosRankSum=-1.898;SOR=1.270;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:25,16:41:99:.:0|1:3761212_T_C:585,0,969:3761212:11,14,5,11 +chrX 3761284 . T C 470 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.50;BaseQRankSum=-2.304;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=2.780;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.61;SOR=0.812;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:19,21:40:99:.:500,0,516:11,8,9,12 +chrX 3761340 . T A 445 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.59;BaseQRankSum=-0.308;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.624;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:22,19:41:99:.:475,0,541:12,10,10,9 +chrX 3761543 . G A 657 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=1.429;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.28;SOR=0.631;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:25,24:49:99:.:687,0,701:15,10,14,10 +chrX 3761769 . G T 1223 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=22.78;BaseQRankSum=0.402;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.310;MQ=59.70;MQRankSum=-1.184;QD=22.78;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.633;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:23,32:55:99:.:0|1:3761769_G_T:1253,0,869:3761769:10,13,17,15 +chrX 3761778 . A T 1210 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=22.14;BaseQRankSum=0.144;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.662;MQ=59.25;MQRankSum=-1.21;QD=22.14;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.590;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:24,32:56:99:.:0|1:3761769_G_T:1240,0,891:3761769:10,14,17,15 +chrX 3761959 . G A 1236 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=18.62;BaseQRankSum=1.717;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.960;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.457;SOR=0.883;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:24,44:68:99:.:1266,0,515:12,12,20,24 +chrX 3762173 . A C 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.58;BaseQRankSum=0.348;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.537;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:26,27:53:99:.:720,0,703:15,11,13,14 +chrX 3762411 . A G 899 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.59;BaseQRankSum=0.64;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.526;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:23,33:56:99:.:929,0,581:10,13,16,17 +chrX 3762560 . G A 713 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=0.858;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;MQRankSum=0;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.610;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:26,27:53:99:.:743,0,705:10,16,11,16 +chrX 3762643 . C CATA 1153.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=22.94;BaseQRankSum=1.276;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=7.963;MQ=59.96;MQRankSum=-0.817;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=0.915;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:22,30:52:99:.:1193,0,833:14,8,12,18 +chrX 3762834 . T C 456 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.79;BaseQRankSum=0.018;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.289;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.577;SOR=1.158;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:19,19:38:99:.:486,0,486:9,10,7,12 +chrX 3762975 . C T 713 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.81;BaseQRankSum=0.494;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.417;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.506;SOR=1.488;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:20,27:47:99:.:743,0,500:11,9,19,8 +chrX 3763024 . T G 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.26;BaseQRankSum=-2.518;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.717;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.039;SOR=1.300;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:27,31:58:99:.:769,0,715:14,13,20,11 +chrX 3763160 . G A 1161 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=22.90;BaseQRankSum=-1.423;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=4.070;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.338;SOR=0.283;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:20,32:52:99:.:0|1:3763160_G_A:1191,0,733:3763160:7,13,16,16 +chrX 3763181 . T A 1333 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=22.72;BaseQRankSum=-0.998;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.032;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.72;ReadPosRankSum=-1.772;SOR=0.484;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:22,38:60:99:.:0|1:3763160_G_A:1363,0,779:3763160:9,13,18,20 +chrX 3763329 . T C 539 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.35;BaseQRankSum=-0.149;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.920;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.299;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:33,22:55:99:.:569,0,942:21,12,11,11 +chrX 3763728 . G T 619 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.47;BaseQRankSum=2.564;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.977;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.431;SOR=0.859;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:38,24:62:99:.:649,0,1013:19,19,11,13 +chrX 3764350 . A T 474 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.26;BaseQRankSum=-1.294;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=1.273;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.234;SOR=0.957;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:19,19:38:99:.:504,0,519:10,9,8,11 +chrX 3764500 . G T,GCATCCATCCATCCATCCATC,C 1014 . AC=0,1,0;AF=0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,23,0;AS_QD=0.00,22.21,18.46;BaseQRankSum=-0.749;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.509;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.377;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237,237,237 0/2:24,0,23,0:47:99:.:1044,1098,1837,0,674,918,601,1405,970,1645:15,9,12,11 +chrX 3764566 . G C,T 672 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=27,1;AS_QD=13.00,0.00;BaseQRankSum=0.292;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=5.494;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.202;SOR=1.349;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237,237 0/1:27,27,1:55:99:.:702,0,682,776,755,1535:14,13,10,18 +chrX 3765682 . A G 721 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=10.43;BaseQRankSum=-2.238;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=4.667;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.189;SOR=0.672;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:41,31:72:99:.:751,0,1144:17,24,17,14 +chrX 3765700 . C CT 795.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.10;BaseQRankSum=-3.175;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=6.422;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=0.801;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:41,28:69:99:.:835,0,1328:17,24,16,12 +chrX 3765909 . G A 596 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.27;BaseQRankSum=1.246;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=15.943;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.454;SOR=1.347;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:27,24:51:99:.:626,0,696:9,18,16,8 +chrX 3766109 . A T 1026 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=19.56;BaseQRankSum=-0.795;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=7.543;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.202;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:26,28:54:99:.:0|1:3766109_A_T:1056,0,963:3766109:18,8,14,14 +chrX 3766113 . A G 994 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.32;BaseQRankSum=-0.53;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=5.783;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.763;SOR=0.229;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:26,27:53:99:.:0|1:3766109_A_T:1024,0,966:3766109:18,8,14,13 +chrX 3766262 . A C 477 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.22;BaseQRankSum=-3.124;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.272;SOR=0.743;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:33,22:55:99:.:507,0,980:19,14,13,9 +chrX 3766482 . A G 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.76;BaseQRankSum=-1.528;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=9.154;MQ=58.75;MQRankSum=-3.376;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.871;SOR=0.755;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:33,26:59:99:.:635,0,941:12,21,15,11 +chrX 3766583 . G C 766 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.54;BaseQRankSum=0.031;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.939;MQ=58.73;MQRankSum=-4.067;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.448;SOR=0.517;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:39,30:69:99:.:796,0,1067:24,15,17,13 +chrX 3766598 . C G 746 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=11.25;BaseQRankSum=0.652;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.945;MQ=58.77;MQRankSum=-4.067;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.537;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:39,30:69:99:.:776,0,1018:25,14,18,12 +chrX 3766855 . C T 684 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=12.31;BaseQRankSum=-1.188;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;MQRankSum=-0.966;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.7;SOR=0.570;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:29,29:58:99:.:714,0,770:17,12,16,13 +chrX 3767049 . G A 642 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.18;BaseQRankSum=1.588;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.958;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=0.520;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:40,26:66:99:.:672,0,1043:22,18,13,13 +chrX 3767120 . G GTTTTTTTTTTC,GTTTTTTTTTTCT 658.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=10,4;AS_QD=20.53,19.61;BaseQRankSum=1.186;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=7.419;MQ=59.19;MQRankSum=-1.837;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.394;SOR=1.718;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237,237 0/1:24,10,4:38:99:.:698,0,767,149,746,951:11,13,10,4 +chrX 3768656 . G A 449 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.09;BaseQRankSum=2.114;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=3.176;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.362;SOR=1.569;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:17,17:34:99:.:479,0,429:9,8,12,5 +chrX 3769212 . C G 608 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.76;BaseQRankSum=-0.138;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.35;SOR=0.693;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:26,24:50:99:.:638,0,724:13,13,12,12 +chrX 3769392 . A AT 155.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=5.74;BaseQRankSum=0.11;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=0.956;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:23,11:34:99:.:195,0,560:8,15,3,8 +chrX 3769447 . A AT 153.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=6.66;BaseQRankSum=-0.47;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=1.561;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.023;SOR=0.399;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:19,10:29:99:.:193,0,449:13,6,6,4 +chrX 3769881 . TATC T 635.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=16.46;BaseQRankSum=0.06;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=4.769;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.329;SOR=0.200;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:23,18:41:99:.:675,0,901:7,16,9,9 +chrX 3769987 . C G 231 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=7.68;BaseQRankSum=0.214;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=1.445;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.064;SOR=1.200;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:22,12:34:99:.:261,0,553:12,10,8,4 +chrX 3770381 . T C 931 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.16;BaseQRankSum=-1.024;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.995;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=0.846;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:30,26:56:99:.:0|1:3770381_T_C:961,0,1168:3770381:15,15,12,14 +chrX 3770384 . C T 934 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.53;BaseQRankSum=0.591;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.113;SOR=0.793;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:29,26:55:99:.:0|1:3770381_T_C:964,0,1138:3770381:15,14,12,14 +chrX 3770761 . A G 1111 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=18.11;BaseQRankSum=-0.129;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.6;SOR=0.644;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:23,40:63:99:.:1141,0,565:13,10,22,18 +chrX 3771011 . T C 470 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.09;BaseQRankSum=0.171;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;MQRankSum=0.242;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.566;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:34,21:55:99:.:500,0,912:15,19,10,11 +chrX 3771394 . C T 618 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.23;BaseQRankSum=1.687;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.713;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:29,24:53:99:.:648,0,772:16,13,11,13 +chrX 3771634 . A G 1020 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.22;BaseQRankSum=1.348;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=21.356;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.468;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:31,38:69:99:.:1050,0,761:24,7,17,21 +chrX 3771645 . G C 963 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=14.39;BaseQRankSum=0.08;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=18.304;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.892;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:31,38:69:99:.:993,0,791:22,9,15,23 +chrX 3771806 . A C 591 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.09;BaseQRankSum=-1.335;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.786;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.977;SOR=0.909;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:32,24:56:99:.:621,0,933:14,18,14,10 +chrX 3774163 . G A 670 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.67;BaseQRankSum=1.845;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=7.085;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.993;SOR=1.396;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:34,26:60:99:.:700,0,900:18,16,9,17 +chrX 3774565 . CG C 1135.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=23.04;BaseQRankSum=-0.164;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.896;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.04;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.091;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:21,30:51:99:.:0|1:3774565_CG_C:1175,0,791:3774565:11,10,12,18 +chrX 3774567 . ACG A 1135.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=23.04;BaseQRankSum=-1.273;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.896;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.04;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=1.091;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,237 0|1:21,30:51:99:.:0|1:3774565_CG_C:1175,0,791:3774565:11,10,12,18 +chrX 3774776 . G A 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.67;BaseQRankSum=-1.065;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=0.616;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,237 0/1:20,26:46:99:.:675,0,515:12,8,15,11 +chrX 3775246 . ATTTTTTTTTTTTTTT ATTTTTTTT,A,ATTTTTTTTTTTTT 500.97 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=7,10,3;AS_QD=14.73,17.72,5.09;BaseQRankSum=-0.157;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=6.805;MQ=57.38;MQRankSum=0.196;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.887;SOR=0.820;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,7,0,0:8:99:221,0,249,249:1,0,4,3 0/2:7,0,10,3:20:34:319,400,928,0,606,985,263,434,34,352:5,2,4,9 +chrX 3775325 . T C 332 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=9.53;BaseQRankSum=-1.018;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.40;MQRankSum=-1.702;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.646;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:23,15:38:99:.:362,0,665:9,14,6,9 +chrX 3775597 . G C 663 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.95;BaseQRankSum=-1.24;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.983;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.851;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:31,27:58:99:.:693,0,861:16,15,15,12 +chrX 3775972 . CTT C 859.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.35;BaseQRankSum=-0.46;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.794;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.056;SOR=1.246;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,297 0|1:31,24:55:99:.:0|1:3775972_CTT_C:899,0,1170:3775972:17,14,16,8 +chrX 3775978 . CTTTCTTT C 853.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.67;BaseQRankSum=-0.73;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.769;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.171;SOR=1.261;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,297 0|1:33,24:57:99:.:0|1:3775972_CTT_C:893,0,1221:3775972:18,15,16,8 +chrX 3776262 . T C 605 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.45;BaseQRankSum=-0.555;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=4.176;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.274;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:25,26:51:99:.:635,0,636:7,18,11,15 +chrX 3776316 . T C 842 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.85;BaseQRankSum=-2.043;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=1.082;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.06;SOR=0.540;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:22,33:55:99:.:872,0,579:7,15,12,21 +chrX 3776620 . T C 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.33;BaseQRankSum=-1.098;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=-0.795;QD=15.33;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=0.812;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:19,27:46:99:.:705,0,493:9,10,12,15 +chrX 3776830 . C A 55 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=2.18;BaseQRankSum=-0.523;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=67.432;MQ=58.77;MQRankSum=-1.892;QD=2.18;ReadPosRankSum=1.987;SOR=5.889;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:21,18:39:85:.:85,0,496:17,4,0,18 +chrX 3777442 . T C 366 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=9.90;BaseQRankSum=-1.804;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.382;SOR=0.765;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:24,16:40:99:.:396,0,689:13,11,9,7 +chrX 3777626 . G A 1013 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=13.55;BaseQRankSum=0.33;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=1.865;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.770;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:38,39:77:99:.:1043,0,979:18,20,21,18 +chrX 3777789 . G GT 922.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=18.86;BaseQRankSum=0.045;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=5.881;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.86;ReadPosRankSum=2.017;SOR=1.609;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:26,25:51:99:.:962,0,1017:13,13,17,8 +chrX 3777794 . G GT,GTTTTGTTTTTGT 1107.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=25,0;AS_QD=24.40,4.77;BaseQRankSum=0.603;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=4.175;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.864;SOR=1.352;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297,297 0/1:22,25,0:47:99:.:1147,0,1002,1042,920,2083:12,10,17,8 +chrX 3778688 . GTTGATTGGATTTTAATCCAATTTTAA G 1037.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=23.41;BaseQRankSum=0.644;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.667;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,297 0|1:19,27:46:99:.:0|1:3778688_GTTGATTGGATTTTAATCCAATTTTAA_G:1077,0,717:3778688:10,9,14,13 +chrX 3778717 . C CGT 1100.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=28.50;BaseQRankSum=0.888;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=5.073;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.50;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.479;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,297 0|1:12,28:40:99:.:0|1:3778688_GTTGATTGGATTTTAATCCAATTTTAA_G:1140,0,419:3778688:4,8,15,13 +chrX 3779024 . C T 753 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=13.50;BaseQRankSum=-0.347;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=9.450;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.50;ReadPosRankSum=-2.07;SOR=0.797;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:29,29:58:99:.:783,0,794:19,10,12,17 +chrX 3779094 . C T 691 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.88;BaseQRankSum=-0.399;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.09;SOR=0.588;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:29,27:56:99:.:721,0,785:18,11,16,11 +chrX 3779160 . T C 608 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=9.97;BaseQRankSum=0.148;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.502;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.115;SOR=1.220;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:38,26:64:99:.:638,0,991:19,19,16,10 +chrX 3779382 . G A 1107 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=17.77;BaseQRankSum=0.25;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.131;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.298;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:23,41:64:99:.:1137,0,543:15,8,21,20 +chrX 3780744 . G A 612 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.88;BaseQRankSum=-1.15;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.770;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,297 0/1:34,25:59:99:.:642,0,960:17,17,12,13 +chrX 3783685 . G A 1096 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=32.17;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.17;SOR=0.749;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1126,0:0,0,17,18 0/0:.:56:76:56:0,76,1076 +chrX 3784510 . A G 1042 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=33.50;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=33.50;SOR=0.818;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:1072,0:0,0,15,17 0/0:.:56:76:56:0,76,1076 +chrX 3785699 . G C 948 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=33.72;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.72;SOR=0.906;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:978,0:0,0,16,13 0/0:.:56:76:56:0,76,1076 +chrX 3785937 . A G 406 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=12.46;BaseQRankSum=-2.422;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=3.012;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.321;SOR=1.371;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 0/1:18,17:35:99:.:436,0,521:9,9,11,6 +chrX 3786403 . G A 989 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=17.57;BaseQRankSum=1.132;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;MQRankSum=-1.504;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.36;SOR=0.737;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,253 0|1:31,27:58:99:.:0|1:3786403_G_A:1019,0,1143:3786403:13,18,11,16 +chrX 3786412 . C T 928 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.42;BaseQRankSum=0.56;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.049;MQ=59.83;MQRankSum=-1.537;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.973;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,253 0|1:30,25:55:99:.:0|1:3786403_G_A:958,0,1127:3786403:14,16,10,15 +chrX 3786429 . A AT 712.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=0.33;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=4.134;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.662;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,253 0|1:27,20:47:99:.:0|1:3786429_A_AT:752,0,1074:3786429:16,11,9,11 +chrX 3786433 . A C 722 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=16.00;BaseQRankSum=-0.07;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=4.134;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.662;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,253 0|1:27,20:47:99:.:0|1:3786429_A_AT:752,0,1074:3786429:16,11,9,11 +chrX 3787157 . G A 952 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.37;BaseQRankSum=1.621;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.998;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.261;SOR=0.693;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 0/1:26,34:60:99:.:982,0,659:14,12,16,18 +chrX 3787427 . T TATCA 1198.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=23.81;BaseQRankSum=-1.511;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.81;ReadPosRankSum=1.912;SOR=0.793;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 0/1:21,31:52:99:.:1238,0,789:11,10,17,14 +chrX 3788564 . CAAAAAAAAA C,CAAAAA 829.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=15,11;AS_QD=33.00,24.46;BaseQRankSum=-0.502;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.193;SOR=1.022;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253,253 1/2:2,15,11:28:99:.:869,308,623,551,0,557:1,1,15,11 +chrX 3789486 . T TC 960.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=18.18;BaseQRankSum=0.131;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=1.070;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.465;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 0/1:26,29:55:99:.:1000,0,862:9,17,12,17 +chrX 3789817 . G A 761 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.18;BaseQRankSum=2.18;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.960;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=0.836;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 0/1:32,28:60:99:.:791,0,850:16,16,15,13 +chrX 3789946 . A C 687 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.28;BaseQRankSum=-0.757;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=5.597;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.831;SOR=1.034;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 0/1:26,28:54:99:.:717,0,713:11,15,17,11 +chrX 3790709 . CTT C,CTTT 619.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=10,20;AS_QD=20.80,18.65;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.43;QD=21.97;SOR=1.329;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253,253 1/2:0,10,20:30:99:.:659,451,762,286,0,296:0,0,19,11 +chrX 3790961 . A G 2018 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=31.03;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=31.03;SOR=1.196;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 1/1:0,66:66:99:.:2048,196,0:0,0,26,40 +chrX 3791028 . C T 878 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.89;BaseQRankSum=-0.626;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.524;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=0.799;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 0/1:27,34:61:99:.:908,0,690:15,12,15,19 +chrX 3791881 . C CTT,CTTTTT 375.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=12,4;AS_QD=25.63,23.75;BaseQRankSum=0.924;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.80;MQRankSum=-0.635;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.996;SOR=0.693;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253,253 1/2:4,12,4:20:5:.:415,5,48,225,0,426:1,3,5,11 +chrX 3792526 . G C 662 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.31;BaseQRankSum=-1.378;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.307;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.31;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=0.430;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 0/1:24,28:52:99:.:692,0,635:10,14,14,14 +chrX 3792628 . G C 492 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=16.84;BaseQRankSum=-0.095;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=6.205;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.124;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,253 0/1:12,19:31:99:.:522,0,305:2,10,8,11 +chrX 3792702 . T A 1736 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.96;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.96;SOR=0.693;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:778,0:0,0,11,12 1/1:0,29:29:87:988,87,0:0,0,15,14 +chrX 3792823 . T C 207 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=6.41;BaseQRankSum=-1.22;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=11.030;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.416;SOR=1.701;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:26,11:37:99:.:237,0,763:10,16,8,3 +chrX 3792846 . C CA 538.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=16.06;BaseQRankSum=0.831;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=11.247;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.991;SOR=1.001;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:12,24:36:99:.:578,0,236:9,3,9,15 +chrX 3793380 . C T 927 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.48;BaseQRankSum=1.902;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.641;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:35,36:71:99:.:957,0,837:18,17,18,18 +chrX 3794057 . A C 37 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=2.68;BaseQRankSum=-1.451;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=31.875;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.095;SOR=2.198;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:19,6:25:67:.:67,0,530:1,18,5,1 +chrX 3795068 . C G 1557 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=33.06;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=33.06;SOR=1.067;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 1/1:0,48:48:99:.:1587,144,0:0,0,20,28 +chrX 3795124 . T C 478 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.55;BaseQRankSum=-1.128;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=6.234;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.745;SOR=1.334;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:24,20:44:99:.:508,0,682:13,11,7,13 +chrX 3795468 . T C 610 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.88;BaseQRankSum=0.203;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.192;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.183;SOR=0.446;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:20,23:43:99:.:640,0,535:12,8,12,11 +chrX 3795824 . A G 839 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.24;BaseQRankSum=-0.016;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=12.24;ReadPosRankSum=-2.107;SOR=0.755;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:37,34:71:99:.:869,0,993:18,19,16,18 +chrX 3795932 . T TGAGA 1612.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=31.17;BaseQRankSum=2.645;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.17;ReadPosRankSum=1.541;SOR=0.900;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 1/1:2,51:53:99:.:1652,110,0:1,1,28,23 +chrX 3796601 . G A 767 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.76;BaseQRankSum=2.233;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.055;MQ=58.27;MQRankSum=-2.601;QD=14.76;ReadPosRankSum=-2.057;SOR=0.976;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:25,29:54:99:.:797,0,567:12,13,12,17 +chrX 3796647 . C T 702 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.94;BaseQRankSum=0.498;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.092;MQ=57.85;MQRankSum=-3.871;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.922;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:22,27:49:99:.:732,0,542:11,11,12,15 +chrX 3796912 . A G 1874 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=34.00;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.00;SOR=0.922;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 1/1:0,56:56:99:.:1904,168,0:0,0,31,25 +chrX 3799660 . C G 680 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.49;BaseQRankSum=-2.388;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=4.189;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.987;SOR=0.381;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:20,29:49:99:.:710,0,529:13,7,14,15 +chrX 3799779 . A G 1492 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=31.71;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.71;SOR=1.179;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 1/1:0,48:48:99:.:1522,143,0:0,0,19,29 +chrX 3799817 . A G 727 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.82;BaseQRankSum=-0.021;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.852;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:18,27:45:99:.:757,0,471:8,10,11,16 +chrX 3799902 . A G 508 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.96;BaseQRankSum=-0.538;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.507;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.354;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:31,23:54:99:.:538,0,836:22,9,14,9 +chrX 3799992 . T G 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=11.65;BaseQRankSum=0.554;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.202;SOR=0.596;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:35,31:66:99:.:769,0,898:19,16,16,15 +chrX 3800019 . G C 698 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.34;BaseQRankSum=2.623;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=7.155;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=1.302;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:31,28:59:99:.:728,0,695:14,17,18,10 +chrX 3800265 . C G 787 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.57;BaseQRankSum=0.458;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=3.370;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.769;SOR=0.732;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,561 0/1:34,31:65:99:.:817,0,902:19,15,14,17 +chrX 3800503 . A AT,ATTTT 581.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=14,14;AS_QD=10.38,19.19;BaseQRankSum=-0.751;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=4.163;MQ=58.80;MQRankSum=0;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.635;SOR=1.535;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,0:14:99:218,0,218:0,0,8,6 0/2:7,0,14:21:99:403,424,641,0,216,174:3,4,11,3 +chrX 3801875 . C T 790 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=16.08;BaseQRankSum=1.207;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.408;SOR=0.743;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:22,29:51:99:.:820,0,558:7,15,9,20 +chrX 3802051 . CAG C 964.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.69;BaseQRankSum=0.881;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.422;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.69;ReadPosRankSum=1.093;SOR=1.123;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:25,26:51:99:.:1004,0,957:14,11,17,9 +chrX 3802225 . G C 232 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=13.10;BaseQRankSum=-0.821;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.67;MQRankSum=-0.804;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.837;SOR=0.437;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:9,11:20:99:.:262,0,243:1,8,2,9 +chrX 3802455 . C T 559 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.73;BaseQRankSum=-1.855;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=4.590;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.83;SOR=0.255;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:18,22:40:99:.:589,0,506:6,12,11,11 +chrX 3802559 . A T 623 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.89;BaseQRankSum=-0.717;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.301;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.362;SOR=0.263;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:23,24:47:99:.:653,0,623:16,7,13,11 +chrX 3803019 . A G 517 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.73;BaseQRankSum=0.09;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=1.058;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.547;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:29,22:51:99:.:547,0,770:12,17,10,12 +chrX 3803297 . C T 432 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=8.40;BaseQRankSum=1.153;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.678;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:35,20:55:99:.:462,0,878:14,21,8,12 +chrX 3803331 . G A 631 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.80;BaseQRankSum=0.384;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=5.523;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.396;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:31,25:56:99:.:661,0,834:11,20,13,12 +chrX 3803378 . TA T 662.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.54;BaseQRankSum=-0.36;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=9.749;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.519;SOR=0.998;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:25,31:56:99:.:702,0,515:16,9,12,19 +chrX 3804413 . A G 842 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.46;BaseQRankSum=0.075;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=3.285;MQ=59.21;MQRankSum=-0.073;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.8;SOR=0.363;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:37,33:70:99:.:872,0,1008:14,23,16,17 +chrX 3805346 . T C 805 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=12.10;BaseQRankSum=0.524;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=4.703;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.10;ReadPosRankSum=2.151;SOR=0.436;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,99 0/1:36,33:69:99:.:835,0,909:22,14,16,17 +chrX 3805612 . CAAAAAAA C,CA,CAAAAAAAA 788.97 . AC=1,0,1;AF=0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,2,17;AS_QD=30.85,27.00,10.55;BaseQRankSum=0;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=12.548;MQ=58.48;MQRankSum=-0.509;QD=23.66;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=1.231;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13,2,0:15:99:617,0,220,451:0,0,9,6 0/3:3,0,0,17:20:2:211,220,270,220,270,270,0,50,50,2:3,0,2,15 +chrX 3805756 . A G 873 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.80;BaseQRankSum=0.466;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.08;SOR=0.830;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,436 0/1:27,34:61:99:.:903,0,676:15,12,20,14 +chrX 3806762 . A T 989 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.21;BaseQRankSum=-0.523;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.923;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.576;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,436 0/1:29,38:67:99:.:1019,0,747:17,12,21,17 +chrX 3807360 . A G 861 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.73;BaseQRankSum=-1.02;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=8.219;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.2;SOR=0.869;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,436 0/1:36,34:70:99:.:891,0,991:22,14,14,20 +chrX 3808325 . T G 920 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.84;BaseQRankSum=0.951;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=10.607;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.272;SOR=0.842;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,436 0/1:30,34:64:99:.:950,0,774:11,19,20,14 +chrX 3808436 . G A 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.06;BaseQRankSum=-1.463;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.06;ReadPosRankSum=2.059;SOR=0.846;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,436 0/1:22,26:48:99:.:675,0,586:11,11,12,14 +chrX 3808613 . G C 414 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=11.38;BaseQRankSum=-0.692;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.226;SOR=0.610;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,436 0/1:21,18:39:99:.:444,0,572:10,11,9,9 +chrX 3808976 . G T 1161 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=20.89;BaseQRankSum=-0.985;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=5.389;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.89;ReadPosRankSum=-1.387;SOR=0.620;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,436 0|1:26,31:57:99:.:0|1:3808976_G_T:1191,0,976:3808976:10,16,17,14 +chrX 3808981 . G A 1135 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=21.57;BaseQRankSum=0.025;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.57;ReadPosRankSum=-1.942;SOR=0.430;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,436 0|1:24,30:54:99:.:0|1:3808976_G_T:1165,0,917:3808976:10,14,15,15 +chrX 3809353 . T C 718 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.96;BaseQRankSum=1.329;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.829;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,436 0/1:23,27:50:99:.:748,0,579:11,12,12,15 +chrX 3809467 . G A 561 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=13.74;BaseQRankSum=1.395;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.790;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.317;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,436 0|1:27,16:43:99:.:0|1:3809467_G_A:591,0,1064:3809467:17,10,8,8 +chrX 3809471 . C G 567 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=1.182;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.263;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.387;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,436 0|1:25,16:41:99:.:0|1:3809467_G_A:597,0,1002:3809467:15,10,8,8 +chrX 3809806 . A C 849 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=12.74;BaseQRankSum=-2.431;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.743;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,436 0/1:33,36:69:99:.:879,0,890:17,16,19,17 +chrX 3810086 . T TAC 851.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=33.00;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.19;QD=33.00;SOR=0.765;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:891,0:0,0,14,13 0/0:.:52:0:52:0,0,742 +chrX 3810113 . A AC 686.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=19.11;BaseQRankSum=1.471;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.16;MQRankSum=-1.748;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.38;SOR=0.910;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 0|1:19,19:38:99:.:0|1:3810113_A_AC:726,0,741:3810113:11,8,12,7 +chrX 3810114 . A ACACACACACACACACACACAC 683.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=18.54;BaseQRankSum=0.514;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.21;MQRankSum=-1.794;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.818;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 0|1:20,19:39:99:.:0|1:3810113_A_AC:723,0,771:3810113:12,8,12,7 +chrX 3810116 . A C 665 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=18.29;BaseQRankSum=1.662;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.77;MQRankSum=-1.844;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.439;SOR=0.732;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 0|1:20,18:38:99:.:0|1:3810113_A_AC:695,0,774:3810113:12,8,11,7 +chrX 3810384 . T C 648 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.89;BaseQRankSum=1.163;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.679;MQ=59.92;MQRankSum=0.919;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.593;SOR=0.782;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:32,25:57:99:.:678,0,878:14,18,14,11 +chrX 3810434 . T TC 925.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.55;BaseQRankSum=-0.148;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.63;MQRankSum=-0.946;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=0.610;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:27,28:55:99:.:965,0,856:17,10,17,11 +chrX 3810818 . T C 840 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=12.08;BaseQRankSum=-0.804;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.627;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:38,34:72:99:.:870,0,1064:15,23,14,20 +chrX 3811336 . C T 1385 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=20.81;BaseQRankSum=2.819;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=-0.913;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.804;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 0|1:32,36:68:99:.:0|1:3811336_C_T:1415,0,1235:3811336:16,16,17,19 +chrX 3811337 . A G 1385 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=20.81;BaseQRankSum=3.003;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=-0.913;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.804;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 0|1:32,36:68:99:.:0|1:3811336_C_T:1415,0,1235:3811336:16,16,17,19 +chrX 3811496 . T C 769 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.67;BaseQRankSum=-1.624;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.67;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.666;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 0|1:28,23:51:99:.:0|1:3811496_T_C:799,0,1045:3811496:16,12,13,10 +chrX 3811516 . G A 768 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=15.35;BaseQRankSum=-0.259;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.848;SOR=0.671;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387 0|1:29,23:52:99:.:0|1:3811496_T_C:798,0,1057:3811496:19,10,15,8 +chrX 3811584 . C T 492 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.35;BaseQRankSum=-0.477;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.566;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:25,21:46:99:.:522,0,636:11,14,10,11 +chrX 3811842 . G A 890 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=17.04;BaseQRankSum=1.4;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.04;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.714;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:22,32:54:99:.:920,0,538:13,9,19,13 +chrX 3811902 . C A 923 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=15.62;BaseQRankSum=-1.793;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=5.310;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.62;ReadPosRankSum=-1.927;SOR=0.561;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:24,37:61:99:.:953,0,622:15,9,17,20 +chrX 3812024 . T C 623 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.89;BaseQRankSum=0.183;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.770;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:22,25:47:99:.:653,0,563:11,11,12,13 +chrX 3812169 . C T 697 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.84;BaseQRankSum=0.643;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.100;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=0.481;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:23,26:49:99:.:727,0,597:13,10,13,13 +chrX 3812303 . T C 683 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.51;BaseQRankSum=0.31;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.212;MQ=59.86;MQRankSum=0.951;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.446;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:31,26:57:99:.:713,0,861:19,12,14,12 +chrX 3812451 . C T 574 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.08;BaseQRankSum=1.954;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=4.124;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.124;SOR=1.402;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:28,22:50:99:.:604,0,753:13,15,7,15 +chrX 3813168 . A G 760 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.63;BaseQRankSum=-1.934;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.092;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=0.469;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:24,30:54:99:.:790,0,652:8,16,12,18 +chrX 3813180 . A AT 577.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.22;BaseQRankSum=-0.06;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.786;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.317;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:27,28:55:99:.:617,0,586:10,17,14,14 +chrX 3814208 . A G 546 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.16;BaseQRankSum=-0.581;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=2.961;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.059;SOR=0.307;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:17,21:38:99:.:576,0,457:12,5,12,9 +chrX 3814275 . C CA 333.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.35;BaseQRankSum=-1.48;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.909;MQ=58.93;MQRankSum=-0.932;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.402;SOR=1.402;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:6,20:26:69:.:373,0,69:3,3,7,13 +chrX 3814291 . G GA 440.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=-0.701;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=9.755;MQ=58.93;MQRankSum=-1.255;QD=15.00;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.054;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:11,21:32:99:.:480,0,196:1,10,9,12 +chrX 3814793 . C T 808 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.89;BaseQRankSum=2.898;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=2.092;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.83;SOR=1.071;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:35,30:65:99:.:838,0,911:17,18,12,18 +chrX 3814897 . G C 445 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=8.64;BaseQRankSum=1.878;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=7.892;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=1.154;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:36,19:55:99:.:475,0,936:21,15,7,12 +chrX 3815162 . G A 711 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.23;BaseQRankSum=2.671;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.959;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.852;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:39,27:66:99:.:741,0,1037:23,16,17,10 +chrX 3815619 . AGCGGGTGCC A 1152.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.68;BaseQRankSum=0.064;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=3.114;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.703;SOR=1.112;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:44,32:76:99:.:1192,0,1708:22,22,19,13 +chrX 3815651 . G T 718 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=9.71;BaseQRankSum=2.34;DP=109;ExcessHet=0.0000;FS=1.966;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.716;SOR=1.045;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:47,30:77:99:.:748,0,1143:26,21,19,11 +chrX 3816540 . G A 412 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=11.33;BaseQRankSum=0.718;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.307;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.737;SOR=0.990;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:22,17:39:99:.:442,0,582:14,8,12,5 +chrX 3817691 . G A 678 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.61;BaseQRankSum=1.4;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.983;MQ=59.74;MQRankSum=-1.577;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.922;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:34,27:61:99:.:708,0,907:17,17,12,15 +chrX 3818448 . C T 574 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.08;BaseQRankSum=0.129;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=1.088;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.910;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:27,23:50:99:.:604,0,747:12,15,9,14 +chrX 3818892 . C CTTTTTTTTTTTTTT 394.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=14.00;BaseQRankSum=-1.819;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=1.451;MQ=59.33;MQRankSum=-1.761;QD=14.00;ReadPosRankSum=-1.907;SOR=0.957;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:19,12:31:99:.:434,0,729:10,9,5,7 +chrX 3818960 . G A 691 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=21.21;BaseQRankSum=1.356;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;MQRankSum=1.733;QD=21.21;ReadPosRankSum=-1.406;SOR=0.617;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:9,25:34:99:.:721,0,181:5,4,12,13 +chrX 3820007 . T C 1829 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.05;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.05;SOR=0.762;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,58:58:99:.:1859,174,0:0,0,28,30 +chrX 3820114 . A G 658 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.10;BaseQRankSum=-0.444;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=8.766;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.492;SOR=1.181;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 0/1:35,27:62:99:.:688,0,932:20,15,10,17 +chrX 3820463 . C T 1875 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.29;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.29;SOR=1.034;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387 1/1:0,59:59:99:.:1905,177,0:0,0,25,34 +chrX 3820546 . A AAAAAAC 3596.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=27.66;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=1.022;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1365,0:0,0,12,19 1/1:0,51:51:99:2271,153,0:0,0,23,28 +chrX 3821036 . A G 498 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.78;BaseQRankSum=1.001;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=16.312;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.356;SOR=1.191;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:29,20:49:99:.:528,0,801:20,9,7,13 +chrX 3821545 . G A 274 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=7.41;BaseQRankSum=0.073;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=1.345;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.377;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:27,14:41:99:.:304,0,746:9,18,6,8 +chrX 3821671 . ATCTAC A 770.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=18.00;BaseQRankSum=0.025;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=1.164;MQ=55.24;MQRankSum=-1.676;QD=18.00;ReadPosRankSum=-1.045;SOR=0.518;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:35:3:.:.:0,35 0|1:24,21:45:99:.:0|1:3821671_ATCTAC_A:810,0,934:3821671:16,8,13,8 +chrX 3821686 . T C 873 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=18.81;BaseQRankSum=0.387;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=1.157;MQ=54.12;MQRankSum=-2.128;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=0.419;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:35:3:.:.:0,35 0|1:24,24:48:99:.:0|1:3821671_ATCTAC_A:903,0,915:3821671:16,8,14,10 +chrX 3822734 . AGTGT A 1002.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.30;BaseQRankSum=-0.224;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=3.855;MQ=58.98;MQRankSum=-1.401;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.375;SOR=0.420;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:27,27:54:99:.:1042,0,1021:10,17,14,13 +chrX 3822870 . C CTGTG,CTGTGTGTGTG 2098.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=26,23;AS_QD=31.94,31.33;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.11;QD=43.63;SOR=0.909;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35,35 1/2:0,26,23:49:99:.:2138,962,875,1098,0,1023:0,0,27,22 +chrX 3822912 . G A 732 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=12.70;BaseQRankSum=-0.455;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=2.188;MQ=58.21;MQRankSum=-3.285;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.873;SOR=1.143;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:30,30:60:99:.:762,0,767:15,15,18,12 +chrX 3822940 . AGTGT A 1220.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=21.00;BaseQRankSum=-1.404;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.990;MQ=58.40;MQRankSum=-3.376;QD=21.00;ReadPosRankSum=0.111;SOR=0.709;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:28,32:60:99:.:1260,0,1079:15,13,15,17 +chrX 3823329 . T G 708 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.92;BaseQRankSum=1.986;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=2.316;MQ=58.30;MQRankSum=-0.809;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=0.818;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:26,27:53:99:.:738,0,628:14,12,12,15 +chrX 3825391 . C T 788 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=17.04;BaseQRankSum=-0.848;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=6.245;MQ=40.88;MQRankSum=-0.952;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.577;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:17,31:48:99:.:818,0,402:11,6,14,17 +chrX 3825532 . T C 281 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=6.91;BaseQRankSum=0.899;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=4.820;MQ=49.74;MQRankSum=-5.113;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.202;SOR=1.665;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:31,14:45:99:.:311,0,842:16,15,10,4 +chrX 3825560 . T G 1033 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=20.84;BaseQRankSum=-1.116;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=11.927;MQ=47.96;MQRankSum=5.142;QD=20.84;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.090;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:15,36:51:99:.:1063,0,352:12,3,18,18 +chrX 3825594 . T C 460 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=8.60;BaseQRankSum=-3.286;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.43;MQRankSum=-2.491;QD=8.60;ReadPosRankSum=-2.757;SOR=0.676;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:33,24:57:99:.:490,0,937:15,18,11,13 +chrX 3826402 . TA T 380.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=10.00;BaseQRankSum=0.465;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=1.204;MQ=58.53;MQRankSum=0.676;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.578;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:21,21:42:99:.:420,0,397:9,12,11,10 +chrX 3826732 . G GA 267.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=8.53;BaseQRankSum=1.465;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.21;MQRankSum=-2.254;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=0.724;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:19,17:36:99:.:307,0,354:8,11,7,10 +chrX 3826992 . A G 844 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.48;BaseQRankSum=-0.141;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=5.913;MQ=50.92;MQRankSum=-6.503;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=1.011;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:35:3:.:.:0,35 0|1:27,23:50:99:.:0|1:3826992_A_G:874,0,1034:3826992:11,16,14,9 +chrX 3827002 . G T 924 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=18.00;BaseQRankSum=-0.803;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=12.548;MQ=51.12;MQRankSum=-6.704;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.980;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:35:3:.:.:0,35 0|1:27,26:53:99:.:0|1:3826992_A_G:954,0,1025:3826992:9,18,16,10 +chrX 3827240 . CCA C 1027.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=21.78;BaseQRankSum=1.479;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=5.913;MQ=53.22;MQRankSum=-5.351;QD=21.78;ReadPosRankSum=1.358;SOR=0.923;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:22,27:49:99:.:1067,0,794:9,13,16,11 +chrX 3827279 . T C 723 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.69;BaseQRankSum=-1.298;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=9.585;MQ=48.78;MQRankSum=-2.957;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.101;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:19,29:48:99:.:753,0,469:3,16,12,17 +chrX 3827553 . A G 232 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=5.70;BaseQRankSum=1.415;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=53.83;MQRankSum=-6.115;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.838;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:35:3:0,35 0/1:34,12:46:99:.:262,0,992:13,21,4,8 +chrX 3828208 . G A 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=3.45;BaseQRankSum=1.072;DP=37;ExcessHet=0.0000;FS=2.039;MQ=55.59;MQRankSum=-4.643;QD=3.45;ReadPosRankSum=-2.545;SOR=1.538;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:35:3:.:.:0,35 0|1:28,5:33:99:.:0|1:3828208_G_A:114,0,1128:3828208:12,16,1,4 +chrX 3828212 . G T 83 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=3.53;BaseQRankSum=1.637;DP=35;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.15;MQRankSum=-4.81;QD=3.53;ReadPosRankSum=-2.909;SOR=0.776;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:35:3:.:.:0,35 0|1:27,5:32:99:.:0|1:3828208_G_A:113,0,1098:3828208:12,15,2,3 +chrX 3828517 . C T 2975 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=33.76;BaseQRankSum=3.177;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.32;MQRankSum=-0.727;QD=33.76;ReadPosRankSum=-0.45;SOR=0.557;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,26:27:99:874,0:1,0,15,11 1/1:0,62:62:99:2131,187,0:0,0,41,21 +chrX 3829044 . A G 620 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.26;BaseQRankSum=-2.06;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.087;MQ=50.32;MQRankSum=-6.014;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.914;SOR=0.961;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,438 0/1:27,26:53:99:.:650,0,768:16,11,17,9 +chrX 3829199 . G A 479 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=15.91;BaseQRankSum=0.865;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=41.07;MQRankSum=1.302;QD=15.91;ReadPosRankSum=-1.083;SOR=0.593;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,438 0/1:14,18:32:99:.:509,0,355:5,9,7,11 +chrX 3829331 . C T 715 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=14.90;BaseQRankSum=1.516;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=48.59;MQRankSum=-2.793;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.682;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,438 0/1:24,26:50:99:.:745,0,654:13,11,14,12 +chrX 3829573 . A G 392 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=32.46;DP=27;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=36.39;QD=32.46;SOR=1.179;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,13:13:99:.:422,0:0,0,8,5 0/0:.:20:25:14:0,25,367 +chrX 3830389 . C T 95 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=31.25;DP=5;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=26.51;QD=31.25;SOR=3.258;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:35:1:0,35 1/1:0,4:4:12:.:125,12,0:0,0,0,4 +chrX 3831318 . A T 245 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=7.05;BaseQRankSum=1.106;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.22;MQRankSum=-2.094;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.627;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:35:1:0,35 0/1:27,12:39:99:.:275,0,717:13,14,6,6 +chrX 3832494 . T C 422 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.02;BaseQRankSum=-1.921;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=39.44;MQRankSum=-0.767;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=0.624;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:3:35:1:0,35 0/1:22,19:41:99:.:452,0,592:10,12,9,10 +chrX 3836754 . TTTTG T 185.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=27.86;DP=6;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.00;QD=45.00;SOR=3.611;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:20:1:0,20 1/1:0,5:5:15:.:225,15,0:0,0,5,0 +chrX 3838351 . GA G 211.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=19.31;BaseQRankSum=-0.53;DP=21;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=37.09;MQRankSum=1.465;QD=19.31;ReadPosRankSum=1.593;SOR=0.446;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,11:13:99:.:251,0:2,0,8,3 0/0:.:18:21:8:0,21,223 +chrX 3838530 . C A 483 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.00;BaseQRankSum=0.709;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=10.110;MQ=32.76;MQRankSum=2.72;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.402;SOR=2.015;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:20:99:20:0,135 0/1:35,22:57:99:.:513,0,849:16,19,5,17 +chrX 3838813 . T C 184 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=30.57;DP=8;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.83;QD=30.57;SOR=4.174;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,5:5:99:154,0:0,0,5,0 1/1:0,2:2:6:60,6,0:0,0,2,0 +chrX 3843114 . C T 227 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=10.28;BaseQRankSum=-2.369;DP=29;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=42.73;MQRankSum=-0.593;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.329;SOR=0.653;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 0/1:14,11:25:99:.:257,0,400:5,9,4,7 +chrX 3843723 . G A 133 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=32.60;DP=7;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=35.71;QD=32.60;SOR=1.022;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 1/1:0,5:5:15:.:163,15,0:0,0,2,3 +chrX 3843815 . G A 119 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=29.80;DP=6;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=28.64;QD=29.80;SOR=1.981;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 1/1:0,5:5:15:.:149,15,0:0,0,4,1 +chrX 3848190 . CTGTTTT C 319.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=28.32;DP=18;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.00;QD=39.89;SOR=1.402;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,9:9:99:.:359,0:0,0,6,3 0/0:.:16:21:8:0,21,233 +chrX 3848772 . C G 30 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=30.00;DP=3;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.00;QD=30.00;SOR=2.303;VarDP=2 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 1/1:0,2:2:6:.:60,6,0:0,0,0,2 +chrX 3853313 . G A 239 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=7.08;BaseQRankSum=2.177;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=31.330;MQ=35.14;MQRankSum=1.724;QD=7.08;ReadPosRankSum=-2.094;SOR=4.973;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:20:1:0,20 0/1:27,11:38:99:.:269,0,639:16,11,0,11 +chrX 3872369 . TGTTA T 272.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=10.06;BaseQRankSum=-0.222;DP=32;ExcessHet=0.0000;FS=1.594;MQ=31.17;MQRankSum=0.082;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=0.668;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 0/1:22,9:31:99:.:312,0,897:13,9,4,5 +chrX 3875154 . A G 99 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=25.80;DP=6;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.00;QD=25.80;SOR=3.611;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 1/1:0,5:5:15:.:129,15,0:0,0,5,0 +chrX 3878518 . G A 297 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=29.73;DP=26;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.00;QD=29.73;SOR=4.977;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,11:11:99:.:327,0:0,0,0,11 0/0:.:14:21:11:0,21,315 +chrX 3878575 . T C 238 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=29.78;DP=10;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.00;QD=29.78;SOR=4.615;VarDP=9 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:2:35:1:0,35 1/1:0,9:9:27:.:268,27,0:0,0,0,9 +chrX 3882541 . G C 44 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=4.93;BaseQRankSum=1.215;DP=16;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=33.84;MQRankSum=-2.337;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.160;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 0/1:11,4:15:74:.:74,0,277:11,0,4,0 +chrX 3902294 . C T 138 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=8;AS_QD=6.22;BaseQRankSum=0.856;DP=29;ExcessHet=0.0000;FS=5.444;MQ=31.41;MQRankSum=1.741;QD=6.22;ReadPosRankSum=2.418;SOR=2.187;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB .:.:1:.:1:.:.:0,0 0|1:19,8:27:99:.:0|1:3902294_C_T:168,0,546:3902294:15,4,8,0 +chrX 3905081 . A G 232 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=10;AS_QD=10.48;BaseQRankSum=0.898;DP=25;ExcessHet=0.0000;FS=4.224;MQ=39.06;MQRankSum=-3.823;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.443;SOR=0.170;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:0:.:0:0,0 0/1:15,10:25:99:.:262,0,432:12,3,6,4 +chrX 3907200 . C G 112 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=6.45;BaseQRankSum=0.961;DP=24;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=39.51;MQRankSum=-0.559;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.664;SOR=0.157;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 0/1:16,6:22:99:.:142,0,460:0,16,0,6 +chrX 3913780 . CT C 41.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=27.00;BaseQRankSum=0;DP=4;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.00;MQRankSum=0;QD=27.00;ReadPosRankSum=0;SOR=1.179;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:4:35:1:.:.:0,35 0|1:1,2:3:36:.:0|1:3913780_CT_C:81,0,36:3913780:1,0,2,0 +chrX 3913785 . T C 51 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=2;AS_QD=27.00;BaseQRankSum=0;DP=4;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.00;MQRankSum=0;QD=27.00;ReadPosRankSum=0;SOR=1.179;VarDP=3 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:4:35:1:.:.:0,35 0|1:1,2:3:36:.:0|1:3913780_CT_C:81,0,36:3913780:1,0,2,0 +chrX 3927061 . C T 238 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=8.12;BaseQRankSum=-2.929;DP=35;ExcessHet=0.0000;FS=3.654;MQ=32.57;MQRankSum=-0.309;QD=8.12;ReadPosRankSum=-1.364;SOR=1.501;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:35:1:0,35 0/1:20,13:33:99:.:268,0,531:6,14,2,11 +chrX 3928320 . C T 97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=7.47;BaseQRankSum=0;DP=18;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=25.00;MQRankSum=0;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=0.293;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:35:1:0,35 0/1:11,6:17:99:.:127,0,276:0,11,0,6 +chrX 3933789 . T A 261 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=9.39;BaseQRankSum=1.563;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=15.375;MQ=31.12;MQRankSum=-2.836;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=2.061;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 0/1:18,13:31:99:.:291,0,462:12,6,3,10 +chrX 3937738 . T C 663 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.33;BaseQRankSum=-0.589;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.889;SOR=0.708;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 0/1:27,25:52:99:.:693,0,757:13,14,13,12 +chrX 3938153 . AGT A 335.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=10.42;BaseQRankSum=-2.574;DP=46;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.871;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:1:25:1:0,25 0/1:23,13:36:99:.:375,0,705:10,13,5,8 +chrX 3939076 . T C 2541 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.14;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.14;SOR=1.031;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1186,0:0,0,16,21 1/1:0,43:43:99:1385,129,0:0,0,30,13 +chrX 3940550 . A T 692 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.24;BaseQRankSum=-1.446;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.576;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.709;SOR=0.615;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,481 0/1:31,28:59:99:.:722,0,861:13,18,15,13 +chrX 3941333 . A AT 189.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=8.48;BaseQRankSum=-0.507;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=9.061;MQ=59.62;MQRankSum=0.497;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.297;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,481 0/1:10,17:27:99:.:229,0,109:2,8,9,8 +chrX 3942191 . A AT 196.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=7.61;BaseQRankSum=-1.346;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=19.167;MQ=59.47;MQRankSum=0;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.692;SOR=1.936;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,481 0/1:15,16:31:99:.:236,0,251:11,4,4,12 +chrX 3942659 . CTTCTTTCTTTCT CTTCTTTCT,C 879.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=18,9;AS_QD=33.32,30.80;BaseQRankSum=-0.428;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=4.929;MQ=59.75;MQRankSum=0;QD=32.82;ReadPosRankSum=-1.195;SOR=1.646;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12,0:12:99:440,0,440:0,0,3,9 1/2:1,6,9:16:99:479,286,287,171,0,418:1,0,5,10 +chrX 3945842 . A G 923 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.44;BaseQRankSum=1.176;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=0.793;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:32,34:66:99:.:953,0,854:19,13,21,13 +chrX 3948080 . A G 726 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=16.09;BaseQRankSum=-1.758;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.201;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.09;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=0.690;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:20,27:47:99:.:756,0,554:12,8,12,15 +chrX 3948694 . A C 646 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.00;BaseQRankSum=-2.073;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.415;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.00;ReadPosRankSum=-1.423;SOR=1.161;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:24,28:52:99:.:676,0,634:11,13,10,18 +chrX 3949890 . T G 299 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=10.61;BaseQRankSum=-0.752;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=3.256;MQ=55.97;MQRankSum=-4.02;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.701;SOR=1.071;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:18,13:31:99:.:329,0,498:10,8,5,8 +chrX 3950226 . AT A 46.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=3.58;BaseQRankSum=1.216;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=4.129;MQ=59.18;MQRankSum=0.733;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.095;SOR=1.571;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:17,7:24:86:.:86,0,295:8,9,5,2 +chrX 3951067 . T A 745 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.20;BaseQRankSum=-1.983;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=10.488;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.103;SOR=0.773;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:22,29:51:99:.:775,0,584:7,15,17,12 +chrX 3951468 . AT A,ATTT 479.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=24,2;AS_QD=11.04,0.00;BaseQRankSum=1.572;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.600;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90,90 0/1:23,24,2:49:99:.:519,0,573,640,584,1693:13,10,14,12 +chrX 3952378 . T C 2207 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.96;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.96;SOR=1.011;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 1/1:0,70:70:99:.:2237,210,0:0,0,40,30 +chrX 3954158 . G GA 393.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.62;BaseQRankSum=0.781;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=11.459;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.902;SOR=1.622;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:25,20:45:99:.:433,0,580:15,10,6,14 +chrX 3955114 . C CA,CAAA 284.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=10,5;AS_QD=17.05,15.50;BaseQRankSum=0.937;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;MQRankSum=-1.057;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.045;SOR=0.593;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90,90 0/1:9,10,5:24:64:.:324,0,89,107,64,466:7,2,11,4 +chrX 3955320 . A AAAAT 845.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=19.24;BaseQRankSum=0.32;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.545;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:23,23:46:99:.:885,0,852:13,10,12,11 +chrX 3957572 . CCG C 1312.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=22.92;BaseQRankSum=-2.183;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.617;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=22.92;ReadPosRankSum=-1.596;SOR=0.790;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:90:31:.:.:0,90 0|1:25,34:59:99:.:0|1:3957572_CCG_C:1352,0,937:3957572:11,14,19,15 +chrX 3957575 . T TTC 1312.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=22.92;BaseQRankSum=-1.135;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=3.617;MQ=59.70;MQRankSum=0;QD=22.92;ReadPosRankSum=-1.443;SOR=0.790;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:90:31:.:.:0,90 0|1:25,34:59:99:.:0|1:3957572_CCG_C:1352,0,937:3957572:11,14,19,15 +chrX 3958241 . TTGTG T,TTGTGTGTGTG 387.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=12,0;AS_QD=14.23,0.00;BaseQRankSum=0.065;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=8.497;MQ=59.45;MQRankSum=-0.294;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.996;SOR=1.934;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90,90 0/1:18,12,0:30:99:.:427,0,779,476,697,1162:8,10,9,3 +chrX 3958303 . A G 775 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=-1.186;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.453;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.957;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:19,33:52:99:.:805,0,476:9,10,19,14 +chrX 3958524 . T C 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=10.64;BaseQRankSum=-1.63;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.468;SOR=0.791;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:31,24:55:99:.:585,0,837:15,16,11,13 +chrX 3959269 . T C 679 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.38;BaseQRankSum=-1.022;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=5.783;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.792;SOR=1.550;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:26,27:53:99:.:709,0,705:14,12,19,8 +chrX 3960039 . G GT 844.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.37;BaseQRankSum=-1.798;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=6.042;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.223;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:26,28:54:99:.:884,0,807:20,6,17,11 +chrX 3960417 . C CT 442.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=9.09;BaseQRankSum=2.09;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.816;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:29,24:53:99:.:482,0,633:16,13,14,10 +chrX 3961515 . A T 595 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.25;BaseQRankSum=0.114;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=5.732;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.25;ReadPosRankSum=-2.312;SOR=0.551;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:27,24:51:99:.:625,0,736:10,17,13,11 +chrX 3961602 . A AACATACT 865.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=21.05;BaseQRankSum=-1.771;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.776;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:20,23:43:99:.:905,0,771:10,10,12,11 +chrX 3961644 . G A 554 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.68;BaseQRankSum=-0.671;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=5.913;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.957;SOR=1.011;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:27,23:50:99:.:584,0,749:16,11,9,14 +chrX 3962140 . A AATAAACTT 971.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=19.82;BaseQRankSum=-0.898;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=5.738;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.556;SOR=1.108;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:25,26:51:99:.:1011,0,958:11,14,16,10 +chrX 3962788 . G GA 292.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=8.74;BaseQRankSum=0.303;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=4.913;MQ=58.41;MQRankSum=1.26;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.235;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:22,16:38:99:.:332,0,532:6,16,7,9 +chrX 3963324 . G C 747 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=16.53;BaseQRankSum=-1.68;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.134;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.932;SOR=0.757;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:19,28:47:99:.:777,0,520:9,10,15,13 +chrX 3963353 . A T 777 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.16;BaseQRankSum=-0.623;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.012;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.507;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:27,30:57:99:.:807,0,738:12,15,15,15 +chrX 3963465 . G A 429 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.43;BaseQRankSum=2.282;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.186;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.43;ReadPosRankSum=2.183;SOR=0.902;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:27,17:44:99:.:459,0,736:11,16,6,11 +chrX 3963556 . CT C,CTT 111.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,10;AS_QD=0.00,5.81;BaseQRankSum=-1.344;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.987;SOR=0.593;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90,90 0/2:16,2,10:28:99:.:151,185,646,0,303,330:5,11,4,8 +chrX 3963594 . A C 144 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=6.21;BaseQRankSum=-0.964;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=12.018;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.451;SOR=3.684;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:20,8:28:99:.:174,0,591:8,12,0,8 +chrX 3963903 . G C 725 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.73;BaseQRankSum=-0.081;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=0.797;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:19,29:48:99:.:755,0,452:10,9,16,13 +chrX 3964393 . T C 669 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.98;BaseQRankSum=-0.248;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.899;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.026;SOR=0.597;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:22,28:50:99:.:699,0,576:13,9,13,15 +chrX 3965317 . C G 730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=17.67;BaseQRankSum=1.615;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=2.907;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.334;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:90:31:0,90 0/1:16,27:43:99:.:760,0,362:12,4,17,10 +chrX 3967140 . G A 733 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=30.52;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.54;QD=30.52;SOR=1.609;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:763,0:0,0,17,8 0/0:.:18:21:11:0,21,315 +chrX 3969776 . G T 991 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=13.99;BaseQRankSum=1.462;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.899;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.353;SOR=0.538;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:36,37:73:99:.:1021,0,917:22,14,21,16 +chrX 3971091 . G A 529 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.47;BaseQRankSum=2.05;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.627;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:37,22:59:99:.:559,0,923:13,24,8,14 +chrX 3971804 . C T 549 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.53;BaseQRankSum=1.427;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=7.561;MQ=58.77;MQRankSum=0.653;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.232;SOR=1.588;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:33,22:55:99:.:579,0,902:16,17,15,7 +chrX 3972813 . G T 571 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.19;BaseQRankSum=1.123;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=12.229;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.987;SOR=2.004;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:36,23:59:99:.:601,0,1004:19,17,6,17 +chrX 3973902 . G C 873 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=20.52;BaseQRankSum=-1.282;DP=46;ExcessHet=0.0000;FS=6.473;MQ=59.10;MQRankSum=-1.955;QD=20.52;ReadPosRankSum=2.292;SOR=1.322;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:16:35:1:.:.:0,35 0|1:21,23:44:99:.:0|1:3973902_G_C:903,0,802:3973902:12,9,8,15 +chrX 3973904 . C G 873 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=20.52;BaseQRankSum=-1.195;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=6.473;MQ=59.39;MQRankSum=-1.955;QD=20.52;ReadPosRankSum=2.339;SOR=1.322;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:16:35:1:.:.:0,35 0|1:21,23:44:99:.:0|1:3973902_G_C:903,0,802:3973902:12,9,8,15 +chrX 3974058 . G A 683 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.71;BaseQRankSum=-1.462;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=3.775;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.612;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:24,28:52:99:.:713,0,619:10,14,15,13 +chrX 3975230 . G A 696 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=11.90;BaseQRankSum=1.284;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=2.137;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.191;SOR=0.581;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:34,27:61:99:.:726,0,904:15,19,14,13 +chrX 3977029 . T C 952 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=15.59;BaseQRankSum=-1.479;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=8.669;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.41;SOR=1.281;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:27,36:63:99:.:982,0,714:15,12,13,23 +chrX 3977962 . C T 517 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.43;BaseQRankSum=-1.838;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=4.185;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.43;ReadPosRankSum=1.222;SOR=1.185;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:23,21:44:99:.:547,0,657:12,11,8,13 +chrX 3978818 . T TTTTCTTTCTTTC 572.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=22.67;BaseQRankSum=-0.697;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=4.075;MQ=59.86;MQRankSum=-0.754;QD=22.67;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=1.755;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:11,16:27:99:.:612,0,389:4,7,3,13 +chrX 3978867 . C CCTTT 317.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=22.31;BaseQRankSum=1.009;DP=31;ExcessHet=0.0000;FS=2.596;MQ=59.15;MQRankSum=0.776;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.31;SOR=1.802;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:7,9:16:99:.:357,0,267:2,5,1,8 +chrX 3978950 . CTTCTTTCTTT C 406.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=15.93;BaseQRankSum=-0.523;DP=37;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.50;MQRankSum=0;QD=15.93;ReadPosRankSum=1.827;SOR=0.495;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:16,12:28:99:.:446,0,579:7,9,6,6 +chrX 3980079 . G A 742 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.57;BaseQRankSum=-0.698;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.027;SOR=0.724;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:25,28:53:99:.:772,0,687:10,15,11,17 +chrX 3980604 . A T 1223 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=21.60;BaseQRankSum=0.069;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=9.553;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.954;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:16:35:1:.:.:0,35 0|1:25,33:58:99:.:0|1:3980604_A_T:1253,0,896:3980604:9,16,20,13 +chrX 3980605 . A T 1223 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=21.60;BaseQRankSum=0.141;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=9.553;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=0.954;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:16:35:1:.:.:0,35 0|1:25,33:58:99:.:0|1:3980604_A_T:1253,0,896:3980604:9,16,20,13 +chrX 3981498 . AT A 56.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=3.31;BaseQRankSum=0;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.36;MQRankSum=0;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.03;SOR=0.903;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:20,9:29:96:.:96,0,300:8,12,3,6 +chrX 3982432 . G A 681 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.66;BaseQRankSum=-0.326;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.968;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=0.551;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:33,28:61:99:.:711,0,900:14,19,13,15 +chrX 3985618 . G A 827 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.04;BaseQRankSum=0.659;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=3.654;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.258;SOR=0.953;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:26,31:57:99:.:857,0,692:12,14,18,13 +chrX 3986368 . T A 745 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.20;BaseQRankSum=2.2;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.453;SOR=0.748;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:24,27:51:99:.:775,0,621:11,13,12,15 +chrX 3987609 . G A 637 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=13.61;BaseQRankSum=-1.353;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=2.463;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.95;SOR=0.374;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:24,25:49:99:.:667,0,675:9,15,12,13 +chrX 3987625 . A AT 280.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=9.70;BaseQRankSum=-1.35;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=10.736;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.70;ReadPosRankSum=-2.811;SOR=1.629;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:16,17:33:99:.:320,0,315:6,10,12,5 +chrX 3988507 . A G 446 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.92;BaseQRankSum=-3.449;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=10.982;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=1.358;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:27,21:48:99:.:476,0,795:10,17,14,7 +chrX 3991969 . T C 627 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=9.52;BaseQRankSum=1.226;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=3.489;MQ=59.78;MQRankSum=0.808;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.768;SOR=0.368;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:43,26:69:99:.:657,0,1152:29,14,15,11 +chrX 3993048 . C T 424 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=13.35;BaseQRankSum=1.396;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=5.368;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.35;ReadPosRankSum=0;SOR=0.169;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:18,16:34:99:.:454,0,503:5,13,8,8 +chrX 3993155 . A G 421 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=12.89;BaseQRankSum=0.975;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=5.023;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.441;SOR=1.109;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:19,16:35:99:.:451,0,545:8,11,10,6 +chrX 3993750 . G T 510 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.00;BaseQRankSum=0.601;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=1.143;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.495;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:25,20:45:99:.:540,0,692:11,14,10,10 +chrX 3994767 . A G 538 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=9.96;BaseQRankSum=-3.146;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=5.333;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.384;SOR=0.719;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:32,25:57:99:.:568,0,942:19,13,11,14 +chrX 3995036 . TTATTATATTATCATATAATATAATATATTCTATATTATATTATTATATAATATAATATATTCTATATTATATTATTATATAATATAATATATTCTATATTATATTATTATATAATATAATATATTCTATATTATATTATTATATAATATAATATATTCTA T 136.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=4.40;BaseQRankSum=-0.965;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=1.382;MQ=56.97;MQRankSum=1.476;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.434;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:35:1:0,35 0/1:29,11:40:99:.:176,0,910:11,18,5,6 +chrX 3995981 . ATATAATATATATTCTATATTATAT A 85.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=25.00;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=3.979;MQ=42.60;MQRankSum=-1.645;QD=25.00;SOR=0.859;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:11:70:11:.:.:0,70 0|1:2,3:5:70:.:0|1:3995981_ATATAATATATATTCTATATTATAT_A:125,0,70:3995981:2,0,1,2 +chrX 3996013 . T TA 50.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=11.25;BaseQRankSum=0;DP=18;ExcessHet=0.0000;FS=7.068;MQ=33.68;MQRankSum=-0.39;QD=11.25;ReadPosRankSum=2.369;SOR=0.610;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,5:8:90:.:90,0:3,0,2,3 0/0:.:7:21:7:0,21,223 +chrX 3996015 . T TATAA 50.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=11.25;BaseQRankSum=0;DP=16;ExcessHet=0.0000;FS=7.068;MQ=32.65;MQRankSum=-0.39;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.93;SOR=0.610;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,5:8:90:.:90,0:3,0,2,3 0/0:.:7:21:7:0,21,223 +chrX 3996048 . C A 84 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=16.29;BaseQRankSum=0;DP=15;ExcessHet=0.0000;FS=8.451;MQ=46.07;MQRankSum=-1.902;QD=16.29;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.829;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:7:99:7:.:.:0,104 0|1:4,3:7:99:.:0|1:3995981_ATATAATATATATTCTATATTATAT_A:114,0,137:3995981:4,0,1,2 +chrX 3996087 . ATATAATATATATTCTATATTATATTATAATATAATATATATTCTATATTATAT A 85.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=17.86;DP=18;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=45.82;MQRankSum=1.902;QD=17.86;SOR=1.022;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,4:7:99:.:125,0:2,1,3,1 0/0:.:5:12:5:0,12,109 +chrX 3996292 . C CCTATATTCTATATAATATATAATATATT 1697.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=29.85;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.90;QD=43.43;SOR=1.788;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:749,0:0,0,12,5 1/1:0,23:23:67:988,67,0:0,0,16,7 +chrX 3996849 . A T 31 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=4;AS_QD=2.03;BaseQRankSum=0.996;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.07;MQRankSum=0.588;QD=2.03;ReadPosRankSum=0.17;SOR=0.368;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,129 0|1:26,4:30:61:.:0|1:3996815_T_TATTAC:61,0,1073:3996815:5,8,1,1 +chrX 3997348 . C T 771 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.04;BaseQRankSum=0.984;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=6.094;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.04;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=1.034;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:19,28:47:99:.:801,0,479:8,11,17,11 +chrX 3997378 . C T 563 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.46;BaseQRankSum=2.508;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=6.684;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.46;ReadPosRankSum=2.289;SOR=0.850;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:19,22:41:99:.:593,0,418:7,12,13,9 +chrX 3997391 . CA C 283.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=10.09;BaseQRankSum=2.509;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=14.955;MQ=59.94;MQRankSum=1.063;QD=10.09;ReadPosRankSum=2.836;SOR=1.947;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:16,16:32:99:.:323,0,315:5,11,12,4 +chrX 3997460 . T C 638 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.90;BaseQRankSum=-0.792;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.203;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.495;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:16,26:42:99:.:668,0,385:9,7,13,13 +chrX 3997656 . A G 822 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.78;BaseQRankSum=-1.766;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.846;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:21,33:54:99:.:852,0,518:12,9,20,13 +chrX 3997877 . G A 1052 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=15.91;BaseQRankSum=1.18;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.656;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:28,40:68:99:.:1082,0,651:15,13,21,19 +chrX 3999442 . A T 706 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.73;BaseQRankSum=1.303;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.8;SOR=0.693;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:18,26:44:99:.:736,0,453:9,9,13,13 +chrX 3999948 . A G 699 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=11.39;BaseQRankSum=-1.036;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=6.801;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.417;SOR=0.868;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:35,29:64:99:.:729,0,975:21,14,12,17 +chrX 4000734 . C T 434 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=11.90;BaseQRankSum=0.834;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=16.958;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.90;ReadPosRankSum=2.297;SOR=2.679;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:22,17:39:99:.:464,0,599:9,13,14,3 +chrX 4000751 . A AAC 286.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=15.52;BaseQRankSum=0.098;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.971;MQ=59.61;MQRankSum=-0.527;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.479;SOR=0.486;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:6,15:21:99:.:326,0,102:2,4,8,7 +chrX 4004449 . A C 518 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=11.18;BaseQRankSum=0.294;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.007;SOR=0.818;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:29,20:49:99:.:548,0,838:15,14,11,9 +chrX 4004776 . G C 910 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.49;BaseQRankSum=0.808;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.316;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.356;SOR=1.133;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:24,33:57:99:.:940,0,632:11,13,12,21 +chrX 4004915 . A G 513 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.92;BaseQRankSum=2.328;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=2.780;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.905;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:20,19:39:99:.:543,0,527:9,11,11,8 +chrX 4006270 . T G 972 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.28;BaseQRankSum=1.395;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.277;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.28;ReadPosRankSum=-1.88;SOR=0.624;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:23,35:58:99:.:1002,0,565:10,13,18,16 +chrX 4006742 . A G 473 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=9.31;BaseQRankSum=0.012;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.492;SOR=0.560;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:33,21:54:99:.:503,0,890:13,20,9,12 +chrX 4007503 . A G 687 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.79;BaseQRankSum=-1.114;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=7.660;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.335;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:25,27:52:99:.:717,0,693:17,8,13,14 +chrX 4008082 . T TTTATTTTATTTATA 1107.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=18.21;BaseQRankSum=-0.296;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=6.768;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.491;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:33,30:63:99:.:1147,0,1284:12,21,16,14 +chrX 4012738 . T C 550 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=14.50;BaseQRankSum=-0.429;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.898;SOR=0.838;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:18,22:40:99:.:580,0,461:8,10,9,13 +chrX 4013775 . T C 850 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.92;BaseQRankSum=-0.354;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.809;SOR=0.752;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:26,33:59:99:.:880,0,666:13,13,17,16 +chrX 4013986 . A G 985 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=17.81;BaseQRankSum=0.247;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.326;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.81;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.721;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,129 0/1:20,37:57:99:.:1015,0,464:11,9,17,20 +chrX 4014815 . GT G,TT 1530 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=40,23;AS_QD=19.48,22.59;BaseQRankSum=2.066;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=5.400;MQ=59.78;MQRankSum=2.711;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.097;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,20,0:23:99:462,0,506:3,0,16,4 1/2:1,20,23:44:99:1098,703,859,488,0,847:1,0,23,20 +chrX 4016714 . A G 576 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.88;BaseQRankSum=-0.527;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.121;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.876;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:27,24:51:99:.:606,0,721:9,18,7,17 +chrX 4017039 . G A 181 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=5.41;BaseQRankSum=1.249;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.631;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:29,10:39:99:.:211,0,756:15,14,5,5 +chrX 4022031 . A T 814 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.40;BaseQRankSum=-0.425;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.954;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.652;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:32,31:63:99:.:844,0,873:15,17,16,15 +chrX 4024006 . G GA 867.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.64;BaseQRankSum=-0.063;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.286;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=1.040;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:20,38:58:99:.:907,0,402:10,10,22,16 +chrX 4024643 . C T 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=14.51;BaseQRankSum=-0.352;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.472;SOR=0.774;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:25,28:53:99:.:769,0,690:12,13,15,13 +chrX 4027071 . A G 556 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.72;BaseQRankSum=-2.783;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.113;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.72;ReadPosRankSum=-2.152;SOR=0.473;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:27,23:50:99:.:586,0,788:10,17,10,13 +chrX 4027291 . C T 929 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.82;BaseQRankSum=0.691;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.238;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.016;SOR=0.882;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:23,34:57:99:.:959,0,577:11,12,19,15 +chrX 4028001 . A G 592 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.69;BaseQRankSum=-0.592;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.018;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.694;SOR=0.465;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:26,23:49:99:.:622,0,736:10,16,12,11 +chrX 4028724 . C CAG 1018.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=22.04;BaseQRankSum=0.399;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.415;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.554;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:21,27:48:99:.:1058,0,790:9,12,14,13 +chrX 4029603 . A G 891 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=17.71;BaseQRankSum=0;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.477;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.846;SOR=0.679;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:19,33:52:99:.:921,0,464:11,8,15,18 +chrX 4029643 . T C 874 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=16.14;BaseQRankSum=-1.849;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.053;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.493;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:22,34:56:99:.:904,0,598:13,9,18,16 +chrX 4029668 . C G 952 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=16.93;BaseQRankSum=-0.891;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=5.482;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.358;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:23,35:58:99:.:982,0,605:15,8,17,18 +chrX 4029803 . G A 619 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.45;BaseQRankSum=-0.874;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=2.735;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=1.270;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:18,24:42:99:.:649,0,449:9,9,9,15 +chrX 4029899 . G A 714 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=15.83;BaseQRankSum=1.642;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.110;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.182;SOR=0.881;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:21,26:47:99:.:744,0,489:9,12,10,16 +chrX 4030015 . C CA 494.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=17.23;BaseQRankSum=0.046;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=3.256;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.147;SOR=1.426;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,403 0|1:15,16:31:99:.:1|0:4030013_G_A:534,0,512:4030013:8,7,11,5 +chrX 4030031 . C A 557 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=16.77;BaseQRankSum=1.132;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=3.110;MQ=59.56;MQRankSum=-0.915;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=1.356;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,403 0|1:17,18:35:99:.:1|0:4030013_G_A:587,0,567:4030013:10,7,13,5 +chrX 4030284 . A G 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.20;BaseQRankSum=0.809;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.145;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.757;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:24,22:46:99:.:607,0,641:13,11,10,12 +chrX 4030460 . G GAGT 877.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.98;BaseQRankSum=-2.09;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=0.628;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:29,25:54:99:.:917,0,1133:10,19,9,16 +chrX 4030512 . C G 898 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=15.21;BaseQRankSum=-0.629;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=2.281;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.394;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:26,35:61:99:.:928,0,671:8,18,14,21 +chrX 4030739 . A G 552 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.88;BaseQRankSum=-2.12;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.229;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.61;SOR=0.434;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:24,25:49:99:.:582,0,668:18,6,17,8 +chrX 4031171 . T C 796 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.02;BaseQRankSum=-1.377;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.258;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.212;SOR=0.446;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,403 0/1:23,32:55:99:.:826,0,605:14,9,17,15 +chrX 4031729 . CTCTATCTATCTA C 1695.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=23.73;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=44.49;SOR=0.968;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:497,0:0,0,5,6 1/1:0,28:28:86:1238,86,0:0,0,17,11 +chrX 4032456 . T TTATC 722.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=17.32;BaseQRankSum=-0.219;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=4.452;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.247;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:24,20:44:99:.:762,0,926:16,8,10,10 +chrX 4032459 . T TCTATTAG 873.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=19.02;BaseQRankSum=1.011;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=4.201;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.02;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=1.519;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:24,24:48:99:.:913,0,926:12,12,16,8 +chrX 4032517 . C T 595 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.50;BaseQRankSum=2.646;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=17.512;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.574;SOR=2.826;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:27,23:50:99:.:625,0,673:13,14,19,4 +chrX 4032682 . G A 856 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=14.52;BaseQRankSum=2.836;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.616;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:30,31:61:99:.:886,0,723:11,19,12,19 +chrX 4033459 . T C 869 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=15.24;BaseQRankSum=0.598;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=9.192;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.903;SOR=1.034;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:28,31:59:99:.:899,0,776:17,11,12,19 +chrX 4033752 . T TTGTGTG 607.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.78;BaseQRankSum=-0.316;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;MQRankSum=0;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.732;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:17,24:41:99:.:647,0,585:5,12,7,17 +chrX 4034054 . T C 601 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=-1.41;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=4.288;MQ=59.67;MQRankSum=-0.85;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.714;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:20,25:45:99:.:631,0,520:12,8,11,14 +chrX 4034088 . A G 676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.35;BaseQRankSum=-1.335;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;MQRankSum=-0.795;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.812;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:19,27:46:99:.:706,0,512:9,10,12,15 +chrX 4034251 . C A 600 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.13;BaseQRankSum=-1.62;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=5.864;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.737;SOR=0.657;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:21,27:48:99:.:630,0,537:13,8,12,15 +chrX 4034431 . C T 558 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.34;BaseQRankSum=0.203;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=15.287;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=1.570;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:18,23:41:99:.:588,0,424:6,12,16,7 +chrX 4034466 . AT A 389.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=13.00;BaseQRankSum=1.321;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=11.832;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.58;SOR=1.711;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:12,21:33:99:.:429,0,196:4,8,15,6 +chrX 4034628 . C T 811 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=17.89;BaseQRankSum=-0.565;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.622;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.89;ReadPosRankSum=2.078;SOR=0.376;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:16,31:47:99:.:841,0,385:10,6,16,15 +chrX 4034801 . C T 810 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.77;BaseQRankSum=1.771;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.971;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.775;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:31,30:61:99:.:840,0,809:15,16,16,14 +chrX 4035182 . A G 662 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.12;BaseQRankSum=-1.709;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.022;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.961;SOR=0.742;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:24,25:49:99:.:692,0,687:14,10,11,14 +chrX 4035289 . G C 599 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.98;BaseQRankSum=2.315;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=2.550;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=0.700;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:23,22:45:99:.:629,0,614:10,13,12,10 +chrX 4035909 . G A 624 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.82;BaseQRankSum=0.628;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.083;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.811;SOR=0.503;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:26,25:51:99:.:654,0,676:10,16,11,14 +chrX 4035949 . GC G 778.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=17.40;BaseQRankSum=0.465;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=6.219;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.480;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:21,26:47:99:.:818,0,624:7,14,14,12 +chrX 4036098 . G T 757 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.57;BaseQRankSum=-1.008;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.064;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=0.914;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:24,30:54:99:.:787,0,617:10,14,11,19 +chrX 4036536 . A T 779 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.26;BaseQRankSum=-0.475;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=6.435;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.219;SOR=1.128;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:35,31:66:99:.:809,0,942:19,16,12,19 +chrX 4036931 . C T 751 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.70;BaseQRankSum=-0.02;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.648;SOR=0.627;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:27,30:57:99:.:781,0,686:14,13,15,15 +chrX 4037247 . T C 606 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.83;BaseQRankSum=-0.957;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=6.267;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.661;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:23,23:46:99:.:636,0,661:15,8,10,13 +chrX 4037616 . G C 427 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.52;BaseQRankSum=-0.587;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.541;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.833;SOR=0.549;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:29,19:48:99:.:457,0,819:17,12,9,10 +chrX 4038125 . C T 815 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=10.56;BaseQRankSum=1.745;DP=112;ExcessHet=0.0000;FS=0.870;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=0.513;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:47,33:80:99:.:845,0,1223:28,19,18,15 +chrX 4038899 . G A 456 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=10.57;BaseQRankSum=-0.438;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.177;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.687;SOR=1.002;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:28,18:46:99:.:486,0,815:15,13,11,7 +chrX 4039869 . GGTA G 909.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.25;BaseQRankSum=-0.775;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.783;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.262;SOR=1.063;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:30,25:55:99:.:949,0,1152:16,14,10,15 +chrX 4040175 . T C 535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.77;BaseQRankSum=-0.304;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=5.874;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=1.261;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,360 0/1:26,22:48:99:.:565,0,720:14,12,8,14 +chrX 4040277 . C CAT,CATATAT 1284.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=27,11;AS_QD=16.67,9.12;BaseQRankSum=1.495;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=4.842;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.47;ReadPosRankSum=1.733;SOR=1.304;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,27,0:28:99:.:.:950,0,988:.:0,1,18,9 0|2:29,0,11:40:99:0|1:4040277_C_CATATAT:374,462,1659,0,1197,1164:4040277:16,13,7,4 +chrX 4040296 . G A 426 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=14;AS_QD=10.36;BaseQRankSum=2.163;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.935;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.454;SOR=1.368;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,640 0|1:30,14:44:99:.:0|1:4040277_C_CATATAT:456,0,1187:4040277:17,13,10,4 +chrX 4040996 . G A 719 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.87;BaseQRankSum=2.201;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.828;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.87;ReadPosRankSum=-1.177;SOR=0.981;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,640 0/1:27,27:54:99:.:749,0,692:12,15,16,11 +chrX 4041190 . G C 2440 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.93;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.93;SOR=1.240;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:967,0:0,0,11,20 1/1:0,44:44:99:1503,132,0:0,0,18,26 +chrX 4054091 . G T 803 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=13.22;BaseQRankSum=1.372;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=5.005;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.22;SOR=0.299;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,522 0/1:33,30:63:99:.:833,0,898:12,21,15,15 +chrX 4054640 . T A 105 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=2.65;BaseQRankSum=0.429;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;MQRankSum=0.514;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.618;SOR=0.892;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,522 0/1:42,9:51:99:.:135,0,1223:21,21,5,4 +chrX 4055949 . CCACA C,CCA 880.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=14,15;AS_QD=20.90,10.47;BaseQRankSum=0.945;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;MQRankSum=0;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.747;SOR=0.544;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,0:14:99:606,0,606:0,0,6,8 0/2:15,0,15:30:99:314,359,710,0,351,306:6,9,7,8 +chrX 4061196 . G GTCTA 616.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=22.62;BaseQRankSum=0;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.485;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.111;SOR=0.586;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,360 0/1:12,17:29:99:.:656,0,433:7,5,8,9 +chrX 4062425 . C T 207 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=5.27;BaseQRankSum=0.267;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=7.817;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=1.741;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,360 0/1:34,11:45:99:.:237,0,1007:19,15,3,8 +chrX 4067335 . CT C 505.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=23.76;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.07;QD=41.92;SOR=3.767;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:99:28:.:.:0,360 1|1:0,13:13:39:.:0|1:4067335_CT_C:545,39,0:4067335:0,0,1,12 +chrX 4067336 . TTTTCTTTCTTTC T,* 651.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=16,0;AS_QD=31.60,34.56;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.19;SOR=3.841;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16,0:16:99:.:.:691,0,691:.:0,0,2,14 2|2:0,0,13:13:39:0|1:4067335_CT_C:545,547,548,39,40,0:4067335:0,0,1,12 +chrX 4067344 . C *,CT 520.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,6;AS_QD=0.00,28.66;BaseQRankSum=-0.097;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.49;MQRankSum=0;QD=43.08;ReadPosRankSum=1.485;SOR=1.609;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16,0:16:99:.:.:691,0,691:.:0,0,2,14 0|2:7,0,6:13:99:0|1:4067335_CT_C:560,240,681,0,261,426:4067335:1,6,0,6 +chrX 4067345 . TTTC *,T 364.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,7;AS_QD=0.00,18.36;BaseQRankSum=-0.424;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.48;MQRankSum=0;QD=18.36;ReadPosRankSum=0;SOR=0.399;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16,0:16:99:.:.:691,0,691:.:0,0,2,14 0|2:15,0,7:22:99:1|0:4067335_CT_C:404,279,1043,0,623,594:4067335:1,14,1,6 +chrX 4070604 . A G 739 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=32.04;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.04;SOR=0.859;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:769,0:0,0,11,13 0/0:.:57:64:57:0,64,794 +chrX 4077443 . G A 81 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=2.41;BaseQRankSum=-0.141;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.570;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.044;SOR=1.536;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:59:28:0,59 0/1:38,8:46:99:.:111,0,1018:21,17,6,2 +chrX 4082093 . C CA 296.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=11.59;BaseQRankSum=0.066;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=7.367;MQ=59.19;MQRankSum=-0.674;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.941;SOR=0.251;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:59:28:0,59 0/1:6,23:29:35:.:336,0,35:5,1,11,12 +chrX 4086288 . G GT 263.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=7.97;BaseQRankSum=0.471;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=2.895;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.499;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:59:28:.:.:0,59 0|1:21,17:38:99:.:0|1:4086288_G_GT:303,0,420:4086288:13,8,8,9 +chrX 4086485 . C T 3447 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=33.11;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.11;SOR=0.833;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1494,0:0,0,25,20 1/1:0,60:60:99:1983,180,0:0,0,31,29 +chrX 4090557 . A AAACAAC 998.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=23.59;BaseQRankSum=-0.733;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.661;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.59;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=1.220;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,264 0/1:18,26:44:99:.:1038,0,621:9,9,16,10 +chrX 4091446 . A G 645 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.06;BaseQRankSum=-1.08;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=6.171;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.723;SOR=1.579;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,264 0/1:23,25:48:99:.:675,0,635:11,12,17,8 +chrX 4094421 . GA G 150.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=15.83;BaseQRankSum=-0.874;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=3.424;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.728;VarDP=12 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,10:12:99:.:190,0:0,2,6,4 0/0:.:55:0:55:0,0,1305 +chrX 4096913 . CA C 224.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=7.76;BaseQRankSum=0;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=50.255;MQ=58.44;MQRankSum=0;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.319;SOR=4.504;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,6:9:76:76,0:1,2,5,1 0/1:12,13:25:99:188,0,139:2,10,13,0 +chrX 4099280 . G GTATC 887.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=29.70;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=1.508;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:927,0:0,0,14,7 0/0:.:55:54:55:0,54,1195 +chrX 4102689 . G A 2276 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=33.42;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=1.054;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13:13:99:419,0:0,0,7,6 1/1:0,56:56:99:1887,168,0:0,0,33,23 +chrX 4109642 . CTGTGTGTGTG C,CTGTGTGTGTGTG 2055.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=31,27;AS_QD=29.70,16.26;BaseQRankSum=2.104;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=4.027;MQ=59.55;MQRankSum=-0.722;QD=28.31;ReadPosRankSum=0.39;SOR=0.956;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31,0:31:99:1396,0,1396:0,0,17,14 0/2:16,0,27:43:99:699,747,1191,0,444,363:7,9,17,10 +chrX 4112015 . AAGAG A 650.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=24.64;BaseQRankSum=0.332;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=5.946;MQ=59.58;MQRankSum=-0.671;QD=24.64;ReadPosRankSum=1.261;SOR=0.556;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:33:21:0,33 0/1:10,18:28:99:.:690,0,319:7,3,8,10 +chrX 4115756 . A AT 252.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=9.73;BaseQRankSum=0.647;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=5.905;MQ=59.17;MQRankSum=-0.692;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.56;SOR=1.109;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:33:21:0,33 0/1:11,19:30:99:.:292,0,161:4,7,12,7 +chrX 4117348 . A G 593 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.26;BaseQRankSum=-0.049;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=1.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.794;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:33:21:0,33 0/1:23,24:47:99:.:623,0,619:11,12,13,11 +chrX 4117929 . T TTTTATTTA,TTTTA 1574.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=24,16;AS_QD=20.37,13.37;BaseQRankSum=0.689;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.939;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=24.09;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.733;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24,0:24:99:1039,0,1040:0,0,10,14 0/2:27,0,16:43:99:575,657,1787,0,1130,1082:14,13,9,7 +chrX 4119179 . T TCCC 174.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=33.09;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.80;SOR=3.611;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:99:32:.:.:0,139 1|1:0,5:5:15:.:0|1:4119179_T_TCCC:214,15,0:4119179:0,0,0,5 +chrX 4119197 . TTTCC T,CTTCC 407 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,5;AS_QD=31.03,29.94;DP=18;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.81;QD=72.83;SOR=3.912;VarDP=6 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,1,0:1:43:43,0,45:0,0,0,1 2/2:0,0,5:5:20:394,234,314,27,20,0:0,0,0,5 +chrX 4119201 . C *,CTTCCTTCT 354.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,5;AS_QD=25.36,28.81;DP=18;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=78.80;SOR=3.912;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,1,0:1:43:.:.:43,0,45:.:0,0,0,1 2|2:0,0,5:5:20:0|1:4119179_T_TCCC:394,234,314,27,20,0:4119179:0,0,0,5 +chrX 4119769 . G A 2282 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=31.67;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.67;SOR=0.720;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:724,0:0,0,14,10 1/1:0,49:49:99:1588,147,0:0,0,22,27 +chrX 4120022 . C CATCT,CATCTATCT 1797.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=23,25;AS_QD=18.80,17.96;BaseQRankSum=-0.158;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=3.431;MQ=59.80;MQRankSum=0;QD=24.82;ReadPosRankSum=0.437;SOR=0.356;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23,0:24:99:921,0,954:1,0,16,7 0/2:25,0,25:50:99:916,992,1973,0,980,905:17,8,12,13 +chrX 4120397 . T C 486 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.92;BaseQRankSum=-0.055;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.514;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=0.357;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,180 0/1:32,20:52:99:.:516,0,920:11,21,9,11 +chrX 4120735 . A T 98 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=5.33;BaseQRankSum=-1.496;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=1.935;MQ=55.79;MQRankSum=0.208;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.119;SOR=1.238;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,180 0/1:18,6:24:99:.:128,0,617:8,10,4,2 +chrX 4120737 . AT ATTTT,ATATTTT,A,ATTTTTT 334.97 . AC=0,1,0,1;AF=0.00,0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,2,0,8;AS_QD=4.27,14.23,0.00,9.95;BaseQRankSum=-0.627;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.58;MQRankSum=-0.715;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.892;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,2,0,0:2:99:185,138,0,162,162:0,0,2,0 0/4:11,0,0,0,8:19:99:189,247,803,247,803,803,232,731,731,728,0,557,557,462,611:6,5,4,4 +chrX 4120738 . T *,TATATA 72.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,7;AS_QD=0.00,7.47;BaseQRankSum=0.135;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.94;MQRankSum=0.045;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.555;SOR=0.941;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:99:16:0,174,174 0/2:8,0,7:15:99:.:112,135,752,0,294,286:4,4,3,4 +chrX 4121350 . A AT,ATT 1262.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=52,3;AS_QD=24.57,0.00;BaseQRankSum=-0.648;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.56;MQRankSum=0;QD=23.25;ReadPosRankSum=-1.64;SOR=0.269;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,15,3:18:99:.:.:457,0,587:.:0,0,7,11 1|1:1,37,0:38:90:0|1:4121350_A_AT:845,90,0,848,109,867:4121350:0,1,19,18 +chrX 4121694 . TTTTC T 1364.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=20.65;BaseQRankSum=0.377;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=19.568;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.65;ReadPosRankSum=-3.137;SOR=1.809;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:912,0:0,0,6,15 0/1:26,21:47:99:492,0,989:16,10,6,15 +chrX 4121789 . C CTTCT,CTTCTTTCTTTCTTTCT 1517.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=11,24;AS_QD=27.50,27.22;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.68;QD=44.49;SOR=1.308;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,0:11:99:478,0,479:0,0,6,5 2/2:0,0,24:24:72:1079,1080,1080,72,72,0:0,0,7,17 +chrX 4121854 . C CCCTT 235.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=27.50;BaseQRankSum=0.126;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=6.990;MQ=57.09;MQRankSum=-0.385;QD=27.50;ReadPosRankSum=0.674;SOR=3.020;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,9:10:99:.:275,0:1,0,1,8 0/0:.:31:14:31:0,14,127 +chrX 4121900 . CT C 221.97 . AC=1;AF=0.500;AN=2;AS_AltDP=7;AS_QD=23.73;BaseQRankSum=-1.282;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=44.84;MQRankSum=0.253;QD=23.73;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.609;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB .:.:19:.:19:0,0 0/1:4,7:11:99:.:261,0,111:2,2,0,1 +chrX 4121904 . CTTTCTTTCTTTCTTT *,C,CCTTT,CCTTTCTTTCTTT 174.97 . AC=0,1,0,0;AF=0.00,0.333,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,0,0,0;AS_QD=26.02,26.60,30.44,29.81;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.12;QD=42.80;SOR=0.446;VarDP=5 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:90:30:0,90,90,90,90 0/2:5,0,0,0,0:5:16:.:214,36,764,0,323,695,16,487,613,862,241,319,278,195,513:2,3,0,0 +chrX 4121923 . T C 192 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=9.65;BaseQRankSum=-1.822;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=46.40;MQRankSum=-0.55;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.306;SOR=1.270;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:90:30:0,90 0/1:16,7:23:99:.:222,0,616:7,9,0,1 +chrX 4123250 . G A 857 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=15.56;BaseQRankSum=2.038;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.032;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.137;SOR=0.534;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:90:30:0,90 0/1:25,32:57:99:.:887,0,593:16,9,19,13 +chrX 4123615 . T A 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=14.80;BaseQRankSum=1.503;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=4.506;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.774;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:90:30:0,90 0/1:20,21:41:99:.:607,0,552:12,8,9,12 +chrX 4124651 . T C 3408 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=105;AS_QD=32.74;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.74;SOR=1.064;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1101,0:0,0,17,15 1/1:0,73:73:99:2337,219,0:0,0,44,29 +chrX 4126026 . G A 2755 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=33.55;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.55;SOR=1.112;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:819,0:0,0,12,13 1/1:0,58:58:99:1966,174,0:0,0,37,21 +chrX 4126778 . A G 3196 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=32.92;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.92;SOR=0.963;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1028,0:0,0,17,14 1/1:0,67:67:99:2198,201,0:0,0,38,29 +chrX 4127073 . T C 3243 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=101;AS_QD=32.41;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.41;SOR=0.839;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1201,0:0,0,16,21 1/1:0,64:64:99:2072,192,0:0,0,31,33 +chrX 4127323 . T C 2634 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.49;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=0.846;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1000,0:0,0,12,18 1/1:0,52:52:99:1664,155,0:0,0,32,20 +chrX 4127524 . C T 3103 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=31.33;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.33;SOR=0.818;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1310,0:0,0,23,17 1/1:0,60:60:99:1823,178,0:0,0,30,30 +chrX 4127656 . T G 2526 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.35;BaseQRankSum=4.241;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.35;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.887;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,36:38:99:1182,0:1,1,17,19 1/1:0,41:41:99:1374,123,0:0,0,18,23 +chrX 4128090 . T C 2696 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=30.63;BaseQRankSum=-0.602;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.63;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.283;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:982,0:0,0,14,17 1/1:1,57:58:99:1744,139,0:0,1,27,30 +chrX 4128158 . T C 2901 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.52;BaseQRankSum=-0.532;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=31.52;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.301;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:947,0:0,0,14,14 1/1:1,64:65:99:1984,159,0:0,1,28,36 +chrX 4128535 . C T 3409 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.40;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.99;SOR=1.165;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33:33:99:.:.:1387,0:.:0,0,19,14 1|1:0,47:47:99:0|1:4128535_C_T:2052,141,0:4128535:0,0,29,18 +chrX 4128557 . T C 3752 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=31.85;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.02;SOR=1.364;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33:33:99:.:.:1382,0:.:0,0,20,13 1|1:0,57:57:99:0|1:4128535_C_T:2400,172,0:4128535:0,0,37,20 +chrX 4129078 . C T 2884 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=33.11;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.11;SOR=0.786;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1162,0:0,0,14,20 1/1:0,54:54:99:1752,162,0:0,0,28,26 +chrX 4129204 . T C 2351 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.75;BaseQRankSum=1.945;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=3.436;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.75;ReadPosRankSum=0.866;SOR=0.574;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:878,0:0,0,11,16 1/1:1,47:48:99:1503,119,0:1,0,22,25 +chrX 4129252 . A T 2178 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.47;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=1.022;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:809,0:0,0,16,8 1/1:0,44:44:99:1399,132,0:0,0,23,21 +chrX 4129499 . T A 2620 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.13;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.13;SOR=1.096;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:923,0:0,0,15,13 1/1:0,52:52:99:1727,156,0:0,0,32,20 +chrX 4129711 . C G 3058 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=33.57;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.57;SOR=0.782;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:854,0:0,0,11,15 1/1:0,66:66:99:2234,199,0:0,0,33,33 +chrX 4129968 . A G 2931 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.54;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=0.906;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1062,0:0,0,13,21 1/1:0,57:57:99:1899,171,0:0,0,28,29 +chrX 4130016 . A G 2445 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.14;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.14;SOR=1.150;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:749,0:0,0,10,13 1/1:0,54:54:99:1726,161,0:0,0,21,33 +chrX 4130397 . C G 3493 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=30.32;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.59;SOR=1.207;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1159,0:.:0,0,20,6 1|1:0,53:53:99:0|1:4130397_C_G:2364,160,0:4130397:0,0,28,25 +chrX 4130406 . C T 3576 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=29.78;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.98;SOR=1.085;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1184,0:.:0,0,20,7 1|1:0,55:55:99:0|1:4130397_C_G:2422,166,0:4130397:0,0,28,27 +chrX 4130736 . T A 2854 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.53;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.53;SOR=1.005;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1067,0:0,0,15,17 1/1:0,54:54:99:1817,162,0:0,0,22,32 +chrX 4130813 . G T 2843 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.41;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.41;SOR=0.788;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:908,0:0,0,16,12 1/1:0,58:58:99:1965,174,0:0,0,29,29 +chrX 4131408 . G A 3027 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=32.52;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.52;SOR=1.396;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1087,0:0,0,13,20 1/1:0,61:61:99:1970,182,0:0,0,21,40 +chrX 4131545 . A G 2197 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.81;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.81;SOR=1.085;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:690,0:0,0,16,5 1/1:0,49:49:99:1537,146,0:0,0,25,24 +chrX 4131841 . C T 2761 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.45;BaseQRankSum=4.201;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.45;ReadPosRankSum=1.541;SOR=1.013;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:968,0:0,0,17,12 1/1:2,55:57:99:1823,122,0:1,1,31,24 +chrX 4131976 . C G 2421 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=28.17;BaseQRankSum=3.915;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.504;MQ=59.61;MQRankSum=1.383;QD=28.17;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.618;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,33:35:99:1098,0:1,1,17,16 1/1:5,47:52:26:1353,26,0:2,3,25,22 +chrX 4133017 . A C 2537 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=28.24;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=0.770;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:974,0:.:0,0,9,13 1|1:0,36:36:99:0|1:4133017_A_C:1593,109,0:4133017:0,0,16,14 +chrX 4133019 . A C 2537 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=27.98;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=0.770;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:974,0:.:0,0,9,13 1|1:0,36:36:99:0|1:4133017_A_C:1593,109,0:4133017:0,0,16,14 +chrX 4133021 . A C 32 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=1.68;BaseQRankSum=0.971;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=2.126;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.712;SOR=1.426;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,719 0|1:32,5:37:62:.:0|1:4133017_A_C:62,0,904:4133017:17,15,3,1 +chrX 4133658 . C CT 1316.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=22.98;BaseQRankSum=-0.399;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.263;SOR=0.283;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,21:22:99:455,0:1,0,8,13 1/1:0,37:37:99:901,111,0:0,0,23,14 +chrX 4133699 . G A 2091 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=33.14;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=33.14;SOR=0.756;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:729,0:0,0,12,11 1/1:0,41:41:99:1392,123,0:0,0,21,20 +chrX 4134502 . A G 2789 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=32.78;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.78;SOR=0.947;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:963,0:0,0,13,17 1/1:0,56:56:99:1856,168,0:0,0,25,31 +chrX 4134685 . C G 2218 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.58;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.58;SOR=0.722;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:858,0:0,0,11,16 1/1:0,42:42:99:1390,126,0:0,0,24,18 +chrX 4135461 . G A 2371 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.35;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.35;SOR=1.073;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:819,0:0,0,16,9 1/1:0,47:47:99:1582,141,0:0,0,26,21 +chrX 4137223 . G A 2393 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.65;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.65;SOR=0.934;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:917,0:0,0,14,13 1/1:0,45:45:99:1506,135,0:0,0,26,19 +chrX 4137478 . T G 2942 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=33.39;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.39;SOR=1.270;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:670,0:0,0,14,6 1/1:0,69:69:99:2302,206,0:0,0,41,28 +chrX 4137929 . TA T 2928.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.62;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.62;SOR=0.959;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:915,0:0,0,9,19 1/1:0,63:63:99:2053,190,0:0,0,31,32 +chrX 4139060 . A AT 1244.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=22.93;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.67;QD=22.93;SOR=0.841;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:517,0:0,0,14,9 1/1:0,33:33:98:767,98,0:0,0,16,17 +chrX 4140344 . A C 2896 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=31.13;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.13;SOR=0.736;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:927,0:0,0,15,14 1/1:0,65:65:99:1999,195,0:0,0,31,34 +chrX 4140380 . T C 2881 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=30.97;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.97;SOR=0.693;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:784,0:0,0,13,11 1/1:0,70:70:99:2127,210,0:0,0,34,36 +chrX 4141325 . T C 2269 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.07;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.07;SOR=0.992;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:776,0:0,0,9,16 1/1:0,49:49:99:1523,146,0:0,0,23,26 +chrX 4142006 . C T 2723 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.39;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.39;SOR=1.101;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1115,0:0,0,15,20 1/1:0,50:50:99:1638,150,0:0,0,20,30 +chrX 4142561 . C T 2682 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.67;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.67;SOR=1.554;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1180,0:0,0,22,12 1/1:0,49:49:99:1532,146,0:0,0,33,16 +chrX 4146236 . G C 2441 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=30.89;BaseQRankSum=-0.335;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.89;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.303;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23:24:99:725,0:1,0,12,11 1/1:0,56:56:99:1746,168,0:0,0,31,25 +chrX 4146909 . C CT 1642.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=27.13;BaseQRankSum=-0.158;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=3.082;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.13;ReadPosRankSum=1.183;SOR=0.222;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,21:22:99:579,0:1,0,11,10 1/1:1,39:40:90:1103,90,0:1,0,18,21 +chrX 4147248 . T C 2296 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=32.31;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.31;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:818,0:0,0,18,8 1/1:0,46:46:99:1508,137,0:0,0,19,27 +chrX 4147551 . A G 2675 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.99;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.99;SOR=0.961;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:904,0:0,0,14,12 1/1:0,56:56:99:1801,168,0:0,0,22,34 +chrX 4148838 . C T 2739 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.20;BaseQRankSum=-0.269;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.20;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.233;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,34:35:99:1107,0:0,1,16,18 1/1:0,51:51:99:1662,153,0:0,0,26,25 +chrX 4149087 . TACACAC T 1941.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=26.01;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.02;SOR=0.883;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,17:17:99:.:.:765,0:.:0,0,8,9 1|1:0,27:27:82:0|1:4149087_TACACAC_T:1216,82,0:4149087:0,0,12,15 +chrX 4149141 . C G 3333 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.86;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.84;SOR=0.832;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1294,0:.:0,0,13,16 1|1:0,46:46:99:0|1:4149087_TACACAC_T:2069,139,0:4149087:0,0,22,24 +chrX 4149143 . C G 3372 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=29.03;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.76;SOR=0.801;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1294,0:.:0,0,13,16 1|1:0,47:47:99:0|1:4149087_TACACAC_T:2108,142,0:4149087:0,0,23,24 +chrX 4149191 . GCA G 3377.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.04;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.19;SOR=0.934;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1355,0:.:0,0,10,22 1|1:0,49:49:99:0|1:4149087_TACACAC_T:2062,148,0:4149087:0,0,26,23 +chrX 4149315 . T C 659 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.31;BaseQRankSum=0.672;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.594;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=0.494;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,540 0/1:20,25:45:99:.:689,0,519:12,8,12,13 +chrX 4153085 . C A 2386 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.79;BaseQRankSum=-0.541;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.79;ReadPosRankSum=1.733;SOR=0.256;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:727,0:0,0,12,9 1/1:1,54:55:99:1689,132,0:0,1,24,30 +chrX 4154841 . A T 2669 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.52;BaseQRankSum=-0.3;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.170;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=32.52;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=0.378;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:897,0:1,0,13,15 1/1:0,54:54:99:1802,162,0:0,0,26,28 +chrX 4155276 . C T 2619 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=31.16;BaseQRankSum=3.118;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=6.389;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=31.16;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.320;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1131,0:0,0,20,15 1/1:2,48:50:99:1518,129,0:2,0,19,29 +chrX 4155863 . A C 638 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.18;BaseQRankSum=-0.13;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.130;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.527;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:99:36:0,843 0/1:20,24:44:99:.:668,0,517:9,11,12,12 +chrX 4155928 . G T 938 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=33.38;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;QD=33.38;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:968,0:0,0,14,15 0/0:.:54:67:54:0,67,1162 +chrX 4158090 . A G 644 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.48;BaseQRankSum=-2.185;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.660;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,397 0/1:23,27:50:99:.:674,0,615:13,10,15,12 +chrX 4159118 . A T 637 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.13;BaseQRankSum=-0.747;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.828;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.821;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,397 0/1:27,28:55:99:.:667,0,730:11,15,16,12 +chrX 4161723 . T TTCTC 3332.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=30.86;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.38;QD=43.79;SOR=1.223;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1373,0:.:0,0,11,20 1|1:0,46:46:99:0|1:4161723_T_TTCTC:1999,140,0:4161723:0,0,19,27 +chrX 4161792 . TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC TTTCCTTCC,T 2845.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=23,43;AS_QD=28.52,36.00;BaseQRankSum=-0.126;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=4.690;MQ=53.72;MQRankSum=0.674;QD=43.06;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.447;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,23,0:24:99:.:.:975,0,781:.:1,0,1,8 2|2:0,0,43:43:99:0|1:4161723_T_TTCTC:1910,1910,1910,129,129,0:4161723:0,0,16,27 +chrX 4163769 . A G 3146 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=32.74;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=32.74;SOR=0.992;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1022,0:0,0,15,17 1/1:0,65:65:99:2154,195,0:0,0,27,38 +chrX 4164018 . A C 2140 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=32.88;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.754;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:814,0:0,0,10,14 1/1:0,42:42:99:1356,125,0:0,0,24,18 +chrX 4164793 . C T 2809 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.01;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=33.01;SOR=0.740;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1176,0:0,0,21,15 1/1:0,50:50:99:1663,150,0:0,0,21,29 +chrX 4164935 . A C 2416 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.61;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=32.61;SOR=0.719;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:912,0:0,0,11,17 1/1:0,47:47:99:1534,141,0:0,0,26,21 +chrX 4165060 . CAA CA,C 962.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=33,15;AS_QD=21.47,22.44;BaseQRankSum=0.764;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=6.673;MQ=59.00;MQRankSum=-0.294;QD=19.65;ReadPosRankSum=-1.487;SOR=0.481;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,21,0:22:99:419,0,582:0,0,11,9 1/2:2,12,15:29:99:583,269,229,179,0,257:0,2,15,12 +chrX 4165138 . G C 2216 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.09;BaseQRankSum=-0.373;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.4;SOR=0.463;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:605,0:0,0,10,8 1/1:1,51:52:99:1641,121,0:1,0,32,19 +chrX 4165329 . TTTA T 3380.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=34.86;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=43.29;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1082,0:0,0,10,15 1/1:0,54:54:99:2338,162,0:0,0,27,27 +chrX 4165506 . C T 2764 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=33.26;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.26;SOR=0.897;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:888,0:0,0,12,15 1/1:0,57:57:99:1906,171,0:0,0,34,23 +chrX 4165538 . A T 2938 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=33.35;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=33.35;SOR=1.204;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:799,0:0,0,12,13 1/1:0,64:64:99:2169,192,0:0,0,42,22 +chrX 4165571 . GAA G 2910.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=30.56;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.90;QD=35.98;SOR=1.220;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:694,0:0,0,11,9 1/1:0,62:62:99:2256,187,0:0,0,39,23 +chrX 4166550 . ATTT A 3194.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=29.24;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=44.30;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1053,0:0,0,12,12 1/1:0,49:49:99:2181,148,0:0,0,21,28 +chrX 4166847 . G A 2560 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.38;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:789,0:0,0,11,13 1/1:0,56:56:99:1801,167,0:0,0,27,29 +chrX 4167626 . A T 2783 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=31.97;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.97;SOR=0.887;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:710,0:0,0,9,13 1/1:0,66:66:99:2103,197,0:0,0,31,35 +chrX 4167780 . G A 2611 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.43;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.43;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:695,0:0,0,14,6 1/1:0,59:59:99:1946,177,0:0,0,28,31 +chrX 4168173 . G T 2793 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=32.45;BaseQRankSum=5.389;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=3.163;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.45;ReadPosRankSum=0;SOR=0.371;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:929,0:1,0,11,16 1/1:0,59:59:99:1894,176,0:0,0,30,29 +chrX 4168757 . C T 2967 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=32.23;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.23;SOR=0.758;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:893,0:0,0,10,17 1/1:0,66:66:99:2104,197,0:0,0,38,28 +chrX 4169346 . C CA 3058.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=28.54;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=40.23;SOR=1.150;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:916,0:0,0,11,12 1/1:0,54:54:99:2182,163,0:0,0,35,19 +chrX 4169891 . T A 3686 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=32.60;BaseQRankSum=2.612;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.60;ReadPosRankSum=-1.414;SOR=0.251;VarDP=114 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1269,0:0,0,21,17 1/1:1,75:76:99:2447,218,0:0,1,36,39 +chrX 4171211 . C T 3023 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=33.55;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;QD=33.55;SOR=0.760;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1325,0:0,0,20,20 1/1:0,51:51:99:1728,153,0:0,0,24,27 +chrX 4172641 . C A 2605 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.00;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.00;SOR=0.867;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:868,0:0,0,17,12 1/1:0,56:56:99:1767,167,0:0,0,29,27 +chrX 4173131 . G A 2365 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.93;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.93;SOR=1.091;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1131,0:0,0,14,21 1/1:0,40:40:99:1264,120,0:0,0,17,23 +chrX 4173519 . T G 2314 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=30.44;BaseQRankSum=-0.512;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.094;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.44;ReadPosRankSum=1.449;SOR=1.033;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:649,0:0,0,13,9 1/1:1,54:55:99:1695,130,0:0,1,34,20 +chrX 4173938 . G A 2492 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=33.18;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.18;SOR=0.859;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:780,0:0,0,9,14 1/1:0,53:53:99:1742,159,0:0,0,26,27 +chrX 4174029 . CT C 1449.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=27.57;BaseQRankSum=-0.393;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.57;ReadPosRankSum=1.213;SOR=0.282;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:396,0:0,0,8,6 1/1:1,39:40:99:1093,111,0:1,0,18,21 +chrX 4174373 . C T 1950 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=23.02;BaseQRankSum=-0.989;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.453;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.02;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.748;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1388,0:0,0,21,21 0/1:21,23:44:99:592,0,568:12,9,8,15 +chrX 4174697 . C T 2342 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.05;BaseQRankSum=2.938;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.64;MQRankSum=-0.68;QD=32.05;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=0.446;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:902,0:0,0,17,12 1/1:1,44:45:99:1470,125,0:1,0,27,17 +chrX 4174796 . T A 1784 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=29.74;BaseQRankSum=2.823;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=55.38;MQRankSum=2.76;QD=29.74;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=0.950;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,21:23:99:610,0:1,1,10,11 1/1:0,38:38:99:1204,113,0:0,0,23,15 +chrX 4174865 . C G 2389 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.25;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.86;QD=32.25;SOR=1.091;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:843,0:0,0,14,11 1/1:0,50:50:99:1576,148,0:0,0,30,20 +chrX 4175625 . G A 2562 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.23;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.23;SOR=1.108;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:823,0:0,0,10,15 1/1:0,53:53:99:1769,159,0:0,0,22,31 +chrX 4176304 . T C 3385 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=30.77;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.77;SOR=0.748;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1185,0:0,0,19,19 1/1:0,73:73:99:2230,217,0:0,0,38,35 +chrX 4176652 . C T 2655 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.56;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.56;SOR=1.031;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:834,0:0,0,12,12 1/1:0,56:56:99:1851,168,0:0,0,22,34 +chrX 4178742 . A G 2685 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.11;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.11;SOR=1.292;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1048,0:0,0,23,8 1/1:0,51:51:99:1667,153,0:0,0,28,23 +chrX 4179477 . GTT GT,G 1126.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=44,3;AS_QD=26.50,33.00;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.76;QD=24.81;SOR=1.659;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,0:11:99:284,0,284:0,0,8,3 1/1:0,33,3:36:29:882,107,0,787,29,783:0,0,24,12 +chrX 4180461 . A G 2577 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.79;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.79;SOR=1.292;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:700,0:0,0,6,15 1/1:0,61:61:99:1907,181,0:0,0,25,36 +chrX 4181484 . A T 1823 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=30.38;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=19.564;MQ=58.52;MQRankSum=-0.24;QD=30.38;SOR=0.995;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,16:19:99:507,0:0,3,9,7 1/1:2,40:42:84:1346,84,0:0,2,26,14 +chrX 4181485 . CAA CA,C 1708.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=32,13;AS_QD=29.31,28.72;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=19.056;MQ=58.20;MQRankSum=-0.283;QD=34.96;SOR=0.964;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,16,0:19:99:507,0,564:0,3,9,7 1/2:2,16,13:31:99:1241,201,118,275,0,333:0,2,19,10 +chrX 4181660 . C T 2432 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=33.27;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.27;SOR=0.927;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1082,0:0,0,14,18 1/1:0,42:42:99:1380,126,0:0,0,19,23 +chrX 4182528 . TCTGA T 3123.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=27.50;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.55;SOR=0.840;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1058,0:0,0,12,12 1/1:0,47:47:99:2105,142,0:0,0,26,21 +chrX 4182777 . GT G 1182.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=22.63;BaseQRankSum=-0.629;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;MQRankSum=3.318;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.935;SOR=0.952;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,19:20:99:.:.:665,0:.:0,1,10,9 1|1:3,31:34:37:0|1:4182777_GT_G:557,37,0:4182777:2,1,12,19 +chrX 4182779 . T G 1192 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=22.63;BaseQRankSum=1.991;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;MQRankSum=3.318;QD=22.63;ReadPosRankSum=1.336;SOR=0.952;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,19:20:99:.:.:665,0:.:0,1,10,9 1|1:3,31:34:37:0|1:4182777_GT_G:557,37,0:4182777:2,1,12,19 +chrX 4186201 . A G 2466 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=33.28;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.28;SOR=0.832;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:545,0:0,0,6,10 1/1:0,59:59:99:1951,177,0:0,0,29,30 +chrX 4187979 . C T 2611 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.01;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.01;SOR=1.096;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:886,0:0,0,14,13 1/1:0,53:53:99:1755,159,0:0,0,33,20 +chrX 4188081 . A C 168 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=5.50;BaseQRankSum=-2.679;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=41.816;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.242;SOR=3.221;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:23:99:23:.:.:0,342 0|1:26,10:36:99:.:0|1:4188081_A_C:198,0,921:4188081:4,22,9,1 +chrX 4188086 . A C 172 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=5.77;BaseQRankSum=-1.458;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=40.593;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.26;SOR=3.221;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:23:99:23:.:.:0,342 0|1:25,10:35:99:.:0|1:4188081_A_C:202,0,865:4188081:4,21,9,1 +chrX 4188197 . C CTTT 1644.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=32.38;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;QD=32.38;SOR=0.770;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,10:10:99:327,0:0,0,4,6 1/1:0,42:42:99:1357,124,0:0,0,21,21 +chrX 4188266 . ACTCATTGAACATGCACGTG A 2120.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=30.40;BaseQRankSum=0;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.20;ReadPosRankSum=1.738;SOR=0.892;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,13:14:99:540,0:0,1,5,8 1/1:0,36:36:99:1620,109,0:0,0,9,27 +chrX 4188812 . G A 2394 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.32;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.32;SOR=0.832;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:828,0:0,0,11,14 1/1:0,50:50:99:1596,150,0:0,0,29,21 +chrX 4188869 . G A 2292 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=32.25;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.25;SOR=0.934;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:764,0:0,0,14,9 1/1:0,49:49:99:1558,147,0:0,0,26,23 +chrX 4189450 . T C 1512 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=19.28;BaseQRankSum=-0.059;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.876;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.569;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,15,10 0/1:28,27:55:99:713,0,747:13,15,11,16 +chrX 4191197 . T C 3225 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=31.91;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.91;SOR=0.815;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1395,0:0,0,22,21 1/1:0,59:59:99:1860,176,0:0,0,32,27 +chrX 4191607 . T C 759 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=31.56;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.56;SOR=0.941;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:789,0:0,0,11,14 0/0:.:59:99:59:0,117,1643 +chrX 4191806 . G A 3230 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=34.11;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.34;SOR=1.012;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,21:21:99:.:.:873,0:.:0,0,10,11 1|1:0,56:56:99:0|1:4191806_G_A:2387,169,0:4191806:0,0,23,33 +chrX 4191827 . T C 3257 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=27.37;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=41.61;SOR=0.446;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,24:25:99:.:.:974,0:.:0,1,12,12 1|1:0,54:54:99:0|1:4191806_G_A:2313,162,0:4191806:0,0,19,35 +chrX 4191981 . C T 2629 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.24;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=33.24;SOR=1.165;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:913,0:0,0,21,7 1/1:0,52:52:99:1746,156,0:0,0,27,25 +chrX 4192146 . T A 2403 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=31.19;BaseQRankSum=2.183;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.19;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.396;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:898,0:0,0,10,18 1/1:1,49:50:99:1535,139,0:0,1,22,27 +chrX 4192266 . C T 2499 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=31.61;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.61;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:773,0:0,0,9,16 1/1:0,55:55:99:1756,165,0:0,0,29,26 +chrX 4192630 . G A 2961 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=31.48;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.48;SOR=0.848;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:967,0:0,0,16,15 1/1:0,64:64:99:2024,191,0:0,0,28,36 +chrX 4193076 . T C 2271 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.87;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.87;SOR=1.085;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:640,0:0,0,12,7 1/1:0,51:51:99:1661,153,0:0,0,29,22 +chrX 4193443 . C T 2798 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=32.88;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.740;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:958,0:0,0,12,18 1/1:0,56:56:99:1870,168,0:0,0,30,26 +chrX 4193692 . G GGAT 3994.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=29.57;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=0.784;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1470,0:0,0,16,17 1/1:0,57:57:99:2564,171,0:0,0,27,30 +chrX 4194182 . A G 2473 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=30.52;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=30.52;SOR=1.085;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:942,0:0,0,14,16 1/1:0,52:52:99:1561,154,0:0,0,34,18 +chrX 4194286 . A ATT 2076.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=33.06;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=33.06;SOR=0.892;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:611,0:0,0,9,9 1/1:0,46:46:99:1505,138,0:0,0,26,20 +chrX 4194429 . C T 2500 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.86;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.86;SOR=0.719;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1046,0:0,0,14,18 1/1:0,45:45:99:1484,134,0:0,0,24,21 +chrX 4194772 . C T 2417 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.78;BaseQRankSum=-0.177;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.78;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.245;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,17:18:99:536,0:0,1,9,8 1/1:0,59:59:99:1911,177,0:0,0,28,31 +chrX 4196554 . C A 2319 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.63;BaseQRankSum=0;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=3.660;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.63;ReadPosRankSum=-1.488;SOR=0.735;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,20:21:99:659,0:0,1,14,6 1/1:0,51:51:99:1690,153,0:0,0,27,24 +chrX 4196850 . T A 3150 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.83;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.83;SOR=0.693;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1069,0:0,0,17,14 1/1:0,63:63:99:2111,189,0:0,0,30,33 +chrX 4197093 . A G 2635 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.90;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.90;SOR=1.497;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1117,0:0,0,11,23 1/1:0,47:47:99:1548,141,0:0,0,17,30 +chrX 4197356 . G C 2292 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=33.17;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.17;SOR=1.163;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:664,0:0,0,13,7 1/1:0,50:50:99:1658,150,0:0,0,29,21 +chrX 4197411 . C A 2339 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.90;BaseQRankSum=4.801;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.90;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.414;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,21:22:99:716,0:1,0,14,7 1/1:0,50:50:99:1653,150,0:0,0,28,22 +chrX 4197467 . C A 2267 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.90;BaseQRankSum=-0.492;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.90;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.258;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:817,0:1,0,16,11 1/1:0,44:44:99:1480,132,0:0,0,21,23 +chrX 4198421 . C G 3590 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=24.77;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.69;SOR=1.416;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1102,0:.:0,0,16,9 1|1:0,56:56:99:0|1:4198421_C_G:2518,169,0:4198421:0,0,36,20 +chrX 4198423 . G C 3590 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=23.25;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.69;SOR=1.416;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1102,0:.:0,0,16,9 1|1:0,56:56:99:0|1:4198421_C_G:2518,169,0:4198421:0,0,36,20 +chrX 4198435 . C T 2683 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.09;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.09;SOR=1.367;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:818,0:0,0,16,10 1/1:0,56:56:99:1895,168,0:0,0,36,20 +chrX 4198990 . T C 2321 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.77;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.77;SOR=0.927;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:620,0:0,0,6,14 1/1:0,54:54:99:1731,162,0:0,0,27,27 +chrX 4199254 . G C 3226 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=28.91;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.00;SOR=0.747;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:810,0:.:0,0,13,5 1|1:0,56:56:99:0|1:4199254_G_C:2446,169,0:4199254:0,0,23,33 +chrX 4199261 . G C 3211 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=27.09;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=0.776;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:810,0:.:0,0,13,5 1|1:0,55:55:99:0|1:4199254_G_C:2431,166,0:4199254:0,0,22,33 +chrX 4199370 . T A 2540 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=33.38;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.38;SOR=0.772;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1010,0:0,0,15,15 1/1:0,47:47:99:1560,141,0:0,0,22,25 +chrX 4199406 . C G 2585 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.89;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.89;SOR=0.693;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1231,0:0,0,22,16 1/1:0,44:44:99:1384,131,0:0,0,19,25 +chrX 4199450 . G C 2488 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.70;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.70;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1189,0:0,0,21,17 1/1:0,39:39:99:1329,117,0:0,0,14,25 +chrX 4199683 . G A 2709 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.61;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.61;SOR=0.791;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1205,0:0,0,17,20 1/1:0,47:47:99:1534,141,0:0,0,27,20 +chrX 4200637 . G T 2909 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=31.60;BaseQRankSum=-0.343;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=6.163;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.60;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.222;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32:33:99:1018,0:1,0,16,16 1/1:1,59:60:99:1921,145,0:1,0,28,31 +chrX 4200821 . T G 2779 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=31.21;BaseQRankSum=2.324;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.21;ReadPosRankSum=1.053;SOR=0.941;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:844,0:0,1,11,16 1/1:1,61:62:99:1965,175,0:1,0,28,33 +chrX 4201285 . TA T 2949.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=26.98;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.36;SOR=0.968;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1160,0:0,0,17,14 1/1:0,49:49:99:1829,147,0:0,0,28,21 +chrX 4201601 . A G 2746 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=31.55;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.55;SOR=0.693;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:980,0:0,0,17,16 1/1:0,55:55:99:1796,165,0:0,0,27,28 +chrX 4201800 . A G 2820 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=33.93;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.93;SOR=0.843;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:953,0:0,0,14,14 1/1:0,56:56:99:1897,168,0:0,0,31,25 +chrX 4201819 . C T 2497 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=31.99;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.99;SOR=0.770;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:732,0:0,0,11,12 1/1:0,56:56:99:1795,167,0:0,0,30,26 +chrX 4202648 . G T 2465 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.83;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=1.270;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:823,0:0,0,17,7 1/1:0,52:52:99:1672,156,0:0,0,30,22 +chrX 4203146 . T C 2494 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=31.95;BaseQRankSum=-0.424;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.791;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.95;ReadPosRankSum=0.977;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:783,0:0,0,17,7 1/1:1,54:55:99:1741,131,0:0,1,29,25 +chrX 4203217 . G T 577 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.47;BaseQRankSum=-1.228;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.872;SOR=0.746;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,823 0/1:33,25:58:99:.:607,0,921:15,18,11,14 +chrX 4203268 . A G 2818 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.12;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.12;SOR=0.839;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1097,0:0,0,19,14 1/1:0,53:53:99:1751,159,0:0,0,21,32 +chrX 4203574 . T C 3495 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=28.93;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1372,0:.:0,0,10,21 1|1:0,49:49:99:0|1:4203574_T_C:2153,147,0:4203574:0,0,28,21 +chrX 4203584 . T G 3521 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.08;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.84;SOR=0.718;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30:30:99:.:.:1338,0:.:0,0,10,20 1|1:0,51:51:99:0|1:4203574_T_C:2213,153,0:4203574:0,0,31,20 +chrX 4204671 . GA G 2474.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=34.44;BaseQRankSum=-0.315;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=34.44;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.297;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:892,0:0,0,14,11 1/1:1,47:48:99:1622,109,0:1,0,25,22 +chrX 4205316 . A G 2069 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.80;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.80;SOR=1.044;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:707,0:0,0,11,10 1/1:0,43:43:99:1392,129,0:0,0,26,17 +chrX 4205715 . A ACTCT 3119.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=27.63;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.98;QD=43.88;SOR=1.002;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1281,0:0,0,18,12 1/1:0,42:42:99:1878,126,0:0,0,23,19 +chrX 4205948 . A G 2582 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.85;BaseQRankSum=1.805;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.85;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.327;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,29:30:99:904,0:0,1,13,16 1/1:0,52:52:99:1708,156,0:0,0,23,29 +chrX 4206501 . G GT 461.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.44;BaseQRankSum=1.041;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.527;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.156;SOR=1.242;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,408 0/1:23,25:48:99:.:501,0,458:12,11,16,9 +chrX 4207192 . A T 2376 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.96;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.96;SOR=0.963;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:912,0:0,0,18,10 1/1:0,45:45:99:1494,135,0:0,0,23,22 +chrX 4207316 . T TA 1521.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=23.30;BaseQRankSum=-0.674;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=6.220;MQ=59.65;MQRankSum=-0.231;QD=23.30;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.268;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:535,0:0,0,12,10 1/1:2,43:45:82:1026,82,0:2,0,19,24 +chrX 4207476 . G A 2358 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.27;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.27;SOR=0.927;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:690,0:0,0,11,10 1/1:0,53:53:99:1698,159,0:0,0,30,23 +chrX 4208042 . T C 2135 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.31;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.31;SOR=1.609;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:864,0:0,0,10,16 1/1:0,41:41:99:1301,122,0:0,0,12,29 +chrX 4209527 . C A 2252 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=33.56;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.56;SOR=0.814;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1011,0:0,0,15,15 1/1:0,38:38:99:1271,114,0:0,0,21,17 +chrX 4212256 . G A 2671 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.54;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=0.717;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1249,0:0,0,19,19 1/1:0,45:45:99:1452,134,0:0,0,23,22 +chrX 4213488 . G A 2631 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.85;BaseQRankSum=2.854;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.34;SOR=0.223;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,12,13 1/1:1,55:56:99:1832,158,0:1,0,28,27 +chrX 4214880 . A AT 1627.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=26.05;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=26.05;SOR=1.127;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:561,0:0,0,11,10 1/1:0,43:43:99:1106,127,0:0,0,27,16 +chrX 4215202 . A G 3291 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.08;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.58;SOR=0.798;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1116,0:.:0,0,13,13 1|1:0,52:52:99:0|1:4215202_A_G:2205,156,0:4215202:0,0,28,24 +chrX 4215219 . C A 3236 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=28.56;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.42;SOR=0.828;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:1012,0:.:0,0,12,11 1|1:0,54:54:99:0|1:4215202_A_G:2254,162,0:4215202:0,0,29,25 +chrX 4215434 . C T 1650 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=17.14;BaseQRankSum=-2.757;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.760;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.792;SOR=0.602;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:864,0:0,0,11,15 0/1:40,32:72:99:816,0,1149:21,19,18,14 +chrX 4215501 . A G 3163 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=32.25;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.25;SOR=0.713;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:955,0:0,0,16,14 1/1:0,69:69:99:2238,207,0:0,0,34,35 +chrX 4215799 . C T 2580 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.22;BaseQRankSum=2.407;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.174;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.22;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=0.382;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:725,0:0,0,12,10 1/1:1,58:59:99:1885,167,0:1,0,26,32 +chrX 4215921 . G T 2911 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.68;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.68;SOR=1.364;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:968,0:0,0,20,9 1/1:0,61:61:99:1973,183,0:0,0,37,24 +chrX 4216648 . C G 2513 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=30.27;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.27;SOR=0.693;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:913,0:0,0,16,12 1/1:0,56:56:99:1630,167,0:0,0,26,30 +chrX 4216809 . C A 1846 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=20.17;BaseQRankSum=0.242;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=1.795;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.17;ReadPosRankSum=1.682;SOR=0.956;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1207,0:0,0,21,14 0/1:32,26:58:99:669,0,843:17,15,15,11 +chrX 4216979 . G A 2548 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.05;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=33.05;SOR=1.670;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:992,0:0,0,10,20 1/1:0,48:48:99:1586,144,0:0,0,15,33 +chrX 4217278 . AAAAAATATATAT AAT,A 137.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=8,0;AS_QD=11.80,0.00;BaseQRankSum=0;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=2.081;MQ=57.99;MQRankSum=0.124;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.003;SOR=1.061;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,3,0:3:99:126,0,126:0,0,2,1 0/1:7,5,0:12:51:51,0,300,113,166,608:3,4,3,2 +chrX 4217458 . C CAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAA 838.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,5;AS_QD=31.08,34.33;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.83;QD=125.43;SOR=0.941;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:25:13:0,25,25 1/2:0,2,5:7:34:.:878,136,74,96,0,34:0,0,3,4 +chrX 4217559 . C G 1982 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=30.95;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.17;QD=30.95;SOR=1.249;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:540,0:0,0,11,7 1/1:0,47:47:99:1472,140,0:0,0,29,18 +chrX 4217657 . G A 1355 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=19.51;BaseQRankSum=2.761;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.957;MQ=59.89;MQRankSum=-0.921;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.919;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:670,0:0,0,12,9 0/1:24,26:50:99:715,0,504:12,12,14,12 +chrX 4217933 . A C 2754 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.00;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=0.763;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:899,0:0,0,14,13 1/1:0,60:60:99:1885,179,0:0,0,28,32 +chrX 4218252 . C T 2852 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.02;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.02;SOR=0.883;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1116,0:0,0,19,16 1/1:0,55:55:99:1766,165,0:0,0,30,25 +chrX 4218342 . A G 3875 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=30.94;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=0.693;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,36:36:99:.:.:1568,0:.:0,0,18,18 1|1:0,54:54:99:0|1:4218342_A_G:2337,163,0:4218342:0,0,27,27 +chrX 4218351 . C T 3827 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=27.40;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.83;SOR=0.786;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:1544,0:.:0,0,17,18 1|1:0,53:53:99:0|1:4218342_A_G:2313,160,0:4218342:0,0,25,28 +chrX 4218762 . TAAAA T 3586.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.82;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=0.897;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1181,0:.:0,0,10,18 1|1:0,56:56:99:0|1:4218762_TAAAA_T:2445,169,0:4218762:0,0,28,28 +chrX 4218775 . A C 3664 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.16;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.95;SOR=0.839;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1181,0:.:0,0,10,18 1|1:0,58:58:99:0|1:4218762_TAAAA_T:2513,175,0:4218762:0,0,30,28 +chrX 4218922 . T C 2550 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.85;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.85;SOR=0.876;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:903,0:0,0,14,15 1/1:0,52:52:99:1677,156,0:0,0,30,22 +chrX 4219073 . G A 2543 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=34.31;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.31;SOR=0.719;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:978,0:0,0,19,10 1/1:0,46:46:99:1595,138,0:0,0,19,27 +chrX 4219748 . A G 2497 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=33.69;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.69;SOR=0.892;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,15,10 1/1:0,50:50:99:1698,150,0:0,0,19,31 +chrX 4219832 . C A 2497 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=33.69;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.69;SOR=0.719;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:849,0:0,0,13,12 1/1:0,50:50:99:1678,150,0:0,0,24,26 +chrX 4219922 . G A 2624 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.77;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=32.77;SOR=0.821;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:833,0:0,0,13,13 1/1:0,55:55:99:1821,165,0:0,0,25,30 +chrX 4220088 . G A 2644 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.43;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.43;SOR=1.031;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1116,0:0,0,17,16 1/1:0,47:47:99:1558,141,0:0,0,29,18 +chrX 4220160 . CATT C 3784.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=33.67;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=0.716;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1350,0:0,0,15,15 1/1:0,55:55:99:2474,166,0:0,0,28,27 +chrX 4220453 . T C 819 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=23.58;BaseQRankSum=0;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=16.196;MQ=59.05;MQRankSum=-0.943;QD=23.58;ReadPosRankSum=-2.483;SOR=0.266;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:493,0:0,0,9,9 0/1:6,12:18:52:356,0,52:6,0,5,7 +chrX 4220670 . G A 2029 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=30.73;BaseQRankSum=3.158;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.73;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=0.925;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:838,0:0,0,17,10 1/1:2,38:40:71:1221,71,0:1,1,19,19 +chrX 4221548 . T C 1737 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=32.72;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=0.931;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:625,0:0,0,9,11 1/1:0,34:34:99:1142,102,0:0,0,15,19 +chrX 4221847 . G A 2976 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=31.98;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.98;SOR=0.976;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1126,0:0,0,21,14 1/1:0,59:59:99:1880,176,0:0,0,32,27 +chrX 4222174 . C T 2989 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=28.75;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.36;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:933,0:.:0,0,10,13 1|1:0,50:50:99:0|1:4222174_C_T:2086,150,0:4222174:0,0,29,21 +chrX 4222199 . A C 2919 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=27.11;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.54;SOR=0.904;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:942,0:.:0,0,11,13 1|1:0,47:47:99:0|1:4222174_C_T:2007,141,0:4222174:0,0,28,19 +chrX 4222246 . CTTTA C 3740.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.26;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=45.00;SOR=0.843;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1530,0:0,0,13,21 1/1:0,50:50:99:2250,151,0:0,0,26,24 +chrX 4222443 . G A 2036 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=34.43;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;QD=34.43;SOR=0.831;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:710,0:0,0,9,12 1/1:0,39:39:99:1356,117,0:0,0,19,20 +chrX 4222909 . T C 2739 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=33.36;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.36;SOR=0.818;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:992,0:0,0,22,9 1/1:0,52:52:99:1777,156,0:0,0,17,35 +chrX 4222994 . A G 2618 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=30.79;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.79;SOR=0.947;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1121,0:0,0,20,16 1/1:0,50:50:99:1527,148,0:0,0,28,22 +chrX 4223419 . G T 2843 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.65;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.65;SOR=0.693;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1022,0:0,0,13,19 1/1:0,56:56:99:1851,167,0:0,0,31,25 +chrX 4223749 . T C 2505 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=31.69;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;QD=31.69;SOR=1.236;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:928,0:0,0,9,20 1/1:0,51:51:99:1607,153,0:0,0,22,29 +chrX 4224194 . A G 2971 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.62;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.62;SOR=0.929;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1081,0:0,0,17,17 1/1:0,58:58:99:1920,174,0:0,0,34,24 +chrX 4224274 . T C 3204 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=32.67;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.67;SOR=0.713;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1275,0:0,0,18,22 1/1:0,59:59:99:1959,177,0:0,0,31,28 +chrX 4224545 . C T 3439 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=107;AS_QD=32.12;BaseQRankSum=2.294;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=3.259;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.12;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.434;VarDP=108 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1216,0:0,0,19,18 1/1:1,70:71:99:2253,203,0:1,0,31,39 +chrX 4224900 . TG T 2643.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=31.81;BaseQRankSum=-0.495;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=40.65;ReadPosRankSum=1.131;SOR=1.044;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,23:24:99:.:.:957,0:.:1,0,13,10 1|1:1,41:42:81:0|1:4224900_TG_T:1726,81,0:4224900:0,1,14,27 +chrX 4224902 . TC T 2643.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=33.60;BaseQRankSum=-0.422;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=40.65;ReadPosRankSum=0.905;SOR=1.044;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,23:24:99:.:.:957,0:.:1,0,13,10 1|1:1,41:42:81:0|1:4224900_TG_T:1726,81,0:4224900:0,1,14,27 +chrX 4224911 . A G 2508 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=32.96;BaseQRankSum=-0.257;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=40.94;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.986;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,23:24:99:.:.:949,0:.:1,0,14,9 1|1:1,37:38:69:0|1:4224900_TG_T:1589,69,0:4224900:0,1,12,25 +chrX 4225570 . C T 2680 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=31.88;BaseQRankSum=-0.408;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.88;ReadPosRankSum=1.23;SOR=0.364;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,30:31:99:948,0:1,0,18,12 1/1:0,54:54:99:1762,162,0:0,0,30,24 +chrX 4226316 . A AT 2133.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=27.86;BaseQRankSum=1.572;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.631;SOR=0.333;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:768,0:0,0,11,16 1/1:1,50:51:99:1405,127,0:0,1,23,27 +chrX 4226624 . T TA,TTA 2631.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=22,48;AS_QD=30.58,32.32;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.16;SOR=0.941;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,24:24:99:890,702,0:0,0,11,13 1/2:0,22,24:46:99:1781,683,571,621,0,477:0,0,28,18 +chrX 4226870 . T A 587 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=14.02;BaseQRankSum=-1.075;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.498;MQ=59.49;MQRankSum=1.092;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.568;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,619 0/1:21,23:44:99:.:617,0,576:12,9,11,12 +chrX 4226912 . C G 2139 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.37;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.37;SOR=0.723;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:685,0:0,0,11,10 1/1:0,46:46:99:1484,138,0:0,0,23,23 +chrX 4227108 . GTATACATATATATA G 301.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.66;BaseQRankSum=-0.56;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=1.428;MQ=56.25;MQRankSum=-0.665;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.115;SOR=1.201;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:16:45:16:.:.:0,45 0|1:15,17:32:99:.:0|1:4227108_GTATACATATATATA_G:341,0,367:4227108:7,8,6,11 +chrX 4227124 . ATG A 622.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=16.97;BaseQRankSum=1.879;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=1.261;MQ=55.17;MQRankSum=0.464;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.425;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,8:8:99:.:.:360,0:.:0,0,3,5 0|1:18,13:31:99:1|0:4227108_GTATACATATATATA_G:302,0,378:4227108:7,11,7,6 +chrX 4227126 . GTATA *,G 1245.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,18;AS_QD=0.00,30.36;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.02;QD=41.45;SOR=0.968;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,8,0:8:99:.:.:360,0,360:.:0,0,3,5 1|2:0,13,18:31:99:0|1:4227108_GTATACATATATATA_G:1285,460,376,394,0,333:4227108:0,0,14,17 +chrX 4227129 . TACATATATATATATATATATGTATACATATATATATATGTATAC T,* 1575.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,17;AS_QD=28.74,0.00;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.44;QD=42.50;SOR=0.914;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,8,0:8:99:.:.:360,0,360:.:0,0,3,5 1|2:0,13,17:30:99:1|0:4227108_GTATACATATATATA_G:1255,431,348,393,0,304:4227108:0,0,14,16 +chrX 4227145 . TATATGTATACATATATATATATGTATAC *,T 1142.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,14;AS_QD=0.00,30.49;DP=41;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.51;QD=43.78;SOR=0.869;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,8,0:8:99:.:.:360,0,360:.:0,0,3,5 1|2:0,13,14:27:99:0|1:4227108_GTATACATATATATA_G:1182,359,277,393,0,313:4227108:0,0,13,14 +chrX 4227312 . G A 1335 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=33.29;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;QD=33.29;SOR=0.954;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13:13:99:442,0:0,0,8,5 1/1:0,28:28:84:923,84,0:0,0,15,13 +chrX 4227651 . A G 2513 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.40;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.40;SOR=0.718;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:913,0:0,0,13,16 1/1:0,52:52:99:1630,155,0:0,0,28,24 +chrX 4227763 . TCCCTTCTC T 1644.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=30.50;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.77;QD=44.32;SOR=1.040;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:722,0:.:0,0,9,7 1|1:0,22:22:71:0|1:4227763_TCCCTTCTC_T:962,71,0:4227763:0,0,7,15 +chrX 4227804 . CTTTTCT C 2009.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=28.81;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.81;QD=43.60;SOR=1.659;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:810,0:.:0,0,8,10 1|1:0,29:29:91:0|1:4227763_TCCCTTCTC_T:1239,91,0:4227763:0,0,7,22 +chrX 4227856 . TTCTTTCTTTCTTTCTCTCTTTTTC T 364.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=13.93;BaseQRankSum=1.692;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=1.697;MQ=57.51;MQRankSum=-0.371;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.54;SOR=1.112;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:17:99:17:0,270 0/1:18,11:29:99:.:404,0,721:5,13,2,9 +chrX 4227860 . TTCTTTCTTTCTCTCTTTTTC T,* 758.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=18,0;AS_QD=29.71,34.88;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.63;QD=44.33;SOR=0.593;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,0:18:99:798,0,798:0,0,7,11 0/2:18,0,11:29:99:404,459,1214,0,756,721:5,13,2,9 +chrX 4227864 . TTCTTTCTCTCTTTTTC *,T 1109.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=11,18;AS_QD=0.00,31.13;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.27;QD=39.62;SOR=1.814;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,0:18:99:798,0,798:0,0,7,11 1/2:0,11,18:29:99:1149,697,722,460,0,404:0,0,7,22 +chrX 4228070 . T C 2095 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=32.20;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.20;SOR=1.033;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:916,0:0,0,14,14 1/1:0,38:38:99:1209,113,0:0,0,24,14 +chrX 4228497 . G A 2819 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.13;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.13;SOR=0.693;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1087,0:0,0,17,16 1/1:0,53:53:99:1762,159,0:0,0,26,27 +chrX 4228524 . T C 2758 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.80;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.80;SOR=0.765;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1032,0:0,0,18,14 1/1:0,53:53:99:1756,159,0:0,0,26,27 +chrX 4229270 . A G 1527 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=30.53;BaseQRankSum=-0.675;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=3.274;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.53;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.477;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:486,0:0,0,8,6 1/1:1,36:37:76:1071,76,0:1,0,15,21 +chrX 4229305 . C T 1682 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=32.30;BaseQRankSum=-0.311;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=3.263;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.30;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=0.467;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:511,0:0,0,8,7 1/1:1,37:38:80:1201,80,0:1,0,16,21 +chrX 4229338 . C T 1692 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=32.49;BaseQRankSum=-0.321;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=3.093;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.49;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=0.343;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:590,0:0,0,11,6 1/1:1,35:36:73:1132,73,0:1,0,14,21 +chrX 4230131 . T G 2545 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.79;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.79;SOR=0.821;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:818,0:0,0,14,13 1/1:0,54:54:99:1757,162,0:0,0,24,30 +chrX 4230391 . T C 3397 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=22.81;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1268,0:.:0,0,16,13 1|1:0,48:48:99:0|1:4230391_T_C:2159,144,0:4230391:0,0,26,22 +chrX 4230392 . G C 3397 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=30.74;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1268,0:.:0,0,16,13 1|1:0,48:48:99:0|1:4230391_T_C:2159,144,0:4230391:0,0,26,22 +chrX 4231322 . G A 2930 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.89;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=0.935;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1014,0:0,0,18,14 1/1:0,58:58:99:1946,174,0:0,0,32,26 +chrX 4231337 . C A 2771 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.20;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.20;SOR=0.917;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:972,0:0,0,16,15 1/1:0,56:56:99:1829,168,0:0,0,32,24 +chrX 4231530 . A G 2638 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=31.76;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.76;SOR=0.741;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1091,0:0,0,20,15 1/1:0,49:49:99:1577,147,0:0,0,23,26 +chrX 4231680 . TA T 2929.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.18;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.11;SOR=0.743;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:973,0:0,0,13,13 1/1:0,54:54:99:1996,162,0:0,0,26,28 +chrX 4232527 . A G 2783 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.33;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.33;SOR=1.218;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:933,0:0,0,14,14 1/1:0,59:59:99:1880,176,0:0,0,39,20 +chrX 4232649 . C T 2709 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=31.13;BaseQRankSum=2.388;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=31.13;ReadPosRankSum=0.837;SOR=1.065;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,29:30:99:903,0:1,0,11,18 1/1:1,57:58:99:1836,164,0:0,1,25,32 +chrX 4232682 . G A 2942 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.30;BaseQRankSum=-0.493;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.617;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=32.30;ReadPosRankSum=-1.313;SOR=0.696;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32:33:99:981,0:1,0,12,20 1/1:0,59:59:99:1991,177,0:0,0,27,32 +chrX 4232746 . G A 2981 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=31.69;BaseQRankSum=-0.385;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.343;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=31.69;ReadPosRankSum=1.326;SOR=0.499;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,33:34:99:1037,0:1,0,18,15 1/1:0,61:61:99:1974,183,0:0,0,25,36 +chrX 4232853 . A T 2913 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=33.44;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.44;SOR=0.786;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:987,0:0,0,19,10 1/1:0,59:59:99:1956,177,0:0,0,27,32 +chrX 4232869 . A G 2547 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=31.81;BaseQRankSum=-0.147;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.81;ReadPosRankSum=1.734;SOR=0.289;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,24:25:99:781,0:1,0,16,8 1/1:0,56:56:99:1796,167,0:0,0,27,29 +chrX 4233009 . G A 2318 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=30.89;BaseQRankSum=0.505;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.038;SOR=0.747;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,31:33:99:903,0:1,1,19,12 1/1:0,43:43:99:1445,129,0:0,0,19,24 +chrX 4233045 . T G 2063 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=30.33;BaseQRankSum=-0.592;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.33;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.273;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:833,0:0,1,15,13 1/1:0,40:40:99:1260,118,0:0,0,17,23 +chrX 4233264 . G C 2238 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.94;BaseQRankSum=-0.326;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=3.889;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.94;ReadPosRankSum=-1.388;SOR=0.896;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,24:25:99:729,0:0,1,12,12 1/1:0,46:46:99:1539,138,0:0,0,30,16 +chrX 4233862 . A T 2675 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.40;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.40;SOR=1.058;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:874,0:0,0,12,14 1/1:0,55:55:99:1831,165,0:0,0,22,33 +chrX 4235001 . A G 2139 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=33.37;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.37;SOR=0.787;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:700,0:0,0,12,9 1/1:0,44:44:99:1469,132,0:0,0,22,22 +chrX 4235138 . ATT A 2141.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=28.52;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=37.60;SOR=1.085;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:830,0:0,0,9,13 1/1:0,36:36:99:1351,108,0:0,0,15,21 +chrX 4235288 . C T 2765 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.50;BaseQRankSum=2.674;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.904;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.955;SOR=0.899;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1216,0:0,0,22,15 1/1:1,48:49:99:1579,122,0:0,1,29,19 +chrX 4235500 . TTA T 2591.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=32.25;BaseQRankSum=-0.112;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.54;MQRankSum=-0.381;QD=42.44;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.295;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:892,0:.:0,0,12,8 1|1:1,41:42:83:0|1:4235500_TTA_T:1739,83,0:4235500:1,0,21,20 +chrX 4235518 . GCGAATACCATTATTTTGTTCCTTCTTATGACTGAGTAGTATTCCATTATATATATATA G 2865.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=34.12;BaseQRankSum=-0.326;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.51;MQRankSum=-0.612;QD=41.50;ReadPosRankSum=0.616;SOR=0.814;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1069,0:.:0,0,13,11 1|1:2,44:46:48:0|1:4235500_TTA_T:1836,48,0:4235500:1,1,23,21 +chrX 4235614 . A ATG 2568.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=26.89;BaseQRankSum=-0.4;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.18;MQRankSum=-0.441;QD=42.06;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.330;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:984,0:.:0,0,11,12 1|1:1,38:39:72:0|1:4235500_TTA_T:1624,72,0:4235500:0,1,16,22 +chrX 4237473 . G A 2719 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.52;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.52;SOR=0.742;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:749,0:0,0,11,12 1/1:0,59:59:99:2000,177,0:0,0,29,30 +chrX 4237545 . C T 3220 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=32.83;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=1.145;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1162,0:0,0,13,21 1/1:0,65:65:99:2088,195,0:0,0,27,38 +chrX 4237749 . G A 2825 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.44;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.44;SOR=0.786;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:814,0:0,0,11,15 1/1:0,62:62:99:2041,186,0:0,0,35,27 +chrX 4238018 . T C 2661 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.82;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.82;SOR=0.902;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:774,0:0,0,14,10 1/1:0,58:58:99:1917,174,0:0,0,31,27 +chrX 4238354 . C G 2646 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.48;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.48;SOR=1.101;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:967,0:0,0,19,13 1/1:0,53:53:99:1709,158,0:0,0,31,22 +chrX 4238393 . G T 3259 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.89;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=1.167;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1175,0:0,0,22,14 1/1:0,64:64:99:2114,192,0:0,0,38,26 +chrX 4238658 . T C 3553 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=30.80;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.23;SOR=0.768;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33:33:99:.:.:1475,0:.:0,0,18,15 1|1:0,48:48:99:0|1:4238658_T_C:2108,144,0:4238658:0,0,24,24 +chrX 4238668 . T C 3598 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.71;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.24;SOR=0.742;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:1544,0:.:0,0,19,16 1|1:0,47:47:99:0|1:4238658_T_C:2084,141,0:4238658:0,0,23,24 +chrX 4239142 . CAA C 2249.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=33.55;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.33;SOR=1.010;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:835,0:0,0,9,14 1/1:0,40:40:99:1454,121,0:0,0,18,22 +chrX 4239915 . G GAA 3611.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=30.59;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.52;SOR=0.846;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1323,0:0,0,15,15 1/1:0,52:52:99:2328,156,0:0,0,29,23 +chrX 4240406 . G A 2635 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.11;BaseQRankSum=2.287;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.063;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.11;ReadPosRankSum=-1.118;SOR=0.300;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:710,0:0,0,11,10 1/1:1,61:62:99:1955,176,0:0,1,31,30 +chrX 4240512 . C T 2181 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.14;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.14;SOR=0.721;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:764,0:0,0,13,10 1/1:0,48:48:99:1447,142,0:0,0,23,25 +chrX 4240943 . C T 3412 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=34.76;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1159,0:.:0,0,13,13 1|1:0,53:53:99:0|1:4240943_C_T:2283,159,0:4240943:0,0,27,26 +chrX 4240944 . T G 3412 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.38;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=0.718;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1159,0:.:0,0,13,13 1|1:0,53:53:99:0|1:4240943_C_T:2283,159,0:4240943:0,0,27,26 +chrX 4240983 . C T 1998 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.20;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.20;SOR=1.000;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:754,0:0,0,12,12 1/1:0,41:41:99:1274,121,0:0,0,25,16 +chrX 4241056 . G C 2043 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.41;BaseQRankSum=-0.479;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=3.424;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.41;ReadPosRankSum=0.039;SOR=0.572;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:709,0:0,0,10,11 1/1:1,44:45:99:1364,100,0:0,1,26,18 +chrX 4241112 . C G 2241 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=31.11;BaseQRankSum=-0.269;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.11;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.297;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:718,0:0,0,13,11 1/1:1,48:49:99:1553,112,0:0,1,20,28 +chrX 4241288 . C T 3096 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=32.91;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.91;SOR=0.802;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1121,0:0,0,17,17 1/1:0,61:61:99:2005,183,0:0,0,33,28 +chrX 4241762 . T A 2625 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.19;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.19;SOR=1.310;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:933,0:0,0,9,20 1/1:0,51:51:99:1722,153,0:0,0,21,30 +chrX 4241810 . T C 2547 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.21;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.21;SOR=1.730;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:659,0:0,0,6,14 1/1:0,60:60:99:1918,180,0:0,0,19,41 +chrX 4242037 . CA C 623.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=28.83;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.83;SOR=1.426;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,6:6:99:173,0:0,0,2,4 1/1:0,17:17:51:490,51,0:0,0,13,4 +chrX 4242075 . A G 1246 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=32.72;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=1.730;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,10:10:99:318,0:0,0,6,4 1/1:0,29:29:87:958,87,0:0,0,21,8 +chrX 4242161 . G A 3115 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=27.14;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.68;SOR=1.675;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:889,0:.:0,0,14,6 1|1:0,52:52:99:0|1:4242161_G_A:2256,156,0:4242161:0,0,35,17 +chrX 4242170 . A G 3013 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=26.39;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=1.576;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:879,0:.:0,0,14,6 1|1:0,49:49:99:0|1:4242161_G_A:2164,147,0:4242161:0,0,32,17 +chrX 4242452 . C CTA 3258.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=30.43;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.57;SOR=1.209;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19:19:99:.:.:834,0:.:0,0,6,13 1|1:0,55:55:99:0|1:4242452_C_CTA:2464,165,0:4242452:0,0,23,32 +chrX 4242454 . C CTA 3294.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.54;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=1.240;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:869,0:.:0,0,6,14 1|1:0,55:55:99:0|1:4242452_C_CTA:2465,166,0:4242452:0,0,23,32 +chrX 4242789 . T G 2491 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.32;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.32;SOR=0.914;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:803,0:0,0,10,16 1/1:0,52:52:99:1718,156,0:0,0,25,27 +chrX 4243194 . GA G 2904.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=32.35;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.35;SOR=0.959;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:867,0:0,0,11,16 1/1:0,64:64:99:2077,193,0:0,0,40,24 +chrX 4243812 . G A 2584 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.68;BaseQRankSum=2.117;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.120;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.68;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.343;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:869,0:0,0,15,10 1/1:1,54:55:99:1745,140,0:1,0,23,31 +chrX 4243834 . G A 2436 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.62;BaseQRankSum=-0.472;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.963;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.62;ReadPosRankSum=1.547;SOR=0.171;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:874,0:0,0,17,9 1/1:2,50:52:86:1592,86,0:2,0,26,24 +chrX 4244122 . C T 2903 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=34.51;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.51;SOR=0.867;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:884,0:0,0,11,15 1/1:0,59:59:99:2049,177,0:0,0,35,24 +chrX 4244278 . A G 2594 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.61;BaseQRankSum=2.919;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.61;ReadPosRankSum=-1.236;SOR=0.768;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:834,0:0,0,14,10 1/1:2,57:59:99:1790,126,0:1,1,28,29 +chrX 4244895 . A G 2639 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.36;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.36;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:978,0:0,0,17,12 1/1:0,51:51:99:1691,153,0:0,0,25,26 +chrX 4245097 . T C 2355 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=31.38;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.38;SOR=0.746;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:909,0:0,0,11,16 1/1:0,49:49:99:1476,146,0:0,0,28,21 +chrX 4245343 . C T 3112 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=27.02;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.64;SOR=1.002;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1194,0:.:0,0,9,18 1|1:0,45:45:99:0|1:4245343_C_T:1948,135,0:4245343:0,0,22,23 +chrX 4245352 . A G 3114 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=30.60;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.67;SOR=1.002;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1195,0:.:0,0,9,18 1|1:0,45:45:99:0|1:4245343_C_T:1949,135,0:4245343:0,0,22,23 +chrX 4245490 . G A 2434 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.85;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.85;SOR=0.774;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:862,0:0,0,13,14 1/1:0,48:48:99:1602,144,0:0,0,23,25 +chrX 4246022 . C T 2201 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=33.80;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.80;SOR=1.112;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:791,0:0,0,14,10 1/1:0,42:42:99:1440,126,0:0,0,25,17 +chrX 4246189 . T C 2599 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.46;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=0.718;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:789,0:0,0,11,13 1/1:0,57:57:99:1840,170,0:0,0,29,28 +chrX 4246582 . A G,T 2195 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=49,3;AS_QD=29.63,28.93;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.24;QD=42.79;SOR=0.853;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21,0:21:99:945,0,945:0,0,11,10 1/1:0,28,3:31:8:1280,93,0,803,8,721:0,0,17,14 +chrX 4246585 . G T 2459 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=31.30;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.17;QD=44.45;SOR=1.009;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,22:22:99:.:.:990,0:.:0,0,12,10 1|1:0,34:34:99:0|1:4246585_G_T:1499,102,0:4246585:0,0,20,14 +chrX 4246590 . C CTTTTTT,CTTTTTTTT,CTTTTTTTTT 2467.97 . AC=3,0,0;AF=1.00,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=43,1,1;AS_QD=27.77,31.03,34.32;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.10;QD=55.71;SOR=0.829;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,10,1,1:12:99:.:.:1022,0,199,270:.:0,0,2,10 1|1:0,33,0,0:33:99:0|1:4246585_G_T:1485,99,0,1485,99,1485,1485,99,1485,1485:4246585:0,0,19,14 +chrX 4246780 . A G 2066 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=33.27;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.87;QD=33.27;SOR=0.790;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:654,0:0,0,10,10 1/1:0,43:43:99:1442,129,0:0,0,20,23 +chrX 4246985 . A G 2613 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=31.09;BaseQRankSum=-0.661;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.242;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:888,0:0,0,14,13 1/1:1,57:58:99:1755,139,0:0,1,27,30 +chrX 4248361 . T C 2019 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.02;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.02;SOR=0.892;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:779,0:0,0,12,12 1/1:0,40:40:99:1270,120,0:0,0,17,23 +chrX 4249244 . A G 2519 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=31.86;BaseQRankSum=3.052;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.86;ReadPosRankSum=-0.672;SOR=0.914;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,30:31:99:982,0:1,0,12,18 1/1:1,48:49:99:1567,137,0:0,1,23,25 +chrX 4249418 . G A 2983 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=33.48;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.48;SOR=0.883;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:923,0:0,0,13,15 1/1:0,62:62:99:2090,186,0:0,0,28,34 +chrX 4250385 . C CTTA 3414.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=35.01;BaseQRankSum=-0.776;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.18;ReadPosRankSum=-1.106;SOR=0.255;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1450,0:0,0,15,18 1/1:1,46:47:96:2004,96,0:0,1,23,23 +chrX 4250489 . A C 538 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.14;BaseQRankSum=-0.226;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=3.775;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.459;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,701 0/1:31,25:56:99:.:568,0,751:19,12,12,13 +chrX 4250581 . A C 2292 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=31.81;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.81;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1072,0:0,0,22,11 1/1:0,40:40:99:1250,118,0:0,0,17,23 +chrX 4252042 . A G 2631 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=31.68;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.68;SOR=0.693;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:931,0:0,0,16,14 1/1:0,54:54:99:1730,161,0:0,0,26,28 +chrX 4252415 . T C 2649 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=30.79;BaseQRankSum=2.537;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=7.260;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.79;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.661;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,39:40:99:1190,0:0,1,20,19 1/1:1,46:47:99:1489,130,0:0,1,29,17 +chrX 4252856 . A G 2698 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=30.65;BaseQRankSum=-0.51;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.583;MQ=59.87;MQRankSum=0;QD=30.65;ReadPosRankSum=-1.444;SOR=0.673;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:883,0:0,0,16,13 1/1:1,59:60:99:1845,145,0:0,1,34,25 +chrX 4253137 . A C 3131 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=32.93;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.93;SOR=0.778;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1072,0:0,0,15,17 1/1:0,64:64:99:2089,191,0:0,0,35,29 +chrX 4253443 . C T 2717 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=31.22;BaseQRankSum=-0.619;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.110;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.22;ReadPosRankSum=-1.14;SOR=0.332;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,37:38:99:1116,0:1,0,15,22 1/1:0,50:50:99:1631,150,0:0,0,27,23 +chrX 4253762 . C T 3863 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=120;AS_QD=32.44;DP=123;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.44;SOR=0.761;VarDP=120 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1270,0:0,0,21,19 1/1:0,80:80:99:2623,240,0:0,0,41,39 +chrX 4253785 . A T 3582 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=111;AS_QD=32.54;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=0.748;VarDP=111 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1091,0:0,0,17,18 1/1:0,76:76:99:2521,229,0:0,0,40,36 +chrX 4254027 . C T 531 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.68;BaseQRankSum=1.38;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.822;SOR=0.793;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,620 0/1:21,20:41:99:.:561,0,567:10,11,9,11 +chrX 4254599 . ATGTG A 2746.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.73;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=1.010;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1050,0:0,0,14,10 1/1:0,39:39:99:1736,118,0:0,0,22,17 +chrX 4254986 . A C 2357 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.15;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.15;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:998,0:0,0,12,17 1/1:0,43:43:99:1389,128,0:0,0,25,18 +chrX 4255677 . A G 2770 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=31.82;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.82;SOR=0.786;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1357,0:0,0,17,26 1/1:0,45:45:99:1443,134,0:0,0,25,20 +chrX 4256257 . G A 2644 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.22;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.22;SOR=0.872;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1087,0:0,0,14,20 1/1:0,49:49:99:1587,146,0:0,0,24,25 +chrX 4256331 . T G 2647 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.49;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.49;SOR=0.765;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1176,0:0,0,17,20 1/1:0,48:48:99:1501,144,0:0,0,24,24 +chrX 4256411 . G T 2819 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.38;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=0.739;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:814,0:0,0,14,11 1/1:0,63:63:99:2035,189,0:0,0,29,34 +chrX 4257010 . A C 2579 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=31.43;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.43;SOR=1.179;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:694,0:0,0,8,14 1/1:0,61:61:99:1915,183,0:0,0,25,36 +chrX 4257344 . G A 791 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.03;BaseQRankSum=0.515;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=6.775;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.601;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,586 0/1:32,31:63:99:.:821,0,852:20,12,14,17 +chrX 4257463 . G A 2860 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.11;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.11;SOR=0.935;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1114,0:0,0,17,19 1/1:0,54:54:99:1776,162,0:0,0,23,31 +chrX 4258370 . G A 2877 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=33.03;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.03;SOR=0.887;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:956,0:0,0,13,16 1/1:0,59:59:99:1951,177,0:0,0,27,32 +chrX 4259292 . T C 2699 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.49;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=0.741;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:670,0:0,0,7,14 1/1:0,63:63:99:2059,189,0:0,0,34,29 +chrX 4259733 . CATATA C 3472.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=38.15;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.90;SOR=0.303;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1286,0:0,0,13,16 1/1:1,50:51:99:2226,129,0:0,1,23,27 +chrX 4262530 . G A 2421 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=33.12;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.12;SOR=0.804;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:869,0:0,0,9,16 1/1:0,49:49:99:1582,146,0:0,0,26,23 +chrX 4262728 . G GGGAGACC 3154.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=38.51;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=0.779;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1305,0:0,0,19,10 1/1:0,42:42:99:1889,126,0:0,0,18,24 +chrX 4262974 . G GAA 1100.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=30.00;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;QD=30.00;SOR=0.914;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:329,0:0,0,7,4 1/1:0,27:27:80:811,80,0:0,0,14,13 +chrX 4263753 . T C 2930 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.89;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=0.738;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1114,0:0,0,21,13 1/1:0,56:56:99:1846,168,0:0,0,25,31 +chrX 4264015 . T C 3293 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=102;AS_QD=32.58;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.58;SOR=0.859;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,45:45:99:1518,0:0,0,20,25 1/1:0,57:57:99:1805,170,0:0,0,27,30 +chrX 4264367 . G A 3052 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=32.79;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=1.143;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1082,0:0,0,14,20 1/1:0,60:60:99:2000,180,0:0,0,24,36 +chrX 4264392 . T A 2971 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=31.93;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.93;SOR=0.780;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1057,0:0,0,15,18 1/1:0,61:61:99:1944,182,0:0,0,30,31 +chrX 4265348 . G C 806 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=17.06;BaseQRankSum=-0.259;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=0.723;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,393 0/1:19,30:49:99:.:836,0,468:9,10,14,16 +chrX 4266308 . A G 2196 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=31.35;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.35;SOR=1.042;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:779,0:0,0,15,10 1/1:0,46:46:99:1447,137,0:0,0,26,20 +chrX 4267403 . A G 957 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.42;BaseQRankSum=1.819;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.4;SOR=0.713;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,25:26:99:733,0:0,1,9,16 0/1:24,14:38:99:254,0,676:9,15,5,9 +chrX 4267777 . T TATAATATATAGTATATTATAATAATATAGC 563.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.23;BaseQRankSum=1.465;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=23.457;MQ=49.51;MQRankSum=0.653;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.809;SOR=1.524;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,10:11:99:296,0:0,1,8,2 0/1:11,13:24:99:307,0,282:2,9,8,5 +chrX 4268498 . A T,AT 425 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=18,2;AS_QD=11.67,0.00;BaseQRankSum=-0.789;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.204;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.465;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,387,387 0/1:21,18,2:41:99:.:455,0,644,491,503,1077:12,9,10,10 +chrX 4268624 . G A 1519 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=19.12;BaseQRankSum=2.068;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.726;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,31:32:99:937,0:0,1,15,16 0/1:25,24:49:99:612,0,642:12,13,10,14 +chrX 4270565 . A G 803 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=15.72;BaseQRankSum=0.477;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.054;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.759;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,520 0/1:23,30:53:99:.:833,0,590:12,11,14,16 +chrX 4270616 . A G 665 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.63;BaseQRankSum=-0.237;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.070;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.906;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,520 0/1:24,27:51:99:.:695,0,629:11,13,11,16 +chrX 4271013 . A AAAT 1356.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=23.27;BaseQRankSum=0.396;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=7.060;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.651;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:646,0:0,0,10,6 0/1:24,20:44:99:750,0,947:15,9,6,14 +chrX 4271470 . C T 1623 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=22.96;BaseQRankSum=1.587;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=12.296;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.96;ReadPosRankSum=-1.872;SOR=1.566;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:958,0:0,0,20,9 0/1:19,24:43:99:695,0,481:8,11,16,8 +chrX 4273153 . TACACAC T,TACACACACACAC 2677.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=45,20;AS_QD=26.96,32.72;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.80;SOR=0.925;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28,0:28:99:1240,0,1240:0,0,16,12 1/2:0,17,20:37:99:1477,792,872,692,0,633:0,0,20,17 +chrX 4273361 . A T 1885 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=21.04;BaseQRankSum=0.876;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.843;SOR=0.714;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1056,0:0,0,10,22 0/1:28,31:59:99:859,0,732:13,15,19,12 +chrX 4274169 . C T 2778 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=32.65;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.65;SOR=0.947;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:933,0:0,0,14,14 1/1:0,58:58:99:1875,173,0:0,0,34,24 +chrX 4274773 . A T 576 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.43;BaseQRankSum=2.943;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.598;SOR=0.603;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,506 0/1:31,22:53:99:.:606,0,818:12,19,9,13 +chrX 4275168 . G A 756 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=14.56;BaseQRankSum=-1.295;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.389;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.27;SOR=1.061;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:32:99:32:.:.:0,506 0|1:24,30:54:99:.:0|1:4275168_G_A:786,0,887:4275168:15,9,21,9 +chrX 4275176 . T C 1620 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=18.33;BaseQRankSum=0.422;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=4.452;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.81;SOR=0.331;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:1096,0:.:0,0,20,15 0|1:33,22:55:99:1|0:4275168_G_A:554,0,1268:4275168:24,9,15,7 +chrX 4275927 . C CA 642.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=12.18;BaseQRankSum=1.037;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.124;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.459;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22:23:99:420,0:0,1,10,12 0/1:16,17:33:99:262,0,271:10,6,10,7 +chrX 4277714 . CTTT C,* 576.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=17,0;AS_QD=28.00,0.00;BaseQRankSum=-0.674;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=2.622;MQ=57.96;MQRankSum=0.549;QD=28.00;ReadPosRankSum=2.881;SOR=1.981;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,12,0:12:99:.:.:433,0,644:.:0,0,2,4 0|1:5,5,0:10:99:0|1:4277714_CTTT_*:183,0,142,237,197,888:4277714:2,3,0,5 +chrX 4277715 . T *,C,TTCC 597 . AC=2,0,1;AF=0.667,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,1,1;AS_QD=0.00,29.53,35.15;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.27;QD=89.57;SOR=2.833;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12,0,0:12:99:433,0,644,644:0,0,2,4 1/3:0,5,1,1:7:19:627,40,79,395,19,680,294,0,495,574:0,0,0,7 +chrX 4277718 . CTTTCT *,C,CTTCT 564.97 . AC=0,1,1;AF=0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,6,5;AS_QD=0.00,31.13,17.10;BaseQRankSum=0.674;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=2.622;MQ=57.96;MQRankSum=0.549;QD=37.75;ReadPosRankSum=2.881;SOR=1.981;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,6,0:6:99:433,854,0,644:0,0,2,4 0/3:5,0,0,5:10:99:171,225,876,208,512,563,0,197,178,245:2,3,0,5 +chrX 4277719 . T *,C 682 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,2;AS_QD=0.00,29.97;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.36;QD=101.71;SOR=2.833;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,6,0:6:99:.:.:433,0,644:.:0,0,2,4 1|2:0,5,2:7:83:1|0:4277714_CTTT_*:712,83,119,225,0,500:4277714:0,0,0,7 +chrX 4277723 . T *,C 734 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,10;AS_QD=25.10,27.97;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.27;QD=76.40;SOR=3.258;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,6,0:6:99:433,0,644:0,0,2,4 2/2:0,0,10:10:39:764,431,508,52,39,0:0,0,0,10 +chrX 4277727 . T C 498 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=17.60;BaseQRankSum=0.782;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=2.315;MQ=57.88;MQRankSum=0.69;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=0.223;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12:12:99:433,0:0,0,2,4 0/1:13,5:18:95:95,0,404:2,11,0,1 +chrX 4278159 . G A 2144 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=32.94;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.94;SOR=1.112;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:774,0:0,0,14,10 1/1:0,42:42:99:1400,126,0:0,0,25,17 +chrX 4279159 . G T 3029 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=32.54;BaseQRankSum=2.354;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=3.297;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.54;ReadPosRankSum=-1.388;SOR=0.466;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,29:30:99:937,0:1,0,15,14 1/1:0,64:64:99:2122,192,0:0,0,28,36 +chrX 4280144 . T C 2783 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.33;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.33;SOR=0.972;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:962,0:0,0,13,17 1/1:0,57:57:99:1851,171,0:0,0,25,32 +chrX 4280681 . T C 1959 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=31.57;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.57;SOR=0.790;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:834,0:0,0,13,13 1/1:0,37:37:99:1155,109,0:0,0,17,20 +chrX 4281419 . T C 1522 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.16;BaseQRankSum=0.7;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.915;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=0.555;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:735,0:0,0,10,12 0/1:25,30:55:99:817,0,633:11,14,15,15 +chrX 4281527 . A T 1856 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.09;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.65;QD=33.09;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:650,0:0,0,8,12 1/1:0,37:37:99:1236,111,0:0,0,19,18 +chrX 4281547 . C CTT 1130.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=27.86;BaseQRankSum=-0.443;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=3.680;MQ=59.42;MQRankSum=3.88;QD=27.86;ReadPosRankSum=1.672;SOR=0.779;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:406,0:0,0,5,9 1/1:1,27:28:53:764,53,0:1,0,12,15 +chrX 4282011 . A T 2385 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.64;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.64;SOR=1.209;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:774,0:0,0,11,13 1/1:0,50:50:99:1641,150,0:0,0,18,32 +chrX 4283127 . A T 2403 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=31.60;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.60;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1060,0:0,0,16,18 1/1:0,43:43:99:1373,128,0:0,0,19,24 +chrX 4283234 . C T 1342 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=18.29;BaseQRankSum=2.276;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=3.202;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.29;ReadPosRankSum=-0.05;SOR=1.154;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1016,0:0,0,19,12 0/1:30,14:44:99:356,0,776:15,15,8,6 +chrX 4285013 . T G 771 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.35;BaseQRankSum=-0.128;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=9.192;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.35;ReadPosRankSum=-1.095;SOR=1.017;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,491 0/1:29,31:60:99:.:801,0,741:18,11,12,19 +chrX 4285135 . G A 2622 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.15;BaseQRankSum=2.758;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.15;ReadPosRankSum=-1.464;SOR=0.425;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:764,0:0,0,11,11 1/1:1,57:58:99:1888,164,0:0,1,21,36 +chrX 4285961 . C T 998 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=33.16;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.16;SOR=1.402;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:1028,0:0,0,11,20 0/0:.:60:60:60:0,60,883 +chrX 4286450 . T A 2841 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.38;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;QD=33.38;SOR=1.005;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:950,0:0,0,15,13 1/1:0,58:58:99:1921,174,0:0,0,34,24 +chrX 4286717 . T C 648 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.30;BaseQRankSum=-1.813;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.66;SOR=0.743;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,874 0/1:32,28:60:99:.:678,0,882:19,13,17,11 +chrX 4286939 . C A 2749 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.69;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=32.69;SOR=0.716;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1022,0:0,0,16,16 1/1:0,53:53:99:1757,159,0:0,0,26,27 +chrX 4287418 . T C 2362 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=35.73;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;QD=39.21;SOR=1.022;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1318,0:0,0,15,15 1/1:0,31:31:93:1074,93,0:0,0,20,11 +chrX 4287419 . G GCACACACA,GCGCGCACACACA 2213.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=15,32;AS_QD=33.24,28.36;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.32;QD=47.94;SOR=1.378;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,24:24:99:1214,1283,0:0,0,14,10 1/2:0,15,8:23:99:1039,295,291,616,0,844:0,0,16,7 +chrX 4287532 . A G 761 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=20.28;BaseQRankSum=-0.232;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=7.588;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.625;SOR=1.429;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,749 0/1:12,27:39:99:.:791,0,290:7,5,9,18 +chrX 4287677 . G T 2719 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=33.12;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.12;SOR=0.987;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1306,0:0,0,25,14 1/1:0,44:44:99:1443,132,0:0,0,22,22 +chrX 4287855 . A AAGG 2947.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=37.61;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.58;SOR=0.917;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:981,0:0,0,7,15 1/1:0,45:45:99:2006,135,0:0,0,23,22 +chrX 4287896 . C T 694 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.09;BaseQRankSum=-0.722;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.742;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:22:99:22:0,575 0/1:19,26:45:99:.:724,0,516:10,9,14,12 +chrX 4288244 . C G 2054 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=32.06;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.06;SOR=0.925;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:824,0:0,0,14,11 1/1:0,40:40:99:1260,120,0:0,0,22,18 +chrX 4288425 . G C 2242 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.46;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=1.329;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:640,0:0,0,11,8 1/1:0,51:51:99:1632,153,0:0,0,33,18 +chrX 4289152 . G A 840 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=17.76;BaseQRankSum=1.916;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=10.663;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.616;SOR=1.149;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,596 0/1:19,30:49:99:.:870,0,473:7,12,19,11 +chrX 4289743 . C T 649 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.79;BaseQRankSum=1.973;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=7.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=1.959;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,596 0/1:19,24:43:99:.:679,0,482:10,9,18,6 +chrX 4289935 . A AGT 1469.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=26.95;BaseQRankSum=0.251;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=9.204;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=26.95;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.045;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:619,0:0,0,12,8 1/1:4,32:36:29:890,29,0:4,0,15,17 +chrX 4290338 . G A 2101 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=23.68;BaseQRankSum=0.143;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.691;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1398,0:0,0,21,21 0/1:21,27:48:99:733,0,536:11,10,15,12 +chrX 4290557 . G A 2378 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.99;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.99;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1018,0:0,0,12,19 1/1:0,42:42:99:1390,126,0:0,0,22,20 +chrX 4290774 . G A 1792 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=21.44;BaseQRankSum=0.359;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=6.272;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.395;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:988,0:0,0,17,12 0/1:25,31:56:99:834,0,641:9,16,14,17 +chrX 4290860 . C A 2540 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.13;BaseQRankSum=2.286;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.120;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.13;ReadPosRankSum=-1.606;SOR=0.343;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,26:27:99:817,0:1,0,15,11 1/1:0,53:53:99:1753,159,0:0,0,23,30 +chrX 4291176 . TTATATGTAAC T 1863.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=25.72;BaseQRankSum=0.716;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.989;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.213;SOR=0.771;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1115,0:0,0,10,15 0/1:28,21:49:99:788,0,1090:15,13,11,10 +chrX 4291783 . A ATTTTTCTC 2671.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=30.48;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.44;SOR=0.793;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:913,0:0,0,11,10 1/1:0,40:40:99:1798,119,0:0,0,18,22 +chrX 4292424 . TACACACAC TAC,T 1909.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=32,13;AS_QD=29.58,31.60;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.31;SOR=0.829;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19,0:19:99:856,0,856:0,0,9,10 1/2:0,13,13:26:99:1093,411,334,393,0,316:0,0,12,14 +chrX 4292670 . G C 2247 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.53;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.53;SOR=0.941;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:923,0:0,0,14,14 1/1:0,42:42:99:1354,125,0:0,0,17,25 +chrX 4292738 . A T 1211 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=19.09;BaseQRankSum=2.377;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=3.946;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.283;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:720,0:0,0,15,9 0/1:20,21:41:99:521,0,497:13,6,8,11 +chrX 4292858 . C T 579 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.53;BaseQRankSum=-2.441;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.706;SOR=0.610;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,782 0/1:21,24:45:99:.:609,0,568:11,10,12,12 +chrX 4293031 . T TATCAATCA,TATCTATCAATCA,TATCTATCTATCTATCAATCA,TATCTATCTATCTATCTATCAATCA 1220.97 . AC=0,1,0,1;AF=0.00,0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,19,0,6;AS_QD=7.00,22.91,2.40,8.13;BaseQRankSum=-2.092;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.687;SOR=0.555;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,19,0,0:19:99:1008,873,0,941,941:0,0,9,10 0/4:25,0,0,0,6:31:99:252,212,1586,202,1337,1302,192,1179,1150,1097,0,987,971,823,939:11,14,3,3 +chrX 4293034 . C CT 587.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=18.44;BaseQRankSum=2.305;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=1.377;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.595;SOR=0.425;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,481 0/1:13,21:34:99:.:627,0,270:8,5,11,10 +chrX 4293035 . A AATCAATCT,ATCTATCTATCAATCAATCT,ATCTATCTATCTATCAATCAATCT 729.97 . AC=0,1,0;AF=0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=0,18,0;AS_QD=3.08,24.81,11.85;BaseQRankSum=1.808;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.81;ReadPosRankSum=1.422;SOR=0.509;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,481,481,481 0/2:13,0,18,0:31:99:.:769,729,1533,0,480,401,615,1112,329,1070:8,5,10,8 +chrX 4293152 . C CATCT 2964.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=34.49;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.84;SOR=0.784;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:940,0:0,0,8,13 1/1:0,46:46:99:2064,138,0:0,0,24,22 +chrX 4293491 . T TTATCTATCTATCTATCTATC 2644.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=27.58;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;QD=44.73;SOR=1.071;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:1028,0:0,0,11,12 1/1:0,37:37:99:1656,110,0:0,0,24,13 +chrX 4293569 . GTCTGTCTA G 679.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=31.10;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.77;QD=39.94;SOR=1.493;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,18:18:99:.:719,0:0,0,12,6 0/0:.:40:83:40:0,83,1101 +chrX 4293573 . GTCTA *,G,ATCTA 1174 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,12,25;AS_QD=26.11,33.92,29.56;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=0.884;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,0,0:18:99:719,0,719,719:0,0,12,6 2/3:0,0,12,25:37:99:1204,1276,1485,797,939,968,465,616,0,653:0,0,18,19 +chrX 4293640 . C CATCT,CATCTATCT 1105.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=14,14;AS_QD=22.21,18.68;BaseQRankSum=0.323;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.345;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.26;ReadPosRankSum=-1.265;SOR=0.382;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,0:14:99:622,0,623:0,0,3,11 0/2:14,0,14:28:99:523,566,1137,0,571,529:4,10,8,6 +chrX 4294608 . A G 2711 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.25;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.25;SOR=0.716;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:862,0:0,0,11,15 1/1:0,59:59:99:1879,176,0:0,0,31,28 +chrX 4294914 . A G 810 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.17;BaseQRankSum=0.568;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=1.984;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=0.468;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,556 0/1:37,32:69:99:.:840,0,999:21,16,16,16 +chrX 4296151 . GTAGATAGATAGA GTAGA,G 2256.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=39,16;AS_QD=30.58,32.82;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.75;SOR=0.804;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,0:14:99:622,0,622:0,0,5,9 1/2:0,25,16:41:99:1674,664,588,1015,0,1099:0,0,21,20 +chrX 4296635 . T A 589 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.48;BaseQRankSum=-0.606;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=1.260;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.926;SOR=1.051;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:99:23:0,397 0/1:16,24:40:99:.:619,0,396:8,8,10,14 +chrX 4296820 . C T 2068 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=31.79;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.79;SOR=0.818;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:770,0:0,0,13,10 1/1:0,43:43:99:1328,129,0:0,0,18,25 +chrX 4297195 . T A 525 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=15.86;BaseQRankSum=0.272;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=1.301;MQ=59.81;MQRankSum=-0.808;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.834;SOR=0.974;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,576 0/1:15,20:35:99:.:555,0,395:7,8,8,12 +chrX 4297545 . G T 1641 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=19.66;BaseQRankSum=1.696;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.859;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.66;ReadPosRankSum=1.303;SOR=0.884;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:943,0:0,0,11,17 0/1:30,27:57:99:728,0,740:15,15,19,8 +chrX 4297911 . T C 2675 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.99;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.99;SOR=0.902;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:794,0:0,0,10,14 1/1:0,58:58:99:1911,174,0:0,0,27,31 +chrX 4298667 . C T 1871 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=33.35;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.35;SOR=0.728;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:561,0:0,0,13,4 1/1:0,40:40:99:1340,120,0:0,0,16,24 +chrX 4298993 . C T 967 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.62;BaseQRankSum=4.588;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=6.930;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.62;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=0.579;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,19:20:99:650,0:1,0,9,10 0/1:26,14:40:99:347,0,689:16,10,6,8 +chrX 4299325 . A AAG 2365.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=34.86;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.86;SOR=0.844;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:815,0:0,0,11,12 1/1:0,46:46:99:1590,138,0:0,0,21,25 +chrX 4299727 . T C 2203 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.90;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.90;SOR=1.011;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:908,0:0,0,12,16 1/1:0,42:42:99:1325,126,0:0,0,18,24 +chrX 4299792 . GTTGTTT G 2415.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=32.78;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=1.061;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:1159,0:0,0,10,16 1/1:0,29:29:88:1296,88,0:0,0,13,16 +chrX 4300313 . T C 2232 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.78;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.78;SOR=1.054;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:754,0:0,0,13,10 1/1:0,46:46:99:1508,137,0:0,0,27,19 +chrX 4300811 . C T 2068 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.78;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.78;SOR=0.822;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:610,0:.:0,0,11,9 1|1:0,44:44:99:0|1:4300811_C_T:1488,132,0:4300811:0,0,23,21 +chrX 4300924 . C T 663 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=16.50;BaseQRankSum=-0.675;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.50;ReadPosRankSum=1.756;SOR=0.678;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,605 0/1:17,25:42:99:.:693,0,445:8,9,13,12 +chrX 4301881 . G C 2480 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.60;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:770,0:0,0,10,13 1/1:0,54:54:99:1740,161,0:0,0,25,29 +chrX 4301957 . C T 515 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=11.35;BaseQRankSum=-1.179;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=6.121;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=1.071;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:18:99:18:0,412 0/1:27,21:48:99:.:545,0,773:16,11,8,13 +chrX 4302048 . T C 1751 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=32.98;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.98;SOR=0.846;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:456,0:0,0,4,10 1/1:0,40:40:99:1325,120,0:0,0,21,19 +chrX 4302287 . C G 1785 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=31.84;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.84;SOR=1.140;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:501,0:0,0,10,6 1/1:0,41:41:99:1314,122,0:0,0,24,17 +chrX 4302678 . A G 2402 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.86;BaseQRankSum=2.902;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.129;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.86;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=0.353;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:764,0:0,0,12,11 1/1:1,50:51:99:1668,143,0:0,1,26,24 +chrX 4303143 . C G 2073 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=31.39;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.39;SOR=0.990;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:645,0:0,0,13,8 1/1:0,46:46:99:1458,136,0:0,0,25,21 +chrX 4306408 . T A 2183 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.07;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.07;SOR=1.131;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:813,0:0,0,12,15 1/1:0,42:42:99:1400,125,0:0,0,16,26 +chrX 4309686 . T C 2358 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=29.85;BaseQRankSum=-0.574;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.590;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.85;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.682;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:777,0:0,0,12,14 1/1:1,53:54:99:1611,126,0:0,1,33,20 +chrX 4311880 . A C 2414 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=30.94;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.94;SOR=0.770;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:803,0:0,0,16,10 1/1:0,53:53:99:1641,158,0:0,0,25,28 +chrX 4312591 . C T 3123 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=33.54;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.54;SOR=0.736;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:981,0:0,0,13,17 1/1:0,64:64:99:2172,192,0:0,0,35,29 +chrX 4314292 . CA C,AA 370 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=26,3;AS_QD=10.00,0.00;BaseQRankSum=1.074;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=10.051;MQ=59.05;MQRankSum=2.446;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.222;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,12,0:13:99:208,0,225:0,1,7,5 0/1:13,14,3:30:99:192,0,257,220,191,926:11,2,7,10 +chrX 4314461 . G GAA 1601.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=30.39;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.20;QD=30.39;SOR=0.693;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:465,0:0,0,7,8 1/1:0,39:39:99:1176,117,0:0,0,20,19 +chrX 4316625 . CT C 740.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=15.60;BaseQRankSum=-0.306;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.093;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=0.588;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,381 0/1:25,25:50:99:.:780,0,784:11,14,13,12 +chrX 4319883 . CA C 2550.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=31.96;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.48;SOR=1.340;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:821,0:0,0,7,16 1/1:0,50:50:99:1769,150,0:0,0,20,30 +chrX 4321790 . A T 2141 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.40;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.40;SOR=1.146;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:697,0:0,0,8,14 1/1:0,45:45:99:1474,135,0:0,0,19,26 +chrX 4326634 . G T 1092 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=33.00;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=0.941;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,34:34:99:.:1122,0:0,0,15,19 0/0:.:47:37:46:0,37,1087 +chrX 4329120 . A C 2390 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=31.43;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.43;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:947,0:0,0,14,17 1/1:0,46:46:99:1473,138,0:0,0,28,18 +chrX 4332478 . T G 604 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.21;BaseQRankSum=-0.065;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.127;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.441;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,481 0/1:25,23:48:99:.:634,0,704:10,15,11,12 +chrX 4334424 . T A 2841 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=31.55;BaseQRankSum=-0.312;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=2.969;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.55;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.166;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,30:31:99:928,0:0,1,13,17 1/1:1,59:60:99:1943,146,0:0,1,26,33 +chrX 4335626 . CTCTA ATCTA,C 103 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=4,2;AS_QD=6.24,0.11;BaseQRankSum=0.841;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=4.669;MQ=57.88;MQRankSum=0.838;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.266;SOR=1.137;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,4,0:4:99:131,0,132:0,0,2,2 0/2:17,0,2:19:2:2,52,572,0,520,514:6,11,2,0 +chrX 4335628 . C A,CTATA,* 445 . AC=1,0,1;AF=0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=4,0,0;AS_QD=29.14,32.21,31.56;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=4.669;MQ=59.01;QD=118.75;SOR=1.137;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,4,0,0:4:99:475,0,306,391:0,0,2,2 0/3:17,0,0,2:19:2:2,52,572,52,572,572,0,520,520,514:6,11,2,0 +chrX 4335630 . A *,C 201 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,6;AS_QD=0.00,19.25;BaseQRankSum=0.605;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=10.710;MQ=57.08;MQRankSum=-0.293;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.020;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,253,253 0/2:6,2,6:14:41:.:231,41,237,0,43,278:0,6,4,4 +chrX 4343484 . G T 1891 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=21.34;BaseQRankSum=-0.358;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=10.074;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.166;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1117,0:0,0,17,17 0/1:26,30:56:99:804,0,685:7,19,14,16 +chrX 4343750 . C T 2636 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.33;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.33;SOR=0.743;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:919,0:0,0,12,15 1/1:0,53:53:99:1747,159,0:0,0,27,26 +chrX 4343902 . T C 2958 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.48;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.48;SOR=0.693;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:943,0:0,0,12,18 1/1:0,62:62:99:2045,186,0:0,0,34,28 +chrX 4346468 . C G 558 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=13.36;BaseQRankSum=1.657;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.714;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,535 0/1:23,21:44:99:.:588,0,602:12,11,10,11 +chrX 4346846 . C G 2733 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.51;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.51;SOR=1.375;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1076,0:0,0,18,15 1/1:0,52:52:99:1687,156,0:0,0,36,16 +chrX 4349936 . A G 2604 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.34;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.34;SOR=0.770;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:933,0:0,0,17,11 1/1:0,51:51:99:1701,153,0:0,0,24,27 +chrX 4351881 . C T 3183 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=32.79;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=1.426;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1174,0:0,0,12,25 1/1:0,61:61:99:2039,183,0:0,0,23,38 +chrX 4352640 . C T 2809 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=33.01;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.01;SOR=1.005;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1280,0:0,0,23,17 1/1:0,46:46:99:1559,138,0:0,0,26,20 +chrX 4356126 . T A 2946 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.35;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.35;SOR=0.782;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:951,0:0,0,16,14 1/1:0,62:62:99:2025,186,0:0,0,32,30 +chrX 4358278 . C CAA,CAAA 841.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,5;AS_QD=31.74,34.06;BaseQRankSum=1.374;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.52;MQRankSum=0;QD=33.88;ReadPosRankSum=-0.653;SOR=0.859;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,9,0:10:99:224,0,254:1,0,3,6 1/2:1,10,5:16:46:657,99,46,221,0,194:0,1,8,7 +chrX 4358552 . A G 436 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=10.84;BaseQRankSum=-2.064;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=2.600;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.387;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,506 0/1:25,18:43:99:.:466,0,738:10,15,9,9 +chrX 4359122 . C T 3301 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=33.31;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.31;SOR=1.007;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1281,0:0,0,22,16 1/1:0,62:62:99:2050,186,0:0,0,35,27 +chrX 4359413 . G A 2804 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=32.95;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.95;SOR=0.839;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1186,0:0,0,21,16 1/1:0,49:49:99:1648,147,0:0,0,25,24 +chrX 4360666 . A G 3196 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=31.94;BaseQRankSum=-0.544;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=3.231;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.94;ReadPosRankSum=-1.516;SOR=0.416;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:988,0:0,0,11,18 1/1:1,71:72:99:2238,181,0:1,0,36,35 +chrX 4361849 . C T 3134 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=33.31;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.31;SOR=0.714;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:898,0:0,0,13,15 1/1:0,67:67:99:2266,202,0:0,0,34,33 +chrX 4367799 . C A 2978 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=31.66;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.66;SOR=1.053;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1149,0:0,0,18,19 1/1:0,58:58:99:1859,174,0:0,0,22,36 +chrX 4370019 . A G 2892 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.47;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=0.990;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,47:47:99:1514,0:0,0,29,18 1/1:0,43:43:99:1408,129,0:0,0,22,21 +chrX 4370747 . A G 3208 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=32.38;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.38;SOR=1.059;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1007,0:0,0,18,14 1/1:0,68:68:99:2231,204,0:0,0,40,28 +chrX 4376359 . A G 2059 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=32.64;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;QD=32.64;SOR=0.693;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,12,13 1/1:0,39:39:99:1260,117,0:0,0,20,19 +chrX 4376455 . A G 2678 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.24;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.24;SOR=0.843;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:868,0:0,0,13,14 1/1:0,57:57:99:1840,170,0:0,0,32,25 +chrX 4376517 . A G 2200 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.86;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.86;SOR=0.750;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:501,0:0,0,6,10 1/1:0,54:54:99:1729,162,0:0,0,30,24 +chrX 4377694 . TTAAGA T 3803.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=29.74;BaseQRankSum=-0.59;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.317;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.67;ReadPosRankSum=1.576;SOR=0.483;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32:33:99:1382,0:1,0,12,20 1/1:0,55:55:99:2461,166,0:0,0,28,27 +chrX 4380230 . G T 2689 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.37;BaseQRankSum=2.42;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.37;ReadPosRankSum=-1.662;SOR=0.261;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1171,0:0,0,18,17 1/1:1,48:49:99:1548,137,0:0,1,24,24 +chrX 4381040 . A G 2911 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.97;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.97;SOR=0.878;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:978,0:0,0,16,14 1/1:0,62:62:99:1963,185,0:0,0,34,28 +chrX 4381478 . A C 2645 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=33.86;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.86;SOR=1.207;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:853,0:0,0,9,17 1/1:0,53:53:99:1822,159,0:0,0,22,31 +chrX 4381622 . A G 2645 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.23;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.23;SOR=0.717;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:893,0:0,0,17,11 1/1:0,55:55:99:1782,165,0:0,0,25,30 +chrX 4383022 . CTTTTTTTTTTTT C 1167.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=31.55;BaseQRankSum=-1.212;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=18.120;MQ=59.53;MQRankSum=1.328;QD=35.50;ReadPosRankSum=0.041;SOR=1.585;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:487,0:0,0,4,7 0/1:4,19:23:0:720,0,0:4,0,5,14 +chrX 4383868 . C A 538 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.91;BaseQRankSum=0.302;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=6.095;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=1.111;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:19:20:18:0,20 0/1:23,21:44:99:.:568,0,602:10,13,13,8 +chrX 4387103 . T A 2608 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=30.67;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.67;SOR=1.127;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:713,0:0,0,7,16 1/1:0,63:63:99:1925,188,0:0,0,28,35 +chrX 4387485 . CA C 1950.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=25.51;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=4.007;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.51;SOR=0.974;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:855,0:0,0,18,15 1/1:1,44:45:99:1135,113,0:0,1,29,15 +chrX 4388206 . G A 2832 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=31.80;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.80;SOR=0.784;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1012,0:0,0,15,16 1/1:0,59:59:99:1850,176,0:0,0,32,27 +chrX 4389716 . G A 1919 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=31.95;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.35;QD=31.95;SOR=0.941;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:696,0:0,0,9,14 1/1:0,38:38:99:1253,112,0:0,0,18,20 +chrX 4390490 . T C 2156 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=30.79;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.79;SOR=0.840;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1170,0:0,0,19,20 1/1:0,32:32:96:1016,96,0:0,0,14,18 +chrX 4390782 . G GATATAT,GATATATAT 221.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=4,0;AS_QD=33.50,30.37;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=65.25;SOR=3.258;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,4,0:4:99:.:261,0,136:0,0,0,4 0/0:.:27:39:23:0,39,569,39,569,569 +chrX 4390820 . TATATAC T 119.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=11.36;BaseQRankSum=0.566;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=10.710;MQ=59.41;MQRankSum=0.152;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.204;SOR=3.912;VarDP=14 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:14:35:13:0,35 0/1:8,6:14:99:.:159,0,224:4,4,0,6 +chrX 4390824 . TAC *,T 464.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,4;AS_QD=0.00,30.16;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.41;QD=50.40;SOR=3.258;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:14:35:13:0,35,35 1/2:0,6,4:10:91:.:504,91,221,211,0,209:0,0,1,9 +chrX 4390826 . C T,* 278 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=10,0;AS_QD=30.80,26.10;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.87;QD=30.80;SOR=3.912;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,10,0:10:99:308,0,288:0,0,0,4 2/2:0,0,4:10:2:504,421,490,211,242,209:0,0,1,9 +chrX 4392582 . C CAA,CAAA 1106.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,7;AS_QD=34.59,25.71;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.57;QD=40.93;SOR=1.609;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0:17:99:406,0,407:0,0,6,11 1/2:0,4,7:11:45:740,178,101,121,0,45:0,0,3,8 +chrX 4393753 . G T 3118 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=99;AS_QD=31.80;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.80;SOR=0.713;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1184,0:0,0,20,18 1/1:0,61:61:99:1964,183,0:0,0,29,32 +chrX 4396140 . C CTG 3886.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=31.31;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.11;SOR=1.141;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1259,0:0,0,15,13 1/1:0,61:61:99:2667,183,0:0,0,21,40 +chrX 4398508 . A G 2882 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=30.65;BaseQRankSum=-0.533;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.757;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.65;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.793;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,33:34:99:1022,0:0,1,17,16 1/1:0,61:61:99:1890,183,0:0,0,38,23 +chrX 4402447 . G C 2231 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=30.97;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.97;SOR=0.836;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:753,0:0,0,14,11 1/1:0,48:48:99:1508,144,0:0,0,25,23 +chrX 4402603 . A T,ATT 526 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=16,4;AS_QD=24.17,6.91;BaseQRankSum=-0.886;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=14.075;MQ=56.62;MQRankSum=-0.827;QD=20.59;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.749;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9,0:9:99:391,0,392:0,0,4,5 0/1:7,7,4:18:89:165,0,329,89,96,257:0,5,8,3 +chrX 4402605 . A T 1030 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=21.41;BaseQRankSum=0;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.69;MQRankSum=-0.488;QD=39.26;ReadPosRankSum=1.737;SOR=0.223;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,9:9:99:.:.:391,0:.:0,0,4,5 1|1:1,17:18:49:0|1:4402605_A_T:669,49,0:4402605:0,1,9,8 +chrX 4402607 . A T 1030 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=30.80;BaseQRankSum=0;DP=49;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.55;MQRankSum=-0.488;QD=39.26;ReadPosRankSum=1.739;SOR=0.223;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,9:9:99:.:.:391,0:.:0,0,4,5 1|1:1,17:18:49:0|1:4402605_A_T:669,49,0:4402605:0,1,9,8 +chrX 4402609 . A T,ATTTTTTTT,ATTTTTT 1806 . AC=3,0,0;AF=1.00,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=26,0,0;AS_QD=28.40,28.40,31.86;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.47;QD=70.62;SOR=0.693;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9,0,0:9:99:626,0,485,556:0,0,4,5 1/1:0,17,0,0:17:68:1210,79,0,820,68,953,855,74,881,987:0,0,9,8 +chrX 4403737 . C T 3320 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=33.50;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.50;SOR=1.345;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:849,0:0,0,7,18 1/1:0,75:75:99:2501,225,0:0,0,30,45 +chrX 4404552 . T C 2689 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.76;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.81;QD=32.76;SOR=0.717;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1077,0:0,0,18,16 1/1:0,49:49:99:1642,147,0:0,0,23,26 +chrX 4404978 . T C 886 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=30.53;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.53;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:916,0:0,0,16,14 0/0:.:49:68:49:0,68,1087 +chrX 4406492 . TGATAGATAGATA T,TGATAGATA 2350.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=25,29;AS_QD=27.73,27.04;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=44.26;SOR=0.931;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25,0:25:99:1106,0,1106:0,0,12,13 2/2:0,0,29:29:88:1284,1284,1284,88,88,0:0,0,12,17 +chrX 4407122 . G A 2864 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=33.26;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.26;SOR=0.972;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:878,0:0,0,13,14 1/1:0,60:60:99:2016,180,0:0,0,25,35 +chrX 4408062 . C G 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.16;BaseQRankSum=1.109;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.683;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.600;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,582 0/1:32,26:58:99:.:705,0,898:13,19,14,12 +chrX 4410243 . G C 2387 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=29.84;BaseQRankSum=1.347;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=0;QD=29.84;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.289;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:742,0:0,0,12,13 1/1:1,55:56:99:1675,143,0:0,1,25,30 +chrX 4410618 . A G 673 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=33.48;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.37;QD=33.48;SOR=1.508;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:703,0:0,0,14,7 0/0:.:54:20:38:0,20,1031 +chrX 4411286 . C T 2571 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.92;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.92;SOR=0.881;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:854,0:0,0,14,12 1/1:0,53:53:99:1747,159,0:0,0,29,24 +chrX 4411795 . A ATT 815.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=25.15;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.19;QD=25.15;SOR=0.693;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,278 1/1:0,34:34:99:.:855,101,0:0,0,17,17 +chrX 4412743 . C G 233 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=5.48;BaseQRankSum=-1.003;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.258;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.48;ReadPosRankSum=1.567;SOR=0.707;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,278 0/1:35,13:48:99:.:263,0,1018:16,19,7,6 +chrX 4415303 . CA C 1484.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=24.98;BaseQRankSum=-0.659;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.46;MQRankSum=0;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.888;SOR=0.314;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:518,0:0,0,10,10 1/1:1,40:41:99:1006,99,0:0,1,17,23 +chrX 4416778 . T G 2409 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.52;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.52;SOR=1.319;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:912,0:0,0,12,17 1/1:0,46:46:99:1527,138,0:0,0,16,30 +chrX 4420125 . A G 1889 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=30.95;BaseQRankSum=-0.162;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.95;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.563;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,20:21:99:624,0:1,0,14,6 1/1:0,41:41:99:1295,123,0:0,0,25,16 +chrX 4420966 . A C 2484 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=33.52;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.52;SOR=0.832;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:613,0:0,0,12,7 1/1:0,56:56:99:1901,168,0:0,0,28,28 +chrX 4423418 . G A 2337 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.42;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;QD=32.42;SOR=0.963;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:804,0:0,0,7,17 1/1:0,49:49:99:1563,146,0:0,0,25,24 +chrX 4428655 . C CTCTTA 3053.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=31.73;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=0.980;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1080,0:0,0,8,16 1/1:0,45:45:99:2013,135,0:0,0,22,23 +chrX 4430001 . T C 2595 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.81;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=32.81;SOR=0.908;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:903,0:0,0,10,18 1/1:0,52:52:99:1722,156,0:0,0,26,26 +chrX 4431514 . G T 2980 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.72;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=0.982;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:973,0:0,0,16,14 1/1:0,62:62:99:2037,186,0:0,0,36,26 +chrX 4433571 . G A 3022 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=32.47;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=0.874;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1077,0:0,0,18,15 1/1:0,61:61:99:1975,183,0:0,0,25,36 +chrX 4435170 . G GCA 625.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.22;BaseQRankSum=0.723;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=1.202;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.22;ReadPosRankSum=-1.918;SOR=0.963;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,456 0/1:18,23:41:99:.:665,0,485:9,9,13,10 +chrX 4438199 . AT A 1995.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=29.93;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=29.93;SOR=0.693;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:474,0:0,0,10,6 1/1:0,52:52:99:1561,156,0:0,0,24,28 +chrX 4442668 . TAC T 1622.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=33.24;BaseQRankSum=-0.319;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=5.850;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=33.24;ReadPosRankSum=0.602;SOR=2.174;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:851,0:0,0,4,20 1/1:1,25:26:68:811,68,0:1,0,8,17 +chrX 4443309 . G GTA 1827.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=25.54;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.90;SOR=0.866;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:771,0:0,0,8,12 1/1:0,28:28:84:1096,84,0:0,0,14,14 +chrX 4443931 . A G 1819 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=29.82;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.44;QD=29.82;SOR=0.899;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:722,0:0,0,10,14 1/1:0,38:38:99:1127,113,0:0,0,24,14 +chrX 4444660 . A G 2575 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.77;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.77;SOR=0.846;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:824,0:0,0,16,10 1/1:0,56:56:99:1781,167,0:0,0,22,34 +chrX 4446527 . G A 2656 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.58;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.58;SOR=0.850;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1127,0:0,0,19,15 1/1:0,46:46:99:1559,138,0:0,0,24,22 +chrX 4448051 . A G 2342 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.49;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:908,0:0,0,9,19 1/1:0,45:45:99:1464,135,0:0,0,24,21 +chrX 4448277 . G T 681 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.70;BaseQRankSum=-0.565;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.997;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,700 0/1:28,28:56:99:.:711,0,730:14,14,12,16 +chrX 4449047 . ATT A 696.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=22.30;BaseQRankSum=-1.284;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=20.739;MQ=58.75;MQRankSum=1.022;QD=22.30;ReadPosRankSum=0.47;SOR=1.393;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,11:11:99:.:.:330,0:.:0,0,5,6 0|1:5,17:22:43:0|1:4449047_ATT_A:406,0,43:4449047:5,0,4,13 +chrX 4450142 . A T 2460 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=33.65;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.65;SOR=1.061;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1017,0:0,0,16,15 1/1:0,43:43:99:1473,129,0:0,0,27,16 +chrX 4451537 . A G 1952 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.97;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.97;SOR=0.899;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:822,0:0,0,10,16 1/1:0,36:36:99:1160,108,0:0,0,18,18 +chrX 4451749 . A G 2849 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.72;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=0.887;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:854,0:0,0,14,12 1/1:0,62:62:99:2025,186,0:0,0,34,28 +chrX 4452013 . A G 2881 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.64;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.64;SOR=1.038;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:982,0:0,0,18,13 1/1:0,61:61:99:1929,182,0:0,0,35,26 +chrX 4452355 . A T 2351 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.18;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.18;SOR=0.747;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:913,0:0,0,16,12 1/1:0,46:46:99:1468,137,0:0,0,22,24 +chrX 4452720 . G A 3390 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=103;AS_QD=33.20;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.20;SOR=0.836;VarDP=103 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1067,0:0,0,18,15 1/1:0,70:70:99:2353,211,0:0,0,37,33 +chrX 4453906 . T C 2327 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=32.74;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=32.74;SOR=1.483;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:670,0:0,0,9,12 1/1:0,51:51:99:1687,153,0:0,0,16,35 +chrX 4453952 . A G 673 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.65;BaseQRankSum=-2.262;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.129;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.65;ReadPosRankSum=2.09;SOR=0.988;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:21:99:21:0,551 0/1:21,27:48:99:.:703,0,584:10,11,11,16 +chrX 4453955 . G A,GA 1662 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=0,59;AS_QD=27.32,28.68;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;QD=28.68;SOR=1.034;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,16:16:99:479,640,0:0,0,6,10 2/2:0,0,43:43:99:1213,1213,1213,129,129,0:0,0,19,24 +chrX 4455938 . T TAAAAAAA 1112.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=34.91;BaseQRankSum=0.444;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=18.978;MQ=57.37;MQRankSum=-0.919;QD=34.91;ReadPosRankSum=-3.173;SOR=1.102;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:476,0:0,0,5,6 0/1:5,17:22:40:676,0,40:5,0,5,12 +chrX 4455979 . A C 1460 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=26.61;BaseQRankSum=3.072;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=14.292;MQ=57.99;MQRankSum=0.842;QD=26.61;ReadPosRankSum=0.214;SOR=0.027;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:571,0:0,0,10,7 1/1:6,33:39:6:919,6,0:6,0,17,16 +chrX 4458394 . G A 2247 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.53;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.53;SOR=0.811;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:893,0:0,0,14,12 1/1:0,44:44:99:1384,132,0:0,0,23,21 +chrX 4461913 . GAAGTCATTGTACAAGGAAAACATTCTGTATGCACTAAGATTTCCCAAAAGAT G 3009.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=29.75;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;QD=44.84;SOR=0.880;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:794,0:0,0,11,7 1/1:0,50:50:99:2255,153,0:0,0,26,24 +chrX 4462789 . AAAAC A 3203.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=29.44;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=1.209;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1105,0:0,0,11,14 1/1:0,49:49:99:2138,148,0:0,0,18,31 +chrX 4464620 . G A 3273 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=100;AS_QD=33.03;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.03;SOR=0.957;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1190,0:0,0,16,20 1/1:0,64:64:99:2113,192,0:0,0,28,36 +chrX 4464853 . A C 2608 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.98;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.98;SOR=0.743;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:794,0:0,0,12,12 1/1:0,56:56:99:1844,168,0:0,0,29,27 +chrX 4465139 . A AAAAG,AAAAGAAAGAAAGAAAG 1182.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=15,13;AS_QD=30.62,28.20;BaseQRankSum=0;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.05;MQRankSum=1.291;QD=42.14;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.693;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,425,425 1/2:1,15,13:29:99:.:1222,524,498,553,0,520:1,0,19,9 +chrX 4465393 . AAAAGAAAG A,AAAAG 1464.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=28,8;AS_QD=29.93,28.40;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.77;QD=41.78;SOR=0.927;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9,0:9:99:396,0,396:0,0,5,4 1/2:0,19,8:27:99:1108,337,335,774,0,757:0,0,15,12 +chrX 4466655 . A G 1851 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=33.59;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.59;SOR=1.009;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:928,0:0,0,17,10 1/1:0,29:29:87:953,87,0:0,0,15,14 +chrX 4467928 . G T 2318 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=32.16;BaseQRankSum=2.006;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.430;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,21:22:99:640,0:1,0,15,6 1/1:0,51:51:99:1708,153,0:0,0,28,23 +chrX 4468135 . T C 1851 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.43;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.43;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:695,0:0,0,12,9 1/1:0,37:37:99:1186,110,0:0,0,15,22 +chrX 4468703 . G GTATA,GTA 297.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,4;AS_QD=30.56,22.50;BaseQRankSum=-0.921;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=3.123;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.141;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,5,0:5:99:202,0,202:0,0,3,2 0/2:2,2,4:8:20:135,62,137,0,20,29:2,0,3,3 +chrX 4470539 . G T 2809 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=30.86;BaseQRankSum=1.262;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=7.080;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.86;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.588;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,33:35:99:1018,0:2,0,12,21 1/1:0,57:57:99:1821,170,0:0,0,27,30 +chrX 4471606 . A AAGAAAGAAAGAAAGAC,AAGAAAGAAAGAC 2482.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=39,10;AS_QD=30.14,33.81;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.95;QD=51.47;SOR=1.112;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20,0:20:99:867,0,868:0,0,14,6 1/2:0,19,10:29:99:1655,446,355,778,0,700:0,0,15,14 +chrX 4473087 . T C 2559 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=31.96;BaseQRankSum=-0.368;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.96;ReadPosRankSum=1.374;SOR=0.315;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:911,0:0,0,15,13 1/1:1,52:53:99:1678,124,0:1,0,29,23 +chrX 4478258 . A AAGG 876.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=27.76;BaseQRankSum=-1.866;DP=37;ExcessHet=0.0000;FS=3.666;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.76;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.223;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13:13:99:568,0:0,0,9,4 0/1:10,10:20:99:348,0,364:8,2,5,5 +chrX 4478293 . GGAAA G 533.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=29.42;DP=37;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.30;QD=44.08;SOR=2.833;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,3:3:99:135,0:0,0,3,0 1/1:0,10:10:31:438,31,0:0,0,8,2 +chrX 4479298 . C CT 898.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=14.21;BaseQRankSum=-0.246;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=1.028;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.044;SOR=0.553;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,24:25:99:548,0:0,1,17,7 0/1:20,21:41:99:390,0,394:14,6,11,10 +chrX 4479951 . G GA,A 685 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=34,3;AS_QD=15.89,3.29;BaseQRankSum=1.843;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=5.079;MQ=59.28;MQRankSum=0;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.725;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22,0:23:99:488,0,494:0,1,11,11 0/1:10,12,3:25:99:227,0,177,181,202,668:7,3,5,10 +chrX 4480922 . T C 1811 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=21.66;BaseQRankSum=-1.077;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.065;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.66;ReadPosRankSum=-1.337;SOR=0.433;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1136,0:0,0,18,18 0/1:22,27:49:99:705,0,588:13,9,14,13 +chrX 4484103 . A C 1168 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=18.15;BaseQRankSum=-0.629;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.511;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.653;SOR=0.358;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22:23:99:613,0:1,0,9,6 0/1:20,23:43:99:585,0,556:5,13,6,14 +chrX 4490270 . C T 591 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=12.94;BaseQRankSum=0.737;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=5.864;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.735;SOR=1.392;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,444 0/1:25,23:48:99:.:621,0,670:13,12,8,15 +chrX 4492348 . T C 881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.46;BaseQRankSum=-0.155;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=19.289;MQ=59.67;MQRankSum=0;QD=14.46;ReadPosRankSum=1.067;SOR=1.284;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:526,0:0,0,5,11 0/1:31,16:47:99:385,0,871:21,10,6,10 +chrX 4497325 . C T 1961 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=21.41;BaseQRankSum=0.158;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=11.590;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.483;SOR=1.134;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1107,0:0,0,12,21 0/1:27,33:60:99:884,0,688:16,11,13,20 +chrX 4497659 . C A 2775 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=29.20;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.42;SOR=1.179;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1193,0:0,0,17,11 1/1:0,45:45:99:1612,135,0:0,0,27,18 +chrX 4497682 . C T 1594 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=22.56;BaseQRankSum=2.008;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.038;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=0.998;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:1114,0:0,0,16,9 0/1:27,20:47:99:510,0,663:15,12,12,8 +chrX 4497747 . AT A 333.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=9.10;BaseQRankSum=-0.057;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=1.204;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.799;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,11:12:99:220,0:1,0,6,5 0/1:18,11:29:99:153,0,310:8,10,6,5 +chrX 4500488 . CA C,CAA,CAAA,CAAAAA 314.97 . AC=1,0,0,1;AF=0.333,0.00,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,6,0,6;AS_QD=4.40,8.89,11.54,14.00;BaseQRankSum=-0.282;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.859;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,7,0,0,0:10:88:88,0,125,125,125:0,3,6,1 0/4:10,0,6,0,6:22:54:266,203,421,97,256,213,116,353,186,349,0,252,54,247,418:7,3,5,7 +chrX 4501066 . G A 906 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=16.42;BaseQRankSum=1.608;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=9.378;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.42;ReadPosRankSum=2.474;SOR=1.224;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,561 0/1:24,33:57:99:.:936,0,593:10,14,21,12 +chrX 4501665 . A G 1786 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=22.42;BaseQRankSum=-0.411;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.002;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.42;ReadPosRankSum=-1.343;SOR=0.957;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1011,0:0,0,19,13 0/1:20,29:49:99:805,0,528:11,9,18,11 +chrX 4506917 . CTT C,TTT 213 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=10,2;AS_QD=11.05,0.00;BaseQRankSum=-0.234;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=6.569;MQ=59.83;MQRankSum=-0.917;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.289;SOR=1.267;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,174,174 0/1:12,10,2:24:99:.:243,0,349,311,289,1005:4,8,8,4 +chrX 4508723 . A G 1609 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=24.10;BaseQRankSum=1.306;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=1.156;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.10;ReadPosRankSum=1.487;SOR=0.455;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:783,0:0,0,18,6 0/1:15,29:44:99:856,0,359:10,5,13,16 +chrX 4508865 . G A 631 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=12.24;BaseQRankSum=-2.2;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=12.599;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.386;SOR=0.970;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,487 0/1:28,26:54:99:.:661,0,790:9,19,16,10 +chrX 4509341 . AT A 1059.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=23.89;BaseQRankSum=-0.449;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.89;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=0.784;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,487 1/1:2,44:46:86:.:1099,86,0:1,1,21,23 +chrX 4510502 . AAT A 1229.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=21.88;BaseQRankSum=0.296;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=5.850;MQ=59.91;MQRankSum=0;QD=21.88;ReadPosRankSum=1.194;SOR=0.899;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23:24:99:752,0:1,0,14,9 0/1:16,18:34:99:517,0,419:6,10,10,8 +chrX 4511568 . T TA 695.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=22.97;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=22.97;SOR=0.818;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:735,0:0,0,17,15 0/0:.:53:74:53:0,74,1170 +chrX 4511821 . G A 1342 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=32.67;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.67;SOR=0.788;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,42:42:99:.:1372,0:0,0,22,20 0/0:.:53:74:53:0,74,1170 +chrX 4513344 . AAAAAG A 406.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=12.39;BaseQRankSum=-0.452;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=4.925;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.785;SOR=0.229;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,14:15:99:.:.:359,0:.:0,1,5,9 0|1:16,5:21:87:0|1:4513344_AAAAAG_A:87,0,590:4513344:5,11,4,1 +chrX 4514073 . G GAAGA 1263.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=27.72;BaseQRankSum=1.719;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=1.395;MQ=58.70;MQRankSum=-0.619;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.131;SOR=0.435;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:789,0:0,0,12,6 0/1:15,14:29:99:514,0,515:12,3,11,3 +chrX 4514093 . G GAAGA,GAAGAAAGAAAGA 842.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,8;AS_QD=26.09,18.12;BaseQRankSum=0.949;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=2.062;MQ=58.68;MQRankSum=-0.722;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=1.429;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13,0:13:99:574,0,575:0,0,11,2 0/2:9,0,8:17:99:308,336,715,0,379,355:7,2,7,1 +chrX 4514221 . G GAGGAAGGAAGGA,GAGGA 1372.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=18,11;AS_QD=35.03,32.56;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.77;QD=48.69;SOR=1.460;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,0:11:99:495,0,495:0,0,6,5 1/2:0,7,11:18:99:917,409,376,319,0,261:0,0,13,5 +chrX 4516998 . GCACA G 1063.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=22.98;BaseQRankSum=1.128;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=1.129;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.941;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,18:19:99:740,0:0,1,7,11 0/1:19,10:29:99:363,0,751:9,10,4,6 +chrX 4518009 . G C 712 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=13.49;BaseQRankSum=-1.165;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.749;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.042;SOR=1.138;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,491 0/1:27,28:55:99:.:742,0,754:14,13,11,17 +chrX 4518588 . G A 1908 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=21.78;BaseQRankSum=2.035;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.878;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.032;SOR=0.859;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1061,0:0,0,17,15 0/1:26,31:57:99:877,0,637:13,13,17,14 +chrX 4521356 . AAGATAGATAGAT A 1133.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=24.96;BaseQRankSum=0;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.96;ReadPosRankSum=0.53;SOR=0.617;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,18:19:99:581,0:1,0,10,8 0/1:13,15:28:99:592,0,499:7,6,8,7 +chrX 4522091 . TATAGATAG TATAG,T 1532.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=27,19;AS_QD=34.72,24.19;BaseQRankSum=0.778;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=7.301;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=32.75;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.728;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,0:18:99:790,0,790:0,0,8,10 1/2:2,9,19:30:99:782,565,712,274,0,353:2,0,11,17 +chrX 4523608 . AT A,ATT 452.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=14,23;AS_QD=7.95,11.03;BaseQRankSum=-0.795;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.612;MQ=59.72;MQRankSum=-0.407;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.322;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,342,342 1/2:8,14,23:45:99:.:492,317,586,150,0,320:6,2,22,15 +chrX 4528448 . A G 1697 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=22.72;BaseQRankSum=-2.157;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.016;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.72;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.471;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1002,0:0,0,16,14 0/1:19,27:46:99:725,0,522:8,11,12,15 +chrX 4529079 . C G 1356 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=19.80;BaseQRankSum=-0.426;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.353;SOR=0.579;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:878,0:0,1,17,11 0/1:22,19:41:99:508,0,606:16,6,14,5 +chrX 4531214 . C A 1520 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=20.95;BaseQRankSum=0.795;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=3.360;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=0.392;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:898,0:0,0,13,14 0/1:23,24:47:99:652,0,598:14,9,13,11 +chrX 4532768 . ATTT A,AT 887.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,8;AS_QD=18.54,5.57;BaseQRankSum=2.24;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=4.112;MQ=59.77;MQRankSum=0.694;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.561;SOR=0.411;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,19,0:20:99:760,0,781:1,0,9,10 0/2:21,0,8:29:99:167,229,757,0,529,504:7,14,5,3 +chrX 4533549 . T TACACAC 1840.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=30.32;BaseQRankSum=-0.566;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.888;SOR=0.584;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1044,0:0,0,14,10 0/1:16,22:38:99:836,0,596:10,6,13,9 +chrX 4534361 . T TAATA 3197.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=29.62;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.74;SOR=0.747;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1228,0:0,0,15,13 1/1:0,46:46:99:2009,138,0:0,0,23,23 +chrX 4534631 . C T 1390 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=18.93;BaseQRankSum=-0.33;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.959;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.959;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:893,0:0,0,15,11 0/1:28,21:49:99:527,0,755:15,13,13,8 +chrX 4538186 . C T 1894 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=21.14;BaseQRankSum=1.897;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=1.959;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.256;SOR=1.015;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,32:34:99:1023,0:2,0,14,18 0/1:23,34:57:99:901,0,573:10,13,13,21 +chrX 4540479 . C T 1343 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=20.49;BaseQRankSum=0.102;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=3.593;MQ=59.90;MQRankSum=-0.952;QD=20.49;ReadPosRankSum=-1.246;SOR=0.687;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:819,0:0,0,14,11 0/1:21,21:42:99:554,0,538:9,12,11,10 +chrX 4540844 . T C 1364 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=19.91;BaseQRankSum=0.928;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.207;MQ=45.32;MQRankSum=2.45;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.947;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:817,0:0,1,12,16 0/1:20,21:41:99:577,0,507:11,9,9,12 +chrX 4541979 . A C 2094 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=26.89;BaseQRankSum=-0.624;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.982;MQ=52.46;MQRankSum=-5.547;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.451;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,26:26:99:.:.:1159,0:.:0,0,15,11 0|1:28,25:53:99:0|1:4541979_A_C:965,0,1100:4541979:18,10,14,11 +chrX 4541982 . A G 2057 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=26.42;BaseQRankSum=0.139;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.894;MQ=52.46;MQRankSum=-5.625;QD=26.42;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.555;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1125,0:.:0,0,15,10 0|1:29,25:54:99:0|1:4541979_A_C:962,0,1131:4541979:18,11,14,11 +chrX 4541985 . G A 2015 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=26.22;BaseQRankSum=-0.448;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.902;MQ=52.48;MQRankSum=-5.551;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.527;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1125,0:.:0,0,15,10 0|1:29,24:53:99:0|1:4541979_A_C:920,0,1134:4541979:18,11,13,11 +chrX 4542167 . T C 993 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.04;BaseQRankSum=-1.319;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.930;MQ=49.27;MQRankSum=-5.102;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.914;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:669,0:0,0,10,12 0/1:30,16:46:99:354,0,835:15,15,7,9 +chrX 4542555 . C T 1882 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=23.60;BaseQRankSum=-0.381;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.901;MQ=57.66;MQRankSum=0.071;QD=23.60;ReadPosRankSum=0.866;SOR=0.698;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,25:25:99:.:.:1094,0:.:0,0,14,11 0|1:25,31:56:99:0|1:4542555_C_T:818,0,876:4542555:13,12,13,18 +chrX 4542565 . G C 2418 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=29.85;BaseQRankSum=-0.561;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.054;MQ=58.07;MQRankSum=-2.184;QD=29.85;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.795;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1154,0:.:0,0,14,13 0|1:21,34:55:99:0|1:4542555_C_T:1294,0,507:4542555:11,10,14,20 +chrX 4542839 . T A 47 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=7;AS_QD=1.54;BaseQRankSum=0.968;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.794;MQ=42.14;MQRankSum=-2.703;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.811;SOR=1.561;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,784 0/1:43,7:50:77:.:77,0,1286:20,23,5,2 +chrX 4543024 . C T 1367 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=20.85;BaseQRankSum=1.329;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=6.921;MQ=42.01;MQRankSum=-5.158;QD=20.85;ReadPosRankSum=-2.091;SOR=0.241;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30:30:99:.:.:979,0:.:0,0,16,14 0|1:22,15:37:99:0|1:4543015_A_G:418,0,589:4543015:15,7,7,8 +chrX 4543203 . T C 2402 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=29.30;BaseQRankSum=-1.278;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.09;MQRankSum=-6.038;QD=29.30;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.726;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1184,0:.:0,0,12,15 0|1:24,32:56:99:0|1:4543203_T_C:1248,0,901:4543203:12,12,17,15 +chrX 4543222 . G A 2560 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=28.46;BaseQRankSum=-1.006;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.840;MQ=48.51;MQRankSum=-6.582;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.883;SOR=0.824;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1260,0:.:0,0,15,13 0|1:29,34:63:99:0|1:4543203_T_C:1330,0,1115:4543203:15,14,19,15 +chrX 4543231 . T C 2399 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=27.92;BaseQRankSum=-0.647;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.853;MQ=48.12;MQRankSum=-6.635;QD=27.92;ReadPosRankSum=1.619;SOR=0.839;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1215,0:.:0,0,15,12 0|1:29,31:60:99:0|1:4543203_T_C:1214,0,1124:4543203:15,14,17,14 +chrX 4543232 . G A 2360 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=28.12;BaseQRankSum=-0.909;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=1.887;MQ=47.98;MQRankSum=-6.506;QD=28.12;ReadPosRankSum=1.964;SOR=0.960;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1215,0:.:0,0,15,12 0|1:28,30:58:99:0|1:4543203_T_C:1175,0,1085:4543203:14,14,17,13 +chrX 4543343 . C T 1378 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=18.77;BaseQRankSum=-0.639;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=54.84;MQRankSum=-3.957;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.696;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:863,0:0,0,11,16 0/1:26,22:48:99:545,0,706:10,16,8,14 +chrX 4543525 . T C 1418 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.11;BaseQRankSum=0;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.008;MQ=55.80;MQRankSum=-3.273;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.938;SOR=0.617;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:867,0:0,0,14,15 0/1:20,23:43:99:581,0,492:9,11,13,10 +chrX 4543631 . G T 1321 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=20.16;BaseQRankSum=0.459;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.54;MQRankSum=-2.268;QD=20.16;ReadPosRankSum=-1.352;SOR=0.657;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:727,0:0,0,10,12 0/1:22,23:45:99:624,0,579:9,13,9,14 +chrX 4544070 . CT C 1078.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=15.11;BaseQRankSum=-0.041;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.14;MQRankSum=-2.05;QD=15.11;ReadPosRankSum=-1.692;SOR=0.676;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:529,0:0,0,9,10 0/1:28,27:55:99:589,0,587:12,16,11,16 +chrX 4544248 . C T 1418 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=21.61;BaseQRankSum=-0.574;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=5.320;MQ=46.51;MQRankSum=-2.415;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.6;SOR=0.686;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:967,0:0,0,15,14 0/1:20,18:38:99:481,0,561:12,8,6,12 +chrX 4544329 . T G 923 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=34.04;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.47;QD=34.04;SOR=0.997;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:953,0:0,0,12,16 0/0:.:50:67:50:0,67,1011 +chrX 4545951 . C T 553 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.67;BaseQRankSum=2.799;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.454;MQ=50.62;MQRankSum=-0.593;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.75;SOR=0.937;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,417 0/1:25,21:46:99:.:583,0,586:12,13,12,9 +chrX 4546820 . A AG 1895.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=23.60;BaseQRankSum=0.396;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.60;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=0.713;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1085,0:0,0,13,15 0/1:28,26:54:99:850,0,855:12,16,10,16 +chrX 4547948 . C CA 601.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.57;BaseQRankSum=-0.778;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.553;SOR=0.631;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:357,0:0,0,11,5 0/1:11,17:28:99:284,0,185:7,4,9,8 +chrX 4548241 . G C 1325 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=34.74;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.74;SOR=1.236;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,39:39:99:.:1355,0:0,0,24,15 0/0:.:57:72:57:0,72,1158 +chrX 4550815 . A G 1696 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=23.32;BaseQRankSum=-0.769;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.675;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.341;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1008,0:0,0,15,14 0/1:19,26:45:99:718,0,505:12,7,13,13 +chrX 4551315 . C CTATGTATGTATGTATG 606.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.56;BaseQRankSum=-1.351;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.243;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=0.668;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:39:99:39:0,507 0/1:22,17:39:99:.:646,0,854:12,10,8,9 +chrX 4551339 . G GTATCTATC,GTATGTATGTATGTATCTATC 1044.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,18;AS_QD=33.43,31.79;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.51;QD=60.22;SOR=0.693;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,0,18:18:99:.:1084,1053,0:0,0,9,9 0/0:.:52:99:52:0,102,1530,102,1530,1530 +chrX 4551639 . GA G 56.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=8;AS_QD=2.91;BaseQRankSum=-2.214;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=6.237;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.21;SOR=0.954;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:36:99:36:0,442 0/1:25,8:33:96:.:96,0,561:16,9,3,5 +chrX 4551757 . A G 2009 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=20.19;BaseQRankSum=-3.238;DP=105;ExcessHet=0.0000;FS=7.273;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.19;ReadPosRankSum=-1.598;SOR=0.641;VarDP=101 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1241,0:0,0,17,21 0/1:28,35:63:99:798,0,755:17,11,16,19 +chrX 4553134 . C A 1445 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=18.21;BaseQRankSum=0.756;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.21;ReadPosRankSum=0;SOR=0.653;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:864,0:0,1,11,16 0/1:30,23:53:99:611,0,794:12,18,9,14 +chrX 4553987 . A G 1974 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=20.88;BaseQRankSum=0.365;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.832;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.886;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1204,0:0,0,21,16 0/1:30,29:59:99:800,0,825:15,15,15,14 +chrX 4554493 . G A 1449 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=19.72;BaseQRankSum=0.893;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=3.273;MQ=59.75;MQRankSum=0;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.514;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1013,0:0,0,15,15 0/1:27,18:45:99:466,0,764:11,16,10,8 +chrX 4555001 . A T 1431 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.87;BaseQRankSum=-0.622;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=3.786;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.87;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=1.244;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:842,0:0,0,11,17 0/1:18,24:42:99:619,0,456:9,9,9,15 +chrX 4555022 . G GA 1037.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=13.99;BaseQRankSum=2.871;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=10.769;MQ=59.81;MQRankSum=0;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.992;SOR=1.281;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,27:29:99:636,0:1,1,9,18 0/1:22,26:48:99:441,0,398:13,9,10,16 +chrX 4556083 . G A 2530 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.41;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;QD=32.41;SOR=0.941;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1013,0:0,0,19,11 1/1:0,49:49:99:1547,147,0:0,0,25,24 +chrX 4556167 . GTTTGTT G 2954.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=33.89;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.69;SOR=0.849;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:939,0:0,0,9,12 1/1:0,46:46:99:2055,139,0:0,0,22,24 +chrX 4557558 . A G 2417 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.52;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.52;SOR=0.963;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:720,0:0,0,11,10 1/1:0,52:52:99:1727,156,0:0,0,30,22 +chrX 4557712 . A G 2138 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.36;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.36;SOR=1.066;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:734,0:0,0,11,12 1/1:0,44:44:99:1434,132,0:0,0,17,27 +chrX 4557780 . T C 2206 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.88;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.693;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:685,0:0,0,10,10 1/1:0,48:48:99:1551,143,0:0,0,24,24 +chrX 4557888 . G A 2718 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.71;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.71;SOR=0.741;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:966,0:0,0,14,17 1/1:0,53:53:99:1782,159,0:0,0,29,24 +chrX 4557929 . T C 586 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.39;BaseQRankSum=0.352;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.209;SOR=0.706;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,725 0/1:23,23:46:99:.:616,0,622:12,11,11,12 +chrX 4558671 . C G 2700 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=32.50;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.50;SOR=1.075;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:909,0:0,0,17,10 1/1:0,57:57:99:1821,171,0:0,0,32,25 +chrX 4559206 . T C 2696 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=30.98;BaseQRankSum=1.939;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.98;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=0.272;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,35:36:99:1049,0:1,0,19,16 1/1:0,52:52:99:1677,155,0:0,0,27,25 +chrX 4559275 . C T 2603 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.91;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.91;SOR=1.096;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:973,0:0,0,17,11 1/1:0,52:52:99:1660,156,0:0,0,30,22 +chrX 4559372 . C A 2278 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=33.45;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.45;SOR=0.980;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:884,0:0,0,18,8 1/1:0,43:43:99:1424,128,0:0,0,21,22 +chrX 4560756 . A AC 2883.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=26.71;BaseQRankSum=-0.151;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=41.76;ReadPosRankSum=1.446;SOR=0.259;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,23:24:99:.:.:979,0:.:1,0,14,9 1|1:0,46:46:99:0|1:4560756_A_AC:1944,138,0:4560756:0,0,22,24 +chrX 4560757 . A AC 2883.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=33.14;BaseQRankSum=2.772;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=41.76;ReadPosRankSum=1.589;SOR=0.259;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,23:24:99:.:.:979,0:.:1,0,14,9 1|1:0,46:46:99:0|1:4560756_A_AC:1944,138,0:4560756:0,0,22,24 +chrX 4562966 . T A 2148 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=31.11;BaseQRankSum=-0.189;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=3.074;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.11;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.316;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,16:17:99:434,0:1,0,7,8 1/1:0,53:53:99:1744,159,0:0,0,26,27 +chrX 4563564 . C CA 815.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=18.59;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.62;QD=18.59;SOR=0.976;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:377,0:0,0,10,10 1/1:0,26:26:75:478,75,0:0,0,10,16 +chrX 4564395 . A T 2942 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=31.96;BaseQRankSum=-0.485;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=3.557;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=31.96;ReadPosRankSum=0.664;SOR=0.653;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1087,0:0,0,12,21 1/1:1,59:60:99:1885,146,0:1,0,28,31 +chrX 4564625 . A G 2526 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=33.19;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.19;SOR=1.079;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:888,0:0,0,18,9 1/1:0,50:50:99:1668,150,0:0,0,27,23 +chrX 4565109 . A G 1903 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=30.68;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.68;SOR=1.092;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:605,0:0,0,7,13 1/1:0,43:43:99:1328,128,0:0,0,19,24 +chrX 4565237 . G T 1952 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=34.17;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.53;QD=34.17;SOR=0.997;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:790,0:0,0,15,8 1/1:0,35:35:99:1192,105,0:0,0,18,17 +chrX 4566311 . A G 2695 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.83;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=0.987;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1028,0:0,0,13,18 1/1:0,52:52:99:1697,156,0:0,0,23,29 +chrX 4567272 . T G 2346 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.68;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.68;SOR=0.719;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:918,0:0,0,15,13 1/1:0,47:47:99:1458,140,0:0,0,23,24 +chrX 4567590 . G T 2268 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.83;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=0.941;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:655,0:0,0,14,6 1/1:0,50:50:99:1643,150,0:0,0,25,25 +chrX 4568029 . G A 1818 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.42;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.42;SOR=0.877;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:683,0:0,0,10,11 1/1:0,36:36:99:1165,108,0:0,0,16,20 +chrX 4568072 . C T 2020 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=34.17;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.17;SOR=0.693;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:739,0:0,0,11,11 1/1:0,38:38:99:1311,114,0:0,0,19,19 +chrX 4568701 . G A 503 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=12.11;BaseQRankSum=-2.327;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.649;MQ=59.87;MQRankSum=1.045;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.307;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,591 0/1:22,22:44:99:.:533,0,634:8,14,11,11 +chrX 4568783 . C G 2902 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=32.58;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.58;SOR=0.784;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:809,0:0,0,11,14 1/1:0,65:65:99:2123,195,0:0,0,36,29 +chrX 4569022 . T G 2724 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.40;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.40;SOR=0.765;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:931,0:0,0,17,11 1/1:0,57:57:99:1823,171,0:0,0,24,33 +chrX 4569468 . G A 3028 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=33.60;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.60;SOR=1.460;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1117,0:0,0,19,14 1/1:0,58:58:99:1941,174,0:0,0,40,18 +chrX 4569499 . A T 3075 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=33.75;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.75;SOR=1.280;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1092,0:0,0,18,14 1/1:0,60:60:99:2013,180,0:0,0,39,21 +chrX 4569743 . C A 3433 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=106;AS_QD=32.67;DP=111;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.67;SOR=0.770;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:675,0:0,0,11,9 1/1:0,86:86:99:2788,257,0:0,0,40,46 +chrX 4570389 . T C 2569 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.32;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.32;SOR=1.040;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:829,0:0,0,16,9 1/1:0,53:53:99:1770,159,0:0,0,29,24 +chrX 4570599 . T C 2720 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.54;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.54;SOR=0.961;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:953,0:0,0,12,16 1/1:0,54:54:99:1797,162,0:0,0,24,30 +chrX 4571090 . C T 2519 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=33.10;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.10;SOR=1.300;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:733,0:0,0,11,12 1/1:0,54:54:99:1816,162,0:0,0,37,17 +chrX 4571214 . GT G 1927.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=26.95;BaseQRankSum=0.494;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=6.451;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.95;ReadPosRankSum=0.19;SOR=0.355;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:592,0:0,0,8,13 1/1:2,50:52:99:1375,125,0:2,0,25,25 +chrX 4572813 . T C 3350 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=30.33;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=1.079;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1184,0:.:0,0,16,11 1|1:0,50:50:99:0|1:4572813_T_C:2196,151,0:4572813:0,0,29,21 +chrX 4572821 . A G 3325 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=28.95;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=0.948;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1159,0:.:0,0,14,13 1|1:0,50:50:99:0|1:4572813_T_C:2196,151,0:4572813:0,0,29,21 +chrX 4573630 . C T 2472 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.92;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.92;SOR=0.984;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1018,0:0,0,11,20 1/1:0,45:45:99:1484,135,0:0,0,22,23 +chrX 4574547 . G A 2497 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.82;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.82;SOR=0.719;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1211,0:0,0,20,18 1/1:0,39:39:99:1316,117,0:0,0,19,20 +chrX 4576615 . G A 2357 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=31.83;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.83;SOR=0.832;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:709,0:0,0,7,16 1/1:0,52:52:99:1678,156,0:0,0,33,19 +chrX 4576964 . T G 2008 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=32.87;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.87;SOR=0.693;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:748,0:0,0,12,11 1/1:0,39:39:99:1290,117,0:0,0,19,20 +chrX 4577067 . C A 1821 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=31.91;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.70;QD=31.91;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:618,0:.:0,0,7,11 1|1:0,40:40:99:0|1:4577067_C_A:1233,116,0:4577067:0,0,24,16 +chrX 4577095 . AAAAATT A 1459.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=34.07;BaseQRankSum=2.105;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=4.130;MQ=57.60;MQRankSum=-0.33;QD=34.07;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=1.086;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:20:99:20:.:.:0,272 1|1:1,43:44:99:.:0|1:4577067_C_A:1499,124,0:4577067:0,1,27,16 +chrX 4577096 . AAAATT A,* 736.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=20,0;AS_QD=25.93,35.25;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=3.438;MQ=56.46;QD=38.80;SOR=0.583;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20,0:20:99:.:.:776,0,777:.:0,0,8,12 2|2:1,0,43:44:99:0|1:4577067_C_A:1499,1501,1504,124,127,0:4577067:0,1,27,16 +chrX 4578723 . A G 1016 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=29.89;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=29.89;SOR=1.002;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,35:35:99:.:1046,0:0,0,15,20 0/0:.:51:46:51:0,46,1061 +chrX 4579142 . T A 2952 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.41;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=32.41;SOR=1.216;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1040,0:0,0,15,17 1/1:0,60:60:99:1942,180,0:0,0,21,39 +chrX 4579353 . T TAC 2501.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=34.34;BaseQRankSum=-0.352;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=34.34;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.266;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22:23:99:719,0:0,1,10,12 1/1:0,51:51:99:1822,153,0:0,0,27,24 +chrX 4579983 . G A 2465 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.83;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=0.984;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:745,0:0,0,13,9 1/1:0,54:54:99:1750,162,0:0,0,20,34 +chrX 4580214 . A T 2990 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=31.46;BaseQRankSum=1.628;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.46;ReadPosRankSum=-1.67;SOR=0.309;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1326,0:0,0,20,21 1/1:1,54:55:99:1694,140,0:0,1,23,31 +chrX 4580415 . ATT A 1964.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=29.87;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=37.81;SOR=0.730;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:911,0:0,0,13,11 1/1:0,29:29:87:1093,87,0:0,0,14,15 +chrX 4580805 . T A 2324 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=33.63;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.63;SOR=0.693;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:968,0:0,0,13,16 1/1:0,41:41:99:1386,123,0:0,0,22,19 +chrX 4581090 . G T 2463 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.80;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.80;SOR=0.984;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:871,0:0,0,15,11 1/1:0,50:50:99:1622,149,0:0,0,28,22 +chrX 4582003 . CAAAAAAAAAAAA C 74.97 . AC=1;AF=1.00;AN=1;AS_AltDP=5;AS_QD=14.25;DP=39;ExcessHet=0.0000;FS=7.068;MQ=59.75;MQRankSum=0;QD=14.25;SOR=0.610;VarDP=8 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,5:8:99:.:114,0:0,3,3,2 ./.:.:16:.:16:0,0,0 +chrX 4582488 . C T 3127 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=32.55;BaseQRankSum=2.573;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.55;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.223;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1052,0:0,0,17,15 1/1:1,64:65:99:2105,185,0:0,1,31,33 +chrX 4582755 . G GTGTA 3403.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=31.52;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.71;SOR=0.887;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1080,0:.:0,0,9,15 1|1:0,53:53:99:0|1:4582755_G_GTGTA:2363,159,0:4582755:0,0,26,27 +chrX 4582777 . G A 3254 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=22.30;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.21;SOR=0.859;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:1014,0:.:0,0,8,15 1|1:0,53:53:99:0|1:4582755_G_GTGTA:2270,159,0:4582755:0,0,27,26 +chrX 4583562 . G C 2158 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=32.18;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.18;SOR=1.098;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:800,0:0,0,13,10 1/1:0,45:45:99:1388,134,0:0,0,27,18 +chrX 4584371 . G A 2293 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=33.67;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.67;SOR=0.910;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1043,0:0,0,15,15 1/1:0,39:39:99:1280,117,0:0,0,16,23 +chrX 4584856 . A G 2612 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=30.72;BaseQRankSum=2.32;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.791;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,28:30:99:848,0:1,1,15,13 1/1:0,56:56:99:1794,167,0:0,0,29,27 +chrX 4585208 . A G 2182 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=32.06;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=32.06;SOR=0.781;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:699,0:0,0,10,12 1/1:0,47:47:99:1513,141,0:0,0,23,24 +chrX 4585444 . G A,GAAAAA 2327 . AC=0,3;AF=0.00,1.00;AN=3;AS_AltDP=4,47;AS_QD=29.54,28.09;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.93;QD=46.22;SOR=1.436;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,4,11:15:99:789,341,0:0,0,6,9 2/2:0,0,36:36:99:1568,1569,1569,107,108,0:0,0,27,9 +chrX 4585638 . T C 2753 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=32.36;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.36;SOR=1.005;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:774,0:0,0,15,9 1/1:0,62:62:99:2009,186,0:0,0,22,40 +chrX 4585797 . A G 3002 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=93;AS_QD=32.60;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=0.758;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:928,0:0,0,14,15 1/1:0,64:64:99:2104,192,0:0,0,34,30 +chrX 4585914 . G GGGA 3273.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=31.67;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=44.77;SOR=0.693;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1337,0:0,0,15,15 1/1:0,44:44:99:1976,132,0:0,0,22,22 +chrX 4585952 . A C 2561 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.39;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=32.39;SOR=0.908;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1028,0:0,0,16,15 1/1:0,49:49:99:1563,146,0:0,0,20,29 +chrX 4586067 . G A 2062 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.69;BaseQRankSum=0;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.69;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.273;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,21:22:99:695,0:0,1,12,9 1/1:0,42:42:99:1397,126,0:0,0,20,22 +chrX 4586139 . CAA C,CA 61.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,5;AS_QD=8.27,9.18;BaseQRankSum=2.611;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=30.584;MQ=58.19;MQRankSum=2.466;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.439;SOR=3.220;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:18:47:15:0,47,47 0/2:6,5,5:16:10:.:101,10,280,0,37,66:0,6,9,1 +chrX 4586229 . G C 2618 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.15;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.15;SOR=0.979;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:754,0:0,0,10,14 1/1:0,61:61:99:1894,181,0:0,0,38,23 +chrX 4586766 . T C 2068 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=30.85;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.85;SOR=0.752;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:893,0:0,0,13,16 1/1:0,39:39:99:1205,117,0:0,0,22,17 +chrX 4586824 . C CA 1170.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=22.41;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.66;QD=22.41;SOR=0.846;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:479,0:0,0,9,12 1/1:0,33:33:98:731,98,0:0,0,16,17 +chrX 4586850 . A G 2151 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.16;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.16;SOR=0.941;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:779,0:0,0,8,16 1/1:0,46:46:99:1402,136,0:0,0,23,23 +chrX 4587463 . C G 2970 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=31.25;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.25;SOR=0.823;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:937,0:0,0,14,16 1/1:0,66:66:99:2063,197,0:0,0,31,35 +chrX 4587930 . C CT 1063.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=23.47;BaseQRankSum=-0.196;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=3.499;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.47;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.643;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,16:17:99:376,0:1,0,4,12 1/1:0,30:30:89:727,89,0:0,0,16,14 +chrX 4587965 . T A 966 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=22.13;BaseQRankSum=1.514;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=1.473;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.404;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,19:20:99:570,0:0,1,8,11 0/1:8,17:25:99:426,0,194:3,5,8,9 +chrX 4588196 . GTT G 1548.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=28.62;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.09;SOR=0.883;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13:13:99:467,0:0,0,8,5 1/1:0,31:31:93:1121,93,0:0,0,16,15 +chrX 4588609 . C T 2293 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=33.67;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.67;SOR=0.844;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:914,0:0,0,8,19 1/1:0,42:42:99:1409,126,0:0,0,24,18 +chrX 4588750 . A G 2594 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.40;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.40;SOR=0.995;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:839,0:0,0,13,13 1/1:0,55:55:99:1785,164,0:0,0,33,22 +chrX 4589691 . A G 2534 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.27;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.78;QD=31.27;SOR=1.085;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:773,0:0,0,14,11 1/1:0,57:57:99:1791,170,0:0,0,34,23 +chrX 4589721 . C T 858 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=32.89;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;QD=32.89;SOR=0.765;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:888,0:0,0,14,13 0/0:.:60:99:60:0,113,1578 +chrX 4590176 . C G 2977 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.33;BaseQRankSum=-0.383;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.33;ReadPosRankSum=0.083;SOR=0.223;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,41:42:99:1320,0:0,1,25,16 1/1:0,51:51:99:1687,153,0:0,0,21,30 +chrX 4590395 . A G 2815 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.33;BaseQRankSum=-0.32;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.763;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.33;ReadPosRankSum=0.122;SOR=0.800;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1018,0:0,0,11,20 1/1:1,56:57:99:1827,136,0:1,0,25,31 +chrX 4590491 . T G 2505 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.92;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.92;SOR=0.719;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:929,0:0,0,13,14 1/1:0,50:50:99:1606,149,0:0,0,26,24 +chrX 4590701 . TA T 1906.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=27.41;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.79;MQRankSum=6.71;QD=27.41;SOR=0.633;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:760,0:0,0,9,18 1/1:1,43:44:99:1186,105,0:0,1,15,28 +chrX 4591029 . G C 2645 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.02;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.02;SOR=0.934;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:933,0:0,0,14,14 1/1:0,53:53:99:1742,159,0:0,0,31,22 +chrX 4591962 . C A 2986 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=31.75;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.75;SOR=0.757;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1002,0:0,0,9,23 1/1:0,63:63:99:2014,189,0:0,0,37,26 +chrX 4592372 . T C 2456 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=76;AS_QD=32.71;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.71;SOR=0.920;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:854,0:0,0,10,16 1/1:0,50:50:99:1632,150,0:0,0,24,26 +chrX 4592678 . T C 3702 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=117;AS_QD=31.90;DP=121;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.90;SOR=0.745;VarDP=117 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1556,0:0,0,24,25 1/1:0,68:68:99:2176,204,0:0,0,36,32 +chrX 4592696 . A G 3662 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=113;AS_QD=32.67;DP=120;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.67;SOR=0.822;VarDP=113 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,49:49:99:1623,0:0,0,25,24 1/1:0,64:64:99:2069,192,0:0,0,35,29 +chrX 4592852 . A G 2816 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=31.98;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.98;SOR=0.809;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:948,0:0,0,17,12 1/1:0,60:60:99:1898,179,0:0,0,25,35 +chrX 4593014 . A AAT 4061.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=30.12;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.63;SOR=0.874;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1653,0:0,0,16,22 1/1:0,56:56:99:2448,168,0:0,0,27,29 +chrX 4593874 . CT C 871.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=22.78;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.12;QD=22.78;SOR=0.793;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:415,0:0,0,10,8 1/1:0,22:22:66:496,66,0:0,0,9,13 +chrX 4593921 . G T 1444 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=32.76;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.89;QD=32.76;SOR=0.737;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:665,0:0,0,12,8 1/1:0,25:25:75:809,75,0:0,0,11,14 +chrX 4594048 . A G 2599 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=31.67;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.67;SOR=0.928;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:864,0:0,0,13,13 1/1:0,57:57:99:1765,170,0:0,0,33,24 +chrX 4594246 . T C 2336 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=32.86;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.86;SOR=0.869;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:734,0:0,0,13,9 1/1:0,50:50:99:1632,150,0:0,0,26,24 +chrX 4594355 . A G 2604 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=31.36;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.36;SOR=0.897;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1007,0:0,0,17,15 1/1:0,52:52:99:1627,155,0:0,0,29,23 +chrX 4595050 . C A 2563 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.82;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.82;SOR=0.824;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1062,0:0,0,16,16 1/1:0,47:47:99:1531,141,0:0,0,21,26 +chrX 4595902 . A G 1835 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.16;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.16;SOR=0.836;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:602,0:0,0,8,10 1/1:0,40:40:99:1263,120,0:0,0,19,21 +chrX 4596061 . A AT 1699.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=25.20;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=25.20;SOR=0.844;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:808,0:0,0,19,13 1/1:0,37:37:99:931,110,0:0,0,18,19 +chrX 4596875 . G A 2620 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=32.72;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=0.821;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:978,0:0,0,12,17 1/1:0,52:52:99:1672,156,0:0,0,31,21 +chrX 4597311 . A G 2744 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=32.64;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=32.64;SOR=0.922;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1007,0:0,0,16,16 1/1:0,53:53:99:1767,159,0:0,0,22,31 +chrX 4597434 . CA C 1387.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=25.04;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.36;MQRankSum=0;QD=25.04;SOR=0.271;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,20:21:99:518,0:0,1,8,12 1/1:0,36:36:99:909,108,0:0,0,17,16 +chrX 4597715 . T G 2416 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=33.51;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.51;SOR=1.340;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:987,0:0,0,14,15 1/1:0,44:44:99:1459,132,0:0,0,13,31 +chrX 4597774 . T C 2521 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.29;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.29;SOR=0.881;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1126,0:0,0,17,19 1/1:0,43:43:99:1425,129,0:0,0,19,24 +chrX 4598045 . CGTGTGT C 2506.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=26.67;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.67;SOR=0.877;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:900,0:0,0,11,9 1/1:0,37:37:99:1646,112,0:0,0,20,17 +chrX 4598795 . T C 1795 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=32.59;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.59;SOR=1.412;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:599,0:0,0,11,8 1/1:0,37:37:99:1226,111,0:0,0,25,12 +chrX 4599216 . C T 2740 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.98;BaseQRankSum=0;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.98;ReadPosRankSum=-0.98;SOR=0.275;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22:23:99:730,0:1,0,11,11 1/1:0,61:61:99:2040,183,0:0,0,33,28 +chrX 4599518 . A G 2446 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.16;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.16;SOR=1.012;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1007,0:0,0,19,13 1/1:0,45:45:99:1469,135,0:0,0,25,20 +chrX 4600424 . G A 2252 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=32.60;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=0.693;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:794,0:0,0,12,14 1/1:0,44:44:99:1488,132,0:0,0,23,21 +chrX 4600632 . G A 870 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=16.67;BaseQRankSum=-0.604;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.645;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,784 0/1:22,32:54:99:.:900,0,565:12,10,17,15 +chrX 4600793 . A T 2983 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=32.40;BaseQRankSum=-0.457;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.349;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:919,0:0,0,12,15 1/1:1,65:66:99:2094,164,0:0,1,28,37 +chrX 4601488 . G A 2810 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=34.22;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.22;SOR=0.766;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1147,0:0,0,16,17 1/1:0,50:50:99:1693,150,0:0,0,24,26 +chrX 4601647 . T C 2966 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=31.21;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.21;SOR=0.693;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1116,0:0,0,16,20 1/1:0,60:60:99:1880,180,0:0,0,32,28 +chrX 4602083 . AT A 2986.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=24.33;BaseQRankSum=-0.423;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.23;ReadPosRankSum=1.196;SOR=0.268;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,28:29:99:.:.:1210,0:.:1,0,14,14 1|1:0,41:41:99:0|1:4602083_AT_A:1816,123,0:4602083:0,0,20,21 +chrX 4602103 . C T 3544 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=29.33;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.05;SOR=0.765;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1335,0:.:0,0,16,15 1|1:0,54:54:99:0|1:4602083_AT_A:2239,162,0:4602083:0,0,28,26 +chrX 4602910 . T C 2017 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=32.49;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=1.092;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:693,0:0,0,11,11 1/1:0,41:41:99:1354,122,0:0,0,15,26 +chrX 4602980 . A T 2200 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=33.79;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.79;SOR=0.693;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:873,0:0,0,13,13 1/1:0,40:40:99:1357,120,0:0,0,20,20 +chrX 4603038 . C A 2427 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.76;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.76;SOR=1.164;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:953,0:0,0,19,10 1/1:0,46:46:99:1504,138,0:0,0,26,20 +chrX 4603425 . T C 2630 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.05;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.05;SOR=0.818;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:812,0:0,0,12,15 1/1:0,56:56:99:1848,168,0:0,0,27,29 +chrX 4603767 . A T 3177 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=34.12;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.12;SOR=0.976;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1033,0:0,0,20,10 1/1:0,64:64:99:2174,193,0:0,0,33,31 +chrX 4603914 . G A,GA 610 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=3,26;AS_QD=0.00,16.00;BaseQRankSum=-0.478;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.712;SOR=0.770;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,913,913 0/2:14,3,26:43:99:.:640,668,1391,0,332,322:8,6,17,12 +chrX 4603996 . T C 3115 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=32.09;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.09;SOR=0.914;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1002,0:0,0,17,13 1/1:0,68:68:99:2143,203,0:0,0,37,31 +chrX 4604254 . T C 2387 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.66;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.66;SOR=0.927;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:998,0:0,0,17,13 1/1:0,44:44:99:1419,131,0:0,0,16,28 +chrX 4605113 . T TTATC 3178.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=27.70;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.69;QD=44.69;SOR=1.148;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1665,0:0,0,19,18 1/1:0,35:35:99:1553,105,0:0,0,24,11 +chrX 4605203 . CATTT C 908.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=21.55;BaseQRankSum=-0.46;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.744;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.55;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=1.232;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,768 0/1:20,24:44:99:.:948,0,735:12,8,17,7 +chrX 4605637 . G C 2449 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=29.87;BaseQRankSum=2.186;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.047;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.87;ReadPosRankSum=0.991;SOR=0.121;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:767,0:0,1,13,14 1/1:1,54:55:99:1712,154,0:0,1,26,28 +chrX 4605659 . A G 2404 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=31.21;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.21;SOR=0.798;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:739,0:0,0,12,11 1/1:0,55:55:99:1695,164,0:0,0,25,30 +chrX 4605948 . G A 2768 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=84;AS_QD=33.31;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.31;SOR=1.139;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1047,0:0,0,12,19 1/1:0,53:53:99:1751,159,0:0,0,22,31 +chrX 4606287 . CAAAAAA CA,C 820.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,10;AS_QD=31.42,29.25;BaseQRankSum=-0.578;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=2.418;MQ=58.36;MQRankSum=-0.509;QD=29.66;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.799;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9,0:9:99:316,0,316:0,0,5,4 1/2:3,7,10:20:70:544,105,114,70,0,184:1,2,10,7 +chrX 4606806 . A T 2861 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=88;AS_QD=32.85;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.85;SOR=0.739;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1031,0:0,0,14,17 1/1:0,57:57:99:1860,171,0:0,0,29,28 +chrX 4607630 . A T 2678 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.02;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.02;SOR=0.693;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:926,0:0,0,17,12 1/1:0,53:53:99:1782,159,0:0,0,24,29 +chrX 4608054 . C T 402 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=8.82;BaseQRankSum=-1.942;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.730;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:34:99:34:0,686 0/1:30,19:49:99:.:432,0,876:13,17,8,11 +chrX 4608165 . G A 2337 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=33.34;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.34;SOR=0.721;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1022,0:0,0,13,18 1/1:0,40:40:99:1345,120,0:0,0,23,17 +chrX 4608484 . T C 2985 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=31.74;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.74;SOR=0.802;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:937,0:0,0,13,17 1/1:0,65:65:99:2078,195,0:0,0,32,33 +chrX 4608740 . G A 2312 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.99;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.99;SOR=0.779;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1047,0:0,0,17,15 1/1:0,39:39:99:1295,117,0:0,0,20,19 +chrX 4608847 . ATACATATATTTGCTATTAGATAG A 1681.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=30.43;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.89;QD=43.03;SOR=1.788;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:859,0:.:0,0,13,7 1|1:0,20:20:61:0|1:4608847_ATACATATATTTGCTATTAGATAG_A:862,61,0:4608847:0,0,15,5 +chrX 4608878 . ACAAATATATTTGCTATTAGATAGCAAATATACAAATATATTTGCTATTAGATAGCAAATATACAAATATATTTGCTATTAGATAGCAAATATACAAATATGTTTGCTATTAGATAGCAAATATACAAATATGTTTGCTATTAGATAGCAAATATACAAATATG A 457.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.43;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=4.890;MQ=57.51;MQRankSum=-0.171;QD=13.43;SOR=1.598;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:358,0:.:0,0,12,6 1|1:1,18:19:26:0|1:4608847_ATACATATATTTGCTATTAGATAG_A:139,26,0:4608847:0,1,13,5 +chrX 4609193 . TTATA T 2696.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=28.82;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.85;SOR=0.941;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:946,0:0,0,11,10 1/1:0,40:40:99:1790,121,0:0,0,16,24 +chrX 4610110 . CT C 1257.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=23.58;BaseQRankSum=-1.028;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=5.768;MQ=58.81;MQRankSum=-2.365;QD=23.58;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=1.119;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:749,0:.:0,0,9,9 0|1:21,16:37:99:0|1:4610110_CT_C:548,0,818:4610110:12,9,4,12 +chrX 4610126 . C CTT 1350.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=23.56;BaseQRankSum=-0.244;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=9.333;MQ=58.62;MQRankSum=-2.325;QD=23.56;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=1.028;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:764,0:.:0,0,9,9 0|1:23,18:41:99:0|1:4610110_CT_C:626,0,912:4610110:14,9,5,13 +chrX 4610150 . T TTC,TTCTTTC,TTCTTTCTTTCTTTCTTTC,TTCTTTCTTTCTTTC 935.97 . AC=2,0,0,0;AF=0.667,0.00,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=11,2,0,0;AS_QD=28.68,16.64,13.65,5.96;BaseQRankSum=1.061;DP=48;ExcessHet=0.0000;FS=14.209;MQ=57.76;MQRankSum=-3.207;QD=27.08;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=1.440;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,4,2,0,0:6:99:547,0,131,233,287:0,0,2,4 0/1:23,7,0,0,0:30:99:428,0,930,402,963,1350,402,963,1350,1350,291,946,1252,1252,1236:16,7,2,5 +chrX 4610168 . C T 597 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.68;BaseQRankSum=0.482;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=12.712;MQ=58.33;MQRankSum=-2.674;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=1.612;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,7:7:99:.:.:295,0:.:0,0,3,4 0|1:23,10:33:99:0|1:4610110_CT_C:332,0,936:4610110:15,8,2,8 +chrX 4610176 . T TTC 70.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=5;AS_QD=15.71;BaseQRankSum=0.566;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.16;MQRankSum=0.967;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=1.022;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,5:7:99:.:110,0:1,1,2,3 0/0:.:39:90:39:0,90,1232 +chrX 4610178 . GTCTCTC G,TTCTCTC,CTCTCTC 1003 . AC=0,1,1;AF=0.00,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,5,12;AS_QD=16.24,19.50,27.52;BaseQRankSum=2.107;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=5.287;MQ=57.99;MQRankSum=-2.304;QD=30.38;ReadPosRankSum=0.075;SOR=1.706;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,5,2:7:99:429,362,0,235:0,0,3,4 0/3:17,0,0,10:27:99:604,395,1125,552,1143,1361,0,697,829,875:9,8,2,8 +chrX 4610182 . C *,CTT 570.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,10;AS_QD=0.00,22.59;BaseQRankSum=0.752;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=5.287;MQ=58.63;MQRankSum=-2.304;QD=22.59;ReadPosRankSum=0;SOR=1.706;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,0,0:7:19:.:.:429,362,381:.:0,0,3,4 0|2:17,0,10:27:99:0|1:4610110_CT_C:610,398,1087,0,695,791:4610110:9,8,2,8 +chrX 4610184 . C *,CTTTCTTTG,CTCTTTCTTTG,CTTTG 1002.97 . AC=0,1,0,1;AF=0.00,0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,5,2,10;AS_QD=0.00,19.50,10.74,22.70;BaseQRankSum=0.312;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=5.287;MQ=57.79;MQRankSum=-2.304;QD=30.65;ReadPosRankSum=0.075;SOR=1.706;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 2:0,0,5,2,0:7:99:.:.:429,317,0,225,372:.:0,0,3,4 0|4:17,0,0,0,10:27:99:0|1:4610110_CT_C:613,401,1089,549,1118,1280,549,1118,1280,1280,0,695,759,759,750:4610110:9,8,2,8 +chrX 4619160 . C T 1583 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=21.51;BaseQRankSum=0.355;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=13.917;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.51;ReadPosRankSum=-1.034;SOR=1.230;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1130,0:0,0,14,21 0/1:22,18:40:99:483,0,585:14,8,5,13 +chrX 4620810 . TA T 1598.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=27.76;BaseQRankSum=0.749;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=10.755;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.665;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,21:21:99:.:.:834,0:.:0,0,11,10 0|1:17,21:38:99:0|1:4620810_TA_T:804,0,632:4620810:5,12,13,8 +chrX 4620834 . T C 1790 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=26.76;BaseQRankSum=-2.162;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=15.096;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.76;ReadPosRankSum=1.439;SOR=0.641;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1015,0:.:0,0,15,12 0|1:19,22:41:99:0|1:4620810_TA_T:805,0,700:4620810:5,14,13,9 +chrX 4625742 . TA T 500.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.74;BaseQRankSum=0.187;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=6.311;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=1.455;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,372 0/1:22,24:46:99:.:540,0,480:12,10,8,16 +chrX 4626261 . C CATATAT,CATAT 836.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=7,14;AS_QD=29.80,34.00;BaseQRankSum=-1.095;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.20;MQRankSum=-0.309;QD=36.50;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.560;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,7,0:7:99:298,0,299:0,0,5,2 0/2:3,0,14:17:84:578,588,714,0,127,84:2,1,7,7 +chrX 4633710 . T C 1649 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=20.48;BaseQRankSum=-0.387;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.926;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.539;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:972,0:0,0,16,14 0/1:26,26:52:99:707,0,717:17,9,18,8 +chrX 4636135 . T TTG 1358.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=24.53;BaseQRankSum=0.79;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.355;MQ=59.75;MQRankSum=-0.819;QD=24.53;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.907;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:860,0:0,0,10,15 0/1:14,18:32:99:538,0,405:8,6,8,10 +chrX 4637208 . TAAAAG T 2020.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=27.84;BaseQRankSum=-0.389;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=16.353;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.84;ReadPosRankSum=0.798;SOR=1.258;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,25:26:99:1060,0:1,0,19,6 0/1:22,26:48:99:1000,0,835:7,15,14,12 +chrX 4637830 . C T 1953 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=22.53;BaseQRankSum=-0.095;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=5.155;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.075;SOR=1.080;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:841,0:0,0,11,15 0/1:20,42:62:99:1142,0,411:11,9,16,26 +chrX 4637949 . G T 428 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.41;BaseQRankSum=2.278;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.615;SOR=0.745;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,540 0/1:27,17:44:99:.:458,0,721:13,14,9,8 +chrX 4639224 . A G 1763 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=20.38;BaseQRankSum=-0.752;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.693;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1221,0:0,0,17,20 0/1:28,23:51:99:572,0,785:14,14,13,10 +chrX 4642006 . C CA 395.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.54;BaseQRankSum=-0.319;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=4.058;MQ=59.00;MQRankSum=-0.554;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.61;SOR=1.074;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13:13:99:193,0:0,0,5,8 1/1:1,14:15:24:242,24,0:1,0,5,9 +chrX 4642919 . T C 1250 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=16.84;BaseQRankSum=-1.123;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.886;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.571;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:620,0:0,0,10,10 0/1:31,25:56:99:660,0,889:19,12,16,9 +chrX 4650039 . CAAAAAAAAAAAAAAA CAAAAAAAAAAAAAAAAA,C 1226.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=21,21;AS_QD=12.42,22.75;BaseQRankSum=0.029;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.131;MQ=59.01;MQRankSum=1.738;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.543;SOR=0.534;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21,0:21:99:447,0,447:0,0,12,9 0/2:15,0,21:36:99:819,864,1460,0,596,530:9,6,11,10 +chrX 4650702 . CTTTT C,CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 548.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,12;AS_QD=9.18,18.00;BaseQRankSum=0.146;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=5.620;MQ=59.74;MQRankSum=0;QD=20.28;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=1.253;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,5,0:8:99:156,0,226:2,1,2,3 0/2:9,0,12:21:99:432,462,843,0,381,345:3,6,9,3 +chrX 4650948 . G A 1641 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=19.89;BaseQRankSum=-0.365;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.885;MQ=59.82;MQRankSum=0;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.97;SOR=0.560;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1017,0:0,0,14,18 0/1:26,26:52:99:654,0,644:14,12,15,11 +chrX 4651798 . T A,TA 1063 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=43,0;AS_QD=15.39,0.00;BaseQRankSum=-0.693;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.926;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.733;SOR=0.889;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21,0:21:99:613,0,696:0,0,9,12 0/1:28,22,0:50:99:480,0,806,593,782,1457:13,15,9,13 +chrX 4653298 . T A 675 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.30;BaseQRankSum=-0.761;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=5.608;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=1.115;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,581 0/1:27,26:53:99:.:705,0,730:12,15,16,10 +chrX 4653497 . CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT C 1626.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=27.77;BaseQRankSum=1.213;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=1.053;MQ=58.96;MQRankSum=2.538;QD=27.77;ReadPosRankSum=1.472;SOR=0.917;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:758,0:0,0,11,6 0/1:20,23:43:99:908,0,769:11,9,13,10 +chrX 4654161 . T A 2097 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=22.39;BaseQRankSum=-0.181;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=9.910;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.504;SOR=0.740;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,43:43:99:1405,0:0,0,14,29 0/1:25,27:52:99:722,0,663:16,9,16,11 +chrX 4654728 . A T 2379 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=32.12;BaseQRankSum=0.132;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.12;ReadPosRankSum=0.752;SOR=0.540;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,31:31:99:.:.:1373,0:.:0,0,19,12 0|1:18,26:44:99:0|1:4654728_A_T:1036,0,637:4654728:11,7,13,13 +chrX 4654738 . T C 2477 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=33.43;BaseQRankSum=-2.746;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.504;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=33.43;ReadPosRankSum=-0.357;SOR=0.364;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1408,0:.:0,0,20,12 0|1:15,28:43:99:0|1:4654728_A_T:1099,0,546:4654728:10,5,13,15 +chrX 4662148 . T G 591 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.72;BaseQRankSum=0.587;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.854;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.836;SOR=1.058;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,219 0/1:28,25:53:99:.:621,0,693:13,15,15,10 +chrX 4665634 . A T 676 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.97;BaseQRankSum=-1.583;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.169;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.446;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,219 0/1:33,26:59:99:.:706,0,969:19,14,13,13 +chrX 4676755 . C CT 329.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=9.46;BaseQRankSum=-0.137;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.70;MQRankSum=-0.923;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.9;SOR=0.776;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,219 0/1:19,20:39:99:.:369,0,346:8,11,8,12 +chrX 4677149 . A AAT,AATATATATAT 374.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=8,6;AS_QD=10.85,10.94;BaseQRankSum=0;DP=52;ExcessHet=0.0000;FS=6.329;MQ=58.30;MQRankSum=-2.523;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.047;SOR=1.687;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,8,0:8:99:217,0,217:0,0,6,2 0/2:12,0,6:18:99:197,234,727,0,493,475:5,7,4,2 +chrX 4684113 . TATATATAC T 38.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=3;AS_QD=19.50;BaseQRankSum=0;DP=28;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.70;MQRankSum=0;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.916;VarDP=4 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,3:4:78:.:78,0:0,1,2,1 0/0:.:18:21:15:0,21,315 +chrX 4684119 . T *,TAC 204.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,10;AS_QD=0.00,15.25;BaseQRankSum=-0.645;DP=33;ExcessHet=0.0000;FS=1.922;MQ=57.39;MQRankSum=0;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.054;SOR=1.061;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,3,0:4:78:78,0,104:0,1,2,1 0/2:6,0,10:16:99:244,262,435,0,173,143:3,3,6,4 +chrX 4686599 . A C 781 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=13.75;BaseQRankSum=-0.594;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=2.177;MQ=59.83;MQRankSum=1.086;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.791;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,164 0/1:28,31:59:99:.:811,0,757:15,13,14,17 +chrX 4691554 . T C 1468 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=19.45;BaseQRankSum=0.757;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.55;SOR=0.446;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1079,0:0,0,18,14 0/1:28,17:45:99:419,0,754:17,11,8,9 +chrX 4692198 . CT C,CTT 65.97 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=4,9;AS_QD=0.25,8.08;BaseQRankSum=-0.985;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=5.315;MQ=58.95;MQRankSum=-0.416;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.916;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,540,540 0/2:4,4,9:17:22:.:105,103,381,0,22,66:1,3,8,5 +chrX 4692319 . T C 427 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=13.85;BaseQRankSum=0;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.18;MQRankSum=0.095;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.082;SOR=0.836;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:90:28:0,90 0/1:17,16:33:99:.:457,0,478:7,10,6,10 +chrX 4694734 . C A 1565 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=19.45;BaseQRankSum=0.673;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.45;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=0.767;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1086,0:0,0,18,17 0/1:28,19:47:99:509,0,802:14,14,10,9 +chrX 4696131 . ATG A 425.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=14.53;BaseQRankSum=0.337;DP=47;ExcessHet=0.0000;FS=1.340;MQ=59.72;MQRankSum=-1.205;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=0.473;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,8:8:99:265,0:0,0,3,5 0/1:15,9:24:99:200,0,401:9,6,6,3 +chrX 4696163 . GTATATA GTA,G 396.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,7;AS_QD=18.17,16.77;BaseQRankSum=-0.83;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=4.947;MQ=59.67;MQRankSum=0.812;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.235;SOR=2.147;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,6,0:7:99:218,0,228:0,1,0,6 0/2:5,0,7:12:78:218,232,331,0,99,78:3,2,3,4 +chrX 4696971 . A AT 1727.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=20.31;BaseQRankSum=1.248;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.834;MQ=59.83;MQRankSum=0;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.137;SOR=0.571;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:922,0:0,0,15,11 0/1:32,29:61:99:845,0,959:14,18,11,18 +chrX 4698388 . T C 1355 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=17.99;BaseQRankSum=1.876;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.790;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.04;SOR=0.682;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:2,29:31:99:853,0:1,1,13,16 0/1:22,24:46:99:532,0,603:13,9,11,13 +chrX 4698782 . AT A 1433.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.75;BaseQRankSum=-2.228;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.273;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.412;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:686,0:0,0,13,9 0/1:19,30:49:99:787,0,443:12,7,15,15 +chrX 4699356 . C CTG 840.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=16.60;BaseQRankSum=0.492;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.60;ReadPosRankSum=1.514;SOR=0.693;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:534,0:0,0,12,8 0/1:17,16:33:99:346,0,393:9,8,7,9 +chrX 4699615 . A G 1675 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=20.06;BaseQRankSum=-0.296;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.87;SOR=0.662;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:953,0:0,0,17,11 0/1:28,29:57:99:752,0,742:15,13,13,16 +chrX 4700004 . G A 1576 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=18.25;BaseQRankSum=0.118;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.884;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.535;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:916,0:0,0,19,11 0/1:31,27:58:99:690,0,804:21,10,17,10 +chrX 4700154 . C CA 767.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=14.16;BaseQRankSum=-0.302;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=2.297;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=1.179;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:478,0:0,0,8,9 0/1:24,16:40:99:329,0,556:12,12,5,11 +chrX 4700691 . T C 1398 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=19.04;BaseQRankSum=-1.646;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=6.465;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.414;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:833,0:0,0,15,12 0/1:25,23:48:99:595,0,705:16,9,9,14 +chrX 4700782 . A G 934 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=17.85;BaseQRankSum=-0.817;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=5.994;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.311;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,759 0/1:19,35:54:99:.:964,0,468:6,13,18,17 +chrX 4702131 . T C 947 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=31.52;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.52;SOR=1.044;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:977,0:0,0,13,18 0/0:.:53:94:53:0,94,1350 +chrX 4702307 . T TAGAG,TATAGAG,TAG,TATATAG 2531.97 . AC=0,1,0,2;AF=0.00,0.333,0.00,0.667;AN=3;AS_AltDP=0,15,0,41;AS_QD=30.60,28.91,24.96,33.97;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=45.91;SOR=0.693;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 2:0,0,15,0,0:15:99:860,533,0,697,697:0,0,7,8 4/4:0,0,0,0,41:41:99:1711,1705,1864,1705,1864,1864,1641,1857,1857,2016,141,155,155,138,0:0,0,21,20 +chrX 4703279 . A ATTTT,ATTTTTTT 634.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=5,5;AS_QD=29.25,26.02;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.89;QD=67.40;SOR=1.609;VarDP=10 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,5,5:10:84:.:674,0,84:0,0,3,7 0/0:.:56:46:56:0,46,972,46,972,972 +chrX 4703287 . A T 759 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=28.49;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.17;QD=43.83;SOR=0.693;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,18:18:99:.:789,0:0,0,9,9 0/0:.:56:46:56:0,46,972 +chrX 4703409 . G A 1286 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=33.74;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=31.74;QD=33.74;SOR=1.387;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:475,0:0,0,9,5 1/1:0,25:25:75:841,75,0:0,0,16,9 +chrX 4704074 . T C 589 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=28.14;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.14;SOR=0.693;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:619,0:0,0,11,11 0/0:.:29:35:28:0,35,805 +chrX 4704101 . A C 749 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=32.46;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=1.051;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:779,0:0,0,10,14 0/0:.:29:35:28:0,35,805 +chrX 4704148 . AAT A 3239.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=27.65;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.51;SOR=0.717;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:917,0:0,0,12,11 1/1:0,60:60:99:2362,181,0:0,0,30,30 +chrX 4704762 . G GAT 3175.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.74;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=0.898;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:1141,0:0,0,10,16 1/1:0,47:47:99:2074,141,0:0,0,23,24 +chrX 4705174 . AATAG AATAGATAG,A 2572.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=40,22;AS_QD=33.33,33.75;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=42.13;SOR=0.976;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23,0:23:99:1016,0,1016:0,0,17,6 1/2:0,17,22:39:99:1596,905,855,696,0,718:0,0,18,21 +chrX 4705706 . T TTAGA 3970.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=27.25;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.07;SOR=1.460;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1688,0:0,0,26,12 1/1:0,53:53:99:2322,159,0:0,0,33,20 +chrX 4708872 . A T 2606 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.95;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.95;SOR=0.908;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:864,0:0,0,12,14 1/1:0,54:54:99:1772,162,0:0,0,32,22 +chrX 4709690 . T A 3250 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=31.54;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.54;SOR=0.693;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:912,0:0,0,20,9 1/1:0,75:75:99:2368,224,0:0,0,32,43 +chrX 4709724 . T C 3327 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=30.52;DP=116;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.52;SOR=0.767;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1086,0:0,0,22,13 1/1:0,75:75:99:2271,224,0:0,0,31,44 +chrX 4709781 . G A 1691 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=33.75;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.75;SOR=0.900;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,199 1/1:0,51:51:99:.:1721,153,0:0,0,23,28 +chrX 4709878 . C CAAAA,A,CA 1043 . AC=1,0,1;AF=0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=17,3,22;AS_QD=27.04,0.00,10.72;BaseQRankSum=-1.799;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=5.291;MQ=59.65;MQRankSum=-0.569;QD=20.63;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=0.371;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0,0:17:99:730,0,731,731:0,0,6,11 0/3:10,0,3,22:35:99:343,417,798,380,812,968,0,233,188,144:7,3,14,11 +chrX 4710417 . C T 2507 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.11;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.11;SOR=1.068;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:560,0:0,0,12,6 1/1:0,61:61:99:1977,183,0:0,0,34,27 +chrX 4710656 . A C 1086 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=31.89;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.89;SOR=0.869;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,486 1/1:0,35:35:99:.:1116,104,0:0,0,16,19 +chrX 4710875 . C T 1150 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=30.26;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.26;SOR=1.096;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,486 1/1:0,39:39:99:.:1180,117,0:0,0,23,16 +chrX 4712329 . G C 356 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=7.42;BaseQRankSum=0.932;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=1.155;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.42;ReadPosRankSum=-2.8;SOR=0.454;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,486 0/1:35,17:52:99:.:386,0,956:21,14,9,8 +chrX 4712720 . C T 1737 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=33.98;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.98;SOR=0.770;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,486 1/1:0,52:52:99:.:1767,156,0:0,0,25,27 +chrX 4713049 . TAAAC T 968.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=19.02;BaseQRankSum=0.745;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=7.686;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.02;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.601;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,486 0/1:26,27:53:99:.:1008,0,987:17,9,12,15 +chrX 4713060 . TA T 2024.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=29.21;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.21;SOR=0.960;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,486 1/1:0,57:57:99:.:2064,171,0:0,0,32,25 +chrX 4713124 . A T 1716 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=32.33;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.33;SOR=0.846;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,486 1/1:0,54:54:99:.:1746,162,0:0,0,29,25 +chrX 4713213 . C T 2528 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.79;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=0.855;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:776,0:0,0,14,10 1/1:0,54:54:99:1782,162,0:0,0,22,32 +chrX 4713255 . A C 2205 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.39;BaseQRankSum=4.518;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=6.477;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.39;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.370;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:596,0:0,0,11,7 1/1:2,49:51:99:1639,119,0:0,2,25,24 +chrX 4713334 . T TA 604.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=11.71;BaseQRankSum=-0.346;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=8.321;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.361;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,14:15:99:283,0:1,0,4,10 0/1:16,24:40:99:361,0,231:11,5,14,10 +chrX 4713498 . GTT G 1780.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=33.09;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=38.72;SOR=1.251;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:99:23:0,490 1/1:0,47:47:99:.:1820,141,0:0,0,18,29 +chrX 4713866 . G A 2376 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=74;AS_QD=32.51;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.51;SOR=0.804;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:903,0:0,0,15,12 1/1:0,47:47:99:1503,140,0:0,0,24,23 +chrX 4714032 . T G 2537 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=31.69;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.69;SOR=0.718;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:814,0:0,0,11,13 1/1:0,57:57:99:1753,169,0:0,0,29,28 +chrX 4714047 . AAACTCC A 3515.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=29.46;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.770;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1260,0:0,0,13,15 1/1:0,51:51:99:2295,154,0:0,0,25,26 +chrX 4714331 . A G 2686 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=85;AS_QD=31.95;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.95;SOR=1.039;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:999,0:0,0,21,12 1/1:0,52:52:99:1717,155,0:0,0,28,24 +chrX 4714520 . T C 2343 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.51;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.51;SOR=0.776;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:976,0:0,0,12,19 1/1:0,42:42:99:1397,126,0:0,0,26,16 +chrX 4715166 . G T 2674 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=33.38;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.38;SOR=0.718;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1022,0:0,0,12,19 1/1:0,50:50:99:1682,150,0:0,0,28,22 +chrX 4715281 . C T 1647 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=25.12;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=3.310;MQ=57.35;MQRankSum=2.071;QD=37.27;SOR=0.511;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,13:14:99:.:.:463,0:.:0,1,8,5 1|1:0,31:31:93:0|1:4715281_C_T:1214,93,0:4715281:0,0,16,15 +chrX 4715296 . C CCTCTCTCTCT,CCTCTCTCT 1910.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=12,37;AS_QD=34.23,28.61;BaseQRankSum=1.752;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.55;MQRankSum=1.988;QD=39.00;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.412;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,12,0:13:99:.:.:445,0,490:.:0,1,6,6 2|2:0,0,37:37:99:0|1:4715281_C_T:1505,1505,1505,111,111,0:4715281:0,0,14,23 +chrX 4715594 . C G 2883 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.73;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.73;SOR=0.965;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1211,0:0,0,21,16 1/1:0,52:52:99:1702,156,0:0,0,29,23 +chrX 4715673 . G T 2986 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=96;AS_QD=31.09;BaseQRankSum=1.496;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=3.740;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.09;ReadPosRankSum=1.734;SOR=0.781;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,37:38:99:1131,0:1,0,16,21 1/1:0,59:59:99:1885,177,0:0,0,24,35 +chrX 4715973 . T C 2531 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.83;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=1.040;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:606,0:0,0,10,8 1/1:0,60:60:99:1955,180,0:0,0,35,25 +chrX 4716079 . T C 1927 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=34.33;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.33;SOR=1.047;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:832,0:0,0,12,12 1/1:0,33:33:99:1125,99,0:0,0,21,12 +chrX 4716560 . T C 2848 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.34;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.34;SOR=1.204;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:982,0:0,0,12,19 1/1:0,58:58:99:1896,174,0:0,0,23,35 +chrX 4716877 . CT C 997.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=24.69;BaseQRankSum=-0.383;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.222;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.69;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.453;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,456 1|1:1,41:42:99:.:0|1:4716877_CT_C:1037,101,0:4716877:0,1,22,19 +chrX 4716893 . T A 1972 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=31.85;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=42.60;SOR=0.823;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,456 1|1:0,47:47:99:.:0|1:4716877_CT_C:2002,141,0:4716877:0,0,22,25 +chrX 4717279 . T A 1917 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.00;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=0.950;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,59:59:99:.:1947,177,0:0,0,33,26 +chrX 4717870 . C T 1603 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=33.33;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.33;SOR=0.818;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,49:49:99:.:1633,147,0:0,0,23,26 +chrX 4717967 . A G 1884 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=31.38;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.38;SOR=1.197;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,61:61:99:.:1914,182,0:0,0,37,24 +chrX 4718501 . C A 1553 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=32.98;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.98;SOR=1.067;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,48:48:99:.:1583,144,0:0,0,20,28 +chrX 4719008 . C G 1412 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=29.43;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=29.43;SOR=0.733;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,49:49:99:.:1442,145,0:0,0,24,25 +chrX 4719205 . CT C 406.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=15.38;BaseQRankSum=0.556;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=4.645;MQ=58.65;MQRankSum=-0.591;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=0.148;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 0/1:5,24:29:7:.:446,0,7:4,1,12,12 +chrX 4719321 . G A 1270 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=32.50;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.67;QD=32.50;SOR=0.693;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,40:40:99:.:1300,120,0:0,0,20,20 +chrX 4719509 . CT C 1117.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=28.93;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.88;QD=28.93;SOR=0.902;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,40:40:99:.:1157,120,0:0,0,18,22 +chrX 4719664 . A G 1871 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=32.78;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.78;SOR=1.179;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,58:58:99:.:1901,174,0:0,0,35,23 +chrX 4720209 . T A 1953 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=31.98;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.98;SOR=0.758;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,62:62:99:.:1983,185,0:0,0,30,32 +chrX 4720731 . A G 558 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.51;BaseQRankSum=-2.314;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.509;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.51;ReadPosRankSum=2.183;SOR=0.368;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 0/1:23,24:47:99:.:588,0,639:14,9,12,12 +chrX 4721455 . T C 1873 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=32.25;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.25;SOR=0.871;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 1/1:0,59:59:99:.:1903,176,0:0,0,27,32 +chrX 4721616 . A ATG 339.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=8.81;BaseQRankSum=-1.882;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=1.194;MQ=59.73;MQRankSum=0;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.604;SOR=0.475;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,456 0/1:22,21:43:99:.:379,0,790:14,8,12,9 +chrX 4721620 . GTGTGTGTGTGTA G 667.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=14.14;BaseQRankSum=1.844;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.114;MQ=59.74;MQRankSum=0.824;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.02;SOR=0.889;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:30:99:30:.:.:0,456 0|1:31,19:50:99:.:0|1:4721620_GTGTGTGTGTGTA_G:707,0,1240:4721620:18,13,12,7 +chrX 4721632 . A G,* 3204 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=61,19;AS_QD=30.46,0.00;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.62;QD=40.43;SOR=1.096;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,30,0:30:99:.:.:976,0,976:.:0,0,17,13 1|2:0,31,19:50:99:1|0:4721620_GTGTGTGTGTGTA_G:2258,826,706,1227,0,1241:4721620:0,0,30,20 +chrX 4722095 . C CTT 537.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=23.08;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.58;QD=23.08;SOR=1.136;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,338 1/1:0,25:25:74:.:577,74,0:0,0,15,10 +chrX 4723975 . T C 2480 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=32.60;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=1.012;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1087,0:0,0,18,15 1/1:0,44:44:99:1423,132,0:0,0,15,29 +chrX 4724379 . A AC,C 1808 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=62,4;AS_QD=29.17,28.31;BaseQRankSum=-0.672;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.43;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.337;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,29,0:30:99:782,0,811:1,0,13,16 1/1:0,33,4:37:43:1056,114,0,847,43,926:0,0,24,13 +chrX 4724977 . T C 3610 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=115;AS_QD=31.65;DP=118;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.65;SOR=0.820;VarDP=115 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1056,0:0,0,19,15 1/1:0,81:81:99:2584,243,0:0,0,42,39 +chrX 4725060 . A G 3441 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=110;AS_QD=31.55;DP=113;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.55;SOR=0.693;VarDP=110 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1224,0:0,0,21,17 1/1:0,72:72:99:2247,216,0:0,0,34,38 +chrX 4725103 . A G 2957 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=98;AS_QD=30.48;DP=106;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.87;QD=30.48;SOR=0.820;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1104,0:0,0,21,15 1/1:0,62:62:99:1883,184,0:0,0,31,31 +chrX 4725263 . A G 2256 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=33.13;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.13;SOR=0.980;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:951,0:0,0,16,13 1/1:0,40:40:99:1335,120,0:0,0,14,26 +chrX 4725680 . T C 2762 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=30.68;BaseQRankSum=-0.557;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.68;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.327;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:803,0:0,0,15,11 1/1:1,64:65:99:1989,160,0:1,0,35,29 +chrX 4729239 . C T 1548 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.20;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.20;SOR=1.007;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,522 1/1:0,49:49:99:.:1578,147,0:0,0,28,21 +chrX 4729408 . C G 1877 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=30.27;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.27;SOR=0.790;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,522 1/1:0,63:63:99:.:1907,187,0:0,0,30,33 +chrX 4729921 . G T 2507 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=81;AS_QD=30.94;BaseQRankSum=-0.784;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.94;ReadPosRankSum=1.398;SOR=0.254;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,30:31:99:876,0:0,1,14,16 1/1:0,51:51:99:1661,152,0:0,0,25,26 +chrX 4730137 . G C 2039 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=31.35;BaseQRankSum=-0.481;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.271;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,506 1/1:1,65:66:99:.:2069,163,0:0,1,33,32 +chrX 4730372 . C CT 217.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=8.03;BaseQRankSum=0.298;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.400;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.790;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,506 0/1:16,16:32:99:.:257,0,229:7,9,9,7 +chrX 4731012 . T G 1514 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=34.31;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.31;SOR=1.038;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,506 1/1:0,45:45:99:.:1544,135,0:0,0,19,26 +chrX 4731430 . G A 710 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=33.64;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.64;SOR=0.874;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:740,0:0,0,10,12 0/0:.:33:39:32:0,39,897 +chrX 4731722 . A G 1063 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=30.36;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.36;SOR=1.209;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,532 1/1:0,36:36:99:.:1093,106,0:0,0,22,14 +chrX 4731809 . T TAC 548.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=16.80;BaseQRankSum=-0.777;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=3.216;MQ=59.44;MQRankSum=0;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.775;SOR=1.426;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,532 0/1:14,21:35:99:.:588,0,365:8,6,15,6 +chrX 4732739 . TTA T 1682.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=31.34;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.00;SOR=0.693;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,532 1/1:0,42:42:99:.:1722,126,0:0,0,21,21 +chrX 4732985 . A G 1534 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=33.28;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.28;SOR=1.251;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,532 1/1:0,47:47:99:.:1564,141,0:0,0,18,29 +chrX 4733110 . G A 1190 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=33.89;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.89;SOR=1.371;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,532 1/1:0,36:36:99:.:1220,108,0:0,0,13,23 +chrX 4733583 . A G 667 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.87;BaseQRankSum=-0.782;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.770;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,532 0/1:14,25:39:99:.:697,0,360:7,7,13,12 +chrX 4734461 . ATGTGTGTGTGTGTGTG A,ATG 2632.97 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=59,3;AS_QD=29.42,33.86;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.10;SOR=0.758;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0:17:99:768,0,768:0,0,7,10 1/1:0,42,3:45:41:1904,137,0,1362,41,1237:0,0,25,20 +chrX 4734569 . T A 643 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.46;BaseQRankSum=-0.622;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.189;SOR=0.712;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,382 0/1:29,25:54:99:.:673,0,815:15,14,12,13 +chrX 4734835 . G A 1832 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=33.85;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.85;SOR=0.804;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,382 1/1:0,55:55:99:.:1862,165,0:0,0,29,26 +chrX 4735144 . A G 1928 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.19;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.19;SOR=1.316;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,382 1/1:0,59:59:99:.:1958,177,0:0,0,22,37 +chrX 4736237 . G A 1630 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=31.32;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.32;SOR=0.730;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,382 1/1:0,53:53:99:.:1660,158,0:0,0,26,27 +chrX 4737626 . CAA C 281.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=17.83;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=13.676;MQ=57.95;MQRankSum=-0.543;QD=17.83;SOR=1.762;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,382 0/1:3,15:18:6:.:321,0,6:0,3,11,4 +chrX 4737687 . G A 1638 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=34.04;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.04;SOR=1.609;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,382 1/1:0,49:49:99:.:1668,147,0:0,0,33,16 +chrX 4738976 . GA G 2803.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.68;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.68;SOR=0.812;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1112,0:0,0,12,22 1/1:0,53:53:99:1731,159,0:0,0,29,24 +chrX 4739139 . GCACA G 2558.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=31.31;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.79;SOR=0.762;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,6,7 1|1:0,45:45:99:0|1:4739139_GCACA_G:2013,136,0:4739139:0,0,22,23 +chrX 4739145 . A G 2568 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=25.19;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.79;SOR=0.762;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,6,7 1|1:0,45:45:99:0|1:4739139_GCACA_G:2013,135,0:4739139:0,0,22,23 +chrX 4739147 . A G 2568 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=33.00;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.79;SOR=0.762;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,13:13:99:.:.:585,0:.:0,0,6,7 1|1:0,45:45:99:0|1:4739139_GCACA_G:2013,136,0:4739139:0,0,22,23 +chrX 4739850 . T C 789 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=32.76;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.55;QD=32.76;SOR=2.584;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,427 1/1:0,25:25:75:.:819,75,0:0,0,5,20 +chrX 4740457 . T C 2514 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.02;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.02;SOR=0.742;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:967,0:0,0,18,14 1/1:0,50:50:99:1577,149,0:0,0,24,26 +chrX 4741820 . G A 1930 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=33.22;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.22;SOR=0.726;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,436 1/1:0,59:59:99:.:1960,177,0:0,0,29,30 +chrX 4742225 . G C 1374 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=32.65;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.33;QD=32.65;SOR=0.941;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,9:9:99:268,0:0,0,4,5 1/1:0,34:34:99:1136,102,0:0,0,15,19 +chrX 4742232 . C CT 298.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.36;BaseQRankSum=-0.319;DP=44;ExcessHet=0.0000;FS=4.393;MQ=58.85;MQRankSum=0;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.326;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,3:4:23:23,0:0,1,1,2 1/1:0,18:18:52:315,52,0:0,0,13,5 +chrX 4742429 . A G 2165 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=31.36;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.36;SOR=0.750;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:723,0:0,0,15,10 1/1:0,45:45:99:1472,134,0:0,0,21,24 +chrX 4742981 . A ATG 547.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=13.65;BaseQRankSum=1.562;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=6.514;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.648;SOR=0.806;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,178 0/1:19,24:43:99:.:587,0,453:7,12,14,10 +chrX 4745817 . CA C 65.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=4.77;BaseQRankSum=2.286;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=44.682;MQ=57.49;MQRankSum=0.497;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=4.796;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,178 0/1:12,10:22:99:.:105,0,153:1,11,10,0 +chrX 4745894 . G A 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=26.32;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=1.179;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,13:13:99:.:585,0:0,0,5,8 0/0:.:60:70:60:0,70,1100 +chrX 4745901 . T TA 545.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=28.24;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=1.179;VarDP=13 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,13:13:99:.:585,0:0,0,5,8 0/0:.:60:70:60:0,70,1100 +chrX 4746418 . A T 1564 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=31.88;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.88;SOR=0.952;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,418 1/1:0,50:50:99:.:1594,150,0:0,0,28,22 +chrX 4746916 . GA G 575.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=30.75;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.75;SOR=1.127;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:615,0:0,0,8,12 0/0:.:52:62:52:0,62,1067 +chrX 4747368 . G A 997 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=32.09;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.09;SOR=1.112;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:1027,0:0,0,19,13 0/0:.:52:62:52:0,62,1067 +chrX 4750216 . ATGTGTG A,ATG,ATGTG 365.97 . AC=0,0,1;AF=0.00,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,0,13;AS_QD=1.38,0.00,13.97;BaseQRankSum=1.266;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.455;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.797;SOR=0.666;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,401,401,401 0/3:16,0,0,13:29:99:.:405,383,1413,499,1337,1450,0,504,428,412:7,9,7,6 +chrX 4750255 . T A 868 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=35.31;BaseQRankSum=1.909;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.074;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=37.42;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.144;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,401 1/1:2,22:24:40:.:898,40,0:2,0,12,10 +chrX 4750257 . T TGAGA,A 2225 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=15,22;AS_QD=27.72,32.76;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.82;QD=60.95;SOR=0.746;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14,0:14:99:598,0,598:0,0,5,9 2/2:0,1,22:23:67:1657,983,1293,90,67,0:0,0,13,10 +chrX 4750303 . C T 1347 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=30.60;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.84;QD=30.60;SOR=1.280;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:16:99:16:0,432 1/1:0,45:45:99:.:1377,133,0:0,0,17,28 +chrX 4750339 . A ATT 792.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=25.03;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.17;SOR=0.963;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:832,0:0,0,10,13 0/0:.:57:82:57:0,82,1319 +chrX 4750408 . C G 868 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=33.26;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.26;SOR=0.765;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,27:27:99:.:898,0:0,0,13,14 0/0:.:57:82:57:0,82,1319 +chrX 4751548 . C G 2858 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.45;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.45;SOR=0.911;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:650,0:0,0,10,10 1/1:0,69:69:99:2238,207,0:0,0,39,30 +chrX 4751952 . G A 2284 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.59;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.59;SOR=1.117;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:914,0:0,0,15,14 1/1:0,42:42:99:1400,126,0:0,0,14,28 +chrX 4752399 . C CAT,T 2814 . AC=3,0;AF=1.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=63,5;AS_QD=25.39,33.07;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.82;SOR=0.752;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23,0:23:99:988,0,988:0,0,6,17 1/1:0,40,5:45:45:1856,135,0,1218,45,1129:0,0,27,18 +chrX 4752503 . GA G 1565.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.87;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.87;SOR=0.770;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:525,0:0,0,9,8 1/1:0,35:35:99:1080,105,0:0,0,16,19 +chrX 4752671 . T C 2713 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=33.05;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.05;SOR=0.717;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1116,0:0,0,19,16 1/1:0,48:48:99:1627,144,0:0,0,23,25 +chrX 4753268 . T C 839 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=34.76;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.76;SOR=0.770;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:869,0:0,0,12,13 0/0:.:51:57:51:0,57,1007 +chrX 4754205 . TATAG T 2209.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=32.45;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=1.314;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:755,0:0,0,12,5 1/1:0,34:34:99:1494,102,0:0,0,20,14 +chrX 4756437 . AC A 1874.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=32.47;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=39.06;SOR=0.733;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,426 1/1:0,49:49:99:.:1914,147,0:0,0,24,25 +chrX 4756859 . CTTT C 741.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=23.67;BaseQRankSum=0.824;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.67;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=0.765;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,426 0/1:13,20:33:99:.:781,0,486:4,9,6,14 +chrX 4756927 . C CCT 1620.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=32.95;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.50;SOR=2.191;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:605,0:0,0,3,11 1/1:0,26:26:78:1055,78,0:0,0,7,19 +chrX 4757104 . A G 1069 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=28.18;DP=46;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.18;SOR=1.730;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:446,0:0,0,4,11 1/1:0,24:24:69:653,69,0:0,0,8,16 +chrX 4757133 . CTTTCTTTCTTT C 328.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=10;AS_QD=14.15;BaseQRankSum=0.849;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=1.653;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.434;SOR=1.270;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,462 0/1:16,10:26:99:.:368,0,624:7,9,3,7 +chrX 4757176 . TTTTC T 520.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=16.97;BaseQRankSum=-0.864;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=3.093;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.622;SOR=0.293;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,462 0/1:17,16:33:99:.:560,0,643:6,11,8,8 +chrX 4757440 . C T 664 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=14.46;BaseQRankSum=0.54;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=10.286;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.372;SOR=0.889;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,462 0/1:23,25:48:99:.:694,0,615:15,8,10,15 +chrX 4757743 . C T 644 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=12.25;BaseQRankSum=1.088;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=7.389;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.465;SOR=0.361;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,462 0/1:30,25:55:99:.:674,0,799:10,20,13,12 +chrX 4757981 . T C 902 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=32.14;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.14;SOR=0.906;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:932,0:0,0,16,13 0/0:.:64:99:64:0,120,1800 +chrX 4758474 . A G 3016 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=94;AS_QD=32.06;BaseQRankSum=-0.325;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=4.095;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=32.06;ReadPosRankSum=0.525;SOR=1.027;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:902,0:0,0,10,19 1/1:1,65:66:99:2144,164,0:1,0,26,39 +chrX 4758914 . A C 690 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=31.30;BaseQRankSum=2.834;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.30;ReadPosRankSum=-0.83;SOR=0.399;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,22:23:99:.:720,0:0,1,9,13 0/0:.:52:83:52:0,83,1342 +chrX 4759004 . A T 934 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=32.13;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.13;SOR=0.976;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:964,0:0,0,13,17 0/0:.:52:83:52:0,83,1342 +chrX 4759611 . G A 545 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.78;BaseQRankSum=0.376;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.78;ReadPosRankSum=-1.446;SOR=0.665;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,590 0/1:24,21:45:99:.:575,0,653:9,15,8,13 +chrX 4759957 . C CTT,CT 927.97 . AC=1,2;AF=0.333,0.667;AN=3;AS_AltDP=18,22;AS_QD=29.72,19.64;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=24.18;SOR=1.151;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18,0:18:99:535,0,535:0,0,7,11 2/2:0,0,22:22:65:432,432,432,65,65,0:0,0,9,13 +chrX 4760415 . A ATG 346.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=16.78;BaseQRankSum=0.502;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=3.834;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.802;SOR=1.015;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,467 0|1:10,13:23:99:.:0|1:4760415_A_ATG:386,0,293:4760415:6,4,5,8 +chrX 4760436 . A T 313 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=11.06;BaseQRankSum=0.831;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.583;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.416;SOR=0.967;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:99:27:.:.:0,467 0|1:18,13:31:99:.:1|0:4760415_A_ATG:343,0,547:4760415:8,10,6,4 +chrX 4761176 . C T 583 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.72;BaseQRankSum=1.585;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.261;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.72;ReadPosRankSum=-1.945;SOR=0.425;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,467 0/1:18,21:39:99:.:613,0,488:11,7,11,10 +chrX 4761856 . G GGAGA 1983.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=30.19;BaseQRankSum=2.081;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.055;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.19;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.478;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1462,0:0,0,15,18 0/1:19,15:34:99:561,0,732:7,12,6,9 +chrX 4765511 . A AG 505.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=12.67;BaseQRankSum=0.386;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=6.673;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.503;SOR=1.253;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,315 0/1:26,17:43:99:.:545,0,919:11,15,11,6 +chrX 4766881 . AT A 655.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.44;BaseQRankSum=-0.168;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=-0.696;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.665;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,199 0/1:16,29:45:99:.:695,0,322:9,7,16,13 +chrX 4767013 . CTTT C,CTTTT 346.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=6,12;AS_QD=28.00,15.17;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.99;QD=21.44;SOR=1.863;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,199,199 1/2:0,6,12:18:99:.:386,218,514,215,0,204:0,0,5,13 +chrX 4767811 . CT C 354.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.13;BaseQRankSum=-0.851;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=5.930;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.506;SOR=1.273;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,199 0/1:10,20:30:99:.:394,0,149:6,4,7,13 +chrX 4769994 . C A,CA 385 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=5,20;AS_QD=4.30,11.86;BaseQRankSum=-0.668;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.258;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.983;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,199,199 0/2:15,5,20:40:99:.:415,329,924,0,247,288:7,8,10,15 +chrX 4770141 . GA G 490.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.05;BaseQRankSum=0.213;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.652;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=1.270;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,199 0/1:20,24:44:99:.:530,0,426:10,10,15,9 +chrX 4771242 . CACACACACACAT C 1236.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=20.25;BaseQRankSum=-1.429;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=5.136;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.22;SOR=0.268;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,199 0|1:30,33:63:99:.:0|1:4771242_CACACACACACAT_C:1276,0,1160:4771242:20,10,17,16 +chrX 4771255 . A G 1245 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=20.24;BaseQRankSum=-0.427;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=5.136;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.268;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,199 0|1:30,33:63:99:.:0|1:4771242_CACACACACACAT_C:1275,0,1160:4771242:20,10,17,16 +chrX 4771769 . C T 1034 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=16.63;BaseQRankSum=-0.354;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=3.469;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.305;SOR=1.151;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,199 0/1:24,40:64:99:.:1064,0,568:12,12,24,16 +chrX 4772610 . T G 1412 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=17.17;BaseQRankSum=0.233;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=2.966;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.05;SOR=0.694;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:725,0:0,0,11,11 0/1:34,28:62:99:717,0,935:15,19,16,12 +chrX 4773701 . G A 1684 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=21.16;BaseQRankSum=-0.85;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=12.688;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.756;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:849,0:0,0,14,11 0/1:24,32:56:99:865,0,590:8,16,19,13 +chrX 4775155 . GAA GAAAAAAA,G 501.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=4,12;AS_QD=20.38,23.63;BaseQRankSum=-0.74;DP=38;ExcessHet=0.0000;FS=5.727;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.05;ReadPosRankSum=-1.822;SOR=0.094;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,4,0:4:99:.:.:163,0,163:.:0,0,3,1 0|2:4,0,12:16:75:0|1:4775155_GAA_G:378,390,502,0,112,75:4775155:4,0,7,5 +chrX 4776293 . A AT 2191.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=68;AS_QD=24.25;BaseQRankSum=1.674;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.898;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.880;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1183,0:0,0,14,19 0/1:24,35:59:99:1048,0,679:12,12,17,18 +chrX 4776510 . T C 2064 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=23.80;BaseQRankSum=-0.76;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.80;ReadPosRankSum=2.044;SOR=0.608;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,39:39:99:1239,0:0,0,20,19 0/1:18,31:49:99:855,0,458:8,10,13,18 +chrX 4777077 . G T 556 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.61;BaseQRankSum=0.557;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.53;MQRankSum=1.133;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.634;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,755 0/1:38,23:61:99:.:586,0,1067:16,22,10,13 +chrX 4777158 . T G 763 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=31.72;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.72;SOR=0.941;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:793,0:0,0,11,14 0/0:.:56:99:56:0,104,1574 +chrX 4777179 . G GAATA 2203.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=29.51;BaseQRankSum=0.805;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=4.976;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.51;ReadPosRankSum=1.288;SOR=0.634;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1305,0:0,0,15,14 0/1:23,24:47:99:938,0,894:14,9,9,15 +chrX 4777876 . TTC T 1123.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=20.77;BaseQRankSum=-1.433;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=4.046;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=1.220;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:674,0:0,0,8,11 0/1:19,18:37:99:489,0,552:10,9,6,12 +chrX 4778036 . C CTTTTTTTT 1390.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=25.54;BaseQRankSum=1.102;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;MQRankSum=0;QD=25.54;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.723;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,19:19:99:.:.:819,0:.:0,0,10,9 0|1:20,17:37:99:0|1:4778036_C_CTTTTTTTT:611,0,720:4778036:11,9,10,7 +chrX 4778147 . A C 1211 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=17.73;BaseQRankSum=-1.281;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.73;ReadPosRankSum=-2.572;SOR=0.784;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:774,0:0,0,11,13 0/1:26,20:46:99:467,0,726:13,13,12,8 +chrX 4778604 . GT G 1057.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=13.71;BaseQRankSum=0.971;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.004;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=1.056;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:646,0:0,0,10,13 0/1:35,22:57:99:451,0,798:16,19,7,15 +chrX 4778764 . T C 1611 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=27.35;BaseQRankSum=-2.16;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.693;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,21:21:99:.:.:916,0:.:0,0,10,11 0|1:18,21:39:99:0|1:4778764_T_C:725,0,665:4778764:9,9,11,10 +chrX 4778766 . TTC T 247.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=19.13;BaseQRankSum=-0.432;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=3.310;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.17;SOR=0.349;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:2,13:15:99:.:287,0:2,0,6,7 0/0:.:38:69:38:0,69,1035 +chrX 4778767 . TC *,T 688.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,21;AS_QD=0.00,19.16;BaseQRankSum=-1.819;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=1.108;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.03;SOR=0.446;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:2,13,0:15:99:.:.:287,0,357:.:2,0,6,7 0|2:17,0,21:38:99:0|1:4778764_T_C:728,779,1481,0,702,639:4778764:9,8,11,10 +chrX 4779094 . C T 1138 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=15.17;BaseQRankSum=-1.1;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.876;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.17;ReadPosRankSum=-2.148;SOR=0.653;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:644,0:0,0,11,9 0/1:35,22:57:99:524,0,956:19,16,9,13 +chrX 4779280 . T A 1139 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=16.94;BaseQRankSum=0.882;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=3.288;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.492;SOR=0.666;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:591,0:0,0,7,10 0/1:30,22:52:99:578,0,814:13,17,14,8 +chrX 4779310 . A C 1442 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=19.89;BaseQRankSum=1.444;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=6.696;MQ=59.99;MQRankSum=0;QD=19.89;ReadPosRankSum=-2.109;SOR=0.683;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:661,0:0,0,11,10 0/1:24,29:53:99:811,0,610:9,15,17,12 +chrX 4779388 . T C 1513 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=19.53;BaseQRankSum=-1.753;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.913;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.840;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:834,0:0,0,17,9 0/1:25,28:53:99:709,0,680:14,11,15,13 +chrX 4779586 . A C 1529 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=22.93;BaseQRankSum=2.438;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=2.321;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.93;ReadPosRankSum=1.327;SOR=0.708;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:893,0:0,0,15,12 0/1:18,23:41:99:666,0,442:8,10,12,11 +chrX 4779616 . A G 1399 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=22.33;BaseQRankSum=-0.179;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=1.129;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.33;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.721;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:865,0:0,0,15,12 0/1:15,22:37:99:564,0,370:7,8,11,11 +chrX 4779790 . A T 1623 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=17.97;BaseQRankSum=0.242;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=2.879;MQ=59.86;MQRankSum=0;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.741;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:912,0:0,0,10,20 0/1:33,29:62:99:741,0,860:18,15,17,12 +chrX 4779822 . T C 1472 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=19.26;BaseQRankSum=-0.87;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=3.148;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.945;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:799,0:0,0,6,17 0/1:27,28:55:99:703,0,714:14,13,16,12 +chrX 4779968 . C G 1532 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=19.53;BaseQRankSum=2.002;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.895;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.53;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=0.560;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,27:28:99:864,0:1,0,15,12 0/1:25,27:52:99:698,0,667:13,12,12,15 +chrX 4780027 . T C 1381 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=19.07;BaseQRankSum=-0.313;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.933;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.964;SOR=0.755;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,26:27:99:828,0:1,0,14,12 0/1:24,23:47:99:583,0,683:11,13,12,11 +chrX 4780056 . G T 1260 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=18.70;BaseQRankSum=-0.203;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.925;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.836;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:745,0:0,0,13,9 0/1:26,21:47:99:545,0,702:13,13,10,11 +chrX 4780109 . A G 1154 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=19.10;BaseQRankSum=-2.162;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=2.232;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.524;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:684,0:0,0,11,11 0/1:21,19:40:99:500,0,610:12,9,9,10 +chrX 4780325 . C T 1313 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=19.75;BaseQRankSum=-2.322;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=3.530;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.75;ReadPosRankSum=-1.407;SOR=0.766;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:732,0:0,0,12,10 0/1:23,23:46:99:611,0,660:13,10,8,15 +chrX 4780349 . GTATA G 1684.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=24.28;BaseQRankSum=0.066;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.998;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.728;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,21:21:99:.:.:895,0:.:0,0,11,10 0|1:28,22:50:99:0|1:4780349_GTATA_G:829,0,1109:4780349:15,13,9,13 +chrX 4780355 . GTA G 1684.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=24.28;BaseQRankSum=-0.676;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.998;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=0.728;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,21:21:99:.:.:895,0:.:0,0,11,10 0|1:28,22:50:99:0|1:4780349_GTATA_G:829,0,1109:4780349:15,13,9,13 +chrX 4780427 . C T 1965 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=28.10;BaseQRankSum=2.506;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=5.068;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.10;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.926;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1183,0:.:0,0,8,19 0|1:23,21:44:99:0|1:4780427_C_T:812,0,880:4780427:13,10,12,9 +chrX 4780434 . A G 2003 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=28.63;BaseQRankSum=-0.101;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.118;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=1.007;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1218,0:.:0,0,9,19 0|1:22,21:43:99:0|1:4780427_C_T:815,0,840:4780427:11,11,12,9 +chrX 4780537 . T G 1196 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=16.79;BaseQRankSum=0.073;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=6.352;MQ=59.84;MQRankSum=0;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.597;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:719,0:0,0,13,11 0/1:29,20:49:99:507,0,799:11,18,11,9 +chrX 4780622 . T C 1428 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=18.00;BaseQRankSum=-2.214;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=7.749;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=1.147;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1096,0:0,0,21,14 0/1:29,17:46:99:362,0,809:13,16,11,6 +chrX 4781806 . T G 2036 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=26.49;BaseQRankSum=1.394;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=8.008;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=0.606;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,34:34:99:.:.:1473,0:.:0,0,15,19 0|1:27,17:44:99:0|1:4781806_T_G:593,0,1032:4781806:17,10,8,9 +chrX 4781823 . T C 2141 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=26.80;BaseQRankSum=0.422;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=6.233;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=0.533;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,36:36:99:.:.:1547,0:.:0,0,16,20 0|1:27,18:45:99:0|1:4781806_T_G:624,0,1029:4781806:17,10,9,9 +chrX 4782576 . G A 1807 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=25.87;BaseQRankSum=2.501;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.68;MQRankSum=0;QD=25.87;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=0.696;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1079,0:.:0,0,7,17 0|1:27,20:47:99:0|1:4782576_G_A:758,0,1048:4782576:11,16,11,9 +chrX 4782577 . A G 1807 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=25.87;BaseQRankSum=1.777;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.57;MQRankSum=0;QD=25.87;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.696;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1079,0:.:0,0,7,17 0|1:27,20:47:99:0|1:4782576_G_A:758,0,1048:4782576:11,16,11,9 +chrX 4782626 . GTAGA G 604.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=15.71;BaseQRankSum=1.674;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=2.755;MQ=59.34;MQRankSum=1.24;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.965;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:20:99:20:.:.:0,452 0|1:24,17:41:99:.:1|0:4782576_G_A:644,0,849:4782576:13,11,7,10 +chrX 4782930 . A G 1157 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=20.12;BaseQRankSum=-0.745;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=1.059;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.12;ReadPosRankSum=1.583;SOR=0.519;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:606,0:0,0,7,11 0/1:19,22:41:99:581,0,509:8,11,12,10 +chrX 4783101 . A AGATG 1486.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=27.25;BaseQRankSum=1.504;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.25;ReadPosRankSum=0.759;SOR=0.660;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:744,0:0,0,10,7 0/1:19,20:39:99:782,0,738:10,9,8,12 +chrX 4783132 . T C 1021 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=18.77;BaseQRankSum=-0.448;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.77;ReadPosRankSum=-1.53;SOR=0.619;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16:16:99:506,0:0,0,8,8 0/1:20,20:40:99:545,0,555:9,11,9,11 +chrX 4783195 . G A 871 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=14.77;BaseQRankSum=-0.046;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=2.133;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.46;SOR=0.910;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,14:14:99:457,0:0,0,8,6 0/1:29,18:47:99:444,0,789:14,15,10,8 +chrX 4783210 . AAGAT A 1005.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=21.33;BaseQRankSum=-1.442;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=4.022;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.33;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.873;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:484,0:0,0,7,4 0/1:23,15:38:99:561,0,920:10,13,8,7 +chrX 4783703 . A G 1641 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=23.87;BaseQRankSum=0.986;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.87;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.753;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1121,0:0,0,18,17 0/1:15,20:35:99:550,0,351:8,7,12,8 +chrX 4784030 . G A 978 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=33.60;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.60;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:1008,0:0,0,16,14 0/0:.:45:84:45:0,84,1132 +chrX 4784228 . GT G 1166.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=19.14;BaseQRankSum=-1.095;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=13.838;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.655;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:649,0:0,0,11,12 0/1:16,24:40:99:557,0,327:4,12,16,8 +chrX 4784546 . A G 1292 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=15.93;BaseQRankSum=-1.201;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=7.205;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.434;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:575,0:0,0,8,10 0/1:35,30:65:99:747,0,951:22,13,15,15 +chrX 4785263 . ACC A 1913.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=29.15;BaseQRankSum=2.942;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=57.862;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.15;ReadPosRankSum=1.455;SOR=1.387;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1115,0:0,0,17,11 0/1:15,24:39:99:838,0,450:0,15,18,6 +chrX 4785309 . T C 1476 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=22.82;BaseQRankSum=-1.839;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=38.955;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.82;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=1.395;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:765,0:0,0,14,8 0/1:17,27:44:99:741,0,458:2,15,19,8 +chrX 4785871 . C T 1881 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=18.74;BaseQRankSum=1.427;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.205;SOR=0.706;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,37:37:99:1163,0:0,0,22,15 0/1:37,28:65:99:748,0,980:21,16,15,13 +chrX 4785977 . G A 1857 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=20.97;BaseQRankSum=3.024;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.844;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=20.97;ReadPosRankSum=-1.318;SOR=0.650;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1340,0:0,0,20,20 0/1:30,20:50:99:547,0,708:16,14,9,11 +chrX 4786271 . T C 1856 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=22.19;BaseQRankSum=-0.015;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=2.099;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.19;ReadPosRankSum=-1.237;SOR=1.041;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1055,0:0,0,19,13 0/1:22,31:53:99:831,0,560:12,10,20,11 +chrX 4786467 . T C 1921 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=20.11;BaseQRankSum=0.334;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=7.169;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.264;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1298,0:0,0,23,17 0/1:33,24:57:99:653,0,955:23,10,12,12 +chrX 4787198 . C T 1789 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=21.40;BaseQRankSum=1.623;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=6.062;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.416;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:894,0:0,0,12,14 0/1:27,32:59:99:925,0,705:10,17,18,14 +chrX 4787593 . GA G 1016.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=17.90;BaseQRankSum=0.152;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=6.663;MQ=59.48;MQRankSum=-1.072;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.475;SOR=1.622;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:523,0:0,0,14,5 0/1:15,25:40:99:533,0,281:7,8,16,9 +chrX 4788001 . T C 1787 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=21.89;BaseQRankSum=-0.376;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.945;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.197;SOR=0.577;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:848,0:0,0,12,14 0/1:22,35:57:99:969,0,564:12,10,18,17 +chrX 4788663 . C A 680 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.68;BaseQRankSum=-1.323;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.749;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.09;SOR=1.104;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,481 0/1:28,28:56:99:.:710,0,765:13,15,17,11 +chrX 4788945 . T G 2265 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=29.51;BaseQRankSum=0;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=42.50;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.395;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,16:17:99:.:.:663,0:.:0,1,8,8 1|1:0,37:37:99:0|1:4788945_T_G:1632,111,0:4788945:0,0,14,23 +chrX 4788962 . T A 2230 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=30.42;BaseQRankSum=0;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=42.64;ReadPosRankSum=-1.413;SOR=0.374;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,15:16:99:.:.:629,0:.:0,1,7,8 1|1:0,37:37:99:0|1:4788945_T_G:1631,111,0:4788945:0,0,15,22 +chrX 4789013 . A T 1848 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=30.29;BaseQRankSum=-0.28;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.29;ReadPosRankSum=0.26;SOR=0.330;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,19:20:99:589,0:0,1,10,9 1/1:0,42:42:99:1289,124,0:0,0,17,25 +chrX 4789144 . A ATATATAT,AATATATATAT,T,AATATATAT,AAAATATATAT,AAATATATAT 839 . AC=2,0,0,0,1,0;AF=0.667,0.00,0.00,0.00,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=5,0,0,0,2,0;AS_QD=25.97,31.95,23.70,32.77,30.86,31.74;DP=36;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=52.80;QD=124.14;SOR=0.941;VarDP=7 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,2,0,0,0,0,0:2:99:299,0,133,229,229,229,229:0,0,1,1 1/5:0,3,0,0,0,2,0:5:82:570,193,340,479,336,600,419,371,490,594,244,151,354,218,318,231,0,240,82,203,266,442,308,566,448,352,235,562:0,0,3,2 +chrX 4789327 . T TA 1703.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=30.05;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.05;SOR=0.914;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:718,0:0,0,14,10 1/1:0,34:34:99:1025,102,0:0,0,18,16 +chrX 4789715 . A ATTAGAC 3986.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=91;AS_QD=30.23;BaseQRankSum=-0.314;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=3.106;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.76;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.328;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1434,0:0,0,17,15 1/1:1,59:60:99:2592,135,0:0,1,30,29 +chrX 4789794 . C CGTAA 4089.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=95;AS_QD=30.38;BaseQRankSum=-0.635;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=43.01;ReadPosRankSum=0.743;SOR=0.249;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,34:35:99:1454,0:1,0,18,16 1/1:0,61:61:99:2675,183,0:0,0,31,30 +chrX 4789988 . T G 677 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.60;BaseQRankSum=-2.042;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=4.058;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.60;ReadPosRankSum=1.08;SOR=1.470;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,611 0/1:26,26:52:99:.:707,0,747:12,14,8,18 +chrX 4791082 . ATTTTT A 908.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=20.61;BaseQRankSum=-0.611;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=8.981;MQ=59.76;MQRankSum=0;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.51;SOR=1.046;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,13:16:99:317,0:2,1,6,7 0/1:14,16:30:99:631,0,475:9,5,5,11 +chrX 4791902 . T C 2400 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=75;AS_QD=32.40;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.40;SOR=0.774;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1022,0:0,0,12,18 1/1:0,45:45:99:1408,134,0:0,0,27,18 +chrX 4794299 . C A 720 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=12.71;BaseQRankSum=1.67;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.025;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.963;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,457 0/1:31,28:59:99:.:750,0,796:18,13,18,10 +chrX 4796072 . G A 611 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.57;BaseQRankSum=-0.997;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.407;SOR=0.782;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,457 0/1:27,24:51:99:.:641,0,765:14,13,13,11 +chrX 4796248 . A C 535 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=14.13;BaseQRankSum=2.075;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=0.693;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,457 0/1:20,20:40:99:.:565,0,515:8,12,8,12 +chrX 4796326 . G A 331 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=10.31;BaseQRankSum=-2.385;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=5.490;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.164;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,457 0/1:20,15:35:99:.:361,0,590:15,5,8,7 +chrX 4797366 . A G 410 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=10.00;BaseQRankSum=0.987;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.704;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.00;ReadPosRankSum=2.086;SOR=0.936;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,457 0/1:27,17:44:99:.:440,0,701:12,15,10,7 +chrX 4798520 . G A 1424 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=31.61;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.61;SOR=0.780;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,457 1/1:0,46:46:99:.:1454,138,0:0,0,22,24 +chrX 4798766 . G C 529 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=13.31;BaseQRankSum=2.216;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=4.360;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=1.402;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,457 0/1:22,20:42:99:.:559,0,552:11,11,13,7 +chrX 4799056 . G A 194 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=5.46;BaseQRankSum=0.225;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.859;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,457 0/1:30,11:41:99:.:224,0,848:15,15,5,6 +chrX 4800596 . A G 882 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=34;AS_QD=14.03;BaseQRankSum=-0.556;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=13.203;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.88;SOR=1.514;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,457 0/1:31,34:65:99:.:912,0,843:18,13,11,23 +chrX 4801220 . G GT 1880.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=24.62;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.73;QD=24.62;SOR=0.976;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:708,0:0,0,11,18 1/1:0,49:49:99:1212,145,0:0,0,23,26 +chrX 4801393 . G T 2413 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.93;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.93;SOR=0.749;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:755,0:0,0,10,12 1/1:0,50:50:99:1688,150,0:0,0,25,25 +chrX 4802032 . C T 910 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.93;BaseQRankSum=0.321;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.159;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.351;SOR=0.464;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,574 0/1:26,33:59:99:.:940,0,696:10,16,15,18 +chrX 4802744 . C T 728 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=14.58;BaseQRankSum=2.085;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=2.504;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.082;SOR=1.204;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,574 0/1:25,27:52:99:.:758,0,623:10,15,8,19 +chrX 4803296 . CT C 319.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=10.26;BaseQRankSum=0.967;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=22.525;MQ=58.38;MQRankSum=1.772;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.549;SOR=2.113;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,6:9:58:58,0:2,1,3,3 0/1:7,19:26:49:301,0,49:6,1,3,16 +chrX 4804083 . T C 1751 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=31.25;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.25;SOR=0.800;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,311 1/1:0,57:57:99:.:1781,170,0:0,0,27,30 +chrX 4804334 . T C 1694 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=30.79;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.79;SOR=0.765;VarDP=56 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,311 1/1:0,56:56:99:.:1724,167,0:0,0,27,29 +chrX 4805865 . G A 751 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=12.60;BaseQRankSum=-1.015;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.579;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,311 0/1:31,31:62:99:.:781,0,842:17,14,16,15 +chrX 4805945 . A G 608 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.19;BaseQRankSum=-0.467;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.877;SOR=0.804;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,311 0/1:32,25:57:99:.:638,0,880:15,17,11,14 +chrX 4806096 . T TTTTTAA 3332.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=31.79;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.97;QD=43.23;SOR=1.040;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:1144,0:0,0,9,17 1/1:0,52:52:99:2228,156,0:0,0,24,28 +chrX 4807639 . G GTTTATC,T,C 2065 . AC=2,0,0;AF=0.667,0.00,0.00;AN=3;AS_AltDP=49,1,1;AS_QD=31.27,0.00,12.58;BaseQRankSum=-2.626;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.361;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.36;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=0.401;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27,0,0:27:99:1215,0,1215,1215:0,0,13,14 0/1:18,22,1,1:42:99:880,0,747,924,582,1591,641,803,1334,1517:12,6,16,8 +chrX 4808343 . T C 1626 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=20.70;BaseQRankSum=2.119;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.896;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.70;ReadPosRankSum=-1.439;SOR=0.582;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1096,0:0,0,17,18 0/1:25,20:45:99:560,0,684:11,14,9,11 +chrX 4808747 . T C 2131 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=30.87;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.87;SOR=0.750;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:708,0:0,0,10,14 1/1:0,46:46:99:1453,137,0:0,0,26,20 +chrX 4809840 . GA G 793.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=15.15;BaseQRankSum=0.943;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.109;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.197;SOR=0.534;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:430,0:0,0,11,7 0/1:16,21:37:99:403,0,251:7,9,8,13 +chrX 4810368 . CATA C 815.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=19.00;BaseQRankSum=-0.505;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.246;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=0.610;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,624 0/1:23,22:45:99:.:855,0,899:9,14,12,10 +chrX 4810640 . C T 1554 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=20.31;BaseQRankSum=-0.342;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.919;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.31;ReadPosRankSum=-1.991;SOR=0.745;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:947,0:0,0,14,15 0/1:25,24:49:99:637,0,663:13,12,11,13 +chrX 4810707 . G C 1489 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=19.99;BaseQRankSum=-1.029;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.99;ReadPosRankSum=1.039;SOR=0.687;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:784,0:0,0,10,15 0/1:24,27:51:99:735,0,660:11,13,14,13 +chrX 4810821 . CA C,CAA,CAAA 400.97 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=12,7,2;AS_QD=12.25,32.14,24.27;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.62;QD=20.95;SOR=0.784;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:22:99:22:0,505,505,505 1/2:0,12,7,2:21:89:.:440,293,423,215,0,237,286,89,253,428:0,0,11,10 +chrX 4810903 . C T 828 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=30.64;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.64;SOR=1.179;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:858,0:0,0,17,11 0/0:.:39:39:36:0,39,1042 +chrX 4811736 . A ATTTTTT,ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 848.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=13,9;AS_QD=28.05,23.67;BaseQRankSum=0.674;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=1.976;MQ=59.05;MQRankSum=-0.949;QD=31.71;ReadPosRankSum=-1.4;SOR=1.609;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13,0:13:99:533,0,534:0,0,2,11 0/2:6,0,9:15:99:355,378,635,0,257,230:3,3,5,4 +chrX 4812009 . C T 1248 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=18.52;BaseQRankSum=-0.351;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=5.111;MQ=59.95;MQRankSum=1.042;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.266;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:640,0:0,0,10,11 0/1:24,24:48:99:638,0,650:8,16,12,12 +chrX 4812524 . T C 479 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=10.60;BaseQRankSum=-2.424;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=1.133;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.22;SOR=0.460;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,556 0/1:28,20:48:99:.:509,0,829:12,16,10,10 +chrX 4812739 . A G 1408 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=24.79;BaseQRankSum=-0.171;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=7.461;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.954;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16:16:99:.:.:720,0:.:0,0,11,5 0|1:23,19:42:99:0|1:4812739_A_G:718,0,898:4812739:9,14,10,9 +chrX 4812746 . A G 1396 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=23.77;BaseQRankSum=-0.493;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=9.358;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.77;ReadPosRankSum=1.626;SOR=1.154;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,17:17:99:.:.:745,0:.:0,0,12,5 0|1:25,18:43:99:0|1:4812739_A_G:681,0,955:4812739:10,15,10,8 +chrX 4813373 . A G 811 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=17.16;BaseQRankSum=0.931;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=8.103;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.16;ReadPosRankSum=1.048;SOR=1.094;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,333 0/1:20,29:49:99:.:841,0,517:12,8,11,18 +chrX 4814357 . G C 1754 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=20.04;BaseQRankSum=-0.379;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.079;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.187;SOR=0.404;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,35:36:99:1061,0:0,1,20,15 0/1:26,27:53:99:723,0,715:16,10,11,16 +chrX 4815621 . T C 1614 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=17.49;BaseQRankSum=-0.263;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.838;MQ=59.94;MQRankSum=0.986;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.852;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:828,0:0,0,18,9 0/1:35,32:67:99:816,0,935:22,13,21,11 +chrX 4816323 . T A 1594 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.82;BaseQRankSum=1.7;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=6.282;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.82;ReadPosRankSum=-0.027;SOR=0.568;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:869,0:0,0,13,12 0/1:26,27:53:99:755,0,692:10,16,15,12 +chrX 4816700 . G A 2697 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=33.26;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.26;SOR=0.742;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1200,0:0,0,20,16 1/1:0,46:46:99:1527,138,0:0,0,22,24 +chrX 4817413 . C T 656 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.45;BaseQRankSum=0.343;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.765;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,522 0/1:25,26:51:99:.:686,0,656:12,13,12,14 +chrX 4818361 . T C 1693 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=24.27;BaseQRankSum=-0.687;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.026;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.27;ReadPosRankSum=0.314;SOR=0.502;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:852,0:.:0,0,16,12 0|1:19,24:43:99:0|1:4818361_T_C:871,0,714:4818361:8,11,9,15 +chrX 4818376 . C T 772 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=18.65;BaseQRankSum=1.117;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.177;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.973;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,626 0|1:21,22:43:99:.:0|1:4818361_T_C:802,0,784:4818361:10,11,9,13 +chrX 4819831 . T C 1249 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=18.81;BaseQRankSum=0;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=2.118;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.534;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,17:18:99:556,0:0,1,10,7 0/1:22,28:50:99:723,0,595:13,9,12,16 +chrX 4820102 . G T 1013 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=17.10;BaseQRankSum=1.99;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=5.323;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.724;SOR=1.432;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,720 0/1:24,37:61:99:.:1043,0,530:12,12,24,13 +chrX 4820155 . C T 1892 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=22.88;BaseQRankSum=1.495;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=2.096;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.88;ReadPosRankSum=0.18;SOR=0.422;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:898,0:0,0,15,12 0/1:22,35:57:99:1024,0,553:14,8,19,16 +chrX 4820306 . A T 1586 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=20.46;BaseQRankSum=-1.931;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=3.367;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.368;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:691,0:0,0,9,11 0/1:25,34:59:99:925,0,667:8,17,14,20 +chrX 4820845 . A ATCTG 2129.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=27.81;BaseQRankSum=1.271;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=4.707;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.81;ReadPosRankSum=2.384;SOR=0.837;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:733,0:0,0,7,10 0/1:25,36:61:99:1436,0,860:14,11,16,20 +chrX 4821929 . GGAGAGAGGGAGAGAGAGA G,GGAGA 1798.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=25,25;AS_QD=20.89,19.96;BaseQRankSum=-0.624;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.036;MQ=59.92;MQRankSum=-0.85;QD=26.26;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.474;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25,0:25:99:940,0,940:0,0,17,8 0/2:20,0,25:45:99:898,957,1652,0,695,619:13,7,12,13 +chrX 4822097 . A G,AAG 688 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,20;AS_QD=28.92,34.09;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=35.90;SOR=0.892;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 2:0,0,20:20:99:.:718,966,0:0,0,11,9 0/0:.:49:53:49:0,53,1033,53,1033,1033 +chrX 4822152 . A C 1470 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=20.83;BaseQRankSum=-0.226;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=2.128;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.472;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:798,0:0,0,11,14 0/1:21,26:47:99:702,0,532:8,13,12,14 +chrX 4823430 . T G 1479 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.39;BaseQRankSum=-1.058;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.96;MQRankSum=-0.895;QD=20.39;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.605;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:862,0:0,0,16,11 0/1:22,25:47:99:647,0,582:10,12,9,16 +chrX 4823902 . C G 1243 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=17.44;BaseQRankSum=-0.203;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.994;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.472;SOR=1.021;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:704,0:0,0,15,8 0/1:29,21:50:99:569,0,847:15,14,11,10 +chrX 4823965 . A G 1255 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=16.91;BaseQRankSum=-1.253;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=1.942;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.91;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.777;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:620,0:0,0,8,12 0/1:30,26:56:99:665,0,834:16,14,13,13 +chrX 4824012 . T C 649 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=9.84;BaseQRankSum=0.064;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=8.508;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.347;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,590 0/1:42,27:69:99:.:679,0,1170:28,14,13,14 +chrX 4824434 . A C 1634 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=20.05;BaseQRankSum=0.714;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.889;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=0.784;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:889,0:0,0,11,16 0/1:27,29:56:99:775,0,701:13,14,19,10 +chrX 4825219 . G A 2628 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=27.98;BaseQRankSum=2.116;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=1.851;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.61;SOR=0.743;VarDP=95 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,34:34:99:.:.:1438,0:.:0,0,19,15 0|1:28,33:61:99:0|1:4825219_G_A:1220,0,1066:4825219:15,13,12,21 +chrX 4825239 . A G 2564 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=28.20;BaseQRankSum=1.46;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=1.823;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.20;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.555;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,29:29:99:.:.:1305,0:.:0,0,18,11 0|1:29,34:63:99:0|1:4825219_G_A:1289,0,1115:4825219:16,13,13,21 +chrX 4825247 . A G 2337 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=27.21;BaseQRankSum=0.154;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.867;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.21;ReadPosRankSum=-1.154;SOR=0.599;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,27:27:99:.:.:1193,0:.:0,0,16,11 0|1:29,31:60:99:0|1:4825219_G_A:1174,0,1124:4825219:16,13,12,19 +chrX 4825368 . ATATCTATCTATCTATC A 1766.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=23.45;BaseQRankSum=0.155;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=1.904;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.45;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=0.814;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1341,0:0,0,11,19 0/1:29,18:47:99:465,0,1106:15,14,11,7 +chrX 4825775 . C T 1028 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=34.13;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.13;SOR=0.892;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:1058,0:0,0,17,14 0/0:.:49:85:49:0,85,1183 +chrX 4826001 . C T 1914 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=21.13;BaseQRankSum=-0.744;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=4.567;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.331;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,35:35:99:1133,0:0,0,20,15 0/1:27,30:57:99:811,0,705:19,8,18,12 +chrX 4826727 . C G 1315 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=20.07;BaseQRankSum=-1.674;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=3.704;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.448;SOR=0.905;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:749,0:0,0,11,12 0/1:20,24:44:99:596,0,533:11,9,9,15 +chrX 4827858 . C T 1811 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=20.92;BaseQRankSum=2.662;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.932;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=20.92;ReadPosRankSum=1.277;SOR=0.531;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,37:38:99:1211,0:0,1,24,13 0/1:27,23:50:99:630,0,723:20,7,16,7 +chrX 4828964 . C A 927 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=33.00;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:957,0:0,0,14,15 0/0:.:55:66:55:0,66,1097 +chrX 4829023 . A G 824 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=32.85;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.85;SOR=0.846;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:854,0:0,0,14,12 0/0:.:55:66:55:0,66,1097 +chrX 4829176 . CACAT C 511.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=32.41;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.41;SOR=0.804;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,17:17:99:.:551,0:0,0,9,8 0/0:.:55:66:55:0,66,1097 +chrX 4829180 . T *,C 526 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,20;AS_QD=0.00,13.56;BaseQRankSum=0.465;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=2.450;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.56;ReadPosRankSum=1.705;SOR=0.379;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17,0:17:99:551,0,551:0,0,9,8 0/2:21,0,20:41:99:556,560,1231,0,634,563:13,7,9,7 +chrX 4830956 . G T 1067 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=33.24;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.24;SOR=1.981;VarDP=33 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,33:33:99:.:1097,0:0,0,24,9 0/0:.:37:29:26:0,29,725 +chrX 4831544 . T C 819 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=33.96;DP=53;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.96;SOR=1.136;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:849,0:0,0,10,15 0/0:.:37:29:26:0,29,725 +chrX 4831771 . A G 862 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=30.76;DP=55;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.76;SOR=0.760;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:892,0:0,0,14,15 0/0:.:37:29:26:0,29,725 +chrX 4832875 . C T 917 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=33.82;DP=56;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.82;SOR=0.693;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:947,0:0,0,14,14 0/0:.:37:29:26:0,29,725 +chrX 4833246 . A G 774 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=33.50;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.50;SOR=1.802;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:804,0:0,0,7,17 0/0:.:37:29:26:0,29,725 +chrX 4833576 . C A 832 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=30.79;BaseQRankSum=-0.306;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.79;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.335;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,27:28:99:.:862,0:0,1,14,13 0/0:.:37:29:26:0,29,725 +chrX 4833659 . A G 997 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=32.09;DP=58;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.09;SOR=0.957;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,32:32:99:.:1027,0:0,0,14,18 0/0:.:37:29:26:0,29,725 +chrX 4834498 . G A 356 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=9.19;BaseQRankSum=1.367;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.002;SOR=0.607;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,327 0/1:27,15:42:99:.:386,0,737:12,15,7,8 +chrX 4834604 . A G 764 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=30.54;BaseQRankSum=-0.32;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=0.330;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:1,25:26:99:.:794,0:0,1,11,14 0/0:.:50:92:50:0,92,1261 +chrX 4834712 . T G 923 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=31.77;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.77;SOR=0.826;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:953,0:0,0,16,14 0/0:.:50:92:50:0,92,1261 +chrX 4834804 . G A 562 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.84;BaseQRankSum=-2.729;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.117;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.432;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,575 0/1:25,25:50:99:.:592,0,684:9,16,11,14 +chrX 4834940 . T C 759 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=32.88;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=0.693;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:789,0:0,0,12,12 0/0:.:45:82:45:0,82,1148 +chrX 4835117 . G T 166 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=5.03;BaseQRankSum=1.322;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=3.333;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.101;SOR=1.402;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,640 0/1:30,9:39:99:.:196,0,861:15,15,3,6 +chrX 4835642 . T C 710 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=33.64;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.64;SOR=0.874;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:740,0:0,0,12,10 0/0:.:48:59:48:0,59,1043 +chrX 4835687 . G T 729 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=33.00;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=1.426;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:759,0:0,0,15,8 0/0:.:48:59:48:0,59,1043 +chrX 4835740 . C A 831 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=30.75;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.75;SOR=0.997;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:861,0:0,0,16,12 0/0:.:48:59:48:0,59,1043 +chrX 4835878 . T G 940 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=31.29;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.29;SOR=1.044;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:970,0:0,0,18,13 0/0:.:48:59:48:0,59,1043 +chrX 4837360 . A G 1038 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=34.45;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.45;SOR=1.214;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,31:31:99:.:1068,0:0,0,19,12 0/0:.:48:59:48:0,59,1043 +chrX 4837377 . A T 730 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=15.83;BaseQRankSum=0.534;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=1.098;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.527;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,616 0/1:20,28:48:99:.:760,0,501:11,9,14,14 +chrX 4838937 . C CAT 863.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=27.46;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=36.12;SOR=0.941;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,25:25:99:.:903,0:0,0,11,14 0/0:.:56:47:56:0,47,1364 +chrX 4839145 . C T 598 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=16.10;BaseQRankSum=2.755;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=7.359;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.417;SOR=0.339;VarDP=39 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:24:99:24:.:.:0,487 0|1:22,17:39:99:.:0|1:4839145_C_T:628,0,805:4839145:6,16,9,8 +chrX 4839160 . A G 537 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=15.75;BaseQRankSum=-0.272;DP=61;ExcessHet=0.0000;FS=5.085;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.217;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:24:99:24:.:.:0,487 0|1:21,15:36:99:.:0|1:4839145_C_T:567,0,803:4839145:6,15,7,8 +chrX 4839685 . G C 684 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=32.45;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.45;SOR=0.874;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:714,0:0,0,10,12 0/0:.:50:90:50:0,90,1121 +chrX 4840465 . G A 522 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=10.82;BaseQRankSum=0.183;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.925;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.651;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,620 0/1:29,22:51:99:.:552,0,745:12,17,12,10 +chrX 4840945 . C T 927 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=31.90;DP=54;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.90;SOR=0.976;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:957,0:0,0,17,13 0/0:.:25:20:23:0,20,671 +chrX 4841828 . CATATATATATATATATATAT C,CATATATATATAT,CATATATATATATATAT 1042.97 . AC=1,0,1;AF=0.333,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=16,0,6;AS_QD=28.54,36.56,30.67;BaseQRankSum=0;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.38;MQRankSum=1.15;QD=45.08;ReadPosRankSum=0.792;SOR=1.329;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,16,0,0:16:99:668,0,668,668:0,0,9,7 0/3:2,0,0,6:8:27:414,371,593,274,547,703,0,95,79,27:1,1,5,1 +chrX 4841835 . A *,G 245 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=0,5;AS_QD=0.00,16.18;BaseQRankSum=0.071;DP=42;ExcessHet=0.0000;FS=1.453;MQ=58.88;MQRankSum=1.035;QD=16.18;ReadPosRankSum=2.215;SOR=1.230;VarDP=17 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,16,0:16:99:.:.:668,0,668:.:0,0,9,7 0|2:12,0,5:17:99:0|1:4841835_A_*:275,150,677,0,385,354:4841835:6,6,4,1 +chrX 4841849 . A C 638 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=29.97;DP=40;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=41.75;SOR=0.941;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,16:16:99:.:668,0:0,0,9,7 0/0:.:26:27:23:0,27,405 +chrX 4842141 . G A 337 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=8.53;BaseQRankSum=1.532;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=2.932;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.275;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,422 0/1:28,15:43:99:.:367,0,764:19,9,8,7 +chrX 4842177 . GA G 661.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=31.86;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.86;SOR=0.874;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:701,0:0,0,10,12 0/0:.:54:84:54:0,84,1256 +chrX 4842808 . T C 2948 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=97;AS_QD=30.08;BaseQRankSum=1.551;DP=103;ExcessHet=0.0000;FS=6.902;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.08;ReadPosRankSum=0.42;SOR=0.515;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32:33:99:975,0:0,1,21,11 1/1:1,65:66:99:2003,173,0:0,1,33,32 +chrX 4844305 . C T 644 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=33.70;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.70;SOR=1.402;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:674,0:0,0,13,7 0/0:.:53:80:53:0,80,1315 +chrX 4844421 . A G 725 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=34.32;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.32;SOR=2.303;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:755,0:0,0,5,17 0/0:.:53:80:53:0,80,1315 +chrX 4844555 . C A 611 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.65;BaseQRankSum=-1.54;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.366;SOR=0.775;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,630 0/1:29,26:55:99:.:641,0,803:15,14,14,12 +chrX 4845327 . C A 916 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=35;AS_QD=15.26;BaseQRankSum=0.876;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=4.985;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.633;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,630 0/1:27,35:62:99:.:946,0,658:11,16,19,16 +chrX 4845895 . A G 1561 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=21.79;BaseQRankSum=-1.337;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.040;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.555;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:987,0:0,0,17,14 0/1:18,24:42:99:604,0,455:10,8,10,14 +chrX 4846273 . G C 854 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=19.22;BaseQRankSum=-0.027;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=3.072;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.260;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,783 0/1:16,30:46:99:.:884,0,407:13,3,20,10 +chrX 4846313 . C T 1908 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=23.35;BaseQRankSum=-0.628;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=9.501;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.35;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.165;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1136,0:0,0,20,16 0/1:19,28:47:99:802,0,509:15,4,17,11 +chrX 4846517 . G A 1878 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=24.46;BaseQRankSum=0.266;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.344;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.46;ReadPosRankSum=-1.145;SOR=0.951;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1142,0:0,0,13,21 0/1:17,27:44:99:766,0,428:9,8,13,14 +chrX 4847073 . T C 1128 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=19.97;BaseQRankSum=-0.645;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=1.073;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.97;ReadPosRankSum=-1.347;SOR=0.902;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:749,0:0,0,14,10 0/1:18,16:34:99:409,0,504:9,9,8,8 +chrX 4847736 . A G 1450 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=21.14;BaseQRankSum=-1.794;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=5.428;MQ=59.17;MQRankSum=-0.975;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.260;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:982,0:0,0,15,16 0/1:20,19:39:99:498,0,578:14,6,12,7 +chrX 4848143 . T TG 3271.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=31.67;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.75;QD=37.20;SOR=0.715;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1148,0:0,0,15,16 1/1:0,58:58:99:2163,175,0:0,0,29,29 +chrX 4848774 . C CAT 1614.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=22.35;BaseQRankSum=1.171;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=2.026;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.35;ReadPosRankSum=1.927;SOR=0.852;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,26:27:99:945,0:0,1,11,15 0/1:24,23:47:99:709,0,771:12,12,16,7 +chrX 4849299 . A G 1793 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=21.45;BaseQRankSum=-0.412;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=8.448;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.45;ReadPosRankSum=1.514;SOR=0.573;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:992,0:0,0,20,11 0/1:23,31:54:99:831,0,583:8,15,14,17 +chrX 4849349 . C T 1671 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=20.25;BaseQRankSum=0.171;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=17.936;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=0.811;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:908,0:0,0,18,11 0/1:25,30:55:99:793,0,615:7,18,17,13 +chrX 4850121 . C A 1419 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=20.41;BaseQRankSum=-1.034;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.174;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.804;SOR=0.463;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:923,0:0,0,17,11 0/1:23,20:43:99:526,0,650:16,7,13,7 +chrX 4851653 . T C 1949 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=18.67;BaseQRankSum=0.035;DP=108;ExcessHet=0.0000;FS=6.316;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.327;VarDP=106 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1340,0:0,0,20,20 0/1:41,25:66:99:639,0,1176:27,14,15,10 +chrX 4852227 . C T 1660 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=19.65;BaseQRankSum=1.155;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.60;MQRankSum=-1.774;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.679;SOR=0.669;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:948,0:0,0,11,18 0/1:29,28:57:99:742,0,722:13,16,15,13 +chrX 4852243 . A ATATTTTATTTTATTT,ATATTTTATTTTATTTTATTT 1862.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=24,24;AS_QD=22.31,19.96;BaseQRankSum=0.896;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.562;MQ=59.36;MQRankSum=-1.913;QD=27.57;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.678;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24,0:24:99:1004,0,1006:0,0,10,14 0/2:21,0,24:45:99:898,964,1772,0,808,736:9,12,16,8 +chrX 4853183 . G A 1734 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=20.05;BaseQRankSum=1.145;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=9.403;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.616;SOR=0.728;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:909,0:0,0,10,17 0/1:30,31:61:99:855,0,758:11,19,23,8 +chrX 4853581 . G C 1703 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=19.47;BaseQRankSum=-1.881;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=7.512;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.18;SOR=0.257;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1067,0:0,0,15,18 0/1:29,27:56:99:666,0,781:9,20,13,14 +chrX 4854152 . T C 1766 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=20.64;BaseQRankSum=-0.659;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.894;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=0.556;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:962,0:0,0,20,11 0/1:26,30:56:99:834,0,715:16,10,15,15 +chrX 4854290 . T TG 2214.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=25.33;BaseQRankSum=0.403;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=0.897;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.33;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.854;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1260,0:0,0,15,19 0/1:24,31:55:99:994,0,729:12,12,15,16 +chrX 4854439 . T A 680 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.64;BaseQRankSum=-3.255;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.656;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,1017 0/1:33,28:61:99:.:710,0,962:15,18,13,15 +chrX 4854453 . T G 2123 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=21.53;BaseQRankSum=3.122;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=4.222;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.608;VarDP=100 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1216,0:0,0,21,17 0/1:29,33:62:99:937,0,692:12,17,17,16 +chrX 4854466 . C G 2103 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=21.77;BaseQRankSum=1.993;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=2.957;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.532;VarDP=98 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1261,0:0,0,20,18 0/1:28,32:60:99:872,0,703:12,16,16,16 +chrX 4855001 . A G 1978 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=70;AS_QD=20.70;BaseQRankSum=-1.431;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.856;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.752;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1056,0:0,0,17,17 0/1:27,36:63:99:952,0,708:13,14,20,16 +chrX 4855342 . T C 1777 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=19.43;BaseQRankSum=-1.601;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=9.009;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.81;SOR=0.291;VarDP=93 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:953,0:0,0,14,15 0/1:30,34:64:99:854,0,786:10,20,18,16 +chrX 4855586 . C CAG 2131.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=28.19;BaseQRankSum=-0.97;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.020;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=28.19;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.588;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1283,0:0,0,14,15 0/1:25,23:48:99:888,0,957:14,11,11,12 +chrX 4855837 . C T 564 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=11.88;BaseQRankSum=-2.113;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.34;SOR=0.693;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:27:99:27:0,694 0/1:26,24:50:99:.:594,0,723:13,13,12,12 +chrX 4856046 . G A 1471 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=18.30;BaseQRankSum=-0.343;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=1.912;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.30;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.445;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,22:23:99:675,0:1,0,12,10 0/1:28,31:59:99:826,0,752:16,12,15,16 +chrX 4857078 . T C 1883 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=64;AS_QD=18.39;BaseQRankSum=1.197;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=2.629;MQ=59.90;MQRankSum=0;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.201;SOR=0.446;VarDP=104 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:977,0:0,0,17,13 0/1:40,34:74:99:936,0,1099:17,23,15,19 +chrX 4858621 . A C 1595 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=21.38;BaseQRankSum=0.244;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.38;ReadPosRankSum=2.077;SOR=0.640;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:879,0:.:0,0,9,11 0|1:35,21:56:99:0|1:4858621_A_C:746,0,1270:4858621:14,21,8,13 +chrX 4858637 . G GTA 1617.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=22.70;BaseQRankSum=0.241;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=1.921;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.70;ReadPosRankSum=1.11;SOR=0.954;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:895,0:.:0,0,10,10 0|1:32,21:53:99:0|1:4858621_A_C:762,0,1197:4858621:16,16,8,13 +chrX 4858672 . AAT A 762.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=22.91;BaseQRankSum=0.4;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=5.391;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.91;ReadPosRankSum=1.112;SOR=0.657;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,685 0/1:12,23:35:99:.:802,0,435:4,8,13,10 +chrX 4858680 . T C 1068 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=17.16;BaseQRankSum=0.421;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=2.145;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.16;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.914;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:802,0:0,0,13,14 0/1:25,12:37:99:296,0,964:13,12,4,8 +chrX 4858899 . T C 1532 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=17.55;BaseQRankSum=-2.107;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=9.164;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.173;SOR=1.505;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:987,0:0,0,18,13 0/1:33,25:58:99:575,0,919:16,17,19,6 +chrX 4859007 . CACACATATAT C 1133.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=22.56;BaseQRankSum=-0.55;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=3.967;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.56;ReadPosRankSum=1.034;SOR=1.329;VarDP=52 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,610 0/1:22,30:52:99:.:1173,0,822:11,11,19,11 +chrX 4860495 . A AATG 2479.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=29.29;BaseQRankSum=0.666;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=1.935;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.29;ReadPosRankSum=1.602;SOR=0.716;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1464,0:0,0,18,15 0/1:26,27:53:99:1055,0,999:14,12,10,17 +chrX 4860529 . CTTTATTTA C 344.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=14.22;BaseQRankSum=1.786;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=8.570;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.056;VarDP=27 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,630 0/1:15,12:27:99:.:384,0,592:14,1,8,4 +chrX 4860725 . TTGTG T,TTGTGTG 1627.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=28,22;AS_QD=26.05,25.39;BaseQRankSum=-0.118;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;MQRankSum=0;QD=32.69;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.335;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,12,0:12:99:541,0,541:0,0,6,6 1/2:1,16,22:39:99:1126,579,897,580,0,542:0,1,16,22 +chrX 4860914 . C A 1543 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=18.95;BaseQRankSum=-0.196;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=4.457;MQ=59.93;MQRankSum=-0.934;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.672;SOR=0.336;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:777,0:0,0,11,12 0/1:29,31:60:99:796,0,753:11,18,16,15 +chrX 4860942 . C T 1300 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=17.73;BaseQRankSum=0.844;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=12.142;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.23;SOR=0.929;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:634,0:0,0,10,9 0/1:30,26:56:99:696,0,775:11,19,17,9 +chrX 4862139 . G A 1315 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=16.40;BaseQRankSum=-0.442;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=5.737;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.225;SOR=1.221;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:715,0:0,0,15,7 0/1:35,25:60:99:630,0,931:17,18,14,11 +chrX 4862545 . C T 1545 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=19.69;BaseQRankSum=0.812;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=9.873;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.940;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:953,0:0,0,11,18 0/1:28,23:51:99:622,0,774:17,11,10,13 +chrX 4863504 . C T 1361 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=18.80;BaseQRankSum=-0.109;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=4.789;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.261;SOR=0.465;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:834,0:0,0,13,12 0/1:26,23:49:99:557,0,667:10,16,12,11 +chrX 4863759 . A G 1026 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=37;AS_QD=17.60;BaseQRankSum=-0.703;DP=60;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.451;SOR=0.610;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:660,0:0,0,10,10 0/1:23,17:40:99:396,0,620:13,10,10,7 +chrX 4864504 . GTATATATGTCCATATATAAATATATGAATATATAAATTTATATGTTCATATATAAATATATGAACATATAAATT G 1613.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=21.47;BaseQRankSum=0.404;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=4.510;MQ=59.75;MQRankSum=-1.648;QD=21.47;ReadPosRankSum=1.853;SOR=1.197;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:842,0:0,0,10,10 0/1:33,24:57:99:811,0,1262:16,17,17,7 +chrX 4864639 . C CATATGT 2921.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=32.73;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.19;SOR=1.066;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:1035,0:0,0,14,9 1/1:0,44:44:99:1926,132,0:0,0,25,19 +chrX 4864758 . T TTATA 2456.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=28.36;BaseQRankSum=-0.747;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=7.790;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=0.366;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1432,0:0,0,16,17 0/1:26,29:55:99:1064,0,1005:17,9,14,15 +chrX 4865205 . A C 2189 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=20.74;BaseQRankSum=1.385;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.718;VarDP=107 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,46:47:99:1408,0:0,1,20,26 0/1:27,33:60:99:811,0,708:14,13,19,14 +chrX 4865281 . CATAT C 662.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=13.76;BaseQRankSum=1.044;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=5.839;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.819;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:35:99:35:0,948 0/1:32,19:51:99:.:702,0,1275:19,13,8,11 +chrX 4865354 . T C 1658 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=19.86;BaseQRankSum=-1.731;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.730;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:926,0:0,0,14,14 0/1:28,29:57:99:762,0,778:15,13,17,12 +chrX 4865567 . A AT 1567.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=19.60;BaseQRankSum=-0.471;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.720;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,29:30:99:867,0:1,0,13,16 0/1:23,29:52:99:740,0,561:9,14,11,18 +chrX 4865937 . T C 1633 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=22.78;BaseQRankSum=-2.049;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=4.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.78;ReadPosRankSum=-0.496;SOR=0.301;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:888,0:0,0,13,14 0/1:16,30:46:99:775,0,420:5,11,13,17 +chrX 4866055 . G GTCA 1903.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=25.23;BaseQRankSum=-1.568;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=3.112;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.23;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.411;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1260,0:0,0,15,13 0/1:30,19:49:99:683,0,1203:18,12,9,10 +chrX 4866764 . T TA 1537.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=20.48;BaseQRankSum=-2.089;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.934;MQ=59.85;MQRankSum=0;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.351;SOR=0.593;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:942,0:0,0,18,11 0/1:24,24:48:99:635,0,640:11,13,9,15 +chrX 4866910 . C CA 1263.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=17.37;BaseQRankSum=-0.752;DP=94;ExcessHet=0.0000;FS=11.477;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.140;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:802,0:0,0,13,18 0/1:20,24:44:99:501,0,401:15,5,15,9 +chrX 4867317 . AAT A 466.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=13.68;BaseQRankSum=-0.852;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=2.864;MQ=59.56;MQRankSum=-0.973;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.721;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,283 0/1:19,18:37:99:.:506,0,578:11,8,8,10 +chrX 4867400 . TATATATATCAAATATATATCAAATATATATCATATATATCAAATATATATCAAATATATATC TATATATATCAAATATATATCATATATATCAAATATATATCAAATATATATC,T 176.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=3,0;AS_QD=6.17,2.78;BaseQRankSum=-1.382;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.483;MQ=59.24;MQRankSum=-1.638;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.202;SOR=1.008;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,283,283 0/1:32,3,0:35:99:.:216,0,1297,127,1309,1440:13,19,2,1 +chrX 4867411 . A AATATATATCATATATATCAAAT,* 1071.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=26,0;AS_QD=29.61,31.50;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=6.913;MQ=57.57;QD=42.73;SOR=0.878;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26,0:26:99:1111,0,1111:0,0,15,11 0/2:32,0,3:35:99:216,227,1539,0,1325,1297:13,19,2,1 +chrX 4867444 . TATATATCAAATATATATC T,* 179.97 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=3,0;AS_QD=6.84,0.00;BaseQRankSum=0.875;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=2.455;MQ=58.98;MQRankSum=-1.534;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.311;SOR=1.019;VarDP=32 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,387,387 0|1:29,3,0:32:99:.:0|1:4867444_TATATATCAAATATATATC_T:219,0,1188,127,1199,1329:4867444:12,17,2,1 +chrX 4871988 . T C 1700 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=20.60;BaseQRankSum=-0.368;DP=93;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.60;ReadPosRankSum=-1.57;SOR=0.775;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:867,0:0,0,14,15 0/1:23,32:55:99:863,0,580:12,11,19,13 +chrX 4872814 . A AT 1996.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=22.62;BaseQRankSum=1.913;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=4.047;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=22.62;ReadPosRankSum=-0.43;SOR=1.025;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1169,0:0,0,17,12 0/1:35,26:61:99:867,0,1225:17,18,15,11 +chrX 4872888 . G A 1667 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=19.96;BaseQRankSum=0.063;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=11.913;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.155;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1072,0:0,0,17,15 0/1:29,24:53:99:625,0,774:8,21,11,13 +chrX 4873030 . C T 907 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=31.23;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.23;SOR=0.976;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:937,0:0,0,13,17 0/0:.:53:94:53:0,94,1259 +chrX 4874110 . C T 1393 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=19.23;BaseQRankSum=-2.521;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=3.349;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.441;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:943,0:0,0,16,13 0/1:25,20:45:99:480,0,714:15,10,8,12 +chrX 4874232 . C CGTGT 1236.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=21.63;BaseQRankSum=-1.638;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.992;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.683;SOR=0.567;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,17:17:99:765,0:0,0,9,8 0/1:27,15:42:99:511,0,1053:17,10,10,5 +chrX 4874312 . A G 1043 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.78;BaseQRankSum=-0.483;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.930;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=0.914;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:705,0:0,0,13,9 0/1:30,16:46:99:368,0,820:15,15,8,8 +chrX 4876030 . G A 1564 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=21.54;BaseQRankSum=2.48;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=3.510;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.54;ReadPosRankSum=-0.75;SOR=1.164;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:888,0:0,0,10,18 0/1:21,25:46:99:706,0,522:10,11,10,15 +chrX 4876118 . C CCCTTTCCCACCTGTATCCTCTCTCTCCTCTCTCTCCCCCTCCTCTCTCCCCCCCTCCTCTCTCCCCCCCTCCTCTCTCCCCCTCCTCTCCCTCCCCTTCCTCTCTCT 844.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=30.51;BaseQRankSum=-0.5;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=57.02;MQRankSum=3.191;QD=36.83;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.425;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,21:24:99:.:884,0:1,2,10,11 0/0:.:21:0:21:0,0,160 +chrX 4878378 . T C 1465 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=19.42;BaseQRankSum=-0.388;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.097;SOR=0.771;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,32:33:99:997,0:0,1,13,19 0/1:24,20:44:99:498,0,652:11,13,9,11 +chrX 4878576 . T C 1545 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=18.31;BaseQRankSum=1.21;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=7.370;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.05;SOR=0.260;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:976,0:0,0,15,16 0/1:32,23:55:99:599,0,877:21,11,12,11 +chrX 4879430 . T G 937 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=15.85;BaseQRankSum=-0.094;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=3.556;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.448;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:651,0:0,0,6,13 0/1:28,14:42:99:316,0,787:17,11,10,4 +chrX 4881094 . C T 1540 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.39;BaseQRankSum=-1.6;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.099;MQ=59.89;MQRankSum=0;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.425;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1048,0:0,0,13,18 0/1:25,21:46:99:522,0,681:8,17,8,13 +chrX 4881145 . C T 454 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.80;BaseQRankSum=-1.921;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=6.803;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.602;SOR=1.551;VarDP=41 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,892 0/1:22,19:41:99:.:484,0,631:12,10,6,13 +chrX 4881351 . T C 1632 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=54;AS_QD=24.81;BaseQRankSum=-1.201;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.162;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.81;ReadPosRankSum=1.141;SOR=0.652;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:889,0:0,0,12,15 0/1:13,27:40:99:773,0,332:7,6,14,13 +chrX 4881828 . T C 1642 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=20.39;BaseQRankSum=-0.991;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.966;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.39;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.446;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:938,0:0,0,14,15 0/1:26,27:53:99:734,0,735:11,15,14,13 +chrX 4882697 . C A 1521 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=19.15;BaseQRankSum=1.29;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.877;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=0.709;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,31:32:99:1013,0:0,1,17,14 0/1:29,20:49:99:538,0,811:16,13,7,13 +chrX 4883871 . A C 2867 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=89;AS_QD=32.55;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.55;SOR=0.859;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1031,0:0,0,17,15 1/1:0,57:57:99:1866,171,0:0,0,31,26 +chrX 4884994 . C G 2401 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=29.29;BaseQRankSum=-0.069;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=3.269;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.29;ReadPosRankSum=0.964;SOR=0.373;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1248,0:.:0,0,11,17 0|1:25,30:55:99:0|1:4884994_C_G:1183,0,948:4884994:9,16,16,14 +chrX 4884996 . G A 2401 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=29.29;BaseQRankSum=1.481;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=3.269;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=29.29;ReadPosRankSum=0.705;SOR=0.373;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,28:28:99:.:.:1248,0:.:0,0,11,17 0|1:25,30:55:99:0|1:4884994_C_G:1183,0,948:4884994:9,16,16,14 +chrX 4885131 . A G 1371 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=22.24;BaseQRankSum=-1.575;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.24;ReadPosRankSum=-0.762;SOR=0.569;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:744,0:0,0,12,12 0/1:14,25:39:99:657,0,345:6,8,11,14 +chrX 4885542 . C T 1587 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=19.02;BaseQRankSum=-2.227;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=5.842;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.02;ReadPosRankSum=2.039;SOR=0.513;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:868,0:0,0,15,12 0/1:28,30:58:99:749,0,780:17,11,12,18 +chrX 4886631 . A C 1618 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=17.53;BaseQRankSum=1.398;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=15.282;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.0;SOR=0.572;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,25:26:99:744,0:0,1,9,16 0/1:32,36:68:99:904,0,869:23,9,18,18 +chrX 4888444 . GGATT G 2472.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=31.40;BaseQRankSum=1.288;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.40;ReadPosRankSum=-2.025;SOR=0.591;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1388,0:0,0,19,12 0/1:20,29:49:99:1124,0,742:12,8,15,14 +chrX 4889291 . C T 1296 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=21.05;BaseQRankSum=1.203;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=1.008;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.999;SOR=0.713;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:859,0:0,0,15,10 0/1:21,17:38:99:467,0,575:11,10,5,12 +chrX 4889574 . T C 1369 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=17.27;BaseQRankSum=-1.709;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.902;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.201;SOR=0.454;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:759,0:0,0,11,12 0/1:31,27:58:99:640,0,827:19,12,16,11 +chrX 4889689 . G C 1119 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=14.36;BaseQRankSum=-1.143;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.936;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.436;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:774,0:0,0,10,15 0/1:38,17:55:99:375,0,1093:16,22,11,6 +chrX 4890372 . C T 770 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=15.69;BaseQRankSum=-0.459;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.69;ReadPosRankSum=2.798;SOR=0.760;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,569 0/1:22,29:51:99:.:800,0,576:11,11,14,15 +chrX 4891366 . T G 249 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=6.64;BaseQRankSum=1.115;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=9.249;MQ=54.70;MQRankSum=-5.125;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=2.732;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:99:28:.:.:0,569 0|1:33,9:42:99:.:0|1:4891366_T_G:279,0,1359:4891366:18,15,8,1 +chrX 4891373 . A G 246 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=6.42;BaseQRankSum=1.097;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=11.870;MQ=54.82;MQRankSum=-5.175;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.164;SOR=2.846;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:99:28:.:.:0,569 0|1:34,9:43:99:.:0|1:4891366_T_G:276,0,1401:4891366:18,16,8,1 +chrX 4891377 . A G 243 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=9;AS_QD=6.20;BaseQRankSum=1.096;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=9.154;MQ=54.94;MQRankSum=-5.225;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.433;SOR=2.749;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:99:28:.:.:0,569 0|1:35,9:44:99:.:0|1:4891366_T_G:273,0,1431:4891366:19,16,8,1 +chrX 4891508 . C CA 1725.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=22.63;BaseQRankSum=0.09;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=56.24;MQRankSum=-3.483;QD=22.63;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.675;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1271,0:0,0,19,15 0/1:27,17:44:99:494,0,879:15,12,9,8 +chrX 4891947 . C G 1811 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=44;AS_QD=28.32;BaseQRankSum=-1.322;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=3.745;MQ=45.04;MQRankSum=-5.108;QD=28.32;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=1.182;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,20:20:99:.:.:896,0:.:0,0,9,11 0|1:21,24:45:99:0|1:4891947_C_G:945,0,768:4891947:10,11,18,6 +chrX 4891954 . T C 1912 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=47;AS_QD=29.42;BaseQRankSum=0.659;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=5.637;MQ=44.72;MQRankSum=-4.608;QD=29.42;ReadPosRankSum=-1.063;SOR=1.333;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,21:21:99:.:.:931,0:.:0,0,10,11 0|1:19,26:45:99:0|1:4891947_C_G:1011,0,699:4891947:9,10,20,6 +chrX 4892218 . T C 1828 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=19.35;BaseQRankSum=-0.341;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=0.822;MQ=55.61;MQRankSum=-4.694;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.576;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:798,0:0,0,13,13 0/1:30,40:70:99:1060,0,773:14,16,20,20 +chrX 4893163 . G A 1329 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=21.92;BaseQRankSum=0.837;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=5.845;MQ=45.54;MQRankSum=-1.901;QD=21.92;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=0.490;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:739,0:0,0,10,12 0/1:17,23:40:99:620,0,381:11,6,11,12 +chrX 4893764 . G A 620 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.82;BaseQRankSum=0.74;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=5.637;MQ=44.37;MQRankSum=-1.321;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.693;SOR=1.484;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,471 0/1:30,25:55:99:.:650,0,778:17,13,18,7 +chrX 4893829 . G A 1081 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=18.83;BaseQRankSum=2.196;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=5.303;MQ=47.16;MQRankSum=-3.162;QD=18.83;ReadPosRankSum=-2.209;SOR=0.264;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:99:28:.:.:0,471 0|1:29,30:59:99:.:0|1:4893829_G_A:1111,0,1107:4893829:19,10,15,15 +chrX 4893850 . C T,A 1023 . AC=1,0;AF=0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=28,3;AS_QD=18.47,1.09;BaseQRankSum=1.862;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.986;MQ=48.02;MQRankSum=-4.029;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.645;SOR=0.551;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,471,471 0/1:29,28,3:60:99:.:1053,0,1134,1018,1067,2228:18,11,18,13 +chrX 4893851 . C G 1014 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.40;BaseQRankSum=1.077;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.656;MQ=48.02;MQRankSum=-2.751;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.452;SOR=0.328;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:28:99:28:.:.:0,471 0|1:32,28:60:99:.:0|1:4893829_G_A:1044,0,1260:4893829:21,11,15,13 +chrX 4894014 . A G 1280 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=17.47;BaseQRankSum=0.294;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.878;MQ=53.36;MQRankSum=2.445;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.588;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,23:24:99:684,0:0,1,13,10 0/1:28,23:51:99:626,0,749:13,15,9,14 +chrX 4894208 . T C 806 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=13.48;BaseQRankSum=-0.066;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=4.921;MQ=56.25;MQRankSum=-4.736;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.550;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:23:99:23:0,536 0/1:30,32:62:99:.:836,0,771:12,18,17,15 +chrX 4894226 . A G 2062 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=24.61;BaseQRankSum=-1.038;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=11.230;MQ=53.97;MQRankSum=-5.911;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.841;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,24:24:99:.:.:1048,0:.:0,0,12,12 0|1:32,29:61:99:0|1:4894226_A_G:1044,0,1246:4894226:12,20,19,10 +chrX 4894236 . A G 2009 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=24.87;BaseQRankSum=-0.933;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=7.661;MQ=53.16;MQRankSum=-6.154;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.753;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,23:23:99:.:.:1023,0:.:0,0,11,12 0|1:31,28:59:99:0|1:4894226_A_G:1016,0,1217:4894226:12,19,18,10 +chrX 4894330 . C T 1243 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=17.44;BaseQRankSum=0.595;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=1.953;MQ=54.83;MQRankSum=-3.64;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.49;SOR=0.639;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:780,0:0,0,9,14 0/1:31,19:50:99:493,0,882:14,17,13,6 +chrX 4894619 . C T 1769 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=21.42;BaseQRankSum=-0.996;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=6.299;MQ=58.40;MQRankSum=0.812;QD=21.42;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.722;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,38:38:99:1296,0:0,0,18,20 0/1:25,21:46:99:503,0,677:15,10,8,13 +chrX 4894884 . T C 1615 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=19.58;BaseQRankSum=2.819;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=13.905;MQ=45.37;MQRankSum=-5.456;QD=19.58;ReadPosRankSum=-1.486;SOR=1.419;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1104,0:0,0,20,13 0/1:31,20:51:99:541,0,824:13,18,15,5 +chrX 4894958 . A T 1742 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=21.35;BaseQRankSum=-0.049;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=10.451;MQ=49.94;MQRankSum=-1.932;QD=21.35;ReadPosRankSum=-0.021;SOR=0.173;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,36:36:99:1163,0:0,0,18,18 0/1:24,23:47:99:609,0,653:6,18,9,14 +chrX 4895064 . A T 1735 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=23.53;BaseQRankSum=-0.787;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=13.201;MQ=58.79;MQRankSum=-1.928;QD=23.53;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=1.332;VarDP=75 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:918,0:0,0,8,20 0/1:17,30:47:99:847,0,440:11,6,12,18 +chrX 4896241 . T C 1587 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=21.85;BaseQRankSum=-2.261;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=11.902;MQ=51.09;MQRankSum=-4.102;QD=21.85;ReadPosRankSum=0.36;SOR=0.407;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:853,0:0,0,14,14 0/1:18,28:46:99:764,0,487:13,5,12,16 +chrX 4896471 . T A 1463 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=21.33;BaseQRankSum=1.568;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.061;MQ=40.95;MQRankSum=-3.555;QD=21.33;ReadPosRankSum=-0.268;SOR=0.997;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:833,0:0,0,9,18 0/1:20,23:43:99:660,0,527:8,12,8,15 +chrX 4896635 . C T 1111 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=18.11;BaseQRankSum=-0.478;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=40.27;MQRankSum=-2.761;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.685;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:726,0:0,0,15,8 0/1:22,18:40:99:415,0,532:13,9,9,9 +chrX 4896749 . G A 1532 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=22.97;BaseQRankSum=3.402;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.344;MQ=46.58;MQRankSum=-0.43;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.09;SOR=1.055;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,21:22:99:.:.:890,0:.:0,1,11,10 0|1:28,18:46:99:0|1:4896749_G_A:672,0,1089:4896749:14,14,12,6 +chrX 4896751 . C A 1532 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=22.97;BaseQRankSum=2.291;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=3.344;MQ=46.85;MQRankSum=-0.43;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.203;SOR=1.055;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,21:22:99:.:.:890,0:.:0,1,11,10 0|1:28,18:46:99:0|1:4896749_G_A:672,0,1089:4896749:14,14,12,6 +chrX 4896764 . A G 1507 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=22.94;BaseQRankSum=2.147;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=8.373;MQ=47.07;MQRankSum=-0.311;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=1.107;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,20:21:99:.:.:820,0:.:0,1,11,9 0|1:27,19:46:99:0|1:4896764_A_G:717,0,1070:4896764:12,15,13,6 +chrX 4896767 . C T 1541 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=23.10;BaseQRankSum=4.588;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=8.524;MQ=47.53;MQRankSum=-0.191;QD=23.10;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=1.171;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,21:22:99:.:.:854,0:.:0,1,12,9 0|1:27,19:46:99:0|1:4896764_A_G:717,0,1070:4896764:12,15,13,6 +chrX 4896774 . G A 1529 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=39;AS_QD=22.93;BaseQRankSum=2.308;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=6.561;MQ=48.04;MQRankSum=-0.197;QD=22.93;ReadPosRankSum=0.257;SOR=1.138;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:1,20:21:99:.:.:845,0:.:0,1,11,9 0|1:28,19:47:99:0|1:4896764_A_G:714,0,1077:4896764:13,15,13,6 +chrX 4896934 . A G 1992 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=67;AS_QD=22.22;BaseQRankSum=-0.544;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=49.66;MQRankSum=-3.9;QD=22.22;ReadPosRankSum=1.366;SOR=0.705;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1082,0:0,0,19,13 0/1:24,35:59:99:940,0,628:14,10,20,15 +chrX 4897126 . C T 1595 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=19.82;BaseQRankSum=-1.53;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=1.921;MQ=56.95;MQRankSum=-2.983;QD=19.82;ReadPosRankSum=1.402;SOR=0.830;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:933,0:0,0,14,14 0/1:27,27:54:99:692,0,776:14,13,11,16 +chrX 4897403 . G C 1591 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=21.91;BaseQRankSum=1.058;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=2.232;MQ=56.23;MQRankSum=-1.973;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.461;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:924,0:0,0,13,15 0/1:21,25:46:99:697,0,542:6,15,6,19 +chrX 4897682 . A G 483 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=11.93;BaseQRankSum=1.485;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=6.374;MQ=48.02;MQRankSum=0.804;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.399;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,661 0/1:24,19:43:99:.:513,0,617:16,8,9,10 +chrX 4897765 . T G 1692 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=22.36;BaseQRankSum=-0.063;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=9.283;MQ=56.57;MQRankSum=-1.948;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.02;SOR=0.850;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:893,0:0,0,15,12 0/1:19,31:50:99:829,0,481:7,12,19,12 +chrX 4898802 . A G 1230 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=18.26;BaseQRankSum=0.099;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.916;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.26;ReadPosRankSum=2.291;SOR=0.573;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:729,0:0,0,13,8 0/1:28,20:48:99:531,0,799:16,12,9,11 +chrX 4899129 . T C 759 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=32;AS_QD=12.93;BaseQRankSum=-0.981;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.975;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.939;SOR=0.518;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,690 0/1:29,32:61:99:.:789,0,754:13,16,16,16 +chrX 4899392 . C A 1335 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=18.96;BaseQRankSum=1.621;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.914;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.848;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:938,0:0,0,12,17 0/1:27,16:43:99:427,0,748:13,14,8,8 +chrX 4899576 . T C 1300 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=16.22;BaseQRankSum=0.32;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=2.906;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.502;SOR=0.522;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:719,0:0,0,11,10 0/1:37,24:61:99:611,0,1003:21,16,11,13 +chrX 4902042 . CA C 238.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=6.32;BaseQRankSum=0.423;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=9.359;MQ=59.75;MQRankSum=0;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.445;SOR=0.105;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:4,12:16:99:158,0:1,3,4,8 0/1:18,10:28:99:120,0,264:4,14,7,3 +chrX 4903288 . A G 1628 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=23.03;BaseQRankSum=-1.292;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.115;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.03;ReadPosRankSum=0.649;SOR=1.033;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1017,0:0,0,21,10 0/1:17,24:41:99:641,0,447:10,7,15,9 +chrX 4903305 . A G 1593 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=23.87;BaseQRankSum=0.595;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.87;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.727;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:983,0:0,0,20,9 0/1:15,24:39:99:640,0,365:10,5,15,9 +chrX 4904666 . C G 1725 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=21.40;BaseQRankSum=-1.604;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.395;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=1.160;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:615,0:0,0,11,8 0/1:22,41:63:99:1140,0,564:11,11,25,16 +chrX 4906501 . C T 609 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=11.62;BaseQRankSum=-0.698;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.728;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.487;VarDP=55 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,522 0/1:30,25:55:99:.:639,0,837:18,12,12,13 +chrX 4907452 . C A 1651 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=22.12;BaseQRankSum=-2.296;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=2.158;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.12;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=0.802;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1067,0:0,0,15,18 0/1:19,24:43:99:614,0,532:10,9,11,13 +chrX 4908640 . C CA,CAAA 517.97 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=26,3;AS_QD=16.88,9.30;BaseQRankSum=0.103;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=3.960;MQ=59.42;MQRankSum=0.057;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.47;SOR=0.545;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,10,3:13:99:328,0,235:0,0,8,5 0/1:7,16,0:23:74:229,0,74,250,121,370:5,2,5,11 +chrX 4908831 . G A 954 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=32.80;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.80;SOR=1.143;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,30:30:99:.:984,0:0,0,12,18 0/0:.:60:41:60:0,41,1285 +chrX 4910329 . T G 1945 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=20.57;BaseQRankSum=1.743;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=2.919;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.57;ReadPosRankSum=-1.646;SOR=0.423;VarDP=96 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1324,0:0,0,20,22 0/1:30,24:54:99:651,0,784:18,12,14,10 +chrX 4912012 . C CA 824.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=17.28;BaseQRankSum=-1.081;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.571;SOR=0.744;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:450,0:0,0,10,9 0/1:10,21:31:99:414,0,154:4,6,6,15 +chrX 4913205 . CT C 752.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=12.38;BaseQRankSum=1.019;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=11.868;MQ=59.93;MQRankSum=0;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.918;SOR=2.179;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:540,0:0,0,6,15 0/1:28,15:43:99:252,0,570:14,14,3,12 +chrX 4913907 . A AAC 2353.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=28.83;BaseQRankSum=-0.276;DP=86;ExcessHet=0.0000;FS=3.147;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.414;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:1213,0:0,0,14,13 0/1:26,30:56:99:1180,0,1002:16,10,16,14 +chrX 4915783 . CA C 1025.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=14.39;BaseQRankSum=-0.194;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=3.354;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.346;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:632,0:0,0,14,10 0/1:28,22:50:99:433,0,589:19,9,12,10 +chrX 4919089 . A C 1867 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=66;AS_QD=19.56;BaseQRankSum=-0.468;DP=98;ExcessHet=0.0000;FS=10.886;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.193;VarDP=97 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,40:41:99:1247,0:0,1,19,21 0/1:30,26:56:99:650,0,825:9,21,13,13 +chrX 4920302 . C G 520 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.79;BaseQRankSum=-0.737;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=14.730;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=1.326;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,303 0/1:22,21:43:99:.:550,0,591:15,7,7,14 +chrX 4924150 . G A 771 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=14.83;BaseQRankSum=0.61;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=7.653;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.83;ReadPosRankSum=-1.119;SOR=1.092;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,303 0/1:25,29:54:99:.:801,0,652:15,10,11,18 +chrX 4925361 . A T,AT 244 . AC=0,1;AF=0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=2,16;AS_QD=0.00,8.06;BaseQRankSum=-1.494;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=4.982;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.519;SOR=0.991;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,303,303 0/2:18,2,16:36:99:.:274,367,1359,0,414,380:7,11,11,7 +chrX 4928703 . G GAC 1512.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=31.67;BaseQRankSum=-0.48;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=31.67;ReadPosRankSum=0.52;SOR=0.446;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:633,0:0,0,7,12 1/1:1,29:30:56:919,56,0:0,1,12,17 +chrX 4929627 . CATATATATATATATAT C 370.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=11;AS_QD=27.33;BaseQRankSum=-0.674;DP=50;ExcessHet=0.0000;FS=5.497;MQ=59.66;MQRankSum=0.993;QD=27.33;ReadPosRankSum=0.254;SOR=1.033;VarDP=15 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:45:27:.:.:0,45 0|1:4,11:15:99:.:0|1:4929627_CATATATATATATATAT_C:410,0,103:4929627:3,1,4,7 +chrX 4929672 . A G 440 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=26.11;BaseQRankSum=0.456;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=2.112;MQ=59.57;MQRankSum=0.902;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.307;VarDP=18 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:27:45:27:.:.:0,45 0|1:5,13:18:99:.:0|1:4929627_CATATATATATATATAT_C:470,0,114:4929627:1,4,5,8 +chrX 4930149 . A G 964 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=32.15;DP=45;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=58.99;QD=43.22;SOR=1.179;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:994,0:0,0,14,9 0/0:.:25:28:21:0,28,620 +chrX 4930153 . C T 1777 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=25.81;BaseQRankSum=2.123;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=1.021;MQ=59.55;MQRankSum=-0.795;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.216;SOR=0.561;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:1028,0:0,0,15,9 0/1:19,27:46:99:779,0,462:12,7,15,12 +chrX 4930356 . CAAAAAAA C 798.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=17.46;BaseQRankSum=0.638;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=39.382;MQ=58.54;MQRankSum=0.967;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.35;SOR=2.313;VarDP=48 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,6:9:99:209,0:1,2,5,1 0/1:22,17:39:99:629,0,720:4,18,13,4 +chrX 4932475 . G A 822 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=19.36;BaseQRankSum=0.057;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=6.930;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.795;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,501 0/1:15,29:44:99:.:852,0,364:5,10,17,12 +chrX 4933015 . T C 654 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=34.20;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.20;SOR=1.127;VarDP=20 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,20:20:99:.:684,0:0,0,8,12 0/0:.:46:70:46:0,70,1092 +chrX 4933861 . T C 1677 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=19.40;BaseQRankSum=0.689;DP=92;ExcessHet=0.0000;FS=5.825;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=1.108;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1083,0:0,0,14,19 0/1:30,25:55:99:624,0,773:16,14,9,16 +chrX 4934424 . G A 2546 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=33.03;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.03;SOR=0.798;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:780,0:0,0,12,11 1/1:0,55:55:99:1796,165,0:0,0,25,30 +chrX 4934852 . T G 1536 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=20.34;BaseQRankSum=0.976;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.939;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.738;SOR=0.885;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:972,0:0,0,20,11 0/1:24,22:46:99:594,0,636:13,11,11,11 +chrX 4935579 . T C 1403 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=20.18;BaseQRankSum=-2.531;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=2.211;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.446;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:794,0:0,0,13,13 0/1:19,26:45:99:639,0,516:11,8,13,13 +chrX 4936464 . G C 1164 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=40;AS_QD=18.09;BaseQRankSum=0.58;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=2.093;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.268;SOR=1.022;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:661,0:0,0,7,12 0/1:26,21:47:99:533,0,677:13,13,10,11 +chrX 4939418 . G A 863 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=31.89;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.89;SOR=0.836;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,28:28:99:.:893,0:0,0,15,13 0/0:.:55:80:55:0,80,1093 +chrX 4941051 . G GA 529.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=25.86;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=25.86;SOR=1.085;VarDP=22 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,22:22:99:.:569,0:0,0,13,9 0/0:.:55:80:55:0,80,1093 +chrX 4942156 . TGATAGATAGATAGATAGATAGATA TGATAGATAGATAGATA,T,TGATAGATAGATA 2226.97 . AC=1,1,1;AF=0.333,0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=19,19,16;AS_QD=36.87,30.07,28.74;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=41.96;SOR=1.981;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19,0,0:19:99:836,0,836,836:0,0,12,7 2/3:0,0,19,16:35:99:1430,1447,1552,674,797,844,756,773,0,706:0,0,27,8 +chrX 4942214 . CAGATAGATAGAT CAGATAGAT,C 2068.97 . AC=2,1;AF=0.667,0.333;AN=3;AS_AltDP=30,21;AS_QD=32.24,28.04;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.85;QD=41.33;SOR=0.813;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15,0:15:99:665,0,665:0,0,10,5 1/2:0,15,21:36:99:1443,849,803,600,0,719:0,0,17,19 +chrX 4942590 . C CA 1485.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=18.60;BaseQRankSum=1.977;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=9.005;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.732;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:705,0:0,0,10,9 0/1:36,27:63:99:820,0,1157:22,14,10,17 +chrX 4943764 . G A 1130 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=32.22;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.22;SOR=0.693;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,36:36:99:.:1160,0:0,0,18,18 0/0:.:53:78:53:0,78,1246 +chrX 4943902 . TA T 923.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=13.56;BaseQRankSum=0.116;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.102;SOR=0.681;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,21:21:99:556,0:0,0,10,11 0/1:29,21:50:99:407,0,610:16,13,13,8 +chrX 4944580 . G A 960 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=18.68;BaseQRankSum=0.037;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=2.583;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.68;ReadPosRankSum=2.287;SOR=0.350;VarDP=53 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:25:99:25:.:.:0,546 0|1:26,27:53:99:.:0|1:4944580_G_A:990,0,964:4944580:10,16,10,10 +chrX 4944594 . CA C 1251.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=18.99;BaseQRankSum=-1.693;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.335;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.736;SOR=0.959;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,18:18:99:.:.:585,0:.:0,0,6,12 0|1:30,20:50:99:0|1:4944580_G_A:706,0,1097:4944580:16,14,10,10 +chrX 4945625 . T C 768 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=30.69;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.69;SOR=1.697;VarDP=26 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,26:26:99:.:798,0:0,0,8,18 0/0:.:56:73:56:0,73,1110 +chrX 4946811 . A G 1177 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=19.79;BaseQRankSum=0.018;DP=63;ExcessHet=0.0000;FS=1.063;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.79;ReadPosRankSum=1.953;SOR=0.965;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:638,0:0,0,9,10 0/1:20,22:42:99:569,0,529:9,11,7,15 +chrX 4947267 . T A 754 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=32.67;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.27;QD=32.67;SOR=1.519;VarDP=24 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,24:24:99:.:784,0:0,0,8,16 0/0:.:56:72:56:0,72,1232 +chrX 4947777 . A G 1781 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=61;AS_QD=22.36;BaseQRankSum=-2.054;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.670;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:962,0:0,0,13,17 0/1:20,31:51:99:849,0,542:9,11,15,16 +chrX 4948767 . A G 928 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=33.03;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.03;SOR=0.906;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:958,0:0,0,13,16 0/0:.:49:90:49:0,90,1171 +chrX 4949065 . G A 1434 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=19.78;BaseQRankSum=1.599;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.924;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.78;ReadPosRankSum=-2.009;SOR=0.836;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:764,0:0,0,11,13 0/1:25,25:50:99:700,0,628:11,14,9,16 +chrX 4949722 . T C 714 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=24.80;BaseQRankSum=1.127;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=6.842;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=24.80;ReadPosRankSum=-1.279;SOR=1.993;VarDP=30 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:3,27:30:99:.:744,0:2,1,7,20 0/0:.:49:71:49:0,71,948 +chrX 4950850 . AT A 136.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=12;AS_QD=11.00;BaseQRankSum=0.82;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=2.447;MQ=59.26;MQRankSum=1.876;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=0.707;VarDP=16 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:4,12:16:99:.:176,0:3,1,5,7 0/0:.:37:13:37:0,13,322 +chrX 4952112 . A G 2552 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=86;AS_QD=30.02;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.02;SOR=0.788;VarDP=86 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:863,0:0,0,15,12 1/1:0,59:59:99:1719,174,0:0,0,30,29 +chrX 4952998 . CAAAAAAAAAA C,CAAAAAAAAA 489.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=11,7;AS_QD=21.33,4.76;BaseQRankSum=-0.381;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=23.542;MQ=58.76;MQRankSum=2.089;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.306;SOR=1.702;VarDP=28 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:3,11,0:14:99:448,0,486:1,2,7,4 0/2:7,0,7:14:81:81,103,213,0,111,90:0,7,6,1 +chrX 4953532 . G A 1025 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=15.75;BaseQRankSum=1.131;DP=100;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.670;VarDP=67 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,526 0/1:29,38:67:99:.:1055,0,722:17,12,22,16 +chrX 4956072 . C A 597 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=13.63;BaseQRankSum=2.263;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=1.097;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.874;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,526 0/1:24,22:46:99:.:627,0,646:12,12,12,10 +chrX 4956845 . G C 3064 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=27.26;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.83;QD=35.56;SOR=0.763;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,35:35:99:.:.:1109,0:.:0,0,19,16 1|1:0,52:52:99:0|1:4956845_G_C:1985,156,0:4956845:0,0,26,26 +chrX 4956847 . C A 680 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=13.92;BaseQRankSum=0.498;DP=99;ExcessHet=0.0000;FS=3.918;MQ=59.71;MQRankSum=0;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.131;SOR=0.883;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:46:99:46:.:.:0,1330 0|1:25,26:51:99:.:0|1:4956845_G_C:710,0,650:4956845:14,11,11,15 +chrX 4957016 . C T 3010 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=33.04;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=33.04;SOR=0.693;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,42:42:99:1377,0:0,0,18,24 1/1:0,50:50:99:1663,150,0:0,0,28,22 +chrX 4958212 . T C 389 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=18;AS_QD=7.76;BaseQRankSum=-0.614;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=4.029;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=7.76;ReadPosRankSum=-1.037;SOR=1.118;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,486 0/1:36,18:54:99:.:419,0,1047:17,19,11,7 +chrX 4958393 . CA C 758.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=17.35;BaseQRankSum=-1.663;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=6.133;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.143;SOR=0.368;VarDP=46 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,486 0/1:21,25:46:99:.:798,0,647:14,7,12,13 +chrX 4958598 . A T 534 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=13.43;BaseQRankSum=-0.39;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.717;SOR=0.708;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,486 0/1:21,21:42:99:.:564,0,574:11,10,10,11 +chrX 4958996 . G T 496 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=8.22;BaseQRankSum=0.507;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.997;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.276;SOR=0.527;VarDP=64 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,486 0/1:42,22:64:99:.:526,0,1173:19,23,11,11 +chrX 4959278 . A T 857 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=29;AS_QD=30.59;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=30.59;SOR=1.071;VarDP=29 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,29:29:99:.:887,0:0,0,12,17 0/0:.:52:58:52:0,58,929 +chrX 4960637 . CA C,CAAA,CAAAA 474.97 . AC=2,0,1;AF=0.667,0.00,0.333;AN=3;AS_AltDP=26,3,9;AS_QD=13.25,0.00,12.64;BaseQRankSum=-1.393;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=3.021;MQ=59.38;MQRankSum=0;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.447;SOR=0.154;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,13,3,0:16:99:211,0,385,351:0,0,11,5 1/3:2,13,0,9:24:99:303,143,232,393,314,1110,164,0,486,472:2,0,10,12 +chrX 4961447 . T C 795 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=33;AS_QD=11.15;BaseQRankSum=-0.823;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=4.563;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.528;SOR=0.877;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,610 0/1:41,33:74:99:.:825,0,1143:23,18,14,19 +chrX 4961960 . C A 936 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=25;AS_QD=19.71;BaseQRankSum=-1.37;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=13.327;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.94;SOR=1.154;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,610 0|1:24,25:49:99:.:0|1:4961960_C_A:966,0,881:4961960:8,16,16,9 +chrX 4961976 . A C 1005 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=21.12;BaseQRankSum=-0.014;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=10.571;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=1.111;VarDP=49 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:29:99:29:.:.:0,610 0|1:22,27:49:99:.:0|1:4961960_C_A:1035,0,801:4961960:8,14,17,10 +chrX 4962194 . CA C 553.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=28.24;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.24;SOR=0.990;VarDP=21 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,21:21:99:.:593,0:0,0,9,12 0/0:.:50:71:50:0,71,1330 +chrX 4962623 . A C 1837 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=21.46;BaseQRankSum=0.41;DP=88;ExcessHet=0.0000;FS=0.903;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.859;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1027,0:0,0,17,16 0/1:24,30:54:99:840,0,617:12,12,12,18 +chrX 4964492 . G GTT,GT,GTTTT 537.97 . AC=1,1,0;AF=0.333,0.333,0.00;AN=3;AS_AltDP=10,12,1;AS_QD=13.48,12.78,4.50;BaseQRankSum=-0.729;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=1.456;MQ=59.72;MQRankSum=0;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.667;SOR=0.377;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,10,0,0:10:99:283,0,283,283:0,0,7,3 0/2:11,0,12,1:24:99:294,309,664,0,230,153,240,653,203,775:4,7,4,9 +chrX 4964524 . G A 421 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=16;AS_QD=18.04;BaseQRankSum=-1.307;DP=51;ExcessHet=0.0000;FS=12.436;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.04;ReadPosRankSum=-2.607;SOR=0.024;VarDP=25 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,256 0/1:9,16:25:99:.:451,0,238:0,9,6,10 +chrX 4964648 . A G 694 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=16.84;BaseQRankSum=-1.2;DP=70;ExcessHet=0.0000;FS=1.217;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.84;ReadPosRankSum=-1.416;SOR=0.425;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,256 0/1:17,26:43:99:.:724,0,452:7,10,13,13 +chrX 4964805 . C T 714 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=32.35;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.35;SOR=0.963;VarDP=23 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,23:23:99:.:744,0:0,0,13,10 0/0:.:51:59:51:0,59,1240 +chrX 4966047 . C CAAACA 803.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=25.08;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=44.37;SOR=1.292;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,19:19:99:.:843,0:0,0,12,7 0/0:.:51:59:51:0,59,1240 +chrX 4966977 . A T 500 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.14;BaseQRankSum=-2.85;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=5.483;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.843;SOR=1.040;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,710 0/1:35,23:58:99:.:530,0,1022:15,20,14,9 +chrX 4967153 . T TATAG 1505.97 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=27.11;BaseQRankSum=1.109;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=3.897;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.721;VarDP=57 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:853,0:0,0,12,8 0/1:19,18:37:99:692,0,672:8,11,9,9 +chrX 4967412 . T A 761 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=17.58;BaseQRankSum=-0.546;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=8.862;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.433;SOR=0.952;VarDP=45 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:29:99:29:0,516 0/1:17,28:45:99:.:791,0,443:6,11,17,11 +chrX 4968691 . A AT 3550.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=90;AS_QD=35.11;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.94;QD=39.89;SOR=0.693;VarDP=90 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:1105,0:0,0,16,12 1/1:0,62:62:99:2485,187,0:0,0,29,33 +chrX 4969003 . C T 600 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=16.58;BaseQRankSum=-0.285;DP=65;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.71;SOR=0.813;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,174 0/1:16,22:38:99:.:630,0,432:9,7,13,9 +chrX 4969074 . G A 452 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=17;AS_QD=13.39;BaseQRankSum=3.252;DP=64;ExcessHet=0.0000;FS=3.164;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.522;SOR=0.264;VarDP=36 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,174 0/1:19,17:36:99:.:482,0,458:14,5,10,7 +chrX 4969180 . CAA C 101.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=6;AS_QD=12.82;BaseQRankSum=0;DP=57;ExcessHet=0.0000;FS=18.195;MQ=58.06;MQRankSum=0;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=3.895;VarDP=11 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,174 0/1:5,6:11:69:.:141,0,69:1,4,6,0 +chrX 4969831 . C CT 1053.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=38;AS_QD=28.76;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=28.76;SOR=0.798;VarDP=38 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,38:38:99:.:1093,0:0,0,18,20 0/0:.:60:49:60:0,49,900 +chrX 4970942 . G A 1876 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=20.28;BaseQRankSum=-0.962;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=20.658;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.28;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=0.775;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1117,0:0,0,13,20 0/1:31,30:61:99:789,0,838:22,9,13,17 +chrX 4971207 . G A 640 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=16.75;BaseQRankSum=1.42;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=2.824;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.232;SOR=1.270;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,615 0/1:17,23:40:99:.:670,0,426:8,9,8,15 +chrX 4972023 . G A 691 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=13.35;BaseQRankSum=-0.042;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.564;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,615 0/1:27,27:54:99:.:721,0,756:15,12,14,13 +chrX 4972812 . T TA,A 1182 . AC=2,0;AF=0.667,0.00;AN=3;AS_AltDP=44,3;AS_QD=18.36,2.24;BaseQRankSum=0.999;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=9.314;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.418;SOR=1.246;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23,0:23:99:666,0,666:0,0,6,17 0/1:22,21,3:46:99:546,0,515,490,525,1242:13,9,11,13 +chrX 4972916 . G T 933 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=14.16;BaseQRankSum=0.009;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.246;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.399;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:22:99:22:0,491 0/1:32,36:68:99:.:963,0,819:13,19,18,18 +chrX 4973047 . C G 1311 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=18.12;BaseQRankSum=-0.604;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.0;SOR=0.764;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:596,0:0,0,12,6 0/1:28,28:56:99:745,0,750:16,12,15,13 +chrX 4973373 . T C 1286 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=17.78;BaseQRankSum=0;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=11.132;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.316;SOR=2.033;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:933,0:0,0,21,7 0/1:31,15:46:99:383,0,938:17,14,12,3 +chrX 4973592 . C T 1675 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=18.74;BaseQRankSum=0.66;DP=96;ExcessHet=0.0000;FS=8.829;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.634;VarDP=91 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1058,0:0,0,17,14 0/1:35,25:60:99:647,0,956:13,22,14,11 +chrX 4973686 . C G 1610 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=20.25;BaseQRankSum=-0.952;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=3.215;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=0.586;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:889,0:0,0,15,12 0/1:26,28:54:99:751,0,711:11,15,14,14 +chrX 4973884 . G A 587 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=12.10;BaseQRankSum=0.132;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=1.098;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=0.990;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:32:99:32:0,755 0/1:27,24:51:99:.:617,0,711:12,15,9,15 +chrX 4974027 . T G 1676 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=19.39;BaseQRankSum=0;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=3.093;MQ=59.94;MQRankSum=0;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.392;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1210,0:0,0,20,20 0/1:29,19:48:99:496,0,831:19,10,13,6 +chrX 4974170 . C G 1682 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=62;AS_QD=17.29;BaseQRankSum=-1.3;DP=101;ExcessHet=0.0000;FS=0.767;MQ=59.95;MQRankSum=0;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.749;SOR=0.606;VarDP=99 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:858,0:0,0,13,14 0/1:37,35:72:99:854,0,960:17,20,17,18 +chrX 4974233 . A G 1716 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=17.12;BaseQRankSum=-2.42;DP=102;ExcessHet=0.0000;FS=0.760;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.584;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:953,0:0,0,16,13 0/1:39,34:73:99:793,0,1097:21,18,16,18 +chrX 4974507 . T C 1718 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=19.86;BaseQRankSum=-2.12;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.843;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.263;SOR=0.557;VarDP=88 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1027,0:0,0,15,16 0/1:29,28:57:99:721,0,813:16,13,14,14 +chrX 4974522 . GTCTTTA G 1083.97 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=30;AS_QD=19.36;BaseQRankSum=1.204;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=2.222;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.391;SOR=0.883;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,720 0/1:28,30:58:99:.:1123,0,1085:13,15,17,13 +chrX 4975005 . G A 662 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=12.81;BaseQRankSum=-0.939;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.693;VarDP=54 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,720 0/1:27,27:54:99:.:692,0,721:15,12,15,12 +chrX 4975565 . C G 1718 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=58;AS_QD=22.13;BaseQRankSum=-0.96;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=2.084;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.481;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1028,0:0,0,17,14 0/1:21,27:48:99:720,0,554:13,8,15,12 +chrX 4976498 . A G 1452 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=19.00;BaseQRankSum=1.719;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.882;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.699;SOR=0.569;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:651,0:0,0,11,8 0/1:28,31:59:99:831,0,661:15,13,14,17 +chrX 4977167 . A G 1633 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=57;AS_QD=17.69;BaseQRankSum=0.714;DP=97;ExcessHet=0.0000;FS=0.798;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.820;VarDP=94 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:866,0:0,0,11,16 0/1:37,30:67:99:797,0,1009:16,21,12,18 +chrX 4977228 . C G 1745 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=60;AS_QD=21.13;BaseQRankSum=-0.78;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=1.989;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.986;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1003,0:0,0,13,17 0/1:24,30:54:99:772,0,603:12,12,13,17 +chrX 4977425 . A G 1861 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=63;AS_QD=22.51;BaseQRankSum=0.088;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=8.878;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.602;VarDP=84 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,40:40:99:1279,0:0,0,23,17 0/1:21,23:44:99:612,0,558:7,14,12,11 +chrX 4977502 . T C 2754 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=87;AS_QD=32.00;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=0.812;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,41:41:99:1239,0:0,0,21,20 1/1:0,46:46:99:1545,138,0:0,0,20,26 +chrX 4977942 . G T 1215 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=42;AS_QD=19.76;BaseQRankSum=-1.801;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=3.696;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.76;ReadPosRankSum=0.198;SOR=1.074;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,15:15:99:491,0:0,0,8,7 0/1:21,27:48:99:754,0,586:10,11,17,10 +chrX 4978398 . G T 1618 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=55;AS_QD=18.52;BaseQRankSum=1.763;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=1.747;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.75;SOR=0.523;VarDP=89 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1018,0:0,0,16,15 0/1:34,24:58:99:630,0,881:15,19,11,13 +chrX 4978442 . G C 705 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=28;AS_QD=11.67;BaseQRankSum=0.888;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.105;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.63;SOR=0.707;VarDP=63 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,610 0/1:35,28:63:99:.:735,0,892:16,19,15,13 +chrX 4978501 . T G 1261 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=16.99;BaseQRankSum=-2.991;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.693;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,20:20:99:655,0:0,0,9,11 0/1:30,26:56:99:636,0,875:17,13,17,9 +chrX 4978739 . G A 1816 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=59;AS_QD=21.22;BaseQRankSum=1.427;DP=91;ExcessHet=0.0000;FS=3.089;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.388;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1072,0:0,0,17,15 0/1:28,27:55:99:774,0,773:11,17,12,15 +chrX 4978871 . G C 2027 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=25.40;BaseQRankSum=2.085;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=3.070;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.422;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,33:33:99:.:.:1422,0:.:0,0,18,15 0|1:30,18:48:99:0|1:4978871_G_C:635,0,1078:4978871:19,11,10,8 +chrX 4978893 . C T 2043 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=26.24;BaseQRankSum=0.502;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=4.644;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=26.24;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.317;VarDP=79 GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS:SB 1:0,32:32:99:.:.:1378,0:.:0,0,15,17 0|1:27,20:47:99:0|1:4978871_G_C:695,0,1002:4978871:17,10,11,9 +chrX 4979468 . T C 1626 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=21.79;BaseQRankSum=-1.235;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.79;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.586;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:874,0:0,0,13,13 0/1:20,30:50:99:782,0,505:11,9,16,14 +chrX 4979710 . G A 1609 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=23.08;BaseQRankSum=-0.85;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=1.030;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.08;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=0.892;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:1043,0:0,0,16,14 0/1:18,23:41:99:596,0,462:9,9,13,10 +chrX 4979738 . A G 2382 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=72;AS_QD=33.50;DP=73;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.50;SOR=0.934;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:904,0:0,0,14,12 1/1:0,46:46:99:1508,138,0:0,0,26,20 +chrX 4979916 . G A 524 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=9.23;BaseQRankSum=-1.522;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=7.236;MQ=59.84;MQRankSum=0.823;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.175;SOR=0.698;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:24:99:24:0,401 0/1:37,23:60:99:.:554,0,1076:23,14,10,13 +chrX 4980695 . A AT 2554.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=31.63;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.63;SOR=1.292;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,19:19:99:600,0:0,0,11,8 1/1:0,63:63:99:1994,189,0:0,0,40,23 +chrX 4980793 . A G 653 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=11.38;BaseQRankSum=0.786;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=2.156;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.724;SOR=1.022;VarDP=60 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:28:99:28:0,561 0/1:34,26:60:99:.:683,0,918:17,17,11,15 +chrX 4980992 . A T 1583 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=19.67;BaseQRankSum=-0.095;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=3.169;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.197;SOR=1.124;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:884,0:0,0,10,16 0/1:29,27:56:99:729,0,799:13,16,9,18 +chrX 4981226 . C T 1653 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=21.58;BaseQRankSum=0.151;DP=80;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.600;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1027,0:0,0,13,19 0/1:22,24:46:99:656,0,586:10,12,14,10 +chrX 4981319 . G A 1460 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=51;AS_QD=19.35;BaseQRankSum=-1.938;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.924;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.538;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:874,0:0,0,9,17 0/1:26,25:51:99:616,0,711:10,16,13,12 +chrX 4981585 . T C 2138 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=33.35;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.93;QD=33.35;SOR=0.854;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:590,0:0,0,10,8 1/1:0,47:47:99:1578,141,0:0,0,25,22 +chrX 4981620 . A G 1231 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=20.34;BaseQRankSum=0.598;DP=62;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.92;MQRankSum=0;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.676;VarDP=62 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,18:18:99:615,0:0,0,11,7 0/1:21,23:44:99:646,0,568:13,8,14,9 +chrX 4981685 . A T 630 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=19;AS_QD=34.74;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=34.74;SOR=1.292;VarDP=19 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 1:0,19:19:99:.:660,0:0,0,12,7 0/0:.:47:79:47:0,79,1121 +chrX 4981887 . G A 2292 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=69;AS_QD=33.65;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.65;SOR=0.910;VarDP=69 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:790,0:0,0,9,14 1/1:0,46:46:99:1532,138,0:0,0,22,24 +chrX 4982092 . C T 1393 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=20.93;BaseQRankSum=-0.979;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=1.022;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=0.507;VarDP=68 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:739,0:0,0,13,10 0/1:20,25:45:99:684,0,510:12,8,13,12 +chrX 4982542 . G A 1368 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=46;AS_QD=21.18;BaseQRankSum=0.169;DP=66;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.841;SOR=0.780;VarDP=66 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:749,0:0,0,10,13 0/1:20,23:43:99:649,0,546:10,10,12,11 +chrX 4982920 . A G 238 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=13;AS_QD=5.25;BaseQRankSum=-1.106;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=2.725;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.735;SOR=1.179;VarDP=51 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:26:99:26:0,571 0/1:38,13:51:99:.:268,0,1128:19,19,5,8 +chrX 4983081 . A G 1209 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=43;AS_QD=14.24;BaseQRankSum=1.238;DP=90;ExcessHet=0.0000;FS=1.752;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=14.24;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.945;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,27:27:99:883,0:0,0,9,18 0/1:44,16:60:99:356,0,1199:21,23,9,7 +chrX 4983204 . A G 2380 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=77;AS_QD=31.30;DP=83;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=31.30;SOR=0.828;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:913,0:0,0,16,12 1/1:0,49:49:99:1497,146,0:0,0,25,24 +chrX 4983487 . G A 1225 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=41;AS_QD=17.93;BaseQRankSum=1.591;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=2.021;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.693;VarDP=70 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:790,0:0,0,9,14 0/1:29,18:47:99:465,0,762:16,13,10,8 +chrX 4983639 . T C 570 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=15.00;BaseQRankSum=0.712;DP=71;ExcessHet=0.0000;FS=6.647;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.00;ReadPosRankSum=-0.19;SOR=0.365;VarDP=40 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,348 0/1:19,21:40:99:.:600,0,520:13,6,10,11 +chrX 4983657 . G A 738 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=27;AS_QD=15.36;BaseQRankSum=1.089;DP=75;ExcessHet=0.0000;FS=4.001;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.310;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,348 0/1:23,27:50:99:.:768,0,608:15,8,14,13 +chrX 4984107 . T C 1345 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=45;AS_QD=23.31;BaseQRankSum=-2.295;DP=59;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.829;VarDP=59 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:789,0:0,0,12,11 0/1:14,22:36:99:586,0,379:7,7,9,13 +chrX 4984191 . T C 1431 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=49;AS_QD=20.29;BaseQRankSum=2.059;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=16.038;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.1;SOR=0.491;VarDP=72 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,23:23:99:759,0:0,0,10,13 0/1:23,26:49:99:702,0,538:6,17,17,9 +chrX 4984354 . G A 1626 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=56;AS_QD=20.44;BaseQRankSum=-1.451;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=10.296;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.450;VarDP=81 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:818,0:0,0,10,15 0/1:25,31:56:99:838,0,681:17,8,16,15 +chrX 4984452 . C G 1523 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=20.99;BaseQRankSum=0.08;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=0.940;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=20.99;ReadPosRankSum=2.558;SOR=0.549;VarDP=74 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:903,0:0,0,14,12 0/1:24,24:48:99:650,0,635:14,10,13,11 +chrX 4984506 . T C 1551 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=53;AS_QD=21.66;BaseQRankSum=-1.263;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=0.980;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=21.66;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.558;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:873,0:0,0,17,9 0/1:20,27:47:99:708,0,507:11,9,10,17 +chrX 4984537 . C T 1488 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=50;AS_QD=19.71;BaseQRankSum=0.251;DP=77;ExcessHet=0.0000;FS=0.892;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.571;VarDP=77 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,24:24:99:834,0:0,0,18,6 0/1:27,26:53:99:684,0,709:15,12,8,18 +chrX 4984565 . G C 1446 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=48;AS_QD=19.42;BaseQRankSum=0.638;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.46;SOR=0.693;VarDP=76 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:902,0:0,0,19,7 0/1:28,22:50:99:574,0,738:14,14,5,17 +chrX 4985030 . C T 1555 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=52;AS_QD=18.22;BaseQRankSum=2.894;DP=87;ExcessHet=0.0000;FS=10.928;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.136;SOR=0.783;VarDP=87 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:1,28:29:99:934,0:0,1,10,18 0/1:34,24:58:99:651,0,928:22,12,12,12 +chrX 4985238 . T C 521 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=22;AS_QD=11.02;BaseQRankSum=0.747;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.727;VarDP=50 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,606 0/1:28,22:50:99:.:551,0,704:15,13,12,10 +chrX 4985482 . G A 532 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=16.53;BaseQRankSum=0.839;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=7.791;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.746;SOR=1.319;VarDP=34 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,606 0|1:19,15:34:99:.:0|1:4985482_G_A:562,0,742:4985482:7,12,10,5 +chrX 4985491 . C A 528 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=15;AS_QD=15.94;BaseQRankSum=0.378;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=5.023;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.9;SOR=0.924;VarDP=35 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,606 0|1:20,15:35:99:.:0|1:4985482_G_A:558,0,774:4985482:8,12,9,6 +chrX 4985623 . G T 882 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=19.40;BaseQRankSum=0.03;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.125;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.907;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,606 0|1:23,24:47:99:.:0|1:4985623_G_T:912,0,894:4985623:13,10,10,14 +chrX 4985624 . A T 882 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=24;AS_QD=19.40;BaseQRankSum=-1.369;DP=78;ExcessHet=0.0000;FS=4.125;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=0.907;VarDP=47 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PGT:PID:PL:PS:SB 0:.:31:99:31:.:.:0,606 0|1:23,24:47:99:.:0|1:4985623_G_T:912,0,894:4985623:13,10,10,14 +chrX 4985649 . A G 523 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=21;AS_QD=12.57;BaseQRankSum=-0.598;DP=76;ExcessHet=0.0000;FS=4.376;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.81;SOR=0.758;VarDP=44 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,606 0/1:23,21:44:99:.:553,0,647:14,9,9,12 +chrX 4986105 . C A 2542 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=78;AS_QD=32.97;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.97;SOR=0.744;VarDP=78 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,30:30:99:933,0:0,0,16,14 1/1:0,48:48:99:1639,144,0:0,0,24,24 +chrX 4988522 . G C 2534 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=32.05;DP=82;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.52;QD=32.05;SOR=0.743;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:840,0:0,0,15,11 1/1:0,54:54:99:1724,161,0:0,0,26,28 +chrX 4989098 . TCCTCCTTC T 1299.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=31;AS_QD=30.98;DP=43;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=43.19;SOR=2.376;VarDP=31 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11:11:99:496,0:0,0,4,7 1/1:0,20:20:60:843,60,0:0,0,3,17 +chrX 4989695 . T A 2619 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=82;AS_QD=32.30;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.30;SOR=0.693;VarDP=82 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,33:33:99:1077,0:0,0,18,15 1/1:0,49:49:99:1572,146,0:0,0,23,26 +chrX 4990002 . G A 2654 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=32.34;DP=85;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.34;SOR=0.766;VarDP=83 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,28:28:99:963,0:0,0,17,11 1/1:0,55:55:99:1721,164,0:0,0,26,29 +chrX 4990471 . C CTTTG 4608.97 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=104;AS_QD=25.58;BaseQRankSum=1.582;DP=110;ExcessHet=0.0000;FS=3.052;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=44.27;ReadPosRankSum=1.664;SOR=0.284;VarDP=105 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:1305,0:0,0,13,16 1/1:1,75:76:99:3343,219,0:1,0,38,37 +chrX 4990505 . A G 928 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=36;AS_QD=13.12;BaseQRankSum=-0.591;DP=107;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.877;SOR=0.643;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:33:99:33:0,868 0/1:37,36:73:99:.:958,0,985:19,18,18,18 +chrX 4990746 . A T 3020 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=92;AS_QD=33.15;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.15;SOR=0.878;VarDP=92 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,34:34:99:1102,0:0,0,16,18 1/1:0,58:58:99:1948,174,0:0,0,26,32 +chrX 4992003 . C T 571 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=13.98;BaseQRankSum=0.162;DP=74;ExcessHet=0.0000;FS=1.171;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=13.98;ReadPosRankSum=-2.326;SOR=0.963;VarDP=43 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:30:99:30:0,575 0/1:20,23:43:99:.:601,0,512:10,10,13,10 +chrX 4992040 . T C 2629 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=80;AS_QD=33.24;DP=81;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.24;SOR=0.796;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,26:26:99:874,0:0,0,9,17 1/1:0,54:54:99:1785,162,0:0,0,29,25 +chrX 4992064 . T A 2351 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=73;AS_QD=32.62;DP=79;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.62;SOR=0.963;VarDP=73 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,32:32:99:1026,0:0,0,14,18 1/1:0,41:41:99:1355,123,0:0,0,18,23 +chrX 4992364 . G T 2144 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=33.45;DP=67;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=33.45;SOR=0.787;VarDP=65 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,25:25:99:849,0:0,0,12,13 1/1:0,40:40:99:1325,120,0:0,0,22,18 +chrX 4993635 . A T 509 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=20;AS_QD=12.83;BaseQRankSum=0.702;DP=69;ExcessHet=0.0000;FS=4.506;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.504;SOR=0.954;VarDP=42 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,411 0/1:22,20:42:99:.:539,0,574:9,13,12,8 +chrX 4994148 . G A 1906 . AC=2;AF=0.667;AN=3;AS_AltDP=65;AS_QD=18.98;BaseQRankSum=2.613;DP=104;ExcessHet=0.0000;FS=18.879;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=18.98;ReadPosRankSum=-1.341;SOR=0.894;VarDP=102 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:987,0:0,0,12,19 0/1:37,34:71:99:949,0,933:25,12,14,20 +chrX 4995103 . A G 636 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=26;AS_QD=10.92;BaseQRankSum=0.394;DP=95;ExcessHet=0.0000;FS=3.665;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.330;VarDP=61 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:31:99:31:0,749 0/1:35,26:61:99:.:666,0,1004:23,12,14,12 +chrX 4995473 . A G 2551 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=79;AS_QD=32.26;BaseQRankSum=-0.311;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=59.99;MQRankSum=0;QD=32.26;ReadPosRankSum=1.202;SOR=0.263;VarDP=80 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,31:31:99:1010,0:0,0,13,18 1/1:1,48:49:99:1571,113,0:1,0,26,22 +chrX 4996387 . T C 2530 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=83;AS_QD=30.12;BaseQRankSum=-0.911;DP=89;ExcessHet=0.0000;FS=6.177;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=30.12;ReadPosRankSum=0.795;SOR=0.233;VarDP=85 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,29:29:99:938,0:0,0,13,16 1/1:2,54:56:98:1622,98,0:0,2,30,24 +chrX 4997934 . C A 555 . AC=1;AF=0.333;AN=3;AS_AltDP=23;AS_QD=10.09;BaseQRankSum=-0.986;DP=84;ExcessHet=0.0000;FS=2.276;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.694;SOR=1.105;VarDP=58 GT:AD:DP:GQ:MIN_DP:PL:SB 0:.:25:99:25:0,386 0/1:35,23:58:99:.:585,0,1012:17,18,9,14 +chrX 4998618 . A G 2292 . AC=3;AF=1.00;AN=3;AS_AltDP=71;AS_QD=32.70;DP=72;ExcessHet=0.0000;FS=0.000;MQ=60.00;QD=32.70;SOR=0.779;VarDP=71 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,22:22:99:714,0:0,0,14,8 1/1:0,49:49:99:1608,147,0:0,0,20,29 +chrX 4998972 . TAATAAATA T,TAATA 802.97 . AC=1,1;AF=0.333,0.333;AN=3;AS_AltDP=11,10;AS_QD=17.89,13.81;BaseQRankSum=-0.329;DP=68;ExcessHet=0.0000;FS=1.314;MQ=60.00;MQRankSum=0;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.393;VarDP=37 GT:AD:DP:GQ:PL:SB 1:0,11,0:11:99:483,0,483:0,0,6,5 0/2:16,0,10:26:99:359,407,1032,0,625,595:6,10,4,6