BioDBSX2

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Curar las bases de datos de NAR

Línea:BIObits
Proyecto: BIOdatabases
Tema:BioDBSX2
Objetivo:Reunir, clasificar, analizar, describir las fuentes de bases de datos más relevantes para Biociencias.
Preguntas:

• Cuántas bases de datos hay
• Qué tecnología utilizan
• Sobre qué temas tratan
• Qué tipo de información contienen
• Cuáles son las más usadas

El proyecto Biodatabases
Nuestro objetivo reunir las bases de datos en biociencias en una plataforma colaborativa, abierta, semántica y multilingüe para que sea utilizada por los estudiantes y les permita aprender, probar, implementar y participar en investigaciones que integren el cómputo, las matemáticas y la ciencias biológicas en proyectos de bioinformática, informática de la biodiversidad y bioinformación.

Wikidata
Wikidata es la base de datos de internet, que utiliza Web semántica y que permite realizar mapas de conocimientos.

El wikiproyecto Bases de datos para Biociencias
https://www.wikidata.org/wiki/Wikidata:Bases_de_Datos_Biociencias

Material y método

• Localizar todas las fuentes de datos disponibles
• Realizar una tabla para estructurar la información

Variables de estudio
-Las fuentes de bases de datos en biociencias
-El propósito
-Lo que registran
-El tamaño
-La tecnología semántica
-Las licencias

Análisis y visualización

Productos

1. Cartel en el congreso SEH2Bioinfo Participación del LABioinformación en SEH2Bioinfo
2. Artículo descripción de las fuentes de bases de datos de biociencias
3. Artículo análisis y visualización de las fuentes de bases de datos de biociencias

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Una variable que valdría la pena agregar a las fuentes es la proporción de bases de datos caducas o inactivas en cada una. En el chat de telegram he estado comentando sobre eso y aquí también esta #10

Les compartimos un intento para saber cuántas bases de datos hay inactivas en NAR, y estamos intentando obtener el nombre de cada una también para poder ligarlo y completar nuestra información.

Trabajar con el html de NAR es una moncerga

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Este artículo está muy interesante y aborda temas como LOD, RDF y OWL es importante que lo leamos @Paola-Cov @Yessicagp20 y @MinRo60 y pienso usarlo para el Journal Club

https://www.nature.com/articles/s41597-021-00797-y

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📌Cómo van con el cartel?