Neben Python 3.x wird SciPy und NumPy benötigt.
Voraussetzung: Python 3.x mit pip
Installation von SciPy und NumPy:
cd ./PubMedAuthorEvaluation
pip install -r requirements.txt
Ausführen der Scripts
python get_actors_publications.py
python calc_authors_results.py
Der Einfachheit halber verwenden wir Miniconda, welches Python als auch conda, einen Paketmanager, umfasst.
Bitte laden und installieren Sie die Python 3.x Version: http://conda.pydata.org/miniconda.html
Beim Installationsprozess kann der Ordner ausgewählt werden in den Miniconda installiert werden soll. Standartmäßig wird es in den Benutzerordner installiert.
Nach erfolgreicher Installation müssen die benötigten Pakete heruntergeladen werden.
Öffnen Sie hierzu die Windows-Eingabeaufforderung.
- via Startmenü -> Suche nach cmd.exe
- oder in einem Ordner auf die weiße Fläche Rechtsklick und dabei "Shift/Großschreibtaste" gedrückt halten -> Eingabeaufforderung hier öffnen
Geben Sie folgendes Kommando ein:
conda update conda[ENTER]
Bitte drücken Sie bei der Nachfrage (Proceed ([y]/n)?) die Enter-Taste um die Aktion zu bestätigen.
Gehen Sie mit folgenden Kommandos identisch vor:
conda install numpy[ENTER]conda install scipy[ENTER]
Navigieren Sie hierzu in den Ordner PubMedAuthors und machen einen Rechtsklick auf get_actors_publications.py oder calc_authors_results.py.
Wählen Sie nun: Öffnen mit -> Andere App auswählen -> Weitere Apps -> Andere App auf diesen PC suchen (am Ende der Liste) Nun müssen Sie die python.exe im Miniconda Ordner auswählen (Installationspfad!). Achtung, nicht pythonW.exe!
Bestätigen Sie die Auswahl. Der Script sollte nun in einem schwarzen Fenster starten.
Nun müssen noch die Python-Dateien (.py als Dateiendung) mit dem Python Interpreter verknüpft werden, um die Dateien mit Doppelklick ausführen zu können.
Schließen Sie das Fenster und führen Sie erneut einen Rechtsklick auf eine der beiden Pythondateien aus.
Wählen Sie nun: Öffnen mit -> Andere App auswählen -> Python auswählen (am Anfang der Liste) Setzen Sie den Haken bei: Immer diese App zum Öffnen von .py-Dateien verwenden. Bestätigen Sie mit OK.
Nun sollten Python-Dateien (.py) mit dem Python Interpreter verknüpft sein. Klicken Sie doppelt auf die get_actors_publications.py-Datei. Diese sollte nun ausgeführt werden und die nach einem Topic fragen. Siehe hierzu die Readme.md