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ComunidadBioInfo/cdsb2023

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Workshop CDSB 2023: Creando paquetes de R/Bioconductor para análisis transcriptómicos de célula única.

07-11 de agosto de 2023

Bienvenidos al Workshop Creando paquetes de R/Bioconductor para análisis transcriptómicos de célula única!

Estamos encantadxs de anunciar que la CDSB, junto con la Red Mexicana de Bioinformática (RMB) y el Nodo Nacional de Bioinformática en la UNAM (NNB-CCG), está organizando el taller Creando paquetes de R/Bioconductor para análisis transcriptómicos de célula única como parte del Encuentro Nacional de Bioinformática México 2023.

Todas las sesiones serán teóricas y prácticas. Nos enfocaremos en dos temas principales:

  • Flujo de análisis de datos transcriptómicos de célula única
  • Creación de paquetes de R/Bioconductor

¡Registrate aquí!

Instructores

Ayudantes

  • Dra. Evelia Lorena Coss Navarrete
  • Andrés Arredondo Cruz
  • M.C. Diego Ramírez
  • M.C. Luis Alberto Meza

Temario

Consulta el calendario de este curso en: http://bit.ly/calendarcdsb2023

  • Día 1: Flujo de análisis de datos transcriptómicos de célula única Parte I

    • Presentación de la CDSB.
    • Estructura e importe de datos.
    • Control de calidad.
    • Normalización.
  • Día 2: Flujo de análisis de datos transcriptómicos de célula única Parte II

    • Selección de genes altamente variables.
    • Reducción de dimensiones.
    • Clustering.
    • Genes marcadores.
    • Anotación de tipos celulares.
  • Día 3: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte I

    • Nuevas funcionalidades de RStudio, Quarto.
    • Control de versiones con GitHub y RStudio.
    • Solución de problemas con las versiones de paquetes de Rstudio.
    • Infraestructura de un paquete de R/Bioconductor.
    • Plática: Convirtiendo tu flujo de análisis en un paquete de R/Bioconductor.
    • Documentación de funciones.
    • Sesión social: Conociendo a la comunidad.
  • Día 4: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte II

    • Diseño de pruebas.
    • Creación de viñetas.
    • Compilación e instalación de paquetes.
    • Proyectos colaborativos Parte I.
  • Día 5: Proyectos colaborativos

    • Proyectos colaborativos Parte II.
    • Presentación de proyectos.
    • Clausura.

Patrocinadores

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